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gi|110109 : ACA-AAGTGA-A-C-GGAA-AT-TTA--TG-TG-T-C-CCA-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------C--C--------TAC---------t
gi|110110 : ACG-AAGTGA-A-T-GGA----------TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TGA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AA------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CT
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gi|110112 : ACA-AAGTGA-A-C-GGAA-AT-GTA--T--TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTC-AGGG--ATT-T--A-G--AA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TACATGTACCGTCAGA-T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-------TG---A----G-----------------CCTTG----T------------------AGTG-ATAAA-AATT--GGAA
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Alignments
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gi|110126 : A-AAGTGA-A-C-GAA-----TTA--TG-TG-G-C-T-A-A-T--C-C------TTA-AGGG----T-T--A-G--AA--T-A---C-C--G----AA------A-------TACT--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-AGAC--AG---ATAT-G-----------------ACGTC----TAAAAAGTTAATT--CAC-AATG-ATAGA-TATT--GG
gi|110127 : AGTAC-A-C-GGAA-AT-TTA--AG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-GGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-A-AC--AG---A----GAGA--------------ACATC----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AATT--GGAAA
gi|110128 : AGTGA-A-C-GG----T-TT---------T-C-C-A-A-A--T-C-A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG------A-------T--CTTACGTGTTGC---------CA---T--G-------A---A-AA--TAT--CTG---A
gi|110129 : A-A-C-GGAA-ATCTTA--TG-TG-T-A-T-A-A-T--T-C-A----TTCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGC-----A-------T--C--------T-C---------CA---T--GA------A---A-AA--T-T--CAG---AT-GCC-A-AC--AG---ATAAGA-----------------ACGTC----T------TTAATTCACAC-AGTGCATAAAGAATT--GGGGA
gi|110130 : A--TG-TG-TTC-T-A-A-T--T-C-A----ATA-AGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AAA-T-T--CTG---AT-A-T-A-AT--AG---AAAG-G-----------------ACGTAATAAT------TT-ATTCACAC-AGTG-ATTAA-AAT---GGGAA
gi|110131 : --TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---C-AA--T-T--CTG---AT-G-T-A-AC--AG---AGAG-G-----------------ACGTA----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AACC--GGGGA
gi|110132 : --TG-TG-T-A-T-T-A-C--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-ATA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CATTTT--G-------A---C-AA--T-T--CTGA--ATGG-T-A-AC--AG---A----GAGGACGTTATTTATTCAACGTA----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AACCTGGGGA
gi|110133 : --TG-TG-T-C-T-A-C-T--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---C-AA--T-TNACTG---A
gi|110134 : G-TG-T-CAT-A-A-T--T-C-A----TTACAAGG--CTT-TT-A-G-GAA--T-AA--C-C--G----AA------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-
gi|110135 : -A-A-C--T-C-AGA--TGA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------TA---T--G-------A---A-CA---------G---AT------------G---G----G-----------------ACGTC----TAAAAAGTT-ATT--CAC-AGTA-ATAAA-AATT--GGG
gi|110136 : -T--T-T-A----TTA-AGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--CTACCTG--TAC---------CA---T--G-------A---ATAA--T-T--CTG---AT-A-T-------TG---G----G-----------------CC--A----T------TT-ATTCA-AC-AGT
gi|110137 : G--CTT-C--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CG---T--G-------A---A-AA--T-T--CTA---AC-A-T-A-AC--AG---AGAG-G-----------------ACGTC----T------TT-ATTCACAT---TG-ATAAA-AATT--GGG
blockSeqs : T G G A T AG GT T C T T C G T AT T C TTAT G CTC TA G C AT T ACT T CG ATAC ACGTAC CGTACAT AC ATACATGT ATGTACCGT TTT TT TAACGAT TTG T GT A NA CGT G C AACAGAGAGGACGTTATTTATTCAACGTAT A A C G CTG
blockSeqs : . . . . . GT G A . . T . G . A . . GA T C T . . T A C A CG . ACGTAC . . TTACGTGT ATGTAT GA . TACCAT . T A . . A . . AGACAGATATGACGTCTAAAAAG A . A . T
blockSeqs : . . . . . CT . . . . C . . . . . . T C C . . . C . T . . . T . . TACATG ATGTAC . . AA . . . . . A . . TACAGATAAGACGTCTAAAAAG . . C . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . A . . . . . . . . C . . . . . A . . . C . . TACATG . . . A . . . . . . . . AATAGAAAGGACGTAATAAT . . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . TACCTG . . . . . . . . . . . . AAACAGAGAGGACGTTT . . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . AACAGATAAGAACGTCT . . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAGAGGACGTTT . . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAACAGAGAGACGTTT . . . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAGAGGACCTCT . . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAAAGAGATGACGTCT . . . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAGAGAACATCT . . . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAGAGGACGTAT . . . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAGAGGACGTCT . . . . T
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGGACGTCTAAAAAG . . . . T
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blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGGGCCAT . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AACAGAG . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACATGT . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAGCC . . . .
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blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ACA-AAGTGA-A-C-GGAA-AT-TTA--TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-A-AC--AG---A----G-----------------ACGTN----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AATC--GGGAA
finalCons : ACA-AAGTGA-A-C-GGAA-AT-TTA--TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-A-AC--AG---A----G-----------------ACGTN----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AATC--GGGAA
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Reference ( family-470 ) : ACA-AAGTGA-A-C-GGAA-AT-TTA--TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-A-AC--AG---A----G-----------------ACGTN----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AATC--GGGAA
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gi|110123 : CA-AAGTGA-A-C-AGAA-AT-GTA--TG-CG-T-C-T-A-T-A--T-C-A----TCA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-T---C-C--G----AG------A-------T--CTACATG--TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-------TG---A----G---------------------------------TT-AT----GT-AGTG-ATACA-AATC--GGGGAtga
gi|110124 : CA-AA---A-G-C-GGAA-AT-TTA--TG-TG-C-C-T-A-A-T--T-C-A----TAA-AGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--GATACAT------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-
gi|110125 : A-AAGTGA-A-C-AGAA-AT-TTA--TG-TG-T-C-T-A-T-T--T-C-C----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTT---AT-A-T-T-AC--AGATAA----G-----------------ACGTC----TAAAAAGTT-ACTCACAC-AGTG-ATAAG-AATT--GGG
gi|110126 : A-AAGTGA-A-C-GAA-----TTA--TG-TG-G-C-T-A-A-T--C-C------TTA-AGGG----T-T--A-G--AA--T-A---C-C--G----AA------A-------TACT--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-AGAC--AG---ATAT-G-----------------ACGTC----TAAAAAGTTAATT--CAC-AATG-ATAGA-TATT--GG
gi|110127 : AGTAC-A-C-GGAA-AT-TTA--AG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-GGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AA--T-T--CTG---AT-A-T-A-AC--AG---A----GAGA--------------ACATC----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AATT--GGAAA
gi|110128 : AGTGA-A-C-GG----T-TT---------T-C-C-A-A-A--T-C-A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG------A-------T--CTTACGTGTTGC---------CA---T--G-------A---A-AA--TAT--CTG---A
gi|110129 : A-A-C-GGAA-ATCTTA--TG-TG-T-A-T-A-A-T--T-C-A----TTCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGC-----A-------T--C--------T-C---------CA---T--GA------A---A-AA--T-T--CAG---AT-GCC-A-AC--AG---ATAAGA-----------------ACGTC----T------TTAATTCACAC-AGTGCATAAAGAATT--GGGGA
gi|110130 : A--TG-TG-TTC-T-A-A-T--T-C-A----ATA-AGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-AAA-T-T--CTG---AT-A-T-A-AT--AG---AAAG-G-----------------ACGTAATAAT------TT-ATTCACAC-AGTG-ATTAA-AAT---GGGAA
gi|110131 : --TG-TG-T-C-T-A-A-T--T-C-A----TTA-AGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---C-AA--T-T--CTG---AT-G-T-A-AC--AG---AGAG-G-----------------ACGTA----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AACC--GGGGA
gi|110132 : --TG-TG-T-A-T-T-A-C--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-ATA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CATTTT--G-------A---C-AA--T-T--CTGA--ATGG-T-A-AC--AG---A----GAGGACGTTATTTATTCAACGTA----T------TT-ATTCACAC-AGTG-ATAAA-AACCTGGGGA
gi|110133 : --TG-TG-T-C-T-A-C-T--T-C-A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---C-AA--T-TNACTG---A
gi|110134 : G-TG-T-CAT-A-A-T--T-C-A----TTACAAGG--CTT-TT-A-G-GAA--T-AA--C-C--G----AA------A-------T--C--------TAC---------CA---T--G-------A---A-
gi|110135 : -A-A-C--T-C-AGA--TGA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------TA---T--G-------A---A-CA---------G---AT------------G---G----G-----------------ACGTC----TAAAAAGTT-ATT--CAC-AGTA-ATAAA-AATT--GGG
gi|110136 : -T--T-T-A----TTA-AGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--CTACCTG--TAC---------CA---T--G-------A---ATAA--T-T--CTG---AT-A-T-------TG---G----G-----------------CC--A----T------TT-ATTCA-AC-AGT
gi|110137 : G--CTT-C--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG------A-------T--C--------TAC---------CG---T--G-------A---A-AA--T-T--CTA---AC-A-T-A-AC--AG---AGAG-G-----------------ACGTC----T------TT-ATTCACAT---TG-ATAAA-AATT--GGG