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lowQualScore                  :                ...  ... ..   .. . .  . .   .  .    .......  ....  ............. . ..... .. ... ....  .... ....  . ....  .   . ..  ....... .  ... .  ...     .  .. ...  ...  .... . . . .   .  .      ...........    ....  . .. .. .  . . ..  . .    .. .........   . . .... .   .    .     .  ... .      .   ... .  . ..   .    
lowQualScore                  :                888  555 88   88 4 4  8 3   0  7    3333333  8888  7777777777777 3 22222 88 000 7777  3333 7777  3 0000  2   2 11  6666666 2  333 1  999     3  77 000  000  7777 1 1 2 1   1  2      88888888888    2222  2 66 44 1  9 2 55  1 1    44 333333333   1 1 7777 1   2    1     0  999 2      2   000 2  2 77   5    
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Reference ( gi|91010 )        :         ATTTATT---AG---CC-AAA--T-C-CACA-TCA-AA-TGTC-------AA----GT----T-----G--A-A-----T--G---C----ATT---T----CC-C----TT-ACA-C-GGT-----A-T-CAC--A-AT---TGGGATTT--A---TT---TG-A-CT-A-T-C-AAA-TT-GGGAAA----------TTTTTT-C-TT-A--T--T-TTCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91011                      :         ATTTATT---AG---CC-AAA--T-C-CACA-TCA-AA-TGTC-------AA----GT----T-----GAAA-A-----T--GGCAT----ATT---C----CC-C----TTCACA-C-GGT-----A-T-CAC--A-AT---TGGGATTTACA---TT---TG-A-CT-A-T-C-AAA-TT-GGGAAAAT--------TTTTTT-C-TT-AT-T--T-TTCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C------TTT-A-CG-GACCC-AA---A-TCAGGGAAGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91013                      : tttattagATTTATT---AG---CA-AAA--TTC-CACA-TCA-AAATATC-------AA----GT----T-----T--G-A-----TTTG---C----ATT---T----CC-C----TT-ACACC-AGT-----T-T-CA---A-AC---TGGGACTT--A---TT---TG-T-TT-A-T-C-AAA-TT-GGGAAA----------AATTTC-C-TC-A--T--T-TTCC-A--AT-T-GGGA--A---------GGT-C-C------TTT-ATCA-GACCC-AA---ATTCAAGG-AGG-T-G-GA-CCAAGC-
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gi|91024                      :           TTATT---AG---CA-AAA--T-C-CTCA-TCA-AA-TGTC-------AA----GT----T-----G--A-A-----T--G---C----ATC---T----CC-C----TT-ACA-T-AGT-----A-T-CAA--A-AC---TGGGATTT--A---TT---AG-T-TT-A-T-C-AAA-TT-GGGAAG----------AATTTG-C-TT-A--T--T-TTCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCA-TATCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91025                      :             ATT---AG---CA-AAA--T-C-CACA-C----A-TTTT-------GA-----T----T-----A--A-A-----T--GAT-C----AGTGGAT----CC-C----T--ACA-C-AGT-----A-T-TAC--A-GTAACTGG-ATTT--A---TT----G-A-TTTA-TAC-AAA-TTTGGGAAA----------TTTTTT-CTTT-A--TTAT-TCCC-A--ATGT-GGGA--A--G------GTTGC-T----T-TTT-ATCATAACCC-AATACA-TGAGGG-A
gi|91026                      :              TT---AG---CA-AAA--T-C-CAGA-TCA-AA-TGTC-------AA----GT----T-----G--A-A-----T--G---C----ATC---T----CC-C----TT-ACA-C-AGT-----A-T-CAA--A-AC---TGGGATTT--A---TT---TG-T-TT-A-T-C-AAA-TT-GGGAAA----------GTTTTG-C-TC-A--T--T-TTCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91036                      :                          -AAA--T-C-CAAC-CCA-AG-TGTC-------AATTAAGT----A-----A--A-A-----T--G---T----ATC---T----CA-C----CT-GTG-C-TGT-----C-T-CTA--A-AT---TGGGA
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gi|91040                      :                                   aaatA-TTG-AA-TGTC-------AA----GT----T-----A--A-A-----T--G---C----ATA---T----TC-C----TT-AAA-C-TGT-----C-T-CAA--A-AT---TAAAATTT--A---TT---TC-A-CT-A-T-T-GAA-TT-TGGAAA----------CTATTG-C-TT-A--T--T-TTCC----AT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCA
gi|91039                      :                                       A-TCA-AA-TGTC-------AG----AT----T-----A--ATC-----T--T---C----ATT---T----CT-CCCTTTT-ACA-CTGGT-----A-TTCAA--A-AT---TGGGAGTT--A---GC---TG-AGCC-A-T-A-AAA-TT-GGGAAA----------TTTTGC-T-TT-A--T--T-TTCC-A--AT----AAA--A--T------GGT-C-CAT--T-TTT-ATCG-AACCC-AA---A-TCA-GG-AGA-TGTAAA-C--AGC-CC
gi|91041                      :                                                                              --A-A-----T--G---C----ATT---T----CAAC----TT-ACA-A-TGT-----C-T-CAA--A-AT---TGGAAATT------TT---TGTC-CT-A-T-C-AA--TT-GAGAAT----------TTTTCG-C-TT-A--T--T-TTAA-A--CT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TAT-ATTG-GATCC-AA---A-
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Reference ( family-469 )      :                                ATTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CANA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGN-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAA----------NTTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
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Reference ( family-469 )      :                                ATTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CANA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGN-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
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Reference ( family-469 )      :                                ATTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CANA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGN-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91024                      : tttatcagccaaaaatgaacataaatatcgctaTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CTCA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAT-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---AGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAGA----------ATTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCA-TATCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91025                      :                                    ATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CA----------CA-CA-T---TTTGA-----TT-----A--A-AT--G-----A--------T--CAGTGGAT----CC-C----T--ACAC-AGTA-TTACAGTA-ACT-GGA---TTT--A---TT---GAT-T-TATAC-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--TTAT-TC-CC-A--ATGT-GGGA--A--G------GTTGC-T----T-TTT-ATCATAACCC-AATACA-TGAGGG-A
gi|91026                      :                                     TT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CAGA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAAG----------TTTT--GC-TCA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91027                      :                                     TT---AGC-AA-------------A-AAT-C-CAGAAT------CA-AAAT---GTCAG----TTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTAAT--CAA-A-ACTGGGA---TTTT-A---TT---TGT-T-TAT-C-AAAACTGGGAAAG----------TTTTTTGC-TCC--T--T-TT-CCCA--AT-TTGGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TTAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91028                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAAT----------TTTT--TC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATCA-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91029                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGAT---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--T--T-TTCCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATC--AACCC--A---A-TCA-GG-AGA-T-T-GA-C--AGCTCCTG
gi|91030                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGAT---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--T--T-TTCCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATC--AACCC--A---A-TCA-GG-AGA-T-T-GA-C--AGCTCCTG
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gi|91032                      :                                            C-GA-------------A-A-T-C-CAAA-TTGAATTCA-AA-T---GGCAA----GTT-----A--A-AT--AC----A--------T--T------C----CC-C---TT--ACAC-TGTA-T--CAA-A--TTGGTA---TTT--A---TT---TCA-C-CAT-C-ACA-TTGGAAAAA----------ATTT--GC-TTA--C--T-TT-CC-C--AG-T-TGGA--G--G------GGT-C-T----T-TTT-ACTG-GACAC-AA---A-TCAGTG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91033                      :                                             -AA-------------A-A-T-C-CA-A-C------CA-AG-T---GTCCA----GT------A--A-GT--GC----AATACCTACT--G------T----CT-C---T--------AATC-T--CTA-A-ATTGGGA---TTT--AATATT---TGA-C-TTT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-T----T--T-TT-CC-A--TT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----------------------A---A-TCAGGA-CGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91035                      :                                             -AA-------------ATA-T-C-CTAA-T------CA-AA-T---AACA-----GTA-----A--A-AT--GCTTGCA--------T--C------T----CA-T---TT--ATAC-TGTC-T--CAA-A-ACTGGGA----TT--A---TT---TGA---TGT-C-TTA-TTGCGAAAA----------TTTC--G--TTA--T--T-TT--C-A--AT-A-CGGA--A----------AT-T-C----TAGTT-A-CG-GATCC-A
gi|91036                      :                                               A-------------A-A-T-C-CAAC-C------CA-AG-T---GTCAATTAAGTA-----A--A-AT--GT----A--------T--C------T----C------------AC----------------CTGTG--------------C---TGT-C-TCT---AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CT-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-AACG-GACCC-AA---A-TCAGGA-CGA-G-T-GG-C--AGC-CCTG
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gi|91038                      :                                               A-------------A-A-T-T-CACA-T------CG-AA-T---GTTTA----TTTTTTTCA--A-AT--GC----A--------T--T------T----TC-C---TT--TCCT-AATT-T--TAC-C-ATTTGGA--------A---AT---TG--C-T-----AAA-TTGGGAAAA----------AATT--GA-CAA--T--T-TT-TT-A--AA-G-GGGA--A--A------GGG-C-CGAAAT------TCG-GACCC-AA---A-
gi|91039                      :                                                                        A-T------CA-AA-T---GTCAG----ATT-----A--ATCT--TC----A--------TTTC------T----CC-C---TTTTACACTGGTA-TT-CAA-A-ATTGGGA---GTT--A---GC---TGAGC-CAT-A-AAA-TTGGG-AAA----------TTTT--GCTTTA--T--T-TT-CC-A--AT----AAA--A--T------GGT-C-CAT--T-TTT-ATCG-AACCC-AA---A-TCA-GG-AGA-TGTAAA-C--AGC-CC
gi|91040                      :                                                                        A-T------TG-AA-T---GTCAA----GTT-----A--A-AT--GC----A--------T--A------T----TC-C---TT--AAAC-TGTC-T--CAA-A-ATTAAAA---TTT--A---TT---TCA-C-TAT-T-GAA-TTTGGAAAC----------TATT--GC-TTA--T--T-TT-CC----AT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCA
gi|91041                      :                                                                                                             --A-AT--GC----A--------T--T------T----CAAC---TT--ACAA-TGTC-T--CAA-A-ATTGGAA---ATT------TT---TGT-CCTAT-C-AA--TTGAGAATT----------TTTC--GC-TTA--T--T-TT-AA-A--CT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TAT-ATTG-GATCC-AA---A-
gi|91042                      :                                                                                                                                                           T--AAAC-AGTT-T--CAA-A-ATTGGGA---TTT--G---TT---TGT-T-GTT-C-AAA-TTGGGGAAA----------TTTT--G
gi|91042                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTGgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacccaaatcagggagattgacagccctg
gi|91043                      :                                                                                                   taaacagtttcaaaattgggatttgtttgttgttcaaattggggaaattttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-C-AAA-TTTGGAAAA----------TTTT--GC-TTA-----T-TT-AC-A--AT-T-TGGA--A--G------GGT-C-CT---T-TTT-ATCG-TACCC-AA---T-TCAGGG-AGACT-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91045                      :                                                                                                                                                tagcaaaatcagttcttttttTA-T--CAA-ATATTGAGA---GTT--G---GT---TG-----------AA-TTGGGAAAAAAAAAGACCCTTTT----------T--T-TT----A--AT-T-GAAA--AT-G------GGG-C-C----T-AAT-ATCG-AACCC-AA---A-TCAGAG-TGA-T-T-GA-C--GGC-CCTG
gi|91046                      :                                                                                                                                                                             A-G-ATTGGGAATTTTC--A---CT---TG--------C-AAA-TTGGGAAAA----------AATG--AC-CGA--T--T-TT-TG-G--AT-T-GGGATTA--G------GGG-C-C----A-AAT-ATTG-GACCCAAA---A-TCAGGT-GGA-A-T-GA-C--AGT-CCTG
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gi|91050                      :                                                                                                                                                                                                                                    atctgtttatattgaataaaccc--T-CT-CC-GT-AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTTAATCG-GACTCAAA---A-TCAGGG-AGA-G-T-GACC--AGC-CCTG


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blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       T  . .       .      C        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     G   A  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   T         .             .   T   T  .  .  C  . .   . .    .  TTG         . . T    .   .    .     .  .   .      .   CT  .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      T        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    GT     . .   T         .             .   T   .  .  .  C  . .   . .    .  TG          . . T    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   T  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   T   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   T   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TG     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      C        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   T  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   A  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   A  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   C   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      C        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   G  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   C  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  G . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  T  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  C . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                       .     .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     G   A  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                             .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      G        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   C  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                             .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      T        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   A  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  T  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                             .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   C  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   G   .  . .    .
blockSeqs                     :                                             .  .             . . . .  A . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   C  .    . .       .     .  .    .    TC     . .   .         .             .   .   .  .  .  C  . .   . .    .  A           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                                .             . . . .  C . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     G   C  .    . .       .     .  .    .    GC     . .   .         .             .   .   .  .  .  A  . .   . .    .  T           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                                .             . . . .  . . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     A   T  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  A  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
blockSeqs                     :                                                .             . . . .  . . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   A  .    . .       .     .  .    .    TT     . .   .         .             .   .   .  .  .  A  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   A   .  . .    .
blockSeqs                     :                                                                         . .       .  . .       .      A        .  .   .    .        .  .      .     . .    .     T   C  .    . .       .     .  .    .    AC     . .   .         .             .   .   .  .  .  T  . .   . .    .  G           . . .    .   .    .     .  .   .      .   T   .  . .    .
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Reference ( family-469 )      :                                ATTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CANA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGN-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
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gi|91016                      :                                 TTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TC--ACAC-AGAA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGT-G-TAT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GATCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-ACTG
gi|91017                      :                                 TTTATTT--AGC-AA-------------A-A-T-C-CAAC-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----C--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---T-----T-T-C-AAA-TTGGGAAAA------------CT--GC-CTA--T--T-TC-CC-A--AT-T-GTGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TGAGGG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91018                      :                                ATTT-TC---AGCCAA-------------A-A-G-C-CTGA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--AC----A--------T--C------T----CC-C---CT--ACAC-AGTA-C--CAA-A-ACTGAGA---TTT--A---TT---TCT-T-TTT-C-ATA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-AATAT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GATCC-AA---A-TTTGGG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91019                      :                         tttattagTTTATTTGTAGT-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------CA-AG-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------------------------C---T---------GTT-T--CAC-A-ACTGGGA---TAC--A---TT---TGT-T-TTT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTGT--GC-TCA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCT-AA---A-TCAGGG-AGA-G-T-AA-C--AGC-CCTG
gi|91020                      :                                 TTTATT---AGC-AAGAAATGAAACTGCA-A-T-C-TGGA-T------CA-AA-T---GTCAG----ATT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----TT-C---TT--ACAT-TGTA-T--CAA-A-ATTGGGA---TTT--A---GT---TGA-C--AT-A-AAA-TTGTGAAAA----------TATT--GT-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-AGGA--T--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-
gi|91021                      :                                 TTTATT---AGT-AA-------------A-A-T-C-TAGA-T------CA-AA-T---GTCAA----GCT-----A--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAT-TGTA-T--CAA-A-ATTTTGA---TTT--A---TT---TGA-C-CAT-C-ATA-TTAGGAAAA------------CT--GC-TTA--T--T-TT-CG-A--AT-A-GTGA--A-------------------------------GACCC-AA---A-TCAAG---AA-C-T-GA-C--AAC-
gi|91022                      :                                 TTTACT---AGA-AACTGA---------A-A-T-C-CAGA-T------CA-AA-C---GTCAG----GTC-----C--A-AT--GT----A--------T--C------TGCCTCT-C---TT--ACAC---TG-T--CAA-A-ATTGGGA---TTT--A---TTCTTTGA-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TATT--GC-TTC--C--T-TT----------------------------GGT-C-A----T-TTT-ATGA-GGCCA-AA---A-TCAGGG-ATC-T-T-GA-T--GGC-CCTG
gi|91023                      :                                                                        A-T------CA-AA-TACAGTAAA----AT------G--C-TT--GC----A--------T--C------T----CA-T---TT--ATAC-TGTC-T--CAA-A-ACTGGGA----TT--A---TT---TGA---TGT-CTTAT-TTGCGAAAA----------TTTC--G--TTA--T--T-TT--C-A--AT-A-CGGA--A----------AT-T-C----TAGTT-A-CG-GATCC-A
gi|91024                      : tttatcagccaaaaatgaacataaatatcgctaTTATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CTCA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAT-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---AGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAGA----------ATTT--GC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCA-TATCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91025                      :                                    ATT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CA----------CA-CA-T---TTTGA-----TT-----A--A-AT--G-----A--------T--CAGTGGAT----CC-C----T--ACAC-AGTA-TTACAGTA-ACT-GGA---TTT--A---TT---GAT-T-TATAC-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--TTAT-TC-CC-A--ATGT-GGGA--A--G------GTTGC-T----T-TTT-ATCATAACCC-AATACA-TGAGGG-A
gi|91026                      :                                     TT---AGC-AA-------------A-A-T-C-CAGA-T------CA-AA-T---GTCAA----GTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAA-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAAG----------TTTT--GC-TCA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91027                      :                                     TT---AGC-AA-------------A-AAT-C-CAGAAT------CA-AAAT---GTCAG----TTT-----G--A-AT--GC----A--------T--C------T----CC-C---TT--ACAC-AGTAAT--CAA-A-ACTGGGA---TTTT-A---TT---TGT-T-TAT-C-AAAACTGGGAAAG----------TTTTTTGC-TCC--T--T-TT-CCCA--AT-TTGGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TTAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91028                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGGA---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAA-TTGGGAAAT----------TTTT--TC-TTA--T--T-TT-CC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATCA-GACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91029                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGAT---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--T--T-TTCCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATC--AACCC--A---A-TCA-GG-AGA-T-T-GA-C--AGCTCCTG
gi|91030                      :                                      T---AGC-AA-------------A-A-T-C-CACA-T------TTTGA-T---GTAAA----GTT-----G--A-TT--AC----A--------T--A------T----CC-C---TT--ACAC-AGTA-T--CAG-A-ACTGGAT---TTT--A---TT---TGT-T-TAT-C-AAATTTGGGAAAT----------TTTT--TCTTTA--T--T-TTCCC-A--AT-T-GGGA--A--G------GTT-C-C----T-TTT-ATC--AACCC--A---A-TCA-GG-AGA-T-T-GA-C--AGCTCCTG
gi|91031                      :                                       ---AGCTAA-------------A-A-T-C-CAAA-T-------A-AG-T---GTCAA----GTA-----T--A-AT--AC----A--------T--C------T----TA-C---TT--GTAC-GGTC-T--CAA-A-ATTGG-A---CTT--A---TT---TGA-C-TAT-C-AAA-TTGGG-AAA----------TTTT--GC-TTAT-T--T-TT-TC-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-ATCG-GACCC-AA---A-TCAGAG-AGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91032                      :                                            C-GA-------------A-A-T-C-CAAA-TTGAATTCA-AA-T---GGCAA----GTT-----A--A-AT--AC----A--------T--T------C----CC-C---TT--ACAC-TGTA-T--CAA-A--TTGGTA---TTT--A---TT---TCA-C-CAT-C-ACA-TTGGAAAAA----------ATTT--GC-TTA--C--T-TT-CC-C--AG-T-TGGA--G--G------GGT-C-T----T-TTT-ACTG-GACAC-AA---A-TCAGTG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91033                      :                                             -AA-------------A-A-T-C-CA-A-C------CA-AG-T---GTCCA----GT------A--A-GT--GC----AATACCTACT--G------T----CT-C---T--------AATC-T--CTA-A-ATTGGGA---TTT--AATATT---TGA-C-TTT-C-AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-T----T--T-TT-CC-A--TT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----------------------A---A-TCAGGA-CGA-G-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91034                      :                                             -AA-------------A-A-T-C-CAAA-T------CA-AG-T---GTCAA----GTA-----A--A-CT--GC----A--------T--C------T----TA-C---TT--ATAC-AGTC-T--C---A-ATTGGGA---TTT--A---TT---TGA-C-TAT-C-AAA-TTGGGAAA
gi|91035                      :                                             -AA-------------ATA-T-C-CTAA-T------CA-AA-T---AACA-----GTA-----A--A-AT--GCTTGCA--------T--C------T----CA-T---TT--ATAC-TGTC-T--CAA-A-ACTGGGA----TT--A---TT---TGA---TGT-C-TTA-TTGCGAAAA----------TTTC--G--TTA--T--T-TT--C-A--AT-A-CGGA--A----------AT-T-C----TAGTT-A-CG-GATCC-A
gi|91036                      :                                               A-------------A-A-T-C-CAAC-C------CA-AG-T---GTCAATTAAGTA-----A--A-AT--GT----A--------T--C------T----C------------AC----------------CTGTG--------------C---TGT-C-TCT---AAA-TTGGGAAAA----------TTTT--GC-TTA--T--T-TT-CT-A--AT-T-GGGA--A--G------GGT-C-C----T-TTT-AACG-GACCC-AA---A-TCAGGA-CGA-G-T-GG-C--AGC-CCTG
gi|91037                      :                                               A-------------A-A-T-C-CAAA-T------CA-AA-T---GTCTA----GCT-----A--A-----------------------C------T----TC-C---TT--AC-C-GG-------------CCAGGA---TTT--A---TT---TTG-C-AAG-C-AAA-TTGTGCAA-----------TTTT--AT-TTA--T--T-T--CG-A--AT-T-GGGA--ACGGT-----GGT-C-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---G-TCAGGA-AGA-T-T-GC-C--AGC-CCTG
gi|91038                      :                                               A-------------A-A-T-T-CACA-T------CG-AA-T---GTTTA----TTTTTTTCA--A-AT--GC----A--------T--T------T----TC-C---TT--TCCT-AATT-T--TAC-C-ATTTGGA--------A---AT---TG--C-T-----AAA-TTGGGAAAA----------AATT--GA-CAA--T--T-TT-TT-A--AA-G-GGGA--A--A------GGG-C-CGAAAT------TCG-GACCC-AA---A-
gi|91039                      :                                                                        A-T------CA-AA-T---GTCAG----ATT-----A--ATCT--TC----A--------TTTC------T----CC-C---TTTTACACTGGTA-TT-CAA-A-ATTGGGA---GTT--A---GC---TGAGC-CAT-A-AAA-TTGGG-AAA----------TTTT--GCTTTA--T--T-TT-CC-A--AT----AAA--A--T------GGT-C-CAT--T-TTT-ATCG-AACCC-AA---A-TCA-GG-AGA-TGTAAA-C--AGC-CC
gi|91040                      :                                                                        A-T------TG-AA-T---GTCAA----GTT-----A--A-AT--GC----A--------T--A------T----TC-C---TT--AAAC-TGTC-T--CAA-A-ATTAAAA---TTT--A---TT---TCA-C-TAT-T-GAA-TTTGGAAAC----------TATT--GC-TTA--T--T-TT-CC----AT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TTT-ATTG-GACCC-AA---A-TCA
gi|91041                      :                                                                                                             --A-AT--GC----A--------T--T------T----CAAC---TT--ACAA-TGTC-T--CAA-A-ATTGGAA---ATT------TT---TGT-CCTAT-C-AA--TTGAGAATT----------TTTC--GC-TTA--T--T-TT-AA-A--CT-T-GGGA--A--G------GGT-T-C----T-TAT-ATTG-GATCC-AA---A-
gi|91042                      :                                                                                                                                                           T--AAAC-AGTT-T--CAA-A-ATTGGGA---TTT--G---TT---TGT-T-GTT-C-AAA-TTGGGGAAA----------TTTT--G
gi|91042                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCC-AA---A-TCAGGG-AGA-T-T-GA-C--AGC-CCTGgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacccaaatcagggagattgacagccctg
gi|91043                      :                                                                                                   taaacagtttcaaaattgggatttgtttgttgttcaaattggggaaattttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-C-AAA-TTTGGAAAA----------TTTT--GC-TTA-----T-TT-AC-A--AT-T-TGGA--A--G------GGT-C-CT---T-TTT-ATCG-TACCC-AA---T-TCAGGG-AGACT-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91044                      :                                                                                                                                                                                            tagcaaaatcagttcttttttT-C-AAA-TTTGGAAAA----------TTTT--GC-TTA-----T-TT-AC-A--AT-T-TGGA--A--G------GGT-C-CT---T-TTT-ATCG-TACCC-AA---T-TCAGGG-AGACT-T-GA-C--AGC-CCTG
gi|91045                      :                                                                                                                                                tagcaaaatcagttcttttttTA-T--CAA-ATATTGAGA---GTT--G---GT---TG-----------AA-TTGGGAAAAAAAAAGACCCTTTT----------T--T-TT----A--AT-T-GAAA--AT-G------GGG-C-C----T-AAT-ATCG-AACCC-AA---A-TCAGAG-TGA-T-T-GA-C--GGC-CCTG
gi|91046                      :                                                                                                                                                                             A-G-ATTGGGAATTTTC--A---CT---TG--------C-AAA-TTGGGAAAA----------AATG--AC-CGA--T--T-TT-TG-G--AT-T-GGGATTA--G------GGG-C-C----A-AAT-ATTG-GACCCAAA---A-TCAGGT-GGA-A-T-GA-C--AGT-CCTG
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