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Reference ( gi|71280 )        :                                                         TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-C-TC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-TTTT-CTC-T--ATA-TAA----G---A---A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
gi|71281                      :                                                         TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-C-TC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AAC------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-TTTT-CTC-T--ATA-TAA----GT--A---A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------C-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71291                      :                                                         TTTGA----C-T-C----TCGAA---TT-C-TC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------AT-----------T-TGGTCC-------C--G---------------------------------TA-AAA----C---AT--A-T-C-------A------T-------G-TGTTTTT--C-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-
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gi|71306                      :                                                          TCGA-T--CAT-C----TCGAA-G-TT-C-TT-GA-TCTC-T-C--A-A-GTAT-AAT------GTC----------C-CGGTCC-------C--C-----------T-----AT-TTTT-CTC-T--ATA-TAA----ACT-A---A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTCTTCGA-A-CAT-TCGA
gi|71305                      :                                                          TCGA-T--A-A-C----TTGAA-C-TT-C----GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--A--------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-TTTT-CTC-T--ATA-TAAC---T---A---A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCGT-TCGA-T-CTC-TCGA
gi|71307                      :                                                          TCGA-TAAC-T------TCGAA-C-TT-C-GC--A-TCTC-T-CG-A-AAGTG--AA-------GTT----------C-CGGTCC-------CC-G--------A--T-----TT-TTTT-CTC-T--ATA-GGA----GGTAA---A-G-C-------A------AC------A-T-----TGTT-------AAC-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGTCTCGA
gi|71309                      :                                                          TCGA-T--A-A-C----TCGAA-C-TT-C----GA-TCTC-T-CG-A---GTG--AA-------G-C----------C-CGGTTC-------C--G--------A--T-----TT-TTT--CTC-T---TA-TAA----TCT-A---A-G-CC------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A--------A-A-CGT-TCGA
gi|71310                      :                                                          TCGA-T--A-A-C----TCGAA------CGTC-GA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------CTC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----GT-TCTT-CTC-T--AAA-TAAC---A---A---A-G-C-------A------A-------A-C------------------C-----------GTT-CT--ATCTC-TCGA-
gi|71308                      :                                                          TCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-C-TC-GACTCTCTT-CG-A-A-GTG--AATGG----GTC----------C-CGTTAA-------C--A--------A--CA----TA-TTTT-C------ATG-TTG----G------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CGC-ATCTCTTCGA-A-
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gi|71301                      : tcgaactttgatcccttgatgtgaaatcacagtcctgattttttcccaaatttactgTCGA-T--C-T-C----TCGAACG-TT-C----GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA--------TT----------T-GGGTCC-------C--GTAAAACACA--T-----TT-CATT-GTT-T--------------------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-
gi|71311                      :                                                          TCGA-T--G-G-C----TTGAA-C-TT-T----GA-TCTT-T-TG-A-A-GTA--AATTTAAAAATC----------A-TGGTCC-------C--A--------A--T-----TC-TTTT-CTC-T--GTA-TAA----G---C---ATG-C--------------A-------A-T-----C--TCTGGAA-G-T-----------TCT-CA--ATCTC-TTGA-A-
gi|71304                      :                                                          TCGA-T--C-T-C----TCGAACG-T----TC-GA-TCTC-G-AG-A-A-GTG--AA--------TT----------T-GGGTCC-------C--GTAAA----A--C-----TT-ATTT-CAT-T--GTT-T-------------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-
gi|71312                      :                                                          TCGA-T--C-T-C----TTGAA-T-TT-C-TC-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATT----------T-AGGTTC-------C--
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gi|71302                      :                                                          TCGA-T--C-T-C----TCGAA-C-AT---TC-GA-TCTC-T-CA-A-A-ATG--AA--------TT----------C-GGGTCC-------C--GTAAA----A--C-----AT-ATTT-CAT-T--GTT-T-------------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CA--ATCTC-TCGA-A-
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gi|71315                      :                                                                --C-T-C----TCAAA-G-TT-C-CT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGGTC-----------------------------------T-TTA-T--AAA-TAAC---T---A---A-G-C-------ACTCTTGA-------A-T-----T--TTC-----A-CTTTCTTGATGTTCT-CG--ATCTC-TCAA-A-
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Alignments
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lowQualScore                  :      . .. . . ....     ...  . ...  .    . .  . . .   ..  ........  ............      ....... .. .................  . .      . ..   . .............................................. ..... .. ....... . ...........   .  ..     .    . .   .    
lowQualScore                  :      1 55 1 1 2222     777  0 111  0    0 0  0 0 0   77  00000000  888888888888      1111111 33 33333333333333333  0 0      0 33   0 7777777777777777777777777777777777777777777777 55555 44 9999999 0 88888888888   0  44     1    1 4   5    
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Reference ( family-464 )      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-T-AA----N---A-A-G-C-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71310                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAACG-T----C-GA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------CTC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----GT-T-CTTCTC-T--AAA-T-AAC---A---A-A-G-C-------A------A-------A-----C------------------C-----------GTT-CT--ATCTC-TCGA-
gi|71311                      :  TCGA-T--G-G-C----TTGAA-C-TT-T---GA-TCTT-T-TG-A-A-GTA--AATTTAAAAATC----------A-TGGTCC-------C--A--------A--T-----TC-T-TTTCTC-T--GTA-T-AA----G---C-ATG-C--------------A-------A-----T-----C--TCTGGAA-G-T-----------TCT-CA--ATCTC-TTGA-A-
gi|71312                      :  TCGA-T--C-T-C----TTGAA-T-TT-CTC-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATT----------T-AGGTTC-------C--
gi|71313                      :  TTGA-T--A-G-C----TCAAA-C-TT-C---AA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------ATCAAAGACAAAAT-CTGACA-------T--G--------A--T-----TT-T-TTTCTG-T--ATA-T-AACTATT---A-A-G-C-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TTT-TG--TTTAC-TCCA-A-
gi|71314                      :    GA-T--C-T-C----TCAAATG-TT-CTT-CA-TCTC-C-TG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------C--C--------G--T-----TT-T-GTTCTC-T--GCA-G-AAC---T---A-A-G-C-------A------A-------A-----
gi|71315                      :        --C-T-C----TCAAA-G-TT-CCT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGGTC------------------------------------TTTA-T--AAA-T-AAC---T---A-A-G-C-------ACTCTTGA-------A-----T-----T--TTC-----A-CTTTCTTGATGTTCT-CG--ATCTC-TCAA-A-
gi|71316                      :             -C----CCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------AT-T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-T-AAT---T---A-A-G-C-------A------A-------G-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-TG--ATCTC-T
gi|71317                      :             -C----TCGAA-G-TT-CT--GA-TCTC-T-CT-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGATCC-------T--G--------A--T-----AT-T-TTTCTT-T--A-A-T-AAC---T---A-A-G-C-------A------A-------A-----TGTATGT--TAA-----A-C-----------TTT-CA--ATCTC-
gi|71318                      :               ----TCGAA-C-TT-T---GA-TCCC-T-TG-A-T-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------T--G--------A--T-----TT-T-TTCC----------------------------C-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TGT-CG--ATCTC-TTGA-A-TTTCTCGA
gi|71319                      :                     GAA-A-TT-CTT-GA-CATT-T-CG-G-G-GTA--AC-------CAT----------C-CAGTCC-------------------A--T-----TT-T-CTTTTCCT--ATA-TAAA----C---C-A-G-C-------A------C-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-C
gi|71320                      :                               TT-GA-TTTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----AT-T-GTTCTC-TTCGTA-T-AAT---T---A-A-G-C-------A------A-------G-----A-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A
gi|71321                      :                                                                               -CGGCCC-------CCGG--------A--TATA--TT-T-TTTCCC-T--ATA-T-AAC---T---A-A-G-C-------A------A-------G-----T-----T--T-------A-C-----------T----------TC-TTGA-A-CGT-TCGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                          11111111                               11111111111111111                        22222222222222222222222222222222222222            1111111                                           
lowQualScore                  :      1 11 1 1 2222     444  3 555  1    1 1  1 1 1   33  22222222  555555555555      3333333 22 88888888888888888  1 2      1 11   44444 77777777777777777777777777777777777777 1 22222 11 2222222 1 44444444444   1  22     2    1 2   3    
lowQualScore                  :      . .. . . ....     ...  . ...  .    . .  . . .   ..  ........  ............      ....... .. .................  . .      . ..   ..... ...................................... . ..... .. ....... . ...........   .  ..     .    . .   .    
lowQualScore                  :      1 55 1 1 2222     777  0 111  0    0 0  0 0 0   77  00000000  888888888888      1111111 33 88888888888888888  0 0      0 33   44444 55555555555555555555555555555555555555 0 55555 44 2222222 0 88888888888   0  44     1    1 4   5    
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Reference ( family-464 )      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AA----T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
gi|71280                      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AA----G-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71294                      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-GTTT-CTC-GA-TCT--T-CG-A-A-GTG--GA-------ATT----------T-GGGTCC-------C--G--------C--TAAACATA-T-TTTCAT-T--GTT-----T----------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CG--AT-TC-TCGA-A--GT-
gi|71295                      : TTCAA-T--C-T-C----TAGAA-G-TT-CTT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ACC----------A-CGGTCC-------T--G--------A--T-----AT-T-TTTCTT-T--ATA-----A-GA----C-GTA-G-C-------A------A-------A-T-----T--A-------A-C-----------GCT-TG--ATCAT-TC-A-A-TGT-
gi|71296                      : TTCAA-T--C-T-C----TCGAA-G-TTACTC--A-TTTC-C------A-ATG--AA-------GTC----------CACGGTCC----------G--------A--G-----TT-A----CTC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-CCAAGATTAT-----A-------A-T-----C--T-------A-C-----------TCTGCT--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71298                      : TTTGG-C--C-T-T----TCAAA-G-TT-TTA-GA-TCTG-TGTG-A-A-GTG--AA-------ATT----------A-TGGTCT-------T--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ACAT----T-GC----T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--TATTTCAAA-C-----------TGT-CA--ATTTC-TTGA-A-
gi|71299                      : TTTGA-T--C-T-C----TAGAA-G-TT-CTG-GA-TCTC-T-GG-T-A-GTG--AA-------ATC----------T-TAGTAT-------C--A--------A--T-----TTGT-TTTCCA-T--TTAG----C-AA----A-A-A-G-T-------A------A-------ATT-----T--T-------A-A-----------T-T-CG--ATCTC-TC
gi|71300                      : TTTGA-T--C-T-CATTTTAAAA-G-TT-CTC-AG-TCTC-T-TGTATA-GTG--AC-------TTT----------G-AAGTCC-------C--A--------A--T-----TT-C-CCTC-C-T--ATA-----TAAA----T-A-A-G-C-------A------A-------A-C-----T------------G-----------TTT-TG--TTCTC-TTGA-A-
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gi|71305                      :  TCGA-T--A-A-C----TTGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--A--------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCGT-TCGA-T-CTC-TCGA
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gi|71307                      :  TCGA-TAAC-T------TCGAA-C-TT-CGC--A-TCTC-T-CG-A-AAGTG--AA-------GTT----------C-CGGTCC-------CC-G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATAGGAGGT-AA--------A-G-C-------A------AC------A-T-----TGTT-------AAC-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGTCTCGA
gi|71308                      :  TCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GACTCTCTT-CG-A-A-GTG--AATGG----GTC----------C-CGTTAA-------C--A--------A--CA----TA-T-TTTC------ATG-----T-------T----------------------G-------G-T-----T--C-------A-C-----------TCT-CGC-ATCTCTTCGA-A-
gi|71309                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A---GTG--AA-------G-C----------C-CGGTTC-------C--G--------A--T-----T--T-TTTCTC-T---TA-----T-AATC--T-A-A-GCC-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A--------A-A-CGT-TCGA
gi|71310                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAACG-T----C-GA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------CTC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----GT-T-CTTCTC-T--AAA-----T-AA----CAA-A-G-C-------A------A-------A-C------------------C-----------GTT-CT--ATCTC-TCGA-
gi|71311                      :  TCGA-T--G-G-C----TTGAA-C-TT-T---GA-TCTT-T-TG-A-A-GTA--AATTTAAAAATC----------A-TGGTCC-------C--A--------A--T-----TC-T-TTTCTC-T--GT---------A----T-A-A-G-C-------ATGC---A-------A-T-----C--TCTGGAA-G-T-----------TCT-CA--ATCTC-TTGA-A-
gi|71312                      :  TCGA-T--C-T-C----TTGAA-T-TT-CTC-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATT----------T-AGGTTC-------C--
gi|71313                      :  TTGA-T--A-G-C----TCAAA-C-TT-C---AA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------ATCAAAGACAAAAT-CTGACA-------T--G--------A--T-----TT-T-TTTCTG-T--ATA-----T-AACTATT-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TTT-TG--TTTAC-TCCA-A-
gi|71314                      :    GA-T--C-T-C----TCAAATG-TT-CTT-CA-TCTC-C-TG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------C--C--------G--T-----TT-T-GTTCTC-T--GCA-----G-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-
gi|71315                      :        --C-T-C----TCAAA-G-TT-CCT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGGTC------------------------------------TTTA-T--AAA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------ACTCTTGA-------A-T-----T--TTC-----A-CTTTCTTGATGTTCT-CG--ATCTC-TCAA-A-
gi|71316                      :             -C----CCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------AT-T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAT---T-A-A-G-C-------A------A-------G-T-----T--T-------A-C-----------TCT-TG--ATCTC-T
gi|71317                      :             -C----TCGAA-G-TT-CT--GA-TCTC-T-CT-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGATCC-------T--G--------A--T-----AT-T-TTTCTT-T--A-A-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-TGTATGT--TAA-----A-C-----------TTT-CA--ATCTC-
gi|71318                      :               ----TCGAA-C-TT-T---GA-TCCC-T-TG-A-T-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------T--G--------A--T-----TT-T-TTCC------------------------------C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TGT-CG--ATCTC-TTGA-A-TTTCTCGA
gi|71319                      :                     GAA-A-TT-CTT-GA-CATT-T-CG-G-G-GTA--AC-------CAT----------C-CAGTCC-------------------A--T-----TT-T-CTTTTCCT--ATA-----T-AAA---C-C-A-G-C-------A------C-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-C
gi|71320                      :                               TT-GA-TTTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----AT-T-GTTCTC-TTCGTA-----T-AAT---T-A-A-G-C-------A------A-------G-A-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A
gi|71321                      :                                                                               -CGGCCC-------CCGG--------A--TATA--TT-T-TTTCCC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------G-T-----T--T-------A-C-----------T----------TC-TTGA-A-CGT-TCGA





Alignments
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lowQualScore                  :      1 11 1 1 2222     444  3 555  1    1 1  1 1 1   33  22222222  555555555555      3333333 22 88888888888888888  1 2      1 11   44444 77777777777777777777777777777777777777 1 22222 11 2222222 1 44444444444   1  22     2    1 2   3    
lowQualScore                  :      . .. . . ....     ...  . ...  .    . .  . . .   ..  ........  ............      ....... .. .................  . .      . ..   ..... ...................................... . ..... .. ....... . ...........   .  ..     .    . .   .    
lowQualScore                  :      1 55 1 1 2222     777  0 111  0    0 0  0 0 0   77  00000000  888888888888      1111111 33 88888888888888888  0 0      0 33   44444 55555555555555555555555555555555555555 0 55555 44 2222222 0 88888888888   0  44     1    1 4   5    
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Reference ( family-464 )      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AA----T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
gi|71280                      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AA----G-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
gi|71281                      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AAC------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAG---T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------C-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71295                      : TTCAA-T--C-T-C----TAGAA-G-TT-CTT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ACC----------A-CGGTCC-------T--G--------A--T-----AT-T-TTTCTT-T--ATA-----A-GA----C-GTA-G-C-------A------A-------A-T-----T--A-------A-C-----------GCT-TG--ATCAT-TC-A-A-TGT-
gi|71296                      : TTCAA-T--C-T-C----TCGAA-G-TTACTC--A-TTTC-C------A-ATG--AA-------GTC----------CACGGTCC----------G--------A--G-----TT-A----CTC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-CCAAGATTAT-----A-------A-T-----C--T-------A-C-----------TCTGCT--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71299                      : TTTGA-T--C-T-C----TAGAA-G-TT-CTG-GA-TCTC-T-GG-T-A-GTG--AA-------ATC----------T-TAGTAT-------C--A--------A--T-----TTGT-TTTCCA-T--TTAG----C-AA----A-A-A-G-T-------A------A-------ATT-----T--T-------A-A-----------T-T-CG--ATCTC-TC
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gi|71303                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAA-C-TT-C---GA-TCTC---CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C--GGTCA-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AA--------A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
gi|71304                      :  TCGA-T--C-T-C----TCGAACG-T---TC-GA-TCTC-G-AG-A-A-GTG--AA--------TT----------T-GGGTCC-------C--GTAAA----A--C-----TT-A-TTTCAT-T--GTT-----T----------------------------------------T-----T--C-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-
gi|71305                      :  TCGA-T--A-A-C----TTGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--A--------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCGT-TCGA-T-CTC-TCGA
gi|71306                      :  TCGA-T--CAT-C----TCGAA-G-TT-CTT-GA-TCTC-T-C--A-A-GTAT-AAT------GTC----------C-CGGTCC-------C--C-----------T-----AT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAAC--T-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTCTTCGA-A-CAT-TCGA
gi|71307                      :  TCGA-TAAC-T------TCGAA-C-TT-CGC--A-TCTC-T-CG-A-AAGTG--AA-------GTT----------C-CGGTCC-------CC-G--------A--T-----TT-T-TTTCTC-T--ATAGGAGGT-AA--------A-G-C-------A------AC------A-T-----TGTT-------AAC-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGTCTCGA
gi|71308                      :  TCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GACTCTCTT-CG-A-A-GTG--AATGG----GTC----------C-CGTTAA-------C--A--------A--CA----TA-T-TTTC------ATG-----T-------T----------------------G-------G-T-----T--C-------A-C-----------TCT-CGC-ATCTCTTCGA-A-
gi|71309                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A---GTG--AA-------G-C----------C-CGGTTC-------C--G--------A--T-----T--T-TTTCTC-T---TA-----T-AATC--T-A-A-GCC-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A--------A-A-CGT-TCGA
gi|71310                      :  TCGA-T--A-A-C----TCGAACG-T----C-GA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------CTC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----GT-T-CTTCTC-T--AAA-----T-AA----CAA-A-G-C-------A------A-------A-C------------------C-----------GTT-CT--ATCTC-TCGA-
gi|71311                      :  TCGA-T--G-G-C----TTGAA-C-TT-T---GA-TCTT-T-TG-A-A-GTA--AATTTAAAAATC----------A-TGGTCC-------C--A--------A--T-----TC-T-TTTCTC-T--GT---------A----T-A-A-G-C-------ATGC---A-------A-T-----C--TCTGGAA-G-T-----------TCT-CA--ATCTC-TTGA-A-
gi|71312                      :  TCGA-T--C-T-C----TTGAA-T-TT-CTC-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATT----------T-AGGTTC-------C--
gi|71313                      :  TTGA-T--A-G-C----TCAAA-C-TT-C---AA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------ATCAAAGACAAAAT-CTGACA-------T--G--------A--T-----TT-T-TTTCTG-T--ATA-----T-AACTATT-A-A-G-C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TTT-TG--TTTAC-TCCA-A-
gi|71314                      :    GA-T--C-T-C----TCAAATG-TT-CTT-CA-TCTC-C-TG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------C--C--------G--T-----TT-T-GTTCTC-T--GCA-----G-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-
gi|71315                      :        --C-T-C----TCAAA-G-TT-CCT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGGTC------------------------------------TTTA-T--AAA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------ACTCTTGA-------A-T-----T--TTC-----A-CTTTCTTGATGTTCT-CG--ATCTC-TCAA-A-
gi|71316                      :             -C----CCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------AT-T-----TT-T-TTTCTC-T--ATA-----T-AAT---T-A-A-G-C-------A------A-------G-T-----T--T-------A-C-----------TCT-TG--ATCTC-T
gi|71317                      :             -C----TCGAA-G-TT-CT--GA-TCTC-T-CT-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGATCC-------T--G--------A--T-----AT-T-TTTCTT-T--A-A-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------A-TGTATGT--TAA-----A-C-----------TTT-CA--ATCTC-
gi|71318                      :               ----TCGAA-C-TT-T---GA-TCCC-T-TG-A-T-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------T--G--------A--T-----TT-T-TTCC------------------------------C-------A------A-------A-T-----T--T-------A-C-----------TGT-CG--ATCTC-TTGA-A-TTTCTCGA
gi|71319                      :                     GAA-A-TT-CTT-GA-CATT-T-CG-G-G-GTA--AC-------CAT----------C-CAGTCC-------------------A--T-----TT-T-CTTTTCCT--ATA-----T-AAA---C-C-A-G-C-------A------C-------A-T-----T--T-------A-C-----------TCT-C
gi|71320                      :                               TT-GA-TTTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----AT-T-GTTCTC-TTCGTA-----T-AAT---T-A-A-G-C-------A------A-------G-A-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A
gi|71321                      :                                                                               -CGGCCC-------CCGG--------A--TATA--TT-T-TTTCCC-T--ATA-----T-AAC---T-A-A-G-C-------A------A-------G-T-----T--T-------A-C-----------T----------TC-TTGA-A-CGT-TCGA


blockSeqs                     :      G AA A T ATTT     GT   T CCC                    GG  TTTAAAAA  AAAGACAAAAT       TCTAGTT CG TAAAACACAT           T        TC   GGAGG AACTAAGCCAAGATTATA                       GTATG GT ATTTCAA A TTTCTTGATGT   G  GT     T    T G   C
blockSeqs                     :      . .  . . .        CG   T TC                     GG  TGGG      CA                .       C  CTAAACA              T        .    T     AAGTAAGCAATCTCTCG                        .     .  CTGGAA  . .             .  C      T    . G   C
blockSeqs                     :      . .  . . .        CG   A TC                     T   CG        C                 .       .  TAAAAC               .        .    G     AAGTAAGCAATCTCTCG                        .     .  TC      . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        CG   . TC                     .   TG        T                 .       .  TAAAAC               .        .    .     AACTAAGCACTCTTGA                         .     .  TC      . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        TG   . TC                     .   G         C                 .       .  TAAAAC               .        .    .     AACTATTAAGCAA                            .     .  AA      . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TT                     .   G         T                 .       .  TAAAAC               .        .    .     AATCTAAGCCAA                             .     .  G       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TT                     .   G         C                 .       .  TAAAAC               .        .    .     AAACTAAGCAA                              .     .  G       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         C                 .       .  TTATT                .        .    .     ATAAGCATGCA                              .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         T                 .       .  TAAAA                .        .    .     AAGTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         C                 .       .  ATATA                .        .    .     AAATAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   A         C                 .       .  AATT                 .        .    .     AACTAAGCAT                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         C                 .       .  ATT                  .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         T                 .       .  ATT                  .        .    .     AAGTAGAAAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   A         C                 .       .  ACA                  .        .    .     GAGTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        A    . TT                     .   A         C                 .       .  ATT                  .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        A    . TC                     .   G         T                 .       .  AT                   .        .    .     GACGTAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        A    . TA                     .   A         A                 .       .  AT                   .        .    .     AACACCACAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TG                     .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     AAATAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   T         A                 .       .  AT                   .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . TC                     .   G         T                 .       .  AT                   .        .    .     AACAAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TC                     .   G         G                 .       .  AG                   .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TT                     .   G         T                 .       .  AG                   .        .    .     AATTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .   .
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . GC                     .   G         C                 .       .  AT                   .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . TC                     .   C         C                 .       .  AT                   .        .    .     AAACCAGCAC                               .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . TC                     .   A         T                 .       .  AT                   .        .    .     AATTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . TT                     .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     AACTAAGCAA                               .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . CT                     .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     GCTAAGCAA                                .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . TT                     .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     AAAAAGTAA                                .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . TT                     .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     AAAGCAAC                                 .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . T                      .   A         C                 .       .  AT                   .        .    .     CATGTGT                                  .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . C                      .   A         A                 .       .  AT                   .        .    .     AAAGCAA                                  .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        T    . T                      .   C         A                 .       .  AT                   .        .    .     CAA                                      .     .  .       . .             .  .      .    . .    
blockSeqs                     :      . .  . . .        C    . .                      .   A         T                 .       .  GT                   .        .    .     TG                                       .     .  .       . .             .  .      .    .      
blockSeqs                     :      . .  . . .        G    . .                      .   .         A                 .       .  AT                   .        .    .     .                                        .     .  .       . .             .  .      .    .      
blockSeqs                     :        .  . . .        C    . .                      .   .         A                 .       .  AT                   .        .    .     .                                        .     .  .       . .             .  .      .           
blockSeqs                     :             . .        G    . .                      .   .         A                 .       .  AT                   .        .    .     .                                        .     .  .       . .             .  .      .           
blockSeqs                     :             . .        C    . .                      .   .         A                 .       .  AT                   .        .    .     .                                        .     .  .       . .             .  .      .           
blockSeqs                     :               .        A    . .                      .   .         A                 .       .  A                    .        .    .     .                                        .     .  .       . .             .  .                  
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Reference ( family-464 )      : TTCGA-T--C-T-C----TCGAA-G-TT-CTC-GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------GTC----------C-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TTT-TTTCTC-T--ATA-----T-AA-C---TAAGC-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--ATCTC-TCGA-A-CGT-TCGA
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gi|71312                      :  TCGA-T--C-T-C----TTGAA-T-TT-CTC-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATT----------T-AGGTTC-------C--
gi|71313                      :  TTGA-T--A-G-C----TCAAA-C-TT-C---AA-TCTC-T-TG-A-A-GTG--AA-------ATCAAAGACAAAAT-CTGACA-------T--G--------A--T-----TTT-TTTCTG-T--ATA-----T-AA-CTATTAAGC-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TTT-TG--TTTAC-TCCA-A-
gi|71314                      :    GA-T--C-T-C----TCAAATG-TT-CTT-CA-TCTC-C-TG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------C--C--------G--T-----TTT-GTTCTC-T--GCA-----G-AA-C---TAAGC-------A------A-------A-----
gi|71315                      :        --C-T-C----TCAAA-G-TT-CCT-GA-TCTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGGTC-----------------------------------TTTA-T--AAA-----T-AA-C---TAAGC-------ACTCTTGA-------A-----T-----T--TTC-----A-CTTTCTTGATGTTCT-CG--ATCTC-TCAA-A-
gi|71316                      :             -C----CCGAA-C-TT-C---GA-TCTC-T-CG-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----TTTTTTTCTC-T--ATA-----T-AA-T---TAAGC-------A------A-------G-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-TG--ATCTC-T
gi|71317                      :             -C----TCGAA-G-TT-CT--GA-TCTC-T-CT-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-TGATCC-------T--G--------A--T-----ATT-TTTCTT-T--A-A-----T-AA-C---TAAGC-------A------A-------A-----TGTATGT--TAA-----A-C-----------TTT-CA--ATCTC-
gi|71318                      :               ----TCGAA-C-TT-T---GA-TCCC-T-TG-A-T-GTG--AA-------ATC----------A-CAGTCC-------T--G--------A--T-----TTT-TTCC---------------------------C-------A------A-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TGT-CG--ATCTC-TTGA-A-TTTCTCGA
gi|71319                      :                     GAA-A-TT-CTT-GA-CATT-T-CG-G-G-GTA--AC-------CAT----------C-CAGTCC-------------------A--T-----TTT-CTTTTCCT--ATA-----T-AA-A---CCAGC-------A------C-------A-----T-----T--T-------A-C-----------TCT-C
gi|71320                      :                               TT-GA-TTTC-T-CA-A-A-GTG--AA-------ATC----------A-CGGTCC-------C--G--------A--T-----ATT-GTTCTC-TTCGTA-----T-AA-T---TAAGC-------A------A-------G-----A-----T--T-------A-C-----------TCT-CG--A
gi|71321                      :                                                                               -CGGCCC-------CCGG--------A--TATA--TTT-TTTCCC-T--ATA-----T-AA-C---TAAGC-------A------A-------G-----T-----T--T-------A-C-----------T----------TC-TTGA-A-CGT-TCGA