lowQualScore                  :                                                                        111               
lowQualScore                  :     000 000              0           0         0                  0  0 333 1111  0       
lowQualScore                  :     ... ...              .           .         .                  .  . ... ....  .       
lowQualScore                  :     777 777              4           4         4                  4  8 333 4444  4       
consensus                     : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
Reference ( gi|62786 )        : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62804                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62801                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62800                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62792                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62787                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62854                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62819                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62910                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62905                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62784                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-C-T----TT-TGTATTC
gi|62921                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62918                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62753                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62750                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62851                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-C-T-T----TT-TGTATTC
gi|62738                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-A-T----TT-TGTATTC
gi|62731                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62816                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62806                      : CTTC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62739                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62894                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATT
gi|62908                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----GT-TGTATTC
gi|62797                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-TTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62870                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62869                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTTCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62866                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGTTGTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-T-T----TT-TGTATTC
gi|62772                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATTC
gi|62768                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-A----TT-TGTATTC
gi|62876                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62872                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62778                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62820                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAATTC-TT-G-C-T----TC-TGTATTC
gi|62773                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62757                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62807                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-G-T----TT-TGTATTC
gi|62814                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-T----TT-TGTATTC
gi|62881                      : CTCC---T---AGGCAACTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62789                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAAATC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62732                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG-TTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62817                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62811                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62805                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62833                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62760                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----CT-TGTATTC
gi|62843                      : CTCC---T---AGGCACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62909                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCCCACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TTGTGTATTC
gi|62777                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTCTTT-T-T-T----TT-TGTATTC
gi|62733                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG--TGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62874                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGAGG-TCCGTGTTTTTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62762                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTTTTC
gi|62907                      : CTCC---C---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-T-TATTC
gi|62788                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TT-TGTATTC
gi|62849                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-
gi|62835                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-ACCTCTGGTGC-ATCCAGGAG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTCgtctt
gi|62841                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGAG-TCCGTGTTTGTCCAACCC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62865                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCA-ACCTCTGGTGT-GTTCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62832                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCC-ACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62815                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCACCTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62917                      : CTCC---T---AGGCACCCGATCCC-ACCTCTGGTGT-ACCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTA-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62752                      : CCCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTACCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62785                      : CTCC---T---AGGCACATGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62754                      : CTCC---T---AAGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCAAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62726                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTATGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62902                      : CTGC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGACCATCTC-TT-G-G-T----TT-TGCATTC
gi|62813                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAC-GTCCATGGA-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62824                      : CTCC---C---AGGCATTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62782                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTTTGGTAT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62871                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCACAACCC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62742                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-TAAAATT-TGCATTC
gi|62771                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTT-TT-A---A----TT-AGTATTC
gi|62828                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCTAACTC-TT-A---T----AT-TGTATTC
gi|62796                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-ATCTTGTTTGTCCAACGC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62885                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCCGGTGT-ATCCAGGGGTTCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT---T-T----TT-TGTATT
gi|62855                      : CTCC---T---AGATACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAATTC-TT-A---T----TT-CGTATTC
gi|62846                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTGT-ATCCAGGGG--GCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---T----TT-TGTATTC
gi|62727                      : CTCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCTGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-A---A----TC-TGTATTC
gi|62808                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGAG-TCCATGTTTGCCCAACTC-AT-A---C----TT-TGTGTTC
gi|62848                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-ACCTCTGTTGT-ATCCAGGGG-CCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-C-T----TT-C-TATTC
gi|62830                      : CTCC---T---AGGTACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-CTC-TGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62721                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-GCCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62837                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGAGG-CCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TC-T-CATTC
gi|62774                      : CTCC---T---AGACACCTGATACC-ACCCCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTACTC
gi|62862                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGCGG-TTCGTGTCTGCCCAACTC-TT---T-A----TT-T-TATTC
gi|62749                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTTTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCCTCTC-TT-A---A----CT-TGTATTC
gi|62725                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGT-T-ATCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCACCTC-TT-A---A----TT-CGTATT
gi|62844                      : CTCC---T---AGGTACCTTATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGC-T-CGTGTTTGTCCAACTC-TT-A-A-T----TT-
gi|62722                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-AGCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-GTCGTGTTTGTCCATTTC-TC-A---A----TT-TGTATTCatagtc
gi|62892                      : CCCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTTTAGTAT-GTCCAGGGG-GTTGTGTTTGTCCAGCTC----G-TAA----TT-TGTATTC
gi|62744                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCAC-ACCTCTGATAT-ATCCATGGG-CCCATGTTTGCCCATTTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62861                      : CTCCCCGT---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTCCCCG--TC-TT---T-TAA--TG-TGTATTC
gi|62889                      : CTCA---T---ATGCACCTGATCTC-GCCCCTGGTAT-ATCCA-GGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62818                      : CTTC---T---AAGCACCTTATTCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGGTC-TCCATGTTTGCCCATCTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62793                      : CTCC---TGCAAAGCACCTAATCCC-ACCTCTCGTAT-GTCCAGGGG-TTCGCGTATGTCCTTCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|63222                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|63223                      :  TCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCATCTC-TT-G-T-T----TT-T-TATT
gi|63221                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT-A-T-T----
gi|63273                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TA-TGTATTCcatgttc
gi|63270                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TTAA-A-A----TT-TGCATTC
gi|63281                      :     ---T---AAGTAGCTGATCCC-ACCTAGGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TTAG--------TT-TGTATTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                        111               
lowQualScore                  :     000 000              0           0         0                  0  0 333 1111  0       
lowQualScore                  :     ... ...              .           .         .                  .  . ... ....  .       
lowQualScore                  :     777 777              4           4         4                  4  8 111 4444  4       
consensus                     : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
Reference ( family-46 )       : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62721                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-GCCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62722                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-AGCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-GTCGTGTTTGTCCATTTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62725                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGT-T-ATCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCACCTC-TT-A---A----TT-CGTATT
gi|62726                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTATGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62727                      : CTCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCTGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-A---A----TC-TGTATTC
gi|62731                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62732                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG-TTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62733                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG--TGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62738                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-A-T----TT-TGTATTC
gi|62739                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62742                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-TAAAATT-TGCATTC
gi|62744                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCAC-ACCTCTGATAT-ATCCATGGG-CCCATGTTTGCCCATTTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62749                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTTTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCCTCTC-TT-A---A----CT-TGTATTC
gi|62750                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62752                      : CCCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTACCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62753                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62754                      : CTCC---T---AAGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCAAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62757                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62760                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----CT-TGTATTC
gi|62762                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTTTTC
gi|62768                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-A----TT-TGTATTC
gi|62771                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTT-TT-A---A----TT-AGTATTC
gi|62772                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATTC
gi|62773                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62774                      : CTCC---T---AGACACCTGATACC-ACCCCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTACTC
gi|62777                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTCTTT-T-T-T----TT-TGTATTC
gi|62778                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62782                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTTTGGTAT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62784                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-C-T----TT-TGTATTC
gi|62785                      : CTCC---T---AGGCACATGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62786                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62787                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62788                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TT-TGTATTC
gi|62789                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAAATC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62792                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62793                      : CTCC---TGCAAAGCACCTAATCCC-ACCTCTCGTAT-GTCCAGGGG-TTCGCGTATGTCCTTCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62796                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-ATCTTGTTTGTCCAACGC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62797                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-TTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62800                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62801                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62804                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62805                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62806                      : CTTC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62807                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-G-T----TT-TGTATTC
gi|62808                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGAG-TCCATGTTTGCCCAACTC-AT-A---C----TT-TGTGTTC
gi|62811                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62813                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAC-GTCCATGGA-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62814                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-T----TT-TGTATTC
gi|62815                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCACCTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62816                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62817                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62818                      : CTTC---T---AAGCACCTTATTCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGGTC-TCCATGTTTGCCCATCTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62819                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62820                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAATTC-TT-G-C-T----TC-TGTATTC
gi|62824                      : CTCC---C---AGGCATTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62828                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCTAACTC-TT-A---T----AT-TGTATTC
gi|62830                      : CTCC---T---AGGTACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-CTC-TGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62832                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCC-ACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62833                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62835                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-ACCTCTGGTGC-ATCCAGGAG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62837                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGAGG-CCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TC-T-CATTC
gi|62841                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGAG-TCCGTGTTTGTCCAACCC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62843                      : CTCC---T---AGGCACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62844                      : CTCC---T---AGGTACCTTATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGC-T-CGTGTTTGTCCAACTC-TT-A-A-T----TT-
gi|62846                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTGT-ATCCAGGGG--GCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---T----TT-TGTATTCatagtc
gi|62848                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-ACCTCTGTTGT-ATCCAGGGG-CCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-C-T----TT-C-TATTC
gi|62849                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-
gi|62851                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-C-T-T----TT-TGTATTCgtctt
gi|62854                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62855                      : CTCC---T---AGATACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAATTC-TT-A---T----TT-CGTATTC
gi|62861                      : CTCCCCGT---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTCCCCG--TC-TT---T-TAA--TG-TGTATTC
gi|62862                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGCGG-TTCGTGTCTGCCCAACTC-TT---T-A----TT-T-TATTC
gi|62865                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCA-ACCTCTGGTGT-GTTCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62866                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGTTGTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-T-T----TT-TGTATTC
gi|62869                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTTCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62870                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62871                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCACAACCC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62872                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62874                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGAGG-TCCGTGTTTTTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62876                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62881                      : CTCC---T---AGGCAACTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62885                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCCGGTGT-ATCCAGGGGTTCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT---T-T----TT-TGTATT
gi|62889                      : CTCA---T---ATGCACCTGATCTC-GCCCCTGGTAT-ATCCA-GGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62892                      : CCCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTTTAGTAT-GTCCAGGGG-GTTGTGTTTGTCCAGCTC----G-TAA----TT-TGTATTC
gi|62894                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATT
gi|62902                      : CTGC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGACCATCTC-TT-G-G-T----TT-TGCATTC
gi|62905                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62907                      : CTCC---C---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-T-TATTC
gi|62908                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----GT-TGTATTC
gi|62909                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCCCACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TTGTGTATTC
gi|62910                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62917                      : CTCC---T---AGGCACCCGATCCC-ACCTCTGGTGT-ACCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTA-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62918                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62921                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|63221                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT-A-T-T----
gi|63222                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTCcatgttc
gi|63223                      :  TCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCATCTC-TT-G-T-T----TT-T-TATT
gi|63270                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TTAA-A-A----TT-TGCATTC
gi|63273                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TA-TGTATTC
gi|63281                      :     ---T---AAGTAGCTGATCCC-ACCTAGGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TTAG--------TT-TGTATTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                        111               
lowQualScore                  :     000 000              0           0         0                  0  0 333 1111  0       
lowQualScore                  :     ... ...              .           .         .                  .  . ... ....  .       
lowQualScore                  :     777 777              4           4         4                  4  8 111 4444  4       
consensus                     : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
Reference ( family-46 )       : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62721                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-GCCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62722                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-AGCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-GTCGTGTTTGTCCATTTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62725                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGT-T-ATCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCACCTC-TT-A---A----TT-CGTATT
gi|62726                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTATGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62727                      : CTCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCTGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-A---A----TC-TGTATTC
gi|62731                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62732                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG-TTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62733                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG--TGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62738                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-A-T----TT-TGTATTC
gi|62739                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62742                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-TAAAATT-TGCATTC
gi|62744                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCAC-ACCTCTGATAT-ATCCATGGG-CCCATGTTTGCCCATTTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62749                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTTTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCCTCTC-TT-A---A----CT-TGTATTC
gi|62750                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62752                      : CCCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTACCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62753                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62754                      : CTCC---T---AAGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCAAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62757                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62760                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----CT-TGTATTC
gi|62762                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTTTTC
gi|62768                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-A----TT-TGTATTC
gi|62771                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTT-TT-A---A----TT-AGTATTC
gi|62772                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATTC
gi|62773                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62774                      : CTCC---T---AGACACCTGATACC-ACCCCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTACTC
gi|62777                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTCTTT-T-T-T----TT-TGTATTC
gi|62778                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62782                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTTTGGTAT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62784                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-C-T----TT-TGTATTC
gi|62785                      : CTCC---T---AGGCACATGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62786                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62787                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62788                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TT-TGTATTC
gi|62789                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAAATC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62792                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62793                      : CTCC---TGCAAAGCACCTAATCCC-ACCTCTCGTAT-GTCCAGGGG-TTCGCGTATGTCCTTCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62796                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-ATCTTGTTTGTCCAACGC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62797                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-TTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62800                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62801                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62804                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62805                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62806                      : CTTC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62807                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-G-T----TT-TGTATTC
gi|62808                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGAG-TCCATGTTTGCCCAACTC-AT-A---C----TT-TGTGTTC
gi|62811                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62813                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAC-GTCCATGGA-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62814                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-T----TT-TGTATTC
gi|62815                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCACCTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62816                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62817                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62818                      : CTTC---T---AAGCACCTTATTCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGGTC-TCCATGTTTGCCCATCTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62819                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62820                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAATTC-TT-G-C-T----TC-TGTATTC
gi|62824                      : CTCC---C---AGGCATTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62828                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCTAACTC-TT-A---T----AT-TGTATTC
gi|62830                      : CTCC---T---AGGTACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-CTC-TGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62832                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCC-ACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62833                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62835                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-ACCTCTGGTGC-ATCCAGGAG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62837                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGAGG-CCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TC-T-CATTC
gi|62841                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGAG-TCCGTGTTTGTCCAACCC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62843                      : CTCC---T---AGGCACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62844                      : CTCC---T---AGGTACCTTATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGC-T-CGTGTTTGTCCAACTC-TT-A-A-T----TT-
gi|62846                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTGT-ATCCAGGGG--GCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---T----TT-TGTATTCatagtc
gi|62848                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-ACCTCTGTTGT-ATCCAGGGG-CCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-C-T----TT-C-TATTC
gi|62849                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-
gi|62851                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-C-T-T----TT-TGTATTCgtctt
gi|62854                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62855                      : CTCC---T---AGATACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAATTC-TT-A---T----TT-CGTATTC
gi|62861                      : CTCCCCGT---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTCCCCG--TC-TT---T-TAA--TG-TGTATTC
gi|62862                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGCGG-TTCGTGTCTGCCCAACTC-TT---T-A----TT-T-TATTC
gi|62865                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCA-ACCTCTGGTGT-GTTCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62866                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGTTGTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-T-T----TT-TGTATTC
gi|62869                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTTCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62870                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62871                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCACAACCC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62872                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62874                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGAGG-TCCGTGTTTTTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62876                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62881                      : CTCC---T---AGGCAACTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62885                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCCGGTGT-ATCCAGGGGTTCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT---T-T----TT-TGTATT
gi|62889                      : CTCA---T---ATGCACCTGATCTC-GCCCCTGGTAT-ATCCA-GGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62892                      : CCCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTTTAGTAT-GTCCAGGGG-GTTGTGTTTGTCCAGCTC----G-TAA----TT-TGTATTC
gi|62894                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATT
gi|62902                      : CTGC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGACCATCTC-TT-G-G-T----TT-TGCATTC
gi|62905                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62907                      : CTCC---C---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-T-TATTC
gi|62908                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----GT-TGTATTC
gi|62909                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCCCACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TTGTGTATTC
gi|62910                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62917                      : CTCC---T---AGGCACCCGATCCC-ACCTCTGGTGT-ACCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTA-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62918                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62921                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|63221                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT-A-T-T----
gi|63222                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTCcatgttc
gi|63223                      :  TCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCATCTC-TT-G-T-T----TT-T-TATT
gi|63270                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TTAA-A-A----TT-TGCATTC
gi|63273                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TA-TGTATTC
gi|63281                      :     ---T---AAGTAGCTGATCCC-ACCTAGGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TTAG--------TT-TGTATTC


blockSeqs                     :                                                                        TT  AAAA
blockSeqs                     :                                                                        TA  AA  
blockSeqs                     :                                                                        TT  .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        A   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        C   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        A   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        G   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        C   .   
blockSeqs                     :                                                                        A   .   
blockSeqs                     :                                                                        A   .   
blockSeqs                     :                                                                        C   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        G   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        A   .   
blockSeqs                     :                                                                        T   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   
blockSeqs                     :                                                                        .   .   


blockSeqCons                  :                                                                        T**
originalCons                  : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
finalCons                     : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GT--T----TT-TGTATTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                        111               
lowQualScore                  :     000 000              0           0         0                  0  0 333 1111  0       
lowQualScore                  :     ... ...              .           .         .                  .  . ... ....  .       
lowQualScore                  :     777 777              4           4         4                  4  8 111 4444  4       
consensus                     : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
Reference ( family-46 )       : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62721                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-GCCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62722                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-AGCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-GTCGTGTTTGTCCATTTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62725                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGT-T-ATCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCACCTC-TT-A---A----TT-CGTATT
gi|62726                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTATGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62727                      : CTCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCTGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-A---A----TC-TGTATTC
gi|62731                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62732                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG-TTGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62733                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTG--TGCCCATCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62738                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-A-T----TT-TGTATTC
gi|62739                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62742                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-TAAAATT-TGCATTC
gi|62744                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCAC-ACCTCTGATAT-ATCCATGGG-CCCATGTTTGCCCATTTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62749                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTTTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCCTCTC-TT-A---A----CT-TGTATTC
gi|62750                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62752                      : CCCC---T---AAGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTACCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62753                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62754                      : CTCC---T---AAGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCAAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62757                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62760                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----CT-TGTATTC
gi|62762                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTTTTC
gi|62768                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-A----TT-TGTATTC
gi|62771                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTT-TT-A---A----TT-AGTATTC
gi|62772                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATTC
gi|62773                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAAGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62774                      : CTCC---T---AGACACCTGATACC-ACCCCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTACTC
gi|62777                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTCTTT-T-T-T----TT-TGTATTC
gi|62778                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62782                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTTTGGTAT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62784                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-C-T----TT-TGTATTC
gi|62785                      : CTCC---T---AGGCACATGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62786                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62787                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62788                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TT-TGTATTC
gi|62789                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAAATC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62792                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62793                      : CTCC---TGCAAAGCACCTAATCCC-ACCTCTCGTAT-GTCCAGGGG-TTCGCGTATGTCCTTCTC-TT-A---A----TT-TGTATT
gi|62796                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-ATCTTGTTTGTCCAACGC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62797                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-TTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62800                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62801                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62804                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62805                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62806                      : CTTC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62807                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-G-T----TT-TGTATTC
gi|62808                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGAG-TCCATGTTTGCCCAACTC-AT-A---C----TT-TGTGTTC
gi|62811                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62813                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAC-GTCCATGGA-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62814                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT---T-T----TT-TGTATTC
gi|62815                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCACCTC-TT-G-T-T----TT-
gi|62816                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62817                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62818                      : CTTC---T---AAGCACCTTATTCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGGTC-TCCATGTTTGCCCATCTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62819                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62820                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAATTC-TT-G-C-T----TC-TGTATTC
gi|62824                      : CTCC---C---AGGCATTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGATTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62828                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTAGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCTAACTC-TT-A---T----AT-TGTATTC
gi|62830                      : CTCC---T---AGGTACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-CTC-TGTTTGCCCAACTC-TT-A---A----TT-TGTATTC
gi|62832                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACATCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCC-ACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62833                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCATGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62835                      : CTCC---T---AGGCACCTGACCCC-ACCTCTGGTGC-ATCCAGGAG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62837                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTAGTAT-ATCCAGAGG-CCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-A-T----TC-T-CATTC
gi|62841                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGAG-TCCGTGTTTGTCCAACCC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62843                      : CTCC---T---AGGCACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62844                      : CTCC---T---AGGTACCTTATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGC-T-CGTGTTTGTCCAACTC-TT-A-A-T----TT-
gi|62846                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTGT-ATCCAGGGG--GCGTGTTTGCCCAGCTC-TT-A---T----TT-TGTATTCatagtc
gi|62848                      : CTCC---T---AAGCATCTGATCCC-ACCTCTGTTGT-ATCCAGGGG-CCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-C-T----TT-C-TATTC
gi|62849                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-
gi|62851                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-C-T-T----TT-TGTATTCgtctt
gi|62854                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATT
gi|62855                      : CTCC---T---AGATACCTGATTCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAATTC-TT-A---T----TT-CGTATTC
gi|62861                      : CTCCCCGT---AGGCACCTGATCCT-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTCCCCG--TC-TT---T-TAA--TG-TGTATTC
gi|62862                      : CTCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGCGG-TTCGTGTCTGCCCAACTC-TT---T-A----TT-T-TATTC
gi|62865                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCA-ACCTCTGGTGT-GTTCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62866                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGTTGTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-A-T-T----TT-TGTATTC
gi|62869                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTTCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62870                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-AACTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62871                      : CTCC---T---AGGCATCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCACAACCC-TT-G---T----TT-TGTATT
gi|62872                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62874                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-GTCCAGAGG-TCCGTGTTTTTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62876                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGATTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62881                      : CTCC---T---AGGCAACTGATCCC-ACTTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62885                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCCGGTGT-ATCCAGGGGTTCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT---T-T----TT-TGTATT
gi|62889                      : CTCA---T---ATGCACCTGATCTC-GCCCCTGGTAT-ATCCA-GGG-TCCGTGTTTGCCCATCTC-TC-A---A----TT-TGTATTC
gi|62892                      : CCCC---T---AGACACCTGATCCC-ACCTTTAGTAT-GTCCAGGGG-GTTGTGTTTGTCCAGCTC----G-TAA----TT-TGTATTC
gi|62894                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-GTT-T----TT-TGTATT
gi|62902                      : CTGC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGACCATCTC-TT-G-G-T----TT-TGCATTC
gi|62905                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACCC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62907                      : CTCC---C---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-T-TATTC
gi|62908                      : CTCC---T---GGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----GT-TGTATTC
gi|62909                      : CTCC---T---AAGCACCTGATCCCCACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TTGTGTATTC
gi|62910                      : CTCC---T---AGGCACCTGGTCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62917                      : CTCC---T---AGGCACCCGATCCC-ACCTCTGGTGT-ACCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTA-TT-G---T----TT-TGTATTC
gi|62918                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCTCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|62921                      : CTCC---T---AGGCACCTGATCTC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTC
gi|63221                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCGC-ACCTCTGGTGT-ATCCAGGGG-TCCGTGTTTGTCCAGCTC-TT-A-T-T----
gi|63222                      :  TCC---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TCCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TT-TGTATTCcatgttc
gi|63223                      :  TCC---T---AGGCACTTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCTAGGGG-TCCGTGTTTGTCCATCTC-TT-G-T-T----TT-T-TATT
gi|63270                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTAT-ATCCAGGGG-TCTGTGTTTGCCCAGCTC-TTAA-A-A----TT-TGCATTC
gi|63273                      :    C---T---AGGCACCTGATCCC-ACCTCTGGTGT-GTCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TT-G-T-T----TA-TGTATTC
gi|63281                      :     ---T---AAGTAGCTGATCCC-ACCTAGGGTGT-ATCCAGGGG-TTCGTGTTTGCCCAACTC-TTAG--------TT-TGTATTC