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lowQualScore                  :     0      1 2 2 99999999999999999999999999999999999999999999  1    333  1 1   000 2  33333   3333 1   11 555  44 2 1 1   1 1  1 1 33 8888888888 11 2 0 3 11   11  44444444444 1 11 77  1 8 1  4   111   22  1   222  1 999999 11 11 999   7777777  222222 3     1  3  55 2 55     
lowQualScore                  :     .      . . . ............................................  .    ...  . .   ... .  .....   .... .   .. ...  .. . . .   . .  . . .. .......... .. . . . ..   ..  ........... . .. ..  . . .  .   ...   ..  .   ...  . ...... .. .. ...   .......  ...... .     .  .  .. . ..     
lowQualScore                  :     7      4 8 8 33333333333333333333333333333333333333333333  1    000  1 1   111 1  33333   3333 1   44 666  44 0 0 0   0 0  0 0 44 8888888888 33 8 9 7 33   33  44444444444 9 33 33  0 3 0  1   888   88  1   111  2 333333 88 88 000   2222222  444444 6     8  6  99 9 44     
consensus                     :  TTATTCTTTG-A-A-G-----AGT---CA--A---G-A--CG--AA-TAT-A--C-TAT-CA-GGGC---AA-G-GTA-N-A-GGA----CCC----C-CAG--GA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG-GGG--G--T-CGGGA-------CA--G-A-T-TTCGAGTCCCT-AT-TT-CCACT
Reference ( gi|107101 )       :  TTATTCTTTG-A-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--GA-TAT-A--C-TAT-CA-GGGC---AA-G-GTA-C-A-GGA----CCC----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TA-TA-GTG-GT-ACC---ACCC-GG-TGG---CT-CACG-GTG--G--T-CGGGA-------CA--G-G-T-TTCGAATCCCT-CT-TC-CTACT
gi|107103                     :  TTATTCTTTG-A-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--GA--ATGA--C-TAT-CA-GGGC---AC-G-GTA-C-A-GAA----CCC----C-CAG--GA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A-G-A--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GTG-GT-ACC---ATCC-GG-TGG---CT-CACG-G-G--G--T-CGGGA-------GA--G-A-T-TTCGACTCCCT-AT-TT-CTACT
gi|107102                     :  TTATTCTTTG-G-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--GA-CAT-A--C-TAT-CA-GGGC---AA-G-GTA-C-A-GGA----CCC----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A-G-T--TTT--GG-----------G-C--TG-TA-GTG-GT-ACT---ACCC-AG-TGG---CT-CCTG-GGG--G--T-TTGGA-------CA--G-A-T-TTTGATTCTCT-AT-TT-CTACT
gi|107104                     :  TTATTCTTTG-A-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--GA--ATGA--C-AAT-CA-GGGC---AA-G-GTA-C-A-GGA----TCC----C-CAG--GA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A-G-A--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GCC-GTAAAA---ATCC-GG-TGG---CT-CACG-GGG--G--T-GGGGA-------CA--G-A-G-TTCGACTCTCT-AT-TT-CTACT
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gi|107105                     :  TTATTCTT-G-A-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--GA--ATGA--C-TAT-CACGGGC---A--G-GTA-C-A-G-A----CCC----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A-G-T--TTG--TG-----------G-C--TG-TA-GTG-GT-ATC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG---G--G--T-C-GGA-------CC--G-A-T-TTTGAGTCTCT-AT-CT-CCACTatgctccact
gi|107108                     : tTTATTCTTGA-A-A-G-----A-----CA--AA--G-A--CG--AA--AT-G--A-CAC-CA-GG-C---AA-G-GTA-C-A-GGT----ACC----C-CA---GG--CTA-A-T-C-ATT-T-CC-C-G--CTT-----T--T--C-A-GTT--TTG--GG-----------GTC--TG-TA-GTG-GT-ACC---ACCC--G-TGG---CT-CCCG-G-G--G--TCCCGGA-------CA--G-A-TGTTCGACTCCCTAAT-TT-CTACT
gi|107107                     :  TTATTCTTGA-A-A-G-----A-----CA--AA--G-A--CG--AA--AT-G--A-CAC-CA-GG-C---AA-G-GTA-C-A-GGT----ACC----C-CA---GG--CTA-A-T-C-ATT-T-CC-C-G--CTT-----T--T--C-A-GTT--TTG--GG-----------GTC--TG-TA-GTG-GT-ACC---ACCC--G-TGG---CT-CCCG-G-G--G--TCCCGGA-------CA--G-A-TGTTCGACTCCCTAAT-TT-CTACT
gi|107110                     :  TTAATGTTTG-A-A-G-----AGT---CA--A---T--------GA-AATGA--G-TAT-GG-AGGC---AC-G-ATA-A-G-GGG----CTC----C-CAG--GA--CC--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-A--TG-TA-GGG-GT-ACC---AC----G-TGGGACCT-CAAG-A-G--G--G-CAGGAC------CA--C-A-T-TTCAGACCACT-
gi|107114                     :  TTACCCTTTGGA-A-G-----AGT---CA--A---C-A--AA--AA-TG--A--G-TAG-CA-AGGT---AA-G-A-A-CGA-GGG----CTCA---C-CAG--GG--CCTCA-T-C-ATT-T-TC-C-A--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GCG-GT-at
gi|107117                     :  TTAATCTTTG-A-A-G-----AGTC--CA--C---G-A------AA-CA--A--G-CAT-CA-AGGC---AA-G-GTT-G-G-GGA----CCC----C-T-G--AA--CT--A-T-T-TTT-T-CT-C-A--C----------T--C-A-A-T--TT---GG-----------G-C--TG-TA-TTGTGT-ACT---TCCT-GG-
gi|107119                     :  TTAATCATTG-A-A-G-----AATGAACA--A---G-A--TG---------A--G-CAT-CG-AAGC---AA-G-GCA-G-G-GGG----CCT----C-TTG--GA--CA--A---C-ATT-T-CC-C-G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GA-----------G-
gi|107120                     :  TTAATCTTTG-A-A-T-----A------A--A---A-A--C----A-TAC-A--C----------------A-G-TTT-A-A-AGA----CCC----C-TTG--AA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-T-G--T-C-----C--T--C-A-G-T--TCG--GG-----------G-A--TG-TA-GGG-Gatgca
gi|107121                     :   TAATCTTTG-A-A-G-----AGTC--CA--C---G-A--AA--GAGTAT-G--C--------AGGC---AA-G-ATA-G-G-GGG----CTA----C-CAG--AA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-GTCC-TCAGTCC--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TG-GGG-AT-ACT---ACC
gi|107123                     :    ATTCTT-G-A-A-G-----A-----CA--A---G-A--CG--AA-TG--A----TAT-CA-GGGCC--AA-G-GTA-C-A-GGAC---CCC----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CA-C-G--C-------T--T--C-A-G-T--TT---AG-----------G-C--TGTTA-ATT-GT-ACC---ACCC-GGTTGG---CT-CCCG-G-G--G--T-T-GGA-------CC--G-A-T-TTCGAGTCTCT-CTATCTCCACT
gi|107129                     :    ATTCTT-G-A-A-G-----A-----CA--A---GAA--CGACAA-AATGA--C-TAT-CA-GGAC---AA---GTA-C-A-GA-------C----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--TTCC-A-G-TTCTTG--GA-----------G-C--
gi|107124                     :      TCTTTG-A-A-GTGT--G-----CATCA---A-A--CG--AA-TAC----------CG-GGGC---AA-G-GTA-A-G-GGA----CAC----A-TAG--A---CT--A-T-C-ATT---CC-C-G--C-C-----T--T--CCA-A-T--TTG--GG-------------C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCT-GG-TGG---CT-CCCT-GGG--G--T-CGGGACACTTTTCA--G-GCT-TTCGTATC-------TC-CTACattgta
gi|107126                     :     aTCTTTG-A-A-GTGT--G-----CATCA---A-A--CG--AA-AAC-A---------A-GGGC---AA-A-GTA-A-G-GGA----CAC----A-TAA--GA--CT--A-T-C-ATT-C-CC-C-GC-C-T-----T--C--C-A-A-T--TT---GG-----------G-C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCT-GG-TGA------CACT-TTGGAG--T-C-GGA-------CA--T-T-T-TTC
gi|107125                     :     aTCTTTG-A-A-GTGTGAA-----TC--A---A-A--CG--AA-TAC----------CG-GGGC---AA-G-GTA-A-G-GGA----CAC----A-TTG--GA--CT--A-T-G-AT-------------------------------------A--GG-----------G-A--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCT-GG-TGG---CT-CCCT-GGG--G--T--GGGA-------Caggctttcatatctcctac
gi|107109                     :      aCTTTA-A-A-G-----AGT---CA--AC--G-AAGTG--AA-TAT-G--C------A-GGG----AA-G-ATA-G-A-GGG----CTC----C-CAG--GA--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-C-----C--T--C-C-GTT--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-G-G-GT-ACC---ACCT--G-TGG---CTCCAAG-AGG--G--T-GGGGC-------CA--C-A-T-TTCAAACCCCT-cacttttcagtttatcgtatctcctac
gi|107111                     :  tttacCTTTG-A-AAG-----AGT---CA--C---G-A------AA-TA--A--G-TATGCG-AGGT---GA-G-ATA-G-A-GGG----CTC----C-CAG--A---CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-C-----C--T--CGA-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-AAG-GT-ACC---ACCA-GG-TGG---CC-Cat
gi|107128                     :  tttacCTTTG-A-A-G-----AGT---CA--A-----A--CG--AA-GAT-GAGT-TAG-CT-GCGCCGTAA-G-ATA-G-A-GGG----CTC----C-CAG--GA--CT--AGT-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----CC-T--C-A-G-T--TTGCGGG-----------G-C--TG-TA-GGG-GT-ACC---A--T-GG-GGC---CC-CAAG-AGG--GCTC-CGGGC-------CAGCG-A-T-TTCAGAGCCCG-CT-cc
gi|107112                     :     acCTTTG-A-A-G-----AGT---CA--T---G-A------AA-TA--A--G-TATGCA-GG-T---GA-G-ATA-G-A-GGG----TTC----C-CAG--GAA-CT--A-T-C-ATT-TTCC-C-G--C-C-----C--T--CGA-G-T--TTG--GG-----------A-C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ATCT-GG-GGC---CC-CAAG-AAG--G--T--GGGA-------Cat
gi|107130                     :  tttacCTTTG-A-A-G-----AGT---CA--AC--G-A--AT--GA-TAT-G--C------A-AGGC---AA-G-ATA-G-A-GGG----TTC----C-CAG--AT--TT--A-A-A-ATT-T-TC-C-GG-C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TC-CAG-GT-ACC---AACT-GG-GGC---CC-CAAGAGTG--C--T--GTGC-------CA--C-A-T-TTCAGACCCCccaaacatttcagaccctat
gi|107115                     :       CTTTG-A-A-G-----A-----GT--T---A-A--CA--AA-CAT-G--G-TAT-GA-GG-T---AA-G-AGA-G-A-GGG----CTC----T-CAA--GG--AT--AGT-C-ATT-T-CC---G--C-C-----T-----C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GTG-Gctat
gi|107118                     :  tttacCTTTG-A-A-G-----AGTT--CA--ACTAA-A--TG--AG-TAT-A--G-----CA-GACC---AA-G-A-A-G-A-GGG----CTC----C--AGAAGGTACT--A-T-C-ATT-T-TC-C-G--C-C-----C--T--T-A-A-T--TTG--GG-----------G-CTGTA-TG-GGG-GT-ACTGGGACCC-AG-AGG---
gi|107131                     :   tttacTTTG-A-AAG-----AGT---CA--A--------CG--AA-AATGA--G-TAT-GG-AGGT---AA-G---A-C-A-GGAGGGGCTC----C-CAG--AA--CTT-A-T-CCATT-T-CC---G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TT---AG-----------G-C--TG-TA-GGG-GT-ACC---TCCT-GG-GGC---CC-CAAG-A-G--G--T-GGGGC-------CA--C-T-T-TTCAGACCCgggggcgacatttcagacccttat
gi|107127                     :         TTG-A-A-GTGT--G-----CATCA---A-A--CG--GA-TGT----------CG-GGGC---AC-A-GTA-A-G-GGA----ACT----TATAG--GA--CT--A-T-C-ATTCT-CC-C-G--C-C-----T--T--C-A-A-T--T-A--GG-----------G-C--T--TA-G-G-GT-ACC---ACCT-GG-TGG---CT-CCTG---G--G--T-CGGCA-------Ctat
gi|107133                     :       atcTG-ACA-G-----A-----CA--A---G-G--TG--AA--AT-G--CATAT-GA-GGAC---AA-G-GTAAC-A--------CCA----C-C----------------C-ATT-T-GC-C----C-C-----T--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------T-C--TG-TA-GTG-GC-CCC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG-GGG--G--T-CCGGAC------CA--G-A-T-TTCGAGTCTCT-AT-CT-CCACTtttttgagctatgcgtatctcctac
gi|107132                     :          TG-ACA-G-----A-----CA--A---G-G--TG--AA--AT-G--CATAT-GA-GGAC---AA-G-GTAAC-A--------CCA----C-C----------------C-ATT-T-GC-C----C-C-----T--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------T-C--TG-TA-GTG-GC-CCC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG-GGG--G--T-CCGGAC------CA--G-A-T-TTCGAGTCTCT-AT-CT-CCACT
gi|107135                     :                               --A---A-A--TG--AG-TAT-A--C--AT-GT-AGGC---AA-G-ATA---G-GGG----TTC----C-CAG--GA--CT--A-T-C-ATA-T-TC-C-G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-T--TC-TA-GT--GT-ACC---ACTC-GG-
gi|107134                     :                            atg--A---A-A--CG--GA-----A--A-TGT-C--GGGC---AA-T-GTA-A-G-GGA----CCA----T--AG--GA--CT--A---C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--C--C-A---T--TTG--GG-------------C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCTGGG-TGG---CT-TCCT-GGG--G--T-GCGGA-------CA--gaccacccgaaggttggcac
gi|107122                     :                                                    -A--C-TATGCA-GG-C---AA-A-ATA-G-A-GGA----TCCGTAGC-TAG--GA--CT--A-T-C-ATT-T-TC-T-G--T-C-----C--T--C-AAG-T--TTG--GG-----------G-C--TA-CA-GGG-GT-ACC---ACCT-GG-GGC---CT-CCTG-AGG--G--T--GGAAC------CA--C-T-T-TTCAGATCTCT-cttttgagctatcgtatctcctac
gi|107137                     :                                               aatatttgaaggaT-CA-GGGC---AA-G-GTA-C-AAGGA----CTT----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A---T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GTG-GTAACC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG-GGG--G--T-CCGGAG------CA--GCA-T-TTTGAGTCTCT-AT-CT-CCACTa
gi|107136                     :                                                       ttaatT-CA-GGGC---AA-G-GTA-C-AAGGA----CTT----C-CAG--GG--CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-G--C-T-----T--T--C-A---T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GTG-GTAACC---ACCC-GG-TGG---CT-CCCG-GGG--G--T-CCGGAG------CA--GCA-T-TTTGAGTCTCT-AT-CT-CCACT
gi|107138                     :                                                           ttaat-GGGC---AA-G-GTA---G-GGA----CTT----A-TAG-------T----T-C-ATT-T-CC-CCG--C-TC----T--T--C-C-A-T--TTG--GG-------------C--TG-TA-GGG-GT-ACC---ACCT-G---GG---CT-CCCT-GGG--G--T-CGGAA-------CA--
gi|107116                     :                                                                  GAC---AA-G-GTA-G-A-GGA----TCC----A-CAG--GA--CT--A-T-A-GAT-T-TC-C-A--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--AG-----------G-C--AG-TA-GGA-GT-GCC---ACCT-GG-TGG---CT-CTTG-GGG--G--T-TG
gi|107139                     :                                   ttaatctacgagtccacagaagcagtatgcaGGC---AAAG-GTA---A-GGA----CTC----T--AT--AG--AT--A-TTC-ATT-T-CCGC-G--C-C-----TGTC--C-A-A-C--TTA--GG-----------G-A--TG-TA-GGG-GT--CC---ACT--GG-TGG---CT-CCCT-GGG--G--T-CGGGA-------CA--
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gi|107140                     :                                                                          ttaacctttgaaaagtcaacgaatgagaagtgag--CT--A-T-C-ATT-C-CC-C-G--C-C-----C--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TG-TA-GGG-GT-ACG---AACT-GG-GGT---CC-CAAG-Gtgggacaagagggtggggccaacatttcagtaccacctatact
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Reference ( family-453 )      :                                TTATTCTTTG-AA-G----AGT---CA--A---GA--CGA--ATAT-A--C---TAT-CA-GGGC---AA-GGT-ANA-GGA----C----CC----C-C--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-CC--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCC-GG-TGG---CT-CC-CGGGG-G---TCGGGA-C----A--G-AT-TTC-GAG---T---CC-CT-AT-TTCCACT
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gi|107130                     :                                     CTTTG-AA-G----AGT---CA--A-------CGA--ATG--A------TATGCA-AGGC---AA-GAT-AGA-GGG----T----TC----C-C--AGA-T-TT--A-A-A-ATT-T-TC-C-------GGC-CC--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------G-C--TGT-C--CAGGT-ACC---AACT-GG--GG---CC-CC-AAGAGTG---CTGTGC-C----A--C-AT-TTCAGAC---C---CC-CT-AT-
gi|107131                     :                                      TTTG-AAAG----AGT---CA--A-------CGA--AAATGA--G---TAT-GG-AGGT---AA-G---ACA-GGAGGGGC----TC----C-C--AGA-A-CTT-A-T-CCATT-T-CC---------G-C-CC--T--C-A-G-T--TTA--GG-------------C--TGT-A--GGGGT-ACC---TCCT-GG--GG---CC-CC-AAGAG-G---TGGGGC-C----A--C-TT-TTC--AG---A---CC-CT-AT-
gi|107132                     :                                               ----AGA---CA--A---GG--TGA--A-AT-G--CA--TAT-GA-GGAC---AA-GGT-AAC---A----C----CA----C-C----------------C-ATT-T-GC-C---------C-CT--T--C-A-G-T--TTG--GG-----------T-C--TGT-A--GTGGC-CCC---ACCC-GG-TGG---CT-CC-CGGGG-G---TCCGGACC----A--G-AT-TTC-GAG---T---CT-CT-AT-CTCCACT
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Reference ( family-453 )      :                                TTATTCTTTG-AA-G----AGT---CA--A---GA--CGA--ATAT-A--C---TAT-CA-GGGC---AA-GGT-A-GA--GGAC----CC----C-C--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCC-GGT-GG---CT-CC-CGGGG-G---TCGGGA-C----A--G-AT-TTC-GAG---T---CC-CT-AT-CTCCACT
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gi|107111                     :                                     CTTTG-AAAG----AGT---CA--C---GA----A--ATA--A--G---TATGCG-AGGT---GA-GAT-A-GA--GGGC----TC----C-C--AG--A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-CC--T--CGA-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--AAGGT-ACC---ACCA-GGT-GG---CC-CC-C
gi|107112                     :                                tttacCTTTG-AA-G----AGT---CA--T---GA----A--ATA--A--G---TATGCA-GG-T---GA-GAT-A-GA--GGGT----TC----C-C--AGG-AACT--A-T-C-ATT-TTCC-C-------G-C-CC--T--CGA-G-T--TT--GGG-----------A-C--TGT-A--GGGGT-ACC---ATCT-GG--GG---CC-CC-AAGAA-G---GTGGGA-CCCAAA--C-AT-TTC--AG---A---CC-CT-AT-
gi|107113                     :                           tttacTTAACCTTTG-AA-A----AGT---CA--A-------CGA--AT-----------------GAG----AA-GTG-A-GA--GGGC----TC----C-C--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-CC--T--C-A-GTT--TT--GGG-----------G-C--TGT-AT-GGGGT-A-----ACC---AT-GG---GA-CA-AGAGG-G---TGGGGC-C----A--ACAT-TTC--AG---T---AC-C--AC-CTATACT
gi|107114                     :                                TTACCCTTTGGAA-G----AGT---CA--A---CA--AAA--ATG--A--G---TAG-CA-AGGT---AA-GAA-C-GA--GGGC----TCA---C-C--AGG-G-CCTCA-T-C-ATT-T-TC-C-------A-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GCGGT-
gi|107115                     :                                     CTTTG-AA-G----AGT---TA--A-------CAA--ACAT-G--G---TAT-GA-GG-T---AA-GAG-A-GA--GGGC----TC----T-C--AAG-G-AT--AGT-C-ATT-T-CC---------G-C-C---T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GTGG
gi|107116                     :                                                                                         tttacGAC---AA-GGT-A-GA--GGAT----CC----A-C--AGG-A-CT--A-T-A-GAT-T-TC-C-------A-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GAG-----------G-C--AGT-A--GGAGT-GCC---ACCT-GGT-GG---CT-CT-TGGGG-G---TTG
gi|107117                     : ttaatctacgagtccacagaagcagtatgcaTTAATCTTTG-AA-G----AGT---CC--A-------CGA--A----A--CAAGCAT-CA-AGGC---AA-GGT-T-GG--GGAC----CC----C-T---GA-A-CT--A-T-T-TTT-T-CT-C-------A----C--T--C-A-A-T--TT---GG-----------G-C--TGT-AT-TGTGT-ACT---TCCT-GG
gi|107118                     :                                     CTTTG-AA-G----AGTT--CA--ACTAAA--TGA--GTAT-A--G-------CA-GACC---AA-GA--A-GA--GGGC----TC----C-AGAAGGTA-CT--A-T-C-ATT-T-TC-C-------G-C-CC--T--T-A-A-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-ATGGGGGT-ACTGGGACCC-AGA-GG----------GGGG-G---C---GA-C---------AT-TTC-AGA---C---CC-TT-AT-
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gi|107120                     :                                TTAATCTTTG-AA-T----A------A--A---AA--C----ATAC-A--C------------------A-GTT-T-AA--AGAC----CC----C-T--TGA-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-T-------G-T-CC--T--C-A-G-T--TC--GGG-----------G-A--TGT-A--GGGG
gi|107121                     :                                 TAATCTTTG-AA-G----AGT---CC--A-------CGA--A-AG-A--G---TATGCA-GG-C---AA-GAT-A-GG--GGGC----TA----C-C--AGA-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-CGTCCTCAG-T-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-G--GGGAT-ACT---ACC
gi|107122                     :                                                                              -A--C---TATGCA-GG-C---AA-AAT-A-GA--GGAT----CCGTAGC-T--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-TC-T-------G-T-CC--T--C-AAG-T--TT--GGG-----------G-C--TAC-A--GGGGT-ACC---ACCT-GGG-GC---CT-CC-TGAGG-G---T-GGAACC----A--C-TT-TTC-AGA---T---CT-CT-A
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lowQualScore                  :                                   1      4  8 7777 44444  22 5555 00   77 777777777777777  1  6 777  0   0 22 33  1 44444 0000 5555   0 0  33 9 0 0   0 0  0 1111111 0 9 666 66 6 9 6 22  22   6666666666666 22   9 11     0   888   44  44  999  1  1 4   1 999 99   3 6666 6666  6   11  6666666  6  6  3       
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Reference ( family-453 )      :                                TTATTCTTTG-AA-G----AGT---CA--A---GA--CGA--ATAT-A--C---TAT-CA-GGGC---AA-GGT-A-GA--GGAC----CC----C-C--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCC-GGT-GG---CT-CC-CGGGG-G---TCGGGA-C----A--G-AT-TTC-GAG---T---CC-CT-AT-CTCCACT
gi|107101                     :                                TTATTCTTTG-AA-G----A-----CA--A---GA--CGG--ATAT-A--C---TAT-CA-GGGC---AA-GGT-A-CA--GGAC----CC----C-C--AGG-G-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-TT--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TAT-A--GTGGT-ACC---ACCC-GGT-GG---CT-CA-CGGTG-G---TCGGGA-C----A--G-GT-TTC-GAA---T---CC-CT-CT-TCCTACT
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gi|107120                     :                                TTAATCTTTG-AA-T----A------A--A---AA--C----ATAC-A--C------------------A-GTT-T-AA--AGAC----CC----C-T--TGA-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-T-------G-T-CC--T--C-A-G-T--TC--GGG-----------G-A--TGT-A--GGGG
gi|107121                     :                                 TAATCTTTG-AA-G----AGT---CC--A-------CGA--A-AG-A--G---TATGCA-GG-C---AA-GAT-A-GG--GGGC----TA----C-C--AGA-A-CT--A-T-C-ATT-T-CC-CGTCCTCAG-T-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-G--GGGAT-ACT---ACC
gi|107122                     :                                                                              -A--C---TATGCA-GG-C---AA-AAT-A-GA--GGAT----CCGTAGC-T--AGG-A-CT--A-T-C-ATT-T-TC-T-------G-T-CC--T--C-AAG-T--TT--GGG-----------G-C--TAC-A--GGGGT-ACC---ACCT-GGG-GC---CT-CC-TGAGG-G---T-GGAACC----A--C-TT-TTC-AGA---T---CT-CT-A
gi|107123                     :                     aatatttgaaggaATTCTT-G-AA-G----A-----CA--A---GA--CGA--ATG--A------TAT-CA-GGGCC--AA-GGT-A-CA--GGAC----CC----C-CC-AGG-G-CT--A-T-C-ATT-T-CA-C-------G-C-T---T--C-A-G-T--TT--AGG-------------C--TGTTA--ATTGT-ACC---ACCC-GGTTGG---CT-CC-CGGGG-T---T--GGA-C----C--G-AT-TTC-GAGTC-T---CT-CT-AT-CTCCACT
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gi|107125                     :                                   aTCTTTG-AA-GTGTGAAT---CA--A----A--CGA--ATAC------------CG-GGGC---AA-GGT-A-AG--GGAC----AC----A-T--TGG-A-CT--A-T-G-AT---------------------------------------AGG-----------G-A--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCT-GGT-GG---CT-CC-CTGGG-G---T-GGGA-C----C--A-CT-TTT-CAG---TTTATC-GT-AT-CTCCtac
gi|107126                     :                                   aTCTTTG-AA-G----TGTG--CATCA---AA--CGA--AAAC-A-----------A-GGGC---AA-AGT-A-AG--GGAC----AC----A-T--AAG-A-CT--A-T-C-ATT-C-CC-C-------G-C-CT--T--CCA-A-T--TT--GGG-------------C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCT-GGT-GA---CA-CT-TTGGA-G---TC-GGA-C----A--T-TT-TTC-AGGCT-T---TC-AT-AT-CTCCtac
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gi|107128                     :                                  atcCTTTG-AA-G----AGT---CA--A----A--CGA--AGAT-GAGT---TAG-CT-GCGCCGTAA-GAT-A-GA--GGGC----TC----C-C--AGG-A-CT--AGT-C-ATT-T-CC-C-------G-CTCC--T--C-A-G-T--TTGCGGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACC---A--T-GG--GG---CC-CC-AAGAG-GGCTCCGGGC-C----AGCG-AT-TTCAGAG---C---CCGCT-AT-tac
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gi|107130                     :                                     CTTTG-AA-G----AGT---CA--A-------CGA--ATG--A------TATGCA-AGGC---AA-GAT-A-GA--GGGT----TC----C-C--AGA-T-TT--A-A-A-ATT-T-TC-C-------GGC-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-C--CAGGT-ACC---AACT-GG--GG---CC-CC-AAGAGTG---CTGTGC-C----A--C-AT-TTCAGAC---C---CC-CT-AT-
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gi|107132                     :                                               ----AGA---CA--A---GG--TGA--A-AT-G--CA--TAT-GA-GGAC---AA-GGT-A-------AC----AC----C--------A-CC------C-ATT-T-GC-C---------C-CT--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------T-C--TGT-A--GTGGC-CCC---ACCC-GGT-GG---CT-CC-CGGGG-G---TCCGGACC----A--G-AT-TTC-GAG---T---CT-CT-AT-CTCCACT
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gi|107134                     :                                                                                        tgac-GGGC---AA-TGT-A-AG--GGAC----CA----T----AGG-A-CT--A---C-ATT-T-CC-C-------G-C-TT--C--C-A---T--TT--GGG-------------C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCTGGGT-GG---CT-TC-CTGGG-G---TGCGGA-C----A----CT-TTT-GAG---CTA-TC-GT-AT-CTCC
gi|107135                     :                                              aaacggaaatgtc--A---AA--TGA--GTAT-A--C----AT-GT-AGGC---AA-GAT-A-GG--GG-T----TC----C-C--AGG-A-CT--A-T-C-ATA-T-TC-C-------G-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-T--TCT-A---GTGT-ACC---ACTC-GG--GA---CCACC-CGAAG-G---TTGGCA-C----tac
gi|107136                     :                                                                                     atgT-CA-GGGC---AA-GGT-ACAA--GGAC----TT----C-C--AGG-G-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-TT--T--C-A---T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GTGGTAACC---ACCC-GGT-GG---CT-CC-CGGGG-G---TCCGGAGC----A--GCAT-TTT-GAG---T---CT-CT-AT-CTCCACT
gi|107137                     :                                                                                   ttaatT-CA-GGGC---AA-GGT-ACAA--GGAC----TT----C-C--AGG-G-CT--A-T-C-ATT-T-CC-C-------G-C-TT--T--C-A---T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GTGGTAACC---ACCC-GGT-GG---CT-CC-CGGGG-G---TCCGGAGC----A--GCAT-TTT-GAG---T---CT-CT-AT-CTCCACT
gi|107138                     :                                                                                       ttaat-GGGC---AA-GGT-A-G---GGAC----TT----A-T--AG-----T----T-C-ATT-T-CC-CC------G-C-TC--TTCC-A---T--TT--GGG-------------C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCT-G---GG---CT-CC-CTGGG-G---TCGGAA-C----A--
gi|107139                     :                                                                                              GGC---AAAGGT-A--A--GGAC----TC----T-A--TAG-A--T--A-TTC-ATT-T-CCGC-------G-C-CTGTC--C-A-A-C--TT--AGG-----------G-A--TGT-A--GGGGT--CC---ACT--GGT-GG---CT-CC-CTGGG-G---TCGGGA-C----AC-T-CT-TTT-GAG----------CT-AT-
gi|107140                     :                                                                                                 ---AA-GAT-A-GG--GAGCTTAACC----C-T--A---A-CT--A-T-C-ATT-C-CC-C-------G-C-CC--T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACG---AACT-GG--GG----T-CC-CAAGG-G---gatcttctac
gi|107141                     :                                                                                                 ---AA-GAT-A-GG--GAGCTTAACC----C-T--A---A-CT--A-T-C-ATT-C-CC-C-------G-C-C---T--C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACG---AACT-GG--GG---TC-CC-AAGGA-G---TAGG
gi|107142                     :                                                                                                                                                                              --C-A-G-T--TT--GGG-----------G-C--TGT-A--GGGGT-ACC---ACCT-GGT-GA---CT-CA-AGAAG-C---TCGGGC-C----A--C-AT-TTC-AGA---C---CC-CT-AT-
gi|107143                     :                                                                                                                                                                              --C-A-A-T--TT--GGG-------------C--TGT-A--GGGGT-ACC---ATGT-GGT-GG---CT-CC-CTGGG-G---TGGGAA-C----A----CT-TTT-AAGGATT---TT-GT-AT-CTCC
gi|107144                     :                                                                                                                                                                                 -A-G-T--TT--GGGCGAGCTAAAATG-C--TGT-A--GGG-T-AC----ACCT-GGT-GG---CT-CC-CTGGG-G---TCGGGA-C----A--C-TT-TTC--AGTT-T---TC-GT-AT-CTCCtac


blockSeqs                     :                                   T      G  A TGTG ATGAA  TC CTAA AG   CA GATGAGTTAG       C    CGT        CA AG    TTAAC GTAG AGA         TC A              GTCCTCA   T TGT TC G   T TC  GC   CGAGCTAAAATG  AT     TG     A   GGG   TG  TT  GAC  A  A G   T GCT TT   C CCAA GCG   G   AG  TTTA     A  A  G
blockSeqs                     :                                   T      .  A .    GTT    TC AG   A    .  AATGACTAT        .    C          CA .     TTAAC A    CC          T  A              C         T T   TC G   T .   .    GT            .      T      A   .     C   T   .    .  . G   . .   CG   C .    AC    G   AG  CTAT     G  A  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GTG    TC AG   .    .  AATGAGTAT        .    .          C  .     C     .    AT          .  G              .         T T   .  C   T .   .    GT            .      T      A   .     C   T   .    .  . G   . .   GG   C .    GC    .   G   GATT     .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GTG    .  CG   .    .  CATACTAT         .    .          C  .     C     .    C           .  G              .         . T   .  C   T .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . G   . .   CC   C .    GC    .   G   TCT      .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GTG    .  TG   .    .  ATGACTAT         .    .          C  .     C     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . G   . .   CC   G .    CT    .   G   CTT      .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GT     .  G    .    .  ATGACAAT         .    .          C  .     C     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   GG   G .    G     .   G   CTT      .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GT     .  G    .    .  ATGACTAT         .    .          C  .     C     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . G   . .   CA   . .    G     .   G   CTA      .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  G    .    .  ATGACTAT         .    .          C  .     C     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . A   . .   TG   . .    G     .   G   TTT      .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  G    .    .  TAAGTATG         .    .          C  .     C     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   GG   . .    G     .   G   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   C      .  . .    GT     .  G    .    .  TAAGTATG         .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     A   T   .    .  . G   . .   TG   . .    G     .   A   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  G    .    .  CATGGTAT         .    .          A  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CG   . .    G     .   A   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  G    .    .  ACAAGCAT         .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    A             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CG   . .    G     .   A   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  C    .    .  AGAGTATG         .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CG   . .    C     .   G   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   A      .  . .    GT     .  G    .    .  ATGCATAT         .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   A   .    .  . T   . .   TG   . .    C     .   A   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    AT     .  A    .    .  ATGCATAT         .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   G   .    .  . T   . .   GG   . .    C     .   C   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                   T      .  . .    GT     .  G    .    .  ATGACAC          .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . T   . .   CC   . .    C     .   A   C        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    GT     .  A    .    .  ATGACAC          .    .          G  .     C     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . A   . .   CC   . .    G     .   G   A        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    GT     .  A    .    .  TGAGTAT          .    .          G  .     C     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . A   . .   GC   . .    C     .   G   A        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    GA     .  A    .    .  TGAGTAG          .    .          G  .     T     .    T           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . A   . .   TG   . .    A     .   G   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    GA     .  G    .    .  TGATATG          .    .          G  .     C     .    T           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CC   . .    T     .   G   C        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  G    .    .  TATACAT          .    .          A  .     C     .    T           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CC   . .    C     .   G   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  G    .    .  TGATAT           .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . T   . .   CG   . .    C     .   G   C        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  A    .    .  TATGC            .    .          G  .     C     .    T           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   T   .    .  . G   . .   CG   . .    C     .   G   C        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  .    .    .  TATAG            .    .          C  .     C     .    T           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . G   . .   AG   . .    G     .   A   A        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  .    .    .  TACAC            .    .          A  .     A     .    T           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . G   . .   CG   . .    G     .   A   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  .    .    .  AACA             .    .          A  .     A     .    T           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . T   . .   GG   . .    C     .   .   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  .    .    .  CAT              .    .          A  .     A     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     C   T   .    .  . T   . .   CG   . .    C     .   .   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                          .  . .    .      .  .    .    .  TAC              .    .          A  .     C     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    T             .      .      .   .     C   T   .    .  . A   . .   C    . .    .     .   .   T        .  .  .
blockSeqs                     :                                               .    .      .  .    .    .  TAC              .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    T             .      .      .   .     T   .   .    .  . A   . .   C    . .    .     .   .   C        .  .  .
blockSeqs                     :                                               .    .      .  .    .    .  TGT              .    .          C  .     T     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   .   .    .  . G   . .   G    . .    .     .   .   .        .  .   
blockSeqs                     :                                                           .  .    .    .  T                .    .          G  .     T     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   .   .    .  . T   . .   G    . .                                  
blockSeqs                     :                                                                                            .    .          G  .     A     .    C           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   .   .    .  . T   . .   C    . .                                  
blockSeqs                     :                                                                                            .    .          A  .     A     .    C           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   .   .    .  . .   . .   .                                         
blockSeqs                     :                                                                                            .    .          G  .     C     .    T           .  .              .         . T   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     T   .   .    .  . .   . .   .                                         
blockSeqs                     :                                                                                            .    .          G  .     T     .    A           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     .   .   .    .  . .   . .                                             
blockSeqs                     :                                                                                            .    .          G  .     T     .    T           .  .              .         . C   .  .   . .   .    G             .      .      .   .     .   .   .    .  .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                 .          G  .     T     .    T           .  .              .         . .   .  .   . .   .    .             .      .      .   .     .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                 .          .  .     T     .    .           .  .              .         . .   .  .   . .   .    .             .      .      .   .                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                 .          .  .     T     .    .           .  .              .         . .   .  .   . .   .    .             .      .      .                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                 .          .  .     .     .    .           .  .              .         . .   .  .   . .   .    .             .      .                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                              .  .   . .   .    .             .      .                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                              .  .   . .   .    .             .      .                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                 .   . .   .    .             .      .                                                                                      


blockSeqCons                  :                                                    GT***
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