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gi|73449 : CTACA-GT---TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G--A-T-C-AC--AC-T--C-G-GT-GG-A-CTT-A-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-C-TT---C-G-GATC-----A-T--TG-AT--G---G--TA-------TATAt
gi|73450 : ACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCAG-AA-A------G-T-C-G-AA-T-C-AC--AC-T--C-G-GG-GG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-TATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAA
gi|73451 : cATA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-G-G-GA-T-C-AC--AC-T--C-T-GT-GA-A-TTT-A-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CA---C-A-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAAtta
gi|73452 : ACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-T-GA-T-C-AT--AC-T--C-T-GG-GA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A------T---C-G-G-TC-----ATT--TG-ATT-G---G--TAATACATGTATAA--TAAA
gi|73453 : ACA-GTGA-TA--C-GG-A-T-TCAG-AA-AACATCAG-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-T--C-G-GT-GG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--CA-------TATAA--
gi|73454 : ACA-GGT--TA--G-TG-A-T-CCAG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AA-T--C-T-GC-GA-C-TTT-T-AC--A----------T------------------------------TT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TAAGA--TAA
gi|73455 : CA-GTGG-TGA-G-TG-A-T-GCGG-AA-A------G-TAC-G-GA-T-C-AC--AC-T--C-TAGT-GATA-TTTGTGAC--A--------G-T----A-T--C-A-C-A-C-CT---C-GCGATGG----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAgt
gi|73456 : -GTG--TG--G-TATA-TACCAG-AA-A----------C-AAGA-T-C--C--AC-T--C-C-GGTGG-A-TTT---AC--A--------G-T----A-T--C---A-G-A-CT---CTG-GATC-----A----TG-ATG-G---G--TA-------T
gi|73457 : TA--TG--A-CG-A-T-TCGG-AA-A------G-T-C-G-CA-T-C-AC--AT-T--C-T-GT-GA-A-ATC-A-AC--A--------G-T----A-T--C-G-A-G-A-C--------AAAC-----A-------GTG-G---G--TA-------TGTAA--TAAA
gi|73458 : G--G-TA-A-TACCAG-AA-A----------T-G-GA-T-C-A---AC-T--C---GC-GG-A-TTT-T-AC--A--------A-G----A-T--C-A-AAG-A-CT---C-G-GATT-----A-T--TA-ATG-G---A--TG-------AATAA--TAAA
gi|73459 : -A-T-CCAA-AA-A------G-T-C-G-GA-T-T-AC--AC-T--C-T-G---A-C-TTC-A-AC--A--------G-T----A-T--G-A-A-A-A-TT---T-G-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TGAA
gi|73460 : -CCAG-AA-A--------T-CAG-GA-T-C-AC--ACCT--C-G-GC-GG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-AGA-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA--------ATA
gi|73461 : -CCGA-GA-A------A-T-C-G-GA-T-C-ACTAGC-T--T-G-GT-GG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-ACCT---C-G-GAT------A-T--TG--TGTG---G--TA-------TATA
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gi|73467 : -A------G-T-C-A-TA-T-T-AC--AC-T--C-T-GT-GA-A-TTT-T-AC--AGTACATGTG-T----A-T--T-A-A-G-A-AT---C-A-AATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------CATGA--CGAAtagaaat
gi|73468 : A-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-TATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
Alignments
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lowQualScore : . . .. .. . . . . . . ...... . . . . . . . .. . ... .. . . . . .. ........ . .... . .. . . ... . ... . . ..... . .. . . ... .. ....... ..
lowQualScore : 6 2 33 88 2 1 1 2 0 9 777777 9 9 9 9 9 9 9 33 9 555 55 9 9 9 8 22 33333333 9 8888 9 33 9 9 555 9 666 9 9 33333 9 33 9 0 777 33 1111111 88
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Reference ( family-448 ) : AACNACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
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Reference ( family-448 ) : AACNACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
gi|73425 : AACGACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-GGA-A-TGT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
gi|73426 : AACGACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-A-C-AC--AC-TC-T-G-GGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-ACA-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
gi|73427 : AACGACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-A-C-AC--AC-TC-T-G-GGA-A-TTT-T-AC--C--------A-T----A-T--C-A-A-ACA-CT---C-G-GATC-----A-T--TGCATG-G---G--TA-------TATAA--TAAAta
gi|73428 : AACGACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-A-G-GGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---A--TA-------TATAA--TAAAca
gi|73429 : AACGACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-A-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-GGA-A-TTT-C-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--t
gi|73430 : AACCACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CTGG-AA-A------A-T-C-A-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-TGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---A-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA
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gi|73467 : -A------G-T-C-A-TA-T-T-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--AGTACATGTG-T----A-T--T-A-A-G-A-AT---C-A-AATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------CATGA--CGAAtagaaat
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gi|73434 : AACAACA-GTG--TT--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------A-T-C-G-GA-T-C-AC--AT-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-ACAGA--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-AT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAAta
gi|73435 : AACCACA--CG--TT--G-TG-A-T-CCAG-AA-A------G-T-C-A-CA-T-C-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---A-G-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--AA-------TATAA--TAAA
gi|73436 : AACAACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AG-A------G-G-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G---A-A-TTT-T-AA--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CA---T-G-AATC-----A-T--TG-ATG-G---G--CA-------TATAAT-TAAA
gi|73437 : AACAACA-ATG--TA--G-TG-A-T-CTGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-T----G-TGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--T-G-A-A-A-CA---C-G-GATT-----A-T--TG-ATG-G---GTATA-------TATAA--TAAA
gi|73438 : AACTACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CTGG-AA-A------G-T-C-A-GA-T-C-AC--AC-TCTT-G-TGA-A-TTT-TAAC--A--------G-TATTGA-T--C-G-A-G-A-CTTGAC-G-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------CA
gi|73439 : AACTACA-GTG--TA--G-TT-A-T-CTGG-AA-A------G-T-T-G-GA-T-C-AC-----TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--T--------G-TT---A-T--C-A-A-G-A-GT---C-A-GATT-----A-T--TG-ATG-G---GG-TA-------TATAA--TGAA
gi|73440 : AACCACA-GCA--AG--G-TG-A-T-CCAG-AA-C------G-T-C-G-GA-T-C-AC--GC-TC-T-G-TAA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--T-G-A-G-A-CA---T-G-GATT-----A-TAATG-ATG-G---T--TA-------TATAA--TGAA
gi|73441 : AAC-ACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C------C-TC-T-A-GGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C---A-C-A-CC---A-G-CATC-------T--TG--TG-G---T--TA-------TATAA--TAAA
gi|73442 : aAACGACA-GTG--TA--G-CG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TA-G-G-TGG-A--TT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-A-GATCATTCAA-T--TG-ATG-GCTTA--TA-------TATAA--
gi|73443 : AATTACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CTGG-AA-A------G-T-C-A-GA-T-C-AC--AC--------TGA-A-TTC-T----------------T----A-C--C-A-A-G-A-CT---G-T-GATC-----A-T--TG-AT
gi|73444 : AACGACAAGTGGTTGAAG-TG-A-T-CGAA-AA-A------G-G-T-GAGA-T-CCAC--AC-TC-T-A-GGA-AATTT-T-AC--A--------GGT----A-T--CCA-A-C-A-CT---C-G-G-TC-----A-T--TGGATG-G---G--TA-------TATGA--TAAA
gi|73445 : AACCACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CTGG-AA-A------G-T-C-A-GA-T-G-AC--A---C-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----
gi|73446 : AACCACA-GTGG-TG--GATG-A-TACCGGGAA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC------C-T-G-TGA-T-TTA-T-CC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-T-------------------------ATG-G---G--TA-------TATAA--TAA
gi|73447 : AACTTCA-GTG--TG--A--------CTGG-AACA------G-C-----GA-T-C--C--AC-TC---G--GG-A-TTT-A-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GA-C-----A----TG-AC--G---G--TA-------TATAA--TCAA
gi|73448 : ACAACA-GTG--TG--A-TG-AAT-CCGG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-GGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-AT--G---G--TA-------TATAA--TAAA
gi|73449 : CTACA-GT---TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-G--A-T-C-AC--AC-TC-G-G-TGG-A-CTT-A-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-C-TT---C-G-GATC-----A-T--TG-AT--G---G--TA-------TATAt
gi|73450 : ACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCAG-AA-A------G-T-C-G-AA-T-C-AC--AC-TC-G-G-GGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-TATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAA
gi|73451 : cATA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-G-G-GA-T-C-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-A-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CA---C-A-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAAtta
gi|73452 : ACA-GTG--TG--G-TG-A-T-CCGG-AA-A------G-T-C-T-GA-T-C-AT--AC-TC-T-G-GGA-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A------T---C-G-G-TC-----ATT--TG-ATT-G---G--TAATACATGTATAA--TAAA
gi|73453 : ACA-GTGA-TA--C-GG-A-T-TCAG-AA-AACATCAG-T-C-G-GA-T-C-AC--AC-TC-G-G-TGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--CA-------TATAA--
gi|73454 : ACA-GGT--TA--G-TG-A-T-CCAG-AA-A------G-T-C-G-GA-T-C-AC--AA-TC-T-G-CGA-C-TTT-T-AC--A----------T------------------------------TT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TAAGA--TAA
gi|73455 : CA-GTGG-TGA-G-TG-A-T-GCGG-AA-A------G-TAC-G-GA-T-C-AC--AC-TC-TAG-TGATA-TTTGTGAC--A--------G-T----A-T--C-A-C-A-C-CT---C-GCGATGG----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAgt
gi|73456 : -GTG--TG--G-TATA-TACCAG-AA-A----------C-AAGA-T-C--C--AC-TC-C-GGTGG-A-TTT---AC--A--------G-T----A-T--C---A-G-A-CT---CTG-GATC-----A----TG-ATG-G---G--TA-------T
gi|73457 : TA--TG--A-CG-A-T-TCGG-AA-A------G-T-C-G-CA-T-C-AC--AT-TC-T-G-TGA-A-ATC-A-AC--A--------G-T----A-T--C-G-A-G-A-C--------AAAC-----A-------GTG-G---G--TA-------TGTAA--TAAA
gi|73458 : G--G-TA-A-TACCAG-AA-A----------T-G-GA-T-C-A---AC-TC---G-CGG-A-TTT-T-AC--A--------A-G----A-T--C-A-AAG-A-CT---C-G-GATT-----A-T--TA-ATG-G---A--TG-------AATAA--TAAA
gi|73459 : -A-T-CCAA-AA-A------G-T-C-G-GA-T-T-AC--AC-TC-T-G---A-C-TTC-A-AC--A--------G-T----A-T--G-A-A-A-A-TT---T-G-GATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TGAA
gi|73460 : -CCAG-AA-A--------T-CAG-GA-T-C-AC--ACCTC-G-G-CGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-AGA-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA--------ATA
gi|73461 : -CCGA-GA-A------A-T-C-G-GA-T-C-ACTAGC-TT-G-G-TGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G-ACCT---C-G-GAT------A-T--TG--TGTG---G--TA-------TATA
gi|73462 : CAG-AA-A--------T-C-A-GA-T-C-AC--AC-TC-G-G-TGG-A-TTT-T--C--A--------G-T----A-T--C-A-AAG-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAC--TAAA
gi|73463 : GG-AA-A------GCT-C-G-GA-TGC-AC--AC-TG-G-C-TGA-A-TTT-T-AG--A--------G-T----A-TGCC-A-G-GGA-CT---C-G-AATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------T
gi|73464 : -AA-A------A-T-C-G--A-T-C--C--AC-TC-G-G-TGG-A-TTT-T-AC--A--------G-T----ATT--C-A-A-G-A-CT---C-G-GA-C-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAACTTAAA
gi|73465 : A-A------A-T-C-G--A-T-C-AC--AC-TC-G-G-GGA----TT-T-ACC-A--------G-T----A-T----A-A-G-A-CT---C-G-GATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAt
gi|73466 : A-A------A-T-C-A-GAAT-C-AC---C-TC-G-G-TGG-A-TT----AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-G---CT---C-G-GA-C-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATA
gi|73467 : -A------G-T-C-A-TA-T-T-AC--AC-TC-T-G-TGA-A-TTT-T-AC--AGTACATGTG-T----A-T--T-A-A-G-A-AT---C-A-AATT-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------CATGA--CGAAtagaaat
gi|73468 : A-A-TTT-T-AC--A--------G-T----A-T--C-A-A-C-A-CT---C-G-TATC-----A-T--TG-ATG-G---G--TA-------TATAA--TAAA