lowQualScore                  :                                                                                                                        11111                1111111111111111111111111111111111111111111                                                                         33333333333333333                                                           111111111111111111111                    1111           222222222222                            1                1111                                                     111111      1111111                                   111                                         1                                  11                       11                            2222222222            111       111111    22222222222222222                   111                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                         1 11    1    7  333333 2 6666  1 1    1    3   44444  1 22 11   11  6666666666666666666666666666666666666666666 1 44444444444444 222222 1 11 5555555555   2   1 11 666666 2 44444444444 22222222222222222     55  33333333   22     777777777777777777 1 1 1 11  1  555555555555555555555   1 222 1  2222 11 0000  2222 3   000000000000  44  6666 3 3333  22 4     7 44444   3 1 99 1111  333  1  1   1 22        2  777 2     33  2 7777    333333  4   4444444      6666666 2        222 444     555   2 2  22  2     33    2  888888 33   2 0     5555   2 2   33     2    99  44 2     2 2   2   77  2 33 2   2  2 999999999  33  55 6666666666  22 2 666  000  66   555555  5 77777777777777777    44  777777 33  555   7777    33    0 66  2    2    33 2 99   2 8888  2  2 444  5        88888 33         
lowQualScore                  :                                                                         . ..    .    .  ...... . ....  . .    .    .   .....  . .. ..   ..  ........................................... . .............. ...... . .. ..........   .   . .. ...... . ........... .................     ..  ........   ..     .................. . . . ..  .  .....................   . ... .  .... .. ....  .... .   ............  ..  .... . ....  .. .     . .....   . . .. ....  ...  .  .   . ..        .  ... .     ..  . ....    ......  .   .......      ....... .        ... ...     ...   . .  ..  .     ..    .  ...... ..   . .     ....   . .   ..     .    ..  .. .     . .   .   ..  . .. .   .  . .........  ..  .. ..........  .. . ...  ...  ..   ......  . .................    ..  ...... ..  ...   ....    ..    . ..  .    .    .. . ..   . ....  .  . ...  .        ..... ..         
lowQualScore                  :                                                                         3 55    1    4  000000 1 4444  0 0    0    1   88888  0 77 44   44  0000000000000000000000000000000000000000000 0 66666666666666 999999 0 44 9999999999   1   0 44 999999 1 99999999999 44444444444444444     11  77777777   44     666666666666666666 0 0 0 44  3  000000000000000000000   3 333 3  9999 99 9999  4444 2   222222222222  44  1111 2 4444  22 8     7 22222   3 7 00 4444  000  7  7   7 55        4  888 4     22  4 3333    555555  7   2222222      8888888 4        999 222     888   1 1  99  1     22    4  111111 22   4 9     1111   4 4   22     4    66  44 4     4 4   4   44  4 99 4   4  4 222222222  44  77 4444444444  88 5 999  333  99   333333  3 11111111111111111    55  777777 77  777   2222    77    5 33  7    7    77 7 00   7 3333  8  7 777  3        22222 77         
consensus                     :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-CG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------G--T-AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TCA--A-N-C-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----AGTTTAC----A--A-AGGGAACG-C-GCC-GCCCGC-GCTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCA-CCCG-AG-CAAT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-NTCT---GNG--TAT-A-A---TC---GA--CTACG-T--GT-A-T---------------GAAT-AAA------A--TTT--ATG--A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
Reference ( gi|60050 )        :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-GA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------G--C-AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TCA--A-A-C-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGT--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----AGTTTAC----A--A-AGGGAACG-T-GCC-GCCCGC-ACTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCA-CCTG-AG-CAAT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-TTCA---GAG--TAT-A-A---TC---GA--CTACC-T--GT-A-C---------------GAAT-AAA------A--TTC--ATG--A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60048                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-T--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-TTG-A--AG-TGG-------TT------G--T-AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TCACCA-A-C------G--TGT---C------AA--T-TATTTCC------GC-T-T--G-AA-CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-G-T--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----AGTTTAC----A--A-AGGGAACG-T-GCC-GCCCGC-GCTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-GTTTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACAT-C-TCA-CCTG-AG-CAAT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-TTCT---GAG--TAT-A-A---TC---GA--CTACTGT--GT-A-T---------------GAAT-AAA------A--TTT--ATG--A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60052                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-C--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------G--T-AGA-G---T-AT----A--C--ATAA--C-A-GCA--A-C-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-G-T--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A-----GTTTAC----A--A-AGGGAACG-T-GCC-GCC-AC-GCTG-C-TT--TG-ATAGGCCGTGG-AC-AC-A-G--GTAGACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATT--AT-CACTT-C-TC---CTG-AG-CAAT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-TTCT---GAG--TAT-A-A---TC---GA--CTACG-T--GT-A-T---------------GAAT-AAA------A--TTT--ATT--A-TTGC--TTTGCC--GA-GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60055                      :                                                                     TCGA-T---TCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------G----AGA-----T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TCACCA-A---A---AG--TGT---C-T----AA--T-T-TTTCC-----AGC-T-G--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GTG--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----ACTTTAC----A--A-AGGGAACG-T-GAC-GCCCGC-GCTGTC-TT--TG-ATAGG--GTAG-AC-AC-A-G--GTA-ACGAGTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCA-CCAG-AG-CAAT-GCG-TT-G---CAA---TA--GG-TTCCT--GAG--TAT-A-A---T----GA--CTACG-T--GT-A-T---------------GAATAAAA------A--TTT--ATG--A-TTGT--TTTGCC--G--GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60057                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCG-AGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------T-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------G--T-AAA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TCA--A-C-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-A---CCCGAGG-GGA--G-CGTGG--CG-A-T--GG-A------AT-TAG-A----GGTTTAC----A--A-AGGGAATG-C-ACT-GCCCGT-GCTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGGTTT---AATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-CACTT-C-TC--CCCC-AG-CATT-GTG-TT-G---A-T---TA--GG-ATCT---GTGTATAT-A-A---TC---GA--CTACA-T--GT-A-T---------------GAAT-AAA------A----G--GTG--T-TTGT--TTTGCC--AA-GACT-ATGC--G-A--GAG-T----AATTT-T---GT-GACAATAAT----C--
gi|60059                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CAAA-ATG-AA--TT-CG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TC------A--T-AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TCA--A-C-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CAC-T-TG-G-A--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCGGAGG-GGA--G-CGTGG--CG-A-T--AGCA------AT-TAAGA----GGTTTAC----A--A-AAAGAATG-C-ACA-GCCCGT-GCTG---TT--TG-ATAAG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATG------------G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-TACTT-C-TCA-CCCC-AG-CATT-GTG-TT-GAATC-AGATTA--GG-ATCT---GTG--TAT-A-A---TC---GA--CTACG-T--GT-A-T---------------GAAT-AAA------A--T----GTG--T-TTGT--TTGGTC--AA-GACT-ATGC--G-A--GAG-T----AATTT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60061                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGACT-CTCTTCGAA-GTG-AA--T---G-G--GTC--CC---------------------G-----------TTA-------ACA---------A----C------A-T--A----------TTTTCAT----G------T-T-----------GG----------------TTCAC--TC--------TCGC-ATCTC------------------TTC-G-A--AG-TG--------TC------G--T-AGA-------AC----A--CCAA-AA--C-AATCA--A-C-C-A---AG--TGT---CCT----AA--TCTATTCTC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CCCTGG-ACCGCCCGAGG-GATTAGTCGTGG--CG-A-ATGGGCA------AT-TAA-A----AGTTTAA----A--ACAGGGACCGAT-GGC-CCCCGCCGCTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-GCCA-GCGGTA-ACGATCTTAAGATA-G-TTT--AATGG-CTCAA-TT-ATCCACTT-C-TCACCCTGTAGACAAT-GCG-TTGG---C-A---TA--GG-TTCT---GAG--TAT-ACAC--TCG--GA--CTACG-T--GT-ATT---------------GAAT-AAATAATTTA--TTCG-ATGCCA-TTG---TTTGCCA-GA-GACT-ATGC--ATA--GAG-T----ATATTATTTGGA-GACGATGATCTGAT--TCGAGAAAA
gi|60064                      :                                                                     TCGA-T--TTCT-CGAA-GT------T-C--TCAA-T-CTTT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGT-------TT------G--T-AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TCA--A-C-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTT-T-----CGCTT-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-GGA--G-CGTGG--CG-A-T--GGCA------AT-TAG-A----GGTTTAC----A--A-AGGGAACG-T-GCA-GCCCGT-GCTG-C-TT--TG-AT
gi|60063                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CT-T-CGAA-GTG-GAA-TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------C-T-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTTTCAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--AT-TC------------------T-C-G-A--AG-TTG-------TC------T-----GA-G---T-AT----A--C--A-AAAAC-A-TCA--A-C-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTTCCGCTAACAT-T-G--G-A--CC---TA-CC-TGA-A--------GG-GGA--C-CGTG---CA-T-T--GGCA-------C-TAG-T----GGATAAC----A--A-AGGGTACG-TTGCA-GCCCGTTGCTG-C-TT--TTCATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGG-TT---AATA-G-TTT--AATTGCGTCAATTT--T-CACTTCC-TCA-TCCC-AG-CATT-TTGATT-G-----A---TAACGG-ATCT---GTT--TATCA-A---TCGG-GA--CTA---T--GT-A-CAACTAGTGTTGTTATGAAT-AAA------A--TGT--ATG--T-TTGT--TGCGCC--AA-GACT-ATGC--G-A--GAG-TA---ATTTT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60071                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---GAA-GTG-AA--TT-------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A-A--------------C------A-T--A----------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCACGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-T-G-------TT------G--T-AGA-G------T----A--C--A-AA--------A--A-A-C-ACCGAG--TG----C-T----AA--TCTATTT-------CGC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-G-CCGAAG-GGT--C-TGT-G--CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GAT--AGTTTAC----A--A-AGGGAA-----GGC-GCCCG--GCGG-C-----TG-ATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAA-C----AG-C-AT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-----GA---TA--A-A---TC---GACTCTACG-T--GT-A-T---------------G-AT---A------G--TTTAAATG--G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGC--A-AG-GAG-T----ATAGT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60070                      :                                                  caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---GAA-GTG-AA--TT-------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A-A--------------C------A-T--A----------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCACGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-T-G-------TT------G--T-AGA-G------T----A--C--A-AA--------A--A-A-C-ACCGAG--TG----C-T----AA--TCTATTT-------CGC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-G-CCGAAG-GGT--C-TGT-G--CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GAT--AGTTTAC----A--A-AGGGAA-----GGC-GCCCG--GCGG-C-----TG-ATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAA-C----AG-C-AT-GCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-----GA---TA--A-A---TC---GACTCTACG-T--GT-A-T---------------G-AT---A------G--TTTAAATG--G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGC--A-AG-GAG-T----ATAGT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60065                      :                                                  caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCTTCGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--CTGTG-G--GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------T-A--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AGTTGG-------TC------T--C--GA-G---T-ATATACA--C--A-CA--C-A-TC---A-A-C-A---AG--TGG---T-C----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TTGG-A--CT---TA-CC-TGG-
gi|60066                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-TGAA-TT------T-C--TCGA-T-CTCT-CAAA-GTG-AAA-TT-TA-G--GTT--CC---------------------T-----------T-T-------A-A---------A----C------A-T--ACCTGATTGTATTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--CC--------TCG--ATCCC------------------T-C-A-A--AG-TGT-------TT------G--T-AGT-G---T-A
gi|60077                      :                                                                     TCAA-T--CTCT-CGAA-G-------T-C--T------------GAA------A--TT-TT-A--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A-----------A-C--A-----------TT-CAT-G--G------T-T-----------TTG---------------TCCAC--TC--------CAG--AGCTC------------------T-C-GAA--AG-T-G-------TCATTCGGG--CTAGA-G---T--T----A--C--A-AA--C-ATTCA--A-C-C-A---A---------C-T----AA-----ATT--------CGC---T--G-A--C----TA-CC-TGGAAC-GCC
gi|60053                      :                                                         tccctcggaactTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AAG-TC-CC-G--GTC--CC---------------------G---------------------------------A----T------T-T--T----------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAGAAGCAAA-------TTTAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60060                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TTGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AAG-TC-CT-G--GTC--CC---------------------GATTTTTTTTTCT-ATATAACTA-A---------G----C------A-T--A----------TTT--------------------------------------------------AC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--Acgttcg
gi|60056                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AACGTC-CC-G--GTC--CC---------------------G---------------------------------A----T------T-T--T----------TTT-CTC-T--A------TATAAGTAAGCAAAT-----------------TTC-C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60051                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AAG-TC-CC-G--GTC--CG---------------------A-----------T--------------------------T------T-T--T----------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAATAAGCAAA------TTTAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--Acgttcg
gi|60068                      :                                                                     TCGA-C--CACT--AAA-AT------T-T--TTTA-T-CCCG-AGAA-GTG-AA--AT-TT-T--ATT--TC---------------------G-----------T-A-------A-A-----------------------T--A----------TTT-CCT-T--GGGGTT-T-T-----------T-----------------TTCCC--TC--------ACG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGA-------TA------G--C-A-------T-AT----A--C--cgttcg
gi|60049                      :                                                                     TCGA-T--CTCT-CGAA--C------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-TTT-TG--TC-TT-G--GTC--CC---------------------T-----------T-G-------A-A---------
gi|60062                      :                                                                     TCGA-TAACT-T-CGAA-CT------T-C--GC-A-T-CTCT-CGAAAGTG-AAG-TT-CC-G--GTC--CCCGATTTTTTTCTCTATAGGAGG-----------T-A-------A-A---------G----C------A----A--------------CAT-T--G------T-T-------------------------------AAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60058                      :                                                                     TCGA-T--AACT-CGAA-CT------T-C----GA-T-CTC--CGAA-GTG-AA--GT-CC-G--GTC--AC---------------------G---------------------------------A----T------T-T--T----------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAAGCAAA---------TTTAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60054                      :                                                                     TCGA-T--AACT-TGAA-CT------T-C----GA-T-CTCT-CGAA-GTG-AG--TC-CC-G--GTC--CC---------------------G---------------------------------A----T------T-T--T----------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAACTAAGCAAA------TTTAC--TCTCGATCGTTCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TGcgttcg
gi|60069                      :                                                                      CGAGT--CTCT-CAAA-GT------T-C--T-GA-T-CTCT-CGAA-GTG-AAG-TC-CC-G--GTC--CC---------------------G-----------T-----------------------------------T--A----------TTT-T-T-T--T------T-C-----------TCTATATGAGTAAGCAAATTTAC--TC--------TCGGTATCTCTTGAACGTTCACTCTCTAT-C-G-A--AG-TGG-------TC------G--T-AGA-G---TAAT----A--C--A-AA--A-A-TCA--A-A-CAA---AG--TGTA--C-T----GA--T-T-TTTTC-----CGCTT-T--G-G--CT---TACCC-TGG-AC-GCCCAAGA-GGT--G-CGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----AGTTTAC----A--A-A-GGAACG-T-GCCTGCCCGC-GCTG-CTTT--TG-ATAGG--GTGGAACAAC-A-G--GTA-ACGATTT---GATAGG-TTTTGAATTG-GTCACATT-AT-CACTT-CATCA-CCTGAAG-CATT-GCG-TT-G---C-A---TA--AGTTTCT---GAG--TAT-A-A---TC---GA--CTACG-T--GTAA-T---------------GAAT-ACA------ACTTTA--ATG--A-TTGT--TTTGCC--GA-GACCTATGC--A-A--GAG-T----ATATT-G---AG-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAaatttg
gi|60072                      :                                                                      CGA-T--CTCT-CAAA-GT------T-C--TCGA-T-CTTT-CAAAAGTG-AAA-TT-TG-G--GTT--C----------------------A-----------T-A-------A-G---------ATGTAC------A-TGTA----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--AT--------TCG--AGCTC------------------T-C-G-G--AG-TGT-------TG------A--T-AGC-G---T-GT----A--C----AT--C-T-TTT--T-T-C-C---AG--TGT---A-T----AAAGT-TATTTTC-----TGC-T-TG-G-A--CCTTATA-CC-TGA-AT-AACCG
gi|60073                      :                                                                      CAA-T--ATCT-TAAA-GT------T-A--TCAA-T-CTCT-GAAA-GTG-AAA-TT-TG-G--GTC--AT---------------------G-----------C-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TA--------TCA--ATCTC------------------T----------------------------------AGA-A---T-AT----A--C--A-CA----A-TCA--C-T-C-----CG--TGA---C-TCACAAA--T-CATTT-C-----CAC-T-T--G-GACCT---TA-C
gi|60074                      :                                                                       GA-T--ATCT-CGAA-TA------C-CA-TGGA-T-ATGT-CGAA-GTG-G---TT-TG-GAAGTC--CC-------------------------------------------A-A---------T----C------ACT--A----------ATT-CAT-TATG------T-A-----------T-----------------TTTAC--TC--------TCG--ATATC------------------T-C-G-A--A
gi|60076                      :                                                                        A-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-TTCTC--CGAA-GTG-GC--TT-TT-G----T--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------G----C------A----A----------TTT-CAT-T--G------TAT-----------T-----------------TTCAC--T
gi|60075                      :                                                                        A-T--CTCT-CAAA-AT------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTA-AG--TC-CC-G--GTC--CC---------------------G---------------------------------------------A-T--T----------TTC-CTC-T--A------T-T-----------TAACTAAGCAAA------TTTAC--TT--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--
gi|60084                      :                                                                         -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CAAA-GTGAAA--TC-TG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A-A---------A----C------A-T--G------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCGA--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TGGTGGTAGATC------GAAC-AGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-tacgtttg
gi|60078                      : ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcac-T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CAAA-GTGAAA--TC-TG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A-A---------A----C------A-T--G------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCGA--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TGGTGGTAGATC------GAAC-AGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-cattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60079                      :                                                                           --CTCT-CGA----------T-CGTTCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TT--------TC------G--T-AGA-G---T-TT----A--C--A-AA--C-A--CA--ACA-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-AT-GCCCGAGG-GGT--G-AGTGG--CG-A-A--GGCA------AT-TAA-A----AGTTTAC-------A-AGGGAACG-T-GCC-GCCCGC-GCTG-C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-AC---G--GTA-A-GATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCA-TCTG-AG-C-AT-GAG-TT-G---C-T---TA--GG-ATCT---GTG--TAT-A-A---TC---GA--CTA-C-G--GT-------------------GAAT-AAA------A--TTT--ATG--A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGC--A-A--GAG-T----ATATT-T---GA-GACGGTG-T----T--TTGTGAAA
gi|60080                      :                                                                           --CTCT-CGAA--T------T-C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--AT-TT-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A-A---------A----C------A-T--A----------T---CATGT--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A---G-TTG-------TC------G--T-AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--A-C-TCA--ACA-A-A---AG--TGT---C-T----AA--T--AT--CC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGA-AC-GCCCG-----------TGTAG--CGTACA--GGCA------ATATAA-G----AAATTAT----C--A-GAGGAACG-T-GCC-GCC-GC-GCTG-C-TT--TG-AT--G--GTGG-AC-AC-A-G--G-A-ACGATTT---AATA-G-TTT--AATTG----------------TT-C-TCA-GCTG-AG-CAA--GTG-TT-G---C-T---TA--TG-ATCG---GCG--TAA-G-A---TCTATGA--CTACG----GT-A-T---------------GAAT-AAA------A--TTT--ATG--A-TTGT--TTTGCC-----AACC-ATGC--A-A--GAG-T----A-A-------GA-GACGATGA-----T--TTGAGA
gi|60081                      :                                                                           --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CGAA-GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C-A---------A----C------G-C--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TGA-------TG------G--T-AGA-G---T-AA----A--CT-G-AA--C-A-TC-----A-C-C---AGATTAC---C-T----AA--T-TATCT-C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGG-TGA--G-CATGG--TG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-G----TGTTTAC----ATCA-AGG--ACG-C-ATT-GCCGGT-GTTT-C-TT--TG-ATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GT--ATAATTT---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CACCC-C-GCA-CCCGAAG-C--TCGTG-TT-G---A-A---TA--CT-TTAAATGAAA--TTT-A-AATTTT---GA--TTA------GTCA-T---------------GACT----------A--TGC--GTG--AGTTAT--TTTG----GA--ACG-GTACTTA-ATTGAC-TTATCAT-TT-T---AA-GACGATAAT----T--TAGAGA
gi|60082                      :                                                                           --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CGA--GTG-AA--TT-TG-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C-A---------A----C------G-C--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TGA-------TG------G--T-AGACG---T-AA----AACT--G-AA--C-A-TC-----A-C-C---AGATTAC---C-T----AA--T-TATT--C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGGTGGA--G-CATGG--TG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-G----TGTTTAC----AT-C-AAGGAGCG-C-ATT-GCCGGT-GTTT-C-TT--TG-ATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GTA---TATTA---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CAC---C-GCA-CCC-----------CG---------------A--AG-CTC------G--T-----G---TT---GA--ATACT-T---T-A------------------AAT-GAA------A--TTT--A-A--A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGC--G-T--GAGTT----ATTTT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGA
gi|60083                      :                                                                           --CTCT-CGAACGTACGATAT-C--TCTA-T-CTCT-CGAA-TTG-AAA-TT-TG-G--ATC--CT---------------------G-----------T-A-------C-A---------A----C------A-T--G----------TTT-TAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTTAC--TC--------TCG----CT-----------------------------G-TGT-------TG------G--T-AGT-G---T-AT----A--C--GCAC--C-A-TCA--C-T-A-A---AG--CGT---A-T----CA--T-TATTTCC-----AGT-TGT--A-C--CT---TA-CC-TGG-A
gi|60084                      :                                                                           --CTCT-CAAA-GT------T-C--CTGA-T-CTCT-CAAA-GTG-AA--AT-CATG--GTC--TTT--------------------A-----------T-A-------A-ATAACTAAGCA----CTCTTGAA-T-------------TTT-CAC-T---------T-T-----------C-----------------TTGATGTTC--------TCG--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TGA-------AA------T--C-TGG-G---T--T----C--C------------TCA--A-AAC-A-------TGC---C-------A--T-TGTTTTC-----CGA-T-T--G-A--GA---TC-TC-TGG-A-------AAT-GGT--G--GTAGATCG-A-A--CAGA------GTATAC-ACACCATTTTACTCCTG--C-TGGGG-CG-T-G---GCCCG----TG-T-TTCCTA-ATGGG--GTGG-A-----------TA-A----TT---AATT-G-TTT--AATTG-GTCAGTTTCAT-CATCT-G-CCA-CCTG-------T-GCT-TT-G---T-A---T
gi|60067                      :                                                                                    AA-GT------T-C--TTGA-C-CTCT-TGATTGTG-AAA-TT-TG-G--GTC--CCT--------------------G-----------T-A-------A-A---------A----T------A----A----------TTT-CAT-T--GTT----T-T-----------T-----------------TTCACT-TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TGG-------T-------G--A-AGA-GCAAT-AT----A--C--A-
gi|60085                      :                                                             ttgatctctcaaacatttgacccta-GT------T-C--T--A-T-CTCT-CGAT-GCG-AA--TT-TG-G--GTT--CC---------------------------------T-AT------A-A---------A----C------A-T--A----------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC--TC--------TCG--
gi|60086                      :                                                                                                      cA-T-CTCT-C--A-GCA-G---TT-CT-G--ATCGTCC---------------------A-----------T-A-------A-A---------A-----------A-T--AAA--------TGT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCAC---C--------TCG--ACCTC------------------T-C-A-GTTAG-TGG-------TT------T-----GA-T---T-AT----A--C--A-CA--CAA-TCA--C-C-C-G---AG--CGTATAT-T----AA--G-TATTTCT-----CGC-T-G--G-A--
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                 -------A-A---------A----C------A-A--A----------TTT-CAT-T--GGGTTTTT-T-----------T-----------------TTCAC--CC--------TCG--ATCTC------------------G-A-G-A--AG-TGC-------TG------G--T---A-G---T-TT----A--T--A-AA--C-A-TCATCA-ATC-A---TG--CAA---A-T----AA--T-TATTT-C-----AGC-T-T--G-GACCT---TA-CC-CGA-A
gi|60049                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AC--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--Ataactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattgattaggtgtttgtataggtggcacactacctgtgtttcctctgagggtggatagtaattgttttattggtcagttttaaccctgctcttgggctttattttatttataatcttatctaagtatgaacaaaaattgtgacttgctttgacttgacaacgaagcaaaaattttgagaaaataaatttgag
gi|60087                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcgatctctcgaTC------------------T-C-G-A--AG-TGG-------TG------G--T-AGC-A---T-AT----A--T-----A--T-A-T------A-C-A-------TGT---CAT----GA--T-TATTT-T-----CAC-A-T--G-GACCT---TA-CC-TGG-Attttgtcttggtcccttgaa
gi|60089                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctgaaagtgaaatttgggtcttgtaaaantgaa-G-A--AG-TGG-------TT------G--C-AGA-G---T-AA----A--C--ACAA--C-A-TCA--A-C-A-A---AG--AGG---C-T----AA--T-TATCT
gi|60090                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TGG-AT-GCCTAAGG-CGA--G-CGTGG--TG-G-T--GGCA------AT-TAG-C----TGTTTAC----A--T-AGGGGACA-C-ATA-ACCCGT-ACTT-C-TT--TG-ATatgctt
gi|60091                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C-TT--TG-ATAGG--GTGG-AC-GG-GTG--ATA-ATTATTT---AATA-A-TTT--AGTTG-GTGAATTT--T-CACAA-C-TCA-TTTG-AG-TCTT-GTG-TT-A---A-G---TA--GG-ATCC---GTT--TAT-G-A---TC---GC--CTA
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C-TC--TG-A--GG--GTGG-AT-A-------GTA-A----TT---G------TTT--TATTG-GTCAGTTTTAA-CCCTG-C-TC---TTG-GG-C--T-TTA-TT-T---T-A---T-------T----------TAT-A-A---TC-------TTATC-TAAGT-A-T---------------GAAC-AAA------A--ATT--GTG--ACTTGC--TTTGACTTGACAACG-AAGC--A-A--AAA-T-------TT-T---GA-GAAAATAAA----T--TTGAGtgcata





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   11                 1111111111111111111111111111111111111111111                1111111111111                                 33333333333333333                                                                        111111111                                     11111                             11111111         1111                                                   111111                                                                                                                         11                       11         111111111                                         1111111111111111                   111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             1 11    1    7  222222 2 444   1 1    1  1  2  111 1  11  77777 11   22  3333333333333333333333333333333333333333333 22  2222  1 11 1111111111111   2   1 11 666666 2 44444444444 11111111111111111    11 33  33333333   22     777777777777777777 1 1 1 11  1  7777 4 222 000000000   1 222 1  2222 11 88 4  33 1 3 22  11111 3 3   5555 3 3333  22 4     44444444  3 1 99 1111  333  1  1   1  2   1    2  555 2       2 7777    222222  2   99999       55 2        6666   2     777    2 4  2       33    2  666666 33   2 9     4444   2 2   33     2    88  33 2     2 2     8888  2 00    2  2 000000000  33  33 2 3 1 33  33 2 2  999  66    2  5555555555555555 2 2     2  33     000000000000 2    66      55  2    2     2 5   2 2   2  2 444  5        77777 66         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             . ..    .    .  ...... . ...   . .    .  .  .  ... .  ..  ..... ..   ..  ........................................... ..  ....  . .. .............   .   . .. ...... . ........... .................    .. ..  ........   ..     .................. . . . ..  .  .... . ... .........   . ... .  .... .. .. .  .. . . ..  ..... . .   .... . ....  .. .     ........  . . .. ....  ...  .  .   .  .   .    .  ... .       . ....    ......  .   .....       .. .        ....   .     ...    . .  .       ..    .  ...... ..   . .     ....   . .   ..     .    ..  .. .     . .     ....  . ..    .  . .........  ..  .. . . . ..  .. . .  ...  ..    .  ................ . .     .  ..     ............ .    ..      ..  .    .     . .   . .   .  . ...  .        ..... ..         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             3 55    1    2  999999 1 555   0 0    0  0  0  888 0  44  88888 44   44  9999999999999999999999999999999999999999999 33  1111  0 44 2222222222222   0   0 44 888888 0 88888888888 66666666666666666    44 88  77777777   44     666666666666666666 0 0 0 44  2  4444 9 333 777777777   3 333 3  9999 99 88 3  55 5 2 22  22222 2 2   5555 2 4444  22 8     22222222  3 7 00 4444  000  7  7   7  1   0    4  111 4       4 3333    888888  2   99999       33 2        5555   1     111    0 0  0       11    2  111111 11   2 7     3333   2 2   11     2    11  11 2     2 2     6666  2 88    2  2 888888888  22  44 4 4 0 22  55 4 4  777  55    4  4444444444444444 4 4     5  44     888888888888 5    99      99  5    5     5 0   5 5   5  5 444  0        11111 99         
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-T--CAACC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
Reference ( family-446 )      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-T--CAANC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60048                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-T--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-TTG-A--AG-TG---GTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-T--CA-CC--A-ACGTGT---C------AA--T-TATTTCC------GC-T-T--G-AA-CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-GTTTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACAT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTACTGT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60049                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA--C------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-TT---T-TG--TC-T-T-G--GTC--CC---------------------T-----------T-G-------A--A
gi|60050                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-GA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---C---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-T--CAAAC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-ACTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CAGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-CT--G-------------T-A-CGAAT-AA--AATTC--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60051                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CG---------------------A-----------T------------------TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAATAAGCAAA------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60052                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--ATAA--C-A-G--CAACA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-A---GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCC-A-C-GCTG-C-TT-TGATAGGCCGTGG-AC-AC-A-G--GTAGACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATT--AT-CACTT-C-TC--CT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--T-----A-TTGC--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAcgttcg
gi|60053                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAGAAGCAAA-------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60054                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-TGAA-CT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TCTCGATCGTTCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---cgttcg
gi|60055                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T---TCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG-------------AGA-----T-AT----A--CA-A-AA--C-A-T--C-ACCAAA-A-GTGT---C-T----AA--T-T-TTTCC-----AGC-T-G--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GTG--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--CTTTACA--A-AGGGAACG-T--GAC-GCCCG-C-GCTGTC-TT-TGATAGG--GTAG-AC-AC-A-G--GTA-ACGAGTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCACCA-G-AG-CAATGCG-TT-G---CAA---TA--GG-TTCCTGAG--TAT-A-A-T----GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAATAAA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--G--GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAaatttg
gi|60056                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AACGTC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------TATAAGTAAGCAAAT-----------------TTC---C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60057                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCG-AG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AAA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-T--CAACA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-A---CCCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GG-A------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAATG-C--ACT-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGGTTT---AATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-CACTT-C-TC-CCC-C-AG-CATTGTG-TT-G---A-T---TA--GG-AT-CTGTGTATAT-A-A-TC---GA--CTAC-AT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AAGGT--GT----------TTGT--TTTGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GT-GACAATAAT----C--cgttcg
gi|60058                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-CGAA-CT------T-C----GA-T-CTC--CG-AA-GT---G-AA--GT-C-C-G--GTC--AC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAAGCAAA---------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60059                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CA-AA-AT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCA---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-T--CAACA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CAC-T-TG-G-A--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCGGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--AGCA------AT-TAAGAG--GTTTACA--A-AAAGAATG-C--ACA-GCCCG-T-GCTG---TT-TGATAAG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATG------------G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-TACTT-C-TCACCC-C-AG-CATTGTG-TT-GAATC-AGATTA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATGT--GT----------TTGT--TTGGTC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAAcgttcg
gi|60060                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TTGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-T-G--GTC--CC---------------------GATTTTTTTTTCT-ATATAACTA--AG----CA-T--A-------------TTT--------------------------------------------------A--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60061                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGACT-CTCTTCG-AA-GT---G-AA--T----G-G--GTC--CC---------------------G-----------TTA-------AC-AA----CA-T--A-------------TTTTCAT----G------T-T-----------GG----------------TTCA--C--TC--------TCGC-ATCTC------------------TTC-G-A--AG-TG----TCG---T---------AGA-------AC----A--CCAA-AA--C-AAT--CAACC--A-A-GTGT---CCT----AA--TCTATTCTC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CCCTGG-ACCGCCCGAGG-GATTAGTCGTGGCG-A-ATGGGCA------AT-TAA-AA--GTTTAAA--ACAGGGACCG-ATGGCC--CCCG-CCGCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GCCA-GCGGTA-ACGATCTTAAGATA-G-TTT--AATGG-CTCAA-TT-ATCCACTT-C-TCACCCTGTAGACAATGCG-TTGG---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-ACACTCG--GA--CTAC-GT--G-------------T-ATTGAAT-AAATAATTT--ATTCGATGCCA-TTG---TTTGCCA-GA-GACT-ATGCATA-GAG-T-ATA-TTATTTGGA-GACGATGATCTGAT--TCGAGAAAA
gi|60062                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-TAACT-T-CGAA-CT------T-C--GC-A-T-CTCT-CGAAA-GT---G-AAG-TT-C-C-G--GTC--CCCGATTTTTTTCTCTATAGGAGG-----------T-A-------A--AG----CA----A-----------------CAT-T--G--------------------------------------TTAA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60063                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CT-T-CG-AA-GT---GGAA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------C-T-------A--AA----CA-T--A-------------TTTTCAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--AT-TC------------------T-C-G-A--AG-TT---GTC----T----------GA-G---T-AT----A--C--A-AAAAC-A-T--CAACA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCCGCTAACAT-T-G--G-A--CC---TA-CC-TG---------AAGG-GGA--C-CGT-GCA-T-T--GGC-------AC-TAG-TG--GATAACA--A-AGGGTACGTT--GCA-GCCCGTT-GCTG-CTTT-TCATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGG-TT---AATA-G-TTT--AATTGCGTCAATTT--T-CACTTCC-TCATCC-C-AG-CATTTTGATT-G-----A---TAACGG-AT-CTGTT--TATCA-A-TCGG-GA--CTAT-GT--ACAACTAGTGTTGTT-A-TGAAT-AA--AATGT--AT--G-----T-TTGT--TGCGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-TAATT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60064                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--TTCT-CGAA-GT------T-C--TCAA-T-CTTT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---TTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-T--CAACA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-T-----CGCTT-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GGCA------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCA-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGAT
gi|60065                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCTTCGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--CTGT-G-G--GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-A--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AGTTG---GTC----T---------CGA-G---T-ATATACA--C--A-CA--C-A-T--CAA-C--A-A-GTGG---T-C----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TTGG-A--CT---TA-CC-TGG-
gi|60066                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-TGAA-TT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AAA-TT-T-A-G--GTT--CC---------------------T-----------T-T-------A--AA----CA-T--ACCTGATTGTA---TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCCC------------------T-C-A-A--AG-TG---TTTG---T---------AGT-G---T-A
gi|60067                      :                                                                                                                                                                                                        AA-GT------T-C--TTGA-C-CTCT-TG-ATTGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--CCT--------------------G-----------T-A-------A--AA----TA----A-------------TTT-CAT-T--GTT----T-T-----------T-----------------TTCA--CT-TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---GT-G---A---------AGA-GCAAT-AT----A--C--A-
gi|60068                      :                                                                                                                                                                ttgatctctcaaacatttgaccctaTCGA-C--CACT--AAA-AT------T-T--TTTA-T-CCCG-AG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-T--ATT--TC---------------------G-----------T-A-------A--A--------T--A-------------TTT-CCT-T--GGGGTT-T-T-----------T-----------------TTCC--C--TC--------ACG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG------A---T---------AGC-A---T-AT----A--C--
gi|60069                      :                                                                                                                                                                                          CGAGT--CTCT-CAAA-GT------T-C--T-GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-----------T---------------------T--A-------------TTT-T-T-T--T------T-C-----------TCTATATGAGTAAGCAAATTTA--C--TC--------TCGGTATCTCTTGAACGTTCACTCTCTAT-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---TAAT----A--C--A-AA--A-A-T--CAAACA-A-A-GTGTA--C-T----GA--T-T-TTTTC-----CGCTT-T--G-G--CT---TACCC-TGG-AC-GCCCAAGA-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-A-GGAACG-T--GCCTGCCCG-C-GCTG-CTTT-TGATAGG--GTGGAACAAC-A-G--GTA-ACGATTT---GATAGG-TTTTGAATTG-GTCACATT-AT-CACTT-CATCACCT-GAAG-CATTGCG-TT-G---C-A---TA--AGTTT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------TAA-TGAAT-AC--AACTTTAAT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACCTATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-G---AG-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60070                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-A--CA-CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60071                      :                                                                                                                                                                      caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-A--CA-CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60072                      :                                                                                                                                                                       caatctctcgattcgacgtCGA-T--CTCT-CAAA-GT------T-C--TCGA-T-CTTT-CA-AAAGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTT--C----------------------A-----------T-A-------A--GATGTACA-TGTA-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--AT--------TCG--AGCTC------------------T-C-G-G--AG-TG---TTGA---T---------AGC-G---T-GT----A--C----AT--C-T-T--TTTTC--C-A-GTGT---A-T----AAAGT-TATTTTC-----TGC-T-TG-G-A--CCTTATA-CC-TGA-AT-AACCG
gi|60073                      :                                                                                                                                                                                          CAA-T--ATCT-TAAA-GT------T-A--TCAA-T-CTCT-GA-AA-GT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--AT---------------------G-----------C-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TA--------TCA--ATCTC------------------------------------------T---------AGA-A---T-AT----A--C--A-CA----A-T--CACTC----C-GTGA---C-TCACAAA--T-CATTT-C-----CAC-T-T--G-GACCT---TA-C
gi|60074                      :                                                                                                                                                                                           GA-T--ATCT-CGAA-TA------C-CA-TGGA-T-ATGT-CG-AA-GT---G-G---TT-T-G-GAAGTC--CC-------------------------------------------A--AT----CACT--A-------------ATT-CAT-TATG------T-A-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG--ATATC------------------T-C-G-A--A
gi|60075                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CAAA-AT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---A-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------------A-T--T-------------TTC-CTC-T--A------T-T-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TT--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--
gi|60076                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-TTCTC--CG-AA-GT---G-GC--TT-T-T-G----T--CC---------------------G-----------T-A-------A--AG----CA----A-------------TTT-CAT-T--G------TAT-----------T-----------------TTCA--C--Ttacgtttg
gi|60077                      :                                                                                                                                                                                             -T--CCCT-CGGA-AC------T----TCAA-T-CTCT-CG-AA-GTCTGA-AA--TT-T-T-A--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA-----A-C--A--------------TT-CAT-G--G------T-T-----------TTG---------------TCCA--C--TC--------CAG--AGCTC------------------T-C-GAA--AG-TGTCATTCGGGCT---------AGA-G---T--T----A--C--A-AA--C-ATT--CAACC--A-A--------C-T----AA-----ATT--------CGC---T--G-A--C----TA-CC-TGGAAC-GCC
gi|60078                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-
gi|60079                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGA----------T-CGTTCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TT----TCG---T---------AGA-G---T-TT----A--C--A-AA--C-A-CAACAA----A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-AT-GCCCGAGG-GGT--G-AGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTAC---A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC---G--GTA-A-GATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCATCT-G-AG-C-ATGAG-TT-G---C-T---TA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-G-------------------G-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGGTG-T----T--TTGTGAAA
gi|60080                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAA--T------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------T---CATGT--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A---G-TT---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--A-C-T--CAACA--A-AAGTGT---C-T----AA--T--AT--CC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGA-AC-GCCCG-----------TGTAGCGTACA--GGCA------ATATAA-GA--AATTATC--A-GAGGAACG-T--GCC-GCC-G-C-GCTG-C-TT-TGAT--G--GTGG-AC-AC-A-G--G-A-ACGATTT---AATA-G-TTT--AATTG----------------TT-C-TCAGCT-G-AG-CAA-GTG-TT-G---C-T---TA--TG-AT-CGGCG--TAA-G-A-TCTATGA--CTAC-G---G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC-----AACC-ATGCA-A-GAG-T-A-A--------GA-GACGATGA-----T--TTGAGA
gi|60081                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGA-G---T-AA----A--CT-G-AA--C-A-T--C-ACC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATCT-C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGG-TGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACATCA-AGG--ACG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GT--ATAATTT---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CACCC-C-GCACCC-G--------------------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAG-T--TATTT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGA
gi|60082                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-A--GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGACG---T-AA----AACT--G-AA--C-A-T--C-ACC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATT--C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGGTGGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACAT-C-AAGGAGCG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GTA---TATTA---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CAC---C-GCACCC-----------CG---------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAGTT-ATT-TT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGActtatcattttaagacgataatttagaga
gi|60083                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACGTACGATAT-C--TCTA-T-CTCT-CG-AA-TT---G-AAA-TT-T-G-G--ATC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CA-T--G-------------TTT-TAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG----CT-----------------------------G-TG---TTGG---T---------AGT-G---T-AT----A--C--GCAC--C-A-T--CACTA--A-A-GCGT---A-T----CA--T-TATTTCC-----AGT-TGT--A-C--CT---TA-CC-TGG-A
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CAAA-GT------T-C--CTGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-C-ATG--GTCT-TT---------------------A-----------T-A-------AATAA----C--T--AAGCACTCTTGAATTTT-CAC-T---------T-T-----------C-----------------TTGATGT--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-aaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcacG-C--GTG-GCCCG-T-GTTT-C-CT--AATGGG--GTGG-A-----------TA-A----TT---AATT-G-TTT--AATTG-GTCAGTTTCAT-CATCT-G-CCACCT-G-------TGCT-TT-G---T-A---Tcattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60085                      : ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcactttcttgatgttctcgatctctcaaagtgaaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggg-GT------T-C--T--A-T-CTCT-CG-AT-GC---G-AA--TT-T-G-G--GTT--CC---------------------------------T-AT------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--
gi|60086                      :                                                                                                                                                                                                                          cA-T-CTCT-C---A-GC-----AG--TT-C-T-G--ATCGTCC---------------------A-----------T-A-------A--AA-----A-T--AAA-----------TGT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C---C--------TCG--ACCTC------------------T-C-A-GTTAG-TG---GT-----T---------TGA-T---T-AT----A--C--A-CA--CAA-T--CACCC--G-A-GCGTATAT-T----AA--G-TATTTCT-----CGC-T-G--G-A--
gi|60087                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTGG---T---------AGC-A---T-AT----A--T--A-TA--T-A----CA----------TGT---CAT----GA--T-TATTT-T-----CAC-A-T--G-GACCT---TA-CC-TGG-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgaaagtgaaatttgggtcttgtaaaantgaa-------A--AA----CA-A--A-------------TTT-CAT-T--GGGTTTTT-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCTC------------------G-A-G-A--AG-TG---CTGG---T---------AGT-T---T-AT----A--A--A-CAT-C-A-T--CAATC--A-T-GCAA---A-T----AA--T-TATTT-C-----AGC-T-T--G-GACCT---TA-CC-CGA-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AT-TAG-GT--GTTTGTA--T-AGGTGGCA-C--ACT-ACCTG-T-GTTT-C-CTCTGA--GG--GTGG-AT-A-------GTA-A----TT---G------TTT--TATTG-GTCAGTTTTAA-CCCTG-C-TC--TT-G-GG-C-------TT-----------TA-----TT-TTATT--TAT-A-A-TC-------TTAT-CTAAG-------------T-A-TGAAC-AA--AAATT--GT--G-----ACTTGC--TTTGACTTGACAACG-AAGCA-A-AAA-T-----TT-T---GA-GAAAATAAA----T--TTGAGtaactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattgattaggtgtttgtataggtggcacactacctgtgtttcctctgagggtggatagtaattgttttattggtcagttttaaccctgctcttgggctttattttatttataatcttatctaagtatgaacaaaaattgtgacttgctttgacttgacaacgaagcaaaaattttgagaaaataaatttgag
gi|60089                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaatttcattgggtttttttttcaccctcgatctcgagaagtgctggtagtttataaacatcatcaatcatgcaaataattatttcagcttggaccttacccgaataactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattg-G-A--AG-TG---GTTG---C---------AGA-G---T-AA----A--C--ACAA--C-A-T--CAACA--A-A-GAGG---C-T----AA--T-TATCT
gi|60090                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TGG-AT-GCCTAAGG-CGA--G-CGTGGTG-G-T--GGCA------AT-TAG-CT--GTTTACA--T-AGGGGACA-C--ATA-ACCCG-T-ACTT-C-TT-TGATatgctt
gi|60091                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GG-GTG--ATA-ATTATTT---AATA-A-TTT--AGTTG-GTGAATTT--T-CACAA-C-TCATTT-G-AG-TCTTGTG-TT-A---A-G---TA--GG-AT-CCGTT--TAT-G-A-TC---GC--CTAT-GC--A-------------T-A-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   11                 1111111111111111111111111111111111111111111                1111111111111                                 33333333333333333                                                                        111111111                                                                       11111111         1111                                                   111111                                                                                                                         11                       11         111111111                                         1111111111111111                   111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             1 11    1    7  222222 2 444   1 1    1  1  2  111 1  11  77777 11   22  3333333333333333333333333333333333333333333 22  2222  1 11 1111111111111   2   1 11 666666 2 44444444444 11111111111111111    11 33  33333333   22     777777777777777777 1 1 1 11  1  7777 4 222 000000000   1 222 1  2222 11 77 4  55 1 3  1 44 333 3 4   5555 3 3333  22 4     44444444  3 1 77 3333  333  1  1   1  2   1    2  555 2       2 7777    222222  2   99999       55 2        6666   2     777    2 4  2       33    2  666666 33   2 9     4444   2 2   33     2    88  33 2     2 2     8888  2 00    2  2 000000000  33  33 2 3 1 33  33 2 2  999  66    2  5555555555555555 2 2     2  33     000000000000 2    66      55  2    2    33 5   2 2   2  2 444  5        77777 66         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             . ..    .    .  ...... . ...   . .    .  .  .  ... .  ..  ..... ..   ..  ........................................... ..  ....  . .. .............   .   . .. ...... . ........... .................    .. ..  ........   ..     .................. . . . ..  .  .... . ... .........   . ... .  .... .. .. .  .. . .  . .. ... . .   .... . ....  .. .     ........  . . .. ....  ...  .  .   .  .   .    .  ... .       . ....    ......  .   .....       .. .        ....   .     ...    . .  .       ..    .  ...... ..   . .     ....   . .   ..     .    ..  .. .     . .     ....  . ..    .  . .........  ..  .. . . . ..  .. . .  ...  ..    .  ................ . .     .  ..     ............ .    ..      ..  .    .    .. .   . .   .  . ...  .        ..... ..         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             3 55    1    2  999999 1 555   0 0    0  0  0  888 0  44  88888 44   44  9999999999999999999999999999999999999999999 33  1111  0 44 2222222222222   0   0 44 888888 0 88888888888 66666666666666666    44 88  77777777   44     666666666666666666 0 0 0 44  2  4444 9 333 777777777   3 333 3  9999 99 44 3  00 5 2  6 44 222 2 8   5555 2 4444  22 8     22222222  3 7 33 0000  000  7  7   7  1   0    4  111 4       4 3333    888888  2   99999       33 2        5555   1     111    0 0  0       11    2  111111 11   2 7     3333   2 2   11     2    11  11 2     2 2     6666  2 88    2  2 888888888  22  44 4 4 0 22  55 4 4  777  55    4  4444444444444444 4 4     5  44     888888888888 5    99      99  5    5    55 0   5 5   5  5 444  0        11111 99         
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
Reference ( family-446 )      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60048                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-T--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-TTG-A--AG-TG---GTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-A--CC--A-ACGTGT---C------AA--T-TATTTCC------GC-T-T--G-AA-CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-GTTTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACAT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTACTGT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60049                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA--C------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-TT---T-TG--TC-T-T-G--GTC--CC---------------------T-----------T-G-------A--A
gi|60050                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-GA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---C---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-AC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-ACTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CAGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-CT--G-------------T-A-CGAAT-AA--AATTC--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60051                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CG---------------------A-----------T------------------TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAATAAGCAAA------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60052                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--ATAA--C-A-GC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-A---GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCC-A-C-GCTG-C-TT-TGATAGGCCGTGG-AC-AC-A-G--GTAGACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATT--AT-CACTT-C-TC--CT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--T-----A-TTGC--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAcgttcg
gi|60053                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAGAAGCAAA-------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60054                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-TGAA-CT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TCTCGATCGTTCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---cgttcg
gi|60055                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T---TCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG-------------AGA-----T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC--A-CCAAA-A-GTGT---C-T----AA--T-T-TTTCC-----AGC-T-G--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GTG--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--CTTTACA--A-AGGGAACG-T--GAC-GCCCG-C-GCTGTC-TT-TGATAGG--GTAG-AC-AC-A-G--GTA-ACGAGTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCACCA-G-AG-CAATGCG-TT-G---CAA---TA--GG-TTCCTGAG--TAT-A-A-T----GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAATAAA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--G--GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAaatttg
gi|60056                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AACGTC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------TATAAGTAAGCAAAT-----------------TTC---C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60057                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCG-AG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AAA-G---T-AT----A--C--A-AAA-C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC---CCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GG-A------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAATG-C--ACT-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGGTTT---AATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-CACTT-C-TC-CCC-C-AG-CATTGTG-TT-G---A-T---TA--GG-AT-CTGTGTATAT-A-A-TC---GA--CTAC-AT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AAGGT--GT----------TTGT--TTTGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GT-GACAATAAT----C--cgttcg
gi|60058                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-CGAA-CT------T-C----GA-T-CTC--CG-AA-GT---G-AA--GT-C-C-G--GTC--AC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAAGCAAA---------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60059                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CA-AA-AT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCA---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CAC-T-TG-G-A--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCGGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--AGCA------AT-TAAGAG--GTTTACA--A-AAAGAATG-C--ACA-GCCCG-T-GCTG---TT-TGATAAG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATG------------G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-TACTT-C-TCACCC-C-AG-CATTGTG-TT-GAATC-AGATTA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATGT--GT----------TTGT--TTGGTC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAAcgttcg
gi|60060                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TTGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-T-G--GTC--CC---------------------GATTTTTTTTTCT-ATATAACTA--AG----CA-T--A-------------TTT--------------------------------------------------A--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60061                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGACT-CTCTTCG-AA-GT---G-AA--T----G-G--GTC--CC---------------------G-----------TTA-------AC-AA----CA-T--A-------------TTTTCAT----G------T-T-----------GG----------------TTCA--C--TC--------TCGC-ATCTC------------------TTC-G-A--AG-TG----TCG---T---------AGA-------AC----A--CCAA-AA--C-AATC-AA-CC--A-A-GTGT---CCT----AA--TCTATTCTC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CCCTGG-ACCGCCCGAGG-GATTAGTCGTGGCG-A-ATGGGCA------AT-TAA-AA--GTTTAAA--ACAGGGACCG-ATGGCC--CCCG-CCGCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GCCA-GCGGTA-ACGATCTTAAGATA-G-TTT--AATGG-CTCAA-TT-ATCCACTT-C-TCACCCTGTAGACAATGCG-TTGG---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-ACACTCG--GA--CTAC-GT--G-------------T-ATTGAAT-AAATAATTT--ATTCGATGCCA-TTG---TTTGCCA-GA-GACT-ATGCATA-GAG-T-ATA-TTATTTGGA-GACGATGATCTGAT--TCGAGAAAA
gi|60062                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-TAACT-T-CGAA-CT------T-C--GC-A-T-CTCT-CGAAA-GT---G-AAG-TT-C-C-G--GTC--CCCGATTTTTTTCTCTATAGGAGG-----------T-A-------A--AG----CA----A-----------------CAT-T--G--------------------------------------TTAA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60063                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CT-T-CG-AA-GT---GGAA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------C-T-------A--AA----CA-T--A-------------TTTTCAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--AT-TC------------------T-C-G-A--AG-TT---GTC----T----------GA-G---T-AT----A--C--A-AAAAC-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCCGCTAACAT-T-G--G-A--CC---TA-CC-TG---------AAGG-GGA--C-CGT-GCA-T-T--GGC-------AC-TAG-TG--GATAACA--A-AGGGTACGTT--GCA-GCCCGTT-GCTG-CTTT-TCATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGG-TT---AATA-G-TTT--AATTGCGTCAATTT--T-CACTTCC-TCATCC-C-AG-CATTTTGATT-G-----A---TAACGG-AT-CTGTT--TATCA-A-TCGG-GA--CTAT-GT--ACAACTAGTGTTGTT-A-TGAAT-AA--AATGT--AT--G-----T-TTGT--TGCGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-TAATT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60064                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--TTCT-CGAA-GT------T-C--TCAA-T-CTTT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---TTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-T-----CGCTT-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GGCA------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCA-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGAT
gi|60065                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCTTCGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--CTGT-G-G--GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-A--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AGTTG---GTC----T---------CGA-G---T-ATATACA--C--A-CA--C-A-TC-AA--C--A-A-GTGG---T-C----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TTGG-A--CT---TA-CC-TGG-
gi|60066                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-TGAA-TT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AAA-TT-T-A-G--GTT--CC---------------------T-----------T-T-------A--AA----CA-T--ACCTGATTGTA---TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCCC------------------T-C-A-A--AG-TG---TTTG---T---------AGT-G---T-A
gi|60067                      :                                                                                                                                                                                                        AA-GT------T-C--TTGA-C-CTCT-TG-ATTGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--CCT--------------------G-----------T-A-------A--AA----TA----A-------------TTT-CAT-T--GTT----T-T-----------T-----------------TTCA--CT-TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---GT-G---A---------AGA-GCAAT-AT----A--C--A-
gi|60068                      :                                                                                                                                                                ttgatctctcaaacatttgaccctaTCGA-C--CACT--AAA-AT------T-T--TTTA-T-CCCG-AG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-T--ATT--TC---------------------G-----------T-A-------A--A--------T--A-------------TTT-CCT-T--GGGGTT-T-T-----------T-----------------TTCC--C--TC--------ACG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG------A---T---------AGC-A---T-AT----A--C--
gi|60069                      :                                                                                                                                                                                          CGAGT--CTCT-CAAA-GT------T-C--T-GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-----------T---------------------T--A-------------TTT-T-T-T--T------T-C-----------TCTATATGAGTAAGCAAATTTA--C--TC--------TCGGTATCTCTTGAACGTTCACTCTCTAT-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---TAAT----A--C--A-AA--A-A-TCAAA-CA--A-A-GTGTA--C-T----GA--T-T-TTTTC-----CGCTT-T--G-G--CT---TACCC-TGG-AC-GCCCAAGA-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-A-GGAACG-T--GCCTGCCCG-C-GCTG-CTTT-TGATAGG--GTGGAACAAC-A-G--GTA-ACGATTT---GATAGG-TTTTGAATTG-GTCACATT-AT-CACTT-CATCACCT-GAAG-CATTGCG-TT-G---C-A---TA--AGTTT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------TAA-TGAAT-AC--AACTTTAAT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACCTATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-G---AG-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60070                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60071                      :                                                                                                                                                                      caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60072                      :                                                                                                                                                                       caatctctcgattcgacgtCGA-T--CTCT-CAAA-GT------T-C--TCGA-T-CTTT-CA-AAAGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTT--C----------------------A-----------T-A-------A--GATGTACA-TGTA-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--AT--------TCG--AGCTC------------------T-C-G-G--AG-TG---TTGA---T---------AGC-G---T-GT----A--C----AT--C-T-TT-TT-TC--C-A-GTGT---A-T----AAAGT-TATTTTC-----TGC-T-TG-G-A--CCTTATA-CC-TGA-AT-AACCG
gi|60073                      :                                                                                                                                                                                          CAA-T--ATCT-TAAA-GT------T-A--TCAA-T-CTCT-GA-AA-GT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--AT---------------------G-----------C-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TA--------TCA--ATCTC------------------------------------------T---------AGA-A---T-AT----A--C--A-CA----A-TC-ACTCC------GTGA---C-TCACAAA--T-CATTT-C-----CAC-T-T--G-GACCT---TA-C
gi|60074                      :                                                                                                                                                                                           GA-T--ATCT-CGAA-TA------C-CA-TGGA-T-ATGT-CG-AA-GT---G-G---TT-T-G-GAAGTC--CC-------------------------------------------A--AT----CACT--A-------------ATT-CAT-TATG------T-A-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG--ATATC------------------T-C-G-A--A
gi|60075                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CAAA-AT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---A-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------------A-T--T-------------TTC-CTC-T--A------T-T-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TT--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--
gi|60076                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-TTCTC--CG-AA-GT---G-GC--TT-T-T-G----T--CC---------------------G-----------T-A-------A--AG----CA----A-------------TTT-CAT-T--G------TAT-----------T-----------------TTCA--C--Ttacgtttg
gi|60077                      :                                                                                                                                                                                             -T--CCCT-CGGA-AC------T----TCAA-T-CTCT-CG-AA-GTCTGA-AA--TT-T-T-A--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA-----A-C--A--------------TT-CAT-G--G------T-T-----------TTG---------------TCCA--C--TC--------CAG--AGCTC------------------T-C-GAA--AG-TGTCATTCGGGCT---------AGA-G---T--T----A--C--A-AA--C-ATTC-AA-CC--A-A--------C-T----AA-----ATT--------CGC---T--G-A--C----TA-CC-TGGAAC-GCC
gi|60078                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-
gi|60079                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGA----------T-CGTTCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TT----TCG---T---------AGA-G---T-TT----A--C--A-AA--C-A--C-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-AT-GCCCGAGG-GGT--G-AGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTAC---A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC---G--GTA-A-GATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCATCT-G-AG-C-ATGAG-TT-G---C-T---TA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-G-------------------G-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGGTG-T----T--TTGTGAAA
gi|60080                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAA--T------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------T---CATGT--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A---G-TT---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--A-C-TC-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T--AT--CC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGA-AC-GCCCG-----------TGTAGCGTACA--GGCA------ATATAA-GA--AATTATC--A-GAGGAACG-T--GCC-GCC-G-C-GCTG-C-TT-TGAT--G--GTGG-AC-AC-A-G--G-A-ACGATTT---AATA-G-TTT--AATTG----------------TT-C-TCAGCT-G-AG-CAA-GTG-TT-G---C-T---TA--TG-AT-CGGCG--TAA-G-A-TCTATGA--CTAC-G---G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC-----AACC-ATGCA-A-GAG-T-A-A--------GA-GACGATGA-----T--TTGAGA
gi|60081                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGA-G---T-AA----A--CT-G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATCT-C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGG-TGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACATCA-AGG--ACG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GT--ATAATTT---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CACCC-C-GCACCC-G--------------------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAG-T--TATTT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGA
gi|60082                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-A--GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGACG---T-AA----AACT--G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATT--C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGGTGGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACAT-C-AAGGAGCG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GTA---TATTA---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CAC---C-GCACCC-----------CG---------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAGTT-ATT-TT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGActtatcattttaagacgataatttagaga
gi|60083                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACGTACGATAT-C--TCTA-T-CTCT-CG-AA-TT---G-AAA-TT-T-G-G--ATC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CA-T--G-------------TTT-TAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG----CT-----------------------------G-TG---TTGG---T---------AGT-G---T-AT----A--C--GCAC--C-A-TC-AC-TA--A-A-GCGT---A-T----CA--T-TATTTCC-----AGT-TGT--A-C--CT---TA-CC-TGG-A
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CAAA-GT------T-C--CTGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-C-ATG--GTCT-TT---------------------A-----------T-A-------AATAA----C--T--AAGCACTCTTGAATTTT-CAC-T---------T-T-----------C-----------------TTGATGT--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-aaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcacG-C--GTG-GCCCG-T-GTTT-C-CT--AATGGG--GTGG-A-----------TA-A----TT---AATT-G-TTT--AATTG-GTCAGTTTCAT-CATCT-G-CCACCT-G-------TGCT-TT-G---T-A---Tcattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60085                      : ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcactttcttgatgttctcgatctctcaaagtgaaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggg-GT------T-C--T--A-T-CTCT-CG-AT-GC---G-AA--TT-T-G-G--GTT--CC---------------------------------T-AT------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--
gi|60086                      :                                                                                                                                                                                                                          cA-T-CTCT-C---A-GC-----AG--TT-C-T-G--ATCGTCC---------------------A-----------T-A-------A--AA-----A-T--AAA-----------TGT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C---C--------TCG--ACCTC------------------T-C-A-GTTAG-TG---GT-----T---------TGA-T---T-AT----A--C--A-CA--CAA-TC-AC-CC--G-A-GCGTATAT-T----AA--G-TATTTCT-----CGC-T-G--G-A--
gi|60087                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTGG---T---------AGC-A---T-AT----A--T--A-TA--T-A--C-A-----------TGT---CAT----GA--T-TATTT-T-----CAC-A-T--G-GACCT---TA-CC-TGG-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgaaagtgaaatttgggtcttgtaaaantgaa-------A--AA----CA-A--A-------------TTT-CAT-T--GGGTTTTT-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCTC------------------G-A-G-A--AG-TG---CTGG---T---------AGT-T---T-AT----A--A--A-CAT-C-A-TC-AA-TC--A-T-GCAA---A-T----AA--T-TATTT-C-----AGC-T-T--G-GACCT---TA-CC-CGA-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AT-TAG-GT--GTTTGTA--T-AGGTGGCA-C--ACT-ACCTG-T-GTTT-C-CTCTGA--GG--GTGG-AT-A-------GTA-A----TT---G------TTT--TATTG-GTCAGTTTTAA-CCCTG-C-TC--TT-G-GG-C-------TT-----------TA-----TT-TTATT--TAT-A-A-TC-------TTAT-CTAAG-------------T-A-TGAAC-AA--AAATT--GT--G-----ACTTGC--TTTGACTTGACAACG-AAGCA-A-AAA-T-----TT-T---GA-GAAAATAAA----T--TTGAGtaactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattgattaggtgtttgtataggtggcacactacctgtgtttcctctgagggtggatagtaattgttttattggtcagttttaaccctgctcttgggctttattttatttataatcttatctaagtatgaacaaaaattgtgacttgctttgacttgacaacgaagcaaaaattttgagaaaataaatttgag
gi|60089                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaatttcattgggtttttttttcaccctcgatctcgagaagtgctggtagtttataaacatcatcaatcatgcaaataattatttcagcttggaccttacccgaataactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattg-G-A--AG-TG---GTTG---C---------AGA-G---T-AA----A--C--ACAA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GAGG---C-T----AA--T-TATCT
gi|60090                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TGG-AT-GCCTAAGG-CGA--G-CGTGGTG-G-T--GGCA------AT-TAG-CT--GTTTACA--T-AGGGGACA-C--ATA-ACCCG-T-ACTT-C-TT-TGATatgctt
gi|60091                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GG-GTG--ATA-ATTATTT---AATA-A-TTT--AGTTG-GTGAATTT--T-CACAA-C-TCATTT-G-AG-TCTTGTG-TT-A---A-G---TA--GG-AT-CCGTT--TAT-G-A-TC---GC--CTAT-GC--A-------------T-A-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   11                 1111111111111111111111111111111111111111111                1111111111111                                 33333333333333333                                                                        111111111                                                                       11111111         1111                                                   111111                                                                                                                         11                       11         111111111                                         1111111111111111                   111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             1 11    1    7  222222 2 444   1 1    1  1  2  111 1  11  77777 11   22  3333333333333333333333333333333333333333333 22  2222  1 11 1111111111111   2   1 11 666666 2 44444444444 11111111111111111    11 33  33333333   22     777777777777777777 1 1 1 11  1  7777 4 222 000000000   1 222 1  2222 11 77 4  55 1 3  1 44 333 3 4   5555 3 3333  22 4     44444444  3 1 77 3333  333  1  1   1  2   1    2  555 2       2 7777    222222  2   99999       55 2        6666   2     777    2 4  2       33    2  666666 33   2 9     4444   2 2   33     2    88  33 2     2 2     8888  2 00    2  2 000000000  33  33 2 3 1 33  33 2 2  999  66    2  5555555555555555 2 2     2  33     000000000000 2    66      55  2    2    33 5   2 2   2  2 444  5        77777 66         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             . ..    .    .  ...... . ...   . .    .  .  .  ... .  ..  ..... ..   ..  ........................................... ..  ....  . .. .............   .   . .. ...... . ........... .................    .. ..  ........   ..     .................. . . . ..  .  .... . ... .........   . ... .  .... .. .. .  .. . .  . .. ... . .   .... . ....  .. .     ........  . . .. ....  ...  .  .   .  .   .    .  ... .       . ....    ......  .   .....       .. .        ....   .     ...    . .  .       ..    .  ...... ..   . .     ....   . .   ..     .    ..  .. .     . .     ....  . ..    .  . .........  ..  .. . . . ..  .. . .  ...  ..    .  ................ . .     .  ..     ............ .    ..      ..  .    .    .. .   . .   .  . ...  .        ..... ..         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             3 55    1    2  999999 1 555   0 0    0  0  0  888 0  44  88888 44   44  9999999999999999999999999999999999999999999 33  1111  0 44 2222222222222   0   0 44 888888 0 88888888888 66666666666666666    44 88  77777777   44     666666666666666666 0 0 0 44  2  4444 9 333 777777777   3 333 3  9999 99 44 3  00 5 2  6 44 222 2 8   5555 2 4444  22 8     22222222  3 7 33 0000  000  7  7   7  1   0    4  111 4       4 3333    888888  2   99999       33 2        5555   1     111    0 0  0       11    2  111111 11   2 7     3333   2 2   11     2    11  11 2     2 2     6666  2 88    2  2 888888888  22  44 4 4 0 22  55 4 4  777  55    4  4444444444444444 4 4     5  44     888888888888 5    99      99  5    5    55 0   5 5   5  5 444  0        11111 99         
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
Reference ( family-446 )      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60048                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-T--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-TTG-A--AG-TG---GTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-A--CC--A-ACGTGT---C------AA--T-TATTTCC------GC-T-T--G-AA-CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-GTTTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACAT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTACTGT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60049                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA--C------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-TT---T-TG--TC-T-T-G--GTC--CC---------------------T-----------T-G-------A--A
gi|60050                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-GA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---C---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-AC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-ACTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CAGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-CT--G-------------T-A-CGAAT-AA--AATTC--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60051                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CG---------------------A-----------T------------------TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAATAAGCAAA------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60052                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--ATAA--C-A-GC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-A---GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCC-A-C-GCTG-C-TT-TGATAGGCCGTGG-AC-AC-A-G--GTAGACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATT--AT-CACTT-C-TC--CT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--T-----A-TTGC--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAcgttcg
gi|60053                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAGAAGCAAA-------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60054                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-TGAA-CT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TCTCGATCGTTCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---cgttcg
gi|60055                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T---TCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG-------------AGA-----T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC--A-CCAAA-A-GTGT---C-T----AA--T-T-TTTCC-----AGC-T-G--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GTG--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--CTTTACA--A-AGGGAACG-T--GAC-GCCCG-C-GCTGTC-TT-TGATAGG--GTAG-AC-AC-A-G--GTA-ACGAGTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCACCA-G-AG-CAATGCG-TT-G---CAA---TA--GG-TTCCTGAG--TAT-A-A-T----GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAATAAA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--G--GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAaatttg
gi|60056                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AACGTC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------TATAAGTAAGCAAAT-----------------TTC---C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60057                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCG-AG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AAA-G---T-AT----A--C--A-AAA-C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC---CCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GG-A------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAATG-C--ACT-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGGTTT---AATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-CACTT-C-TC-CCC-C-AG-CATTGTG-TT-G---A-T---TA--GG-AT-CTGTGTATAT-A-A-TC---GA--CTAC-AT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AAGGT--GT----------TTGT--TTTGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GT-GACAATAAT----C--cgttcg
gi|60058                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-CGAA-CT------T-C----GA-T-CTC--CG-AA-GT---G-AA--GT-C-C-G--GTC--AC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAAGCAAA---------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60059                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CA-AA-AT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCA---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CAC-T-TG-G-A--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCGGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--AGCA------AT-TAAGAG--GTTTACA--A-AAAGAATG-C--ACA-GCCCG-T-GCTG---TT-TGATAAG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATG------------G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-TACTT-C-TCACCC-C-AG-CATTGTG-TT-GAATC-AGATTA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATGT--GT----------TTGT--TTGGTC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAAcgttcg
gi|60060                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TTGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-T-G--GTC--CC---------------------GATTTTTTTTTCT-ATATAACTA--AG----CA-T--A-------------TTT--------------------------------------------------A--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60061                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGACT-CTCTTCG-AA-GT---G-AA--T----G-G--GTC--CC---------------------G-----------TTA-------AC-AA----CA-T--A-------------TTTTCAT----G------T-T-----------GG----------------TTCA--C--TC--------TCGC-ATCTC------------------TTC-G-A--AG-TG----TCG---T---------AGA-------AC----A--CCAA-AA--C-AATC-AA-CC--A-A-GTGT---CCT----AA--TCTATTCTC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CCCTGG-ACCGCCCGAGG-GATTAGTCGTGGCG-A-ATGGGCA------AT-TAA-AA--GTTTAAA--ACAGGGACCG-ATGGCC--CCCG-CCGCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GCCA-GCGGTA-ACGATCTTAAGATA-G-TTT--AATGG-CTCAA-TT-ATCCACTT-C-TCACCCTGTAGACAATGCG-TTGG---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-ACACTCG--GA--CTAC-GT--G-------------T-ATTGAAT-AAATAATTT--ATTCGATGCCA-TTG---TTTGCCA-GA-GACT-ATGCATA-GAG-T-ATA-TTATTTGGA-GACGATGATCTGAT--TCGAGAAAA
gi|60062                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-TAACT-T-CGAA-CT------T-C--GC-A-T-CTCT-CGAAA-GT---G-AAG-TT-C-C-G--GTC--CCCGATTTTTTTCTCTATAGGAGG-----------T-A-------A--AG----CA----A-----------------CAT-T--G--------------------------------------TTAA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60063                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CT-T-CG-AA-GT---GGAA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------C-T-------A--AA----CA-T--A-------------TTTTCAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--AT-TC------------------T-C-G-A--AG-TT---GTC----T----------GA-G---T-AT----A--C--A-AAAAC-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCCGCTAACAT-T-G--G-A--CC---TA-CC-TG---------AAGG-GGA--C-CGT-GCA-T-T--GGC-------AC-TAG-TG--GATAACA--A-AGGGTACGTT--GCA-GCCCGTT-GCTG-CTTT-TCATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGG-TT---AATA-G-TTT--AATTGCGTCAATTT--T-CACTTCC-TCATCC-C-AG-CATTTTGATT-G-----A---TAACGG-AT-CTGTT--TATCA-A-TCGG-GA--CTAT-GT--ACAACTAGTGTTGTT-A-TGAAT-AA--AATGT--AT--G-----T-TTGT--TGCGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-TAATT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60064                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--TTCT-CGAA-GT------T-C--TCAA-T-CTTT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---TTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-T-----CGCTT-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GGCA------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCA-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGAT
gi|60065                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCTTCGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--CTGT-G-G--GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-A--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AGTTG---GTC----T---------CGA-G---T-ATATACA--C--A-CA--C-A-TC-AA--C--A-A-GTGG---T-C----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TTGG-A--CT---TA-CC-TGG-
gi|60066                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-TGAA-TT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AAA-TT-T-A-G--GTT--CC---------------------T-----------T-T-------A--AA----CA-T--ACCTGATTGTA---TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCCC------------------T-C-A-A--AG-TG---TTTG---T---------AGT-G---T-A
gi|60067                      :                                                                                                                                                                                                        AA-GT------T-C--TTGA-C-CTCT-TG-ATTGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--CCT--------------------G-----------T-A-------A--AA----TA----A-------------TTT-CAT-T--GTT----T-T-----------T-----------------TTCA--CT-TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---GT-G---A---------AGA-GCAAT-AT----A--C--A-
gi|60068                      :                                                                                                                                                                ttgatctctcaaacatttgaccctaTCGA-C--CACT--AAA-AT------T-T--TTTA-T-CCCG-AG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-T--ATT--TC---------------------G-----------T-A-------A--A--------T--A-------------TTT-CCT-T--GGGGTT-T-T-----------T-----------------TTCC--C--TC--------ACG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG------A---T---------AGC-A---T-AT----A--C--
gi|60069                      :                                                                                                                                                                                          CGAGT--CTCT-CAAA-GT------T-C--T-GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-----------T---------------------T--A-------------TTT-T-T-T--T------T-C-----------TCTATATGAGTAAGCAAATTTA--C--TC--------TCGGTATCTCTTGAACGTTCACTCTCTAT-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---TAAT----A--C--A-AA--A-A-TCAAA-CA--A-A-GTGTA--C-T----GA--T-T-TTTTC-----CGCTT-T--G-G--CT---TACCC-TGG-AC-GCCCAAGA-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-A-GGAACG-T--GCCTGCCCG-C-GCTG-CTTT-TGATAGG--GTGGAACAAC-A-G--GTA-ACGATTT---GATAGG-TTTTGAATTG-GTCACATT-AT-CACTT-CATCACCT-GAAG-CATTGCG-TT-G---C-A---TA--AGTTT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------TAA-TGAAT-AC--AACTTTAAT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACCTATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-G---AG-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60070                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60071                      :                                                                                                                                                                      caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60072                      :                                                                                                                                                                       caatctctcgattcgacgtCGA-T--CTCT-CAAA-GT------T-C--TCGA-T-CTTT-CA-AAAGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTT--C----------------------A-----------T-A-------A--GATGTACA-TGTA-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--AT--------TCG--AGCTC------------------T-C-G-G--AG-TG---TTGA---T---------AGC-G---T-GT----A--C----AT--C-T-TT-TT-TC--C-A-GTGT---A-T----AAAGT-TATTTTC-----TGC-T-TG-G-A--CCTTATA-CC-TGA-AT-AACCG
gi|60073                      :                                                                                                                                                                                          CAA-T--ATCT-TAAA-GT------T-A--TCAA-T-CTCT-GA-AA-GT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--AT---------------------G-----------C-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TA--------TCA--ATCTC------------------------------------------T---------AGA-A---T-AT----A--C--A-CA----A-TC-ACTCC------GTGA---C-TCACAAA--T-CATTT-C-----CAC-T-T--G-GACCT---TA-C
gi|60074                      :                                                                                                                                                                                           GA-T--ATCT-CGAA-TA------C-CA-TGGA-T-ATGT-CG-AA-GT---G-G---TT-T-G-GAAGTC--CC-------------------------------------------A--AT----CACT--A-------------ATT-CAT-TATG------T-A-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG--ATATC------------------T-C-G-A--A
gi|60075                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CAAA-AT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---A-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------------A-T--T-------------TTC-CTC-T--A------T-T-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TT--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--
gi|60076                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-TTCTC--CG-AA-GT---G-GC--TT-T-T-G----T--CC---------------------G-----------T-A-------A--AG----CA----A-------------TTT-CAT-T--G------TAT-----------T-----------------TTCA--C--Ttacgtttg
gi|60077                      :                                                                                                                                                                                             -T--CCCT-CGGA-AC------T----TCAA-T-CTCT-CG-AA-GTCTGA-AA--TT-T-T-A--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA-----A-C--A--------------TT-CAT-G--G------T-T-----------TTG---------------TCCA--C--TC--------CAG--AGCTC------------------T-C-GAA--AG-TGTCATTCGGGCT---------AGA-G---T--T----A--C--A-AA--C-ATTC-AA-CC--A-A--------C-T----AA-----ATT--------CGC---T--G-A--C----TA-CC-TGGAAC-GCC
gi|60078                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-
gi|60079                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGA----------T-CGTTCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TT----TCG---T---------AGA-G---T-TT----A--C--A-AA--C-A--C-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-AT-GCCCGAGG-GGT--G-AGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTAC---A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC---G--GTA-A-GATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCATCT-G-AG-C-ATGAG-TT-G---C-T---TA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-G-------------------G-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGGTG-T----T--TTGTGAAA
gi|60080                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAA--T------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------T---CATGT--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A---G-TT---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--A-C-TC-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T--AT--CC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGA-AC-GCCCG-----------TGTAGCGTACA--GGCA------ATATAA-GA--AATTATC--A-GAGGAACG-T--GCC-GCC-G-C-GCTG-C-TT-TGAT--G--GTGG-AC-AC-A-G--G-A-ACGATTT---AATA-G-TTT--AATTG----------------TT-C-TCAGCT-G-AG-CAA-GTG-TT-G---C-T---TA--TG-AT-CGGCG--TAA-G-A-TCTATGA--CTAC-G---G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC-----AACC-ATGCA-A-GAG-T-A-A--------GA-GACGATGA-----T--TTGAGA
gi|60081                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGA-G---T-AA----A--CT-G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATCT-C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGG-TGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACATCA-AGG--ACG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GT--ATAATTT---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CACCC-C-GCACCC-G--------------------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAG-T--TATTT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGA
gi|60082                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-A--GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGACG---T-AA----AACT--G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATT--C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGGTGGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACAT-C-AAGGAGCG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GTA---TATTA---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CAC---C-GCACCC-----------CG---------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAGTT-ATT-TT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGActtatcattttaagacgataatttagaga
gi|60083                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACGTACGATAT-C--TCTA-T-CTCT-CG-AA-TT---G-AAA-TT-T-G-G--ATC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CA-T--G-------------TTT-TAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG----CT-----------------------------G-TG---TTGG---T---------AGT-G---T-AT----A--C--GCAC--C-A-TC-AC-TA--A-A-GCGT---A-T----CA--T-TATTTCC-----AGT-TGT--A-C--CT---TA-CC-TGG-A
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CAAA-GT------T-C--CTGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-C-ATG--GTCT-TT---------------------A-----------T-A-------AATAA----C--T--AAGCACTCTTGAATTTT-CAC-T---------T-T-----------C-----------------TTGATGT--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-aaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcacG-C--GTG-GCCCG-T-GTTT-C-CT--AATGGG--GTGG-A-----------TA-A----TT---AATT-G-TTT--AATTG-GTCAGTTTCAT-CATCT-G-CCACCT-G-------TGCT-TT-G---T-A---Tcattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60085                      : ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcactttcttgatgttctcgatctctcaaagtgaaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggg-GT------T-C--T--A-T-CTCT-CG-AT-GC---G-AA--TT-T-G-G--GTT--CC---------------------------------T-AT------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--
gi|60086                      :                                                                                                                                                                                                                          cA-T-CTCT-C---A-GC-----AG--TT-C-T-G--ATCGTCC---------------------A-----------T-A-------A--AA-----A-T--AAA-----------TGT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C---C--------TCG--ACCTC------------------T-C-A-GTTAG-TG---GT-----T---------TGA-T---T-AT----A--C--A-CA--CAA-TC-AC-CC--G-A-GCGTATAT-T----AA--G-TATTTCT-----CGC-T-G--G-A--
gi|60087                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTGG---T---------AGC-A---T-AT----A--T--A-TA--T-A--C-A-----------TGT---CAT----GA--T-TATTT-T-----CAC-A-T--G-GACCT---TA-CC-TGG-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgaaagtgaaatttgggtcttgtaaaantgaa-------A--AA----CA-A--A-------------TTT-CAT-T--GGGTTTTT-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCTC------------------G-A-G-A--AG-TG---CTGG---T---------AGT-T---T-AT----A--A--A-CAT-C-A-TC-AA-TC--A-T-GCAA---A-T----AA--T-TATTT-C-----AGC-T-T--G-GACCT---TA-CC-CGA-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AT-TAG-GT--GTTTGTA--T-AGGTGGCA-C--ACT-ACCTG-T-GTTT-C-CTCTGA--GG--GTGG-AT-A-------GTA-A----TT---G------TTT--TATTG-GTCAGTTTTAA-CCCTG-C-TC--TT-G-GG-C-------TT-----------TA-----TT-TTATT--TAT-A-A-TC-------TTAT-CTAAG-------------T-A-TGAAC-AA--AAATT--GT--G-----ACTTGC--TTTGACTTGACAACG-AAGCA-A-AAA-T-----TT-T---GA-GAAAATAAA----T--TTGAGtaactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattgattaggtgtttgtataggtggcacactacctgtgtttcctctgagggtggatagtaattgttttattggtcagttttaaccctgctcttgggctttattttatttataatcttatctaagtatgaacaaaaattgtgacttgctttgacttgacaacgaagcaaaaattttgagaaaataaatttgag
gi|60089                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaatttcattgggtttttttttcaccctcgatctcgagaagtgctggtagtttataaacatcatcaatcatgcaaataattatttcagcttggaccttacccgaataactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattg-G-A--AG-TG---GTTG---C---------AGA-G---T-AA----A--C--ACAA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GAGG---C-T----AA--T-TATCT
gi|60090                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TGG-AT-GCCTAAGG-CGA--G-CGTGGTG-G-T--GGCA------AT-TAG-CT--GTTTACA--T-AGGGGACA-C--ATA-ACCCG-T-ACTT-C-TT-TGATatgctt
gi|60091                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GG-GTG--ATA-ATTATTT---AATA-A-TTT--AGTTG-GTGAATTT--T-CACAA-C-TCATTT-G-AG-TCTTGTG-TT-A---A-G---TA--GG-AT-CCGTT--TAT-G-A-TC---GC--CTAT-GC--A-------------T-A-


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             G AA    T    C  ACGATA T GTT   C T    T  A  T  CTG G  CG  GTG   AA   GT  CGATTTTTTTCTCTATAGGAGGTA                    AT  TGTA  C GT AGCACTCTTGAAT   T   G AT GGTTTT A AAGTAAGCAAA CTATATGAGTAAGCAAA    TG GT  TCGATCGT   GT     TTGAACGTTCACTCTCTA T . A TT  T  TCAT C GGC AGATCGAAC   C CAA A  ATAC AC CA T  AA A A  A CT CAA G A   TATA C CACA  AG C     CCGCTAAC  T G TG GAC   TTA  C  C   A  C   C    T  TTA T       T ATG     ATAATC  A   GATA        TC C        ATG    T     CC     T T  C       CC    A  GCCA   CG   G C     TAAG   G .   TG     C    AT  CA C     C A     CTGT  A AA    A  G AATCAGAT   AC  TT C A A TA  TC C C  TAT  CT    .  ACAACTAGTGTTGT   A T     A  AT     ATTCGATGCC   C    GA      TT  C    T    AT G   T A   T  A TTG  T        TCTGA AA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    C  .      T AT    . .    .  .  A  .   .  G   CTG   .    T   GATTTTTTTTTCTATATAACT                       C   .     . .  CCTGATTGTA      T   . .  GGGTT  A .           AAATAAGCAAA          .  GT  .          C      .                  . . . .   .  G    C .   AGATCGAAC   . .   .  .    .  A  C  A  . T  . A  C   G A   TA   A .     .  C     CCC       T . G  GAC   .    .  .   .  .   C    .  T   .       . CA      ATAATC  .   GATA        T  .        TT     .     TT     . T  .       .     .  AACA   .    . C     G      . .   .      .    AT  TA .     . .     TGA   . AA    .  . CAA        .   T  . T A .   T  . .  GG   CT    .  AAG              . .     .  .      TAATG        .    GA      A   .    .    A  G   . .   .  . .    T        T     AA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    C  .      . T     . .    .  .  .  .   .  G   CAT   .    .   GTTA                                        .   .     . .  AA              .   . .  TT     . .           AACTAAGCAAA          .  T   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  A  C  T  . .  . A  A   . .   T    . .     .  C     CCA       . . G  GAC   .    .  .   .  .   C    .  T   .       . A       .       .   GAG         .  .        T      .     C      . .  .       .     .  GGGT   .    . C     G      . .   .      .    AT  A  .     . .     TG    . AA    .  . CA         .   T  . T A .   T  . .  G    .     .  G                . .     .  .      AAATG        .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    C  .      . T     . .    .  .  .  .   .  G   CTG   .    .   TGTA                                        .   .     . .  .               .   . .  .      . .           AACTAAGCAAA          .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  A  .  .  . .  . A  A   . .   T    . .     .  .     TCC       . . G  GA    .    .  .   .  .   C    .  G   .       . A       .       .   AA          .  .        T      .     C      . .  .       .     .  ACA    .    . T     G      . .   .      .    AT  A  .     . .     TG    . AT    .  . CA         .   T  . T T .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      AAATG        .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    C  .      . T     . .    .  .  .  .   .  G   TT    .    .   TTG                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           AAGAAGCAAA           .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  T  .  .  . .  . A  A   . .   T    . .     .  .     TCC       . . .  GA    .    .  .   .  .   G    .  A   .       . A       .       .   AA          .  .        T      .     C      . .  .       .     .  ACA    .    . T     A      . .   .      .    AT  A  .     . .     AG    . AT    .  . AT         .   A  . T T .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATG          .    .       .   .    .    G  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    C  .      . T     . .    .  .  .  .   .  A   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           AAAGCAAA             .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   T    . .     .  .     TCT       . . .  GA    .    .  .   .  .   C    .  A   .       . T       .       .   AG          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  ACA    .    . C     A      . .   .      .    CA  A  .     . .     CC    . AA    .  . CA         .   A  . T A .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATT          .    .       .   .    .    G  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  A   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           TG                   .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   T    . .     .  .     CCC       . . .  GA    .    .  .   .  .   C    .  A   .       . T       .       .   AA          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  ACA    .    . T     G      . .   .      .    AT  A  .     . .     CC    . AT    .  . CA         .   T  . T T .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATG          .    .       .   .    .    G  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  G   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           G                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  T    T .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   T    . .     .  .     CCA       . . .  AA    .    .  .   .  .   C    .  A   .       . T       .       .   TG          .  .        T      .     T      . .  .       .     .  ACA    .    . C     G      . .   .      .    AT  A  .     . .     CC    . AT    .  . CA         .   A  . T A .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATG          .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  A   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   T    . .     .  .     CTC       . . .  AA    .    .  .   .  .   C    .  T   .       . T       .       .   AG          .  .        T      .     C      . .  .       .     .  ACA    .    . C     A      . .   .      .    GT  A  .     . .     TG    . AA    .  . CA         .   T  . T G .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATG          .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  A   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  T    T .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   T    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   C    .  T   .       . A       .       .   AA          .  .        T      .     C      . .  .       .     .  ACA    .    . T     A      . .   .      .    GT  A  .     . .     TG    . CT    .  . CT         .   T  . G G .   A  . .  .    .     .  G                . .     .  .      ATG          .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  A   TG    .    .   GCT                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   G    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   C    .  T   .       . A       .       .   AA          .  .        T      .     C      . .  .       .     .  CA     .    . T     A      . .   .      .    AT  .  .     . .     CG    . A     .  . CT         .   A  . T T .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      GTG          .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        T     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . G     . .    .  .  .  .   .  .   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    T .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . T  C   . .   T    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   T    .  T   .       . A       .       .   GA          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  CA     .    . .     A      . .   .      .    A   .  .     . .     TG    . A     .  . TA         .   A  . C C .   T  . .  .    .     .  G                . .     .  .      GT           .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        A     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  T    T .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   A    . .     .  .     TC        . . .  A     .    .  .   .  .   T    .  A   .       . A       .       .   GT          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  AC     .    . .     G      . .   .      .    A   .  .     . .     TG    . A     .  . AG         .   C  . . T .   .  . .  .    .     .  A                . .     .  .      GT           .    .       .   .    .    G  .   . .   .  . .    .        .     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CC    .    .   TTT                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   T    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   T    .  A   .       . T       .       .   GT          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  AG     .    . .     A      . .   .      .    A   .  .     . .     TG    . .     .  . A          .   C  . . T .   .  . .  .    .     .  .                . .     .  .      AA           .    .       .   .    .    G  .   . .   .  . .    .        .     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   T    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   .    .  A   .       . T       .       .   GT          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  AG     .    . .     .      . .   .      .    .   .  .     . .     C     . .     .  . .          .   T  . . T .   .  . .  .    .     .  .                . .     .  .      AA           .    .       .   .    .    A  .   . .   .  . .    .        .     . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CT    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  A    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   C    . .     .  .     CC        . . .  G     .    .  .   .  .   .    .  .   .       . T       .       .   CT          .  .        C      .     T      . .  .       .     .  A      .    . .     .      . .   .      .    .   .  .     . .     .     . .     .  . .          .   A  . . T .   .  . .  .    .     .  .                . .                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  A    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   C    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .   .                             .       .   A           .  .        .      .     .      . .  .       .     .  .      .    . .     .      . .   .      .    .   .  .     . .     .     . .     .  . .                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   ATA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  T    C .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . C  C   . .   T    . .     .  .     CC        . . .  A     .    .  .   .  .                                                                     .      .     .      . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GCA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . C  C   . .   T    . .     .  .     TC        . . .  A     .    .  .   .                                                                                            . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TA    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  A   . .   A    . .     .  .     CA        . . .  A     .    .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . A  C   . .   G    . .     .  .     C         . . .  A     .    .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TT    .    .   TCA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  C    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . .  C   . .   .    . .     .  .     C         . . .  C     .    .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  G    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . .  A   . .   .    . .     .  .     C         . . .  A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    G .   .           . .   .  .    .  .  .  .  . .  . .  .   . .   .    . .     .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    T .   .           . .   .  .    .  .  .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    . .   .           . .   .  .    .  .  .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   CC    .    .   GTA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    . .   .           . .   .  .    .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TT    .    .   ATA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    . .   .           . .   .  .    .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . C     . .    .  .  .  .   .  .   TT    .    .   TCA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .  .    . .   .           . .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             . .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   TAT                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . T     . .    .  .  .  .   .  .   TT    .    .   ATA                                         .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   AT                                          .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   GT                                          .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   G                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   TG    .    .   G                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .     .    .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   CT    .    .   G                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   G     .    .   G                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .  .      . .     . .    .  .  .  .   .  .   .     .    .   G                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .   .          .      .                  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            . .    .  .  .  .   .  .   .     .    .   .                                           .   .     . .  .               .   . .  .      . .           .                    .  .                                          . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                      T**                                                                                                                                                                                                                                                                                            A*                                                  A***                                                                                                                                                                              AT
originalCons                  :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-CT--CGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--GA---CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   11                 1111111111111111111111111111111111111111111                1111111111111                                 33333333333333333                                                                        111111111                                                                       11111111         1111                                                   111111                                                                                                                         11                       11         111111111                                         1111111111111111                   111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             1 11    1    7  222222 2 444   1 1    1  1  2  111 1  11  77777 11   22  3333333333333333333333333333333333333333333 22  2222  1 11 1111111111111   2   1 11 666666 2 44444444444 11111111111111111    11 33  33333333   22     777777777777777777 1 1 1 11  1  7777 4 222 000000000   1 222 1  2222 11 77 4  55 1 3  1 44 333 3 4   5555 3 3333  22 4     44444444  3 1 77 3333  333  1  1   1  2   1    2  555 2       2 7777    222222  2   99999       55 2        6666   2     777    2 4  2       33    2  666666 33   2 9     4444   2 2   33     2    88  33 2     2 2     8888  2 00    2  2 000000000  33  33 2 3 1 33  33 2 2  999  66    2  5555555555555555 2 2     2  33     000000000000 2    66      55  2    2    33 5   2 2   2  2 444  5        77777 66         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             . ..    .    .  ...... . ...   . .    .  .  .  ... .  ..  ..... ..   ..  ........................................... ..  ....  . .. .............   .   . .. ...... . ........... .................    .. ..  ........   ..     .................. . . . ..  .  .... . ... .........   . ... .  .... .. .. .  .. . .  . .. ... . .   .... . ....  .. .     ........  . . .. ....  ...  .  .   .  .   .    .  ... .       . ....    ......  .   .....       .. .        ....   .     ...    . .  .       ..    .  ...... ..   . .     ....   . .   ..     .    ..  .. .     . .     ....  . ..    .  . .........  ..  .. . . . ..  .. . .  ...  ..    .  ................ . .     .  ..     ............ .    ..      ..  .    .    .. .   . .   .  . ...  .        ..... ..         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                             3 55    1    2  999999 1 555   0 0    0  0  0  888 0  44  88888 44   44  9999999999999999999999999999999999999999999 33  1111  0 44 2222222222222   0   0 44 888888 0 88888888888 66666666666666666    44 88  77777777   44     666666666666666666 0 0 0 44  2  4444 9 333 777777777   3 333 3  9999 99 44 3  00 5 2  6 44 222 2 8   5555 2 4444  22 8     22222222  3 7 33 0000  000  7  7   7  1   0    4  111 4       4 3333    888888  2   99999       33 2        5555   1     111    0 0  0       11    2  111111 11   2 7     3333   2 2   11     2    11  11 2     2 2     6666  2 88    2  2 888888888  22  44 4 4 0 22  55 4 4  777  55    4  4444444444444444 4 4     5  44     888888888888 5    99      99  5    5    55 0   5 5   5  5 444  0        11111 99         
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
Reference ( family-446 )      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-CC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGN--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-C--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCC-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-NT-CTGNG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCG-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60048                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-T--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-TTG-A--AG-TG---GTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-A--CC--A-ACGTGT---C------AA--T-TATTTCC------GC-T-T--G-AA-CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-GTTTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACAT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTACTGT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60049                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA--C------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-TT---T-TG--TC-T-T-G--GTC--CC---------------------T-----------T-G-------A--A
gi|60050                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-GA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---C---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--C-A-TC-AA-AC--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC-----CGC-T-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-ACTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT-AT-CACTT-C-TCACCT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CAGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-CT--G-------------T-A-CGAAT-AA--AATTC--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60051                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CG---------------------A-----------T------------------TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAATAAGCAAA------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60052                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--ATAA--C-A-GC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-G-T--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-A---GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCC-GCC-A-C-GCTG-C-TT-TGATAGGCCGTGG-AC-AC-A-G--GTAGACGATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAATT--AT-CACTT-C-TC--CT-G-AG-CAATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--T-----A-TTGC--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAcgttcg
gi|60053                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAGAAGCAAA-------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60054                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-TGAA-CT------T-C----GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TCTCGATCGTTCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---cgttcg
gi|60055                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T---TCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG-------------AGA-----T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC--A-CCAAA-A-GTGT---C-T----AA--T-T-TTTCC-----AGC-T-G--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-GCCCGAGG-GTG--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--CTTTACA--A-AGGGAACG-T--GAC-GCCCG-C-GCTGTC-TT-TGATAGG--GTAG-AC-AC-A-G--GTA-ACGAGTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCACCA-G-AG-CAATGCG-TT-G---CAA---TA--GG-TTCCTGAG--TAT-A-A-T----GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAATAAA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--G--GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGAGAAAAaatttg
gi|60056                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AACGTC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------TATAAGTAAGCAAAT-----------------TTC---C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60057                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-T-CTCG-AG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AAA-G---T-AT----A--C--A-AAA-C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCC------GC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGG-AC---CCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GG-A------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAATG-C--ACT-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGGTTT---AATA-G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-CACTT-C-TC-CCC-C-AG-CATTGTG-TT-G---A-T---TA--GG-AT-CTGTGTATAT-A-A-TC---GA--CTAC-AT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AAGGT--GT----------TTGT--TTTGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GT-GACAATAAT----C--cgttcg
gi|60058                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--AACT-CGAA-CT------T-C----GA-T-CTC--CG-AA-GT---G-AA--GT-C-C-G--GTC--AC---------------------G-------------------------A----TT-T--T-------------TTT-CTC-T--A------T-A-----------TAAAGCAAA---------TTTA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60059                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CA-AA-AT---G-AA--TT-C-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTCA---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CAC-T-TG-G-A--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCGGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--AGCA------AT-TAAGAG--GTTTACA--A-AAAGAATG-C--ACA-GCCCG-T-GCTG---TT-TGATAAG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATG------------G-TTT--AATTG-GTCAATTT--T-TACTT-C-TCACCC-C-AG-CATTGTG-TT-GAATC-AGATTA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------T-A-TGAAT-AA--AATGT--GT----------TTGT--TTGGTC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-T-AAT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAAcgttcg
gi|60060                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TTGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-T-G--GTC--CC---------------------GATTTTTTTTTCT-ATATAACTA--AG----CA-T--A-------------TTT--------------------------------------------------A--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60061                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C--TCGACT-CTCTTCG-AA-GT---G-AA--T----G-G--GTC--CC---------------------G-----------TTA-------AC-AA----CA-T--A-------------TTTTCAT----G------T-T-----------GG----------------TTCA--C--TC--------TCGC-ATCTC------------------TTC-G-A--AG-TG----TCG---T---------AGA-------AC----A--CCAA-AA--C-AATC-AA-CC--A-A-GTGT---CCT----AA--TCTATTCTC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CCCTGG-ACCGCCCGAGG-GATTAGTCGTGGCG-A-ATGGGCA------AT-TAA-AA--GTTTAAA--ACAGGGACCG-ATGGCC--CCCG-CCGCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GCCA-GCGGTA-ACGATCTTAAGATA-G-TTT--AATGG-CTCAA-TT-ATCCACTT-C-TCACCCTGTAGACAATGCG-TTGG---C-A---TA--GG-TT-CTGAG--TAT-ACACTCG--GA--CTAC-GT--G-------------T-ATTGAAT-AAATAATTT--ATTCGATGCCA-TTG---TTTGCCA-GA-GACT-ATGCATA-GAG-T-ATA-TTATTTGGA-GACGATGATCTGAT--TCGAGAAAA
gi|60062                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-TAACT-T-CGAA-CT------T-C--GC-A-T-CTCT-CGAAA-GT---G-AAG-TT-C-C-G--GTC--CCCGATTTTTTTCTCTATAGGAGG-----------T-A-------A--AG----CA----A-----------------CAT-T--G--------------------------------------TTAA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--A
gi|60063                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------TTC--TCGA-T-CT-T-CG-AA-GT---GGAA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------C-T-------A--AA----CA-T--A-------------TTTTCAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--AT-TC------------------T-C-G-A--AG-TT---GTC----T----------GA-G---T-AT----A--C--A-AAAAC-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTTCCGCTAACAT-T-G--G-A--CC---TA-CC-TG---------AAGG-GGA--C-CGT-GCA-T-T--GGC-------AC-TAG-TG--GATAACA--A-AGGGTACGTT--GCA-GCCCGTT-GCTG-CTTT-TCATAGG--GTGG-AC-AC-A-G--GTA-ATGG-TT---AATA-G-TTT--AATTGCGTCAATTT--T-CACTTCC-TCATCC-C-AG-CATTTTGATT-G-----A---TAACGG-AT-CTGTT--TATCA-A-TCGG-GA--CTAT-GT--ACAACTAGTGTTGTT-A-TGAAT-AA--AATGT--AT--G-----T-TTGT--TGCGCC--AA-GACT-ATGCG-A-GAG-TAATT-TT-T---GA-GACGATGAT----T--TTGTGACAA
gi|60064                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--TTCT-CGAA-GT------T-C--TCAA-T-CTTT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG---TTTG---T---------AGA-G---T-AT----A--CA-A-AA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GTGT---C-T----AA--T-TATTT-T-----CGCTT-T--G-A--CT---TA-CC-TGG-AC-ACCCGAGG-GGA--G-CGTGGCG-A-T--GGCA------AT-TAG-AG--GTTTACA--A-AGGGAACG-T--GCA-GCCCG-T-GCTG-C-TT-TGAT
gi|60065                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCTTCGAA-CA------T----TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--CTGT-G-G--GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--AA----CT-A--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AGTTG---GTC----T---------CGA-G---T-ATATACA--C--A-CA--C-A-TC-AA--C--A-A-GTGG---T-C----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TTGG-A--CT---TA-CC-TGG-
gi|60066                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-TGAA-TT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AAA-TT-T-A-G--GTT--CC---------------------T-----------T-T-------A--AA----CA-T--ACCTGATTGTA---TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCCC------------------T-C-A-A--AG-TG---TTTG---T---------AGT-G---T-A
gi|60067                      :                                                                                                                                                                                                        AA-GT------T-C--TTGA-C-CTCT-TG-ATTGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--CCT--------------------G-----------T-A-------A--AA----TA----A-------------TTT-CAT-T--GTT----T-T-----------T-----------------TTCA--CT-TC--------TCA--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---GT-G---A---------AGA-GCAAT-AT----A--C--A-
gi|60068                      :                                                                                                                                                                ttgatctctcaaacatttgaccctaTCGA-C--CACT--AAA-AT------T-T--TTTA-T-CCCG-AG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-T--ATT--TC---------------------G-----------T-A-------A--A--------T--A-------------TTT-CCT-T--GGGGTT-T-T-----------T-----------------TTCC--C--TC--------ACG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG------A---T---------AGC-A---T-AT----A--C--
gi|60069                      :                                                                                                                                                                                          CGAGT--CTCT-CAAA-GT------T-C--T-GA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AAG-TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-----------T---------------------T--A-------------TTT-T-T-T--T------T-C-----------TCTATATGAGTAAGCAAATTTA--C--TC--------TCGGTATCTCTTGAACGTTCACTCTCTAT-C-G-A--AG-TG---GTCG---T---------AGA-G---TAAT----A--C--A-AA--A-A-TCAAA-CA--A-A-GTGTA--C-T----GA--T-T-TTTTC-----CGCTT-T--G-G--CT---TACCC-TGG-AC-GCCCAAGA-GGT--G-CGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTACA--A-A-GGAACG-T--GCCTGCCCG-C-GCTG-CTTT-TGATAGG--GTGGAACAAC-A-G--GTA-ACGATTT---GATAGG-TTTTGAATTG-GTCACATT-AT-CACTT-CATCACCT-GAAG-CATTGCG-TT-G---C-A---TA--AGTTT-CTGAG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-GT--G-------------TAA-TGAAT-AC--AACTTTAAT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACCTATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-G---AG-GACGATGAT----T--TTGAGAAAA
gi|60070                      :                                                                                                                                                                                         TCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60071                      :                                                                                                                                                                      caatctctcgattcgacgtTCGA-T--CTCT-CGAA-GT------T-C----GA-T-CTC---G-AA-GT---G-AA--TT--------GTC--CA---------------------G-----------T-A-------A--A-----CA-T--A-------------TGT-CAT-T--G------C-T-----------T-----------------TTCA--CGTTC--------TCC--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TG----TTG---T---------AGA-G---T-A--------C--A-AA--A-A-AC-A--CC--G-A-GTG----C-T----AA--TCTATTTC-------GC-T-G--G-A--CG---TA-CT---G-AC-GCC-GAAG-GGT--C-TGTG-CG-A-A--GGCA------TT-TAA-GATAGTTTACA--A-AGGGAA------GGC-GCCCG---GCGG-C----TGATAGG--GTGG-AC--C-A-G--GTA-A-GAT------GTA-G-TTT---ATTG-GTCA--TT-AT-CA-TT-C-TAAC-----AG-C-ATGCG-TT-G---C-A---TA--GG-TT----GA--TA--A-A-TC---GACTCTAC-GT--G-------------T-A-TG-AT-----AGTTTAAAT--G-----G-ATGT--TTGGGC--GA-A--C-GTGCA-AGGAG-T-ATA-GT-T---GATGACGATGA-----T--TTGAGTAA
gi|60072                      :                                                                                                                                                                       caatctctcgattcgacgtCGA-T--CTCT-CAAA-GT------T-C--TCGA-T-CTTT-CA-AAAGT---G-AAA-TT-T-G-G--GTT--C----------------------A-----------T-A-------A--GATGTACA-TGTA-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--AT--------TCG--AGCTC------------------T-C-G-G--AG-TG---TTGA---T---------AGC-G---T-GT----A--C----AT--C-T-TT-TT-TC--C-A-GTGT---A-T----AAAGT-TATTTTC-----TGC-T-TG-G-A--CCTTATA-CC-TGA-AT-AACCG
gi|60073                      :                                                                                                                                                                                          CAA-T--ATCT-TAAA-GT------T-A--TCAA-T-CTCT-GA-AA-GT---G-AAA-TT-T-G-G--GTC--AT---------------------G-----------C-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TA--------TCA--ATCTC------------------------------------------T---------AGA-A---T-AT----A--C--A-CA----A-TC-ACTCC------GTGA---C-TCACAAA--T-CATTT-C-----CAC-T-T--G-GACCT---TA-C
gi|60074                      :                                                                                                                                                                                           GA-T--ATCT-CGAA-TA------C-CA-TGGA-T-ATGT-CG-AA-GT---G-G---TT-T-G-GAAGTC--CC-------------------------------------------A--AT----CACT--A-------------ATT-CAT-TATG------T-A-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG--ATATC------------------T-C-G-A--A
gi|60075                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CAAA-AT------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---A-AG--TC-C-C-G--GTC--CC---------------------G-------------------------------A-T--T-------------TTC-CTC-T--A------T-T-----------TAACTAAGCAAA------TTTA--C--TT--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--
gi|60076                      :                                                                                                                                                                                            A-T--CTCT-CGAACGT------T-C----GA-TTCTC--CG-AA-GT---G-GC--TT-T-T-G----T--CC---------------------G-----------T-A-------A--AG----CA----A-------------TTT-CAT-T--G------TAT-----------T-----------------TTCA--C--Ttacgtttg
gi|60077                      :                                                                                                                                                                                             -T--CCCT-CGGA-AC------T----TCAA-T-CTCT-CG-AA-GTCTGA-AA--TT-T-T-A--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA-----A-C--A--------------TT-CAT-G--G------T-T-----------TTG---------------TCCA--C--TC--------CAG--AGCTC------------------T-C-GAA--AG-TGTCATTCGGGCT---------AGA-G---T--T----A--C--A-AA--C-ATTC-AA-CC--A-A--------C-T----AA-----ATT--------CGC---T--G-A--C----TA-CC-TGGAAC-GCC
gi|60078                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-
gi|60079                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGA----------T-CGTTCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A--AG-TT----TCG---T---------AGA-G---T-TT----A--C--A-AA--C-A--C-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T-TATTT-C-----CGC-T-TG-G-A--CT---TA-CC-TGG-AT-GCCCGAGG-GGT--G-AGTGGCG-A-A--GGCA------AT-TAA-AA--GTTTAC---A-AGGGAACG-T--GCC-GCCCG-C-GCTG-C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-AC---G--GTA-A-GATTT---GATA-G-TTT--AATTG-GTCAA-TT-AT-CACTT-C-TCATCT-G-AG-C-ATGAG-TT-G---C-T---TA--GG-AT-CTGTG--TAT-A-A-TC---GA--CTAC-G-------------------G-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC--GA-GACC-ATGCA-A-GAG-T-ATA-TT-T---GA-GACGGTG-T----T--TTGTGAAA
gi|60080                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAA--T------T-C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--AT-T-T-G--GTC--CC---------------------G-----------T-A-------A--AA----CA-T--A-------------T---CATGT--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-G-A---G-TT---GTCG---T---------AGA-G---T-AT----A--C--A-AA--A-C-TC-AA-CA--A-AAGTGT---C-T----AA--T--AT--CC-----CGC-T-T--GGA--CT---TA-CC-TGA-AC-GCCCG-----------TGTAGCGTACA--GGCA------ATATAA-GA--AATTATC--A-GAGGAACG-T--GCC-GCC-G-C-GCTG-C-TT-TGAT--G--GTGG-AC-AC-A-G--G-A-ACGATTT---AATA-G-TTT--AATTG----------------TT-C-TCAGCT-G-AG-CAA-GTG-TT-G---C-T---TA--TG-AT-CGGCG--TAA-G-A-TCTATGA--CTAC-G---G-------------T-A-TGAAT-AA--AATTT--AT--G-----A-TTGT--TTTGCC-----AACC-ATGCA-A-GAG-T-A-A--------GA-GACGATGA-----T--TTGAGA
gi|60081                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-AA-GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGA-G---T-AA----A--CT-G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATCT-C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGG-TGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACATCA-AGG--ACG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GT--ATAATTT---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CACCC-C-GCACCC-G--------------------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAG-T--TATTT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGA
gi|60082                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACG---------C--TCGA-T-CTCT-CG-A--GT---G-AA--TT-T-G-G--GTC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CG-C--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TTG--ATATC------------------T-C-G-A--AG-TG---ATGG---T---------AGACG---T-AA----AACT--G-AA--C-A-TC--A-CC--AGA-TTAC---C-T----AA--T-TATT--C-----CGC-T-T--GAA--TT---TA-CC-TGG-AC-GCCTCAGGTGGA--G-CATGGTG-A-T--GGCAATAATCAT-TAG-GT--GTTTACAT-C-AAGGAGCG-C--ATT-GCCGG-T-GTTT-C-TT-TGATAGG--GTGA-AC-A--G-G--GTA---TATTA---ACTA-G-CTT--AAATA-GTCAATTT--T-CAC---C-GCACCC-----------CG---------------A--AG-CT-C-GTG----------TT---GA--ATAC-TT--------------------TAAAT-GA--AATTT--A---A-----A-TTTTGATTAGTC--AT-GACT-ATGCG-T-GAGTT-ATT-TT-T---GG-AACGGTACT----TAATTGActtatcattttaagacgataatttagaga
gi|60083                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CGAACGTACGATAT-C--TCTA-T-CTCT-CG-AA-TT---G-AAA-TT-T-G-G--ATC--CT---------------------G-----------T-A-------C--AA----CA-T--G-------------TTT-TAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTTA--C--TC--------TCG----CT-----------------------------G-TG---TTGG---T---------AGT-G---T-AT----A--C--GCAC--C-A-TC-AC-TA--A-A-GCGT---A-T----CA--T-TATTTCC-----AGT-TGT--A-C--CT---TA-CC-TGG-A
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                               --CTCT-CAAA-GT------T-C--CTGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-C-ATG--GTCT-TT---------------------A-----------T-A-------AATAA----C--T--AAGCACTCTTGAATTTT-CAC-T---------T-T-----------C-----------------TTGATGT--TC--------TCG--ATCTC------------------T-C-A-A--AG-TG---
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                             -T--TTCT-TGAT-GT------T-C--TCGA-T-CTCT-CA-AA-GT---G-AA--AT-CTG-G--GTT--CC---------------------T-----------C-A-------A--AA----CA-T--G---------------C-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TCCG--A--TT--------GAG--ATCTC------------------T-G-G-A--AA-TG---GTGG---TAGATCGAACAGA-G---T-AT----A--C--A-CA--C-aaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60084                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcacG-C--GTG-GCCCG-T-GTTT-C-CT--AATGGG--GTGG-A-----------TA-A----TT---AATT-G-TTT--AATTG-GTCAGTTTCAT-CATCT-G-CCACCT-G-------TGCT-TT-G---T-A---Tcattttactcctgctggggcgtggcccgtgtttcctaatggggtggataattaattgtttaattggtcagtttcatcatctgccacctgtgctttgtat
gi|60085                      : ctctcaaagttcctgatctctcaaagtgaaatcatggtctttataaataactaagcactcttgaattttcactttcttgatgttctcgatctctcaaagtgaaatctgggttcctcaaaacatgccattgttttccgattgagatctctggaaatggtggtagatcgaacagagtatacacaccattttactcctgctggg-GT------T-C--T--A-T-CTCT-CG-AT-GC---G-AA--TT-T-G-G--GTT--CC---------------------------------T-AT------A--AA----CA-T--A-------------TTT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C--TC--------TCG--
gi|60086                      :                                                                                                                                                                                                                          cA-T-CTCT-C---A-GC-----AG--TT-C-T-G--ATCGTCC---------------------A-----------T-A-------A--AA-----A-T--AAA-----------TGT-CAT-T--G------T-T-----------T-----------------TTCA--C---C--------TCG--ACCTC------------------T-C-A-GTTAG-TG---GT-----T---------TGA-T---T-AT----A--C--A-CA--CAA-TC-AC-CC--G-A-GCGTATAT-T----AA--G-TATTTCT-----CGC-T-G--G-A--
gi|60087                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TC------------------T-C-G-A--AG-TG---GTGG---T---------AGC-A---T-AT----A--T--A-TA--T-A--C-A-----------TGT---CAT----GA--T-TATTT-T-----CAC-A-T--G-GACCT---TA-CC-TGG-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tctgaaagtgaaatttgggtcttgtaaaantgaa-------A--AA----CA-A--A-------------TTT-CAT-T--GGGTTTTT-T-----------T-----------------TTCA--C--CC--------TCG--ATCTC------------------G-A-G-A--AG-TG---CTGG---T---------AGT-T---T-AT----A--A--A-CAT-C-A-TC-AA-TC--A-T-GCAA---A-T----AA--T-TATTT-C-----AGC-T-T--G-GACCT---TA-CC-CGA-A
gi|60088                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AT-TAG-GT--GTTTGTA--T-AGGTGGCA-C--ACT-ACCTG-T-GTTT-C-CTCTGA--GG--GTGG-AT-A-------GTA-A----TT---G------TTT--TATTG-GTCAGTTTTAA-CCCTG-C-TC--TT-G-GG-C-------TT-----------TA-----TT-TTATT--TAT-A-A-TC-------TTAT-CTAAG-------------T-A-TGAAC-AA--AAATT--GT--G-----ACTTGC--TTTGACTTGACAACG-AAGCA-A-AAA-T-----TT-T---GA-GAAAATAAA----T--TTGAGtaactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattgattaggtgtttgtataggtggcacactacctgtgtttcctctgagggtggatagtaattgttttattggtcagttttaaccctgctcttgggctttattttatttataatcttatctaagtatgaacaaaaattgtgacttgctttgacttgacaacgaagcaaaaattttgagaaaataaatttgag
gi|60089                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacaaatttcattgggtttttttttcaccctcgatctcgagaagtgctggtagtttataaacatcatcaatcatgcaaataattatttcagcttggaccttacccgaataactttatatatatataataataaaggaatggtctagggcaagtttggctgtgaattg-G-A--AG-TG---GTTG---C---------AGA-G---T-AA----A--C--ACAA--C-A-TC-AA-CA--A-A-GAGG---C-T----AA--T-TATCT
gi|60090                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TGG-AT-GCCTAAGG-CGA--G-CGTGGTG-G-T--GGCA------AT-TAG-CT--GTTTACA--T-AGGGGACA-C--ATA-ACCCG-T-ACTT-C-TT-TGATatgctt
gi|60091                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -C-TT-TGATAGG--GTGG-AC-GG-GTG--ATA-ATTATTT---AATA-A-TTT--AGTTG-GTGAATTT--T-CACAA-C-TCATTT-G-AG-TCTTGTG-TT-A---A-G---TA--GG-AT-CCGTT--TAT-G-A-TC---GC--CTAT-GC--A-------------T-A-