lowQualScore                  :            11  1 1 444  2222  111 2222 11 22 3 11 1 1  1  0 22 111 1  1 11  1 22 1   1 11 44444 1 22   1  1 1  11 333  2222 1  1  1 333   2  
lowQualScore                  :            ..  . . ...  ....  ... .... .. .. . .. . .  .  . .. ... .  . ..  . .. .   . .. ..... . ..   .  . .  .. ...  .... .  .  . ...   .  
lowQualScore                  :            44  0 0 888  1111  888 1111 44 44 0 33 0 9  0  9 22 666 0  0 33  9 33 0   9 33 88888 0 33   9  0 0  33 333  0000 0  0  0 333   3  
consensus                     :    TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CC-GT-C-C-GTCCGT
Reference ( gi|89193 )        :    TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-T-GTCTGT
gi|89192                      :    TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-C-GTCTGT
gi|89194                      :   tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-A--G---G-GA-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CC-GT-C-C-GTCCGT
gi|89197                      :   tTTATTAGA--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-A-GTCAGT
gi|89199                      :   tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-TC-GT-C-TGGTCCGT
gi|89202                      :   tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-A-TC-GA-A--G---A-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-TT--C---CG----T-CC-GT-C-T-GTCTGT
gi|89201                      :   tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---C----T--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-TG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---TG----T-CC-GT-C-C-GTCTGT
gi|89196                      :   tTTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---TG----T-C---T-C-T-GTCTGT
gi|89198                      :    TTTTTAGT--GC-C-C---TA----TC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-A--TAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-T-C-GTCTGTccgt
gi|89195                      :    TTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TT-C--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CT-GT-T-C-GTCC
gi|89203                      :    TTGTTA-T--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--C-----T-G--CAC-TC-C-AT--C---CG----T-CC-GT-C-C-ATC
gi|89206                      :    TTATTAGT--CC-C-C---TA----CTCCTG----A--C--G-A--A-G-T--GACA--G---G-GG-A--CT-T--T-AGGTT--T-----T-G--CACGTC-C-GT--C---CG----T-CT-GT-C-T-GTCTGT
gi|89204                      :    TTATT-GT--CC-C-C---TA----CC---GCGGAA--C--GGA--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AG-----T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-A-GTCC
gi|89205                      : tttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CT---G-------------------TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CC-GT-G-C-GTCAGT
gi|89209                      :    TTGTTAGT--AC-C-----TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A-----T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT------CG------CC-GT-C-T-G
gi|89210                      :    TTAT-AGT--TC-C-C---TA----CC---G----A--C--GGA--A-G-TC-GA-A--A---G-AG-A--AT-T--T-AGG-TTGT-----C-G--CACATC-C-CT--C---GG----T-CCGGT-C-T-GTCTGT
gi|89208                      :  ttTTTTTA-T--CT-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--AAG-TC-GA-ATGG---G-GG-A--CT-TC-T-GGT-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-TC-cc
gi|89207                      :    TTTTTAGT--CC-C-----TA---------G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TTGT--T-AGG----T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-
gi|89211                      :    TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----GTTT--G-T--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--TTCTTCT-GT-CGC-TC-T-GT--C---TG----T-CT-GT-C-T-GTCgttctccgt
gi|89219                      :       TTAGT--CC-C-A---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CT-GT-C-T-GTCCGTc
gi|89220                      :       TTGGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--C--T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GC--C---CG----T-CC-GT-C-T-GTCC
gi|89221                      :       TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GGAA--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-C-GTCTGT
gi|89214                      :       TTAGTTTCC-C-C---TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C---GTCTGT
gi|89212                      :      tTTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-GCTC-GA-A--G---G-GG-ATTCT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CA--TC-C-GT--CTGTCG----T-CC-GT-C-T-GTCC
gi|89222                      :     tcTTAGT--TC-A-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A------------G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---TG----T-CC-AT-C-T-GTCTGT
gi|89215                      :       TTAGT--CC-C-C---TA----CC--------A--C--G-A--A-G-TC-GG-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CTT-TC-TGGT--CTGTCG----T-CC-GT-C-A-GTCC
gi|89216                      :      tTTAGT--CC-TAT---TA----CA---G-------C--A-A--A-G-TT-GA-A--G---G-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-AT--T---CA----C-CC-AT-C-A-TTCTGT
gi|89218                      :      tTTTGT--CC-C-C---TA----CC---G----G--TTTG-G--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--T-----T-A--TTC-TT-T-GT--C---AG----T-CT-GT-C-T-GTC
gi|89223                      :       TTAGT--CC-C-T---TAGTTACT---G----A--T--G-A--A-G-TT-GA-A--G---G-GG-G--CT-TTAT-AAT-T--T-----T-G--CAC-TCTT-AT--C---AG----T-CT-Gc
gi|89217                      :       TTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---
gi|89200                      :       tTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--G-AAG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---TG----T-CC-GT-C-A-GTCAGT
gi|89225                      :    tttgTAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CC-C-TT--C---AG----T-CC-GT-C-T-GTCAGT
gi|89224                      :        TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CC-C-TT--C---AG----T-CC-GT-C-T-GTCAGTccg
gi|89226                      :        TAGT--CC-C-CCCCTA----CC---G----A--T----A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--TAAGG-T--T-----T-G--CA--TC-C-GT--C---CA----T-CA-GT-C-C-Gccg
gi|89227                      :        TAGT--TCTC-C---TA----CC---G----A--CT-GTA--A-G-TC-GA-A--GTCGG-GG-A--CT-T--T-AGG-T--TATCGGC-A--CAC-TC-C-GT--C---CG----TACT-GT-CTT-GTCTGT
gi|89228                      :         AGT--CC-C-CG--TA----CC---G----A--C--G-ATAA-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-T-GTCCGTccgt
gi|89229                      :            --CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-AT-G---GCGG-A-----T--T-AGGTT--T-----T-GCCCAC-TC-T-GTTCC---CG----T-CC-GT-C-C-GTCTGT
gi|89230                      :            --CC-C-C---CA----CC---A----A--C--G-A--A-GTTT-GG-G--G---G-GG-T--AT-A--T-AGG-T--T-----T----CAC-CC-C-GT--C---TG----T-CC-AT-C-C-GTCTGT
gi|89231                      :            --CC-C-C---CG----CA---A----A--C--G-A--A-A-TTTG-----G---G-GG-A--CTAT--T-AGG-T--T-----T----CAC-CC-T-GT--C---TG----T-CC-GT-C-T-GTCC
gi|89232                      :                -C-C---TA----CC---A----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---TG----T-CC-GT-C-C-GTCAGT
gi|89213                      :                  -C---TG----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--T---G-GG-A--CT-T--T-AAA-G--T-----T-G--CAA-TC-C-GT--C---TGTATCT-CC-GT-C-A-GTCAGT
gi|89233                      :                                       ttttgttta--A-G-TT-GA-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGG-T--T-----T-G--TAC-TC-T-GT--C---CG----T-CC-GT-C-T-GCC
gi|89234                      :                                                   -G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T----AGG-T--T-----TTG--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CC-GT-G-C-GTCAGT
gi|89235                      :                                                           -A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TC-C-GT--C---CG----T-CT-GTCC-T-GTCCGT





Alignments
lowQualScore                  :               11  1 1 444  2222  111 2222 11 22 2 11 0 1  0  0 22 111 0  0 11  1 22 0   1 11 44444 0 22   1   5555  22 333  3333   333333   33      
lowQualScore                  :               ..  . . ...  ....  ... .... .. .. . .. . .  .  . .. ... .  . ..  . .. .   . .. ..... . ..   .   ....  .. ...  ....   ......   ..      
lowQualScore                  :               44  0 0 666  1111  777 1111 33 33 9 33 9 9  9  9 22 666 9  9 33  9 22 9   9 33 77777 9 22   9   0000  66 333  3333   777777   44      
consensus                     :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
Reference ( family-445 )      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89192                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89193                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89194                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-A--G---G-GA-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89195                      :      tTTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TT-C--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTTC-GTCCG
gi|89196                      :       TTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TGTC--TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89197                      :       TTATTAGA--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89198                      :      tTTTTTAGT--GC-C-C---TA----TC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-A--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTTC-GTCTGT
gi|89199                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TTC------GTCTGGTCCGT
gi|89200                      :          tTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--G-AAG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89201                      :   tttgTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---C----T--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-TG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89202                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-A-TC-GA-A--G---A-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----TT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89203                      :      tTTGTTA-T--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--C-----T-G--CAC-TCC----AT--C---CG----TCC------GTCC-ATC
gi|89204                      :       TTATT-GT--CC-C-C---TA----CC---GCGGAA--C--GGA--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AG-----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89205                      :    tttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CT---G-------------------TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89206                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CTCCTG----A--C--G-A--A-G-T--GACA--G---G-GG-A--CT-T--T-AGGTT--T-----T-G--CACGTCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCTGT
gi|89207                      :       TTTTTAGT--CC-C-----TA---------G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TTGT--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----T--------GTTC--TCCGT
gi|89208                      :       TTTTTA-T--CT-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--AAG-TC-GA-ATGG---G-GG-A--CT-TC-T-GGT-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TTC------
gi|89209                      :       TTGTTAGT--AC-C-----TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A-----T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GTCGC---CG----TCT------G
gi|89210                      :       TTAT-AGT--TC-C-C---TA----CC---G----A--C--GGA--A-G-TC-GA-A--A---G-AG-A--AT-T--T-AGG-TTGT-----C-G--CACATCC----CT--C---GG----TCCG-----GTCT-GTCTGT
gi|89211                      :     ttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----GTTT--G-T--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--TTCTTCT-GT-CGC-TCT----GT--C---TG----TCT------GTCT-GTCCcc
gi|89212                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-GCTC-GA-A--G---G-GG-ATTCT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--CTGTCG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89213                      :                   tc-C---TG----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--T---G-GG-A--CT-T--T-AAA-G--T-----T-G--CAA-TCC----GT--C---TGTATCTCC------GTCA-GTCAGT
gi|89214                      : ttttgtttaTTAGTTTCC-C-C---TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GT-C-GTCTGT
gi|89215                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC--------A--C--G-A--A-G-TC-GG-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CTT-TCTG---GT--CTGTCG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89216                      :         tTTAGT--CC-TAT---TA----CA---G-------C--A-A--A-G-TT-GA-A--G---G-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----AT--T---CA----CCC------ATCA-TTCTGT
gi|89217                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---
gi|89218                      :         tTTTGT--CC-C-C---TA----CC---G----G--TTTG-G--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--T-----T-A--TTC-TTT----GT--C---AG----TCT------GTCT-GTCC
gi|89219                      :          TTAGT--CC-C-A---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89220                      :          TTGGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--C--T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GC--C---CG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89221                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GGAA--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89222                      :          TTAGT--TC-A-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A------------G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------ATCT-GTCTGT
gi|89223                      :          TTAGT--CC-C-T---TAGTTACT---G----A--T--G-A--A-G-TT-GA-A--G---G-GG-G--CT-TTAT-AAT-T--T-----T-G--CAC-TC
gi|89224                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCGttatcagtctg
gi|89225                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCG
gi|89226                      :           TAGT--CC-C-CCCCTA----CC---G----A--T----A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--TAAGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--C---CA----TCA------GTCC-
gi|89227                      :           TAGT--TCTC-C---TA----CC---G----A--CT-GTA--A-G-TC-GA-A--GTCGG-GG-A--CT-T--T-AGG-T--TATCGGC-A--CAC-TCC----GT--C---CG----TACTGTCTTGTCT-GTCCGT
gi|89228                      :            AGT--CC-C-CG--TA----CC---G----A--C--G-ATAA-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCCGT
gi|89229                      :               --CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-AT-G---GCGG-A-----T--T-AGGTT--T-----T-GCCCAC-TCT----GTTCC---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89230                      :               --CC-C-C---CA----CC---A----A--C--G-A--A-GTTT-GG-G--G---G-GG-T--AT-A--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCC----GT--C---TG----TCC------ATCC-GTCTGT
gi|89231                      :               --CC-C-C---CG----CA---A----A--C--G-A--A-A-TTTG-----G---G-GG-A--CTAT--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCT----GT--C---TG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89232                      :                   -C-C---TA----CC---A----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCAGT
gi|89233                      :                                                   --A-G-TT-GA-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGG-T--T-----T-G--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GCC
gi|89234                      :                                                      -G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T----AGG-T--T-----TTG--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89235                      :                                                              -A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCCTGTCCGT





Alignments
lowQualScore                  :               11  1 1 444  2222  111 2222 11 22 2 11 0 1  0  0 22 111 0  0 11  1 22 0   1 11 44444 0 22   1   5555  22 333  3333   333333   33      
lowQualScore                  :               ..  . . ...  ....  ... .... .. .. . .. . .  .  . .. ... .  . ..  . .. .   . .. ..... . ..   .   ....  .. ...  ....   ......   ..      
lowQualScore                  :               44  0 0 666  1111  777 1111 33 33 9 33 9 9  9  9 22 666 9  9 33  9 22 9   9 33 77777 9 22   9   0000  66 333  3333   777777   44      
consensus                     :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
Reference ( family-445 )      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89192                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89193                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89194                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-A--G---G-GA-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89195                      :      tTTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TT-C--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTTC-GTCCG
gi|89196                      :       TTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TGTC--TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89197                      :       TTATTAGA--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89198                      :      tTTTTTAGT--GC-C-C---TA----TC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-A--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTTC-GTCTGT
gi|89199                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TTC------GTCTGGTCCGT
gi|89200                      :          tTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--G-AAG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89201                      :   tttgTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---C----T--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-TG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89202                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-A-TC-GA-A--G---A-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----TT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89203                      :      tTTGTTA-T--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--C-----T-G--CAC-TCC----AT--C---CG----TCC------GTCC-ATC
gi|89204                      :       TTATT-GT--CC-C-C---TA----CC---GCGGAA--C--GGA--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AG-----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89205                      :    tttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CT---G-------------------TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89206                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CTCCTG----A--C--G-A--A-G-T--GACA--G---G-GG-A--CT-T--T-AGGTT--T-----T-G--CACGTCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCTGT
gi|89207                      :       TTTTTAGT--CC-C-----TA---------G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TTGT--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----T--------GTTC--TCCGT
gi|89208                      :       TTTTTA-T--CT-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--AAG-TC-GA-ATGG---G-GG-A--CT-TC-T-GGT-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TTC------
gi|89209                      :       TTGTTAGT--AC-C-----TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A-----T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GTCGC---CG----TCT------G
gi|89210                      :       TTAT-AGT--TC-C-C---TA----CC---G----A--C--GGA--A-G-TC-GA-A--A---G-AG-A--AT-T--T-AGG-TTGT-----C-G--CACATCC----CT--C---GG----TCCG-----GTCT-GTCTGT
gi|89211                      :     ttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----GTTT--G-T--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--TTCTTCT-GT-CGC-TCT----GT--C---TG----TCT------GTCT-GTCCcc
gi|89212                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-GCTC-GA-A--G---G-GG-ATTCT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--CTGTCG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89213                      :                   tc-C---TG----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--T---G-GG-A--CT-T--T-AAA-G--T-----T-G--CAA-TCC----GT--C---TGTATCTCC------GTCA-GTCAGT
gi|89214                      : ttttgtttaTTAGTTTCC-C-C---TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GT-C-GTCTGT
gi|89215                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC--------A--C--G-A--A-G-TC-GG-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CTT-TCTG---GT--CTGTCG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89216                      :         tTTAGT--CC-TAT---TA----CA---G-------C--A-A--A-G-TT-GA-A--G---G-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----AT--T---CA----CCC------ATCA-TTCTGT
gi|89217                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---
gi|89218                      :         tTTTGT--CC-C-C---TA----CC---G----G--TTTG-G--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--T-----T-A--TTC-TTT----GT--C---AG----TCT------GTCT-GTCC
gi|89219                      :          TTAGT--CC-C-A---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89220                      :          TTGGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--C--T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GC--C---CG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89221                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GGAA--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89222                      :          TTAGT--TC-A-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A------------G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------ATCT-GTCTGT
gi|89223                      :          TTAGT--CC-C-T---TAGTTACT---G----A--T--G-A--A-G-TT-GA-A--G---G-GG-G--CT-TTAT-AAT-T--T-----T-G--CAC-TC
gi|89224                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCGttatcagtctg
gi|89225                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCG
gi|89226                      :           TAGT--CC-C-CCCCTA----CC---G----A--T----A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--TAAGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--C---CA----TCA------GTCC-
gi|89227                      :           TAGT--TCTC-C---TA----CC---G----A--CT-GTA--A-G-TC-GA-A--GTCGG-GG-A--CT-T--T-AGG-T--TATCGGC-A--CAC-TCC----GT--C---CG----TACTGTCTTGTCT-GTCCGT
gi|89228                      :            AGT--CC-C-CG--TA----CC---G----A--C--G-ATAA-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCCGT
gi|89229                      :               --CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-AT-G---GCGG-A-----T--T-AGGTT--T-----T-GCCCAC-TCT----GTTCC---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89230                      :               --CC-C-C---CA----CC---A----A--C--G-A--A-GTTT-GG-G--G---G-GG-T--AT-A--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCC----GT--C---TG----TCC------ATCC-GTCTGT
gi|89231                      :               --CC-C-C---CG----CA---A----A--C--G-A--A-A-TTTG-----G---G-GG-A--CTAT--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCT----GT--C---TG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89232                      :                   -C-C---TA----CC---A----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCAGT
gi|89233                      :                                                   --A-G-TT-GA-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGG-T--T-----T-G--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GCC
gi|89234                      :                                                      -G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T----AGG-T--T-----TTG--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89235                      :                                                              -A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCCTGTCCGT


blockSeqs                     :               TT  T   CCC  GTTA  CCT CGGA TT TT G TA   C       TG TCG      TT  G TA     T TG TCTTC   CC   G   TTCA  CG TGT  TATC   TGTCTT   TG
blockSeqs                     :               .   .   C    .     .   .    .  T  G .    T       T  .        .   A C      T .  ATCGG   T    A   TTCA  TC TGT  TC     G        CT
blockSeqs                     :               .   .   C    .     .   .    .  .  T .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   G     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   G    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        A 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :               .   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        T 
blockSeqs                     :                   .   .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .        C 
blockSeqs                     :                       .    .     .   .    .  .  . .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .          
blockSeqs                     :                                                   .    .       .  .        .   . .      . .  .       .    .   .     .  .    .      .          
blockSeqs                     :                                                        .       .  .        .   . .      . .  .       .    .                                   
blockSeqs                     :                                                                .  .                                                                           


blockSeqCons                  :       
originalCons                  :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
finalCons                     :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT





Alignments
lowQualScore                  :               11  1 1 444  2222  111 2222 11 22 2 11 0 1  0  0 22 111 0  0 11  1 22 0   1 11 44444 0 22   1   5555  22 333  3333   333333   33      
lowQualScore                  :               ..  . . ...  ....  ... .... .. .. . .. . .  .  . .. ... .  . ..  . .. .   . .. ..... . ..   .   ....  .. ...  ....   ......   ..      
lowQualScore                  :               44  0 0 666  1111  777 1111 33 33 9 33 9 9  9  9 22 666 9  9 33  9 22 9   9 33 77777 9 22   9   0000  66 333  3333   777777   44      
consensus                     :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
Reference ( family-445 )      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89192                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89193                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89194                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-A--G---G-GA-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCCGT
gi|89195                      :      tTTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TT-C--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTTC-GTCCG
gi|89196                      :       TTTTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TGTC--TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89197                      :       TTATTAGA--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89198                      :      tTTTTTAGT--GC-C-C---TA----TC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-A--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTTC-GTCTGT
gi|89199                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--A-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TTC------GTCTGGTCCGT
gi|89200                      :          tTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--G-AAG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCA-GTCAGT
gi|89201                      :   tttgTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---C----T--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-TG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89202                      :      tTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-A-TC-GA-A--G---A-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----TT--C---CG----TCC------GTCT-GTCTGT
gi|89203                      :      tTTGTTA-T--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--C-----T-G--CAC-TCC----AT--C---CG----TCC------GTCC-ATC
gi|89204                      :       TTATT-GT--CC-C-C---TA----CC---GCGGAA--C--GGA--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AG-----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89205                      :    tttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CT---G-------------------TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89206                      :       TTATTAGT--CC-C-C---TA----CTCCTG----A--C--G-A--A-G-T--GACA--G---G-GG-A--CT-T--T-AGGTT--T-----T-G--CACGTCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCTGT
gi|89207                      :       TTTTTAGT--CC-C-----TA---------G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--TTGT--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----T--------GTTC--TCCGT
gi|89208                      :       TTTTTA-T--CT-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--AAG-TC-GA-ATGG---G-GG-A--CT-TC-T-GGT-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TTC------
gi|89209                      :       TTGTTAGT--AC-C-----TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A-----T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GTCGC---CG----TCT------G
gi|89210                      :       TTAT-AGT--TC-C-C---TA----CC---G----A--C--GGA--A-G-TC-GA-A--A---G-AG-A--AT-T--T-AGG-TTGT-----C-G--CACATCC----CT--C---GG----TCCG-----GTCT-GTCTGT
gi|89211                      :     ttTTATTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----GTTT--G-T--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--TTCTTCT-GT-CGC-TCT----GT--C---TG----TCT------GTCT-GTCCcc
gi|89212                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-GCTC-GA-A--G---G-GG-ATTCT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--CTGTCG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89213                      :                   tc-C---TG----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--T---G-GG-A--CT-T--T-AAA-G--T-----T-G--CAA-TCC----GT--C---TGTATCTCC------GTCA-GTCAGT
gi|89214                      : ttttgtttaTTAGTTTCC-C-C---TA----C----G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GT-C-GTCTGT
gi|89215                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC--------A--C--G-A--A-G-TC-GG-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CTT-TCTG---GT--CTGTCG----TCC------GTCA-GTCCG
gi|89216                      :         tTTAGT--CC-TAT---TA----CA---G-------C--A-A--A-G-TT-GA-A--G---G-AG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----AT--T---CA----CCC------ATCA-TTCTGT
gi|89217                      :         tTTAGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---
gi|89218                      :         tTTTGT--CC-C-C---TA----CC---G----G--TTTG-G--A-A-CC-GG-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGC-T--T-----T-A--TTC-TTT----GT--C---AG----TCT------GTCT-GTCC
gi|89219                      :          TTAGT--CC-C-A---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCT-GTCCGT
gi|89220                      :          TTGGT--CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--C--T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GC--C---CG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89221                      :          TTAGT--CC-C-CC--TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GGAA--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89222                      :          TTAGT--TC-A-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A------------G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------ATCT-GTCTGT
gi|89223                      :          TTAGT--CC-C-T---TAGTTACT---G----A--T--G-A--A-G-TT-GA-A--G---G-GG-G--CT-TTAT-AAT-T--T-----T-G--CAC-TC
gi|89224                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCGttatcagtctg
gi|89225                      :           TAAT--CC-C-C---TA----CT---G----A--C--G-A--A-G-TC-TA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-A-A-T--T-----T-G--CAT-CCCTTCAGT--C---CG----TCT------GTCA-GTCCG
gi|89226                      :           TAGT--CC-C-CCCCTA----CC---G----A--T----A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--TAAGG-T--T-----T-G--CA--TCC----GT--C---CA----TCA------GTCC-
gi|89227                      :           TAGT--TCTC-C---TA----CC---G----A--CT-GTA--A-G-TC-GA-A--GTCGG-GG-A--CT-T--T-AGG-T--TATCGGC-A--CAC-TCC----GT--C---CG----TACTGTCTTGTCT-GTCCGT
gi|89228                      :            AGT--CC-C-CG--TA----CC---G----A--C--G-ATAA-G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GTCCGT
gi|89229                      :               --CC-C-C---TA----CC---G----A--C--G-A--A-G-TC-AA-AT-G---GCGG-A-----T--T-AGGTT--T-----T-GCCCAC-TCT----GTTCC---CG----TCC------GTCC-GTCTGT
gi|89230                      :               --CC-C-C---CA----CC---A----A--C--G-A--A-GTTT-GG-G--G---G-GG-T--AT-A--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCC----GT--C---TG----TCC------ATCC-GTCTGT
gi|89231                      :               --CC-C-C---CG----CA---A----A--C--G-A--A-A-TTTG-----G---G-GG-A--CTAT--T-AGG-T--T-----T----CAC-CCT----GT--C---TG----TCC------GTCT-GTCCG
gi|89232                      :                   -C-C---TA----CC---A----A--C--G-A--A-G-TC-GA-A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG----T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---TG----TCC------GTCC-GTCAGT
gi|89233                      :                                                   --A-G-TT-GA-A--G---G-GG-A--CT-A--T-AGG-T--T-----T-G--TAC-TCT----GT--C---CG----TCC------GTCT-GCC
gi|89234                      :                                                      -G-TC-GA-A--G---G-G--A--CT-T----AGG-T--T-----TTG--CAC-TCC----GT--C---CG----TCC------GTGC-GTCAGT
gi|89235                      :                                                              -A--G---G-GG-A--CT-T--T-AGG-T--T-----T-G--CAC-TCC----GT--C---CG----TCT------GTCCTGTCCGT