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Reference ( gi|78776 )        :                                                   ACTGCTCTA----AG-TTAA-CTTAGAGC-AGT--------TT---TT-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--A--G--TC------C-T--G---------C---A---A---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--T--A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-A-----CTGC-TCTA
gi|78777                      :                                                   ACTGTTCTA----AG-TTAA-CT-AGAAC-AGC--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CT------C-T--A---------T---G---A---CT--GC--T---TTA----
gi|78782                      :                             actgctctagaacagtcctgcaACTGCTCTA----AG-TTAA-CTCAGAAC-AGC--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--T--A--A------------T--G---------C-----------CT--GT--T----TG----A-T-T-CA--------------C--C--A-GACC-AGg
gi|78784                      :                             actgctctagaactgttctgcgACTGCTCTA----AG-T-AA-CTTAGAGC-AGT--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--------------------------------------------T--GC--T---TTA--------T-GA--------------C--T--G-G------T-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-G-----CTGC-TCTAggaataattgc
gi|78784                      :                                                   ACTGCTCTA----AG-TT-A-CTTAGAGC-AGT--------
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gi|78786                      :                             actgctctagaactgttctacgACTGCTCCA----AG-TTAA-CTTAGAAC-AGC--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--tgctcta
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gi|78775                      :                                                   ACTGCTCTA----GA---AA-CCTACCGT-A---------------------C-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TG-----------G---------A--------A--T--A--GAATC------C-T--G-----------------A---CTGCGT--T---CT-----AGT-G-AA--------------A--A--A-GAGCTGGT-T--C-T-G----------gattagaatcattgcagataacatagatat
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gi|78792                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TGGA-ACTGGAGC-AGT--------CA---T-----G-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tctctgctgactgctctagagctgcctcgtgactgctccaaa
gi|78778                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TTAA-C-TAAAGC-AGT--------CA---T-----A-G-AGC-A--G--T--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tctctgctgactgctctagagctgctct
gi|78788                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TTAA-CTT-GAGC-AG---------------T-CA-T-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tctctgcgatgctctaaactgctctatgactgctccaagtta
gi|78802                      :                                                    CTGTTCTA----TG-TTAA-CTTAGAGC-AGT--------CG---T-----A-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------ctcctgctgactgctctagagcctactctgtgactgctcca
gi|78790                      :                                                   cCTGTTC-A----AG-TTAAATTTAGAGC-AGT--------CA---TT-A--A-A-AGC-A--G--T--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tctcttctgactgttatggaacaactctatgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78787                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TGAA-CTTGGAGC-AG----------T---CA-C--A-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tcttctgctgacctgctctagagctgcttcta
gi|78791                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TGAA-CTTGGAGC-GG----------T---CA-C--A-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tgtccacgactgctccacgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78789                      :                                                    CTGTTCTA----AG-TTAA-CTTGGAGC-AGT--------CA---T-----G-G-AGC-A--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tgtccacgactgctccaagttcgctagaacaggtccacgactgctcta
gi|78794                      :                                                    CTGCT----------TTAA-CT--------GT--------TC---TA-C--A-A-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--T--A--GAATC------C-T--G-----------------A---CT--GT--T---CTG----GGT-C-A-----------------------GAA------T--C-C------------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-ATAGAGCTGT-TCTAgtccacgactgctccacgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78780                      :                                                     TGTTCTA----AT-TTAA-CTTAGAGC-AG----------T---AT-A--T-GAA-C-A--G--T--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--Tgattaaatcattggatgata
gi|78805                      :                                                      GCTCTAGAGCAG-TCAG-C--AGAGC------------TG---TT-C--T-A-A-G-T--GAAC------------C-----------TG-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------G-TA-G---------C---G-------CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--T--CTGAAC-AGT-C--G-T-A----------G-TG------C-TGT--TCT----------Aaatttcgatgactgcctagagactgttctcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78797                      :                                                                  -TTAA-CTTAGGGC-AGT--------T-------C--TAG-AGC-A--G--C--T---------C-----------GA-----------G---------A--------G--C--C--G--TCGG----C-T--G-------------A---A---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------CT-T--A-GAGC-GG--T--C---G----------T-AGA-A---C-AGT--TCT----------AGA-G-----Ctgctctggaatagaatcat
gi|78778                      :                                                                  ctTAA-CTTGGAGC-AGT--------CA---TA------G-A------G--CAGT---------T-----------TA-----------G---------A--------G--C--A-----TC-----------G---------C---A---GAG-CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--T--A-AAGC-AGa
gi|78798                      :                                             actgctctagaactgctctatgaTAA-TCTAGAAC-AGC--------TC---TT-C--T--------------------------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TCAGAATTC-T--GA--------C---AGTCA---GT--AT--T---CTA------T-T-----------------C--T--A-GAGC-AG--T--C-T--------------TGGAA---C-AGT--TCT----------AGA-G-----C
gi|78779                      :                                                                      t-CTTAGAAC-TGC--------TC---TA-C----G-A-C-T--G--C--T---------C-----------CA-----------A---------GTTCACTTGA--C--A--G--CT------C-T--A-------------G---A---CT--GC--T---CCG----AGT-C-A---------------C--TTTA-GAAC-AGC-C--C-T-G----------C-TA---------GC--TCT----------AGA-A-----gaatcattgcatgatgaatatatat
gi|78793                      :                                                                     actgTTAAAAC-TGT--------TC---TA-C------A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--T--A--GAATC------C-T--G-----------------A---CT--GT--T---CTG----GGT-C-A-----------------------GAA------T--C--------------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-AAAGAGCTGT-TCTA
gi|78777                      :                                                                     ctgctTAGAGC-AGT--------T-------------------------------------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------C---A---GAG-CT--GT--T---CTA-----GT-T-AA--------------C--TT-A-GAAC-AG-----T-T-G----------CAGG--A---C-TGT--TCT----------AGA-G-----Cgattagaatcattggatgata
gi|78786                      :                                                                       actTAGAGC---T--------GC---TC-CA-T-G-A-C-T--G--C--T---------CCAAGTTAACT-TA-----------G---------A--------A--C--A--G--CT------C-T--G---------CT--G---A---CT--GC--T---CTA----tgactgctttag
gi|78773                      :                                                                   actgctcTAGAGC-AGT--------T-------------------------------------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------AGT--A---------T---A---G---CT--GT--T---CTA----AGT-G-AA--------------CT-T--T-GAGC-AG--T--C---G----------T-AG--AG--C-AGT--TCT----------AGA-G-----Cgagctgctct
gi|78804                      :                                                                       actTAGAAC-AGC--------TC---CA-C----G-A-C-T--G--T--T---------CCGAGTTCACT-TA-----------G---------A--------A--C--A--G--CT------C-T--A---------T---G---A---CT--GA--T---CCA----AGT-T-CA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-A-----CTGT-TCTA
gi|78788                      :                                                                          TAGAGC------------TG---CT-CA-T-G-A-C-T--G--C--T---------CAAGTTAACT--TA-----------G---------A--------A--C--A--GC-TC------C-T--G---------CT--G---A---CT--GC--T---CTAG---AGC-------------------C--T--A--------C-T--C-T-G------------TG--A---C-TGC--TCC----------Acgactgctctggaatagaatc
gi|78787                      :                                                                   actgctcTAGAGC-TGC--------TC---TG----T-G-A-C-T--G--C--T---------CCAAGTTCACT-TA-----------G---------A--------A--C--A--G--GT------C-C--A---------C---G---A---CT--GC--T---CCA----CGT-T-CGTT------------T--T--A-GAAC-AGG-T--C-C-A----------C--G--A---C-TGC--TCT----------A
gi|78787                      :                                                                   actgctcTAGAGC-AGT--------CG---T-----G-G-ACC-T--G--T--T---------C-----------TAAAACGAACGTGG---------A--------G--C--A--G--TC------G-T--G---------G---A---C---CT--GT--T---CTA----AGT-G-AA--------------CT-T--G-GAGC-AG--T--C---A----------C-AG--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----C
gi|78791                      :                                                                       actTAGAGC-TGC--------TC---TG----T-G-A-C-C--G--C--T---------CCAAGTTCACT-TA-----------G---------A--------A--C--A--G--GT------C-C--A---------C---G---A---CT--GC--T---CCA----AGT-T-CG--------------C--T--A-GAAC-AGG-T--C-C-A----------C--G--A---C-TGC--TCT----------A
gi|78791                      :                                                                   actgctcTAGAGC-AGT--------CG---TG------G-A-CCT--G--T--T---------C-----------TA-----------GCGAACTTGGA--------G--C--A--G--TC------G-T--G---------G---A---C---CT--GT--T---CTA----AGT-G-AA--------------CT-T--G-GAGC-GG--T--C---A----------C-AG--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----C
gi|78789                      :                                                                       actTAGAGC---T--------GC---TC-CA-T-G-A-C-T--G--C--T---------CCAAGTTAACT-TA-----------G---------A--------A--C--A--G--GT------C-C--A---------C---G---A---CT--GC--T---CCA----CGT-T-CG--------------C--TT-A-GAAC-AGG-T--C-C-A----------C--G--A---C-TGC--TCT----------A
gi|78789                      :                                                                   actgctcTAGAGC-AGT--------CG---T-----G-G-ACC-T--G--T--T---------C-----------TAAGCGAACGTG-G---------A--------G--C--A--G--TC------G-T--G---------G---A---C---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------CT-T--G-GAGC-AGT-C--A-T-G-------------G--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----C
gi|78766                      :                                                                       actTAGGAC-TGT--------TC---TA-C----G-G-C-T--G--C--T---------C-----------TATC---------G---------A--------A--C--A--GAATC------C-T--G-----------------A---CT--GT--T---CCG----GGT-C-A-----------------------GAA------T--C--------------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-AAAGAGCTGT-TCTA
gi|78806                      :                                                                   actgatcTAGAAC-AGC--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------C---------AAT------A--T--A--T--TT------C-T--G-----------------A---CT--GC--T---CTG----GGT----------------------C--A-GAA------T--C--------------C-TT--A---C-TGC--TCT----------AGA-AAAGAGCTGT-TCTAgattagaatcgctgcatgataaatatatat
gi|78767                      :                                                                          TAGAGC-AGT--------CAGGATT-C--T-G-A-C--------------------C-----------CA-----------G---------A--------A--C--A--G--TC-----------G---------G---G---A---TT--ATATT---CTA----GAG-C-AA--------------TCGT--A-GAAC-AGT-T--C-T-gattagaatcattgcatgataagtgtatat
gi|78807                      :                                                                  actgctctTAGAAC-AGC--------TC---TG-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TG-----------G---------AAT------A--T--A--A--TT------C-T--G-----------------A---CT--GT--T---CTG----AGT-T-Agaaaagagttgttctagattagaatcttttcat
gi|78796                      :                                                                          TAGAAC-TGT--------TC---TA-C----G-A-C-T--G--T--T---------C-----------TA-----------G---------AAT------A--C--A--A--TC------C-T--G-----------------A---TT--GT--T---CTG----GGT-C-A------------------T--A-A--------T--C--------------C-TG--A---C-TGC--TTT----------AGA-A-----gaatcctaacaggcccagaacag
gi|78795                      :                                                                    ctgttcTATAGC-AGT--------CAGAATT-C--T-G-A-C--------------------C-----------CA-----------G---------A--------A--C--A--G--TC------A-T--G-------------------------AT--T---CTA------T-T-----------------C--C--A-GAGC-AGC-T--C-T-aagatatgatcgataatagaattattgcatgactgctctataaatatat
gi|78769                      :                                                                               ctgctgactgctctT---TT-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TAG----------G---------A--------A--A--A--G-----------------------------A---G---CT--GT--T---CTA----GAT-T-Agaaaagagctgttctagattagaatcattgcatgataaatatatat
gi|78795                      :                             actgctctagaactgctctacgactgctctggagtagaatcctggcctggctgttattctgggtcaggaa-C--T-G-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-T--GGAATAGAATC---ATG-A---CT--GT--T---CTG----GGT----------------------C--A-GAA-----------T-T----------C-TG--A---C-TGC--TAT----------AGA-AAAGAGCTGT-TCTAgaatcattgcagataacatagatat
gi|78808                      :                                                                                                     ctg-G-A-C-TTGG--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--T--A--GATCC------C-T--G-----------------A---CT--GT--T---CTG----GGT-------------------C--C--A-GAAgattagaatcattgcatgataaatatatat
gi|78777                      :                                                                                                       tac-A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--A--G--TC------C-T--G---------C---A---A---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--T--A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-A-----CTGC-TCTAtcgattgtttagtgtgagggctgctttctgtatt
gi|78782                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------C-T--G---------C---G---A---CT--GC--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--TC-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-A-----tgactgctttag
gi|78783                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTA----CGT-T-AA--------------C--TT-A-AAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---T-TTC--TCT----------AGA-G-----CTGC-TCTAtaatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
gi|78786                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-C--A---------T---G---A---CT--GC--T---CCA----AGT-T-AA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-G-----CTGC-TCT
gi|78773                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CAA----AGT-T-CA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--A-T-A----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-A-----CTGC-TCTA
gi|78785                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--GC-TCA-----C-T--G-----------------A---CT--GC--T---CCA----AGT-T-AA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-G-----CTGC-
gi|78792                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-C--A---------T---G---A---CT--GC--T---CCA----GTT-C-CA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-G-----CTGC-TCTctcgtgactgctccaaa
gi|78778                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CT------C-T--A---------T---G---A---CT--GC--T---TT-----AGT-T-AA--------------CT-T--A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C--G--A-----TGC--TCT----------A-A-A-----CTGC-TCTA
gi|78788                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--GC-TC------A-T--G-----------------A---CT--GC--T---C-A----AGT-T-AA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--CCT-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-GC----CTAC-TCTtgactgctccaagtta
gi|78790                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CT------T-TTAA---------T---G---A---CT--GC--T---CTA----AAT-TTAA--------------C--T--T-GAAC-AGC-TT-C-T-G----------C-TG--A---CCTGC--TCT----------AGA-G-----CTGCTTCTAgtgactgctcca
gi|78780                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------CAT--A---------T-------A---CT--GC--T---CTA----AGT-TAAA--------------T--T--A-GAAC-AAA-T--T-TCG----------A-TG--A---C-TGC---CT----------AGAGA-----CTGT-TCT
gi|78787                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-T--G---------T---G---A---CT--GC--T---CCA----AGT-T-CA--------------CT-T--A-GAAC-AGG-T--C-C-A----------C--G--A---C-TGC--TCC----------Acatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78789                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-C--A---------T---G---A---CT--GC--T---CCA----AGT-T-AA--------------CT-T--A-GAAC-AGG-T--C-C-A----------C--G--A---C-TGC--TCC----------Acgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78771                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--T--------TC------C-TCTG---------C---A---A---CC--GC--T---CTA----G-----AA-----------------T--A-GAAT--GT-T--T-T-GGGTTAGAATCC-TG--A---C-TGC--TTT----------AGA-AAAGAGCTGT-TCTAcgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78772                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--A--TT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTG----G-----AA-----------------T--A-GAA------T--C-T--------------TG--A---C-TGT--TCTGCACTAGAGAAGA-G-----CTGT-TCTAgatttggatcactgcataactgctcaatgaatatacat
gi|78768                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CCT-----C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTGG---AGT-T-AGAATCCTGGCTGTTTC--T--G-GGTC-AGA-A--T-T-T----------C-TG--A---C-TGC--TCTAGGAAA----AGA-G-----CTGT-TCTAgattagaattattgtataataaataaatgtatat
gi|78770                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--CT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTA----gattagaatcattgcatgataatcatatat
gi|78781                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---C
gi|78775                      :                                                                                                          -A-C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------AACC--T--A--CC------G-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTG----G-----AA-----------------T--A-GAA------T--C--------------C-TG--A---C-TGCGTTCT----------AGgagaatggaattttga
gi|78797                      :                                                                                                            -C-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------C-T--A---------C---G---A---CC--GC--T---CTA----AGT-T-AA--------------CT-T--A-GAAC-AGT-T--C-A-G----------C-CG--A---C-GGC--TCT----------CGA-G-----CTGC-TCTAtgaaaaagagctggttctgaagattagaaacaattgcatgataaaatacat
gi|78802                      :                                                                                                              -T--G--T--T---------C-----------CA-----------T---------A--------A--C--A--G--TC-----------A---------G---A---AGAGCT--GT--T---CTA----TGT-T-AA--------------C--TT-A-GAGC-AG--T--C---G----------T-AG--AG--C-AGC--TCT----------AGA-gaactgccctaagttaaa
gi|78798                      :                                                                                                             c-T--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--T--G--TT------C-C--A---------A---G---A---CT--GC--T---CTA----G-----AA-----------------T--A-GAAT-A-C-TGAC-T-GTCAGAATT--C-TG--A---C-TGC--TCTAGAGA-----AGA-G-----CTGT-TCTAactctatgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78784                      :                                                                                                                --G--T--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------C---AGA-A---CT--GC--T---CTA----AGT-T-AC--------------T--T--A-GAGC-AGgattagaatcattgcatgatgaatatatat
gi|78784                      :                                                                                                               a--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------CAG-A---A---CCA-GT--C---ATAAAGCAGT-T-----------------C--T--A-GAGC-AG--T--C-A-G----------C-AGA-A---C-TGC--TCT----------Atgctttatgactggttctgctgactgctctagagctgctcta
gi|78783                      :                                                                                                actgctctaagtaact--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--A--A--A--TC------A----G---------C---A---GAG-CT--GT--T---TTA----AGT-T-AA--------------CG-T--A-GAGC-AG--T--C---G----------T-AGA-A---C-AGT--TCT----------AGA-G-----Ctgctcta
gi|78786                      :                                                                                                             act--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------CAG-A---G---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------CT-T--G-GAGC-AGT-C--A-T-G-------------G--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----Ctgctcta
gi|78785                      :                                                                                                             act--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------C---A---GAG-CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------CT-T--G-GAGC-AG--T--C-A-G------------TG--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----Ctgctct
gi|78792                      :                                                                                                             act--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------CAG-A---G---CT--GT--T---CTA----AGTGG-AA--------------C--T--G-GAGC-AGT-C--A-T-G-------------G--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----Ctgcctcgtgactgctccaaa
gi|78788                      :                                                                                                             act--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TCAG----C-A--G---------G---A---G---CT--GT--T---CTA----AGT-T-AA--------------C--T--T-GAGC-AG--T--C--------------A-TG--AG--C-AGC--TCT----------AGA-G-----Ctgctct
gi|78790                      :                                                                                                             act--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--GT------C-A--G---------CAGAA---G---CT--GT--T---C-A----AGT-T-AAAT------------T--T--A-GAGC-AGctactctgtgactgctcca
gi|78801                      :                                                                                       actgctctagaactgcttttaatga--G--C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------A--C--A--T--AT------T-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CT------------------------------T--G-GAAT-GAA-T--C--------------C-TG--AGTTC-TGC--TCT----------AGA-A-----tgcttcta
gi|78802                      :                                                                                                                   --C--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--T--G--CT------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CTA----AGT-T-AA--------------CA-T--A-GAAC-AGC-T--C-T-T----------C-TG--A---C-TGT--TAT----------GGA-A-----CAAC-TCTAagagctgtttctagatagtagaatcatgatgataatacatgtatat
gi|78780                      :                                                                                                                   --C--T---------C-----------TA-----------G---------G-----------C--A--G--TC------A-TC-G---------A---A---A---TTT-GT--T---CTA----ATT-T-AA--------------CT-T--A-GAGC-AGTAT--A-T-G-------------A--A---C-AGT--TCT----------AGA-G-----Ctgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78782                      :                                                                                                                   act--T---------C-----------TA-----------G---------A--------G--C--A--G--TC------A----G---------C---A---GAG-CT--GT--T---CTG----AGT-T-AA--------------CT-T--A-GAGC-AG--T--C---G----------C-AGA-A---C-AGT--TCT----------AGA-G-----Cactgttctcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78805                      :                                                                                                                                act-----------TA-----------G---------A--------A--C--A--G--CG------C-T--A---------C---G---A---CT--GC--T---CCA----GGT-T-CA--------------C--TT-A-GAAC-AGC-T--C-T-G----------C-TG--A---C-TGC--TCT----------AGA-G-----CTGC-TCTataatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
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gi|78769                      :                                                                                                                    actgctctagaattcctctgcaaccgctctagaatagaatgttttgggttagaatcctgactgctttagaaa------C-T--G---------C---A---A---TG--AT--T---CTA----A---T-----------------C--T--A-GAAC-AGC-T--C-T-aatgaatatacat
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gi|78779                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --A---C-TGC--T-T----------AGA-A-----CTGC-TCTAtgactgctccaagttaacttagaacaggtccacgactgctccacgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|78803 ): TCTAAAACTATTCTACCCGATGCTCTGGAGAGAATCTGACTGTCTGCTCTAGAAATAGCTGTTCTAGATTAGAATCGTTGATCATAAATACTATGT
Unaligned ( gi|78809 ): ATCCTGACTGTTCCGCTCTAGAAAAGAGCTGCCCTAAATAAGAATCATTGCATGATAAAATACA
Unaligned ( gi|78800 ): TGCGTCGAGAATAGGTCTGACGATGTTTTCTGGAAATAGAATCCTGACTGTTCGCTCTTTTAAGAAAAGAGTGATTTCATTGCATGATAAATACATGT






Alignments
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lowQualScore                  :                                               8888    9   7 1 8   11111  8 8   00  5555555555  2222222222  222222222222222222222222222222222222  5 7 00  00 000      99999999999    11111111111111111111111 22 9 000 9   22  11111 9999999999    2   2 2    
consensus                     :                                      ACTGCTCTAGGTTAACTTAGAGCAGCTCTAC---GA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---NG--CT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTAAGTT-AA--C-T--AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTA
Reference ( family-441 )      :                                      ACTGCTCTAAGTTAACTTAGAGCAGCTCTNC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---AG--TC--C-T--G-----------C-GA-C-T--GC--T---CTAAGTT-AA--C-T--AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTA
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gi|78766                      :                                                       TAGGACTGTTCTAC---GG-C-TGC--TC----------TATC--------GA--A--C---AGAATC--C-T--G--------------A-C-T--GT--T---CCGGGTC-A---------GAA-----T--C--------------C-TG-A---C-TGC--TC-----TAGAAA-----AGAG-CTG-T-TCTAgattagaatcattgcatgataaatacat
gi|78767                      :                               actgatcACTGCTCTAG---AACT-------GTTCTAC---GA-T-TGC--TC----------TA----------GAATA--T---AA--TC--C----------------C-GA-C-T--GT--T---CTGGGT--------C--AGAA-----T--C--------------C-TG-A---C-TGC--TC-----TAGAAA-----AGAG-TTG-T-TCTAgattagaatcgctgcatgataaatatatat
gi|78768                      :                                      ACTGCTCTAG---AACT----GC--CTCTAC---GA-C-TGC--TC----------TG----------GA--G--TTAGAA--TC--C-T--G--------------G-C-T--GT--TT--CTGGGTC-A---------GAA-----T--T-T------------C-TG-A---C-TGC--TC-----TAGGAAA----AGAG-CTG-T-TCTAgattagaatcttttcat
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gi|78772                      : actgctctagaattcctctgcaaccgctctagaatagaatgttttgggttagaatcctgactgctttagaaaA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TA--TT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTGG----AA----T--AGAA-----T--C-T--------------TG-A---C-TGT--TC-----TGCACTAGAGAAGAG-CTG-T-TCTAaatgaatatacat
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gi|78774                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--CT--AT--TG--C-T--A-----------C-GA-T-T--GC--T---CTGG----AA----T--AGAA-----T--C--------------C-TG-A---C-TGT--TC-----T----------G------G-C-TCTA
gi|78774                      :                                      ACTGCTCTAG---AACT------ATTGCTAC---GA-T-TGC--TC----------TG----------GA--A--T---AGAATC--C-T--G--------------A-C-T--GT--T---CTG-GCT-----C-T--AGAAC-AGA---------------------G-G---C-TAT--TC-----T----------AGAgaacagaggctattctagattagaatcattgcatgatataata
gi|78775                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--AACC---TA--CC--G-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTGG----AA----T--AGAA-----T--C--------------C-TG-A---C-TGCGTTC-----T----------AGttagaatcattgcatgatataata
gi|78775                      :                                      ACTGCTCTAGA--AACCTA------CCGTAC---GA-C-TGC--TC----------TG----------GA--A--T---AGAATC--C-T----------------GA-C-T--GCGTT---CT-AGTG-AA--A-A--AGAGCTGGTT--C-T-G----------tgaaaaagagctggttctgaagattagaaacaattgcatgataaaatacat
gi|78776                      :                                      ACTGCTCTAAGTTAACTTAGAGCAGTTTTTC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---AG--TC--C-T--G-----------C-AA-C-T--GT--T---CTAAGTT-AA--C-T--AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAA-CTG-C-TCTAaagattagaaacaattgcatgataaaatacat
gi|78777                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---AG--TC--C-T--G-----------C-AA-C-T--GT--T---CTAAGTT-AA--C-T--AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAA-CTG-C-TCTA
gi|78778                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--CT--C-T--A-----------T-GA-C-T--GC--T---TT-AGTT-AA--CTT--AGAAC-AGCT--C-T-G----------C--G-A-----TGC--TC-----T----------A-AA-CTG-C-TCTAtgactgctttag
gi|78778                      :                                                  TAACTTGGAGCAGTCATA----GA----GCAGTT----------TA----------GA--G--C---A---TC-------G-----------CAGAGC-T--GT--T---CTAAGTT-AA--C-T--AAAGC-AGTC--A-T-A-------------G-AG--C-AGT--TC-----T----------AGAG-Ctgactgctccaagtta
gi|78778                      :                                   actACTGCTTTA-GTTAACTTAGAACAGCTCTGC---GA---TGC--TC----------TA-----------A--A--C---TG--CT--C-T--A-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-A
gi|78779                      :                                                   actgctctagaactgctctatgA-C-TGC--T-----------TA----------GA--A--C---TG--CT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-CA--C-T--TG-AC-AGCT--C-T-A-------------G-A---C-TGC--TC-----C-----------GAG-TCA-C-TTTA
gi|78779                      :                                                     CTTAGAACTGCTCTAC---GA-C-TGC--TC----------CAAGTTCACTT-GA-----C---AG--CT--C-T--A-------------GA-C-T--GC--T---CCGAGTC-A---C-TTTAGAAC-AGCC--C-T-G----------C-TA--------GC--TC-----T----------AGAgaacagccctgctagctctagaa
gi|78780                      :                                                                     actgA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--CAT--A-----------T--A-C-T--GC--T---CTAAGTTAAA--T-T--AGAAC-AAAT--T-TCG----------A-TG-A---C-TGC---C-----T----------AGAGACTG-T-TCTa
gi|78780                      :                                      ACTGCTCTAAGTTAAATTAGAACAAAT-TTCGATGA-C-TGC---C----------TA----------GA--GA-C---TG--TT--C-TC-A-----------T-GG-C-TGCGC--T---CTAA----AA----T--ATAA-----T--C--------------C-TA-A---C-TGC--TC-----TTAAA------AGAGACTG-C-TTTAcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78781                      :                                                   actgctctagaactgttcatatA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---Cgattagaatcattgcataa
gi|78782                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--C-T--G-----------C-GA-C-T--GC--T---CTAAGTT-AA--C-TC-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAgagaatggaattttga
gi|78783                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTACGTT-AA--C-TT-AAAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---T-TTC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTAataatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
gi|78784                      :                                      ACTGCTCTAAGT-AACTTAGAGCAGTTCTGC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------GA-------------------------------------A-C-T--GC--T---TTA---T-GA--C-T--------GGTT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTA
gi|78785                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-A--C-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-AA--C-TT-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-
gi|78785                      :                                                      TTGGAGCAG-TCACG--AGG-C-AGC--TC----------TA----------GA--G--C---AG--TC--A----G-----------CAGAGC-T--GT--T---CTAAGTT-AA--CTT--GGAGC-AG-T--C-A-G------------TG-AG--C-AGC--TC-----T----------AGAG-Cctcgtgactgctccaaa
gi|78785                      :                                   actACTGCTCCAAGTTAACTTAGAACAGCTCTGC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CC--T-C--G-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAa
gi|78786                      :                                                   actgctctagagctgctcactgA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-C--A-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-AA--C-TT-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTa
gi|78787                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-T--G-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-CA--CTT--AGAAC-AGGT--C-C-A----------C--G-A---C-TGC--TC-----C----------A
gi|78787                      :                                                       TAGAGCTGCTCTG---TGA-C-TGC--TCCAAGTTCACTTA----------GA--A--C---AG--GT--C-C--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CCACGTT-CGTTT-T--AGAAC-AGGT--C-C-A----------C--G-A---C-TGC--TC-----T----------Acgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78788                      :                                                                  actgctcA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C----A-----------T-GA-C-T--GC--T---C-AAGTT-AA--C-TT-AGAAC-AGCT--CCT-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAGCCTA-C-TCT
gi|78789                      :                                                                         A-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-C--A-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-AA--CTT--AGAAC-AGGT--C-C-A----------C--G-A---C-TGC--TC-----C----------Agtgactgctcca
gi|78789                      :                                                       TAGAGCAGTCGTG----GA-CCTGT--TC----------TAAGCGAACGTGGA--G--C---AG--TC--G-T--G-------------GA-CCT--GT--T---CTAAGTT-AA--CTT--GGAGC-AGTC--A-T-G-------------G-AG--C-AGC--TC-----T----------AGAG-Ccgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78789                      :                                   actACTGCTCCAAGTTAACTTAGAACAGGTCCAC---GA-C-TGC--TCCACGTTCGCTTA----------GA--A--C---AG--GT--C-C--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTA
gi|78790                      :                                                   actgctctagagctgctccatgA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--CT--T-TTAA-----------T-GA-C-T--GC--T---CTAAATTTAA--C-T--TGAAC-AGCTT-C-T-G----------C-TG-A---CCTGC--TC-----T----------AGAG-CTG-CTTCTA
gi|78791                      :                                                                                                                                                                                                                -A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCT
gi|78791                      :                                                       TAGAGCTGCTCTG---TGA-C-CGC--TCCAAGTTCACTTA----------GA--A--C---AG--GT--C-C--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CCAAGTT-CG--C-T--AGAAC-AGGT--C-C-A----------C--G-A---C-TGC--TC-----T----------Agtgaccgctccaagttcacttagaacaggtccacgactgctccaagttcgctagaacaggtccacgactgctcta
gi|78792                      :                                                                  actgctcA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-C--A-----------T-GA-C-T--GC--T---CCAGTTC-CA--C-TT-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCT
gi|78793                      :                                                      TTAAAACTGTTCTAC----A-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--T---AGAATC--C-T--G--------------A-C-T--GT--T---CTGGGTC-A---------GAA-----T--C--------------C-TG-A---C-TGC--TC-----TAGAAA-----AGAG-CTG-T-TCTA
gi|78794                      :                                  ctgctCTGCT-----TTAACT-------GTTCTAC--AAA-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--T---AGAATC--C-T--G--------------A-C-T--GT--T---CTGGGTC-A---------GAA-----T--C-C------------C-TG-A---C-TGC--TCTAGAAT----------AGAG-CTG-T-TCTAgattagaatcattggatgata
gi|78795                      :                                                                 CTGC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-T--GGAATAGAATCAT-GA-C-T--GT--T---CTGGGT--------C--AGAA----------T-T----------C-TG-A---C-TGC--TA-----TAGAAA-----AGAG-CTG-T-TCTAgattaaatcattggatgata
gi|78796                      :                                                                                                                                                                          --C-T--AGAAC-TGTT--C-T-A----------C--G-A---C-TGT--TC-----T----------AGAgattagaatcattgcatgataaatatatat
gi|78797                      :                                                                     ctgtt-C-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--C-T--A-----------C-GA-C-C--GC--T---CTAAGTT-AA--CTT--AGAAC-AGTT--C-A-G----------C-CG-A---C-GGC--TC-----T----------CGAG-CTG-C-TCTAatacaatcctgattgttctgggtcataatcctgactgctttagaaaagatatgatcgataatagaattattgcatgactgctctataaatatat
gi|78797                      :                                                 TTAACTTAGGGCAGTTCTA----GAGC-AGC--TC----------GA----------GA--G--C---CG--TCGGC-T--G-------------AA-C-T--GT--T---CTAAGTT-AA--CTT--AGAGC-GG-T--C---G----------T-AGAA---C-AGT--TC-----T----------AGAG-Cgaactgccctaagttaaa
gi|78797                      :                                    ctACCGCTCTAAGTTAACTTAGAACAGTTCAGC--CGA-C-GGC--TC----------TC----------GA--G--C---TG--CT--C-T--A-----------G-AA-C-T--GC--C---CTAAGTT-AA--a
gi|78798                      :                                                       ctgctctagaactgttctacg-TGC--TC----------TA----------GA--A--C---TG--TT--C-C--A-----------A-GA-C-T--GC--T---CTAG----AA----T--AGAAT-A-CTGAC-T-GTCAGAATT--C-TG-A---C-TGC--TC-----TAGAGA-----AGAG-CTG-T-TCTAa
gi|78801                      :                                                                              GC--TC----------TA----------GA--A--C---AT--AT--T-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CT------------T--GGAAT-GAAT--C--------------C-TG-AGTTC-TGC--TC-----TAGAA------AGAG-CTGTT-TCTAgattagaatcattgcatgatgaatatatat
gi|78802                      :                                                                               C--TC----------TA----------GA--G--C---TG--CT--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CTAAGTT-AA--CAT--AGAAC-AGCT--C-T-T----------C-TG-A---C-TGT--TA-----T----------GGAA-CAA-C-TCTAgatagtagaatcatgatgataatacatgtatat
gi|78804                      :                                                       TAGAACAGCTCCAC---GA-C-TGT--TCCGAGTTCACTTA----------GA--A--C---AG--CT--C-T--A-----------T-GA-C-T--GA--T---CCAAGTT-CA--C-TT-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAA-CTG-T-TCTAtgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78805                      :                                                       TAGAACAGCACTAC---GA-C-TGT--TCAGAGTTAACTTA----------GA--A--C---AG--CG--C-T--A-----------C-GA-C-T--GC--T---CCAGGTT-CA--C-TT-AGAAC-AGCT--C-T-G----------C-TG-A---C-TGC--TC-----T----------AGAG-CTG-C-TCTcgactgctctggaatagaatc
gi|78806                      :                                                       TAGAACAGCTCTGC--TGA-C-TGC--TC----------TA----------CAATA--T---AT--TT--C-T----------------GA-C-T--GC--T---CTGGGT--------C--AGAA-----T--C--------------C-TT-A---C-TGC--TC-----TAGAAA-----AGAG-CTG-T-TCTAggaatagaatcat
gi|78807                      :                                                       TAGAACAGCTCTGC--TGA-C-TGC--TC----------TG----------GAATA--T---AA--TT--C-T----------------GA-C-T--GT--T---CTGAGTT-Agattagaatcattgcatgataagtgtatat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78799 ): TGCTCTAGAACTGTTTACGACTAGCTGGAATAAGAATCTGCTGTTATGGGCAAGAATTCTGACTGCTCTAATAAAAGACCTG
Unaligned ( gi|78803 ): TCTAAAACTATTCTACCCGATGCTCTGGAGAGAATCTGACTGTCTGCTCTAGAAATAGCTGTTCTAGATTAGAATCGTTGATCATAAATACTATGT
Unaligned ( gi|78809 ): ATCCTGACTGTTCCGCTCTAGAAAAGAGCTGCCCTAAATAAGAATCATTGCATGATAAAATACA
Unaligned ( gi|78808 ): TACGACTTGGCTCTAGAATAGATCCCTGACTGTTCTGGGTCCAGAATCGATTGTTTAGTGTGAGGGCTGCTTTCTGTATT
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Reference ( family-441 )      :                                                                ACTGCTCTAGGTTAACTTAGAGCAG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TA--G--------A--A--C-NG--C-T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AGTT-AA--------------C--T-AGAAC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---C-TGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-441 )      :                                                    ACTGCTCTAGGTTAACT----TAGAACAG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
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gi|78769                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCTGG-AG-TA-GAATC-----------C--T-GGC------CT-GGCTGTTATT--C-T-GGGTCAGGAATTTCTG-A---CTGC--TC-----TAGGAAA----AG----AG-CTG-T-TCTAgattagaatcattgcatgataatcatatat
gi|78770                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-gattagaatcattgcagataacatagatat
gi|78771                      :                                                    ACTGCTCTAG---AATT----C---------CTCTG--C-AA--CC--GC--TC-----------TAGA---A---------------------T-----------A---GA-AT--GT--TTT-G-GG-T---------------------T-AGA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGC--TT-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTA
gi|78772                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----A--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-G-G-----AA-----------------T-AGA------A-----------T--C-T---------------TG-A---CTGT--TC-----TGCACTAGAGAAG----AG-CTG-T-TCTAgatttggatcactgcataactgctcaatgaatatacat
gi|78773                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCA-A-AG-TT-CA--------------CT-T-AGA------AC-AGC------T--A-T-A------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AA-CTG-C-TCTAgattagaattattgtataataaataaatgtatat
gi|78774                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----A--T--TGC-T-----------AC--GA-TT--GC--TCT-G-G-----AA-----------------T-AGA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGT--TC-----T----------G----------G-C-TCTA
gi|78774                      :                                                    ACTGCTCTAG---AACT--------ATTG----CTA--C-GA--TT--GC--TC-----------TGGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT---GG-CT-----------------C--T-AGA------AC-AGA----------------------------G-G---CTAT--TC-----T----------AG----Agaacagaggctattctagattagaatcattgcatgatataata
gi|78775                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---AACC--T-----A--C--C-G-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-G-G-----AA-----------------T-AGA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGCGTTC-----T----------AG----ttagaatcattgcatgatataata
gi|78775                      :                                                    ACTGCTCTAGA--AACC----TA--------CCGTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TGGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GCGTTCT---AG-TG-AA--------------A--A-AGA------GCTGGT------T--C-T-G------------tgaaaaagagctggttctgaagattagaaacaattgcatgataaaatacat
gi|78776                      :                                                    ACTGCTCTAAGTTAACT----TAGAGCAG--TTTTT--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--A-----G--T--C-C-T-----------GC--AA-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AA-CTG-C-TCTAaagattagaaacaattgcatgataaaatacat
gi|78777                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--A-----G--T--C-C-T-----------GC--AA-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AA-CTG-C-TCTA
gi|78777                      :                                                    ACAGCTCT--GCTGACTGCTCTAGAACTG--CTCTA--T-GA--CT--GC--TT-----------TAGtgactgctttag
gi|78778                      :                                                   actgctctagaacagtcctgcaactgttctaagttaactagaA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GC--TTT---AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------C-G-A----TGC--TC-----T----------A-----AA-CTG-C-TCTA
gi|78778                      :                                                                TAACT----TGGAGCAG--TCATA----GA------GCAGTT-----------TAGA---G--CATC-----G--C------------------AG--AG-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AAA------GC-AGT------C--A-T-A--------------G-AG--CAGT--TC-----T----------AG----AG-Ctgactgctccaagtta
gi|78778                      :                                                 actACTGCTTTAG-TTAACT----TAGAACAG--CTCTG--C-GA---T--GC--TC-----------TA-A---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-A
gi|78779                      :                                                                       actgctctagaactgctctatgA--CT--GC--T------------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------C--T-TG-------AC-AGC------T--C-T-A--------------G-A---CTGC--TC-----C-----------G----AG-TCA-C-TTTA
gi|78779                      :                                                                   CT----TAGAACTG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------CAAGTTCA--C--TTGACAG--C--T-C-T-----------A---GA-CT--GC--TCC-G-AG-TC--A--------------CTTT-AGA------AC-AGC------C--C-T-G------------CTA-------GC--TC-----T----------AG----Agaacagccctgctagctctagaa
gi|78780                      :                                                                                         actgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-CAT-----------AT---A-CT--GC--TCT-A-AG-TTAAA--------------T--T-AGA------AC-AAA------T--T-TCG------------ATG-A---CTGC---C-----T----------AG----AGACTG-T-TCTa
gi|78780                      :                                                    ACTGCTCTAAGTTAAAT----TAGAACAAATTTCGA--T-GA--CT--GC---C-----------TAGAG--A--C--T-----G--T--T-C-TC----------AT--GG-CTGCGC--TCT-A-A-----AA-----------------T-ATA------A-----------T--C----------------CTA-A---CTGC--TC-----TTAAA------AG----AGACTG-C-TTTAcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78781                      :                                                                       actgctctagaactgttcatatA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCgattagaatcattgcataa
gi|78782                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------GC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--TCAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----Agagaatggaattttga
gi|78783                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-CG-TT-AA--------------CT-T-AAA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---TTTC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTAataatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
gi|78784                      :                                                    ACTGCTCTAAGT-AACT----TAGAGCAG--TTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-T-----------AT--GA-CT--G-------------------------------------------------GT------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
gi|78785                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------ACT-GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-
gi|78785                      :                                                                    T----TGGAGCAG---TC-A--C-GAGGCA--GC--TC-----------TAGA---G--C--A-----G-----T-C-A-----------GCA-GAGCT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-GGA------GC-AG-------T--C-A-G-------------TG-AG--CAGC--TC-----T----------AG----AG-Cctcgtgactgctccaaa
gi|78785                      :                                                 actACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--C-T-C-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-Aa
gi|78786                      :                                                                       actgctctagagctgctcactgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTa
gi|78787                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------A
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CGTT------------T--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTCACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGTTTTAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78788                      :                                                                       actgctctagagctgctctgtgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------AT--GA-CT--GC--TC--A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--CCT-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AGCCTA-C-TCT
gi|78789                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------Agtgactgctcca
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCCA--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTAACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CG--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGCT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78790                      :                                                                       actgctctagagctgctccatgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-TTA---------AT--GA-CT--GC--TCT-A-AATTT-AA--------------C--T-TGA------AC-AGCT-----T--C-T-G------------CTG-AC--CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-CTTCTA
gi|78791                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CC--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CG--------------C--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------A
gi|78792                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-GT-TC-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCT
gi|78793                      :                                                                    T----TAAAACTG--TTCTA--C--A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGC--TC-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTA
gi|78794                      :                                                                       ctgctAACTG--TTCTA--C-AAA-CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C-C--------------CTG-A---CTGC--TCTAGAAT----------AG----AG-CTG-T-TCTAgattagaatcattggatgata
gi|78795                      :                                                                                    ctgcttt-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-TGGAATAGAATCAT--GA-CT--GT--TCT-G-GG-T---------------------C-AGA------A----------------T-T------------CTG-A---CTGC--TA-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTAgattaaatcattggatgata
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gi|78797                      :                                                                                        ctgttc--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CC--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGT------T--C-A-G------------CCG-A---CGGC--TC-----T----------CG----AG-CTG-C-TCTAaaagatatgatcgataatagaattattgcatgactgctctataaatatat
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-441 )      :                                                    ACTGCTCTAGGTTAACT----TAGAACAG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
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gi|78778                      :                                                                TAACT----TGGAGCAG--TCATA----GA------GCAGTT-----------TAGA---G--CATC-----G--C------------------AG--AG-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AAA------GC-AGT------C--A-T-A--------------G-AG--CAGT--TC-----T----------AG----AG-Ctgactgctccaagtta
gi|78778                      :                                                 actACTGCTTTAG-TTAACT----TAGAACAG--CTCTG--C-GA---T--GC--TC-----------TA-A---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-A
gi|78779                      :                                                                       actgctctagaactgctctatgA--CT--GC--T------------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------C--T-TG-------AC-AGC------T--C-T-A--------------G-A---CTGC--TC-----C-----------G----AG-TCA-C-TTTA
gi|78779                      :                                                                   CT----TAGAACTG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------CAAGTTCA--C--TTGACAG--C--T-C-T-----------A---GA-CT--GC--TCC-G-AG-TC--A--------------CTTT-AGA------AC-AGC------C--C-T-G------------CTA-------GC--TC-----T----------AG----Agaacagccctgctagctctagaa
gi|78780                      :                                                                                         actgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-CAT-----------AT---A-CT--GC--TCT-A-AG-TTAAA--------------T--T-AGA------AC-AAA------T--T-TCG------------ATG-A---CTGC---C-----T----------AG----AGACTG-T-TCTa
gi|78780                      :                                                    ACTGCTCTAAGTTAAAT----TAGAACAAATTTCGA--T-GA--CT--GC---C-----------TAGAG--A--C--T-----G--T--T-C-TC----------AT--GG-CTGCGC--TCT-A-A-----AA-----------------T-ATA------A-----------T--C----------------CTA-A---CTGC--TC-----TTAAA------AG----AGACTG-C-TTTAcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78781                      :                                                                       actgctctagaactgttcatatA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCgattagaatcattgcataa
gi|78782                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------GC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--TCAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----Agagaatggaattttga
gi|78783                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-CG-TT-AA--------------CT-T-AAA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---TTTC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTAataatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
gi|78784                      :                                                    ACTGCTCTAAGT-AACT----TAGAGCAG--TTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-T-----------AT--GA-CT--G-------------------------------------------------GT------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
gi|78785                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------ACT-GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-
gi|78785                      :                                                                    T----TGGAGCAG---TC-A--C-GAGGCA--GC--TC-----------TAGA---G--C--A-----G-----T-C-A-----------GCA-GAGCT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-GGA------GC-AG-------T--C-A-G-------------TG-AG--CAGC--TC-----T----------AG----AG-Cctcgtgactgctccaaa
gi|78785                      :                                                 actACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--C-T-C-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-Aa
gi|78786                      :                                                                       actgctctagagctgctcactgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTa
gi|78787                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------A
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CGTT------------T--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTCACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGTTTTAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78788                      :                                                                       actgctctagagctgctctgtgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------AT--GA-CT--GC--TC--A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--CCT-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AGCCTA-C-TCT
gi|78789                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------Agtgactgctcca
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCCA--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTAACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CG--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGCT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78790                      :                                                                       actgctctagagctgctccatgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-TTA---------AT--GA-CT--GC--TCT-A-AATTT-AA--------------C--T-TGA------AC-AGCT-----T--C-T-G------------CTG-AC--CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-CTTCTA
gi|78791                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CC--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CG--------------C--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------A
gi|78792                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-GT-TC-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCT
gi|78793                      :                                                                    T----TAAAACTG--TTCTA--C--A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGC--TC-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTA
gi|78794                      :                                                                       ctgctAACTG--TTCTA--C-AAA-CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C-C--------------CTG-A---CTGC--TCTAGAAT----------AG----AG-CTG-T-TCTAgattagaatcattggatgata
gi|78795                      :                                                                                    ctgcttt-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-TGGAATAGAATCAT--GA-CT--GT--TCT-G-GG-T---------------------C-AGA------A----------------T-T------------CTG-A---CTGC--TA-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTAgattaaatcattggatgata
gi|78796                      :                                                                ctgct----TAGAACTG--TTCTA--C-GA--CT--GT--TC-----------TAGA---A-----T-----A--CAAT-C-C------------T--GA-TT--GT--TCT-G-GG-TC-A------------------T-AA-------------------T--C----------------CTG-A---CTGC--TT-----T----------AG----Agattagaatcattgcatgataaatatatat
gi|78797                      :                                                                                        ctgttc--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CC--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGT------T--C-A-G------------CCG-A---CGGC--TC-----T----------CG----AG-CTG-C-TCTAaaagatatgatcgataatagaattattgcatgactgctctataaatatat
gi|78797                      :                                                               TTAACT----TAGGGCAG--TTCTA--G-AG--CA--GC--TC-----------GAGA---G--C--C-----G-----T-C-G-----------GCTGAA-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------GC-GG-------T--C---G------------TAGAA---CAGT--TC-----T----------AG----AG-Cgaactgccctaagttaaa
gi|78797                      :                                                  ctACCGCTCTAAGTTAACT----TAGAACAG--TTC-AGCC-GA--CG--GC--TC-----------TCGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------AG--AA-CT--GC--CCT-A-AG-TT-AA--------------a
gi|78798                      :                                                                            ctgctctagaactgttctacgT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-C-----------AA--GA-CT--GC--TCT-A-G-----AA-----------------T-AGA------AT-A-C------TGAC-T-GTCAGAATT----CTG-A---CTGC--TC-----TAGAGA-----AG----AG-CTG-T-TCTAa
gi|78799                      :                                                                                                 T--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G-----T-T-T-----------AC--GA-CTA-GC--TGG-A-A---T-A--------------------AGA------A-----------T--C-T-G------------CTG-gattagaatcattgcatgatgaatatatat
gi|78801                      :                                                                                                  --GC--TC-----------TAGA---A--C--A-----T--A--T-T-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT----------------------------T-GGA------AT-GAA------T--C----------------CTG-AGTTCTGC--TC-----TAGAA------AG----AG-CTGTT-TCTAttatgggcaagaattctgactgctctaataaaagacctg
gi|78802                      :                                                                                                     C--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------CA-T-AGA------AC-AGC------T--C-T-T------------CTG-A---CTGT--TA-----T----------GG----AA-CAA-C-TCTAgatagtagaatcatgatgataatacatgtatat
gi|78803                      :                                                                                                      --TC-----------TAAA---A--C--T-----A--T--T-C-T-----------ACCCGA--T--GC--TCT-GGAG-------------------------AGA------A-----------T--C-T-GA-----------CTG-T---CTGC--TC-----T----------AGAAATAG-CTG-T-TCTAtgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78804                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCCA--C-GA--CT--GT--TCCGAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GA--TCC-A-AG-TT-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AA-CTG-T-TCTAgattagaatcgttgatcataaatactatgt
gi|78804                      :                                                    ACAGCTCT--GCTGACTGCTCTAGAACTG--TTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TGGA---A--cgactgctctggaatagaatc
gi|78805                      : tagaacagctccacgactgttccgagttcacttagaacagctctatgactgatccaagttcacttaga----TAGAACAG--CACTA--C-GA--CT--GT--TCAGAGTTAACT-TAGA---A--C--A-----G--C--G-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-GG-TT-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTtagaatc
gi|78806                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TACA---A--TA-T-----AT-T--T-C-T---------------GA-CT--GC--TCT-G-GG-T---------------------C-AGA------A-----------T--C----------------CTT-A---CTGC--TC-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTAggaatagaatcat
gi|78807                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TGGA---A--TA-TA----A--T--T-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-AG-TT-Agattagaatcattgcatgataagtgtatat
gi|78808                      :                                                                                      TA--C-GA--CTTGGC--TC-----------TAGA---A--T--A-----G--A--T-C-C-----------CT--GA-CT--GT--TCT-G-GG-T------------------C--C-AGA------AT-CGA------T----T-G------------TTT-A---GTG----T-----G----------AG----GG-CTG-C-TTTgaatcctaacaggcccagaacag


blockSeqs                     :                                                              GTT    GCTCT     T ATT    GC T  GG          CACGTTCGTTT    TTC    TTGACA   AAT       GGAATAGAATCAT       GC       GG     AGAATCCTGGCCTGGCTGTTATTCTGGGTCAGGAATTT                               GTT    GT  TAGAA GCACTAGAGA  AAAT  A   T T
blockSeqs                     :                                                              GCT    GCTCT     A C      .  T  A           CAAGTTCACT     G      ATC      AAT       TAAT                A        GG     CGAACAGAATCCTGACTGTTCCGGGTCAGAATC                                    G      .   .     AGGAAA      .     A   . .
blockSeqs                     :                                                              GTT    C         T C      .  T  .           CAAGTTAACT     .      ATA      AAT       GCTG                .        GG     TAGAATCCTGGCTGTTTCTGGGTCAGAATTT                                      G      .   .     AGGAAA      .     C   . .
blockSeqs                     :                                                              GTT    T         A T      .  T  .           CACGTTCGCT     .      AT       AAT       ACCC                .        A      AATAGAATACTGACTGTCAGAATT                                             C      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              GTT    T         A C      .  T  .           CAAGTTCACT     .      AT       CAA       CAT                 .        G      TAAATTAGAACAAATTTCG                                                  .      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              GTT    T         T T      .  .  .           CGAGTTCACT     .      T        CC        ACT                 .        A      TCGTTTTAGAACAGGTCCA                                                  .      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              GTT    T         A C      .  .  .           AGAGTTAACT     .      T        TT        GCA                 .        G      TAACTTAGAACAGCTCCTG                                                  .      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              GCT    T         A C      .  .  .           .              .      T        T         AC                  .        G      TCACTTAGAACAGCTATA                                                   .      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              TT     T         A T      .  .  .           .              .      T        A         AC                  .        A      GAAAAAGAGCTGGTTCTG                                                   .      .   .     AGAGA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              GT     T         A C      .  .  .           .              .      T        C         AC                  .        G      TAACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     AGAAA       .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              A      T         A C      .  .  .           .              .      T        C         AC                  .        G      CACTTTAGAACAGCCCTG                                                   .      .   .     TAAA        .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              .      T         A G      .  .  .           .              .      T        T         AC                  .        A      TAACTCAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     AGAA        .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              .      T         T C      .  .  .           .              .      A        C         AC                  .        A      TAACTTAAAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              .      T         T G      .  .  .           .              .      T        T         AC                  .        A      TAACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              .      T         T C      .  .  .           .              .      A        C         AC                  .        A      TAACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                              .      T         A T      .  .  .           .              .      A        T         GC                  .        A      TCACTTAGAACAGGTCCA                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         A T      .  .  .           .              .      A        T         GC                  .        G      TAACTTAGAACAGGTCCA                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         A T      .  .  .           .              .      T        C         AT                  .        A      TCGCTTAGAACAGGTCCA                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         T T      .  .  .           .              .      T        C         AG                  .        A      TAACTTGAACAGCTTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         A T      .  .  .           .              .      T        C         AT                  .        A      CCACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         A C      .  .  .           .              .      T        C         AC                  .        A      TAACTTAGAACAGTTCAG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     T         A T      .  .  .           .              .      T        C         AT                  .        A      TAACATAGAACAGCTCTT                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     .         . C      .  .  .           .              .      T        T         AC                  .        A      TCACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     .         . C      .  .  .           .              .      T        T         GC                  .        A      TCACTTAGAACAGCTCTG                                                   .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     .         . C      .  .  .           .              .      T        T         AC                  .        A      TAACTAGAACAGCTCTG                                                    .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                     .         . .      .  .  .           .              .      T        T         AT                  .        A      TAACTAGAACAGCTCTG                                                    .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                               . .      .  .  .           .              .      T        T         GT                  .        A      TAACTAAAGCAGTCATA                                                    .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                        .  .  .           .              .      A        C         AT                  .        A      TAACTTGGAGCAGTCAG                                                    .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                           .  .           .              .      T        C         GT                  .        A      TCGCTAGAACAGGTCCA                                                    .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         AC                  .        A      TCACTTGACAGCTCTA                                                     .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         AC                  .        A      TAACTTAGAGCGGTCG                                                     .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         AT                  .        A      CCAGAATCGATTG                                                        .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        G         AT                  .        A      TCTAGAACAGA                                                          .      .   .     .           .     .   . .
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        G         AC                  .        A      TGGAATGAATC                                                          .      .   .     .           .     .      
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         AC                  .        A      AATAGAATCT                                                           .      .   .     .           .     .      
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         AC                  .        G      TAAGAATCTG                                                           .      .   .     .           .     .      
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        G         AT                  .        G      AATAGAATC                                                            .      .   .     .           .            
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        G         AC                  .        G      AATAGAATC                                                            .      .   .     .           .            
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         AG                  .        G      AATATAATC                                                            .      .   .     .           .            
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        G         AA                  .        A      AGAATCTGA                                                            .      .   .     .           .            
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         AC                  .        A      CAGAATCC                                                             .      .   .     .           .            
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         AC                  .        A      CAGAATC                                                              .      .   .     .                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        T         AC                  .        A      TAGAATC                                                              .      .   .     .                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         AT                  .        A      CAGAATC                                                              .      .   .     .                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        T         AC                  .        A      CAGAATT                                                              .      .   .     .                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      C        A         CT                  .        A      CATAATC                                                              .      .   .     .                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         C                   .        A      CAGAATC                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        T         A                   .        G      GTTCTG                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        C         A                   .        G                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      A        C         T                   .        G                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                              .           .              .      T        T         .                   .        .                                                                                                                     
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78809 ): ATCCTGACTGTTCCGCTCTAGAAAAGAGCTGCCCTAAATAAGAATCATTGCATGATAAAATACA
Unaligned ( gi|78800 ): TGCGTCGAGAATAGGTCTGACGATGTTTTCTGGAAATAGAATCCTGACTGTTCGCTCTTTTAAGAAAAGAGTGATTTCATTGCATGATAAATACATGT






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Reference ( family-441 )      :                                                    ACTGCTCTAGGTTAACT----TAGAACAG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
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gi|78778                      :                                                                TAACT----TGGAGCAG--TCATA----GA------GCAGTT-----------TAGA---G--CATC-----G--C------------------AG--AG-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--T-AAA------GC-AGT------C--A-T-A--------------G-AG--CAGT--TC-----T----------AG----AG-Ctgactgctccaagtta
gi|78778                      :                                                 actACTGCTTTAG-TTAACT----TAGAACAG--CTCTG--C-GA---T--GC--TC-----------TA-A---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-A
gi|78779                      :                                                                       actgctctagaactgctctatgA--CT--GC--T------------TAGA---A--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------C--T-TG-------AC-AGC------T--C-T-A--------------G-A---CTGC--TC-----C-----------G----AG-TCA-C-TTTA
gi|78779                      :                                                                   CT----TAGAACTG--CTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------CAAGTTCA--C--TTGACAG--C--T-C-T-----------A---GA-CT--GC--TCC-G-AG-TC--A--------------CTTT-AGA------AC-AGC------C--C-T-G------------CTA-------GC--TC-----T----------AG----Agaacagccctgctagctctagaa
gi|78780                      :                                                                                         actgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-CAT-----------AT---A-CT--GC--TCT-A-AG-TTAAA--------------T--T-AGA------AC-AAA------T--T-TCG------------ATG-A---CTGC---C-----T----------AG----AGACTG-T-TCTa
gi|78780                      :                                                    ACTGCTCTAAGTTAAAT----TAGAACAAATTTCGA--T-GA--CT--GC---C-----------TAGAG--A--C--T-----G--T--T-C-TC----------AT--GG-CTGCGC--TCT-A-A-----AA-----------------T-ATA------A-----------T--C----------------CTA-A---CTGC--TC-----TTAAA------AG----AGACTG-C-TTTAcatggctgcgctctaaaatataatcctaactgctcttaaaagagactgctttagattagaatcattgcataa
gi|78781                      :                                                                       actgctctagaactgttcatatA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCgattagaatcattgcataa
gi|78782                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------GC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------C--TCAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----Agagaatggaattttga
gi|78783                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-CG-TT-AA--------------CT-T-AAA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---TTTC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTAataatgcctgtttgattcaccagaccagggaataattgc
gi|78784                      :                                                    ACTGCTCTAAGT-AACT----TAGAGCAG--TTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-T-----------AT--GA-CT--G-------------------------------------------------GT------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTA
gi|78785                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------ACT-GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-
gi|78785                      :                                                                    T----TGGAGCAG---TC-A--C-GAGGCA--GC--TC-----------TAGA---G--C--A-----G-----T-C-A-----------GCA-GAGCT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-GGA------GC-AG-------T--C-A-G-------------TG-AG--CAGC--TC-----T----------AG----AG-Cctcgtgactgctccaaa
gi|78785                      :                                                 actACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--C-T-C-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-Aa
gi|78786                      :                                                                       actgctctagagctgctcactgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTa
gi|78787                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------GT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------A
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CGTT------------T--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgttttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78787                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTCACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGTTTTAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78788                      :                                                                       actgctctagagctgctctgtgA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-------------AT--GA-CT--GC--TC--A-AG-TT-AA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--CCT-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AGCCTA-C-TCT
gi|78789                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----C----------Agtgactgctcca
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCCA--T-GA--CT--GC--TCCAAGTTAACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-CG-TT-CG--------------CT-T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------Acgttcgcttagaacaggtccacgactgctcta
gi|78789                      :                                                    ACTGCTCCAAGTTAACT----TAGAACAG--GTCCA--C-GA--CT--GC--TCCACGTTCGCT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-
gi|78790                      :                                                                       actgctctagagctgctccatgA--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--C--T-T-TTA---------AT--GA-CT--GC--TCT-A-AATTT-AA--------------C--T-TGA------AC-AGCT-----T--C-T-G------------CTG-AC--CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-CTTCTA
gi|78791                      :                                                    ACTGCTCTAG---AGCT-----------G--CTCTG--T-GA--CC--GC--TCCAAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--G--T-C-C-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-AG-TT-CG--------------C--T-AGA------AC-AGG------T--C-C-A------------C-G-A---CTGC--TC-----T----------A
gi|78792                      :                                                                                             A--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-C-----------AT--GA-CT--GC--TCC-A-GT-TC-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCT
gi|78793                      :                                                                    T----TAAAACTG--TTCTA--C--A--CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C----------------CTG-A---CTGC--TC-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTA
gi|78794                      :                                                                       ctgctAACTG--TTCTA--C-AAA-CT--GC--TC-----------TAGA---A--T--A-----GAAT--C-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-GG-TC-A---------------------GA------A-----------T--C-C--------------CTG-A---CTGC--TCTAGAAT----------AG----AG-CTG-T-TCTAgattagaatcattggatgata
gi|78795                      :                                                                                    ctgcttt-GA--CT--GC--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-TGGAATAGAATCAT--GA-CT--GT--TCT-G-GG-T---------------------C-AGA------A----------------T-T------------CTG-A---CTGC--TA-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTAgattaaatcattggatgata
gi|78796                      :                                                                ctgct----TAGAACTG--TTCTA--C-GA--CT--GT--TC-----------TAGA---A-----T-----A--CAAT-C-C------------T--GA-TT--GT--TCT-G-GG-TC-A------------------T-AA-------------------T--C----------------CTG-A---CTGC--TT-----T----------AG----Agattagaatcattgcatgataaatatatat
gi|78797                      :                                                                                        ctgttc--CT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-T-----------AC--GA-CC--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------AC-AGT------T--C-A-G------------CCG-A---CGGC--TC-----T----------CG----AG-CTG-C-TCTAaaagatatgatcgataatagaattattgcatgactgctctataaatatat
gi|78797                      :                                                               TTAACT----TAGGGCAG--TTCTA--G-AG--CA--GC--TC-----------GAGA---G--C--C-----G-----T-C-G-----------GCTGAA-CT--GT--TCT-A-AG-TT-AA--------------CT-T-AGA------GC-GG-------T--C---G------------TAGAA---CAGT--TC-----T----------AG----AG-Cgaactgccctaagttaaa
gi|78797                      :                                                  ctACCGCTCTAAGTTAACT----TAGAACAG--TTC-AGCC-GA--CG--GC--TC-----------TCGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------AG--AA-CT--GC--CCT-A-AG-TT-AA--------------a
gi|78798                      :                                                                            ctgctctagaactgttctacgT--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G--T--T-C-C-----------AA--GA-CT--GC--TCT-A-G-----AA-----------------T-AGA------AT-A-C------TGAC-T-GTCAGAATT----CTG-A---CTGC--TC-----TAGAGA-----AG----AG-CTG-T-TCTAa
gi|78799                      :                                                                                                 T--GC--TC-----------TAGA---A--C--T-----G-----T-T-T-----------AC--GA-CTA-GC--TGG-A-A---T-A--------------------AGA------A-----------T--C-T-G------------CTG-gattagaatcattgcatgatgaatatatat
gi|78801                      :                                                                                                  --GC--TC-----------TAGA---A--C--A-----T--A--T-T-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT----------------------------T-GGA------AT-GAA------T--C----------------CTG-AGTTCTGC--TC-----TAGAA------AG----AG-CTGTT-TCTAttatgggcaagaattctgactgctctaataaaagacctg
gi|78802                      :                                                                                                     C--TC-----------TAGA---G--C--T-----G--C--T-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCT-A-AG-TT-AA--------------CA-T-AGA------AC-AGC------T--C-T-T------------CTG-A---CTGT--TA-----T----------GG----AA-CAA-C-TCTAgatagtagaatcatgatgataatacatgtatat
gi|78803                      :                                                                                                      --TC-----------TAAA---A--C--T-----A--T--T-C-T-----------ACCCGA--T--GC--TCT-GGAG-------------------------AGA------A-----------T--C-T-GA-----------CTG-T---CTGC--TC-----T----------AGAAATAG-CTG-T-TCTAtgactcctttatgaccgctttaagtttgctctaaatta
gi|78804                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCCA--C-GA--CT--GT--TCCGAGTTCACT-TAGA---A--C--A-----G--C--T-C-T-----------AT--GA-CT--GA--TCC-A-AG-TT-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AA-CTG-T-TCTAgattagaatcgttgatcataaatactatgt
gi|78804                      :                                                    ACAGCTCT--GCTGACTGCTCTAGAACTG--TTCTA--C-GA--CT--GC--TC-----------TGGA---A--cgactgctctggaatagaatc
gi|78805                      : tagaacagctccacgactgttccgagttcacttagaacagctctatgactgatccaagttcacttaga----TAGAACAG--CACTA--C-GA--CT--GT--TCAGAGTTAACT-TAGA---A--C--A-----G--C--G-C-T-----------AC--GA-CT--GC--TCC-A-GG-TT-CA--------------C--TTAGA------AC-AGC------T--C-T-G------------CTG-A---CTGC--TC-----T----------AG----AG-CTG-C-TCTtagaatc
gi|78806                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TACA---A--TA-T-----AT-T--T-C-T---------------GA-CT--GC--TCT-G-GG-T---------------------C-AGA------A-----------T--C----------------CTT-A---CTGC--TC-----TAGAAA-----AG----AG-CTG-T-TCTAggaatagaatcat
gi|78807                      :                                                                     ----TAGAACAG--CTCTG--CTGA--CT--GC--TC-----------TGGA---A--TA-TA----A--T--T-C-T---------------GA-CT--GT--TCT-G-AG-TT-Agattagaatcattgcatgataagtgtatat
gi|78808                      :                                                                                      TA--C-GA--CTTGGC--TC-----------TAGA---A--T--A-----G--A--T-C-C-----------CT--GA-CT--GT--TCT-G-GG-T------------------C--C-AGA------AT-CGA------T----T-G------------TTT-A---GTG----T-----G----------AG----GG-CTG-C-TTTgaatcctaacaggcccagaacag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78809 ): ATCCTGACTGTTCCGCTCTAGAAAAGAGCTGCCCTAAATAAGAATCATTGCATGATAAAATACA
Unaligned ( gi|78800 ): TGCGTCGAGAATAGGTCTGACGATGTTTTCTGGAAATAGAATCCTGACTGTTCGCTCTTTTAAGAAAAGAGTGATTTCATTGCATGATAAATACATGT