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lowQualScore                  :     .   . . .  . .. ... .... .  . . ...... .... . .. .  . .. ..  ... .. ..   . .. .  .. ... . ..  ....   .  .. . . . . .  . . . ... . .     
lowQualScore                  :     0   0 0 0  9 33 555 5555 9  9 9 000000 7777 9 33 9  9 22 99  555 22 00   9 22 9  22 555 8 22  7777   9  33 9 0 9 9 1  1 1 1 999 1 1     
consensus                     : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-C--GG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
Reference ( gi|80647 )        : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T--GG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--G-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80654                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T--TG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-A--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80653                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T--TG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-A--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80664                      : GGGT-ATC-A-GTAA-T--A---T----G-CC-A-T--GA--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TCGAT
gi|80649                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-C--AG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACT-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TCA-AC--T-A-C-T-C-GT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80651                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-TC-A-T--AC--A-T--T-T--T-CA-A--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AG--A-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80652                      : GGGT-ATC-A-A-AA-C--A---T----G-TC-A-T--AA--A-T--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-A--AA--A-TCA-GC--T-A-T-T-G-AT-
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gi|80668                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-T--GA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TCA-GT--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTCAT
gi|80676                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T--GA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-G---C--G-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A-----T-TTGAT
gi|80669                      :  GAT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T---A--A-A--TGT--T-TA-G--A--TG---T--C--ATG-C--T-TA--A---T-G--AA--G-TCA-AC--T-A-C-A-A-AT-A-C-A---T-A-TTGAT
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gi|80677                      :  GGT-GTC-T-A-AA-C--A---T----T-TC-A-T--CA--T-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-A--AA--
gi|80680                      :   GT-GCC-A-G-AAAT--AAAAT----G-CC-A-T--GA--A------T--T-CA-G--AA-TA---T--CT-ACA-G--C-TA--A---T-G--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGATa
gi|80681                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-A-T--CA--T-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TTA-GC--T-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80679                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-A-T--C---A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TTA-GC--T-A-C-T-A-TT-A-C-A---T-T-
gi|80678                      :   GT-ATC-A-G-AA-T--G---T----G-TC-A-T--CA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TT--A---T-A--AA--A-TTA-AC--G-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80682                      :   GT-CTC-C-G-AA-T--T---T----G-TC-A-T--CA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TTA-GC--G-A-C-T-
gi|80683                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-T--AA--A-T--T-T--T-CA-G--AACTA---T--C--ACG-C--T-TATGA-----G--AA--T-TAA-GG--T-A-C-T---AT-A-CAA---T-T-TTGAT
gi|80684                      :    T-GTC-A-G-AA-T--G---T----G-CC-A-T------A-A--T-T--T-TA-G--AT-TA---T--C--ACG-T--T-AA--A---T-G--AATGA-TCA-GT--A-A-CAT-A-GT-A-C-GT--T-T-TTGAT
gi|80685                      :     -GCC-A-G-AA-A--A---TCATTG-CC-A-T--GG--A-A--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--A-TCATGC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTG
gi|80686                      :     -GCC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-T--GG--A-A--T-T--T-CA----A--TA---TGCT--ACATC--T-TA--A---T-A--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-A-CT-A-C-A---T-T-TTGA
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gi|80688                      :       TC-A-G-AA-A--A---T----G-CC-A-T--CG--A-T--T-T--T-TA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-AA--AAATT-G--AA--A-TCA-GC--T-A-C-T-
gi|80689                      :               A-T--A---T----A-CC-A-C--CA--A-T--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---G-G--AA--A-TCA-GC--C-A-T-T-
gi|80690                      :                -T--A---T----G-CC-A-T--GG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA--G---T-G--AA--A-TCA-GC--C-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80691                      :                                                           --A--TA---T--C--ACG-C--T-TA--A---T-G--AA--G-TCA-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT





Alignments
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lowQualScore                  :     .   . . .  . .. ... .... .  . ...... .... . .. .  . .. ..  ... .. ..   . .. .  . ... . .. . .. .  . .  .. . . . . .  . . . ... . .     
lowQualScore                  :     0   9 9 9  9 22 444 4444 9  9 999999 4444 9 22 9  9 22 88  444 11 99   9 22 9  9 444 9 22 9 22 7  9 8  22 9 9 9 9 0  0 1 0 888 1 1     
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Reference ( family-439 )      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80647                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80648                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-C----CGGTCA-A--G-T--T-TA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80654                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TTG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80656                      : GGTT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-AC-A-TGG--ATA--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-AC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-
gi|80657                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-ATCGGA-A-A--T-T--T-CA-G--AT-TA---TG-C--ACG----T-TA-A---T-G--A-A--ACTC-A-GC--TAA-C-T---AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80658                      : GGGT-GTCGA-G-AA-T--AG--T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--TTCA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TAGA---T-G----A--A-TC-A-GC--T-A-C-TAA-ATGA-C-A---TGT-TTG
gi|80659                      : GGGT-GTC-AAG-AA-T--A---T----G-CCCA-CGT--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--CC-ACG-C--TCTG-A---T-G--A-A--AATC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-----T-T-TTGAT
gi|80660                      : GGGTCGTC-A-G-AA-TGCA---T----G-CC-A-CGG--A-AA-T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--AAG-C--T-TA-A---TAG--A-A--T-TC-A-GCTAT-A-C-TAA-AT-A-C-A---T-TATTGAT
gi|80661                      : GGGT-GTC-A-GGAA-T--A---T----G-CG-A-CGG--A-ATTT-T--T-CA-GGAA--TA---T--C--ACG-CCTT-TC-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-AGC-T-A-CT-A-C-A---T-G-TT
gi|80662                      : GGGT-GTT-C-A-AA-T--A---TT---G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG----T-TA-AT--T-G--A-A--G-AT-A-GC--T-A-C-T---AT-ATC-A---T-T-TTGAT
gi|80663                      : GGTT-GTC-ACG-AA-T--AA--T----G-CG-AGCGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TAATGC--T--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-AGGC--TGA-C-T-A-AT-A---A-----T-TTGAT
gi|80664                      : GGGT-ATC-A-GTAA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TCGAT
gi|80665                      : GGGT-ATC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-T--A-GC----A-C-T-A-AT-A-C-A---T-TATTGAT
gi|80666                      : GGGT-ATC-A-T-AA-T--A---T----G-CC-A-CCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-GA-A---G-A--A-A--A-TA-A-GC--T-A-C-T-T-AT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80667                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-ATG--G-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T----A-A--A-TC-G-GA--T-A-C-T-G-ATCA-C-A---C-A-TTGA
gi|80668                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TGA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GT--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTCAT
gi|80669                      :  GAT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T-A--A-A--TGT--T-TA-G--A--TG---T--C--ATG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-AC--T-A-C-A-A-AT-A-C-A---T-A-TTGAT
gi|80670                      :  GGT-GTC-G-G-AA-C--A---T----T-TC-A-TCA--T-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-T-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-C---T-T-TTG
gi|80671                      :  GGT-GTC-C---AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--ATA--T-T--T-CA-G--A--TA---T--CCTACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-GTAA-C-ATGTT-C-TTGAT
gi|80672                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----GCCC-A-CGA--A-AAGT-TTGT-CA-G--AC-TA---T--CG-ACG-C--T-TA-A---T-GATA-A--A-TC-A-GC--T-A-C-G-A-GT-ATC-A---TGT-TTGAT
gi|80673                      :  GGT-GTCTA-G-AA-T--A---TAAT-G-CC-AGCG-----A--T-A--T-CAAG--A--TAG--T--C--ACG-C--T-CA-A---T-T--A-A--AGTC-A-GCG-T-A-TAT-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80674                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G----A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-ACAT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80675                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A----------CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-AT--T-T-TTGAT
gi|80676                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G----C--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A-----T-TTGAT
gi|80677                      :  GGT-GTC-T-A-AA-C--A---T----T-TC-A-TCA--T-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-
gi|80678                      :   GT-ATC-A-G-AA-T--G---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TT-A---T-A--A-A--A-TT-A-AC--G-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80679                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-ATC----A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-TT-A-C-A---T-T-
gi|80680                      :   GT-GCC-A-G-AAAT--AAAAT----G-CC-A-TGA--A------T--T-CA-G--AA-TA---T--CT-ACA-G--C-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80681                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-A-TCA--T-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80682                      :   GT-CTC-C-G-AA-T--T---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--G-A-C-T-
gi|80683                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TAA--A-T--T-T--T-CA-G--AACTA---T--C--ACG-C--T-T--A---T-G--AGA--A-TTAA-GG--T-A-C-T---AT-A-CAA---T-T-TTGAT
gi|80684                      :    T-GTC-A-G-AA-T--G---T----G-CC-A-T----A-A--T-T--T-TA-G--AT-TA---T--C--ACG-T--T-AA-A---T-G--A-ATGA-TC-A-GT--A-A-CAT-A-GT-A-C-GT--T-T-TTGAT
gi|80685                      :     -GCC-A-G-AA-A--A---TCATTG-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-ATGC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTG
gi|80686                      :     -GCC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA----A--TA---TGCT--ACATC--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-CT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80687                      :       TC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80688                      :       TC-A-G-AA-A--A---T----G-CC-A-TCG--A-T--T-T--T-TA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-AA-AAATT-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-
gi|80689                      :               A-T--A---T----A-CC-A-CCA--A-T--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---G-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-T-T-
gi|80690                      :                -T--A---T----G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-G---T-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80691                      :                                                         --A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT





Alignments
lowQualScore                  :     1   1 1 1  0 11 333 4444 0  0 888888 4444 0 11 0  0 11 44  222 22 33   0 11 0  0 222 0 11 0 11 2  0 1  22 1 0 1 1 1  3 2 1 333 2 2     
lowQualScore                  :     .   . . .  . .. ... .... .  . ...... .... . .. .  . .. ..  ... .. ..   . .. .  . ... . .. . .. .  . .  .. . . . . .  . . . ... . .     
lowQualScore                  :     0   9 9 9  9 22 444 4444 9  9 999999 4444 9 22 9  9 22 88  444 11 99   9 22 9  9 444 9 22 9 22 7  9 8  22 9 9 9 9 0  0 1 0 888 1 1     
consensus                     : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
Reference ( family-439 )      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80647                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80648                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-C----CGGTCA-A--G-T--T-TA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80649                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CAG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACT-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-AC--T-A-C-T-C-GT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80650                      : GGGT-GTC-T-G-CA-T--A---T----G-CC-A-CAA--A-A--T-T--T-CA-G--A--CA---T--C--ACG-A--T-TA-A---T-A--T-C--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80651                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-TC-A-TAC--A-T--T-T--T-CA-A--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-G--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80652                      : GGGT-ATC-A-A-AA-C--A---T----G-TC-A-TAA--A-T--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-T-T-G-AT-
gi|80653                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TTG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80654                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TTG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80655                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CCA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-G
gi|80656                      : GGTT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-AC-A-TGG--ATA--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-AC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-
gi|80657                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-ATCGGA-A-A--T-T--T-CA-G--AT-TA---TG-C--ACG----T-TA-A---T-G--A-A--ACTC-A-GC--TAA-C-T---AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80658                      : GGGT-GTCGA-G-AA-T--AG--T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--TTCA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TAGA---T-G----A--A-TC-A-GC--T-A-C-TAA-ATGA-C-A---TGT-TTG
gi|80659                      : GGGT-GTC-AAG-AA-T--A---T----G-CCCA-CGT--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--CC-ACG-C--TCTG-A---T-G--A-A--AATC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-----T-T-TTGAT
gi|80660                      : GGGTCGTC-A-G-AA-TGCA---T----G-CC-A-CGG--A-AA-T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--AAG-C--T-TA-A---TAG--A-A--T-TC-A-GCTAT-A-C-TAA-AT-A-C-A---T-TATTGAT
gi|80661                      : GGGT-GTC-A-GGAA-T--A---T----G-CG-A-CGG--A-ATTT-T--T-CA-GGAA--TA---T--C--ACG-CCTT-TC-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-AGC-T-A-CT-A-C-A---T-G-TT
gi|80662                      : GGGT-GTT-C-A-AA-T--A---TT---G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG----T-TA-AT--T-G--A-A--G-AT-A-GC--T-A-C-T---AT-ATC-A---T-T-TTGAT
gi|80663                      : GGTT-GTC-ACG-AA-T--AA--T----G-CG-AGCGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TAATGC--T--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-AGGC--TGA-C-T-A-AT-A---A-----T-TTGAT
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gi|80666                      : GGGT-ATC-A-T-AA-T--A---T----G-CC-A-CCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-GA-A---G-A--A-A--A-TA-A-GC--T-A-C-T-T-AT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80667                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-ATG--G-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T----A-A--A-TC-G-GA--T-A-C-T-G-ATCA-C-A---C-A-TTGA
gi|80668                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TGA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GT--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTCAT
gi|80669                      :  GAT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T-A--A-A--TGT--T-TA-G--A--TG---T--C--ATG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-AC--T-A-C-A-A-AT-A-C-A---T-A-TTGAT
gi|80670                      :  GGT-GTC-G-G-AA-C--A---T----T-TC-A-TCA--T-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-T-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-C---T-T-TTG
gi|80671                      :  GGT-GTC-C---AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--ATA--T-T--T-CA-G--A--TA---T--CCTACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-GTAA-C-ATGTT-C-TTGAT
gi|80672                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----GCCC-A-CGA--A-AAGT-TTGT-CA-G--AC-TA---T--CG-ACG-C--T-TA-A---T-GATA-A--A-TC-A-GC--T-A-C-G-A-GT-ATC-A---TGT-TTGAT
gi|80673                      :  GGT-GTCTA-G-AA-T--A---TAAT-G-CC-AGCG-----A--T-A--T-CAAG--A--TAG--T--C--ACG-C--T-CA-A---T-T--A-A--AGTC-A-GCG-T-A-TAT-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80674                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G----A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-ACAT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80675                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A----------CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-AT--T-T-TTGAT
gi|80676                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G----C--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A-----T-TTGAT
gi|80677                      :  GGT-GTC-T-A-AA-C--A---T----T-TC-A-TCA--T-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-
gi|80678                      :   GT-ATC-A-G-AA-T--G---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TT-A---T-A--A-A--A-TT-A-AC--G-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80679                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-ATC----A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-TT-A-C-A---T-T-
gi|80680                      :   GT-GCC-A-G-AAAT--AAAAT----G-CC-A-TGA--A------T--T-CA-G--AA-TA---T--CT-ACA-G--C-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80681                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-A-TCA--T-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80682                      :   GT-CTC-C-G-AA-T--T---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--G-A-C-T-
gi|80683                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TAA--A-T--T-T--T-CA-G--AACTA---T--C--ACG-C--T-T--A---T-G--AGA--A-TTAA-GG--T-A-C-T---AT-A-CAA---T-T-TTGAT
gi|80684                      :    T-GTC-A-G-AA-T--G---T----G-CC-A-T----A-A--T-T--T-TA-G--AT-TA---T--C--ACG-T--T-AA-A---T-G--A-ATGA-TC-A-GT--A-A-CAT-A-GT-A-C-GT--T-T-TTGAT
gi|80685                      :     -GCC-A-G-AA-A--A---TCATTG-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-ATGC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTG
gi|80686                      :     -GCC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA----A--TA---TGCT--ACATC--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-CT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80687                      :       TC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80688                      :       TC-A-G-AA-A--A---T----G-CC-A-TCG--A-T--T-T--T-TA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-AA-AAATT-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-
gi|80689                      :               A-T--A---T----A-CC-A-CCA--A-T--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---G-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-T-T-
gi|80690                      :                -T--A---T----G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-G---T-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80691                      :                                                         --A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT


blockSeqs                     :     C   G A G    GC AAA CATT      CGGTC  ATT    TG      GA AC  ATG GC CT     CT      AAT   AT   TG C    G  TA A   A A C  G T A TGT G A
blockSeqs                     :     .   T C T    .  G   AAT       TCGGA  AAG    .       .  T   G   G  C      .       T     .    .  A    T  G  G   A A .  C T . T   G A
blockSeqs                     :     .   . . .    .  A   T         GCGG   TA     .       .  C   .   .  G      .       .     .    .  G    .  .  .   . . .  A . . T   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CAG    AA     .       .  A   .   .  T      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CAA    TA     .       .  T   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TAC    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TAA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TTG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TTG    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CCA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGT    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CCA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         ATG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         GCG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TAA    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGG    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CGG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         TCG    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  . . . .   . .
blockSeqs                     :     .   . . .    .  .   .         CCA    A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . . .  .            
blockSeqs                     :         . . .    .  .   .         TGG    T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . .                 
blockSeqs                     :         . . .    .  .   .         TA     T      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . .                 
blockSeqs                     :                  .  .   .         TC     A      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .  .  .   . .                 
blockSeqs                     :                  .  .   .         T      .      .       .  .   .   .  .      .       .     .    .  .    .                             
blockSeqs                     :                                                         .  .   .   .  .      .       .     .    .  .                                  


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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Alignments
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lowQualScore                  :     .   . . .  . .. ... .... .  . ...... .... . .. .  . .. ..  ... .. ..   . .. .  . ... . .. . .. .  . .  .. . . . . .  . . . ... . .     
lowQualScore                  :     0   9 9 9  9 22 444 4444 9  9 999999 4444 9 22 9  9 22 88  444 11 99   9 22 9  9 444 9 22 9 22 7  9 8  22 9 9 9 9 0  0 1 0 888 1 1     
consensus                     : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
Reference ( family-439 )      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80648                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-C----CGGTCA-A--G-T--T-TA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80649                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CAG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACT-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-AC--T-A-C-T-C-GT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80650                      : GGGT-GTC-T-G-CA-T--A---T----G-CC-A-CAA--A-A--T-T--T-CA-G--A--CA---T--C--ACG-A--T-TA-A---T-A--T-C--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80651                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-TC-A-TAC--A-T--T-T--T-CA-A--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-G--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80653                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TTG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80654                      : GAGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TTG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80655                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CCA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-G
gi|80656                      : GGTT-GTC-A-G-AA-T--A---T----A-AC-A-TGG--ATA--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-AC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-
gi|80657                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-ATCGGA-A-A--T-T--T-CA-G--AT-TA---TG-C--ACG----T-TA-A---T-G--A-A--ACTC-A-GC--TAA-C-T---AT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80660                      : GGGTCGTC-A-G-AA-TGCA---T----G-CC-A-CGG--A-AA-T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--AAG-C--T-TA-A---TAG--A-A--T-TC-A-GCTAT-A-C-TAA-AT-A-C-A---T-TATTGAT
gi|80661                      : GGGT-GTC-A-GGAA-T--A---T----G-CG-A-CGG--A-ATTT-T--T-CA-GGAA--TA---T--C--ACG-CCTT-TC-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-AGC-T-A-CT-A-C-A---T-G-TT
gi|80662                      : GGGT-GTT-C-A-AA-T--A---TT---G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG----T-TA-AT--T-G--A-A--G-AT-A-GC--T-A-C-T---AT-ATC-A---T-T-TTGAT
gi|80663                      : GGTT-GTC-ACG-AA-T--AA--T----G-CG-AGCGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TAATGC--T--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-AGGC--TGA-C-T-A-AT-A---A-----T-TTGAT
gi|80664                      : GGGT-ATC-A-GTAA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TCGAT
gi|80665                      : GGGT-ATC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T----CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-T--A-GC----A-C-T-A-AT-A-C-A---T-TATTGAT
gi|80666                      : GGGT-ATC-A-T-AA-T--A---T----G-CC-A-CCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-GA-A---G-A--A-A--A-TA-A-GC--T-A-C-T-T-AT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80667                      : GGGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-ATG--G-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T----A-A--A-TC-G-GA--T-A-C-T-G-ATCA-C-A---C-A-TTGA
gi|80668                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TGA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GT--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTCAT
gi|80669                      :  GAT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-T-A--A-A--TGT--T-TA-G--A--TG---T--C--ATG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-AC--T-A-C-A-A-AT-A-C-A---T-A-TTGAT
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gi|80671                      :  GGT-GTC-C---AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--ATA--T-T--T-CA-G--A--TA---T--CCTACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-GTAA-C-ATGTT-C-TTGAT
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gi|80674                      :  GGT-GTC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-TGA--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G----A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-ACAT-A-C-A---T-T-TTGAT
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gi|80678                      :   GT-ATC-A-G-AA-T--G---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TT-A---T-A--A-A--A-TT-A-AC--G-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80679                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-ATC----A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-TT-A-C-A---T-T-
gi|80680                      :   GT-GCC-A-G-AAAT--AAAAT----G-CC-A-TGA--A------T--T-CA-G--AA-TA---T--CT-ACA-G--C-TA-A---T-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80681                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---A----G-TC-A-TCA--T-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--T-A-C-T-A-GT-A-C-A---T-T-
gi|80682                      :   GT-CTC-C-G-AA-T--T---T----G-TC-A-TCA--A-T--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TT-A-GC--G-A-C-T-
gi|80683                      :   GT-CTC-A-G-AA-T--A---T----G-TC-A-TAA--A-T--T-T--T-CA-G--AACTA---T--C--ACG-C--T-T--A---T-G--AGA--A-TTAA-GG--T-A-C-T---AT-A-CAA---T-T-TTGAT
gi|80684                      :    T-GTC-A-G-AA-T--G---T----G-CC-A-T----A-A--T-T--T-TA-G--AT-TA---T--C--ACG-T--T-AA-A---T-G--A-ATGA-TC-A-GT--A-A-CAT-A-GT-A-C-GT--T-T-TTGAT
gi|80685                      :     -GCC-A-G-AA-A--A---TCATTG-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-T--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--A-TC-ATGC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTG
gi|80686                      :     -GCC-A-G-AA-T--A---T----G-GC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA----A--TA---TGCT--ACATC--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-CT-A-C-A---T-T-TTGA
gi|80687                      :       TC-A-G-AA-T--A---T----G-CC-A-CGG--G-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-A--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80688                      :       TC-A-G-AA-A--A---T----G-CC-A-TCG--A-T--T-T--T-TA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-AA-AAATT-G--A-A--A-TC-A-GC--T-A-C-T-
gi|80689                      :               A-T--A---T----A-CC-A-CCA--A-T--T-T--C-CA-G--A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---G-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-T-T-
gi|80690                      :                -T--A---T----G-CC-A-TGG--A-A--T-T--T-CA-G--A--TA---T--C--ACA-C--T-TA-G---T-G--A-A--A-TC-A-GC--C-A-C-T-G-AT-A-C-A---T-T-TTGAT
gi|80691                      :                                                         --A--TA---T--C--ACG-C--T-TA-A---T-G--A-A--G-TC-A-GC--T-A-C-T-A-AT-A-C-A---T-T-TTGAT