lowQualScore                  :                                                                                           2222222222222222222222222                                1111               1111111111111111111111                                                   11                                                                                       11111      
lowQualScore                  :         2  2 2  1  11 1 444 1  333  22 7777 1  2  22 2 2 1 2 2222  1 3333333 11 1  1 1 1  5555555555555555555555555 11 2222  33 1  1  11 222 222 0 3333 2 8888888  1  3333333333333333333333      0 3333 0 1  1 33   1 11 33  555   11  1   1  00 1    0  2222  0 2 55 2   1 2 2  444444  22  2  2 1  22 1  111 1 1 1  555 11  3 2 2222 55555      
lowQualScore                  :         .  . .  .  .. . ... .  ...  .. .... .  .  .. . . . . ....  . ....... .. .  . . .  ......................... .. ....  .. .  .  .. ... ... . .... . .......  .  ......................      . .... . .  . ..   . .. ..  ...   ..  .   .  .. .    .  ....  . . .. .   . . .  ......  ..  .  . .  .. .  ... . . .  ... ..  . . .... .....      
lowQualScore                  :         6  4 4  2  66 1 333 1  111  66 2222 0  1  44 1 1 0 1 2222  0 3333333 44 0  0 0 0  3333333333333333333333333 33 0000  22 9  0  33 666 999 9 6666 8 4444444  8  7777777777777777777777      9 5555 9 8  8 11   8 22 11  000   33  9   9  33 9    9  0000  9 8 11 9   0 0 0  888888  77  9  9 0  33 0  888 1 8 1  111 55  3 2 4444 66666      
consensus                     :      TTTCTA-T-CA-AT--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-C--GT-G---N-T----C------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--N-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCN-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TCT-AAT--T--AA-C-C----T----GTTTTTT
Reference ( gi|74493 )        :      TTTTTA-T-CA-AT--T-TT--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-C--GT-G---C-T----C------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--T-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TCT-AAC--T--AA-C-C----T----TTTTTTT
gi|74461                      :      TTTTTG-T-CA-AT--T-TG--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TT-C-T-GC-C--GT-G---C-T----C------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--T-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TAA-T-TTTA-AA----AT-ATT--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CC--T-TC---T-TCT-AAC--T--AA-C-C----T----GTTTATT
gi|74460                      :   taaTTTCTA-C-CA-AT--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TCAGG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-T-GCGC--GT-G-----------------AATA----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA----TT--CA-ATT-TCA---TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-C---T-TC---T-TTT-AAT--T--AA-C-T----TGG--TTTTT
gi|74488                      :   taaTTTCTA-T-CA-AT--T-TT--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T----------C-TC-T-C-GC-T--GT-G---A-A----T------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------AA-TA-------T--------A-----TCTGAA-AA-T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCT-T-TTTA-AA----AT-A-TA-A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-TT--T-TC---T-TTT-AAT--T---A-T-C----T----TGTTTTT
gi|74469                      :     aTTTCTC-T-CA-AT--T-TT--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-G-T-T----TG-T-------T----TC-T-C-GT-T--TT-G---C-T----C------A--A----AT--A-CA-AA--A---T---A-T--T-G-C-------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TCA-AAC--T--AATC-C----T----GTTTTTT
gi|74462                      :   taaTTTCTA-T-CA-AT--T-TC--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC----GA-G---A-T-----------A--A----AT--C-TG-AA------T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------TT-------A-----TCTGAA-A--T-A-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCT-T-TAAA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---T-TTT-AAT--T--AA-T-C----T----GTTCTTT
gi|74490                      :   taaTTTCTA-T-CA-AT--T-TT--G-AT---CG--A--G-A-TC-AA--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GT-T--GT-G---A-T----T------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TATACTAG-T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-GG-A------------CA---TTT--CA-ATT-TCT-T-TTTG-AA----AT-A-C--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-
gi|74464                      :     aTTTCTA-T-CA-AT--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TC-GGG-T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-TTC-GC-T--GA-G---A-TA---T------A--A----ATTGC-TG-AA--A---T---A-T--A-G-CT------GA-TA-------T--------AG----TCTAAA-A--T---A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCT-TCTTTA-AA----AT-A-T--ATCTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TTT-AAT--C--AA-T-C----T----GTTTTTT
gi|74489                      :   taaTTTCTAGT-CA-AT--T-TC--G-AT---CG----------------T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-TTTGT-G---A-A----C------A--A----AT--C-TG-AA------T---A-TA-T-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTC--CA-ATTCTCG-T-TTTA-AA----AT-A-T--AGCTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---A-T-T-AAT--T--AA-C-G----TGA--TTTTT
gi|74474                      :     aTTTCTA-T-AA-AT--T-TT--G-AT---CG--G----A-T---G--T-A---T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-C--GT-G---C-T----C------A--A-----T--C-AG-AA--G---T---A-T--T-G---------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--TCCCA---TTT--CATATT-TTG-T-TTTA-AA----AT---T--ACCTT-G-T--T------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---C-ATT-AAT--T---A-C-C----T----GTTTTTT
gi|74491                      :   taaTTTCTA-T-CG-AT--T-TT--G-AT---TG--G--G-A-TC-AG--T-A-T-T-G----TT-T-------T--C-TT-T-C-G-----AT-T---CAT----C------A--A----AT--C-TA-AA--C---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTAAA-A--T-G-T-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CCA---TTTA-AA----AT-G-T--A-CTT-G-T-CT------AG--CA-TG-T-AA--T-TT---T-GCT-AAC--T--GA-C-A----TGGTGTTTTTT
gi|74466                      :     aTTTCTA-T-CA-TC--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--TTA-C-T-T----TT-T-------T--CGTC-T-C-GC-T--GA-G---A-T-----------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-AG-CATAT--T--C----TTC--TA-ATT--CT-T-TTTT-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CC--TGTC---A-TTT--AT--T--AA-T-C----T----GTTTTTT
gi|74477                      :   taaTTTTTA-T-CA-AT--T-TT--G-AT---CG--G--C-A-TC-AG--T-A-CTT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GA-T--GT-A---A-T----G------A--A----AT--T-TA-AA----------A-T--T-GAC-------AA-TA-------C--------A-----TATGAA-A--T-G-T-CG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-AAT-TCT-C-ATCA-AA----AT-G-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-T
gi|74485                      :   taaTTTCGA-T-CA-AT--T-TC--G-AT---TG--G----A-TC-G---T-A-C-T-T----TT-C-------T--C-TC--------C--G--G---T-T----A------A--AGAAAAT--C-TG-AA------T---A-T--A-G-A-------GA-TA-------T--------A-----TCT-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TAT--CA-ATT-TCG-T-TTTA-AA----AA-A-TA-A-CTT-G-T-CTC-----AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TTT-AAT--T---A-C-C----T----GTTTTTT
gi|74475                      :    aaTTTCTA-TTCA-AT--T-TC--G-AT---CTC-G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GCAG---A-A----T------A--A----AT--CATG-AA--A---T---A------GCC-------GACTAT------T--------AC----TCTGGA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATC-T---T-TTTA-AA----AC-AGTA-A-CTT-GCC-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TTT-AAT--T--AA-T-C----C----TGTTTTT
gi|74476                      :  taatTTTCTA-T-CA-AT--C-----G-AT---CG--G--C-A-TC-GG--T-AGC-TGT----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GA-G---A-A----T------A--A----A---C-TG-AA--A---TTATA-TAGT-A-C-------GA-CA-------T--------A-----TCTGAA-A--AAT-A-A--A--CAT-T--T--CAT--TTT--CA-ATT-TCT-T-TTTA-AAAATGAT-A----A-CTT-G-T-CT------AG--CG-TG-T-CT--G-GC---T-TTT-AAA--TTAAA-T-C----T----GTTTTTT
gi|74479                      :   taaTTTCTA-C-CA-AT--T-GT--C-ATG--CG--G--G-AATC-G---T-A-C-T-T----TTCT-------T--C-TC-T-T-GC----GT-A---C-A----T------A--A----AT--C--G-AA--A---T---T-T--A-G-CTCG----AA-TAA------TCA------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AGTA--CAT-TATT--CA---TTTTCCA-ATTCTCA-T-TTTA-AA----AT-A-TTAA-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T--T--T-TC---T-TAT-AA---T--AA-C-T----TAGG-TTTTTT
gi|74487                      :   taaTTTCTA-T-AA-AT--T-T---G-AT---CT--T--T-A-TC-T---T-A-A-C-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-C--TT-C---C-T----C------A--A----ATT-C-TT-TA--A---T---A-T------C-------TA-TA----------------A-----TCTTTA-A--A-T-A-AT-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA-------A-T--A-CTT-T-T-C-------AA--CA-AT-T-CTTCT-TA---T-TTT-AAC--T--AA-C-C----T----TTTTTTT
gi|74480                      :    aaTTTCTA-T-CA-AT--T-TTC-GCAT---CG--G--C-A-TC-G---T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GA-GA--A-G----A------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------AT-TA-------T--------A-----TCTTGA-A--T-A-ATAG-A--CAC-T--T--CA---TTT--T---TT-TCT-T-CTC--------AT-A-T----CTT-G-T-CT------AA--CG-GGTT-CT--G-TC---A-TTT-AAT--T--AA-T-C----T----TGTTTT
gi|74494                      :   taaTTTTTG-TGCA-AT--T-TC--G-AT---CG--G--G-C-TT-GG--T--------------------------------------------------T----C------A--A----AT--T-AG-AA--A---A---A-T--C-G-C-------AA-TA-------T--------T-----TCTGAA-T--T-T-T-GA-T--TAC-T--T--CA---TTT--CA-GTT-TCT-T-TTTA-AC----AT-A-C--A-TTT-T-T-CC------AA--CA-TA-TCCT--T-TT---T-TCT-AAG--T--GA-C-A----T----GTTCTTTct
gi|74492                      :      TTTCTAAT-CT-AT--TATC--G-ATAGACG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GT-GAATA-T----A------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---G------G-CAAGAACAGA-TATAATAC-T--------A-----CCCGAA-A--C-T-A-AA-G--TAT--------------------------A-T-TTTA-AA----AG-A----A-ATT-G-A-CTG-----AA--AA-TG-T-CT--T-
gi|74483                      :     aTCTCTA-T-CA-TT--T-TT--G-AT---CG--G--GTA-TC-GG--T-AAC-T-T----TT-T-------T--C-TT-T-C-TC-T--G----------------------------AT--T-TG-G----------------T-G-C-------GA-AT-------T--------A-----TTT-AA-A--T-C----G-A--CAT-T--T--CA---
gi|74463                      :    taaTTCTA-T-CA-AT--T-TCACG-AT---CG--GC-G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-TGTTTTTTT--C-TC-T-C-GC-T--GA-G---A-A----T------A--A----AT--C-TGTAA--A---T---A-T--TAG-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-AA-CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCT-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTTGG-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TCAATT-TTT-AAT--T--AA-T-C----T----GTTTTTT
gi|74465                      : taattaTTTTA-T-CA--T--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TCGT-C-GC-T--GA-G---A-A----T------A--A----ATT-C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-A--CATAT--T--C-----TT--CA-ATC-T---T-TTTA-AA-----T-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TTT-AAT--T--AA-T-T----G----TTTTTT
gi|74471                      :    taaTTCTC-T-CA-AA--T-TT--G-AT---CG--G--GCA-TC-GG--T-A-G-T-G----TT-G-------T--T-TC-T-C-GT-C--TTTG---C-T----C------A--A----AT--A-CA-AA--A---T---A-T--T-G-CC------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TCA-AAC--T--AA-CGC----T----TTTT
gi|74470                      :    taaTTCTC-T-CA-AA--T-TT--G-AT---CG--G--GCA-TC-GG--T-A-G-T-G----TT-G-------T--T-TC-T-C-GT-C--TTTG---C-T----C------A--A----AT--A-CA-AA--A---T---A-T--T-G-CC------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TCA-AAC--T--AA-CGC----T----TTTT
gi|74473                      :    taaTTTTA-T-CA-AT--T-TC--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GT-G---A-T----A------T--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------G---A-------T--------A-----TTTGAA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T---A---TTT--C--ATT-TCT-T-TTTT-AA----AT-A-T--A--TT-G-T-CT-------A--C--TG-T-CT--G-TA---T-TTT--AT--G--AA-T-C----T----GTTTTTT
gi|74478                      :    taaTTTCA-T-GA-AT--T-TC--G-AT---CG--G----A-TC-CG--G-A-C-T-T----TT-C-------T--C-TC-T-CCGC-T--GA-G---AAT----A------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----T---AA-A--A-T-A-AG-A---AT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC--T-TTTT-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CGCTG-T-CTG-G-TC---T-TTT--AT--T--AA-T-CGGGGT----TTTTT
gi|74481                      :    taaTTTTA-T-CA-TT--T-TC--G-AT---CG--GGTG-A-TC-GT--A-A-C-TCT----TT-T-------T--C-TC-T-T--C-T--GC-----C-T----CAAAACTA--A----AT--C-TG-AA--C---T---A----T-A-C-------GA-TA-------T--------AT----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CACATTTC--CATATT-TTG-TGTTCA-AA----AT-A-T--A-CTG-T-T-CTTCATTCAC--TA-TG-T-CT--T-TC---T-CCT-
gi|74495                      :    taaTTCTA-T-CA-AT--T-C---G-AT----A--A--G-A-TC-AG--T---C-T-T----TT-T-------TTTC-TC-T-C-GC-T--GA-A---C-T--------------A----AT--GATG-AA--A---A---A-TA-T-G-C-------GA-GA-------T--------A-----ATGAAA-A--C-T-A-AA-A--CAT-T--TA-CA---TTT--CA-ATT---A-T-TTAA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T--T--G-TC---A-T-T-AAT--T--AA-T-C----TGTG-TTTTTTtgaatt
gi|74467                      :        TCTA-T-CA-AT--C-AT--G-A-------------A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--A-TC-C-C-GC-C--GT-G---C-T----C------A--A----AT--C-TG-AA--A---T---A-T--T-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTCTA-A--------AA-A--CAT-T--T--AA---TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-CCT-AAC--T--AA-C-C----T----GTTTTTT
gi|74486                      :   taatgTCTA-T-CA-AA--T-TT--G-AT---CG--A--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-A-------T--C-TC-T-C-AC-T--GT-G---C-T----C------A--A----AT--A-TG-AA--A---T---A-T--A-GCC-------AA-TA-------T--------A-----
gi|74496                      :        aatg-T-CATAT--T-TC--G-TT---CC--G--T-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GT-GA--A-T----A------A--A----AT--T-TG-AC--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----T-TAAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--G--CA---TTT--C--ATT-TCGTT-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA--G-T--T--T-TC---T-TCT-
gi|74472                      :            -T-CA-ATCTT-TT--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--TTA-G-T-T----TG-T-------T----TC-T-C-GT-T--TT-G---C-T----C------A--A----AA--C-AA-AA--AA--T---ACT--T-G-C-------GA-TAATAGCAGT--------A-----TCTGAA-AAAT-T-A-AG-AATCAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCA-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TCA-AAC--T--AATC-C----T----GTTTTTTtaatt
gi|74497                      :      taatttcgtcA-AT--T-AT--G-AT---TG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T--------------------------------C-T----A------A--T----GT--T-TG-AT--A---T---A------A-C-------AA-TA-------T--------A-----TTTGAA-A--T-T-T-GG-T--CAT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TCT-T-TTTA-GA----AT-A-
gi|74498                      :                       -TT--G-AT---CGTGG--G-A-TC-GGGGT-A-A-T-C----TT-T-------T--T-CC-T-C-GT-C--AT-----C-T----A------G--A----AT--T--------A---T---A-T--A-A-C-------GA-TA-------TTAATGATTA-----TCTGAA-A--T-TTG-GG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA--TT-TC--T-TTTA-AA----GT-A-T--A-CT--G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TCT--TC--T--AA-A-C----T----GTGTTTT
gi|74484                      :                               T---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GT-G---A-A----T------A--A----AT--T-TT-AA--A---T---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TCG-T-TTTA-GA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-CC---T-TTT-AAT--T--AA-T-C----T----GTTATTT
gi|74482                      :                              aacttctatg--G-A-TCCGG--T-A-C-T-TGCATTT-T-------T--C-TC-T-C-GC-C--TG-G---C-TGACAT------A--A----AT--C-TG-AATAA---CCC-A-T--CAG-C-------GA-TA-------T--------T-----TCTCAA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---CTT--TC-ATT-TCT-T-TTTT-AA----AT-T-A--A-CTT-GTT-CT------AA--CA-TG-T-CT--G-TA---T-CCT-TAT--G--AA-T-T----G----TTTTTT
gi|74468                      :    taatttcgtatctaaagttttctttgtaccgtcggcagc-A-TC-G---T-A-C-T-T----TT-T----------A-TC-C-C-GC-C--GT-G---C-T----C------A--A----AT--C-TG--A--A---T---A-T--T---C-------GA-TA-------T--------A-----TCTAA---------A-AA-A--CAT-T--T--AA---T-----G-CTT-TCA-T-TTCATAA----ATAA-T--A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC-----TCC-AACTTT--AC-C-C----T----GTCTTT
gi|74499                      :                           taatgtctatcatatata-TC-GG--T-A-C-T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C-GC-T--GT-G---AAT----G------A--A----AT--C-TG-AA--A---A---A-TAATAG-C-------AAATA-------T--------AG----TCTGAAGA--TAT-AGAG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TTG-T-TTTA-AA----AT-A-TA-A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TT---TATTTAAAT--T--AA-C-C----T----GTTTTT
gi|74500                      :                                                                                                         ----C------A--A----AT--T-TG-AA--A-------A-T--A-G-C-------AA-TA-------T--------T-----TCTAAA-T--T-T-T-GG-C--TAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TTT-T-TTT---A----AT---T--A-TTT-C-T-C-------GA--CA-TA-T-CT--T-TT---T-CCT-AAG--T--GA-C-A----T----GTTTTTT
gi|74501                      :                                                                                                              ------A--A----AT--T-TG-AA--A---A---A-T--C-G-CC------AA-TA-------T--------T-----TCTAAA-T--T-T----G-C--TAT-T--C--CA---TTT--CA-ATT-TCT-T-TTTA-AA----AT-A-T--A-TTT-C-T-CC------GA--CA-T--T-CT--T-TT---T-CCA-AAG--T--GA-C-A----T----GTTTT
gi|74502                      :                                                                                                                        ----AT--C-TG-AA--AAGAT---A-T--A-G-C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AGGA--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC--T-TTTA-AA----AT-ATT--A-CTT-G-T-CT-------A--CG--G-T-CT--T-CC---T-T-T-AA---T--AATT-C----T----TGTTTTT
gi|74503                      :                                                                                                                                       --A---C---A-T--T-T-C-------NA-TACTAG---T--------A-----TCTGAA-A--T-A-A-GG-A--CAT-T------------T--CA-ATT-TCT-T-TTTA-TA----AT-A-C--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TCT-ATC--T--AA-C-C----T----GTTTTCT
gi|74504                      :                                                                                                                                                                   A-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-G-A-AT-A--AAG-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CCC--------AA----AT-A-T--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-AC---T-TCT-AAC--T--AA-C-C----TGAA-TTTT
gi|74492                      :                                                                                                                                                                                                          -A-AG-A--CAT-T--TT-CA---GT---CA-ATT-TC--T-TTTA-AA----AT-A-T--A-CTT-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               2222222222222222222222                                                  1111111111111111111111                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :                                            1  2 2  1  11 2 1 11 1  444  22 6666 1  2  22 3 1  2 2222  1 3333333 22 1  1 22 1  4444444444444444444444 1   33 1 0 0  6666666666 111 1 44 22 8888888  1  3333333333333333333333      0 3333 0 1  1 33   1 11 22  555   11  1   1  33 1    0     3 7777 2   1 1 1  444444  22  2  2 1  22 1  111 1 333 33  11 1 1  4 222222 11 11      
lowQualScore                  :                                            .  . .  .  .. . . .. .  ...  .. .... .  .  .. . .  . ....  . ....... .. .  . .. .  ...................... .   .. . . .  .......... ... . .. .. .......  .  ......................      . .... . .  . ..   . .. ..  ...   ..  .   .  .. .    .     . .... .   . . .  ......  ..  .  . .  .. .  ... . ... ..  .. . .  . ...... .. ..      
lowQualScore                  :                                            2  4 4  1  55 2 1 55 1  555  66 5555 0  0  44 0 0  0 1111  0 2222222 44 0  0 44 0  0000000000000000000000 0   11 9 9 9  5555555555 666 8 66 22 2222222  8  0000000000000000000000      9 8888 9 8  8 11   8 22 22  000   33  9   9  77 9    9     7 1111 9   0 9 9  666666  66  9  9 0  33 0  888 0 000 55  44 0 0  3 555555 55 55      
consensus                     :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--GT----G---A-T----CA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
Reference ( family-438 )      :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--GT----G---N-T----CA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TN-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74460                      :                                        TTTC-TA-C-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TCAGG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--T-GCGC--GT----G---A-------ATAAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA----TT--CA-ATT-TC-A--TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-C---T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-C---T--T--G--GTTTTT
gi|74461                      :                                     taaTTTT-TG-T-CA-AT--T-T-G--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TT-C--T-GC-C--GT----G---C-T----CA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TT-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TA-AT-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CC--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTATT
gi|74462                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC----GA----G---A-T-----A-AAT--C-T-G-AA----------T---A-TA-G--C-------GA-TA-------TT-------A-----TCTGAA-A--T-A-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TAAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTCTTT
gi|74463                      :                                      taaTTC-TA-T-CA-AT--T-T-CACG-AT---CG--GC-G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-TGTTTTTTT--C-TC-T--C-GC-T--GA----G---A-A----TA-AAT--C-T-GTAA------A---T---A-TTAG--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-AA-CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-CTTGG-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TCAATT-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74464                      :                                  taattaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GGG-T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-TT-C-GC-T--GA----G---A-TA---TA-AATTGC-T-G-AA------A---T---A-TA-G--CT------GA-TA-------T--------AG----TCTAAA-A--T---A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TTCTTTA-AAATA-T----ATCTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-C-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74465                      :                                      taaTTT-TA-T-CA--T--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TCGT--C-GC-T--GA----G---A-A----TA-AATT-C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-A--CATAT--T--C-----TT--CA-AT---C-TT-TTTA-AA-TA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74466                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-TC--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--TTA-CT-T----TT-T-------T--CGTC-T--C-GC-T--GA----G---A-T-----A-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AG-AG-CATAT--T--C----TTC--TA-ATT--C-TT-TTTT-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CC--TGTC---A-TT--T---A--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74467                      :                                       taaTC-TA-T-CA-AT--C--------AT-------G--A-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--A-TC-C--C-GC-C--GT----G---C-T----CA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TT-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTCTA-A--------AA-A--CAT-T--T--AA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74468                      :                                                                          taatg-A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T----------A-TC-C--C-GC-C--GT----G---C-T----CA-AAT--C-T-G-AA----------T---A-TT----C-------GA-TA-------T--------A-----TCTAAA-A---------A-A--CAT-T--T--AA---TGC------TT-TC-AT-TTCATAAATAAT----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC-----TC--C--AACTT-T-AC-C---C--T--G--TCTTT
gi|74469                      :                      taatgtctatcatatataTTTC-TC-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-GT-T----TG-T-------T----TC-T--C-GT-T--TT----G---C-T----CA-AAT--A-C-A-AA------A---T---A-TT-G--C-------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74470                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G--GCA-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T--C-GT-C--TTT---G---C-T----CA-AAT--A-C-A-AA------A---T---A-TT-G--CC------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74471                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G--GCA-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T--C-GT-C--TTT---G---C-T----CA-AAT--A-C-A-AA------A---T---A-TT-G--CC------GA-TA-------T--------ACAGTATCTGAA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74472                      :                                     taaTTTCGTC-T-CA-ATCTT-T-T--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--TTA-GT-T----TG-T-------T----TC-T--C-GT-T--TT----G---C-T----CA-AAA--C-A-A-AA------AA--T---ACTT-G--C-------GA-TAATAGCAGT--------A-----TCTGAA-AAAT-T-A-AG-AATCAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74473                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GT----G---A-T----AT-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------G---A-------T--------A-----TTTGAA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T---A---TTT--C--ATT-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A--TT-G-T-CT-------A--C--TG-T-CT--G-TA---T-TT--T---A--T-G-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74474                      :                                     taaTTTC-TA-T-AA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-T---G--T-A--T-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--GT----G---C-T----CA-A-T--C-A-G-AA------G---T---A-TT-G----------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--TCCCA---TTT--CATATT-TT-GT-TTTA-AAAT--T----ACCTT-G-T--T------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---C-AT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74475                      :                                     taaTTTC-TA-TTCA-AT--T-T-C--G-AT---CTC-G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GCA---G---A-A----TA-AAT--CAT-G-AA------A---T---A--G-C--C-------GACTAT------T--------AC----TCTGGA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-A---TC-TT-TTTA-AAACAGTA---A-CTT-GCC-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---C--T--G--TTTTT
gi|74476                      :                                    taatTTTC-TA-T-CA-AT------C--G-AT---CG--G--C-A-TC-GG--T-AGCTGT----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GA----G---A-A----TA-AA---C-T-G-AA------A---TTATA-TA-GTAC-------GA-CA-------T--------A-----TCTGAA-A--AAT-A-A--A--CAT-T--T--CAT--TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAA-A-TGATAA-CTT-G-T-CT------AG--CG-TG-T-CT--G-GC---T-TT--TA-AA--T-TAAA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74477                      :                                     taaTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G--C-A-TC-AG--T-A-CT-T----TT-T-------TT-C-TC-T--C-GA-T--GT----A---A-T----GA-AAT--T-T-A-AA------A---T-----TG-A--C-------AA-TA-------C--------A-----TATGAA-A--T-G-T-CG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-AAT-TC-TC-ATCA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-T
gi|74478                      :                                     taaTTTC--A-T-GA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-CG--G-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC-T--CCGC-T--GA----G---AAT----AA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----T---AA-A--A-T-A-AG-A---AT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTTA-AA-TA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CGCTG-T-CTG-G-TC---T-TT--T---A--T-T-AA-T---CGGG--G--TTTTTT
gi|74479                      :                                     taaTTTC-TA-C-CA-AT--TGT-C----ATG--CG--G--G-AATC-G---T-A-CT-T----TTCT-------T--C-TC-T--T-GC----GT----A---C-A----TA-AAT--C---G-AA------A---T---T-TA-G--CTCG----AA-TAA------TCA------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AGTA--CAT-TATT--CA---TTTTCCA-ATTCTC-AT-TTTA-AAATA-TTA--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T--T--T-TC---T-TA--T--AA----T-AA-C---T--TAGG--TTTTTT
gi|74480                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-TTC--GCAT---CG--G--C-A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GA----G---AAG----AA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------AT-TA-------T--------A-----TCTTGA-A--T-A-ATAG-A--CAC-T--T--CA---TTT--T---TT-TC-TT-CTC----ATA-T------CTT-G-T-CT------AA--CG-GGTT-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---T--T--G--TTTTCT
gi|74481                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-TT--T-T-C--G-AT---CG--GGTG-A-TC-GT--A-A-CTCT----TT-T-------T--C-TC-TTCT-GC-C---TCAA-A---A-C----TA-AAT--C-T-G-AA------C---T---A-TA----C-------GA-TA-------T--------AT----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CACATTTC--CATATT-TT-GTGTTCA-AAATA-T----A-CTG-T-T-CTTCATTCAC--TA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--TTGAA--T-T-
gi|74482                      :                                                                         taa--G-A-TCCGG--T-A-CT-TGCATTT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--TG----G---C-TGACATA-AAT--C-T-G-AATAACCCA---T-----CA-G--C-------GA-TA-------T--------T-----TCTCAA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---CTT--TC-ATT-TC-TT-TTTT-AAATT-A----A-CTT-GTT-CT------AA--CA-TG-T-CT--G-TA---T-CC--T--TA--T-G-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74483                      : taatttcgtatctaaagttttctttgtaccgtcggcagcTCTC-TA-T-CA-TT--T-T-T--G-AT---CG--G--GTA-TC-GG--TAA-CT-T----TT-T-------T--C-TT-T--C-TC-T--G--------------------AT--T-T-G-G------------------T-G--C-------GA-AT-------T--------A-----TTT-AA-A--T-C----G-A--CAT-T--T--CA---
gi|74484                      :                                                taaA-AC--T-T-C--T-ATGT-CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GT----G---A-A----TA-AAT--T-T-T-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-GAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-CC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTATTT
gi|74485                      :                                        TTTC-GA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---TG--G----A-TC-G---T-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC----C-G-----GTTAAAG---A-------A-AAT--C-T-G-AA----------T---A-TA-G--A-------GA-TA-------T--------A-----TCT-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TAT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-AAAAA-TA---A-CTT-G-T-CTC-----AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74486                      :                                        aaTC-TA-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--A--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-A-------T--C-TC-T--C-AC-T--GT----G---C-T----CA-AAT--A-T-G-AA------A---T---A-TA-GC-C-------AA-TA-------T--------A-----
gi|74487                      :                                    aatgTTTC-TA-T-AA-AT--T-T----G-AT---CT--T--T-A-TC-T---T-A-AC-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--TT----C---C-T----CA-AATT-C-T-T-TA------A---T---A-T-----C-------TA-TA----------------A-----TCTTTA-A--A-T-A-AT-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AA--A-T----A-CTT-T-T-C-------AA--CA-AT-T-CTTCT-TA---T-TT--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74488                      :                                      aaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T----------C-TC-T--C-GC-T--GT----G---A-A----TA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------AA-TA-------T--------A-----TCTGAA-AA-T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-TT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AT-C---T--T--G--TTTTT
gi|74489                      :                                       aTTTC-TAGT-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG----------------T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-TTTGT----G---A-A----CA-AAT--C-T-G-AAT-----A---T---A-T--G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTC--CA-ATTCTC-GT-TTTA-AAATA-T----AGCTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-C---G--T--G--ATTTTT
gi|74490                      :                                       aTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--A--G-A-TC-AA--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GT-T--GT----G---A-T----TA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TA-G--C-------GA-TATACTAG-T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-GG-A------------CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTG-AAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-
gi|74491                      :                                       aTTTC-TA-T-CG-AT--T-T-T--G-AT---TG--G--G-A-TC-AG--T-A-TT-G----TT-T-------T--C-TT-T--C-GA-T---T----C---A-T----CA-AAT--C-T-A-AA------C---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTAAA-A--T-G-T-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-A--TTTA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AG--CA-TG-T-AA--T-TT---T-GC--T--AA--C-T-GA-CATGG--T--G--TTTTTT
gi|74492                      :                                       aTTTC-TAAT-CT-AT--TAT-C--G-ATAGACG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GT----GAATA-T----AA-AAT--C-T-G-AA--------------A-TG-G--CAAGAACAGA-TATAATAC-T--------A-----CCCGAA-A--C-T-A-AA-G--TAT---------------------------AT-TTTA-AAAGA------A-ATT-G-A-CTG-----AA--AA-TG-T-CT--T-
gi|74493                      :                                       aTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-C--GT----G---C-T----CA-AAT--C-T-G-AA------A---T---A-TT-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74494                      :                                        TTTT-TG-TGCA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G--G-C-TT-GG--T-----------------------------------------------------T----CA-AAT--T-A-G-AA------A---A---A-TC-G--C-------AA-TA-------T--------T-----TCTGAA-T--T-T-T-GA-T--TAC-T--T--CA---TTT--CA-GTT-TC-TT-TTTA-ACATA-C----A-TTT-T-T-CC------AA--CA-TA-TCCT--T-TT---T-TC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTCTTT
gi|74495                      :                                         TTC-TA-T-CA-AT--T---C--G-AT----A--A--G-A-TC-AG--T---CT-T----TT-T-------TTTC-TC-T--C-GC-----T----G---A-A----CT-AAT--GAT-G-AA------A---A---A-TATG--C-------GA-GA-------T--------A-----ATGAAA-A--C-T-A-AA-A--CAT-T--TA-CA---TTT--CA-ATT----AT-TTAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T--T--G-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TGTTTT
gi|74496                      :                                               -T-CATAT--T-T-C--G-TT---CC--G--T-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GT----GA--A-T----AA-AAT--T-T-G-AC------A---T---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----T-TAAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--G--CA---TTT--C--ATT-TCGTT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA--G-T--T--T-TC---T-TCT-T--AA--T-T-tt
gi|74497                      :                                                   A-AT--T-A-T--G-AT---TG--G--G-A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------------C-T--A-A------T----G---T-T--------------T-G-A-----------T---A-TA-A--C-------AA-TA-------T--------A-----TTTGAA-A--T-T-T-GG-T--CAT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTTA-GAATA-
gi|74498                      :                                                          -T-T--G-AT---CGTGG--G-A-TC-GGGGT-A-AT-C----TT-T-------T--T-CC-T--C-GT-C-----------------------AT--C-TAG-AATT----A---T---A-TA-A--C-------GA-TA-------TTAATGATTA-----TCTGAA-A--T-TTG-GG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA--TT-TC--T-TTTA-AAGTA-T----A-CT--G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T------TCT-AA-A---C--T--G--TGTTTT
gi|74499                      :                                                                                 -TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T--C-GC-T--GT----G---AAT----GA-AAT--C-T-G-AA------AAA-T---AATA-G--C-------AAATA-------T--------AG----TCTGAAGA--TAT-AGAG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-GT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TT---TATT--TA-AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTT
gi|74500                      :                                                                                                                                                ----CA-AAT--T-T-G-AA------A-------A-TA-G--C-------AA-TA-------T--------T-----TCTAAA-T--T-T-T-GG-C--TAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-TT-TTT---AAT--T----A-TTT-C-T-C-------GA--CA-TA-T-CT--T-TT---T-CC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTTTT
gi|74501                      :                                                                                                                                                     A-AAT--T-T-G-AA------A---A---A-TC-G--CC------AA-TA-------T--------T-----TCTAAA-T--T-T----G-C--TAT-T--C--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-TTT-C-T-CC------GA--CA-T--T-CT--T-TT---T-CC--A--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTT
gi|74502                      :                                                                                                                                                        AT--C-T-G-AA------AAGAT---A-TA-G--C-------GA-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--A-T-A-AGGA--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC--T-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT-------A--CG--G-T-CT--T-CC---T-TTAAT--AA--T-T----C---T--T--G--TTTTT
gi|74503                      :                                                                                                                                                                    ------A---C---A-TT-T--C-------NA-TACTAG---T--------A-----TCTGAA-A--T-A-A-GG-A--CAT-T------------T--CA-ATT-TC-TT-TTTA-TAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AT--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTCT
gi|74504                      :                                                                                                                                                                                                   A-TA-------T--------A-----TCTGAA-A--T-G-A-AT-A--AAG-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-C-------AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-AC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--GAATTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               222222222222222222222                                                  1111111111111111111111                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                            1  2 2  1  11 2 1 11 1  444  22 6666 1  2  22 3 1  2 2222  1 3333333 22 1  1 1 22  222222222222222222222 1   33 1 0 0  5555555555 3333 0 44444 33 666  1  0000000000000000000000 0   0  0 2222 0 1  1 33   1 11 22  555   11  1   1  33 1    0     3 7777 2   1 1 1  444444  22  2  2 1  22 1  111 1 333 33  11 1 1  4 222222 11 11      
lowQualScore                  :                                            .  . .  .  .. . . .. .  ...  .. .... .  .  .. . .  . ....  . ....... .. .  . . ..  ..................... .   .. . . .  .......... .... . ..... .. ...  .  ...................... .   .  . .... . .  . ..   . .. ..  ...   ..  .   .  .. .    .     . .... .   . . .  ......  ..  .  . .  .. .  ... . ... ..  .. . .  . ...... .. ..      
lowQualScore                  :                                            2  4 4  1  55 2 1 55 1  555  66 5555 0  0  44 0 0  0 1111  0 2222222 44 0  0 0 44  777777777777777777777 0   11 9 9 9  7777777777 6666 9 22222 11 333  8  2222222222222222222222 9   9  9 9999 9 8  8 11   8 22 22  000   33  9   9  77 9    9     7 1111 9   0 9 9  666666  66  9  9 0  33 0  888 0 000 55  44 0 0  3 555555 55 55      
consensus                     :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---A--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
Reference ( family-438 )      :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---A--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74460                      :                                        TTTC-TA-C-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TCAGG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-T--GCGC--G-T----G---A-----ATAAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA----TT--CA-ATT-TC-A--TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-C---T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-C---T--T--G--GTTTTT
gi|74461                      :                                     taaTTTT-TG-T-CA-AT--T-T-G--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TT-C-T--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TA-AT-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CC--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTATT
gi|74462                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC----G-A----G---A--T--A-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-A---G--C---GA-TA-------TT-------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TAAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTCTTT
gi|74463                      :                                      taaTTC-TA-T-CA-AT--T-T-CACG-AT---CG--GCG--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-TGTTTTTTT--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AAT--C-T-GTAA------A---T----A-TTA---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AA-CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-CTTGG-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TCAATT-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74464                      :                                  taattaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GGG-T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-TTC--GC-T--G-A----G---A--TATA-AATTGC-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--CT--GA-TA-------T--------AG----T-CTA-AA-A--T---A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TTCTTTA-AAATA-T----ATCTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-C-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74465                      :                                      taaTTT-TA-T-CA--T--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TCGT-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AATT-C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CATAT--T--C-----TT--CA-A---TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74466                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-TC--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-CT-T----TT-T-------T--CGTC-T-C--GC-T--G-A----G---A--T--A-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AG-CATAT--T--C----TTC--TA-A-T-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CC--TGTC---A-TT--T---A--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74467                      :                                       taaTC-TA-T-CA-AT--C--------AT-------G-A--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--A-TC-C-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTC-TA-A--------AA-A--CAT-T--T--AA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74468                      :                                                                         taatg--A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T----------A-TC-C-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-----T--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A---------A-A--CAT-T--T--AA---TGC------TT-TC-AT-TTCATAAATAAT----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC-----TC--C--AACTT-T-AC-C---C--T--G--TCTTT
gi|74469                      :                      taatgtctatcatatataTTTC-TC-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-GT-T----TG-T-------T----TC-T-C--GT-T--T-T----G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74470                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T-C--GT-C--T-TT---G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74471                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T-C--GT-C--T-TT---G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74472                      :                                     taaTTTCGTC-T-CA-ATCTT-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-GT-T----TG-T-------T----TC-T-C--GT-T--T-T----G---C--T-CA-AAA--C-A-A-AA------A--------A-T-ACTTG--C---GA-TAATAGCAGT--------A-----T-CTG-AA-AAAT-T-A-AG-AATCAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74473                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--T-AT-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---G---A-------T--------A-----T-TTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T---A---TTT--C--ATT-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A--TT-G-T-CT-------A--C--TG-T-CT--G-TA---T-TT--T---A--T-G-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74474                      :                                     taaTTTC-TA-T-AA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-T---G--T-A--T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-A-T--C-A-G-AA------G---T----A-T-T---G------GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--TCCCA---TTT--CATATT-TT-GT-TTTA-AAAT--T----ACCTT-G-T--T------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---C-AT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74475                      :                                     taaTTTC-TA-TTCA-AT--T-T-C--G-AT---CTC-G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-CA---G---A--A-TA-AAT--CAT-G-AA---------------A-T-A---GC-C---GACTAT------T--------AC----T-CTG-GA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-A---TC-TT-TTTA-AAACAGTA---A-CTT-GCC-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---C--T--G--TTTTT
gi|74476                      :                                    taatTTTC-TA-T-CA-AT------C--G-AT---CG--G-C--A-TC-GG--T-AGCTGT----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AA---C-T-G-AA------A---TTAT-A-T-A---GTAC---GA-CA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--AAT-A-A--A--CAT-T--T--CAT--TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAA-A-TGATAA-CTT-G-T-CT------AG--CG-TG-T-CT--G-GC---T-TT--TA-AA--T-TAAA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74477                      :                                     taaTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-C--A-TC-AG--T-A-CT-T----TT-T-------TT-C-TC-T-C--GA-T--G-T----A---A--T-GA-AAT--T-T-A-AA------A---T------T-G---A--C---AA-TA-------C--------A-----T-ATG-AA-A--T-G-T-CG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-AAT-TC-TC-ATCA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-T
gi|74478                      :                                     taaTTTC--A-T-GA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-CG--G-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC-T-CC-GC-T--G-A----G---AA-T-AA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-----AA-A--A-T-A-AG-A---AT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CGCTG-T-CTG-G-TC---T-TT--T---A--T-T-AA-T---CGGG--G--TTTTTT
gi|74479                      :                                     taaTTTC-TA-C-CA-AT--TGT-C----ATG--CG--G-G--AATC-G---T-A-CT-T----TTCT-------T--C-TC-T-T--GC----G-T----AC--A--T--A-AAT--C---G-AA------A---T----T-T-A---G--CTCGAA-TAA------TCA------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AGTA--CAT-TATT--CA---TTTTCCA-ATTCTC-AT-TTTA-AAATA-TTA--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T--T--T-TC---T-TA--T--AA----T-AA-C---T--TAGG--TTTTTT
gi|74480                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-TTC--GCAT---CG--G-C--A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---AA-G-AA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---AT-TA-------T--------A-----T-CTT-GA-A--T-A-ATAG-A--CAC-T--T--CA---TTT--T---TT-TC-TT-CTC----ATA-T------CTT-G-T-CT------AA--CG-GGTT-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---T--T--G--TTTTCT
gi|74481                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-TT--T-T-C--G-AT---CG--G-GTGA-TC-GT--A-A-CTCT----TT-T-------T--C-TC-T-TCTGC-C--T-C----A---AAAC-TA-AAT--C-T-G-AA------C---T----A-T-A------C---GA-TA-------T--------A-----TTCTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CACATTTC--CATATT-TT-GTGTTCA-AAATA-T----A-CTG-T-T-CTTCATTCAC--TA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--TTGAA--T-T-
gi|74482                      :                                                                         taa-G--A-TCCGG--T-A-CT-TGCATTT-T-------T--C-TC-T-C--GC-CTGGCT----G---A--CATA-AAT--C-T-G-AATAACCCA---T------C-A---G--C---GA-TA-------T--------T-----T-CTC-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---CTT--TC-ATT-TC-TT-TTTT-AAATT-A----A-CTT-GTT-CT------AA--CA-TG-T-CT--G-TA---T-CC--T--TA--T-G-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74483                      : taatttcgtatctaaagttttctttgtaccgtcggcagcTCTC-TA-T-CA-TT--T-T-T--G-AT---CG--G-GT-A-TC-GG--TAA-CT-T----TT-T-------T--C-TT-T-C--TC-T--G-------------------AT--T-T-G---------G---T------------G--C---GA-AT-------T--------A-----T-TT--AA-A--T-C----G-A--CAT-T--T--CA---
gi|74484                      :                                                taaA-AC--T-T-C--T-ATGT-CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--A-TA-AAT--T-T-T-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-GAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-CC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTATTT
gi|74485                      :                                        TTTC-GA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---TG--G----A-TC-G---T-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC---C--G-----G-TTAAAG---A-----A-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-A---G--A---GA-TA-------T--------A-----T-CT--AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TAT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-AAAAA-TA---A-CTT-G-T-CTC-----AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74486                      :                                        aaTC-TA-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-A-------T--C-TC-T-C--AC-T--G-T----G---C--T-CA-AAT--A-T-G-AA------A---T----A-T-A---GC-C---AA-TA-------T--------A-----
gi|74487                      :                                    aatgTTTC-TA-T-AA-AT--T-T----G-AT---CT--T-T--A-TC-T---T-A-AC-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--T-T----C---C--T-CA-AATT-C-T-T-TA------A---T----A-T--------C---TA-TA----------------A-----T-CTT-TA-A--A-T-A-AT-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AA--A-T----A-CTT-T-T-C-------AA--CA-AT-T-CTTCT-TA---T-TT--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74488                      :                                      aaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT---------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--A-TA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---AA-TA-------T--------A-----T-CTGAAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-TT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AT-C---T--T--G--TTTTT
gi|74489                      :                                       aTTTC-TAGT-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG----------------T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-TTTG-T----G---A--A-CA-AAT--C-T-G-AAT-----A---T----A-T-----G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTC--CA-ATTCTC-GT-TTTA-AAATA-T----AGCTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-C---G--T--G--ATTTTT
gi|74490                      :                                       aTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-AA--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GT-T--G-T----G---A--T-TA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TATACTAG-T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-GG-A------------CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTG-AAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-
gi|74491                      :                                       aTTTC-TA-T-CG-AT--T-T-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-AG--T-A-TT-G----TT-T-------T--C-TT-T-C--GA-T----T----C---A--T-CA-AAT--C-T-A-AA------C---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A--T-G-T-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-A--TTTA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AG--CA-TG-T-AA--T-TT---T-GC--T--AA--C-T-GA-CATGG--T--G--TTTTTT
gi|74492                      :                                       aTTTC-TAAT-CT-AT--TAT-C--G-ATAGACG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----GAATA--T-AA-AAT--C-T-G-AA------A---TGGCAA-G-A---A--CA--GA-TATAATAC-T--------A-----C-CCG-AA-A--C-T-A-AA-G--TAT---------------------------AT-TTTA-AAAGA------A-ATT-G-A-CTG-----AA--AA-TG-T-CT--T-
gi|74493                      :                                       aTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74494                      :                                        TTTT-TG-TGCA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--C-TT-GG--T-------------------------------------------------------T-CA-AAT--T-A-G-AA------A---A----A-T-C---G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTG-AA-T--T-T-T-GA-T--TAC-T--T--CA---TTT--CA-GTT-TC-TT-TTTA-ACATA-C----A-TTT-T-T-CC------AA--CA-TA-TCCT--T-TT---T-TC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTCTTT
gi|74495                      :                                         TTC-TA-T-CA-AT--T---C--G-AT----A--A-G--A-TC-AG--T---CT-T----TT-T-------TTTC-TC-T-C--GC------T----G---A--A-CT-AAT--GAT-G-AA------A---A----A-T-AT--G--C---GA-GA-------T--------A-----A-TGA-AA-A--C-T-A-AA-A--CAT-T--TA-CA---TTT--CA-ATT----AT-TTAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T--T--G-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TGTTTT
gi|74496                      :                                               -T-CATAT--T-T-C--G-TT---CC--G-T--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----GA--A--T-AA-AAT--T-T-G-AC------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T--TA-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--G--CA---TTT--C--ATT-TCGTT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA--G-T--T--T-TC---T-TCT-T--AA--T-T-tt
gi|74497                      :                                                   A-AT--T-A-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------C--------------------T----A---A--T-----GT--T-T-G-A-----------T----A-T-A---A--C---AA-TA-------T--------A-----T-TTG-AA-A--T-T-T-GG-T--CAT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTTA-GAATA-
gi|74498                      :                                                          -T-T--G-AT---CGTGG-G--A-TC-GGGGT-A-AT-C----TT-T-------T--T-CC-T-C--GT-C----------------------AT--C-TAG-AATT----A---T----A-T-A---A--C---GA-TA-------TTAATGATTA-----T-CTG-AA-A--T-TTG-GG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA--TT-TC--T-TTTA-AAGTA-T----A-CT--G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T------TCT-AA-A---C--T--G--TGTTTT
gi|74499                      :                                                                                 -TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---AA-T-GA-AAT--C-T-G-AA------AAA-T----AAT-A---G--C---AAATA-------T--------AG----T-CTG-AAGA--TAT-AGAG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-GT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TT---TATT--TA-AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTT
gi|74500                      :                                                                                                                                                  -CA-AAT--T-T-G-AA------A--------A-T-A---G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T-T-GG-C--TAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-TT-TTT---AAT--T----A-TTT-C-T-C-------GA--CA-TA-T-CT--T-TT---T-CC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTTTT
gi|74501                      :                                                                                                                                                    A-AAT--T-T-G-AA------A---A----A-T-C---G--CC--AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T----G-C--TAT-T--C--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-TTT-C-T-CC------GA--CA-T--T-CT--T-TT---T-CC--A--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTT
gi|74502                      :                                                                                                                                                       AT--C-T-G-AA------AAGAT----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AGGA--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC--T-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT-------A--CG--G-T-CT--T-CC---T-TTAAT--AA--T-T----C---T--T--G--TTTTT
gi|74503                      :                                                                                                                                                                                                      -------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-GG-A--CAT-T------------T--CA-ATT-TC-TT-TTTA-TAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AT--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTCT
gi|74504                      :                                                                                                                                                                                   acatttcnatactagA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-G-A-AT-A--AAG-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-C-------AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-AC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--GAATTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                               222222222222222222222                                                  1111111111111111111111                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                            1  2 2  1  11 2 1 11 1  444  22 6666 1  2  22 3 1  2 2222  1 3333333 22 1  1 1 22  222222222222222222222 1   33 1 0 0  5555555555 3333 0 44444 33 666  1  0000000000000000000000 0   0  0 2222 0 1  1 33   1 11 22  555   11  1   1  33 1    0     3 7777 2   1 1 1  444444  22  2  2 1  22 1  111 1 333 33  11 1 1  4 222222 11 11      
lowQualScore                  :                                            .  . .  .  .. . . .. .  ...  .. .... .  .  .. . .  . ....  . ....... .. .  . . ..  ..................... .   .. . . .  .......... .... . ..... .. ...  .  ...................... .   .  . .... . .  . ..   . .. ..  ...   ..  .   .  .. .    .     . .... .   . . .  ......  ..  .  . .  .. .  ... . ... ..  .. . .  . ...... .. ..      
lowQualScore                  :                                            2  4 4  1  55 2 1 55 1  555  66 5555 0  0  44 0 0  0 1111  0 2222222 44 0  0 0 44  777777777777777777777 0   11 9 9 9  7777777777 6666 9 22222 11 333  8  2222222222222222222222 9   9  9 9999 9 8  8 11   8 22 22  000   33  9   9  77 9    9     7 1111 9   0 9 9  666666  66  9  9 0  33 0  888 0 000 55  44 0 0  3 555555 55 55      
consensus                     :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---A--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
Reference ( family-438 )      :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---A--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74460                      :                                        TTTC-TA-C-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TCAGG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-T--GCGC--G-T----G---A-----ATAAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA----TT--CA-ATT-TC-A--TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-C---T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-C---T--T--G--GTTTTT
gi|74461                      :                                     taaTTTT-TG-T-CA-AT--T-T-G--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TT-C-T--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TA-AT-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CC--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTATT
gi|74462                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC----G-A----G---A--T--A-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-A---G--C---GA-TA-------TT-------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TAAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTCTTT
gi|74463                      :                                      taaTTC-TA-T-CA-AT--T-T-CACG-AT---CG--GCG--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-TGTTTTTTT--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AAT--C-T-GTAA------A---T----A-TTA---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AA-CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-CTTGG-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TCAATT-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74464                      :                                  taattaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GGG-T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-TTC--GC-T--G-A----G---A--TATA-AATTGC-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--CT--GA-TA-------T--------AG----T-CTA-AA-A--T---A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TTCTTTA-AAATA-T----ATCTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-C-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74465                      :                                      taaTTT-TA-T-CA--T--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TCGT-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AATT-C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CATAT--T--C-----TT--CA-A---TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74466                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-TC--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-CT-T----TT-T-------T--CGTC-T-C--GC-T--G-A----G---A--T--A-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AG-CATAT--T--C----TTC--TA-A-T-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CC--TGTC---A-TT--T---A--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74467                      :                                       taaTC-TA-T-CA-AT--C--------AT-------G-A--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--A-TC-C-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTC-TA-A--------AA-A--CAT-T--T--AA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74468                      :                                                                         taatg--A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T----------A-TC-C-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-----T--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A---------A-A--CAT-T--T--AA---TGC------TT-TC-AT-TTCATAAATAAT----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC-----TC--C--AACTT-T-AC-C---C--T--G--TCTTT
gi|74469                      :                      taatgtctatcatatataTTTC-TC-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-GT-T----TG-T-------T----TC-T-C--GT-T--T-T----G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74470                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T-C--GT-C--T-TT---G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74471                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----TT-G-------T--T-TC-T-C--GT-C--T-TT---G---C--T-CA-AAT--A-C-A-AA------A---T----A-T-T---G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74472                      :                                     taaTTTCGTC-T-CA-ATCTT-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-GT-T----TG-T-------T----TC-T-C--GT-T--T-T----G---C--T-CA-AAA--C-A-A-AA------A--------A-T-ACTTG--C---GA-TAATAGCAGT--------A-----T-CTG-AA-AAAT-T-A-AG-AATCAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74473                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--T-AT-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---G---A-------T--------A-----T-TTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T---A---TTT--C--ATT-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A--TT-G-T-CT-------A--C--TG-T-CT--G-TA---T-TT--T---A--T-G-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74474                      :                                     taaTTTC-TA-T-AA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-T---G--T-A--T-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-A-T--C-A-G-AA------G---T----A-T-T---G------GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--TCCCA---TTT--CATATT-TT-GT-TTTA-AAAT--T----ACCTT-G-T--T------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---C-AT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74475                      :                                     taaTTTC-TA-TTCA-AT--T-T-C--G-AT---CTC-G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-CA---G---A--A-TA-AAT--CAT-G-AA---------------A-T-A---GC-C---GACTAT------T--------AC----T-CTG-GA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-A---TC-TT-TTTA-AAACAGTA---A-CTT-GCC-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---C--T--G--TTTTT
gi|74476                      :                                    taatTTTC-TA-T-CA-AT------C--G-AT---CG--G-C--A-TC-GG--T-AGCTGT----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---A--A-TA-AA---C-T-G-AA------A---TTAT-A-T-A---GTAC---GA-CA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--AAT-A-A--A--CAT-T--T--CAT--TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAA-A-TGATAA-CTT-G-T-CT------AG--CG-TG-T-CT--G-GC---T-TT--TA-AA--T-TAAA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74477                      :                                     taaTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-C--A-TC-AG--T-A-CT-T----TT-T-------TT-C-TC-T-C--GA-T--G-T----A---A--T-GA-AAT--T-T-A-AA------A---T------T-G---A--C---AA-TA-------C--------A-----T-ATG-AA-A--T-G-T-CG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-AAT-TC-TC-ATCA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-T
gi|74478                      :                                     taaTTTC--A-T-GA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-CG--G-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC-T-CC-GC-T--G-A----G---AA-T-AA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-----AA-A--A-T-A-AG-A---AT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CGCTG-T-CTG-G-TC---T-TT--T---A--T-T-AA-T---CGGG--G--TTTTTT
gi|74479                      :                                     taaTTTC-TA-C-CA-AT--TGT-C----ATG--CG--G-G--AATC-G---T-A-CT-T----TTCT-------T--C-TC-T-T--GC----G-T----AC--A--T--A-AAT--C---G-AA------A---T----T-T-A---G--CTCGAA-TAA------TCA------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AGTA--CAT-TATT--CA---TTTTCCA-ATTCTC-AT-TTTA-AAATA-TTA--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T--T--T-TC---T-TA--T--AA----T-AA-C---T--TAGG--TTTTTT
gi|74480                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-TTC--GCAT---CG--G-C--A-TC-G---T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-A----G---AA-G-AA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---AT-TA-------T--------A-----T-CTT-GA-A--T-A-ATAG-A--CAC-T--T--CA---TTT--T---TT-TC-TT-CTC----ATA-T------CTT-G-T-CT------AA--CG-GGTT-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---T--T--G--TTTTCT
gi|74481                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-TT--T-T-C--G-AT---CG--G-GTGA-TC-GT--A-A-CTCT----TT-T-------T--C-TC-T-TCTGC-C--T-C----A---AAAC-TA-AAT--C-T-G-AA------C---T----A-T-A------C---GA-TA-------T--------A-----TTCTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CACATTTC--CATATT-TT-GTGTTCA-AAATA-T----A-CTG-T-T-CTTCATTCAC--TA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--TTGAA--T-T-
gi|74482                      :                                                                         taa-G--A-TCCGG--T-A-CT-TGCATTT-T-------T--C-TC-T-C--GC-CTGGCT----G---A--CATA-AAT--C-T-G-AATAACCCA---T------C-A---G--C---GA-TA-------T--------T-----T-CTC-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---CTT--TC-ATT-TC-TT-TTTT-AAATT-A----A-CTT-GTT-CT------AA--CA-TG-T-CT--G-TA---T-CC--T--TA--T-G-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74483                      : taatttcgtatctaaagttttctttgtaccgtcggcagcTCTC-TA-T-CA-TT--T-T-T--G-AT---CG--G-GT-A-TC-GG--TAA-CT-T----TT-T-------T--C-TT-T-C--TC-T--G-------------------AT--T-T-G---------G---T------------G--C---GA-AT-------T--------A-----T-TT--AA-A--T-C----G-A--CAT-T--T--CA---
gi|74484                      :                                                taaA-AC--T-T-C--T-ATGT-CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--A-TA-AAT--T-T-T-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-GAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-CC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTATTT
gi|74485                      :                                        TTTC-GA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---TG--G----A-TC-G---T-A-CT-T----TT-C-------T--C-TC---C--G-----G-TTAAAG---A-----A-AAT--C-T-G-AA----------T----A-T-A---G--A---GA-TA-------T--------A-----T-CT--AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TAT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-AAAAA-TA---A-CTT-G-T-CTC-----AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74486                      :                                        aaTC-TA-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-A-------T--C-TC-T-C--AC-T--G-T----G---C--T-CA-AAT--A-T-G-AA------A---T----A-T-A---GC-C---AA-TA-------T--------A-----
gi|74487                      :                                    aatgTTTC-TA-T-AA-AT--T-T----G-AT---CT--T-T--A-TC-T---T-A-AC-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--T-T----C---C--T-CA-AATT-C-T-T-TA------A---T----A-T--------C---TA-TA----------------A-----T-CTT-TA-A--A-T-A-AT-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AA--A-T----A-CTT-T-T-C-------AA--CA-AT-T-CTTCT-TA---T-TT--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74488                      :                                      aaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----TT---------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---A--A-TA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---AA-TA-------T--------A-----T-CTGAAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-TT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AT-C---T--T--G--TTTTT
gi|74489                      :                                       aTTTC-TAGT-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG----------------T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-TTTG-T----G---A--A-CA-AAT--C-T-G-AAT-----A---T----A-T-----G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTC--CA-ATTCTC-GT-TTTA-AAATA-T----AGCTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-C---G--T--G--ATTTTT
gi|74490                      :                                       aTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-AA--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GT-T--G-T----G---A--T-TA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TATACTAG-T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-GG-A------------CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTG-AAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-
gi|74491                      :                                       aTTTC-TA-T-CG-AT--T-T-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-AG--T-A-TT-G----TT-T-------T--C-TT-T-C--GA-T----T----C---A--T-CA-AAT--C-T-A-AA------C---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A--T-G-T-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-A--TTTA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AG--CA-TG-T-AA--T-TT---T-GC--T--AA--C-T-GA-CATGG--T--G--TTTTTT
gi|74492                      :                                       aTTTC-TAAT-CT-AT--TAT-C--G-ATAGACG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----GAATA--T-AA-AAT--C-T-G-AA------A---TGGCAA-G-A---A--CA--GA-TATAATAC-T--------A-----C-CCG-AA-A--C-T-A-AA-G--TAT---------------------------AT-TTTA-AAAGA------A-ATT-G-A-CTG-----AA--AA-TG-T-CT--T-
gi|74493                      :                                       aTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---C--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-T---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74494                      :                                        TTTT-TG-TGCA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--C-TT-GG--T-------------------------------------------------------T-CA-AAT--T-A-G-AA------A---A----A-T-C---G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTG-AA-T--T-T-T-GA-T--TAC-T--T--CA---TTT--CA-GTT-TC-TT-TTTA-ACATA-C----A-TTT-T-T-CC------AA--CA-TA-TCCT--T-TT---T-TC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTCTTT
gi|74495                      :                                         TTC-TA-T-CA-AT--T---C--G-AT----A--A-G--A-TC-AG--T---CT-T----TT-T-------TTTC-TC-T-C--GC------T----G---A--A-CT-AAT--GAT-G-AA------A---A----A-T-AT--G--C---GA-GA-------T--------A-----A-TGA-AA-A--C-T-A-AA-A--CAT-T--TA-CA---TTT--CA-ATT----AT-TTAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T--T--G-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TGTTTT
gi|74496                      :                                               -T-CATAT--T-T-C--G-TT---CC--G-T--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----GA--A--T-AA-AAT--T-T-G-AC------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T--TA-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--G--CA---TTT--C--ATT-TCGTT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA--G-T--T--T-TC---T-TCT-T--AA--T-T-tt
gi|74497                      :                                                   A-AT--T-A-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------C--------------------T----A---A--T-----GT--T-T-G-A-----------T----A-T-A---A--C---AA-TA-------T--------A-----T-TTG-AA-A--T-T-T-GG-T--CAT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTTA-GAATA-
gi|74498                      :                                                          -T-T--G-AT---CGTGG-G--A-TC-GGGGT-A-AT-C----TT-T-------T--T-CC-T-C--GT-C----------------------AT--C-TAG-AATT----A---T----A-T-A---A--C---GA-TA-------TTAATGATTA-----T-CTG-AA-A--T-TTG-GG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA--TT-TC--T-TTTA-AAGTA-T----A-CT--G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T------TCT-AA-A---C--T--G--TGTTTT
gi|74499                      :                                                                                 -TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-T--G-T----G---AA-T-GA-AAT--C-T-G-AA------AAA-T----AAT-A---G--C---AAATA-------T--------AG----T-CTG-AAGA--TAT-AGAG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-GT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TT---TATT--TA-AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTT
gi|74500                      :                                                                                                                                                  -CA-AAT--T-T-G-AA------A--------A-T-A---G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T-T-GG-C--TAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-TT-TTT---AAT--T----A-TTT-C-T-C-------GA--CA-TA-T-CT--T-TT---T-CC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTTTT
gi|74501                      :                                                                                                                                                    A-AAT--T-T-G-AA------A---A----A-T-C---G--CC--AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T----G-C--TAT-T--C--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-TTT-C-T-CC------GA--CA-T--T-CT--T-TT---T-CC--A--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTT
gi|74502                      :                                                                                                                                                       AT--C-T-G-AA------AAGAT----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AGGA--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC--T-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT-------A--CG--G-T-CT--T-CC---T-TTAAT--AA--T-T----C---T--T--G--TTTTT
gi|74503                      :                                                                                                                                                                                                      -------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-GG-A--CAT-T------------T--CA-ATT-TC-TT-TTTA-TAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AT--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTCT
gi|74504                      :                                                                                                                                                                                   acatttcnatactagA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-G-A-AT-A--AAG-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-C-------AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-AC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--GAATTTT


blockSeqs                     :                                            G  G T  T  CT G T AC C  AGA  TG GTG  A  C  GG T G  G GCAT  C GTTTTTT TT G  G T CT  CTGGCTGACAT               TG A      TAACCCA    GGCA   ACTT  TA TCG  C  TTAATGATTA                      AAT    T  T AT   A AT CC  CAT   TC  T   C  GT C          T GATA T     C C  TCATTC  GG  C  C    TC    AAT A TAA TG  CT C A  T ATGG   AG AA
blockSeqs                     :                                            .  A G  .  .  A . .  .  GT   C  CG   .  .  G  T .  C .     . .       T  .  . . C   TGTGAATATA                T  A      AAGA       TAT    TA    C  T    A  ATAGCAGTA                       AA     G  G A    A .  A   CT    .   T   C  A  G          A TA   C     T C  C       GG  C  C    G     .   . CT  A   .  . .  T CGG    .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  G    .  GC   .  .  .  A .  . .     . .       .  .  . . .   CTCAAAACT                 T  .      TTA        .      AT    C  C    .  TACTAGTA                        TA     .  . G    . .  .   CT    .   .   .  T  .          G A    G     . .  G       .   C  T    .     .   . C   A   .  . .  T C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  GC   .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TTTGTGAAC                 .  .      AAA        .      T     .  C    .  TAATACTA                        T      .  . .    . .  .   T     .   .   .  T  .          T A    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  T C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  GT   .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGATAT                  .  .      TA         .      A     .  A    .  TACAGTA                         T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . A    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CTTTGCTC                  .  .      A          .      A     .  C    .  TACAGTA                         A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . A    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CTTTGCTC                  .  .      A          .      A     .  .    .  TACAGTA                         T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGCAGAAT                  .  .      A          .      A     .  .    .  ATCAA                           A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAATA                  .  .      A          .      T     .  .    .  TTAC                            A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  A    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAAGA                  .  .      A          .      T     .  .    .  TTA                             T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   GTTAAAGA                  .  .      A          .      T     .  .    .  TAG                             T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGAATA                  .  .      A          .      T     .  .    .  TAG                             T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGAATG                  .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CGTGCTC                   .  .      A          .      T     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  C    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAAT                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  C    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAAT                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CGTGCTC                   .  .      G          .      G     .  .    .  TA                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  C    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CGTGCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TTTGCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TTTGCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . A   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGATA                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  T    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CGTGCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  CA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAAT                   .  .      C          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTAATG                   .  .      G          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . G      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGAAT                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  TT                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . A      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CTTCCTC                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGAAT                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  T    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGTGATT                   .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   CGTGCTC                   .  .      C          .      T     .  .    .  TA                              C      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . A      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  G    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAGAT                    .  .      A          .      C     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . A      .  . 
blockSeqs                     :                                            .  . .  .  .  . . .  .  .    .  .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   GTACAT                    .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . T   .   .  . .  . T      .  . 
blockSeqs                     :                                               . .  .  .  . . .  .  .    .  .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TTCATC                    .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              C      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                                    .  .  . . .  .  .    .  .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   GAGAT                     .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  A  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . C      .  . 
blockSeqs                     :                                                    .  .  . . .  .  .    .  .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TGAAC                     .  .      A          .      A     .  .    .  TT                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . .      .  . 
blockSeqs                     :                                                          . . .  .  .    .  .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TAAT                      .  .      A          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  G  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . C   .   .  . .  . .      .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .    .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TG                        .  .      A          .      C     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . .   .   .  . .                
blockSeqs                     :                                                                                 .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   TC                        .  .      .          .      A     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .     .   . .   .   .  . .                
blockSeqs                     :                                                                                 .  .  .  . .  . .     . .       .  .  . . .   C                         .  .      .          .      .     .  .    .  TT                              A      .  . .    . .  .   .     .   .   .  T  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .  .      .          .      .     .  .    .  TT                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  C  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .  .      .          .      .     .  .    .  TA                              T      .  . .    . .  .   .     .   .   .  .  .          . .    .     . .  .       .   .  .    .                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .  .      .          .      .     .  .    .  TA                              .      .  . .    . .  .   .     .   .   .  .  .          .                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                   .  TA                              .      .  . .    . .  .   .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      A                                                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                               TGTGAAC**************
originalCons                  :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GC-C--G-T----G---A--T-CA-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
finalCons                     :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----TT-T-------T--C-TC-T-C--GCTGTGAAC--------------A-AAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A---G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                    1111111111111111111                                                 1111111111111111111111                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                            1  2 2  1  11 2 1 11 1  444  22 6666 1  2  22 3 1  2 2222 1 1 3333333 22 1  222 1 1 2 2 5555555555555555555 1  1 33 1 0 0  4444444444 3333 1 222 33 666  1  0000000000000000000000 0   0  0 2222 0 1  1 33   1 11 22  555   11  1   1  33 1    0     3 7777 2   1 1 1  444444  22  2  2 1  22 1  111 1 333 33  11 1 1  4 222222 11 11      
lowQualScore                  :                                            .  . .  .  .. . . .. .  ...  .. .... .  .  .. . .  . .... . . ....... .. .  ... . . . . ................... .  . .. . . .  .......... .... . ... .. ...  .  ...................... .   .  . .... . .  . ..   . .. ..  ...   ..  .   .  .. .    .     . .... .   . . .  ......  ..  .  . .  .. .  ... . ... ..  .. . .  . ...... .. ..      
lowQualScore                  :                                            2  4 4  1  55 2 1 55 1  555  66 5555 0  0  44 0 0  0 1111 0 0 2222222 44 0  888 0 0 0 0 5555555555555555555 0  9 11 9 9 9  8888888888 6666 9 999 11 333  8  2222222222222222222222 9   9  9 9999 9 8  8 11   8 22 22  000   33  9   9  77 9    9     7 1111 9   0 9 9  666666  66  9  9 0  33 0  888 0 000 55  44 0 0  3 555555 55 55      
consensus                     :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-C---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
Reference ( family-438 )      :                                        TTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-C---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-NT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74460                      :                                        TTTC-TA-C-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TCAGG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-T-G-CGC--G--T----GA-A-T-----AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA----TT--CA-ATT-TC-A--TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-C---T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-C---T--T--G--GTTTTT
gi|74461                      :                                     taaTTTT-TG-T-CA-AT--T-T-G--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TT---C-T-G-C-C--G--T----GC-T-C---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-T-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TA-AT-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CC--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTATT
gi|74462                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C------------GAGA-T---A-AA-T--C-T-G-AA----------T----A-T-A-G--C---GA-TA-------TT-------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TAAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTCTTT
gi|74463                      :                                      taaTTC-TA-T-CA-AT--T-T-CACG-AT---CG--GCG--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-TGTTTTTTT--C-TC---T-C-G-C-T--G--A----GA-A-T---A-AA-T--C-T-GTAA------A---T----A-TTA-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AA-CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-CTTGG-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TCAATT-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74464                      :                                  taattaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GGG-T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---TTC-G-C-T--G--A----GATA-T---A-AA-TTGC-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--CT--GA-TA-------T--------AG----T-CTA-AA-A--T---A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TTCTTTA-AAATA-T----ATCTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-C-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74465                      :                                      taaTTT-TA-T-CA--T--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TCG--T-C-G-C-T--G--A----GA-A-T---A-AA-TT-C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CATAT--T--C-----TT--CA-A---TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74466                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-TC--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-CT-T----T-T-T-------T--CGTC---T-C-G-C-T--G--A----GA---T---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AG-AG-CATAT--T--C----TTC--TA-A-T-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T-CC--TGTC---A-TT--T---A--T-T-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74467                      :                                       taaTC-TA-T-CA-AT--C--------AT-------G-A--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--A-TC---C-C-G-C-C--G--T----GC-T-C---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-T-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTC-TA-A--------AA-A--CAT-T--T--AA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74468                      :                                                                         taatg--A-TC-G---T-A-CT-T----T-T-T----------A-TC---C-C-G-C-C--G--T----GC-T-C---A-AA-T--C-T-G-AA----------T----A-T---T--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A---------A-A--CAT-T--T--AA---TGC------TT-TC-AT-TTCATAAATAAT----A-GTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC-----TC--C--AACTT-T-AC-C---C--T--G--TCTTT
gi|74469                      :                      taatgtctatcatatataTTTC-TC-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-GT-T----T-G-T-------T----TC---T-C-G-T-T--T--T----GC-T-C---A-AA-T--A-C-A-AA------A---T----A-T-T-G--C---GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74470                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----T-T-G-------T--T-TC---T-C-GTC-T--T--T----GC-T-C---A-AA-T--A-C-A-AA------A---T----A-T-T-G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74471                      :                                      taaTTC-TC-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--G-GC-A-TC-GG--T-A-GT-G----T-T-G-------T--T-TC---T-C-GTC-T--T--T----GC-T-C---A-AA-T--A-C-A-AA------A---T----A-T-T-G--CC--GA-TA-------T--------ACAGTAT-CTG-AA----T-T-A-A--A--CAT-T--C--CACT-TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--GACTG-T-CT--T-TC---T-TC--A--AA--C-T-AA-C---------G--CTTTTT
gi|74472                      :                                     taaTTTCGTC-T-CA-ATCTT-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--TTA-GT-T----TGT-T-------T--C-TCGTTT-T-G-C-T--C--A----AA-A-C---A-AA----------AA------A---T----ACT-T-G--C---GA-TAATAGCAGT--------A-----T-CTG-AA-AAAT-T-A-AG-AATCAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-TCCT------AAGGAA-TGCT-CT--G-TC---T-TC--A--AA--C-T-AATC---C--T--G--TTTTTT
gi|74473                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----G--A-T---ATAA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---G---A-------T--------A-----T-TTG-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T---A---TTT--C--ATT-TC-TT-TTTT-AAATA-T----A--TT-G-T-CT-------A--C--TG-T-CT--G-TA---T-TT--T---A--T-G-AA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74474                      :                                     taaTTTC-TA-T-AA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-T---G--T-A--T-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-C--G--T----GC-T-C---A-A--T--C-A-G-AA------G---T----A-T-T-G------GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--TCCCA---TTT--CATATT-TT-GT-TTTA-AAAT--T----ACCTT-G-T--T------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---C-AT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74475                      :                                     taaTTTC-TA-TTCA-AT--T-T-C--G-AT---CTC-G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--CA---GA-A-T---A-AA-T--CAT-G-AA---------------A-T-A-GC-C---GACTAT------T--------AC----T-CTG-GA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-A---TC-TT-TTTA-AAACAGTA---A-CTT-GCC-CT------AA--CG-TG-T-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---C--T--G--TTTTT
gi|74476                      :                                    taatTTTC-TA-T-CA-AT------C--G-AT---CG--G-C--A-TC-GG--T-AGCTGT----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--A----GA-A-T---A-AA----C-T-G-AA------A---TTAT-A-T-A-GTAC---GA-CA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--AAT-A-A--A--CAT-T--T--CAT--TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAA-A-TGATAA-CTT-G-T-CT------AG--CG-TG-T-CT--G-GC---T-TT--TA-AA--T-TAAA-T---C--T--G--TTTTTT
gi|74477                      :                                     taaTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-C--A-TC-AG--T-A-CT-T----T-T-T-------TT-C-TC---T-C-G-A-T--G--T----AA-T-G---A-AA-T--T-T-A-AA------A---T------T-G-A--C---AA-TA-------C--------A-----T-ATG-AA-A--T-G-T-CG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-AAT-TC-TC-ATCA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-T
gi|74478                      :                                     taaTTTC--A-T-GA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G----A-TC-CG--G-A-CT-T----T-T-C-------T--C-TC---T-CCG-C-T--G--A----GA-A-T---A-AAAT--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-----AA-A--A-T-A-AG-A---AT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTT--AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CGCTG-T-CTG-G-TC---T-TT--T---A--T-T-AA-T---CGGG--G--TTTTTT
gi|74479                      :                                     taaTTTC-TA-C-CA-AT--TGT-C----ATG--CG--G-G--AATC-G---T-A-CT-T----T-TCT-------T--C-TC---T-T-G-C----G--T----AC-A-T---A-AA-T--C---G-AA------A---T----T-T-A-G--CTCGAA-TAA------TCA------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AGTA--CAT-TATT--CA---TTTTCCA-ATTCTC-AT-TTTA-AAATA-TTA--A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T--T--T-TC---T-TA--T--AA----T-AA-C---T--TAGG--TTTTTT
gi|74480                      :                                     taaTTTC-TA-T-CA-AT--T-TTC--GCAT---CG--G-C--A-TC-G---T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--A----GA-AGA---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---AT-TA-------T--------A-----T-CTT-GA-A--T-A-ATAG-A--CAC-T--T--CA---TTT--T---TT-TC-TT-CTC----ATA-T------CTT-G-T-CT------AA--CG-GGTT-CT--G-TC---A-TT--T--AA--T-T-AATC---T--T--G--TTTTCT
gi|74481                      :                                      taaTTT-TA-T-CA-TT--T-T-C--G-AT---CG--G-GTGA-TC-GT--A-A-CTCT----T-T-T-------T--C-TC---T-T---C-T--G--CCTCAAA-A-CT--A-AA-T--C-T-G-AA------C---T----A-T-A----C---GA-TA-------T--------A-----TTCTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CACATTTC--CATATT-TT-GTGTTCA-AAATA-T----A-CTG-T-T-CTTCATTCAC--TA-TG-T-CT--T-TC---T-CC--TTGAA--T-T-
gi|74482                      :                                                                         taa-G--A-TCCGG--T-A-CT-TGCATT-T-T-------T--C-TC---T-C-G-CCT--GGCT----GACA-T---A-AA-T--C-T-G-AATAACCCA---T------C-A-G--C---GA-TA-------T--------T-----T-CTC-AA-A--A-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---CTT--TC-ATT-TC-TT-TTTT-AAATT-A----A-CTT-GTT-CT------AA--CA-TG-T-CT--G-TA---T-CC--T--TA--T-G-AA-----T--T--G--TTTTTT
gi|74483                      : taatttcgtatctaaagttttctttgtaccgtcggcagcTCTC-TA-T-CA-TT--T-T-T--G-AT---CG--G-GT-A-TC-GG--TAA-CT-T----T-T-T-------T--C-TT---T-C-T-C-T--G-------------------A-T--T-T-G---------G---T----------G--C---GA-AT-------T--------A-----T-TT--AA-A--T-C----G-A--CAT-T--T--CA---
gi|74484                      :                                                taaA-AC--T-T-C--T-ATGT-CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-T---A-AA-T--T-T-T-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-GAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-CC---T-TT--T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TTATTT
gi|74485                      :                                        TTTC-GA-T-CA-AT--T-T-C--G-AT---TG--G----A-TC-G---T-A-CT-T----T-T-C-------T--C-TC-----C-G-G-T-----T----AA-A-G---A-AAAT--C-T-G-AA----------T----A-T-A-G--A---GA-TA-------T--------A-----T-CT--AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TAT--CA-ATT-TC-GT-TTTA-AAAAA-TA---A-CTT-G-T-CTC-----AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T--A-C---C--T--G--TTTTTT
gi|74486                      :                                        aaTC-TA-T-CA-AA--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-A-------T--C-TC---T-C-A-C-T--G--T----GC-T-C---A-AA-T--A-T-G-AA------A---T----A-T-A-GC-C---AA-TA-------T--------A-----
gi|74487                      :                                    aatgTTTC-TA-T-AA-AT--T-T----G-AT---CT--T-T--A-TC-T---T-A-AC-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-C--T--T----CC-T-C---A-AA-TT-C-T-T-TA------A---T----A-T------C---TA-TA----------------A-----T-CTT-TA-A--A-T-A-AT-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AA--A-T----A-CTT-T-T-C-------AA--CA-AT-T-CTTCT-TA---T-TT--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74488                      :                                      aaTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G----A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T---------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-T---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---AA-TA-------T--------A-----T-CTGAAA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-TT--T-TC---T-TT--T--AA--T-T-AT-C---T--T--G--TTTTT
gi|74489                      :                                       aTTTC-TAGT-CA-AT--T-T-C--G-AT---CG----------------T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-TTTG--T----GA-A-C---A-AA-T--C-T-G--A------A---T----A-T-ATG--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTC--CA-ATTCTC-GT-TTTA-AAATA-T----AGCTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-C---G--T--G--ATTTTT
gi|74490                      :                                       aTTTC-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--A-G--A-TC-AA--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-T-T--G--T----GA-T-T---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-A-G--C---GA-TATACTAG-T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-GG-A------------CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTG-AAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-
gi|74491                      :                                       aTTTC-TA-T-CG-AT--T-T-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-AG--T-A-TT-G----T-T-T-------T--C-TT---T-C-G-A-T-----T----CA-T-C---A-AA-T--C-T-A-AA------C---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTA-AA-A--T-G-T-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-A--TTTA-AAATG-T----A-CTT-G-T-CT------AG--CA-TG-T-AA--T-TT---T-GC--T--AA--C-T-GA-CATGG--T--G--TTTTTT
gi|74492                      :                                       aTTTC-TAAT-CT-AT--TAT-C--G-ATAGACG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-TATAA-AA-T--C-T-G-AA------A---TGGCAA-G-A-A--CA--GA-TATAATAC-T--------A-----C-CCG-AA-A--C-T-A-AA-G--TAT---------------------------AT-TTTA-AAAGA------A-ATT-G-A-CTG-----AA--AA-TG-T-CT--T-
gi|74493                      :                                       aTTTT-TA-T-CA-AT--T-T-T--G-AT---CG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-C--G--T----GC-T-C---A-AA-T--C-T-G-AA------A---T----A-T-T-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC-AT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--T--TTTTTT
gi|74494                      :                                        TTTT-TG-TGCA-AT--T-T-C--G-AT---CG--G-G--C-TT-GG--T-----------------------------------------------T---------C---A-AA-T--T-A-G-AA------A---A----A-T-C-G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTG-AA-T--T-T-T-GA-T--TAC-T--T--CA---TTT--CA-GTT-TC-TT-TTTA-ACATA-C----A-TTT-T-T-CC------AA--CA-TA-TCCT--T-TT---T-TC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTCTTT
gi|74495                      :                                         TTC-TA-T-CA-AT--T---C--G-AT----A--A-G--A-TC-AG--T---CT-T----T-T-T-------TTTC-TC---T-C-G-C-T--G--------A-A-C---T-AA-T--GAT-G-AA------A---A----A-T-ATG--C---GA-GA-------T--------A-----A-TGA-AA-A--C-T-A-AA-A--CAT-T--TA-CA---TTT--CA-ATT----AT-TTAA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CG-TG-T--T--G-TC---A-T---T--AA--T-T-AA-T---C--T--G--TGTTTT
gi|74496                      :                                               -T-CATAT--T-T-C--G-TT---CC--G-T--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-TA--A-AA-T--T-T-G-AC------A---T----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T--TA-AA-A--T-T-A-AG-A--CAT-T--G--CA---TTT--C--ATT-TCGTT-TTTA-AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA--G-T--T--T-TC---T-TCT-T--AA--T-T-tt
gi|74497                      :                                                   A-AT--T-A-T--G-AT---TG--G-G--A-TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-----------------------C-T-----------A-A-T---G----T--T-T-G-A-----------T----A-T-A-A--C---AA-TA-------T--------A-----T-TTG-AA-A--T-T-T-GG-T--CAT-T--T--CA---TTT--TA-ATT-TC-TT-TTTA-GAATA-
gi|74498                      :                                                          -T-T--G-AT---CGTGG-G--A-TC-GGGGT-A-AT-C----T-T-T-------T--T-CC---T-C-G-T-C----------------------A-T--C-TAG-AATT----A---T----A-T-A-A--C---GA-TA-------TTAATGATTA-----T-CTG-AA-A--T-TTG-GG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA--TT-TC--T-TTTA-AAGTA-T----A-CT--G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T------TCT-AA-A---C--T--G--TGTTTT
gi|74499                      :                                                                                 -TC-GG--T-A-CT-T----T-T-T-------T--C-TC---T-C-G-C-T--G--T----GA-A-TG--A-AA-T--C-T-G-AA------AAA-T----AAT-A-G--C---AAATA-------T--------AG----T-CTG-AAGA--TAT-AGAG-A--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-GT-TTTA-AAATA-TA---A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TT---TATT--TA-AA--T-T-AA-C---C--T--G--TTTTT
gi|74500                      :                                                                                                                                                  -C---A-AA-T--T-T-G-AA------A--------A-T-A-G--C---AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T-T-GG-C--TAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TT-TT-TTT---AAT--T----A-TTT-C-T-C-------GA--CA-TA-T-CT--T-TT---T-CC--T--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTTTT
gi|74501                      :                                                                                                                                                    ---A-AA-T--T-T-G-AA------A---A----A-T-C-G--CC--AA-TA-------T--------T-----T-CTA-AA-T--T-T----G-C--TAT-T--C--CA---TTT--CA-ATT-TC-TT-TTTA-AAATA-T----A-TTT-C-T-CC------GA--CA-T--T-CT--T-TT---T-CC--A--AA--G-T-GA-C---A--T--G--TTTT
gi|74502                      :                                                                                                                                                          A-T--C-T-G-AA------AAGAT----A-T-A-G--C---GA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--A-T-A-AGGA--CAT-T--T--CA---TTT--CA-ATT-TC--T-TTTA-AAATATT----A-CTT-G-T-CT-------A--CG--G-T-CT--T-CC---T-TTAAT--AA--T-T----C---T--T--G--TTTTT
gi|74503                      :                                                                                                                                                                                                        -------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-A-A-GG-A--CAT-T------------T--CA-ATT-TC-TT-TTTA-TAATA-C----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-TC---T-TC--T--AT--C-T-AA-C---C--T--G--TTTTCT
gi|74504                      :                                                                                                                                                                                     acatttcnatactagA-TA-------T--------A-----T-CTG-AA-A--T-G-A-AT-A--AAG-T--T--CA---TTT--CA-ATT-CC-C-------AAATA-T----A-CTT-G-T-CT------AA--CA-TG-T-CT--T-AC---T-TC--T--AA--C-T-AA-C---C--T--GAATTTT