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Alignments
lowQualScore : 1111 11111111111111 1 11
lowQualScore : 8 1 11 0 0 1111 11 33333 0 3333333333 11 111 22222 0 2222 1 1 1 222 2222 4444 3 55555555555555 6 1 5 77 5 0 33 3 2 3 3
lowQualScore : . . .. . . .... .. ..... . .......... .. ... ..... . .... . . . ... .... .... . .............. . . . .. . . .. . . . .
lowQualScore : 3 6 88 9 9 9999 22 22222 9 9999999999 22 666 33333 9 8888 0 0 0 555 3333 9999 3 00000000000000 5 4 0 99 7 0 88 2 5 2 2
consensus : ACTGC-T-C-GCATTC-ATGAGG-AAATGG----CTAT--CATTN----CA-ATTG----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGC-A-AA-AACATT-GGAA---TA--A-GT-AAAC------A-A-----AAAGTG-TGCCTAAAT-TTTGTATTC-TA--TGTATATATTTATGAGATCTAATCACTATTCATTAATATCTTTATGTTTGAACTTTTGACAAAGCAATAATTAGAGATTAAATCTATATTGATCTACCAGAGCGATACATGTAT
Reference ( family-435 ) : ACTGC-T-C-GCATTC-ATGAGG-AAATGG----CTAT--CATTN----CA-ATTG----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGC-A-AA-AACATT-GGAA---TA--A-GT-AAAC------A-A-----AAAGTG-TGCCTAAAT-TTTGTATTC-TA--TGTATATATTTATGAGATCTAATCACTATTCATTAATATCTTTATGTTTGAACTTTTGACAAAGCAATAATTAGAGATTAAATCTATATTGATCTACCAGAGCGATACATGTAT
gi|32803 : ACTGC-T-C-ACAGTC-ATGGGG-AAATGG----CTAC--CATTT----CA-GTTG----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGT-A-AA-AACA---GGAA---TA--A-GT-CAAC------A-A-----AAAGTG-TGCCTAAAT-TTTGTATTC-TA--TGTATATATTTATGAGATCTAATCACTATTCATTAATATCTTTATGTTTGAACTTTTGACAAAGCAATAATTAGAGATTAAATCTATATTGATCTACCAGAGCGATACATGTAT
gi|32804 : ACTGC-T-C-ACAGTC-ATGGGG-AAATGG----CTAC--CATTT----CA-GTTG----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGT-A-AA-AACA---GGAA---TA--A-GT-CAAC------A-A-----AAAGTG-TGCCTAAAT-TTTGTATTC-TA--TGTATATATTTATGAGATCTAATCACTATTCATTAATATCTTTATGTTTGAACTTTTGACAAAGCAATAATTAGAGATTAAATCTATATTGATCTACCAGAGCGATACATGTAT
gi|32805 : ACTGC-T-C-ACAGTC-ATGGGG-AAATGG----CTAC--CATTT----CA-GTTG----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGT-A-AA-AACA---GGAA---TA--A-GT-CAAC------A-A-----AAAGTG-TGCCTAAAT-TTTGTATTC-TA--TGTATATATTTATGAGATCTAATCACTATTCATTAATATCTTTATGTTTGAACTTTTGACAAAGCAATAATTAGAGATTAAATCTATATTGATCTACCAGAGCGATACATGTAT
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gi|32817 : ACTGC-AAC-ACATT----GAGGGAAATGG----ATAA--CATTA----CA-ATTG----------GTCAA--GA---T-----ATC-AACTTAAGGC-A-GA-AACA
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gi|32819 : CTGCAT-T-ACATT--ATGATG-AAATGG----CCAC--CACTA----CA-GCTG----------GTACA--GA---C-----ATC-C----AAGGC-A-GA-AACA
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gi|32824 : tgttcactgtcctgaggaaCATTC-ATGAGA-AAATGG----CTGT--CATGT----CA-ATTT----------GTAAA--GG---T-----ATC-A----AAGGC-T-AA-AAC
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gi|32836 : aCATTC-ATGAGG-AAATGA----CTAT--CAATA----CA-AATC----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGC-A-AAGAATTTT-GGAA----A--T-GT-AAAT------A-T-----A---TG-TA-ATAAAC-TTTGTATT
gi|32837 : aCATTC-ATGGGG-TAATGG----TTAT--CATTT----CA-GTGA----------GT--A--GA---T-----ATG-G----AAGTT-A-AA-AATAAT-GGAA----A--T-GTAAAAT------A-A-----ATATTGATGTCTAAATCTCTGT
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gi|32839 : cagtgCATTC-ATGAGG-AAATGGTGCCCTAT--CATTA----CA-ATTT----------GTAAA--GA---T-----ATC-A----CAGGC-A-AT-AGCA
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gi|32846 : C-ATGAGG-AAATGG----CTAT--CGTTG----CATAGTT----------GTAAC--GA---T-----ATC-A----AAGAC-A-AA-AGCATT-GGAA---
gi|32847 : GG-ACATGG----CTAT--CATTA----CA-ATTG----------ATAAA--GA---T-----ATC-A----AAGGC-A-AA-AA