lowQualScore                  :                           11                                          111                    1          11111                                                                                        2222222222222222222222222                               1111               11             
lowQualScore                  :      4   222  1 1      1  22 3333333   0    333   1     444 333  11 1 000  11   555  1   11  2  4    1  00000 11 3333333 111  1   5555   11  2  1  3333   1 1  66   1   22222 2  3  666666    444444 6666666666666666666666666      4 44    44444444 1  33   0000  1  1     2   11  555     6  
lowQualScore                  :      .   ...  . .      .  .. .......   .    ...   .     ... ...  .. . ...  ..   ...  .   ..  .  .    .  ..... .. ....... ...  .   ....   ..  .  .  ....   . .  ..   .   ..... .  .  ......    ...... .........................      . ..    ........ .  ..   ....  .  .     .   ..  ...     .  
lowQualScore                  :      7   333  3 3      2  88 7777777   9    111   1     999 444  66 1 222  55   000  1   55  7  6    1  11111 44 4444444 888  1   9999   44  1  1  3333   1 1  55   1   66666 2  2  444444    444444 0000000000000000000000000      8 22    00000000 1  55   6666  1  1     4   99  666     8  
consensus                     :    ATATTT---AG-C-GGAAAT-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACG--C--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-CG-GAAG-T---AGTCTTCC-GCCAA--------A-AT-CGCT-A--AA-AT-AAATC-CAC-NGT--AAAATATAA
Reference ( gi|90934 )        :    ATGTTT---AG-C-GGAAAT-TTC-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACA--C--AGA--C-TC--AA--TTT---AG-CGG--ATCTTTACTC-CCTC---T--T-------T---TG-TCCATT-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTA-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---T-AG-CG-GAAA-A---AGTCTTTC-ACCAA--------A-AT-TGCT-G--AA-AT-AAATC-CAC-GGT--GAAATACAA
gi|90932                      :    ATATTT---AG-C-AGAAAT-TTG-A-------TCTTCTAA---AAT-TTGACA--C--GGA--C-TT--AA--TTT---AC-TGG--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----ACC-T--TG-TTG-GTG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TTAG-TG-GAAG-T---TGTCCTTC-ACCAA--------A-AT-TTCT-A--AA-AT-AAATC-CAC-CAT--AAAATA
gi|90937                      :    ATATTT---TG-C-GGCAAT-TTG-C-------TTTGCTAA---CAT-TTGTCA--T--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TTCGTC-AAA--AT-GC-AT----GCC-C-CTA-TTG-GCG-----G-TG-TACTTCATCTTG------AT---T---T-AG-CA-GAAG-T---AGTCTTCT-GCCAA--------A-AT-TGCT-A--AA-AT-AAATCATAC-CGG--AAAATAAAAtga
gi|90944                      :    ATGTTT---AG-C-AGAAAA-TTC-A-------ATTTCTAA---CAT-TTGACG--C--AGA--T-TT--AA--TAT---AG-GGG--ATATTTACTT-CCCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCT-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---T-GT-CA-G---------------C-A--AA--------A-AC-TGCT-A--AA-AT-GAATC-CAC-AGC--AAAATATAA
gi|90940                      :    ATATTT---AG-C-AGAAAT-TTT-A-------TCGTCTAA---CAT-TTGGCG--C--GGA--C-TT--AA--TCA---AT-CA---ATC---ATCC-CCTC---T--T-------T---TG-TTCGTC-ATA--AT-AC-AT----GCC-C-CTT-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TAAG-CA-GATG-T---AGTCTTCC-GTCAA--------A-AT-CGCT-A--AA-AT-AAATC-CGC-AGT--GAAATAT
gi|90933                      :    ATATTT---AG-G-AGAAAG-TTG-A-------TATTGTAA---CGT-TTGACA--C--AGA--C-TT--AA--TTT---TG-TGT--ATGTTCACAC-CC-C---T--C-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTA-GCG-----T-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-CA-GATG-T---AGTCTTCT-GCCAA--------A-AT-CGCT-A--AA-AT-AAATC-CAC-AGT--AAAATA
gi|90936                      :    ATGTAT---AG-C-GGAAAT-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACT--T--GGAAGT-TC--A---TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------C---TG-TTTGTC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------TTTG------AT---T---T-AG-TG-G--A-C---ATTATTCC-GCC-A--------A-AT-CGCT-A--AA-CT-AAATC-CTC-AGT--AAAATATAAt
gi|90941                      :    ATATTT---AG-C-GGAAGT-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACT--C--GGA--C-TT--AA--TTT---GG-GGG--ATTTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TCTGTC-ATA--AT-AC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTGA-----A----T---A-AG-CA-GAAG-T---AGT-TCTC-GCCAA--------A-AT-
gi|90935                      :    ATATTT---CG-C-AGAAAT-TTG-A-------TTTTCTGA---CAT-TTGACA--T--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-CGG--TTGTCCACTC-C-TCAAAT--T-------T---TG-TCCGTC-AAA--AT-GC-AT------C-C-CTT-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-CG-GAAG-T---AGTCTTCC-ACCAA--------A-AT-CGCC-A--AA-AT-AAAcctcagtaaattataattcgtttacagtaa
gi|90938                      :    ATATTT---TG-C-GGCAAT-TTG-C-------TTTGCTAA---CAT-T-GTCG--T--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CC-C---T--T-------T---TG-TTCGTC-AAA--AT-GC--T----GCC-C-CTA-TTG-GCG-----G-TG-TACTTCATCTTG------AT---T---T-AG-CA-GAAG-T---AGTCTTCT-GCCAA--------A-AT-TGCT----AA-AT-AAATCATAC-CGG--AAAATAAAAatacatgtacagtaga
gi|90949                      :    ATATTT---AG-C-GGAAAT-ATT-A-------TTT-CTAA---CAT-TTGAC----------------------------G-CGG--ATGTTCGCTA-TCCC---T--T-------T---TA-TCCATC-ATA--AG-GC-GT----GCC-C-CTA-TAA-GCG-----G-TG-TA------CTTGATTTTAA----T---T-AG-TG-GAAGTAGCTAGTCTTCC-ATCAA--------A-AT-TGCT-A--TA-AT-AAATT-CAC-AGT--AAAATATAA
gi|90946                      :    ATATTT---AG-C-AGAAAT-TAG-A-------TTTTGTAA---CAT-TTGACA--C--GAG--C-TT--AA--TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TCTGCG-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----A-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-C
gi|90954                      :    ATATTT---AG-T-GGAA-T-TTA-A-------TTTTCTAA---CAT-TTAATG--C--AGA--C-GT--AA--TTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-TCAC---T--T-------T---TG-TCCATC-ATA--AT-TT-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTA------AT---T---T-AG-C
gi|90945                      :    ATATTT---AG-C-GGAAAT-TCT-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGATG--C--GTA--C-TT--AA--TTT---A----------------C-CCT----T--T-------T---TG-TCCGTC-ATC--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-CTG-GGG-----G-TG-CA------CTTG------ATT--T---T-A--CG-GAAG-T---AGTTTTCC-TTCAA--------C-AT-CGCT-A--AA-AT-AAATC-CAC-
gi|90948                      :    ATATTT---AT-C-GGCGAT-TAA-A-------TTTTCTCA---CAT-TTGATG--C--GGG--C-TT--GA--TTT---AG-CGG--ATGCTTAGTC-TCCA---T--T-------A---TG-TCTCTC-ATA--AT-GT-AT----GCC-C-CTA-TAG-GTG-----G-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-CG-GAAG-T---ATTCTTCC-GCCA----------------------GA-AT-GAATC-TAC-TGT--AAAATATAA
gi|90950                      :    ATATTT---GA-CTGGAAAT-TTG-A-------TCTTCTAA---CAT-TTGACA--C--AGA--C-TTTTAA--ATT---AG-TAA--ATGTTCACTC-CCCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-AC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------GTTG------A----T---T-
gi|90947                      :    ATATTT---AG-C-AGAAAT-TTA-AAAAAAAATTT----G---CAT-TAAACG--C--GGA--T-TT--AA--TTT---AG-CGA--ATGTTCACCC-CCCC---C------------------CCATC-ATA--AT-GC-AT----TCC-C-CTG-TTG-GCG-----A-TG-TA------TTTA------AT---T---T-AG-CA-G----T---AGTCTACC-AACAA--------A-AT-TGCT-A--AA-AT-AAATC-CAA-AGT--AAAATAT
gi|90939                      :    ATATTT---AG-C-GGAA---TTG-A-------TTT---AA---C-T-TTGATG--C--GGA--C-TT--AA--TTT---TG-CAG--ATGTTCACTC-CCCC---T--TAAAGCTTT---TG-TCCGTC-ATA--AT-AC-AT----GCC-T-CTG-TTA-GCA-----G-TG-TA------CT-A------A----T-----------GA---------TCTTCC-GCCAA--------A-AT-CGCT-A--CA-AT-AAATC-TAC-CGT--AAAATA
gi|90955                      :    ATATTT---AG-C-TGAAAC-TGT-A-------TTGTCTTA---CAT-TTGACG--C--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-TGG--ATGTTCACTC-CC-C---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GT-GT----ACC-C-CTT-TTG-GCG-----G-TG-TA------Cgtaa
gi|90953                      :    ATATAT---AG-C-AGACAT-TTA-A-------GTTTCGAA---GAT-TTGACG--C--GAA--C-TT--AA--GTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CCAA---A--T-------T---TG-TCC--T-ATA--A--GG-AT----GCC-C-CTG--TG-GCG-----G-TGTTA------C-TG------AT---T---T-AG-CG-AAAA-GC--AGTATTCC-G-GAA--------A-AT-TGCT-T--AA-ATAAAATT-CAC-
gi|90943                      :    ATATTG---AG-C-AGAAAT-TTG-A-------TTTTTTAA---CAT-TTGACG--T--AGA--C-TT--AT--TTT---AG-CAG--ATGTTTGCTC-CCCC---T--T-------T---TT-TCCGTC-ACA--AA-GC-AT----GCC-C-CAG-TTG-GTG-----G-TG-T
gi|90957                      :    ATATTTTACAG-C-GGAAAT-TTG-C-------TTTTTTAAAAACAT-TTCACA--C--AGA--C-TT--GA--TTT---AG-CGG--ATGTTCAGTC-CCGC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCC-gatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctggtgtacttgatttagtgaaagtagtgttccgccaaaattgctaaaataatccacagtaaaatataa
gi|90958                      :    ATATTT---AG-C-AGAAAA-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGAC
gi|90959                      :     TATTT---TG-C-GGAAAT-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACG--T--GGA--C-TT--AA--TTTTATAG-AGG--ATGTTCACTC-CCCA---T--A-------G---AA-TAAACA-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTG-GCA-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TTAG-CG-GAAA-T---AGTCCTCC-GCCAA--------A-AT-CGCT-G--AA-AT-AAATC-CAC-TGT--GA
gi|90960                      :     TATTT---AG-T-AGAAATATTG-A-------CTTTCTAA---CAT-TTGACG--C--TGA--C-T--------------G-TG----CCCTT--TC-CCTG---T--T------------G-TCCGTC-ATA--AT-AC--------TC-C-CTA-TTG-GCG-----G-TG-TA------TTTG------A----T---TTAG-CG-GAAG-T---TGTCTTCC-GCCAA--------A-GT-TGCT-A--AA-AT-AAAT--CACTAGT--AAAATATAAcagtaaaatataa
gi|90962                      :     TATCT---AG-C-GGAAAT-TTA-A-------TTTTATAA---CAT-TTGACG--C--GAA--C-TT--CA--CTA---AG-CGG--ATGTTCACTCTCCCC---T--G-------T---TA-TTTGCC-ACA--TT-GT-AT----GCC-C-CTA-TAG-ACG-----
gi|90952                      :       TTT---AG-T-GAAAAT-TTG-A-------TTT-CTAA---ACT-TTAATG--T--GGA--CCTT--TA--TTT---AG-TGG--ATGTTCACTC-CACA---T--T-------A---TG-TCTGTC-ATA--ATTGCCGT----ACC-C-CTG-TTA-GTG-----G-TG-TA------TTTG------A----TTATT-AG-CGCGAAG-G---AGTCTTCCGGCCAA--------A-AT---------A-----AAATC-CAC-CAT--AAAATA
gi|90963                      :   atatTTT---AG-C-GGAAAT-TTG-A-------TTT-CGAA---ATT-TTGACA--C--AGA--C-TT--AA--TTT---AG-CTG--ATGTTTACTC-CCAT---T--T-------T---TG-TACCTC-ATA--AC--C-AT----GCC-C-CTG-TTG-AC
gi|90956                      :      aTTT---AGGT-GCAAAT-TGCGA-------TGTTC-AA---TATATTGACG--CCAAGA--C-TT--AA--TTTTCTAG-TGGCGATGTTCACTC-TCAA---T--T-------T----G-TCCATC-ATA--AT-GC-CT----GCCAC-CTGTTTGCGCG-----GCTG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-TT----------AGTCTTCC-GCCAA--------C-ATCCGCT-A--TA-GT-AAATC-CCC-TGT--AAAATATAA
gi|90942                      :     atatT---AG-C-AGAAAT-TCG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGATG--T--GGA--C-TT--CA--TTC---CG-TGG--ATGTTCACTT-CCCC---T--T-------T---TG-TCCATC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-TTA-GCG-----G-GG-TC------CTTG------AT---T---T-AG-CA-G----T---AGTCTTCC-GTCAA--------A-AT-CGCC-GTAAA-AT-
gi|90951                      : atattttaT---AG-C-GAAAAT-TTC-A-------TTCTCAAA---CAT-TTGACG--C--GGA--C-TT--A---TTT---AA-TTG--ATGTTCACTC-CTCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-TT----GCC-C-CTG-TTG-GCAAATACA-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-------------AG--------CCAA--------A-AT-TGCT-------AT-TAATG-CAC-CGT--AAAATAT
gi|90964                      :     acatg---AG-C-AGAAAT-TTG-A-------TTTT-TAAT--CAT-TTGCCG--T--AGA--C-TT--AT--TTT---AG-CAG--ATGTTTGCTC-CCCC---T--T-------T---T--TCCGTC-ACA--AA-GC-AT----GCC-
gi|90965                      :                   GAAAT-TTG-A-------TTTTCTAA---CAT-TTGACG--C--AGA--C-T--------TT---AG-TTG--ATGTTCACTT-CC-------------------------CATT-ATG------------------T-CTG-TTA-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TTAA-CA-GAAA-T---AGTCTTCC-GTCAA--------A-AT-CGTT-A--AA-AT-AAATA-CAC-AGT--AAAATATAAgagttggggtggtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctggtggtacttgatttagtgaaagtgagtgttccgccaaaattgctaaagataatcacagtaaaatataa
gi|90966                      :                   GACAT-TTG-A-------TTT-CTAA---T-T-TTGATGAGC--GGA--C-TT--TACTTTT---AGTCGG--ATGTCCACTT-CCT-------T-------T---TG-TCCGGT--CA--GC-GC-ATT---GCC-CTCTAATTA-GCG-----G-TG-TA------CTTG------GAGTTT---T-AGTCG-GAAG-T---TATACTTC-ATTAGCCTCCCCTA-AT-CGCT-A--AA-AT-AATTC-CAC-TGT--
gi|90968                      :                              -------TTGTCTAA---TAT-TTGACA--C--AGA--C-TT--AA--CTT---AG-CGG--ATGTTCACTC-CC-C---TAAT-------TAACTG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCT-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TAAG-TG-GAAG-T---AGTCTTCC-TCCAA--------A-AT-CACT-A--AA-AT-AAATC-CAC-CGT--ATAATGTAAacaaca
gi|90969                      :                              -------TTTCCTAA---CAT-TTGATG--C--GGA--C-T-------TTT---AG-TGG--ATACTCACTC-CCCC---T--T-------T---TT-ACCATC-ATATTAT-GC-AT----TCT-A-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------AT---T---T-AG-CG-GAAG-T---ATCCTTCC-GCCAA--------A-AT-CGCT-A--AA-AT-AAACC-CAC-CAT--AAAATATAA
gi|90970                      :                                      TTTCTAA---CAT-TTAACA--C--GGA--C-TT--AA--TTT---AG-CAG--ATGATCACCC-CTCC---T--T-------T---TG-TCCGTC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CTG-CTG-GCG-----G-TG-TA------CTTA------AT---T---T-AG-CG-GAAG-C---AGTTTTCC-GCCAA--------A-AC-CGTT-A--AA-AT-AAATC-CAC-AGT--AAAATAT
gi|90967                      :                                                                        --AA--TTTG--AG-CGG--AAATG-ACCC-CCAC---A--T-------T---TGATCCGCTCATA--ATCAC-ATTTCCACC-C-CTG-TTG-GCG-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TGAG-CG-GCAA-T---AGTCTTCC-GCCAA--------A-AT-CCCA-A--AA-AT-AAATC-CA-------AAAATATAA
gi|90972                      :                                                             tgattttctcaatagtgaggtggacagtgtaaTCTTT---C-TTTT---T--T-------T---TG-TTC--T-GTC--AG-G--AT----GCC-C--TG-TTG-GCG-----GTTGTTA------CTTG--------------------------------AATCTGTC-GCCAG--------ATAT-CGCTAA--AA-AT-AATCC-CAC-AGTTAGAGATA
gi|90973                      :                                                                                                tgtCTC-CCCT---T--T-------A---TG-TCCGAC-ATA--AT-GC-AT----GCC-C-CAT-TTA-GCG-----G-TG-TA------CTTG------AT---T---T-TG-TG-GA-----------TTCT-ACTAA--------A-AT-CGTT----AA-AT-AAATC-CAC-TGT--AAAATAT
gi|90943                      :                                                                                                                                                                        G-----G-TG-TA------CTTG------A----T---TTAG-TG-AAAG-T---AGTGTTCC-GCCAA--------A-AT-TGCT-A--AA-AT--AATC-CAC-AGT--AAAATATAA
gi|90964                      :                              atattgagcagaaatttgattttttaacatttgacgtagacttattttagcagatgtttgctcccccttttttccgtcacaaagcatgccccagttggtggtgtgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctG-----G-TGGTA------CTTG------A----T---TTAG-TG-AAAGTG---AGTGTTCC-GCCAA--------A-AT-TGCT-A--AAGAT-AA--T-CAC-AGT--AAAATATAA
gi|90974                      :                                   agcagaaatttgatttttaatcatttgccgtagacttattttagcagatgtttgctccccctttttccgtcacaaagcatgccgagttggggtggtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttct-----G-TG-TT------CTCG------A----T---TTAG-CG-AAAA-T---AGTACTCC-ACCAA--------A-GT-CGTT-G--AA-AT-ACATC-CAA-AGT--AAAATATAA
gi|90975                      :                                                                                                                                                                                                                    G-GAAG-T---AGTCTTCC-GCCAA--------T-AT-TGCT-A--AA-AC-AAATC-CAC-CGT--AAAATATAA
gi|90976                      :                                                                                                                                                                                                                        AA-T---AGTCTTCC-ACCAA--------A-AT-CACT-A--AA-AC-AAACC-CAC-CGT--AAAATATAA
gi|90961                      :                                                                                                                                                                                                                            ---AATCTTCC-GCCAA--------A-AT-CGCT-G--AA-AT-AAATC-CAC-AAT--GAAATA
gi|90977                      :                                                                                                                                 tacttagataaacttgatatttctaagacaccttaatgtgatttaattttctgtgtgtaaaaattgttttttgttagtgtttagagggtccttaagtCTTCC-GCCAA--------A-AT-AGCT-A--AA-AT-AAATT-CAC-AGT--ATAATATAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|90971 ): TTTAATGGATGTTAACTCCCCAATTTTGACTGTAATAATGCATAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 777   1      1 1   3333333      1  222   1      11 11   1 22 1 11  22   444  1   11 11         1   22222  4444444   1   1 2     11 1 1 1   3333   1 1   1  1 1   22222 1 1 2 1 333333   333333  111 44444    1  2 333333   2222 66666666666              1   1  3333 1   22  2     444   22  333333      1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 ...   .      . .   .......      .  ...   .      .. ..   . .. . ..  ..   ...  .   .. ..         .   .....  .......   .   . .     .. . . .   ....   . .   .  . .   ..... . . . . ......   ......  ... .....    .  . ......   .... ...........              .   .  .... .   ..  .     ...   ..  ......      .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 333   2      2 1   5555555      1  999   1      55 55   1 66 1 55  99   777  1   44 44         0   66666  6666666   0   0 0     44 0 0 0   1111   0 1   1  1 1   55555 0 0 1 1 111111   222222  999 22222    1  3 333333   4444 44444444444              1   1  8888 1   66  2     333   66  555555      2   
consensus                     :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
Reference ( family-429 )      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
gi|90932                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---AAT-TTGACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AC-TGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----A-C-C-TTG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-G------AAG----T-----------TGTCCTTCACCAAA-ATT-TC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CAT------AAAATA-TGA
gi|90933                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGG-AGAAAG-T-TGA-------TATTGT-AA---CGT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---TG-TGT--A--TGTTCAC-A-CCC--C--TC-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----T-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-
gi|90934                      :                                                                                                                                           ATGTTT---AGC-GGAAAT-T-TCA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-C--AA--TTT---AG-CGG--A--TCTTTACTC-CCT--C--TT-------TTG-TCC-A-TTATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---------TTAG-CG-G------AAA----A-----------AGTCTTTCACCAAA-ATT-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-GGT------GAAATA-CAA
gi|90935                      :                                                                                                                                           ATATTT---CGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-GA---CAT-TTGACA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--T--TGTCCACTC-CTCAAA--TT-------TTG-TCC-G-TCAAA--A-T-G-CAT------C-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-GC----C-AAA--AT-AAA
gi|90936                      :                                                                                                                                           ATGTAT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--T--GGA-AG-T-T--CA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------CTG-TTT-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-TG-G------A------C-----------ATTATTCCGCC-AA-ATC-GC----T-AAA--CT-AAATC---CTC-AGT------AAAATA-TAAatacatgtacagtaga
gi|90937                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-TTGTCA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-ACTTCATCTT------GA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90938                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-T-GTCG--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC-----TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-C-T----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTTCATCTTGA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T--AA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90939                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAA---T-TGA-------TTT----AA---C-T-TTGATG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---TG-CAG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TTAAAGCTTTTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-T-CTG-TT-A-GCA-----G-T-G-T-A------CT----------------------------------AA----T-----------GATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-ACA--AT-AAATC---TAC-CGT------AAAATAGTAA
gi|90940                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TTA-------TCGTCT-AA---CAT-TTGGCG--C--GGA-C--T-T--AA--TCA---AT-CAA--------TCATCC-CCT--C--TT-------TTG-TTC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CGC-AGT------GAAATA-TA
gi|90941                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAGT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---GG-GGG--A--TTTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---A-----TAAG-CA-G------AAG----T-----------AGT-TCTCGCCAAA-ATC--CTCAGT-AAATTAT-AATTCGTTTAC-AGT------AA
gi|90942                      :                                                                                                                                           ATATTTTATAGC-AGAAAT-T-CGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--T--GGA-C--T-T--CA--TTC---CG-TGG--A--TGTTCACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----G-G-G-T-C------CTT------GA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GCCG--T-AAA--AT-
gi|90943                      :                                                                                                                                           ATATTG---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTTT-AA---CAT-TTGACG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TTT-TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-C-CAG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-
gi|90943                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----T-----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT--AATC---CAC-AGT------AAAATA-TAAgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctggtgtacttgatttagtgaaagtagtgttccgccaaaattgctaaaataatccacagtaaaatataa
gi|90944                      : atattgagcagaaatttgattttttaacatttgacgtagacttattttagcagatgtttgctcccccttttttccgtcacaaagcatgccccagttggtggtgtgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctATGTTT---AGC-AGAAAA-T-TCA-------ATTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-T--T-T--AA--TAT---AG-GGG--A--TATTTACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----T--G-----------------------------------TCAGCAAAA-ACT-GC----T-AAA--AT-GAATC---CAC-AGC------AAAATA-TAA
gi|90945                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-CTA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--C--GTA-C--T-T--AA--TTT---A--------------------CCC--T--TT-------TTG-TCC-G-TCATC--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GGG-----G-T-G-C-A------CTT------GA---T-----TTTA-CG-G------AAG----T-----------AGTTTTCCTTCAAC-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-
gi|90946                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-AGA-------TTTTGT-AA---CAT-TTGACA--C--GAG-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-CGATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-C
gi|90947                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TAAAAAAAAATTT-----G---CAT-TAAACG--C--GGA-T--T-T--AA--TTT---AG-CGA--A--TGTTCACCC-CCC--C--C-------------CC-A-TCATA--A-T-G-CAT----TCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------TTT------AA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTACCAACAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAA-AGT------AAAATA-TA
gi|90948                      :                                                                                                                                           ATATTT---ATC-GGCGAT-T-AAA-------TTTTCT-CA---CAT-TTGATG--C--GGG-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGCTTAGTC-TCC--A--TT-------ATG-TCT-C-TCATA--A-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATTCTTCCGCC----------------AGA--AT-GAATC---TAC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90949                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-A-TTA-------TTT-CT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA------------------------------TGTTCGCTA-TCC--C--TT-------TTA-TCC-A-TCATA--A-G-G-CGT----GCC-C-CTA-TA-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---TTTTAATTAG-TG-G------AAGTAGCT-----------AGTCTTCCATCAAA-ATT-GC----T-ATA--AT-AAATT---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90950                      :                                                                                                                                           ATATTT---GACTGGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-TTTAA--ATT---AG-TAA--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------GTT------GA---T-----T
gi|90951                      :                                                                                                                                           ACATGT---AGC-GAAAAT-T-TCA-------TTCTCA-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--A---TTT---AA-TTG--A--TGTTCACTC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CTT----GCC-C-CTG-TT-G-GCAAATACA-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTA-----G------A--------------------------GCCAAA-ATT-GC----T------AT-TAATG---CAC-CGT------AAAATA-TA
gi|90952                      :                                                                                                                                           ATATTTT--AGT-GAAAAT-T-TGA--------TTTCT-AA---ACT-TTAATG--T--GGACC--T-T--TA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACTC-CAC--A--TT-------ATG-TCT-G-TCATA--ATT-GCCGT----ACC-C-CTG-TT-A-GTG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---TTA---TTAG-CGCG------AAG----G-----------AGTCTTCCG----------GC----C-AAA--ATAAAATC---CAC-CAT------AAAATA-
gi|90953                      :                                                                                                                                           ATATAT---AGC-AGACAT-T-TAA-------GTTTCG-AA---GAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--AA--GTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCA--A--AT-------TTG-TCC----TATA--A---G-GAT----GCC-C-CTG--T-G-GCG-----G-T-GTT-A------C-T------GA---T-----TTAG-CGAA------AAG----C-----------AGTATTCCG-GAAA-ATT-GC----T-TAA--ATAAAATT---CAC-
gi|90954                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGT-GGAA-T-T-TAA-------TTTTCT-AA---CAT-TTAATG--C--AGA-C--G-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-TCA--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-T-TAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-C
gi|90955                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-TGAAAC-T-GTA-------TTGTCT-TA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACT--CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-TGT----ACC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------C
gi|90956                      :                                                                                                                                           ATATTTTA-GGT-GCAAAT-TGCGA-------TGTTC--AA---TATATTGACG--CCAAGA-C--T-T--AA--TTTTCTAG-TGGCGA--TGTTCACTC-TCA--A--TT-------T-G-TCC-A-TCATA--A-T-G-CCT----GCCAC-CTG-TTTGCGCG-----GCT-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-T----------------T-----------AGTCTTCCGCCAAC-ATCCGC----T-ATA--GT-AAATC---CCC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90957                      :                                                                                                                                           ATATTTTACAGC-GGAAAT-T-TGC-------TTTTTT-AAAAACAT-TTCACA--C--AGA-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCAGTC-CCG--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-
gi|90958                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAA-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGAC
gi|90959                      :                                                                                                                                            TATTT---TGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--T--GGA-C--T-T--AA--TTTTATAG-AGG--A--TGTTCACTC-CCC--A--TA-------GAA-TAA-A-CAATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCA-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAA----T-----------AGTCCTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-TGTGACAGTAAAATA-TAA
gi|90960                      :                                                                                                                                            TATTT---AGT-AGAAATAT-TGA-------CTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--TGA-C--T--------------------------GTGCCCTT-TCC--C--TG-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-C-------TC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------TGTCTTCCGCCAAA-GTT-GC----T-AAA--AT-AAAT----CACTAGT------AAAATA-TAA
gi|90961                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---T-----TTAG-AG-GGTCCTTAAG----T-----------AATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-AAT------GAAATA-
gi|90962                      :                                                             tacttagataaacttgatatttctaagacaccttaatgtgatttaattttctgtgtgtaaaaattgttttttgttagtgTATCT---AGC-GGAAAT-T-TAA-------TTTTAT-AA---CAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--CA--CTA---AG-CGG--A--TGTTCACTCTCCC--C--TG-------TTA-TTT-G-CCACA--T-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-ACG-----
gi|90963                      :                                                                                                                                             ATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTT-CG-AA---ATT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CTG--A--TGTTTACTC-CCA--T--TT-------TTG-TAC-C-TCATA--A-C---CAT----GCC-C-CTG-TT-G-AC
gi|90964                      :                                                                                                                                                 ---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTT-T-AAT--CAT-TTGCCG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TT--TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-G-A-G-TT-G-G-G-----G-T-G-
gi|90964                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-GGT-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----TG----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAAG-AT-AA--T---CAC-AGT------AAAATA-TAAgtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctggtggtacttgatttagtgaaagtgagtgttccgccaaaattgctaaagataatcacagtaaaatataa
gi|90965                      :                   agcagaaatttgatttttaatcatttgccgtagacttattttagcagatgtttgctccccctttttccgtcacaaagcatgccgagttggggtggtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-C--T-T--------T---AG-TTG--A--TGTTCACTT-CCC--A--TT-------ATG-TC-------------------------------TG-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAA-CA-G------AAA----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GT----T-AAA--AT-AAATA---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90966                      :                                                                                                                                                         GACAT-T-TGA-------TTT-CT-AA---T-T-TTGATGAGC--GGA-C--T-T--TACTTTT---AGTCGG--A--TGTCCACTT-CC------TT-------TTG-TCC-GGTCA----G-C-G-CATT---GCC-CTCTAATT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GGAGTT-----TTAGTCG-G------AAG----TTATACTTCATTAGCCTCCC-CTAA---TC-GC----T-AAA--AT-AATTC---CAC-TGT------ACAACA-
gi|90967                      :                                                                                                                                                                -TGA-------TTTTCTCAA---TAG-T-GAGG--T--GGA-CAGTGT--AAAATTTG--AG-CGG--AAATG---ACCC-CCA--C--AT-------TTGATCC-GCTCATA--A-TCA-CATTTCCACC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TGAG-CG-G------CAA----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-CC----A-AAA--AT-AAATC---CA-----------AAAATA-TAA
gi|90968                      :                                                                                                                                                                    -------TTGTCT-AA---TAT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--CTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--TAATTAA-----CTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-TG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCTCCAAA-ATC-AC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CGT------ATAATG-TAA
gi|90969                      :                                                                                                                                                                    -------TTTCCT-AA---CAT-TTGATG--C--GGA-C--T-T-------TT---AG-TGG--A--TACTCACTC-CCC--C--TT-------TTT-ACC-A-TCATATTA-T-G-CAT----TCT-A-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATCCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAACC---CAC-CAT------AAAATA-TAA
gi|90970                      :                                                                                                                                                                            TTTCT-AA---CAT-TTAACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CAG--A--TGATCACCC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-CG-G------AAG----C-----------AGTTTTCCGCCAAA-ACC-GT----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-TA
gi|90971                      :                                                                                                                                                                                                                    --TTT---AA-TGG--A--TGTTAACTC-CCCA-A--TT-------TTG-ACT-G-TAATA--A-T-G-CAT----AC
gi|90972                      :                                                                                                                                                                                                                                     --TGTTCTTTC-TTT--T--TT-------TTG-TTCTG-TCAGG--A-T-G-C----------C-CTG-TT-G-GCG-----G-TTG-TTA------CTT------GA--------------------------------------------ATCTGTCGCCAGATATC-GC----TAAAA--AT-AATCC---CAC-AGT------TAGAGA-TA
gi|90973                      :                                                                                                                                                                                                                                             CTC-CCC--T--TT-------ATG-TCC-G-ACATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CAT-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTTG-TG-G------A----------------------TTCTACTAAA-ATC-GT----T--AA--AT-AAATC---CAC-TGT------AAAATA-TA
gi|90974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----G-T-G-T-T------CTC------GA---T-----TTAG-CG-A------AAA----T-----------AGTACTCCACCAAA-GTC-GT----T-GAA--AT-ACATC---CAA-AGT------AAAATA-TAA
gi|90975                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAT-ATT-GC----T-AAA--AC-AAATC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90976                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-AC----T-AAA--AC-AAACC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90977                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCCGCCAAA-ATA-GC----T-AAA--AT-AAATT---CAC-AGT------ATAATA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 777   1      1 1   3333333      1  222   1      11 11   1 22 1 11  22   444  1   11 11         1   22222  4444444   1   1 2     11 1 1 1   3333   1 1   1  1 1   22222 1 1 2 1 333333   333333  111 44444    1  2 333333   2222 66666666666              1   1  3333 1   22  2     444   22  333333      1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 ...   .      . .   .......      .  ...   .      .. ..   . .. . ..  ..   ...  .   .. ..         .   .....  .......   .   . .     .. . . .   ....   . .   .  . .   ..... . . . . ......   ......  ... .....    .  . ......   .... ...........              .   .  .... .   ..  .     ...   ..  ......      .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 333   2      2 1   5555555      1  999   1      55 55   1 66 1 55  99   777  1   44 44         0   66666  6666666   0   0 0     44 0 0 0   1111   0 1   1  1 1   55555 0 0 1 1 111111   222222  999 22222    1  3 333333   4444 44444444444              1   1  8888 1   66  2     333   66  555555      2   
consensus                     :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
Reference ( family-429 )      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
gi|90932                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---AAT-TTGACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AC-TGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----A-C-C-TTG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-G------AAG----T-----------TGTCCTTCACCAAA-ATT-TC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CAT------AAAATA-TGA
gi|90933                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGG-AGAAAG-T-TGA-------TATTGT-AA---CGT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---TG-TGT--A--TGTTCAC-A-CCC--C--TC-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----T-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-
gi|90934                      :                                                                                                                                           ATGTTT---AGC-GGAAAT-T-TCA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-C--AA--TTT---AG-CGG--A--TCTTTACTC-CCT--C--TT-------TTG-TCC-A-TTATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---------TTAG-CG-G------AAA----A-----------AGTCTTTCACCAAA-ATT-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-GGT------GAAATA-CAA
gi|90935                      :                                                                                                                                           ATATTT---CGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-GA---CAT-TTGACA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--T--TGTCCACTC-CTCAAA--TT-------TTG-TCC-G-TCAAA--A-T-G-CAT------C-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-GC----C-AAA--AT-AAA
gi|90936                      :                                                                                                                                           ATGTAT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--T--GGA-AG-T-T--CA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------CTG-TTT-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-TG-G------A------C-----------ATTATTCCGCC-AA-ATC-GC----T-AAA--CT-AAATC---CTC-AGT------AAAATA-TAAatacatgtacagtaga
gi|90937                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-TTGTCA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-ACTTCATCTT------GA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90938                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-T-GTCG--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC-----TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-C-T----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTTCATCTTGA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T--AA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90939                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAA---T-TGA-------TTT----AA---C-T-TTGATG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---TG-CAG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TTAAAGCTTTTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-T-CTG-TT-A-GCA-----G-T-G-T-A------CT----------------------------------AA----T-----------GATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-ACA--AT-AAATC---TAC-CGT------AAAATAGTAA
gi|90940                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TTA-------TCGTCT-AA---CAT-TTGGCG--C--GGA-C--T-T--AA--TCA---AT-CAA--------TCATCC-CCT--C--TT-------TTG-TTC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CGC-AGT------GAAATA-TA
gi|90941                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAGT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---GG-GGG--A--TTTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---A-----TAAG-CA-G------AAG----T-----------AGT-TCTCGCCAAA-ATC--CTCAGT-AAATTAT-AATTCGTTTAC-AGT------AA
gi|90942                      :                                                                                                                                           ATATTTTATAGC-AGAAAT-T-CGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--T--GGA-C--T-T--CA--TTC---CG-TGG--A--TGTTCACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----G-G-G-T-C------CTT------GA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GCCG--T-AAA--AT-
gi|90943                      :                                                                                                                                           ATATTG---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTTT-AA---CAT-TTGACG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TTT-TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-C-CAG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-
gi|90943                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----T-----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT--AATC---CAC-AGT------AAAATA-TAAgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctggtgtacttgatttagtgaaagtagtgttccgccaaaattgctaaaataatccacagtaaaatataa
gi|90944                      : atattgagcagaaatttgattttttaacatttgacgtagacttattttagcagatgtttgctcccccttttttccgtcacaaagcatgccccagttggtggtgtgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctATGTTT---AGC-AGAAAA-T-TCA-------ATTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-T--T-T--AA--TAT---AG-GGG--A--TATTTACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----T--G-----------------------------------TCAGCAAAA-ACT-GC----T-AAA--AT-GAATC---CAC-AGC------AAAATA-TAA
gi|90945                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-CTA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--C--GTA-C--T-T--AA--TTT---A--------------------CCC--T--TT-------TTG-TCC-G-TCATC--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GGG-----G-T-G-C-A------CTT------GA---T-----TTTA-CG-G------AAG----T-----------AGTTTTCCTTCAAC-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-
gi|90946                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-AGA-------TTTTGT-AA---CAT-TTGACA--C--GAG-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-CGATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-C
gi|90947                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TAAAAAAAAATTT-----G---CAT-TAAACG--C--GGA-T--T-T--AA--TTT---AG-CGA--A--TGTTCACCC-CCC--C--C-------------CC-A-TCATA--A-T-G-CAT----TCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------TTT------AA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTACCAACAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAA-AGT------AAAATA-TA
gi|90948                      :                                                                                                                                           ATATTT---ATC-GGCGAT-T-AAA-------TTTTCT-CA---CAT-TTGATG--C--GGG-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGCTTAGTC-TCC--A--TT-------ATG-TCT-C-TCATA--A-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATTCTTCCGCC----------------AGA--AT-GAATC---TAC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90949                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-A-TTA-------TTT-CT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA------------------------------TGTTCGCTA-TCC--C--TT-------TTA-TCC-A-TCATA--A-G-G-CGT----GCC-C-CTA-TA-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---TTTTAATTAG-TG-G------AAGTAGCT-----------AGTCTTCCATCAAA-ATT-GC----T-ATA--AT-AAATT---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90950                      :                                                                                                                                           ATATTT---GACTGGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-TTTAA--ATT---AG-TAA--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------GTT------GA---T-----T
gi|90951                      :                                                                                                                                           ACATGT---AGC-GAAAAT-T-TCA-------TTCTCA-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--A---TTT---AA-TTG--A--TGTTCACTC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CTT----GCC-C-CTG-TT-G-GCAAATACA-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTA-----G------A--------------------------GCCAAA-ATT-GC----T------AT-TAATG---CAC-CGT------AAAATA-TA
gi|90952                      :                                                                                                                                           ATATTTT--AGT-GAAAAT-T-TGA--------TTTCT-AA---ACT-TTAATG--T--GGACC--T-T--TA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACTC-CAC--A--TT-------ATG-TCT-G-TCATA--ATT-GCCGT----ACC-C-CTG-TT-A-GTG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---TTA---TTAG-CGCG------AAG----G-----------AGTCTTCCG----------GC----C-AAA--ATAAAATC---CAC-CAT------AAAATA-
gi|90953                      :                                                                                                                                           ATATAT---AGC-AGACAT-T-TAA-------GTTTCG-AA---GAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--AA--GTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCA--A--AT-------TTG-TCC----TATA--A---G-GAT----GCC-C-CTG--T-G-GCG-----G-T-GTT-A------C-T------GA---T-----TTAG-CGAA------AAG----C-----------AGTATTCCG-GAAA-ATT-GC----T-TAA--ATAAAATT---CAC-
gi|90954                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGT-GGAA-T-T-TAA-------TTTTCT-AA---CAT-TTAATG--C--AGA-C--G-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-TCA--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-T-TAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-C
gi|90955                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-TGAAAC-T-GTA-------TTGTCT-TA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACT--CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-TGT----ACC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------C
gi|90956                      :                                                                                                                                           ATATTTTA-GGT-GCAAAT-TGCGA-------TGTTC--AA---TATATTGACG--CCAAGA-C--T-T--AA--TTTTCTAG-TGGCGA--TGTTCACTC-TCA--A--TT-------T-G-TCC-A-TCATA--A-T-G-CCT----GCCAC-CTG-TTTGCGCG-----GCT-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-T----------------T-----------AGTCTTCCGCCAAC-ATCCGC----T-ATA--GT-AAATC---CCC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90957                      :                                                                                                                                           ATATTTTACAGC-GGAAAT-T-TGC-------TTTTTT-AAAAACAT-TTCACA--C--AGA-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCAGTC-CCG--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-
gi|90958                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAA-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGAC
gi|90959                      :                                                                                                                                            TATTT---TGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--T--GGA-C--T-T--AA--TTTTATAG-AGG--A--TGTTCACTC-CCC--A--TA-------GAA-TAA-A-CAATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCA-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAA----T-----------AGTCCTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-TGTGACAGTAAAATA-TAA
gi|90960                      :                                                                                                                                            TATTT---AGT-AGAAATAT-TGA-------CTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--TGA-C--T--------------------------GTGCCCTT-TCC--C--TG-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-C-------TC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------TGTCTTCCGCCAAA-GTT-GC----T-AAA--AT-AAAT----CACTAGT------AAAATA-TAA
gi|90961                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---T-----TTAG-AG-GGTCCTTAAG----T-----------AATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-AAT------GAAATA-
gi|90962                      :                                                             tacttagataaacttgatatttctaagacaccttaatgtgatttaattttctgtgtgtaaaaattgttttttgttagtgTATCT---AGC-GGAAAT-T-TAA-------TTTTAT-AA---CAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--CA--CTA---AG-CGG--A--TGTTCACTCTCCC--C--TG-------TTA-TTT-G-CCACA--T-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-ACG-----
gi|90963                      :                                                                                                                                             ATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTT-CG-AA---ATT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CTG--A--TGTTTACTC-CCA--T--TT-------TTG-TAC-C-TCATA--A-C---CAT----GCC-C-CTG-TT-G-AC
gi|90964                      :                                                                                                                                                 ---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTT-T-AAT--CAT-TTGCCG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TT--TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-G-A-G-TT-G-G-G-----G-T-G-
gi|90964                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-GGT-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----TG----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAAG-AT-AA--T---CAC-AGT------AAAATA-TAAgtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctggtggtacttgatttagtgaaagtgagtgttccgccaaaattgctaaagataatcacagtaaaatataa
gi|90965                      :                   agcagaaatttgatttttaatcatttgccgtagacttattttagcagatgtttgctccccctttttccgtcacaaagcatgccgagttggggtggtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-C--T-T--------T---AG-TTG--A--TGTTCACTT-CCC--A--TT-------ATG-TC-------------------------------TG-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAA-CA-G------AAA----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GT----T-AAA--AT-AAATA---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90966                      :                                                                                                                                                         GACAT-T-TGA-------TTT-CT-AA---T-T-TTGATGAGC--GGA-C--T-T--TACTTTT---AGTCGG--A--TGTCCACTT-CC------TT-------TTG-TCC-GGTCA----G-C-G-CATT---GCC-CTCTAATT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GGAGTT-----TTAGTCG-G------AAG----TTATACTTCATTAGCCTCCC-CTAA---TC-GC----T-AAA--AT-AATTC---CAC-TGT------ACAACA-
gi|90967                      :                                                                                                                                                                -TGA-------TTTTCTCAA---TAG-T-GAGG--T--GGA-CAGTGT--AAAATTTG--AG-CGG--AAATG---ACCC-CCA--C--AT-------TTGATCC-GCTCATA--A-TCA-CATTTCCACC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TGAG-CG-G------CAA----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-CC----A-AAA--AT-AAATC---CA-----------AAAATA-TAA
gi|90968                      :                                                                                                                                                                    -------TTGTCT-AA---TAT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--CTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--TAATTAA-----CTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-TG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCTCCAAA-ATC-AC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CGT------ATAATG-TAA
gi|90969                      :                                                                                                                                                                    -------TTTCCT-AA---CAT-TTGATG--C--GGA-C--T-T-------TT---AG-TGG--A--TACTCACTC-CCC--C--TT-------TTT-ACC-A-TCATATTA-T-G-CAT----TCT-A-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATCCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAACC---CAC-CAT------AAAATA-TAA
gi|90970                      :                                                                                                                                                                            TTTCT-AA---CAT-TTAACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CAG--A--TGATCACCC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-CG-G------AAG----C-----------AGTTTTCCGCCAAA-ACC-GT----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-TA
gi|90971                      :                                                                                                                                                                                                                    --TTT---AA-TGG--A--TGTTAACTC-CCCA-A--TT-------TTG-ACT-G-TAATA--A-T-G-CAT----AC
gi|90972                      :                                                                                                                                                                                                                                     --TGTTCTTTC-TTT--T--TT-------TTG-TTCTG-TCAGG--A-T-G-C----------C-CTG-TT-G-GCG-----G-TTG-TTA------CTT------GA--------------------------------------------ATCTGTCGCCAGATATC-GC----TAAAA--AT-AATCC---CAC-AGT------TAGAGA-TA
gi|90973                      :                                                                                                                                                                                                                                             CTC-CCC--T--TT-------ATG-TCC-G-ACATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CAT-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTTG-TG-G------A----------------------TTCTACTAAA-ATC-GT----T--AA--AT-AAATC---CAC-TGT------AAAATA-TA
gi|90974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----G-T-G-T-T------CTC------GA---T-----TTAG-CG-A------AAA----T-----------AGTACTCCACCAAA-GTC-GT----T-GAA--AT-ACATC---CAA-AGT------AAAATA-TAA
gi|90975                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAT-ATT-GC----T-AAA--AC-AAATC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90976                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-AC----T-AAA--AC-AAACC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90977                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCCGCCAAA-ATA-GC----T-AAA--AT-AAATT---CAC-AGT------ATAATA-TAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                 TAT   T      A G   AAAAAAA      C  AAA   A      AG CA   C AG G TT  CT   TCT  T   CG AA         T   AAA    AAAGCTT   A   T G     TT T C C   TTCC   A T   A  T C   AATAC C T T T CTTCAT   CATCTT  AGT TTTAA    T  C GTCCTT   TAGC TATACTTCATT              T   C  TCAG A   TT  A     GTT   TA  GACAGT      G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 TAC   .      . .   .            .  T     .      .  .    . G  . .   AA   TAT  .   .  .          .   TAA    AA        .   . C     .  . . .   T      . .   .  . .   .     . . G . .        .       .   TA       .  A .        .    G                        .   .  CG   .   G   A     A     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 TA    .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    G    .   .  .          .   AA     .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     A     G   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 T     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     T   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   T      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     T   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     T   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     T   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     T   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   T      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     C   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .     .      . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     A   .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   A      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .     .   .            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              . .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .  . .        .    .                        .   .  .    .   .   .     .                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   C      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .        .       .   .        .             .    .                        .   .  .    .   .   .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .            .  .     .      .  .    . .  . .   .    .    .   .  .          .   T      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . . .                .   .                                                    .   .  .    .   .   .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                 .  .     .                         .    .    .   .  .          .   T      .         .   . .     .  . . .   .      . .   .  . .   .     . . . .                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                     .          .   .      .         .   . .     .  . . .   .      .              .     . . .                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                .   .      .         .   . .     .  . . .   .                     .                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                           
originalCons                  :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
finalCons                     :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 777   1      1 1   3333333      1  222   1      11 11   1 22 1 11  22   444  1   11 11         1   22222  4444444   1   1 2     11 1 1 1   3333   1 1   1  1 1   22222 1 1 2 1 333333   333333  111 44444    1  2 333333   2222 66666666666              1   1  3333 1   22  2     444   22  333333      1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 ...   .      . .   .......      .  ...   .      .. ..   . .. . ..  ..   ...  .   .. ..         .   .....  .......   .   . .     .. . . .   ....   . .   .  . .   ..... . . . . ......   ......  ... .....    .  . ......   .... ...........              .   .  .... .   ..  .     ...   ..  ......      .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                 333   2      2 1   5555555      1  999   1      55 55   1 66 1 55  99   777  1   44 44         0   66666  6666666   0   0 0     44 0 0 0   1111   0 1   1  1 1   55555 0 0 1 1 111111   222222  999 22222    1  3 333333   4444 44444444444              1   1  8888 1   66  2     333   66  555555      2   
consensus                     :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
Reference ( family-429 )      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-NGT------AAAATA-TAA
gi|90932                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---AAT-TTGACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AC-TGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----A-C-C-TTG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-G------AAG----T-----------TGTCCTTCACCAAA-ATT-TC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CAT------AAAATA-TGA
gi|90933                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGG-AGAAAG-T-TGA-------TATTGT-AA---CGT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---TG-TGT--A--TGTTCAC-A-CCC--C--TC-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----T-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-
gi|90934                      :                                                                                                                                           ATGTTT---AGC-GGAAAT-T-TCA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-C--AA--TTT---AG-CGG--A--TCTTTACTC-CCT--C--TT-------TTG-TCC-A-TTATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---------TTAG-CG-G------AAA----A-----------AGTCTTTCACCAAA-ATT-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-GGT------GAAATA-CAA
gi|90935                      :                                                                                                                                           ATATTT---CGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-GA---CAT-TTGACA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--T--TGTCCACTC-CTCAAA--TT-------TTG-TCC-G-TCAAA--A-T-G-CAT------C-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-GC----C-AAA--AT-AAA
gi|90936                      :                                                                                                                                           ATGTAT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--T--GGA-AG-T-T--CA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------CTG-TTT-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-TG-G------A------C-----------ATTATTCCGCC-AA-ATC-GC----T-AAA--CT-AAATC---CTC-AGT------AAAATA-TAAatacatgtacagtaga
gi|90937                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-TTGTCA--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-ACTTCATCTT------GA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90938                      :                                                                                                                                           ATATTT---TGC-GGCAAT-T-TGC-------TTTGCT-AA---CAT-T-GTCG--T--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC-----TT-------TTG-TTC-G-TCAAA--A-T-G-C-T----GCC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTTCATCTTGA---T-----TTAG-CA-G------AAG----T-----------AGTCTTCTGCCAAA-ATT-GC----T--AA--AT-AAATCA--TAC-CGG------AAAATA-AAA
gi|90939                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAA---T-TGA-------TTT----AA---C-T-TTGATG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---TG-CAG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TTAAAGCTTTTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-T-CTG-TT-A-GCA-----G-T-G-T-A------CT----------------------------------AA----T-----------GATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-ACA--AT-AAATC---TAC-CGT------AAAATAGTAA
gi|90940                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TTA-------TCGTCT-AA---CAT-TTGGCG--C--GGA-C--T-T--AA--TCA---AT-CAA--------TCATCC-CCT--C--TT-------TTG-TTC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-CA-G------ATG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CGC-AGT------GAAATA-TA
gi|90941                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAGT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACT--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---GG-GGG--A--TTTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---A-----TAAG-CA-G------AAG----T-----------AGT-TCTCGCCAAA-ATC--CTCAGT-AAATTAT-AATTCGTTTAC-AGT------AA
gi|90942                      :                                                                                                                                           ATATTTTATAGC-AGAAAT-T-CGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--T--GGA-C--T-T--CA--TTC---CG-TGG--A--TGTTCACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-A-GCG-----G-G-G-T-C------CTT------GA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GCCG--T-AAA--AT-
gi|90943                      :                                                                                                                                           ATATTG---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTTTT-AA---CAT-TTGACG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TTT-TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-C-CAG-TT-G-GTG-----G-T-G-T-
gi|90943                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----T-----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAA--AT--AATC---CAC-AGT------AAAATA-TAAgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctggtgtacttgatttagtgaaagtagtgttccgccaaaattgctaaaataatccacagtaaaatataa
gi|90944                      : atattgagcagaaatttgattttttaacatttgacgtagacttattttagcagatgtttgctcccccttttttccgtcacaaagcatgccccagttggtggtgtgatacatgtttgcatatctcttgatttgtattctATGTTT---AGC-AGAAAA-T-TCA-------ATTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-T--T-T--AA--TAT---AG-GGG--A--TATTTACTT-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----T--G-----------------------------------TCAGCAAAA-ACT-GC----T-AAA--AT-GAATC---CAC-AGC------AAAATA-TAA
gi|90945                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-T-CTA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGATG--C--GTA-C--T-T--AA--TTT---A--------------------CCC--T--TT-------TTG-TCC-G-TCATC--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GGG-----G-T-G-C-A------CTT------GA---T-----TTTA-CG-G------AAG----T-----------AGTTTTCCTTCAAC-ATC-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-
gi|90946                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-AGA-------TTTTGT-AA---CAT-TTGACA--C--GAG-C--T-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCT-G-CGATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-C
gi|90947                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAT-T-TAAAAAAAAATTT-----G---CAT-TAAACG--C--GGA-T--T-T--AA--TTT---AG-CGA--A--TGTTCACCC-CCC--C--C-------------CC-A-TCATA--A-T-G-CAT----TCC-C-CTG-TT-G-GCG-----A-T-G-T-A------TTT------AA---T-----TTAG-C----------AG----T-----------AGTCTACCAACAAA-ATT-GC----T-AAA--AT-AAATC---CAA-AGT------AAAATA-TA
gi|90948                      :                                                                                                                                           ATATTT---ATC-GGCGAT-T-AAA-------TTTTCT-CA---CAT-TTGATG--C--GGG-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGCTTAGTC-TCC--A--TT-------ATG-TCT-C-TCATA--A-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-GTG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATTCTTCCGCC----------------AGA--AT-GAATC---TAC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90949                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-GGAAAT-A-TTA-------TTT-CT-AA---CAT-TTGACG--C--GGA------------------------------TGTTCGCTA-TCC--C--TT-------TTA-TCC-A-TCATA--A-G-G-CGT----GCC-C-CTA-TA-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---TTTTAATTAG-TG-G------AAGTAGCT-----------AGTCTTCCATCAAA-ATT-GC----T-ATA--AT-AAATT---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90950                      :                                                                                                                                           ATATTT---GACTGGAAAT-T-TGA-------TCTTCT-AA---CAT-TTGACA--C--AGA-C--T-TTTAA--ATT---AG-TAA--A--TGTTCACTC-CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------GTT------GA---T-----T
gi|90951                      :                                                                                                                                           ACATGT---AGC-GAAAAT-T-TCA-------TTCTCA-AA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--A---TTT---AA-TTG--A--TGTTCACTC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CTT----GCC-C-CTG-TT-G-GCAAATACA-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTA-----G------A--------------------------GCCAAA-ATT-GC----T------AT-TAATG---CAC-CGT------AAAATA-TA
gi|90952                      :                                                                                                                                           ATATTTT--AGT-GAAAAT-T-TGA--------TTTCT-AA---ACT-TTAATG--T--GGACC--T-T--TA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACTC-CAC--A--TT-------ATG-TCT-G-TCATA--ATT-GCCGT----ACC-C-CTG-TT-A-GTG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---TTA---TTAG-CGCG------AAG----G-----------AGTCTTCCG----------GC----C-AAA--ATAAAATC---CAC-CAT------AAAATA-
gi|90953                      :                                                                                                                                           ATATAT---AGC-AGACAT-T-TAA-------GTTTCG-AA---GAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--AA--GTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCA--A--AT-------TTG-TCC----TATA--A---G-GAT----GCC-C-CTG--T-G-GCG-----G-T-GTT-A------C-T------GA---T-----TTAG-CGAA------AAG----C-----------AGTATTCCG-GAAA-ATT-GC----T-TAA--ATAAAATT---CAC-
gi|90954                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGT-GGAA-T-T-TAA-------TTTTCT-AA---CAT-TTAATG--C--AGA-C--G-T--AA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-TCA--C--TT-------TTG-TCC-A-TCATA--A-T-T-TAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-C
gi|90955                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-TGAAAC-T-GTA-------TTGTCT-TA---CAT-TTGACG--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-TGG--A--TGTTCACT--CCC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-TGT----ACC-C-CTT-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------C
gi|90956                      :                                                                                                                                           ATATTTTA-GGT-GCAAAT-TGCGA-------TGTTC--AA---TATATTGACG--CCAAGA-C--T-T--AA--TTTTCTAG-TGGCGA--TGTTCACTC-TCA--A--TT-------T-G-TCC-A-TCATA--A-T-G-CCT----GCCAC-CTG-TTTGCGCG-----GCT-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-T----------------T-----------AGTCTTCCGCCAAC-ATCCGC----T-ATA--GT-AAATC---CCC-TGT------AAAATA-TAA
gi|90957                      :                                                                                                                                           ATATTTTACAGC-GGAAAT-T-TGC-------TTTTTT-AAAAACAT-TTCACA--C--AGA-C--T-T--GA--TTT---AG-CGG--A--TGTTCAGTC-CCG--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-
gi|90958                      :                                                                                                                                           ATATTT---AGC-AGAAAA-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGAC
gi|90959                      :                                                                                                                                            TATTT---TGC-GGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--T--GGA-C--T-T--AA--TTTTATAG-AGG--A--TGTTCACTC-CCC--A--TA-------GAA-TAA-A-CAATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-TT-G-GCA-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAA----T-----------AGTCCTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-TGTGACAGTAAAATA-TAA
gi|90960                      :                                                                                                                                            TATTT---AGT-AGAAATAT-TGA-------CTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--TGA-C--T--------------------------GTGCCCTT-TCC--C--TG-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-A-C-------TC-C-CTA-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------TTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------TGTCTTCCGCCAAA-GTT-GC----T-AAA--AT-AAAT----CACTAGT------AAAATA-TAA
gi|90961                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---T-----TTAG-AG-GGTCCTTAAG----T-----------AATCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-GAA--AT-AAATC---CAC-AAT------GAAATA-
gi|90962                      :                                                             tacttagataaacttgatatttctaagacaccttaatgtgatttaattttctgtgtgtaaaaattgttttttgttagtgTATCT---AGC-GGAAAT-T-TAA-------TTTTAT-AA---CAT-TTGACG--C--GAA-C--T-T--CA--CTA---AG-CGG--A--TGTTCACTCTCCC--C--TG-------TTA-TTT-G-CCACA--T-T-G-TAT----GCC-C-CTA-TA-G-ACG-----
gi|90963                      :                                                                                                                                             ATTT---AGC-GGAAAT-T-TGA-------TTT-CG-AA---ATT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CTG--A--TGTTTACTC-CCA--T--TT-------TTG-TAC-C-TCATA--A-C---CAT----GCC-C-CTG-TT-G-AC
gi|90964                      :                                                                                                                                                 ---AGC-AGAAAT-T-TGA-------TTTT-T-AAT--CAT-TTGCCG--T--AGA-C--T-T--AT--TTT---AG-CAG--A--TGTTTGCTC-CCC--C--TT-------TT--TCC-G-TCACA--A-A-G-CAT----GCC-G-A-G-TT-G-G-G-----G-T-G-
gi|90964                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-----G-T-GGT-A------CTT------GA---T-----TTAG-TG-A------AAG----TG----------AGTGTTCCGCCAAA-ATT-GC----T-AAAG-AT-AA--T---CAC-AGT------AAAATA-TAAgtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctggtggtacttgatttagtgaaagtgagtgttccgccaaaattgctaaagataatcacagtaaaatataa
gi|90965                      :                   agcagaaatttgatttttaatcatttgccgtagacttattttagcagatgtttgctccccctttttccgtcacaaagcatgccgagttggggtggtgtgatcatgttttgcatatctcttgatttggtatttctGAAAT-T-TGA-------TTTTCT-AA---CAT-TTGACG--C--AGA-C--T-T--------T---AG-TTG--A--TGTTCACTT-CCC--A--TT-------ATG-TC-------------------------------TG-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAA-CA-G------AAA----T-----------AGTCTTCCGTCAAA-ATC-GT----T-AAA--AT-AAATA---CAC-AGT------AAAATA-TAA
gi|90966                      :                                                                                                                                                         GACAT-T-TGA-------TTT-CT-AA---T-T-TTGATGAGC--GGA-C--T-T--TACTTTT---AGTCGG--A--TGTCCACTT-CC------TT-------TTG-TCC-GGTCA----G-C-G-CATT---GCC-CTCTAATT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GGAGTT-----TTAGTCG-G------AAG----TTATACTTCATTAGCCTCCC-CTAA---TC-GC----T-AAA--AT-AATTC---CAC-TGT------ACAACA-
gi|90967                      :                                                                                                                                                                -TGA-------TTTTCTCAA---TAG-T-GAGG--T--GGA-CAGTGT--AAAATTTG--AG-CGG--AAATG---ACCC-CCA--C--AT-------TTGATCC-GCTCATA--A-TCA-CATTTCCACC-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TGAG-CG-G------CAA----T-----------AGTCTTCCGCCAAA-ATC-CC----A-AAA--AT-AAATC---CA-----------AAAATA-TAA
gi|90968                      :                                                                                                                                                                    -------TTGTCT-AA---TAT-TTGACA--C--AGA-C--T-T--AA--CTT---AG-CGG--A--TGTTCACTC-CCC--TAATTAA-----CTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCT-C-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TAAG-TG-G------AAG----T-----------AGTCTTCCTCCAAA-ATC-AC----T-AAA--AT-AAATC---CAC-CGT------ATAATG-TAA
gi|90969                      :                                                                                                                                                                    -------TTTCCT-AA---CAT-TTGATG--C--GGA-C--T-T-------TT---AG-TGG--A--TACTCACTC-CCC--C--TT-------TTT-ACC-A-TCATATTA-T-G-CAT----TCT-A-CTG-TT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTAG-CG-G------AAG----T-----------ATCCTTCCGCCAAA-ATC-GC----T-AAA--AT-AAACC---CAC-CAT------AAAATA-TAA
gi|90970                      :                                                                                                                                                                            TTTCT-AA---CAT-TTAACA--C--GGA-C--T-T--AA--TTT---AG-CAG--A--TGATCACCC-CTC--C--TT-------TTG-TCC-G-TCATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CTG-CT-G-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------AA---T-----TTAG-CG-G------AAG----C-----------AGTTTTCCGCCAAA-ACC-GT----T-AAA--AT-AAATC---CAC-AGT------AAAATA-TA
gi|90971                      :                                                                                                                                                                                                                    --TTT---AA-TGG--A--TGTTAACTC-CCCA-A--TT-------TTG-ACT-G-TAATA--A-T-G-CAT----AC
gi|90972                      :                                                                                                                                                                                                                                     --TGTTCTTTC-TTT--T--TT-------TTG-TTCTG-TCAGG--A-T-G-C----------C-CTG-TT-G-GCG-----G-TTG-TTA------CTT------GA--------------------------------------------ATCTGTCGCCAGATATC-GC----TAAAA--AT-AATCC---CAC-AGT------TAGAGA-TA
gi|90973                      :                                                                                                                                                                                                                                             CTC-CCC--T--TT-------ATG-TCC-G-ACATA--A-T-G-CAT----GCC-C-CAT-TT-A-GCG-----G-T-G-T-A------CTT------GA---T-----TTTG-TG-G------A----------------------TTCTACTAAA-ATC-GT----T--AA--AT-AAATC---CAC-TGT------AAAATA-TA
gi|90974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----G-T-G-T-T------CTC------GA---T-----TTAG-CG-A------AAA----T-----------AGTACTCCACCAAA-GTC-GT----T-GAA--AT-ACATC---CAA-AGT------AAAATA-TAA
gi|90975                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G-G------AAG----T-----------AGTCTTCCGCCAAT-ATT-GC----T-AAA--AC-AAATC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90976                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA----T-----------AGTCTTCCACCAAA-ATC-AC----T-AAA--AC-AAACC---CAC-CGT------AAAATA-TAA
gi|90977                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCCGCCAAA-ATA-GC----T-AAA--AT-AAATT---CAC-AGT------ATAATA-TAA