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lowQualScore : .. . . . . ...... ... . ...... . . .. . . .... . . .. ................ . . . . . . .. .. . ... .. ...
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Alignments
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Reference ( family-426 ) : TACCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32022 : TACCTTTCAT--AATGT-GCTGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32023 : TACCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AAC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--T--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32024 : TACCTTACAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-A-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32025 : TACCTTTCAT--TATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-CCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32026 : TATCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCATGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-A-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTGAT
gi|32027 : TACCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---G-T-G-T-T----GGA-ACGTGG-G-T-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---ATTCAT
gi|32028 : TAACTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---G-T-G-T-T----GGA-GCATGG-G-G------A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AA-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32029 : TACCTTTCAT--AATGA-GCAGCA-TTCTCA-A-C------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-G-T-A----A-T-G-T--G----------------AG-C-G-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32030 : TGCCTTTCAT--AACGT-GCAGCA-TTCTCT-CGC------A---A-T-A-A-T----GGA-ACGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-CT---TTT--C---TTTCAT
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gi|32032 : ACCTTTAAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------ATTAA-TTG-C-T----GGA-ACGTGG-A-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-G-T-G-T-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32033 : ACCTCTAAT--AATGTTGCAGCA-TTCTCA-AGCCCATTTA---A-TTGCT-GCATTGGA-ACGTGG-AAG-T----A-T-G-T--G----------------AG-G-G-T-GTC-T--C--AC-CT---TTT--C---TTTCAT
gi|32034 : TTCATTTAATGT-GCAGCA-TTTTAA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-G-G-T----T-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTT
gi|32035 : T-GTAGCA-TTGCCA-TTC------A---T-T-G-T-T----GGG-GCATGG-T-G-T----A-T-G-T--G----------------AA-G-T-T-G-C-T--C--AC-AT---TTT--T---TT
gi|32036 : -GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCATGG-
gi|32037 : AGCAATTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GG--GCGTGG-G-G-TA---A-T-G-T--G----------------AGAC-T-T-G-C-T--C--AC-TC---TTC--C---TTT
gi|32038 : AGCAATTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-T----GGA-GCGTGG-G-G-TAA--A-T-G-T--G----------------A--C-T-T-G-C-T-----AC-TC---TTT--CGTTTTTCA
gi|32039 : AACA-TT-TCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GAAAGCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-TAG-C-T--C--AC--T---TTT--C---TT
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gi|32058 : CA-TT-TCA-A-C------A---A---G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T-----AC-TTTAATTT--C---CTTCAT
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gi|32062 : TCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-TCAC--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32063 : TCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GC-TGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32064 : TTA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----T-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--A--TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32065 : TCA-GGC------A---A-T-G---G----GGA-G-GTGG-G-G-T----A-TTG-T--G----------------AC-T-T-T-G-C-T--C--AC--T---TTT--C---TTTCAT
gi|32066 : -AGC------A---C-C-G-T-A----G-A-GCTAGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32067 : GC------A---A-T-G-T-G----G-A-GCGTGGAG-G-TC---A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T------C-TT---TTT--C---TTTCAT
gi|32068 : ---A-T-G-T-G----G-A-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-TG-G----------------AG-C-T-T-G-C-T--TCAAC-TT---TTT--C---TTTCAT
Alignments
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lowQualScore : 44 2 2 4 0 222222 111 1 2 1 222222 0 0 0 1 5555 0 2 0 22 5555555555555555 1 0 0 0 0 1 22 11 0 111 11 111
lowQualScore : .. . . . . ...... ... . . . ...... . . . . .... . . . .. ................ . . . . . . .. .. . ... .. ...
lowQualScore : 22 7 2 3 9 555555 555 7 6 7 000000 9 9 9 7 7777 9 6 9 11 8888888888888888 7 9 9 9 9 7 99 22 9 555 22 555
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Reference ( family-426 ) : TACCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
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blockSeqs : TT T A C CCATTT TTA A T C GCATT A AATA G TG CAGCTTGGCTCCTTTT A T CA CA TAA CA GTT
blockSeqs : . . A C . . A T A CG A AA T G . A T C . . . .
blockSeqs : . . . C . . . T . T . A T . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . T . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G
blockSeqCons :
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Alignments
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lowQualScore : 44 2 2 4 0 222222 111 1 2 1 222222 0 0 0 1 5555 0 2 0 22 5555555555555555 1 0 0 0 0 1 22 11 0 111 11 111
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Reference ( family-426 ) : TACCTTTCAT--AATGT-GCAGCA-TTCTCA-AGC------A---A-T-G-T-G----GGA-GCGTGG-G-G-T----A-T-G-T--G----------------AG-C-T-T-G-C-T--C--AC-TT---TTT--C---TTTCAT
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