lowQualScore                  :                                                11111                                                                              11111111                              111111                         11111                                  11111111111                                      11111111111                                                   
lowQualScore                  :       44 11  1      2    1     11  111  1 1  1 77777 11      1   1111   88 11 333333 0  222222  2222 6666666666 0  66 222  0    1 55555555 22 0 22 0  444 33333 11   11 000000 0  22 222   1  22 0 1 0 33333 444444 6666666666666666  11  22  11111111111 3333333  555  2   11 222 444  1      22222222222   4444    22 222 222  2 1      33 11 4 33         
lowQualScore                  :       .. ..  .      .    .     ..  ...  . .  . ..... ..      .   ....   .. .. ...... .  ......  .... .......... .  .. ...  .    . ........ .. . .. .  ... ..... ..   .. ...... .  .. ...   .  .. . . . ..... ...... ................  ..  ..  ........... .......  ...  .   .. ... ...  .      ...........   ....    .. ... ...  . .      .. .. . ..         
lowQualScore                  :       66 55  1      1    0     33  777  0 0  0 33333 33      0   9999   88 22 555555 9  666666  8888 6666666666 9  66 888  9    8 44444444 22 9 22 9  111 55555 33   33 333333 9  22 555   9  22 9 9 9 88888 555555 6666666666666666  44  44  88888888888 2222222  555  1   88 999 888  1      88888888888   7777    99 111 111  4 2      00 77 0 11         
consensus                     : AAAAATANT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------N--A-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATA-----N-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--ATACACTTT
Reference ( gi|113665 )       : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--T--A--TTACTG-CTT----GATA-T--A------T-TT----C-AC----C-C------A-G-AAC-T---TT-ACAT-T----AG--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------C--A-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATA-----A-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--ATACACTTT
gi|113666                     : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-TTAT--A--TTACTG-CTT----GATA-T--A------T-TT------AC----C-C------A-G-AACAT---TT-ACAT-T----AG--A--G-T--C-TA---T-----G--G----A-T----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------C--A-------AA---GA-AAT-TA---T--A-T-TTCATA-----A-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--ATACACTTT
gi|113667                     : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGAA-TTT----AA---AA-TATT-T--TG-A--TTACTG-CTT----GATA-T--A------T-TT----C-AC----C-C------A-T-ATT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--AGA--A-A----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-G-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------C--A-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATA-----A-----AAA----TATC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--ATACACTTT
gi|113668                     : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGGA-TTTTC--AA---A--T-TT-T--G--A--TTACTG-CTC----GACA-T--A------T-TT----C-AC----C-T------C-G-AAC-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----A-TC--A---TTT-TT--T---T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TTT-------C--A-------AA---GA-AAT-TA---T--GTT-TTCATA-----A-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--GTACACTTT
gi|113671                     : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTG--AA---AA-T-TT-T--G--G--TTACTG-CTTTCAAGATA-T--A------T-TT----C-AC----C-C------A-G-AAC-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----G-AC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------T--A-------AT---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCA-------------------------------------T-AAAAAG--T--TGC--ATACAATT
gi|113670                     : AAAAATATT--TC-ACCAAA-TGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-TTT----TATT-T--A------T-TT----T-CC----C-C------G-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-C----A-GC--A---TGT-TT--T-A-TGA-----A------A------T---T-----AT--TT--CT--------C--A-------AA---GA-AAT-GA---T--ATT-TTCATA-----C-----ACA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGC--GAACACTTT
gi|113669                     : AAAAATGTT--CC-ACCA-A-GGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GATA-T--A------T-TT----A-AA----C-C------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--C--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----A-GC--AT--TGT-TTC-T-ATT-C-----A------A------T---T-----A---TT--TT--------C--A-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATC-----A-----AAT----CCTCT-T---T---GA-T-AAAAG------TAC--ATACACTTT
gi|113672                     : AAAAATATT--TC-GTCATT-GGAA-TTTTC--TA---AA-T-TT-T--G--A--TTAATG-CTT----GATT-T--A------T-TT----T-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--G-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GT--A---TAT-TT--TAA-T-C-----A------A------T---T-----A---TT--TT--------C--A-------AAC--GA-AAT-TT---T--ATT-TTCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GG---AAAAAT--T--T
gi|113673                     : AAAAATAAC--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--A---------------------CCACTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----G-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAC-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GC--A---TAT-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------A--A-------AA---GA-AAT-TA---T--TTT-TCCATT-----T-----AGA----TATT--T---T---GGTT-AAAAAG--T--TAC--ATAC
gi|113674                     : AAAAATAAT--CC-ACCACA-GGAA-TTTTC--AA---AC-T-TT-T--G--A--TTACTT-CTT----GATT-T--A------T-TT----A-AC----C-T------A-G-AAT-A---TT-ATAT-T----GA--A--G-T--T-TA---T-----A--GGA--A-G----A-GC--A---TGT-TA--T-A-A-C-----A------AG-----T---T-----AC--CT---------------A-------AACAGGA-AAT-AT---T--TTT-TTCATA-----C-----CAA----CCTA--T---T---GG-T-ATAAAG--T--TAC--ATACACTTT
gi|113677                     : AAAAATGT---CC-ACCA----GGA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T-----A--TTAC-G-CTC----GATA----A------TATT----C-AC----C-T------C-A-AAC-T---TA-GCATAT----GA--A--G-T--C-TACA-T-----G--GGA--A-T----A-GC--A---TGT-TT--T-G-G-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------CCAA-------AA---GA-AAT-CAAGTT--TTC-TTCATA-----A-----AAAT---TCTT--C---T---GG-T-AAAGA---T--TGC--AT
gi|113675                     : AAGAATAAG--CC-AGCTTA-GGGA-TTGTC--AG---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTG----GATT-T--A------T-GT----C-CC----T-T------T-A-AAT-TGTTTT-ACAT-T----TA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGG--A-A----A-GC--A---TGT-TT--C-A-T-T-----A------A------AA--T-----AG--TT--TT--------A--T-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--T----ATACACTTT
gi|113680                     : AAAAATGCT--CC-ACCAAAAGGAA-TTTTTTAAA---AA-T-TT-T--GGAA--TTACTG-CTT----GATA-T--A------T-TT----CAACA---C-C------A-A-AAC-T---AT-ATA--T----AGAAA--G-T--C-TA---T-----G--GAA--A-T------GT------TG--TT--T-A-T-C-----AC-----A------T----------T--TT--TT--------C--AACACAACAA---TA-AAT-T--------TT-TTCAAA-----A-----AAAG---TCTC--TTCAT---GGTT-AAAAAG--T--TGC--ATACACTT
gi|113681                     : AAAAATGTT--CCCACCA-A-AGAA-TTTTC--AA---AAAT-TTAT--T--A--TCA-TG-CTC----GATA-T-----------TT----C-TC----C-T------C-G-AAC-C---TT-ACAT-T-----G--A--G-T--CCTA---TCG---G--GGACAA-T----A-GC--A---TTTGTT--T-G-T-C-----A------A------T---------AT--TT--TC--------A--A-------AA---GA-AAT-TA---T--GTT-TC--TA-----A-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAA
gi|113676                     : AAAAATAAT--CA-ACCATA-CGAT-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACAT-CTT----GATT-T--A------T-CT----C-AC----C-T------A-A-AAT-T---CT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---A-----A--AGA--A-G----A-AA--A---TGT-TT--T-AGT-C-----A------A----------------GT--TT--T-------------------------AA-AAT-GA---T--CTT-TTCATA-----G-----AAA----TCTC--T---T---CG-T-AAAAGG--T--TACA-AAACACTTT
gi|113678                     : AAAAATAAC--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AG-T-TT-T--G--A--TTACTG-TTT----GATT-T--A------T-TT----C-ACCTATC-T------A-G-AAT-C---TT-ACAT-T----GA--C--G-T--C-TA---T-----G--GGG--A-G----A-GCATA---TAT-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----GT--TT--GT--------A--A-------AA---GATAGT-AA---T--ATT----ATA-----A-----AA
gi|113683                     : AAAAGTAAT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AT-T-TT-T--TTTA--TTATTG-ATT----TATT-T--A------T-TT----C-AC----C-T------A-G-AGT-T---GT-ACAT-T----GA--A--G-A--C-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GC--A---TGT-TT--A-A-T-TA----A------A------T---C-----AT--TT--TT--------A--T-------AA---GG-AATATAT--T--ATT-TTT-TA-----A-----A
gi|113682                     : AAAAGTATT--CC-ACCATA-CGAA-GTTTC--AA---AT-T-GT-T--G--A--TTACTG-CTA----GAAA-T--A------T-TT----A-AA----C-C------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---C-----G--GGA--A-T----A-GT--A---T
gi|113684                     : AAAAATAAT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AC-C-TT-T--G--A--TTACTT-TTT----GATT-T--A------T-TT----G-AT----C-T------A-T-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C--A---T-----G--TGA--A-G----A-----------T-TT--T-A-T-C-----A------AG-----T---T-----AT--TT--TT--------G--A-------CA---CA-AAT-AA---T---TT-TTCATA-----C-----AAA----T
gi|113679                     : AAAAATGTT--CC-ACCATA-GGAA-TTATC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GATA-
gi|113686                     : AAAAATTAT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AC-T-TT-T--G--A--TTACTT-CTT----G--A-T--A------T-TT----T-AT----C-
gi|113687                     : AAGAATAAT--TC-ACCAAA-GGGA-TTTAC--AA---AA-T-TG-T--T--C--TCAGTG-CTT----GGCT-T--A------T-TT----C-AC----C-G------T-A-AAT-T---CT-ATAT-TGTTCAA--A--G-TGAA-TT---T-----A--GGA--A-G----A-AC--A---TGT-ATACT-A-G-T-----A------A------T---TAAAACAT--TC--TT--------A--G-------AA---GA-AAT-TG---T--ATT-TTAATT-----C-----GAA----TCTC--T---TTGAGG---GAAAAG--T--T-C--ATACAatattatttttaagagaaataatttttcaaacaaatctcttggaaagaagttgcata
gi|113685                     : AAGAATTAC--CC-ACTATA-GAAAATTTTC--AA---AC-C-TT-T--G--A--TCAATT-CTT----GATT-T--A------T-TT----G-AT----C-T------A-G-AAA-T---TT-GCAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--TGA--G-G----A-GC--A---TAT-TT--T-A-A-A-----A------A------TCTAT-----AT--CTA-TA--------C--A-------AATC-AA-AGT-TA---C--AT
gi|113688                     :  AAAATATT--CC-ACCATA-GGAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--T--A--TTACTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----T-T------T-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GC--A---TGA-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------A--A-------AA---GA-AAT-TA---T--ATT-TCCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GA-T-AAAAAG--T--TGC--ATagtacgcttt
gi|113689                     :  AAAATAAT--CT-ACCATG-G------------A---AA-T-TT-T--G--A--TAACTG-TTT----CATT-T--A------T-TT----C-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-A--C-TA---T-----G--GGA--A-G----A-AA--A---TGT-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------G--A-------AA---GA-AAT-CA---T--ATT-TTCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---TG-T-ACAAAGT-T--TAC--AGACACTT
gi|113690                     :  AAAATTAT--CC-ACCACA-G-AA-GTTTC--AA------T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GAAAAT--A------T-TT----C-AC----C-C--------G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----GAAGGA--A-T----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------G------T---A-----AT--TT--TTTTTTTCTAC--T-------AG---CATAAT-TA---T---TT-TTCATG-----A-----TA-----TCTTCTT---T---GG-T-A----------TGC--ATACACTTT
gi|113691                     :  AAAATATT--TC-ACCATA-GACA-TTTTC--AA---AA-T-GT-T--G--T--TTACTG-CTT----GATT-C--A------T-TC----C-AC----C-C------A-G-TAT-T---TT-ACAT-T----
gi|113692                     :   AAATATTACCC-ACCATA-TGAA-TTTTC--AA---AC-T-TT-T--G--A--TTACTT-CTT----GATT-T--A------T-CT----G-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--T--G-T--C-TA---T-----G--GGA--G-G----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------AA-----T---T-----AT--TT--TT--------A--A-------AA---GA-AAT--A---T--TTT-TTCATA-----C-----AAT----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TAC--ATAgaaat
gi|113693                     :   AAATATT--CC-ACCA------A-TTTTT--TTTTTAA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GATT-T--A------T-CC----C-CC----C-CCCCCCCG-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--T-TA---C-----G--GGA--A-C----A-GC--A---TGT-TT--T-T-G-A-----A------A------T---A-----AA--TT--TT--------C--A-------AA---GA-AAT-GA---T--ATT-TTCATAC----A-----AAA------------------AG-T-AAAAAG--T--TGC--GAACACTTT
gi|113694                     :   AAATGAT--CC-ACCATA-GAAA-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTAATG-CTC----GATA-T--A------T-TT----C-AC----T-C------A-G-AAC-T---TT-ACGT-T----GA--A--G-T--T-TA---T-----
gi|113696                     :         T--CC-ACCATAAGGAT-TTTTC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTATTG-CTT----CATT-T--A------T-TTATAGT-AC----C-C------A-G-AAG-T---TT-ATAT-T----GA--T--G-T--C-TA---T-----G--CGA--A-G----A-TC--A---TGT-TT--T-A-T-CG----A------A------T---T-----AT--TG--TC--------A--A-------AA---GA-AGT-TA---T--ACT-TTCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GG-T-AAACAG--T--TAC--ATACACTTT
gi|113695                     :         T--CC-ATTATA-GAAA-TTTTC--AA---AA-T-GT-T--G--A--TTTCTG-CTG----GATT-T--A------T-TT----C-AC----C-A------A-G-AAT-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--G-TA---T-----T--GTA--A-G----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-TA----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------A--A-------AA---GA-AGT-TA---T--TTT-TTCATA-----C-----AAA----TCTT--T---T---GA-T-GAAAAA--T--TAC--ATACACCTT
gi|113697                     :         T--CG-ACCATT-GGAA-TTTTA--AA---AA-T-T--------------CTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----C-T------A-G-AAT-C---AT-AC---------------G-T--C-TA---T-----G--GGA--T-G----A-GC--A---TG--TT--T-A-T-TA----A------A------T---T-----AT--CT--TT--------A--A-------AA---GT-AAT-AA---T--ATT-TTTATA-----C-----AAA----TATC--T---T---TG-T-AAAAAG--T--AAT--ATACACTTT
gi|113698                     :         T--CC-ACCATA-GGAA-TTAGC--AA---AA-T-TT-T--A--A--TAATTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----T-G------A-G-AAT-T---TT-AC-T-T----CG--AT-G-T--T-CA---T-----G--GAA--A-G----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-CA----A------A------A---T-----AT--TC--CTG-------C--A-------AA---GA-A
gi|113700                     :         T--CC-ACCATA-GGAA-T------AA---AA-C-TT-T--T--GATTTACTA-ATT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----C-T------T-G-AAT-T---TT-ACAT-T-----------C-T--G-TA---TTAAAAA--AAA--A-T----G-CC--A---TCC-TT--T-A-T-TAAAAGA------A------T----------T--TT--TT--------G--A-------AA---GA-AAT-CA--------T-TTTATA-----G-----AAA----TTTT--T---T---AG-T-GAAAAA--T--TTC--ACACACTTT
gi|113699                     :         T--CC-ACCATA-AGAA-TTTAC--AA---AA-T-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GATT-T--A------T-TT-------C----T-T------A-A-AA------TT-ACAA-A----GA--A--G-T--C-CA---T-----G--GGA--A-A----A-AC--A---TGC-TT--T-A-T-T-----A------A------
gi|113701                     :          --CC-ACCATA-AGGA-TTTAC--AA---AA-T-TA-T-----A--TTACTG-CTT----GATG-T--ACATGTAT-TT----C-AC----G-T------A-T-AGT-T---TT-ACAT-T----AA--A--G-T--C-TA---C-----T--GGA--A-A----A-AA--A---CAT-T----------------------------------------T--CT--TT--------A--A-------AA---GA-AAT-TG---A--ATT-TTCTTA-----CT----TTA----TGTT--T---T---GG-T-GAAAAG--G--TAC--ACAGACATTaatat
gi|113702                     :             C-ACCATA-AGA--TTTTA--GA---AA-T-TT-T--G--A--TCACTT-ATT----GATT-T--A------T-TT----T-AC----C---------------------T-ACA--------------A-T--C-TA---T-----G--GAA--A-G----G-GC--A---TGC-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----A
gi|113703                     :                   TA-GGGA-TGCTC--AG---AA-T-TT-TG-C--A--TTACTGGCTG----GATT-T--A------T-GT----C-CC----T-T------T-GTAAT-TGT-TTGACAT-TT---AA--ATGG-T--C-TA---T-----G--GGG--A------A-GC--A---TGT-TT--C-C-T-C-----ATTAAGAA------TAG-T-----ATGGTT--T--------------------AA---GA-AAT-TA---A--TTT-TTCATA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GG-T--TAAAG--T--T-T--ATACACTT
gi|113704                     :                     -GGAA-TTC-C--AA---A----TT-T--G--A--TCATTG-CTT----GATT-T--A------T-TC----C-AC----C-T------GCG-AA--T---TT-ACACAT----GA--A--G----C-TAAT-T-----G--GGA--GGT----A-GCC-A---TGTGTT--T-A-T-T-----G------A------T---T-----TT--TT--TT--------C--A-------TA---AG-AAT-GA---T--ATTATTCA-A-----ATACACAAA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TGCGAACATACTT
gi|113706                     :                        AA-TTTTC--CA---AA-A-TT-T--T--A----ACTG-CTT----GATT-T--AA-----T-GT----A-AC----C-T------A-G-AAT-T---TT-ACAC-A----GA--A--G-T--C-TA---T--------GGA--A-C----G-AT--A---TG--TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--ATCGTT--------G--A-------AA---G
gi|113707                     :                             TCC--AA---AA-G-TT-T--G--A--TTACTG-CTT----GGTT-TTTA------T-TT----C-AC----C-T------T-C-AAC-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----A-CC--A---TGC-CT--T-A-T-T-----A------
gi|113708                     :                                         -T-TT-T--A--A--GTACTG-CTT----GATT-T--A------T-TT----C-AC----C-G------T-G-AAT-T---TT-ACTT-T----GA--A--G-T--T-TA---T-----A--GAC--A-G----A-AC--T---TAC-TT--T-A-T-C-----A------A----------A-----AT--AT--TT--------C--C-------A-----A-AAT-TA---TTCA-T-CTCATT-----A-----AAA----TTTC--T---T---GA-TAAAAAAG--T--GAC--ATAcaaggaattggacttataa
gi|113710                     :                                                                TT----GATA-T------------T----A-AC----TAC------A-G-A-T-T---TT-ACAT-T----GA--A--GGT--C-TAATAT-----G--GGA--A-G----AAGC--G---TGT-TT--T-A-T-T-----A------AA-----C---T-----AT--TT--TG--------A--A-------AA---GG-AAT-TA---T--ATT-TTCATA-----C-----ATA----TCTT--T---T---GT-T-CTTAAG--TTATAT--ATACACTTT
gi|113711                     :                                                                  ----GATA-A--G------T-TT----C-AC----C-C------A-G-AAC-T---TT-ACAT-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--A-T----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-C-----A------A------T---T-----AT--TT--TT--------C--A-------AC---GA-AAT-AA---T--ATT-TTCATA-----A-----CAA----
gi|113705                     :                                                                          -T--A------T-TT----G-AC----A-T------A-G-AA------------T-T----GA--A--G-T--C-TA---T-----G--GGA--C-TGAAGA-GC--AATATGT-TT--T-A-T-C-----A------AATTAATT---T-----AT--TT--TT--------A--A-------AA---GA-AAG-AA---T---TT-TTCATATGTGGAC----AGA----TCTC--T---T---GG-T-AAAAAG--T--TAC--ATAC
gi|113709                     :                                                                                              gaatttttcaaactctaggctAT-T---TT-ACAC-G----AA--A--G-TA-C-TG---T-----C--GGA--A-A----A-GC--A---TGT-TA--C-A-T-TGA---A------A------T---T---------TC--TT--------C--G-------AAAT-GA-AAT-TA---T--ATT-TTCATC-----A-----AAATATTTCTT--T---T---GA-T-AAAATG--T--TTC--ATA
gi|113712                     :                                                                                                               tgataactgcgtgatttT-T----AC--A--G-T--A-TA---T-----G--GGA--A-G----A-GC--A---TGT-TT--T-A-T-CA----A------A------T---T-----A---TT--TT--------A--A-------AA---GA-AAA-TA---T--GTC-TCAATG-----C-----AAA----TATC--T---T---TG-T-GAAAAGTTT--TCT--ATACATTT
gi|113686                     :                                                                                                                                                                                 tt--A---TAT-TT--T-A-T-C-----AT-----A------T---T-----AT--TT--TT--------A--A-------GA---GA-AAT-AA---T---TT-TTCAAA-----C-----AAA----TCTC--T---T---GG-A-AAGAAG--T--TGC--ATA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                                 
lowQualScore                  :                                                     11 11  1    111  2    1     22    0     33  11 0  11  0   1111 0  4444444 11 0   22222 0 2222 0 222222 0 0 0  0 222  0    1  1111  222 0 22   444 11 11   3333 22 0 33333 11 222   1 11 22 0 1 0 33 444444 555555 22 22222 33333   11  7777777 444444  222  2   2  222 4 11 1   2222   55555555   4444 1  11 1  444  1 2      22 11 3 22 222        
lowQualScore                  :                                                     .. ..  .    ...  .    .     ..    .     ..  .. .  ..  .   .... .  ....... .. .   ..... . .... . ...... . . .  . ...  .    .  ....  ... . ..   ... .. ..   .... .. . ..... .. ...   . .. .. . . . .. ...... ...... .. ..... .....   ..  ....... ......  ...  .   .  ... . .. .   ....   ........   .... .  .. .  ...  . .      .. .. . .. ...        
lowQualScore                  :                                                     22 55  1    888  0    0     33    9     44  22 9  22  9   8888 9  0000000 22 9   33333 9 7777 9 666666 9 9 9  9 777  9    7  8888  444 9 11   000 22 22   2222 88 9 22222 22 444   8 22 22 9 8 9 11 444444 555555 33 44444 33333   33  1111111 111111  777  0   1  888 3 44 0   2222   44444444   5555 1  66 1  000  1 3      88 66 6 99 111        
consensus                     :                                               AAAAATANT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
Reference ( family-420 )      :                                               AAAAATANT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------NA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-N------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113665                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TA----GA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------CA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-A------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113666                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--ATATT-AC--TG-CTT----G-AT-----A-T--A-TTT-----A-C----C-C------A-G-A-ACAT---TT-ACAT-TA----GA---G-T--CTA---T--G--G------AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------CA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-T-C----ATA-A------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113667                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTAA--AATA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-T-A-TT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--AGA----AA-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-G--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------CA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-A------AAA----T-AT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113668                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGGA-TTTTC--AAA--TTTTG--AT--T-AC--TG-CTC----G-AC-----A-T--A-TTT----CA-C----C-T------C-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-T-----C--A---TTT-T--T--T---T-C--A------A------T--T-----AT----TTT--TT------CA------AA---GA-AAT-TA---TGT--T-TTC----ATA-A------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--G---TACACTTT
gi|113669                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA----A-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----A-T--A-TTT----AA-A----C-C------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AC---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--AT--TGT-T--TC-T-ATT-C--A------A------T--T-----A------TT--TT------CA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT--C------AAA----TCCT--CTTT---GA-T-AAAAG------TAC--A---TACACTTT
gi|113670                     :                                               AAAAATATT--TC-ACCA---AA-TGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-TTT----T-AT-----T-T--A-TTT----TC-C----C-C------G-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AC-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-TGA--A------A------T--T-----A-----TTT--CT------CA------AA---GA-AAT-GA---TAT--T-TTC----ATA-C------ACA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--G---AACACTTT
gi|113671                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTG--AAAA-TTTTG--GT--T-AC--TG-CTTTCAAG-AT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-G-A-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------TA------AT---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----A---------------------------------T-AAAAAG--T--TGC--A---TACAATT
gi|113672                     :                                               AAAAATATT--TC-GTCA---TT-GGAA-TTTTC--TAAA-TTTTG--AT--T-AA--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----TA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--GTA---T--G--GGA----AG-A-G-----T--A---TAT-T--T--TAA-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TC------AA------AC---GA-AAT-TT---TAT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG---AAAAAT--T--T
gi|113673                     :                                               AAAAATAAC--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--A------------C--C-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----GA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAC-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TAT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AAT-TA---TTT--T-TCC----ATT-T------AGA----T-AT--T-TT---GGTT-AAAAAG--T--TAC--A---TAC
gi|113674                     :                                               AAAAATAAT--CC-ACCA---CA-GGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----AA-C----C-T------A-G-A-AT-A---TT-ATAT-TG----AA---G-T--TTA---T--A--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--A--T-A-A-C--A------AG-----T--T-----A-----CCT-----------A------AACAGGA-AAT-AT---TTT--T-TTC----ATA-C------CAA----C-CT--A-TT---GG-T-ATAAAG--T--TAC--A---TACACTTT
gi|113675                     :                                               AAGAATAAG--CC-AGCT---TA-GGGA-TTGTC--AGAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTG----G-AT-----T-T--A-TGT----CC-C----T-T------T-A-A-AT-TGTTTT-ACAT-TT----AA---G-T--CTA---T--G--GGG----AA-A-G-----C--A---TGT-T--T--C-A-T-T--A------A------AA-T-----A-----GTT--TT------AT------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--T----A---TACACTTT
gi|113676                     :                                               AAAAATAAT--CA-ACCA---TA-CGAT-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--AT-CTT----G-AT-----T-T--A-TCT----CA-C----C-T------A-A-A-AT-T---CT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---A--A--AGA----AG-A-A-----A--A---TGT-T--T--T-AGT-C--A------A---------------G-----TTT--T--------------------AA-AAT-GA---TCT--T-TTC----ATA-G------AAA----T-CT--C-TT---CG-T-AAAAGG--T--TACA-A---AACACTTT
gi|113677                     :                                               AAAAAT-GT--CC-ACCA-------GGA-TTTTC--AAAA-TTTT---AT--T-AC---G-CTC----G-AT-----AAT--A-TT-----CA-C----C-T------C-A-A-AC-T---TA-GCATATG----AA---G-T--CTACA-T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-G-G-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TTCC----AA------AA---GA-AAT-CAAGTTTT--C-TTC----ATA-A------AAAT---T-CT--T-CT---GG-T-AAAGA---T--TGC--A---
gi|113678                     :                                               AAAAATAAC--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAG-TTTTG--AT--T-AC--TG-TTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-CCTATC-T------A-G-A-AT-C---TT-ACAT-TG----AC---G-T--CTA---T--G--GGG----AG-A-G-----CATA---TAT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----G-----TTT--GT------AA------AA---GATAGT-AA---TAT--T--------ATA-A------AA
gi|113679                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTATC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----
gi|113680                     :                                               AAAAATGCT--CC-ACCA---AAAGGAA-TTTTTTAAAAA-TTTTGGAAT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----A-T--A-TTT----CAACA---C-C------A-A-A-AC-T---AT-ATAT-AG----AAA--G-T--CTA---T--G--GAA----A-----------------TGT-TGTT--T-A-T-C--AC-----A------T--T-----------TTT--TC------AACACAACAA---TA-AAT-T------T--T-TTC----AAA-A------AAAG---T-CT--C-TTCATGG-TTAAAAAG--T--TGC--A---TACACTTa
gi|113681                     :                                               AAAAATGTT--CCCACCA----A-AGAA-TTTTC--AAAA-ATTT---AT--T-ATCATG-CTC----G-AT----------A-TTT----CT-C----C-T------C-G-A-AC-C---TT-ACAT-TG----AG---T-C--CTA---TCGG--GGACA--AT-A-G-----C--A---TTTGT--T--T-G-T-C--A------A------T--------A-----TTT--TC------AA------AA---GA-AAT-TA---TGT--T-TC------TA-A------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAA
gi|113682                     :                                               AAAAGTATT--CC-ACCA---TA-CGAA-GTTTC--AAAT-TGTTG--AT--T-AC--TG-CTA----G-AA-----A-T--A-TTT----AA-A----C-C------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---C--G--GGA----AT-A-G-----T--A---T
gi|113683                     :                                               AAAAGTAAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAT-TTTTTTTAT--T-AT--TG-ATT----T-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-GT-T---GT-ACAT-TG----AA---G-A--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--A-A-T-TA-A------A------T--C-----A-----TTT--TT------AT------AA---GG-AATATAT--TAT--T-TT
gi|113684                     :                                               AAAAATAAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAC-CTTTG--AT--T-AC--TT-TTT----G-AT-----T-T--A-TTT----GA-T----C-T------A-T-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--C-A---T--G--TGA----AG-A----------------T-T--T--T-A-T-C--A------AG-----T--T-----A-----TTT--TT------GA------CA---CA-AAT-AA---T-T--T-TTC----ATA-C------AAA----T-ttaaa
gi|113685                     :                                               AAGAATTAC--CC-ACTA---TA-GAAAATTTTC--AAAC-CTTTG--AT--C-AA--TT-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----GA-T----C-T------A-G-A-AA-T---TT-GCAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--TGA----GG-A-G-----C--A---TAT-T--T--T-----------------------------------------------------------A---AA-AATCTA---TAT--C-T------ATA-C------AAA----T-C-----------------AAAG--T--TAC--ATAGTACGCTTT
gi|113686                     :                                               AAAAATTAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----G-A--------T--A-TTT----TA-T----C-
gi|113686                     :                                                                                                                                                                                                                               --A---TAT-T--T--T-A-T-C--AT-----A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------GA---GA-AAT-AA---T-T--T-TTC----AAA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-A-AAGAAG--T--TGC--A---TAatattatttttaagagaaataatttttcaaacaaatctcttggaaagaagttgcata
gi|113687                     : aaaaattatccaccataggaattttcaaacttttgattacttcttgAAGAATAAT--TC-ACCA---AA-GGGA-TTTAC--AAAA-TTGTT--CT--C-AG--TG-CTT----G-GC-----T-T--A-TTT----CA-C----CGT------A---A-AT-T---CT-ATAT-TGTTCAAA---G-TGAATT---T--A--GGA----AG-A-A-----C--A---TGT-A--TACT-A-G-T--A------A------T--TAAAACA-----TTC--TT------AG------AA---GA-AAT-TG---TAT--T-TTA----ATT-C------GAA----T-CT--C-TTTGAGG---GAAAAG--T--T-C--A---TACA
gi|113688                     :                                                AAAATATT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----T-T------T-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGA-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AAT-TA---TAT--T-TCC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GA-T-AAAAAG--T--TGC--A---
gi|113689                     :                                                AAAATAAT--CT-ACCA---TG-G------------AAA-TTTTG--AT--A-AC--TG-TTT----C-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-A--CTA---T--G--GGA----AG-A-A-----A--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----TTT--TT------GA------AA---GA-AAT-CA---TAT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---TG-T-ACAAAGT-T--TAC--A---GACACTT
gi|113690                     :                                                AAAATTAT--CC-ACCA---CA-G-AA-GTTTC--AA---TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAAA-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C--------G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--GAAGGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------G------T--A-----A-----TTT--TTTTTTTCTACT----AG---CATAAT-TA---T-T--T-TTC----AT--G------ATA----T-CTTCT-TT---GG-T-A----------TGC--A---TACACTTT
gi|113691                     :                                                AAAATATT--TC-ACCA---TA-GACA-TTTTC--AAAA-TGTTG--TT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-C--A-TTC----CA-C----C-C------A-G-T-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---A-T--
gi|113692                     :                                                 AAATATTACCC-ACCA---TA-TGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----G-AT-----T-T--A-TCT----GA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AT---G-T--CTA---T--G--GGA----GG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AA--TA---TTT--T-TTC----ATA-C------AAT----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TAC--A---TA
gi|113693                     :                                                 AAATATT--CC-ACCAATTT-------TTTTT--TTAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TCC----CC-C----C-CCCCCCCG-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--TTA---C--G--GGA----AC-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-T-G-A--A------A------T--A-----A-----ATT--TT------CA------AA---GA-AAT-GA---TAT--T-TTC----ATA-C------AAA-------------A---AG-T-AAAAAG--T--TGC--G---AACACTTT
gi|113694                     :                                                 AAATGAT--CC-ACCA---TA-GAAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AA--TG-CTC----G-AT-----A-T--A-TTT----CA-C----T-C------A-G-A-AC-T---TT-ACGT-TG----AA---G-T--TTA---T--
gi|113695                     :                                                       T--CC-ATTA---TA-GAAA-TTTTC--AAAA-TGTTG--AT--T-TC--TG-CTG----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-A------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--GTA---T--T--GTA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-TA-A------A------T--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AGT-TA---TTT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--T-TT---GA-T-GAAAAA--T--TAC--A---TACACCTT
gi|113696                     :                                                       T--CC-ACCA---TAAGGAT-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AT--TG-CTT----C-AT-----T-T--A-TTTATAGTA-C----C-C------A-G-A-AG-T---TT-ATAT-TG----AT---G-T--CTA---T--G--CGA----AG-A-T-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CG-A------A------T--T-----A-----TTG--TC------AA------AA---GA-AGT-TA---TAC--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAACAG--T--TAC--A---TACACTTT
gi|113697                     :                                                       T--CG-ACCA---TT-GGAA-TTTTA--AAAA-TT------------C--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-C---AT-AC--------------G-T--CTA---T--G--GGA----TG-A-G-----C--A---TG--T--T--T-A-T-TA-A------A------T--T-----A-----TCT--TT------AA------AA---GT-AAT-AA---TAT--T-TTT----ATA-C------AAA----T-AT--C-TT---TG-T-AAAAAG--T--AAT--A---TACACTTT
gi|113698                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-GGAA-TTAGC--AAAA-TTTTA--AT--A-AT--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----T-G------A-G-A-AT-T---TT-ACTT-CG----AT---G-T--TCA---T--G--GAA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------A--T-----A-----TTC--CTG-----CA------AA---GA-A
gi|113699                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-AGAA-TTTAC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT-------C----T-T------A-A-A-A------TT-ACAA-AG----AA---G-T--CCA---T--G--GGA----AA-A-A-----C--A---TGC-T--T--T-A-T-T--A------A------
gi|113700                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-GGAA-T------AAAACTTTTG--AT--TTAC--TA-ATT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------T-G-A-AT-T---TT-ACAT-T----------C-T--GTA---T--T--AAA----AA-A-AAATGCC--A---TCC-T--T--T-A-T-T--A------A---------------AAGAATTTT--TT------GA------AA---GA-AAT-CA--------T-TTT----ATA-G------AAA----T-TT--T-TT---AG-T-GAAAAA--T--TTC--A---CACACTTTaatat
gi|113701                     :                                                        --CC-ACCA---TA-AGGA-TTTAC--AAAA-TTAT---AT--T-AC--TG-CTT----G-ATGTACATGT--A-TTT----CA-C----G-T------A-T-A-GT-T---TT-ACAT-TA----AA---G-T--CTA---C--T--GGA----AA-A-A-----A--A---CAT-T-------------------------------------------TCT--TT------AA------AA---GA-AAT-TG---AAT--T-TTC----TTACT------TTA----T-GT--T-TT---GG-T-GAAAAG--G--TAC--A---CAGACATT
gi|113702                     :                                                           C-ACCA---TA-AGA--TTTTA--GAAA-TTTTG--AT--C-AC--TT-ATT----G-AT-----T-T--A-TTT----TA-C----C-T------A-C-A-A---------------------------T--CTA---T--G--GAA----AG-G-G-----C--A---TGC-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----
gi|113703                     :                                                                 ---TA-GGGA-TGCTC--AGAA-TTTTGC-AT--T-AC--TGGCTG----G-AT-----T-T--A-TGT----CC-C----T-T------T-GTA-AT-TGT-TTGACAT-TT----AAATGG-T--CTA---T--G--GGG----A--A-G-----C--A---TGT-T--T--C-C-T-C--ATTAAGAA------TAGT-----A-----TGG--TT------TA------A----GA-AAT-TA---ATT--T-TTC----ATA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-T--TAAAG--T--T-T--A---TACACTT
gi|113704                     :                                                                      -GGAA-TTC-C--AAA---TTTG--AT--C-AT--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTC----CA-C----C-T------GCG-A-A--T---TT-ACACATG----AA---G----CTAAT-T--G--GGA----GGTA-GC----C--A---TGTGT--T--T-A-T-T--G------A------T--T-----T-----TTT--TT------CA------TA---AG-AAT-GA---TAT--TATTCAAATACA-C------AAA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TGCGAA---CATACTT
gi|113705                     :                                                                                                    -AC--T--CTA----G-GC-----T-T--A-TTT----GA-C----A-T------A-G-A-AT-T------------G----AA---G-T--CTA---T--G--GGACTGAAG-A-G-----C--AATATGT-T--T--T-A-T-C--A------AATTAATT--T-----A-----TTT--TT------AA------AA---GA-AAG-AA---T-T--T-TTC----ATA-TGTGGACAGA----T-CT--C-TT---GG-T-AAAAAG--T--TAC--A---TAC
gi|113706                     :                                                              gaatttttcaaAA-TTTTCC-AAAA-TTTTA--A------C--TG-CTT----G-AT-----T-T--AATGT----AA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAC-AG----AA---G-T--CTA---T--G--GAA----CG-A-------T--A---TG--T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TATCGTT------GA------AA---G
gi|113707                     :                                                                              TCC--AAAA-GTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----G-GT-----T-TTTA-TTT----CA-C----C-T------T-C-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-C-----C--A---TGC-C--T--T-A-T-T--A------
gi|113708                     :                                                                                       -TTTTA--AG--T-AC--TG-CTT----G-AT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-G------T-G-A-AT-T---TT-ACTT-TG----AA---G-T--TTA---T--A--GAC----AG-A-A-----C--T---TAC-T--T--T-A-T-CA-A------A------A--T-----A-----TTT--CC------A-------------A-AAT-TA---T-TCAT-CTC----ATT-A------AAA----T-TT--C-TT---GA-TAAAAAAG--T--GAC--A---TAcaaggaattggacttataa
gi|113709                     :                                                                                           TG--AT--A-AC--TG-CGT----G-AT-----T-T--A-TTT-----------------------------------T-ACAC-GA----AA---G-TA-CTG---T--C--GGA----AA-A-G-----C--A---TGT-T--A--C-A-T-TGAA------A------T--T-----------TCT--TC------GA------AAT--GA-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATC-A------AAATATTT-CT--T-TT---GA-T-AAAATG--T--TTC--A---TA
gi|113710                     :                                                                                                             TT----G-AT----------A-TT------A-A----C-T------A-C-AGAT-T---TT-ACAT-TG----AA---GGT--CTAATAT--G--GGA----AG-AAG-----C--G---TGT-T--T--T-A-T-T--A------AA-----C--T-----A-----TTT--TG------AA------AA---GG-AAT-TA---TAT--T-TTC----ATA-C------ATA----T-CT--T-TT---GT-T-CTTAAG--TTATAT--A---TACACTTT
gi|113711                     :                                                                                                                                  -TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----TTT--TT------CA------AC---GA-AAT-AA---TAT--T-TTC----ATA-A------CAA----
gi|113712                     :                                                                                                                                                            gataagT-T---TT-ACA-------------G-T--ATA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A------TT--TT------AA------AA---GA-AAA-TA---TGT--C-TCA----ATG-C------AAA----T-AT--C-TT---TG-T-GAAAAGTTT--TCT--A---TACATTT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     11                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                                     11 11  1    111  2    1     22    0     33  11 0  11  0   1111   4444444 11 0   22222 0 2222 0 222222 0 0 0  0 222  0    1  1111  222 0 22   444 11 11   3333 22 0 33333 11 222   1 11 22 0 1 0 33 444444 555555 22 22222 33333 11  11  666666666 222222 1 1 1 2   2  333 4 11 1   2222  1 33333333   55555 1   22  444  1 2      22 11 3 22 222        
lowQualScore                  :                                                     .. ..  .    ...  .    .     ..    .     ..  .. .  ..  .   ....   ....... .. .   ..... . .... . ...... . . .  . ...  .    .  ....  ... . ..   ... .. ..   .... .. . ..... .. ...   . .. .. . . . .. ...... ...... .. ..... ..... ..  ..  ......... ...... . . . .   .  ... . .. .   ....  . ........   ..... .   ..  ...  . .      .. .. . .. ...        
lowQualScore                  :                                                     22 55  1    888  0    0     33    9     44  22 9  22  9   8888   9999999 22 9   33333 9 7777 9 666666 9 9 9  9 777  9    7  8888  444 9 11   000 22 22   2222 88 9 22222 22 444   8 22 22 9 8 9 11 444444 555555 33 44444 33333 33  33  444444444 888888 0 0 0 0   1  888 3 44 0   3333  1 44444444   00000 1   77  000  1 3      88 66 6 99 111        
consensus                     :                                               AAAAATANT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
Reference ( family-420 )      :                                               AAAAATANT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113665                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TA----GA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------C-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------A-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113666                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--ATATT-AC--TG-CTT----GAT-----A-T--A-TTT-----A-C----C-C------A-G-A-ACAT---TT-ACAT-TA----GA---G-T--CTA---T--G--G------AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------C-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-T-C----AT-A------A-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113667                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTAA--AATA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-T-A-TT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--AGA----AA-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-G--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------C-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------A-AAA-----T-ATC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--A---TACACTTT
gi|113668                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGGA-TTTTC--AAA--TTTTG--AT--T-AC--TG-CTC----GAC-----A-T--A-TTT----CA-C----C-T------C-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-T-----C--A---TTT-T--T--T---T-C--A------A------T--T-----AT----T--TT--TT-------C-A------A-A-G-A-AAT-TA---TGT--T-TTC----AT-A------A-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--G---TACACTTT
gi|113669                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA----A-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----A-T--A-TTT----AA-A----C-C------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AC---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--AT--TGT-T--TC-T-ATT-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TC---------A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT--------C-AAA-----TCCTCT-TT---GA-T-AAAAG------TAC--A---TACACTTT
gi|113670                     :                                               AAAAATATT--TC-ACCA---AA-TGAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-TTT----TAT-----T-T--A-TTT----TC-C----C-C------G-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AC-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-TGA--A------A------T--T-----A-----T--TT--CT-------C-A------A-A-G-A-AAT-GA---TAT--T-TTC----AT-A------C-ACA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGC--G---AACACTTT
gi|113671                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTG--AAAA-TTTTG--GT--T-AC--TG-CTTTCAAGAT-----A-T--A-TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-G-A-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------T-A------A-T-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----A----------------------------------T-AAAAAG--T--TGC--A---TACAATT
gi|113672                     :                                               AAAAATATT--TC-GTCA---TT-GGAA-TTTTC--TAAA-TTTTG--AT--T-AA--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----TA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--GTA---T--G--GGA----AG-A-G-----T--A---TAT-T--T--TAA-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TC-------A-A------A-C-G-A-AAT-TT---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG---AAAAAT--T--T
gi|113673                     :                                               AAAAATAAC--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--A------------C--C-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----GA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAC-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TAT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAT-TA---TTT--T-TCC----AT-T------T-AGA-----T-ATT--TT---GGTT-AAAAAG--T--TAC--A---TAC
gi|113674                     :                                               AAAAATAAT--CC-ACCA---CA-GGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----AA-C----C-T------A-G-A-AT-A---TT-ATAT-TG----AA---G-T--TTA---T--A--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--A--T-A-A-C--A------AG-----T--T-----A---------C--CT-------A-A------ACA-G-G-AAA-TAT--TTT--T-TTC----AT-A------C-CAA-----C-CTA--TT---GG-T-ATAAAG--T--TAC--A---TACACTTT
gi|113675                     :                                               AAGAATAAG--CC-AGCT---TA-GGGA-TTGTC--AGAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTG----GAT-----T-T--A-TGT----CC-C----T-T------T-A-A-AT-TGTTTT-ACAT-TT----AA---G-T--CTA---T--G--GGG----AA-A-G-----C--A---TGT-T--T--C-A-T-T--A------A------AA-T-----A-----G--TT--TT-------A-T------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--T----A---TACACTTT
gi|113676                     :                                               AAAAATAAT--CA-ACCA---TA-CGAT-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--AT-CTT----GAT-----T-T--A-TCT----CA-C----C-T------A-A-A-AT-T---CT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---A--A--AGA----AG-A-A-----A--A---TGT-T--T--T-AGT-C--A----------------------A-----G--TT--TT-------A--------------A-AAT-GA---TCT--T-TTC----AT-A------G-AAA-----T-CTC--TT---CG-T-AAAAGG--T--TACA-A---AACACTTT
gi|113677                     :                                               AAAAAT-GT--CC-ACCA-------GGA-TTTTC--AAAA-TTTT---AT--T-AC---G-CTC----GAT-----AAT--A-TT-----CA-C----C-T------C-A-A-AC-T---TA-GCATATG----AA---G-T--CTACA-T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-G-G-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TTCC-----A-A------A-A-G-A-AAT-CAAGTTTT--C-TTC----AT-A------A-AAAT----T-CTT--CT---GG-T-AAAGA---T--TGC--A---
gi|113678                     :                                               AAAAATAAC--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAG-TTTTG--AT--T-AC--TG-TTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-CCTATC-T------A-G-A-AT-C---TT-ACAT-TG----AC---G-T--CTA---T--G--GGG----AG-A-G-----CATA---TAT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----G-----T--TT--GT-------A-A------A-A-G-ATAGT-AA---TAT--T-
gi|113679                     :                                               AAAAATGTT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTATC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----ataaaa
gi|113680                     :                                               AAAAATGCT--CC-ACCA---AAAGGAA-TTTTTTAAAAA-TTTTGGAAT--T-AC--TG-CTT----GAT-----A-T--A-TTT----CAACA---C-C------A-A-A-AC-T---AT-ATAT-AG----AAA--G-T--CTA---T--G--GAA----A-----------------TGT-TGTT--T-A-T-C--AC-----A------T--T-----------T--TT--TC-------A-ACACAACA-A-T-A-AAT-T------T--T-TTC----AA-A------A-AAAG----T-CTC--TTCATGG-TTAAAAAG--T--TGC--A---TACACTTa
gi|113681                     :                                               AAAAATGTT--CCCACCA----A-AGAA-TTTTC--AAAA-ATTT---AT--T-ATCATG-CTC----GAT----------A-TTT----CT-C----C-T------C-G-A-AC-C---TT-ACAT-TG----AG---T-C--CTA---TCGG--GGACA--AT-A-G-----C--A---TTTGT--T--T-G-T-C--A------A------T--------A-----T--TT--TC-------A-A------A-A-G-A-AAT-TA---TGT--T-TC------T-A------A-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAA
gi|113682                     :                                               AAAAGTATT--CC-ACCA---TA-CGAA-GTTTC--AAAT-TGTTG--AT--T-AC--TG-CTA----GAA-----A-T--A-TTT----AA-A----C-C------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---C--G--GGA----AT-A-G-----T--A---T
gi|113683                     :                                               AAAAGTAAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAT-TTTTTTTAT--T-AT--TG-ATT----TAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-GT-T---GT-ACAT-TG----AA---G-A--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--A-A-T-TA-A------A------T--C-----A-----T--TT--TT-------A-T------A-A-G-G-AATATAT--TAT--T-TT
gi|113684                     :                                               AAAAATAAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAC-CTTTG--AT--T-AC--TT-TTT----GAT-----T-T--A-TTT----GA-T----C-T------A-T-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--C-A---T--G--TGA----AG-A----------------T-T--T--T-A-T-C--A------AG-----T--T-----A-----T--TT--TT-------G-A------C-A-C-A-AAT-AA---T-T--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-ttaaa
gi|113685                     :                                               AAGAATTAC--CC-ACTA---TA-GAAAATTTTC--AAAC-CTTTG--AT--C-AA--TT-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----GA-T----C-T------A-G-A-AA-T---TT-GCAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--TGA----GG-A-G-----C--A---TAT-T--T--T----------------------------------------------------------------A-A-A-AATCTA---TAT--C-T------AT-A------C-AAA-----T-C----------------AAAG--T--TAC--ATAGTACGCTTT
gi|113686                     :                                               AAAAATTAT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----GA--------T--A-TTT----TA-T----C-
gi|113686                     :                                                                                                                                                                                                                              --A---TAT-T--T--T-A-T-C--AT-----A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------G-A-G-A-AAT-AA---T-T--T-TTC----AA-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-A-AAGAAG--T--TGC--A---TAatattatttttaagagaaataatttttcaaacaaatctcttggaaagaagttgcata
gi|113687                     : aaaaattatccaccataggaattttcaaacttttgattacttcttgAAGAATAAT--TC-ACCA---AA-GGGA-TTTAC--AAAA-TTGTT--CT--C-AG--TG-CTT----GGC-----T-T--A-TTT----CA-C----CGT------A---A-AT-T---CT-ATAT-TGTTCAAA---G-TGAATT---T--A--GGA----AG-A-A-----C--A---TGT-A--TACT-A-G-T--A------A------T--TAAAACA-----T--TC--TT-------A-G------A-A-G-A-AAT-TG---TAT--T-TTA----AT-T------C-GAA-----T-CTC--TTTGAGG---GAAAAG--T--T-C--A---TACA
gi|113688                     :                                                AAAATATT--CC-ACCA---TA-GGAA-TTTTC--AAAA-TTTTT--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----T-T------T-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGA-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAT-TA---TAT--T-TCC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GA-T-AAAAAG--T--TGC--A---
gi|113689                     :                                                AAAATAAT--CT-ACCA---TG-G------------AAA-TTTTG--AT--A-AC--TG-TTT----CAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-A--CTA---T--G--GGA----AG-A-A-----A--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------G-A------A-A-G-A-AAT-CA---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---TG-T-ACAAAGT-T--TAC--A---GACACTT
gi|113690                     :                                                AAAATTAT--CC-ACCA---CA-G-AA-GTTTC--AA---TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAA-----AAT--A-TTT----CA-C----C-C--------G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--GAAGGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------G------T--A-----A-----T--TT--TTTTTTTCTA-C------T-A-GCATAAT-TA---T-T--T-TTC----AT-G--------ATA-----T-CTTCTTT---GG-T-A----------TGC--A---TACACTTT
gi|113691                     :                                                AAAATATT--TC-ACCA---TA-GACA-TTTTC--AAAA-TGTTG--TT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-C--A-TTC----CA-C----C-C------A-G-T-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---A-T--
gi|113692                     :                                                 AAATATTACCC-ACCA---TA-TGAA-TTTTC--AAAC-TTTTG--AT--T-AC--TT-CTT----GAT-----T-T--A-TCT----GA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AT---G-T--CTA---T--G--GGA----GG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AA--TA---TTT--T-TTC----AT-A------C-AAT-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TAC--A---TA
gi|113693                     :                                                 AAATATT--CC-ACCAATTT-------TTTTT--TTAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TCC----CC-C----C-CCCCCCCG-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--TTA---C--G--GGA----AC-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-T-G-A--A------A------T--A-----A-----A--TT--TT-------C-A------A-A-G-A-AAT-GA---TAT--T-TTC----AT-A------C-AAA-------------A---AG-T-AAAAAG--T--TGC--G---AACACTTT
gi|113694                     :                                                 AAATGAT--CC-ACCA---TA-GAAA-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AA--TG-CTC----GAT-----A-T--A-TTT----CA-C----T-C------A-G-A-AC-T---TT-ACGT-TG----AA---G-T--TTA---T--
gi|113695                     :                                                       T--CC-ATTA---TA-GAAA-TTTTC--AAAA-TGTTG--AT--T-TC--TG-CTG----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-A------A-G-A-AT-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--GTA---T--T--GTA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-TA-A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AGT-TA---TTT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTT--TT---GA-T-GAAAAA--T--TAC--A---TACACCTT
gi|113696                     :                                                       T--CC-ACCA---TAAGGAT-TTTTC--AAAA-TTTTG--AT--T-AT--TG-CTT----CAT-----T-T--A-TTTATAGTA-C----C-C------A-G-A-AG-T---TT-ATAT-TG----AT---G-T--CTA---T--G--CGA----AG-A-T-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CG-A------A------T--T-----A-----T--TG--TC-------A-A------A-A-G-A-AGT-TA---TAC--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAACAG--T--TAC--A---TACACTTT
gi|113697                     :                                                       T--CG-ACCA---TT-GGAA-TTTTA--AAAA-TT------------C--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------A-G-A-AT-C---AT-AC--------------G-T--CTA---T--G--GGA----TG-A-G-----C--A---TG--T--T--T-A-T-TA-A------A------T--T-----A-----T--CT--TT-------A-A------A-A-G-T-AAT-AA---TAT--T-TTT----AT-A------C-AAA-----T-ATC--TT---TG-T-AAAAAG--T--AAT--A---TACACTTT
gi|113698                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-GGAA-TTAGC--AAAA-TTTTA--AT--A-AT--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----T-G------A-G-A-AT-T---TT-ACTT-CG----AT---G-T--TCA---T--G--GAA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------A--T-----A-----T--TC--CT-------GCA------A-A-G-A-A
gi|113699                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-AGAA-TTTAC--AAAA-TTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT-------C----T-T------A-A-A-A------TT-ACAA-AG----AA---G-T--CCA---T--G--GGA----AA-A-A-----C--A---TGC-T--T--T-A-T-T--A------A------
gi|113700                     :                                                       T--CC-ACCA---TA-GGAA-T------AAAACTTTTG--AT--TTAC--TA-ATT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-T------T-G-A-AT-T---TT-ACAT-T----------C-T--GTA---T--T--AAA----AA-A-AAATGCC--A---TCC-T--T--T-A-T-T--A------A---------------AAGAATT--TT--TT-------G-A------A-A-G-A-AAT-CA--------T-TTT----AT-A------G-AAA-----T-TTT--TT---AG-T-GAAAAA--T--TTC--A---CACACTTTaatat
gi|113701                     :                                                        --CC-ACCA---TA-AGGA-TTTAC--AAAA-TTAT---AT--T-AC--TG-CTT----GATGTACATGT--A-TTT----CA-C----G-T------A-T-A-GT-T---TT-ACAT-TA----AA---G-T--CTA---C--T--GGA----AA-A-A-----A--A---CAT-T-------------------------------------------T--CT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAT-TG---AAT--T-TTC----TT-A------CTTTA-----T-GTT--TT---GG-T-GAAAAG--G--TAC--A---CAGACATT
gi|113702                     :                                                           C-ACCA---TA-AGA--TTTTA--GAAA-TTTTG--AT--C-AC--TT-ATT----GAT-----T-T--A-TTT----TA-C----C-T------A-C-A-A---------------------------T--CTA---T--G--GAA----AG-G-G-----C--A---TGC-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A-----
gi|113703                     :                                                                 ---TA-GGGA-TGCTC--AGAA-TTTTGC-AT--T-AC--TGGCTG----GAT-----T-T--A-TGT----CC-C----T-T------T-GTA-AT-TGT-TTGACAT-TT----AAATGG-T--CTA---T--G--GGG----A--A-G-----C--A---TGT-T--T--C-C-T-C--ATTAAGAA------TAGT-----A-----TGGTT--T-----------------A-A-G-A-AAT-TA---ATT--T-TTC----AT-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T--TAAAG--T--T-T--A---TACACTT
gi|113704                     :                                                                      -GGAA-TTC-C--AAA---TTTG--AT--C-AT--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTC----CA-C----C-T------GCG-A-A--T---TT-ACACATG----AA---G----CTAAT-T--G--GGA----GGTA-GC----C--A---TGTGT--T--T-A-T-T--G------A------T--T-----T-----T--TT--TT-------C-A------T-A-A-G-AAT-GA---TAT--TATTCAAATAC-A------C-AAA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TGCGAA---CATACTT
gi|113705                     :                                                                                                    -AC--T--CTA----GGC-----T-T--A-TTT----GA-C----A-T------A-G-A-AT-T------------G----AA---G-T--CTA---T--G--GGACTGAAG-A-G-----C--AATATGT-T--T--T-A-T-C--A------AATTAATT--T-----A-----T--TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAG-AA---T-T--T-TTC----AT-ATGTGGAC-AGA-----T-CTC--TT---GG-T-AAAAAG--T--TAC--A---TAC
gi|113706                     :                                                              gaatttttcaaAA-TTTTCC-AAAA-TTTTA--A------C--TG-CTT----GAT-----T-T--AATGT----AA-C----C-T------A-G-A-AT-T---TT-ACAC-AG----AA---G-T--CTA---T--G--GAA----CG-A-------T--A---TG--T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--ATCGTT-------G-A------A-A-G-
gi|113707                     :                                                                              TCC--AAAA-GTTTG--AT--T-AC--TG-CTT----GGT-----T-TTTA-TTT----CA-C----C-T------T-C-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-C-----C--A---TGC-C--T--T-A-T-T--A------
gi|113708                     :                                                                                       -TTTTA--AG--T-AC--TG-CTT----GAT-----T-T--A-TTT----CA-C----C-G------T-G-A-AT-T---TT-ACTT-TG----AA---G-T--TTA---T--A--GAC----AG-A-A-----C--T---TAC-T--T--T-A-T-CA-A------A------A--T-----A-----T--TT--CC-------A--------------A-AAT-TA---T-TCAT-CTC----AT-T------A-AAA-----T-TTC--TT---GA-TAAAAAAG--T--GAC--A---TAcaaggaattggacttataa
gi|113709                     :                                                                                           TG--AT--A-AC--TG-CGT----GAT-----T-T--A-TTT-----------------------------------T-ACAC-GA----AA---G-TA-CTG---T--C--GGA----AA-A-G-----C--A---TGT-T--A--C-A-T-TGAA------A------T--T-----------T--CT--TC-------G-A------A-ATG-A-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT--------C-AAAATATTT-CTT--TT---GA-T-AAAATG--T--TTC--A---TA
gi|113710                     :                                                                                                             TT----GAT----------A-TT------A-A----C-T------A-C-AGAT-T---TT-ACAT-TG----AA---GGT--CTAATAT--G--GGA----AG-AAG-----C--G---TGT-T--T--T-A-T-T--A------AA-----C--T-----A-----T--TT--TG-------A-A------A-A-G-G-AAT-TA---TAT--T-TTC----AT-A------C-ATA-----T-CTT--TT---GT-T-CTTAAG--TTATAT--A---TACACTTT
gi|113711                     :                                                                                                                                 -TTT----CA-C----C-C------A-G-A-AC-T---TT-ACAT-TG----AA---G-T--CTA---T--G--GGA----AT-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-C--A------A------T--T-----A-----T--TT--TT-------C-A------A-C-G-A-AAT-AA---TAT--T-TTC----ATAA------C-AA
gi|113712                     :                                                                                                                                                           gataagT-T---TT-ACA-------------G-T--ATA---T--G--GGA----AG-A-G-----C--A---TGT-T--T--T-A-T-CA-A------A------T--T-----A--------TT--TT-------A-A------A-A-G-A-AAA-TA---TGT--C-TCA----AT-G------C-AAA-----T-ATC--TT---TG-T-GAAAAGTTT--TCT--A---TACATTT