lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222222222222222222222 55555 22 22222
lowQualScore : 1 1 11 1 4 3333333 1 2 1 1 1 1 2 3333 555555 222222 66666666666666 2 1 1 333 1 000000 2 222222 444444 2222 1 1 33333 2222 0 2 11 555555555 2 44444 1 99999999 1 444 6666 2 444 11 11 3 1 33 22 11 5555555555555555555555555555555 1 22222 11 11 33 1 11 222 1 1 11 1 3 99 1 1 2 1 3 1 2 1 2 1 5555555555 22222 1 666 11 2 333 44 55555 22 22222 2 1 1
lowQualScore : . . .. . . ....... . . . . . . . .... ...... ...... .............. . . . ... . ...... . ...... ...... .... . . ..... .... . . .. ......... . ..... . ........ . ... .... . ... .. .. . . .. .. .. ............................... . ..... .. .. .. . .. ... . . .. . . .. . . . . . . . . . . .......... ..... . ... .. . ... .. ..... .. ..... . . .
lowQualScore : 3 3 77 2 7 8888888 2 4 1 1 1 0 1 2222 000000 999999 00000000000000 1 0 0 222 0 666666 0 888888 999999 1111 0 0 33333 0000 9 8 33 222222222 1 77777 1 77777777 1 111 4444 2 111 55 55 2 1 00 55 44 2222222222222222222222222222222 0 77777 55 55 66 1 44 999 1 1 55 1 2 11 0 0 1 0 1 0 1 0 1 1 8888888888 33333 1 222 66 3 777 00 77777 88 11111 4 2 3
consensus : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-NTA-T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CAT----TTAAG-GG--NT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
Reference ( gi|71193 ) : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CATTAT-TTAAG-GG--AT--T-T---A--G-----AA--T---C-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71195 : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-A-GTA-T-G-T-G-T-C-------TT----------AATAA---TAAG-GG--AT--T-T---A--G-----AA--TA--C-TCGGAG-ACG-TAC
gi|71194 : CCTTTTTCA-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-ATT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-A-----CTG----C-G-T--T-----C---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--GCA-A--AGTGA---A-C-AG--AA-A-T-GTA-T-G-C-G-T-C-T-A---------------TATCA--TCAAG-GG--AT--T-T---AG-G-----AA--T---T-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71197 : CCTTTTT-A-TT--TT--ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-GA-----G-AT--C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-TG--AA-A-T-GT--T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CATT------AA-GG--AT--T-T---AG-G-----AA--TA--C-TC-GAG-ACG-TAC
gi|71196 : CCCTTTT-A-TT--TTT-ACAG-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CCG----C-G-T--T-----A---AGT-A-----A-AC-----A-ATG-T---AAAC-A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AATGA---A-C-GG--AA-A-C--T--T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TCAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AG--T---A-CC-AAA-ATC-TAC
gi|71201 : CCTTTTT-A-TT--TTT-AACA-C-------AG-TG-TA-T-TT-A-T-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATTT----G-T-G-TG----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A--C-------ATG-T---A----A-A---C--A--TGGC-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GTA-T---T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TTCAG-GG--AT--T-T---A--G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71198 : CTTTTTT-A-TT--TT--ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-T-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----C---GCT-A-----A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--TGTGA---A-C-GA--AA-A-T-TTA-T-G-C-T-T-C-A-A-A-TT----------CA------TGAGAGG--AC--T-TGA-G--G-----AA--C---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71199 : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------CG-TG-TA-C-TT-TATATGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---CAA------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---AC--------------------------------------C--A--TG-C-A--G--A--G---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-TTA-T-G-T-G-TCC-C-A-A-TT----------CA-----TTAAG-GG--AT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ACC-TAC
gi|71200 : CCCTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----A------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T--------T------TTT----G-TCG-T------TG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------ATT-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A--------------------------T----------CA-----TTAAG-GG--AT--T-TTAAG--G-----AA--T---T-CC-GCG-ATC-TAC
gi|71202 : CCTTTTT-AATT--TTT-ACA--C--------G-TG-TA-C-TT-TAT-TGA-TT---G------A------CG--------------T--TA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-------CTG----CGG-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--C--CA-ACA-A--AGTGA---AGC-GG---A-A-T-TTA-T-G-T-G-T-C-C-A-A-TT----------CA-----TTAAG-GG------T-T---AGCG-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71204 : CCTTTTT-A-TT--TTA-TCAA-C-------AG-TG-TA-T-TT--AT-TGA-T----G-------------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----GTTCG-T-----CTG----C-G-T--T-----C---ACTAA-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A---G-C-A--G--G--A---------------AAT-------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-AA--AG-A-TAGTA-T-G-T-G-T-C-T-AGA-TT----------C---AT-CCAA---G--AT--T-T---AG-G-----AA--T---TACC-GAG-ATCATAC
gi|71203 : CCTTTTT-A-TT--TTTTACAA-C-------AG-TG-TA-C-TTTAAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTTTGGTG-TGG-C-----TGG----C-G-T--T-----G---ACTTA-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--AGAA--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACT-A---GTGA---A-C-GG-------------T-T-T---T-C-C-A-A-AT----------CATTA-----AG-GG--AT--T-T---AG-G-----AA--TA--A-CC-GAG-ATC-
gi|71205 : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAATC-------CG-T--TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------GC--------------T-GTA-CAA---C-A------T-A------T------TTT------TCT-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G--TG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--T---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T--TA--------------------------------------TTAAG-GG--AT--T-T---A--G-----GA--T---TACC-GAT-AT
gi|71207 : CCCCTTT-A-TT--TTT-A-AA-CCACACTCAG-TA-TA-CCTT-AAT-TGA-T----GC-----A------CG--------------TTGTA-C-A---C-A------TGA------T------TTT----G-CCG-T-----CTG----C-C-TCTT-----GC--ACT-A-----ACAC-----G-ATG-TTACA----A-A---C--A--TT-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACATA--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GTC-A-G-TCGTT-C-T-A-A--T----------CATT------AG-GG--AT--T-T---A--G-----GA--CTTAC-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71208 : CTTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CGTAAACACATATACAT-GTA-T-A---T-A------T-A------T------TTT----G-TCC-T-----CTG----C-G-T--T-----C---GCT-G-----A-AA-----A-A-G-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A--A--A---------------AAGAATCTTTCATTTGA-T-----TC--G--CT-ATT-A--AAT-A---A-C-GG--AA-A-TCTTA-T-G-T-G-T-A-T-A-A-TT----------CATTCT-T---G-GGCTCT--T-T---A--G-----GAACT---A-CC-GAGCATC-
gi|71206 : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TA-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-TCTGAGCTG----C-G-T--T-----G---ACT-
gi|71210 : CCTTTTT-A-TG--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-ACA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCA-T-----CTG----C-G-T--T-----G---
gi|71211 : CCATTTT-A-CT--TT--ACA--C-------TG-TAATA-C-TT-AAT-TGAAT----G------A------CG--------------T-GTAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T-------------CT-G-----A-GG-----A-ATGTT---G----A-A---C--A--TG-C-G--G--AGTA---------------A---------------G-T-----TCCGG--C--TCA-A----TGACCCC-C-GGAAAA-A-T--TA-TGG-T-G-T-T-TCA-A-TTTCCCGAGTGCCATTTTATTAA---G--ATTAT-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71209 : CCTTTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------AA-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------AG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------
gi|71212 : CTCTTT-G-TTAATTT-ACAA-C-------AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----C---GCT-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-CAA--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--A-TGA---A-C-GG--AA-AGT-G-A-T-G-T-G-T-C-T-A-A-------------GATCA--TTAGG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAT-A-C-TACcagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgatgttgtcgtctacgttgacatgtaaacatgcagaaaattcgcacaaagtga
gi|71213 : CTTGTT-A-TT--TT---CAA-C-------AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGAAT----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--TC----G---GCT-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-ACGA--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-AGT-G-A-T-G-T-G-T-C-T-AGA-TT----------CATTA
gi|71215 : CTTGTT-A-AT--TTT-ACAA-C-------AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----gggctgtaggaatacgtatctac
gi|71214 : CTTGTT-A-AT--TTT-ACAA-C-------AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----
gi|71216 : CTTGTT-A-AT--TTA-ACAA-C-------AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-G----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----
gi|71217 : TTTTT-A-TT--TTT--CGA-T-------AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-ATA-C-A---A-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--TCGTTCA---GCT-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--ATTTGTC-ATTT--T--A---------------A---------------A-T-----TC--GCAC--ACA-A--ATTGA---A-CAGG--AA-A-T-TTA-T-G-G-T-T-C-T-A-A-TT----------C--CAT----AG-GG--GT--T-T---A--G-----GA--A---T-AC-GAG-AAT-TAC
gi|71218 : TTTC-A-TT--TTT-ACAA-C-------TG-TG-AT-C-CT-AAT-TGA-T----G------A------TG--------------C-ACA-T-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-GTT--T-----GTATGCT-------A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TT-C-A--G--A--AAAAGTATTGTTTTT-A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-TCA-T-G-C-G-T-C-C-A-A-TT----------C----C-TTAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71220 : TTTT-A-TT--TTT-ACAA-T-------AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CC--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TTC----G-TTG-T-----CTG----C-G----------------T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--AAATAATCTTGTCATTA---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-AT--AA-G-T-TTT-T-G-C-G-T-C-T-A-A-T------------ATTTA-TTAAA-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71219 : TTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------TA-TG-AA-C-CT-AAT-TGA-T----GAAGTATA------CA--------------T-GTA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-GTT--T-----GTTCGCT-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--AAAGAATCTTGTCATTA---------------A-T-----TC--G--C--AGA-A--AGTGA---A-C-AG--AA-A-T-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A-T-TT----------C----C-TTAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71221 : TTTT-A-TT--TTT-ACAA-C-------TG-TG-CA-C-CT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-------A---T-G------T-A------T------TTT----G-TCA-T-----CTG----C-GTT--T-----GTTCGCT-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--AA-C-A--G--A--A---------------A---------------A-
gi|71222 : TTAT-A-TT--TTT-ACAAAT-------AG-TG-AA-C-TT-CAT-TGA-T----G------AGGTACATG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TTA----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--TC----GTTTGCT-A-----A-AA-----A-AGG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--A---------------A---------------A-gtttcttatcattaattcgcactttctgtatgtttacatttttagcgaacaaactcagatgaagggctttaggaataacgagatctac
gi|71223 : T-A-TT--TTT-ACAA-C-------AG-TG-TA-C-TT-AAT-TAA-T----G------A------CA--------------T-TTA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TTT----G-TCG-T-----CTG----T-G-T--T-----A---ACT-A-----A-AC-----A-ATG-T---ACGTAA-A---C--A--TG-T-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TCAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71224 : -A-TG--TTT-ACAAAC-------AG-TGGTAAT-TT-AAT-TGA-TATATG------A------CG--------------T-TTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----A---ACT-A-----A-ACAAATTG-ATG-T---A----ATA---A--A--TG-C-A--GA-A--A---------------A---------------A-A-----TC--G--T--AC-------T-A---A-C-AA--AA-G-----A-T-G-T-GTT-C-T-A-A-TT----------CA--A---TAAG-GG--CT--TAT---A--GT----AA--TA--T-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71225 : --TTT-ACGA-T-------AGGTG-AA-C-TT-ATT-TGA-T----G------A------CG--------------TAGGA-C-A---A-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--TCGTC-G---GCT-AG----A-AA-----A-ATG-T--------A-A---C--A--T--C-T--G--T--C---------------C---------------A-TTTTAATC--T--C--ACA-A--ATTGA---A-C--G--AA-A-T-TTAGT-G-T-G-T-T-T-A-ATTT----------CA--A---TAAG-GG--CT--T-T---A--GGA---AA--T---TACC-AAG-ATC-
gi|71226 : TT-ACAA-C-------AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----C---GCT-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-AGT-G-A-T-G-T-G-T-C-T-A-G-AT----------CA-----TTAGG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAT-ATC-TAC
gi|71227 : TT-ACAAAC-------AA-T--TA-C-TT-AAT-TAC-T----GG-----A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------A-A------T------TTC----G-TCG-T-----ATG----A-G-T--T-------------------------------------------------------------------------------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-ACAAATGA---A-C-GG--AC-T-T-GTA-C-G-T-G---C-T-C-A-TT----------CATTC-----AG-GG---C--T-T---A--G-----AAA-T---A-CC-GAG-ATC-TAC
gi|71230 : -C-TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA---A---C-A------T-A------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-A------G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-T--G--G--A---------------C-----------------T-----TC--G--C--ACT-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GTA-T-G-T-A-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TTAAG-AG--AT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GA
gi|71231 : -C-TT-AAT-TGA-T----G------A------TG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTT----G-TTG-T-----CTG----T-G-T--T-----A---GCT-A-----A-AC-----
gi|71229 : -TT-AAT-TGA-T----G------A------CG--------------T-A-A-C-A---T-AAAC---T-A------T------TTT----G-TCA-T-----CTG----C-T-T--TTC---G---CCT-AGTTAAA-AC-------ACG-----A----A-AGAGCTGA--CG-T-A--G--A--A---------------ATATTGCCATCTA---A-T-----TC--G--C--ACA-A---GTGA---A-C-G---AA-A-T-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A-
gi|71228 : ttT-TGA-T----G------A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------TTA------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----GAATG-T---A----A-A---C--A--TG---A-------------------------------------------------C--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-TTA-T-GTT-GCT-CTT-A-A-TT------------TCAT-TTAAG-GG--AT--TAG---G--G-----AA--TA--C-AC-GAG-AT
gi|71232 : ttctT-TGG-T----G------A------CG--------------T-ATT-C-A---C-A------T-A------T------TTC----G-TCG-T-----CTG----T-T-T--TC----G---TCT-C-----G-CC-----T-A-G-T---A----T-----C--T--TG-C-C--A--T--T---------------A---------------A-T-----TT--G--C--ACG-A--AGTGA---A-T-GG--A----------T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TGAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAA-ATC-TAC
gi|71209 : -A------T------GTT----G-TCG-T-----CTA----C-G-T--T-----G---AC-------------------ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---
gi|71233 : cctttttatttttacaacaatgtacttaattgatgaagtatacacatacagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatg------T------TTT----G-TCG-T-----CTG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-TG--AA-A-T-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TTAAG-GG--AT--T-
gi|71234 : TT----G-CCGAT-----TGG----C-G-T--T-----G---ACT-A-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A--TG-C-A--G--A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ACA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------TA-----TTAAG-GG--AT--T-T---AG-G-----AA--TA--C-TCGGAG-ACG-TAC
gi|71221 : -TCA-T-----CTGAGTTT-G-T--T-----C---GCT-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G--A--A---------------A---------------G-T-----GC--G--A--ATT-A--A-TGA---T-A-AG--AA-A-C-TTT-T-C-T-G-T-T-T-G-T-TTA---------CATT-T-TTA
gi|71235 : ttttatttttacaactgtgcacctaattgatgacgtatgtattttgtcatctgcgtttgttcgcTG----G-G-T--T-----G---ACT-AT----A-AC-----G-ATG-T---A----GTA---C--A--TGGC-A--G--A--A---------------G---------------A-A-----TC--G--CTAACA-A--AGTGAG--A-C-GG--AATA-T-GTA-T-GAT-G-T-CCT-A-A-TT----------TATTA-----AG-GG--AT--T-T---A--GGGAATAA--C---T-CG-GAG-ACG-TACagggctttaggaataacgagatctac
gi|71236 : --A--A---------------A---------------A-T-----TC--G--C--ATA-A--AGTGA---A-C-GG--AA-A-T-GCA-T-G-T-G-T-C-T-A-
gi|71237 : ---------------A---------------A-T-----TC--G--C--GCA-A--A---A---G-C-GG--AA-A-T-TTA-T-G-T-G-C-C-T-A-A-TT----------CA-TA----AAG-GG--TT--T-T---A--G-----GA--
gi|71238 : --AGTAC---A-C-GG--AA-A-T-TTA-A-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TTAGG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CC-GAG-ATC-TACataacgatacatatctac
gi|71239 : -T-G-T-G-T-C-T-A-A-TT----------CA-----TTAAG-GG--TT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CT-GTG-ATC-TAC
gi|71240 : -T-G-T-G-T-C-T-A-C-TT----------CA-----TTAAG-GG--CT--T-T---AG-G-----AA--T---A-CT-GTG-ATC-TAC
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 1 1 11 1 222 1 4 11 1 2 1 1 1 1 2 3333 2 555555 55555555555555 2 1 1 333 1 000000 2 222222 444444 2222 1 1 33333 0 0 11 666666666 1 1 44444 1 77777777 1 444 6666 2 444 11 11 3 1 44 1 11 666666666666666 1111111111111111111111111111111 22222 11 11 33 1 22 11 1 1 1 55555 1 55 1 1 2 1 3 1 2 1 77777777 2 1 5555555555 111 9999999 444 1 11 1 1 44 1 444 2 33 2222 2 1
lowQualScore : . . .. . ... . . .. . . . . . . . .... . ...... .............. . . . ... . ...... . ...... ...... .... . . ..... . . .. ......... . . ..... . ........ . ... .... . ... .. .. . . .. . .. ............... ............................... ..... .. .. .. . .. .. . . . ..... . .. . . . . . . . . ........ . . .......... ... ....... ... . .. . . .. . ... . .. .... . .
lowQualScore : 2 2 77 1 000 1 6 66 1 3 1 1 1 0 0 1111 0 888888 99999999999999 0 0 0 111 0 444444 0 777777 888888 0000 0 0 33333 9 9 33 555555555 0 0 77777 1 99999999 1 111 4444 2 111 55 55 2 1 55 1 44 444444444444444 2222222222222222222222222222222 66666 44 44 66 1 55 44 0 0 1 99999 1 22 0 0 0 0 0 0 0 0 00000000 1 1 7777777777 888 9999999 555 1 55 1 1 77 1 111 2 00 3333 2 2
consensus : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
Reference ( family-419 ) : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-NTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71193 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------CATTAT----TTAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-C---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71194 : CCTTTTTCA-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-A-----CTGC-G-T--T-----C---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-GTA-T-G-C-G-T-C-T-A--------T-A-T----------C---A-----TCAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-T---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71195 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AA-GTA-T-G-T-G-T-C-T-T--------A-A-T----------A---A------TAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71196 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-G-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CCGC-G-T--T-----A---AG-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---AAAC-A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AAT-GA-A-C-----GGAA-AC-T---T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAG--T-A---C-C--A----AA-ATC-TAC
gi|71197 : CCTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-GA-----G-AT--C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GT--T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----T--AAGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---CTC--G----AG-ACG-TAC
gi|71198 : CTTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--TGT-GA-A-C-----GAAA-AT-TTA-T-G-C-T-T-C-A-A--------A-T-T----------C---AT----GAGAGGA--CTT-G--A-G-GAA--C-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71199 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--CG-TG-TA-C-TT-TATATGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---CAA------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC---------------------------------------C--A--TG-C-A--G-A--G---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA-T-G-T-G-TCC-C-A--------A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ACC-TAC
gi|71200 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----A-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T--------T------TT----TG-TCG-T------TGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------AT--------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A---------------------------------T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-TTAA-G-GAA--T-T---C-C--G----CG-ATC-TAC
gi|71201 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---AC-A-C--AG-TG-TA-T-TT-A-T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATT----TG-T-G-TG----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A--C-------ATG-T---A----A-A---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA-T---T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----TC-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71202 : CCTTTTT-AATT--TTT-A---CA---C---G-TG-TA-C-TT-TAT-TGA-TT---G-A------CG--------------T--TA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-------CTGCGG-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--C--CA-A-CA--A--AGT-GA-AGC-----GG-A-AT-TTA-T-G-T-G-T-C-C-A--------A-T-T----------C---A-----TTAAGGG----T-T--A-GCGAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71203 : CCTTTTT-A-TT--TTTTA---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TTTAAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTTTGGTG-TGG-C-----TGGC-G-T--T-----G---ACTT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-AAGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-C---T--AGT-GA-A-C-----GG----T-TT----------T-C-C-A--------A-A-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG-ATC-
gi|71204 : CCTTTTT-A-TT--TTA-T---CA-A-C--AG-TG-TA-T-TT--AT-TGA-T----G--------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TGTTCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---AC-TAA-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A---G-C-A--G-G--A---------------AAT-------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----AAAG-ATAGTA-T-G-T-G-T-C-T-AG-------A-T-T----------C---AT----CCAA--G--ATT-T--A-G-GAAT-T-A---C-C--G----AG-ATCATAC
gi|71205 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-ATC--CG-T--TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------GC--------------T-GTA-CAA---C-A------T-A------T------TT----T--TCT-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G--TG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--T---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT--TA-------------------------------------------------TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAT--T-A---C-C--G----AT-AT
gi|71206 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TA-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-TCTGAGCTGC-G-T--T-----G---AC-T-
gi|71207 : CCCCTTT-A-TT--TTT-AAACCACA-CTCAG-TA-TA-CCTT-AAT-TGA-T----GCA------CG--------------TTGTA-C-A---C-A------TGA------T------TT----TG-CCG-T-----CTGC-C-TCTT-----GC--AC-T-A-----ACAC-----G-ATG-TTACA----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CAT-A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTC-A-G-TCGTT-C-T-A--------A---T----------C---AT----T--AGGG--ATT-T--A-G-GACT-T-AC--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71208 : CTTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CGTAAACACATATACAT-GTA-T-A---T-A------T-A------T------TT----TG-TCC-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-G-----A-AA-----A-A-G-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------AAGAATCTTTCATTTGA---------------T-----TC--G--CT-A-TT--A--AAT--A-A-C-----GGAA-ATCTTA-T-G-T-G-T-A-T-A--------A-T-T----------C---AT----TCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGCATC-
gi|71209 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AA-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------AG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------
gi|71209 : -A------T------GT----TG-TCG-T-----CTAC-G-T--T-----G---AC--------------------ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-cagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgatgttgtcgtctacgttgacatgtaaacatgcagaaaattcgcacaaagtga
gi|71210 : cctttttatttttacaacaatgtacttaattgatgaagtatacacatacagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgCCTTTTT-A-TG--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ACA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-G-T--T-----G---
gi|71211 : CCATTTT-A-CT--TT--A---CA---C--TG-TAATA-C-TT-AAT-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T-------------C-T-G-----A-GG-----A-ATGTT---G----A-A---C--A--TG-C-G--G-AGTA---------------A---------------G---------------T-----TCCGG--C--T-CA--A----T-GA-C-CCCCG-GAAA-AA-TTA-TGG-T-G-T-T-TCA--------A-T-TTCCCGAGTGCC---ATTTTATTAAGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71212 : CTCTTT-G-TTAATTT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-CAA--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--A-T-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-GAT----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-A-C-TAC
gi|71213 : CTTGTT-A-TT--TT------CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----G---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-ACGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA-T-G-T-G-T-C-T-AG-------A-T-T----------C---AT----T--AGGG--CTG-T--A-G-GAA--T-A---C----------GTATC-TAC
gi|71214 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71215 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71216 : CTTGTT-A-AT--TTA-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-G----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71217 : TTTTT-A-TT--TTT-----CG-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTTCA---GC-T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--ATTTGTC-ATTT-T--A---------------A---------------A---------------T-----TC--GCAC--A-CA--A--ATT-GA-A-CA----GGAA-AT-TTA-T-G-G-T-T-C-T-A--------A-T-TC---------C---AT-------AGGG--GTT-T--A-G-GAA--T-A-----C--G----AG-AAT-TAC
gi|71218 : TTTC-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-AT-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------C-ACA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTATGC-T-A-----A--C-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------AAGTATTGTTTTTAA-T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TCA-T-G-C-G-T-C-C-A--------A-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71219 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TA-TG-AA-C-CT-AAT-TGA-T----G-AAGTATACA--------------T-GTA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGAATCTTGTCATTAAT-----TC--G--C--A-GA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------T-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71220 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CC--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TTG-T-----CTGC-G-----------------T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--AAATAATCTTGTCATTA---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----ATAA-GT-TTT-T-G-C-G-T-C-T-AAT------A-T-T----------T---A-----TTAAAGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71221 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-CA-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-------A---T-G------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-GTT--T-----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--AA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGT-------------T-----TC--T--T--ATCATTA--ATTCGC-A-CTTTCTGTAT-GT-TTA-C-A-T-T-T-T-T-AGCGAACAAA-C-T----------C---AG----ATGAAGGG-CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71222 : TTAT-A-TT--TTT-A---CA-AAT--AG-TG-AA-C-TT-CAT-TGA-T----G-AGGTACATG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----AG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----GTTTGC-T-A-----A-AA-----A-AGG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------
gi|71223 : T-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TAA-T----G-A------CA--------------T-TTA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TT----TG-TCG-T-----CTGT-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---ACGTAA-A---C--A--TG-T-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71224 : -A-TG--TTT-A---CA-AAC--AG-TGGTAAT-TT-AAT-TGA-TATATG-A------CG--------------T-TTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-ACAAATTG-ATG-T---A----ATA---A--A--TG-C-A--GAA--A---------------A---------------A---------------A-----TC--G--T--A-C--------T--A-A-C-----AAAA-G----A-T-G-T-GTT-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----ATAAGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71225 : --TTT-A---CG-A-T--AGGTG-AA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------TAGGA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTC-G---GC-T-AG----A-AA-----A-ATG-T--------A-A---C--A--T--C-T--G-T--C---------------C---------------A---------------TTTTAATC--T--C--A-CA--A--ATT-GA-A-C------GAA-AT-TTAGT-G-T-G-T-T-T-A--------ATT-T----------C---A-----ATAAGGG--CTT-T--A-G-GAAATT-A---C-C--A----AG-ATC-
gi|71226 : TT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA-T-G-T-G-T-C-T-A--------G-A-T----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-ATC-TAC
gi|71227 : TT-A---CA-AAC--AA-T--TA-C-TT-AAT-TAC-T----GGA------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------A-A------T------TT----CG-TCG-T-----ATGA-G-T--T-------------------------------------------------------------------------------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--ACAAAT-GA-A-C-----GGAC-TT-GTA-C-G-T-G---C-T-C--------A-T-T----------C---AT----TCA--GG--GCT-T--A-G-AAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71228 : T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------TTA------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----GAATG-T---A----A-A---C--A--TG---A--------------------------------------------------------------C--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA-T-GTT-GCT-CTT-A--------ATT-T----------C---AT----TTAAGGG--ATT-A--G-G-GAA--T-A---CAC--G----AG-AT
gi|71229 : ttct-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-A-A-C-A---T-AAAC---T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-T-T--TTC---G---CC-T-AGTTAAA-AC-------ACG-----A----A-AGAGCTGA--CG-T-A--G-A--A---------------ATATTGCCATCTA---A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A---GT-GA-A-C-----G-AA-AT-TTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------
gi|71230 : tt-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA---A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-A------G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-T--G-G--A---------------C-------------------------------T-----TC--G--C--A-CT--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA-T-G-T-A-T-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----TTAAGAG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----A
gi|71231 : -C-TT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TTG-T-----CTGT-G-T--T-----A---GC-T-A-----A-AC-----
gi|71232 : T-TGG-T----G-A------CG--------------T-ATT-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TCG-T-----CTGT-T-T--TC----G---TC-T-C-----G-CC-----T-A-G-T---A----T-----C--T--TG-C-C--A-T--T---------------A---------------A---------------T-----TT--G--C--A-CG--A--AGT-GA-A-T-----GGA---------T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----G-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AA-ATC-TAC
gi|71233 : ------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-
gi|71234 : T----TG-CCGAT-----TGGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA-T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------T---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71235 : TGG-G-T--T-----G---AC-T-AT----A-AC-----G-ATG-T---A----GTA---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------G---------------A---------------A-----TC--G--CTAA-CA--A--AGT-GAGA-C-----GGAATAT-GTA-T-GAT-G-T-CCT-A--------A-T-T----------T---AT----T-AAGGG--ATT-T--AGG-GAA--T-AACTC-G--G----AG-ACG-TAC
gi|71236 : -A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-TA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GCA-T-G-T-G-T-C-T-A--------
gi|71237 : ---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--A----A-G-C-----GGAA-AT-TTA-T-G-T-G-C-C-T-A--------A-T-T----------C---A-----TAAAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--GATACAT-ATC-TAC
gi|71238 : --AGT-AC-A-C-----GGAA-AT-TTA-A-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----T-AGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71239 : -T-G-T-G-T-C-T-A--------A-T-T----------C---AT----T-AAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
gi|71240 : -T-G-T-G-T-C-T-A--------C-T-T----------C---AT----T-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222222222222222222222 2222222
lowQualScore : 1 1 11 1 222 1 4 11 1 2 1 1 1 1 2 3333 2 555555 55555555555555 2 1 1 333 1 000000 2 222222 444444 2222 1 1 33333 0 0 11 666666666 1 1 44444 1 77777777 1 444 6666 2 444 11 11 3 1 44 1 11 666666666666666 1111111111111111111111111111111 22222 11 11 33 1 22 11 1 1 1 55555 1 33 22 1 2 2 1 2 44444444 33 2 1 5555555555 111 0000000 333 1 11 1 1 44 1 444 2 33 2222 2 1
lowQualScore : . . .. . ... . . .. . . . . . . . .... . ...... .............. . . . ... . ...... . ...... ...... .... . . ..... . . .. ......... . . ..... . ........ . ... .... . ... .. .. . . .. . .. ............... ............................... ..... .. .. .. . .. .. . . . ..... . .. .. . . . . . ........ .. . . .......... ... ....... ... . .. . . .. . ... . .. .... . .
lowQualScore : 2 2 77 1 000 1 6 66 1 3 1 1 1 0 0 1111 0 888888 99999999999999 0 0 0 111 0 444444 0 777777 888888 0000 0 0 33333 9 9 33 555555555 0 0 77777 1 99999999 1 111 4444 2 111 55 55 2 1 55 1 44 444444444444444 2222222222222222222222222222222 66666 44 44 66 1 55 44 0 0 1 99999 1 66 44 0 0 0 0 0 66666666 44 1 1 7777777777 888 9999999 555 1 55 1 1 77 1 111 2 00 3333 2 2
consensus : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
Reference ( family-419 ) : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71193 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------CATTAT----TTAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-C---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71194 : CCTTTTTCA-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-A-----CTGC-G-T--T-----C---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-GTA--T-G-CG-T-C-T--------A--T-A-T----------C---A-----TCAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-T---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71195 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AA-GTA--T-G-TG-T-C-T--------T--A-A-T----------A---A------TAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71196 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-G-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CCGC-G-T--T-----A---AG-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---AAAC-A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AAT-GA-A-C-----GGAA-AC-T----T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAG--T-A---C-C--A----AA-ATC-TAC
gi|71197 : CCTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-GA-----G-AT--C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GT---T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T--AAGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---CTC--G----AG-ACG-TAC
gi|71198 : CTTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--TGT-GA-A-C-----GAAA-AT-TTA--T-G-CT-T-C-A--------A--A-T-T----------C---AT----GAGAGGA--CTT-G--A-G-GAA--C-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71199 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--CG-TG-TA-C-TT-TATATGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---CAA------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC---------------------------------------C--A--TG-C-A--G-A--G---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-TCC-C--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ACC-TAC
gi|71200 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----A-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T--------T------TT----TG-TCG-T------TGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------AT--------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A----------------------------------T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-TTAA-G-GAA--T-T---C-C--G----CG-ATC-TAC
gi|71201 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---AC-A-C--AG-TG-TA-T-TT-A-T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATT----TG-T-G-TG----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A--C-------ATG-T---A----A-A---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T---TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TC-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71202 : CCTTTTT-AATT--TTT-A---CA---C---G-TG-TA-C-TT-TAT-TGA-TT---G-A------CG--------------T--TA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-------CTGCGG-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--C--CA-A-CA--A--AGT-GA-AGC-----GG-A-AT-TTA--T-G-TG-T-C-C--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG----T-T--A-GCGAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71203 : CCTTTTT-A-TT--TTTTA---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TTTAAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTTTGGTG-TGG-C-----TGGC-G-T--T-----G---ACTT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-AAGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-C---T--AGT-GA-A-C-----GG----T-TT----------T-C-C--------A--A-A-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG-ATC-
gi|71204 : CCTTTTT-A-TT--TTA-T---CA-A-C--AG-TG-TA-T-TT--AT-TGA-T----G--------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TGTTCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---AC-TAA-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A---G-C-A--G-G--A---------------AAT-------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----AAAG-ATAGTA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A-T-T----------C---AT----CCAA--G--ATT-T--A-G-GAAT-T-A---C-C--G----AG-ATCATAC
gi|71205 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-ATC--CG-T--TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------GC--------------T-GTA-CAA---C-A------T-A------T------TT----T--TCT-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G--TG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--T---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A--TTA--------------------------------------------------TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAT--T-A---C-C--G----AT-AT
gi|71206 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TA-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-TCTGAGCTGC-G-T--T-----G---AC-T-
gi|71207 : CCCCTTT-A-TT--TTT-AAACCACA-CTCAG-TA-TA-CCTT-AAT-TGA-T----GCA------CG--------------TTGTA-C-A---C-A------TGA------T------TT----TG-CCG-T-----CTGC-C-TCTT-----GC--AC-T-A-----ACAC-----G-ATG-TTACA----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CAT-A--AGT-GA-A-C-----GGAA-ATGTCAGTC-G-T--T-C-T--------A--A---T----------C---AT----T--AGGG--ATT-T--A-G-GACT-T-AC--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71208 : CTTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CGTAAACACATATACAT-GTA-T-A---T-A------T-A------T------TT----TG-TCC-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-G-----A-AA-----A-A-G-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------AAGAATCTTTCATTTGA---------------T-----TC--G--CT-A-TT--A--AAT--A-A-C-----GGAA-ATCTTA--T-G-TG-T-A-T--------A--A-T-T----------C---AT----TCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGCATC-
gi|71209 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AA-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------AG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------
gi|71209 : -A------T------GT----TG-TCG-T-----CTAC-G-T--T-----G---AC--------------------ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-cagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgatgttgtcgtctacgttgacatgtaaacatgcagaaaattcgcacaaagtga
gi|71210 : cctttttatttttacaacaatgtacttaattgatgaagtatacacatacagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgCCTTTTT-A-TG--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ACA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-G-T--T-----G---
gi|71211 : CCATTTT-A-CT--TT--A---CA---C--TG-TAATA-C-TT-AAT-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T-------------C-T-G-----A-GG-----A-ATGTT---G----A-A---C--A--TG-C-G--G-AGTA---------------A---------------G---------------T-----TCCGG--C--T-CA--A----T-GA-C-CCCCG-GAAA-AA-TTA--TGG-TG-T-T-TC-------A--A-T-TTCCCGAGTGCC---ATTTTATTAAGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71212 : CTCTTT-G-TTAATTT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-CAA--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--A-T-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-GAT----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-A-C-TAC
gi|71213 : CTTGTT-A-TT--TT------CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----G---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-ACGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A-T-T----------C---AT----T--AGGG--CTG-T--A-G-GAA--T-A---C----------GTATC-TAC
gi|71214 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71215 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71216 : CTTGTT-A-AT--TTA-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-G----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71217 : TTTTT-A-TT--TTT-----CG-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTTCA---GC-T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--ATTTGTC-ATTT-T--A---------------A---------------A---------------T-----TC--GCAC--A-CA--A--ATT-GA-A-CA----GGAA-AT-TTA--T-G-GT-T-C-T--------A--A-T-TC---------C---AT-------AGGG--GTT-T--A-G-GAA--T-A-----C--G----AG-AAT-TAC
gi|71218 : TTTC-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-AT-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------C-ACA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTATGC-T-A-----A--C-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------AAGTATTGTTTTTAA-T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TCA--T-G-CG-T-C-C--------A--A-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71219 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TA-TG-AA-C-CT-AAT-TGA-T----G-AAGTATACA--------------T-GTA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGAATCTTGTCATTAAT-----TC--G--C--A-GA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--T-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71220 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CC--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TTG-T-----CTGC-G-----------------T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--AAATAATCTTGTCATTA---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----ATAA-GT-TTT--T-G-CG-T-C-T--------AATA-T-T----------T---A-----TTAAAGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71221 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-CA-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-------A---T-G------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-GTT--T-----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--AA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGT-------------T-----TC--T--T--ATCATTA--ATTCGC-A-CTTTCTGTAT-GT-TTA--C-A-TT-T-T-TAGCGAACAA--A-C-T----------C---AGA---TGAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71222 : TTAT-A-TT--TTT-A---CA-AAT--AG-TG-AA-C-TT-CAT-TGA-T----G-AGGTACATG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----AG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----GTTTGC-T-A-----A-AA-----A-AGG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------
gi|71223 : T-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TAA-T----G-A------CA--------------T-TTA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TT----TG-TCG-T-----CTGT-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---ACGTAA-A---C--A--TG-T-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71224 : -A-TG--TTT-A---CA-AAC--AG-TGGTAAT-TT-AAT-TGA-TATATG-A------CG--------------T-TTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-ACAAATTG-ATG-T---A----ATA---A--A--TG-C-A--GAA--A---------------A---------------A---------------A-----TC--G--T--A-C--------T--A-A-C-----AAAA-G----A--T-G-TGTT-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----ATAAGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71225 : --TTT-A---CG-A-T--AGGTG-AA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------TAGGA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTC-G---GC-T-AG----A-AA-----A-ATG-T--------A-A---C--A--T--C-T--G-T--C---------------C---------------A---------------TTTTAATC--T--C--A-CA--A--ATT-GA-A-C------GAA-AT-TTAG-T-G-TG-T-T-T--------A--ATT-T----------C---A-----ATAAGGG--CTT-T--A-G-GAAATT-A---C-C--A----AG-ATC-
gi|71226 : TT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--G-A-T----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-ATC-TAC
gi|71227 : TT-A---CA-AAC--AA-T--TA-C-TT-AAT-TAC-T----GGA------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------A-A------T------TT----CG-TCG-T-----ATGA-G-T--T-------------------------------------------------------------------------------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--ACAAAT-GA-A-C-----GGAC-TT-GTA--C-G-TG---C-T--------C--A-T-T----------C---AT----TCA--GG--GCT-T--A-G-AAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71228 : T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------TTA------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----GAATG-T---A----A-A---C--A--TG---A--------------------------------------------------------------C--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-GTTGCT-CTT--------A--ATT-T----------C---AT----TTAAGGG--ATT-A--G-G-GAA--T-A---CAC--G----AG-AT
gi|71229 : ttct-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-A-A-C-A---T-AAAC---T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-T-T--TTC---G---CC-T-AGTTAAA-AC-------ACG-----A----A-AGAGCTGA--CG-T-A--G-A--A---------------ATATTGCCATCTA---A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A---GT-GA-A-C-----G-AA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71230 : tt-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA---A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-A------G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-T--G-G--A---------------C-------------------------------T-----TC--G--C--A-CT--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TA-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGAG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----A
gi|71231 : -C-TT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TTG-T-----CTGT-G-T--T-----A---GC-T-A-----A-AC-----
gi|71232 : T-TGG-T----G-A------CG--------------T-ATT-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TCG-T-----CTGT-T-T--TC----G---TC-T-C-----G-CC-----T-A-G-T---A----T-----C--T--TG-C-C--A-T--T---------------A---------------A---------------T-----TT--G--C--A-CG--A--AGT-GA-A-T-----GGA----------T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----G-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AA-ATC-TAC
gi|71233 : ------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-
gi|71234 : T----TG-CCGAT-----TGGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------T---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71235 : TGG-G-T--T-----G---AC-T-AT----A-AC-----G-ATG-T---A----GTA---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------G---------------A---------------A-----TC--G--CTAA-CA--A--AGT-GAGA-C-----GGAATAT-GTA--T-GATG-T-CCT--------A--A-T-T----------T---AT----T-AAGGG--ATT-T--AGG-GAA--T-AACTC-G--G----AG-ACG-TAC
gi|71236 : -A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-TA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GCA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71237 : ---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--A----A-G-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-C-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TAAAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--GATACAT-ATC-TAC
gi|71238 : --AGT-AC-A-C-----GGAA-AT-TTA--A-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T-AGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71239 : --T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T-AAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
gi|71240 : --T-G-TG-T-C-T--------A--C-T-T----------C---AT----T-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222222222222222222222 2222222
lowQualScore : 1 1 11 1 222 1 4 11 1 2 1 1 1 1 2 3333 2 555555 55555555555555 2 1 1 333 1 000000 2 222222 444444 2222 1 1 33333 0 0 11 666666666 1 1 44444 1 77777777 1 444 6666 2 444 11 11 3 1 44 1 11 666666666666666 1111111111111111111111111111111 22222 11 11 33 1 22 11 1 1 1 55555 1 33 22 1 2 2 1 2 44444444 33 2 1 5555555555 111 0000000 333 1 11 1 1 44 1 444 2 33 2222 2 1
lowQualScore : . . .. . ... . . .. . . . . . . . .... . ...... .............. . . . ... . ...... . ...... ...... .... . . ..... . . .. ......... . . ..... . ........ . ... .... . ... .. .. . . .. . .. ............... ............................... ..... .. .. .. . .. .. . . . ..... . .. .. . . . . . ........ .. . . .......... ... ....... ... . .. . . .. . ... . .. .... . .
lowQualScore : 2 2 77 1 000 1 6 66 1 3 1 1 1 0 0 1111 0 888888 99999999999999 0 0 0 111 0 444444 0 777777 888888 0000 0 0 33333 9 9 33 555555555 0 0 77777 1 99999999 1 111 4444 2 111 55 55 2 1 55 1 44 444444444444444 2222222222222222222222222222222 66666 44 44 66 1 55 44 0 0 1 99999 1 66 44 0 0 0 0 0 66666666 44 1 1 7777777777 888 9999999 555 1 55 1 1 77 1 111 2 00 3333 2 2
consensus : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
Reference ( family-419 ) : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71193 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------CATTAT----TTAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-C---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71194 : CCTTTTTCA-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-A-----CTGC-G-T--T-----C---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-GTA--T-G-CG-T-C-T--------A--T-A-T----------C---A-----TCAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-T---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71195 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AA-GTA--T-G-TG-T-C-T--------T--A-A-T----------A---A------TAAGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71196 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-G-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CCGC-G-T--T-----A---AG-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---AAAC-A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AAT-GA-A-C-----GGAA-AC-T----T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAG--T-A---C-C--A----AA-ATC-TAC
gi|71197 : CCTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-GA-----G-AT--C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GT---T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T--AAGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---CTC--G----AG-ACG-TAC
gi|71198 : CTTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--TGT-GA-A-C-----GAAA-AT-TTA--T-G-CT-T-C-A--------A--A-T-T----------C---AT----GAGAGGA--CTT-G--A-G-GAA--C-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71199 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--CG-TG-TA-C-TT-TATATGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---CAA------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC---------------------------------------C--A--TG-C-A--G-A--G---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-TCC-C--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ACC-TAC
gi|71200 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----A-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T--------T------TT----TG-TCG-T------TGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------AT--------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A----------------------------------T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-TTAA-G-GAA--T-T---C-C--G----CG-ATC-TAC
gi|71201 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---AC-A-C--AG-TG-TA-T-TT-A-T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATT----TG-T-G-TG----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A--C-------ATG-T---A----A-A---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T---TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TC-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71202 : CCTTTTT-AATT--TTT-A---CA---C---G-TG-TA-C-TT-TAT-TGA-TT---G-A------CG--------------T--TA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-------CTGCGG-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--C--CA-A-CA--A--AGT-GA-AGC-----GG-A-AT-TTA--T-G-TG-T-C-C--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG----T-T--A-GCGAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71203 : CCTTTTT-A-TT--TTTTA---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TTTAAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTTTGGTG-TGG-C-----TGGC-G-T--T-----G---ACTT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-AAGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-C---T--AGT-GA-A-C-----GG----T-TT----------T-C-C--------A--A-A-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG-ATC-
gi|71204 : CCTTTTT-A-TT--TTA-T---CA-A-C--AG-TG-TA-T-TT--AT-TGA-T----G--------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TGTTCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---AC-TAA-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A---G-C-A--G-G--A---------------AAT-------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----AAAG-ATAGTA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A-T-T----------C---AT----CCAA--G--ATT-T--A-G-GAAT-T-A---C-C--G----AG-ATCATAC
gi|71205 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-ATC--CG-T--TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------GC--------------T-GTA-CAA---C-A------T-A------T------TT----T--TCT-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G--TG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--T---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A--TTA--------------------------------------------------TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAT--T-A---C-C--G----AT-AT
gi|71206 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TA-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-TCTGAGCTGC-G-T--T-----G---AC-T-
gi|71207 : CCCCTTT-A-TT--TTT-AAACCACA-CTCAG-TA-TA-CCTT-AAT-TGA-T----GCA------CG--------------TTGTA-C-A---C-A------TGA------T------TT----TG-CCG-T-----CTGC-C-TCTT-----GC--AC-T-A-----ACAC-----G-ATG-TTACA----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CAT-A--AGT-GA-A-C-----GGAA-ATGTCAGTC-G-T--T-C-T--------A--A---T----------C---AT----T--AGGG--ATT-T--A-G-GACT-T-AC--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71208 : CTTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CGTAAACACATATACAT-GTA-T-A---T-A------T-A------T------TT----TG-TCC-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-G-----A-AA-----A-A-G-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------AAGAATCTTTCATTTGA---------------T-----TC--G--CT-A-TT--A--AAT--A-A-C-----GGAA-ATCTTA--T-G-TG-T-A-T--------A--A-T-T----------C---AT----TCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGCATC-
gi|71209 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AA-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------AG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------
gi|71209 : -A------T------GT----TG-TCG-T-----CTAC-G-T--T-----G---AC--------------------ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-cagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgatgttgtcgtctacgttgacatgtaaacatgcagaaaattcgcacaaagtga
gi|71210 : cctttttatttttacaacaatgtacttaattgatgaagtatacacatacagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgCCTTTTT-A-TG--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ACA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-G-T--T-----G---
gi|71211 : CCATTTT-A-CT--TT--A---CA---C--TG-TAATA-C-TT-AAT-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T-------------C-T-G-----A-GG-----A-ATGTT---G----A-A---C--A--TG-C-G--G-AGTA---------------A---------------G---------------T-----TCCGG--C--T-CA--A----T-GA-C-CCCCG-GAAA-AA-TTA--TGG-TG-T-T-TC-------A--A-T-TTCCCGAGTGCC---ATTTTATTAAGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71212 : CTCTTT-G-TTAATTT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-CAA--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--A-T-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-GAT----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-A-C-TAC
gi|71213 : CTTGTT-A-TT--TT------CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----G---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-ACGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A-T-T----------C---AT----T--AGGG--CTG-T--A-G-GAA--T-A---C----------GTATC-TAC
gi|71214 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71215 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71216 : CTTGTT-A-AT--TTA-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-G----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71217 : TTTTT-A-TT--TTT-----CG-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTTCA---GC-T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--ATTTGTC-ATTT-T--A---------------A---------------A---------------T-----TC--GCAC--A-CA--A--ATT-GA-A-CA----GGAA-AT-TTA--T-G-GT-T-C-T--------A--A-T-TC---------C---AT-------AGGG--GTT-T--A-G-GAA--T-A-----C--G----AG-AAT-TAC
gi|71218 : TTTC-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-AT-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------C-ACA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTATGC-T-A-----A--C-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------AAGTATTGTTTTTAA-T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TCA--T-G-CG-T-C-C--------A--A-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71219 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TA-TG-AA-C-CT-AAT-TGA-T----G-AAGTATACA--------------T-GTA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGAATCTTGTCATTAAT-----TC--G--C--A-GA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--T-T-T----------C----C----TTAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71220 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CC--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TTG-T-----CTGC-G-----------------T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--AAATAATCTTGTCATTA---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----ATAA-GT-TTT--T-G-CG-T-C-T--------AATA-T-T----------T---A-----TTAAAGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71221 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-CA-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-------A---T-G------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-GTT--T-----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--AA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGT-------------T-----TC--T--T--ATCATTA--ATTCGC-A-CTTTCTGTAT-GT-TTA--C-A-TT-T-T-TAGCGAACAA--A-C-T----------C---AGA---TGAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71222 : TTAT-A-TT--TTT-A---CA-AAT--AG-TG-AA-C-TT-CAT-TGA-T----G-AGGTACATG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----AG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----GTTTGC-T-A-----A-AA-----A-AGG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------
gi|71223 : T-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TAA-T----G-A------CA--------------T-TTA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TT----TG-TCG-T-----CTGT-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---ACGTAA-A---C--A--TG-T-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TCAAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71224 : -A-TG--TTT-A---CA-AAC--AG-TGGTAAT-TT-AAT-TGA-TATATG-A------CG--------------T-TTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-ACAAATTG-ATG-T---A----ATA---A--A--TG-C-A--GAA--A---------------A---------------A---------------A-----TC--G--T--A-C--------T--A-A-C-----AAAA-G----A--T-G-TGTT-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----ATAAGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71225 : --TTT-A---CG-A-T--AGGTG-AA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------TAGGA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTC-G---GC-T-AG----A-AA-----A-ATG-T--------A-A---C--A--T--C-T--G-T--C---------------C---------------A---------------TTTTAATC--T--C--A-CA--A--ATT-GA-A-C------GAA-AT-TTAG-T-G-TG-T-T-T--------A--ATT-T----------C---A-----ATAAGGG--CTT-T--A-G-GAAATT-A---C-C--A----AG-ATC-
gi|71226 : TT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--G-A-T----------C---A-----TTAGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-ATC-TAC
gi|71227 : TT-A---CA-AAC--AA-T--TA-C-TT-AAT-TAC-T----GGA------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------A-A------T------TT----CG-TCG-T-----ATGA-G-T--T-------------------------------------------------------------------------------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--ACAAAT-GA-A-C-----GGAC-TT-GTA--C-G-TG---C-T--------C--A-T-T----------C---AT----TCA--GG--GCT-T--A-G-AAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71228 : T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------TTA------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----GAATG-T---A----A-A---C--A--TG---A--------------------------------------------------------------C--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-GTTGCT-CTT--------A--ATT-T----------C---AT----TTAAGGG--ATT-A--G-G-GAA--T-A---CAC--G----AG-AT
gi|71229 : ttct-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-A-A-C-A---T-AAAC---T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-T-T--TTC---G---CC-T-AGTTAAA-AC-------ACG-----A----A-AGAGCTGA--CG-T-A--G-A--A---------------ATATTGCCATCTA---A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A---GT-GA-A-C-----G-AA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71230 : tt-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA---A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-A------G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-T--G-G--A---------------C-------------------------------T-----TC--G--C--A-CT--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TA-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGAG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----A
gi|71231 : -C-TT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TTG-T-----CTGT-G-T--T-----A---GC-T-A-----A-AC-----
gi|71232 : T-TGG-T----G-A------CG--------------T-ATT-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TCG-T-----CTGT-T-T--TC----G---TC-T-C-----G-CC-----T-A-G-T---A----T-----C--T--TG-C-C--A-T--T---------------A---------------A---------------T-----TT--G--C--A-CG--A--AGT-GA-A-T-----GGA----------T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----G-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AA-ATC-TAC
gi|71233 : ------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TTAAGGG--ATT-
gi|71234 : T----TG-CCGAT-----TGGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------T---A-----TTAAGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71235 : TGG-G-T--T-----G---AC-T-AT----A-AC-----G-ATG-T---A----GTA---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------G---------------A---------------A-----TC--G--CTAA-CA--A--AGT-GAGA-C-----GGAATAT-GTA--T-GATG-T-CCT--------A--A-T-T----------T---AT----T-AAGGG--ATT-T--AGG-GAA--T-AACTC-G--G----AG-ACG-TAC
gi|71236 : -A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-TA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GCA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71237 : ---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--A----A-G-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-C-C-T--------A--A-T-T----------C---A-----TAAAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--GATACAT-ATC-TAC
gi|71238 : --AGT-AC-A-C-----GGAA-AT-TTA--A-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T-AGGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71239 : --T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----T-AAGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
gi|71240 : --T-G-TG-T-C-T--------A--C-T-T----------C---AT----T-AAGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
blockSeqs : C A AA T AAC C T TC G A A C T A A ATAT C AGTATA TAAACACATATACA T G A ATT A TACATG G CATGTA ATTGTA TTGG CTGAG CT CGTTCA T A GTTAA C CAAATTG T TAC CGTA T GAG TG TT G A AG A GT AATAATCTTGTCATT AGAATCTTTCATTTGA TTTAA CG CA TA T TT CA C G G TTTCT T AG GT G T T C T AGCGAACA AT T A TCCCGAGTGC . TTTTATT CTC A TA G C AT A ACT T CG ATAC C A
blockSeqs : . . . . . . A . . G . . . . A T G GGTACA . A . . GG . TACATG T . C . G . TGTAT . . G . CGA . A AAC T C . . T . CG . . . AGAATCTTGTCATTAA . . . A . T . . . . CCCG . GT G . A C . C C G T . C . GATG A . . . . T . C A CG . T .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AAATTT . . A . . . TGTTC . . T . CG . A T . C . . G . TT . . . AAGTATTGTTTTTAA . . . T . . . . . . A . CT . . . . . . . G . . . . TGA A . . . . T . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . CGTTT . . . . CG . . T . . . . . . . . . . TATTGCCATCTAA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TTC C . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGTCG . . . . CA . . . . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TCC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTC . . . . AG . . . . . . . . . . . . . AGT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TTC C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCG . . . . CA . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . CTT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . CTT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TTC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TTT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . AA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . AA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TC C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TG A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TT A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TA A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** TT*****
originalCons : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---AT----TTAAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
finalCons : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A-T-T----------C---ATT-----AAGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 1 11 1 222 1 4 11 1 2 1 1 1 1 2 3333 2 555555 55555555555555 2 1 1 333 1 000000 2 222222 444444 2222 1 1 33333 0 0 11 666666666 1 1 44444 1 77777777 1 444 6666 2 333 22 11 3 1 44 1 11 666666666666666 1111111111111111111111111111111 22222 11 11 33 1 22 11 1 1 1 55555 1 33 22 1 2 2 1 3 44444444 33 888888888888888 1 1 11 3333 2 333 1 11 1 1 44 1 444 2 33 2222 2 1
lowQualScore : . . .. . ... . . .. . . . . . . . .... . ...... .............. . . . ... . ...... . ...... ...... .... . . ..... . . .. ......... . . ..... . ........ . ... .... . ... .. .. . . .. . .. ............... ............................... ..... .. .. .. . .. .. . . . ..... . .. .. . . . . . ........ .. ............... . . .. .... . ... . .. . . .. . ... . .. .... . .
lowQualScore : 2 2 77 1 000 1 6 66 1 3 1 1 1 0 0 1111 0 888888 99999999999999 0 0 0 111 0 444444 0 777777 888888 0000 0 0 33333 9 9 33 555555555 0 0 77777 1 99999999 1 111 4444 2 000 66 55 2 1 55 1 44 444444444444444 2222222222222222222222222222222 66666 44 44 66 1 55 44 0 0 1 99999 1 66 44 0 0 0 0 0 66666666 44 777777777777777 1 1 44 3333 1 555 1 55 1 1 77 1 111 2 00 3333 2 2
consensus : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
Reference ( family-419 ) : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--NTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71193 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--ATTATTTA-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-C---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71194 : CCTTTTTCA-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-A-----CTGC-G-T--T-----C---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-GTA--T-G-CG-T-C-T--------A--T---------------A-T-C--A----TCA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-T---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71195 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AA-GTA--T-G-TG-T-CTT--------A--A---------------T------A----ATA-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71196 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-G-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CCGC-G-T--T-----A---AG-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---AAAC-A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AAT-GA-A-C-----GGAA-AC-T----T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TCA-AGGG--CTT-T--A-G-GAG--T-A---C-C--A----AA-ATC-TAC
gi|71197 : CCTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-GA-----G-AT--C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GT---T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-A-GG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---CTC--G----AG-ACG-TAC
gi|71198 : CTTTTTT-A-TT--TT--A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--TGT-GA-A-C-----GAAA-AT-TTA--T-G-CT-T-C-A--------A--A---------------T-T-C--A----TGAGAGGA--CTT-G--A-G-GAA--C-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71199 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--CG-TG-TA-C-TT-TATATGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---CAA------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC---------------------------------------C--A--TG-C-A--G-A--G---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-TCC-C--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ACC-TAC
gi|71200 : CCCTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----A-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T--------T------TT----TG-TCG-T------TGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-AC--C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------AT--------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-A------------------------------------------------T-C--A----TTA-AGGG--ATT-TTAA-G-GAA--T-T---C-C--G----CG-ATC-TAC
gi|71201 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---AC-A-C--AG-TG-TA-T-TT-A-T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATT----TG-T-G-TG----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A--C-------ATG-T---A----A-A---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T---TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTC-AGGG--ATT-T--A---GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71202 : CCTTTTT-AATT--TTT-A---CA---C---G-TG-TA-C-TT-TAT-TGA-TT---G-A------CG--------------T--TA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-------CTGCGG-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--C--CA-A-CA--A--AGT-GA-AGC-----GG-A-AT-TTA--T-G-TG-T-C-C--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG----T-T--A-GCGAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71203 : CCTTTTT-A-TT--TTTTA---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TTTAAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TTTTGGTG-TGG-C-----TGGC-G-T--T-----G---ACTT-A-----A-AC-----G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-AAGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-C---T--AGT-GA-A-C-----GG----T-TT----------T-C-C--------A--A---------------A-T-C--A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--TAA---C-C--G----AG-ATC-
gi|71204 : CCTTTTT-A-TT--TTA-T---CA-A-C--AG-TG-TA-T-TT--AT-TGA-T----G--------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TGTTCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---AC-TAA-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A---G-C-A--G-G--A---------------AAT-------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----AAAG-ATAGTA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A---------------T-T-C--A----TCC-A-AG--ATT-T--A-G-GAAT-T-A---C-C--G----AG-ATCATAC
gi|71205 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-ATC--CG-T--TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------GC--------------T-GTA-CAA---C-A------T-A------T------TT----T--TCT-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G--TG-TA--A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--T---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-T--------------------------------------------------A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAT--T-A---C-C--G----AT-AT
gi|71206 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TA-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-TCTGAGCTGC-G-T--T-----G---AC-T-
gi|71207 : CCCCTTT-A-TT--TTT-AAACCACA-CTCAG-TA-TA-CCTT-AAT-TGA-T----GCA------CG--------------TTGTA-C-A---C-A------TGA------T------TT----TG-CCG-T-----CTGC-C-TCTT-----GC--AC-T-A-----ACAC-----G-ATG-TTACA----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CAT-A--AGT-GA-A-C-----GGAA-ATGTCAGTC-G-T--T-C-T--------A--A-----------------T-C--A----TT--AGGG--ATT-T--A-G-GACT-T-AC--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71208 : CTTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CGTAAACACATATACAT-GTA-T-A---T-A------T-A------T------TT----TG-TCC-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-G-----A-AA-----A-A-G-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--A-A--A---------------AAGAATCTTTCATTTGA---------------T-----TC--G--CT-A-TT--A--AAT--A-A-C-----GGAA-ATCTTA--T-G-TG-T-A-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTCTTGGGCTCTT-T--A-G-GAAC-T-A---C-C--G----AGCATC-
gi|71209 : CCTTTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AA-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------AG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------
gi|71209 : -A------T------GT----TG-TCG-T-----CTAC-G-T--T-----G---AC--------------------ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-cagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgatgttgtcgtctacgttgacatgtaaacatgcagaaaattcgcacaaagtga
gi|71210 : cctttttatttttacaacaatgtacttaattgatgaagtatacacatacagggtgtttcataatatatgttacgttttgaatctatgCCTTTTT-A-TG--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ACA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-G-T--T-----G---
gi|71211 : CCATTTT-A-CT--TT--A---CA---C--TG-TAATA-C-TT-AAT-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T-------------C-T-G-----A-GG-----A-ATGTT---G----A-A---C--A--TG-C-G--G-AGTA---------------A---------------G---------------T-----TCCGG--C--T-CA--A----T-GA-C-CCCCG-GAAA-AA-TTA--TGG-TG-T-T-TC-------A--ATTTCCCGAGTGCCATT-T-T--A----TTA-AGAT--TAT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71212 : CTCTTT-G-TTAATTT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-CAA--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--A-T-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------GAT-C--A----TTA-GGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-A-C-TAC
gi|71213 : CTTGTT-A-TT--TT------CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGAAT----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----G---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---CC-A--TG-C-ACGA-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------AG-A---------------T-T-C--A----TT--AGGG--CTG-T--A-G-GAA--T-A---C----------GTATC-TAC
gi|71214 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71215 : CTTGTT-A-AT--TTT-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71216 : CTTGTT-A-AT--TTA-A---CA-A-C--AG-T--T--C-TT-AAC-TGA-G----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----
gi|71217 : TTTTT-A-TT--TTT-----CG-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-ATA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTTCA---GC-T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--ATTTGTC-ATTT-T--A---------------A---------------A---------------T-----TC--GCAC--A-CA--A--ATT-GA-A-CA----GGAA-AT-TTA--T-G-GT-T-C-T--------A--A---------------T-TCC--A----T---AGGG--GTT-T--A-G-GAA--T-A-----C--G----AG-AAT-TAC
gi|71218 : TTTC-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-AT-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------C-ACA-T-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTATGC-T-A-----A--C-----A-ATG-T---A----A-A---C--A--TT-C-A--G-A--A---------------A---------------AAGTATTGTTTTTAA-T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TCA--T-G-CG-T-C-C--------A--A---------------T-T-C--C----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71219 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TA-TG-AA-C-CT-AAT-TGA-T----G-AAGTATACA--------------T-GTA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TT----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGAATCTTGTCATTAAT-----TC--G--C--A-GA--A--AGT-GA-A-C-----AGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--T---------------T-T-C--C----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71220 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-T--AG-TG-AA-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CC--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TTG-T-----CTGC-G-----------------T-A-----A-A--------ATG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--AAATAATCTTGTCATTA---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----ATAA-GT-TTT--T-G-CG-T-C-T--------AATA---------------T-T-T--A----TTA-AAGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71221 : TTTT-A-TT--TTT-A---CA-A-C--TG-TG-CA-C-CT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-------A---T-G------T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-GTT--T-----GTTCGC-T-A-----A-A------A-ATG-T---A----A-A---C--A--AA-C-A--G-A--A---------------A---------------AGT-------------T-----TC--T--T--ATCATTA--ATTCGC-A-CTTTCTGTAT-GT-TTA--C-A-TT-T-T-TAGCGAACAA--A---------------C-T-CAGA----TGA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71222 : TTAT-A-TT--TTT-A---CA-AAT--AG-TG-AA-C-TT-CAT-TGA-T----G-AGGTACATG--------------T-ATA-C-A---C-A------T-A------T------TT----AG-TCG-T-----CTGC-G-T--TC----GTTTGC-T-A-----A-AA-----A-AGG-T---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------
gi|71223 : T-A-TT--TTT-A---CA-A-C--AG-TG-TA-C-TT-AAT-TAA-T----G-A------CA--------------T-TTA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TT----TG-TCG-T-----CTGT-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-AC-----A-ATG-T---ACGTAA-A---C--A--TG-T-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TCA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71224 : -A-TG--TTT-A---CA-AAC--AG-TGGTAAT-TT-AAT-TGA-TATATG-A------CG--------------T-TTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----A---AC-T-A-----A-ACAAATTG-ATG-T---A----ATA---A--A--TG-C-A--GAA--A---------------A---------------A---------------A-----TC--G--T--A-C--------T--A-A-C-----AAAA-G----A--T-G-TGTT-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----ATA-AGGG--CTTAT--A-G-TAA--T-AT--C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71225 : --TTT-A---CG-A-T--AGGTG-AA-C-TT-ATT-TGA-T----G-A------CG--------------TAGGA-C-A---A-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--TCGTC-G---GC-T-AG----A-AA-----A-ATG-T--------A-A---C--A--T--C-T--G-T--C---------------C---------------A---------------TTTTAATC--T--C--A-CA--A--ATT-GA-A-C------GAA-AT-TTAG-T-G-TG-T-T-T--------A--AT--------------T-T-C--A----ATA-AGGG--CTT-T--A-G-GAAATT-A---C-C--A----AG-ATC-
gi|71226 : TT-A---CA-A-C--AG-AG-TT-C-TT-AAC-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----C---GC-T-T-----A-AC-----A-TTG-T---A----A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AG-TGA--T-G-TG-T-C-T--------A--G---------------A-T-C--A----TTA-GGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AT-ATC-TAC
gi|71227 : TT-A---CA-AAC--AA-T--TA-C-TT-AAT-TAC-T----GGA------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------A-A------T------TT----CG-TCG-T-----ATGA-G-T--T-------------------------------------------------------------------------------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--ACAAAT-GA-A-C-----GGAC-TT-GTA--C-G-TG---C-T--------C--A---------------T-T-C--A----TTC-AGGG--CTT----A-G-AAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71228 : T-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA-C-A---C-A------TTA------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----GAATG-T---A----A-A---C--A--TG---A--------------------------------------------------------------C--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-TTA--T-GTTGCT-CTT--------A--AT--------------T-T-C--AT---TTA-AGGG--ATT-A--G-G-GAA--T-A---CAC--G----AG-AT
gi|71229 : ttct-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-A-A-C-A---T-AAAC---T-A------T------TT----TG-TCA-T-----CTGC-T-T--TTC---G---CC-T-AGTTAAA-AC-------ACG-----A----A-AGAGCTGA--CG-T-A--G-A--A---------------ATATTGCCATCTA---A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A---GT-GA-A-C-----G-AA-AT-TTA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71230 : tt-C-TT-AAT-TGA-T----G-A------CG--------------T-GTA---A---C-A------T-A------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-A------G-ATG-T---A----A-A---C--A--TG-C-T--G-G--A---------------C-------------------------------T-----TC--G--C--A-CT--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TA-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGAG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----A
gi|71231 : -C-TT-AAT-TGA-T----G-A------TG--------------T-GTA-C-A---C-A------T-A------T------TT----TG-TTG-T-----CTGT-G-T--T-----A---GC-T-A-----A-AC-----
gi|71232 : T-TGG-T----G-A------CG--------------T-ATT-C-A---C-A------T-A------T------TT----CG-TCG-T-----CTGT-T-T--TC----G---TC-T-C-----G-CC-----T-A-G-T---A----T-----C--T--TG-C-C--A-T--T---------------A---------------A---------------T-----TT--G--C--A-CG--A--AGT-GA-A-T-----GGA----------T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TGA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AA-ATC-TAC
gi|71233 : ------T------TT----TG-TCG-T-----CTGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-C---A----A-A---C--A--TA-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----TGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--ATT-
gi|71234 : T----TG-CCGAT-----TGGC-G-T--T-----G---AC-T-A-----A-AC-----G-ATG-T---AT---A-A---C--A--TG-C-A--G-A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-CA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GTA--T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-T--A----TTA-AGGG--ATT-T--A-G-GAA--T-A---C-TCGG----AG-ACG-TAC
gi|71235 : TGG-G-T--T-----G---AC-T-AT----A-AC-----G-ATG-T---A----GTA---C--A--TGGC-A--G-A--A---------------G---------------A---------------A-----TC--G--CTAA-CA--A--AGT-GAGA-C-----GGAATAT-GTA--T-GATG-T-CCT--------A--A---------------T-T-T--A----TTA-AGGG--ATT-T--AGG-GAA--T-AACTC-G--G----AG-ACG-TAC
gi|71236 : -A--A---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--A-TA--A--AGT-GA-A-C-----GGAA-AT-GCA--T-G-TG-T-C-T--------A--
gi|71237 : ---------------A---------------A---------------T-----TC--G--C--G-CA--A--A----A-G-C-----GGAA-AT-TTA--T-G-TG-C-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TAA-AGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---A-C--GATACAT-ATC-TAC
gi|71238 : --AGT-AC-A-C-----GGAA-AT-TTA--A-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-GGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-C--G----AG-ATC-TAC
gi|71239 : --T-G-TG-T-C-T--------A--A---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--TTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC
gi|71240 : --T-G-TG-T-C-T--------A--C---------------T-T-C--A----TTA-AGGG--CTT-T--A-G-GAA--T-A---C-T--G----TG-ATC-TAC