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Reference ( gi|85562 )        :  AATTT--AAA--AAAT--TC-AA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-G----ACA---T-CTTA-A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT--AA--A-A--TA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACCCTG
gi|85564                      :  AATTTC-AAA--AAAT--TC-AA-T--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT-TC--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-G----ATA---G-CTTA-A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-A--C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACCTTG
gi|85563                      :  AATTT--CAA--AAAT--TC-AA-A--C-CTG-G---A-G----TTT----A-TCTT-TT--G-AA-C-A-----G-A-G-A-G----ACA---T-CTTA-A--GG---C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT--AA--A-AAACA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACCTTG
gi|85565                      :  AATTC--AAA--A-AT--TC-AA-A--T-CTG-A---A-G----TTT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-G----ATA---G-CTTA-A--GG-G-C---TTT--G-A-TATTTTT---T-TT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACTTTG
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gi|85566                      :  AATTC--AAA--AT-T--TC-AA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-G----ATA---T-CTT--A--GG-G-T---TTTG-G-A-TA---TT---T-CT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-CAA--G-AG--C------TA-T-T-G-ACC
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gi|85569                      :  AATTT--CAA--AAAT--TC-AA-A----CTG-G-----------TT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-GTATCATA---T-CTTA-A--GG-G-C---TTT--G-A--A----T---T-CT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--AATA--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-TCT-G-ACCTTG
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gi|85591                      :   tTTT--GAA--AAAC--TC-AA-A--C-CT---------------------------TT--G-AA-C-C-A--AC-A-T-G-G----ATA-------------GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT--AATTA-A--TACAAA----T--GGA-TA-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----A--ATT-------C-AC------T-GC-C-A--A-AG--C------TA-T-T-G-ACCTTGtt
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gi|85578                      :    TTT--CAA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-T-----G-A-A-G-G----AAA---T------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-
gi|85592                      :    TTC--AAA--AACT--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----TTA--T-A-TCTT-TTT-G-AA-CTA-A--AG-G-G-G-A----A--------TT--A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85587                      :   tTTT--CAA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----CTA--C-A-TCTT-TT--G-AA-C-C-A--A--A-G-G-G----A-A---T------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-
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gi|85579                      :   tTTT--CAA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-T-G--A--A-G-G-G----A-A---T------A--GG-G-C---TTT--G-G-TA---TT---T-ca
gi|85582                      :    TTT--CAA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G---G-C----TAT--A-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--GG-G-G-G-A----A----------A-A--GA-G-C---TTTG-G-A-TA---TT---
gi|85580                      :    TTT--CAA--AAAC--TT-AA-A--A-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-T---G-AA-A-A-T--AA-A-A-G-G----A-A---T------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-ca
gi|85596                      :     TT--CAA--AAATCTTT-AA-A--C--TG-G---A-A----CTA--T-AATCTT-TT--G-AA-C-T-A--AA-A-G-G-A----ATA-------------GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-C
gi|85585                      :       --AAA--AAAT--TC-AA-AA-C-TTG-G---A-AGT--TTT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-ACAAG-AAG-G-G----ATA---G-CTTA-A--GG-GGC---TTT--G-A-TA---TT---T-TT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-CC-TT-TTT--T--A--G----A---C-T--TTTTAAGAC--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACCTTGaa
gi|85600                      :     tttcaAA--AAAT--TC-AA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--A-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-ACCCG-A-G-G-G----ATA---G-CTTA-A--GG-G------TT--G-A-TA---TT---T-C----A--A-A--CA--AA----G--GTA-TC-TTGTTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----A--ATT-------CTAC------T-AC-C-AACG-AG--C------TA-T-T-G-
gi|85601                      :          AA--ATAT--TC-AA-AT-C-CTGAG---A-GAAGTCTT--T-A-TCTTATT--G-AAAC-A-A--AG-A-G-G-A----ATA---T-CTTA-AA-GG-G-C---TTT--G-A-T-----T---T-CT--AA--A-AA-CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-ATTTTT-----C--A-T-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-G-ACcttg
gi|85594                      :          AA--GAAT--TC-AA-AACC-TTGCG---A-G----TTT--T-A-TTTT-TT--G-A------------------------CA---T--TCATA--GT-G-----TTT--G-T-TA---TT---T-CT--AA--A----CA--AA----T--ATA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT--------ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C---------T-T-G-ACCTTGtt
gi|85575                      :      tctcAA--AAAT--TC-ACCA--C-GTG-GCACG-A----TTT--T-AGTCTT-TTT-G-AA-C-AGA--AG-A-G-GCG----ATA---T-CTTA-A--GG-G-CGCCTTT--G-AATA---TT---T-CTT-AA--A-A--CA--AAAA--T--GTACTCGTT-TTC--GG-A--GGCACA---C-A--TTT-----C--ATCGCCTCCAC-AC------T-AC-C-A--G-AC--G------TA-T-T-G-ACCTTG
gi|85602                      : aatttcagcAA--AAAT--TT-AA----C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-T-A--AG-G-G-G-G----ACA-------------GA-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CA--CA--T-A--TA--GA----T--GCC-TC-AT-GAT--G--A--G----A---C-C--TTT-----G--TTT-------T-GA------T-AC-C-A--A-GA--C------TT-T-T-G-ACC
gi|85599                      :          AA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-T-A--AA-A-G-G-A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-t
gi|85598                      :          AA--AAAC--TT-TA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-T-A--AA-A-G-G-A----A---------TA-G--GG-C-C---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85603                      :          cA--AAAT--TC-AA-AA-C-CTGTG---ACG----TTT--TCA-TCTT-TT--GGAA-C-A-A--AG-A-G-G-G----GTA---T-TTTG-A--GG-G-C---TTTTGA-A-TA----T---T-CT--AA--ATA--CAT-AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--GA---A---C-A--TTT-----TCAATT-------C-AC------T-AC-CAA--G-AG--C------TA---T-G-ACca
gi|85604                      :            --AAAT--TC-AG-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT-TT--G-AA-C-A-A--AG-A-G-G-G----ATA---G-CTTA-A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT--AA--A-A--CA--AA----T--GTA-TC-TT-TTC--A--A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------T-AC-C-A--G-AG--C------TA-T-T---ACCatcttg
gi|85605                      :                 T--TC-AA-A--C-CTGAG---A-G----TCTC-T-A-TCTTATT--G-AA-G-A-G--AA-A-GAG-G----ATA---TTCTTA-A--GG-G-C---TTTC-G-A-TA---TT---TACT--AA--A-AA-CA--AA----T--GTA-TC-TT-T-C--A--A--C----G---C-A--TTT-----C--ATT-------CCAC------TTAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T-GAACCCTG
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Reference ( family-417 )      : AATTTCA---A--A--A-A--T--T-CAA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-A--AGA--G-G--G----AT-A-T---CTTAA--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
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gi|85596                      :    TTCA---A--A--A-A--TCTT-TAA-A--C--TG-G---A-A----CTA--T-AATCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-C
gi|85597                      :    TTCT---A--A--A-G--C--A-CTA-A--C-CTG-G---A-G----CCT----A-TCTT--TT--G-AA-C-C-A--ACA--G-G--G----AT-A------------GG-G-C---TTT--G-C-TA---TT---T-CT---A-A---T-A--CA-AG--T--GCG-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTG-----C--ATT-------C-AA------TAC-C-A--G-AG--CTGCATGTA-T-T--G-AC--CTTGaa
gi|85598                      :      CA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-GCC---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85599                      :       A---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-ca
gi|85600                      :       A---A--A--A-A--T--T-CAA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--A-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-ACCCGA--G-G--G----AT-A-G---CTTAA--GG-G------TT--G-A-TA---TT---T-C------A---A-A--CA-AA--G--GTA-TC-TTGT---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----A--ATT-------CTAC------TAC-C-AACG-AG--C------TA-T-T--G-----CTTG
gi|85601                      :       A---A--A--T-A--T--T-CAA-AT-C-CTGAG---A-GAAGTCTT--T-A-TCTTA-TT--G-AAAC-A-A--AGA--G-G--A----AT-A-T---CTTAAA-GG-G-C---TTT--G-A-T-----T---T-CT---A-A---A-AA-CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-ATTTTT-----C--A-T-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--TT
gi|85602                      :       A---A--A--A-A--T--T-TAA----C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AGG--G-G--G----AC-A------------GA-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CA---C-A---T-A--TA-GA--T--GCC-TC-AT-G---AT--G-----A--G----A---C-C--TTT-----G--TTT-------T-GA------TAC-C-A--A-GA--C------TT-T-T--G-AC--CT
gi|85603                      :        ---A--A--A-A--T--T-CAA-AA-C-CTGTG---ACG----TTT--TCA-TCTT--TT--GGAA-C-A-A--AGA--G-G--G----GT-A-T---TTTGA--GG-G-C---TTTTGA-A-TA----T---T-CT---A-A---ATA--CATAA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--GA---A---C-A--TTT-----TCAATT-------C-AC------TAC-CAA--G-AG--C------TA---T--G-ACATCTTG
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lowQualScore                  :        777 22 33 9 33 22 9   9 00 9   6 33333 9999  111 9 5    99  55 9  9 9 6 33   00 9 99 0000  00000000000 88  7 6 777   77 9 9  222  000 0  999 2 000 4 66  2  66 66   2  4  2 111  88 77777 66 7777 222 2 00   33333 66   0000000 2  666666   2 4 66 2  88 777777  2 2 99 2  77    
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Reference ( family-417 )      : AATTTCA---A--A--A-A--T--T-CAA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-A--AGA--G-G--G----AT-A-T---CTTAA--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
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gi|85575                      : AATTTCAGCAA--A--A-A--T--T-CACCA--C-GTG-GCACG-A----TTT--T-AGTCTT--TTT-G-AA-C-AGA--AGA--G-GC-G----AT-A-T---CTTAA--GG-G-CGCCTTT--G-AATA---TT---T-CTT--A-A---A-A--CA-AAAAT--GTACTCGTT-T---TC--GG----A--GGCACA---C-A--TTT-----C--ATCGCCTCCAC-AC------TAC-C-A--G-AC--G------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85576                      : AATTTCC---A--AGGA-A--T--T-CAA------CTA-G---A-G----TT-----AGTCTT--TTT-G-AA-C-A-A--AGA--C-G--G----AT-A-T---CTTAAGGGG-G-C---GTT--G-G-GA---TA---T-CT---G-A---
gi|85577                      :  ATTTTA---A--A--A-A--T--T-CAA-A--C-CTG-G---A-T----TTT--T-A-TCCT--TT--T-AA-C-A-----GA--A-G--A----AC---T---CTTAA--GG-G-C---CTT--G-A-T----TT---T-CT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-TC-CT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85578                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-----GA--A-G--G----AA-A-T-------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-
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gi|85581                      :   TTTCA---A--A--A-A--T--T-CAA-A--TTCTG-G---A-G----TTT----A-TCTT--TT--G-AA-C-ACA--AGA--G-G--G----AT-------TTTAA--GG-G-C---TT---G-A-TAA--TT---T-CT---AGA---A-A--CA-A---T--GTA-TC-TT-T----C--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--CT-----TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85582                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G---G-C----TAT--A-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-A--GGG--G-G--A----A-----------AA--GA-G-C---TTTG-G-A-TA---TT---
gi|85583                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-ca
gi|85584                      :   TTTTA---A--A--A-ACTT--T-TAA-A--C-ATG-G---G-C----TGT--T-A-TCTT--TTT-G-AA-C-C-A--AGG--G-G--G----A-----------AA--GA-G-C---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85585                      :   TTTCA---A--A--A-AAAT--T-CAA-AA-C-TTG-G---A-AGT--TTT--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-ACAAGAA-G-G--G----AT-A-G---CTTAA--GG-GGC---TTT--G-A-TA---TT---T-TT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-CC-TT-T---TT--T-----A--G----A---C-T--TTTTAAGAC--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTGca
gi|85586                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--A-A--G-G--G----AC-------C---A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-
gi|85587                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--C-A-TCTT--TT--G-AA-C-C-A--A-A--G-G--G----A--A-T-------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-
gi|85588                      :   TTTAA---A--A--A-A--C--T-TAA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--A-A--G-G--G----A--A-T-------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85589                      :   TTTCA---A--A--A-A--T--T-C-A-A--C-CTG-G---A-GT---TTT--T-A-GCTT--GT--G-AA-C-A-A--AGA--G-GC-G----AT-A-T----TTGA--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CTAAAA-A---A-A--CA-AT--T--GTA-TC-TT-T---TCA-A-----A--G----AC--C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-T-C--G-AG--
gi|85590                      :   TTTCA---A--A--A-T--T--TTCAA-A--C-CTG-G---G-A----GTA--T-A-TCTT--TTT-G-AA-C-A-A--AGA--G-G--GA---AT-A-T---CTTAA--GG-T-CTT-TTT--G-A-TA---TT---T-TTTA-A-A---A-A--CA-AT--G--GTA-TCTTT-T---TC--A-----AGGG----A---C-A---TT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--GAAG--C------TATT-T--G-AC--TT
gi|85591                      :   TTTGA---A--A--A-A--C--T-CAA-A--C-CT----------------------------TT--G-AA-C-C-A--ACA--T-G--G----AT-A------------GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT---A-ATTAATA--CA-AA--T--GGA-TA-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----A--ATT-------C-AC------TGC-C-A--A-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85592                      :   TTTCA---A--A--A-AC-T--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----TTA--T-A-TCTT--TTT-G-AA-CTA-A--AGG--G-G--A----AT---------TA---GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85593                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T--AA-A--C-CT----------------------------TT----AG-C-C-A--AGA--G-G--G----AT-A------------GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CC---A-A---T-A--AA-AA--T--GCA-TC-TT-T---AC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--AGT-------C-AA------TAC-C-A--G-TG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85594                      :   TCTCA---A--G--A-A--T--T-CAA-AACC-TTGCG---A-G----TTT--T-A-TTTT--TT--G-A--C-A--------------------T---T---CATAG--TG-------TTT--G-T-TA---TT---T-CT---A-A---A----CA-AA--T--ATA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT--------ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C---------T-T--G-AC--CTTG
gi|85595                      :   TTTCA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-C-------------------A--T--GTA-TA-TA-TGCCTC--ATGATGA--G----A---C-C--TTTG----T--TTT-------T-GG------TAC-C-A--A-GA--C------TT-A-T--G-AC--CTTG
gi|85596                      :    TTCA---A--A--A-A--TCTT-TAA-A--C--TG-G---A-A----CTA--T-AATCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-C
gi|85597                      :    TTCT---A--A--A-G--C--A-CTA-A--C-CTG-G---A-G----CCT----A-TCTT--TT--G-AA-C-C-A--ACA--G-G--G----AT-A------------GG-G-C---TTT--G-C-TA---TT---T-CT---A-A---T-A--CA-AG--T--GCG-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTG-----C--ATT-------C-AA------TAC-C-A--G-AG--CTGCATGTA-T-T--G-AC--CTTGaa
gi|85598                      :      CA---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-GCC---TTT--G-A-TA---TT---
gi|85599                      :       A---A--A--A-A--C--T-TTA-A--C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AAA--G-G--A----AT-----------A--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-ca
gi|85600                      :       A---A--A--A-A--T--T-CAA-A--C-CTG-G---A-G----TTT--A-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-ACCCGA--G-G--G----AT-A-G---CTTAA--GG-G------TT--G-A-TA---TT---T-C------A---A-A--CA-AA--G--GTA-TC-TTGT---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----A--ATT-------CTAC------TAC-C-AACG-AG--C------TA-T-T--G-----CTTG
gi|85601                      :       A---A--A--T-A--T--T-CAA-AT-C-CTGAG---A-GAAGTCTT--T-A-TCTTA-TT--G-AAAC-A-A--AGA--G-G--A----AT-A-T---CTTAAA-GG-G-C---TTT--G-A-T-----T---T-CT---A-A---A-AA-CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-ATTTTT-----C--A-T-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--TT
gi|85602                      :       A---A--A--A-A--T--T-TAA----C-CTG-G-----G----CTA--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-T-A--AGG--G-G--G----AC-A------------GA-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CA---C-A---T-A--TA-GA--T--GCC-TC-AT-G---AT--G-----A--G----A---C-C--TTT-----G--TTT-------T-GA------TAC-C-A--A-GA--C------TT-T-T--G-AC--CT
gi|85603                      :        ---A--A--A-A--T--T-CAA-AA-C-CTGTG---ACG----TTT--TCA-TCTT--TT--GGAA-C-A-A--AGA--G-G--G----GT-A-T---TTTGA--GG-G-C---TTTTGA-A-TA----T---T-CT---A-A---ATA--CATAA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--GA---A---C-A--TTT-----TCAATT-------C-AC------TAC-CAA--G-AG--C------TA---T--G-ACATCTTG
gi|85604                      :            --A--A-A--T--T-CAG-A--C-CTG-G---A-G----TTT--T-A-TCTT--TT--G-AA-C-A-A--AGA--G-G--G----AT-A-G---CTTAA--GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T----AC--
gi|85605                      :                    --T--T-CAA-A--C-CTGAG---A-G----TCTC-T-A-TCTTA-TT--G-AA-G-A-G--AAA--GAG--G----AT-A-TT--CTTAA--GG-G-C---TTTC-G-A-TA---TT---TACT---A-A---A-AA-CA-AA--T--GTA-TC--T-T---TC--A-----A--C----G---C-A--TTT-----C--ATTC------C-ACT-----TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--GAAC--CCTG
gi|85606                      :                                      G-A---A-G----TTT--T-A-TCTT--TTTGA-AA-C-A-A--AGA--G-G--GA---AT-A-T---CT--A--GG-GCC---CTT--G-G-TAT--TT---T-CT---A-A---A-A---A-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTTC----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-TTGA-AC--CTTG
gi|85607                      :                                         ---A-G----ATT--T-A-TTTTCTTT--A-GG-C-A-A--AAGTTG-A--G----ATTA-TACATTTGA--GT-G-C---TT---G-A-TA---TTGTTT-CT---A-A---A-A--CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TTCAA-----A--G----A---CAA--TTT-----C--ATT-------C-AC------TACGC-A--G-AGGTC------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85608                      :                                                                            -A-A--AGA--G--------------T---TTTAAA-GG-G-C---TTT--G-A-TA---TT---T-CT---A-A---A----CA-AA--T--GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-AC------TAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85609                      :                                                                                                       ---CTTAA--GG-G-C---TTT--G-A-TA---T--------------------------------GTA-TC-TT-T---TC--A-----A--A----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-ACTACTAGTAC-C-A--G-AG--C------TA-T-T--G-AC--CTTG
gi|85610                      :                                                                                                                                                       ---A-A--CA-AA--T--GTG-TC-TT-T---TC--A-----A--G----A---C-A--TTT-----C--ATT-------C-GC------CAC-C-A--G-AG--C------TA-C-T--G-AC--CTTG


blockSeqs                     :        GCA TA GG   CT CT       AC     C CACG  AAGT  TCT   A    CT  TG        G CA   TT   AA TATC  TATACATTTG  GG  C G GCC   TG      TTT  TTG    AAA G TTA T AA  T  AA TG   C  G  G GCC  CA TGATG GG GCAC TTT A TT   TAAGA CA   GCCTCCA T  TACTAG   G A AC A  GT TGCATG  T C TG A  AT
blockSeqs                     :        .   G  .    AA .        A      A CA    GT    TC    G    A   T         T CC   A    C  GAA   ATTCTTA     A   A C TT    G       A    GTT    TA  . .   T AC  .  .  .    .  T  . .    A  AT    .  A    C   . T    G     .    C       .  T        . A .  .  C  T       . . G  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    A  .        T      T AA    T     T     G    A   T         C .    .    C  A     ATTCTTA     A   . C .     G       T    .      T   . .   . A   .  .  .    .  .  . .    .  G     .  .    .   . T    C     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    C  .        A      A AC    .     T     A    .   T         . .    .    .  A     ATTCTTA     .   . . .     C       .    .      .   . .   . A   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   T         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   T         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATTTTG      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATTTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . G     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . G     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATTTTG      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     AGCTTA      .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . G     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTT       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     ATCTT       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     TCTTA       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     ATTTG       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     TCATA       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     TTTTA       .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     TTTA        .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     ATCT        .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     AT          .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . A     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     AT          .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     AT          .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     AT          .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .  .       . . .  .  . 
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     TA          .   . . .     .       .    .      .   . .   . .   .  .  .    .  .  . .    .  .     .  .    .   . .    .     .    .       .  .        . . .  .  .                      
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .            .                                                                                                                             
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     C           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     A     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :        .   .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     A           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .  .    .  .        .      . .     .     T     .    .   .         . .    .    .  .     .           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                    .  .        .      . .     .     .     .    .   .         . .    .    .  .     .           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                       . .     .     .     .    .   .         . .    .    .  .     .           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                         .     .     .     .    .   .         . .    .    .  .     .           .   . . .     .       .    .                                                                                                                                          
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