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Reference ( gi|32691 )        : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGAC-CCGG---TTTA----TGTGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32692                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------AGAC-CCGG---TTT------GTGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32694                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGAC-CCGG---TT------TGTGA--TGAGGGG-A-T---------CGAGTC----ACAGTTCGAATATTCT-AACTA
gi|32693                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGCC-CCGG---TT-------GTGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AGCTA
gi|32695                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATAACAGA----TGT-----CCTCC----------AGAC-CCGG---TT------TGTGA--TGAGGGG-A-C---------TGAGTC----ACAGTTAGAACATTCT-AACTAt
gi|32690                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATAACAGA----TGT-----CCTCC----------GGAC-CCGG---T----------GA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAACATTCT-AACTA
gi|32698                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TTT-----CCTCC----------GGAT-CCGG---TTT-----TGTGA--TGAGGGA-A-C---------CAAGTC----ACGGTTAGAATACTCT-AACTA
gi|32697                      : TTCT-ATCGTTA------AA---TGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGAC-CCGG---TTTA-------------AGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCG-AACTA
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gi|32713                      : TTCT-ATCGTTA------AA--GTGATAT-----TGT-----CCTAC----------GGAC-CCAG---Tagcgtagcctggtcacag
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Alignments
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Reference ( family-413 )      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
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gi|32714                      : TTCT-ATCGTTA------AA--TTGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTAACT--G-TGAACTGAGCGT-AGC---------CTGGTC----ACAGTCAAATTATTCT-
gi|32715                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGA-CC--GG---TTTA-----ACTGA----ACGTA-G-C---------CTGGTC----ACAGTAAAATTATTCT-
gi|32716                      : TTCT-ATCCTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32717                      : TTCT-ATCCTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32718                      : TTAT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
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gi|32720                      : TTCT-ATTGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--AG---T
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Alignments
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lowQualScore                  :     2       333333  66        4444   99999     0000000000      66  000 9999999999   44       0 1 111111111      5555                1     
consensus                     : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
Reference ( family-413 )      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32687                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACA------TGT-----CCTAC----------GGACCC--GG---T-----------GA--TGAGGGG-A-C---------CCAGTCACAGACAGTTAGAATATTCT-AACTA
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gi|32689                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACA------TGT-----CCTAC----------GGACCC--GG---T-----------GA--TGAGGGG-A-C---------CCAGTCACAGACAGTTAGAATATTCT-AACTAt
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gi|32694                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTT------G-TGA--TGAGGGG-A-T---------CGAGTC----ACAGTTCGAATATTCT-AACTAt
gi|32695                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATAACAGA----TGT-----CCTCC----------AGACCC--GG---TTT------G-TGA--TGAGGGG-A-C---------TGAGTC----ACAGTTAGAACATTCT-AACTA
gi|32696                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCT----------GGACCC--------------------A--TGAGGGG-A-C---------GAAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32697                      : TTCT-ATCGTTA------AA---TGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA--------------AGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCG-AACTA
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gi|32707                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
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gi|32709                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
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gi|32717                      : TTCT-ATCCTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32718                      : TTAT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
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gi|32720                      : TTCT-ATTGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--AG---T
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gi|32734                      :                                                   gtgatgaggggaccgagtcacagt-----G-TGG--TGAGGGG-A-C---------TGAGAC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32735                      :                                                                                    A--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA


blockSeqs                     :     C       CATGTA  TA        TAGT   TCCTA     TATCGTATAG      TG  ATT TTAATGATG    AC       G G TCGAATAAC      ACAG                A
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   CTAACTG      .        . G .              ACAG                .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTAACTG      .        . G .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTATG        .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTAAC        .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTTG         .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   CCGG         .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTAA         .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTAA         .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTG          .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTG          .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTG          .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTA          .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TTA          .        . . .              .                   .
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blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   TG           .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   T            .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   .            .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   .            .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .   .            .        . . .              .                   .
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blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .                .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .                .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .                .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .                .        . . .              .                   .
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blockSeqs                     :     .       .       .         .      .         .               .   .                .        . . .              .                   .
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blockSeqs                     :                                                                                     .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :                                                                                     .        . . .              .                   .
blockSeqs                     :                                                                                     .        . . .              .                    


blockSeqCons                  :                                                                                                                 ****
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Reference ( family-413 )      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32687                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACA------TGT-----CCTAC----------GGACCC--GG---T-----------GA--TGAGGGG-A-C---------CCAGTCACAGACAGTTAGAATATTCT-AACTA
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gi|32697                      : TTCT-ATCGTTA------AA---TGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA--------------AGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCG-AACTA
gi|32698                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TTT-----CCTCC----------GGATCC--GG---TTTT-----G-TGA--TGAGGGA-A-C---------CAAGTC----ACGGTTAGAATACTCT-AACTA
gi|32699                      : TTCT-ATCGTTACATGTAAA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GG-----------TTTAATGATG-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32700                      : TTTT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCT----------GGACCC--GG---TTTA--------------------A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32701                      : TTTT-ATCGTTA------AA--ATGACAAA----TGT-----CCTTCTATCGTATAGGGAA----GGATTTCTAACT--G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CCAGTC----ACAGTTAGAATATTTT-AACTA
gi|32702                      : TTCT-ACCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCT----------GGACTCTGGA---CCCG-----G-TGG--CTAGGGG-A-C---------TGAGAC----AC----AGAATATTCT-AACTA
gi|32703                      : TTTT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA------------------------------------------ACAGTTAGAATATTCT-AACTAt
gi|32704                      : TTCT-ATCATTA------AA--ATGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG-------------------TGAGCGT-AGC---------CTGGTC----ACAGTAAGATTATTCT-t
gi|32705                      : TTCT-ATCCTTC------AA--ATGACAGA----TGTTCCTACCTCC----------GGACCC--GA---TT-----------------GGGG-A-C---------CGAGAC----ACAGTTAGAATATT-T-AACT
gi|32706                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32707                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32708                      : TTCT-ATCTTTA------AA--ATGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----A-C----TGAGCGT-AGC---------CTGGTC----ACAGTAAGATTATTCT-
gi|32709                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32710                      : TTCT-ATCGTTA------AA--TTGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32711                      : TTCTCATCGTTA------AATAATGACAGA----TGT-----CCTCC----------CGACCC-----------------------------G-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT--ACTA
gi|32712                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGACATATAGTTGT-----CCTCC----------AGACCC--GG---T
gi|32713                      : TTCT-ATCGTTA------AA--GTGATAT-----TGT-----CCTAC----------GGACCC--AG---Tagcgtagcctggtcacag
gi|32714                      : TTCT-ATCGTTA------AA--TTGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTAACT--G-TGAACTGAGCGT-AGC---------CTGGTC----ACAGTCAAATTATTCT-
gi|32715                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGA-CC--GG---TTTA-----ACTGA----ACGTA-G-C---------CTGGTC----ACAGTAAAATTATTCT-
gi|32716                      : TTCT-ATCCTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32717                      : TTCT-ATCCTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32718                      : TTAT-ATCGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---T
gi|32719                      : TTCT-ATCGTTA------AA--ATGATAGT----TGT-----CCTCC----------GGACCC--AG---T
gi|32720                      : TTCT-ATTGTTA------AA--ATGACAGA----TGT-----CCTCC----------GGACCC--AG---T
gi|32721                      :             ------AG--ATGAC-------TGT-----CCTCC----------GGACCC--GG---TTTA-----A-TGA--TGAGGG--A-C---------TGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32722                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32723                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32724                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------C-AGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32725                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CAAATC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32726                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAATC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
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gi|32733                      :                                                                           -----G-TGA--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTgtgatgaggggaccgagtcacagttagaatattctaact
gi|32734                      :                                                   gtgatgaggggaccgagtcacagt-----G-TGG--TGAGGGG-A-C---------TGAGAC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA
gi|32735                      :                                                                                    A--TGAGGGG-A-C---------CGAGTC----ACAGTTAGAATATTCT-AACTA