lowQualScore : 111111 111111111 2222222222222 33333333333 11 2222
lowQualScore : 1 11 1 222222 1 1 11 1 2222 2 0 1 222 0 666666666666666 11 0 1 5555555 2 22 4444 1 0 22222 0 0 0 99999 222 44444 2222 22 1 11 1 33 333333 22 44 444444 5555 2 2 22 22 2 1 2 1 2 44444 1 33333 1 3333 55 1 1 22 1 2 1 1 1 1 222 44444 22 1 4444 22 11 444 1 1 2 1 2 1 22 444444 555555555 1 2 7777 3333333333333 222 4444444 2 3333 11 1 1 2 3333 2 1 222222 44 1 111 1 4444444444 77777 222 777 3 2222 1 5555 22 1 11 44444444 3333 22 1 777777777777777 111 11 3333 1 111 1 333333333 2222 44444 1 2 222 2 1 5555555555 8888888 4444444444 1 22 00000000000 22 11 5 11 111 444 1 2 1 5 2 11 88888888 1 1 1 22222 7777
lowQualScore : . .. . ...... . . .. . .... . . . ... . ............... .. . . ....... . .. .... . . ..... . . . ..... ... ..... .... .. . .. . .. ...... .. .. ...... .... . . .. .. . . . . . ..... . ..... . .... .. . . .. . . . . . . ... ..... .. . .... .. .. ... . . . . . . .. ...... ......... . . .... ............. ... ....... . .... .. . . . .... . . ...... .. . ... . .......... ..... ... ... . .... . .... .. . .. ........ .... .. . ............... ... .. .... . ... . ......... .... ..... . . ... . . .......... ....... .......... . .. ........... .. .. . .. ... ... . . . . . .. ........ . . . ..... ....
lowQualScore : 0 33 0 888888 0 0 33 9 9999 7 9 8 444 9 444444444444444 22 9 7 2222222 7 22 1111 8 9 33333 9 9 9 11111 000 11111 8888 33 0 33 9 22 888888 77 33 888888 0000 0 0 33 33 9 0 0 0 0 55555 0 44444 0 4444 66 0 0 77 0 9 0 0 0 0 777 55555 33 0 9999 33 33 555 0 0 0 0 0 0 33 111111 555555555 0 0 8888 6666666666666 777 1111111 0 0000 33 0 0 0 8888 9 0 222222 66 0 777 0 2222222222 33333 666 999 8 0000 9 0000 33 9 33 44444444 0000 33 0 000000000000000 777 33 0000 0 777 0 999999999 1111 66666 0 1 888 1 0 5555555555 7777777 5555555555 1 99 44444444444 55 44 5 55 999 111 1 2 1 6 2 66 00000000 1 1 1 99999 9999
consensus : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-N----AA--T------GA-A-T----CGTT----A----TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-CGT--------G-AC-GT-A-----ATAA--AACAATA
Reference ( gi|30257 ) : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--G------GA-A-T----CGTT----A----TA--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-A-T-A----T-TT----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT--A--------A--ATTA--TCACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAA-AACAATA
gi|30260 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AT-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----G----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--CATGTACCT----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GC-T----AA--G------GA-A-T----CGTT----AC---TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----T----A--A--------T----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT--A--------A--ATTA--TTACC---A---AA---C-T-C-CG-C-T-AAT--------T-AC-GT-A-----ATAAC-AACA
gi|30256 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----A--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----A----CG--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-G-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CA-C-T-CAT--------G-AC-TT-A-----ATAA
gi|30262 : TATGT-A--CT-A------T-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--T----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------C--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-A-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--G---C-C-G-C-T-T-C--AT-T----AA--G------AA-A-T----CGTT----ACT--TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----C-------A--------A----TT--TT-T------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ATTT-T--GAT--A--------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAC-AACAc
gi|30258 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-T-A-----A-GC-C-GT-T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--AC--C-C-G-C---T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----A----CG--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-ATAT-T-C-CT-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----A----T-A------T--------T---T--T----T-A---A-TA-G-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAC-AA
gi|30259 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----A----CG--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--A-AAGA--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-G-------T----T-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------C--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-t
gi|30261 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----A--T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--AT-C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T--C-A---T-----A--G-T----T--A--------C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--C------GA-A-T----CGTT----A----TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TTAA----T-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------------TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--CTG--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-----A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TTAA-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T---CG---T-CAT--------G-AC-GT-A-----AT--A-TACAATA
gi|30266 : TATGT-A--CC-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-A-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----TATG-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--GT-A----AA--T------GA-A-C----CATT----A----TT--TG--T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T---CG-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----T--C-A--A--------A----A--------------------------T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------TTAGTTACT----------ACTT-T--AAT-----------A--ATTA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-G-GGT--------G-GC-GT-A-----ATA
gi|30263 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-C-------GGA-T--GG---A-C-A-----A-GC-C-G-----G--TAC-----A----T--A------CC-A--TA------T--A--C------CC----TTG-T--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT------AA--A------GA-A-T----CGTT----A-----ACTT---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-C--C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAA--T--------A--ATTA--TTA-CA--A---AA---C---C-CG-C-T-CTT--------GCAC--T-A-----AT----AACAATA
gi|30267 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GTA-T---------------T--TC-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--A--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-CG-----GG-A-----T-A----T--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--T------GA-A-T----CATT----A----CT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-ATTCT-A----------A-----TCT---GA-G-T-G----T-TT----T--C-A--A--------A----AC--TT-G------T--------T---T--G----T-A---A-AA-TAACAAGCT----A-----C-G-T---TC-A-C----------TTACTTA-T----------ACTT-T--AAT-----------A--ATTA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-
gi|30264 : TATGT-A--CT-AGGCCTAC-T-G--CA-GAGAAA----TA-T-G-TAG---ACG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-C-----A-AC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-AG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-A----AA--A------GA-A-T----CGTT----A----CT--T---T-------T-TG---G--C-A--TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A-----A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA---------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-T-----------A--ATTA--TTAC----A---AA---C---C-CG-C-T-CAT--------G-A--GT-------AT----AACAATAgtcatg
gi|30265 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----T--G-G----T--A--A---T-C-A-C-T-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTA----A----CT--T---TG------T-T----G--C-AT-TT------T-C-CA-C----C--TTAA---T-A----------G-----TTTC--GA-G-T-A----T-TT----TG-C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---ACAA-C-------T----A-----C-ATT---TT-A-C----------T-------T----------ACTG-T---AT--A--------A--TCGA--TATTCA--A---CA---C-T-C-CGCC-C-GAT--------G-AC-GT-A-----ATACA-
gi|30268 : TATGT-A--TT-A------C-T-G--CA-GAGA-------------TAG----CA-C---------------T--TA-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-AA-TA------T--A--C------CC----C-GGT--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T-TTCC-A---T-----A--G-TA---T--A--------T-G-A-T-T-C--GT-TT---AA--T------GA-A-CATC-CGTT----A----CT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-GA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T-----------CTT-T--GAA--T--------A--ATTA--TTACC---A---AA---C-T-CGCG-C-T-CA---------G-AC-GT-A-----t
gi|30269 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA---------------------------------------AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-GCC-T-T-C--G--C----AA-------------------CGTT----A----CT--T---T-------TGT----G--C-AT-TT-A----TCC-CC-C----C--TT-A---T-A----------------TTG---GAGA-T-A----TGTT----T--T-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----------C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTG-T--AAT--A--------G--ATTA---CATCA--A---AA-------C-CG-C-C--GT--------G-AC-GTCA-----GT----AACAATA
gi|30270 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----G-GC-C-G-----G---AC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------A--A--CG-----CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-CGTGT-T----AAC-T------GA-G-T----CGTT----A----TT--T---T-------T-T----A--C-AT-TT-A----T-C-CA------C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C----A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-A---A-
gi|30271 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAGT-GGTAG---GAC-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A---------CC----T-G-T--CAA---AA-T-G-A-A-TG-----GG-AATATCC-A----T--A-T-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---C-----G--T-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--GT-A----AA--A------GA-A-T----GTTT----AACTTTA------T-------T-T----G--C-ATATT-A----TAC-CATC----T--TT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-TAA----T-TC----T--C-A--A--------A----AAATTT-AT-----T--------T---T--G----T-A---A-TA-T-------T----A-----A-A-T---TTAA-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT--G--------A--A-TA--GTACCA--A---GA---C-T-C-CG-C-T--AT--------G-AC-GT-A-----AT--A-CACAATA
gi|30272 : TATG--A--TT-A------C-T-G--CA-GAGATA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGG-C--G----A-A-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--A-AGA--CCTA--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-ACA-A-TGTAGATGG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----AT-A-TA---T--A--A---C-C-G-T-T-T-C--GT-A----AA--T------G------------------------------T-------T-T----G--C-GT-TT-A----T-C-CA-CCTAGC--TT-A---T-A----------A-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----T--C-A--A--------A----ACT-TT-A------T--------T---T--G----T-A---A------------------------------------------------------------------ACTT-T--AAT-----------A--ATTA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-TGT--------G-AC-GT-ATGCCCCTAAT-AACAAT
gi|30273 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CACGAGATA----A------TAG---ACA-T---------------T---G-ATGT-------GTAGC--G----A---A-----A-GC-C-GAAT--G--TAC-----A----T--G-AGGGGCC-AG-TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CTAA-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-CGT-G-C--GT-CTTAGAA--T------GA-A-T----CGTT----A------------G-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-T----C--TT-A---TGA----------G-----TGT---GAGG-T-A----T-TC----T--C-C--A--------A----AA--GA-A------T--------A---T--GATGTT-A---A-AA-G-------T----A-----CAA-T---TT-A-C----------T-------T----------AC-------AT-----------A--ATCC--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-T-T-CAT--------G-A--GT----------AA-AACAATA
gi|30276 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT---------GGA-C--A----A-C-A-------GC-C-G--G--G--ATC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------A--C--C------CC----T-G-T--C-----------------------GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T---CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--AT-----GA-A-T----CGTT----A-------------------------------------------------------C--T------T-A----------G-----T------------A----T-TT----T--C-A--A--------A----GT--TT-A------T--------T---T--G----T-ATTTA------------T----A-----C-A-T---TA-A-C----------T-------TACAATAAATAACTG-T--AAT-----------A--ATTA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-C-TGT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30277 : TATGT-A--CT-A------CAT-G--CA-GAGAAACTACAA-TAG-TAGA--GCATT---------------T--TG-ATGTAA-----GGA-C--GTA--A-C-A-----A-GCACAG--T--G---ACCGATTG----T--G-AGG--CC-A---A------T--A--C------CC----T-GCT--CAAATTAA-T-A-G-A-TG-----AG-G-----T-AAC--C--A-A-AA--T-GGAC-TCT-CC-A---T-----A--G-TA---T--A--AAAGC-C-G-C-T-TACA-GG-T----AA--ATTTCGTGA-A-G----CGCT----ACTTTTT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GAGG-T-AAAGTT-TT----T--C-A--AT-------A----AT--TT-A------G--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----
gi|30278 : TGTGT-ATTCT-A------C-T-G--CA-GCGAAA----A--T-C-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-------------------------A-----A-GC-C-G--G--G--AAT-----A----T--G-AGG--TC-A--TA------A--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-ATTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CT-A---TTCTAAA--T-T----T--A--A---C-C-gagcggttttaacttaacttttaatta
gi|30280 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-
gi|30281 : TAGGT-A--CT-A------C-T-G--TA-GAGAAA----AA-C-A-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--GCCGAG-C-A-----A-GC-T-G--G--G--TAC-----A----C--G-ATG--CC-A--T
gi|30279 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-G-GAAG----AA-A-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--
gi|30275 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA-----------------T--TG-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30274 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA-----------------T--TG-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30282 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GACAAA----AA-T-G-CAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------G
gi|30284 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--C--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--T------GA-A-T----CGT----------TA--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-TA-C----C--TA-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--AAT-----------A--ATCA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-GGT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30283 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G--T----AA--A------GA-A-T----CGTT----A----CT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T---CA------C--TT-A---T------------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-T--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA---------T----A-----C-A-TATATT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-CAT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30286 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--GAC-----A----T--G-AGG--CC-----A------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---TTATA-A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--GT-T----AA--T------GA-A-T----CGTT----AC---TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GT-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AG-T-------T----C-----C----------A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT----------------------ACCA--A---AA---C-T-C-TG-C-T-CAT--------G-AC-AT-A-----AT----AACAATA
gi|30285 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AATT-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-CTT-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-TCAAACG-T----A----TG--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----C-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AAGT-------T----A-------A-----TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T---AT--A--------ATTATTA--CCA-CA--A---AA---C---C-CGCC-T-CATG-------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30288 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CG-AAGAAA----AA-T-A-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--T------GA-A-T----CGTT----AC---TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-T-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--A-A--A--------AT---AG--TT--------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GATTGA--------T--ATTA--TC
gi|30287 : ATTT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CTG---GTA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--A----A-C-A-----A-GC-T-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------TC----T-T-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----AC---TA--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A---------A-----------------------------------------GA-G-T-A----T-TT----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----T-----C-A-T---TT-A-A----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------G--ATTA--TAATCA--A---AA---C-T-T-CG-C-T-CGT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30289 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--T-T----C--A--A---C-C-G-C-C-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----A----CG--T---T-------T-C----A--C-AT-CT-A----T-T-CA-T----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TC----T--C-A--A--------A----A
gi|30290 : ATGT-A--CT-A------C-TTG--CA-GAGAAA----AA-T-G-AGG---ACA-TGGTTATGTTACCTCAT--TG-AT-T-------GGA-C--G----AAC-A-----A-AG-C-G--T--G--TAC-----A----TA-G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----TAG-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CA-A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--AATA---C-C-G-C-TAT-C--GTAA----AA--A------GA-A-T----CGTT----AC---TT--C---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-TTC---T--C-A--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----AC----C-ATT---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTAGTTTACCAATA---AA---C-TCC-CGTC-T-CAT--------G-AC-GT-A-----ATA
gi|30291 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--C--GAGAAA----AA-T-G-TAG----CA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----AAGC-C-G--T--G--TACC----A----T--G-AGG--CCCA--TA------T--A--C------CCC---T-G-T--CAAGT-AA-T-A-G-A-TG-----GT-------T-A----C--A-A-AA--T----C-T-T-CCCA---T-----AAGG-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--GT-A----AA--T------GA---T----CGTT----AC---TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-TAA----T-TT----T--C-A--A--------T----AA--TT-A------G--------T---T--GT---T-A---A-AACT-------T----A-----C-G-T---TT-A-CT---------T-------T----------ACTT-T--AAA--T--------A--ATCA--TTATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-GGTG-------G-ACGGT-A-----AT-----ACAATAtaca
gi|30292 : ATGT-A--CTTA------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-GATAG---ACA-T---------------T--TG-AC-TTG-----GGA-C--G----AGCGA-----A-GC-C-G--T--G--GTC-----A----T--G-AG---CC-A--TA------TCAA--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TT-----GA---------A----C--A-A-AA--TGGG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TAAA--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-A----AA--A------GA-ATT----CGTTTGACG----TT--T---T-------T-T----GGTA-AT-TT-ATTCTT-C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GTTGT-TTT---GA-GTT-A----T-TC----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---TTGG----T-A---A-AA-T-------C----ACTTGCC-A-TG--TT-A-CTTTTATGTGTT-------T----------ACTTGT--GAT-----------A--ATTA--TTACT---A---AA---C-T-C-GG-C-T-CGT--------G-AC-GT-A-------AAT-AACAATA
gi|30293 : ATGT-A--TA-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------G
gi|30294 : TGT-A--TT-A------C-T-G--CA-CAGAAA----TA-T-G-CAGCAGGCA-T---------------T--TG-AT-T-------GAA-C--G----A-C-A-----A-TC-C-G--G--G--AGC-----A----T--G-AGG--CC-AATTG------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----A--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-A-C-T-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CGTT----AC---TT--T---T-------T-T----G--G-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---C-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----T--C-A--A--------A----AA--TT-ATTAAACT--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--AAT-----------A--ATTA--TTAACA--A---AA---T-T-C---------GT--------G-AT-GC-A-----ATAAC-AA
gi|30295 : TGTCA--CT-A------C-T-GAGCAAGAGAAA----AA-T-G-TAG---ATA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-CG-G----A-C-A-----A-GC-C-G--TACG--TACA----A----T--G-GGC--CT-A--TATTATTTT--A--CA-----CC----T-G-TCACAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GGAA-----T-A----C----G-AA--T-GGAC-T-T-CC-AT--T-----A--G-T----T--A--A---CGC-GCC-T-T-C--GTAA----AA--G------GA-A-T----CGTA----G----TA--T---T-------TCT----G--T--T-TC-A----T---CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTA---GG-G-T-A----TGTC----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------TAACAA-----T-A-T---AT-A-C----------T-------T----------ACTA-TAGGAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCAGTAG------A-AC-GT--------TAAT-AACAAt
gi|30296 : --CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-TAA-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---A-T-G-C-T-T-C--GT-T----AA--C------GA-A-T----AGTT----C----TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TCTTAAT--C-G--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-T-CAT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30297 : --CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-TAG----CA-T---------------T--TGGAT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-AG-C-GGAT--A--TAC-----A----T--G-AGA--C--A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-AGTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-T-T-C-CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GC-A----AA--T------GA-A-T----CGTTA---A----TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-CTCA-C----C---T-A---T-A----------GTTTTTTTT---GA-G-T-A----T-TT----C-------A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----TAA---A-AA-T-------C----A-----C-A-T---TT-A-C----------TG------T----------ACTG-G--GGT--A--------AT-AATA--TCATCA--AAATAA---C-T-C-CGCC-C-CGT--------G-AC-G--------GTAAATAACAATA
gi|30298 : -GAGAAAT---GA-T-A-GAG---ACA-T---------------TATTG-AT-TTGGTCTCGGA-T--C----A-T-ATGTCTA-GC-C-G--T--GAGTAC-----AATCGT--A-GAG--CA-A--TA------TGTA--C------CCATCAT-G-T--CAAA--GA-T-A-GTA-TG-----GG-AA----T-A----TCAA-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-ACTAT-----A--G-T----T--A--A---C-CGG-C-C-T-C--GT-A----AA--T------GATATT----CGTT----AT---TA--TACGT-------T-TAATAG--C-AT-TTAA----T-C-CATT----C--TT-A---T-ATGATTTCTTTG-----TTT---AC-G-T-A----T-TTAACCT--C-A--AGGGTTTAGA----GA--TTAA------TGCTTAAAGT---T--G----T-A---A-AA-G-------T----AG----C-A-T---CT-ACC----------T-------T----------ACTT-T--GAT--AG-------A--ATTA--TTACCA--A---AAACTC-T-C-CG-C-T-CATTTGGGGGAG-AC-GT-A-----ATAA
gi|30299 : AGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-TG--------------T--TG-A--T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TAT-----T--A--C------CC----T-G-T--C-AG--AA-T-A-G-G-TA-----TG-A-----TAA----C--A-A-AA--T-GGCC-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TA-A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-TAAA-AA--G------GA-A-T----CGTT----A----TA--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----TCC-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TT-----G-A-C-A----T-AT----T--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-----TT-A-C----------T-------T----------ACTT-T--TAT--A--------A--ATTA--TTACCA--A---AA---C-TAC-CG-CTT-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAC-AACAc
gi|30300 : A-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GTA-C--G----A-C-A-----A-GC---G-----G--TAC-----A----T--GGAGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-G--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-G-----T-A----C--A-ACAA--T--G-C-T-T-CC-A---T-----A--GAT----T--A--A---C-C-G-C-TGT-C--GT-A----AA--A------GA-A-T----CGTT----A----CT--T---T-------T-T----G--C-A--TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T------------G-----TTA---GA-G-TCA----T-TC----TCCC-A--A--------A----AA--TA-A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------A----A-----C-A-T---TT-A-A----------C-------T----------ACTG-T--GAT--AATT-----A--ATTA--T-ACCA--A---A------C-C-CG-C-T-CAT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
gi|30301 : -T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-G--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--A--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--ATAC------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TGCATG-GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GC-A----AA--T------GA-A-T----CGTTA---A----TT--T---T-------T-T----G--C-AT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------C-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----T--CAA--A--------A----AA--TT-A------T--------TCAGT--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TC-A-C----------T-------T----------ACTG-T--AAT-----------A--ATTA--TCATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-C-CGT--------G-AT-G---------TAAA-AACAATA
gi|30302 : -AT-T-------GGA-CCCG----A-C-A-----A-AC-C-G--G--G--TAC-----AA---T--G-AGA--CC-A--TA-------------------CC----T-G-TA-CTAG--AA-T-AAG-A-TG-----AG-A-----T-AAACAC--ATA-AA--T-GG-A-T-T-CC-A---A-----A--A-TAAAGT--A--A---A-C-G-C-T-T-C--GT------AATTG------AA-A-TGTTACGTTTT--A----TA--T---TATTTTTTT-T----A--TGAT-TT-A----T-C-CA-C----C--TT-A---T-A----------A-----CTTATTGA-A-T-A----T-TT----T--C-G--A--------AGGAAAA--TT-----------------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT-A-C----------TAA-----T----------TCTT-TAAAAT--ATAAATTTTA--ATTA--TTATCA--A---AA---T-T-C-CG-CTT-TTT--------G-AC-GT-A-----ATAA
gi|30304 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--G------GA-A-TG---CGTT----A----TA--T---T-------T-T----G--C-A--TT-A----T-C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-TT----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-----TT-A-C----------T-------T----------CTTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-T-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAC-AACAca
gi|30303 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT-T----AA--G------GA-A-TG---CGTT----A----TA--T---T-------T-T----G--C-A--TT-A----T-C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-TT----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-----TT-A-C----------T-------T----------CTTT-T--GAT-----------A--ATTA--TTACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-T-AAT--------G-AC-GT-A-----ATAAC-AACA
gi|30305 : -T----T--A--A---C-C-G-C-A-T-C--GT-A----AA--T------GA-A-T----CTTT-------------T---T-------T-T----G--T-AT-GT-A----T-C-CA-C----T--TT-A---T-T----------G-----TTT---GA-A-TAA----T-TT----C--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-A---A-AT-A-------T----A-----C-T-T---TT-A-C----------T-------T----------GC
gi|30306 : ---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-TT----C--C-A--A--------G----AA--TT-ACATGTAT--------T---T--A----T-A---A-AA-T-------T----A-----C-A-T---T--A-C----------T-------T----------ACGT-T--AAT--G--------A---TTA--TTATCA--A---AA---C-T-C-TG-C-T-GGT--------G-AC-GT-A-----AT----AACAATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 2222
lowQualScore : 1 11 1 222222 1 1 11 1 2222 2 0 1 222 0 666666666666666 11 0 1 5555555 2 22 4444 1 0 22222 0 0 0 88888 111 44444 2222 22 0 11 1 33 333333 22 44 444444 4444 1 1 22 22 2 1 1 1 1 44444 1 33333 1 3333 55 1 1 22 1 2 1 1 1 1 222 44444 22 0 4444 22 11 333 0 1 1 1 1 1 22 1 777777 555555 1 1 5555 11 3333 777777777777777 1 333 1 1 3333 11 1 1 1 2222 444 1 1 44 2222 1 111 0 4444444444 77777 222 2 1 3 2222 1 444444444 22 1 11 44444444 2222 11 1 666666666666666 111 11 3333 1 1 2 4444444 3333 44444 2 2 222 33 1 5555555555 8888888 5555555555 1 3333 44444444444 55 1 333 1 11 11 11 11 111 333 1 2 1 4 1 3333 77777777 1 2 1 1 7777
lowQualScore : . .. . ...... . . .. . .... . . . ... . ............... .. . . ....... . .. .... . . ..... . . . ..... ... ..... .... .. . .. . .. ...... .. .. ...... .... . . .. .. . . . . . ..... . ..... . .... .. . . .. . . . . . . ... ..... .. . .... .. .. ... . . . . . . .. . ...... ...... . . .... .. .... ............... . ... . . .... .. . . . .... ... . . .. .... . ... . .......... ..... ... . . . .... . ......... .. . .. ........ .... .. . ............... ... .. .... . . . ....... .... ..... . . ... .. . .......... ....... .......... . .... ........... .. . ... . .. .. .. .. ... ... . . . . . .... ........ . . . . ....
lowQualScore : 0 33 0 777777 0 0 33 9 8888 6 9 7 444 9 333333333333333 22 9 7 1111111 7 11 0000 8 9 22222 9 9 9 77777 777 00000 8888 22 9 33 9 11 777777 66 22 666666 9999 9 9 33 33 9 0 9 0 9 44444 0 33333 0 3333 55 0 0 66 0 9 0 0 0 0 666 44444 33 9 8888 22 33 555 9 9 9 0 9 0 66 0 555555 000000 0 9 6666 33 9999 000000000000000 9 666 0 0 0000 33 0 0 9 0000 555 0 9 55 0000 0 666 9 1111111111 11111 666 8 9 7 9999 9 333333333 22 9 33 33333333 9999 33 9 777777777777777 777 33 0000 0 0 0 9999999 4444 44444 0 0 777 33 0 2222222222 3333333 2222222222 0 8888 88888888888 44 0 111 0 44 44 44 44 888 999 1 1 1 3 1 7777 88888888 1 2 1 1 6666
consensus : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
Reference ( family-403 ) : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----N-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
gi|30256 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----A--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC-A-T--------G-AC-T-T-AAT-AA-
gi|30257 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----GGA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-A-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--CAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AATAAA-AACAATAc
gi|30258 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-T-A-----A-GC-C-G--TT-G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-A-----T-A----C--A-A-A---T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-CCG-C-T---C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TATTC-CT-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A----T-A------T--------T---T--T----T-AA-TA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAAT
gi|30259 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-AAGA--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----T-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--C-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-
gi|30260 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AT-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----G----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--CATGTACCT----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-C----T-AA-----GGA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--T-A--A--------T----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------T-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30261 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----A--T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--AT-C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T--C-A---T-----A--G-T----T--A--------C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----CGA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TTAA----T---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------------TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--CTG--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T--A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T---CG---TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-TACAATA
gi|30262 : TATGT-A--CT-A------T-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--T----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------C--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-A-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--G---C-C-G-C-T-T-C--A-T----T-AA-----GAA-A-T----CGT--T----ACT------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----TT--TT-T------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ATTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30263 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-C-------GGA-T--GG---A-C-A-----A-GC-C-G-----G--TAC-----A----T--A------CC-A--TA------T--A--C------CC----TTG-T--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----AA-------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-C--CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TA---CA--A---AA---C---C-CG-C-TC-T-T--------GCAC---T-AAT----AACAATA
gi|30264 : TATGT-A--CT-AGGCCTAC-T-G--CA-GAGAAA----TA-T-G-TAG---ACG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-C-----A-AC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-AG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----AGA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-TG---G--C-A--TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A-----A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-------------T--A-AT---T-A--T--TAC------A---AA---C---C-CG-C-TC-A-T--------G-A--G-T--AT----AACAATA
gi|30265 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----T--G-G----T--A--A---T-C-A-C-T-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--A----A--------------CT-T---TGT-T----G--C-AT-TT------T---C-CA-CC--T----TAA---T-A----------G-----TTTC--GA-G-T-A----T-T----T----TG-C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AACAA-C-------T----A-----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T----A-----------T--A-ATCGAT-A--T--T----CA--A---CA---C-T-C-CG-C-CC-GAT--------G-AC-G-T-AAT-AC-AA
gi|30266 : TATGT-A--CC-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-A-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----TATG-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G-T----A-AA-----TGA-A-C----CAT--T----A--------------TT-TG--T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CG-CT--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----A--------------------------T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TTAGTTACT----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG-G-T--------G-GC-G-T-AAT-At
gi|30267 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GTA-T---------------T--TC-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--A--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-CG-----GG-A-----T-A----T--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----TGA-A-T----CAT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-ATTCT-A----------A-----TCT---GA-G-T-G----T-T----T----T--C-A--A--------A----AC--TT-G------T--------T---T--G----T-AA-AA-TAACAAGCT----A-----C-G-T---TC--A-C----------TTACTTA-T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-T
gi|30268 : TATGT-A--TT-A------C-T-G--CA-GAGA-------------TAG----CA-C---------------T--TA-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-AA-TA------T--A--C------CC----C-GGT--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T-TTCC-A---T-----A--G-TA---T--A--------T-G-A-T-T-C--G-T----TTAA-----TGA-A-CATC-CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-GA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T-----------CTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-CGCG-C-TC-A----------G-AC-G-T-Agtcatg
gi|30269 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA---------------------------------------AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-GCC-T-T-C--G-C----A-A-----------------CGT--T----A--------------CT-T---T-TGT----G--C-AT-TT-A----TC--C-CC-CC--T----T-A---T-A----------------TTG---GA-GAT-A----TGT----T----T--T-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----------C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--AGAT---T-A-----CAT--CA--A---AA-------C-CG-C--C-G-T--------G-AC-G-TCAGT----AACAATA
gi|30270 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----G-GC-C-G-----G---AC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------A--A--CG-----CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-CGTG-T----T-AAC----TGA-G-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----A--C-AT-TT-A----T---C-CA--C--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C----A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-
gi|30271 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAGT-GGTAG---GAC-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A---------CC----T-G-T--CAA---AA-T-G-A-A-TG-----GG-AATATCC-A----T--A-T-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---C-----G--T-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----AGA-A-T----GTT--T----AAC------------TT-TA--T-T-T----G--C-ATATT-A----TA--C-CATCT--T----T-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-TAA----T-T----C----T--C-A--A--------A----AAATTT-AT-----T--------T---T--G----T-AA-TA-T-------T----A-----A-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AA---T-A--G--TAC--CA--A---GA---C-T-C-CG-C-T--A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-CACAATA
gi|30272 : TATG--A--TT-A------C-T-G--CA-GAGATA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGG-C--G----A-A-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--A-AGA--CCTA--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-ACA-A-TGTAGATGG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----AT-A-TA---T--A--A---C-C-G-T-T-T-C--G-T----A-AA-----TG-----------------------------------------T-T-T----G--C-GT-TT-A----T---C-CA-CC--TAGCTT-A---T-A----------A-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AC--TTTA------T--------T---T--G----T-AA-A------------------------------------------------------------------CTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT-G-T--------G-AC-G-T-A
gi|30273 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CACGAGATA----A------TAG---ACA-T---------------T---G-ATGT-------GTAGC--G----A---A-----A-GC-C-GAAT--G--TAC-----A----T--G-AGGGGCC-AG-TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CTAA-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-CGT-G-C--G-TCTTAG-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A---------------------G-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-TC--T----T-A---TGA----------G-----TGT---GAGG-T-A----T-T----C----T--C-C--A--------A----AA--GA-A------T--------A---T--GATGTT-AA-AA-G-------T----A-----CAA-T---TT--A-C----------T-------T----------AC--------A-----------T--A-AT---C-C--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC-A-T--------G--------AGT-AA-AACAATAtgcccctaataacaat
gi|30274 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA-----------------T--TG-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30275 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA-----------------T--TG-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30276 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT---------GGA-C--A----A-C-A-------GC-C-G--G--G--ATC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------A--C--C------CC----T-G-T--C-----------------------GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T---CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GTT----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T------------------------------------------------------------------------------A-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----GT--TT-A------T--------T---T--G----T-----A-TTTA----T----A-----C-A-T---TA--A-C----------T-------TACAATAAATAACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30277 : TATGT-A--CT-A------CAT-G--CA-GAGAAACTACAA-TAG-TAGA--GCATT---------------T--TG-ATGTAA-----GGA-C--GTA--A-C-A-----A-GCACAG--T--G---ACCGATTG----T--G-AGG--CC-A---A------T--A--C------CC----T-GCT--CAAATTAA-T-A-G-A-TG-----AG-G-----T-AAC--C--A-A-AA--T-GGAC-TCT-CC-A---T-----A--G-TA---T--A--AAAGC-C-G-C-T-TACAGG-T----A-AATTTCGTGA-A-G----CGC--T----ACTTT----------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-CT--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GAGG-T-AAAGTT-T----T----T--C-A--AT-------A----AT--TT-A------G--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TGA--G-----CGG-T---TTTAA-C----------T-------TA---------ACTT-T----------------T--A-AT---T-A--
gi|30278 : TGTGT-ATTCT-A------C-T-G--CA-GCGAAA----A--T-C-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-------------------------A-----A-GC-C-G--G--G--AAT-----A----T--G-AGG--TC-A--TA------A--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-ATTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CT-A---TTCTAAA--T-T----T--A--A---C-C-
gi|30279 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-G-GAAG----AA-A-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--
gi|30280 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-
gi|30281 : TAGGT-A--CT-A------C-T-G--TA-GAGAAA----AA-C-A-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--GCCGAG-C-A-----A-GC-T-G--G--G--TAC-----A----C--G-ATG--CC-A--T
gi|30282 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GACAAA----AA-T-G-CAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------G
gi|30283 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACG-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CA--C--T----T-A---T------------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-T--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-TATATT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30284 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--C--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A-----------------T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-TA-CC--T----A-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30285 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AATT-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-CTT-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-TCAAACG---T----A--------------TG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----C---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AAGT-------T----A-------A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T----A-----------T--A-AT---T-A--T--TACCACA--A---AA---C---C-CGCC-TC-A-TG-------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30286 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--GAC-----A----T--G-AGG--CC-----A------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---TTATA-A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G-T----T-AA-----TGA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GT-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AG-T-------T----C-----C-----------A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------------------------TAC--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC-A-T--------G-AC-A-T-AAT----AACAATA
gi|30287 : ATTT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CTG---GTA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--A----A-C-A-----A-GC-T-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------TC----T-T-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CTAT---T-T-T----G--C-AT-TT-A-----------A-----------------------------------------GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----T-----C-A-T---TT--A-A----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AT---T-A--T--AAT--CA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30288 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CG-AAGAAA----AA-T-A-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----TGA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---T-CA-TC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-A--A--------AT---AG--TT--------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--T-GA---T-A--T--TAT--C
gi|30289 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--T-T----C--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-C----A--C-AT-CT-A----T---T-CA-TT--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A
gi|30290 : ATGT-A--CT-A------C-TTG--CA-GAGAAA----AA-T-G-AGG---ACA-TGGTTATGTTACCTCAT--TG-AT-T-------GGA-C--G----AAC-A-----A-AG-C-G--T--G--TAC-----A----TA-G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----TAG-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CA-A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--AATA---C-C-G-C-TAT-C--G-TA---A-AA-----AGA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-C---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CCTTT----T-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-T-AT---T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----AC----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-AGTT--TAC--CAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT-A
gi|30291 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--C--GAGAAA----AA-T-G-TAG----CA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----AAGC-C-G--T--G--TACC----A----T--G-AGG--CCCA--TA------T--A--C------CCC---T-G-T--CAAGT-AA-T-A-G-A-TG-----GT-------T-A----C--A-A-AA--T----C-T-T-CCCA---T-----AAGG-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----TGA---T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-CT--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-TAA----T-T----T----T--C-A--A--------T----AA--TT-A------G--------T---T--GT---T-AA-AACT-------T----A-----C-G-T---TT--A-CT---------T-------T----------ACTT-TA-A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-TG-------G-ACGG-T-AAT-----ACAATAtaca
gi|30292 : ATGT-A--CTTA------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-GATAG---ACA-T---------------T--TG-AC-TTG-----GGA-C--G----AGCGA-----A-GC-C-G--T--G--GTC-----A----T--G-AG---CC-A--TA------TCAA--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TT-----GA---------A----C--A-A-AA--TGGG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TAAA--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AA-----AGA-ATT----CGT--TTGACG--------------TT-T---T-T-T----GGTA-AT-TT-ATTCTT---C-CA-CCTTT----T-A---T-A----------GTTGT-TTT---GA-GTT-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---TTGG----T-AA-AA-T-------C----ACTTGCC-A-TG--TT--A-CTTTTATGTGTT-------T----------ACTTGT--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--T---A---AA---C-T-C-GG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AA--AT-AACAATA
gi|30293 : ATGT-A--TA-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------G
gi|30294 : TGT-A--TT-A------C-T-G--CA-CAGAAA----TA-T-G-CAGCAGGCA-T---------------T--TG-AT-T-------GAA-C--G----A-C-A-----A-TC-C-G--G--G--AGC-----A----T--G-AGG--CC-AATTG------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----A--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-A-C-T-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--G-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---C-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-ATTAAACT--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAA--CA--A---AA------------T-TC-G-T--------G-AT-G-C-AAT----AACAAT
gi|30295 : TGTCA--CT-A------C-T-GAGCAAGAGAAA----AA-T-G-TAG---ATA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-CG-G----A-C-A-----A-GC-C-G--TACG--TACA----A----T--G-GGC--CT-A--TATTATTTT--A--CA-----CC----T-G-TCACAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GGAA-----T-A----C----G-AA--T-GGAC-T-T-CC-AT--T-----A--G-T----T--A--A---CGC-GCC-T-T-C--G-TA---A-AA-----GGA-A-T----CGTAGT----A---------------T-T---T-C-T----G--T--T-TC-A----T-----CA-CC--T----T-A---T-A----------G-----TTA---GG-G-T-A----TGT----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TAACAA-----T-A-T---AT--A-C----------T-------T----------ACTA-TAGG-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCAG-TAG------A-AC-GTT-AAT-AA-
gi|30296 : --CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-TAA-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---A-T-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----CGA-A-T----AGT--T----C--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-TC--T----T-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----CTTAAT--C-G--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATAcaa
gi|30297 : --CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-TAG----CA-T---------------T--TGGAT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-AG-C-GGAT--A--TAC-----A----T--G-AGA--C--A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-AGTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-T-T-C-CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-C----A-AA-----TGA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---CTCA-CC-------T-A---T-A----------GTTTTTTTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----TAAA-AA-T-------C----A-----C-A-T---TT--A-C----------TG------T----------ACTG-G--G-G-----------T--A-ATAA-T-A--T--CAT--CA--AAATAA---C-T-C-CGCC-CC-G-T--------G-ACGG-T-AA--AT-AACAATA
gi|30298 : -GAGAAAT---GA-T-A-GAG---ACA-T---------------TATTG-AT-TTGGTCTCGGA-T--C----A-T-ATGTCTA-GC-C-G--T--GAGTAC-----AATCGT--A-GAG--CA-A--TA------TGTA--C------CCATCAT-G-T--CAAA--GA-T-A-GTA-TG-----GG-AA----T-A----TCAA-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-ACTAT-----A--G-T----T--A--A---C-CGG-C-C-T-C--G-T----A-AA-----TGATATT----CGT--T----A--------------TTATACGT-T-TAATAG--C-AT-TTAA----T---C-CATTC--T----T-A---T-ATGATTTCTTTG-----TTT---AC-G-T-A----T-TTAACC----T--C-A--AGGGTTTAGA----GA--TTAA------TGCTTAAAGT---T--G----T-AA-AA-G-------T----AG----C-A-T---CT--ACC----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TAGA-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC-A-TTTGGGGGAG-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30299 : AGAAA----AA-T-G-TAG---GCA-TG--------------T--TG-A--T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TAT-----T--A--C------CC----T-G-T--C-AG--AA-T-A-G-G-TA-----TG-A-----TAA----C--A-A-AA--T-GGCC-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TA-A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-TTAA-A-AA-----GGA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TC--C-CA-CC--T----T-A---T-A----------G------TT---GACA-T-A----T-----------T--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--T-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-TAC-CG-C-TTAA-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAc
gi|30300 : A-T-G-TAG---ACA-T---------------T--TG-AT-T-------GTA-C--G----A-C-A-----A-GC---G-----G--TAC-----A----T--GGAGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-G--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-G-----T-A----C--A-ACAA--T--G-C-T-T-CC-A---T-----A--GAT----T--A--A---C-C-G-C-TGT-C--G-T----A-AA-----AGA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T------------G-----TTA---GA-G-TCA----T-T----C----TCCC-A--A--------A----AA--TA-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------A----A-----C-A-T---TT--A-A----------C-------T----------ACTG-T--G-A-----------T--A-AT---TAA--TTATAC--CA--A---A------C-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30301 : -T-G-TAG---GCA-T---------------T--TG-AT-T-------GGA-G--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--A--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--ATAC------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TGCATG-GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-C----A-AA-----TGA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------C-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--CAA--A--------A----AA--TT-A------T--------TCAGT--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TC--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--CAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC-G-T--------G-AT-G-T-A---AA-AACAATA
gi|30302 : -AT-T-------GGA-CCCG----A-C-A-----A-AC-C-G--G--G--TAC-----AA---T--G-AGA--CC-A--TA-------------------CC----T-G-TA-CTAG--AA-T-AAG-A-TG-----AG-A-----T-AAACAC--ATA-AA--T-GG-A-T-T-CC-A---A-----A--A-TAAAGT--A--A---A-C-G-C-T-T-C--G-T----A-AT-----TGA-A-A----TGT--T----ACGTTTTATATTATTTT-T---T-T-T----A--TGAT-TT-A----T---C-CA-CC--T----T-A---T-A----------A-----CTTATTGA-A-T-A----T-T----T----T--C-G--A--------AGGAAAA--TT-----------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TAA-----T----------TCTT-T--A-AAATATAAATTTT--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT-T-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30303 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----GGA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-CCA-T----T-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAca
gi|30304 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G-T----T-AA-----GGA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-CCA-T----T-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30305 : -T----T--A--A---C-C-G-C-A-T-C--G-T----A-AA-----TGA-A-T----C----T-------------------TT-T---T-T-T----G--T-AT-GT-A----T---C-CA-CT--T----T-A---T-T----------G-----TTT---GA-A-TAA----T-T----T----C--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AT-A-------T----A-----C-T-T---TT--A-C----------T-------T----------GC
gi|30306 : ---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----C--C-A--A--------G----AA--TT-ACATGTAT--------T---T--A----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---T---A-C----------T-------T----------ACGT-T--A-A-----------T--G-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 2222
lowQualScore : 1 11 1 222222 1 1 11 1 2222 2 0 1 222 666666666666666 11 0 0 1 5555555 2 22 4444 1 0 22222 0 0 0 88888 111 44444 2222 22 0 11 1 33 333333 22 44 444444 4444 1 1 22 22 2 1 1 1 1 44444 1 33333 1 3333 55 1 1 22 1 2 1 1 1 1 222 44444 22 0 4444 22 11 333 0 1 1 1 1 1 11 222 5555 1 444444 1 1 5555 11 3333 777777777777777 1 333 1 1 3333 11 1 1 1 2222 444 1 1 2222 44 1 111 0 4444444444 77777 222 2 1 3 2222 1 444444444 22 1 11 44444444 2222 22 1 666666666666666 111 11 3333 1 1 2 4444444 3333 44444 2 2 222 33 1 5555555555 8888888 5555555555 1 3333 44444444444 55 1 333 1 11 11 11 11 111 333 1 2 1 4 1 3333 77777777 1 2 1 1 7777
lowQualScore : . .. . ...... . . .. . .... . . . ... ............... .. . . . ....... . .. .... . . ..... . . . ..... ... ..... .... .. . .. . .. ...... .. .. ...... .... . . .. .. . . . . . ..... . ..... . .... .. . . .. . . . . . . ... ..... .. . .... .. .. ... . . . . . . .. ... .... . ...... . . .... .. .... ............... . ... . . .... .. . . . .... ... . . .... .. . ... . .......... ..... ... . . . .... . ......... .. . .. ........ .... .. . ............... ... .. .... . . . ....... .... ..... . . ... .. . .......... ....... .......... . .... ........... .. . ... . .. .. .. .. ... ... . . . . . .... ........ . . . . ....
lowQualScore : 0 33 0 777777 0 0 33 9 8888 6 9 7 444 333333333333333 22 9 9 7 1111111 7 11 0000 8 9 22222 9 9 9 77777 777 00000 8888 22 9 33 9 11 777777 66 22 666666 9999 9 9 33 33 9 0 9 0 9 44444 0 33333 0 3333 55 0 0 66 0 9 0 0 0 0 666 44444 33 9 8888 22 33 555 9 9 9 0 9 0 33 666 6666 0 111111 0 9 6666 33 9999 000000000000000 9 666 0 0 0000 33 0 0 9 0000 555 0 9 0000 55 0 666 9 1111111111 11111 666 8 9 7 9999 9 333333333 22 9 33 33333333 9999 33 0 777777777777777 777 33 0000 0 0 0 9999999 4444 44444 0 0 777 33 0 2222222222 3333333 2222222222 0 8888 88888888888 44 0 111 0 44 44 44 44 888 999 1 1 1 3 1 7777 88888888 1 2 1 1 6666
consensus : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
Reference ( family-403 ) : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
gi|30256 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----A--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC-A-T--------G-AC-T-T-AAT-AA-
gi|30257 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-A-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--CAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AATAAA-AACAATAc
gi|30258 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-T-A-----A-GC-C-G--TT-G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-A-----T-A----C--A-A-A---T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-CCG-C-T---C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TATTC-CT-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A----T-A------T--------T---T--T----T-AA-TA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAAT
gi|30259 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-AAGA--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----T-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--C-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-
gi|30260 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AT-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----G----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--CATGTACCT----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--T-A--A--------T----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------T-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30261 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----A--T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--AT-C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T--C-A---T-----A--G-T----T--A--------C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TTAA----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------------TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--CTG--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T--A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T---CG---TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-TACAATA
gi|30262 : TATGT-A--CT-A------T-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--T----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------C--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-A-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--G---C-C-G-C-T-T-C--A---T----T-AAG-----AA-A-T----CGT--T----ACT------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----TT--TT-T------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ATTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30263 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-C-------GGA-T--GG---A-C-A-----A-GC-C-G-----G--TAC-----A----T--A------CC-A--TA------T--A--C------CC----TTG-T--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----AA-------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-C--C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TA---CA--A---AA---C---C-CG-C-TC-T-T--------GCAC---T-AAT----AACAATA
gi|30264 : TATGT-A--CT-AGGCCTAC-T-G--CA-GAGAAA----TA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-C-----A-AC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-AG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-TG---G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A-----A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-------------T--A-AT---T-A--T--TAC------A---AA---C---C-CG-C-TC-A-T--------G-A--G-T--AT----AACAATA
gi|30265 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----T--G-G----T--A--A---T-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--A----A--------------CT-T---TGT-T----G--C-AT-TT------T---C-CA-C----C--TTAA---T-A----------G-----TTTC--GA-G-T-A----T-T----T----TG-C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AACAA-C-------T----A-----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T----A-----------T--A-ATCGAT-A--T--T----CA--A---CA---C-T-C-CG-C-CC-GAT--------G-AC-G-T-AAT-AC-AA
gi|30266 : TATGT-A--CC-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-A-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----TATG-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----A-AAT-----GA-A-C----CAT--T----A--------------TT-TG--T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CG-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----A--------------------------T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TTAGTTACT----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG-G-T--------G-GC-G-T-AAT-At
gi|30267 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GTAT---------------T--T-C-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--A--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-CG-----GG-A-----T-A----T--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CAT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-ATTCT-A----------A-----TCT---GA-G-T-G----T-T----T----T--C-A--A--------A----AC--TT-G------T--------T---T--G----T-AA-AA-TAACAAGCT----A-----C-G-T---TC--A-C----------TTACTTA-T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-T
gi|30268 : TATGT-A--TT-A------C-T-G--CA-GAGA-------------TAG----CAC---------------T--T-A-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-AA-TA------T--A--C------CC----C-GGT--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T-TTCC-A---T-----A--G-TA---T--A--------T-G-A-T-T-C--G---T----TTAAT-----GA-A-CATC-CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-GA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T-----------CTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-CGCG-C-TC-A----------G-AC-G-T-Agtcatg
gi|30269 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA---------------------------------------AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-GCC-T-T-C--G---C----A-A-----------------CGT--T----A--------------CT-T---T-TGT----G--C-AT-TT-A----TC--C-CC-C----C--TT-A---T-A----------------TTG---GA-GAT-A----TGT----T----T--T-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----------C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--AGAT---T-A-----CAT--CA--A---AA-------C-CG-C--C-G-T--------G-AC-G-TCAGT----AACAATA
gi|30270 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----G-GC-C-G-----G---AC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------A--A--CG-----CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GTGTT----A-ACT-----GA-G-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----A--C-AT-TT-A----T---C-CA------C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C----A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-
gi|30271 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAGT-GGTAG---GACT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A---------CC----T-G-T--CAA---AA-T-G-A-A-TG-----GG-AATATCC-A----T--A-T-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---C-----G--T-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----GTT--T----AAC------------TT-TA--T-T-T----G--C-ATATT-A----TA--C-CATC----T--TT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-TAA----T-T----C----T--C-A--A--------A----AAATTT-AT-----T--------T---T--G----T-AA-TA-T-------T----A-----A-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AA---T-A--G--TAC--CA--A---GA---C-T-C-CG-C-T--A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-CACAATA
gi|30272 : TATG--A--TT-A------C-T-G--CA-GAGATA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGG-C--G----A-A-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--A-AGA--CCTA--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-ACA-A-TGTAGATGG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----AT-A-TA---T--A--A---C-C-G-T-T-T-C--G---T----A-AAT-----G-----------------------------------------T-T-T----G--C-GT-TT-A----T---C-CA-CCTAGC--TT-A---T-A----------A-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----ACT-TT-A------T--------T---T--G----T-AA-------------------------------------------------------------------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT-G-T--------G-AC-G-T-A
gi|30273 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CACGAGATA----A------TAG---ACAT---------------T----G-ATGT-------GTAGC--G----A---A-----A-GC-C-GAAT--G--TAC-----A----T--G-AGGGGCC-AG-TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CTAA-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-CGT-G-C--G---TCTTAG-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A---------------------G-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---TGA----------G-----TGT---GAGG-T-A----T-T----C----T--C-C--A--------A----AA--GA-A------T--------A---T--GATGTT-AA-AA-G-------T----A-----CAA-T---TT--A-C----------T-------T----------AC--------A-----------T--A-AT---C-C--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC-A-T--------G--------AGT-AA-AACAATAtgcccctaataacaat
gi|30274 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30275 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30276 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT---------GGA-C--A----A-C-A-------GC-C-G--G--G--ATC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------A--C--C------CC----T-G-T--C-----------------------GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T---CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT--T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T------------------------------------------------------------------------------A-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----GT--TT-A------T--------T---T--G----T-----A-TTTA----T----A-----C-A-T---TA--A-C----------T-------TACAATAAATAACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30277 : TATGT-A--CT-A------CAT-G--CA-GAGAAACTACAA-TAG-TAGA--GCAT---------------T--TTG-ATGTAA-----GGA-C--GTA--A-C-A-----A-GCACAG--T--G---ACCGATTG----T--G-AGG--CC-A---A------T--A--C------CC----T-GCT--CAAATTAA-T-A-G-A-TG-----AG-G-----T-AAC--C--A-A-AA--T-GGAC-TCT-CC-A---T-----A--G-TA---T--A--AAAGC-C-G-C-T-TACAGG---T----A-AATTTCGTGA-A-G----CGC--T----ACTTT----------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GAGG-T-AAAGTT-T----T----T--C-A--AT-------A----AT--TT-A------G--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TGA--G-----CGG-T---TTTAA-C----------T-------TA---------ACTT-T----------------T--A-AT---T-A--
gi|30278 : TGTGT-ATTCT-A------C-T-G--CA-GCGAAA----A--T-C-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-------------------------A-----A-GC-C-G--G--G--AAT-----A----T--G-AGG--TC-A--TA------A--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-ATTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CT-A---TTCTAAA--T-T----T--A--A---C-C-
gi|30279 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-G-GAAG----AA-A-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--
gi|30280 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-
gi|30281 : TAGGT-A--CT-A------C-T-G--TA-GAGAAA----AA-C-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--GCCGAG-C-A-----A-GC-T-G--G--G--TAC-----A----C--G-ATG--CC-A--T
gi|30282 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GACAAA----AA-T-G-CAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30283 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CA------C--TT-A---T------------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-T--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-TATATT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30284 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--C--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A-----------------T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-TA-C----C--TA-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30285 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AATT-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-CTT-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-TCAAACG---T----A--------------TG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----C---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AAGT-------T----A-------A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T----A-----------T--A-AT---T-A--T--TACCACA--A---AA---C---C-CGCC-TC-A-TG-------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30286 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--GAC-----A----T--G-AGG--CC-----A------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---TTATA-A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GT-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AG-T-------T----C-----C-----------A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------------------------TAC--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC-A-T--------G-AC-A-T-AAT----AACAATA
gi|30287 : ATTT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CTG---GTAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--A----A-C-A-----A-GC-T-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------TC----T-T-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CTAT---T-T-T----G--C-AT-TT-A-----------A-----------------------------------------GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----T-----C-A-T---TT--A-A----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AT---T-A--T--AAT--CA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30288 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CG-AAGAAA----AA-T-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---T-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-A--A--------AT---AG--TT--------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--T-GA---T-A--T--TAT--C
gi|30289 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--T-T----C--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-C----A--C-AT-CT-A----T---T-CA-T----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A
gi|30290 : ATGT-A--CT-A------C-TTG--CA-GAGAAA----AA-T-G-AGG---ACATGGTTATGTTACCTCAT--T-G-AT-T-------GGA-C--G----AAC-A-----A-AG-C-G--T--G--TAC-----A----TA-G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----TAG-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CA-A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--AATA---C-C-G-C-TAT-C--G---TA---A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-C---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-T-AT---T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----AC----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-AGTT--TAC--CAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT-A
gi|30291 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--C--GAGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----AAGC-C-G--T--G--TACC----A----T--G-AGG--CCCA--TA------T--A--C------CCC---T-G-T--CAAGT-AA-T-A-G-A-TG-----GT-------T-A----C--A-A-AA--T----C-T-T-CCCA---T-----AAGG-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----G--A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-TAA----T-T----T----T--C-A--A--------T----AA--TT-A------G--------T---T--GT---T-AA-AACT-------T----A-----C-G-T---TT--A-CT---------T-------T----------ACTT-TA-A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-TG-------G-ACGG-T-AAT-----ACAATAtaca
gi|30292 : ATGT-A--CTTA------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-GATAG---ACAT---------------T--T-G-AC-TTG-----GGA-C--G----AGCGA-----A-GC-C-G--T--G--GTC-----A----T--G-AG---CC-A--TA------TCAA--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TT-----GA---------A----C--A-A-AA--TGGG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TAAA--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-ATT----CGT--TTGACG--------------TT-T---T-T-T----GGTA-AT-TT-ATTCTT---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GTTGT-TTT---GA-GTT-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---TTGG----T-AA-AA-T-------C----ACTTGCC-A-TG--TT--A-CTTTTATGTGTT-------T----------ACTTGT--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--T---A---AA---C-T-C-GG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AA--AT-AACAATA
gi|30293 : ATGT-A--TA-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30294 : TGT-A--TT-A------C-T-G--CA-CAGAAA----TA-T-G-CAGCAGGCAT---------------T--T-G-AT-T-------GAA-C--G----A-C-A-----A-TC-C-G--G--G--AGC-----A----T--G-AGG--CC-AATTG------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----A--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--G-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---C-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-ATTAAACT--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAA--CA--A---AA------------T-TC-G-T--------G-AT-G-C-AAT----AACAAT
gi|30295 : TGTCA--CT-A------C-T-GAGCAAGAGAAA----AA-T-G-TAG---ATAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-CG-G----A-C-A-----A-GC-C-G--TACG--TACA----A----T--G-GGC--CT-A--TATTATTTT--A--CA-----CC----T-G-TCACAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GGAA-----T-A----C----G-AA--T-GGAC-T-T-CC-AT--T-----A--G-T----T--A--A---CGC-GCC-T-T-C--G---TA---A-AAG-----GA-A-T----CGTAGT----A---------------T-T---T-C-T----G--T--T-TC-A----T-----CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTA---GG-G-T-A----TGT----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TAACAA-----T-A-T---AT--A-C----------T-------T----------ACTA-TAGG-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCAG-TAG------A-AC-GTT-AAT-AA-
gi|30296 : --CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-TAA-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---A-T-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----AGT--T----C--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----CTTAAT--C-G--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATAcaa
gi|30297 : --CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-GGAT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-AG-C-GGAT--A--TAC-----A----T--G-AGA--C--A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-AGTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-T-T-C-CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---CTCA-C----C---T-A---T-A----------GTTTTTTTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----TAAA-AA-T-------C----A-----C-A-T---TT--A-C----------TG------T----------ACTG-G--G-G-----------T--A-ATAA-T-A--T--CAT--CA--AAATAA---C-T-C-CGCC-CC-G-T--------G-ACGG-T-AA--AT-AACAATA
gi|30298 : -GAGAAAT---GA-T-A-GAG---ACAT---------------TATT-G-AT-TTGGTCTCGGA-T--C----A-T-ATGTCTA-GC-C-G--T--GAGTAC-----AATCGT--A-GAG--CA-A--TA------TGTA--C------CCATCAT-G-T--CAAA--GA-T-A-GTA-TG-----GG-AA----T-A----TCAA-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-ACTAT-----A--G-T----T--A--A---C-CGG-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GATATT----CGT--T----A--------------TTATACGT-T-TAATAG--C-AT-TTAA----T---C-CATT----C--TT-A---T-ATGATTTCTTTG-----TTT---AC-G-T-A----T-TTAACC----T--C-A--AGGGTTTAGA----GA--TTAA------TGCTTAAAGT---T--G----T-AA-AA-G-------T----AG----C-A-T---CT--ACC----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TAGA-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC-A-TTTGGGGGAG-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30299 : AGAAA----AA-T-G-TAG---GCATG--------------T--T-G-A--T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TAT-----T--A--C------CC----T-G-T--C-AG--AA-T-A-G-G-TA-----TG-A-----TAA----C--A-A-AA--T-GGCC-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TA-A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---TTAA-A-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TC--C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G------TT---GACA-T-A----T-----------T--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--T-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-TAC-CG-C-TTAA-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAc
gi|30300 : A-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GTA-C--G----A-C-A-----A-GC---G-----G--TAC-----A----T--GGAGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-G--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-G-----T-A----C--A-ACAA--T--G-C-T-T-CC-A---T-----A--GAT----T--A--A---C-C-G-C-TGT-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T------------G-----TTA---GA-G-TCA----T-T----C----TCCC-A--A--------A----AA--TA-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------A----A-----C-A-T---TT--A-A----------C-------T----------ACTG-T--G-A-----------T--A-AT---TAA--TTATAC--CA--A---A------C-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30301 : -T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-G--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--A--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--ATAC------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TGCATG-GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------C-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--CAA--A--------A----AA--TT-A------T--------TCAGT--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TC--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--CAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC-G-T--------G-AT-G-T-A---AA-AACAATA
gi|30302 : -AT-T-------GGA-CCCG----A-C-A-----A-AC-C-G--G--G--TAC-----AA---T--G-AGA--CC-A--TA-------------------CC----T-G-TA-CTAG--AA-T-AAG-A-TG-----AG-A-----T-AAACAC--ATA-AA--T-GG-A-T-T-CC-A---A-----A--A-TAAAGT--A--A---A-C-G-C-T-T-C--G---T----A-ATT-----GA-A-A----TGT--T----ACGTTTTATATTATTTT-T---T-T-T----A--TGAT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------A-----CTTATTGA-A-T-A----T-T----T----T--C-G--A--------AGGAAAA--TT-----------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TAA-----T----------TCTT-T--A-AAATATAAATTTT--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT-T-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30303 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAca
gi|30304 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30305 : -T----T--A--A---C-C-G-C-A-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----C----T-------------------TT-T---T-T-T----G--T-AT-GT-A----T---C-CA-C----T--TT-A---T-T----------G-----TTT---GA-A-TAA----T-T----T----C--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AT-A-------T----A-----C-T-T---TT--A-C----------T-------T----------GC
gi|30306 : ---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----C--C-A--A--------G----AA--TT-ACATGTAT--------T---T--A----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---T---A-C----------T-------T----------ACGT-T--A-A-----------T--G-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 2222
lowQualScore : 1 11 1 222222 1 1 11 1 2222 2 0 1 222 666666666666666 11 0 0 1 5555555 2 22 4444 1 0 22222 0 0 0 88888 111 44444 2222 22 0 11 1 33 333333 22 44 444444 4444 1 1 22 22 2 1 1 1 1 44444 1 33333 1 3333 55 1 1 22 1 2 1 1 1 1 222 44444 22 0 4444 22 11 333 0 1 1 1 1 1 11 222 5555 1 444444 1 1 5555 11 3333 777777777777777 1 333 1 1 3333 11 1 1 1 2222 444 1 1 2222 44 1 111 0 4444444444 77777 222 2 1 3 2222 1 444444444 22 1 11 44444444 2222 22 1 666666666666666 111 11 3333 1 1 2 4444444 3333 44444 2 2 222 33 1 5555555555 8888888 5555555555 1 3333 44444444444 55 1 333 1 11 11 11 11 111 333 1 2 1 4 1 3333 77777777 1 2 1 1 7777
lowQualScore : . .. . ...... . . .. . .... . . . ... ............... .. . . . ....... . .. .... . . ..... . . . ..... ... ..... .... .. . .. . .. ...... .. .. ...... .... . . .. .. . . . . . ..... . ..... . .... .. . . .. . . . . . . ... ..... .. . .... .. .. ... . . . . . . .. ... .... . ...... . . .... .. .... ............... . ... . . .... .. . . . .... ... . . .... .. . ... . .......... ..... ... . . . .... . ......... .. . .. ........ .... .. . ............... ... .. .... . . . ....... .... ..... . . ... .. . .......... ....... .......... . .... ........... .. . ... . .. .. .. .. ... ... . . . . . .... ........ . . . . ....
lowQualScore : 0 33 0 777777 0 0 33 9 8888 6 9 7 444 333333333333333 22 9 9 7 1111111 7 11 0000 8 9 22222 9 9 9 77777 777 00000 8888 22 9 33 9 11 777777 66 22 666666 9999 9 9 33 33 9 0 9 0 9 44444 0 33333 0 3333 55 0 0 66 0 9 0 0 0 0 666 44444 33 9 8888 22 33 555 9 9 9 0 9 0 33 666 6666 0 111111 0 9 6666 33 9999 000000000000000 9 666 0 0 0000 33 0 0 9 0000 555 0 9 0000 55 0 666 9 1111111111 11111 666 8 9 7 9999 9 333333333 22 9 33 33333333 9999 33 0 777777777777777 777 33 0000 0 0 0 9999999 4444 44444 0 0 777 33 0 2222222222 3333333 2222222222 0 8888 88888888888 44 0 111 0 44 44 44 44 888 999 1 1 1 3 1 7777 88888888 1 2 1 1 6666
consensus : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
Reference ( family-403 ) : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
gi|30256 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----A--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC-A-T--------G-AC-T-T-AAT-AA-
gi|30257 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-A-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--CAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AATAAA-AACAATAc
gi|30258 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-T-A-----A-GC-C-G--TT-G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-A-----T-A----C--A-A-A---T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-CCG-C-T---C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TATTC-CT-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A----T-A------T--------T---T--T----T-AA-TA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAAT
gi|30259 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-AAGA--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----T-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--C-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-
gi|30260 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AT-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----G----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--CATGTACCT----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--T-A--A--------T----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------T-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30261 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----A--T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--AT-C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T--C-A---T-----A--G-T----T--A--------C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TTAA----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------------TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--CTG--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T--A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T---CG---TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-TACAATA
gi|30262 : TATGT-A--CT-A------T-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--T----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------C--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-A-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--G---C-C-G-C-T-T-C--A---T----T-AAG-----AA-A-T----CGT--T----ACT------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----TT--TT-T------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ATTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30263 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-C-------GGA-T--GG---A-C-A-----A-GC-C-G-----G--TAC-----A----T--A------CC-A--TA------T--A--C------CC----TTG-T--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----AA-------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-C--C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TA---CA--A---AA---C---C-CG-C-TC-T-T--------GCAC---T-AAT----AACAATA
gi|30264 : TATGT-A--CT-AGGCCTAC-T-G--CA-GAGAAA----TA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-C-----A-AC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-AG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-TG---G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A-----A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-------------T--A-AT---T-A--T--TAC------A---AA---C---C-CG-C-TC-A-T--------G-A--G-T--AT----AACAATA
gi|30265 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----T--G-G----T--A--A---T-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--A----A--------------CT-T---TGT-T----G--C-AT-TT------T---C-CA-C----C--TTAA---T-A----------G-----TTTC--GA-G-T-A----T-T----T----TG-C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AACAA-C-------T----A-----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T----A-----------T--A-ATCGAT-A--T--T----CA--A---CA---C-T-C-CG-C-CC-GAT--------G-AC-G-T-AAT-AC-AA
gi|30266 : TATGT-A--CC-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-A-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----TATG-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----A-AAT-----GA-A-C----CAT--T----A--------------TT-TG--T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CG-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----A--------------------------T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TTAGTTACT----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG-G-T--------G-GC-G-T-AAT-At
gi|30267 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GTAT---------------T--T-C-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--A--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-CG-----GG-A-----T-A----T--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CAT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-ATTCT-A----------A-----TCT---GA-G-T-G----T-T----T----T--C-A--A--------A----AC--TT-G------T--------T---T--G----T-AA-AA-TAACAAGCT----A-----C-G-T---TC--A-C----------TTACTTA-T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-T
gi|30268 : TATGT-A--TT-A------C-T-G--CA-GAGA-------------TAG----CAC---------------T--T-A-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-AA-TA------T--A--C------CC----C-GGT--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T-TTCC-A---T-----A--G-TA---T--A--------T-G-A-T-T-C--G---T----TTAAT-----GA-A-CATC-CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-GA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T-----------CTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-CGCG-C-TC-A----------G-AC-G-T-Agtcatg
gi|30269 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA---------------------------------------AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-GCC-T-T-C--G---C----A-A-----------------CGT--T----A--------------CT-T---T-TGT----G--C-AT-TT-A----TC--C-CC-C----C--TT-A---T-A----------------TTG---GA-GAT-A----TGT----T----T--T-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----------C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--AGAT---T-A-----CAT--CA--A---AA-------C-CG-C--C-G-T--------G-AC-G-TCAGT----AACAATA
gi|30270 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----G-GC-C-G-----G---AC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------A--A--CG-----CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GTGTT----A-ACT-----GA-G-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----A--C-AT-TT-A----T---C-CA------C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C----A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-
gi|30271 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAGT-GGTAG---GACT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A---------CC----T-G-T--CAA---AA-T-G-A-A-TG-----GG-AATATCC-A----T--A-T-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---C-----G--T-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----GTT--T----AAC------------TT-TA--T-T-T----G--C-ATATT-A----TA--C-CATC----T--TT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-TAA----T-T----C----T--C-A--A--------A----AAATTT-AT-----T--------T---T--G----T-AA-TA-T-------T----A-----A-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AA---T-A--G--TAC--CA--A---GA---C-T-C-CG-C-T--A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-CACAATA
gi|30272 : TATG--A--TT-A------C-T-G--CA-GAGATA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGG-C--G----A-A-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--A-AGA--CCTA--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-ACA-A-TGTAGATGG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----AT-A-TA---T--A--A---C-C-G-T-T-T-C--G---T----A-AAT-----G-----------------------------------------T-T-T----G--C-GT-TT-A----T---C-CA-CCTAGC--TT-A---T-A----------A-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----ACT-TT-A------T--------T---T--G----T-AA-------------------------------------------------------------------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT-G-T--------G-AC-G-T-A
gi|30273 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CACGAGATA----A------TAG---ACAT---------------T----G-ATGT-------GTAGC--G----A---A-----A-GC-C-GAAT--G--TAC-----A----T--G-AGGGGCC-AG-TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CTAA-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-CGT-G-C--G---TCTTAG-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A---------------------G-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---TGA----------G-----TGT---GAGG-T-A----T-T----C----T--C-C--A--------A----AA--GA-A------T--------A---T--GATGTT-AA-AA-G-------T----A-----CAA-T---TT--A-C----------T-------T----------AC--------A-----------T--A-AT---C-C--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC-A-T--------G--------AGT-AA-AACAATAtgcccctaataacaat
gi|30274 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30275 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30276 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT---------GGA-C--A----A-C-A-------GC-C-G--G--G--ATC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------A--C--C------CC----T-G-T--C-----------------------GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T---CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT--T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T------------------------------------------------------------------------------A-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----GT--TT-A------T--------T---T--G----T-----A-TTTA----T----A-----C-A-T---TA--A-C----------T-------TACAATAAATAACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30277 : TATGT-A--CT-A------CAT-G--CA-GAGAAACTACAA-TAG-TAGA--GCAT---------------T--TTG-ATGTAA-----GGA-C--GTA--A-C-A-----A-GCACAG--T--G---ACCGATTG----T--G-AGG--CC-A---A------T--A--C------CC----T-GCT--CAAATTAA-T-A-G-A-TG-----AG-G-----T-AAC--C--A-A-AA--T-GGAC-TCT-CC-A---T-----A--G-TA---T--A--AAAGC-C-G-C-T-TACAGG---T----A-AATTTCGTGA-A-G----CGC--T----ACTTT----------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GAGG-T-AAAGTT-T----T----T--C-A--AT-------A----AT--TT-A------G--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TGA--G-----CGG-T---TTTAA-C----------T-------TA---------ACTT-T----------------T--A-AT---T-A--
gi|30278 : TGTGT-ATTCT-A------C-T-G--CA-GCGAAA----A--T-C-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-------------------------A-----A-GC-C-G--G--G--AAT-----A----T--G-AGG--TC-A--TA------A--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-ATTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CT-A---TTCTAAA--T-T----T--A--A---C-C-
gi|30279 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-G-GAAG----AA-A-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--
gi|30280 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-
gi|30281 : TAGGT-A--CT-A------C-T-G--TA-GAGAAA----AA-C-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--GCCGAG-C-A-----A-GC-T-G--G--G--TAC-----A----C--G-ATG--CC-A--T
gi|30282 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GACAAA----AA-T-G-CAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30283 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CA------C--TT-A---T------------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-T--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-TATATT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30284 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--C--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A-----------------T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-TA-C----C--TA-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30285 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AATT-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-CTT-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-TCAAACG---T----A--------------TG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----C---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AAGT-------T----A-------A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T----A-----------T--A-AT---T-A--T--TACCACA--A---AA---C---C-CGCC-TC-A-TG-------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30286 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--GAC-----A----T--G-AGG--CC-----A------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---TTATA-A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GT-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AG-T-------T----C-----C-----------A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------------------------TAC--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC-A-T--------G-AC-A-T-AAT----AACAATA
gi|30287 : ATTT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CTG---GTAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--A----A-C-A-----A-GC-T-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------TC----T-T-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CTAT---T-T-T----G--C-AT-TT-A-----------A-----------------------------------------GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----T-----C-A-T---TT--A-A----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AT---T-A--T--AAT--CA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30288 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CG-AAGAAA----AA-T-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---T-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-A--A--------AT---AG--TT--------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--T-GA---T-A--T--TAT--C
gi|30289 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--T-T----C--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-C----A--C-AT-CT-A----T---T-CA-T----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A
gi|30290 : ATGT-A--CT-A------C-TTG--CA-GAGAAA----AA-T-G-AGG---ACATGGTTATGTTACCTCAT--T-G-AT-T-------GGA-C--G----AAC-A-----A-AG-C-G--T--G--TAC-----A----TA-G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----TAG-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CA-A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--AATA---C-C-G-C-TAT-C--G---TA---A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-C---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-T-AT---T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----AC----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-AGTT--TAC--CAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT-A
gi|30291 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--C--GAGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----AAGC-C-G--T--G--TACC----A----T--G-AGG--CCCA--TA------T--A--C------CCC---T-G-T--CAAGT-AA-T-A-G-A-TG-----GT-------T-A----C--A-A-AA--T----C-T-T-CCCA---T-----AAGG-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----G--A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-TAA----T-T----T----T--C-A--A--------T----AA--TT-A------G--------T---T--GT---T-AA-AACT-------T----A-----C-G-T---TT--A-CT---------T-------T----------ACTT-TA-A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-TG-------G-ACGG-T-AAT-----ACAATAtaca
gi|30292 : ATGT-A--CTTA------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-GATAG---ACAT---------------T--T-G-AC-TTG-----GGA-C--G----AGCGA-----A-GC-C-G--T--G--GTC-----A----T--G-AG---CC-A--TA------TCAA--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TT-----GA---------A----C--A-A-AA--TGGG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TAAA--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-ATT----CGT--TTGACG--------------TT-T---T-T-T----GGTA-AT-TT-ATTCTT---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GTTGT-TTT---GA-GTT-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---TTGG----T-AA-AA-T-------C----ACTTGCC-A-TG--TT--A-CTTTTATGTGTT-------T----------ACTTGT--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--T---A---AA---C-T-C-GG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AA--AT-AACAATA
gi|30293 : ATGT-A--TA-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30294 : TGT-A--TT-A------C-T-G--CA-CAGAAA----TA-T-G-CAGCAGGCAT---------------T--T-G-AT-T-------GAA-C--G----A-C-A-----A-TC-C-G--G--G--AGC-----A----T--G-AGG--CC-AATTG------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----A--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--G-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---C-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-ATTAAACT--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAA--CA--A---AA------------T-TC-G-T--------G-AT-G-C-AAT----AACAAT
gi|30295 : TGTCA--CT-A------C-T-GAGCAAGAGAAA----AA-T-G-TAG---ATAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-CG-G----A-C-A-----A-GC-C-G--TACG--TACA----A----T--G-GGC--CT-A--TATTATTTT--A--CA-----CC----T-G-TCACAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GGAA-----T-A----C----G-AA--T-GGAC-T-T-CC-AT--T-----A--G-T----T--A--A---CGC-GCC-T-T-C--G---TA---A-AAG-----GA-A-T----CGTAGT----A---------------T-T---T-C-T----G--T--T-TC-A----T-----CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTA---GG-G-T-A----TGT----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TAACAA-----T-A-T---AT--A-C----------T-------T----------ACTA-TAGG-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCAG-TAG------A-AC-GTT-AAT-AA-
gi|30296 : --CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-TAA-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---A-T-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----AGT--T----C--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----CTTAAT--C-G--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATAcaa
gi|30297 : --CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-GGAT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-AG-C-GGAT--A--TAC-----A----T--G-AGA--C--A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-AGTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-T-T-C-CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---CTCA-C----C---T-A---T-A----------GTTTTTTTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----TAAA-AA-T-------C----A-----C-A-T---TT--A-C----------TG------T----------ACTG-G--G-G-----------T--A-ATAA-T-A--T--CAT--CA--AAATAA---C-T-C-CGCC-CC-G-T--------G-ACGG-T-AA--AT-AACAATA
gi|30298 : -GAGAAAT---GA-T-A-GAG---ACAT---------------TATT-G-AT-TTGGTCTCGGA-T--C----A-T-ATGTCTA-GC-C-G--T--GAGTAC-----AATCGT--A-GAG--CA-A--TA------TGTA--C------CCATCAT-G-T--CAAA--GA-T-A-GTA-TG-----GG-AA----T-A----TCAA-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-ACTAT-----A--G-T----T--A--A---C-CGG-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GATATT----CGT--T----A--------------TTATACGT-T-TAATAG--C-AT-TTAA----T---C-CATT----C--TT-A---T-ATGATTTCTTTG-----TTT---AC-G-T-A----T-TTAACC----T--C-A--AGGGTTTAGA----GA--TTAA------TGCTTAAAGT---T--G----T-AA-AA-G-------T----AG----C-A-T---CT--ACC----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TAGA-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC-A-TTTGGGGGAG-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30299 : AGAAA----AA-T-G-TAG---GCATG--------------T--T-G-A--T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TAT-----T--A--C------CC----T-G-T--C-AG--AA-T-A-G-G-TA-----TG-A-----TAA----C--A-A-AA--T-GGCC-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TA-A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---TTAA-A-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TC--C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G------TT---GACA-T-A----T-----------T--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--T-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-TAC-CG-C-TTAA-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAc
gi|30300 : A-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GTA-C--G----A-C-A-----A-GC---G-----G--TAC-----A----T--GGAGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-G--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-G-----T-A----C--A-ACAA--T--G-C-T-T-CC-A---T-----A--GAT----T--A--A---C-C-G-C-TGT-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T------------G-----TTA---GA-G-TCA----T-T----C----TCCC-A--A--------A----AA--TA-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------A----A-----C-A-T---TT--A-A----------C-------T----------ACTG-T--G-A-----------T--A-AT---TAA--TTATAC--CA--A---A------C-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30301 : -T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-G--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--A--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--ATAC------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TGCATG-GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------C-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--CAA--A--------A----AA--TT-A------T--------TCAGT--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TC--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--CAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC-G-T--------G-AT-G-T-A---AA-AACAATA
gi|30302 : -AT-T-------GGA-CCCG----A-C-A-----A-AC-C-G--G--G--TAC-----AA---T--G-AGA--CC-A--TA-------------------CC----T-G-TA-CTAG--AA-T-AAG-A-TG-----AG-A-----T-AAACAC--ATA-AA--T-GG-A-T-T-CC-A---A-----A--A-TAAAGT--A--A---A-C-G-C-T-T-C--G---T----A-ATT-----GA-A-A----TGT--T----ACGTTTTATATTATTTT-T---T-T-T----A--TGAT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------A-----CTTATTGA-A-T-A----T-T----T----T--C-G--A--------AGGAAAA--TT-----------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TAA-----T----------TCTT-T--A-AAATATAAATTTT--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT-T-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30303 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAca
gi|30304 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30305 : -T----T--A--A---C-C-G-C-A-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----C----T-------------------TT-T---T-T-T----G--T-AT-GT-A----T---C-CA-C----T--TT-A---T-T----------G-----TTT---GA-A-TAA----T-T----T----C--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AT-A-------T----A-----C-T-T---TT--A-C----------T-------T----------GC
gi|30306 : ---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----C--C-A--A--------G----AA--TT-ACATGTAT--------T---T--A----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---T---A-C----------T-------T----------ACGT-T--A-A-----------T--G-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
blockSeqs : C TT GGCCTA AG C CTAC G G CAG GGTTATGTTACCTCA AT G TGGTCTC G CC CCGA A TGTCT AAT AGT CGATT ATCG AT GG T AT TTATTT CA TA ATGTAC ATCA T G CA TT T C T TAGAT ATATC AACA TA AA A CTA TCTAA AG AAAG AA AT AAG C C A AG TGT CTTA TTTCGT T CAAA AG TGAC CGTTTTATATTATTT A ACG AATA GT A TTCT ATT T CTAG TT TTC TGATTTCTTT TTTTT ATT G A A AAGT G CTTAA CC T AG GGGTTTAG GGAA AT TGCTTAAAG CAG TG ATGT G AACAAGC AACA CTTGC A T ATA TA TTTTATGTGT TAGTTAC ACAATAAATA G AGG AATATAAATTT AG G CGA A GT TA CA AT AAT ACT A C G C T CGA TTGGGGGA C G T C AAA
blockSeqs : . . . . A T A A A G . G AA C G TA G . TAC T C A A . C A T GT T G C A C A T A A G CATG A AC CA . A T TATA T A A . G G C G . T TAA G T ATC . A CTTTT A G G . A . C T . TT . . TTGT C G T A T G TAACC G A . T T T TTAAACT . . T C TTA GA C G T G A T TACTTA A . GA . A . AA . . . . . . T . A . T . CAG AG . G . . AAC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TG C . G . . GAT T A . . . . G . . A A A . . . . A . . . . . C . C . . . A . . G . . . . . A T . G . A CTT . A . . . . A . . A . . T . C . C . . T . . . . . . CATGTAT . . . . . . G . . . A . AA . . GA . A . . . . . . . . T . . . T . TAA G . . . . AAC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . A T . G . . ACT . . . . . . C . . A . . T . . . A . . C . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . G . . AA . A . . . . . . . . . . . . C . AA G . . . . AAC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . AAC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . AAC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . AC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . AT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . AT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** AA**
originalCons : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
finalCons : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AATAA--AACAATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 2222
lowQualScore : 1 11 1 222222 1 1 11 1 2222 2 0 1 222 666666666666666 11 0 0 1 5555555 2 22 4444 1 0 22222 0 0 0 88888 111 44444 2222 22 0 11 1 33 333333 22 44 444444 4444 1 1 22 22 2 1 1 1 1 44444 1 33333 1 3333 55 1 1 22 1 2 1 1 1 1 222 44444 22 0 4444 22 11 333 0 1 1 1 1 1 11 222 5555 1 444444 1 1 5555 11 3333 777777777777777 1 333 1 1 3333 11 1 1 1 2222 444 1 1 2222 44 1 111 0 4444444444 77777 222 2 1 3 2222 1 444444444 22 1 11 44444444 2222 22 1 666666666666666 111 11 3333 1 1 2 4444444 3333 44444 2 2 222 33 1 5555555555 8888888 5555555555 1 3333 44444444444 55 1 333 1 11 11 11 11 111 333 1 2 1 4 1 3333 77777777 1 2 1 1 7777
lowQualScore : . .. . ...... . . .. . .... . . . ... ............... .. . . . ....... . .. .... . . ..... . . . ..... ... ..... .... .. . .. . .. ...... .. .. ...... .... . . .. .. . . . . . ..... . ..... . .... .. . . .. . . . . . . ... ..... .. . .... .. .. ... . . . . . . .. ... .... . ...... . . .... .. .... ............... . ... . . .... .. . . . .... ... . . .... .. . ... . .......... ..... ... . . . .... . ......... .. . .. ........ .... .. . ............... ... .. .... . . . ....... .... ..... . . ... .. . .......... ....... .......... . .... ........... .. . ... . .. .. .. .. ... ... . . . . . .... ........ . . . . ....
lowQualScore : 0 33 0 777777 0 0 33 9 8888 6 9 7 444 333333333333333 22 9 9 7 1111111 7 11 0000 8 9 22222 9 9 9 77777 777 00000 8888 22 9 33 9 11 777777 66 22 666666 9999 9 9 33 33 9 0 9 0 9 44444 0 33333 0 3333 55 0 0 66 0 9 0 0 0 0 666 44444 33 9 8888 22 33 555 9 9 9 0 9 0 33 666 6666 0 111111 0 9 6666 33 9999 000000000000000 9 666 0 0 0000 33 0 0 9 0000 555 0 9 0000 55 0 666 9 1111111111 11111 666 8 9 7 9999 9 333333333 22 9 33 33333333 9999 33 0 777777777777777 777 33 0000 0 0 0 9999999 4444 44444 0 0 777 33 0 2222222222 3333333 2222222222 0 8888 88888888888 44 0 111 0 44 44 44 44 888 999 1 1 1 3 1 7777 88888888 1 2 1 1 6666
consensus : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
Reference ( family-403 ) : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-AACAATA
gi|30256 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----A--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC-A-T--------G-AC-T-T-AAT-AA-
gi|30257 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-A-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--CAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AATAAA-AACAATAc
gi|30258 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-T-A-----A-GC-C-G--TT-G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-A-----T-A----C--A-A-A---T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-CCG-C-T---C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TATTC-CT-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A----T-A------T--------T---T--T----T-AA-TA-G-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAAT
gi|30259 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-AAGA--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-G-------T----T-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--C-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-
gi|30260 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AT-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----G----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--CATGTACCT----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----T-AAG-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--T-A--A--------T----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------T-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30261 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----A--T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--AT-C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T--C-A---T-----A--G-T----T--A--------C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TTAA----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------------TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--CTG--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T--A-AA-T-------T----A-----C-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T---CG---TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-TACAATA
gi|30262 : TATGT-A--CT-A------T-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--T----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------C--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-A-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--G---C-C-G-C-T-T-C--A---T----T-AAG-----AA-A-T----CGT--T----ACT------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----TT--TT-T------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ATTT-T--G-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30263 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-C-------GGA-T--GG---A-C-A-----A-GC-C-G-----G--TAC-----A----T--A------CC-A--TA------T--A--C------CC----TTG-T--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AAAAT-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----AA-------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-C--C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TA---CA--A---AA---C---C-CG-C-TC-T-T--------GCAC---T-AAT----AACAATA
gi|30264 : TATGT-A--CT-AGGCCTAC-T-G--CA-GAGAAA----TA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-C-----A-AC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-AG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-TG---G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A-----A----------GT----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-------------T--A-AT---T-A--T--TAC------A---AA---C---C-CG-C-TC-A-T--------G-A--G-T--AT----AACAATA
gi|30265 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----T--G-G----T--A--A---T-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--A----A--------------CT-T---TGT-T----G--C-AT-TT------T---C-CA-C----C--TTAA---T-A----------G-----TTTC--GA-G-T-A----T-T----T----TG-C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AACAA-C-------T----A-----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T----A-----------T--A-ATCGAT-A--T--T----CA--A---CA---C-T-C-CG-C-CC-GAT--------G-AC-G-T-AAT-AC-AA
gi|30266 : TATGT-A--CC-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-A-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----TATG-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----A-AAT-----GA-A-C----CAT--T----A--------------TT-TG--T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CG-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----A--------------------------T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TTAGTTACT----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG-G-T--------G-GC-G-T-AAT-At
gi|30267 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GTAT---------------T--T-C-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--A--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-CG-----GG-A-----T-A----T--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--A-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CAT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-ATTCT-A----------A-----TCT---GA-G-T-G----T-T----T----T--C-A--A--------A----AC--TT-G------T--------T---T--G----T-AA-AA-TAACAAGCT----A-----C-G-T---TC--A-C----------TTACTTA-T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-T
gi|30268 : TATGT-A--TT-A------C-T-G--CA-GAGA-------------TAG----CAC---------------T--T-A-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-AA-TA------T--A--C------CC----C-GGT--CA-G--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T-TTCC-A---T-----A--G-TA---T--A--------T-G-A-T-T-C--G---T----TTAAT-----GA-A-CATC-CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-GA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T-----------CTT-T--GAA-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--C---A---AA---C-T-CGCG-C-TC-A----------G-AC-G-T-Agtcatg
gi|30269 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA---------------------------------------AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-GCC-T-T-C--G---C----A-A-----------------CGT--T----A--------------CT-T---T-TGT----G--C-AT-TT-A----TC--C-CC-C----C--TT-A---T-A----------------TTG---GA-GAT-A----TGT----T----T--T-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----------C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--AGAT---T-A-----CAT--CA--A---AA-------C-CG-C--C-G-T--------G-AC-G-TCAGT----AACAATA
gi|30270 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----G-GC-C-G-----G---AC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------A--A--CG-----CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GTGTT----A-ACT-----GA-G-T----CGT--T----A--------------TT-T---T-T-T----A--C-AT-TT-A----T---C-CA------C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C----A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-
gi|30271 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AAGT-GGTAG---GACT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A---------CC----T-G-T--CAA---AA-T-G-A-A-TG-----GG-AATATCC-A----T--A-T-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---C-----G--T-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----GTT--T----AAC------------TT-TA--T-T-T----G--C-ATATT-A----TA--C-CATC----T--TT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-TAA----T-T----C----T--C-A--A--------A----AAATTT-AT-----T--------T---T--G----T-AA-TA-T-------T----A-----A-A-T---TTA-A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AA---T-A--G--TAC--CA--A---GA---C-T-C-CG-C-T--A-T--------G-AC-G-T-AAT--A-CACAATA
gi|30272 : TATG--A--TT-A------C-T-G--CA-GAGATA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGG-C--G----A-A-A-----A-GC-C-G--G--G--TAC-----A----T--A-AGA--CCTA--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-ACA-A-TGTAGATGG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----AT-A-TA---T--A--A---C-C-G-T-T-T-C--G---T----A-AAT-----G-----------------------------------------T-T-T----G--C-GT-TT-A----T---C-CA-CCTAGC--TT-A---T-A----------A-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----ACT-TT-A------T--------T---T--G----T-AA-------------------------------------------------------------------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT-G-T--------G-AC-G-T-A
gi|30273 : TAT-T-A--CT-A------C-T-G--CACGAGATA----A------TAG---ACAT---------------T----G-ATGT-------GTAGC--G----A---A-----A-GC-C-GAAT--G--TAC-----A----T--G-AGGGGCC-AG-TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CTAA-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-CGT-G-C--G---TCTTAG-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A---------------------G-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---TGA----------G-----TGT---GAGG-T-A----T-T----C----T--C-C--A--------A----AA--GA-A------T--------A---T--GATGTT-AA-AA-G-------T----A-----CAA-T---TT--A-C----------T-------T----------AC--------A-----------T--A-AT---C-C--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC-A-T--------G--------AGT-AA-AACAATAtgcccctaataacaat
gi|30274 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30275 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAG-TA----AA-T-G-TAG---GCA----------------T--T-G-AT-T-------GGACC--G----A-T-------A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----
gi|30276 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT---------GGA-C--A----A-C-A-------GC-C-G--G--G--ATC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------A--C--C------CC----T-G-T--C-----------------------GG-A-----T-A----CC-A-A-AA--T-GG-C-T---CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--GT--T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T------------------------------------------------------------------------------A-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----GT--TT-A------T--------T---T--G----T-----A-TTTA----T----A-----C-A-T---TA--A-C----------T-------TACAATAAATAACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30277 : TATGT-A--CT-A------CAT-G--CA-GAGAAACTACAA-TAG-TAGA--GCAT---------------T--TTG-ATGTAA-----GGA-C--GTA--A-C-A-----A-GCACAG--T--G---ACCGATTG----T--G-AGG--CC-A---A------T--A--C------CC----T-GCT--CAAATTAA-T-A-G-A-TG-----AG-G-----T-AAC--C--A-A-AA--T-GGAC-TCT-CC-A---T-----A--G-TA---T--A--AAAGC-C-G-C-T-TACAGG---T----A-AATTTCGTGA-A-G----CGC--T----ACTTT----------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GAGG-T-AAAGTT-T----T----T--C-A--AT-------A----AT--TT-A------G--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TGA--G-----CGG-T---TTTAA-C----------T-------TA---------ACTT-T----------------T--A-AT---T-A--
gi|30278 : TGTGT-ATTCT-A------C-T-G--CA-GCGAAA----A--T-C-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-------------------------A-----A-GC-C-G--G--G--AAT-----A----T--G-AGG--TC-A--TA------A--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-ATTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CT-A---TTCTAAA--T-T----T--A--A---C-C-
gi|30279 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-G-GAAG----AA-A-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--
gi|30280 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-
gi|30281 : TAGGT-A--CT-A------C-T-G--TA-GAGAAA----AA-C-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--GCCGAG-C-A-----A-GC-T-G--G--G--TAC-----A----C--G-ATG--CC-A--T
gi|30282 : TATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GACAAA----AA-T-G-CAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30283 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACGT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AA------GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T-----CA------C--TT-A---T------------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-T--A--------A----AA--GT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA---------T----A-----C-A-TATATT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30284 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--C--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A-----------------T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-TA-C----C--TA-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30285 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-A-G--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AATT-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-CTT-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-TCAAACG---T----A--------------TG-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----C---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G------TT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AAGT-------T----A-------A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T----A-----------T--A-AT---T-A--T--TACCACA--A---AA---C---C-CGCC-TC-A-TG-------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30286 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--GAC-----A----T--G-AGG--CC-----A------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---TTATA-A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-T--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GT-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AG-T-------T----C-----C-----------A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------------------------TAC--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC-A-T--------G-AC-A-T-AAT----AACAATA
gi|30287 : ATTT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CTG---GTAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--A----A-C-A-----A-GC-T-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------TC----T-T-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CTAT---T-T-T----G--C-AT-TT-A-----------A-----------------------------------------GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----T-----C-A-T---TT--A-A----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--G-AT---T-A--T--AAT--CA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30288 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CG-AAGAAA----AA-T-A-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-T--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--G--AAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---T-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--A-A--A--------AT---AG--TT--------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--T-GA---T-A--T--TAT--C
gi|30289 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--T-T----C--A--A---C-C-G-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CG-T---T-T-C----A--C-AT-CT-A----T---T-CA-T----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----A
gi|30290 : ATGT-A--CT-A------C-TTG--CA-GAGAAA----AA-T-G-AGG---ACATGGTTATGTTACCTCAT--T-G-AT-T-------GGA-C--G----AAC-A-----A-AG-C-G--T--G--TAC-----A----TA-G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----TAG-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GG-A-----T-A----CA-A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--AATA---C-C-G-C-TAT-C--G---TA---A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-C---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GT----TTT---GA-G-T-AT---T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----AC----C-ATT---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-AGTT--TAC--CAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT-A
gi|30291 : ATGT-A--CT-A------C-T-G--C--GAGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----AAGC-C-G--T--G--TACC----A----T--G-AGG--CCCA--TA------T--A--C------CCC---T-G-T--CAAGT-AA-T-A-G-A-TG-----GT-------T-A----C--A-A-AA--T----C-T-T-CCCA---T-----AAGG-T----T--A--AG--C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----G--A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---A-TA-C----T--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-TAA----T-T----T----T--C-A--A--------T----AA--TT-A------G--------T---T--GT---T-AA-AACT-------T----A-----C-G-T---TT--A-CT---------T-------T----------ACTT-TA-A-A-----------T--A-AT---C-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG-G-TG-------G-ACGG-T-AAT-----ACAATAtaca
gi|30292 : ATGT-A--CTTA------C-T-G--CA-GAGAAA----AAAT-GATAG---ACAT---------------T--T-G-AC-TTG-----GGA-C--G----AGCGA-----A-GC-C-G--T--G--GTC-----A----T--G-AG---CC-A--TA------TCAA--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TT-----GA---------A----C--A-A-AA--TGGG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TAAA--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----A-AAA-----GA-ATT----CGT--TTGACG--------------TT-T---T-T-T----GGTA-AT-TT-ATTCTT---C-CA-C----CTTTT-A---T-A----------GTTGT-TTT---GA-GTT-A----T-T----C----T--C-A--A--------A----AA--GT-A------T--------T---TTGG----T-AA-AA-T-------C----ACTTGCC-A-TG--TT--A-CTTTTATGTGTT-------T----------ACTTGT--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--T---A---AA---C-T-C-GG-C-TC-G-T--------G-AC-G-T-AA--AT-AACAATA
gi|30293 : ATGT-A--TA-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-CAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------G
gi|30294 : TGT-A--TT-A------C-T-G--CA-CAGAAA----TA-T-G-CAGCAGGCAT---------------T--T-G-AT-T-------GAA-C--G----A-C-A-----A-TC-C-G--G--G--AGC-----A----T--G-AGG--CC-AATTG------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----AG-A-----T-A----A--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-A-C-T-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----CGT--T----AC-------------TT-T---T-T-T----G--G-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---C-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--C-A--A--------A----AA--TT-ATTAAACT--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAA--CA--A---AA------------T-TC-G-T--------G-AT-G-C-AAT----AACAAT
gi|30295 : TGTCA--CT-A------C-T-GAGCAAGAGAAA----AA-T-G-TAG---ATAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-CG-G----A-C-A-----A-GC-C-G--TACG--TACA----A----T--G-GGC--CT-A--TATTATTTT--A--CA-----CC----T-G-TCACAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GGAA-----T-A----C----G-AA--T-GGAC-T-T-CC-AT--T-----A--G-T----T--A--A---CGC-GCC-T-T-C--G---TA---A-AAG-----GA-A-T----CGTAGT----A---------------T-T---T-C-T----G--T--T-TC-A----T-----CA-C----C--TT-A---T-A----------G-----TTA---GG-G-T-A----TGT----C----T--C-A--A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------TAACAA-----T-A-T---AT--A-C----------T-------T----------ACTA-TAGG-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCAG-TAG------A-AC-GTT-AAT-AA-
gi|30296 : --CT-A------C-T-G--CA-GAGAAA----AA-T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-TAA-G-A-TG-----GG-A-----T-A----C----A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---A-T-G-C-T-T-C--G---T----T-AAC-----GA-A-T----AGT--T----C--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-T----C--TT-A---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----CTTAAT--C-G--A--------A----AA--TT-A---------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATAcaa
gi|30297 : --CT-A------C-T-G--CA--AGAAA----AA-T-G-TAG----CAT---------------T--T-GGAT-T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-AG-C-GGAT--A--TAC-----A----T--G-AGA--C--A--TA------T--A--C------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-AGTG-----GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-T-T-C-CA-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---CTCA-C----C---T-A---T-A----------GTTTTTTTT---GA-G-T-A----T-T---------T--C----A--------A----AA--TT-A------T--------T---T--G----TAAA-AA-T-------C----A-----C-A-T---TT--A-C----------TG------T----------ACTG-G--G-G-----------T--A-ATAA-T-A--T--CAT--CA--AAATAA---C-T-C-CGCC-CC-G-T--------G-ACGG-T-AA--AT-AACAATA
gi|30298 : -GAGAAAT---GA-T-A-GAG---ACAT---------------TATT-G-AT-TTGGTCTCGGA-T--C----A-T-ATGTCTA-GC-C-G--T--GAGTAC-----AATCGT--A-GAG--CA-A--TA------TGTA--C------CCATCAT-G-T--CAAA--GA-T-A-GTA-TG-----GG-AA----T-A----TCAA-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-ACTAT-----A--G-T----T--A--A---C-CGG-C-C-T-C--G---T----A-AAT-----GATATT----CGT--T----A--------------TTATACGT-T-TAATAG--C-AT-TTAA----T---C-CATT----C--TT-A---T-ATGATTTCTTTG-----TTT---AC-G-T-A----T-TTAACC----T--C-A--AGGGTTTAGA----GA--TTAA------TGCTTAAAGT---T--G----T-AA-AA-G-------T----AG----C-A-T---CT--ACC----------T-------T----------ACTT-T--G-A-----------TAGA-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC-A-TTTGGGGGAG-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30299 : AGAAA----AA-T-G-TAG---GCATG--------------T--T-G-A--T-------GGA-C--G----A-C-A-----A-GC-C-G--T--G--TAC-----A----T--G-AGG--CC-A--TAT-----T--A--C------CC----T-G-T--C-AG--AA-T-A-G-G-TA-----TG-A-----TAA----C--A-A-AA--T-GGCC-T-T-CC-A---T-----A--G-T----TA-A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---TTAA-A-AAG-----GA-A-T----CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----TC--C-CA-C----C--TT-A---T-A----------G------TT---GACA-T-A----T-----------T--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------ACTT-T--T-A-----------TA-A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AA---C-TAC-CG-C-TTAA-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAc
gi|30300 : A-T-G-TAG---ACAT---------------T--T-G-AT-T-------GTA-C--G----A-C-A-----A-GC---G-----G--TAC-----A----T--GGAGG--CC-A--TA------T--A--C------CC----T-G-G--CAAG--AA-T-A-G-A-TG-----GA-G-----T-A----C--A-ACAA--T--G-C-T-T-CC-A---T-----A--GAT----T--A--A---C-C-G-C-TGT-C--G---T----A-AAA-----GA-A-T----CGT--T----A--------------CT-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T------------G-----TTA---GA-G-TCA----T-T----C----TCCC-A--A--------A----AA--TA-A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------A----A-----C-A-T---TT--A-A----------C-------T----------ACTG-T--G-A-----------T--A-AT---TAA--TTATAC--CA--A---A------C-C-CG-C-TC-A-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA
gi|30301 : -T-G-TAG---GCAT---------------T--T-G-AT-T-------GGA-G--G----A-C-A-----A-GC-C-G--G--A--TAC-----A----T--G-AGA--CC-A--TA------T--ATAC------CC----T-G-T--CAAG--AA-T-A-G-A-TGCATG-GG-A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-CC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---C----A-AAT-----GA-A-T----CGT--TA---A--------------TT-T---T-T-T----G--C-AT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------C-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----T--CAA--A--------A----AA--TT-A------T--------TCAGT--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TC--A-C----------T-------T----------ACTG-T--A-A-----------T--A-AT---T-A--T--CAT--CA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC-G-T--------G-AT-G-T-A---AA-AACAATA
gi|30302 : -AT-T-------GGA-CCCG----A-C-A-----A-AC-C-G--G--G--TAC-----AA---T--G-AGA--CC-A--TA-------------------CC----T-G-TA-CTAG--AA-T-AAG-A-TG-----AG-A-----T-AAACAC--ATA-AA--T-GG-A-T-T-CC-A---A-----A--A-TAAAGT--A--A---A-C-G-C-T-T-C--G---T----A-ATT-----GA-A-A----TGT--T----ACGTTTTATATTATTTT-T---T-T-T----A--TGAT-TT-A----T---C-CA-C----C--TT-A---T-A----------A-----CTTATTGA-A-T-A----T-T----T----T--C-G--A--------AGGAAAA--TT-----------------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---TT--A-C----------TAA-----T----------TCTT-T--A-AAATATAAATTTT--A-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT-T-T--------G-AC-G-T-AAT-AA-
gi|30303 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACAca
gi|30304 : -----A----T--G-ACG--C--A--TA------T--AA-C------CCA---T-G-T--CAAG--AAAT-A-G-A-TG-----G--A-----T-A----C--A-A-AA--T-GG-C-T-T-TC-A---T-----A--G-T----T--A--A---C-C-G-C-T-T-C--G---T----T-AAG-----GA-A-TG---CGT--T----A--------------TA-T---T-T-T----G--C-A--TT-A----T---C-CA-C----CA-TT-A---T-A----------G-----TTT---GG-A-T------T-T----T----T--C-A--A--------A----AA-----A------T--------T---T--G----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-----TT--A-C----------T-------T----------CTTT-T--G-A-----------T--A-AT---T-A--T--TAC--CA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA-A-T--------G-AC-G-T-AAT-AACAACA
gi|30305 : -T----T--A--A---C-C-G-C-A-T-C--G---T----A-AAT-----GA-A-T----C----T-------------------TT-T---T-T-T----G--T-AT-GT-A----T---C-CA-C----T--TT-A---T-T----------G-----TTT---GA-A-TAA----T-T----T----C--C-A--A--------A----AA--AT-A------T--------T---T--G----T-AA-AT-A-------T----A-----C-T-T---TT--A-C----------T-------T----------GC
gi|30306 : ---T-A----------G-----TTT---GA-G-T-A----T-T----T----C--C-A--A--------G----AA--TT-ACATGTAT--------T---T--A----T-AA-AA-T-------T----A-----C-A-T---T---A-C----------T-------T----------ACGT-T--A-A-----------T--G-AT---T-A--T--TAT--CA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG-G-T--------G-AC-G-T-AAT----AACAATA