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Reference ( gi|77992 )        : TTAGAAATC-AGTTT------A-G-CTTCTCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-GT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTA-G---AAG--GGTGTGG
gi|77991                      : TTAGAAATC-AATTC------A-G-CTTCGCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTA-G---AAG--GGCGTGG
gi|77993                      : TTAGAAATC-TATTT------A-G-CTTCTTC--TC---T---TC------A-GTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GT-GG-A--C-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTA-G---AAG--GGCGTGG
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gi|78001                      : TTAGAAATC-AATTT------A-G-GTTCTCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A-----------------------------GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTA-G---AAG--GGCGTGG
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gi|77999                      : TTAGAAACC-AAATT------G-G-CCTCTTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--G------T-TGCA-G---AAG--GGCGTGG
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gi|78014                      : TTAGAAATA-AATTT------A-G-CGTC-----AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AT---A--T-TT--C--A------A-TGTA-G---AAG--GACGTGG
gi|78023                      : TTATAGATC-AATTT------A-G-CTTTTCC--AC---T---AC--------ATT----G-GC-T-T------T-----G------A---------GC-AT------G-----GT-GG-G--T-TT-CGG--AACT-TT--C--ACAT---A-TGTA-G---AAG--G
gi|78022                      : TTAGAAATC-AAATT------A-G-TGTCTCC--AC---T---TT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GC-----GC-AG-A--C-TT-AG
gi|78003                      : TTAGAAATC-AATTC------AAG-C--CTTC--GC---TCTGGC------A-ATT------GC-C-TG-----TCAA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--TGTT-AGG--A--TATT--C--A------A-CG-A-G---AAG--G
gi|78024                      : TCAGAAATT-AATCT------A-G-CTTTTCT--AC---T---GCTACACTATATT----T-GC-A-T------T-----A------T---------GC-AT-----TT-----GC-AG-A--T-TT-AGC--A--T-TT--C--A------G-TGTA-GTTCAGG--AGAGTGGcatgg
gi|78026                      : TTACAAATT-AATTT------G-T-GTTCTTC--AA---T---GC------A-AAT----T-GC-CTT------T-----ATTAGCTA---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AAG--A--T-TTAAT--A------A-TTTA-G---AGA--GGCGT
gi|78025                      : TTTGAAATC-AATTT------A-G-TTTCTT----C---T---GC------A-ATT----T-GT-C-C------TGGG--A------A---------GC-AT----------------------------G--A--T-TT--T---------A-TATAGG---AAG--GGCGTGG
gi|78008                      : TTAGAAATC-AATTC------A-A-C--CGGC--AC---TCT-GC------A-AAT----T-AG-C-TA-----G-----A------A---------GCTAT-----GG-----A--GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------A-ACTA-G---AAG--G
gi|78027                      :  TAGAAATC-AATTC------A-G-TTTCGCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------G-----A------A---------GC-AA-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--T--A------A-TGTA-G---AAG--GGCGTGG
gi|78029                      :  TAGAAATC-AATTA------A-G-CTTCTCC--AC---T---AC------G-CTT----T-GC-G-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGT------GAT--GGCGTGG
gi|78028                      :  TAGAAATC-AATTC------A-GTCTTCGCC--TC---T---GCC-----A-ATC----TAGC-C-T------T-----A------G---------AA-GA-----GGAATG-GC-GGCA--T-TT-AGG--AA-T-TT--C--A------A-CCTA-G---AAG--GGC
gi|78030                      :   AGAAATCCAATTTTAAATTA-G-CTTTTCCTCAT---T---GC------T-TTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GT-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--G--AATGTATA-TGTA-G---AAT--GGCGTG
gi|78031                      :      AATC-CATTT------A-G-CTTATCCC-ACATGT---AC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------TTGCT-----GC-GT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-T-T--G---GAT--GGCGTGG
gi|78032                      :       ACC-AATTT------A-G-TTTCTAC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------G-TGTA-G---AAG--AG
gi|78038                      :              TT------A-G-CTTCTCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----A------T---------GC-AT-----GG-----AC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--G--A------A-TGTG-G---AAG--GGCGTGG
gi|78035                      :              TC------A-G-CTTCGCC--AT---T---GC------A-ATT----T-GT-C-TGT----TCA---A------A---------GC-ATCATCGGG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTA-G---AAG--
gi|78033                      :         ttaacTT------A-G-CTTC----------------------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTA-A---AAG--GGCGTAG
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Reference ( family-401 )      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77991                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77992                      : TTAGAAATC-AGT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-GT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGTGTGG
gi|77993                      : TTAGAAATC-TAT-TT------A-G-CT--TC--TTC--TC---T---TC------A-GTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GT-GG-A--C-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77994                      : TTAGATATC-AAT-TC------A-T-CT--TC--GCC--TC---T---GA------A-ATT----T-GC-C-TA-----G-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCG
gi|77995                      : TTAAAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-CGTGG---A----AA--GGCGGGG
gi|77996                      : TTGGAAATC-AAT-TT------A-G-CC--TA--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-TG-A--T-TT-GGG--A--T-TT--C--A------A-TATAG---A----GG--GGCGTGG
gi|77997                      : TTAGAAATC-AAG-TT------A-A-CC--TC--TTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AT--GGCGTAG
gi|77998                      : TTAGAAAAT-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-A------T-----G------T---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TG--C--A------A-TGTAG---A----AT--AACGTGG
gi|77999                      : TTAGAAACC-AAA-TT------G-G-CC--TC--TTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--G------T-TGCAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78000                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GTGC-TG-----T-----A------A---------GCGAT-----GG------C-GG-A--T-AT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAA---A----AG--GGCG
gi|78001                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-GT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A-----------------------------GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78002                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCT---C---T---GC------A-ATT----T-GG-C-TG-----TCCA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TTGAGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AGA-GGC-TGG
gi|78003                      : TTAGAAATC-AAT-TC------AAG-C----C--TTC--GC---TCTGGC------A-ATT------GC-C-TG-----TCAA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--TGTT-AGG--A--TATT--C--A------A-CG-AG---A----A---GGCATGG
gi|78004                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GG------A-ATT----T-GC-C-TAAAGGCTGAGTAA------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--T--T-TT--C--A------G-TGCAG---A----AG--AGCGTGG
gi|78005                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC-------AC---T---GC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-AG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--A------A-TGAAG---A----AG--TGCG
gi|78006                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GC------A-ATT----T-TC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----TG-----TC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A----AG--GGTGTGG
gi|78007                      : TTAGAAA-C-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A--------T-GA-C-C------T-----AGA----A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------ACCGTAG---A----GGGCGGCGTG
gi|78008                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-A-C----C--GGC--AC---TCT-GC------A-AAT----T-AG-C-TA-----G-----A------A---------GCTAT-----GG-----A--GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------A-ACTAG---A----AG--
gi|78009                      : TTAGAAATC-AAT-TT------T-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGCGTGG
gi|78010                      : TTAGGAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TCC--AC---T---GC------G-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------AC-AA-----AG-----GC-GG-A--T------------C-TT--C--A------G-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78011                      : TCAGAACGC-AATGTT------AAG-CGG-TC--TCT---C---T---GC------A-ATT----T-GT-C-T------T-----G------A---------AC-AC-----GG-----AT-GG-A--T-TT--GG--A--T-TT--C--A------T-CAAGG---A----AG--GGCGTGG
gi|78012                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78013                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-T--ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78014                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AT---A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78015                      : TTAGACATC-AAT-TC------A-G-CC--TC--TCC--AC---T---GT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----GG-----GT-AG-A--T-TT-AGGATA--T-TT--C--A------T-TGTTG---A----AA--TGTGTGG
gi|78016                      : TTAAAAATC-GAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GA-----GC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---------G--GGCGTGG
gi|78017                      : TTAGAA-TC-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-AAT----T-GC-A--------A-----A------A---------GC-AT-----GAACGCCGC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTGA---G----AG--GACATGG
gi|78018                      : TTAGAACGT-AAT-TT------A-G-TG--TC--TCT--AC---T---GC------A-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------GC-AC-----GG-----GT-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------T-CGAAG---GAGCTAG--GGCGT
gi|78019                      : TTAGAAACC-AAT-TT------A-G-CT--AC--TCC--AC---T---AC------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------T---------GC-AT-----GA-----GC-AG-A--A-TT-GGG--A--T-TT--T--A------A-TGAGG---G----AG--GGC
gi|78020                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-AATT-TT-A----A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGTGTGG
gi|78021                      : TTAGCAAAC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T----C------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-CA-----GG-----GTAGA-A--T-TT-AGG--A--T-TT--TAAA------A-TGTGG---A----AG--AG
gi|78022                      : TTAGAAATC-AAA-TT------A-G-TG--TC--TCC--AC---T---TT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GC-----GC-AG-A--C-TT-AG
gi|78023                      : TTATAGATC-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---AC--------ATT----G-GC-T-T------T-----G------A---------GC-AT------G-----GT-GG-G--T-TT-CGG--AACT-TT--C--ACAT---A-TGTAG---A----AG--
gi|78024                      : TCAGAAATT-AAT-CT------A-G-CT--TT--TCT--AC---T---GCTACACTATATT----T-GC-A-T------T-----A------T---------GC-AT-----TT-----GC-AG-A--T-TT-AGC--A--T-TT--C--A------G-TGTAGTTCA----GG--AGAGTGG
gi|78025                      : TTTGAAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TTC-------T---GC------A-ATT----T-GT-C-C------TGGG--A------A---------GC-AT-----G-------------------------A--T-TT--T--A--------TATAGG--A----AG--GGCGTGG
gi|78026                      : TTACAAATT-AAT-TT------G-T-GT--TC--TTC--AA---T---GC------A-AAT----T-GC-CTT------T-----ATTAGCTA---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AAG--A--T-TTAAT--A------A-TTTAG---A----GA--GGCGT
gi|78027                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-G-TT--TC--GCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------G-----A------A---------GC-AA-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--T--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78028                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-GTCT--TC--GCC--TC---T---GCC-----A-ATC----TAGC-C-T------T-----AGAAG--A---------GG-AA-----TG-----GC-GGCA--T-TT-AGG--AA-T-TT--C--A------A-CCTAG---A----AG--GGCG
gi|78029                      :  TAGAAATC-AAT-TA------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-CTT----T-GC-G-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGT-----G----AT--GGCGTGG
gi|78030                      :   AGAAATCCAAT-TTTAAATTA-G-CT--TT--TCCTCAT---T---GC------T-TTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GT-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--G--AATGTATA-TGTAG---A----AT--GGCGTG
gi|78031                      :      AATC-CAT-TT------A-G-CT--TA--TCCC-ACATGT---AC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------TTGCT-----GC-GT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-T-T-G---G----AT--GGCGTGG
gi|78032                      :       ACC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TAC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------G-TGTAG---A----AG--AG
gi|78033                      :       ATT-AAT-T-------A-G-CT--TC------------------------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTAA---A----AG--GGCGTAG
gi|78034                      :        TT-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----C------T---------GC-AT-----GG-----AA-GA-A--A-TT---G--A--T-TT--G--A------A-TGTGT---G----AG--GGCGTGG
gi|78035                      :        TT-AAC-TC------A-G-CT--TC--GCC--AT---T---GC------A-ATT----T-GT-C-TGT----TCA---A------A---------GC-ATCATCGGG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--
gi|78036                      :        TT-AAC-TT------A-G-AC--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATTAATTT-GC-C-C------T-----A------A---------AC-AT-----GG-----AC-GA-A--T-TT--GG--G--T-TT--A--A------A-TTTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78037                      :            AT-TT------C-G-CTCGTCAGTCC--AC---T---GC------A-ACT----T-GC-A-T------T-----ATA----A---------GC-AT-----GA-----AC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--G------A-TGTAG---A----GG--GGCGTGG
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gi|78039                      :                                         C---T---GT------A-ATA----T-GC-C-T------G-----C------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
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gi|78041                      :                                              ---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----AC-----GC-GG-A--T-AT-AGG--A--T-CC--C--A------A-CGGAG---A----AG--GGTGTGG
gi|78042                      :                                                                                 -----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--T------A-CTTAG---A----AG--GGCGTGG





Alignments
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Reference ( family-401 )      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77991                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77992                      : TTAGAAATC-AGT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-GT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGTGTGG
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gi|77998                      : TTAGAAAAT-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-A------T-----G------T---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TG--C--A------A-TGTAG---A----AT--AACGTGG
gi|77999                      : TTAGAAACC-AAA-TT------G-G-CC--TC--TTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--G------T-TGCAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78000                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GTGC-TG-----T-----A------A---------GCGAT-----GG------C-GG-A--T-AT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAA---A----AG--GGCG
gi|78001                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-GT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A-----------------------------GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78002                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCT---C---T---GC------A-ATT----T-GG-C-TG-----TCCA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TTGAGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AGA-GGC-TGG
gi|78003                      : TTAGAAATC-AAT-TC------AAG-C----C--TTC--GC---TCTGGC------A-ATT------GC-C-TG-----TCAA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--TGTT-AGG--A--TATT--C--A------A-CG-AG---A----A---GGCATGG
gi|78004                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GG------A-ATT----T-GC-C-TAAAGGCTGAGTAA------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--T--T-TT--C--A------G-TGCAG---A----AG--AGCGTGG
gi|78005                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC-------AC---T---GC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-AG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--A------A-TGAAG---A----AG--TGCG
gi|78006                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GC------A-ATT----T-TC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----TG-----TC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A----AG--GGTGTGG
gi|78007                      : TTAGAAA-C-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A--------T-GA-C-C------T-----AGA----A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------ACCGTAG---A----GGGCGGCGTG
gi|78008                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-A-C----C--GGC--AC---TCT-GC------A-AAT----T-AG-C-TA-----G-----A------A---------GCTAT-----GG-----A--GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------A-ACTAG---A----AG--
gi|78009                      : TTAGAAATC-AAT-TT------T-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGCGTGG
gi|78010                      : TTAGGAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TCC--AC---T---GC------G-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------AC-AA-----AG-----GC-GG-A--T------------C-TT--C--A------G-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78011                      : TCAGAACGC-AATGTT------AAG-CGG-TC--TCT---C---T---GC------A-ATT----T-GT-C-T------T-----G------A---------AC-AC-----GG-----AT-GG-A--T-TT--GG--A--T-TT--C--A------T-CAAGG---A----AG--GGCGTGG
gi|78012                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78013                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-T--ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78014                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AT---A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78015                      : TTAGACATC-AAT-TC------A-G-CC--TC--TCC--AC---T---GT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----GG-----GT-AG-A--T-TT-AGGATA--T-TT--C--A------T-TGTTG---A----AA--TGTGTGG
gi|78016                      : TTAAAAATC-GAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GA-----GC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---------G--GGCGTGG
gi|78017                      : TTAGAA-TC-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-AAT----T-GC-A--------A-----A------A---------GC-AT-----GAACGCCGC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTGA---G----AG--GACATGG
gi|78018                      : TTAGAACGT-AAT-TT------A-G-TG--TC--TCT--AC---T---GC------A-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------GC-AC-----GG-----GT-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------T-CGAAG---GAGCTAG--GGCGT
gi|78019                      : TTAGAAACC-AAT-TT------A-G-CT--AC--TCC--AC---T---AC------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------T---------GC-AT-----GA-----GC-AG-A--A-TT-GGG--A--T-TT--T--A------A-TGAGG---G----AG--GGC
gi|78020                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-AATT-TT-A----A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGTGTGG
gi|78021                      : TTAGCAAAC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T----C------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-CA-----GG-----GTAGA-A--T-TT-AGG--A--T-TT--TAAA------A-TGTGG---A----AG--AG
gi|78022                      : TTAGAAATC-AAA-TT------A-G-TG--TC--TCC--AC---T---TT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GC-----GC-AG-A--C-TT-AG
gi|78023                      : TTATAGATC-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---AC--------ATT----G-GC-T-T------T-----G------A---------GC-AT------G-----GT-GG-G--T-TT-CGG--AACT-TT--C--ACAT---A-TGTAG---A----AG--
gi|78024                      : TCAGAAATT-AAT-CT------A-G-CT--TT--TCT--AC---T---GCTACACTATATT----T-GC-A-T------T-----A------T---------GC-AT-----TT-----GC-AG-A--T-TT-AGC--A--T-TT--C--A------G-TGTAGTTCA----GG--AGAGTGG
gi|78025                      : TTTGAAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TTC-------T---GC------A-ATT----T-GT-C-C------TGGG--A------A---------GC-AT-----G-------------------------A--T-TT--T--A--------TATAGG--A----AG--GGCGTGG
gi|78026                      : TTACAAATT-AAT-TT------G-T-GT--TC--TTC--AA---T---GC------A-AAT----T-GC-CTT------T-----ATTAGCTA---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AAG--A--T-TTAAT--A------A-TTTAG---A----GA--GGCGT
gi|78027                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-G-TT--TC--GCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------G-----A------A---------GC-AA-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--T--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78028                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-GTCT--TC--GCC--TC---T---GCC-----A-ATC----TAGC-C-T------T-----AGAAG--A---------GG-AA-----TG-----GC-GGCA--T-TT-AGG--AA-T-TT--C--A------A-CCTAG---A----AG--GGCG
gi|78029                      :  TAGAAATC-AAT-TA------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-CTT----T-GC-G-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGT-----G----AT--GGCGTGG
gi|78030                      :   AGAAATCCAAT-TTTAAATTA-G-CT--TT--TCCTCAT---T---GC------T-TTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GT-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--G--AATGTATA-TGTAG---A----AT--GGCGTG
gi|78031                      :      AATC-CAT-TT------A-G-CT--TA--TCCC-ACATGT---AC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------TTGCT-----GC-GT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-T-T-G---G----AT--GGCGTGG
gi|78032                      :       ACC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TAC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------G-TGTAG---A----AG--AG
gi|78033                      :       ATT-AAT-T-------A-G-CT--TC------------------------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTAA---A----AG--GGCGTAG
gi|78034                      :        TT-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----C------T---------GC-AT-----GG-----AA-GA-A--A-TT---G--A--T-TT--G--A------A-TGTGT---G----AG--GGCGTGG
gi|78035                      :        TT-AAC-TC------A-G-CT--TC--GCC--AT---T---GC------A-ATT----T-GT-C-TGT----TCA---A------A---------GC-ATCATCGGG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--
gi|78036                      :        TT-AAC-TT------A-G-AC--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATTAATTT-GC-C-C------T-----A------A---------AC-AT-----GG-----AC-GA-A--T-TT--GG--G--T-TT--A--A------A-TTTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78037                      :            AT-TT------C-G-CTCGTCAGTCC--AC---T---GC------A-ACT----T-GC-A-T------T-----ATA----A---------GC-AT-----GA-----AC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--G------A-TGTAG---A----GG--GGCGTGG
gi|78038                      :              -TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----A------T---------GC-AT-----GG-----AC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--G--A------A-TGTGG---A----AG--GGCGTGG
gi|78039                      :                                         C---T---GT------A-ATA----T-GC-C-T------G-----C------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78040                      :                                        ct---T---GC------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----AC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTAG---A----AG--GGCATGG
gi|78041                      :                                              ---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----AC-----GC-GG-A--T-AT-AGG--A--T-CC--C--A------A-CGGAG---A----AG--GGTGTGG
gi|78042                      :                                                                                 -----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--T------A-CTTAG---A----AG--GGCGTGG


blockSeqs                     :                 TAAATT A    CG  AGT  TC  ATG CTG  TACACT     AATT        AAAGGCTGAGTAAA                 G  CATCG  ACGCC       AT        AT AC    AA AA ATGTAT       TTC AGCT  GC
blockSeqs                     :                 .      A    G   T    C   .   CT   C          .           TAAAAATTAAAA                   T  .      .           .         .  A     .  .  CAT          G   .     A 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAAAAATTAAAA                   .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           TAAAAATTAAAA                   .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TATTAGCTA                      .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           GTCCAAA                        .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           GTCAAAA                        .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAGAAGA                        .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TATTGCT                        .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           GTTCAAA                        .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TGGGAA                         .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           TAGAA                          .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TATAA                          .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           AGAA                           .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           GTAA                           .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           AGAA                           .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           CAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TGT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TGA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           AAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TGA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   G    .   .   .    .          .           GAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   T    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   .    .   .   .    .          .           TAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   .    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   .    .   .   .    .          .           CCT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   .    .   .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                 .      .    .   .    .   .   .    .          .           CAT                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .   .    .          .           GCA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .   .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                                              .    .          .           TAA                            .  .      .           .         .  .     .  .  .            .   .     . 
blockSeqs                     :                                                                                                         .  .      .           .                                                 


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
finalCons                     : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG





Alignments
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lowQualScore                  :          .   .  ...... . .  ..  ...  ..  ... ...  ...... .   .... .  . . .............................  .  .....  .....  .  . .. .  .   .. .. .  .. .. ...... .     ... ....  ..       
lowQualScore                  :          9   8  444444 7 8  00  888  00  444 555  000000 8   7777 8  8 8 77777777777777777777777777777  5  99999  99999  8  8 11 8  8   11 99 8  11 11 666666 8     222 7777  99       
consensus                     : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
Reference ( family-401 )      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77991                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77992                      : TTAGAAATC-AGT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-GT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGTGTGG
gi|77993                      : TTAGAAATC-TAT-TT------A-G-CT--TC--TTC--TC---T---TC------A-GTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GT-GG-A--C-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|77994                      : TTAGATATC-AAT-TC------A-T-CT--TC--GCC--TC---T---GA------A-ATT----T-GC-C-TA-----G-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCG
gi|77995                      : TTAAAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-CGTGG---A----AA--GGCGGGG
gi|77996                      : TTGGAAATC-AAT-TT------A-G-CC--TA--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-TG-A--T-TT-GGG--A--T-TT--C--A------A-TATAG---A----GG--GGCGTGG
gi|77997                      : TTAGAAATC-AAG-TT------A-A-CC--TC--TTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AT--GGCGTAG
gi|77998                      : TTAGAAAAT-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-A------T-----G------T---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TG--C--A------A-TGTAG---A----AT--AACGTGG
gi|77999                      : TTAGAAACC-AAA-TT------G-G-CC--TC--TTC--AT---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--G------T-TGCAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78000                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A-ATT----T-GTGC-TG-----T-----A------A---------GCGAT-----GG------C-GG-A--T-AT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAA---A----AG--GGCG
gi|78001                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-GT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A-----------------------------GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78002                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCT---C---T---GC------A-ATT----T-GG-C-TG-----TCCA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TTGAGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AGA-GGC-TGG
gi|78003                      : TTAGAAATC-AAT-TC------AAG-C----C--TTC--GC---TCTGGC------A-ATT------GC-C-TG-----TCAA--A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--TGTT-AGG--A--TATT--C--A------A-CG-AG---A----A---GGCATGG
gi|78004                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GG------A-ATT----T-GC-C-TAAAGGCTGAGTAA------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--T--T-TT--C--A------G-TGCAG---A----AG--AGCGTGG
gi|78005                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC-------AC---T---GC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-AG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--A------A-TGAAG---A----AG--TGCG
gi|78006                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--GC---T---GC------A-ATT----T-TC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----TG-----TC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A----AG--GGTGTGG
gi|78007                      : TTAGAAA-C-AAT-TC------A-G-CT--TC--GCC--TC---T---GC------A--------T-GA-C-C------T-----AGA----A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------ACCGTAG---A----GGGCGGCGTG
gi|78008                      : TTAGAAATC-AAT-TC------A-A-C----C--GGC--AC---TCT-GC------A-AAT----T-AG-C-TA-----G-----A------A---------GCTAT-----GG-----A--GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------A-ACTAG---A----AG--
gi|78009                      : TTAGAAATC-AAT-TT------T-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGCGTGG
gi|78010                      : TTAGGAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TCC--AC---T---GC------G-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------AC-AA-----AG-----GC-GG-A--T------------C-TT--C--A------G-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78011                      : TCAGAACGC-AATGTT------AAG-CGG-TC--TCT---C---T---GC------A-ATT----T-GT-C-T------T-----G------A---------AC-AC-----GG-----AT-GG-A--T-TT--GG--A--T-TT--C--A------T-CAAGG---A----AG--GGCGTGG
gi|78012                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78013                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-T--ATG--A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78014                      : TTAGAAATA-AAT-TT------A-G-CG--TC-------AC---A---GG------A-ATT------GC-C-T------T-----A------AAAATTAAAAGC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AT---A--T-TT--C--A------A-TGTAG---A----AG--GACGTGG
gi|78015                      : TTAGACATC-AAT-TC------A-G-CC--TC--TCC--AC---T---GT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AT-----GG-----GT-AG-A--T-TT-AGGATA--T-TT--C--A------T-TGTTG---A----AA--TGTGTGG
gi|78016                      : TTAAAAATC-GAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GA-----GC-AG-A--A-TT-AAG--A--T-TT--T--A------A-TGTGG---------G--GGCGTGG
gi|78017                      : TTAGAA-TC-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-AAT----T-GC-A--------A-----A------A---------GC-AT-----GAACGCCGC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTGA---G----AG--GACATGG
gi|78018                      : TTAGAACGT-AAT-TT------A-G-TG--TC--TCT--AC---T---GC------A-ATT----T-AC-C-T------T-----A------A---------GC-AC-----GG-----GT-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------T-CGAAG---GAGCTAG--GGCGT
gi|78019                      : TTAGAAACC-AAT-TT------A-G-CT--AC--TCC--AC---T---AC------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------T---------GC-AT-----GA-----GC-AG-A--A-TT-GGG--A--T-TT--T--A------A-TGAGG---G----AG--GGC
gi|78020                      : TTAGAAATC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-AATT-TT-A----A--T-TT--T--A------A-TGTGG---A--------GGTGTGG
gi|78021                      : TTAGCAAAC-AAT-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T----C------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-CA-----GG-----GTAGA-A--T-TT-AGG--A--T-TT--TAAA------A-TGTGG---A----AG--AG
gi|78022                      : TTAGAAATC-AAA-TT------A-G-TG--TC--TCC--AC---T---TT------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----GC-----GC-AG-A--C-TT-AG
gi|78023                      : TTATAGATC-AAT-TT------A-G-CT--TT--TCC--AC---T---AC--------ATT----G-GC-T-T------T-----G------A---------GC-AT------G-----GT-GG-G--T-TT-CGG--AACT-TT--C--ACAT---A-TGTAG---A----AG--
gi|78024                      : TCAGAAATT-AAT-CT------A-G-CT--TT--TCT--AC---T---GCTACACTATATT----T-GC-A-T------T-----A------T---------GC-AT-----TT-----GC-AG-A--T-TT-AGC--A--T-TT--C--A------G-TGTAGTTCA----GG--AGAGTGG
gi|78025                      : TTTGAAATC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TTC-------T---GC------A-ATT----T-GT-C-C------TGGG--A------A---------GC-AT-----G-------------------------A--T-TT--T--A--------TATAGG--A----AG--GGCGTGG
gi|78026                      : TTACAAATT-AAT-TT------G-T-GT--TC--TTC--AA---T---GC------A-AAT----T-GC-CTT------T-----ATTAGCTA---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AAG--A--T-TTAAT--A------A-TTTAG---A----GA--GGCGT
gi|78027                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-G-TT--TC--GCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------G-----A------A---------GC-AA-----TG-----GC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--T--A------A-TGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78028                      :  TAGAAATC-AAT-TC------A-GTCT--TC--GCC--TC---T---GCC-----A-ATC----TAGC-C-T------T-----AGAAG--A---------GG-AA-----TG-----GC-GGCA--T-TT-AGG--AA-T-TT--C--A------A-CCTAG---A----AG--GGCG
gi|78029                      :  TAGAAATC-AAT-TA------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---AC------G-CTT----T-GC-G-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-TGT-----G----AT--GGCGTGG
gi|78030                      :   AGAAATCCAAT-TTTAAATTA-G-CT--TT--TCCTCAT---T---GC------T-TTT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----TG-----GT-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--G--AATGTATA-TGTAG---A----AT--GGCGTG
gi|78031                      :      AATC-CAT-TT------A-G-CT--TA--TCCC-ACATGT---AC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------TTGCT-----GC-GT-----GG-----GC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--T--A------A-T-T-G---G----AT--GGCGTGG
gi|78032                      :       ACC-AAT-TT------A-G-TT--TC--TAC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------T---------GC-AA-----GG-----AC-AG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--C------G-TGTAG---A----AG--AG
gi|78033                      :       ATT-AAT-T-------A-G-CT--TC------------------------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTAA---A----AG--GGCGTAG
gi|78034                      :        TT-AAA-TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----C------T---------GC-AT-----GG-----AA-GA-A--A-TT---G--A--T-TT--G--A------A-TGTGT---G----AG--GGCGTGG
gi|78035                      :        TT-AAC-TC------A-G-CT--TC--GCC--AT---T---GC------A-ATT----T-GT-C-TGT----TCA---A------A---------GC-ATCATCGGG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--
gi|78036                      :        TT-AAC-TT------A-G-AC--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATTAATTT-GC-C-C------T-----A------A---------AC-AT-----GG-----AC-GA-A--T-TT--GG--G--T-TT--A--A------A-TTTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78037                      :            AT-TT------C-G-CTCGTCAGTCC--AC---T---GC------A-ACT----T-GC-A-T------T-----ATA----A---------GC-AT-----GA-----AC-GG-A--T-TT-AGA--A--T-TT--C--G------A-TGTAG---A----GG--GGCGTGG
gi|78038                      :              -TT------A-G-CT--TC--TCC--AC---T---GC------A-ATT----T-GC-C-T------C-----A------T---------GC-AT-----GG-----AC-AG-A--A-TT-AGG--A--T-TT--G--A------A-TGTGG---A----AG--GGCGTGG
gi|78039                      :                                         C---T---GT------A-ATA----T-GC-C-T------G-----C------A---------GC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------A-CGTAG---A----AG--GGCGTGG
gi|78040                      :                                        ct---T---GC------A-ATT----T-GC-T-T------T-----A------A---------GC-AT-----GG-----AC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--A------G-TGTAG---A----AG--GGCATGG
gi|78041                      :                                              ---GC------A-ATT----T-GC-C-T------T-----A------A---------GC-AT-----AC-----GC-GG-A--T-AT-AGG--A--T-CC--C--A------A-CGGAG---A----AG--GGTGTGG
gi|78042                      :                                                                                 -----A------A---------TC-AT-----GG-----GC-GG-A--T-TT-AGG--A--T-TT--C--T------A-CTTAG---A----AG--GGCGTGG