lowQualScore                  :                                                       222222222222222        
lowQualScore                  :                    0      111    111    22222   0 11  111111111111111  3     
lowQualScore                  :                    .      ...    ...    .....   . ..  ...............  .     
lowQualScore                  :                    8      444    444    00000   8 11  666666666666666  1     
consensus                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGCT
Reference ( gi|101487 )       : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------G-------TATTGGCT
gi|101491                     : AAACGTAGGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CCAT-----TCT-C--CT-------G-------TAATGGCT
gi|101492                     : AAATGTTGGAGTATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------G-------TACTGGtttggtttga
gi|101484                     : AAACGTAGGAGTATTTCTC-TCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------attttggtttga
gi|101501                     : AAACGCAGG-GTATTTCCC-TCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTAGCTtttacttgctattggtttga
gi|101490                     : AAACG-AGGAGTATCTCCC-TCCTGC---AAAG---CTCT-----CCT-C--CT-------T-------TAATGGCT
gi|101506                     : AAACGTAGACGTATCTCCC-TCATAC---AAAG---CTCC-----TCT-C--AT-------G-------TTCTGGCTatggctggtggcttga
gi|101485                     : AAATATAGGAGTACCTCCC-TCATGC----AAG---CTCT-----TCT-C--TT-------T-------TACTGGCTtttggctt
gi|101495                     : AAATATAGGAGTATCTCAC-TCATGC---ATAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGattggcttga
gi|101508                     : AACCGTACGATTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCC-----TCT-C--CT-------T-------CATTGACTattttgacttga
gi|101509                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGT---AAAG---CAAT-----TCT-C--CT---------------TACCGGtttgactt
gi|101498                     : AAACGTCGGAGTATCCCCC-TCATAC---AAAG---CTGT-----CCT-C--CT-------T-------TACTGG
gi|101486                     : AAACGTAAGGATATCTCCCCTCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CTTTTCTAAC-------TATTGGCTacgttggctaga
gi|101489                     : AAACATAGGAGTACCTCCC-CCATGC---AAA----CTTT-----TCT-C--CTTTACTGGG-------TATTGGCTtga
gi|101488                     : AAACGTTGAAGTATCTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTGTCGTCT-A--CT-------GGT-----TATTGGCTtaa
gi|101507                     : AAACGTAGGAGTATCTTCC--CATGC---AAAT---CTCT-----TTT-T--CT-------GTGCAGTCTATTGGCTtga
gi|101515                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGCTCTTATG---CTCT-----TCT-A--AT-------T-------TATTGGCTtga
gi|101497                     : AAACGTAAGCGTATCTCCC-TCATAA---AAAG---CTGT-----TCT-C--TT-------T-------TACTGGCTtctgattt
gi|101496                     : AAACGT-GGAGTATTTCCC-CCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--Cttttgcttga
gi|101511                     : AAACGTAGAAGTAGCTCCA-TCATAC---AAAG---CCCT-----TCT-T--CT-------T-------TAATGGCTgtcactgtcttttggcttga
gi|101493                     : AAACGAAAAAGTATCTGCC-TCATGC---AAAG---CGCT-----TTT-C--CT-------T-------TACTGGCTtttg
gi|101503                     : AAAC-TATGAGTATCTTTC-TCATAC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------A-------TACTGTCTaatggcttga
gi|101500                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-TCATTC---AAAG---TCCT-----TCG-C--CT-------T-------TACTGGtttggcttga
gi|101505                     : AGATGTAGGAATATTTCCT-TCATAC---AAAG---TTCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTTGCT
gi|101499                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-CCATGC---TATG---CTCT-----TAC-C--CT-------T-------TACTGGCTtttgacttaa
gi|101510                     : AAACGTACGTATATCTCAT-TCACGA---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGCTattagctt
gi|101502                     : AAATGTAGGAGTATCTCCC-TCTTCC---AAAG---ATCT-----TTT-C--GT-------T-------TACTGACTtttgacttaa
gi|101494                     : AAACGTAGGAGTATCTC----CATGC---AAAG---GTCT-----T-T-A--CT-------GGT-----TATTGACTattagcttaa
gi|101504                     : AAACATAGGAGTATATCCG-TCGTGC---AAAG------T-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGtga
gi|101517                     : AAACGCAGGTATATTTCCT-TCATAC---AAAG---CTCT-----TTT-C--CT-------T-------TCCTGGtcttttggcttga
gi|101519                     : AAAAGTAGGATTATCACCC-TCATGT---AAAA---ATCT-------T-C--CT-------T-------TATTGGCTtctttgatttaa
gi|101514                     : AAACGTATGGATACCTCCT-TCATGT---AAAG---CTTT-----TCT-C--TT-------T-------TGCTGACTctcggct
gi|101513                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------CGCTGGCTtttgacttaa
gi|101512                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------T-------CGCTGGCTtttagcttg
gi|101518                     : AAACGTAAG-GT-TTGCCC-TCATGC---AAAA---CTCT-----TCT-TTACT-------GGT-----TATTAACTtttagcttg
gi|101516                     : AAACGTGGGAGTATATACC-TCATGT---AAAA---TTCA-----TCT-T--Ctga
gi|101520                     :  AATATAGGATTATCTCCC-TCATTG---AAGG---CTAT-----TTC-C--CT-------T-------TATCGTCTattaccagctattgcttga
gi|101521                     :   ACCTAGGA-TATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCG-----TAT-C--CT-------G-------TTCTGGCTattggcctga
gi|101522                     :   ACGTAAGAGTCTTTCCT-T-GTGT---AAAG---CTCA-----TTT-C--CT-------T-------TACTGGTTattggtttga
gi|101523                     :     GTAAGAATGTCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCT-----TCT-T--CT-------T-------TAGTGGCTattgttttga
gi|101524                     :     GTAGAAATATATCCC-TCATAC---AAAG---ATCC-----TCC-C--CT-------T-------TATTGGCTattttcttga
gi|101525                     :      TAGCAATATCTCCC-TCATGC---AAAGTTCCCCT-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGCTat
gi|101526                     :       AGGATTATGCCCC-TCATGC---AAGG---CTCT-----TCT-T--CA-------T-------TACTGGTTttt
gi|101527                     :        GGAGTATCTCCT-TCATGC---AAAC---CTCC-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGCTatttgcttg
gi|101528                     :        GGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAT---CTCT-----TCT-A--CT-------T-------TACTGGCTattggcttga
gi|101529                     :         GAATATCTCTC-ATATGC---AAAG---TTCT-----TCT-T--CT-------T-------TACTGGCTatttggcttga
gi|101530                     :         GATTATCTCAC-T-ATGC---AAAG---CTC------TCT-C--CT-------T-------TACTGGCTaatggctt
gi|101531                     :          AATATCTCCC-ACATGC---AAAG---CTCT-----TCT-C--CT-------G-------TACTGGTTa
gi|101532                     :          AGTATCTCCC-TCATGC---AAGA---CTTT-----TCT-C--CT-------T-------TACTGGCTatcggcttaa
gi|101533                     :           GTATCTCTC-TTATGC---AAAG---CTCT-----TCTAA--CT-------T-------TACTGGCT
gi|101534                     :           GCATCTCCT-TCACGC---AAAG---CTCT-----TCT-A--CT-------T-------TAattgcattga
gi|101535                     :                  CT-TCATGC---AAAG---CTCT-----TTT-C--CT-------T-------T-TCGGCTcagggttttggtttga





Alignments
lowQualScore                  :                    0      111    111       0  0 11 222222        
lowQualScore                  :                    .      ...    ...       .  . .. ......        
lowQualScore                  :                    8      333    333       8  8 11 333333        
consensus                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
Reference ( family-400 )      : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101484                     : AAACGTAGGAGTATTTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CCTT--T------TACTTGCT
gi|101485                     : AAATATAGGAGTACCTCCC-TCATGC----AAG---CTCTTCT-CT-T--T------TACTGGCTattggtttga
gi|101486                     : AAACGTAAGGATATCTCCCCTCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TTCTAACTattggcttga
gi|101487                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TATTGGCTattggcttga
gi|101488                     : AAACGTTGAAGTATCTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTGT-CG-T--C------TACTGGTT
gi|101489                     : AAACATAGGAGTACCTCCC-CCATGC---AAA----CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGattggcttga
gi|101490                     : AAACG-AGGAGTATCTCCC-TCCTGC---AAAG---CTCTCCT-CC-T--T------TAATGGCTgtattggcttaa
gi|101491                     : AAACGTAGGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CCATTCT-CC-T--G------TAATGGCTatggctggtggcttga
gi|101492                     : AAATGTTGGAGTATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGtttggtttga
gi|101493                     : AAACGAAAAAGTATCTGCC-TCATGC---AAAG---CGCTTTT-CC-T--T------TACTGGCTattttggtttga
gi|101494                     : AAACGTAGGAGTATCTC----CATGC---AAAG---GTCTT-T-AC-TGGT------TATTGACTaatggcttga
gi|101495                     : AAATATAGGAGTATCTCAC-TCATGC---ATAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGtga
gi|101496                     : AAACGT-GGAGTATTTCCC-CCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-G--T------CACTGTCTattttgacttga
gi|101497                     : AAACGTAAGCGTATCTCCC-TCATAA---AAAG---CTGTTCT-CT-T--T------TACTGGCTtttggcttga
gi|101498                     : AAACGTCGGAGTATCCCCC-TCATAC---AAAG---CTGTCCT-CC-T--T------TACTGGttttgcttga
gi|101499                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-CCATGC---TATG---CTCTTAC-CC-T--T------TACTGGCTacgttggctaga
gi|101500                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-TCATTC---AAAG---TCCTTCG-CC-T--T------TACTGGattagctt
gi|101501                     : AAACGCAGG-GTATTTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTAGCT
gi|101502                     : AAATGTAGGAGTATCTCCC-TCTTCC---AAAG---ATCTTTT-CG-T--T------TACTGACT
gi|101503                     : AAAC-TATGAGTATCTTTC-TCATAC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--A------TACTGTCTattagcttaa
gi|101504                     : AAACATAGGAGTATATCCG-TCGTGC---AAAG------TTCT-CC-T--T------TACTGGtttggcttga
gi|101505                     : AGATGTAGGAATATTTCCT-TCATAC---AAAG---TTCTTCT-CC-T--T------TACTTGCTtcttttggcttga
gi|101506                     : AAACGTAGACGTATCTCCC-TCATAC---AAAG---CTCCTCT-CA-T--G------TTCTGGCTtttgacttaa
gi|101507                     : AAACGTAGGAGTATCTTCC--CATGC---AAAT---CTCTTTT-TC-T--tttggctt
gi|101508                     : AACCGTACGATTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCCTCT-CC-T--T------CATTGACTgtgcagtctattggcttga
gi|101509                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGT---AAAG---CAATTCT-CC----T------TACCGGtttgactt
gi|101510                     : AAACGTACGTATATCTCAT-TCACGA---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101511                     : AAACGTAGAAGTAGCTCCA-TCATAC---AAAG---CCCTTCT-TC-T--T------TAATGGCTtttgacttaa
gi|101512                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttg
gi|101513                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttagcttg
gi|101514                     : AAACGTATGGATACCTCCT-TCATGT---AAAG---CTTTTCT-CT-T--T------TGCTGACTtttagcttg
gi|101515                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGCTCTTATG---CTCTTCT-AA-T--T------TATTGGCTtttgacttaa
gi|101516                     : AAACGTGGGAGTATATACC-TCATGT---AAAA---TTCATCT-TC-A--T------TACCAGCTtctgattt
gi|101517                     : AAACGCAGGTATATTTCCT-TCATAC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--T------TCCTGGattgcttga
gi|101518                     : AAACGTAAG-GT-TTGCCC-TCATGC---AAAA---CTCTT----C-T--T------TACTGGTTtctttgatttaa
gi|101519                     : AAAAGTAGGATTATCACCC-TCATGT---AAAA---ATCT--T-CC-T--T------TATTGGCTattaacttga
gi|101520                     :  AATATAGGATTATCTCCC-TCATTG---AAGG---CTATTTC-CC-T--T------TATCGTCTctcggct
gi|101521                     :   ACCTAGGA-TATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCGTAT-CC-T--G------TTCTGGCTattggcctga
gi|101522                     :   ACGTAAGAGTCTTTCCT-T-GTGT---AAAG---CTCATTT-CC-T--T------TACTGGTTattggtttga
gi|101523                     :     GTAAGAATGTCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-TC-T--T------TAGTGGCTattgttttga
gi|101524                     :     GTAGAAATATATCCC-TCATAC---AAAG---ATCCTCC-CC-T--T------TATTGGCTattttcttga
gi|101525                     :      TAGCAATATCTCCC-TCATGC---AAAGTTCCCCTTCT-CC-T--T------TACTGGCTat
gi|101526                     :       AGGATTATGCCCC-TCATGC---AAGG---CTCTTCT-TC-A--T------TACTGGTTttt
gi|101527                     :        GGAGTATCTCCT-TCATGC---AAAC---CTCCTCT-CC-T--T------TACTGGCTatttgcttg
gi|101528                     :        GGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAT---CTCTTCT-AC-T--T------TACTGGCTattggcttga
gi|101529                     :         GAATATCTCTC-ATATGC---AAAG---TTCTTCT-TC-T--T------TACTGGCTatttggcttga
gi|101530                     :         GATTATCTCAC-T-ATGC---AAAG---CTCT-CT-CC-T--T------TACTGGCTaatggctt
gi|101531                     :          AATATCTCCC-ACATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGTTa
gi|101532                     :          AGTATCTCCC-TCATGC---AAGA---CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGCTatcggcttaa
gi|101533                     :           GTATCTCTC-TTATGC---AAAG---CTCTTCTAAC-T--T------TACTGGCT
gi|101534                     :           GCATCTCCT-TCACGC---AAAG---CTCTTCT-AC-T--T------TACAGGattgcattga
gi|101535                     :                  CT-TCATGC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--TTTCGGCTACTGGCTgttttggtttga





Alignments
lowQualScore                  :                    0      111    111       0  0 11 222222        
lowQualScore                  :                    .      ...    ...       .  . .. ......        
lowQualScore                  :                    8      333    333       8  8 11 333333        
consensus                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
Reference ( family-400 )      : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101484                     : AAACGTAGGAGTATTTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CCTT--T------TACTTGCT
gi|101485                     : AAATATAGGAGTACCTCCC-TCATGC----AAG---CTCTTCT-CT-T--T------TACTGGCTattggtttga
gi|101486                     : AAACGTAAGGATATCTCCCCTCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TTCTAACTattggcttga
gi|101487                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TATTGGCTattggcttga
gi|101488                     : AAACGTTGAAGTATCTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTGT-CG-T--C------TACTGGTT
gi|101489                     : AAACATAGGAGTACCTCCC-CCATGC---AAA----CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGattggcttga
gi|101490                     : AAACG-AGGAGTATCTCCC-TCCTGC---AAAG---CTCTCCT-CC-T--T------TAATGGCTgtattggcttaa
gi|101491                     : AAACGTAGGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CCATTCT-CC-T--G------TAATGGCTatggctggtggcttga
gi|101492                     : AAATGTTGGAGTATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGtttggtttga
gi|101493                     : AAACGAAAAAGTATCTGCC-TCATGC---AAAG---CGCTTTT-CC-T--T------TACTGGCTattttggtttga
gi|101494                     : AAACGTAGGAGTATCTC----CATGC---AAAG---GTCTT-T-AC-TGGT------TATTGACTaatggcttga
gi|101495                     : AAATATAGGAGTATCTCAC-TCATGC---ATAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGtga
gi|101496                     : AAACGT-GGAGTATTTCCC-CCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-G--T------CACTGTCTattttgacttga
gi|101497                     : AAACGTAAGCGTATCTCCC-TCATAA---AAAG---CTGTTCT-CT-T--T------TACTGGCTtttggcttga
gi|101498                     : AAACGTCGGAGTATCCCCC-TCATAC---AAAG---CTGTCCT-CC-T--T------TACTGGttttgcttga
gi|101499                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-CCATGC---TATG---CTCTTAC-CC-T--T------TACTGGCTacgttggctaga
gi|101500                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-TCATTC---AAAG---TCCTTCG-CC-T--T------TACTGGattagctt
gi|101501                     : AAACGCAGG-GTATTTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTAGCT
gi|101502                     : AAATGTAGGAGTATCTCCC-TCTTCC---AAAG---ATCTTTT-CG-T--T------TACTGACT
gi|101503                     : AAAC-TATGAGTATCTTTC-TCATAC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--A------TACTGTCTattagcttaa
gi|101504                     : AAACATAGGAGTATATCCG-TCGTGC---AAAG------TTCT-CC-T--T------TACTGGtttggcttga
gi|101505                     : AGATGTAGGAATATTTCCT-TCATAC---AAAG---TTCTTCT-CC-T--T------TACTTGCTtcttttggcttga
gi|101506                     : AAACGTAGACGTATCTCCC-TCATAC---AAAG---CTCCTCT-CA-T--G------TTCTGGCTtttgacttaa
gi|101507                     : AAACGTAGGAGTATCTTCC--CATGC---AAAT---CTCTTTT-TC-T--tttggctt
gi|101508                     : AACCGTACGATTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCCTCT-CC-T--T------CATTGACTgtgcagtctattggcttga
gi|101509                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGT---AAAG---CAATTCT-CC----T------TACCGGtttgactt
gi|101510                     : AAACGTACGTATATCTCAT-TCACGA---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101511                     : AAACGTAGAAGTAGCTCCA-TCATAC---AAAG---CCCTTCT-TC-T--T------TAATGGCTtttgacttaa
gi|101512                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttg
gi|101513                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttagcttg
gi|101514                     : AAACGTATGGATACCTCCT-TCATGT---AAAG---CTTTTCT-CT-T--T------TGCTGACTtttagcttg
gi|101515                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGCTCTTATG---CTCTTCT-AA-T--T------TATTGGCTtttgacttaa
gi|101516                     : AAACGTGGGAGTATATACC-TCATGT---AAAA---TTCATCT-TC-A--T------TACCAGCTtctgattt
gi|101517                     : AAACGCAGGTATATTTCCT-TCATAC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--T------TCCTGGattgcttga
gi|101518                     : AAACGTAAG-GT-TTGCCC-TCATGC---AAAA---CTCTT----C-T--T------TACTGGTTtctttgatttaa
gi|101519                     : AAAAGTAGGATTATCACCC-TCATGT---AAAA---ATCT--T-CC-T--T------TATTGGCTattaacttga
gi|101520                     :  AATATAGGATTATCTCCC-TCATTG---AAGG---CTATTTC-CC-T--T------TATCGTCTctcggct
gi|101521                     :   ACCTAGGA-TATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCGTAT-CC-T--G------TTCTGGCTattggcctga
gi|101522                     :   ACGTAAGAGTCTTTCCT-T-GTGT---AAAG---CTCATTT-CC-T--T------TACTGGTTattggtttga
gi|101523                     :     GTAAGAATGTCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-TC-T--T------TAGTGGCTattgttttga
gi|101524                     :     GTAGAAATATATCCC-TCATAC---AAAG---ATCCTCC-CC-T--T------TATTGGCTattttcttga
gi|101525                     :      TAGCAATATCTCCC-TCATGC---AAAGTTCCCCTTCT-CC-T--T------TACTGGCTat
gi|101526                     :       AGGATTATGCCCC-TCATGC---AAGG---CTCTTCT-TC-A--T------TACTGGTTttt
gi|101527                     :        GGAGTATCTCCT-TCATGC---AAAC---CTCCTCT-CC-T--T------TACTGGCTatttgcttg
gi|101528                     :        GGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAT---CTCTTCT-AC-T--T------TACTGGCTattggcttga
gi|101529                     :         GAATATCTCTC-ATATGC---AAAG---TTCTTCT-TC-T--T------TACTGGCTatttggcttga
gi|101530                     :         GATTATCTCAC-T-ATGC---AAAG---CTCT-CT-CC-T--T------TACTGGCTaatggctt
gi|101531                     :          AATATCTCCC-ACATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGTTa
gi|101532                     :          AGTATCTCCC-TCATGC---AAGA---CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGCTatcggcttaa
gi|101533                     :           GTATCTCTC-TTATGC---AAAG---CTCTTCTAAC-T--T------TACTGGCT
gi|101534                     :           GCATCTCCT-TCACGC---AAAG---CTCTTCT-AC-T--T------TACAGGattgcattga
gi|101535                     :                  CT-TCATGC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--TTTCGGCTACTGGCTgttttggtttga


blockSeqs                     :                           TCT    TTC            GG TTCGGC
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .  .     
blockSeqs                     :                           .      .              .        


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
finalCons                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT





Alignments
lowQualScore                  :                    0      111    111       0  0 11 222222        
lowQualScore                  :                    .      ...    ...       .  . .. ......        
lowQualScore                  :                    8      333    333       8  8 11 333333        
consensus                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
Reference ( family-400 )      : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101484                     : AAACGTAGGAGTATTTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CCTT--T------TACTTGCT
gi|101485                     : AAATATAGGAGTACCTCCC-TCATGC----AAG---CTCTTCT-CT-T--T------TACTGGCTattggtttga
gi|101486                     : AAACGTAAGGATATCTCCCCTCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TTCTAACTattggcttga
gi|101487                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TATTGGCTattggcttga
gi|101488                     : AAACGTTGAAGTATCTCTC-TCATGC---AAAG---CTCTTGT-CG-T--C------TACTGGTT
gi|101489                     : AAACATAGGAGTACCTCCC-CCATGC---AAA----CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGattggcttga
gi|101490                     : AAACG-AGGAGTATCTCCC-TCCTGC---AAAG---CTCTCCT-CC-T--T------TAATGGCTgtattggcttaa
gi|101491                     : AAACGTAGGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CCATTCT-CC-T--G------TAATGGCTatggctggtggcttga
gi|101492                     : AAATGTTGGAGTATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGtttggtttga
gi|101493                     : AAACGAAAAAGTATCTGCC-TCATGC---AAAG---CGCTTTT-CC-T--T------TACTGGCTattttggtttga
gi|101494                     : AAACGTAGGAGTATCTC----CATGC---AAAG---GTCTT-T-AC-TGGT------TATTGACTaatggcttga
gi|101495                     : AAATATAGGAGTATCTCAC-TCATGC---ATAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGtga
gi|101496                     : AAACGT-GGAGTATTTCCC-CCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-G--T------CACTGTCTattttgacttga
gi|101497                     : AAACGTAAGCGTATCTCCC-TCATAA---AAAG---CTGTTCT-CT-T--T------TACTGGCTtttggcttga
gi|101498                     : AAACGTCGGAGTATCCCCC-TCATAC---AAAG---CTGTCCT-CC-T--T------TACTGGttttgcttga
gi|101499                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-CCATGC---TATG---CTCTTAC-CC-T--T------TACTGGCTacgttggctaga
gi|101500                     : AAACGTAGAAGTATCTCCT-TCATTC---AAAG---TCCTTCG-CC-T--T------TACTGGattagctt
gi|101501                     : AAACGCAGG-GTATTTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTAGCT
gi|101502                     : AAATGTAGGAGTATCTCCC-TCTTCC---AAAG---ATCTTTT-CG-T--T------TACTGACT
gi|101503                     : AAAC-TATGAGTATCTTTC-TCATAC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--A------TACTGTCTattagcttaa
gi|101504                     : AAACATAGGAGTATATCCG-TCGTGC---AAAG------TTCT-CC-T--T------TACTGGtttggcttga
gi|101505                     : AGATGTAGGAATATTTCCT-TCATAC---AAAG---TTCTTCT-CC-T--T------TACTTGCTtcttttggcttga
gi|101506                     : AAACGTAGACGTATCTCCC-TCATAC---AAAG---CTCCTCT-CA-T--G------TTCTGGCTtttgacttaa
gi|101507                     : AAACGTAGGAGTATCTTCC--CATGC---AAAT---CTCTTTT-TC-T--tttggctt
gi|101508                     : AACCGTACGATTATCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCCTCT-CC-T--T------CATTGACTgtgcagtctattggcttga
gi|101509                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGT---AAAG---CAATTCT-CC----T------TACCGGtttgactt
gi|101510                     : AAACGTACGTATATCTCAT-TCACGA---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------TACTGGCT
gi|101511                     : AAACGTAGAAGTAGCTCCA-TCATAC---AAAG---CCCTTCT-TC-T--T------TAATGGCTtttgacttaa
gi|101512                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttg
gi|101513                     : AAACGGCTGAGAATTTCCC-TCATTC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--T------CGCTGGCTtttagcttg
gi|101514                     : AAACGTATGGATACCTCCT-TCATGT---AAAG---CTTTTCT-CT-T--T------TGCTGACTtttagcttg
gi|101515                     : AAACGTAGGAGTATCTCCC-TCATGCTCTTATG---CTCTTCT-AA-T--T------TATTGGCTtttgacttaa
gi|101516                     : AAACGTGGGAGTATATACC-TCATGT---AAAA---TTCATCT-TC-A--T------TACCAGCTtctgattt
gi|101517                     : AAACGCAGGTATATTTCCT-TCATAC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--T------TCCTGGattgcttga
gi|101518                     : AAACGTAAG-GT-TTGCCC-TCATGC---AAAA---CTCTT----C-T--T------TACTGGTTtctttgatttaa
gi|101519                     : AAAAGTAGGATTATCACCC-TCATGT---AAAA---ATCT--T-CC-T--T------TATTGGCTattaacttga
gi|101520                     :  AATATAGGATTATCTCCC-TCATTG---AAGG---CTATTTC-CC-T--T------TATCGTCTctcggct
gi|101521                     :   ACCTAGGA-TATCTCCC-TCGTGC---AAAG---CTCGTAT-CC-T--G------TTCTGGCTattggcctga
gi|101522                     :   ACGTAAGAGTCTTTCCT-T-GTGT---AAAG---CTCATTT-CC-T--T------TACTGGTTattggtttga
gi|101523                     :     GTAAGAATGTCTCCC-TCATGC---AAAG---CTCTTCT-TC-T--T------TAGTGGCTattgttttga
gi|101524                     :     GTAGAAATATATCCC-TCATAC---AAAG---ATCCTCC-CC-T--T------TATTGGCTattttcttga
gi|101525                     :      TAGCAATATCTCCC-TCATGC---AAAGTTCCCCTTCT-CC-T--T------TACTGGCTat
gi|101526                     :       AGGATTATGCCCC-TCATGC---AAGG---CTCTTCT-TC-A--T------TACTGGTTttt
gi|101527                     :        GGAGTATCTCCT-TCATGC---AAAC---CTCCTCT-CC-T--T------TACTGGCTatttgcttg
gi|101528                     :        GGGGTATCTCCC-TCATGC---AAAT---CTCTTCT-AC-T--T------TACTGGCTattggcttga
gi|101529                     :         GAATATCTCTC-ATATGC---AAAG---TTCTTCT-TC-T--T------TACTGGCTatttggcttga
gi|101530                     :         GATTATCTCAC-T-ATGC---AAAG---CTCT-CT-CC-T--T------TACTGGCTaatggctt
gi|101531                     :          AATATCTCCC-ACATGC---AAAG---CTCTTCT-CC-T--G------TACTGGTTa
gi|101532                     :          AGTATCTCCC-TCATGC---AAGA---CTTTTCT-CC-T--T------TACTGGCTatcggcttaa
gi|101533                     :           GTATCTCTC-TTATGC---AAAG---CTCTTCTAAC-T--T------TACTGGCT
gi|101534                     :           GCATCTCCT-TCACGC---AAAG---CTCTTCT-AC-T--T------TACAGGattgcattga
gi|101535                     :                  CT-TCATGC---AAAG---CTCTTTT-CC-T--TTTCGGCTACTGGCTgttttggtttga