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Reference ( gi|70538 )        : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CGC--GGC-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70564                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CGC-G-----GCC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-CC--G-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--
gi|70540                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCA----GA-ATG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---T-TGC--AGG-C--AACA--G-C-C--T-G-CAC-TCCGA-TC-CA-A---TA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--T-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTgagactcctgtcaactaactgt
gi|70542                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---T--GA-----------------AACA--G-C-T--T-G-CAC-TTCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CAA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
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gi|70553                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AC-C-TG---T-AG-GA-CCG----GA-GTG-A-A--AAG-T--T-GT-T--GT-C---CGC-G-----GCC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AAAA--A-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGggtagactttcacctgtcaacatactgt
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gi|70575                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-T-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA---------------------GG---C-CGT--AGT-C--------------------------------------------G-T-CGA-CTG--T--TTCC--CCG--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-gagacccctgtcaacaactgt
gi|70552                      : GGGA-A--T--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----AA-CTG-C-A--A-G-T--T-GT-T--GC-C---CTT-G-----GCC----T---AT-GG---C-CTT--GGG-A--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCtctaccagtcaacaactgtat
gi|70556                      : GGAA-A--A--C-G-T-G-AT----G---T-TG-GA-C-G----GA-GTG-C-A--A-G-CC-T-GT-T--GC-C----------------G---T---A--GG---C-CTG--GGC-A--ACCA--G-C-T--T-GTCAC-TCCG--TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCG--C-A--------T-TACCT----CCA-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70583                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-Gat
gi|70569                      : GGGA-A--A--ACG-T-G-AT----G---T-TG-GA-C-G----GA-GTG-C-A--A-G-CC-T-GT-T--GC-C----------------G---T---A--GG---C-CTG--GGC-A--ACCA--G-C-T--T-GTCAC-TCCG--TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCgagacccctgtcaacaacctgt
gi|70555                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-T-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCC
gi|70559                      : GGAA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---A-TT-GA-CCG----AA-GTG-C-A--A-G-CCTC-GT-TC-GCGC---CAA-G-------CGAT-T---AT-AG---C-CGA--GGG-CAAAACA--G-C-TC-T-T-CAC-TCCGG-T--CA-A---CA-C-G-TCCGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70559                      : GGGA-A--A--CAG-TCGGAC-G-TG---T-TG--A-CCG----GA-GTG-A-AG-A-G-C--T-GT-TTTGC-C---CTC-G-----GCTA---T---A--A----T-CGCTTGGCGCG-AACGAGG-C-T--T-G-CAC-TTCGG-TC-AA-T---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTTC--C-ctctacctccagtca
gi|70558                      : GGAA-A--A--CAG-TCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-A-----GCCctctacctccagtca
gi|70584                      : GGGA-A--A--TAG-TCG-AT-A-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-
gi|70557                      : GGGA-A--A--C---TCG-AT-C-TG---T-TG--A-CCG----GA-ATG-C-A--A-G-A--T-GT-T--GC-C---GAA-------GCCG---T---A--GG---C-CGtttaccccagtcaacaactgtat
gi|70579                      : GGGA-A--A--C---TCG-AT-C-TG---T-TG--A-CCG----GA-ATG-C-A--A-G-A--T-GT-T--GC-C---GAA-------GCCG---T---A--GG---C-Cgcct
gi|70563                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-Gtctaccccagtcaacaactgtat
gi|70562                      : GGGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-G
gi|70561                      : GGGA-A--A--TAG-TCG-AT-A-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-
gi|70576                      : GGCA-A--A--CAG-TAG-AT-C-TGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCA-C-A--A-G-C--T-GT----GC-C---CAA-G------CCG---TGAGA--GG---CACAC--AGT-C--A------------T-G-CAC-TCC
gi|70564                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-C------GG-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CGC--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AACTA-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70540                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AC-C-TA---T-TG-GA-TCG----GA-GTG-C-A--G-G-C--T-GT-T--GC-CTG-CAA--------CC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAT-TCTGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70566                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---TATG-GA-CC-----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-TGCG-GGC-A--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCC-G-TC-CA-A---CA-G-G---CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GG-AT----CC--T-----G-TC--AAC---A-CTGTtgagactcctgtcaacaactgt
gi|70536                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA-C------GG-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CGC--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70565                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AC-C-TA---T-TG-GA-TCG----GA-GTG-C-A--G-G-C--T-GT-T--GC-CTG-CAA--------CC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAT-TCTGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-G-CTtctaccccagtcaacaactgtat
gi|70545                      :  GGA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---TATG-GA-CCG-----A-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-TGCG-GGC-A--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCC-G-TC-CA-A---CA-G-G---CGA-CTG--T--TTCC--C-ctat
gi|70581                      :  GGA-A--A--CAGCTCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--C-GT-tctacccagtcaacaactgtat
gi|70585                      :  GAA-A--A--CAG-TCA-AT-C-TG---T-TG-GA-CTG----gcgagacccctgtcaacaactgt
gi|70567                      :  GGA-A--A--CAGCTCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--C-GT-tgatactcctgtcaacaactgt
gi|70578                      :  GGATA--A--CAG-CTG-TT-T-TG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG---G--A-T-C--T-GT-T--GC-C---CAA-A-----GCAG---G---A--AG---C-TGA--GGG-C--AACA--G-accaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70535                      :   GA-A--A--CAG-TTG-AC-C-TG---T-TG-AA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CGC-G-----GTC----T---AT-GG---C-CTT--GGG-C--AATA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CAA-CTG--T--TTCC--C-tcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70568                      :   GA-A--A--CAG-TTG-AC-C-TG---T-TG-AA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CGC-G-----GTC----T---AT-GG---C-CTT--GGG-C--AATA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CAA-CTG--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70556                      :   GA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA--CG----GA-GTGAC-A--A-G-C--TGGT-T--GC-C---C-A-G-----GCC----T---A-----------C--GG--C--AACAG-G-C-T--T-G-CAC-TCC-G-TC-CA-A---CA-----T-C-A-C-G--T--TTTC--C-at
gi|70569                      :   GA-A--A--CAG-TCG-AT-C-TG---T-TG-GA--CG----GA-GTGAC-A--A-G-C--TGGT-T--GC-C---C-A-G-----GCC----T---A-----------C--GG--C--AACAG-G-C-T--T-G-CAC-TCC-G-TC-CA-A---CA-----T-C-A-CGT--T--TTCC--C-gcattacctccaagtcaacaactgtat
gi|70539                      :              G-TCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A----G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70570                      :              G-TCG-AC-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A----G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCC----T---AC-GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CAGTgatactcctgtcaacaactgt
gi|70553                      :                 CG-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-T--T-TT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CGC--GGA-C--AACA--A-CTT--T-T-CAC-TCCGG-TC-CT-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-at
gi|70571                      :                  G-AT-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-T--T-TT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CGC--GGA-C--AACA--A-CTT--T-T-CAC-TCCGG-TC-CT-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70554                      :                   -AT-T-TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CCC--GGG-C--AACA--G-C-TTCT-G-CAC-TCCGG-TC-C--A---CATG-G-T-CAA-CT---T--TTCC--C-
gi|70572                      :                     T-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-A-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GACG---T---A--GG--------------C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-
gi|70573                      :                     T-C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---TA----------CG---T-----------C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-T-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-
gi|70572                      :                      -C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---TA----------CG---T-----------C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-T-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-
gi|70573                      :                      -C-TG---T-TG-GA-CCG----GA-GTG-A-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GACG---T---A--GG--------------C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-a
gi|70574                      :                        -TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--GC-C---CAA-G-----GCCG---T---A--GG---C-CCC--GGG-C--AACA--G-C-TTCT-G-CAC-TCCGG-TC-C--A---CATG-G-T-CAA-CT---T--TTCC--C-GGT------A-GA-CTTTCACC--T-----G-TC--AAC-ATA-CTGTa
gi|70576                      :                                        G----GA-GTG-C-A--T-GAC--T-GTGT--GC-CTCTCAC-G-----GCT----T---G--GG---C--------------ACA--G-C-T--T-G-TGCTTTCGG-TCGCA-AGC-CA-G-A-T-CTA-CTG--T--TTGC--C---------------------TC--T-----G-TC--AA
gi|70577                      :                                         ----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--TC-C---CAA-G-----GCCA---T---A--GG---C-CAA--GGG-C--AACA--A-C-T--T-G-CAG-TTCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--A--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtgcccatcaacgaatctggtat
gi|70552                      :                                         ----GA-GTG-C-A--A-G-C--T-GT-T--TC-C---CAA-G-----GCCA---T---A--GG---C-CAA--GGG-C--AACA--A-C-T--T-G-CAG-TTCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--A--TTCC--C-at
gi|70557                      :                                                                                 A-G-----GCCGGCCT---AC-GG---C-TTC--GGC----AACA--T-C-T--T-G-CAT-TCCGG-T--CA-A---CA-G-A-T-CGA---G--T--TTCC--C-
gi|70579                      :                                                                                  -G-----GCC----T---AC-GG---C-TTC--GGC----AACA--T-C-T--T-G-CAT-TCCGG-T--CA-A---CA-G-A-T-CGA---G--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70580                      :                                                                                                     --GG---C-TTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTTC--C-G--------A-GA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-TTGTat
gi|70575                      :                                                                                                 ctac--GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-A-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-T-------------CTA---CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70555                      :                                                                tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactac--GG---C-CTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-A-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-at
gi|70558                      :                                                                                                     --GG---C-TTT--GGG-C--AACA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGA-CTG--T--TTTC--C-
gi|70581                      :                                                                                                                           ACG--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGAGCTG--T--TTCCG-C-G--------A-GA-CC----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70567                      :                                                                                                                           ACG--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-G-T-CGAGCTG--T--TTCC--
gi|70582                      :                                                                                                                            CA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CC----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70583                      :                                                                                                                            CA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-G--------A-GA-CC----CC--T-----G-TC--AAC-A-ACCTGT
gi|70563                      :                                                                                                                            CA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70562                      :                                                                                                                            CA--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-G-A-T-CGA-CTG--T--TTCC--C-
gi|70584                      :                                                                                                                             A--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-T-A-T-CGA-CTA--T--TTCC--C-T--------T-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70561                      :                                                                                                                             A--G-C-T--T-G-CAC-TCCGG-TC-CA-A---CA-T-A-T-CGA-CTA--T--TTCC--C-at
gi|70567                      :                                                                                                                                     --T-G-CAA-GCCGT-AC-CA-A---CA-A-GAT-AGA-CTG--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                     ggaaacagctcgacctgttggaccggagCAG-TC-CA-A---CA-G-A-T-TGA-CTG--T--TTTC--T-G--------A-TA-CT----CC--T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                         GA-CTG--T--TTCC--C-T--------C-TA-CC----CC--A-----G-TC--AAC-A-A-CTG





Alignments
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lowQualScore                  :                                          . .. ..   .     .   ... .  .  .   ....  .    .   . ..    .  .     .....  ..  .. . .    ..    .. .  .  . . ..  . .....     ....  . . .  .  . . .  .   .    .. . ........  . ......   .... ...... ... .  .. ....  . . .    
lowQualScore                  :                                          1 55 11   2     0   555 9  9  9   9999  9    8   9 11    9  9     77777  33  66 0 6    11    55 9  7  7 8 11  7 22222     8888  7 9 9  7  9 3 9  9   9    22 9 22222222  9 888888   1111 666666 777 2  77 7777  2 2 2    
consensus                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACC----C------C--NG-TC--A----AC-A-A-CTGT
Reference ( family-398 )      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCNCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACC----C------C--NG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70535                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GC--CA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-T-CA-AC-A-G-GT-CAA-CTGT--T-T--------C
gi|70536                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-Ctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GG-CCGCG-----GC--C---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-TCCCCTTTACC-CC--A-GATCAA--C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTctttaccccagatcaaccagtcaacaactgtat
gi|70538                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
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gi|70540                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-C-----ACTCC----GA-T-C-CA-AT-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-TG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-C--TGTT----TCAA----------CG-------GCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----CCATATGC--AG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70542                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTTC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CAA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
gi|70543                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCT----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GT-CC--------GC----------GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----CCTCC----AG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-C-A-CTGT
gi|70544                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CTG----GA-GGGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG-----------CGGAC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCA----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-GTGTat
gi|70545                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC-----G-T-C-CA-AC-A-G-G--CGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70546                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTGG--T-TG-GAACCG----GA-GTGC-AAGTC--TGTT-G-----------------A--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-CACA-AC-A-GAAT-CGC-CTGTTAT-T--------CC-CT--T-TACC----C------C--AGTTC--A----AC-A-A-CTGTtctacccagtcaacaactgtat
gi|70547                      :                                      GGGA-ATAA--CAG-GCGATTCTG---T-TGTGA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--C---T-A-T--------C--A-AC-AGAC-T--TG-C-----ACTCC----GG-TTC-CA-ACCA-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--AGGACC----C------C--TG-TCAAA----AC-A-A-CTGTat
gi|70548                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGAC--CGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GGCT-C-CACAC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70549                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGAC--CGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GGCT-C-CACAC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CA--A-GACC----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTtctaacctcccacgtcaacaactgt
gi|70550                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GC--CA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C------CTCC----GC-T-C-CA-AC-AGG-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70551                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GC--CA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C------CTCC----GC-T-C-CA-AC-AGG-AT-CGA-CTGT--T-TC-------CC-CG--A-G-CT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTtaccgccagtcacaaactgtat
gi|70552                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GC--CA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-C-----AGTTC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGA--T-T--------CC-C
gi|70553                      :                                                      CGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-C-----ACTCC----GG-T-C-CT-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70554                      :                                                        AT-TTG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-C-----ACTCC----GG-T-C-C--AC-ATG-GT-CAA-CT-T--T-T--------CC-C
gi|70555                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--C
gi|70556                      :                                      GGAA-A--A--C-G-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C--------------G--T-A-GGCCT-GGGC--A-ACCAG-C-T--TGTC-----ACTCC----G--T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CG-CA--T-TACC----T------CCAAG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70557                      :                                      GGGA-A--A--C---TCGAT-CTG---T-TG--A-CCG----GA-ATGC-AAG-A--TGTT-GC-CGAA------GC--CG--T-A-GGCCat
gi|70558                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAA-----GC--Cggcct
gi|70559                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG---------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-C-----ACTCC----GG-T---CA-AC-A-C-GTCCGA-CTGT--T-T--------CC-C
gi|70560                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG---------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-C-----ACTCC----GG-T---CA-AC-A-C-GTCCGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GA-C----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTctctacctccagtca
gi|70561                      :                                      GGGA-A--A--TAG-TCGAT-ATG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--T
gi|70562                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70563                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70564                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----ACTA-A-CTGT
gi|70565                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-C-----ACTCC----GA-T-C-CA-AT-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-
gi|70566                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC-----G-T-C-CA-AC-A-G-G--CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GGAT----C------C--TG-TC--A----AC---A-CTGTtctaccccagtcaacagctctat
gi|70567                      :                                       GGA-A--A--CAGCTCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--CGT
gi|70567                      :                                                                                                                                                    --TG-C-----AAGCC----GT-A-C-CA-AC-AAG-AT-AGA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70568                      :            ggaaacagctcgacctgttggaccggagGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-AA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCGCG-----GT--C---T-ATGGCCTTGGGC--A-AT-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CAA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
gi|70569                      :                                      GGGA-A--A--ACG-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C--------------G--T-A-GGCCT-GGGC--A-ACCAG-C-T--TGTC-----ACTCC----G--T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------Cat
gi|70570                      :                                                   G-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--C---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CAGT
gi|70571                      :                                                       GAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-C-----ACTCC----GG-T-C-CT-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
gi|70572                      :                                                         T-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GA--CG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70573                      :                                                          -CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GA--CG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-A
gi|70574                      :                                                            TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-C-----ACTCC----GG-T-C-C--AC-ATG-GT-CAA-CT-T--T-T--------CC-CGGTA-GACTTTCAC------C--TG-TC--A----AC-ATA-CTGT
gi|70575                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GC--CG--T-A-GTCGTCG-------AC-TG-T-T--TC-CCCGAGACTCC----TG-T---CA-AC-A-
gi|70575                      :                                                                                                                            -GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-A-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-C-------TCTA--C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTtctaccagtcaacaactgtat
gi|70576                      : tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactacGGCA-A--A--CAG-TAGAT-CTGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCAC-AAG-C--TGT--GC-CCAAG------C--CG--T-G-AG----AGGC--ACAC-AGTC-A--TG-C-----ACTCC----at
gi|70577                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GC--CA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-C-----AGTTC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGA--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70578                      :                                       GGATA--A--CAG-CTGTT-TTG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG--GAT-C--TGTT-GC-CCAAA-----GC--AG--G-A-AGCTGAGGGC--A-AC-AG-at
gi|70578                      :                                                                                           -C--TGTT-GC-CCTCA-----GCTTCC--T----GCTTTGGGC--A-AC-AG-A-T--C--C-----A-TCGAGGGGG-T-C-AA-AC-A-A-AA-CAG-CTGT--TAT--------CCTCG--A-A--C----C------C--AG-TC--AATATAT-A-A-CTGTtcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70579                      :                                                                                                           G-----GC--C---T-ACGGCTTCGG-C--A-AC-AT-C-T--TG-C-----ATTCC----GG-T-C--A-AC-A-G-AT-CGA---GT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
gi|70580                      :                                                                                                                            -GGCTTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGA-CTGT--T-T--------TC-CG--A-GACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-TTGTat
gi|70581                      :                                                                                                                                      ctac-AC-GG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-GT-CGAGCTGT--T-T--------CCGCG--A-GACC----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70582                      :                                                                                                                                            C-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACC----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70583                      :                                                                                                                                            C-AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-G-AT-CGA-CTGT--T-T--------CC-CG--A-GACC----C------C--TG-TC--A----AC-A-ACCTGT
gi|70584                      :                                                                                                                                             -AG-C-T--TG-C-----ACTCC----GG-T-C-CA-AC-A-T-AT-CGA-CTAT--T-T--------CC-CT--T-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                                                                   C----AG-T-C-CA-AC-A-G-AT-TGA-CTGT--T-T--------TC-TG--A-TACT----C------C--TG-TC--A----AC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                                             GA-CTGT--T-T--------CC-CT--C-TACC----C------C--AG-TC--A----AC-A-A-CTG





Alignments
lowQualScore                  :                                          1 11 33   2     1   555 1  1  0   1111  0    1   0 44    1  1     44444    44 2 4    44    44 0  1  1 1 44  1        1 0 0  1  0 1 0 2 1   1    11  44444444  0 4444444   6666 333333 222 1  11   1 1 1    
lowQualScore                  :                                          . .. ..   .     .   ... .  .  .   ....  .    .   . ..    .  .     .....    .. . .    ..    .. .  .  . . ..  .        . . .  .  . . . . .   .    ..  ........  . .......   .... ...... ... .  ..   . . .    
lowQualScore                  :                                          1 55 11   2     0   555 9  9  9   9999  9    8   9 22    9  9     77777    66 0 7    33    55 9  7  7 7 00  7        7 9 9  7  9 7 9 7 8   7    22  00000000  9 9999999   3333 777777 888 3  88   3 3 3    
consensus                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGT
Reference ( family-398 )      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----C------C--NG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70535                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------C
gi|70536                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-tctaccccagtcaacaactgtat
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GG-CCGCG-----GCC---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TTCCCCTTTACC-C-C--A-GATCAA--C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGTctttaccccagatcaaccagtcaacaactgtat
gi|70538                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70539                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA--------------------C-G--A-TACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70540                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-T-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-C--TGTT----TCAA--------CG-------GCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CCATATGC--AG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccatatgcagtcaacaactgtat
gi|70542                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70543                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCT----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GT-CC--------GC--------GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CCCTCCAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-C-A-CTGT
gi|70544                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CTG----GA-GGGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG-----------CGGAC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCAGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-GTGTat
gi|70545                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70546                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTGG--T-TG-GAACCG----GA-GTGC-AAGTC--TGTT-G---------------A--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-CACA-AC-A-GAA-T-CGC-CTGTTATT--------CC-C-T--T-TACC----C------C--AGTTC--AAC-A-A-CTGTtctacccagtcaacaactgtat
gi|70547                      :                                      GGGA-ATAA--CAG-GCGATTCTG---T-TGTGA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC---T-A-T--------C--A-AC-AGAC-T--TG-CACTCCGG-TTC-CA-ACCA-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--AGGACC----C------C--TG-TCAAAAC-A-A-CTGTat
gi|70548                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70549                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-A--A-GACC----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaacctcccacgtcaacaactgt
gi|70550                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70551                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TTC-------CC-C-G--A-G-CT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTtaccgccagtcacaaactgtat
gi|70552                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-
gi|70553                      :                                                      CGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70554                      :                                                        AT-TTG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-
gi|70555                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC
gi|70556                      :                                      GGAA-A--A--C-G-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CG-C-A--T-TACC----T------CCAAG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70557                      :                                      GGGA-A--A--C---TCGAT-CTG---T-TG--A-CCG----GA-ATGC-AAG-A--TGTT-GC-CGAA------GCCG--T-A-GGCCGat
gi|70558                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCCgcct
gi|70559                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70560                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GA-C----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTctctacctccagtca
gi|70561                      :                                      GGGA-A--A--TAG-TCGAT-ATG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--T
gi|70562                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70563                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70564                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AACTA-A-CTGT
gi|70565                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-
gi|70566                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GGAT----C------C--TG-TC--AAC---A-CTGTtctaccccagtcaacagctctat
gi|70567                      :                                                                                                                                        -AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CC-
gi|70567                      :                                                                                                                                                  --TG-CAAGCCGT-A-C-CA-AC-A-A-GAT-AGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70568                      :          ggaaacagctcgacctgttggaccggagGGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------Cat
gi|70569                      :                                      GGGA-A--A--ACG-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------Ctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70570                      :                                                   G-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CAGT
gi|70571                      :                                                       GAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70572                      :                                                         T-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70573                      :                                                          -CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70574                      :                                                            TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-GGTA-GACTTTCAC------C--TG-TC--AAC-ATA-CTGTa
gi|70575                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCA---------------A-GGCCGTAG-----------------------------T-C-----------G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-CCG--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-
gi|70575                      :                                                                                                                          -GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-A-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C--------TCTA--C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccagtcaacaactgtat
gi|70576                      : tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactacGGCA-A--A--CAG-TAGAT-CTGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCAC-AAG-C--TGT--GC-CCAAG------CCG--T-G-AG----AGGC--ACAC-AGTC-A--TG-CACTCCat
gi|70577                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70578                      :                                       GGATA--A--CAG-CTGTT-TTG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG--GAT-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCAG--G-A-AGCTGAGGGC--A-AC-AG-at
gi|70579                      :                                                                                                           G-----GCC---T-ACGGCTTCGG-C--A-AC-AT-C-T--TG-CATTCCGG-T-C--A-AC-A-G-A-T-CGA---GT--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGTtcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70580                      :                                                                                                                          -GGCTTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------TC-C-G--A-GACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-TTGTat
gi|70581                      :                                                                                                                                    ctac-AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CCGC-G--A-GACC----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70582                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70583                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----C------C--TG-TC--AAC-A-ACCTGT
gi|70584                      :                                                                                                                                           -AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-T-A-T-CGA-CTAT--TT--------CC-C-T--T-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                                                            CAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-TGA-CTGT--TT--------TC-T-G--A-TACT----C------C--TG-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                                   GA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----C------C--AG-TC--AAC-A-A-CTG





Alignments
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lowQualScore                  :                                          . .. ..   .     .   ... .  .  .   ....  .    .   . ..    .  .     .....    .. . .    ..    .. .  .  . . ..  .        . . .  .  . . . . .   .    ..  ........  . ......    ....  ....... .  ..   . . .    
lowQualScore                  :                                          1 55 00   2     0   555 9  9  9   9999  9    8   9 22    9  9     77777    66 0 7    33    55 9  7  7 7 00  7        7 9 9  7  9 7 9 7 8   7    22  11111111  0 888888    7777  7777777 3  88   3 3 4    
consensus                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
Reference ( family-398 )      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70535                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------C
gi|70536                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-tctaccccagtcaacaactgtat
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GG-CCGCG-----GCC---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TTCCCCTTTACC-C-C--A-GATCAA--CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctttaccccagatcaaccagtcaacaactgtat
gi|70538                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
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gi|70540                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-T-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-C--TGTT----TCAA--------CG-------GCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CCATATGCAG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccatatgcagtcaacaactgtat
gi|70542                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
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gi|70544                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CTG----GA-GGGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG-----------CGGAC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCAGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-GTGTat
gi|70545                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70546                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTGG--T-TG-GAACCG----GA-GTGC-AAGTC--TGTT-G---------------A--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-CACA-AC-A-GAA-T-CGC-CTGTTATT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----GTTC--AAC-A-A-CTGTtctacccagtcaacaactgtat
gi|70547                      :                                      GGGA-ATAA--CAG-GCGATTCTG---T-TGTGA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC---T-A-T--------C--A-AC-AGAC-T--TG-CACTCCGG-TTC-CA-ACCA-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--AGGACC----CC-T-----G-TCAAAAC-A-A-CTGTat
gi|70548                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70549                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-A--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaacctcccacgtcaacaactgt
gi|70550                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
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gi|70552                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-
gi|70553                      :                                                      CGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70554                      :                                                        AT-TTG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-
gi|70555                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC
gi|70556                      :                                      GGAA-A--A--C-G-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CG-C-A--T-TACC----TC-CAA---G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70557                      :                                      GGGA-A--A--C---TCGAT-CTG---T-TG--A-CCG----GA-ATGC-AAG-A--TGTT-GC-CGAA------GCCG--T-A-GGCCGat
gi|70558                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCCgcct
gi|70559                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70560                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GA-C----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctctacctccagtca
gi|70561                      :                                      GGGA-A--A--TAG-TCGAT-ATG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--T
gi|70562                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70563                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70564                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AACTA-A-CTGT
gi|70565                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-
gi|70566                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GGAT----CC-T-----G-TC--AAC---A-CTGTtctaccccagtcaacagctctat
gi|70567                      :                                                                                                                                        -AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CC-
gi|70567                      :                                                                                                                                                  --TG-CAAGCCGT-A-C-CA-AC-A-A-GAT-AGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70568                      :          ggaaacagctcgacctgttggaccggagGGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------Cat
gi|70569                      :                                      GGGA-A--A--ACG-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------Ctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70570                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-C
gi|70571                      :                                                       GAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccagtcaacaacagtat
gi|70572                      :                                                         T-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70573                      :                                                          -CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70574                      :                                                            TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-GGTA-GACTTTCACC-T-----G-TC--AAC-ATA-CTGTa
gi|70575                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCA---------------A-GGCCGTAG-----------------------------T-C-----------G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-CCG--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-
gi|70575                      :                                                                                                                          -GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-A-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----A--------G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccagtcaacaactgtat
gi|70576                      : tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactacGGCA-A--A--CAG-TAGAT-CTGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCAC-AAG-C--TGT--GC-CCAAG------CCG--T-G-AG----AGGC--ACAC-AGTC-A--TG-CACTCCat
gi|70577                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70578                      :                                       GGATA--A--CAG-CTGTT-TTG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG--GAT-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCAG--G-A-AGCTGAGGGC--A-AC-AG-at
gi|70579                      :                                                                                                           G-----GCC---T-ACGGCTTCGG-C--A-AC-AT-C-T--TG-CATTCCGG-T---CA-AC-A-G-A-T-CGA---GT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70580                      :                                                                                                                          -GGCTTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------TC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-TTGTat
gi|70581                      :                                                                                                                                    ctac-AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CCGC-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70582                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70583                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-ACCTGT
gi|70584                      :                                                                                                                                           -AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-T-A-T-CGA-CTAT--TT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                                                            CAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-TGA-CTGT--TT--------TC-T-G--A-TACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                                   GA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTG





Alignments
lowQualScore                  :                                          1 11 33   2     1   555 1  1  0   1111  0    1   0 44    1  1     44444    44 2 3    44    44 0  1  1 1 44  1        1 0 0  1  0 1 0 2 1   1    11  44444444  1 222222    4444  5555555 1  11   1 1 1    
lowQualScore                  :                                          . .. ..   .     .   ... .  .  .   ....  .    .   . ..    .  .     .....    .. . .    ..    .. .  .  . . ..  .        . . .  .  . . . . .   .    ..  ........  . ......    ....  ....... .  ..   . . .    
lowQualScore                  :                                          1 55 00   2     0   555 9  9  9   9999  9    8   9 22    9  9     77777    66 0 7    33    55 9  7  7 7 00  7        7 9 9  7  9 7 9 7 8   7    22  11111111  0 888888    7777  7777777 3  88   3 3 4    
consensus                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
Reference ( family-398 )      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70535                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------C
gi|70536                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-tctaccccagtcaacaactgtat
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GG-CCGCG-----GCC---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TTCCCCTTTACC-C-C--A-GATCAA--CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctttaccccagatcaaccagtcaacaactgtat
gi|70538                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70539                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA--------------------C-G--A-TACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70540                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-T-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-C--TGTT----TCAA--------CG-------GCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CCATATGCAG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccatatgcagtcaacaactgtat
gi|70542                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70543                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCT----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GT-CC--------GC--------GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CCCTCCAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-C-A-CTGT
gi|70544                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CTG----GA-GGGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG-----------CGGAC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCAGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-GTGTat
gi|70545                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70546                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTGG--T-TG-GAACCG----GA-GTGC-AAGTC--TGTT-G---------------A--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-CACA-AC-A-GAA-T-CGC-CTGTTATT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----GTTC--AAC-A-A-CTGTtctacccagtcaacaactgtat
gi|70547                      :                                      GGGA-ATAA--CAG-GCGATTCTG---T-TGTGA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC---T-A-T--------C--A-AC-AGAC-T--TG-CACTCCGG-TTC-CA-ACCA-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--AGGACC----CC-T-----G-TCAAAAC-A-A-CTGTat
gi|70548                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70549                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-A--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaacctcccacgtcaacaactgt
gi|70550                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70551                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TTC-------CC-C-G--A-G-CT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtaccgccagtcacaaactgtat
gi|70552                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-
gi|70553                      :                                                      CGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70554                      :                                                        AT-TTG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-
gi|70555                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC
gi|70556                      :                                      GGAA-A--A--C-G-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CG-C-A--T-TACC----TC-CAA---G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70557                      :                                      GGGA-A--A--C---TCGAT-CTG---T-TG--A-CCG----GA-ATGC-AAG-A--TGTT-GC-CGAA------GCCG--T-A-GGCCGat
gi|70558                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCCgcct
gi|70559                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70560                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GA-C----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctctacctccagtca
gi|70561                      :                                      GGGA-A--A--TAG-TCGAT-ATG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--T
gi|70562                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70563                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70564                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AACTA-A-CTGT
gi|70565                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-
gi|70566                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GGAT----CC-T-----G-TC--AAC---A-CTGTtctaccccagtcaacagctctat
gi|70567                      :                                                                                                                                        -AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CC-
gi|70567                      :                                                                                                                                                  --TG-CAAGCCGT-A-C-CA-AC-A-A-GAT-AGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70568                      :          ggaaacagctcgacctgttggaccggagGGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------Cat
gi|70569                      :                                      GGGA-A--A--ACG-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------Ctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70570                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-C
gi|70571                      :                                                       GAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccagtcaacaacagtat
gi|70572                      :                                                         T-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70573                      :                                                          -CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70574                      :                                                            TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-GGTA-GACTTTCACC-T-----G-TC--AAC-ATA-CTGTa
gi|70575                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCA---------------A-GGCCGTAG-----------------------------T-C-----------G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-CCG--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-
gi|70575                      :                                                                                                                          -GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-A-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----A--------G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccagtcaacaactgtat
gi|70576                      : tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactacGGCA-A--A--CAG-TAGAT-CTGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCAC-AAG-C--TGT--GC-CCAAG------CCG--T-G-AG----AGGC--ACAC-AGTC-A--TG-CACTCCat
gi|70577                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70578                      :                                       GGATA--A--CAG-CTGTT-TTG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG--GAT-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCAG--G-A-AGCTGAGGGC--A-AC-AG-at
gi|70579                      :                                                                                                           G-----GCC---T-ACGGCTTCGG-C--A-AC-AT-C-T--TG-CATTCCGG-T---CA-AC-A-G-A-T-CGA---GT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70580                      :                                                                                                                          -GGCTTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------TC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-TTGTat
gi|70581                      :                                                                                                                                    ctac-AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CCGC-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70582                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70583                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-ACCTGT
gi|70584                      :                                                                                                                                           -AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-T-A-T-CGA-CTAT--TT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                                                            CAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-TGA-CTGT--TT--------TC-T-G--A-TACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                                   GA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTG


blockSeqs                     :                                          T TA AC   G         GTA A  T      CCTC       C     CT    C  G     TGGGG    AT G C    GC    AA    C  A T TC  T        C      C    T   A C   G    TA  CCCCTTTA    GGTA      TTCA  ATATGCA T  AA   T T C
blockSeqs                     :                                          . .  AC   G         GTA A  C      .          C     CT    C  G     TGGGG    AT G T    GC    AA    C  T T TC  T        C      C    T   A C   G    .   C           GAG       .     CAA     .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         GC  .  .      .          .     C     .  .     .        G  . T    TT    A     .  . . C   .        .      .    .   A .   .    .   .           CGA       .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         G   .  .      .          .     C     .  .     .        G  . C    GC    A     .  . . C   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TT        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           AA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           AT        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    AA    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    CC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GA    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GA    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    CC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TT        .     T       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           GA        .     A       .  .    . . .
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    AA    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .           TC        .     .       .  .    . .  
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    GA    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TC    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    TT    .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    C     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    T     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    T     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                          . .  .    .         .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                              .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                              .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                              .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                              .   .  .      .          .     .     .  .     .        .  . .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                              .   .  .      .          .     .     .  .     .             .    .     .     .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
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blockSeqs                     :                                                                            .          .     .                                             .  . . .   .        .      .    .   . .   .    .   .                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .  . . .   .        .      .    .         .                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .  .   .   .        .      .    .                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                    ****
originalCons                  :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
finalCons                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT





Alignments
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lowQualScore                  :                                          . .. ..   .     .   ... .  .  .   ....  .    .   . ..    .  .     .....    .. . .    ..    .. .  .  . . ..  .        . . .  .  . . . . .   .    ..  ........  . ......    ....  ....... .  ..   . . .    
lowQualScore                  :                                          1 55 00   2     0   555 9  9  9   9999  9    8   9 22    9  9     77777    66 0 7    33    55 9  7  7 7 00  7        7 9 9  7  9 7 9 7 8   7    22  11111111  0 888888    7777  7777777 3  88   3 3 4    
consensus                     :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
Reference ( family-398 )      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70535                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------C
gi|70536                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-tctaccccagtcaacaactgtat
gi|70537                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GG-CCGCG-----GCC---T-ACGGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TTCCCCTTTACC-C-C--A-GATCAA--CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctttaccccagatcaaccagtcaacaactgtat
gi|70538                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGCC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70539                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA--------------------C-G--A-TACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70540                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-T-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70541                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TTGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-C--TGTT----TCAA--------CG-------GCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CCATATGCAG-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccatatgcagtcaacaactgtat
gi|70542                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-T-GA----------A-AC-AG-C-T--TG-CACTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70543                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCT----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GT-CC--------GC--------GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CCCTCCAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-C-A-CTGT
gi|70544                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CTG----GA-GGGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG-----------CGGAC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCAGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-GTGTat
gi|70545                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70546                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAC-CTGG--T-TG-GAACCG----GA-GTGC-AAGTC--TGTT-G---------------A--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-CACA-AC-A-GAA-T-CGC-CTGTTATT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----GTTC--AAC-A-A-CTGTtctacccagtcaacaactgtat
gi|70547                      :                                      GGGA-ATAA--CAG-GCGATTCTG---T-TGTGA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC---T-A-T--------C--A-AC-AGAC-T--TG-CACTCCGG-TTC-CA-ACCA-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--AGGACC----CC-T-----G-TCAAAAC-A-A-CTGTat
gi|70548                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70549                      :                                      GGGA-A--AACCAG-T-GAT-CTGGTAT-TG-GA-CCG----GA-GTGCCAAG-C--TGTT-GC-CCAAGTGGGGACCGG-TGA-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGGCT-C-CACAC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-A--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaacctcccacgtcaacaactgt
gi|70550                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70551                      :                                      GGGG-A--A--TAGGTC-AT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-A-G-C--TGT--GC-CCA-------GCCA--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-C-CTCCGC-T-C-CA-AC-A-G-GAT-CGA-CTGT--TTC-------CC-C-G--A-G-CT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtaccgccagtcacaaactgtat
gi|70552                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-
gi|70553                      :                                                      CGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70554                      :                                                        AT-TTG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-
gi|70555                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCC
gi|70556                      :                                      GGAA-A--A--C-G-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CG-C-A--T-TACC----TC-CAA---G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70557                      :                                      GGGA-A--A--C---TCGAT-CTG---T-TG--A-CCG----GA-ATGC-AAG-A--TGTT-GC-CGAA------GCCG--T-A-GGCCGat
gi|70558                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAC-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCCgcct
gi|70559                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-
gi|70560                      :                                      GGAA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---A-TT-GA-CCG----AA-GTGC-AAG-CCTCGTTCGCGCCAAG-------CGATT-ATAGCCGAGGGCAAA-AC-AG-C-TC-TT-CACTCCGG-T---CA-AC-A-C-G-TCCGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GA-C----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTctctacctccagtca
gi|70561                      :                                      GGGA-A--A--TAG-TCGAT-ATG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--T
gi|70562                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70563                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TG
gi|70564                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-C------GG-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AACTA-A-CTGT
gi|70565                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCA----GA-ATGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGTTGCAGGC--A-AC-AG-C-C--TG-CACTCCGA-T-C-CA-AT-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-
gi|70566                      :                                       GGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---TATG-GA-CC-----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCTGCGGGCA-A-AC-AG-C-T--TG-CACTCC-G-T-C-CA-AC-A-G-G---CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GGAT----CC-T-----G-TC--AAC---A-CTGTtctaccccagtcaacagctctat
gi|70567                      :                                                                                                                                        -AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CC-
gi|70567                      :                                                                                                                                                  --TG-CAAGCCGT-A-C-CA-AC-A-A-GAT-AGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTaccaacaagatagactgtttccctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70568                      :          ggaaacagctcgacctgttggaccggagGGGA-A--A--CAG-TTGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TATT-GC-CCAAG-----GCCA--T-A-GACCGCGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-T-CA-AC-A-G-G-T-CAA-CTGT--TT--------Cat
gi|70569                      :                                      GGGA-A--A--ACG-T-GAT---G---T-TG-GA-C-G----GA-GTGC-AAG-CC-TGTT-GC-C------------G--T-A-GGCC-TGGGC--A-ACCAG-C-T--TGTCACTCCG--T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------Ctctaccccagtcaacaactgtat
gi|70570                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C----TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-C
gi|70571                      :                                                       GAT-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-T--TTTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCGCGGAC--A-AC-AA-CTT--TT-CACTCCGG-T-C-CT-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccccagtcaacaacagtat
gi|70572                      :                                                         T-CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70573                      :                                                          -CTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGA-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GACG--T-A--------GGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-
gi|70574                      :                                                            TG---T-TG-GA-CTG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCAAG-----GCCG--T-A-GGCCCCGGGC--A-AC-AG-C-TTCTG-CACTCCGG-T-C-C--AC-ATG-G-T-CAA-CT-T--TT--------CC-C-GGTA-GACTTTCACC-T-----G-TC--AAC-ATA-CTGTa
gi|70575                      :                                      GGGA-A--A--CAG-TCGAT-TTG---T-TG-GA-CCG----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-GC-CCA---------------A-GGCCGTAG-----------------------------T-C-----------G-T-CGA-CTGT--TT--------CC-CCG--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-
gi|70575                      :                                                                                                                          -GGCCTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-A-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----A--------G-TC--AAC-A-A-CTGTtctaccagtcaacaactgtat
gi|70576                      : tgttgacaggagtctcggggaaacagtcgacgactacGGCA-A--A--CAG-TAGAT-CTGGC-T-TGCGA-CCG----AAAGCAC-AAG-C--TGT--GC-CCAAG------CCG--T-G-AG----AGGC--ACAC-AGTC-A--TG-CACTCCat
gi|70577                      :                                                                            ----GA-GTGC-AAG-C--TGTT-TC-CCAAG-----GCCA--T-A-GGCCAAGGGC--A-AC-AA-C-T--TG-CAGTTCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGA--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtctgtcaatgcccatcaacgaatctggtat
gi|70578                      :                                       GGATA--A--CAG-CTGTT-TTG---T-TT-GA-CCCCCTCGA--TG--GAT-C--TGTT-GC-CCAAA-----GCAG--G-A-AGCTGAGGGC--A-AC-AG-at
gi|70579                      :                                                                                                           G-----GCC---T-ACGGCTTCGG-C--A-AC-AT-C-T--TG-CATTCCGG-T---CA-AC-A-G-A-T-CGA---GT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGTtcgaacccagtcaatatataactgtat
gi|70580                      :                                                                                                                          -GGCTTTGGGC--A-AC-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGA-CTGT--TT--------TC-C-G--A-GACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-TTGTat
gi|70581                      :                                                                                                                                    ctac-AC-GG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-G-T-CGAGCTGT--TT--------CCGC-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70582                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70583                      :                                                                                                                                          C-AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-CGA-CTGT--TT--------CC-C-G--A-GACC----CC-T-----G-TC--AAC-A-ACCTGT
gi|70584                      :                                                                                                                                           -AG-C-T--TG-CACTCCGG-T-C-CA-AC-A-T-A-T-CGA-CTAT--TT--------CC-C-T--T-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTGT
gi|70585                      :                                                                                                                                                            CAG-T-C-CA-AC-A-G-A-T-TGA-CTGT--TT--------TC-T-G--A-TACT----CC-T-----G-TC--AAC-A-A-CTGTat
gi|70586                      :                                                                                                                                                                                   GA-CTGT--TT--------CC-C-T--C-TACC----CC-A-----G-TC--AAC-A-A-CTG