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Reference ( gi|121821 )       :  TTGTCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-A-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--G-GTTT-T-TGG
gi|121819                     :  TTGTCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-T-G---T---G--A---A--G---A--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--AT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-GCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--T--G--A-T-A-AG-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121826                     :  TTGCCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GTT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T-----A-A-T-A-C--TGAG--A-A------T--CT-GA-A-G----CC-A--T--AGG-G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--T--G--A---A-AG-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121825                     :  TTGCCCA-AA-------T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--C--T-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A-----A-T-A-AA-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-T--G-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121823                     :  TTGCCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--G--A-----G--G--GGT-A-A---T---A--A---T--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CC-G--G-G----CC-A--T--AG--G---C-T-GCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--T--G--A-T-A-TG-G-T-T---G----CT------A-G-T---G--T-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121822                     :  TTGTCCA-AA--CGTTGT-T-A-T----A-TAG-G-A-----G----T-A-T--G-T--A-C--C--T--GCTCT-G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------TTCCT-G--A-G----CC-A--T--A---G---G-C-TCG-G-ATT----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A---A-AG-G-A-T---G----TT------AGG-T---G--C-T-GGTT-T----A-A--G-GTTT-T-TGGag
gi|121831                     :  TTGCCCA-AA--C----T---G-T----A-T-G-G-A-----TT---G-A-T--G-C--T----C--T--G-----G--G--GGA-A-A---T---G--A---A--G---G--A-----T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CTGG--A-G----CC-A--T--ATAGG---C-T-TCA-GCA-T----G-G-T--G-G-A---GGT--A--G--A-T---AG-G-T-T---G-----T------A-G-T---G--C-T-GG---T----A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121835                     :  TTG-CCA-AA--C----T-T-G-T----AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---GC-A---A--G---G--A--A--C-A-T-A-C-G-T---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--TC-G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---GGC-T-T-TCG-G-A-T------C-T--G-G-A---GGAT-A--G------A-AG-G-T-T---G-----T------A-G-T---GCAC-T-GG-T-A----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121839                     :  TTGCC---AA--C----T-T-G-TTTCAA-T-G---A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-T-A-G---A---------T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--AT-G--A-G----CT-A--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G----T-A-AG-G-A-T--------TT------A-G-TG--G--C-T--G-T-T----A-A--A-GTTT-T-Ta
gi|121837                     :  TTGCCCA-AA--C----T-T-G-TT---A-T-G-G-A-----TT---G-A-T--GGC--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-C---TA--G--A---AATG---G--A--A--T---C-A-T-A-GG--A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AAG-G---C-T-TCGCG-A-T----G---T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G---T---T----TT------A-T-T---C--T-T-GG-T-T----ATA--A-GTTT-T-TGGtggag
gi|121838                     :  TTGCCCACAA--TACT-T-T-G-TG---A-T-G-A-G-----T------A-G--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----TAT---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--AGG----CC-A--T--AAG-A---C-T-TCGTG-A-T----G-C-TG-G-G-A---TGA--A--G--A-T-G-AA-G-T-TC--G----TT------A-G-----G--C-T-GT-C-T----A-A----GTTT-T-TG
gi|121841                     :  TTGCCCA-A--------C-T-G-T----A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----GTTA--GGT-A-AT--T---G--A---AACG---G--A--AT-T-A-C-A-T-A-----A--CTTTAT-T---A-A-A-T-A-CTTT--G--A-A------T--CTAG--A-G----CCTA--T--AGG-G---C-T-GCG-GTA-T----G-C-T----G-A---GGATTC--G--A-T-A-AG-G-T-T---G----TT------
gi|121842                     :   TGCCCA-AAAAC----TCT-G-TC---A-T-G-G-A-----TTCTGGCA-T--GAC--T-T--C--T--G-----A--GAAGGTTA-AC--T---G--A---A--G---A--A--ACTT-A-T-A-T-ACG---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GA-A-A------T--CT-G--A-G----CA-T--T--G---G---C-TCTTG-G-ATT----G-C-T--G-G-A----GA--A--A--C-T-A-AG-G-T-TTG-G----TT------A---T---G----T-GG-T-T----T-A--A-GTCC-T-T
gi|121843                     :    GCCCA-AA--C----TGT-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-TCTG-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-AG--T---G--AGAAA--G---G--A--A--T-A-C-AAT-A-A---AGTC----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-C----CC-A--T--A---GGC-T-T-TTG-G-A-T----G-C-T--G-G-AATTGGA--AAGG--A-A-A-TG-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-TA---A-A--A-GTTT-T-TAGtcctggag
gi|121844                     :    GCCCA-AA--C----T-T---T----A-TTG-G-A-----T----G-AAT--T-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---TT--G--A---A--A---G--A--A--T-A-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----TT-A--A--G---G---C-T-T---G-A------G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-T-T---G----TT------A-G-TCA-G--C-T-GG-T-T----T-A--A-GTTT-T-
gi|121824                     :      CCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-A-G-G-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--A-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--C-A------T--CT-T--G-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A--A--A-T-A-AG-G-A-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-GGGggag
gi|121827                     :  ttccCCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-TT-G-C--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T---T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--ACA------T--CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--T-G-A---GGA--A--G--A-T-ATAG-G-A-T---G----TT------A---T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-ag
gi|121820                     :  ttccCCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--C--T-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A------------A--T-A-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-A-T-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-AAT----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-A-T---G----TA------T-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121829                     :  ttccCCA-AA--T----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--G--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-G-G---A--C----T-TTAAA-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-A----CC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-T-T--G-G-A---GGA--A--G--A-TCA-AG-G-A-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----ag
gi|121830                     :  ttccCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-GCA-----T----G-A-T--G-C--T-T--CACT--G-----G--G--T-T-A-AGA-C---G--AG--A--G---G--ATCA--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---TGA--A--G--A-T-A-AG-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A----GTTT-T-TGG
gi|121845                     : ttgccCCA-AA--C----T-T-G-CC---A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TT-G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--AA-T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-AC-----T--CT-C--A-G----CT-A--T--A---GGCTT-T-TCA-G-A-T----G-C-T--G---A---GGA--A-------T-A-AG---A-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121828                     :     cCCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-A-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--A-----A--G--GGT-G-A---T---T--A---A--G---G--T--A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G----------------------CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---A-T-TCT-G-A-T----G-A-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-A-T---G----TT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121847                     :  ttccCCA-AA--C----T-T-G-C----A-TTG-G-A-----T----G-A-TT-G-CA-T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---TC--G--A---A--G---G--G--A--T-A-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-ATT-G-C--T--G--A-A------T--CT----A-G----CT-A--T--G---G---C-T-TCG-G-A-TG---G-C-T--G-------GGA--AT-G--A-T-A-AG-G-A-T---G----TT------A-GTT---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121834                     :     cCCA-AA--C----T-T-G-T----A-TGG-G-A-----T----G-A-TC-G-C--T-T--C--T--G-----G--GT-GAT-A-A---T---G--A---A--G---------A--T-A-C-A-T-A-G---A--C----T-T---A-G-A-T-A-C--T--G--A-AC-----T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--GCG-A---GGA--T--G--ATT-A-AG-GTACT---G----TT------A---T---G--C-TGGG-T-T----A-A--A-GTTT-TATGGa
gi|121848                     : ttgcaCCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TTGG-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G-----A--T-A-T---T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GAAA-A------T--CT-GA-A-G----CT-A--T--A---G---C-T-GCA-G-A-T----G-C-T----G-A---GG---A--G--A-T-A-GC-G-A-G---G----TT------A-G-T---G--C-T-GGTT-T----A-A--A-GTTT-T-ag
gi|121846                     :     cCCA-AA--C----T---G-C----AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--------G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-AGC--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--A--AT--G---C-T-TCG---A-T----G-C-T--G---A---GGA--A--T--A-T-A-AG---A-T---G----T---------A-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121833                     :     cCCA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-A--A-T-----T--G-----G--G--GGT-A-AA--T---G--A---A--G------A--A--T-A-C-A-T-A-T---A--A----C-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--G-ATT--CC-A--T--AG--G---C-TGTCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG---T--G--A-T-A-AG-G-T-T---G----TT------A-G-T---G--C-TGGG-T-T----A-A--A-GTTT-T-GGGa
gi|121832                     : ttgccCCA-AA--C----T-TTG-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-TT-C--T--G-----G--G----T-A-A---T---G--A------G---G--A--A--T-------T-A-A-------------T---A-A-G---G-C--T--G--A--------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-A-T---G----T---------G-T---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-Ta
gi|121849                     :  ttccCCC-AA--C----T---G-TC---A-T-G-G-A-----T------A-T--G-CCCT-T--C--T--G-----G--G--TGT-A-G---T------A---A--G---G--A--T--A-A-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C----G-G-T---GGA--A--G--A-T-A-AG-T---T---G----T---------A-T---G--C-T-GG---T----A-A--A-GTTT-T-tggag
gi|121852                     :     cCCA-AA--C----TAT-G-A----AAT-G-G-A-----T----G-A-T----C--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-A---T---G--A---A--GA--G--A--A--T-A---A-T-A-G---ATTC----T-T---AGA-A-T-G-C--TT-G--A-A------A--CT-G--A-G----CT-AA-T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G----A--G--ATT-A-AG-G-A-T---G----TTG-----A-G-T---G--C-T-GG-G-TATAAA-A--G-GTTTGT-TG
gi|121861                     :     cCCA-AA--C----T---G-C----A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A---A-T-A-GTAAA-------------A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-A--A-G----CT-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-CTT--G-G-A---TG------G--A-T---AG-G-A-T---ag
gi|121836                     :      CCA-AA--CA---T-T-G-C----A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--TAT--C--T--G-----G--G--G-T-A-A-------G--A---G--G---AT-A--G--T-A-T-A-T---G---A--C----T-----A-A-A-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--AAG----CTTA--T--A---G-------TCG-G-A-T----G-C-T--G-GCA---GGA--A--G--A-T-T-GG-GAA-T---G----TT------C-G-T---G--C-T-GT-T-A----A-A--A-GTTT-T-TGGtat
gi|121863                     :  ttccCTA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-C-A-C---A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AGA-----G--A-T-G-GT-G-C-T---A----TT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121858                     :      CCC-AA--C----T-T-G-CC---A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--CT-T--G-----G--G--GGT-ACA---C---GTTA---A--G---GGTA--A--T-ATT-A-T-C-G---A--C----T-T---A-ATC-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-GCAGTCC-A--A--G---G---CTT-TTG-G-A-T----A-A-T--G-A-A---GGA--A--G--A-T-A-AG-G-AGTTAAG----TT------A-G-----A--C-T-GG-T-T----A-A--ag
gi|121850                     :      CCA-AT--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----TT---G-ACT--G-C--T-T--CA-T--GT----G--G--GGT-A-AA--T---G--A---A--G---G--A--A--T---T-A-TTA-G-----------C-T---A-A-A-T-G-C--TT-G--A-A------T---T-G--A-G----CT-AA-T--G---G---C-T-TTG-G-A-T----G-CCT--G-G-A---GGA--A--G--A-T---AG-G-A-----G----TT------A-G-----G--T----G-T-T----A-A--ATGTTTCT-TGGaagttctcttggag
gi|121855                     :     cCTA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----G----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-C-A-A---A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--G-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---AG---A--G--G-T-A-AG-A----------------------------G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-ag
gi|121840                     :      CCA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--G-A-T-T-T-A-G---A--C----T-T---A-G-A-
gi|121856                     :  ttccCTA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--T--A-----G--T--GAT-C-----T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-CCA-C-A-C---A--C----T-----G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AGA-----G--A-T----GTG-C-T---A----TT------A-G-A---G--A-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121854                     :      CTA-AA--C----G-T-G-C----A-T-G-G-A-----G----G-A-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-C-A-A---T--C----T-T---A-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----TG-T--T--G---G---T-T-TCG-A-A-T----G-C-T--G-G-A---AG---A--G--A-T-A------------------C------A-------G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GATT-T-ag
gi|121860                     :      CCA-AT--C----T-T-G-T----A-A-G-G-A-----T----T-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--T-A-C-ggag
gi|121859                     :      CCA-AA--C----T-T-T-C----A-T-G-G-A-----T----G-T-T--G------T--C--C--G-----G--G--TGT-A-C---T---G--A-----------------------C-T-T-A-G---A---------T---G-A-T-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AAG-G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G
gi|121864                     :      CCA-AA--C----G-T-G-C----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--C-C--T-T--T--T--G-----G--G--AAT-A-A---T---T--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-T-A-atgcgatgttgttag
gi|121862                     :      CCA-AA--C----T-C-T-C----A-T-G-G-A-----T----G-G-T----C--TGT--C--G--G-----G--T--GAT-A-C---T---G--A-----------------------C-T-T-A-G---A--T------------G-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G
gi|121857                     :      CTA-AA--C----T-T-G-C----AAT-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--G--AC-T-A-CCA-C-A-C---A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-ACAA-G----CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AAG--A--G--A-T----G-G-T-T---G----CT------A-T-TAAAG----T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121851                     :        A-AA--C----T-A-GAC----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--T--GGT-A-A---T---A--A---A--G---G--A--A--T-G-T-A-T-A-G---A--C----T-T---A-A-A-T-G----T--G--A-AAAAATCC--CT-GA-A-G----CCTATTT--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GGA--A--G--A-T---AG-G-A-T---G----TT------A-G-T---G--CTT-GG-T-T------A--T-GTTT-T-TGGag
gi|121853                     :     ccaA-AA--C----T-T-G-T----A-T-G-G-A-----T----G-A-T--A-T--T-T--C--G--A-----A--G--GGT-A-A-------G--A---A------G--A--A--TAA-C-A-T-ACG---A--C----T-T---A-A-ATT-A-C--TTGA--A-A------T--TT-G--A-A----AC-A--T--AT--G---C-T-TCT-G-A-TAAGAG-C-TAAG-G-ATT-GGA--AAGA--A-TAA-AG-G-A-T---G----TT------A-G-C------C-T--G-T-T----G-A--G-TTTC-T-ag
gi|121865                     :     ccgA-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C-----G-----G--T--GAT-T-C---T---G--A---A--G---G--A--C--T-A---A-C-A-GC--A--CT---T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----CT-G--T--A---GT--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A-----A--A--G--A-T------G-G-T---GCTTATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T----T-A--G-TTTT-T-TGG
gi|121866                     :        A-AA--C----T-T-G-C----A-T-G-G-AAGG--T----G-G-T--A-A--T-T--C--A--G-----G--T--GAT-T-C---T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-C-A-C---A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A------CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-C----CTC-T--G-T-A---AGA-----G--A-T----G-G-G-C---A----TT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T----A-A--A-GTTT-T-TGGag
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Reference ( family-396 )      : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--NT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121819                     : TTGT-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-T-G---T---G--A---A--G---A--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--AT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-GCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--T--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121820                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--C--T-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A------------A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-A-T-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-AAT----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTA------T-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121821                     : TTGT-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--G-GTTT-T-TGGag
gi|121822                     : TTGT-CC-A--A-A--CGTTGT-T-A---T-A-TAG-G-A-----G----T-A-T--G-T--A-C--C--T--GCTCT-G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------TTCCT-G--A-G----CC-A--T--A---G---G-C-TCG-G-ATT----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A---A-A-G-G--AT--GTT------AGG-T---G--C-T-GGTT-T---A-A--G-GTTT-T-TGG
gi|121823                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--G--A-----G--G--GGT-A-A---T---A--A---T--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CC-G--G-G----CC-A--T--AG--G---C-T-GCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--T--G--A-T-A-T-G-G--TT--GCT------A-G-T---G--T-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121824                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-A-G-G-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--A-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--C-A------T--CT-T--G-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--A--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-GGGag
gi|121825                     : TTGC-CC-A--A-A-------T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--C--T-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A-----A-T-A-A-A-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T--G-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121826                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GTT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T-----A-A-T-A-C--TGAG--A-A------T--CT-GA-A-G----CC-A--T--AGG-G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--T--G--A---A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121827                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-ATT--G-C--T-T--C--T--------G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T---T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--ACA------T--CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--T-G-A---GG-A--A--G--A-T-ATA-G-G--AT--GTT------A---T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-ag
gi|121828                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-A-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--A-----A--G--GGT-G-A---T---T--A---A--G---G--T--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G----------------------CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---A-T-TCT-G-A-T----G-A-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121829                     : TTCC-CC-A--A-A--T----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--G--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TG-G-A--C----T-TTAAA-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-A----CC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-T-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-TCA-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---ag
gi|121830                     : TTGC-CCCA--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-GCA-----T----G-A-T--G-C--T-T--CACT--G-----G--G--T-T-A-AGA-C---G--AG--A--G---G--ATCA--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---TG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T-----A--A-GTTT-T-TGG
gi|121831                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T---G---T-A-T-G-G-A-----TT---G-A-T--G-C--T----C--T--G-----G--G--GGA-A-A---T---G--A---A--G---G--A-----T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CTGG--A-G----CC-A--T--ATAGG---C-T-TCA-GCA-T----G-G-T--G-G-A---GG-T--A--G--A-T---A-G-G--TT--G-T------A-G-T---G--C-T-GG---T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121832                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-TTG---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-TT-C--T--G-----G--G----T-A-A---T---G--A------G---G--A--A--T-------TA-A-----------T---A-A-G---G-C--T--G--A--------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GT---------G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-Tag
gi|121833                     : TTGC-CCCA--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-A--A-T-----T--G-----G--G--GGTAA-A---T---G--A---A------G--A--A--T-A-C-A-TA-T-A--A----C-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--G-ATT--CC-A--T--AG--G---C-TGTCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG----T--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-TGGG-T-T---A-A--A-GTTT-T-GGGtggag
gi|121834                     : TTGCACC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-GGA-----T----G-A-TC-G-C--T-T--C--T--G-----G--GT-GAT-A-A---T---G--A---A--G---------A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-G-A-T-A-C--T--G--A-AC-----T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--GCG-A---GG-A--T--G--ATT-A-A-G-GTACT--GTT------A---T---G--C-TGGG-T-T---A-A--A-GTTT-TATGGa
gi|121835                     : TTGC-C--A--A-A--C----T-T-G---T-AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---GC-A---A--G---G--A--A--C-A-T-A-CG-T-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--TC-G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---GGC-T-T-TCG-G-A-T------C-T--G-G-A---GG-AT-A--G------A-A-G-G--TT--G-T------A-G-T---GCAC-T-GG-T-A---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121836                     : TTCC-CC-A--A-A--CA---T-T-G---C-A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--TAT--C--T--G-----G--G--G-T-A-A-------G--A---G--G---AT-A--G--T-A-T-A-T--G-A--C----T-----A-A-A-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--AAG----CTTA--T--A---G-------TCG-G-A-T----G-C-T--G-GCA---GG-A--A--G--A-T-T-G-G-GA-AT--GTT------C-G-T---G--C-T-GT-T-A---A-A--A-GTTT-T-TGGa
gi|121837                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---TTA-T-G-G-A-----TT---G-A-T--GGC--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-C---TA--G--A---AATG---G--A--A--T---C-A-TA-GGA--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AAG-G---C-T-TCGCG-A-T----G---T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT---TT------A-T-T---C--T-T-GG-T-T---ATA--A-GTTT-T-TGGag
gi|121838                     : TTGC-CC-ACAATA--C----T-T---------T-GTG-A-----T----G-AGTAGG-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----TAT---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--AGG----CC-A--T--AAG-A---C-T-TCGTG-A-T----G-C-TG-G-G-A---TG-A--A--G--A-T-G-A-A-G--TTC-GTT------A-G-----G--C-T-GT-C-T-----A--A-GTTT-T-TG
gi|121839                     : TTGC-C-----A-A--C----T-T-GTTTC-A-A-T-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-TA-G-A---------T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--AT-G--A-G----CT-A--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G----T-A-A-G-G--AT---TT------A-G-TG--G--C-T--G-T-T---A-A--A-GTTT-T-T
gi|121840                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--G-A-T-T-TA-G-A--C----T-T---A-G-A-tggag
gi|121841                     : TTGC-CC-A--A---------C-T-G---T-A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----GTTA--GGT-A-AT--T---G--A---AACG---G--A--AT-T-A-C-A-TA---A--CTTTAT-T---A-A-A-T-A-CTTT--G--A-A------T--CTAG--A-G----CCTA--T--AGG-G---C-T-GCG-GTA-T----G-C-T----G-A---GG-ATTC--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------
gi|121842                     :  TGC-CC-A--A-AAAC----TCT-GT--C-A-T-G-G-A-----TTCTGGCA-T--GAC--T-T--C--T--G-----A--GAAGGTTA-AC--T---G--A---A--G---A--A--ACTT-A-T-A-TACG-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GA-A-A------T--CT-G--A-G----CA-T--T--G---G---C-TCTTG-G-ATT----G-C-T--G-G-A----G-A--A--A--C-T-A-A-G-G--TTTGGTT------A---T---G----T-GG-T-T---T-A--A-GTCC-T-T
gi|121843                     :   GC-CC-A--A-A--C----TGT-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-TCTG-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-AG--T---G--AGAAA--G---G--A--A--T-A-C-AATA-A-AGTC----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-C----CC-A--T--A---GGC-T-T-TTG-G-A-T----G-C-T--G-G-AATTGG-A--AAGG--A-A-A-T-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-TA--A-A--A-GTTT-T-TAGtcctggag
gi|121844                     :   GC-CC-A--A-A--C----T-T-T---A-T-T-G-G-A-----T----G-AAT--T-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---TT--G--A---A--A---G--A--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----TT-A--A--G---G---C-T-T---G-A------G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-TCA-G--C-T-GG-T-T---T-A--A-GTTT-T-
gi|121845                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---CCA-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TT-G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--AA-T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-AC-----T--CT-C--A-G----CT-A--T--A---GGCTT-T-TCA-G-A-T----G-C-T--G---A---GG-A--A-------T-A-A-G----AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121846                     :    C-CC-A--A-A--C----T---G---C-AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--------G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-TAG-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--A--AT--G---C-T-TCG---A-T----G-C-T--G---A---GG-A--A--T--A-T-A-A-G----AT--GT---------A-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121847                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-TTG-G-A-----T----G-A-TT-G-CA-T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---TC--G--A---A--G---G--G--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-ATT-G-C--T--G--A-A------T--CT----A-G----CT-A--T--G---G---C-T-TCG-G-A-TG---G-C-T--G-------GG-A--AT-G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-GTT---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGa
gi|121848                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TTGG-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G-----A--T-A-T---TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GAAA-A------T--CT-GA-A-G----CT-A--T--A---G---C-T-GCA-G-A-T----G-C-T----G-A---GG----A--G--A-T-A-G-C-G--AG--GTT------A-G-T---G--C-T-GGTT-T---A-A--A-GTTT-T-a
gi|121849                     :    C-CC-C--A-A--C----T-G-T---C-A-T-G-G-A-----T------A-T--G-CCCT-T--C--T--G-----G--G--TGT-A-G---T------A---A--G---G--A--T--A-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C----G-G-T---GG-A--A--G--A-T-A-A---G--TT--GT---------A-T---G--C-T-GG---T---A-A--A-GTTT-T-ggag
gi|121850                     :    C-CC-A--A-T--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----TT---G-ACT--G-C--T-T--CA-T--GT----G--G--GGT-A-AA--T---G--A---A--G---G--A--A--TTA-T---TA-G---------C-T---A-A-A-T-G-C--TT-G--A-A------T---T-G--A-G----CT-AA-T--G---G---C-T-TTG-G-A-T----G-CCT--G-G-A---GG-A--A--G--A-T---A-G-G--A---GTT------A-G-----G--T----G-T-T---A-A--ATGTTTCT-TGG
gi|121851                     :    C-CA-A--A-A--C----T-A-GA--C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--T--GGT-A-A---T---A--A---A--G---G--A--A--T-G-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G----T--G--A-AAAAATCC--CT-GA-A-G----CCTATTT--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T---A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--CTT-GG-T-T-----A--T-GTTT-T-TGGag
gi|121852                     :    C-CC-A--A-A--C----TAT-G---A-AAT-G-G-A-----T----G-A-T----C--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-A---T---G--A---A--GA--G--A--A--T-A---A-TA-G-ATTC----T-T---AGA-A-T-G-C--TT-G--A-A------A--CT-G--A-G----CT-AA-T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G-----A--G--ATT-A-A-G-G--AT--GTTG-----A-G-T---G--C-T-GG-G-TATAA-A--A-GGTT-T-ag
gi|121853                     :    C-CG-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--A-T--T-T--C--G--A-----A--G--GGT-A-A-------G--A---A------G--A--A--TAA-C-A-TACG-A--C----T-T---A-A-ATT-A-C--TTGA--A-A------T--TT-G--A-A----AC-A--T--AT--G---C-T-TCT-G-A-TAAGAG-C-TAAG-G-ATT-GG-A--AAGA--A-TAA-A-G-G--AT--GTT------A-G-C------C-T--G-T-T-----G--A-GTTT-C-Tgttgag
gi|121854                     :     -CT-A--A-A--C----G-T-G---C-A-T-G-G-A-----G----G-A-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-CA-A-T--C----T-T---A-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----TG-T--T--G---G---T-T-TCG-A-A-T----G-C-T--G-G-A---AG----A--G--A-T-A--------------C------A-------G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GATT-T-
gi|121855                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----G----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-A-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--G-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---AG----A--G--G-T-A-A-G-A-----------------------G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-ggag
gi|121856                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--T--A-----G--T--GAT-C-----T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-CCA-CA-C-A--C----T-----G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AG-A-----G--A-T-----GTG--CT--ATT------A-G-A---G--A-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121857                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-AAT-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--G--AC-T-A-CCA-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-ACAA-G----CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AA-G--A--G--A-T-----G-G--TT--GCT------A-T-TAAAG----T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121858                     :     -CC-C--A-A--C----T-T-G---CCA-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--CT-T--G-----G--G--GGT-ACA---C---GTTA---A--G---GGTA--A--T-ATT-A-TC-G-A--C----T-T---A-ATC-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-GCAGTCC-A--A--G---G---CTT-TTG-G-A-T----A-A-T--G-A-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--A---GTTA-----A-G-TTAGA--C-T-GG-T-TA--A-A--A-GTTC-T-ag
gi|121859                     :     -CC-A--A-A--C----T-T-T---C-A-T-G-G-A-----T----G-T-T--G------T--C--C--G-----G--G--TGT-A-C---T---G------------------------A-C-T-TA-G-A---------T---G-A-T-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AAG-G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GATG--C--G--A-T-------G--TT--GTT------A-G-cttggag
gi|121860                     :     -CC-A--A-T--C----T-T-G---T-A-A-G-G-A-----T----T-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--T-A-C-
gi|121861                     :     -CC-A--A-A--C----T---G---C-A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A---A-TA-G-----------TAAAA-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-A--A-G----CT-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-CTT--G-G-A---TG-------G--A-T-A-G-G-A--TT--AT
gi|121862                     :     -CC-A--A-A--C----T-C-T---C-A-T-G-G-A-----T----G-G-T----C--TGT--C--G--G-----G--T--GAT-A-C---T---G--A-----------------------C-T-TA-G-A--T------------G-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G
gi|121863                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AG----A--G--A-T-G-G-T-G--CT--ATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121864                     :     -CC-A--A-A--C----G-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--C-C--T-T--T--T--G-----G--G--AAT-A-A---T---T--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-ag
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gi|121866                     :        -A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-AAGG--T----G-G-T--A-A--T-T--C--A--G-----G--T--GAT-T-C---T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A------CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-C----CTC-T--G-T-A---AG-A-----G--A-T-----G-G--GC--ATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
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lowQualScore                  :     9  7 11 8 11 5555 4 8 000 4 2 6 4 6 44444 1111 8 2 88 6 99 6 99 66666666666 11 99   6 8 555 222 99 222 22 222 99 11 55 6 8 6 8  6 6 22 5555 8 888 8 8 6 4 6 11 66 99 8 999999 11  6 55 6 8888  4 77 11 0000000 6 4   6 6 4 3333 8 6 99 8 8 555  1111111 11 6 222 8 8 000 99   111111 9 9 111 22 9 7  7 7 333 9 22 9    9 9   
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Reference ( family-396 )      : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--NT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
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gi|121823                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--G--A-----G--G--GGT-A-A---T---A--A---T--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CC-G--G-G----CC-A--T--AG--G---C-T-GCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--T--G--A-T-A-T-G-G--TT--GCT------A-G-T---G--T-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121824                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-A-G-G-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--A-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--C-A------T--CT-T--G-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--A--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-GGGag
gi|121825                     : TTGC-CC-A--A-A-------T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--C--T-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A-----A-T-A-A-A-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T--G-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121826                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GTT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T-----A-A-T-A-C--TGAG--A-A------T--CT-GA-A-G----CC-A--T--AGG-G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--T--G--A---A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121827                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-ATT--G-C--T-T--C--T--------G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T---T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--ACA------T--CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--T-G-A---GG-A--A--G--A-T-ATA-G-G--AT--GTT------A---T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-ag
gi|121828                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-A-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--A-----A--G--GGT-G-A---T---T--A---A--G---G--T--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G----------------------CT-G--A-G----TC-A--T--AG--G---A-T-TCT-G-A-T----G-A-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121829                     : TTCC-CC-A--A-A--T----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--T--G--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TG-G-A--C----T-TTAAA-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-A----CC-A--T--AG--G---C-T-TCT-G-A-T----G-T-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-TCA-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---ag
gi|121830                     : TTGC-CCCA--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-GCA-----T----G-A-T--G-C--T-T--CACT--G-----G--G--T-T-A-AGA-C---G--AG--A--G---G--ATCA--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G----A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---TG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T-----A--A-GTTT-T-TGG
gi|121831                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T---G---T-A-T-G-G-A-----TT---G-A-T--G-C--T----C--T--G-----G--G--GGA-A-A---T---G--A---A--G---G--A-----T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CTGG--A-G----CC-A--T--ATAGG---C-T-TCA-GCA-T----G-G-T--G-G-A---GG-T--A--G--A-T---A-G-G--TT--G-T------A-G-T---G--C-T-GG---T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121832                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-TTG---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-TT-C--T--G-----G--G----T-A-A---T---G--A------G---G--A--A--T-------TA-A-----------T---A-A-G---G-C--T--G--A--------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GT---------G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-Tag
gi|121833                     : TTGC-CCCA--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-A--A-T-----T--G-----G--G--GGTAA-A---T---G--A---A------G--A--A--T-A-C-A-TA-T-A--A----C-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--G-ATT--CC-A--T--AG--G---C-TGTCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG----T--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-TGGG-T-T---A-A--A-GTTT-T-GGGtggag
gi|121834                     : TTGCACC-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-GGA-----T----G-A-TC-G-C--T-T--C--T--G-----G--GT-GAT-A-A---T---G--A---A--G---------A--T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-G-A-T-A-C--T--G--A-AC-----T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--GCG-A---GG-A--T--G--ATT-A-A-G-GTACT--GTT------A---T---G--C-TGGG-T-T---A-A--A-GTTT-TATGGa
gi|121835                     : TTGC-C--A--A-A--C----T-T-G---T-AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---GC-A---A--G---G--A--A--C-A-T-A-CG-T-A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--TC-G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--A---GGC-T-T-TCG-G-A-T------C-T--G-G-A---GG-AT-A--G------A-A-G-G--TT--G-T------A-G-T---GCAC-T-GG-T-A---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121836                     : TTCC-CC-A--A-A--CA---T-T-G---C-A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--TAT--C--T--G-----G--G--G-T-A-A-------G--A---G--G---AT-A--G--T-A-T-A-T--G-A--C----T-----A-A-A-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--AAG----CTTA--T--A---G-------TCG-G-A-T----G-C-T--G-GCA---GG-A--A--G--A-T-T-G-G-GA-AT--GTT------C-G-T---G--C-T-GT-T-A---A-A--A-GTTT-T-TGGa
gi|121837                     : TTGC-CC-A--A-A--C----T-T-G---TTA-T-G-G-A-----TT---G-A-T--GGC--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-C---TA--G--A---AATG---G--A--A--T---C-A-TA-GGA--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CC-A--T--AAG-G---C-T-TCGCG-A-T----G---T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT---TT------A-T-T---C--T-T-GG-T-T---ATA--A-GTTT-T-TGGag
gi|121838                     : TTGC-CC-ACAATA--C----T-T---------T-GTG-A-----T----G-AGTAGG-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-G-A--C----TAT---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--AGG----CC-A--T--AAG-A---C-T-TCGTG-A-T----G-C-TG-G-G-A---TG-A--A--G--A-T-G-A-A-G--TTC-GTT------A-G-----G--C-T-GT-C-T-----A--A-GTTT-T-TG
gi|121839                     : TTGC-C-----A-A--C----T-T-GTTTC-A-A-T-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-TA-G-A---------T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--AT-G--A-G----CT-A--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G----T-A-A-G-G--AT---TT------A-G-TG--G--C-T--G-T-T---A-A--A-GTTT-T-T
gi|121840                     : TTCC-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--G-A-T-T-TA-G-A--C----T-T---A-G-A-tggag
gi|121841                     : TTGC-CC-A--A---------C-T-G---T-A-T-GTG-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----GTTA--GGT-A-AT--T---G--A---AACG---G--A--AT-T-A-C-A-TA---A--CTTTAT-T---A-A-A-T-A-CTTT--G--A-A------T--CTAG--A-G----CCTA--T--AGG-G---C-T-GCG-GTA-T----G-C-T----G-A---GG-ATTC--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------
gi|121842                     :  TGC-CC-A--A-AAAC----TCT-GT--C-A-T-G-G-A-----TTCTGGCA-T--GAC--T-T--C--T--G-----A--GAAGGTTA-AC--T---G--A---A--G---A--A--ACTT-A-T-A-TACG-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GA-A-A------T--CT-G--A-G----CA-T--T--G---G---C-TCTTG-G-ATT----G-C-T--G-G-A----G-A--A--A--C-T-A-A-G-G--TTTGGTT------A---T---G----T-GG-T-T---T-A--A-GTCC-T-T
gi|121843                     :   GC-CC-A--A-A--C----TGT-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-TCTG-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-AG--T---G--AGAAA--G---G--A--A--T-A-C-AATA-A-AGTC----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-C----CC-A--T--A---GGC-T-T-TTG-G-A-T----G-C-T--G-G-AATTGG-A--AAGG--A-A-A-T-G-G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-TA--A-A--A-GTTT-T-TAGtcctggag
gi|121844                     :   GC-CC-A--A-A--C----T-T-T---A-T-T-G-G-A-----T----G-AAT--T-C--T-T--C--T--G-----A--G--GGT-A-A---TT--G--A---A--A---G--A--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-TTG-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----TT-A--A--G---G---C-T-T---G-A------G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--TT--GTT------A-G-TCA-G--C-T-GG-T-T---T-A--A-GTTT-T-
gi|121845                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---CCA-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TT-G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--AA-T-A-C-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-AC-----T--CT-C--A-G----CT-A--T--A---GGCTT-T-TCA-G-A-T----G-C-T--G---A---GG-A--A-------T-A-A-G----AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGggag
gi|121846                     :    C-CC-A--A-A--C----T---G---C-AAT-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--------G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G------A--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-TAG-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--A--AT--G---C-T-TCG---A-T----G-C-T--G---A---GG-A--A--T--A-T-A-A-G----AT--GT---------A-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121847                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-TTG-G-A-----T----G-A-TT-G-CA-T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---TC--G--A---A--G---G--G--A--T-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-ATT-G-C--T--G--A-A------T--CT----A-G----CT-A--T--G---G---C-T-TCG-G-A-TG---G-C-T--G-------GG-A--AT-G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-GTT---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGa
gi|121848                     :    C-CC-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--TTGG-----G--G--AGT-A-A---T---G--A---A--G---G-----A--T-A-T---TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--GAAA-A------T--CT-GA-A-G----CT-A--T--A---G---C-T-GCA-G-A-T----G-C-T----G-A---GG----A--G--A-T-A-G-C-G--AG--GTT------A-G-T---G--C-T-GGTT-T---A-A--A-GTTT-T-a
gi|121849                     :    C-CC-C--A-A--C----T-G-T---C-A-T-G-G-A-----T------A-T--G-CCCT-T--C--T--G-----G--G--TGT-A-G---T------A---A--G---G--A--T--A-A-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-A--T--A---G---C-T-TCG-G-A-T----G-C----G-G-T---GG-A--A--G--A-T-A-A---G--TT--GT---------A-T---G--C-T-GG---T---A-A--A-GTTT-T-ggag
gi|121850                     :    C-CC-A--A-T--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----TT---G-ACT--G-C--T-T--CA-T--GT----G--G--GGT-A-AA--T---G--A---A--G---G--A--A--TTA-T---TA-G---------C-T---A-A-A-T-G-C--TT-G--A-A------T---T-G--A-G----CT-AA-T--G---G---C-T-TTG-G-A-T----G-CCT--G-G-A---GG-A--A--G--A-T---A-G-G--A---GTT------A-G-----G--T----G-T-T---A-A--ATGTTTCT-TGG
gi|121851                     :    C-CA-A--A-A--C----T-A-GA--C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--T--GGT-A-A---T---A--A---A--G---G--A--A--T-G-T-A-TA-G-A--C----T-T---A-A-A-T-G----T--G--A-AAAAATCC--CT-GA-A-G----CCTATTT--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T---A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--CTT-GG-T-T-----A--T-GTTT-T-TGGag
gi|121852                     :    C-CC-A--A-A--C----TAT-G---A-AAT-G-G-A-----T----G-A-T----C--T-T--C--T--G-----G--G--G-T-A-A---T---G--A---A--GA--G--A--A--T-A---A-TA-G-ATTC----T-T---AGA-A-T-G-C--TT-G--A-A------A--CT-G--A-G----CT-AA-T--A---GG--C-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G-----A--G--ATT-A-A-G-G--AT--GTTG-----A-G-T---G--C-T-GG-G-TATAA-A--A-GGTT-T-ag
gi|121853                     :    C-CG-A--A-A--C----T-T-G---T-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--A-T--T-T--C--G--A-----A--G--GGT-A-A-------G--A---A------G--A--A--TAA-C-A-TACG-A--C----T-T---A-A-ATT-A-C--TTGA--A-A------T--TT-G--A-A----AC-A--T--AT--G---C-T-TCT-G-A-TAAGAG-C-TAAG-G-ATT-GG-A--AAGA--A-TAA-A-G-G--AT--GTT------A-G-C------C-T--G-T-T-----G--A-GTTT-C-Tgttgag
gi|121854                     :     -CT-A--A-A--C----G-T-G---C-A-T-G-G-A-----G----G-A-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-CA-A-T--C----T-T---A-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----TG-T--T--G---G---T-T-TCG-A-A-T----G-C-T--G-G-A---AG----A--G--A-T-A--------------C------A-------G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GATT-T-
gi|121855                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----G----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-A-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--G-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---AG----A--G--G-T-A-A-G-A-----------------------G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-ggag
gi|121856                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--T--A-----G--T--GAT-C-----T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-CCA-CA-C-A--C----T-----G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--A---G---G-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AG-A-----G--A-T-----GTG--CT--ATT------A-G-A---G--A-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121857                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-AAT-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-A---TTCTG--A---A--G---G--G--AC-T-A-CCA-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-ACAA-G----CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AA-G--A--G--A-T-----G-G--TT--GCT------A-T-TAAAG----T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121858                     :     -CC-C--A-A--C----T-T-G---CCA-T-G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--CT-T--G-----G--G--GGT-ACA---C---GTTA---A--G---GGTA--A--T-ATT-A-TC-G-A--C----T-T---A-ATC-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-GCAGTCC-A--A--G---G---CTT-TTG-G-A-T----A-A-T--G-A-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--A---GTTA-----A-G-TTAGA--C-T-GG-T-TA--A-A--A-GTTC-T-ag
gi|121859                     :     -CC-A--A-A--C----T-T-T---C-A-T-G-G-A-----T----G-T-T--G------T--C--C--G-----G--G--TGT-A-C---T---G------------------------A-C-T-TA-G-A---------T---G-A-T-T-C-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AAG-G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GATG--C--G--A-T-------G--TT--GTT------A-G-cttggag
gi|121860                     :     -CC-A--A-T--C----T-T-G---T-A-A-G-G-A-----T----T-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--G---A--G---G--A--A--T-A-C-
gi|121861                     :     -CC-A--A-A--C----T---G---C-A---G-G-A-----T----G-A-T--G-C--T-T--C--T--G-----G--G--GGT-A-A---T---G--A---A--G---G--A--A--T-A---A-TA-G-----------TAAAA-A-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-A--A-G----CT-A--T--AG--G---C-T-TCG-G-A-T----G-CTT--G-G-A---TG-------G--A-T-A-G-G-A--TT--AT
gi|121862                     :     -CC-A--A-A--C----T-C-T---C-A-T-G-G-A-----T----G-G-T----C--TGT--C--G--G-----G--T--GAT-A-C---T---G--A-----------------------C-T-TA-G-A--T------------G-A-T-G-C--T--G--A-A------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---G
gi|121863                     :     -CT-A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AG----A--G--A-T-G-G-T-G--CT--ATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGG
gi|121864                     :     -CC-A--A-A--C----G-T-G---C-A-T-G-G-A-----T----G-A-T--C-C--T-T--T--T--G-----G--G--AAT-A-A---T---T--A---A--G---G--A--A--T-A-C-A-TA-ag
gi|121865                     :        -A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C-----G-----G--T--GAT-T-C---T---G--A---A--G---G--A--C--T-A---A-CA-GCA--CT---T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----CT-G--T--A---GT--T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A------A--A--G--A-T-G-GTG-C--TT--ATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T---T-A--G-TTTT-T-TGG
gi|121866                     :        -A--A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-AAGG--T----G-G-T--A-A--T-T--C--A--G-----G--T--GAT-T-C---T---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--A------CT-G--T--A---GG--T-T-TCG-G-A-C----CTC-T--G-T-A---AG-A-----G--A-T-----G-G--GC--ATT------A-G-A---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121867                     :          --A-A--C----T-T-G---C-A-T-G-G-A-----A----G-G-T--G-T--A-T--C--------------G--GGT-G-ATTCT---G--A---A--G---G--A--C--T-A-C-A-CA-C-A--C----T-T---G-G-T-T-GTC--T--G--A-T------T--CT-C--A-G----CT-G--T--AG--G---T-T-TCG-G-A-T----G-C-T--G-T-A---AG----A--G--A-T-G-G-T-G--CT--ATT------A-G-A---G------GA-TGT---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121868                     :                  ----T-T-G---T-A-T-G-G-AGAAATT----G-A-T--T-C--T-TTTC--T--GCGAGTG--A--GGT-A-A---T---G--A---A--ATGAG--A--C--A-A-C-A--A-G-A--C----T-----A-A-A-T-ATC--G--G--A-A------A--CT-G--A------CC-A--TCAG---G---C-T-TTC-G-A-TT---G-C-T--G-T-A---TG-A--T--GCAA-T-A-----G--TT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-TAT---A-AAGA-GTTT-T-ag
gi|121869                     :                                                                                                                                    A-A-A--C----T-T---G-G-T-T-G-C--T--G--A-T------T--CT-C--G-G----CT-G--T--A---G---G-TATCG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---A--A--A--G--A-T-A-G-T-G--CT--ATTTATTAAA-G-A---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-ATTT-T-TGG
gi|121870                     :                                                                                                                                       -A--C----T-T---A-A-A-T-A-C--T--G--A-T------T--CT-G--A-G----TC-A--T--A---G---GGT-TTG-G-A-T----G-C-T--G-G-A---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-A--A-GTTT-T-TGGag
gi|121871                     :                                                                                                                                                                    --G--G-A------T--CT-G--A-A----CT-A--T--A---GG--C-T-TCT-G-A-T----G-C-A--G-G-G---GG-A--A--G--A-T-A-A-G-G--AT--GTT------A-G-T---G--C-T-GG-T-T---A-C--A-ATTT-T-TAGag


blockSeqs                     :        C CA   AA GTTG C   TTT T A A T C GAAAT TCTG   T AG G CC A TT TGCGAGT     TT AA   A   TTC TCT TT GAA AT TGA GT TC CT T   C    C G GT TTTA   TAA     T T T TT GA AA   AAAATC TC  G CA A CAGT  T TT CA TAGG    T G   C C A AAGA   C AA     ATT  ATTC    CA T AT      TAC TG   TATTAA     AAA CA   G  T G ATA   AG
blockSeqs                     :        C .    .  A    G   T   C A T T G AGG   T      G CT A A  G T  TGCTCT      .  T    T   TTC TCT C  G   AC A   T  .  T  A   C    C C TT T      AAA     T T T .  TG A    C      .   A A  G TT    T A  .  GGCT    G C   T T T G      T G      TT   AAAG    .  T CA      AA  C    G          TAG .    G  T A A     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    A   A   C A . T . .     T      A C  . .  . .  ACTG        .  .    .   TTC A   .  .   .  .   .  .  A  .   .    . . .  .      .       . A . .  C  .    C      .   . A  . .     T A  .  GGG     . A   . . T T      . .      .    AAAG    .  . AA      A   .    A          CA  .    .  . . A     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . A . . . .     T      C T  . .  . .  TTGG        .  .    .   GA  T   .  .   .  .   .  .  C  .   .    . . .  .      .       . . . .  T  .    .      .   . A  . .     . .  .  GGC     . .   . . . .      . .      .    ATA     .  . A       A   .    .          G   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  ATGT        .  .    .   T   C   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  T  .    .      .   . .  . .     . .  .  AGG     . .   . . . .      . .      .    AAT     .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TTG         .  .    .   C   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  AGA     . .   . . . .      . .      .    TGC     .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TTG         .  .    .   G   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GGG     . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  CT          .  .    .   A   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GGC     . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  AGG     . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  GA          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AT      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  CT          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AT      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TA          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  GG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . T       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    TA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . G       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AT      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  TG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  TG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GT      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  GG      . .   . . . .      . .      .    GA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  GA          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       C   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TA          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AT      .  . G       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  CG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AA      .  . G       A   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AA      .  . G       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    AA      .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  GG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    T       .  . A       C   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  TG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . A       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  AG          .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . A       G   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  T           .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . .       C   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  G           .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . .       T   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  G           .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . .       C   .    .          .   .    .  . . .     . 
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  .           .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . .       A   .    .          .   .    .  . . .       
blockSeqs                     :        . .    .  .    .   .   . . . . . .     .      . .  . .  . .  .           .  .    .   .   .   .  .   .  .   .  .  .  .   .    . . .  .      .       . . . .  .  .    .      .   . .  . .     . .  .  G       . .   . . . .      . .      .    A       .  . .       A   .    .                                  
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