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gi|54572                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-C--T-GA-TC-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG-------A--T--A---T-T-TC---C-CC----CT-C--------G--G--T-A----------T-T-G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54585                      :   AAAAC-AG-TT-A-TT----T---A-TGT-C--T-GATTC-----A--G--T--C----A-TA--GAA--C-CG--GA---A--C--A---T-T-TT---C-CC----CT-C--------G--G--T-ACTCGCCTAATC-T-G-GT---AA-C-A-G-----CTA-A-A---TG-C-AC-A--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54589                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-A-A-TGT-C--T-GA-TCC----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG---A---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CT-C--------G--G--T-A------------T-G-GG------C-A-G-----CT
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gi|54591                      :     AGC-AG-TT-A-TT----T-A-ACTGT-C--TCGA-TC-----A--GC-T--C--A-A-TACAG-A--C-CG--GA---A--T--AA--TAT-TT---T-CC----CC-G--------A--G--T-A----------C-T-G-CG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---CG-T-A
gi|54593                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-C--T-GG-TC-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CG-A--------G--G--T-A----------C-T-G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54596                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-T--T-GA-TC-----A--G--T--C--A-A-TA--G----C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CG-A--------G--G--T-A----------C-T-G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54592                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-C--T-GA-TC-----A--G--TTCC--A-A-TA--G-AA-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CG-A--------G--G--T-A----------C-T-G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54603                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-C--T-GA-TC-----A--A--T--C--A-A-TA--G-A--C-AG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----AG-A--------G--G----A----------C-T-G-GGAA-AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-T-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54594                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-A-A-TGT-C--T-G--TC-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CC--GA---A--T--A---A-T-TT---T-TC----CG-A--------G--G--T-A----------C-T---GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--C----A--T-TACC
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gi|54604                      :      AC-AG-TT-A-TT------A-A-TGT-CCCT-GA-TC-----A--G--T--TCAA-A-TA--G-A--C-CG--GA---T--T--A---T-T-TT---T-CC----CGAC--------G--G--TAA----------C-T-A-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A----G-CGAC-G--T-T--CT---A--TATGCC
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gi|54606                      :      AT-AG-TT-AGTT----T-A-A-TGT-C--TCGA-TC-----A--G--T--C--A-T-TA--G-A--CATG--GA---A--T--A---TAG-TT---T-CC----CT-C--------G--GCTT-AAT--------T-T-G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ACA---TG-C-AC-G--T-TTCCTAACA--T-TGCC
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gi|54609                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCA-A-TGT-C--T-GA-TC-----A--GATC--C--A-A-TA--G-A--CGCG--GA------T--A---T-T-TT---TTCC----CG-A--------G--G--T-A----------C-T-G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
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gi|54613                      :      AC-CG-TT-A-TT------A-A-TGT-C--T-G--TC-----A--G--T--C--A-AGTA--G-AACC-TG--GA---A--CTGA---T-T-TT---T-C--------C--------G--A--T-A----------T-T-G-GG---AA---A-G-----CTC-A-A---GC-C-AC-G--T-T--CT---AATC-TGCC
gi|54602                      :      AC-AG-T--A-TT----A-G-A-TGTTC--T-G--TC-----A--G--TA-C--A-A-TA--G-A--C-----GA---A--T--A---T-T-TT---T-TC----CC-G--------A--G--G-AC---------T-T-G-GG---AA-C-A-GA----ATC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CTA--A--T-TG
gi|54614                      :        -AG-TT-A-TT----C-A-A--GT-C--T-G--CC-----A--G--T--C--A---TA----A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CC-CGAGGGGGGG--G--T------------C-T-G-GG---AAGCAA-G-----CTC-A-A---TG-CAAC-G--T-T--CT---A--T-TCCC
gi|54615                      :        -AG-TT-A-AT----T-A-A-TGT-C--T-GA-TCA----A--G--T--C--ATA-TA--G-A--C-CG--GA---AT-T--A---T-T-T
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Reference ( family-395 )      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C-NC--------GG--T-A----------C-T--G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54608                      :      AC-AT-TT-A-TT----T-AAATGTGC--T-GA-T-CAGATCA--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-TC----C-CCAGAG----GA--T-A----------C-TTGG-GA---AA-C-A-G-----CTG-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--
gi|54609                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--GATC--C--A-A-TA--G-A--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-T--G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54610                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--GATC--C--A-A-TA--G-A--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-T--G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54611                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--GATC--C--A-A-TA--G-A--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-T--G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54612                      :      AC-AG-TT-C-TT----T-AA-TGC-C--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--T-CG--G----A--T--T---T-C-TT---T-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-T-----G---AA-CAA-A-----CTC-A-A---TG-C-AC----T-T--CT---A--T-TTCC
gi|54613                      :      AC-CG-TT-A-TT------AA-TGT-C--T-G--T-C-----A--G--T--C--A-AGTA--G-AACC-TG--GA---A--CTGA---T-T-TT---T-C--------C--------GA--T-A----------T-T--G-GG---AA---A-G-----CTC-A-A---GC-C-AC-G--T-T--CT---AATC-TGCC
gi|54614                      :        -AG-TT-A-TT----C-AA--GT-C--T-G--C-C-----A--G--T--C--A---TA----A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C-CCGAGGGGGGGG--T------------C-T--G-GG---AAGCAA-G-----CTC-A-A---TG-CAAC-G--T-T--CT---A--T-TCCC
gi|54615                      :        -AG-TT-A-AT----T-AA-TGT-C--T-GA-T-CA----A--G--T--C--ATA-TA--G-A--C-CG--GA---AT-T--A---T-T-T
gi|54616                      :           -TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--G--TT-C--A-A-TA--G-AG-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---C-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-T--G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TGCC-AA-G--T-T--C----A--T-TGCC
gi|54617                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-T--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C-GA--------GG-----------------T--G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--AT---A--T-TACC
gi|54618                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---G--T--A-----T-TT---T-CC----C-CCGA------GG--T-A----------C-T--G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54619                      :                -TT----T-AA-TGT-C--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---C--T--A---T-T-TT---T-CC----C-GA--------GG--T-A----------C-TC-GCGC---AA-C-A-GACGTATTC-A-ACATTG-C-AC-G--A-T--CT---G----TGCC
gi|54620                      :                             GT-C--TAGA-T-C-----GAGG--T--C--A-A-TA--G-A--C-TGCCGA---A-----A---T-T-GT---T-TC----C-GC--------AGA-T-A----------C-T--G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ATA---TG-C-AC-G--T-T--CT---T--A-TGCC
gi|54621                      :                               -C--T-GA-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G-A--C-CG--GA---A--C--A---T-T-TT---T-CC----C-TC--------GG--T-A----------C-T--G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--A-TGCC
gi|54622                      :                                                                 A--G-A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C-CGA-------GG--T-A----------T-T--G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC

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Reference ( family-395 )      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------NN-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54570                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54571                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AAATGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---C-CC----T--------CC-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-AGG-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---AT-T-TGCC
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gi|54577                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A---TG--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-
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gi|54587                      :   AAAAC-AG-TT-A-TA----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-ATTA--GA--C-CG--GGACCA--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC--G--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ACA---TG-C-ACGG--T-T--TT---A--T-TG
gi|54588                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-AA-TGT-C--T-GATCC-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-C---GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A----T----------G-GG------C-A-G-----CT
gi|54589                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-AA-TGT-C--T-GATCC-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-C---GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A----T----------G-GG------C-A-G-----CT
gi|54590                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-AA-TGT-C--T-GATCC-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-C---GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A----T----------G-GG------C-A-G-----CT
gi|54591                      :     AGC-AG-TT-A-TT----T-AACTGT-C--TCGAT-C-----A--GC-T--C--A-A-TACAGA--C-CG--GA---A--T--AA--TAT-TT---T-CC----C--------CG-AG--T-A--C-T----------G-CG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---CG-T-A
gi|54592                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--TTCC--A-A-TA--GAA-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54593                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GGT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54594                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-G-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CC--GA---A--T--A---A-T-TT---T-TC----C--------GA-GG--T-A--C-T------------GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--C----A--T-TACC
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gi|54603                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--A--T--C--A-A-TA--GA--C-AG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----A--------GA-GG----A--C-T----------G-GGAA-AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-T-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54604                      :      AC-AG-TT-A-TT------AA-TGT-CCCT-GAT-C-----A--G--T--TCAA-A-TA--GA--C-CG--GA---T--T--A---T-T-TT---T-CC----CG-------AC-GG--TAA--C-T----------A-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A----G-CGAC-G--T-T--CT---A--TATGCC
gi|54605                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GGT-C-----A--G--T--C--A-AATA--GA--C-CG--GA---AATT--AC--T-T-TT---T-TC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-CG-G--T-TC-CT---A--T-TGTC
gi|54606                      :      AT-AG-TT-AGTT----T-AA-TGT-C--TCGAT-C-----A--G--T--C--A-T-TA--GA--CATG--GA---A--T--A---TAG-TT---T-CC----C--------TC-GGCTT-AATT-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ACA---TG-C-AC-G--T-TTCCTAACA--T-TGCC
gi|54607                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA---------------------------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTT-A-T---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54608                      :      AC-AT-TT-A-TT----T-AAATGTGC--T-GAT-CAGATCA--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-TC----CCCAG----AG-GA--T-A--C-TTG--------G-GA---AA-C-A-G-----CTG-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--
gi|54609                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54610                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54611                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54612                      :      AC-AG-TT-C-TT----T-AA-TGC-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--T-CG--G----A--T--T---T-C-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T-------------G---AA-CAA-A-----CTC-A-A---TG-C-AC----T-T--CT---A--T-TTCC
gi|54613                      :      AC-CG-TT-A-TT------AA-TGT-C--T-G-T-C-----A--G--T--C--A-AGTA--GAACC-TG--GA---A--CTGA---T-T-TT---T-CC----------------GA--T-A--T-T----------G-GG---AA---A-G-----CTC-A-A---GC-C-AC-G--T-T--CT---AATC-TGCC
gi|54614                      :        -AG-TT-A-TT----C-AA--GT-C--T-G-C-C-----A--G--T--C--A---TA---A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CCCGAGGGGGG-GG--T----C-T----------G-GG---AAGCAA-G-----CTC-A-A---TG-CAAC-G--T-T--CT---A--T-TCCC
gi|54615                      :        -AG-TT-A-AT----T-AA-TGT-C--T-GAT-CA----A--G--T--C--ATA-TA--GA--C-CG--GA---AT-T--A---T-T-T
gi|54616                      :           -TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--TT-C--A-A-TA--GAG-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---C-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TGCC-AA-G--T-T--C----A--T-TGCC
gi|54617                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-T--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG---------T----------G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--AT---A--T-TACC
gi|54618                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---G--T--A---T-T-TTC--C-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54619                      :                -TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---C--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-TC---------GCGC---AA-C-A-GACGTATTC-A-ACATTG-C-AC-G--A-T--CT---G----TGCC
gi|54620                      :                             GT-C--TAGAT-C-----GAGG--T--C--A-A-TA--GA--C-TGCCGA---A-----A---T-TGTT---T-CC----G--------CA-GA--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ATA---TG-C-AC-G--T-T--CT---T--A-TGCC
gi|54621                      :                               -C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--C--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--A-TGCC
gi|54622                      :                                                                A--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------CGAGG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC

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Reference ( family-395 )      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------NN-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54570                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54571                      : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AAATGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---C-CC----T--------CC-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-AGG-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---AT-T-TGCC
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gi|54589                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-AA-TGT-C--T-GATCC-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-C---GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A----T----------G-GG------C-A-G-----CT
gi|54590                      :   AAAAC-AG-TA-T-TT----T-AA-TGT-C--T-GATCC-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-C---GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A----T----------G-GG------C-A-G-----CT
gi|54591                      :     AGC-AG-TT-A-TT----T-AACTGT-C--TCGAT-C-----A--GC-T--C--A-A-TACAGA--C-CG--GA---A--T--AA--TAT-TT---T-CC----C--------CG-AG--T-A--C-T----------G-CG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---CG-T-A
gi|54592                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--TTCC--A-A-TA--GAA-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54594                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-G-T-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CC--GA---A--T--A---A-T-TT---T-TC----C--------GA-GG--T-A--C-T------------GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--C----A--T-TACC
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gi|54596                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-T--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--G---C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
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gi|54599                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--AA---A-----------T-TT---T-TC----C--------TC-GG--T-A--T-T----------G-GG----A-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T---T---A--T-TGCC
gi|54600                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-G-AA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---TCCC----C--------GA-GG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54601                      :      AC-AG-TT-C-TT----T-AA-TGC-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--T-CG--GA---A--T--T---T-C-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-A-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54602                      :      AC-AG-T--A-TT----A-GA-TGTTC--T-G-T-C-----A--G--TA-C--A-A-TA--GA--C-----GA---A--T--A---T-T-TT---T-TC----C--------CG-AG--G-A--C-TT---------G-GG---AA-C-A-GA----ATC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CTA--A--T-TG
gi|54603                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--A--T--C--A-A-TA--GA--C-AG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----A--------GA-GG----A--C-T----------G-GGAA-AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-T-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54604                      :      AC-AG-TT-A-TT------AA-TGT-CCCT-GAT-C-----A--G--T--TCAA-A-TA--GA--C-CG--GA---T--T--A---T-T-TT---T-CC----CG-------AC-GG--TAA--C-T----------A-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A----G-CGAC-G--T-T--CT---A--TATGCC
gi|54605                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GGT-C-----A--G--T--C--A-AATA--GA--C-CG--GA---AATT--AC--T-T-TT---T-TC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-CG-G--T-TC-CT---A--T-TGTC
gi|54606                      :      AT-AG-TT-AGTT----T-AA-TGT-C--TCGAT-C-----A--G--T--C--A-T-TA--GA--CATG--GA---A--T--A---TAG-TT---T-CC----C--------TC-GGCTT-AATT-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ACA---TG-C-AC-G--T-TTCCTAACA--T-TGCC
gi|54607                      :      AC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA---------------------------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTT-A-T---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54608                      :      AC-AT-TT-A-TT----T-AAATGTGC--T-GAT-CAGATCA--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-TC----CCCAG----AG-GA--T-A--C-TTG--------G-GA---AA-C-A-G-----CTG-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--
gi|54609                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54610                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54611                      :      AC-AG-TT-A-TT----TCAA-TGT-C--T-GAT-C-----A--GATC--C--A-A-TA--GA--CGCG--GAT--A--T------T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-G----AA-C-A-G-----CTCAA-A---TG---AC-G--T-T--CT---A--T-TG
gi|54612                      :      AC-AG-TT-C-TT----T-AA-TGC-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--T-CG--G----A--T--T---T-C-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T-------------G---AA-CAA-A-----CTC-A-A---TG-C-AC----T-T--CT---A--T-TTCC
gi|54613                      :      AC-CG-TT-A-TT------AA-TGT-C--T-G-T-C-----A--G--T--C--A-AGTA--GAACC-TG--GA---A--CTGA---T-T-TT---T-CC----------------GA--T-A--T-T----------G-GG---AA---A-G-----CTC-A-A---GC-C-AC-G--T-T--CT---AATC-TGCC
gi|54614                      :        -AG-TT-A-TT----C-AA--GT-C--T-G-C-C-----A--G--T--C--A---TA---A--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----CCCGAGGGGGG-GG--T----C-T----------G-GG---AAGCAA-G-----CTC-A-A---TG-CAAC-G--T-T--CT---A--T-TCCC
gi|54615                      :        -AG-TT-A-AT----T-AA-TGT-C--T-GAT-CA----A--G--T--C--ATA-TA--GA--C-CG--GA---AT-T--A---T-T-T
gi|54616                      :           -TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--TT-C--A-A-TA--GAG-C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---C-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TGCC-AA-G--T-T--C----A--T-TGCC
gi|54617                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-T--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG---------T----------G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--AT---A--T-TACC
gi|54618                      :             T-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---G--T--A---T-T-TTC--C-CC----C--------GA-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC
gi|54619                      :                -TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---C--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------GA-GG--T-A--C-TC---------GCGC---AA-C-A-GACGTATTC-A-ACATTG-C-AC-G--A-T--CT---G----TGCC
gi|54620                      :                             GT-C--TAGAT-C-----GAGG--T--C--A-A-TA--GA--C-TGCCGA---A-----A---T-TGTT---T-CC----G--------CA-GA--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-ATA---TG-C-AC-G--T-T--CT---T--A-TGCC
gi|54621                      :                               -C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--C--A---T-T-TT---T-CC----C--------TC-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--A-TGCC
gi|54622                      :                                                                A--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------CGAGG--T-A--T-T----------G-GG---AA-C-A-G-----TTC-A-A---TG----T-G--T-T--CT---A--T-TGCC


blockSeqs                     :              T    AACT T  A   T CC C   T AGATC AG AT TC CA   T  CA  AC A  CC  ACC AT TG TTT A A  CCG    GCCA CCGAGGGGGG   CT   AT   CGCCTAATCT C  AAC    A   ACGTA   T C CAT  C G  G TT   TC  CAC AT A
blockSeqs                     :              T    .    C  C   G .  C   C A     .  AT A  .    T  G   C  G  A   T   T  .  A   A G  C      CT   CCAGAG       T    .    TG         C  AAC    A   A       A C T    C A  G TC   C   AAC T  A
blockSeqs                     :              .    .    C  C   . .  A   C .     .  AT T  .    T  .   A  G  .   T   .  .  C   . .  .      .    GAC          T    .    T          .  AA     .   A       A T .    . .  . .    .   A   C  .
blockSeqs                     :              .    .    C  A   . .  .   C .     .  C  .  .    A  .   A  G  .   T   .  .  .   . .  .      .    CGA          .    .    T          .  .      .   .       A . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    G  .   G  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    CC           .    .    C          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    CG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    CG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    CG           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .  .
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  . .    .   .   .   
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .  .                  
blockSeqs                     :              .    .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    GA           .    .    .          .  .      .   .       . . .    . .                     
blockSeqs                     :                   .    .  .   . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    CA           .    .    .          .  .      .   .                                        
blockSeqs                     :                               . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    TC           .    .    .          .  .      .   .                                        
blockSeqs                     :                               . .  .   . .     .  .  .  .    .  .   .  .  .   .   .  .  .   . .  .      .    .            .    .    .          .  .      .   .                                        
blockSeqs                     :                                                                 .   .  .  .   .   .  .  .   . .                                                                                                       


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------NN-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC
finalCons                     : ATAAAAC-AG-TT-A-TT----T-AA-TGT-C--T-GAT-C-----A--G--T--C--A-A-TA--GA--C-CG--GA---A--T--A---T-T-TT---T-CC----C--------NN-GG--T-A--C-T----------G-GG---AA-C-A-G-----CTC-A-A---TG-C-AC-G--T-T--CT---A--T-TGCC