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gi|64084                      :  TT-TA----T--T-AGCGG-----T-----GT-T-A--TC---------G---T-A--T--A--GA-TC-TT--------TA---T----T-A-T-C-ATTA--A-T-AT-A-G-ACA--AAA--TT-ATCG-G-TTCCTG
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gi|64087                      :      A----A--T-AGGGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GA-CC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-ACC---AA--TT-ACCG-G-TTCCTGTG
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gi|64089                      :       ----A--T-AGGGG-----T-----GG-T-AAATG---------G---T-A--T--A--GA-CC-CC--------TA---C----T-T-T-T-ATTA--T-T-GT-A-G-ATA--AAA--TT-ACCA-G-TTTCT
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Alignments
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lowQualScore                  :    1  1111 44 0     99999 44444  8 8 11  555555555 333 8 88 99 11    3  22222222  44444444 8 5 5 8    00 8 8  8 8 88 444   11  8    8 8        
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gi|64087                      :      A----A--T-AGGGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G--AC-C-AA--TT-ACCG-G-TTCCTGTG
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lowQualScore                  :    .  .... .. .     ..... .....  . . ..  ......... ... . .. .. ..    .  ........  ........ . . . .    .. . .  . . .  ..   ..  .    . .        
lowQualScore                  :    1  1111 44 0     99999 44444  8 8 11  555555555 333 8 88 99 11    3  22222222  44444444 8 5 5 8    00 8 8  8 8 8  99   11  8    8 8        
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gi|64083                      :  TC-TA----A--TTAGGGG----GC-----GG-T-A--TG---------G---G-A--T--A--GACCTCT--------AA---A----TGA-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AT-AAAA--TT-ACCG-G-TTCC
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Alignments
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lowQualScore                  :    .  .... .. .     ..... .....  . . ..  ......... ... . .. .. ..    .  ........  ........ . . . .    .. . .  . . .  ..   ..  .    . .        
lowQualScore                  :    1  1111 44 0     99999 44444  8 8 11  555555555 333 8 88 99 11    3  22222222  44444444 8 5 5 8    00 8 8  8 8 8  99   11  8    8 8        
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Reference ( family-388 )      : TTT-TA----A--T-AGGGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AC-NAAA--TT-ACCG-G-TTCCTGTG
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gi|64088                      :       ----A--C-AGGGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-CT--------TG---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AC-CAAA---T-ACCG-G-TTCCTGTG
gi|64089                      :       ----A--T-AGGGG-----T-----GG-T-AAATG---------G---T-A--T--A--GACC-CC--------TA---C----T-T-T-T-ATTA--T-T-GT-A-G-AT-AAAA--TT-ACCA-G-TTTCT
gi|64090                      :               -AGGGA----GA-----AG-T-A--TG---------G---T-A--T--A--GACCGCTATTAGTACTA---G----T-A-T-T-ATTC--T-T-TC-A-G-AC--AAA--TC-ACCG-G-TTCCTGTG
gi|64091                      :                  GGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-AT--------TA---A----T-A-T-T-ATTA--T-T-AC-A-G-AC-CAAA--TT-ACCG-A-TTCCTGTG
gi|64092                      :                  GGG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AT-CAAA--TC-ACTG-G-TTCCTTTG
gi|64093                      :                  GGG----GT-----AG-T-A--TA---------G---T-A--C--A--GACC-AT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AT-CAAA--TT-ATCG-G-TTCCTTTG
gi|64094                      :                   GG----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-A
gi|64095                      :                     ----GT-----AG-T-T--TA---------GACTT-A--T--A--AACC-CT--------TA---C----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-A-GT-AAAA--TG-ACCG-A-TTCCTGTGt
gi|64096                      :                     ----GT-----GG-T-A--TA---------G---T-A--TGTA--GACC-CT--------TA---C----TTA-T-T--TTA--T-T-AC-A-G-AC--AAA--TG-ACC--A-TTCCTGTG
gi|64097                      :                          T-----GC-T-A--TA---------G---T-A--T--A--GACCGCC--------CA---C----T-AAC-C-ATTG--T-T-AT-A-G-AC-AAAA--TT-ACCG-GTTTTCTATG
gi|64098                      :                                  -T-A--TA---------G---T-G--T--A--GAAC-CT--------TACTAA----TGA-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AC-AGAA--AT-ATCA-G-TTCTTGTG
gi|64099                      :                                  -T-A--AA---------G---T-A--T--A--TA-------------TA---A----TCA-T-G-ATTA--T-T-TC-A-G-AT-AAAA--TT-ACCG-G-TTCCTGTG
gi|64100                      :                                         A---------G---T-A--TT-A--AACC-CT--------TG---C----A-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-AC-AAAA--TT-ACCG-G-CTTCTGTG
gi|64101                      :                                                    ---T-A--T--A--GACC-CT--------TA---A----T-A-T-C-ATTA--T-T-AC-A-G-A--TAAA--T---CCG-G-TTCCTGTG
gi|64102                      :                                                                                              -T-C-GTTA--T-T-AC-A-G-GT-AAAA--TT-ACCG-G-TTCTTGTG


blockSeqs                     :    A  TTAG AA T     TGGTA ATATC      AA  TACATGTAT ACT   GC TA TA    T  ATTAGTAC  AGTAC    C T T      GT             AA   CT
blockSeqs                     :    .  .    .  T     G     TAG        .   TAT       .     A  GT .     G  CTAC      CTAA     G A A      .              AA   . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     T          .   .         .     .  T  .     G  GG        TA       T . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  C         A        G . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        C . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     T     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     A     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     A     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     T     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              G    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         G        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     G     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         G        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :    .  .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         T        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :       .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         T        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :       .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              C    . 
blockSeqs                     :       .    .  .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :               .     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         G        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              T    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              A    . 
blockSeqs                     :                     .     .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              .    . 
blockSeqs                     :                           .          .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              .    . 
blockSeqs                     :                                      .   .         .     .  .  .     .  .         C        . . .      .              .    . 
blockSeqs                     :                                      .   .         .     .  .  .     .  .         A        . . .      .              .    . 
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