lowQualScore                  :            22                                                     111111                                                                                    1                                                                                                           1                                                1                                        1                                                                                 11       
lowQualScore                  :      1  55 77 11  1   1  44 3  111  33     22 88888888 1 22 333 1 333333   3333 2  111 555555555 222 1 22    3   1  1    22 1 3333 1  1 22  33  33  1 1 1 1 3 1 2 1  3333 2  1  2     33333  0       6 22    99  2 1 222  1  1   11 22     3333    2 1   5    1 11 111  2  1  2 1 1 222  1  1 4444   1     66   6666   1 0      1  55555  4444444  1  2  111 1  1 6   3333 2 1 666666   77777777777777 1 1  1 1 333 1 999999 1 222222 555555    1   99       
lowQualScore                  :      .  .. .. ..  .   .  .. .  ...  ..     .. ........ . .. ... . ......   .... .  ... ......... ... . ..    .   .  .    .. . .... .  . ..  ..  ..  . . . . . . . .  .... .  .  .     .....  .       . ..    ..  . . ...  .  .   .. ..     ....    . .   .    . .. ...  .  .  . . . ...  .  . ....   .     ..   ....   . .      .  .....  .......  .  .  ... .  . .   .... . . ......   .............. . .  . . ... . ...... . ...... ......    .   ..       
lowQualScore                  :      1  33 55 55  1   1  11 2  999  00     66 55555555 1 66 000 1 555555   5555 1  888 555555555 888 1 55    2   1  1    44 0 2222 1  1 66  66  11  1 1 1 1 4 1 2 1  1111 2  1  2     99999  5       4 44    77  1 0 888  0  0   44 44     4444    1 0   1    1 55 999  1  1  1 1 1 555  1  1 4444   1     66   9999   1 8      1  99999  6666666  1  2  444 0  0 2   2222 1 0 999999   11111111111111 0 0  0 0 222 0 999999 0 999999 111111    1   11       
consensus                     : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAANA--GCGCC-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CG---AAA-GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
Reference ( gi|51299 )        : ATCGC-GC--A--G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----A-AAC----A-CA---TA--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GCC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---CTAGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GAATT--CCCT---TTT-TCATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-ATTTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-ACTGCGTT
gi|51298                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--AT--CT-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATTCCAAAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---ATTGC-TA-T-A-A-A-TC-GA-CA---AAA-GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TA-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTG
gi|51301                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGC-AC--A-GT---CC--ATTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----G-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CT-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--G-AT-TC-GCCAC---C-CGA-TCCAAAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACTG--T-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---ATCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-C----AAA-GAATT--CCCT---TTT-T-ATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51300                      : ATCGG-GC--AA-G--AA-TGC-AC--A-GT---GC--AGTGA--T--------G-A--T---G-T----G-AACT---A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--AT--CT-T-G-G-GAC-ATC-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATTCCAAAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--A---TTTGC--A-T-A-A-A-TC-GA-CA---AAA-GAATT--CCCC---TTT-TTATGTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-A-CA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCA-TCTGCGTT
gi|51302                      : ATCGCTGC--A--G--AA-TGT-AC--A-GT----C--AGTGA--T--------A-A--C---G-T----G-AAC----A-CAATGTA--------T-C-T------AG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-TA-AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CGTTTCCAAATT--GCGCT-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--A---CTCGC-TA-T-A-A-A-CA-GA-CA---AAA-AAGTT--CCCC---CTT-TTATTTTT-AC-----AG-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCCGCGTT
gi|51303                      : ATCGC-GCG-A--A--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-TG---A-AAC----A-CA---TG--------T-A-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-TT-TC-GCCAC-T-T-CGCTTCCAAATA--GCGCC-GT-A-T---TT-GC-GAA--T--AACAT--C-CGAT-A-ATT-GGGT-C--C---CTTGC-TA-T-C-A-A-TA-GA-CA---AAC-GGTTTC-CCCT---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACGTAAACACATATACAT-G-TA-T-A---T-A------T-A------T------TTTG-TCC-TCTGCGTT
gi|51306                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-ACC-A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--T-----T----G-AA-----A-CA---TA--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-TT---A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GACGA-C-AA-T--TGAT-TC-GCCACCT-T-CGCTTCCAAAAA--GCGCC-GT-AGT---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGATGA-ATT-GGGC-C--C---CCGCC-TAGT-A-A-A-TA-GA-CA---AAAAGAATT--CCCC---TTT-TTATTTTA-TC-----AA-------CA-GT-GT-A-T-TT-A-TTG----A-T-G-------CG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTGTTCG-TCTGCGTT
gi|51304                      : ATCGC-GC--AAAG--AA-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGAA-T--------G-AGTC---A-T----G-AAC----A-CA---TG----------C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT----AT--AT--CT-T-G-G-GAC-A-C-AAAT--T-AT-TC-GCCAC-A-CGCGATTCCAAAAAA-GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--T-CCAT-A-ATT-GGGC-C--CATGCTA---TA-T-A-A-A-TC-GA-CA---AAA-GAATC--CCCT---TTT-T-ATTTT--AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51307                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGCGA--T--------G-A--C---A-T----G-AAC----A-TA---TA--------C-A-T-C--TAAG-AAA-TG-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-C-T-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-T-CGCTTTCAAATA--GCGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T--AACTG--T-TGAC-A-ATT-GGGC-C--C---CTAGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CG---AAA-AATTT--CCCA---ATT-TTATTTTT-AC-----AA-------CT-GT-GC-A-C-CT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T--------A---T-G------T-A------T------TTTG-TCA-TCTGCGTT
gi|51305                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TAT-AC--A-GT---CC--TGTTA--T--------G-A--C---T-TG---A-AAC----A-CA---TACACATGTAT-A-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-AAC-A-CGAA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAATA--GCGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T--AACTG--C-CGAT-A-ATT-GGAT-C--C---ATTGC-TA-T-G-A-A-TA-GA-CG---AAA-GATTT--CCCA---ATT-TTATTTTT-AC-----AA-------TA-GT-GA-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACC--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTCG-TTG-TCTGCGT
gi|51308                      : ATAGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CA--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----A---C----A-CA---TG--------T-C-TTC--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-GCGAC-A-C-AA-A--T-A--TC-GCCAC-C-C-CGCTTCAAAAAG--GCGCCTTT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--A-T--T-A-ATTGGGGC-C--C---CTCGCTTA-T-A-A-T-TA-GA-CT---TAA-GAATT--CCCT---TTT---ATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-A------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T--------T------TTTG-TCG--TTGCGTT
gi|51309                      : ATCGC-GC--A--A--GA-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A------G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AA--TA-GAAA--G-T----A-AT---------------------------C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGATTCCAAA----GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GATGGT--AACAG--T-CAAT-A-AT--GGGC-C--C----TCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CA---AA--GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AA-----CA-------CA-GT-GT-A-T-TT-A-TTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATTTG-TGT-GCTGCGTT
gi|51315                      : ATCGA-GC--A--G--AG-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---GGT----G-AAC----G-CA---TG--------T-C-T-CG-CAAGCAAA-TT-GAAA--A-T----G-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-ACA-A-C-A--C--T-AT-TC-TCCAC-TTC-CGCTTCCAAGTA--GCAT--GT-A-T---TT-GA-GAT--T--ACAAG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-ATTATGA-CA---GGA-G-------------------ATGTTT-ACA----AA-------CA-GTGGTAA-T-TT-AATTGATATA-T-G------ACG--------------T-T-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51314                      : ATCGC-GAG-A--G--AA-TGT-AA--A-GT---CC--AGCGA--C--------G-A--C---A-TG---A-AAC----A-CA---TA--------C-A-T-C--TATG-AAG-TA-GAAA--A-T----A-AT-C--AT--GC--CA-T-G-G-TAC-A-T-AA-T--T-AT-TT-GTCAC-T-T-CGCTTTCAGTTA--GCGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T--AACTG--C-CGAT-A-ACC-GATC-C--C---CTCTC-AA-T-A-A-T-TA-GA-CG---AAA-TATTT--TCCA---ATT-TCATTTTT-AC-----AA-------CT-GT-GA-T-C-CT-AATTG----A-T-G------ATG--------------C-A-CA-T-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51312                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-AG--A-TT---CT--GGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-A-G-GAC-A-C-AA-T--TAAT-TT-GCCAC-T-T-TGCTTCCAAATG--GCGCA-TT---T---TT-GA-GAT--T--AACA---T-CGAT-A-ATT-GGGT-T--C---CTTGT-TA-A-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GAATT--CCTT---TTT-T
gi|51313                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-AA--A-TT---CT--GGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA----T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-A-G-GAC-A-C-AT-T--A-AT-TT-GCACC-T-T-TGCTTCCAAATG--GCGCA-TT---T---TT-GA-GAT--T--AACAT--C-CGAT-A-ATT-GGGT-T--C---CTTGT-TA-A-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GAATT--CCTT---TTT-T
gi|51310                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGCGA--T--------G-A--C---G-TG---A-AAC----A-CA---TA--------C-A-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T-------------------------------------AA-T--T-AT----GTCAT------GGT---ACATA--GCGCT-GT-A-TAATTT-GC-GAT--T--AACTG--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---TGCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GATTT--CCCA---ATT-TTATTTTT-AC-----AA-------CT-AT-GA-A-C-CT-AATTG----A-T-GAAGTATACA--------------T-G-TA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51316                      : ATCGC-GA--A--G--AA-TG--AC--A-GT---C---AGTGA--T--------G-T--A---G-TGG--A-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TTAA-GAA-TA-GAAA----T----A-AT-T--AT--AT--T--T-G-G-GG--A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATT--AAAGA--GCGCA-GT-A-TG--TT-GA-G-T--T--AACAG-----GAT----TT-GGGC-T--C---ATTGC-TA-T-A-A---TC-GA-TA---AAA-GAATT--CCCC---TTT-TTA-TTTT-AC-----AA--------A-GT-GT---C-TA-AATTG----A-T-G------AC---------------T-A-T--C-C---T-A------T--------T------TTTG-TCG-TCTGAGT
gi|51322                      : ATC-C-GC--AAGG--AA-TGT-ACGCA-GT---CC--ACTGAGGTCCAGTTGAG-A--C---G-TG---A-AAC----ATTA---TA--------T---T-C--TAGA-GAT-TA-GAAA--A-T----A-A--T--AT--GT--CA-T-G-A-A-C-A-T-AA-T--T-AT-TCGGCCAC-T-C-AACTTCTAAATA--GCGCC-G--A-T---TT-G--GAT--T--AA-AGGTC-CGAT-A-ATT-GGGC-C--A---ACA-C-TA-T-ACA-A-TA-GA-CG---AAA------------------------TTT-AC-----GA-------TAGGT-GA-A-C-TT-ATTTG----A-T-G------ACG--------------TAG-GA-C-A---A-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51318                      : ATCTC-GC--AA-G--AA-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--A---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-----------------T-T--GG--CT--CAAT-GCG-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGATTCCAAAAA--GCGAT-GT-A-----TT-GA-GA---T--AACAG--T-CGAT-A-ATT--GGC-C--C---ATTGC-TA-T-
gi|51319                      : ATCGC-GC--AA-G--AA-AGT-AC--A-GC---CC--AGTGA--C--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-A-T-C--TAAGAAAA-TA-GAAA--ATT----T-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GTCAC-T-C---------------GCGCT-GT-A-T---TA-GA-AAT--T--AACAG--C-TGAT-A-ATT-G
gi|51321                      : ATCGC-GC--A--A--GA-TGT-AC--AAGT---CC--ACTGA--TTTTTCC--A-A--G---G-TTGGGA-GACCGTGA-CA---TA--------T-A-T-C--TAAG-----TA-GAAC--T-T----T-AT-G--AT--GT--CA-T-G-G-------C-AA-T--G-ATATT-GC-AC-T-C-AATTTC--AATA--GCGC--GT-A-T---TT-GT-GAT--T--AACTG--CGCGATTA-ATT-GGGC-C--C-----ACG-TA-TTA-A-A-TA-----A---GAA-ATATT--GTTTCAATTT-TTATTTTT--C-----GA-------TA-GT-GA-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---A-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51320                      : ATCGC-GCCAA--GGCAA-AGT-AC--A-GC---CCTAAGTGA--C--------GTA--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-AAT-C--TAAG-AAAATA-GAAA--A-T----TTAT-T--TT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-TTAT-AT-TC-G-TAC-T------TTC--------GCGCT-GT-A-T---GTAGA-AAT--T--AACAG--C-TGAT-A-ATT-G
gi|51317                      : ATCGC-GCCAA--G--AAGTGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-A-C----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-
gi|51311                      : ATCGC-CC--AA-G--AA-TGT-ACCAA-GT---CC--AGCGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TA--------C-A-T-C--TAAGAAAA-TA-GAAA--A-T----
gi|51323                      : ATCAC-CC--AA-G--AA-TGT-AC--G-GT---CA--AGTGA--T--------G-A--C---G-TG---A-AAC----A-CA---TG--------T-A-T-C--TATG-GAA-TA-GAAA--A-TATTAA-AT-T--AT--
gi|51324                      :  TCGC-GC--AA-G--AA-TGT-GT--T-GT---TC--AGTAA--T--------G-G--CT--G-C----T-GCC----A-TG---TA------------T-T--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-C--AT--GTAGCA-A-G-G-G
gi|51325                      :   CGC-AC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-AC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAAAA--GCGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-G-ATTGGGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-T-TA-AA-CT---TGT-GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CA-AT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------AAG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------
gi|51327                      :   CGC-GT--A--A--GA-TGT-AC--AAGT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-A--TAAG-AA--TA-GAAA--A-T----A-AT-T--ATATGT--CA-T-G-G-GAC-AGC-AA-A--T-AT-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCCAAAAA--GCGCA-ATTA-T---TT-GA-GA----------------------ATT-GGGGGC--C---CTCGC-TA-T-A-A-T-TA-GA-CT---TCA-GAATTT-CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CC-GT-GT-A-CTTT-ATATG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---CAA------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51333                      :   CGC-GC--A--A--AT-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--CCTCG-T----G-AAC----A------TG--------T-C-T-C--CAAG-AAA-TA-GAAAT-A-T----A-AT-T--ATT-GT--C--T-G-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TCCGCCAC-----CGGATTCACAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG------AT-A-ATT-GAGC-C--C---ATCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-C----AAA-GAATT--CCCC---TTT---ATTTTT-A------AACCACACTCA-GT-AT-ACC-TT-AATTG----A-T-GC-----ACGT-------------T-G-TA-C-A---C-A------TGA------T------TTTG-CCG-TCTGC
gi|51331                      :   CGC-GC--A--A--GA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------TAT-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-A-AA-T-----T-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCCAACAG--TCGCA-TTGA-T---TT-GA-GAT--TC-AACAG----CAAT-A-GTT-GAGA-C--C---CTCGC-TA-T-A-ATT-TA-GA-CT---TAA-GAATT--CCCA---TTT-T-A-CTTT-AC------A-------CT-GTAAT-A-C-TT-AATTGA---A-T-G------ACG--------------T-G-TAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TTTG-TCG-TCTGCGT
gi|51330                      :   CGC-GC--AA-G--AA-TGT-AT--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-G--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-AGATAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGCTTCC-AAAA--GCGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-TGAT-A-ATTGGGGT-C--C---CT--C-T--T-------------------AA-GAATT--CCC--------------------------------------------C-TT-CTTTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-AT-----T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51329                      :   CGC-GC--AA-G--AA-TAT-AC--A-GT---CC--TGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-TAC----A-CT---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCGC-C-C-CGCTTCCAAAAA--GCGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAG--C-CGAT-A-ATTGGGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-T-TA-TA-CT---TAA-GAATA--CCCC---TTT-TTA
gi|51332                      :   CGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--AAGT---CC--AGTGA--T--------G-AA-C---G-T----G-AAC----AACA---TG--------T-C-T-C--TA-G-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-TTAAT--TT--CA-T-G-G-GAT-A-C-AA-AA-T-AT-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCCAAAAA--GCGCA-TT-A-T---TT-GA-GA--------------------A-ATTGGGGC-CAGC---CTCGC-AA-T-A-A-T-TA-GA--ACTTACA-GAATTC-CCCT---TTT-TAATTTTT-AC------A-------C--GT-GT-A-C-TT-TATTG----ATT-G------ACG--------------T---TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG--CTGCG
gi|51328                      :   CGC-GC--AA-G--AA-TGT-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAA-TA-G-AA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-T-G-G-GAC-A-C-AA------AT-TC-GCCAC---C-CGCTTCCAAAAG--GCGC--TT-A-C---TT-GA-GAT--T--AACAG----CGAT-A-ATT-GGGG-C--C---CTCGC-T--T-A-A-T-TA-GA-C
gi|51334                      :   CGC-AC--AA-G--AA-TGTGAC--A-GT---CC--AGTGA--TTG------A-A--C---G-T----G-AAC----A-CA---TG--------T-C-T-C--TAAG-AAT-TA-GGAATAA-T----A-TT-T--TT--GT--CA-TTG-G-ACC-A-C-AA-A--T-AT-TC-AC-AC-------------------ACGCA-TT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAA--G-CGAT-A-ATT-GGGA-C--C---CTCTC-TCTT-A-T-A-T--TA-CT---TAA-GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AAT------CC-GT--T-A-C-TT-AATTG----A-T-G------AGC--------------T-G-TA-CAA---C-A------T-A------T------TTT--TCT-TCTGCGTTtgacctacttaattgatgacgtgtaacatattttgtcgtctgcgtt
gi|51326                      :   CGC-GC--AA-G--AA-TGC-AC--A-GT---CC--AGTGA--T--------G-A--C---G-T----
gi|51349                      :                       -AC--A-GTGAACCTAAGTGA--T--------G-A--C---G-T----ATTAC----A-CA---TA--------T-T-T-C--
gi|51335                      :                                                                     ttttacgaccaa-CA---TG--------T-A-T-C--TAAG-AAA-AA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--AA-T-G-G-GAC-A-C-AA-C--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CATTTCCATACA--GCGGC-GT-A-T---TT-GA-GAT--G--AACAA--C-CGAT-A-ATT-GGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CG---AAC-TATTTTGTCCT---TTT-Tgtcgttctgcgt
gi|51336                      :                                                                                 -CA---TG--------T-A-T-C--TAAG-AAA-AAAGAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--AA-T-G-G-GAC-A-C-AA-C--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CATTTCCATACA--GCGGC-GT-A-T---TT-GA-GAT--G--AACAA--C-CGAT-A-A-T-GGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CG---AAC-TATTTTGTCCT---TTT-T
gi|51314                      :                                                                                                             G-AAG-TG-ACAA--A-T----A-AT-T--AT--GTACCA-T-G-G---C-A-T-GA-T--T-AT-TT-TCTAC-T-T-C
gi|51337                      :                                                                        atcgcgagagaatgtaaagtccagcgacgacatgaaacacatacatctat--A-T----A-ATAT--ATT-GT--CA-T-G-G--TC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAATA--GC-CT-GT-A-T---TT-GATGAT-----AGCAG--C-AAAT-A-ATA-GGGC-C--C---CTCGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GAATT--CCCC---T------TGGTT-ACA----AA-------CA-AT--T-A-C-TT-AATTA----C-TGG------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------A-A------T------TTCG-TCG-gctttcagttagcgccgtatttgcgattaactgccgataaccgatcccctctcaataattagacgaaatattttccaatttcatttttacaactgtgatcctaattgatgatgcacatacatattttgtcgtctgcgtt
gi|51298                      :                                                                                                                                                    A-T-G-G-GCC---C-AA-T--T-AT-CG-GCTGT-T----AATCTCAAATACTGCGC---T-T-T---TT-GG-AAT--CGGAGTGG--C-GAAT-A-ATT-GTGT-C--C---CAAGA-TA-T-A-A-T-TA-tatgagtt
gi|51338                      :                                                                                                            atcgcgcaagaatgcacagtccagtgatgacgtgaacacatgtctctaagaaatagaaaa--T-AT-TC-ACCAC-T-C-CGCTTCCAAATA--GCACC-GT-G-T---TT-GC-GAT--T--AACTG--C-CGAT-A-ATT-GGG--C--C---CTAGC-TA-T-A-A-A-TA-GA-CG---AAA-TATTT--CACA---ATT-ATATTTTT-ACA----AA-------TA-GT-GA-A-C-TT-CATTG----A-T-GAGGTACATG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTAG-TCG-TCTGCGTTtgctataaatcgacaaaagaattcccctttttatttttacaacagtgtactaaattgatgacgtatacacatattttgtcgtctg
gi|51339                      :                                                                                                                                                                                             GCTTCCAAATG--GCGCA-TT---T---TT-GA-GAT--T--AACAT--C-CGAT-A-ATT-GGGT-T--C---CTTGT-TA-A-A-A-A-TA-GA-CA---AAA-GAATT--CCTT---TTT-T
gi|51340                      :                                                                                                                                                                                               TTCCAAAAA--GCGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T--AACAA--T-CGAT-ACATT-GGGC-C--C---ATTGC-TA-T-A-A-A-TC-GA-CA---AAA-GAATT--CCCC---TTT-TTATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51341                      :                                                                                                                                                                                               TTCTAGATA--ACACC-GT-A-T---TT-AA-GAT--G--AACAG--T-CGAT-A--TT-GGGC-A--C---CTCAA-TA-T-A-A-A-TG-GA-CG---AAG-GATTT--CCCT---TTT-TTATTTT--AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-T-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51342                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            -TA-T-A-A-AACA-GAACA---AAA-GAATT--CCCCC--TTT-TTATTTTTTAC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TTTAATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTT
gi|51343                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCT---CTTGTTATTTT---C-----AA-------CA-GA-GT-T-C-TT-AACTG----AAT-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51348                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-C-TT-AATTA----A-T-G------ACA--------------T-T-TA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TTTG-TCG-TCTGTGTT
gi|51346                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTT-AC-----AA-------CA-GT--T---C-TT-AACTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51345                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cttgttaaTTTT-AC-----AA-------CA-GT--T---C-TT-AACTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51347                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cttgttaaTTTA-AC-----AA-------CA-GT--T---C-TT-AACTG----A-G-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51349                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cttgttaaTTTT-ACGACCAAA-------CA-GT-GA-A-C-CT-AAGTG----A-T-G------ACG--------------T-ATTA-C-A---C-A------T-A------T------TTCG-TCGTTCTGCGT
gi|51344                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTT-AC-----AA-------CA-GA-GT-T-C-TT-AACTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51350                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctctttgttaaTT-AC-----AA-------CA-GA-GT-T-C-TT-AACTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51328                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA---A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-TCTGCGTT
gi|51351                      :                                                                                                                                                                                               cgcgcaagaatgtacagtccagtgatgacgtgaacacatgtctctaagaaatagaaataattatgtcatgggacacaaattcgccacccgcttccaaaaggcgcttacttgagattaacagcgataattggggccctcgcttaattagactgacc-A-C-TT-AATTG----A-T-G------ATG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TTG-TCTGTGTT

lowQualScore                  :                                           1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :      1  2  1 22  1   1  44 3    11     22 2222222222222222 1 22 444 2  22  6666666 1 1 1 1   333 22 22    3   1  1    22 1 3333 1  1 22  33  11  1  1 1   2 2 1  4444 2  1  2     222 1          3 1 1   66  2 1 222  1  1   11 1     3333   1 2 1   5    1 11      2  1 1 22 1 1  1  22 77   1  11   1 2   1     1   11   1  55555  4444444  1  2  111   1   1  3333 2 1 666666   66666666666666 1 1  1 1 333 1 999999 1 222222 555555    1   1 1       
lowQualScore                  :      .  .  . ..  .   .  .. .    ..     .. ................ . .. ... .  ..  ....... . . . .   ... .. ..    .   .  .    .. . .... .  . ..  ..  ..  .  . .   . . .  .... .  .  .     ... .          . . .   ..  . . ...  .  .   .. .     ....   . . .   .    . ..      .  . . .. . .  .  .. ..   .  ..   . .   .     .   ..   .  .....  .......  .  .  ...   .   .  .... . . ......   .............. . .  . . ... . ...... . ...... ......    .   . .       
lowQualScore                  :      1  2  1 66  1   1  11 2    55     66 6666666666666666 1 66 111 2  66  9999999 1 1 1 1   222 55 55    2   1  1    44 0 2222 1  1 66  66  55  1  1 1   3 3 1  1111 2  1  2     777 1          7 0 0   11  1 0 888  0  0   44 0     4444   0 1 0   1    1 55      1  1 1 66 1 1  1  66 00   1  55   1 1   9     0   44   0  66666  4444444  0  1  777   0   0  1111 0 0 888888   99999999999999 0 0  0 0 111 0 666666 0 999999 000000    1   1 1       
consensus                     : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAANA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
Reference ( family-383 )      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAANA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51298                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGC-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--AT--CT-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATTCCAAAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CATTGC-TA-T-A--A-A-TC-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTA-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTG
gi|51299                      : ATCGC-GC-A--G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TA--AA-------C-A-C-A-TAT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GCC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CCTAGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CCT-TTTTC-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-ATT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-A-CTGCGTT
gi|51300                      : ATCGG-GC-AA-G--AA-TGC-AC--A-GTGC--AGTGA--T----------------G-A--T---G-TG--AA-------CTA-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--AT--CT-TG-G-GAC-ATC-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATTCCAAAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--ATTTGC--A-T-A--A-A-TC-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATG--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-A-CA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCA-T-CTGCGTT
gi|51301                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGC-AC--A-GTCC--ATTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-G-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CT-TG-G-GAC-A-C-AA-T--G-AT-TC-GCCAC---C-CGA-TCCAAAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACTG--T-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CATCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C--AAA-GA--ATT---CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51302                      : ATCGCTGC-A--G--AA-TGT-AC--A-GT-C--AGTGA--T----------------A-A--C---G-TG--AA-------C-A-CAA-TGT-A-T--C--T-AG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-TA-AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CGTTTCCAAATT-G-CGCT-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--ACTCGC-TA-T-A--A-A-CA-GA--C-AAAA-AA--GTT-C-CCC-CTTTT-ATT--TTT-AC-----AG-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CCGCGTT
gi|51303                      : ATCGC-GC-GA-A--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AAA------C-A-C-A-TGT-A-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-TT-TC-GCCAC-T-T-CGCTTCCAAATA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GC-GAA--T-AACAT--C-CGA-T-A-ATT-GGGT-C--CCTTGC-TA-T-C--A-A-TA-GA--C-AAAC-GG--TTT-C-CCCTTTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACGTAAACACATATACAT-G-TA-T-A---T-A------T-A------T------TTTG-TCC-T-CTGCGTT
gi|51304                      : ATCGC-GC-AAAG--AA-TGC-AC--A-GTCC--AGTGAA-T----------------G-AGTC---A-TG--AA-------C-A-C-A-TG--C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT----AT--AT--CT-TG-G-GAC-A-C-AAAT--T-AT-TC-GCCAC-A-CGCGATTCCAAAAAAG-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--T-CCA-T-A-ATT-GGGC-C--CAT-GC-TA-T-ATAA-A-TC-GA--C-AAAA-GA--AT--C-CCC-TTTTT-ATT--TT--AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51305                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TAT-AC--A-GTCC--TGTTA--T----------------G-A--C---T-TG--AAACACATAC-A-C-A-TGT-A-TATC--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-AAC-A-CGAA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAATA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T-AACTG--C-CGA-T-A-ATT-GGAT-C--CATTGC-TA-T-G--A-A-TA-GA--C-GAAA-GA--TTT-C-CCA-ATTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------TA-GT-GA-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACC--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTCG-TTG-T-CTGCGT
gi|51306                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-ACC-A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--T-----TG--AA---------A-C-A-TAT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-TT---A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GACGA-C-AA-T--TGAT-TC-GCCACCT-T-CGCTTCCAAAAA-G-CGCC-GT-AGT---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-TGA-ATT-GGGC-C--CC-CGCCTAGT-A--A-A-TA-GA--C-AAAAAGA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTA-TC-----AA-------CA-GT-GT-A-TTT--AT-TG----A-T-G-------CG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTGTTCG-T-CTGCGTT
gi|51307                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGCGA--T----------------G-A--C---A-TG--AA-------C-A-T-A-TAC-A-T--C--TAAG-AAA-TG-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-C-T-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-T-CGCTTTCAAATA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T-AACTG--T-TGA-C-A-ATT-GGGC-C--CCTAGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAA-AA--TTT-C-CCA-ATTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CT-GT-GC-A-CCT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T--------A---T-G------T-A------T------TTTG-TCA-T-CTGCGTT
gi|51308                      : ATAGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCA--AGTGA--T----------------G-A--C---G-T----A-------C-A-C-A-TGT-C-TT-C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-GCGAC-A-C-AA-A--T-A--TC-GCCAC-C-C-CGCTTCAAAAAG-G-CGCCTTT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACA------GATT-A-ATTGGGGC-C--CCTCGCTTA-T-A--A-T-TA-GA--C-TTAA-GA--ATT-C-CC---TTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-A------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T--------T------TTTG-TCG-T--TGCGTT
gi|51309                      : ATCGC-GC-AA-G--A--TGC-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A------G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AA--TA-GAAA--G-T----A-AT--------------------------C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGATTCCAAA---G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GATGGT-AACAG--T-CAA-T-A-AT--GGGC-C--C-TCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C--AAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AA-----CA-------CA-GT-GT-A-TTT--AT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------CATTGTATTTG-T-G-TGCTGCGTT
gi|51310                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGCGA--T----------------G-A--C---G-TG--AAA------C-A-C-A-TAC-A-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-TAC--------------------------------------ATA-G-CGCT-GT-A-TAATTT-GC-GAT--T-AACTG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CTGCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--TTT-C-CCA-ATTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CT-AT-GA-A-CCT-AAT-TG----A-T-GAAGTATACA--------------T-G-TA-C-G---C-AAAATTTT-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51311                      : ATCGC-CC-AA-G--AA-TGT-ACCAA-GTCC--AGCGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TAC-A-T--C--TAAGAAAA-TA-GAAA--A-T----
gi|51312                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AG--A-TTCT--GGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TA-G-GAC-A-C-AA-T--TAAT-TT-GCCAC-T-T-TGCTTCCAAATG-G-CG-C-AT-T-T---TT-GA-GAT--T-AACA---T-CGA-T-A-ATT-GGGT-T--CCTTGT-TA-A-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CTT-TTTT
gi|51313                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-TGT-AA--A-TTCT--GGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-G-AA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TA-G-GAC-A-C-AT-T--A-AT-TT-GCACC-T-T-TGCTTCCAAATG-G-CG-C-AT-T-T---TT-GA-GAT--T-AACAT--C-CGA-T-A-ATT-GGGT-T--CCTTGT-TA-A-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CTT-TTTT
gi|51314                      : ATCGC-GA-GA-G--AA-TGT-AA--A-GTCC--AGCGA--C----------------G-A--C---A-TG--AAA------C-A-C-A-TAC-A-T--C--TATG-AAG-TA-GAAA--A-T----A-AT-C--AT--GC--CA-TG-G-TAC-A-T-AA-T--T-AT-TT-GTCAC-T-T-CGCTTTCAGTTA-G-CGCC-GT-A-T---TT-GC-GAT--T-AACTG--C-CGA-T-A-ACC-GATC-C--CCTCTC-AA-T-A--A-T-TA-GA--C-GAAA-TA--TTT-T-CCA-ATTTC-ATT--TTT-AC-----AA-------CT-GT-GA-T-CCT-AAT-TG----A-T-G------ATG--------------C-A-CA-T-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51315                      : ATCGA-GC-A--G--AG-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---GGTG--AA-------C-G-C-A-TGT-C-T--CG-CAAGCAAA-TT-GAAA--A-T----G-AT-T--AT--GT--CA-TG-G--AC-A-A-CA-C--T-AT-TC-TCCAC-TTC-CGCTTCCAAGTA-G-CAT--GT-A-T---TT-GA-GAT--T-ACAAG--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-T--TA--T-GACA-GG--A-------------G-ATG--TTT-ACA----AA-------CA-GTGGTAA-TTT-AAT-TGATATA-T-G------ACG--------------T-T-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51316                      : ATCGC-G--AA-G--AA-TG--AC--A-GTC---AGTGA--T----------------G-T--A---G-TGGAAA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TTAA-GAA-TA-GAAA----T----A-AT-T--AT--AT--T--TG-G-GG--A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGATT--AAAGA-G-CGCA-GT-A-TG--TT-GA-G-T--T-AACAG-----GA-T----TT-GGGC-T--CATTGC-TA-T-A--A---TC-GA--T-AAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-A-T--TTT-AC-----AA--------A-GT-GT---CTA-AAT-TG----A-T-G------AC---------------T-A-T--C-C---T-A------T--------T------TTTG-TCG-T-CTGAGT
gi|51317                      : ATCGC-GCCAA-G--AAGTGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--A--------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-
gi|51318                      : ATCTC-GC-AA-G--AA-TGC-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--A---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-----------------T-T--GG--CT--CAATGCG-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGATTCCAAAAA-G-CGAT-GT-A-----TT-GA-GA---T-AACAG--T-CGA-T-A-ATT--GGC-C--CATTGC-TA-T-
gi|51319                      : ATCGC-GC-AA-G--AA-AGT-AC--A-GCCC--AGTGA--C----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-A-T--C--TAAGAAAA-TA-GAAA--ATT----T-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TC-GTCAC-T-C--------------G-CGCT-GT-A-T---TA-GA-AAT--T-AACAG--C-TGA-T-A-ATT-G
gi|51320                      : ATCGC-GCCAA-GGCAA-AGT-AC--A-GCCCTAAGTGA--C----------------GTA--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-AAT--C--TAAG-AAAATA-GAAA--A-T----TTAT-T--TT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-TTAT-AT-TC-G-TAC-T------TTC-------G-CGCT-GT-A-T---GTAGA-AAT--T-AACAG--C-TGA-T-A-ATT-G
gi|51321                      : ATCGC-GC-AA-G--A--TGT-AC--AAGTCC--ACTGA--TTTTTCCAAGGTTGGGAG-A--CC--G-TG--A------------C-A-TAT-A-T--C--TAAG-----TA-GAAC--T-T----T-AT-G--AT--GT--CA-TG-G-------C-AA-T--G-ATATT-GC-AC-T-C-AATTTC--AATA-G-CGC--GT-A-T---TT-GT-GAT--T-AACTG--CGCGA-TTA-ATT-GGGC-C--CA-CG--TA-TTA--A-A-TA-A-----GAAA-TATTGTT-T-CAA-TTTTT-ATT--TTT--C-----GA-------TA-GT-GA-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---A-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51322                      : ATC-C-GC-AA-GG-AA-TGT-ACGCA-GTCC--ACTGAGGTCCAGTTGA--------G-A--C---G-TG--AA---------A-C-ATTATAT-T--C--TAGA-GAT-TA-GAAA--A-T----A-A--T--AT--GT--CA-T--G-AAC-A-T-AA-T--T-AT-TCGGCCAC-T-C-AACTTCTAAATA-G-CGCC-G--A-T---TT-G--GAT--T-AA-AGGTC-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--AA-CAC-TA-T-AC-A-A-TA-GA--C-GAAA--------------------------TTT-AC-----GA-------TAGGT-GA-A-CTT-ATT-TG----A-T-G------ACG--------------TAG-GA-C-A---A-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51323                      : ATCAC-CC-AA-G--AA-TGT-AC--G-GTCA--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TGA-AA-------C-A-C-A-TGT-A-T--C--TATG-GAA-TA-GAAA--A-TATTAA-AT-T--AT--
gi|51324                      :  TCGC-GC-AA-G--AA-TGT-GT--T-GTTC--AGTAA--T----------------G-G--CT--GCTG-----------C---C-A-TGT-A-T--T--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-C--AT--GTAGCA-AG-G-G
gi|51325                      :   CGC-AC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-AC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAAAA-G-CGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-G-ATTGGGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-T-TA-AA--C-TTGT-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-AT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------AAG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------
gi|51326                      :   CGC-GC-AA-G--AA-TGC-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-T
gi|51327                      :   CGC-GT-AA-G--A--TGT-AC--AAGTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--A--TAAG-AA--TA-GAAA--A-T----A-AT-T--ATATGT--CA-TG-G-GAC-AGC-AA-A--T-AT-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCCAAAAA-G-CGCA-ATTA-T---TT-GA-GA----------------------ATT-GGGGGC--CCTCGC-TA-T-A--A-T-TA-GA--C-TTCA-GA--ATTTC-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CC-GT-GT-A-CTT-TATATG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---CAA------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51328                      :   CGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-G-AA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA------AT-TC-GCCAC---C-CGCTTCCAAAAG-G-CGCT--T-A-C---TT-GA-GAT--T-AACAG----CGA-T-A-ATT-GGGG-C--CCTCGC-T--T-A--A-T-TA-GA--CTGA-----------C-C-------T-ACT--T----------AA-------------------TT-GA--TG----A-C-G-----------------------T-G-TA---A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51329                      :   CGC-GC-AA-G--AA-TAT-AC--A-GTCC--TGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--TA-------C-A-C-T-TGT-C-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCGC-C-C-CGCTTCCAAAAA-G-CGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-CGA-T-A-ATTGGGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-T-TA-TA--C-TTAA-GA--ATA-C-CCC-TTTTT-A
gi|51330                      :   CGC-GC-AA-G--AA-TGT-AT--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-G--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--AGATAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-C-AA-A--T-AT-TC-GCCAC-C-C-CGCTTCCAAA-A-G-CGCC-TT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG--C-TGA-T-A-ATTGGGGT-C--CCTC-T-T----------------------AA-GA--ATT-C-CCC-TTCT--------------------------------------------T-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-AT-----T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51331                      :   CGC-GC-AA-G--A--TGT-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGTAT-T--C--TAAG-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--CA-TG-G-GAC-A-A-AA-T-----T-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCC-AACA-GTCGCA-TTGA-T---TT-GA-GAT--TCAACAG----CAA-T-A-GTT-GAGA-C--CCTCGC-TA-T-A--ATT-TA-GA--C-TTAA-GA--ATT-C-CCA--TTTT-A-C--TTT-AC------A-------CT-GTAAT-A-CTT-AAT-TGA---A-T-G------ACG--------------T-G-TAGC-AGG-C-A------T-A------TC-----TTTG-TCG-T-CTGCGT
gi|51332                      :   CGC-GC-AA-G--AA-TGT-AC--AAGTCC--AGTGA--T----------------G-AA-C---G-TG--AA-------C-AAC-A-TGT-C-T--C--TA-G-AAA-TA-GAAA--A-T----A-AT-TTAAT--TT--CA-TG-G-GAT-A-C-AA-AA-T-AT-TC-ACCAC-C-T-CGCTTCCAAAAA-G-CGCA-TT-A-T---TT-GA-GA--------------------A-ATTGGGGC-CAGCCTCGC-AA-T-A--A-T-TA-GAACT-TACA-GA--ATT-C-CCC-TTTTTAATT--TTT-AC------A-------C--GT-GT-A-CTT-TAT-TG----ATT-G------ACG--------------T---TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG---CTGCG
gi|51333                      :   CGC-GC-AA----AT-TGC-AC--A-GTCC--AGTGA--T----------------G-A--CCTCG-TG--AA-------C-A-----TGT-C-T--C--CAAG-AAA-TA-GAAAT-A-T----A-AT-T--ATT-GT--C--TG-G-GAC-A-C-AA-T--T-AT-TCCGCCAC-----CGGATTCACAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAG------A-T-A-ATT-GAGC-C--CATCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C--AAA-GA--ATT-C-CCC---TTT-ATT--TTT-A------AACCACACTCA-GT-AT-ACCTT-AAT-TG----A-T-GC-----ACGT-------------T-G-TA-C-A---C-A------TGA------T------TTTG-CCG-T-CTGC
gi|51334                      :   CGC-AC-AA-G--AA-TGTGAC--A-GTCC--AGTGA--TTG--------------A-A--C---G-TG--AA-------C-A-C-A-TGT-C-T--C--TAAG-AAT-TA-GGAATAA-T----A-TT-T--TT--GT--CA-TT-G-GACCA-C-AA-A--T-AT-TC-AC-----------------ACA---CGCA-TT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAA--G-CGA-T-A-ATT-GGGA-C--CCTCTC-TC-T----T-A-TATTA--C-TTAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AAT------CC-GT--T-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------AGC--------------T-G-TA-CAA---C-A------T-A------T------TTT--TCT-T-CTGCGTT
gi|51335                      :                                                                                      -C-A-TGT-A-T--C--TAAG-AAA-AA-GAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--AA-TG-G-GAC-A-C-AA-C--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CATTTCCATACA-G-CGGC-GT-A-T---TT-GA-GAT--G-AACAA--C-CGA-T-A-ATT-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAC-TA--TTT-TGTCC-TTTTT-
gi|51336                      :                                                                                      -C-A-TGT-A-T--C--TAAG-AAA-AAAGAAA--A-T----A-AT-T--AT--GT--AA-TG-G-GAC-A-C-AA-C--T-AT-TC-GCCAT-T-C-CATTTCCATACA-G-CGGC-GT-A-T---TT-GA-GAT--G-AACAA--C-CGA-T-A-A-T-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAC-TA--TTT-TGTCC-TTTTT-
gi|51337                      :                                                                                                                       --A-T----A-ATAT--ATT-GT--CA-TG-G-T-C-A-C-AA-T--T-AT-TC-GCCAC-T-C-CGCTTCCAAATA-G-C-CT-GT-A-T---TT-GATGAT----AGCAG--C-AAA-T-A-ATA-GGGC-C--CCTCGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CCC-T------TG--GTT-ACA----AA-------CA-AT--T-A-CTT-AAT-TA----C-TGG------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------A-A------T------TTCG-TCG-T-ATGAGTT
gi|51338                      :                                                                                                                                                                    --T-AT-TC-ACCAC-T-C-CGCTTCCAAATA-G-CACC-GT-G-T---TT-GC-GAT--T-AACTG--C-CGA-T-A-ATT-GGG--C--CCTAGC-TA-T-A--A-A-TA-GA--C-GAAA-TA--TTT-C-ACA-ATTAT-ATT--TTT-ACA----AA-------TA-GT-GA-A-CTT-CAT-TG----A-T-GAGGTACATG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTAG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51339                      :                                                                                                                                                                                         GCTTCCAAATG-G-CGC--AT-T-T---TT-GA-GAT--T-AACAT--C-CGA-T-A-ATT-GGGT-T--CCTTGT-TA-A-A--A-A-TA-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CTT-TTTT
gi|51340                      :                                                                                                                                                                                           TTCCAAAAA-G-CGCA-GT-A-T---TT-GA-GAT--T-AACAA--T-CGA-T-ACATT-GGGC-C--CATTGC-TA-T-A--A-A-TC-GA--C-AAAA-GA--ATT-C-CCC-TTTTT-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-A-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51341                      :                                                                                                                                                                                           TTCTAGATA-A-CACC-GT-A-T---TT-AA-GAT--G-AACAG--T-CGA-T-A--TT-GGGC-A--CCTCAA-TA-T-A--A-A-TG-GA--C-GAAG-GA--TTT-C-CCT-TTTTT-ATT--TT--AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-T-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51342                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     -TA-T-A--A-AACA-GAA-C-AAAA-GA--ATT-C-CCCCTTTTT-ATT--TTTTAC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTTTAAT-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTT
gi|51343                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -C-CTC-TTGTT-ATT--TT---C-----AA-------CA-GA-GT-T-CTT-AAC-TG----AAT-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51344                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-TCTTT-GTTAATTT-AC-----AA-------CA-GA-GT-T-CTT-AAC-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51345                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-TTGTT-AAT--TTT-AC-----AA-------CA-GT--T---CTT-AAC-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51346                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-TTGTT-AAT--TTT-AC-----AA-------CA-GT--T---CTT-AAC-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-ATACATGT-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51347                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-TTGTT-AAT--TTA-AC-----AA-------CA-GT--T---CTT-AAC-TG----A-G-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-ACATGTAT------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51348                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-ATT--TTT-AC-----AA-------CA-GT-GT-A-CTT-AAT-TA----A-T-G------ACA--------------T-T-TA-C-AATTC-A------T-A------TA-----TTTG-TCG-T-CTGTGTT
gi|51349                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T--TTT-ACGACCAAA-------CA-GT-GA-A-CCT-AAG-TG----A-T-G------ACG--------------T-ATTA-C-A---C-A------T-A------T------TTCG-TCGTT-CTGCGT
gi|51350                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TT-AC-----AA-------CA-GA-GT-T-CTT-AAC-TG----A-T-G------ACG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TCG-T-CTGCGTT
gi|51351                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A-CTT-AAT-TG----A-T-G------ATG--------------T-G-TA-C-A---C-A------T-A------T------TTTG-TTG-T-CTGTGTT