lowQualScore                  :          1         11                           222                                                                                                                  
lowQualScore                  :        5 5         66 0  0 11   8  999999999    555 111  0  111 11 3333  111 11  111 0 0  0 0 0 0 11  777 111 2   55 222 0 111   22222 11  0 111  11 1   1 11        
lowQualScore                  :        . .         .. .  . ..   .  .........    ... ...  .  ... .. ....  ... ..  ... . .  . . . . ..  ... ... .   .. ... . ...   ..... ..  . ...  .. .   . ..        
lowQualScore                  :        0 0         44 9  9 22   3  222222222    444 555  8  444 11 8888  444 11  333 8 8  7 7 7 7 00  555 333 2   99 111 8 333   66666 00  8 333  00 5   6 11        
consensus                     :      TCATTGTGCAAGTC-AT-TC-G--TCANATG--------AAGT-ANT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
Reference ( gi|65107 )        :      TCGTGGTGCAAGTC-TT-TC-G--TCAGATG--------AAGT-CAT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--AG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65104                      :      TCGTTATGTAAGTC-AT-TC-G--TTAGATG--------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---A-AGT--A---T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65100                      :      TCATTGTGTAAGTC-AT-TA-G--TCATATG--------AAGT-ATT---TC-AT---T--T----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TT--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65098                      :      TCATTGTGTTAGTC-AT-TC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----AT---T--AG---A-T-GC-A-T-T-T--CA--AG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65099                      :      TCATTGTGCAAGTC-AT-TC-G--TCAAAT---------AACT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-A-T-T--CG--GG---G-AGT--A---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--A-ACT-G--ATATTCTT
gi|65109                      :      TCATTGTGTACGTC-AT-TT-G--TCAGATG--------ATGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GT-A-G-T-T--CACTGG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATAATTTT
gi|65101                      :      TCATTGTGTAAGTC-AT-TC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--A----GT---T--AG---A-T-GC-A-A-T-T--TG--GG---G-AGCATA---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65110                      :      TCATTGTACAAGTC-AT-TT-G--TCAGA-----------AGT-ATT---TC-AA---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--AC---G-AAC--A---T-C---CGT-----C--AG-T---TT--T-AAT-G--ATATTCTT
gi|65112                      :      TCATTGTGTAAGTC-AT-TC-G--TCAGAT---------AAGT-AATATTTC-AT---T--G----GT---A--AG---A-T-ATGA-T-T-T--TG--TA---G-AAC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCT
gi|65117                      :      TCATTGTGTAAGTC-AT-TC-A--TTGTATG--------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CC--AG---GAAGC--A---TAC---TCT-----T--AG-----TT--T-ACTCA--ATGTTCTT
gi|65102                      :      TCATTGTGTAAGTC-ATATC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--A----GT---T--AG---AAT-GC-A-A-T-T--TG--GG---GGAGC--AATAT-T---CAT-----C--AG-T---TT--TTACT-G--ATTTTCTT
gi|65118                      :      TCATTGTGCACGTC-AT-TC--------ATG--------AAGG--A-----C-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--GG---G-ATC--A---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65124                      :      TCATTGTGCAAGAC-AT-TT-G--TCATATG--------AAAT-AGT---TC-ATACAT--GTAA-GT---T--AG---A-T-GT-A-G-T-T--TG--GG---C-AGA--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-AC------TATTTTT
gi|65116                      :      TCATTGTGTAAGTG-AT-TC-G--TCACCTG--------AAAT-ATT---TC-AT---T--G----TT---T--AG---A-A-GC-A-A-T-T--T---AG---G-GGC--A---T-C---TAT-----A--AC-T---TT--T-ACT-G--ATATCCTT
gi|65125                      :      TCATTGTGCGAGTCATC-T---------ATG--------TAGT-------TT-AT---G--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--AG--GA---G-AGC--A---T-C---TAT-----TTAAG-T---TT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65123                      :      TCATTGTGCAAGTC-AT-TC-AATCCAAAAG--------A--T---T---TC-AT---T--G----GT---TTAAG---A-TTGC-ACG-T-TTTCA--GA---G-AGC--A---T-C---CAT-----T--CG-T---TT--T-ACT-G--ATA
gi|65126                      :      TCATTGTGAAAGTC-AT-TC-G--GCAAATT--------A-GT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--NG---G-
gi|65135                      :           GTGTAAGTC-AT-TC-G--TCAAAT---------AAGT--AT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-A-T-T--CG--GG---G-AGC--A---T-----CAT--------AGTT---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65106                      :        attGTGTAAGTC-AT-TCTG--TGAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-T-A-T--CG--GG---G-AGCATA---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65119                      :      ttattGTGGAA-TC-AT-CC-C--TCATATG--------AAGT-AGC---TC-AT---T--G----GT---T--AA---A-T-GC-A-C-T-T--CG--GA---A-AAC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65136                      :      tcaatGTGCAAATC-AT-TC-G--TCATATG--------AAGC-AGT---TC-AT---T--G----GTTACT--AGTACA-T-GC-A-A-T-T--CA--TG---G-AGC--A---T-C---CATC----C--AG-G---TT--T-ACT-G--GTA
gi|65120                      :        atcGTGGAA-TC-AT-TC-C--TCATATG--------AAGT-AGC---TC-AT---T--G----GT---T--AA---A-T-GC-A-C-T-T--CG--GA---A-AAC--A---T-C---TAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65128                      :      tcaatGTACAATTC-AT-TT-A--ACAGATG--------AAGT-ATT---TT-AT---T--G----GC---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CT--GG---G-ATC--A---T-C---CATAAAAAA--AG------T--T-ACC-A--ATATTTTT
gi|65137                      :      tcactGTATGAGTT-AT-TC-G--TCAAATT--------AAGT-CGT---TT-AT---TTAG----GT---T--AC---A-T-GC-T-G-TAG--CG---G---G-TGT--A---T-C---CAT-----C--AT-T---TT--C-ACC-G--ATATT
gi|65127                      :        attGTGTTAGTC-AT-TC-G--TCAAATA--------A--C-CAT---T---T---C--GT---GT---T--AG---A-T-GC---G-T-T--CG--GG-------C--A---T-G---CAT-----C--AG-----TT--T-ACT-T--GTAT
gi|65134                      :       ttattTGCAAGTC-AT-TC-A--TCAAATA-----------T---T---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---G-AAC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65103                      :        atttTGCGAGTG-AT-TC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CA--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AA-T---TT--T-ACT-G--ATATTGTT
gi|65121                      :      tcatttTGCAAG-C-AT-TC-A--TCATATG--------AAGT-AGC---TT--T---T--G----GT---T--AC---C-T-GC-A-G-T-T--TG--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65122                      :      tcatttTGCAAG-C-AT-TC-A--TCATATG--------AAGT-AGC---TT--T---T--G----GT---T--AC-----T-GC-A-G-T-T--TG--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65130                      :      tcatttTGCAAGTC-AT-TC-A--TCATATGGAGCAAAGAAGT-AGT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG---G---G-AGCA-A---T-C---CAT---------G-T---TT--T-
gi|65113                      :        tcattGTAAGTC-AT-TC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TT-AT---T--G----GT---G--TG---A-T-GC-A-A-T-T--CG--GG---G-AGCATA---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-
gi|65129                      :       tcattgaCGAGTC-AT-TC-G--TCC--TG--------AAGT-CGT---TC-AT---T--G----GT---C--AG---A-T-TA-A-A------CA--CG---G-GGC--A---T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACT-C--ATATTCTT
gi|65139                      :       tcattgaaAAGTC-AT-TC-A--TCATATG--------AAGT-ACT---TC-AT---T--G----GG---T--TC---A-T-GC-A-C-T-T--TG--GG---G-AAC--A---T-C---CGT-----C--AG-T---TT--TAACT-G--ATGTTTTT
gi|65111                      :                 GTC-AT-TC-G--TCATATG--------AAGT-AGT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-T-G-T-T--TG--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACC-A--ATA
gi|65108                      :          tcattgtGTC-AT-TC-G--TCAAATA--------A--T-TAT---TTTAT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---G-ATC--A---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACG-G--ATATTCTT
gi|65114                      : tcattgtgcacgacgtGTC-AT-TC-T--TCATACA--------AAGTACAT---GT-AT------G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CA--GA---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65115                      :          tcattgtGTC-AT-TC-A--CCATATG--------AAGT-AGT---TC-AT---T--G----GT------AG---A-T-GC-A-T-T-T--CG--GG---G-AGC--A---C-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65138                      :          tcattgtGTC-AT-TC-A--TCATCAG--------AAGT-AGT---AC-AA---T--G----CT---T--AA---A-C-GC-A-G-T-T--CA--GG---G-AGC--G---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-GCT-ATCATGTTCTT
gi|65132                      :          atcatgtGTC-AT-TG-A--TAAGATG--------AAGT-AGT---TC-AT---T--G----GT---G--AG---A-T-GC-A-GTT-T--CA--AAAATG-AGT------T-CGGGCA---------AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65142                      :           tcattgtTC-CT-TC-A--TCATATA--------AAGC-TGT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-AC-A-G-T-T--CG--GG---A-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--GAATTCTT
gi|65141                      :                  TC-AT-TC-A--TCAAAT---------AAGT-ATT---TT-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-A-T-T--CG--GG---G-AGCATA---T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65131                      :                  TC-TT-TC-G--TTATATG--------AAGT-AGT---TT-AT---A--T----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CT--GG---G-AGA--A---T-C---CGT-----------T---TTAAT-ACT-G--ATATTCTT
gi|65133                      :              tcattgtaT-TC-A--TCATCTG--------AAGT-AGT---GC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TA--TA---G-AGC--A---T-A---TAT-----C--AG-T---TT--C-ACT-G--ATACTCTT
gi|65143                      :            cattgtgccaT-TT-G--TCAGATG--------AAGT-ACT---TT-AT---C--G----GT---G--AG---A-T-GC-A-G-T-T--AG--GA---G-AAT--A---T-C---CAT-----C--TG-T---AA--T-ACC-G--ATGTTCTT
gi|65144                      :                      ttaC-G--TCAAAT---------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-T-A-T-T--CG--GG---G-AGCATA---T-T---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65105                      :                                  ata--------AAGT-ATT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--GG---G-AGA--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65146                      :                              tcattgtgttatgccattcgttT---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65145                      :                                                    T---TC-AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--TG--GG---A-AGT--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TA--T-ACT-G--ATACTCTT
gi|65147                      :                                                gtgtT---TC-AT---T--GTATGGT---A--AG---A-T-GC-A-T-T-T--CA--GG---G-AGT--A---C-C---CAA-----T--AG-T---TT--T-ACT-G--ATGTTCTT
gi|65140                      :                                                          -AT---T--G----GT---T--AG---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---GAAGT--AT--T-C---CAT-----C--AG-TTTCTT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65148                      :                                aagtcattttttgtgaaacattatctgtT---T--G----AT---T--AG---A-T-GC-T-G-T-T--TG--TA---A-AGC--A---T-G---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-A--ATATTCTT
gi|65149                      :                                                                    ----GT---C--AG---A-T-GT-A-G-T-T--CG--AG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ATT-G--ATACTCTT
gi|65150                      :                                                                                  ---A-T-GC-A-G-T-T--CA--GG---G-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACA-G--TTATTCTT
gi|65151                      :                                                                                  ---A-T-GC-A-G-T-T--CG--GG---A-AGC--A---T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACCAG--TTATTCTT
gi|65152                      :                                                                                           -A-G-T-T--CG--GG---A-AGC--A---T-C---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ACATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :                                  111111111                                                                                                                        
lowQualScore                  :         4 11 222     0  0 0   4  000000000 11    3 0  111  222 11 3333  111 11  222  0  0 0 0  11 0 11  111 0   777 0 0 111   22222 11  1 111  11 0   1 11        
lowQualScore                  :         . .. ...     .  . .   .  ......... ..    . .  ...  ... .. ....  ... ..  ...  .  . . .  .. . ..  ... .   ... . . ...   ..... ..  . ...  .. .   . ..        
lowQualScore                  :         1 33 666     9  9 9   1  666666666 22    4 8  444  777 11 0000  333 11  000  7  7 7 7  77 7 00  333 7   111 7 7 333   66666 00  5 333  00 7   5 11        
consensus                     : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
Reference ( family-382 )      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTANT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65098                      : TCATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----AT---T--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65099                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGT---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--A-ACT-G--ATATTCTT
gi|65100                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TA-G-TCATATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-T--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65101                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--T-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65102                      : TCATTGTGTA--A---GTCATATC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AGA--AT-GC-A-A-TT--TGG--GG---G-AGCAATA-T-T---CAT-----C--AGTT---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65103                      : TCATTTTGCG--A---GTGAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AA-T---TT--T-ACT-G--ATATTGTT
gi|65104                      : TCGTTATGTA--A---GTCAT-TC-G-TTAGATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGT---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65105                      : TCATTGTGTT--AT--GCCAT-TC-G-TTA---------------AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65106                      : TTATTGTGTA--A---GTCAT-TCTG-TGAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-T-AT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65107                      : TCGTGGTGCA--A---GTCTT-TC-G-TCAGATG--------A--AGTCAT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65108                      : TCATTGTGCACGACGTGTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ATTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACG-G--ATATTCTT
gi|65109                      : TCATTGTGTA--C---GTCAT-TT-G-TCAGATG--------A--TGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--C-ACTGG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATAATTTT
gi|65110                      : TCATTGTACA--A---GTCAT-TT-G-TCA---G--------A--AGTATT-TC---AA---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--AC---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--T-AAT-G--ATATTCTT
gi|65111                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACC-A--ATA
gi|65112                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAGATA--------AGTAATATT-TC---AT---T--G----GT---A--AG---AT-ATGA-T-TT--T-G--TA---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCT
gi|65113                      : TCATTGAGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---G--TG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-
gi|65114                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-T-TCATACA--------A--AGTA----C---ATGTAT--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65115                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-A-CCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT------AG---AT-GC-A-T-TT--C-G--GG---G-AGC---A-C-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65116                      : TCATTGTGTA--A---GTGAT-TC-G-TCACCTG--------A--AATATT-TC---AT---T--G----TT---T--AG---AA-GC-A-A-TT--T-A--GG---G--GC---A-T-C---TAT-----A--AC-T---TT--T-ACT-G--ATATCCTT
gi|65117                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-A-TTGTATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TTC-C-A--GG---A-AGC---A-TAC---TCT-----T--AG-----TT--T-ACTCA--ATGTTCTT
gi|65118                      : TCATTGTGCA--C---GTCAT-TC-------ATG--------A--AGGA----C---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65119                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-CC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65120                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-TC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---TAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65121                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC---CT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65122                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC----T-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65123                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-AATCCAA----------A--AG-ATT-TC---AT---T--G----GT---TTAAG---ATTGC-ACG-TTTTC-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----T--CG-T---TT--T-ACT-G--ATA
gi|65124                      : TCATTGTGCA--A---GACAT-TT-G-TCATATG--------A--AATAGT-TC---ATACAT--GTAA-GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--T-G--GG---C-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-AC------TATTTTT
gi|65125                      : TCATTGTGCG--A---GTCAT-CT-A-T------------------GTAGT-TT---AT---G--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AGC---A-T-C---TAT-----TTAAG-T---TT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65126                      : TCATTGTGAA--A---GTCAT-TC-G-GCAAATT--------A---GTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--NG---G-
gi|65127                      : TTATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACCATT-TC---GT-----------GT---T--AG---AT-GC---G-TT--C-G--G-------GC---A-T-G---CAT-----C--AG-----TT--T-ACT-T--GTAT
gi|65128                      : TCACTGTACA--A---TTCAT-TT-A-ACAGATG--------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GC---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-ATC---A-T-C---CATAAAAAA--AG------T--T-ACC-A--ATATTTTT
gi|65129                      : TCATTGAACG--A---GTCAT-TC-G-TCC--TG--------A--AGTCGT-TC---AT---T--G----GT---C--AG---AT-TA-A-A-CA--C-G--GG---G---C---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACT-C--ATATTCTT
gi|65130                      : TCATT-TGCA--A---GTCAT-TC-A-TCATATGGAGCAAAGA--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T----GG---G-AGCA--A-T-C---CAT---------G-T---TT--T-
gi|65131                      : TCATTGTA---------TCTT-TC-G-TTATATG--------A--AGTAGT-TT---AT---A--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-AGA---A-T-C---CGT-----------T---TTAAT-ACT-G--ATATTCTT
gi|65132                      : TCATTGTG---------TCAT-TG-A-TAAGATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---G--AG---AT-GC-A-GTTT--C-A--AAAATG-AGT-----T-CGGGCA---------AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65133                      :  CATTGTGC---------CAT-TC-A-TCATCTG--------A--AGTAGT-GC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-A--TA---G-AGC---A-T-A---TAT-----C--AG-T---TT--C-ACT-G--ATACTCTT
gi|65134                      :   ATTTTGCA--A---GTCAT-TC-A-TCAAAT---------------ATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65135                      :   ATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTA-T-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-----CAT--------AGTT---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65136                      :   ATCGTGCA--A---ATCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGCAGT-TC---AT---T--G----GTTACT--AGTACAT-GC-A-A-TT--C-A--TG---G-AGC---A-T-C---CATC----C--AG-G---TT--T-ACT-G--GTA
gi|65137                      :   ATTGTATG--A---GTTAT-TC-G-TCAAATT--------A--AGTCGT-TT---AT---TTAG----GT---T--AC---AT-GC-T-G-TA--G-C--GG---G-TGT---A-T-C---CAT-----C--AT-T---TT--C-ACC-G--ATATT
gi|65138                      :              ---GTCAT-TC-A-TCATCAG--------A--AGTAGT-AC---AA---T--G----CT---T--AA---AC-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---G-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-GCT-ATCATGTTCTT
gi|65139                      :   atcatgtA--A---GTCAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTACT-TC---AT---T--G----GG---T--TC---AT-GC-A-C-TT--T-G--GG---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--TAACT-G--ATGTTTTT
gi|65140                      :          A--A---GTCAT-TT-T-T--TGTG--------A--AACATTATCTGTAT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---GAAGT---ATT-C---CAT-----C--AG-TTTCTT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65141                      :                  TCAT-TC-A-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65142                      :                  TCCT-TC-A-TCATATA--------A--AGCTGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-AC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--GAATTCTT
gi|65143                      :                  TTAT-TT-G-TCAGATG--------A--AGTACT-TT---AT---C--G----GT---G--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AAT---A-T-C---CAT-----C--TG-T---AA--T-ACC-G--ATGTTCTT
gi|65144                      :                    AT-AC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65145                      :                                               GTGTT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---A-AGT---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TA--T-ACT-G--ATACTCTT
gi|65146                      :                                                   T-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65147                      :                                                   T-TC---AT---T--GTATGGT---A--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--GG---G-AGT---A-C-C---CAA-----T--AG-T---TT--T-ACT-G--ATGTTCTT
gi|65148                      :                                                           T---T--G----AT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--TA---A-AGC---A-T-G---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-A--ATATTCTT
gi|65149                      :                                                                   ----GT---C--AG---AT-GT-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ATT-G--ATACTCTT
gi|65150                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACA-G--TTATTCTT
gi|65151                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACCAG--TTATTCTT
gi|65152                      :                                                                                         -A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ACATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :                                  111111111                                                                                                                        
lowQualScore                  :         4 11 222     0  0 0   4  000000000 11    2 0  111  222 11 3333  111 11  222  0  0 0 0  11 0 11  111 0   777 0 0 111   22222 11  1 111  11 0   1 11        
lowQualScore                  :         . .. ...     .  . .   .  ......... ..    . .  ...  ... .. ....  ... ..  ...  .  . . .  .. . ..  ... .   ... . . ...   ..... ..  . ...  .. .   . ..        
lowQualScore                  :         1 33 666     9  9 9   1  666666666 22    7 8  444  777 11 0000  333 11  000  7  7 7 7  77 7 00  333 7   111 7 7 333   66666 00  5 333  00 7   5 11        
consensus                     : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
Reference ( family-382 )      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65098                      : TCATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----AT---T--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65099                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGT---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--A-ACT-G--ATATTCTT
gi|65100                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TA-G-TCATATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-T--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65101                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--T-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65102                      : TCATTGTGTA--A---GTCATATC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AGA--AT-GC-A-A-TT--TGG--GG---G-AGCAATA-T-T---CAT-----C--AGTT---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65103                      : TCATTTTGCG--A---GTGAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AA-T---TT--T-ACT-G--ATATTGTT
gi|65104                      : TCGTTATGTA--A---GTCAT-TC-G-TTAGATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGT---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65105                      : TCATTGTGTT--AT--GCCAT-TC-G-TTA---------------AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65106                      : TTATTGTGTA--A---GTCAT-TCTG-TGAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-T-AT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65107                      : TCGTGGTGCA--A---GTCTT-TC-G-TCAGATG--------A--AGTCAT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65108                      : TCATTGTGCACGACGTGTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ATTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACG-G--ATATTCTT
gi|65109                      : TCATTGTGTA--C---GTCAT-TT-G-TCAGATG--------A--TGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--C-ACTGG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATAATTTT
gi|65110                      : TCATTGTACA--A---GTCAT-TT-G-TCA---G--------A--AGTATT-TC---AA---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--AC---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--T-AAT-G--ATATTCTT
gi|65111                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACC-A--ATA
gi|65112                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAGATA--------AGTAATATT-TC---AT---T--G----GT---A--AG---AT-ATGA-T-TT--T-G--TA---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCT
gi|65113                      : TCATTGAGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---G--TG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-
gi|65114                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-T-TCATACA--------A--AGTA----C---ATGTAT--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65115                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-A-CCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT------AG---AT-GC-A-T-TT--C-G--GG---G-AGC---A-C-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65116                      : TCATTGTGTA--A---GTGAT-TC-G-TCACCTG--------A--AATATT-TC---AT---T--G----TT---T--AG---AA-GC-A-A-TT--T-A--GG---G--GC---A-T-C---TAT-----A--AC-T---TT--T-ACT-G--ATATCCTT
gi|65117                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-A-TTGTATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TTC-C-A--GG---A-AGC---A-TAC---TCT-----T--AG-----TT--T-ACTCA--ATGTTCTT
gi|65118                      : TCATTGTGCA--C---GTCAT-TC-------ATG--------A--AGGA----C---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65119                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-CC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65120                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-TC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---TAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65121                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC---CT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65122                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC----T-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65123                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-AATCCAA----------A--AG-ATT-TC---AT---T--G----GT---TTAAG---ATTGC-ACG-TTTTC-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----T--CG-T---TT--T-ACT-G--ATA
gi|65124                      : TCATTGTGCA--A---GACAT-TT-G-TCATATG--------A--AATAGT-TC---ATACAT--GTAA-GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--T-G--GG---C-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-AC------TATTTTT
gi|65125                      : TCATTGTGCG--A---GTCAT-CT-A-T------------------GTAGT-TT---AT---G--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AGC---A-T-C---TAT-----TTAAG-T---TT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65126                      : TCATTGTGAA--A---GTCAT-TC-G-GCAAATT--------A---GTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--NG---G-
gi|65127                      : TTATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACCATT-TC---GT-----------GT---T--AG---AT-GC---G-TT--C-G--G-------GC---A-T-G---CAT-----C--AG-----TT--T-ACT-T--GTAT
gi|65128                      : TCACTGTACA--A---TTCAT-TT-A-ACAGATG--------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GC---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-ATC---A-T-C---CATAAAAAA--AG------T--T-ACC-A--ATATTTTT
gi|65129                      : TCATTGAACG--A---GTCAT-TC-G-TCC--TG--------A--AGTCGT-TC---AT---T--G----GT---C--AG---AT-TA-A-A-CA--C-G--GG---G---C---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACT-C--ATATTCTT
gi|65130                      : TCATT-TGCA--A---GTCAT-TC-A-TCATATGGAGCAAAGA--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T----GG---G-AGCA--A-T-C---CAT---------G-T---TT--T-
gi|65131                      : TCATTGTA---------TCTT-TC-G-TTATATG--------A--AGTAGT-TT---AT---A--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-AGA---A-T-C---CGT-----------T---TTAAT-ACT-G--ATATTCTT
gi|65132                      : TCATTGTG---------TCAT-TG-A-TAAGATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---G--AG---AT-GC-A-GTTT--C-A--AAAATG-AGT-----T-CGGGCA---------AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65133                      :  CATTGTGC---------CAT-TC-A-TCATCTG--------A--AGTAGT-GC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-A--TA---G-AGC---A-T-A---TAT-----C--AG-T---TT--C-ACT-G--ATACTCTT
gi|65134                      :   ATTTTGCA--A---GTCAT-TC-A-TCAAAT---------------ATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65135                      :   ATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT--C---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-----CAT--------AGTT---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65136                      :   ATCGTGCA--A---ATCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGCAGT-TC---AT---T--G----GTTACT--AGTACAT-GC-A-A-TT--C-A--TG---G-AGC---A-T-C---CATC----C--AG-G---TT--T-ACT-G--GTA
gi|65137                      :   ATTGTATG--A---GTTAT-TC-G-TCAAATT--------A--AGTCGT-TT---AT---TTAG----GT---T--AC---AT-GC-T-G-TA--G-C--GG---G-TGT---A-T-C---CAT-----C--AT-T---TT--C-ACC-G--ATATT
gi|65138                      :              ---GTCAT-TC-A-TCATCAG--------A--AGTAGT-AC---AA---T--G----CT---T--AA---AC-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---G-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-GCT-ATCATGTTCTT
gi|65139                      :   atcatgtA--A---GTCAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTACT-TC---AT---T--G----GG---T--TC---AT-GC-A-C-TT--T-G--GG---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--TAACT-G--ATGTTTTT
gi|65140                      :          A--A---GTCAT-TT-T-T--TGTG--------A--AACATTATCTGTAT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---GAAGT---ATT-C---CAT-----C--AG-TTTCTT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65141                      :                  TCAT-TC-A-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65142                      :                  TCCT-TC-A-TCATATA--------A--AGCTGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-AC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--GAATTCTT
gi|65143                      :                  TTAT-TT-G-TCAGATG--------A--AGTACT-TT---AT---C--G----GT---G--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AAT---A-T-C---CAT-----C--TG-T---AA--T-ACC-G--ATGTTCTT
gi|65144                      :                    AT-AC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65145                      :                                               GTGTT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---A-AGT---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TA--T-ACT-G--ATACTCTT
gi|65146                      :                                                   T-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65147                      :                                                   T-TC---AT---T--GTATGGT---A--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--GG---G-AGT---A-C-C---CAA-----T--AG-T---TT--T-ACT-G--ATGTTCTT
gi|65148                      :                                                           T---T--G----AT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--TA---A-AGC---A-T-G---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-A--ATATTCTT
gi|65149                      :                                                                   ----GT---C--AG---AT-GT-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ATT-G--ATACTCTT
gi|65150                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACA-G--TTATTCTT
gi|65151                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACCAG--TTATTCTT
gi|65152                      :                                                                                         -A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ACATTCTT


blockSeqs                     :         C CG CGT              A  GGAGCAAAG GT    T    TGT  GTA TA TATG  TAC TA  TAC            TT   CT  AAT     AAT     GGG   AAAAA TA  T TTC  AA     C TC
blockSeqs                     :         T .  T                T  G         .     T    .    ACA .  TAA   .   .   A              C    .   .       AT      .     C     .   T .    .      A . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       AT      .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       AT      .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                A  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       AT      .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                G  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       AT      .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       A       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                G  A         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                A  A         .     A    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                G  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                G  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                C  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         G .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         G .  .                T  T         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                A  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                A  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         A .  .                A  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                G  T         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  G         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                G  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  A         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                A  G         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         C .  .                T  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         T .  .                A  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         . .  .                T  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         . .  .                T  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         . .  .                T  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         . .  .                A  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :         . .  .                T  .         .     C    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :           .  .                G  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :           .  .                A  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :              .                .  .         .     G    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                               .  .         .     C    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                               .  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                               .  .         .     T    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                               .  .         .     .    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                  .    .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                       .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                       .    .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                            .   .  .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                                   .     .   .   .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .      . . 
blockSeqs                     :                                                                                 .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .          
blockSeqs                     :                                                                                 .              .    .   .       .       .     .     .   . .    .          
blockSeqs                     :                                                                                                .    .   .                                                 


blockSeqCons                  :                                  G********
originalCons                  : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
finalCons                     : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :                                  111111111                                                                                                                        
lowQualScore                  :         4 11 222     0  0 0   4  000000000 11    2 0  111  222 11 3333  111 11  222  0  0 0 0  11 0 11  111 0   777 0 0 111   22222 11  1 111  11 0   1 11        
lowQualScore                  :         . .. ...     .  . .   .  ......... ..    . .  ...  ... .. ....  ... ..  ...  .  . . .  .. . ..  ... .   ... . . ...   ..... ..  . ...  .. .   . ..        
lowQualScore                  :         1 33 666     9  9 9   1  666666666 22    7 8  444  777 11 0000  333 11  000  7  7 7 7  77 7 00  333 7   111 7 7 333   66666 00  5 333  00 7   5 11        
consensus                     : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
Reference ( family-382 )      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCANATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65098                      : TCATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----AT---T--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65099                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGT---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--A-ACT-G--ATATTCTT
gi|65100                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TA-G-TCATATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-T--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65101                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--T-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65102                      : TCATTGTGTA--A---GTCATATC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--A----GT---T--AGA--AT-GC-A-A-TT--TGG--GG---G-AGCAATA-T-T---CAT-----C--AGTT---TT--T-ACT-G--ATTTTCTT
gi|65103                      : TCATTTTGCG--A---GTGAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AA-T---TT--T-ACT-G--ATATTGTT
gi|65104                      : TCGTTATGTA--A---GTCAT-TC-G-TTAGATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGT---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65105                      : TCATTGTGTT--AT--GCCAT-TC-G-TTA---------------AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65106                      : TTATTGTGTA--A---GTCAT-TCTG-TGAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-T-AT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65107                      : TCGTGGTGCA--A---GTCTT-TC-G-TCAGATG--------A--AGTCAT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65108                      : TCATTGTGCACGACGTGTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ATTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACG-G--ATATTCTT
gi|65109                      : TCATTGTGTA--C---GTCAT-TT-G-TCAGATG--------A--TGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--C-ACTGG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATAATTTT
gi|65110                      : TCATTGTACA--A---GTCAT-TT-G-TCA---G--------A--AGTATT-TC---AA---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--AC---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--T-AAT-G--ATATTCTT
gi|65111                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACC-A--ATA
gi|65112                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAGATA--------AGTAATATT-TC---AT---T--G----GT---A--AG---AT-ATGA-T-TT--T-G--TA---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCT
gi|65113                      : TCATTGAGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---G--TG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-
gi|65114                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-T-TCATACA--------A--AGTA----C---ATGTAT--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65115                      : TCATTGTG---------TCAT-TC-A-CCATATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT------AG---AT-GC-A-T-TT--C-G--GG---G-AGC---A-C-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65116                      : TCATTGTGTA--A---GTGAT-TC-G-TCACCTG--------A--AATATT-TC---AT---T--G----TT---T--AG---AA-GC-A-A-TT--T-A--GG---G--GC---A-T-C---TAT-----A--AC-T---TT--T-ACT-G--ATATCCTT
gi|65117                      : TCATTGTGTA--A---GTCAT-TC-A-TTGTATG--------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TTC-C-A--GG---A-AGC---A-TAC---TCT-----T--AG-----TT--T-ACTCA--ATGTTCTT
gi|65118                      : TCATTGTGCA--C---GTCAT-TC-------ATG--------A--AGGA----C---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-ATC---A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--
gi|65119                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-CC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65120                      : TCAATGTGGA--A----TCAT-TC-C-TCATATG--------A--AGTAGC-TC---AT---T--G----GT---T--AA---AT-GC-A-C-TT--C-G--GA---A-AAC---A-T-C---TAT-----C--AG-T---TT--T-TCT-A--ATATTCTT
gi|65121                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC---CT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65122                      : TCATTTTGCA--A---G-CAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTAGC-TT----T---T--G----GT---T--AC----T-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----G--AG-T---TT--T-ACC-A--ATATTCTT
gi|65123                      : TCATTGTGCA--A---GTCAT-TC-AATCCAA----------A--AG-ATT-TC---AT---T--G----GT---TTAAG---ATTGC-ACG-TTTTC-A--GA---G-AGC---A-T-C---CAT-----T--CG-T---TT--T-ACT-G--ATA
gi|65124                      : TCATTGTGCA--A---GACAT-TT-G-TCATATG--------A--AATAGT-TC---ATACAT--GTAA-GT---T--AG---AT-GT-A-G-TT--T-G--GG---C-AGA---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-AC------TATTTTT
gi|65125                      : TCATTGTGCG--A---GTCAT-CT-A-T------------------GTAGT-TT---AT---G--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AGC---A-T-C---TAT-----TTAAG-T---TT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65126                      : TCATTGTGAA--A---GTCAT-TC-G-GCAAATT--------A---GTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--NG---G-
gi|65127                      : TTATTGTGTT--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--ACCATT-TC---GT-----------GT---T--AG---AT-GC---G-TT--C-G--G-------GC---A-T-G---CAT-----C--AG-----TT--T-ACT-T--GTAT
gi|65128                      : TCACTGTACA--A---TTCAT-TT-A-ACAGATG--------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GC---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-ATC---A-T-C---CATAAAAAA--AG------T--T-ACC-A--ATATTTTT
gi|65129                      : TCATTGAACG--A---GTCAT-TC-G-TCC--TG--------A--AGTCGT-TC---AT---T--G----GT---C--AG---AT-TA-A-A-CA--C-G--GG---G---C---A-T-C---CTT-----C--AG-T---TT--T-ACT-C--ATATTCTT
gi|65130                      : TCATT-TGCA--A---GTCAT-TC-A-TCATATGGAGCAAAGA--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T----GG---G-AGCA--A-T-C---CAT---------G-T---TT--T-
gi|65131                      : TCATTGTA---------TCTT-TC-G-TTATATG--------A--AGTAGT-TT---AT---A--T----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-T--GG---G-AGA---A-T-C---CGT-----------T---TTAAT-ACT-G--ATATTCTT
gi|65132                      : TCATTGTG---------TCAT-TG-A-TAAGATG--------A--AGTAGT-TC---AT---T--G----GT---G--AG---AT-GC-A-GTTT--C-A--AAAATG-AGT-----T-CGGGCA---------AG-T---TT--T-ACC-G--ATATTCTT
gi|65133                      :  CATTGTGC---------CAT-TC-A-TCATCTG--------A--AGTAGT-GC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-A--TA---G-AGC---A-T-A---TAT-----C--AG-T---TT--C-ACT-G--ATACTCTT
gi|65134                      :   ATTTTGCA--A---GTCAT-TC-A-TCAAAT---------------ATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---G-AAC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65135                      :   ATTGTGTA--A---GTCAT-TC-G-TCAAAT---------A--AGTATT--C---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGC---A-T-----CAT--------AGTT---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65136                      :   ATCGTGCA--A---ATCAT-TC-G-TCATATG--------A--AGCAGT-TC---AT---T--G----GTTACT--AGTACAT-GC-A-A-TT--C-A--TG---G-AGC---A-T-C---CATC----C--AG-G---TT--T-ACT-G--GTA
gi|65137                      :   ATTGTATG--A---GTTAT-TC-G-TCAAATT--------A--AGTCGT-TT---AT---TTAG----GT---T--AC---AT-GC-T-G-TA--G-C--GG---G-TGT---A-T-C---CAT-----C--AT-T---TT--C-ACC-G--ATATT
gi|65138                      :              ---GTCAT-TC-A-TCATCAG--------A--AGTAGT-AC---AA---T--G----CT---T--AA---AC-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---G-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-GCT-ATCATGTTCTT
gi|65139                      :   atcatgtA--A---GTCAT-TC-A-TCATATG--------A--AGTACT-TC---AT---T--G----GG---T--TC---AT-GC-A-C-TT--T-G--GG---G-AAC---A-T-C---CGT-----C--AG-T---TT--TAACT-G--ATGTTTTT
gi|65140                      :          A--A---GTCAT-TT-T-T--TGTG--------A--AACATTATCTGTAT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---GAAGT---ATT-C---CAT-----C--AG-TTTCTT--T-GCT-G--ATATTCTT
gi|65141                      :                  TCAT-TC-A-TCAAAT---------A--AGTATT-TT---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65142                      :                  TCCT-TC-A-TCATATA--------A--AGCTGT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-AC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--GAATTCTT
gi|65143                      :                  TTAT-TT-G-TCAGATG--------A--AGTACT-TT---AT---C--G----GT---G--AG---AT-GC-A-G-TT--A-G--GA---G-AAT---A-T-C---CAT-----C--TG-T---AA--T-ACC-G--ATGTTCTT
gi|65144                      :                    AT-AC-G-TCAAAT---------A--AGTATT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-T-A-TT--C-G--GG---G-AGCAT-A-T-T---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65145                      :                                               GTGTT-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---A-AGT---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TA--T-ACT-G--ATACTCTT
gi|65146                      :                                                   T-TC---AT---T--G----GT---T--AG---AT-GC-A-G-TT--T-G--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACT-G--ATATTCTT
gi|65147                      :                                                   T-TC---AT---T--GTATGGT---A--AG---AT-GC-A-T-TT--C-A--GG---G-AGT---A-C-C---CAA-----T--AG-T---TT--T-ACT-G--ATGTTCTT
gi|65148                      :                                                           T---T--G----AT---T--AG---AT-GC-T-G-TT--T-G--TA---A-AGC---A-T-G---CAT-----C--AG-T---TT--T-ACT-A--ATATTCTT
gi|65149                      :                                                                   ----GT---C--AG---AT-GT-A-G-TT--C-G--AG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---TT--T-ATT-G--ATACTCTT
gi|65150                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-A--GG---G-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACA-G--TTATTCTT
gi|65151                      :                                                                                 ---AT-GC-A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAT-----C--AG-T---GT--T-ACCAG--TTATTCTT
gi|65152                      :                                                                                         -A-G-TT--C-G--GG---A-AGC---A-T-C---CAC-----C--AG-T---TT--T-ACT-G--ACATTCTT