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lowQualScore                  :          .  .      .  .....   ...  ....... . .. .    .....   ..   .. .    . .. .    . .  ..   .....    ...  ..          
lowQualScore                  :          9  0      9  00000   666  0000000 8 11 1    88888   00   00 7    7 00 4    4 7  00   44444    000  77          
consensus                     :   TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
Reference ( gi|24244 )        :   TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24245                      :   TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24224                      :   TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24226                      :  aTCACCAT-AT-GCAGGT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--CCT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24225                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--TAG--T-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24229                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A----TATTTG-----CCT--TAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24228                      :  aTCACCAT-AT-ACAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTT-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-C---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24231                      :  aTCACCAT-GC--CAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-ATA--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24232                      :  aTCACCAT-AT-GCATAT-GT----GTAT--ATT---AGA-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-TGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24233                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AT--------A-A--CATTTG-----TCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTATTT
gi|24227                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAG-GT----GTAT--TTT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGT-C--A-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGT
gi|24230                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AGT---A-C-A-A--AATTTG-----TCT--TGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24234                      :  aTCACCAT-GT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-C-A--CATTTG-----CCT--CAG--T-GGGT-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24239                      :  aTCACCAT-CC-ACAGAC-GT----TTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCC--CAG--T-GGAC-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTC
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gi|24237                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-----------------------------ATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24236                      :  aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----------------------------TTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CCCC-CCTG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24242                      :  aTCACCAT-AT-GAGGAT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-A------------------CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--A---T---TGTC---AG--CGTTATAGTT
gi|24246                      :   aCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-C-A-A--AATTTG-----CCT--TGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ATT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24247                      :    CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----TTT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTT
gi|24248                      :    CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CGG--A-AGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTTGTT
gi|24250                      :    CACCAC-ATCGCAGAT-CT----GTAC--ATC---A-A-A-AAACAGTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-CCGC-TTTG-C-CG--ACT-T---TGTC---AG---GTTCTA
gi|24251                      :    CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24249                      :    CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--TAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24252                      :    CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24235                      :     ATCAT-AT-GCAGAT-AT----GCTT--ATT---T-A-A-A--CATATG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--CGTTCTAGTT
gi|24254                      :  ataACCAT-AT-GCAGAT-AT----GTGC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----TCT--CAG--C-GGGA-C--C-CTTG-C-TT--GCT-C---TGTC---AG--TGTACTAATT
gi|24240                      :     ACCAT-AT-GCAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--T-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTAGTT
gi|24243                      :  atgACCAT-AT-GCAGATTGT----GTAC--ATTTA-A-A-A-A--CATTTG-----CCA--TAG--T-GGTG-G--C-CTTGAA-TG--ACT-T---TGTCG--AG--TGTTC-AGTT
gi|24241                      : atcgACCAT-AT--CAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A----CATTTG-----C-T--CAG--T-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTATTT
gi|24257                      :  atgATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24261                      :     ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--AAG--T-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24255                      :     ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGT-TTTTCTAGTT
gi|24262                      :     ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--AAG--T-GGGG-C--C-CTTG-C-CG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24256                      :     ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTGG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24259                      :     ATCAA-AT-ACAGAT-GT----G-GC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--C--TTG-C-TG--ACC-A---TGTT---AG--TTTTCTAGTT
gi|24260                      :     ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CGC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACCATGCATGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24263                      :     ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--CGG--C-GGGG-C--C-TTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTT
gi|24264                      :      CCAC-AT-GCAGCG-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-AGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACA-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24265                      :       CAT-AA-GCAGAT-GT----TTGT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CCTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24266                      :        AT-AT-GCAGAT-GT------------------A-A-A--CATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTCATGAG--TGTTCTAGTT
gi|24267                      :         T-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--GATTTG-----CCT--CAG--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCT
gi|24268                      :               CAGGT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-G--CATTTG-----CCT--CAA--C-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---
gi|24270                      :           tatcaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24269                      :           atacaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--CGG--C-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24271                      :             atacaAT-GT----GTAT--AAT---A-A-A-T--AATTTG-----CTT--CAG--A-TGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TATC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24272                      :               acaAT-CT----GTAT--ATT---A-G-A-A--AATTCG-----ACT--TGG--T-GGGA-C--C-CTTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24273                      :                               --ATT---T-A-A-A--CATTTG-----CAT--CAG--T-GGGA-C--C-CTTA-C-TG--AGT-G---TGTC---AA--TGTTCTAGTT
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gi|24253                      :                                                     G-----CCT--CGG--C-GGGGGC--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTTTAGTT
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gi|24258                      :                                                      -----CCT--CAG--CCGGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTCTAGTT
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Alignments
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Reference ( family-381 )      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24224                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
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gi|24234                      :                                 aTCACCAT-GT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-C-A--CATTTG-----CCT--C--AGT-GGGT-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24235                      :                                   aATCAT-AT-GCAGAT-AT----GCTT--ATT---T-A-A-A--CATATG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--CGTTCTAGTT
gi|24236                      :                               ataTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----------------------------TTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCCC-CCTG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24237                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-----------------------------ATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
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gi|24239                      :                                 aTCACCAT-CC-ACAGAC-GT----TTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCC--C--AGT-GGAC-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTC
gi|24240                      :                                   aACCAT-AT-GCAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGT-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTAGTT
gi|24241                      :                                 atgACCAT-AT--CAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A----CATTTG-----C-T--C--AGT-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTATTT
gi|24242                      :                               atgTCACCAT-AT-GAGGAT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-A--CA------------------GC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--A---T---TGTC---AG--CGTTATAGTT
gi|24243                      :                                   aACCAT-AT-GCAGATTGT----GTAC--ATTTA-A-A-A-A--CATTTG-----CCA--T--AGT-GGTG-G--C-CTTGAA-TG--ACT-T---TGTCG--AG--TGTTC-AGTT
gi|24244                      :                              atcgTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24245                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24246                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-C-A-A--AATTTG-----CCT--T--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ATT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24247                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----TTT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTT
gi|24248                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGA-AGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTTGTT
gi|24249                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--T--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24250                      :                                   CACCAC-ATCGCAGAT-CT----GTAC--ATC---A-A-A-AAACAGTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-CCGC-TTTG-C-CG--ACT-T---TGTC---AG---GTTCTA
gi|24251                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24252                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24253                      :                                                                                    G-----CCT--C--GGC-GGGGGC--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTTTAGTT
gi|24254                      :    caccttcatacagatgccactttctttgataaACCAT-AT-GCAGAT-AT----GTGC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----TCT--C--AGC-GGGA-C--C-CTTG-C-TT--GCT-C---TGTC---AG--TGTACTAATT
gi|24255                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGT-TTTTCTAGTT
gi|24256                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTGG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24257                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24258                      :                                                                                     -----CCT--C--AGCCGGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTCTAGTT
gi|24259                      : atcaaatacagatgtcactttccttaattgatagcATCAA-AT-ACAGAT-GT----G-GC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C--TTG-C-TG--ACC-A---TGTT---AG--TTTTCTAGTT
gi|24260                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CGC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACCATGCATGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24261                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24262                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-CG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24263                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTT
gi|24264                      :                                     CCAC-AT-GCAGCG-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-AGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACA-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24265                      :                                      CAT-AA-GCAGAT-GT----TTGT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24266                      :                                       AT-AT-GCAGAT-GT------------------A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTCATGAG--TGTTCTAGTT
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gi|24268                      :                                              CAGGT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-G--CATTTG-----CCT--C--AAC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---
gi|24269                      :                                          tatcaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
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gi|24272                      :                                              acaAT-CT----GTAT--ATT---A-G-A-A--AATTCG-----ACT--T--GGT-GGGA-C--C-CTTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
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consensus                     :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
Reference ( family-381 )      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24224                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24225                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--T--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
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gi|24229                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A----TATTTG-----CCT--T--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24230                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AGT---A-C-A-A--AATTTG-----TCT--T--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24231                      :                                 aTCACCAT-GC--CAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-ATA--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24232                      :                                 aTCACCAT-AT-GCATAT-GT----GTAT--ATT---AGA-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-TGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24233                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AT--------A-A--CATTTG-----TCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTATTT
gi|24234                      :                                 aTCACCAT-GT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-C-A--CATTTG-----CCT--C--AGT-GGGT-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24235                      :                                   aATCAT-AT-GCAGAT-AT----GCTT--ATT---T-A-A-A--CATATG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--CGTTCTAGTT
gi|24236                      :                               ataTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----------------------------TTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCCC-CCTG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24237                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-----------------------------ATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24238                      :                                 aTTACCAT-TT-GGAGAT-GT----GCAT--ATTTTAA-A-A-A--CATTTT-----CCT--C--TGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---TG--TGTTCTAGTT
gi|24239                      :                                 aTCACCAT-CC-ACAGAC-GT----TTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCC--C--AGT-GGAC-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTC
gi|24240                      :                                   aACCAT-AT-GCAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGT-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTAGTT
gi|24241                      :                                 atgACCAT-AT--CAGAT-GT----GGAT--ATT---G-A-A----CATTTG-----C-T--C--AGT-CTGG-C--C-CTTG-C-TG--AGT-T---TTTC---AG--TGCTCTATTT
gi|24242                      :                               atgTCACCAT-AT-GAGGAT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-A--CA------------------GC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--A---T---TGTC---AG--CGTTATAGTT
gi|24243                      :                                   aACCAT-AT-GCAGATTGT----GTAC--ATTTA-A-A-A-A--CATTTG-----CCA--T--AGT-GGTG-G--C-CTTGAA-TG--ACT-T---TGTCG--AG--TGTTC-AGTT
gi|24244                      :                              atcgTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24245                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24246                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-C-A-A--AATTTG-----CCT--T--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ATT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24247                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----TTT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTT
gi|24248                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGA-AGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTTGTT
gi|24249                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--T--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24250                      :                                   CACCAC-ATCGCAGAT-CT----GTAC--ATC---A-A-A-AAACAGTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-CCGC-TTTG-C-CG--ACT-T---TGTC---AG---GTTCTA
gi|24251                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24252                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24253                      :                                                                                    G-----CCT--C--GGC-GGGGGC--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTTTAGTT
gi|24254                      :    caccttcatacagatgccactttctttgataaACCAT-AT-GCAGAT-AT----GTGC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----TCT--C--AGC-GGGA-C--C-CTTG-C-TT--GCT-C---TGTC---AG--TGTACTAATT
gi|24255                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGT-TTTTCTAGTT
gi|24256                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTGG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24257                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24258                      :                                                                                     -----CCT--C--AGCCGGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTCTAGTT
gi|24259                      : atcaaatacagatgtcactttccttaattgatagcATCAA-AT-ACAGAT-GT----G-GC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C--TTG-C-TG--ACC-A---TGTT---AG--TTTTCTAGTT
gi|24260                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CGC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACCATGCATGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24261                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24262                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-CG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24263                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTT
gi|24264                      :                                     CCAC-AT-GCAGCG-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-AGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACA-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24265                      :                                      CAT-AA-GCAGAT-GT----TTGT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24266                      :                                       AT-AT-GCAGAT-GT------------------A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTCATGAG--TGTTCTAGTT
gi|24267                      :                                        T-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--GATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCT
gi|24268                      :                                              CAGGT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-G--CATTTG-----CCT--C--AAC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---
gi|24269                      :                                          tatcaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24270                      :                                          atacaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24271                      :                                            atacaAT-GT----GTAT--AAT---A-A-A-T--AATTTG-----CTT--C--AGA-TGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TATC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24272                      :                                              acaAT-CT----GTAT--ATT---A-G-A-A--AATTCG-----ACT--T--GGT-GGGA-C--C-CTTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24273                      :                                                              --ATT---T-A-A-A--CATTTG-----CAT--C--AGT-GGGA-C--C-CTTA-C-TG--AGT-G---TGTC---AA--TGTTCTAGTT
gi|24274                      :                                                                 tT---A-A-A-A--AGGTTG-----CCT--C--AGC-GGG--C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24275                      :                                                           atttggTT---G-A-A-A--TATTTC-----CCT--C--TGC-GGAG-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24276                      :                                                                                ATTTG-----CCTGCCAGGGC-AGGG-C--C-CTTGAC-TGGAACT-T---TGTC---AG--TGTTCTATTT
gi|24277                      :                                                                            aacagTTTGTCA--CCT--T--AGC-GGAG-C--C-CTTG-C-TG--AAT-T---TGTC---AG--TGTTCTGGTT
gi|24278                      :                                                                                     -----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24279                      :                                                                                     -----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24280                      :                                                                                                   GC-GGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTA---AG--TGTTCTAGTT


blockSeqs                     :                                         C            CGCTG   TTA  TTAAA     AA      ATAGC      AGG            G    A           GCA    ATG  TT
blockSeqs                     :                                         C            CGCTG   TTA  TAAA      .       ATAGC      A              G    A           .      G    TT
blockSeqs                     :                                         C            CGCTG   A    AGA       .       ATAGC      A              .    .           .      .    T 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    GAT       .       ATAGC      A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    GAT       .       ATAGC      A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AAT       .       ATAGC      A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AAT       .       ATAGC      G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    GAT       .       ATAGC      A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       TCA        A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AC        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          T              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            T       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    TA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    GA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    GA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AC        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            T       T    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            T       T    CA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            T       T    CA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       T    AA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            G       A    AG        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            .       A    TA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            .       A    AA        .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            .       T    GA        .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            .       A    A         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                         .            .       A    .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                      .       A    .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                      .       .    .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                      .       .    .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                      .       .    .         .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                      .       .    .         .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                              .    .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                   .         .       .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                   .         .       .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          T              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          A              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          G              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                     .          .              .    .           .      .    . 
blockSeqs                     :                                                                                                               .    .           .             


blockSeqCons                  :                                  
originalCons                  :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
finalCons                     :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT





Alignments
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lowQualScore                  :                                         .  .      .  .....   ...  ....... . .. .    .....   .. ...  .    . .. .    . .  ..   . ...    ...  ..          
lowQualScore                  :                                         9  0      9  77777   333  5555555 8 11 4    55555   00 333  7    7 00 4    4 7  00   7 222    000  77          
consensus                     :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
Reference ( family-381 )      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24224                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24225                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--T--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24226                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGGT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--CCT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24227                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAG-GT----GTAT--TTT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGT-C--A-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGT
gi|24228                      :                                 aTCACCAT-AT-ACAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTT-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-C---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24229                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A----TATTTG-----CCT--T--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24230                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AGT---A-C-A-A--AATTTG-----TCT--T--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24231                      :                                 aTCACCAT-GC--CAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-ATA--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24232                      :                                 aTCACCAT-AT-GCATAT-GT----GTAT--ATT---AGA-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-TGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24233                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--AT--------A-A--CATTTG-----TCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTATTT
gi|24234                      :                                 aTCACCAT-GT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-C-A--CATTTG-----CCT--C--AGT-GGGT-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTTTAGTT
gi|24235                      :                                   aATCAT-AT-GCAGAT-AT----GCTT--ATT---T-A-A-A--CATATG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--CGTTCTAGTT
gi|24236                      :                               ataTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----------------------------TTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCCC-CCTG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24237                      :                                 aTCACCAT-AT-GCAGAT-----------------------------ATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
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gi|24239                      :                                 aTCACCAT-CC-ACAGAC-GT----TTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCC--C--AGT-GGAC-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTC
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gi|24243                      :                                   aACCAT-AT-GCAGATTGT----GTAC--ATTTA-A-A-A-A--CATTTG-----CCA--T--AGT-GGTG-G--C-CTTGAA-TG--ACT-T---TGTCG--AG--TGTTC-AGTT
gi|24244                      :                              atcgTCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24245                      :                                  TCACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24246                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-C-A-A--AATTTG-----CCT--T--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ATT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24247                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--TATTTG-----TTT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTT
gi|24248                      :                                   CACCAT-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--GGA-AGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTTGTT
gi|24249                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--T--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24250                      :                                   CACCAC-ATCGCAGAT-CT----GTAC--ATC---A-A-A-AAACAGTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-CCGC-TTTG-C-CG--ACT-T---TGTC---AG---GTTCTA
gi|24251                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24252                      :                                   CACCTTCAT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTA-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24253                      :                                                                                    G-----CCT--C--GGC-GGGGGC--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTTTAGTT
gi|24254                      :    caccttcatacagatgccactttctttgataaACCAT-AT-GCAGAT-AT----GTGC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----TCT--C--AGC-GGGA-C--C-CTTG-C-TT--GCT-C---TGTC---AG--TGTACTAATT
gi|24255                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGT-TTTTCTAGTT
gi|24256                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTGG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24257                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CAC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24258                      :                                                                                     -----CCT--C--AGCCGGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--T-TTCTAGTT
gi|24259                      : atcaaatacagatgtcactttccttaattgatagcATCAA-AT-ACAGAT-GT----G-GC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C--TTG-C-TG--ACC-A---TGTT---AG--TTTTCTAGTT
gi|24260                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GT-----CGC--TTT------------CCTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACCATGCATGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24261                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24262                      :                                    ATCAA-AT-ATAGAT-GT-----TACTTATC---A-ATA-A--C----------CCT--A--AGT-GGGG-C--C-CTTG-C-CG--ACC-A---TGTC---AG--TAGTCTAGTT
gi|24263                      :                                    ATCAA-AT-ACAGAT-GTCGCTGTCC--TTT---G-ATA-G--C----------CCT--C--GGC-GGGG-C--C-TTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTT
gi|24264                      :                                     CCAC-AT-GCAGCG-GT----GTAC--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-AGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACA-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24265                      :                                      CAT-AA-GCAGAT-GT----TTGT--ATT---A-A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CCTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24266                      :                                       AT-AT-GCAGAT-GT------------------A-A-A--CATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTCATGAG--TGTTCTAGTT
gi|24267                      :                                        T-AT-GCAGAT-GT----GTAT--ATT---A-A-A-A--GATTTG-----CCT--C--AGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCT
gi|24268                      :                                              CAGGT-GT----GTAT--TTT---A-A-A-G--CATTTG-----CCT--C--AAC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---
gi|24269                      :                                          tatcaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24270                      :                                          atacaAGAT-GT----TCAT---TT---C-A-A-A--CTTTTGATAGCCCT--C--GGC-GGGG-C--CGCTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AGTTTTTTCTAGT
gi|24271                      :                                            atacaAT-GT----GTAT--AAT---A-A-A-T--AATTTG-----CTT--C--AGA-TGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TATC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24272                      :                                              acaAT-CT----GTAT--ATT---A-G-A-A--AATTCG-----ACT--T--GGT-GGGA-C--C-CTTC-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24273                      :                                                              --ATT---T-A-A-A--CATTTG-----CAT--C--AGT-GGGA-C--C-CTTA-C-TG--AGT-G---TGTC---AA--TGTTCTAGTT
gi|24274                      :                                                                 tT---A-A-A-A--AGGTTG-----CCT--C--AGC-GGG--C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24275                      :                                                           atttggTT---G-A-A-A--TATTTC-----CCT--C--TGC-GGAG-C--C-CTTT-C-TG--ACT-T---TGTC---AG--TGTTCTAGTT
gi|24276                      :                                                                                ATTTG-----CCTGCCAGGGC-AGGG-C--C-CTTGAC-TGGAACT-T---TGTC---AG--TGTTCTATTT
gi|24277                      :                                                                            aacagTTTGTCA--CCT--T--AGC-GGAG-C--C-CTTG-C-TG--AAT-T---TGTC---AG--TGTTCTGGTT
gi|24278                      :                                                                                     -----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGTT
gi|24279                      :                                                                                     -----CCT--C--GGC-GGGG-C--C-CTTG-C-TG--ACC-A---TGTC---AG--TTTTCTAGT
gi|24280                      :                                                                                                   GC-GGGA-C--C-CTTG-C-TG--ACT-T---TGTA---AG--TGTTCTAGTT