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gi|90378                      : TAAATAA-TT-ACA-T----T--A-T------A------TA-A---C--------------GAA--AA-AA--A--A------T--ATT----G---T-CAA--A-A-A--AC-A---A--TA------A-------TC-T----A-----T----G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT----A------------T--A----TC-T----TA--G-GG-G-T-------A--T------T-T-T-----A---CAG-TGGA--T-TT---T-CCAGT--A---AT-A--------------T---------G-C-A-------CG---T----A-G--A---A--ATT--ATCTG---C--C---T----A-T-T-TTGACA--------A---A--TTCAA-G-CAG--G--T--TT---T-C-C-TA--A--A-----ACT--G------T-C----C---A-CA--T----T---A-----A--GA----------ACT-T-T-GCTC---A--TTATT-T-T----A-----TCATT---A-TC--T-----TC---AACTTCAA---TTCTGATGATG-T-----TTT-GTAC-G----A---AAA-T---A-T-TCC---AA--AATTGG-TGCGATTT
gi|90377                      : TAAATAA-TT-ACA-T----T--A-T------A------TA-A---C--------------GAA--AA-AA--A--A------T--ATT----G---T-CAA--A-A-A--AC-A---A--TA------A-------TC-T----A-----T----G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT----A------------T--A----TC-T----TA--G-GG-G-T-------A--T------T-T-T-----A---CAG-TGGA--T-TT---T-CCAGT--A---AT-A--------------T---------G-C-A-------CG---T----A-G--A---A--ATT--ATCTG---C--C---T----A-T-T-TTGACA--------A---A--TTCAA-G-CAG--G--T--TT---T-C-C-TA--A--A-----ACT--G------T-C----C---A-CA--T----T---A-----A--GA----------ACT-T-T-GCTC---A--TTATT-T-T----A-----TCATT---A-TC--T-----TC---AACTTCAA---TTCTGATGATG-T-----TTT-GTAC-G----A---AAA-T---A-T-TCC---AA--AATTGG-TGCGATTT
gi|90380                      : TAGATAA-TT-A-A-TACAGT--A-TGAT--TA------TA-A---C--------------CAA--AA-AA--A--A------TT-ATT--------T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TAG-----A--C---TC-------------TA---G-C-G------------GACCG-----G---------AT----C------------T--A----CC-TCAC-TA--G-GT-G-T-------T--T------T-C-------A---CA--TTA------T---G-CC--T--A---AT-A--------------CATAATATAGG-C-A-------CA---T----C-A--A---A--TTC--A--TGC--C--A---T----A-CAC-C--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G----------T-T-A-T---A--A-----AC----------T-T----A---T-CA--T----TTTAA-----A--AA----------A-A-T-T-G--C---A--T--T---------------T--TT---A-T---T-----TT---A--T---A---TTC------TT-T-----TCT-G--TAAA---A---AAA-T---A-T-T-C---AA--AA---G-TGCGATTT
gi|90376                      : TAGATAA-TT-A-A-TAAA-C--A-A--T--AA------TA-A---C--------------GAA---A-GA--A--A------T--ATTAATTG---T-T-A--A-G-G--AC-A---A--TA------A--A---TCC-T----A-----TT---G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT----C------------T--A----TC-T-----A--G-GT-G-T-------A--T------T-G-C-----A---CA--TTAA--T-TT---T-CT--G--A---AT-A--------------T---------G-C-A-------TA---T----T-A--A---A--TGT--A--TG---C--A---A----A-C-T-T--ACA--------C---A--T--AA-G-CA---G--T--TT---T-T-C-T---T--A-----ACT--
gi|90379                      : TATATAA-TT-A-AAT----T--A-T--T--TA-------A-A---C--------------GAA--AACAA--A--A------T--A------G---T-C-A--A-G-G--GCTA---A--TA------A--C---TCA-T----A-----TG---G-T-G------------G--TA-----A----TT--ACG----A------------T--A-------T----T---G-AT-A-T-------T-----------C-T-----A---CA--TTGA--T-TT---C-AT--T--A---AT-A--------------T---------G-C-A-------CA---T----T-A--A--------T--G--TG---T--AATCT----A-A-T-T--ATA--------A---AG-C--AA-A-AG---G--T--TC---T-T-T-TTG-A--A-----ACT--G------A-T----A-----CA--T----T---T-----A--AA----------A-T-T-TAA-TC---A--T--TT-TCT----ATTATCT--TT---A-----T-----TT---A--TTAAG---TTG------TG-T-----T-T-A--C------A---AAA-T---T-TAT-C---AA--AAT--T-TGCGAGTTTactggtaatat
gi|90381                      : TAGATAA-AT-C-A-T----T--A-T--T--TA------AA-A---C--------------GGA--AA-AA--A--C------T--ATT----G---C-C-A--A-G-G--GC-A---A--CA------A--C---TCT-T----A-----TA---G-T-A------------G--TA-----A----TT--CCT----C------------A--G----CT-T----TA--T-AT-G-T-------A--T------T-C-T-----A---CA--TTGA--T-T------------------T-A--------------C---------A-T---------CA---T----T-T--A---A--TTT--T--TG---CAAA---A----A-T-T-T--ACA--------A---A--T--AA-G--A---------TT---T-T-C-T---G--ATGGTGACTTAG------TCT----T---T-CT--T----T-------------T----------A-T-T-T---TC---A--T--TT-T-C----A-----T--TT---
gi|90383                      : TAGATGA-TT-A-A-T----T--A-------------------------------------------------A--A------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT----T------------T--A----CC-T----TA--G-GT-
gi|90384                      : TGGATAA-TC-A-A-T----T--A-T--T--CA------TA-A---C--------------GAA------A--A--C------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A--C---TCC-A----A-----CA---C-T-A------------C--TA-----A----TT--CCT----C------------T--G----TT-G----TA--T-GT-G-T-------A--A------T-C-T-----A---CA--ATGC--T-TT---tat
gi|90382                      : TAGATAA-TT-G-A-T----T--G-TA-T--TA------TC-A---C--------------GAA--AA-AA--A--T------T--AT-----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---C--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--CA-----A----T
gi|90371                      : TAAATAA-TC-A-A-T----T--A-C--T--TA------TA-A---C--------------GAA--AA-AA--AT-A------T--ATT----G---T-A-A--A-G-A--GC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-cattccggaatattctacaaataagcagtttttctaaactgttaaatttaaaatttgccaattttatttattttggttagtactgtcatccac
gi|90385                      : TAGATGA-TC-A-A-T----T--A-T--C--TG------TA-TTTTC--------------GAA---------A--A------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--AC-A---A--TA------A--CTGGTTC-T----C-----TG---G-T------------------------A----TTTGTCT----T------------T--A----TT-T----T---T-TT-G-T-------C--TA-----T-CAT-----A---CA--GTGA--T-TT---C-CT--T--G---AT-A--------------T---------T-C-AC------CA---T----T-A--ATCTA--TTT--A--TA---------------A-T-C-C--ATA--------A---A--G--AA-A-CA---G--T--TCATAT-T-A-T---AATA-----GCT--G------T-T-----------------------------G--AA----------A-TGT-T-G-TC---A--T--TT-T-C----A-----A--CA---G-T---T-----TT---A--TT------TTC------TG-
gi|90386                      :  AGATAA-TT-G-A-T----T--A-A--T--TA------TA-AA--C--------------GAA---A-GA--A--A------T--ATT----G---C-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-C-G------------G--CA-----A----TTT-CCT----C------------T--A----CCCT----TAC-G-GT-G-T-------A--T------T-C-T-----A---CAA-TTGA--T-TT---T-CC--T--A---AT-A--------------T---------G-C-A-------TA---T----A-A--A------TTT--A--TG---C--A---T----A-T-T-T--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G--T--TT---T-T-C-T---A--A-----ACT--G------C-T----A---A-CAT-T----T---T-----A--AA----------A-T-T-T-G-T----A--T--TT-T-T----A-----T--TT---A-T---T-----TT---A--TTCAA---TTC------TG-T-----CCT-A--C-GA---
gi|90387                      :  AGATAA-T----A-T----T--A-T--CA-TA------TA-A------------------GAA---A-AATTA--A------T--ATT----G---T-C-A------G--GC-A------TA------A--C---TCCGT----AA----TG---G-T-G------------G--C------A----TT--CCT----C------------T--A----CC-T----TACGG-GT-G-T-------T--T------A-T-A-----A---CAAATTGA--T-TT---T-C---T--A---AT-G--------------C---------------------CG---T----T-A--A---A--TTG--AA-TG---C--A---T----A-T-TGT--ACA---------------T--A--G-CA---A--T--GT---T-C-T-A---A--A-----ACT---------C-T----A-----CA--T----T---T-----A--AA----------A-T-T-T-G-TC---ACTT--TT-T-T----A--------TT---A-T---T-----TT---ATCTCAAA---TTC------TG-T-----TT-----C-TA---G---AAATT---A-T-T-C---AG--AAT--G-TG-GATTTgttttcagaa
gi|90388                      :    ATAG-AT-A-A-T----C--A-T--T--TA------TA-G---A--------------GAA-----AA--A--A------T--ATT----G---T-C-A--A-T-G--GC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT-----------------T--A----T--------------T-G-T-------A--T------T-C-T-----A---CA--TTGA--T-TT---T-CC--T--A---AT-A--------------T---------G-T-A-------CA---T----T-A--A---A--TTT--A--TA---C--A---T----A-T-T-T--AAA--------A---A--C--AG-G-CA---G--T--TT---T-T-T-TTTAA--A-----ACT--G------T-T----A---A-CA--T----T---T-----A--AA----------A-T-T-T-G-TC---A--T--TT-T-T----A-----T--TT---A-T---T-----TT---A--CTAAA---TTC------TG-T-----TTT-T--C-AA---A---AAT-C---A-T-T-C---AA--A
gi|90389                      :    ATAA-TC-A-A-T----T--A-T--C--TAAATATATA-A---C--------------GAA---A-AA--A--A------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A--C---TC-------AGGAATTG---G-T-G------------G--CA-----A----TT--CCT----CCCGCAATTCCTCT--A----CC-T----TA--G-GT-G-T-------A--T------T-C-A-----A---C------------------------------T-A--------------T---------G-C-A-------CA---T----T-----------TTT--A--TG---C--A---T----A-T-T-T--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G--T--TT---T-T-C-T---A--A-----ACT--G------T-T----A---A-CA--T---------------------------------------TC---A--G--TT-T-A----AACG--A--TT---A-T---T-----TT---A--TTAAA---GTC------TG-T-----TTT-A--C-GA---A---AAT-C---A-T-T-C---GA--AAT--G-TGCGATTTT
gi|90390                      :      AA-TC-A-A-T----A--A-T--T--TA------TA-A---T--------------GGA---A-AA--A--C------T--GTT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--T------------------T----T-----T------------------------------------TT--CCT----C------------T--A----C-------TG--A-AT-A-T-------CTAT------T-A-T-----A---CA--ATGA--T-TT---C-CT--T--A---AT-A--------------T---------C-C-C-------CA---T------T--A---A--TTC--A--TA---C--A---T----A-G-T-G--ATA--------A---A--T--TT-G-CA---GGAT--TT---T-T-A-T---T--T-----ACT--G------T-T----G---A-TA--T----A---A-----A--AAAAAAAATGCCA-T-T-T-GAAC---ATTT--TT-T-T----A-----T--CT---ATT---T-----TT---A--TT--A---TTC------TA-T-----TTA-A--C-G--------------------------AA--AAT--A-TGCGATTTT
gi|90391                      :       A-TT-A-A-G----TCAA-T--T--TA------TA-A---C--------------GAA--AC-AA--A--T------T--ATT----G---T-C-ATAA-G-G--GT-A------TA------A--C---TCC-A----A-----TGT--G-T-GA-----------G--CA-----C----TT--CGT----C------------T--A----CA-T----TA--G-TT-G-C-------A--T------T-C-T-----C---C---TTGAA-T-TT---T-CC--T--A----T-A--------------T-----------C-A-------CA---T----T-A--A---A-------A--TG---CG-A---C----A-T-T-T--ACA--------A------T--AG-T-CA---G--T--TT---T-C-C-T---A--A-----ACT--G------T-T----G---A-CAAGT----T---A-----A--AA--------------T-T-GCTC---A-----TT-T-T----A-----T--TT---T-C---TAAGAGTT---A--TTGAT---TTT------CG-T-----C---------A---A---AAG-TATCA-T-T-C---AA--AAC--G-TGCGAGTTT
gi|90392                      :        -TT-A-T-T----T--T-T--C--TA------TA-AA--C--------------GAA--AA-AA--A--A---------GTT----G---T-C-C--ACG-GT-GC-A---A--TAT-----A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--CATAATTA----TC--ACT----C------------T--AA---CC-A----TA--C-GT-G-T-------A--T------T-C-TTAAGTA---TA--TTGA--T-TTCTTT-CC--T--A---AT-A--------------T---------G-CGA-------CT---T----C-C--A---GCTTTT--A--TC---CC-A---T----AAT-T-T--ACA--------A---T--A--AA-GTCA---G--TATTT---C-T-C-T---A--G-----AAC--G------G-T----A---G-CA--T----T---A---------A----------A-T-T-T-T-AC---A--T--TTAT-T----A-----T--TT---A-TGA-T-----TTGTCA--TTAAACACTCC------TG-C-----TCT-A--C-GT---A---AGA-TC--A-T-T-C---AC--AAT--G-TTGGATT
gi|90394                      :             -A-T----T--A-TA-T--TA------TA-A---C--------------------A-AA--A--A------TT-ATT----G---T-C-A--A-G-G---C-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG-----T-G---------------CT-----A----TCG-TCT----A------------T--A----CT-T----TA--G--T-G-T-------G--T------T-C-T-----AT--CA--TCGA--T-TT---T-CT--C--A---AA-A--------------C---------A-C-AATGATGACA---T----CTA--A---A--TTC--A--T----C--A---T----A-T-A-C--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G--T--TT---T-T-TAT---A--A-----ACT-----------T----A---T-CA--T----T---A-----A--AA----------A-A-A-A-A-TC---A--T--TT-T-T----A-----T--TT---A-T---T-----T
gi|90393                      :             -A-T----C--A-T--T--TA------TA-A---C--------------GAAAACA-AA--A--A---------ATT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------ATGC---TCC-T----A-----TG---C-T-G------------A---A-----A----TT--TCT----C------------C--A----C----------------------------------------------G---CA--TTGA--T-TT---C-CC--T--A---AT-A--------------T---------C-C-A-------CA---T----T-A--G---A--TTT--A--TA---C--T---T----C-T-T-C--AT----------------T--TA-G-AA---G--T--TT---T-T-T-TCA-A--A-----ACT--G------T-T----G---A-CA--T-----------------------------A-T-T-T-ATTT---A--T--TT-T-T----------T--TT---T-T---T-----TT---A--CGAAA---
gi|90395                      :                 ----T--A-T--T--TG------TA-A---T--------------GAA--AA-AA--AGAA------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--AC-ATTTA--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--TA-----A----TT--CCT----T------------T--A----CC-T----TA--T-GT-G-T-------A--T------T-C-T-----A---CA--TCGA--T-TT---C-CC--T--A---AT-A--------------C---------A-T-G-------TA---T----GTA--C---A--TTT--A--Tat
gi|90396                      :                                 A------TA-A---T--------------CAA--TA-AA--A---------T--GT-----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---C-T-G------------G---G-----A----TT--TC-----C------------T--A----TA-T----TG--T-AT-G-A-------T--T------T-C-C-----A---CA-----A--T-TT----------------AT-A--------------C---------A-T-ATT-----CA---T----A-A--A-------TT--A---G---C--A---T------T-T-T--A
gi|90398                      :                                                --------------GAA--CA-AA--A--A------T--GTT----G---T-C-A--A-G-G--GA-A---A--TA------A--C---CCC-T----A-----TG---A-T-G------------G--ttaaa
gi|90397                      :                                                               AA--AA-AA--A--A------T--ATT----G---T-C-A--A-G-G--GC-A---A--TA------A------TCC-T----A-----TG---G-T-G------------G--CG-----ATATTTT--CCT----C------------T--AGTATCT-T----TA----GT-G-T-------T--TG-----T-CTT-----AATTCA--TTGA----TT---T-CC--T--A---AT-AATAATGCTATTTGTC---------G-A-A-------CA---TTTGCA-A--A---T--TTC--A--TG---T--A---T----A-T-TAC--ACA--------A---A--T--AA-GTCA---G--T--TT---T-T-A-T---A--A-----ACT--G------T-T----A-----CA--T----T---ATAAACA--AA----------A-T-T-T-A-------------T-T-T----AG----T--CT---A-T---T-----TT---A--taa
gi|90401                      :                                                                 aaaA-AA--A--A------T--GCT----G---C-C-A--A-G-GCGGC-A---A--TA------A--C---TCC-T----A-----TG---G-T-A------------A--TA-----A----TT--TCT----C------------T--A----
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gi|90377                      :                                                                           TAAATAA-TT-ACA-T----T--A-T------A------TA-A---C--------------GAAAA-AA-A--A------T--ATT-G---T-CA--A-A-A--AAC-A---A--TA------A--T------C-T---A-----T----G----T-G-GC-------------A-----A-T----T--C------------C---T----AT--A----TC-T----TA--G-GG-G-TAT-------------TT-----T--A---C-AG----------T--GGA----T---T----TT-CCAG--T--A---A--T-A---------T--G--C----------A-------C-GT-A---GA---A--ATT--ATCT-G---C--C---T----A-T-T-TTGACA--------A---A--TTCAA-G-CAG--G--TTT---T-C-C-TA--A--A--ACT-GT-C--C-A-C-A-T---T---------AA-----GA----------ACT-T-T-GCTC---A--TTATT-T-T----A----TCATT---A-TC----T-----TC---AACTTCAA---TTCTGATGATGTTT-----TGT-AC--G-A---AA--A-T-A-TTCC---AA--AATTGG-TGCGATTT
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gi|90385                      :                                                                           TAGATGA-TC-A-A-T----T--A-T--C--TG------TA-TTTTC--------------GAAAA--------------T--ATT-G---T-CA--A-G-G--A-C-A---A--TA------A--CTGGT-TC-T---C-----T----G---GT------------------------A-T----TTGT------------C---T----TT--A----TT-T----T---T-TT-G-TCTA------------TCA----T--A---C-A-----------G--TGA----T---T----TC-CT----T--G---A--T-A---------T--T--C----------AC------C-AT-T---AATCTA--TTT--A--T-A---------------A-T-C-C--ATA--------A---A--G--AA-A-CA---G--TTCATAT-T-A-T---AATA--GCT-GT-T-------------------------G-----AA----------A-TGT-T-G-TC---A--T--TT-T-C----A----A--CA---G-T-----T-----TT---A--TT------TTCTG--------
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Reference ( family-379 )      :                                                                           TAGATAA-TT-A-AT----T--A-T--T--TA------TA-A---C--------------GAAAA-AA-A--A------T--ATT-G---T-CA--A-G-G--G-C-A---A--TA------A--C---T-CC-T---A-----T----G---GT-G-GC-------------A-----A-T----T--C------------C---T----CT--A----CC-T----TA--G-GT-G-TAT-------------TC-----T--A---C-A-----------T--TGA----T---T----TTCC----T--A---A--T-A---------T--G--C----------A-------C-AT-T---AA---A--TTT--A--T-G---C--A---T----A-T-T-T--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G--TTT---T--T-C-T---AA--ACT-GT-T--A-A-C-A-TT---------T---A-----AA----------A-T-T-T-G-TC---A--T--TT-T-T----A----T--TT--A-T-----T-----TT---A--TTAAA---TTCTG--------T-----TCT-AC--G-A---AA--ATT-A-TT-C---AA--AAT--G-TGCGATTTT
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gi|90399                      :                                                                                                                                         AAA-AA-A--A------T--GTT-GG--T-GA--A-G-G--G-C-A---A--CA------A--C---T-CC-T---A-----T----T---CT-G-GT-------------A-----A--------------------------------T--A----CTGT----T------T-G-TA---------------------C--A---C-A-----------A--TGA----T---T----TATC----T--G---A--T----------------------------------------------A---A--TTC-----C-G---C--A---T----A-T-T-T--GTAC-------G---G--T--AA---CA------TTT---TCAT-T-T---AA--ACT-AT-T--G-A-C-A-TT---------A---A-----AA----------A-T-T-A-G-TC---A--C--TT-T-T----
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gi|90382                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --A---T----A-T-TCT--ACA--------A---A--T--AA-G-CA---G--TTT---T--T-C-T---AA--ACT-GT-T--A-A---A-TT---------T---A-----AA----------A-T-T-T-G-CC---A--A--TT-T-T----A----T--TT--A-T-----T-----TT---G--GTTAG---TACTG--------TCA---TCC-AC--tttatttattttggttagtactgtcatccac
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gi|90384                      :                                                                           TGGATAA-TC-A-AT----T--A-T--T--CA------TA-A---C--------------GAAAA-C------------T--ATT-G---T-CA--A-G-G--G-C-A---A--TA------A--C---T-CC-A---A-----C----A---CT-A-CT-------------A-----A-T----T--C------------C---T----CT--G----TT-G----TA--T-GT-G-TAA-------------TC-----T--A---C-A-----------A--TGC----T---T----T
gi|90385                      :                                                                           TAGATGA-TC-A-AT----T--A-T--C--TG------TA-TTTTC--------------GAAAA--------------T--ATT-G---T-CA--A-G-G--A-C-A---A--TA------A--CTGGT-TC-T---C-----T----G---GT------------------------A-T----TTGT------------C---T----TT--AT---TT-T----TT--T-GT-C-TAT-------------CA-----T--A---C-A-----------G--TGA----T---T----TCCT----T--G---A--T-A---------T--T--C----------AC------C-AT-T---AATCTA--TTT--A--T-A---------------A-T-C-C--ATA--------A---A--G--AA-A-CA---G--TTCATAT--T-A-T---AA---------T--A-G-C-T-GT---------T---G-----AA----------A-TGT-T-G-TC---A--T--TT-T-C----A----A--CA--G-T-----T-----TT---A--TT------TTCTG--------
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blockSeqs                     :                                                                                  .  G C  AAA  .  . A  A   ATGAA   . TTAA                   C    GAA       CA     G      .      T  A T .   .   G      .  .        T   CAGA  .    T         .             .       .    T  .            .   A     A  AAG  TG CAC   AT    T C   .              ACA   .  A   A TT          .    AT   A   AA   T  AG   .  .   .    ATAA      AGG   G          G          G AA   .   A    C  TC   C   G  AT  A      A G TG   C        .   G  TC    T  GTT      .   G    A TA   .         AC          ATAAAC        .      GTT        C C     C  .   TTA        AAAA G    CA  .  T TAG   .      C   AC  C  C       ATGATGTT CA    G .  A  . .    .  T . .  C .    .    TG .
blockSeqs                     :                                                                                  .  A C  C    .  . A  .   .       . TTTC                   .    AA        T      .      .      .  . . .   .   T      .  .        .   T     .    .         .             .       .    G  .            .   .     .  T    C  C     CG    . .   .              G     .  T   . AA          .    T    .   .    T  AG   .  .   .    .         GG    .          C          . A    .   .    .  A    .   .  .   .      . A TG   .        .   .  .     .  GGA      .   .    . TG   .         A           TTTA          .      .          . .     A  .   CTT        C    .    .   .  . GA    .      .   TC  C  .       T        .     C .  .  . .    .  T . .  . .    .    .  .
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blockSeqs                     :                                                                                  .  . .  .    .  . .  .   .       . C                      .    A         .      .      .      .  . . .   .   .      .  .        .   .     .    .         .             .       .    .  .            .   .     .  .    C  .     G     . .   .              .     .  .   . .           .    .    .   .    T  .    .  .   .    .         G     .          .          . A    .   .    .  .    .   .  .   .      . . .    .        .   .  .     .  G        .   .    . .    .         A           T             .      .          . .     .  .   T          .    .    .   .  . .     .      .   .   C  .       .        .     C .  .  . .    .  T . .  . .    .    .  .
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blockSeqs                     :                                                                                  .  . .  .    .  . .  .   .       . C                      .    C         .      .      .      .  . . .   .   .      .  .        .   .     .    .         .             .       .    .  .            .   .     .  .    A  .     G     . .   .              .     .  .   . .           .    .    .   .    C  .    .  .   .    .         G     .          .          . G    .   .    .  .    .   .  .   .      . . .    .        .   .  .     .  A        .   .    . .    .         C           T             .      .          . .     .  .   T          .    .    .   .  . .     .      .   .   A  .       .        .     G .  .  . .    .  T . .  . .    .    .  .
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blockSeqs                     :                                                                                  .  . .  .    .  . .  .   .       . C                      .    A         .      .      .      .  . . .   .   .      .  .        .   .     .    .         .             .       .    .  .            .   .     .  .    T  .     G     . .   .              .     .  .   . .           .    .    .   .    C  .    .  .   .    .         G     .          .          . A    .   .    .  .    .   .  .   .      . . .    .        .   .  .     .  G        .   .    . .    .         A           T             .      .          . .     .  .   T          .    .    .   .  . .     .      .   .   A  .       .        .     T .  .  . .    .  T . .  . .    .    .  .
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blockSeqs                     :                                                                                       .  .    .  . .  .   .       . .                      .    A         .      .      .      .  . . .   .   .      .  .        .   .     .    .         .             .       .    .  .            .   .     .  .    C  .     G     . .   .              .     .  .   . .           .    .    .   .    T  .    .  .   .    .         C     .          .          . T    .   .    .  .    .   .  .   .      . . .    .        .   .  .     .  G        .   .    . .    .         G           T             .      .          . .     .  .   T          .    .    .   .  . .     .      .   .   .  .       .        .     C .  .  . .    .  .                      
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gi|90416                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----T--TT--A-T-----T-----TT---A--TTCAA---TTCTG--------T-----TCT-AC--G-A---A-------A-TT-C---AA--AAG--G-TGCGATTTT