lowQualScore                  :                                                                         1                       
lowQualScore                  :      0 1   0 11 1 1111 0 0 8888888 0 11   11   1  2 0  33  0  0   0 11  0      0  11 1          
lowQualScore                  :      . .   . .. . .... . . ....... . ..   ..   .  . .  ..  .  .   . ..  .      .  .. .          
lowQualScore                  :      7 5   7 77 4 5555 7 7 1111111 7 77   00   4  1 7  88  7  7   7 00  5      7  00 5          
consensus                     : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
Reference ( gi|71029 )        : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------GA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71035                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71040                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71031                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCATGGTG
gi|71047                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTGACAG
gi|71030                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71045                      : ATTAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------GA-T--TTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71034                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AC-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71037                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TA-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCTCGGCG
gi|71051                      : ATTGA-T-TGA-TG-T-A----T-A-T-------A-T--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71028                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------GA-G--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71032                      : ATTGA-T-TGA-T--C-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CA--A-TTTCACGGCG
gi|71046                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AC-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71048                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AC-T--GTT--ATA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71033                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----C-T-T------AA-T--GCT--TTA-CG-C-CA--TT-CT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71054                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AAAT--GTT--TTAACG-C-CG--TT-TT-GAC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71039                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-C-T------TA-A--GTT--TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71052                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--CT-TT-AGC-A--ACATTTCAG-CC--A-GTTCACGG
gi|71041                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTG-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCACGG
gi|71038                      : ATTGACT-TGA-TATT-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TTCTT-GGC-A--GTCTTTCAG-CCCAA-TTTCACGGCG
gi|71043                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71050                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TT--CA-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--ATTTTCACGAC
gi|71036                      : ATTGA-T-TGA-C--T-G----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAT-CC--A-TTTTACTGCG
gi|71049                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-C-TTTA---AA-T--GTT--TTA-CA-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCATGGCG
gi|71055                      : ATTGA-T-TGC-T--T-A----T-T-T------AA-T--GGT--TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--T-TTGCACGGCG
gi|71053                      : ATCAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-TG-C-AA--TT-TT-TGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71060                      : ATTGA-T-TGA-T--T-T----T-T-A------AA-T--GTT--TTAACGAC-CG--TT-TT-GGCCA--ATCTTTC-G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71061                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----A-T-T------GT-G--GTT--TCA-AG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AACTTTCAG-CC--A-TTCTACGGCG
gi|71057                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--G-C--TTA-CG-C-T---TT-TT-GGC-A--ATA-TTCAG-CC--A-TTTCACGG
gi|71058                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-TAATGTTGA-T--GCT--TTA-CG-C-C---TT-TT-GGC-A--GTATTTCAG-TC--A-TTTCACCGC
gi|71042                      : ATTGA-TGTGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--G-T--TTA-CG-C-CGA-TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71056                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T------AA-G--GTT--TTA-CA-T-CA---T-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC--ATTTTTGCGGCG
gi|71059                      : ATTGA-T-TGA-C--T-A----T-T-A------AA-T--ATT--TTA-CG-C-CA--AG-TT-GGC-A--ACATT---G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71063                      : ATTGA-T-TGA-T--TGA----T----------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTC
gi|71044                      : ATTGA-TCTGA-T--T-A----T-T--------AA-T--GTTATTTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71062                      : ATTGA-T-TTA-T--T-G----TAT-T------GG-G--GTT--TAT-CG-C-CA--TT-TT-TGC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71064                      : ATTGA-T-TGA-T--T-GGTGCT-T-T-------A-C--GTT--T-A-CG-C-TG--TT-TT-GTC-A--ACATTCTAG-CC--A-TTTTATGGCG
gi|71065                      : ATAGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-TG-C-CA--TT-CT-GGC-G--AT
gi|71066                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AC-T--GTT--TTA-CGTC-CC--AC-TC-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-a
gi|71067                      :  TTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T------GA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACTGC
gi|71068                      :  TTGA-T-TGA-T--T-----------------------GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CT--A-TTTCACGGCG
gi|71069                      :  TTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T------AC-T--GTT--TTA-CG-C-CGTCTT-TT-GGC-A--ATATTTCAGAAA--A-TTTCACGGCG
gi|71070                      :  TTGA-T-TTA-T--T-G----T-G-T------GA-T--ATT--TTA-CT-C-CG--TT-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC----TTTTACGGCG
gi|71071                      :  TTAA-T-TAA-T--T-G----T-TAT------G-----GCT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AAATTTCAG-GC--A-TTTTACGGCG
gi|71072                      :  TTGA-T-TCA-T--TCA----T-T-TAC----GG-TC-GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TC-GGT-A--ATATTTTTG-CC--A-TTTTAAGGCG
gi|71074                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T--------AA-T--GTT--T-A-CG-C-CG--TT-TTCGGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACG
gi|71073                      :   TGA-T-TTA-T--T-A----T-T-T------GA-T--TTT--CTA-CG-C-TA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71076                      :   TGA-T-CAG-T--T------T-T-T------GA-TTGATT--TTA-CG-C-CA--AT-TT-GAC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71075                      :   TGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CA--CT-TT-GGC-C--ATATTTCGG-C
gi|71077                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AT-T--GTT--TTA-CGTC-CC--AC-TT-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71078                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71079                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71081                      :    GA-T-TGA-T--T-A---------------GG----GTT--TTA-CA-C-CG--TT-AT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71080                      :    GA-T-TGA-T--T-G----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-TG-C-AA--TT-TT-GTC-A--ATATTGTAG-CC--A-TTGCACGGCG
gi|71083                      :    GA-T-TGAAT--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-CACG--TT-TT-GGT-ATTATATTCGAG--C--A-TTTCACGGCG
gi|71082                      :    GA-G-TGA-T--C-G----T-T-T------GA-T--GTT--TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ACATTGCAG-AC--A-TTTTA
gi|71084                      :          GA-T--T-A----T-T-T------AA-T--GTT--TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-
gi|71085                      :                                      --GTT--TGG-CG-C-CG--TG-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTGCGGTG





Alignments
lowQualScore                  :      0 1   0 11 1 1111 1 0 111 00 0 11 0  222222   1  2 0  33  0  0   0 00         0  11 1          
lowQualScore                  :      . .   . .. . .... . . ... .. . .. .  ......   .  . .  ..  .  .   . ..         .  .. .          
lowQualScore                  :      7 4   7 66 4 5555 4 7 222 99 7 66 7  999999   4  1 7  77  7  7   7 99         7  00 5          
consensus                     : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
Reference ( family-374 )      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71028                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-G--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71029                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71030                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71031                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCATGGTG
gi|71032                      : ATTGA-T-TGA-T--C-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CA--A-TTTCACGGCG
gi|71033                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----C-T-T---A--A-T--G-CT------TTA-CG-C-CA--TT-CT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71034                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71035                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71036                      : ATTGA-T-TGA-C--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAT-CC--A-TTTTACTGCG
gi|71037                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TA-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCTCGGCG
gi|71038                      : ATTGACT-TGA-TATT-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TTCTT-GGC-A--GTCTTTCAG-CCCAA-TTTCACGGCG
gi|71039                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----TCT-T---A--A----G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71040                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71041                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTG-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCACGG
gi|71042                      : ATTGA-TGTGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--T------TTA-CG-C-CGA-TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71043                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71044                      : ATTGA-TCTGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TTAT----TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71045                      : ATTAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71046                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71047                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTGACAG
gi|71048                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------ATA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71049                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-C-TTTAA--A-T--G-TT------TTA-CA-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCATGGCG
gi|71050                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TT--CA-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--ATTTTCACGAC
gi|71051                      : ATTGA-T-TGA-TG-T-A----T-A-T---A----T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71052                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--CT-TT-AGC-A--ACATTTCAG-CC--A-GTTCACGG
gi|71053                      : ATCAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-TGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71054                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--AAT--G-TT------TTAACG-C-CG--TT-TT-GAC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71055                      : ATTGA-T-TGC-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-GT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--T-TTGCACGGCG
gi|71056                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-G--G-TT------TTA-CA-T-CA---T-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC--ATTTTTGCGGCG
gi|71057                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--C------TTA-CG-C-T---TT-TT-GGC-A--ATA-TTCAG-CC--A-TTTCACGG
gi|71058                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TTGATGCTTTA-CG-C-C---TT-TT-GGC-A--GTATTTCAG-TC--A-TTTCACCGC
gi|71059                      : ATTGA-T-TGA-C--T-A----T-T-A---A--A-T--A-TT------TTA-CG-C-CA--AG-TT-GGC-A--ACATT---G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71060                      : ATTGA-T-TGA-T--T-T----T-T-A---A--A-T--G-TT------TTAACGAC-CG--TT-TT-GGCCA--ATCTTTC-G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71061                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----A-T-T---G--T-G--G-TT------TCA-AG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AACTTTCAG-CC--A-TTCTACGGCG
gi|71062                      : ATTGA-T-TTA-T--T-G----TAT-T---G--G-G--G-TT------TAT-CG-C-CA--TT-TT-TGC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71063                      : ATTGA-T-TGA-T--TGA----T-------A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTC
gi|71064                      : ATTGA-T-TGA-T--T-GGTGCT-T-T---A----C--G-TT------T-A-CG-C-TG--TT-TT-GTC-A--ACATTCTAG-CC--A-TTTTATGGCG
gi|71065                      : ATAGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-CT-GGC-G--ATA
gi|71066                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--C-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TC-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71067                      :  TTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACTGC
gi|71068                      :  TTGA-T-TGA-T--T----------------------G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CT--A-TTTCACGGCG
gi|71069                      :  TTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CGTCTT-TT-GGC-A--ATATTTCAGAAA--A-TTTCACGGCG
gi|71070                      :  TTGA-T-TTA-T--T-G----T-G-T---G--A-T--A-TT------TTA-CT-C-CG--TT-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC----TTTTACGGCG
gi|71071                      :  TTAA-T-TAA-T--T-G----T-T--------A-T--GGCT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AAATTTCAG-GC--A-TTTTACGGCG
gi|71072                      :  TTGA-T-TCA-T--TCA----T-T-T---ACGG-TC-G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TC-GGT-A--ATATTTTTG-CC--A-TTTTAAGGCG
gi|71073                      :   TGA-T-TTA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------CTA-CG-C-TA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71074                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TT------T-A-CG-C-CG--TT-TTCGGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACG
gi|71075                      :   TGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--CT-TT-GGC-C--ATATTTCGG-C
gi|71076                      :   TGA-T-CAG-T--T------T-T-T---G--A-TTGA-TT------TTA-CG-C-CA--AT-TT-GAC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71077                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--T-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TT-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71078                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71079                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71080                      :    GA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-GTC-A--ATATTGTAG-CC--A-TTGCACGGCG
gi|71081                      :    GA-T-TGA-T--T-A---------------G-G--G-TT------TTA-CA-C-CG--TT-AT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71082                      :    GA-G-TGA-T--C-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ACATTGCAG-AC--A-TTTTA
gi|71083                      :    GA-T-TGAAT--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-CACG--TT-TT-GGT-ATTATATTCGAG--C--A-TTTCACGGCG
gi|71084                      :          GA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-
gi|71085                      :              --T-A----T-TAT---A--G-G--G-TT------TGG-CG-C-CG--TG-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTGCGGTG





Alignments
lowQualScore                  :      0 1   0 11 1 1111 1 0 111 00 0 11 0  222222   1  2 0  33  0  0   0 00         0  11 1          
lowQualScore                  :      . .   . .. . .... . . ... .. . .. .  ......   .  . .  ..  .  .   . ..         .  .. .          
lowQualScore                  :      7 4   7 66 4 5555 4 7 222 99 7 66 7  999999   4  1 7  77  7  7   7 99         7  00 5          
consensus                     : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
Reference ( family-374 )      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71028                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-G--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71029                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71030                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71031                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCATGGTG
gi|71032                      : ATTGA-T-TGA-T--C-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CA--A-TTTCACGGCG
gi|71033                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----C-T-T---A--A-T--G-CT------TTA-CG-C-CA--TT-CT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71034                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71035                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71036                      : ATTGA-T-TGA-C--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAT-CC--A-TTTTACTGCG
gi|71037                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TA-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCTCGGCG
gi|71038                      : ATTGACT-TGA-TATT-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TTCTT-GGC-A--GTCTTTCAG-CCCAA-TTTCACGGCG
gi|71039                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----TCT-T---A--A----G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71040                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71041                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTG-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCACGG
gi|71042                      : ATTGA-TGTGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--T------TTA-CG-C-CGA-TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71043                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71044                      : ATTGA-TCTGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TTAT----TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71045                      : ATTAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71046                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71047                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTGACAG
gi|71048                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------ATA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71049                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-C-TTTAA--A-T--G-TT------TTA-CA-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCATGGCG
gi|71050                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TT--CA-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--ATTTTCACGAC
gi|71051                      : ATTGA-T-TGA-TG-T-A----T-A-T---A----T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71052                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--CT-TT-AGC-A--ACATTTCAG-CC--A-GTTCACGG
gi|71053                      : ATCAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-TGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71054                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--AAT--G-TT------TTAACG-C-CG--TT-TT-GAC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71055                      : ATTGA-T-TGC-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-GT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--T-TTGCACGGCG
gi|71056                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-G--G-TT------TTA-CA-T-CA---T-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC--ATTTTTGCGGCG
gi|71057                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--C------TTA-CG-C-T---TT-TT-GGC-A--ATA-TTCAG-CC--A-TTTCACGG
gi|71058                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TTGATGCTTTA-CG-C-C---TT-TT-GGC-A--GTATTTCAG-TC--A-TTTCACCGC
gi|71059                      : ATTGA-T-TGA-C--T-A----T-T-A---A--A-T--A-TT------TTA-CG-C-CA--AG-TT-GGC-A--ACATT---G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71060                      : ATTGA-T-TGA-T--T-T----T-T-A---A--A-T--G-TT------TTAACGAC-CG--TT-TT-GGCCA--ATCTTTC-G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71061                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----A-T-T---G--T-G--G-TT------TCA-AG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AACTTTCAG-CC--A-TTCTACGGCG
gi|71062                      : ATTGA-T-TTA-T--T-G----TAT-T---G--G-G--G-TT------TAT-CG-C-CA--TT-TT-TGC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71063                      : ATTGA-T-TGA-T--TGA----T-------A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTC
gi|71064                      : ATTGA-T-TGA-T--T-GGTGCT-T-T---A----C--G-TT------T-A-CG-C-TG--TT-TT-GTC-A--ACATTCTAG-CC--A-TTTTATGGCG
gi|71065                      : ATAGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-CT-GGC-G--ATA
gi|71066                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--C-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TC-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71067                      :  TTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACTGC
gi|71068                      :  TTGA-T-TGA-T--T----------------------G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CT--A-TTTCACGGCG
gi|71069                      :  TTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CGTCTT-TT-GGC-A--ATATTTCAGAAA--A-TTTCACGGCG
gi|71070                      :  TTGA-T-TTA-T--T-G----T-G-T---G--A-T--A-TT------TTA-CT-C-CG--TT-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC----TTTTACGGCG
gi|71071                      :  TTAA-T-TAA-T--T-G----T-T--------A-T--GGCT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AAATTTCAG-GC--A-TTTTACGGCG
gi|71072                      :  TTGA-T-TCA-T--TCA----T-T-T---ACGG-TC-G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TC-GGT-A--ATATTTTTG-CC--A-TTTTAAGGCG
gi|71073                      :   TGA-T-TTA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------CTA-CG-C-TA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71074                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TT------T-A-CG-C-CG--TT-TTCGGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACG
gi|71075                      :   TGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--CT-TT-GGC-C--ATATTTCGG-C
gi|71076                      :   TGA-T-CAG-T--T------T-T-T---G--A-TTGA-TT------TTA-CG-C-CA--AT-TT-GAC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71077                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--T-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TT-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71078                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71079                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71080                      :    GA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-GTC-A--ATATTGTAG-CC--A-TTGCACGGCG
gi|71081                      :    GA-T-TGA-T--T-A---------------G-G--G-TT------TTA-CA-C-CG--TT-AT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71082                      :    GA-G-TGA-T--C-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ACATTGCAG-AC--A-TTTTA
gi|71083                      :    GA-T-TGAAT--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-CACG--TT-TT-GGT-ATTATATTCGAG--C--A-TTTCACGGCG
gi|71084                      :          GA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-
gi|71085                      :              --T-A----T-TAT---A--G-G--G-TT------TGG-CG-C-CG--TG-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTGCGGTG


blockSeqs                     :        G     AT G GTGC C   TTA      TG    GATGCT   A  A    TC                         CA T
blockSeqs                     :        C     G  C .    A   .        C     AT       A  T    T                          .  T
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  T    A                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    T                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    T                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                          .  .
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                              
blockSeqs                     :        .     .  . .    .   .        .     .        .  .    .                              
blockSeqs                     :              .  . .    .   .        .     .        .  .    .                              
blockSeqs                     :              .  . .    .   .        .     .        .  .    .                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
finalCons                     : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG





Alignments
lowQualScore                  :      0 1   0 11 1 1111 1 0 111 00 0 11 0  222222   1  2 0  33  0  0   0 00         0  11 1          
lowQualScore                  :      . .   . .. . .... . . ... .. . .. .  ......   .  . .  ..  .  .   . ..         .  .. .          
lowQualScore                  :      7 4   7 66 4 5555 4 7 222 99 7 66 7  999999   4  1 7  77  7  7   7 99         7  00 5          
consensus                     : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
Reference ( family-374 )      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71028                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-G--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71029                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71030                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71031                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCATGGTG
gi|71032                      : ATTGA-T-TGA-T--C-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CA--A-TTTCACGGCG
gi|71033                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----C-T-T---A--A-T--G-CT------TTA-CG-C-CA--TT-CT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71034                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71035                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71036                      : ATTGA-T-TGA-C--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAT-CC--A-TTTTACTGCG
gi|71037                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TA-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCTCGGCG
gi|71038                      : ATTGACT-TGA-TATT-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TTCTT-GGC-A--GTCTTTCAG-CCCAA-TTTCACGGCG
gi|71039                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----TCT-T---A--A----G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71040                      : ATTGG-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71041                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTG-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCACGG
gi|71042                      : ATTGA-TGTGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--T------TTA-CG-C-CGA-TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71043                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71044                      : ATTGA-TCTGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TTAT----TTA-TG-C-TA--TT-TT-GGC-A--GTATTGTAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71045                      : ATTAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71046                      : ATTTA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71047                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTGACAG
gi|71048                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------ATA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71049                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-C-TTTAA--A-T--G-TT------TTA-CA-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTCATGGCG
gi|71050                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TT--CA-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--ATTTTCACGAC
gi|71051                      : ATTGA-T-TGA-TG-T-A----T-A-T---A----T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71052                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--CT-TT-AGC-A--ACATTTCAG-CC--A-GTTCACGG
gi|71053                      : ATCAA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-TGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71054                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--AAT--G-TT------TTAACG-C-CG--TT-TT-GAC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTT-ACGGCG
gi|71055                      : ATTGA-T-TGC-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-GT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--T-TTGCACGGCG
gi|71056                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-G--G-TT------TTA-CA-T-CA---T-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC--ATTTTTGCGGCG
gi|71057                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G--C------TTA-CG-C-T---TT-TT-GGC-A--ATA-TTCAG-CC--A-TTTCACGG
gi|71058                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TTGATGCTTTA-CG-C-C---TT-TT-GGC-A--GTATTTCAG-TC--A-TTTCACCGC
gi|71059                      : ATTGA-T-TGA-C--T-A----T-T-A---A--A-T--A-TT------TTA-CG-C-CA--AG-TT-GGC-A--ACATT---G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71060                      : ATTGA-T-TGA-T--T-T----T-T-A---A--A-T--G-TT------TTAACGAC-CG--TT-TT-GGCCA--ATCTTTC-G-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71061                      : ATTGA-T-TGA-T--T-G----A-T-T---G--T-G--G-TT------TCA-AG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AACTTTCAG-CC--A-TTCTACGGCG
gi|71062                      : ATTGA-T-TTA-T--T-G----TAT-T---G--G-G--G-TT------TAT-CG-C-CA--TT-TT-TGC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71063                      : ATTGA-T-TGA-T--TGA----T-------A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTC
gi|71064                      : ATTGA-T-TGA-T--T-GGTGCT-T-T---A----C--G-TT------T-A-CG-C-TG--TT-TT-GTC-A--ACATTCTAG-CC--A-TTTTATGGCG
gi|71065                      : ATAGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-CA--TT-CT-GGC-G--ATA
gi|71066                      : ATTGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--C-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TC-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71067                      :  TTGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACTGC
gi|71068                      :  TTGA-T-TGA-T--T----------------------G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--ATATTTCGG-CT--A-TTTCACGGCG
gi|71069                      :  TTGA-T-TGA-T--T-A----T-A-T---A--C-T--G-TT------TTA-CG-C-CGTCTT-TT-GGC-A--ATATTTCAGAAA--A-TTTCACGGCG
gi|71070                      :  TTGA-T-TTA-T--T-G----T-G-T---G--A-T--A-TT------TTA-CT-C-CG--TT-TT-GGC-A--ACATTTCAG-CC----TTTTACGGCG
gi|71071                      :  TTAA-T-TAA-T--T-G----T-T--------A-T--GGCT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGC-A--AAATTTCAG-GC--A-TTTTACGGCG
gi|71072                      :  TTGA-T-TCA-T--TCA----T-T-T---ACGG-TC-G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TC-GGT-A--ATATTTTTG-CC--A-TTTTAAGGCG
gi|71073                      :   TGA-T-TTA-T--T-A----T-T-T---G--A-T--T-TT------CTA-CG-C-TA--TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGCG
gi|71074                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-----A--A-T--G-TT------T-A-CG-C-CG--TT-TTCGGC-A--ATCTTTCAG-CC--A-TTTCACG
gi|71075                      :   TGA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--CT-TT-GGC-C--ATATTTCGG-C
gi|71076                      :   TGA-T-CAG-T--T------T-T-T---G--A-TTGA-TT------TTA-CG-C-CA--AT-TT-GAC-A--ATATTGCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71077                      :   TGA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--T-T--G-TT------TTA-CGTC-CC--AC-TT-GAC-A--ATATTTCAC-TC--A-
gi|71078                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CG--TT-TT-GGT-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTCACGGCG
gi|71079                      :    GA-T-TGA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GCC-A--ATATTTCGG-CC--A-TTTAACGG
gi|71080                      :    GA-T-TGA-T--T-G----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-TG-C-AA--TT-TT-GTC-A--ATATTGTAG-CC--A-TTGCACGGCG
gi|71081                      :    GA-T-TGA-T--T-A---------------G-G--G-TT------TTA-CA-C-CG--TT-AT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTACGGTG
gi|71082                      :    GA-G-TGA-T--C-G----T-T-T---G--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CA--TT-TT-GGC-A--ACATTGCAG-AC--A-TTTTA
gi|71083                      :    GA-T-TGAAT--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-CACG--TT-TT-GGT-ATTATATTCGAG--C--A-TTTCACGGCG
gi|71084                      :          GA-T--T-A----T-T-T---A--A-T--G-TT------TTA-CG-C-CGT-TT-TT-GGC-A--ATATTTCAG-
gi|71085                      :              --T-A----T-TAT---A--G-G--G-TT------TGG-CG-C-CG--TG-TT-GGC-A--ATATTTCAG-CC--A-TTTTGCGGTG