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lowQualScore                  :           ..        . .... .......     . . . ..     ... ..... .   . .   .  ...  ... .........   .. .. . .....  ......  .   . . ........... ... .       ....   . .     ........  . . ...... ..... ....    ...... .. . .. .. ... .... ... .   . . .  .....   . ..  .  ... . . . . ......... . ............ .........  .......  ...... ..  . . .   .......  ....... . . .     . . .... .   .... ........  .  ...     ..     ...  ...  ...   .. . . .  . .    ...   .  .... .....   ... ....  .   .  ......  . .....   ...   . ..       
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Reference ( gi|84908 )        : ATACCCCTAT--CAACACTT-T--A-C---T-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCA---C-AT-TTC-CTT-----------A---C-GTTGGCC----TTTAT-AACTT--------TCGT-A------T-----C----TGTA-A----C--T-T--T--G---ATC--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AAT------TA------C-GAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AGCCC----A-------TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---AAT--ATT-TCGC-TGTAAT---TCATAG----T-----TGT---A----AC-CTC-TT--T---CA-TA----TGG---TAG-G-GTAAAGAA
gi|84911                      : ATACCCCTAT--CAACCCTT-T--A-C---T-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---T-AT-TTC-CTT-----------A---C-GATCGCC----TTTGT-AACTT--------TCGT-A------TA----C----TGTA-A----C--T-T--T--G---ATC--T---T-TGA-T-A-GT-----TTT-G--TA-GA---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-GAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACCC----A-------TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---AAT--ATT-TCGC-TATAAT---TCATAG----T-----TGT---A----AC-CTC-TT--T---CA-TA----TGG---TAG-G-ATAAAG
gi|84909                      : ATACCCCTAT--CAACACTT-T--A-C---T-A-AAGTA-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---T-AT-TTC-CTT---------------C-GTTGGCC----TTTGT-AACTT--------TCAT-A------T-----C----TGTA-A----C--T-T--T--T---ATC--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-GAT-A-A-TG--------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACCC----A-------TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TTA--AAT--ATT-T-GC-TATAAT---TCATAG----T-----TGT---A----AC-CTCTTT--T---CA-TA----TGG---TAG-G-GTAAAGAA
gi|84910                      : ATACCCCTAT--CAACACTT-T--A-C---T-A-AAGTA-AAC-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---T-AT-TTC-CTT---------------C-GTTGGCC----TTTGT-AACTT--------TCAT-A------T-----C----TGTA-A----C--T-T--T--T---ATC--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-GAT-A-A-TG--------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACCC----A-------TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TTA--AAT--ATT-T-GC-TATAAT---TCATAG----T-----TGT---A----AC-CTCTTT--T---CA-TA----TGG---TAG-G-GTAAAGAA
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gi|84912                      : ATACTCCTAT--CAACACTT-C--A-C---A-C-AAGTT-A-C-C--TTCCT---T-----GACCA-C-CATCTT---GT---G-GAC-----AGA--A--A-A-----TCG---T-AT-TTC-CTT-----------A---C-ATTGGCCGAGCTTTAC-AACTT--------TCTT-A------T-----C----TGTA-T----C--T-T--C--G---ACA--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-T-T-T-G--C------A-G------------C-------A-AAC------CA------C-AAT-A-A-TGC-------TC-------T-A-A-GGTGG-GAC----AACCC----A-------TGA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---AAC--A---ACAC-TACAAT---TCACAG----T-----TGT---A----A
gi|84914                      : ATACCCCGATT-CAACCCTT-TT-A-CG--T-A-AGTTT-A-CCG--TCCCT---T-----GACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCAGCGT-AT-TTCGCTT-----------A---C-GATGGCC----TTTGTCAACTG--------TCGT-A------T-----C----TGTA-A----C--T-T--TTGA---ATCATT---T-TGAGG-A-TT-----TTTCG--TA-T----A-A-TGT-G--CAGAAGAA-G------------T-------A-AAC------TA------CGGAT-A-A-TGC-------CC-------CTA-ATGGTGGTGGC----AA-CC----A-------TAA-AC---TTGTA--TG-AA---AC---TT---AAT--ATT-TCGC-T-TAAT---TCATAGTTGAT-----TGT---A----ACACTC-TT--TG--CA-TA----TGGTTATAG-G-ATAAAGAAtagatttattatgttttgtaagaaaaagga
gi|84915                      : ATACCCTTAT--TAACAATT-T--G-C---G-C-AA-TT-A-C-G--TCCCT---T-----GACTG-C-CATCTT---GT---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---C-GT-TTC-CTT-----------A---T-GCCGCCC----TTTGT-AACTT--------TCGT-A------T-----C----CGTA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TGA-T-A-TA-----TTT-A--TA-TT---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AACTACATGTA------C-AAT-T-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GAC----AACCC----A-------TAC-AC---TTGTA--TTAAA---AT---TC---AAT--AT----GC-TATAAT---TTACGG----C-----TAT---A----A
gi|84917                      : ATACCCCTAT--CAACACTT-T--A-C---T-A-AAGTT-A-T-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CATTTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---T-AT-TTC-CTT-----------A---T-GTTGGCC----TTTGT-AACTT--------TCGT-A------T-----CTGCATGTA-A----C--T-T--T--G---AGC--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-Ataatatcttacatttgattgg
gi|84916                      : ATACTCCTAT--CAACACTT-C--A-C---G-C-AAATT-A-C-A--TCC-T---T----TGTCTG-C-CATCTT---GC---A-GAC-----AAA--A--T-T-----TTG---T-AT-TTC-CTA-----------A---T-GCTGGCC----TTTGT-TACTT--------TCTT-A------T-----C----TGTA-A----C--T-T-----G---ACA--T---T-TGA-T-A-TA-----TCT-A--TA-TC---A-G-T-T-G--T------A-G------------T-------A-AAC------TG------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------T-A-A-GGTGG-GGT----AACCC----A-------TAG-AC---TTGT
gi|84918                      : ATACTCCTAT--CAACACTG-T--G-C-------AATTA-A-C-G--TCTCT---T-----GACCG-C-CATCTC---GC---G-GACCAAAAAAA--A--A-A-----TCA---T-AT-TTT-CCT-----------A---C-ATTGGCA----TTTGT-ATCTT--------TCTT-A------T-----C----AGTA-G----C--T-T--T--G---GCT--T---A-TAA-T-A-TT-----TTC-A--TA-TC---A-A-C-T-G--C------A-G------------T-------A-ACC------TA------C-AAC-A-A-TGC-------AT-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACTC----A-------TAA-
gi|84920                      : ATAACCTTAT--CATCATTT-T-------------------------TCCCT---T-----GATCG-C-CTTCTT---GC---A-GAA-----AAA--AT-A-G-----TTG---C-AT-TTC-CCA-----------A---C-GTTAGCC----TTTGT-AACTT--------TAGT-A------A-----T----TGTA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TGA-T-A-TT-----TTC-A--TA-TCCT-ATA-T-T-G--C------A-G------------T-------G-AAT------TA------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-TAC----AACCT----A-------TAACAC---Tttagcacaaatgattaagttgactacatcataaaacacctt
gi|84919                      : ATACCCCTAT--CAACCGTT-T--G-C---G-C-AAATT-A-C-A--TCCCT---T----TGACCG-C-CAT
gi|84921                      : ATACTCCAAT--CCACACTT-T--G-C---A-A-AAGTT--------TCCCT---T-----GGCCA-C-CATCTT---ATTCTG-GGTTAGCAAAA--A--A-G-----TAG---C-AT-TTC-CCT-----------A---C-ATTGGCC----TTTGT-AATTTCTATATGATCTT-A------T-----C-----GTA-T----C--T-T--TG-G---ATT--T---T-TGA-T-A--T-----TTT-A---A-TT---A-A-T-T-G--A------A-G------------G-------A-AAC------TA------A-AAT-A-T-T---------TT-------T-A----------------------------------AA-AC---TTGTA--CGGAA---TC---TT---AAT--AAT-TCAC-TATAAT---ACACAG----T-----TGT---A----AT-CTC-TT--A---CA-TT----TGG---TAG-G-ATAAAGAActttgtaacttttgtgtctgtagctttggcattttatattttttttttacatcaattgcagttaactacatgtgcaataatgttccaaggttcccaactataaacgtatataaaaacgtaatatttcgctataattcatagttgtaatctcttgcatttggtagggtaaa
gi|84922                      : ATACTTCTAT--CAACACTT-CGAA-C-------AAGCT-A-C-G--ACACT---T----T-ACCG-C-CATCTT---AC---A-GAC-----AAA--A--ACG-----ATA---CCAT-TTC-CCT-----------A---C-GTTGGCC----TTAGT-AACTT--------TCTT-A------T-----C----TGTA-T----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TGA-T-A-TT-----ATC-A--GA-TC---A-T-T-T-G--C------A-A------------T-------G-AAC------TA------T-A---A-A-T--------------------------TGA-GAC----AATCC----G-------GAA-AA---TGGCA--TGATA---AC---TT---AAT--
gi|84923                      : ATACCCCGAT--CAACACTT-T--G-T---G-C-AAGTT-A-C-A--TCACT---T----TGATAG-C-C---TT---G-------AA-----AAA--A--A-G-----TCA---C-AT-TTC-CCA-----------A---T-GTTGGCC----TTTGT-AACTT--------TTGT-A------T-----C----TGGA-G----C--T-T--T--G---ACG--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-ATTTA-TC---A-
gi|84927                      : ATACTCCTAT--TAACACTG-T--G-CAATT-A-AA----A-C-G--TCTCT---T-----GACCGAT-CATCTC---GC---GTGCC-----AAA--A--A-AAAATTCCA---T-AT-TTT-CTT-----------A---CTATTGGCA----TTTGT-ATCTT--------TCTT-A------T-----C----GGTA-G----C--T-TGTT--G---GCT--T---A-TAA-T-A-TT-----C---A--TA-TC---A-A-C-T-G--TCA----A-G------------T---------AAC------TG------C-TAC-A-ACTG--------CA-------T-A-A-GGT-G-GGC----AACTC----A-------TAA-
gi|84928                      : ATACCCATAT--CAACATT-------------A-AA------------------------TG--CG-C-CATCTT---GC---G-GAC-----AAA--A--A-G-----TCG---C-AT-TTT-CCT-----------A---C-GTTGGCC----TTTGC-CACTT--------TCGT-A------T-----C----TGTA-G----CATT-T--T--A---ATT--T---
gi|84926                      : ATATTCCTAT--ACGCACTG-C--A-T-------AAGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CATCTT---GC---A-GACA----AAA--A--A-G-----GCG---T-AT-TGCGATT-----------A---C-GTTGGCC----TTTTT-AACTT--------CCAT-ACTTCCTT-----C----CTTA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TGA-T-A-Taat
gi|84924                      : ATACCCCTATATCAACACTT-T--G-C---G-C-AAGTT-A-T-G--TCCCTTAAT----TGATCA-C-CATCAT---GC---G-GAC-----AAA--A------------A---T-AT-TTC-CCT-----------A---C-GTTGACC----TTTGT-AAC
gi|84925                      : ATACCCCTAT--CAACACTT-T--A-C---C-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CATTTT---GC---G-
gi|84929                      : ATACTTTAAT--CAACACTT-T--G-T---G-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CATCTT---GC---G-GGC-----AAA--A--A-G-----TTG---C-AT-TTC-Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggcaactcataaacttgtatgaaaacttaatatttcgc
gi|84930                      : ATACCCCTAT--CAACCCTT-T--A-C---T-A-AAaaggttgg
gi|84931                      : ATTCCTCTAC--CAACACTT-T--G-C---G-C-AA-TT-A-T-G--TCCCT---C----T-ACCA-C-CATTTC----C---G-GACA----AAA--A--A-A-----TCG---T-AT-TTC-CCC-----------A---CTGTT--CC----TTCA--GACTA--------TTTT-A------T-----C----TGTA-T----C--T-C--T--T---A-C--A---T-CGG-T-A-TA-----TTT-cgtgatccaaagcgatccacgataaacactcactatggcacgaatctcgccttaatttgtacgagcaaaaaggtacgtactaccgctagttcttaaacagtactgggcctttgttaattttcgttatctgtaaaactctatgatctttgagtattttgataatgagaatatgcaagtagaatactacgatacatcctgaccctcccaaggtgagaagaccaaccactttaaacttgtatgaaaaataataacccact
gi|84932                      :  TACCTTTAG--CAATTCTT-T--A-C---G-C-AAGTT-A-C-G--CCCCT---T-----GACCG-C-CATCTT---GC---G-GGC-----TAA--A--T-G-----TTG---C-TT-TTC-CCT-----------A---C-GTT--------TTT-----TTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA-G----C--T-T--T--G---AT---------------A-TT-------------A-TC---A-A-T-T-G--C------A-C------------T-------A-AAC------TA------C-AAG-A-A-TAT-------CC-------T-A-A-GGTGG-GAC----AACCC----A-------TAA-CC---TTGTA--TGAAA---AC---TA---AAT--AAT-ACGC-TATAAT---TGATAT----T-----CGT---A----AT-CTC-TT--T---TA-TT----TGG---TAG-G-ATAAAGA
gi|84933                      :  TACGCCTAT--CAACACTTGT--GGC-------AAGTT--------------------------G-C-TATCTT---AC---G-GAC-----AAA--A--C-G-----TCG---C-AT-TTT-CCT-----------A---C-GTTGACC----TTTGT-GACTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---G-GAA-T-A-TT-----ATT-A--TA-TC---A-A-C-T-G--C------A-G------------T---------AAC------TA------T-AGT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-CGT----AACCC----A-------TAA-AC---TTTCA--TGAAA---AC---TT---AAC--A
gi|84934                      :   ACACCTAT--CAACACTT-C--G-C--------AATT-A-C-G--TCCAT---T-----GTCCG-C-GAGTTT----C---A-G-C-----GAA--A--A-G-------------ATGTTC-CTTCTAATGTATGTA---C-GTTGGTT----TT-----ACTT--------A----A------T-----A----TATA-C----A--T-T--T--T---ATC--T---C-TGA-T----------TTG-A--AA-TC---A-A-A-T-G--C------A-GACAACTACTGTAC-------A-AAT------TA------T-ATT-A-A-TGC-------ACAGTCTGAC-ACG-GGTGC-GGC----ATCCC----A-------TAA-AC---TTGAA--TGAAA---TT---GT---AATC-AAT-TGAT-TTTAAT---TGGGAA----T-----T-T---A----A----C-TT--A---AA-TT----TGG---TAG-G-ACAAAGGA
gi|84935                      :      CCAAT--CCACACTT-T--G-T---TGA-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T------GCCG-CGCATCTT---TC---G-AGT-----AAA--A--A-T-----TCA---T-AT-TTC-TCT-----------A---C-GT-GGCC----TTTGT-AACTT--------TCTT-A------T-----C----TGTA-T----C--T-T--T--G---AAA--T---T-TTA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---G-A-T-T-G--A------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGCA---AACCC----A-------GAA-AA---TTGTA--TGAAA---TCTTTTT---AAT--AAT-TC
gi|84936                      :      CCAAT--CCACACTT----G-C---G-A-AAGTT-A-C-GACTCCCT---T-----GGCCG-C-C-TCTT---GT---GAGAA-----AAA--A--A-G-----TCA---C-AT-TCC-CT------------A---C-AT-GGCC----TTCTTGAACTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA-T----C--T-T--T--G---AGGA-T---T-TTA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TC---A-T-T-G-G--A------A-G------------T-------ACAAA------TA------C-AAA-A-T-TGC-------CC-------C-A---GGTGG--------AACCC----A-------GAA-A----TTGTG--TGACA---TC---TC---AACTAATT-CTGC-AATAAT---ACACAG----T-----TGT---A----AT-ATC-TT--G---CG-TT----TGG---TAG-G---AAAGAA
gi|84938                      :      CCAAT--CCGCACTT-T--A-C---A-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CATCTT---GC---G-AGT-----AAA--A--A-G-----TCA---A-AT-TTC-CGT-----------A---C-CTCGTCC----TTTGT-AACTT--------TCTT-C------T-----C----TGTA-T----C--T-T--T--T---AGT--T---T-TGA-T-A-TT-----TTA-G--TA-TC---G-A-T-T-G--A------A-G------------A-------A-AAC------TA------C-AGT-A-
gi|84937                      :      CCAAT--AAACACTT-T--G-C---A-A-AAGTT-A-C-G--TCCCT---TAAATTGGCCG-C-CGCTTTCTTGC---G-AGC-----AAA--A--C-G-----TCG---C-AT-TTC-CCT-----------A---A-GTTGGCC----TTTGT---CTT--------T
gi|84939                      :      CCTGT--CAGT-CTT-T--G-CA--T-A-ATTTT-A-C-A--TCCCT---T-----GAGTG-C---------------------------------A-A-----TCA---A-GT-TTC-CCT-----------A---T-GTTG-----------T-AACTT--------TCTT-A------CTGTGAC----TGTA-G----C--T-T--T--G---A-C--A---T-TAA-T-A-TG-----TTT-A--TA-TC---------------------------------------------------------------C-AAT-A-A-TGC-------TC-------C-A-A-GGTGGTGAC----AG-CC----A-------TAA-ACGTTCTGTA--TG-AA---AC---TT---AAG--AAT-TTGC-TAT-AT---TCGCAT----C-----TGT---A----AC-gagatttacaatgatgccccaaggtggggcaacccagaaacttgtatgaaaacttaataccaggtaattcacagttgtaatctcttacatat
gi|84941                      :        TAT--CAACACTT-C--A-T---G-C-AAGTT-A-T-G--TCCCT---T---------GTC-CATTTT---AA---G-GCG-----AAA--A--A-G-------A---C-TT-TTT-TTT-----------TTTTC-ATTAGCC----TTTTT-AATTT--------TCTG-A------T-----C----TGTA-G----C--T-T--T--T---ACA--TCAAT-TAA---A-TT-----TTC-A--T---T---A-A-T-T-G--C------T-G------------T-------C-AAC------TA------C-AAT-A-A-TGC-------CT-------C-G-G-GATGG-GGC----AACCC----A-------TTA-AC---TTGTA--TAAAA---AC---TT---AGT--AAT-GAGC-TGTAAT---TCACTG----T-----AGT---A----AC-GTC-TC--A---CA-TT----TTG---TAG-acc
gi|84940                      :        TAT--AAGTACTT-C--A-C-------AAGTC-A-C-A--TCTCT---T-----GTCTG-C-CATATT---GC---G-GTG-----AAA--A--A-G-----T--------T-TT----------------------GTTGGCC----TTTGT-AATGT--------TCTG-A------T-----A----TGTA-A----A--T-T--T--T---ACA--T---T-TGT-T-A-TT-----TTT-C--CA-CC---A-A-T---G--C------A-G------------T-------C-AAT------AA------C-AAT-G-A-TGC-------CC-------C-A-G-GGTGA-GAC----AATTC----A-------CAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---AT---AAT--GAT-TTAC-TATGAT---TCATA------------CT---A----AC-ATT-T----------------TGG---CAG-G-ATTAAGA
gi|84942                      :        TAT--TATCACCT-T--A-C---C-ACAAGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GTCCG-T-CATT----------G-GA-------------------------------T-TTC-CCT-----------A---C-TTTGATC----TTTGT-AATTT--------TCAG-A------T-----C----TGTA-A----C--TGT--T--G----TA--T---T-TAC-T-A-TA-----TAT-A--TAGTCAAGA-A-T-T-T--C------A-G------------T-------
gi|84943                      :         AT--CCACACTT-T--G-C-----G-AAGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GTCCG-C-CATCTT---GC---G-AGT-----AAA--A--A-G-----TCC---T-AT-TTC-TCT-----------A---C-ACTGGCC----TTTGT-AACTT--------TTCT-A------T-----C----TGT
gi|84944                      :           --CAACACTT-T--G-C---G-C-AAGTT-A-T-G--TCCCT---C----T-ACCA-C-CATTTT---GC---G-GACA----AAA--A--A-A-----TCG---T-AT-TT
gi|84946                      :                  CTT-T--G-C---G-A-AAGTTTA-C-G--TCCCT---T-----GGTCG-C-CATT-----GC---G-----------------A-G-----TCA---C-AT-TTC-A-------------A---C-ACTG-CC----TTTGT-AACTT--------TTCT-A------G-----C----TGTA-T----C--T-TATT--G---AGA--C---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TT---A-ATT-T-G--A------A-G------------T-------A-AAC------T-------C-AAT-A-A-TG-----------------C-A-A--------------------------------AA-A----TTGTG--TGACA---TC---TTA--AAT--AAT-TCGC-TATGA----TCACAG----T-----TGT---A----AT-ATC-TT--A---CG-TT----TGG---TAGCG-ATAAGAAA
gi|84945                      :                  CTT-T--G-C---G-A-AAGTTTA-C-G--TCCCT---T-----GGTCG-C-CATT-----GC---G-----------------A-G-----TCA---C-AT-TTC-A-------------A---C-ACTG-CC----TTTGT-AACTT--------TTCT-A------G-----C----TGTA-T----C--T-TATT--G---AGA--C---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TA-TT---A-ATT-T-G--A------A-G------------T-------A-AAC------T-------C-AAT-A-A-TG-----------------C-A-A--------------------------------AA-A----TTGTG--TGACA---TC---TTA--AAT--AAT-TCGC-TATGA----TCACAG----T-----TGT---A----AT-ATC-TT--A---CG-TT----TGG---TAGCG-ATAAGAAA
gi|84947                      :                            ---T-A-AAGTT-A-C-G--TCCAT---------GGCCG-C-CTCTTT---GC---G--AT-----AAA--A--A-G-----TCG---C-AT-TGC-TCT-----------A---C-GT-GGC-----TTTGT-AATAT--------TCCT-A------------C----TGTACA----TG-T-T--T--G---AGA--T---T-TAG-T-A-TT-----T---A--GA-TCG--A-A-G-T-G-----------A------------T-------C-AAC------TA------T-TATTA-A-TGC-------CC-----------A-AGTGG-G-C----AACCC----G--------AA-AC---TTGTA--C-AAA---TC---T-----AT--ATAAGCGC-TATATA---TCACGG----T-----TGT---A----AT-CTC-TT--T---AA-TACGTTTGGA--TAG-G-A-AAAGAA
gi|84948                      :                                -A-AAGTC-A-C-A--TGTGT---A----CGACCG-T-C---TT---GCC--G-GTT-----AGA--A--A-T-----TCA---T-AT-TTC-CGT-----------A---T-ATTGGCC----TTTTC-AATTT--------TCTG-A------T-----C----TTCA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TCT-T-A-TT-----TTC-C--CG-TC---A-A-C-T-G--C------A-G------------T-------C-AAT------TG------C-AAC-A-A-TGC-------CC-------C-G-G-GTTGG-GGC----AACAC----G-------TTG-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---ATT--AAT-TGGC-TTTAAT---TCACAA----T-----AGT---A----GC-ACC-TT--G---CA-CT----TGG---TTG-A-GTAAGGA
gi|84949                      :                                -A-AAGTT-A-C-G--TTCCT---T---------G------------GC---G-AGT-----AAA--A--A-G-----TAA---C-AT-TTT-CGT-----------A---C-TTTAGCC----TTTGT-AACTT--------T-------------------------------------T--T--G---AGA--T---T-TGA-C------------T-A---A-CC---A-C-T-T-TTCC------A-G------------T-------A-AAC------TT------C-AGT-A-A-AGC-------CA-------C-A-T-GGTGG-GAC----AGACC----A-------GAC-AC---TTGCA--TGGAA---GC---TA---AAT--AAT-TTGC-TATAAT---TCACA-------------------------------------CA-TT----TGG---TAG-T-GTAAAGAA
gi|84950                      :                                  -AAGTT-A-C----TTCCA---G----TGTCTG-C-AATTTTTTAGC---G---------AAA--A--G-A-----TTT---C-AT-TTC-CCT-----------------------C----TTTGA-AATTT--------TCTG-A------C-----C----TATA-A----C--T-T--T--G---ACA--T---C-TGT-T-A-TTA----TTT-T--TA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------TCAATTACA-AAT------TA------C-AAT-A-A-TAC-------TC-------------AGTGA-GGT----AACCT----A-------TAA-AC---TTGTA--TGAAGTCTAA---TT---AAT--A----AGC-TATAAT---TCACAG----A-----TGT---A----AC-CTC-TT--A---AA-TT----TCG---AAG-A-TTAAAGAA
gi|84951                      :                                  -AAGTG-A-G-A--TCCCT---T----TT-CTA-C-CATTTT---TG---G-GAA-----AAACCA--A-T-----TCA-----AT-T---CTC-----------A---C-AACAGCC----TTTGT-AACTTA-------TTG--G------T-----T----TATA-A----C--T-T--C--G----TCA-T---T-TGA-T-A-TC-----CTT-G--TA------A-A-T-T-G--T------T-T------------T-------A-AAC------T
gi|84919                      :                                                 CCCTA--T----CAACCG------TTT---GC---G---C-----AAA-------------TTA---C-AT-CCC-TTT-----------GAC-C-GCCA-TC----TTTGT-AACTT--------TTGT-G------T-----C----TGTA-G----C--T-T--T--G---GCA--T---T-TTA-T-A-TTTTTTTTTT-A--CA-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------T-AAC------TACATGTGC-AAT-A-A-TGT-------TC-------C-A-A-GGT-----------TCCCAACTA-------TAA-AC---GTATA--TAAAA---AC---GT---AAT--ATT-TCGC-TATAAT---TCATAG----T-----TGT---A----AT-CTC-TT--G---CA-TT----TGG---TAG-G-GTAAA
gi|84952                      :                                               atacCC---T----TGGCCG-C-CATCTT---GT---G-AGA-----AAA--A--A-G-----TCA---C-AT-TTC-CCT-----------A---C-AGTGGGC----TTTGT-AACTT--------TT-T-A------T-----C----TGAA-T----C--T-T--T--GGAGATT--T---TATTA-TCA-TT-----TTT-A--TA-TC---A-A--------C------A-T------------T-------A-TAT--------------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACCC----A-------GAA-AA---TTGTG--TGACA---TC---TT---AAT--AAT-TCGC-AATAAT---ACACAG----T-----CGC---A----AT-ATC-TT--A---CG-TT----TGG---TAG-G-ATAAAGAA
gi|84953                      :                                                                                       AT-----AAA--A--A-A-----TCA---C-AG-GTCACGT-----------A---C-ATTGTCCACCATTT-C-AA--T--------TCTG-A------T-----T----TGTA-G----C--T-T--T--G---ACG--T---T-TGC-T-A-CT-----TTT-T--CA-TC---A-A-T-T-A--T------A-G------------T-------C-AAC------TT------C-AGT-A-C-AGC-------C------------A-GG---------------------------------------GTA--TGAAA---AC---TTTTAAAT--AAT-TAGC-CTCAAT---TCACGG----T-----TGA---A----AC-CTC-TA--A---CATTT----TGG---TAC-G-GTAAAAAA
gi|84954                      :                                                                                                                     -AT-TCC-CAT-----------A---C-GTTGGCC----TTGGT-AATTT--------TATG-A------T-----C----TGTA-G----C--T-T--T--G---ACA--T---T-TGT-T-A-TT-----TTT-T--CA-TC---A-G-T-T-G--C------A-G------------T-------C-A------------------GCT-A-G-TGC-------TC-------C-A-G-GATGG-GACAATTAACAC----A-------TTT-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---GAT--AAT-TAGC-TATAAT---TCACTG----T-----AGTATAA----AC-CTC-TTAATA--CA-TT----TAG---TAA-A-G--AAGAA
gi|84955                      :                                                                                                                        aacttgtT-----------A---C-GTTGGCC----TGT-------T--------CTGT--------T-----C----CGTA-G----C--T-T--T--G---GT---------------A-TT-----T---A--CA------G-A-C-T-A--C----------------------------------------TA------T-AGT-A-A-TAC-------CC-------C-A-G-GGTGG-GAC----AGCCC----A-------TAA-AC---GTGTA--TGAAA---AC---TT---AAT--A
gi|84930                      :                                                                                                                                                    GGCC----TTTGTTAATTT--------TCGTTA------T-----C----TGTA-AAACTC--T-A--T--G---ATC--T---T-TGAGT-A-TT-----TTG-A--TA-ATGAGA-A-TAT-G--C------AAG------------T-------AGAATAC----TA------C-GAT-ACA-TCCTGACCCTCC-------C-A-A-GGTGA-GA-----AGACC----AACCACTTTAA-AC---TTGTA--TGAAA---AA----T---AAT--Aactc
gi|84957                      :                                                                                  atacccctatcaaccctttactaaacgtgatccaaagcgatccacgataaacactcactatggcacgaatctcgccttaatttgtacgagcaaaaaggtacgtactaccgctagttcttaaacagtactg-T--T--G---ATA--T---T-TGA-T-A-TT-----TTT-A--TG-TC---A-A-T-T-G--C------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-AGCGG-GGC----AACCC----A-------TGA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---AAT--AAT-TCGC-TATAAT---TCATAG----T-----TGC---A----GC-CTC-TT--T---CA-TA----TGG---TAG-G-ATAAAGAAacccact
gi|84956                      :                                                                                                                                                                                                                                     ---T-TGC-T-A-TT-----TC------A-TC---A-A-T-T-G--C------A-A------------T-------C-AAC------TA------C-AAT-A-A-TGC-------TA-------T-G-G-GGTGG-GGC----ACCTC------------------------TA--TGAAA---AC---TTTT-AAA--ATT--AGC-TATAATAATTCACAG----C-----TGT---A----AC-CTC-TT--A---CA-TT----TTG---TAG-G-GTAAAGAA
gi|84958                      :                                                                                                                                                                                                                                      tttgacaattg-TT-----TCT-A--TA-TC---T-A-T-T-G--G------A-C------------T-------ATAAT------TA------C-AGC-A-A-TGCATTAAG-CCG------C-A-G-GGTGG-TGC----AACTC----A-------TA---C---TTGTA--TGGAA---AC---TG---AAA--AAT-CGGTATGTTAT---CGACAG----TAGCAATGT---A----TT-GTC-TTA-TA--CA-TT----TGG---TTG-G-GTAAAGAA
gi|84959                      :                                                                                                                                                                                                                                                          TT-G--TA-TT---A---T-T-G--A------A-G------------T-------A-AAC------TA------C-AAT-A-A-TGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACCC----A-------GAA-AA---TTGTG--TGACA---TC---TC---AAT--AAT-TTGC-AATTAT---ACACAT----T-----TGT---A----AT-ATC-TT--A---CG-TT----TGG---TAG-G-ATAAAGAA
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Reference ( family-364 )      :                                                                                                                                                                                    ATACCCCTAT--CAACACTT-T-GC-GA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CA---TCTT---GC---G-GAC-----AAA--A-A--G-----T---CG----CAT-TTC-CC-T-----------A-C-GTTGGCC----T--TTGT-AACTT--------TCNT-A------T-----C----TGTA---G----C-T--T--T-G-A--CNT---TT----G-A-T----A-TT-TTTA--TA-TC---A-A-T-T-GC------A-GT-------A-A--A---C------TA------C------AAT------A-ATGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACC---CA---TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---A-A-T-AATTC-GCTA--TA--A---TTCACAG----T-----T---GT---A----AC-CTC-T----T---N--C---A-TTTGG---TAG-G-GTAAAGAA
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gi|84923                      :                                                                                                                                                                                    ATACCCCGAT--CAACACTT-T-GT-GC--A--AGTT-A-C-A--TCACT---T----TGATAG-C-C------TT---G-------AA-----AAA--A-A--G-----T---CA----CAT-TTC-CC-A-----------A-T-GTTGGCC----T--TTGT-AACTT--------TTGT-A------T-----C----TGGA---G----C-T--T--T-G-A--CGT---TT----G-A-T----A-TT-TTTATTTA-TC---A-
gi|84924                      :                                                                                                                                                                                    ATACCCCTATATCAACACTT-T-GC-GC--A--AGTT-A-T-G--TCCCTTAAT----TGATCA-C-CA---TCAT---GC---G-GAC-----AAA--A-A------------------TAT-TTC-CC-T-----------A-C-GTTGACC----T--TTGT-AAC
gi|84925                      :                                                                                                                                                                                    ATACCCCTAT--CAACACTT-T-AC-CA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T----TGACCG-C-CA---TTTT---GC---G-
gi|84925                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GGC----AACT---CA---TAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---A-A-T-ATTTC-GCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggcaactcataaacttgtatgaaaacttaatatttcgc
gi|84926                      : atacccctatcaacactttaccaaagttacgtccctttgaccgccattttgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATATTCCTAT----ACGCAC-T-GC-AT--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CA---TCTT---GC---A-GACA----AAA--A-A--G-----G---CG----TAT-TGCGAT-T-----------A-C-GTTGGCC----T--TTTT-AACTT--------CCAT-ACTTCCTT-----C----CTTA---G----C-T--T--T-G-A--CAT---TT----G-A-T----A-T
gi|84927                      :                                                                                                                                                                                    ATACTCCTAT--TAACACTG-T-GC-AATTA--AA---A-C-G--TCTCT---T-----GACCGAT-CA---TCTC---GC---GTGCC-----AAA--A-A--AAAATTC---CA----TAT-TTT-CT-T-----------A-CTATTGGCA----T--TTGT-ATCTT--------TCTT-A------T-----C----GGTA---G----C-TTGT--T-G-G--CTT---AT----A-A-T----A----TTCA--TA-TC---A-A-C-T-GTCA----A-GT-------A-ACTG---C------TA------C------AAC---------TG--------CA-------T-A-A-GGT-G-GGC----AACT---CA---TAA-
gi|84928                      :                                                                                                                                                                                    ATACCCATAT--CAACATT--------A--A--A------------------------TG--CG-C-CA---TCTT---GC---G-GAC-----AAA--A-A--G-----T---CG----CAT-TTT-CC-T-----------A-C-GTTGGCC----T--TTGC-CACTT--------TCGT-A------T-----C----TGTA---G----CAT--T--T-T-A---AT---TT----A-A-T----
gi|84929                      :                                                                                                                                                                                    ATACTTTAAT--CAACACTT-T-GT-GA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CA---TCTT---GC---G-GGC-----AAA--A-A--G-----T---TG----CAT-TTC-CA-------------A-G-GTTGG
gi|84930                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCC----T--TTGTTAATTT--------TCGTTA------T-----C----TGTA---AAACTC-T--A--T-G-A--TCT---TT----G-AGT----A-TT-TTGA--TA-ATGAGA-A-TAT-GC------AAGT-------A-G--AATAC------TA------C------GAT------ACATCCTGACCCTCC-------C-A-A-GGTGA-GAA----GACCAACCACTTTAA-AC---TTGTA--TGAAA---AA----T---A-A-T-AACCC-ACT
gi|84931                      :                                                  atacccctatcaaccctttactaaacgtgatccaaagcgatccacgataaacactcactatggcacgaatctcgccttaatttgtacgagcaaaaaggtacgtactaccgctagttcttaaacagtactgATTCCTCTAC--CAACACTT-T-GC-GC--A--A-TT-A-T-G--TCCCT---C----T-ACCA-C-CA---T-TT---CC---G-GACA----AAA--A-A--A-----T---CG----TAT-TTC-CC-C-----------A-CTGTT--CC----T--TCA--GACTA--------TTTT-A------T-----C----TGTA---T----C-T--C--T-T-A--CAT---CG----GTA-T----A-TT-T
gi|84932                      :                                                                                                                                                                                     TACCTTTAG--CAATTCTT-T-AC-GC--A--AGTT-A-C-G--CCCCT---T-----GACCG-C-CA---TCTT---GC---G-GGC-----TAA--A-T--G-----T---TG----CTT-TTC-CC-T-----------A-C-GTT--------T--TT-----TTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA---G----C-T--T--T-G-A------------------T----A-TT--------A-TC---A-A-T-T-GC------A-CT-------A-A--A---C------TA------C------AAG------A-ATAT-------CC-------T-A-A-GGTGG-GAC----AACC---CA---TAA-CC---TTGTA--TGAAA---AC---TA---A-A-T-AATAC-GCTA--TA--A---TTGATAT----T-----C---GT---A----AT-CTC-T----T---T--T---A-TTTGG---TAG-G-ATAAAGA
gi|84933                      :                                                                                                                                                                                     TACGCCTAT--CAACACTTGT-G--GC--A--AGTT--------------------------G-C-TA---TCTT---AC---G-GAC-----AAA--A-C--G-----T---CG----CAT-TTT-CC-T-----------A-C-GTTGACC----T--TTGT-GACTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA---G----C-T--T--T-G-A--CAT---GG----A-A-T----A-TT-ATTA--TA-TC---A-A-C-T-GC------A-GT---------A--A---C------TA------T------AGT------A-ATGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-CGT----AACC---CA---TAA-AC---TTTCA--TGAAA---AC---TT---A-A-C-A
gi|84934                      :                                                                                                                                                                                      ACACCTAT--CAACACTT-C-GC-AA-------TT-A-C-G--TCCAT---T-----GTCCG-C-GA---GTTT----C---A-G-C-----GAA--A-A--G----------------ATGTTC-CT-TCTAATGTATGTA-C-GTTGGTT----T--T-----ACTT---------AAT-A------T-----A----TACA----------T--T--T-T-A--TCT---CT----G-A-T---------TTGA--AA-TC---A-A-A-T-GC------A-GA-------C-A--A---C------TA------CTGTACAAATTATATTA-ATGC-------ACAGTCTGAC-ACG-GGTGC-GGC----ATCC---CA---TAA-AC---TTGAA--TGAAA---TT---GT---A-A-TCAATTG-ATTT--TA--A---TTGGGAA----T-----T----T---A----A----C-T----T---A--A---A-TTTGG---TAG-G-ACAAAGGA
gi|84935                      :                                                                                                                                                                                         CCAAT--CCACACTT-T-GTTGA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T------GCCG-CGCA---TCTT---TC---G-AGT-----AAA--A-A--T-----T---CA----TAT-TTC-TC-T-----------A-C-GT-GGCC----T--TTGT-AACTT--------TCTT-A------T-----C----TGTA---T----C-T--T--T-G-A--AAT---TT----T-A-T----A-TT-TTTA--TA-TC---G-A-T-T-GA------A-GT-------A-A--A---C------TA------C------AAT------A-ATGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGCA---AACC---CA---GAA-AA---TTGTA--TGAAA---TCTTTTT---A-A-T-AATTC-
gi|84936                      :                                                                                                                                                                                         CCAAT--CCACACTT---GC-GA--A--AGTT-A-C-GACTCCC----T----TGGCCG-C-C----TCTT---GT---GAGAA-----AAA--A-A--G-----T---CA----CA--TTC-CC-T-----------A-C-A-TGGCC----TTCTTG--AACTT--------TTTT-A------T-----C----TGTA---T----C-T--T--T-G-AG-GAT---TT----T-A-T----A-TT-TTTA--TA-TC---A-T-T-G-GA------A-GT-------ACA--A---A------TA------C------AAA------A-TTGC-------CC-------C---A-GGTGG--------AACC---CA---GAA-A----TTGTG--TGACA---TC---TC---A-ACT-AATTCTGCAA--TA--A---TACACAG----T-----T---GT---A----AT-ATC-T----T---G--C---G-TTTGG---TAG-G---AAAGAA
gi|84937                      :                                                                                                                                                                                         CCAAT--AAACACTT-T-GC-AA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---TAAATTGGCCG-C-CGCTTTCTT---GC---G-AGC-----AAA--A-C--G-----T---CG----CAT-TTC-CC-T-----------A-A-GTTGGCC----T--TTGT---CTT--------T
gi|84937                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------TA------C------AAT------G-ATGC-------CC-------C-A-A-GGTGG-GGC----AACC---CA---GAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---TT---A-A-T-A------CCAGGTA--A---TTCACAG----T-----T---GT---A----AT-CTC-T----T---A--C---A-Tgagatttacaatgatgccccaaggtggggcaacccagaaacttgtatgaaaacttaataccaggtaattcacagttgtaatctcttacatat
gi|84938                      :                                                                                     ccaataaacactttgcaaaagttacgtcccttaaattggccgccgctttcttgcgagcaaaacgtcgcatttccctaagttggcctttgtctttgagattCCAAT--CCGCACTT-T-AC-AA--A--AGTT-A-C-G--TCCCT---T-----GACCG-C-CA---TCTT---GC---G-AGT-----AAA--A-A--G-----T---CA----AAT-TTC-CG-T-----------A-C-CTCGTCC----T--TTGT-AACTT--------TCTT-C------T-----C----TGTA---T----C-T--T--T-T-A--GTT---TT----G-A-T----A-TT-TTAG--TA-TC---G-A-T-T-GA------A-GA-------A-A--A---C------TA------C------AGT------A-at
gi|84939                      :                                                                                                                                                                                         CCTGT--CAGT-CTT-T-GC-AT--A--ATTTTA-C-A--TCCCT---T-----GAGTG-C-AA---TC-------------------------A-A--G-----T-------------TTC-CC-T-----------A-T-GTTG-------------T-AACTT--------TCTT-A------CTGTGAC----TGTA---G----C-T--T--T-G-A--CAT---T-----A-A-T----A-TG-TTTA--TA-TC------------------------------------------------------C------AAT------A-ATGC-------TC-------C-A-A-GGTGGTGAC----AG-C---CA---TAA-ACGTTCTGTA--TG-AA---AC---TT---A-A-G-AATTT-GCTA--T---A---TTCGCAT----C-----T---GT---A----AC-
gi|84940                      :                                                                                                                                                                                           TAT--AAGTACTT-C-AC-----A--AGTC-A-C-A--TCTCT---T-----GTCTG-C-CA---TATT---GC---G-GTG-----AAA--A-A--G-----T-----------T-TT---------------------GTTGGCC----T--TTGT-AATGT--------TCTG-A------T-----A----TGTA---A----A-T--T--T-T-A--CAT---TT----G-T-T----A-TT-TTTC--CA-CC---A-A-T---GC------A-GT-------C-A--A---T------AA------C------AAT------G-ATGC-------CC-------C-A-G-GGTGA-GAC----AATT---CA---CAA-AC---TTGTA--TGAAA---AC---AT---A-A-T-GATTT-ACTA--TG--A---TTCATA---------------CT---A----AC-AT--------------------TTTGG---CAG-G-ATTAAGAacc
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gi|84968                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-AC---GTGTA--TGAAA---A----TT---A-C-T-AATTA-GCTA--TA--A---GTCACAT----T-----T---GA---A----AC-CTC-T----TGAGA--CATAA-TTTGG---TAA-G-GTAAAGAA