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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-356 )      :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore                  :                                                           7            00  222 7 77   7      7  00 7   00           7 7   7            
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Reference ( family-356 )      :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
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gi|118457                     :                                              aatATTCGTGGGG--CCAATGTTCGT--GG---GGT--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTTGTGGAG-A-CGT-AATTTCGTG
gi|118458                     :                                               atATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGTtat
gi|118459                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CGAAAT-TT--TCACT--GGTTCGTAGGG-A-CGTAAATTTCGTGGGTg
gi|118460                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAA--TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118461                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--CG---T-T--AGC-CAAATA-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|118443 ): TGGTTTCATCAATATTTGTGATCATCAATTTTCGTGTATCAGGCAAAATCCACTGTTCGTGGATTCATAAATTCGTGGAACTATGAAA
Unaligned ( gi|118445 ): TGGTTTTATCAATATTCGTGGGCATCAATTTTCGTGGATCAGACAAATATCACTGTTTTGTATACATA
Unaligned ( gi|118451 ): GTTTCATCAATATCGGGCATCGCAATTTCGTGGATAGCAAAAAATAACTATTTTCAGTGGATACGTAAATTTCTGTGACCCACCGTGAACAA
Unaligned ( gi|118447 ): TGGTTTCATCATATTCGTGGGCATCAATTTTCGTGGATCAG
Unaligned ( gi|118448 ): TAGTTTCATCAATATTCGTGCATGGACATCAAATCTCGTGGATCAGGCAAAATTCATT
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Alignments
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lowQualScore                  :                                                           7            00  222 7 77   7      7  00 7   00           7 7   7            
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Reference ( family-356 )      :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118439                     :                                                 ATTCGTGGGC-ATAAGTTTTCGT--GG---G-TCAGAC---AAAC-TC--C-ACT--TTTTCGTGGAT-A-CGT-AAATTCGTGGAT
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gi|118454                     :                                       ttcatccaatATTCGTGGGG-GCCAATTTTCGT--GG---A-T--TGC-TGAA---TT--T-GTTTGGGTTCATGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGATgaggacccaccgtaaaaaaa
gi|118455                     :                                             tcattaaaGTGGGC-ATCAATTTTCAT--GG---A-T--AGG-CAAAAT-CC----ACT--GTTTTGTGGAT-A-AGT-AAATTCGTGGAT
gi|118456                     :                                        catcaatgctTTCGTGGGA-GCCAATTGTCGT--GG---A-T--TGC-TGAATT-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AGTTTCGTGGATgcccaccatgaaaaaa
gi|118457                     :                                              aatATTCGTGGGG--CCAATGTTCGT--GG---GGT--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTTGTGGAG-A-CGT-AATTTCGTG
gi|118458                     :                                               atATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGTtat
gi|118459                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CGAAAT-TT--TCACT--GGTTCGTAGGG-A-CGTAAATTTCGTGGGTg
gi|118460                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAA--TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118461                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--CG---T-T--AGC-CAAATA-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118462                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATATTCGT--GG---A-T--AAA-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCATGGGT
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gi|118464                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---A-T--AAC-AAAACT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTTGTGGGT
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gi|118469                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCAT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118470                     :                                                 ATTCGTGGGG--CCAATGTTCAT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118471                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCATTTGG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-TAATTCGTGGGT
gi|118472                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGG
gi|118473                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---A-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-TGT-AATTTCGTGGGT
gi|118474                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGAG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118475                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T---AT-CAAAATATT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118476                     :                                                 ATGCATGGGG-GTCAATGTCTGT--GG---A-T--AAC-AAAAAC-TT--G-ACT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGG
gi|118477                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TG--T-GCT--GGTTCGTGTAG-A-CGT-AATTTCGTGGGTagtccgcaaaaa
gi|118478                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---A-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTTGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118479                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCAT--GG---G-T--AAC-AAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118480                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--TA---A-T--AAC-CAAAAT-TT--T-ACT--GGTTCATGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118481                     :                                                 ATTTGTGGGG-A--AATGTTCGT--GG---A-T--AGC-TAAAAT-TT--T-GCT--GTTTCATGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118482                     :                                                 ATTTGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---A-T--AGC-TAAAAT-TT--T-GCT---GTTCATGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118483                     :                                                 ATTTGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-GT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118484                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCAT--GG---A-T--AAC-CAAA-T-TT--T-GCT--GGTTTGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118485                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118486                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-AAAGAA-TT--T-GCT--GGTTCGTGGAG-A-CAT-AATTGTGTGGGT
gi|118487                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118488                     :                                                 ATTCGTGGGG-GTCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCATGGGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118489                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-GAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-CAT-AATTTCGTGGGT
gi|118490                     :                                                 ATTCGTGGAA-GCCAATGTTCGT--GG---A-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGTGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118491                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTTGTGGGG-A-CGT-AATTTCGAGGAT
gi|118492                     :                                                 ATTCGAGGGA-ATCAATGTTCTT--AG---T-T--AAC-CAAAAT-AT--T-ATT--GCTTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCGTGG
gi|118493                     :                                                 ATTCGTGGTG-GCCAATATTCGT--GG---A-T--AAT-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTAGGG-A-CGT-AATTTCGTGG
gi|118494                     :                                                 ATTCGTCGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAA-CAAAAT-TT--T-GTT--GGTTCGTGGGG-A-TGT-AATTTCGTGGGT
gi|118495                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-GGT-AATTTCGTGGAT
gi|118496                     :                                                 ATTCGAGGGA-TC--ATGTTCGC--GG---G-T--AGC-CAAAAT-TT--T-ACT--GATTCGTGGGG-A-CGT-AATTTCATGGAT
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gi|118498                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAC-CAAAAT-TT--T-GTT--GGTTCGTGGGG-A-TGT-AATTTCGTGGGT
gi|118499                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAT-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCATGGGG-A-TGT-AATTTCGTGGGT
gi|118500                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCGT--GG---G-T--AAA-CAAATT-TT--T-GCT--GGTTCGTAAGG-A-CGT-AATTTCGTGGGT
gi|118501                     :                                                 ATTCGTGGGG-GCCAATGTTCAT--GG---G-T--AAT-CAAAAT-TT--T-GCT--GGTTCGTGGGG-A-TGT-AATTTCGTGGGT
gi|118502                     :                                                  TTTGTGGGG-GCCAATGTTCGT--AA---A-T--AAC-CAAAAT-TT--A-GCT--GGTTCGTGGGC-A-CGT-AATTTCGTGGGT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|118452 ): TTCATCAATATTCGTGGGCATCAATTTTCGTGGATTAGATGCAATCCATCGTTTCATGGATTCGTAAATTCATGGACATTCACCATCAAAAAA
Unaligned ( gi|118443 ): TGGTTTCATCAATATTTGTGATCATCAATTTTCGTGTATCAGGCAAAATCCACTGTTCGTGGATTCATAAATTCGTGGAACTATGAAA
Unaligned ( gi|118445 ): TGGTTTTATCAATATTCGTGGGCATCAATTTTCGTGGATCAGACAAATATCACTGTTTTGTATACATA
Unaligned ( gi|118451 ): GTTTCATCAATATCGGGCATCGCAATTTCGTGGATAGCAAAAAATAACTATTTTCAGTGGATACGTAAATTTCTGTGACCCACCGTGAACAA
Unaligned ( gi|118447 ): TGGTTTCATCATATTCGTGGGCATCAATTTTCGTGGATCAG
Unaligned ( gi|118448 ): TAGTTTCATCAATATTCGTGCATGGACATCAAATCTCGTGGATCAGGCAAAATTCATT
Unaligned ( gi|118446 ): TGGTTTCATCATTATTCGTTGAGCACCAATTTTCGTGGAT