lowQualScore                  :                                                                                           111111                                    555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555                                                                                      2222222222222222222222222222222222222                            
lowQualScore                  :          0  0   0  1 66666 0 22 1 11111  0     0 0 0 222 3333333333333  2 0 2  0 0 2 1  0 555555 1  777 00    111  22   0 22 11 0 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  11  00 555555 0  1111 0 00 1 2 222 00 0   111   0 11 222 0 2 11111  22  1 555  11   0000000000000000000000000000000000000 111  11 0  0 222  1111     
lowQualScore                  :          .  .   .  . ..... . .. . .....  .     . . . ... .............  . . .  . . . .  . ...... .  ... ..    ...  ..   . .. .. . . ............................................................................................................................................................  ..  .. ...... .  .... . .. . . ... .. .   ...   . .. ... . . .....  ..  . ...  ..   ..................................... ...  .. .  . ...  ....     
lowQualScore                  :          8  8   8  5 99999 8 33 5 88888  7     7 7 7 000 8888888888888  1 7 1  7 7 1 4  7 888888 4  555 99    999  55   7 55 66 7 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999  66  99 111111 7  4444 7 99 3 0 000 99 7   111   7 88 111 7 0 77777  55  4 333  99   6666666666666666666666666666666666666 333  00 7  8 111  7777     
consensus                     :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-CAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TG--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTGGN-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
Reference ( gi|52473 )        :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TA--TG-ACG--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------G--------------------G-C--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52474                      :    TCTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-AA-A-TA--CA-ACA--T--TTTT---GC--AGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---TG-C-GTGGC-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-T---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GC--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52475                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-T-C-AC-A-G-T-GA-A-TT--CG-ACA--T--TTTT---GT--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTGAC-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-TT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52478                      :    TTTATT-TT-ATC-TT-C----GG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------C--------------------G-T--GG----------------ATCT----------------G--------C-----AGATATTGTGTTTCGT----------------AAAG--------T---CG-C-GTGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52476                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-A---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TA--CG-ACA--T--TTTT---GC--GAA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------A--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CGTC-------CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AT----TCAT
gi|52479                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-TGATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TT--CA-ACA--T--TTTT---GT--GGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTT-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTGGG-CTC--AC--AT-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-A-A-----AA--TC-A-G-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCACT
gi|52477                      :    TTTATT-TA-ATTATA-C----TG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TG--TT-ACA--T--TTAT---GC--AGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GA----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-ATGGC-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----CA--TC-A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52480                      :    TCTATC-TT-ATT-TA-C----TG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-A---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GT--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCCGTAGATATTGTGGGTTG--------C-----A--------------A----------------AA-G--------T---CG-C-GTGGG-TTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-AT--GAT---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52481                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-AT-T-----GT-TAATA-A-T-G---TA------------TA-C-C-AC-A-G-T-GA-A-TA--CA-ACA--T--TTTT---GC--GGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------T-T--GG----------------GCC-----------------G--------C-----A--------------T----------------G--G--------T---CG-C-GTGAC-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---T--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-T-GT--GAC---------TTGAA-----T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----TCATT
gi|52515                      :    TTT-TT-TT-ATA-TA-C----GA-A-AT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-T-G-T-GA-A-TC--TG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--CTA-T-----------------GTGGGTTCGTAGATATT----G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AAT---AGA-G--A---G-T-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------G---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52486                      : ttaTCTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-T-GC-A-G-T-AA-A-TC--TG-ACA--T--TTTT---GC--AGA-C--G--C-ATT-----------------GTGGGTCCACAGATATTAATTG-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------A----------------A--G--------T---CA-T-GTGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TT-A-A-AA--AAA---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52483                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GG-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T---CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-TATGT-------------G--------------------GTC--GGTAGATATT--------GTG-----------------G--------CTAGA-A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTAGG-TTC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GACTTGAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52482                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GG-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GT-A-G-T-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-G--G--T-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTT-----------------G--------C-----A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-ATGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--A-G-G---C--T-GAT----------A---G-C-A-----AA--TT-A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------T---AT--G-
gi|52484                      :    TTTTTT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---AA------------TG-C-C-AC-A-G-T-GA-A-TA--CA-ACA--T--TTTT---GC--GAA-C--G--T-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------TTC-----------------G--------C-----ATC------------T----------------C--G--------T---CG-C-GTGTC-CTT--AC--GATT---T-TT----T-T--T-A-G---C--C-GAT---AGA-T--A---A-A-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----GCATT
gi|52489                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-CAATG-A-T-G---TG------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--T--TTTT---GC--AGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-C--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---TG-----GGA-GTC--AC--AG-----C-TTTTAAT-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TCAA-T-GT--GGC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52487                      :    TTCATT-TT-ATG-TA-C----GG-A-AT-T-----GT-TAATG---T-----TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-AA-A--A--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------TTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CATC-------CTC--AC--AA-----T-TC----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-A--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--A-C
gi|52496                      :    TTTATT-TT-ATC-TAAC----GG-A-GTGT-----GT-TTCTG-G-T-G---TA------------TA-CGC-AC-G-G-T--A-A-TA--CG-ACA--T--TTTTT--GC--GGA-C--G--C-AAT-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------CC----A--------------T----------------A--G--------T---TG-C-GTGGC-CTC--AC--AGAT---T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGAGG--A---G-C-A-----AGATTC-A-T-GTTCGAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-----AA----TCATT
gi|52485                      :    TTTCTT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GT-CAATG-A-T-G---TG------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--AG----------------GTC-----------------G--------A-----A------------------------------------------------A-C-TTGGA-GTC--AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TC-A-T-GC--GAC---------T---------T-----------------CGGAGT--T-CC-T---AA----TCATT
gi|52491                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-CAATA-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--A--TTTT---GC--GGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G-----------------------------T----------------A--G------------------------TC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-C-G---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TA-A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCA
gi|52493                      :    TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GT-TCATG-A-T-G---TA------------TA-C-T-GG-A-G-T-TA---TA--CA-ACA--T--ATTT---GC--GGA-C--A--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG-----------------TT-----------------G--------T-----A--------------C----------------A--G--------T---GG-A-GCGGC-CTC--GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-G-A-----AG--TC-A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52494                      :    TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GT-TCATG-A-T-G---TA------------TA-C-T-GG-A-G-T-T--A-TA--CA-ACA--T--ATTT---GC--GGA-C--A--C-A-T-----------------T--------------------G-T---G----------------GTT-----------------G--------T-----A--------------C----------------A--G--------T---GG-A-GCGGC-CTC--GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-G-A-----AG--TC-A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52488                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GT-CAGTG-G-T-G---TG------------TA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-GG--CA-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------A--------A-----A------------------------------------------------A-C-TTGGA-GTC--AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AAA-G--A---G-C-A-----AG--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-TA--AA----TCA
gi|52500                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-------GT-TAATG-A-T-G---T-------------TA-C-T-GCTA-G-T-AA-A-TC--CG-ACAC-T--TTTT---GTT-GGA-CACG--C-A-TTGTGCGGTCCGTAAATAGT-------------------G-T--GG----------------GTC--------------------------C-----A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGGG-CTC--ACCAAA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GA----AGA-G--A---G-CAA-----AA--TCAA-C-GA--AAC---------T---------T--------A--------C---GT--G-CCAT---AA----TCATT
gi|52495                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-AT-T-----C----AT----T-G---T-------------CA-A-C-GC-A-G-T-GA-A-TA--TG-ACA--T--TTTT---GC--GAA-C-----C-G-T-----------------T--------------------G-T--TG----------------GTT-----------------A--------C-----A--------------T----------------A--T--------A---TT-C-GTC---CTT--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--AC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----
gi|52490                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-GT-T-----GT-CAATG-A-T-G---CAATGTCAATGAGCCA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-GG--CA-ACA--T--TTTT---GC--GAA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---CA------GA-ATC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-CTT-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52492                      :    TTTCTT-GT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GT-CTATG-A-TAG---TG------------TA-C-C-GC-A-G-TTGA-AGCG--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A--------------A----------------A------------------C-TTGGA-ATC--AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC-A-CGGT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52504                      :    TTTATT-GT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GA-CAATG-A-T-G---TG------------TA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-GG--GG-ACA--A--TTTT---GC--AGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---C--C-G-GGA-GTC--AC--AA-----T-AT----T-T--C-A-A---T--G-AAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CG-T---AA----TCATT
gi|52499                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-CAAGG-A-T-G---TG------------TA-T-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-CCA--T--TTTG---GC--AGA-C--A--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---TG-----GGA-GTC--AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-T---C--T-GAT----GA-G--A-----C-A-----AA--TC-A-C-GG--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52498                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-TTTTAAG-A-GT-------GT-CAATT-A---G---TG------------TA-C-C-AC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--T--TTTT---AC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------ATC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---CG-----GGA-GTC--AC--AC-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----TA--TT-A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AC----TTATT
gi|52506                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GT-AATTG-A-T-G---TG------------TAAC-CAGC-A-G-T-GG-A--A--TCCACA--T--TTTT---GC--TGA-C--G--C---T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGAGACTC--AC--TT-----T-TT----T-T--T-AAG---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC-A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52505                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GT-AATTG-A-T-G---TG------------TAAC-CAGC-A-G-T-GG-A--A--TCCACA--T--TTTT---GC--TGA-C--G--C---T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGAGACTC--AC--TT-----T-TT----T-T--T-AAG---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC-A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52507                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C-----G-A--C-T-----GT-CAATA-A-T-G---TA------------TA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-GG--CA-ACA--T--TTTT---GT--GGA-A--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GT---------------------------C-----A--------------T----------------------------T--------------TTC--AT--TA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---GAA-T--A---G-C-A-----AA--TC-A-T-GT--GAC----------------------------A--------C---ATGAG-TG-T---AA----TCGTT
gi|52497                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-T----AG-A-GT-T-----GA-CAATG-A-T-G---TT------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-GCA--T--TT-----------A-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--C--------T---TG-TAGTAG--------C--AA-----T-TT----T-T--T-T-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--TACTA-------T---------T--------A----------------G-CC-T---A
gi|52503                      :    TTTTTT-TT-ATT-TA-C----GGGA-AT-T-----GT-CTATG-A-T-G---TG------------TA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA-----TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GT------------------G--------A-----A-------------------------------A--A--------C---CT-T-G-GAA-TTCA-AC--AGC----T-TT----T-T--CAA-G---C--T-GAT---AG--G--A---G-C-A-----AG--TC-A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52508                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT-TAATG---------TA------------TA-C-C-AC-A-GGT-GA---T---CG-ACA--T-----------------------C-A-T-----------------GT-------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------TT-G--------TTTGCG-C-GTGGT-CTTCTAC--AA-----T-TT----T-T--C-A-AGT-C--T-GAT---AGA-GAGA---G-C-A-----AA--TC-ATT-GT--GAC---------T---------T--------A--------
gi|52502                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GT-CAATG-A-T-A---AG------------TA-C-C-GC-G-G-T-GA-A-GG--CG-AGA--T--ATTT---GC--GTA-T--G--C-A-T-----------------C--------------------G-T--GC----------------GCC-----------------GT-------C-----G--------------A----------------A--G--------T---------TGGA-GTA--AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--
gi|52501                      :    TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GT-CAATG-A-T-A---AG------------TA-C-C-GC-G-G-T-GA-A-GG--CG-AGA--T--ATTT---GC--GTA-T--G--C-A-T-----------------C--------------------G-T--GC----------------GCC-----------------GT-------C-----G--------------A----------------A--G--------T---------TGGA-GTA--AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--caaaacataactt
gi|52509                      :    TTTATT-TT-ATT-GA-C----GT-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-G-C-GC-A-A-T-TA-A-TA--CT-GCA--T--TTTT---GC--GTA-T--A--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GA----------------GGC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---TG-caaaacataactt
gi|52510                      :    TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----AC-CAATG-A-A-A---TT------------TA-T-C-GC-G-G-T-GA-A-GG--TG-ACA--T--TTTT---TTCAAGA-A--G--C-A-T---------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----------------A---------------------TGGA----------AA-----T-TT----T-T----A-G---C--T-GA------A-A--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TA-C---AA----TCATT
gi|52513                      :    TTTATT-TTTATT-TA-C-----G-A-GT-T-----GT-TAATG-AAG-G---TA------------TAGC-C-GC-A-G-T-GA-A-TC--AG-ACACTT--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------G
gi|52511                      :    TTTCTT-TT---T-TA-C----GG-A-TT-T-----GT-CAATG-G-T-C---TG------------TA-T-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--T--------------------G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G----------------------------------------------------------------------------------AA-----A-CT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TA-A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52512                      :    TTTATT-CT-ATA-TA-C----GG-G-GA-T-----GC-CAGTG-A-A-G----A------------TA-C-C-GC-A-T-T-GA-C-GA--CG-ACA--T--TTGT---CC--AGA-A--G--C-A-C-----------------T--------------------A-T--GG----------------G-------------------------------------------------T----------------A--A--------T---C----------CTC-------------T-TT----T-T--T-A-G---G--T-GAT-------G--A---G-C-A-----CA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----ACATT
gi|52514                      :     TTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---T-------------TA-C-T-GC-A-G-T-GA-A-TA--CG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-C--G----A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-ATGGGGCTC--AC--A--------TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52517                      :     TTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GT-CTATG-A-T-G---TG------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-GG--CG-ACA--T--------------------G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GAC-----------------G--------A-----A------------------------------------------------A-C-TTGGA-GTC--AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC-A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52516                      :     TTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-TCAGTTGT-CAATG-C-T-G---TG------------TA-C-T-AC-A-G-T-GA-A-GG--CA-ACA--T--TTTT---GC--ACA-C--A--C-T-T-----------------T--------------------T-T--GG----------------GTC--------------------------------A--------------T----------------A--G--------T---C---------------AA--AC-----T-TT----T-C--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-AAATTTAA--TC-A-T-GT--GAC---------
gi|52518                      :     TCATT-TT-ATT--A-C----GG-A-ATAT-----GT-CAATG-A-T-A---AG------------TC-T-C-GC-G-G-T-GA-A-GA--CG-A-A--T--ATTT---GC--GGA-T--G--C-A-T-----------------CT-------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--A--------T---------TGGA-GTA--AC--AA-----T-TA----C----C-A-AAAAC--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C-A-C-AC--AAC---------T---------T--------
gi|52519                      :      TATT-AT-ATT-TA-T-----G-A-TT-T------T-CAGT--A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GATA-TA--CG-A----T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTAGC-CTC--AT--AA-----T-TT----TAT--C-A-G---C--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----A------A-T-AT--GA----------T---------T--------AC-------C---AT--A-CC-T---A
gi|52520                      :      TATTATT-ATT-AA-C----A--A-TT-T-----GTCTAATG-A-T-GT--TG------------TA-C-C-GC-A-GATAGA-A------G-GCG--TCATTTT---GCTTTGA-CTAG--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A--------------A----------------A------------------C-TTGAA-AGT--AC--AGC----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-
gi|52521                      :       ATT-TT-ATT-TATC----AT-A-GA-T-----GT-CAATG-A-T-A---AG------------TA-C-C-GC-G-G-T-GA-A-GG--CG-AGA--T--ATTT---GC--GGA-T--G--C-A-T-----------------C--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------A-----A-------------------------------A--G--------T---------TGGA-GTA--AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C-A-C-AT--AAC---------T---------T---------------------------CC-T---TA----TCATT
gi|52522                      :       ATT-TT-ATT-TA-C-----G-A--T-T-----G---AAT--A-T-----TA------------TA-C-C-CA-A-G-T-GA-A-TC--C--ACA--T--TTGCAGCGC--AAA-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--AG----------------TCC-----------------G--------T-----AATATTTGCT-----TCGGAAAAA--------A--G--------TG--CG-C-GTGG--CTC--AC--AA-----T-TT---------C-A-G---C--T-GAT---AGA-GCAG---G-C-A-----AA--TC-A-C--T--GACTTAAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-CCTGAA----TCATT
gi|52523                      :        TT-TT-ATT-TA-C----GG---GT-G-----GT-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-ATGTT-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GC--GG--C--GC-C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCT----------------G--------T-----A--------------TATTTTTAGGTGGCAAAA--G--------T---CG-C-GTGGA-CT---AC--AT-----T-TT----T-TAAT-A-G---C--TGGAT---AGG-G--AAG-G-C-A-----AA---C-A-C-GTTGGATAAAAAA---T---------T--------A--------C---AT--G--C-T---AA----TCATT
gi|52524                      :         T-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GA-TAATGTA-T-G----A------------TA-C-C-GC-A---T-GA-A-TAGCCG-ACA--T--TTTT---GC--GGA-CT-G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GGTCTGTAGATATTTTAGGTG-----------------G--------A-----A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGA--CTC--AC--A--------TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---GGA-G--A---G-CAA-----AA--CC-A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAA-T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52525                      :             -ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GT-TAATG-A-T-G---TG------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GC--TGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-C-GTGGG-CTC--AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52526                      :                            -A-GT-T-----TT-TAATG-G-T-GATTTG------------TA-C-CCGC-A-G-C-GA-A-CAGGCG-ACA--T--TTTT---GC--GGAGC--GGAC-A-T-----------------T--------------------G-CTTGG----------------GTC-----------------GAAACCCAAC-----A--------------A----------------A--GAAAAAACTT---CG-----GAG--TC--AC--AGGGTTTT-TT----T-T--C-A-G---A--T-GAT---TGG-G--A---G-C-A-----AAGTTC-A-C-GT--G
gi|52527                      :                                T-T-----GG-TAATG-A-T-G---TA------------TA-C-C-GC-A-G-T-GA-A-TC--CG-ACA--T--TTTT---GT--GGC-C--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCCGTAGATATTGTG----G--------CTCGA-A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGGT-CTC--AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC-A-C-GT--GAC---------T---------TAAAAAATCA--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52528                      :                                   -----GT-CAATT-A-T-G---TA------------TA-C-C-AC-A-G-T-GA-A-AG--CC-ACA--T--TTTT---GC--AGA-C--A--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------ATC-----------------G----------------------------------------------------------T---C----------CTC--AT--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AA-----------------C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----TCACT
gi|52529                      :                                                                        A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-TA--CG-ACA--T--TTTT---GC--AGA-T--G--C-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTT-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---TG-C-GTGGC-GTC--AC--AA-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TC-A-C--T--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52531                      :                                                                                                      --T--TTTT---GC--GGA-C--G--C-A-A-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTC-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CT-T-GTGGC-ATC--AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T---C---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------T---GT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52530                      :                                                                                                         --TTTT---GC--GGA-C--G--T-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GTCTGTAGATATTTTAGGTGG--------C-----A--------------A----------------AA-G--------T---CG-C-GTGGA-CTC--AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---GCC-A-----AAC-CC-A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAAAT--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52532                      :                                                                                                         acaTTT---GC--AGA-C--G--T-A-T-----------------T--------------------G-T--GG----------------GCT-----------------G--------C-----A--------------T----------------A--G--------T---CG-T-GTGAT-CTC--AC---------T-TT----C-T--C-G-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TT-T---GA----TCATT
gi|52533                      :                                                                                                                                                                                                   TC-----------------A--------C-----A--------------C-------------------G--------T---CA-C-GTGGC-CTC--AC--AA-----TGTT----T-T--C-A-A--------GATCGAAGA-G--ACAGG-C-A-----AA--TA-ACT-GT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AAAACCTCATT
gi|52534                      :                                                                                                                                                                                                                       --------C-----A--------------A----------------A--G--------T---CG-C-GTGGA-CTC--AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---CGTT-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CA-G-C-GT--GAC---------T---------T--------AAAAAATCGC---AT--GCCC-T---AA----TCATT
gi|52535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGT-TTC--CC--AA-----T-TT---------C-ACG---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TT-G-C-GT--GAC---------T---------T--------G------------AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               cacaatcggttt-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC-A-C-GT--GAT---------T---------T--------C--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                          11111111111111111                                       333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                    1111111111111111111111111111111111111                            
lowQualScore                  :         0  0   0  1 1111  0 1  1 33333   0    0 0 0 111 33333333333333 1 0 0 2  0 1 0 3  0 8888888     11     111  11 00  0 22 11 44444444444444444 0 2  00000000000000000  444444444444444444 7777777777777777  777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 22222222 66666666  1 444 00 0  00 444444 0  1111 0 00 2 0 222 00 0   222   0 00 222 0 2 11111  22  333 0 1  11   9999999999999999999999999999999999999 111  22 0  0 222  1111     
lowQualScore                  :         .  .   .  . ....  . .  . .....   .    . . . ... .............. . . . .  . . . .  . .......     ..     ...  .. ..  . .. .. ................. . .  .................  .................. ................  ................................................................................. . ........ ........  . ... .. .  .. ...... .  .... . .. . . ... .. .   ...   . .. ... . . .....  ..  ... . .  ..   ..................................... ...  .. .  . ...  ....     
lowQualScore                  :         8  8   8  5 6666  7 5  5 33333   7    7 7 7 222 88888888888888 4 7 7 1  7 4 7 5  7 3333333     66     888  66 99  7 55 66 77777777777777777 7 0  22222222222222222  999999999999999999 8888888888888888  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 44444444 00000000  3 666 99 7  99 888888 6  4444 6 99 6 6 000 99 6   000   6 99 000 7 0 66666  55  666 7 3  88   0000000000000000000000000000000000000 333  00 7  8 111  7777     
consensus                     :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
Reference ( family-352 )      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52473                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACG--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-GG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52474                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-T---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GC--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52475                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-T-C-AC-A-G-T-GA-A-T--T--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-TT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52476                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--AA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT------C-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AT----TCAT
gi|52477                      :   TTTATT-TA-ATTATA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--TTACA--TTTAT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52478                      :   TTTATT-TT-ATC-TT-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------CT----------------G--------CAGAT-A---------TTGTGTTTCGTAA----A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52479                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-GATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--T--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-A-A-----AA--TC---A-G-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCACT
gi|52480                      :   TCTATC-TT-ATT-TA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAT---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52481                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-AT-T-----GTT-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TT-----------------TG------------------G----------------GC---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------G-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---T--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------TTGAA-----T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----TCATT
gi|52482                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GT-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-G--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-ATG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--A-G-G---C--T-GAT----------A---G-C-A-----AA--TT---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------T---AT--G-
gi|52483                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T-----CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-TATG-----------------TG------------------GTCGGTAGATATT----GT---------------------G-----------------G--------CTAGA-A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTA-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GACTTGAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52484                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---A-A------------T-G-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----ATC-------T----------------C-G--------T---CGC-GTG-TC-CT--T-AC--GATT---T-TT----T-T--T-A-G---C--C-GAT---AGA-T--A---A-A-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----GCATT
gi|52485                      :   TTTCTT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TC---A-T-GC--GAC---------T---------T-----------------CGGAGT--T-CC-T---AA----TCATT
gi|52486                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-AA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GTCCACAGATATTAATTGTGGGTC-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CAT-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TT---A-A-AA--AAA---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52487                      :   TTCATT-TT-ATG-TA-C----GG-A-AT-T-----GTT-AATG---T-----T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A----A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CAT------C-CT--C-AC--AA-----T-TC----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--A-C
gi|52488                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AGTG-G-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AAA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-TA--AA----TCA
gi|52489                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AG-----C-TTTTAAT-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TCA--A-T-GT--GGC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52490                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---C-AATGTCAATGAGCC-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-----A-GA-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-CTT-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52491                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--ATTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G------------------------T----------------A-G------------------------T--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-C-G---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TA---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCA
gi|52492                      :   TTTCTT-GT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GTC-TATG-A-TAG---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-TTGA-AGC--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-GA-AT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-CGGT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52493                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-TA---T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G-----------------T---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52494                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-T--A-T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------T-------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52495                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-AT-TCATT-GTC-AA--------------------------------C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACA--TTTTT---GC--G--AA-C-----C-----------------G-T-TG-----------------TT------------------G----------------GT---------------------T-----------------A--------C-----A---------T----------------A-T--------A---TTC-GT---C-CT--T-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--AC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----
gi|52496                      :   TTTATT-TT-ATC-TAAC----GG-A-GTGT-----GTT-TCTG-G-T-G---T-A------------T-A-CGC-AC-G-G-T--A-A-T--A--CGACA--TTTTTT--GC--G--GA-C--G--C-----------------AAT-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------CC----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AGAT---T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGAGG--A---G-C-A-----AGATTC---A-T-GTTCGAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-----AA----TCATT
gi|52497                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----AG-A-GT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-T------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGGCA--TTT-------------A-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TGTAGTA-G---------C--AA-----T-TT----T-T--T-T-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--TAC---------T-------------------------------ATTAG-CC-T---A
gi|52498                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-TTTTAAG-A-GT-------GTC-AATT-A---G---T-G------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---AC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---CG----G-GA-GT--C-AC--AC-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----TA--TT---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AC----TTATT
gi|52499                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AAGG-A-T-G---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGCCA--TTTTG---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-T---C--T-GAT----GA-G--A-----C-A-----AA--TC---A-C-GG--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52500                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-------GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GCTA-G-T-AA-A-T--C--CGACAC-TTTTT---GTT-G--GA-CACG--C-----------------A-T-TG-----------------TGCGGTCCGTAAATAGTGTGG----------------GT---------------------C--------------------------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-ACCAAA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GA----AGA-G--A---G-CAA-----AA--TCA--A-C-GA--AAC---------T---------T--------A--------C---GT--G-CCAT---AA----TCATT
gi|52501                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52502                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52503                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----GGGA-AT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA---TTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------------------------G--------A-----A--------------------------A-A--------C---CTT-G-G-AA-TT--CAAC--AGC----T-TT----T-T--CAA-G---C--T-GAT---AG--G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52504                      :   TTTATT-GT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--GGACA--ATTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-C-G-G-GA-GT--C-AC--AA-----T-AT----T-T--C-A-A---T--G-AAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CG-T---AA----TCATT
gi|52505                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52506                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52507                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GA----C-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-A--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------------------------------T-TT--C-AT--TA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---GAA-T--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC----------------------------A--------C---ATGAG-TG-T---AA----TCGTT
gi|52508                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT----TA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-AGG-T-G--A-T-----CGACA--T-----------------------C-----------------A-TGTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----AT--------T----------------T-G--------TTTGCGC-GTG-GT-CTTCT-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-AGT-C--T-GATAG-AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---ATT-GT--GAC---------T---------T--------A--------
gi|52509                      :   TTTATT-TT-ATT-GA-C----GT-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-G-C-GC-A-A-T-TA-A-T--A--CTGCA--TTTTT---GC--G--TA-T--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GG---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TG
gi|52510                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----ACC-AATG-A-A-A---T-T------------T-A-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--TGACA--TTTTT---TTCAA--GA-A--G--C-----------------A-T-TA-----------------TG------------------G----------------A----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-----T-TT----T-T----A-G---C--T-GA------A-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TA-C---AA----TCATT
gi|52511                      :   TTTCTT-TT---T-TA-C----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-G-T-C---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G-----------------------------------------------------------------------------AA-----A-CT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TA---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52512                      :   TTTATT-CT-ATA-TA-C----GG-G-GA-T-----GCC-AGTG-A-A-G-----A------------T-A-C-C-GC-A-T-T-GA-C-G--A--CGACA--TTTGT---CC--A--GA-A--G--C-----------------A-C-TA-----------------TG------------------G----------------G-----------------------------------------------------------------T----------------A-A--------T---C----------CT--C------------T-TT----T-T--T-A-G---G--T-GAT-------G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----ACATT
gi|52513                      :   TTTATT-TTTATT-TA-C----G--A-GT-T-----GTT-AATG-AAG-G---T-A------------T-AGC-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--AGACACTTTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------G
gi|52514                      :    TTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--------------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GGGCT--C-AC--A--------TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52515                      :   TTT-TT-TT-ATA-TA-C----GA-A-AT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-T-G-T-GA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--CTATGTGGGTTCGTAGATA-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AAT---AGA-G--A---G-T-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------G---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52516                      : ttaTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-TCAGTTGTC-AATG-C-T-G---T-G------------T-A-C-T-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--A--CA-C--A--C-----------------T-T-TT-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------A-G--------T---C----------------AA--AC-----T-TT----T-C--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-AAATTTAA--TC---A-T-GT--GAC---------
gi|52517                      :    TTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GA---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52518                      :    TCATT-TT-ATT--A-C----GG-A-ATAT-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-C-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--A--CGA-A--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-TCTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-A--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TA----C----C-A-AAAAC--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AC--AAC---------T---------T--------
gi|52519                      :     TATT-AT-ATT-TA-T----GA----T-T-----TTC-AGT--A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GATA-T--A--CGA----TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTA-GC-CT--C-AT--AA-----T-TT----TAT--C-A-G---C--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--T--------AT--GA----------T---------T--------AC-------C---AT--A-CC-T---A
gi|52520                      :     TATTATT-ATT-AA-C----A--A-TT-T-----GTCTAATG-A-T-G---TTG------------T-A-C-C-GC-A-GATAGA-A-G--G--CGTCA--TTTT----GC--TTTGA-CTAG--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-AA-AG--T-AC--AGC----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-
gi|52521                      :      ATT-TT-ATT-TATC----AT-A-GA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AT--AAC---------T---------T---------------------------CC-T---TA----TCATT
gi|52522                      :      ATT-TT-ATT-TA-C----GA----T-T-----G---AAT--A-T-----T-A------------T-A-C-C-CA-A-G-T-GA-A-T--C--C-ACA--TTTGCAGCGC--A--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------TC---------------------C-----------------G--------T-----AATATTTGCTTCGGAAAAA--------A-G--------TG--CGC-GTG-G--CT--C-AC--AA-----T-TT---------C-A-G---C--T-GAT---AGA-GCAG---G-C-A-----AA--TC---A-C--T--GACTTAAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-CCTGAA----TCATT
gi|52523                      :       TT-TT-ATT-TA-C----GG---GT-G-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-ATG-TTGA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--G--C--GC-C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CT----------------G--------T-----A---------TATTTTTAGGTGGCAAAA-G--------T---CGC-GTG-GA-CT----AC--AT-----T-TT----T-TAAT-A-G---C--TGGAT---AGG-G--AAG-G-C-A-----AA---C---A-C-GTTGGATAAAAAA---T---------T--------A--------C---AT--G--C-T---AA----TCATT
gi|52524                      :        T-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GAT-AATGTA-T-G-----A------------T-A-C-C-GC-A---T-GA-A-T--AGCCGACA--TTTTT---GC--G--GA-CT-G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------GTCTGTAGATATTTTAGGT---------------------G-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG--A-CT--C-AC--A--------TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---GGA-G--A---G-CAA-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAA-T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52525                      :            -ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--T--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52526                      :                           -A-GT-T-----TTT-AATG-G-T-GATTT-G------------T-A-C-CCGC-A-G-C-GA-A-CAGG--CGACA--TTTTT---GC--G--GAGC--GGAC-----------------A-T-TGCT---------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------GAAACCCAAC-----A---------A----------------A-GAAAAAACTT---C-----G-GA-GT--C-AC--AGGGTTTT-TT----T-T--C-A-G---A--T-GAT---TGG-G--A---G-C-A-----AAGTTC---A-C-GT--G
gi|52527                      :                               T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GC-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------CT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GT-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------T---------TAAAAAATCA--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52528                      :                                  -----GTC-AATT-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-A--G--CCACA--TTTTT---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G----------------------------------------------------T---C----------CT--C-AT--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AA-----------------C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----TCACT
gi|52529                      :                                                                        -A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TC---A-C--T--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52530                      :                                                                                                     ACA--TTTT----GC--G--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CTGTAGATATTTTAGGTGG--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---GCC-A-----AAC-CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAAAT--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52531                      :                                                                                                        --TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-A-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CTT-GTG-GC-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T---C---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------T---GT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52532                      :                                                                                                            TTT---GC--A--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GC---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT-GTG-AT-CT--C-AC---------T-TT----C-T--C-G-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TT-T---GA----TCATT
gi|52533                      :                                                                                                                                                                                                                 T---------------------C-----------------A--------C-----A---------C------------------G--------T---CAC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----TGTT----T-T--C-A-A--------GATCGAAGA-G--ACAGG-C-A-----AA--TA---A-CTGT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AAAACCTCATT
gi|52534                      :                                                                                                                                                                                                                                                          --------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---CGTT-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CA---G-C-GT--GAC---------T---------T--------AAAAAATCGC---AT--GCCC-T---AA----TCATT
gi|52535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG-GT-TT--C-CC--AA-----T-TT---------C-ACG---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TT---G-C-GT--GAC---------T---------T--------G------------AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cacaatcggttt-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAT---------T---------T--------C--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                          11111111111111111                                       333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                    1111111111111111111111111111111111111                            
lowQualScore                  :         0  0   0  1 1111  0 1  1 33333   0    0 0 0 111 33333333333333 1 0 0 2  0 1 0 3  0 8888888     11     111  11 00  0 22 11 44444444444444444 0 2  00000000000000000  444444444444444444 7777777777777777  777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 22222222 66666666  1 444 00 0  00 444444 0  1111 0 00 2 0 222 00 0   222   0 00 222 0 2 11111  22  333 0 1  11   9999999999999999999999999999999999999 111  22 0  0 222  1111     
lowQualScore                  :         .  .   .  . ....  . .  . .....   .    . . . ... .............. . . . .  . . . .  . .......     ..     ...  .. ..  . .. .. ................. . .  .................  .................. ................  ................................................................................. . ........ ........  . ... .. .  .. ...... .  .... . .. . . ... .. .   ...   . .. ... . . .....  ..  ... . .  ..   ..................................... ...  .. .  . ...  ....     
lowQualScore                  :         8  8   8  5 6666  7 5  5 33333   7    7 7 7 222 88888888888888 4 7 7 1  7 4 7 5  7 3333333     66     888  66 99  7 55 66 77777777777777777 7 0  22222222222222222  999999999999999999 8888888888888888  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 44444444 00000000  3 666 99 7  99 888888 6  4444 6 99 6 6 000 99 6   000   6 99 000 7 0 66666  55  666 7 3  88   0000000000000000000000000000000000000 333  00 7  8 111  7777     
consensus                     :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
Reference ( family-352 )      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52473                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACG--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-GG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52474                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-T---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GC--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52475                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-T-C-AC-A-G-T-GA-A-T--T--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-TT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52476                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--AA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT------C-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AT----TCAT
gi|52477                      :   TTTATT-TA-ATTATA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--TTACA--TTTAT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52478                      :   TTTATT-TT-ATC-TT-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------CT----------------G--------CAGAT-A---------TTGTGTTTCGTAA----A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52479                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-GATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--T--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-A-A-----AA--TC---A-G-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCACT
gi|52480                      :   TCTATC-TT-ATT-TA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAT---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52481                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-AT-T-----GTT-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TT-----------------TG------------------G----------------GC---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------G-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---T--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------TTGAA-----T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----TCATT
gi|52482                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GT-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-G--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-ATG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--A-G-G---C--T-GAT----------A---G-C-A-----AA--TT---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------T---AT--G-
gi|52483                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T-----CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-TATG-----------------TG------------------GTCGGTAGATATT----GT---------------------G-----------------G--------CTAGA-A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTA-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GACTTGAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52484                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---A-A------------T-G-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----ATC-------T----------------C-G--------T---CGC-GTG-TC-CT--T-AC--GATT---T-TT----T-T--T-A-G---C--C-GAT---AGA-T--A---A-A-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----GCATT
gi|52485                      :   TTTCTT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TC---A-T-GC--GAC---------T---------T-----------------CGGAGT--T-CC-T---AA----TCATT
gi|52486                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-AA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GTCCACAGATATTAATTGTGGGTC-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CAT-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TT---A-A-AA--AAA---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52487                      :   TTCATT-TT-ATG-TA-C----GG-A-AT-T-----GTT-AATG---T-----T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A----A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CAT------C-CT--C-AC--AA-----T-TC----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--A-C
gi|52488                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AGTG-G-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AAA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-TA--AA----TCA
gi|52489                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AG-----C-TTTTAAT-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TCA--A-T-GT--GGC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52490                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---C-AATGTCAATGAGCC-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-----A-GA-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-CTT-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52491                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--ATTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G------------------------T----------------A-G------------------------T--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-C-G---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TA---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCA
gi|52492                      :   TTTCTT-GT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GTC-TATG-A-TAG---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-TTGA-AGC--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-GA-AT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-CGGT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52493                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-TA---T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G-----------------T---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52494                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-T--A-T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------T-------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52495                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-AT-TCATT-GTC-AA--------------------------------C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACA--TTTTT---GC--G--AA-C-----C-----------------G-T-TG-----------------TT------------------G----------------GT---------------------T-----------------A--------C-----A---------T----------------A-T--------A---TTC-GT---C-CT--T-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--AC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----
gi|52496                      :   TTTATT-TT-ATC-TAAC----GG-A-GTGT-----GTT-TCTG-G-T-G---T-A------------T-A-CGC-AC-G-G-T--A-A-T--A--CGACA--TTTTTT--GC--G--GA-C--G--C-----------------AAT-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------CC----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AGAT---T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGAGG--A---G-C-A-----AGATTC---A-T-GTTCGAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-----AA----TCATT
gi|52497                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----AG-A-GT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-T------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGGCA--TTT-------------A-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TGTAGTA-G---------C--AA-----T-TT----T-T--T-T-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--TAC---------T-------------------------------ATTAG-CC-T---A
gi|52498                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-TTTTAAG-A-GT-------GTC-AATT-A---G---T-G------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---AC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---CG----G-GA-GT--C-AC--AC-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----TA--TT---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AC----TTATT
gi|52499                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AAGG-A-T-G---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGCCA--TTTTG---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-T---C--T-GAT----GA-G--A-----C-A-----AA--TC---A-C-GG--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52500                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-------GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GCTA-G-T-AA-A-T--C--CGACAC-TTTTT---GTT-G--GA-CACG--C-----------------A-T-TG-----------------TGCGGTCCGTAAATAGTGTGG----------------GT---------------------C--------------------------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-ACCAAA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GA----AGA-G--A---G-CAA-----AA--TCA--A-C-GA--AAC---------T---------T--------A--------C---GT--G-CCAT---AA----TCATT
gi|52501                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52502                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52503                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----GGGA-AT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA---TTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------------------------G--------A-----A--------------------------A-A--------C---CTT-G-G-AA-TT--CAAC--AGC----T-TT----T-T--CAA-G---C--T-GAT---AG--G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52504                      :   TTTATT-GT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--GGACA--ATTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-C-G-G-GA-GT--C-AC--AA-----T-AT----T-T--C-A-A---T--G-AAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CG-T---AA----TCATT
gi|52505                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52506                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52507                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GA----C-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-A--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------------------------------T-TT--C-AT--TA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---GAA-T--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC----------------------------A--------C---ATGAG-TG-T---AA----TCGTT
gi|52508                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT----TA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-AGG-T-G--A-T-----CGACA--T-----------------------C-----------------A-TGTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----AT--------T----------------T-G--------TTTGCGC-GTG-GT-CTTCT-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-AGT-C--T-GATAG-AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---ATT-GT--GAC---------T---------T--------A--------
gi|52509                      :   TTTATT-TT-ATT-GA-C----GT-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-G-C-GC-A-A-T-TA-A-T--A--CTGCA--TTTTT---GC--G--TA-T--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GG---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TG
gi|52510                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----ACC-AATG-A-A-A---T-T------------T-A-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--TGACA--TTTTT---TTCAA--GA-A--G--C-----------------A-T-TA-----------------TG------------------G----------------A----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-----T-TT----T-T----A-G---C--T-GA------A-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TA-C---AA----TCATT
gi|52511                      :   TTTCTT-TT---T-TA-C----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-G-T-C---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G-----------------------------------------------------------------------------AA-----A-CT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TA---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52512                      :   TTTATT-CT-ATA-TA-C----GG-G-GA-T-----GCC-AGTG-A-A-G-----A------------T-A-C-C-GC-A-T-T-GA-C-G--A--CGACA--TTTGT---CC--A--GA-A--G--C-----------------A-C-TA-----------------TG------------------G----------------G-----------------------------------------------------------------T----------------A-A--------T---C----------CT--C------------T-TT----T-T--T-A-G---G--T-GAT-------G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----ACATT
gi|52513                      :   TTTATT-TTTATT-TA-C----G--A-GT-T-----GTT-AATG-AAG-G---T-A------------T-AGC-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--AGACACTTTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------G
gi|52514                      :    TTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--------------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GGGCT--C-AC--A--------TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52515                      :   TTT-TT-TT-ATA-TA-C----GA-A-AT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-T-G-T-GA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--CTATGTGGGTTCGTAGATA-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AAT---AGA-G--A---G-T-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------G---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52516                      : ttaTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-TCAGTTGTC-AATG-C-T-G---T-G------------T-A-C-T-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--A--CA-C--A--C-----------------T-T-TT-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------A-G--------T---C----------------AA--AC-----T-TT----T-C--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-AAATTTAA--TC---A-T-GT--GAC---------
gi|52517                      :    TTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GA---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52518                      :    TCATT-TT-ATT--A-C----GG-A-ATAT-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-C-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--A--CGA-A--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-TCTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-A--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TA----C----C-A-AAAAC--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AC--AAC---------T---------T--------
gi|52519                      :     TATT-AT-ATT-TA-T----GA----T-T-----TTC-AGT--A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GATA-T--A--CGA----TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTA-GC-CT--C-AT--AA-----T-TT----TAT--C-A-G---C--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--T--------AT--GA----------T---------T--------AC-------C---AT--A-CC-T---A
gi|52520                      :     TATTATT-ATT-AA-C----A--A-TT-T-----GTCTAATG-A-T-G---TTG------------T-A-C-C-GC-A-GATAGA-A-G--G--CGTCA--TTTT----GC--TTTGA-CTAG--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-AA-AG--T-AC--AGC----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-
gi|52521                      :      ATT-TT-ATT-TATC----AT-A-GA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AT--AAC---------T---------T---------------------------CC-T---TA----TCATT
gi|52522                      :      ATT-TT-ATT-TA-C----GA----T-T-----G---AAT--A-T-----T-A------------T-A-C-C-CA-A-G-T-GA-A-T--C--C-ACA--TTTGCAGCGC--A--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------TC---------------------C-----------------G--------T-----AATATTTGCTTCGGAAAAA--------A-G--------TG--CGC-GTG-G--CT--C-AC--AA-----T-TT---------C-A-G---C--T-GAT---AGA-GCAG---G-C-A-----AA--TC---A-C--T--GACTTAAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-CCTGAA----TCATT
gi|52523                      :       TT-TT-ATT-TA-C----GG---GT-G-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-ATG-TTGA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--G--C--GC-C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CT----------------G--------T-----A---------TATTTTTAGGTGGCAAAA-G--------T---CGC-GTG-GA-CT----AC--AT-----T-TT----T-TAAT-A-G---C--TGGAT---AGG-G--AAG-G-C-A-----AA---C---A-C-GTTGGATAAAAAA---T---------T--------A--------C---AT--G--C-T---AA----TCATT
gi|52524                      :        T-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GAT-AATGTA-T-G-----A------------T-A-C-C-GC-A---T-GA-A-T--AGCCGACA--TTTTT---GC--G--GA-CT-G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------GTCTGTAGATATTTTAGGT---------------------G-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG--A-CT--C-AC--A--------TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---GGA-G--A---G-CAA-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAA-T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52525                      :            -ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--T--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52526                      :                           -A-GT-T-----TTT-AATG-G-T-GATTT-G------------T-A-C-CCGC-A-G-C-GA-A-CAGG--CGACA--TTTTT---GC--G--GAGC--GGAC-----------------A-T-TGCT---------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------GAAACCCAAC-----A---------A----------------A-GAAAAAACTT---C-----G-GA-GT--C-AC--AGGGTTTT-TT----T-T--C-A-G---A--T-GAT---TGG-G--A---G-C-A-----AAGTTC---A-C-GT--G
gi|52527                      :                               T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GC-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------CT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GT-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------T---------TAAAAAATCA--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52528                      :                                  -----GTC-AATT-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-A--G--CCACA--TTTTT---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G----------------------------------------------------T---C----------CT--C-AT--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AA-----------------C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----TCACT
gi|52529                      :                                                                        -A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TC---A-C--T--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52530                      :                                                                                                     ACA--TTTT----GC--G--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CTGTAGATATTTTAGGTGG--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---GCC-A-----AAC-CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAAAT--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52531                      :                                                                                                        --TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-A-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CTT-GTG-GC-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T---C---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------T---GT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52532                      :                                                                                                            TTT---GC--A--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GC---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT-GTG-AT-CT--C-AC---------T-TT----C-T--C-G-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TT-T---GA----TCATT
gi|52533                      :                                                                                                                                                                                                                 T---------------------C-----------------A--------C-----A---------C------------------G--------T---CAC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----TGTT----T-T--C-A-A--------GATCGAAGA-G--ACAGG-C-A-----AA--TA---A-CTGT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AAAACCTCATT
gi|52534                      :                                                                                                                                                                                                                                                          --------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---CGTT-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CA---G-C-GT--GAC---------T---------T--------AAAAAATCGC---AT--GCCC-T---AA----TCATT
gi|52535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG-GT-TT--C-CC--AA-----T-TT---------C-ACG---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TT---G-C-GT--GAC---------T---------T--------G------------AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cacaatcggttt-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAT---------T---------T--------C--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT


blockSeqs                     :                   A TTTA    A  G CAGTT              ATT AATGTCAATGAGC  A     A    G   T    TAGC        CT     AGC  CA       AC GA TATGTGGGTTCGTAGAT   A  TGGGTCCGTAGATATTG  CGGTCCGTAAATAGTGTG TCTGTAGATATTTTAG  CCACAGATATTAATTGTGGGTCGCAA                                                        A AAAAAACT TTGCGCG   A GGC          GGGTTT    TTAA      A   AAA        CGA        CAG   T AATTT  AT  AAA   G  TC   TTAAAAAAATTA                          GGA  TA      CTG  AACC
blockSeqs                     :                   T .       A  A CATT               .   TG             A     A    T   G    CAGG        C      T    T        TA C  .                   G  TGGGTCCGTAGATATTG  .                  TCGGTAGATATT      CTGCAGATATTGTGTTTCGTAA                                                            A .        TGTAG     A CC           ATT       .         A   GT         AG         AG    A .      GT  AAA   T  TG   TTAAAAAAATTA                          .    GA      A    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     C    .   G    GCG         .      .    .        T  .  .                   C  CT                 .                  .                 CCGTAGATATTGTGCTCGAAAA                                                            . .        GCGCG     . CC           GAT       .         A   .          .          .     A .      C   A     .  .    TTAAAAAAAATA                          .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   A    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CCGTAGATATTGTGCTCGAAAA                                                            . .        TGCG      . CC           GC        .         A   .          .          .     . .      .   A     .  .    TTGAAAAATTA                           .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   T    TT          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGTAATATTTGCTTCGGAAAAA                                                            . .        CGCG      . CC           GC        .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTAAAAAATTA                           .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CTGTATATTTTTAGGTGGCAAA                                                            . .        CGCA      . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTAAAAAAATA                           .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CTGTAGATATTTTAGGTGGCAA                                                            . .        CGCG      . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTAAAAAATCA                           .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAAACCCAACAA                                                                     . .        CGCG      . GT           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTAAAAAATCG                           .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TT          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 GGCTAGAAA                                                                         . .        CGCG      . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    AAAAAATTA                             .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCATCT                                                                           . .        CGCG      . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTGAATA                               .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCCAT                                                                            . .        CGCA      . GT           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTAC                                  .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGTCGA                                                                            . .        CGCG      . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGTCGA                                                                            . .        CGCG      . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCATT                                                                            . .        CATG      . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        GGAG      . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        GGAG      . AG           G         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CACAT                                                                             . .        TTCG      . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        TGCG      . AA           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGCAT                                                                             . .        CGCG      . AA           G         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTG                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGCAA                                                                             . .        CTTG      . CC           G         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CGCG      . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGCAA                                                                             . .        CGCG      . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    ATA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CGCA      . CC           G         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    ATA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   T              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAAA                                                                             . .        CGCG      . AG           C         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    ATA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGTAC                                                                             . .        CGCG      . AG           C         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTG                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGTAC                                                                             . .        CGCG      . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TACAT                                                                             . .        CGCG      . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CGCG      . AG           C         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CGCG      . AT           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TCA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAA                                                                             . .        TGCG      . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TCA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CGCG      . AC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAAA                                                                             . .        CTTG      . AC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    GTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 GGAAA                                                                             . .        CGTG      . TT           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        CACG      . TC           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAAA                                                                             . .        CGCG      . GC           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTG                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   T              .     .    .   .    GA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGCAT                                                                             . .        CGT       . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGCAT                                                                             . .        ACT       . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTA                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 TGCAT                                                                             . .        CAT       . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTG                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CACAC                                                                             . .        ACT       . AA           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTG                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        CCG       . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TTC                                   .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CAAA                                                                              . .        ACT       . AC           C         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        TG        . AC           G         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        CT        . GC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        CG        . AG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TC                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    GG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        TG        . TC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        CT        . CG           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CCAA                                                                              . .        C         . AC           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TC                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        C         . CA           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    TC          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        C         . TC           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    TT                                    .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   G              .     .    .   .    AG          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        C         . CC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    T                                     .    .       .    .   
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    TA          .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGAA                                                                              . .        C         . AC           A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    A                                     .    .       .        
blockSeqs                     :                   . .       .  . .                  .   A              .     .    .   .    T           .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CGT                                                                               . .        .         . TT           T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    .                                     .    .       .        
blockSeqs                     :                             .  . .                  .   .              .     .    .   .    A           .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 GAA                                                                               . .        .         . C            A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    .                                     .    .                
blockSeqs                     :                                . .                  .   .              .     .    .   .    T           .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CAT                                                                               . .        .         . C            A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    .                                     .    .                
blockSeqs                     :                                  .                  .   .              .     .    .   .    T           .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CAT                                                                               . .        .         . C            T         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .    .                                                           
blockSeqs                     :                                                                        .     .    .   .    T           .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CG                                                                                . .        .         . .            A         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                        .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 CG                                                                                . .        .         . .            .         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                        .      .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 T                                                                                 . .        .         . .            .         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                               .    .        .  .  .                   .  .                  .                  .                 .                                                                                 . .        .         . .            .         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    . .                  . .            .         .         .   .          .          .     . .      .   .     .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .         .   .          .                                                                                                       


blockSeqCons                  :   
originalCons                  :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
finalCons                     :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                          11111111111111111                                       333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                    1111111111111111111111111111111111111                            
lowQualScore                  :         0  0   0  1 1111  0 1  1 33333   0    0 0 0 111 33333333333333 1 0 0 2  0 1 0 3  0 8888888     11     111  11 00  0 22 11 44444444444444444 0 2  00000000000000000  444444444444444444 7777777777777777  777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 22222222 66666666  1 444 00 0  00 444444 0  1111 0 00 2 0 222 00 0   222   0 00 222 0 2 11111  22  333 0 1  11   9999999999999999999999999999999999999 111  22 0  0 222  1111     
lowQualScore                  :         .  .   .  . ....  . .  . .....   .    . . . ... .............. . . . .  . . . .  . .......     ..     ...  .. ..  . .. .. ................. . .  .................  .................. ................  ................................................................................. . ........ ........  . ... .. .  .. ...... .  .... . .. . . ... .. .   ...   . .. ... . . .....  ..  ... . .  ..   ..................................... ...  .. .  . ...  ....     
lowQualScore                  :         8  8   8  5 6666  7 5  5 33333   7    7 7 7 222 88888888888888 4 7 7 1  7 4 7 5  7 3333333     66     888  66 99  7 55 66 77777777777777777 7 0  22222222222222222  999999999999999999 8888888888888888  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 44444444 00000000  3 666 99 7  99 888888 6  4444 6 99 6 6 000 99 6   000   6 99 000 7 0 66666  55  666 7 3  88   0000000000000000000000000000000000000 333  00 7  8 111  7777     
consensus                     :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
Reference ( family-352 )      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GN-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52473                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACG--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-GG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52474                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-T---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GC--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52475                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-T-C-AC-A-G-T-GA-A-T--T--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-TT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52476                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--AA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT------C-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AT----TCAT
gi|52477                      :   TTTATT-TA-ATTATA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--G--TTACA--TTTAT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52478                      :   TTTATT-TT-ATC-TT-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------CT----------------G--------CAGAT-A---------TTGTGTTTCGTAA----A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52479                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-GATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--T--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-A-A-----AA--TC---A-G-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TCACT
gi|52480                      :   TCTATC-TT-ATT-TA-C----TG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-A---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAT---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52481                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-AT-T-----GTT-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TT-----------------TG------------------G----------------GC---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------G-G--------T---CGC-GTG-AC-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---T--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC---------TTGAA-----T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----TCATT
gi|52482                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GT-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-G--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-ATG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--A-G-G---C--T-GAT----------A---G-C-A-----AA--TT---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------T---AT--G-
gi|52483                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T-----CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-TATG-----------------TG------------------GTCGGTAGATATT----GT---------------------G-----------------G--------CTAGA-A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTA-GG-TT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GACTTGAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52484                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---A-A------------T-G-C-C-AC-A-G-T-GA-A-T--A--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----ATC-------T----------------C-G--------T---CGC-GTG-TC-CT--T-AC--GATT---T-TT----T-T--T-A-G---C--C-GAT---AGA-T--A---A-A-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-C---AA----GCATT
gi|52485                      :   TTTCTT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TC---A-T-GC--GAC---------T---------T-----------------CGGAGT--T-CC-T---AA----TCATT
gi|52486                      :   TCTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-AA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GTCCACAGATATTAATTGTGGGTC-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CAT-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TT---A-A-AA--AAA---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52487                      :   TTCATT-TT-ATG-TA-C----GG-A-AT-T-----GTT-AATG---T-----T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-AA-A----A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------TT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CAT------C-CT--C-AC--AA-----T-TC----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--A-C
gi|52488                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-AGTG-G-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------A--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AAA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-TA--AA----TCA
gi|52489                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------CG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AG-----C-TTTTAAT-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TCA--A-T-GT--GGC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52490                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-GT-T-----GTC-AATG-A-T-G---C-AATGTCAATGAGCC-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--G--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-----A-GA-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-CTT-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52491                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--ATTTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G------------------------T----------------A-G------------------------T--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-C-G---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TA---A-C-GT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AA----TCA
gi|52492                      :   TTTCTT-GT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GTC-TATG-A-TAG---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-TTGA-AGC--G--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-GA-AT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-CGGT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52493                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-TA---T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G-----------------T---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52494                      :   TTTATT-TT-ATT-CA-C----GG-A-GT-T-----GTT-CATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GG-A-G-T-T--A-T--A--CAACA--TATTT---GC--G--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------T-------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------T-----A---------C----------------A-G--------T---GGA-GCG-GC-CT--C-GT--AC-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT----GA-G--A---G-G-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC---------A---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---AA----TTATT
gi|52495                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-AT-TCATT-GTC-AA--------------------------------C-GC-A-G-T-GA-A-T--A--TGACA--TTTTT---GC--G--AA-C-----C-----------------G-T-TG-----------------TT------------------G----------------GT---------------------T-----------------A--------C-----A---------T----------------A-T--------A---TTC-GT---C-CT--T-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--AC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----
gi|52496                      :   TTTATT-TT-ATC-TAAC----GG-A-GTGT-----GTT-TCTG-G-T-G---T-A------------T-A-CGC-AC-G-G-T--A-A-T--A--CGACA--TTTTTT--GC--G--GA-C--G--C-----------------AAT-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------CC----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-CT--C-AC--AGAT---T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGAGG--A---G-C-A-----AGATTC---A-T-GTTCGAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-----AA----TCATT
gi|52497                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-T----AG-A-GT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-T------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGGCA--TTT-------------A-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TGTAGTA-G---------C--AA-----T-TT----T-T--T-T-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--TAC---------T-------------------------------ATTAG-CC-T---A
gi|52498                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-TTTTAAG-A-GT-------GTC-AATT-A---G---T-G------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--TTTTT---AC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---CG----G-GA-GT--C-AC--AC-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----TA--TT---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CC-T---AC----TTATT
gi|52499                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTC-AAGG-A-T-G---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGCCA--TTTTG---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---TG----G-GA-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-T---C--T-GAT----GA-G--A-----C-A-----AA--TC---A-C-GG--GAC---------T---------C---------------------------CC-T---AA----TCATT
gi|52500                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-------GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GCTA-G-T-AA-A-T--C--CGACAC-TTTTT---GTT-G--GA-CACG--C-----------------A-T-TG-----------------TGCGGTCCGTAAATAGTGTGG----------------GT---------------------C--------------------------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-ACCAAA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GA----AGA-G--A---G-CAA-----AA--TCA--A-C-GA--AAC---------T---------T--------A--------C---GT--G-CCAT---AA----TCATT
gi|52501                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52502                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----AA-AAGA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--TA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------C----------------GC---------------------C-----------------GT-------C-----G---------A----------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---CAAAA-C-AT--AAC---------T---------T--------
gi|52503                      :   TTTTTT-TT-ATT-TA-C----GGGA-AT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA---TTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------------------------G--------A-----A--------------------------A-A--------C---CTT-G-G-AA-TT--CAAC--AGC----T-TT----T-T--CAA-G---C--T-GAT---AG--G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52504                      :   TTTATT-GT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GAC-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--GGACA--ATTTT---GC--A--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-C--------T---C-C-G-G-GA-GT--C-AC--AA-----T-AT----T-T--C-A-A---T--G-AAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-AT--GAC---------T---------T---------------------------CG-T---AA----TCATT
gi|52505                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52506                      :   TTCATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-TT-T-----GTA-ATTG-A-T-G---T-G------------TAA-C-CAGC-A-G-TGGA-A-T-----CCACA--TTTTT---GC--T--GA-C--G--C-------------------T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CCGTAGATATTGT-----G--------CTCGAAA---------A----------------A-G--------T---CGC-GTGAGA-CT--C-AC--TT-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GACTTAAAAAAAT---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCA
gi|52507                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GA----C-T-----GTC-AATA-A-T-G---T-A------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GT--G--GA-A--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------------------------------T-TT--C-AT--TA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---GAA-T--A---G-C-A-----AA--TC---A-T-GT--GAC----------------------------A--------C---ATGAG-TG-T---AA----TCGTT
gi|52508                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-T-----GT----TA-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-AGG-T-G--A-T-----CGACA--T-----------------------C-----------------A-TGTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----AT--------T----------------T-G--------TTTGCGC-GTG-GT-CTTCT-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-AGT-C--T-GATAG-AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---ATT-GT--GAC---------T---------T--------A--------
gi|52509                      :   TTTATT-TT-ATT-GA-C----GT-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-G-C-GC-A-A-T-TA-A-T--A--CTGCA--TTTTT---GC--G--TA-T--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------A----------------GG---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TG
gi|52510                      :   TTTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----ACC-AATG-A-A-A---T-T------------T-A-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--TGACA--TTTTT---TTCAA--GA-A--G--C-----------------A-T-TA-----------------TG------------------G----------------A----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-----T-TT----T-T----A-G---C--T-GA------A-A--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TA-C---AA----TCATT
gi|52511                      :   TTTCTT-TT---T-TA-C----GG-A-TT-T-----GTC-AATG-G-T-C---T-G------------T-A-T-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G-----------------------------------------------------------------------------AA-----A-CT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AG--TA---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52512                      :   TTTATT-CT-ATA-TA-C----GG-G-GA-T-----GCC-AGTG-A-A-G-----A------------T-A-C-C-GC-A-T-T-GA-C-G--A--CGACA--TTTGT---CC--A--GA-A--G--C-----------------A-C-TA-----------------TG------------------G----------------G-----------------------------------------------------------------T----------------A-A--------T---C----------CT--C------------T-TT----T-T--T-A-G---G--T-GAT-------G--A---G-C-A-----CA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------C--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----ACATT
gi|52513                      :   TTTATT-TTTATT-TA-C----G--A-GT-T-----GTT-AATG-AAG-G---T-A------------T-AGC-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--AGACACTTTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------G
gi|52514                      :    TTATT-TT-ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T--------------T-A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--------------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-ATG-GGGCT--C-AC--A--------TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52515                      :   TTT-TT-TT-ATA-TA-C----GA-A-AT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-T-G-T-GA-A-T--C--TGACA--TTTTT---GC--G--GA-C--G--CTATGTGGGTTCGTAGATA-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AAT---AGA-G--A---G-T-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------G---------T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52516                      : ttaTTATT-TT-ATT-TA-C----AG-A-GT-TCAGTTGTC-AATG-C-T-G---T-G------------T-A-C-T-AC-A-G-T-GA-A-G--G--CAACA--TTTTT---GC--A--CA-C--A--C-----------------T-T-TT-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C--------------------------------A---------T----------------A-G--------T---C----------------AA--AC-----T-TT----T-C--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-AAATTTAA--TC---A-T-GT--GAC---------
gi|52517                      :    TTATT-TT-ATT-TA-T----GG-A-TT-T-----GTC-TATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-G--G--CGACA--T--------------------G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GA---------------------C-----------------G--------A-----A------------------------------------------AC-TTG-GA-GT--C-AC--AG-----C-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AG--TC---A-C-GT--GAC------------------------------------------T--A-CC-T---AA----TCATT
gi|52518                      :    TCATT-TT-ATT--A-C----GG-A-ATAT-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-C-T-C-GC-G-G-T-GA-A-G--A--CGA-A--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-TCTG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-A--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TA----C----C-A-AAAAC--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AC--AAC---------T---------T--------
gi|52519                      :     TATT-AT-ATT-TA-T----GA----T-T-----TTC-AGT--A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GATA-T--A--CGA----TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTA-GC-CT--C-AT--AA-----T-TT----TAT--C-A-G---C--G-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--T--------AT--GA----------T---------T--------AC-------C---AT--A-CC-T---A
gi|52520                      :     TATTATT-ATT-AA-C----A--A-TT-T-----GTCTAATG-A-T-G---TTG------------T-A-C-C-GC-A-GATAGA-A-G--G--CGTCA--TTTT----GC--TTTGA-CTAG--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A----------------C-TTG-AA-AG--T-AC--AGC----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-
gi|52521                      :      ATT-TT-ATT-TATC----AT-A-GA-T-----GTC-AATG-A-T-A---A-G------------T-A-C-C-GC-G-G-T-GA-A-G--G--CGAGA--TATTT---GC--G--GA-T--G--C-----------------A-T-CG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------A-----A--------------------------A-G--------T--------TG-GA-GT--A-AC--AA-----T-TT----C-C--C-A-A---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA---C---A-C-AT--AAC---------T---------T---------------------------CC-T---TA----TCATT
gi|52522                      :      ATT-TT-ATT-TA-C----GA----T-T-----G---AAT--A-T-----T-A------------T-A-C-C-CA-A-G-T-GA-A-T--C--C-ACA--TTTGCAGCGC--A--AA-C--G--C-----------------A-T-TG-----------------TA------------------G----------------TC---------------------C-----------------G--------T-----AATATTTGCTTCGGAAAAA--------A-G--------TG--CGC-GTG-G--CT--C-AC--AA-----T-TT---------C-A-G---C--T-GAT---AGA-GCAG---G-C-A-----AA--TC---A-C--T--GACTTAAAAAA-T---------T--------A--------C---AT--G-CC-CCTGAA----TCATT
gi|52523                      :       TT-TT-ATT-TA-C----GG---GT-G-----GTT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-ATG-TTGA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--G--G--C--GC-C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CT----------------G--------T-----A---------TATTTTTAGGTGGCAAAA-G--------T---CGC-GTG-GA-CT----AC--AT-----T-TT----T-TAAT-A-G---C--TGGAT---AGG-G--AAG-G-C-A-----AA---C---A-C-GTTGGATAAAAAA---T---------T--------A--------C---AT--G--C-T---AA----TCATT
gi|52524                      :        T-TT-ATT-TA-C----GG-A--T-T-----GAT-AATGTA-T-G-----A------------T-A-C-C-GC-A---T-GA-A-T--AGCCGACA--TTTTT---GC--G--GA-CT-G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------GTCTGTAGATATTTTAGGT---------------------G-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG--A-CT--C-AC--A--------TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---GGA-G--A---G-CAA-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAA-T--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52525                      :            -ATT-TA-C----GG-A-GT-T-----GTT-AATG-A-T-G---T-G------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GC--T--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGC-GTG-GG-CT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52526                      :                           -A-GT-T-----TTT-AATG-G-T-GATTT-G------------T-A-C-CCGC-A-G-C-GA-A-CAGG--CGACA--TTTTT---GC--G--GAGC--GGAC-----------------A-T-TGCT---------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------GAAACCCAAC-----A---------A----------------A-GAAAAAACTT---C-----G-GA-GT--C-AC--AGGGTTTT-TT----T-T--C-A-G---A--T-GAT---TGG-G--A---G-C-A-----AAGTTC---A-C-GT--G
gi|52527                      :                               T-T-----GGT-AATG-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-GC-A-G-T-GA-A-T--C--CGACA--TTTTT---GT--G--GC-C--G--C-----------------A-T-TGTGGGTCCGTAGATATTGTG------------------G----------------CT---------------------C-----------------G--------A-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GT-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CC---A-C-GT--GAC---------T---------TAAAAAATCA--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52528                      :                                  -----GTC-AATT-A-T-G---T-A------------T-A-C-C-AC-A-G-T-GA-A-A--G--CCACA--TTTTT---GC--A--GA-C--A--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------AT---------------------C-----------------G----------------------------------------------------T---C----------CT--C-AT--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-AA-----------------C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TG-T---AA----TCACT
gi|52529                      :                                                                        -A-C-T-GC-A-G-T-GA-A-T--A--CGACA--TTTTT---GC--A--GA-T--G--C-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---TGC-GTG-GC-GT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--TAA-G---C--T-GAT---AGA-G--A---A-C-A-----AA--TC---A-C--T--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52530                      :                                                                                                     ACA--TTTT----GC--G--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------CTGTAGATATTTTAGGTGG--------C-----A---------A----------------AAG--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---GCC-A-----AAC-CC---A-C-GT--GAC---------TTAAAAAAAAT--------A--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT
gi|52531                      :                                                                                                        --TTTTT---GC--G--GA-C--G--C-----------------A-A-TG-----------------TG------------------G----------------GT---------------------C-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CTT-GTG-GC-AT--C-AC--AA-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T---C---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-AT--GAC---------T---------T--------A--------T---GT--G-TC-T---AA----TCATT
gi|52532                      :                                                                                                            TTT---GC--A--GA-C--G--T-----------------A-T-TG-----------------TG------------------G----------------GC---------------------T-----------------G--------C-----A---------T----------------A-G--------T---CGT-GTG-AT-CT--C-AC---------T-TT----C-T--C-G-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAC---------T---------T--------A--------C---AT--G-TT-T---GA----TCATT
gi|52533                      :                                                                                                                                                                                                                 T---------------------C-----------------A--------C-----A---------C------------------G--------T---CAC-GTG-GC-CT--C-AC--AA-----TGTT----T-T--C-A-A--------GATCGAAGA-G--ACAGG-C-A-----AA--TA---A-CTGT--GAC---------T---------T--------G--------C---AT--G-TC-T---AAAACCTCATT
gi|52534                      :                                                                                                                                                                                                                                                          --------C-----A---------A----------------A-G--------T---CGC-GTG-GA-CT--C-AC--AT-----T-TT----T-T--T-A-G---CGTT-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--CA---G-C-GT--GAC---------T---------T--------AAAAAATCGC---AT--GCCC-T---AA----TCATT
gi|52535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG-GT-TT--C-CC--AA-----T-TT---------C-ACG---C--T-GTT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TT---G-C-GT--GAC---------T---------T--------G------------AT--G-TC-T---TA----TCATT
gi|52536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cacaatcggttt-----T-TT----T-T--C-A-G---C--T-GAT---AGA-G--A---G-C-A-----AA--TC---A-C-GT--GAT---------T---------T--------C--------C---AT--G-CC-T---AA----TCATT