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lowQualScore : . . .. .... .. . ......... .. .... .... ... .... .. . . . . . . . . .. . .... . . ..... .... ......... .... .. ...... ..
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Reference ( gi|28954 ) : ACAGAGAGAC-A--G----ACA--G-A----T----GGA--C----A----G---GC----C--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28955 : ACGGACATAC-A--G----ACA--G-A----C----GGA--C----A----A---GC----C--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|28956 : ACAGACCCAC-A--G----ACA--G-A----C----GGA--C----A----G---GC----C--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--A-C-C-AA-----AG----TGGGGG----G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28957 : ACGGACACAC-G--G----ACC--C-A----C----GGA--C----G----G---GC----C--AA-AA-A-CA-A-A-ATG-T-CT--CCC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28961 : ACGGACAGAC-A--G----AC---G-A----C----GGATAC----G----G---GC----A--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T--T--CTC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------AG--AATATAA
gi|28960 : ACGGACAGACCG--G----ACA--G-A----C----AGA--CC---A----G---GC----A--AT-AA-A-CA-T-T-AT--T-CT--CCC-CC-A-C-C-AT-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28964 : ACAGACAGAC-G--G----ACA--G-A----T----GGA--C----ACAAAG---TA----C--AA-AA-A-CA-G-T-GTG-T-CT--CCC-C----C-T-GG-----AG--------------G----A--GGG------GA--GACATA
gi|28962 : ACAGACAGAC-G--G----ACACAG-A----CCCAGGGG--C----A----G---AC----C--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--A-C-T-AATTATGAG----T---------G----G--G
gi|28987 : ACAGACAGAT-A--G----ACC--C-A----C----AGA--C----A----G---AC----C--AA-AA-A--A-A-T-ATG-C-CT--CCC-C--A-C-A-AA-----AG----T---------GTTTTG--GGG------GG--G
gi|28967 : gACAGACAGAC-G--G----CCA--G-A----T----GGA--C----A----GAAAGTA---C--GA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACACAA
gi|28984 : ACAGATAGAC-A--G----ACG--G------T----GGA--CT---A--------------C--AA-AG-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28971 : tgACGGACAAAC-A--G----ACA--G-A----C----GGA--C----A----G---AC----C--AA-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CC--CCG-A--A-T-C-GA-----AGATTCC---------G----G--GGG------------CATAA
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gi|28986 : tGACAGAC-G--A----ACC--C-A----C----TGA--C----A----G---GC----C--AA-AA-A-CA-A-T-TTG-T-CT--CCC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
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gi|28982 : tGACAGAC-A--G----CCA--G-A----T----GGA--C----A----GAAAGTA---C--AA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28965 : tGACAGAC-A--G----ACA--G-A----T----GGA--C----A----G---GG----C--AA-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CC--CCC-A--A-T-C-AA-----AG----
gi|28985 : attGACAGAC-A--G----ACA--G-A----T----GGA--C----A----G---ACAGTAT--AA-AA-T-CA-A-T-ATG-T-CT--CCC-C--C-T-G-AA-----A---------------G----A--AGG------GA--GACCTAA
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gi|28974 : GAC-G--GGA--ACA--GCA----C----GAG--C----A----G---GT----TTTAA-AA-A-CA-A-T--TG-T-CT--CCCTC--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
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gi|28973 : aaacg--G----ACG--G-A----C----AGA--C----A----G---GC----C--GA-AA-A-CA-A-T---G-T-CT--CTC-C--A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGA------GA--GACACAA
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Reference ( family-351 ) : ACGGACAGAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28954 : ACAGAGAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28955 : ACGGACATAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|28956 : ACAGACCCAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----TGGGGG----G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28957 : ACGGACACAC---G-G----ACC--C-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-A-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
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gi|28959 : GAC---A-G----ACA--C-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-AA-C-A-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
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gi|28966 : att-G----ACA--G-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-------A-A-C-ATGAT-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--G
gi|28967 : actgacaaactttgtgactaACAGACAGAC---G-G----CCA--G-AT----GGA--C-A----GAAA-------GTA---C--G----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACACAA
gi|28968 : ACAGACAGAC---G-G----AAA--G-AC----GGC--C-A----GAAA-------GTA---C--A----A-AA-C-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28969 : ACAGACAAAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AA----TTCC------G----G--GG-------------CATAA
gi|28970 : ACGGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGAT--T---------C----C--GGG----------GACATAA
gi|28971 : ACGGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGATTCC---------G----G--GGG------------CATAA
gi|28972 : ACTGACAGGT---A-T----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-C----T-ATG-T-CCCC
gi|28973 : GACAAACTTTGTG----ACG--G-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--G----A-AA-A-CA-A-T---G-T-CTCTC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGA------GA--GACACAA
gi|28974 : ctGAC---G-GGA--ACA--GCAC----GAG--C-A----G----------GT----TTTA----A-AA-A-CA-A-T--TG-T-CTCCCTC-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28975 : ctgacaaaactgtGAC---G-G----ACC--C-ACC---GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-AACA-GCT-ATG-T-CTCCC-C-A-C-CAAA-----AG----T---------G----G--GCG------GG--AACATAA
gi|28976 : ctgacaacttgtt--G-AC----GGA--C-A----C----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATA-T-ATCCC-C-ACC-C-AA-----AG----G---------G----G--GGG------GG--
gi|28977 : ctgtcaaacatattACAGACAGAC---G-G----A------ACCCT-GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-G-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|28978 : tgGACACAT---G-G----ACC--C-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-T-A-C-T-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GT--GACATAA
gi|28979 : tAC---G-G----ACA--G-AC----G-A--C-A----AA---------GC----C--A----A-AAAA-CA-A-T-ATG-T-TCCCC-C-A-CGA-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28980 : tgacGACAGAC---A-G----ACG--G-AC----GGA--C-A----GAA--------GTA---C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C---C-T-GG-----A-----C---------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28981 : t---G-G----ACT--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-AACA-A-T-ACG-T-CTCCC-C-T-C-C-AA-----A-----T--------------G--GGG------GA--GACATAA
gi|28982 : tgaccgGACAGAC---A-G----CCA--G-AT----GGA--C-A----GAAA-------GTA---C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28983 : tGACGGAC---C-C----ACG--G-AC----AGA--C-A----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-----ATG-T-CTCCC-T-A-T-C-AA-----GG----G---------G----A--GGGGGAGGAGA--GACATAA
gi|28984 : tGACAGAT---A-G----ACA--G-AC----GG---T-G----G----------ACTA--C--A----A-AG-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28985 : tGACAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------ACAGTAT--A----A-AA-T-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-AA-----A---------------G----A--AGG------GA--GACCTAA
gi|28986 : tGACAGAC---G-A----ACC--C-AC----TGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-TTG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28987 : ACAGACAGAT---A-G----ACC--C-AC----AGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A--A-A-T-ATG-C-CTCCC-C-A-C-A-AA-----AG----T---------GTTTTG--GGG------GG--
gi|28988 : gGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGATTCT---------G----G--GGG------
gi|28989 : CGGAC---A-G----ACA--G-AG----AGA--T-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-TA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----TATGTGTGTGG----G--GGA------GG--GGCATAA
gi|28990 : CAGAC---A-G----ACG--G-AC----AAA--A-A----G----------TA----C--A----A-AA-A-CA-G-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-AA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28991 : CAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCA-A-A-T-C-AA-----AG----
gi|28992 : AAAC---GAG----ACA-----T----GGA--C-A----C----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-GCG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28993 : AGAT---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G-------------------A----G-AA-A--A-A-C-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------
gi|28994 : GAC---G-G----ACA--G-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--AAG------GA--GACATAA
gi|28995 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-A-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28996 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTGCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GAG------GA--GACATAA
gi|28997 : GAT---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-T-A-C-C-AT-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28998 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A---C-AA-----AG----T---------G----G--AGG------GA--GACATAA
gi|28999 : GAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-C-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--AGA------GA--GA
gi|29000 : GAC---G-G----ACC--C-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----T---------G----GAAGGG------GAGGGACAT
gi|29001 : GAC---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-T----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----
gi|29002 : GAC---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-T----G----------GC----C--A----AGAA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----
gi|29003 : GAC---G-G----ACA-----C----AAA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ACG-T-CTCCC-C-A-C-C-AT-----AG----T---------A----G--GGG------GA--GACATAA
gi|29004 : GAT---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----T---------G----
gi|29005 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--A-A----G----------GC----C--A----A-AA-A--A-A-T-ATG-T-TCCCC-C-A-C-C-AT-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|29006 : GAC---G-G----ACA--GCAC----GAA--A-G----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-G-G-T-CTCCC-C-A-C-C-AAG----AG----T---------G----G--GGA------GA--GACATAA
gi|29007 : GAC---G-G----ACC--C-AC----AGA--T-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-C--A-T-ATG-TGCTCCC-C-A-C-TAAA-----AG----T---------G----G--AAG------GA--GA
gi|29008 : ACGGACACAC---G-G----ACA--G-CC----AAAAAC-A----ATGATGTCTCCGC----C--ACAGAA-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A---C-AA-----AG----T---------G----A--GTG------GA--GACATAA
gi|29009 : gAC---G-A----ACA--G-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CT--C-C-A---C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATA
gi|29010 : C---G-G-----CA--G-ACA---GGA--C-A----T----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-G-CCTCC-C-A-C-C-AA-----AA----T---------G----G--GGG------GA--GACATGA
gi|29011 : C---G-G----GCC--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-----ATG-T-CTCCC-C-C-A-A-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GG--
gi|29012 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|29013 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----G--A----A-AA-A-CTTA-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-CA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--
gi|29014 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-----ATG-T-CTCTC-G-A-C-G-AA-----AA----TGGGG-----G----G--GGG------GG--GACATAA
gi|29015 : -AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTTCC-C-G-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATA
gi|29016 : C----AGG--C-A----G----------GC------------G-AC-A-CA-A-TTATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------T----G--GGG------AA--GACAT
gi|29017 : GA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-
gi|29018 : --C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-TA-A-T-ACG-T-CTCCT-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----A--GTG------GA--GACATAA
Alignments
lowQualScore : 0 222 1 2222 1111 5555 11 0 1111 7777777777 4444 00 1111 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 22222 3333 888888888 1111 00 222222 11
lowQualScore : . ... . .... .... .... .. . .... .......... .... .. .... . . . . . . . . . . . . . ..... .... ......... .... .. ...... ..
lowQualScore : 2 000 4 5555 6666 1111 77 6 3333 4444444444 6666 88 3333 6 6 2 6 6 6 6 6 6 6 6 6 2 22222 6666 777777777 4444 99 111111 00
consensus : ACGGACAGAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
Reference ( family-351 ) : ACGGACAGAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28954 : ACAGAGAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28955 : ACGGACATAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|28956 : ACAGACCCAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----TGGGGG----G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28957 : ACGGACACAC---G-G----ACC--C-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-A-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28958 : ACCGACACAT---G-G----ACC----AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-T-A-C-T-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GT--GACATAA
gi|28959 : GAC---A-G----ACA--C-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-AA-C-A-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28960 : actcatgACGGACAGACC--G-G----ACA--G-AC----AGA--CCA----G----------GC----A--A----T-AA-A-CA-T-T-AT--T-CTCCC-CCA-C-C-AT-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28961 : ACGGACAGAC---A-G----AC---G-AC----GGATAC-G----G----------GC----A--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T--TCTC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------AG--AATATAA
gi|28962 : ACAGACAGAC---G-G----ACACAG-ACCCAGGGG--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AATTATGAG----T---------G----G--G
gi|28963 : ACGGACAGAC---G-GTCACATA--G-ACACATGGA--C-A----G----------GT----C--A----A-AA---CA-A-T-ATG-T-CTTCC-C-A-C-G-AA-----AG----TGGCGGG---G----G--GGG------GG--GGCATAA
gi|28964 : ACAGACAGAC---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-ACAAAG----------TA----C--A----A-AA-A-CA-G-T-GTG-T-CTCCC-C---C-T-GG-----AG--------------G----A--GGG------GA--GACATA
gi|28965 : GACAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GG----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCC-A-A-T-C-AA-----AG----
gi|28966 : att-G----ACA--G-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-------A-A-C-ATGAT-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--G
gi|28967 : actgacaaactttgtgactaACAGACAGAC---G-G----CCA--G-AT----GGA--C-A----GAAA-------GTA---C--G----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACACAA
gi|28968 : ACAGACAGAC---G-G----AAA--G-AC----GGC--C-A----GAAA-------GTA---C--A----A-AA-C-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28969 : ACAGACAAAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AA----TTCC------G----G--GG-------------CATAA
gi|28970 : ACGGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGAT--T---------C----C--GGG----------GACATAA
gi|28971 : ACGGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGATTCC---------G----G--GGG------------CATAA
gi|28972 : ACTGACAGGT---A-T----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-C----T-ATG-T-CCCC
gi|28973 : GACAAACTTTGTG----ACG--G-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--G----A-AA-A-CA-A-T---G-T-CTCTC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGA------GA--GACACAA
gi|28974 : ctGAC---G-GGA--ACA--GCAC----GAG--C-A----G----------GT----TTTA----A-AA-A-CA-A-T--TG-T-CTCCCTC-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28975 : ctgacaaaactgtGAC---G-G----ACC--C-ACC---GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-AACA-GCT-ATG-T-CTCCC-C-A-C-CAAA-----AG----T---------G----G--GCG------GG--AACATAA
gi|28976 : ctgacaacttgtt--G-AC----GGA--C-A----C----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATA-T-ATCCC-C-ACC-C-AA-----AG----G---------G----G--GGG------GG--
gi|28977 : ctgtcaaacatattACAGACAGAC---G-G----A------ACCCT-GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-G-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------TA--GACATAA
gi|28978 : tgGACACAT---G-G----ACC--C-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-T-A-C-T-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GT--GACATAA
gi|28979 : tAC---G-G----ACA--G-AC----G-A--C-A----AA---------GC----C--A----A-AAAA-CA-A-T-ATG-T-TCCCC-C-A-CGA-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28980 : tgacGACAGAC---A-G----ACG--G-AC----GGA--C-A----GAA--------GTA---C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C---C-T-GG-----A-----C---------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28981 : t---G-G----ACT--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-AACA-A-T-ACG-T-CTCCC-C-T-C-C-AA-----A-----T--------------G--GGG------GA--GACATAA
gi|28982 : tgaccgGACAGAC---A-G----CCA--G-AT----GGA--C-A----GAAA-------GTA---C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28983 : tGACGGAC---C-C----ACG--G-AC----AGA--C-A----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-----ATG-T-CTCCC-T-A-T-C-AA-----GG----G---------G----A--GGGGGAGGAGA--GACATAA
gi|28984 : tGACAGAT---A-G----ACA--G-AC----GG---T-G----G----------ACTA--C--A----A-AG-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-GA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28985 : tGACAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------ACAGTAT--A----A-AA-T-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-AA-----A---------------G----A--AGG------GA--GACCTAA
gi|28986 : tGACAGAC---G-A----ACC--C-AC----TGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-TTG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28987 : ACAGACAGAT---A-G----ACC--C-AC----AGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A--A-A-T-ATG-C-CTCCC-C-A-C-A-AA-----AG----T---------GTTTTG--GGG------GG--
gi|28988 : gGACAAAC---A-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCG-A-A-T-C-GA-----AGATTCT---------G----G--GGG------
gi|28989 : CGGAC---A-G----ACA--G-AG----AGA--T-A----G----------AC----C--A----A-AA-A-TA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----TATGTGTGTGG----G--GGA------GG--GGCATAA
gi|28990 : CAGAC---A-G----ACG--G-AC----AAA--A-A----G----------TA----C--A----A-AA-A-CA-G-T-ATG-T-CTCCC-C-C-T-G-AA-----A---------------G----A--GGG------GA--GACATAA
gi|28991 : CAGAC---A-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CT-A-T-ATG-C-CCCCA-A-A-T-C-AA-----AG----
gi|28992 : AAAC---GAG----ACA-----T----GGA--C-A----C----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-GCG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28993 : AGAT---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G-------------------A----G-AA-A--A-A-C-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------
gi|28994 : GAC---G-G----ACA--G-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--AAG------GA--GACATAA
gi|28995 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-A-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28996 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTGCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GAG------GA--GACATAA
gi|28997 : GAT---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-T-A-C-C-AT-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|28998 : GAC---G-G----ACA--C-AC----GGA--C-G----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A---C-AA-----AG----T---------G----G--AGG------GA--GACATAA
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gi|29000 : GAC---G-G----ACC--C-AC----AGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----T---------G----GAAGGG------GAGGGACAT
gi|29001 : GAC---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-T----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----
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gi|29004 : GAT---G-G----ACA--G-AT----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-T-AA-----AG----T---------G----
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gi|29006 : GAC---G-G----ACA--GCAC----GAA--A-G----A----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-G-G-T-CTCCC-C-A-C-C-AAG----AG----T---------G----G--GGA------GA--GACATAA
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Reference ( family-351 ) : ACGGACAGAC---G-G----ACA--G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
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gi|29012 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATAA
gi|29013 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----G--A----A-AA-A-CTTA-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-CA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--
gi|29014 : --G-AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-----ATG-T-CTCTC-G-A-C-G-AA-----AA----TGGGG-----G----G--GGG------GG--GACATAA
gi|29015 : -AC----GGA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTTCC-C-G-C-C-AA-----AG----T---------G----G--GGG------GA--GACATA
gi|29016 : C----AGG--C-A----G----------GC------------G-AC-A-CA-A-TTATG-T-CTCCC-C-A-C-C-AA-----AG----T---------T----G--GGG------AA--GACAT
gi|29017 : GA--C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-CA-A-T-ATG-T-CTCCC-C-A-C-C-
gi|29018 : --C-A----G----------GC----C--A----A-AA-A-TA-A-T-ACG-T-CTCCT-C-A-C-C-AA-----AG----T---------G----A--GTG------GA--GACATAA