lowQualScore                  :            1111111         11111                                 22                                                111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111        
lowQualScore                  :        44  5555555  222    11111  333333 1 1 1 1   3333    1  1  11  22 22 666666 111 1 666 0 2222222 11 666666666 000000 111   333 11 0  0 999999999999 33 0 1  2 222  22 555555555555 111 2222 5555555 555555 1 666 33 4444 22 111  1111 222222 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00  1 111 0 11111 1 0 0   11 1111 0   0 0 2222 2 777777777777 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 11 111 22222222 33 0  0 33333 44444444 111 2222 33333 333333 0 1111  1 22   0 99999999999999999999999999 44 11   0  1  1 0 222 0 2222 0 0    
lowQualScore                  :        ..  .......  ...    .....  ...... . . . .   ....    .  .  ..  .. .. ...... ... . ... . ....... .. ......... ...... ...   ... .. .  . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . ..  . ... . ..... . . .   .. .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ .. .  . ..... ........ ... .... ..... ...... . ....  . ..   . .......................... .. ..   .  .  . . ... . .... . .    
lowQualScore                  :        77  2222222  333    44444  333333 1 1 1 1   2222    0  0  99  33 33 888888 777 0 777 8 7777777 11 777777777 555555 444   111 88 7  7 111111111111 22 7 5  2 000  44 444444444444 222 2222 6666666 222222 4 222 11 4444 44 222  5555 000000 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 4444 000 3 3 55 3333 99999  0000   6 99  9 777 6 66666 3 6 6   55 4444 7   7 7 1111 7 000000000000 222 999999 4 2222 4  7 444444444 00 99 222 55555555 88 7  7 22222 55555555 999 5555 44444 000000 7 5555  4 44   7 00000000000000000000000000 55 00   8  6  6 9 444 9 6666 9 9    
consensus                     :     TTTTTTT--A---GTT---ATAA-N---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGG-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
Reference ( gi|46480 )        :     TTTCCTT--A---ATT---ATAA-T---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGC-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GG-A-T---C-AT---C-C-TTAA
gi|46482                      :     TTTCCTT--A----------TAA-T---TA------A-T-T-A-ATT----ATCTAAT-GG--AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTATA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GG-A-T---C-ATC--C-C-TTAA
gi|46483                      : ttttTTTCCTT--A----------TAA-T---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGG-AA--AA-TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--G-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GG-A-T---C-AT---C-C-TTAA
gi|46484                      : ttttTTTTTTT--C---GTT---ATAA-A---TG------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGG-AA--A--TA----GC---A-A---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--A-TA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-CTAA
gi|46485                      :     TTTCGTT--A----TT---ATTG-T---TT------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-AGA-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-T-TTAA
gi|46481                      : tttcTTTTTTT--C---GTT---ATAA-A---TG------A-T-T-CCATT----ATCT-AT-GGG-GA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---A-AT---C-C-TTAA
gi|46486                      :     TTTTTTT--A---GTT---ATAAAT---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGG-AA--A--TA----GC---A-T---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--T-CA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-CATTATTTTTGAAAAACCTTTGCACACA-TG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-T
gi|46487                      :     TTTTTTT--G---GTT---ATAA-A---TA------A-T-A-A-A------AT---AT-GGG-AA--A--TA----AC---A-A---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--TA-T---C-G-----T-G-T-GGA--C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GG-GGAA-T---A-AT---C-C-TT
gi|46504                      :     TTTCGTT--A-----T---ATGA-T---TA------A-T-T-A-ATTT---GTCT-AT-GGG-AAC-A--TA----TC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-ACA--A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA----------------------------A-CG--AGG-TT-GG-A-----C-AA---C-T-TTAA
gi|46488                      :  tttTTTTGTT--C---GTT---ATAA-A---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AT-GGGGAA--A--TA----AC---C-A---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GAA--C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C--------------------------A-CG--AGG-GA-GG-A-T---A-CT---C-C-TT
gi|46489                      :     TTTCGTT--ATATATTTAGATAA-T---TG------A-T-T-A-TAA----ATCT-AT-GGG-AA--G--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGAT-CG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--T---------------------------------G--AGG-GT-TG-A-T---C-A----A-C-TTAA
gi|46490                      : ttttTTTTTTT--C---AT----ATAA-A---TA------A-T-T-G-ATT----ATCT-AT-GGA-AA--A--TA----TC---A-AC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-GA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--TA-----C-A-----T-G-T-ACA--C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-GA--AGG-GT-TG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46503                      :     TTTCCTT--A---A-----ATAG-------------A-T-TGA-ATT----ATCT-AT-GG--AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--T-CACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--TATT---C-A-----T---T-GCA--A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GG-ATT---C-AT---CGC-TTAA
gi|46491                      :  tttTTTTTTT--C---GTT---ATAA-TA--TA------A-C-T-A-ATT----ATCT-AT-GG--AA--A--TT----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--T-CA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--TA-C---C-------T-G-T-GCA--A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AAG-G--GG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46492                      :     TTTTTTT--C---GTG---ATAA-TA--CA------A-T-C-A-ATT----ATCT-AT-GAG-AA--A--TA----GC---C-A---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :     TTTCC--------GTT---TTAA-A---TA------A-T-G-A-TTT----ATCT-AT-GAA-AA--A--TA----CC---A-A---G-T-------T--T---------T-------------------T-CA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--TA-T---G-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--A-AA-A-----A------------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------G-TG--AAG-AT-TG-A-T---C-AA---C-CATTAA
gi|46497                      :  tttTTTTCTT--A-----T---ATGA-T----A------A-T-----ATT----ATCT----GG--AA--A--TA----TC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--T-CA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATT---C-A-----T---T-GCA--A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--A-TA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C--------------------------A-CG--A---GT-GG-A-TC--C-AT---C-C-TTAA
gi|46495                      :     TTTTTTT--G---GTT---ATAA-T---CATACTGTA-T-T-A-ATT----ATCT-AT-G-------A--TA----AC---A-ATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-AA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-G----G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A------------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C--------------------------T-GA--AGG-GG-GG-A-T---A-AT---C-T-TCAA
gi|46496                      :     TTTTTTT--A---ATG---ATAA-T---C-----------------T----ATTG-AT-AGA-AA--A--TA-----T---A-A---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--A-AA-ATAAAGA--------C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T--------------------------A-TG--AAG-GT-AG-
gi|46494                      :     TTTTTTT--C---GTT---ATAA-A---TA------A-T-T-A-ATT----ATCT-AC-GAG-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46500                      :     TTTTTTTGGA---ATT---ATAA-A---TA------A-T-T-A-ATT----ATTT-AT-TAG-AA--A--TA----AC---A-T---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--T-CA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--TA-T---A-G-----T-G---GCA--
gi|46499                      :     TTTTTTT--A---GTT---GGAA------A------A-T-T-----T----ATCT-AT-GGA-AA--A--TA----TA---A-AC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--T-T------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA--G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-A-AA-A-----A--------C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-AT-GG-
gi|46502                      :     TTTGTTT--C---GTT---ATAAAT---TG------ACT-T-A-AT----------AC-GAG-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---A--TTCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------A---T----CTCA----G------T-T---A--T----C--A---TA----T------C----A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-TAATC-A-----T-G-T-GCA--C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A----A---------T----A--T--T---C--------G--A-AA-A-----AAAAAAACAC---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GTCTG-A-T---C-AA---C-T-CTAA
gi|46508                      :         CTT--A---ATT---ATAA-A---TA------A-T-T-G-AT----------AT-----AA--A--C----------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-TA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG------------------C-A-----C-G-A-GCA--A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C--------------------------A-
gi|46509                      :           t--A---ATT---ATTA-TGTGTA------A-T-T-G-ATT----AC---AT-GGA-AA--A--TA----G----A-G---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T------------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TT-T---C-A-----C-G-C-GCA--A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--C-AATA-----A--------G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C--------------------------A-CG--AGG-AT-CG-A-TCTAC-ATGTAC-C-TTAAt
gi|46507                      :             ttttaaTT---ATAA-T-------------------ATA----ATCT-AT-GG--AA--A--TAT---AC---A-A---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--TA-T-----A-----T-G-T-GGA--C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GA-GG-A-T---A-AT---C-C-TT
gi|46505                      :              tttttgT---ATAA-A---TA------A-T-T-G-ATT----ATCC-AT-GGA-AA--A--TA-----C---A-ACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--T-CA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------A---T----TT-G----T------T-T---AA-T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--AA-T---A-A-----T-T-T---A--A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----T--TGTC---T--------G--A-AA-A--------------C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-AT-GG-C-T---C-AA---G-C-TTAA
gi|46512                      :           ttttttcgcT---ATAG-A---TA------A-T---G-ATT----ATTC-AT-AG--AA--A--TT----AT---ACA---C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--T-CA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--TA-T---C-G-----T-G-T-GCA--C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TA--AGT-GT-GG-A-G---C-TA---C-C-TTAA
gi|46510                      :                    T---ATAG-A---TA------A-T-C-A-ATT----AT----T-GA--AA--A--T-----GT---A-AAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--A-TA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--TA-A---C-G-----T-G-C-ACA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--C-AA-A-----AT-------T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T--------------------------A-TG--ATG-GT-GG-A-A---C-TA---C-C-TTAA
gi|46513                      :                tttga---ATAT-T---TA------A-T-T-A-ATC----ATCT-AT-GG---------------GC---A------------------T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46514                      :                     ---ATAA-A---TA------A-T-T-A-ATG------CT-AT-GGG-AA--A--TGAG--GC---A-A---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--T-CA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---CAA-----A-G-T-GCA--A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--A-GA-A-----C--------C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C--------------------------ATCGGAAGG-GT-GG-A-T---
gi|46515                      :                         TAA-T---TA------A-TAT-A-ATT----ATCT-ATTAGC-GATGA--T-----GC---G-A---T-----------------------------C---ACT---A--T-CA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-GTT-GCA--GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--G-AA-A-----A--------C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C--------------------------ATTG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46516                      :                           A-C---TA------T-T-C-A-ATT----ACTT-AT-GGA-CA--A--TT----TC---A-A---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--T-CA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--TA-T---C-A-----C-G-A-TCA--A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--T-TA-A-----A--------C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AAG-TT-GG-A-
gi|46517                      :                            -T---TT------A-T-T-G-ATT----ATCT-AT-GGA-AA--AAATA----AA---A-C---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--C-CA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                              ---TA------A-A-T-G-ATT----ATCT-AT-GGT-AA--A--TA----GC---A-A---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--T-CA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--TA-T---C-A-----T-C-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T--------------------------A-TG--AGG-GT-TT-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46519                      :                              ---TA------A-T-T-G-ATC----ATCT-AT-A---AA--A--T-----------------------------T---------T------G---AGT---A----CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--TA-C---T-A-----T-G-C-ACA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------A-CA-A-----A--------C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-G---C-CA---C-C-TTAA
gi|46520                      :                                          -T-T-A-ATTTCAAATCT-AT-GA--------------------A-A---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--T-CA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--AA-T---C-A-----T-G-C-GCAT-T----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C--------------------------A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                          -T-T-G-ATT----ATCT-AT-AGA-AA--A--TATATGGC---------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--T-C-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--TA-T---T-------T-A---GCA--A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--A-TC-A-----A--------C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C--------------------------T-TG--AGG-GT-GGAA-T---T-AT---C-C-T
gi|46523                      :                                                   T----ATCT-AT-GAA-AA--A--T------CTTTA-A---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--T-CG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--TA-T---A-T-----T-G-C-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--C-AA-GT----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------T-TG--AAG-AT-CA-A-T---C-TA---C-C-TTAA
gi|46501                      :                                                    ----ATCT-AT-GGGGAA--A--TG----AC---A-AAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-T-CA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--TA-T---C-A-----TAG-T-GGA--C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----A--------C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CA-------------------------A-TG--AGT-GT-
gi|46498                      :                                                    tttttttgttataac-AA--A--TA----GC---A-A---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-TAGCA--T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G-----A-A-----A--------C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C--------------------------ATCG--A-G-GT-GG-A-T---A-AT---C-C-T
gi|46525                      :                     ttttttcgtttatagaaaaataaaactagattctatgcgacatgcggat--A--TA----GA---A-A---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--T-CA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A---------T-GCAATA----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--C-AA-G-----A--------------------------------------------CG-C--------------------------A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                       -A---T-T-------T--T---------T------T------------T-TA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA------------------C-A------------CA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C--------------------------T-TG--AGG-AT-CG-C-T---C-TA---C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                      aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-GA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A------------------------------------------------------------------------------------------CA-C--------------------------A-CG--AGG-GT-GT-A-T---C-AA---C-C-TT
gi|46522                      :                                                                                        t---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--T-TA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--TA-T---T-ACTGTAT-G-C-ACA--A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--C-AA-A-----A--------CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--GGG-AT-CG-A-T---C-TA---C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                            taatgtctctttaagtaagaaaaaaaacc---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--T-CA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A------------------T--C----T------TAT---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G-----A-A-----A--------C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C--------------------------A-CG--A------GG-A-T---C-ATTCAC-T-TTAA
gi|46528                      :                                                                                   ataaac---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A----CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                        t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----C---------------------T-G-T-ACA--A--------------------------G-----A---A------C-A----A-TG-T----T----T--A--T---T--------G--CTAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T--------------------------A-AG--AGG-AT-GG-A-A---C-TA---C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                             -T-------T--T---------T------C---AAT---A--T-CA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TGGT---C-A-----T-G-C-ACA----------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--A-AA-A-----A--------C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46530                      :                                                                  ttgtagttttagttgataagtataaaaca-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CA-------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-TTAAg
gi|46531                      :                                                                                                       --T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                T---A--T-CA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----T-------TCA----T-T---A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--TG-T---C-A-----T-G-C-ACA--A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--A-AA-A-----A--------C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                T---A--T-GA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-------T-A-A-ACC--A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--C-AA-A-----A-------------------------------------AC-G--TCA-T--------------------------A-CG--AGA-AT-GG-A-C---CTAT---C-T-TTA
gi|46506                      :                                                                                                                                 ---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA--C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--C-AA-A-----A--------C---T----T-----A------
gi|46534                      :                                                                                                ttttttaacttctaattcattaatataattcatataa--T-CA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-TT--C-A-----T-G-T-GGA--C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AA-A-----AAAC-----C---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC--------------------------A-TG--AGG-GG-GG-A-T---A-AT---C-C-TT
gi|46535                      :                                                                                                                                                             -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--CA-T---C-A-----T-G-C-ACA--A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                        C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-CA-A-----A--------C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-CG--AGA-GT-GG-A-T---C-AA---C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                 -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--TA-T-----A-----TAG-T-GTA--A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTA-AA-AT----A--------CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGGAAT-GG-G-T---C-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                  ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-T-C-ACA--A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--C-AA-A-----A--------C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C--------------------------A-CA--AAG-ATCGG-A-T---T-A
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                   -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--CA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-AG-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TA--AGG-GT-TG-A-T---C-AA---C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                              G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GG-A-T---A-AT---C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GGA--A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-A-AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A--------------------------A-TG--AGC-AT-TG-A-T---C-GA---C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA--C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--A-AA-A-----A--------T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------A-TA--AGG-GT-GG-A-T---C-AA---C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C-----------A-----T-G-T-GCA--A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--A-GA-A-----A--------C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C--------------------------
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -T---C-A-----T-G-C-GCA--A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--A-AA-A-----A--------A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C--------------------------A-TG--AGG-GT-GA-A-C---T-A------C-TTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                1111                                                                                                      1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                1111     777777 55 22 555555  1 1 1   3333 111 2222     33333333 44 11 33 22  66666 111  666 0 2222222 11 1111111111111111 111   333 11 0  0 888888888888 33 0 1  2 222  22 555555555555 111 2222 5555555 444444 0 666 33 4444 22 111  1111 111111 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00  1 222 0 11111 1 444   0 1111 0   0 0 2222 2 666666666666 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 00 111 22222222 33   0 33333 44444444 111 2222 33333 222222 0 1111  1 22   0 1 44 11   0  1   0  0 44444 1 1 1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                ....     ...... .. .. ......  . . .   .... ... ....     ........ .. .. .. ..  ..... ...  ... . ....... .. ................ ...   ... .. .  . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . ..  . ... . ..... . ...   . .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ ..   . ..... ........ ... .... ..... ...... . ....  . ..   . . .. ..   .  .   .  . ..... . . .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                0000     333333 44 66 999999  0 0 0   0000 777 1111     55555555 77 33 22 33  99999 777  666 8 6666666 11 1111111111111111 444   111 77 7  7 888888888888 22 7 4  1 000  44 888888888888 222 2222 1111111 111111 7 111 00 3333 33 222  4444 999999 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 2222 000 3 3 55 3333 88888  0000   6 99  9 333 6 66666 2 333   6 4444 6   6 7 0000 6 777777777777 222 999999 4 1111 4  7 111111111 99 99 222 55555555 77   7 11111 44444444 999 4444 44444 999999 7 5555  4 44   7 4 22 00   8  5   8  9 99999 9 0 0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TTATA------AN-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
Reference ( family-349 )      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TTATA------AN-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46480                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCCTTAA--TTATA------AT-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GC-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46481                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TTATA------AA-T--G------AT-T-CCATT----A---T----CTATG--------GG-G--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46482                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TTATA------AT-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTAAT--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTATA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-AT----C-C-C-TTAA
gi|46483                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TTATA------AT-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GG-A--A--AA-TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--GAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46484                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TTATA------AA-T--G------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--A-TA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-CTAA
gi|46485                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTCG--TTATT------AT-T--GTTT---AT-T-A-ATT----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-T-TTAA
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TTATA------AA-TT-A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AT---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-C-A-
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-Tttatttttgaaaaacctttgcacacatgagggtggatcaacct
gi|46487                      : tttttttagttataaattaattaattatctatgggaaatagcatttttttcactatcaaacgtctaccaaattatttatgatatccagtgaatgaaattcctttagaagatatatttctatcatgtgcaaagtttaataataaaaagatttttgaaaaacctttggcatcacattatttttgaaaaacctttgcacacatTTTTTTTGG--TTATA------AA-T--A------AT-A-A-A------A---T------ATG--------GG-A--A--A--TA----AC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--TA-T---C-G-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GG-GGA-AT-A-----ATC-C-TT
gi|46488                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTGTTCG--TTATA------AA-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TA----AC---CA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GAA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C-A-CG--AGG-GA-GGA-T
gi|46489                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TTATATATTTAGA-T--A------AT-T-G-ATT----A---TAAATCTATG--------GG-A--A--G--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGAT-CG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--T--------G--AGG-GT-TGA-TC-A-----A---C-TTAAactcctt
gi|46490                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCA----TATA------AA-T--A------AT-T-G-ATT----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TC---AAC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-GA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--TA-----C-A-----T-G-T-ACA-C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C-A-GA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46491                      :                                                                                                                                                                                                        tTTTTTTTCG--TTATA------ATAT--A------AC-T-A-ATT----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TT----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--T-CA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--TA-C---C-------T-G-T-GCA-A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AAG-G--GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46492                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TGATA------ATAC--A------AT-C-A-ATT----A---T----CTATG--------AG-A--A--A--TA----GC---CA---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCCG--TTTTA------AA-T--A------AT-G-A-TTT----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--TA----CC---AA---G-T-------T--T---------T-------------------T-CA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--TA-T---G-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--AAA-A-----A------------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-G-TG--AAG-AT-TGA-TC-A-----A-C-CATTAA
gi|46494                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TTATA------AA-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----CTACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46495                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGG--TTATA------AT-C--ATACTGTAT-T-A-ATT----A---T----CTATG-----------------A--TA----AC---AATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-AA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-G---G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AAA-A-----A------------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C-T-GA--AGG-GG-GGA-T--A-----A-T-C-TT
gi|46496                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAA--TGATA------AT-C------------------T----A---T----TGATA--------GA-A--A--A--TA-----T---AA---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--AAA-ATAAAGA--------C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T-A-TG--AAG-GT-AGcaa
gi|46497                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTCTTA----TATG------A--T--A------AT-----ATT----A---T----CT-----------GG-A--A--A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--T-CA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATT---C-A-----T---T-GCA-A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--ATA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C-A-CG--A---GT-GGA-TC-C-----ATC-C-TTAA
gi|46498                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCGT--TTATAGAAA--AA-T--A------A----A-ACT----AGATT----CTATGCGACATGCGG-ATAA--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--T-CA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-TAGCA-T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----A-A-----A--------C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C-ATCG--A-G-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-T
gi|46499                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TTGGA------A-----A------AT-T-----T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TA---AAC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--T-T------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA-G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-AAA-A-----A--------C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GG
gi|46500                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGGAATTATA------AA-T--A------AT-T-A-ATT----A---T----TTATT--------AG-A--A--A--TA----AC---AT---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--T-CA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--TA-T---A-G-----T-G---GCA-
gi|46501                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTT-G--TTATA------AC-------------------------A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TG----AC---AAAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-T-CA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--TA-T---C-A-----TAG-T-GGA-C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CAA-TG--AGT-GT-
gi|46502                      :                                                                                                                                                                                                         TTTGTTTCG--TTATA------AA-TTGA------CT-T-A-AT----------------ACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---A--TTCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------A---T----CTCA----G------T-T---A--T----C--A---TA----T------C----A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-TAATC-A-----T-G-T-GCA-C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A----A---------T----A--T--T---C--------G--AAA-A-----AAAAAAACAC---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GTCTGA-TC-A-----A-C-T-CTAA
gi|46503                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCC--TTA--------AA-T--AG-----AT-TGA-ATT----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--T-CACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--TATT---C-A-----T---T-GCA-A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGATTC-A-----T-CGC-TTAA
gi|46504                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TTATATG----AT-T--A------AT-T-A-ATTT---G---T----CTATG--------GG-A--AC-A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA---A-CG--AGG-TT-GGA--C-A-----A-C-T-TTAA
gi|46505                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--CTATA------AA-T--A------AT-T-G-ATT----A---T----CCATG--------GA-A--A--A--TA-----C---AACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--T-CA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------A---T----TT-G----T------T-T---AA-T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--AA-T---A-A-----T-----TTA-A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----TTGT--C---T--------G---AA-A-----A--------C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GGC-TC-A-----A-G-C-TTAA
gi|46506                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-ACA-C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A-----A--------C---T----T-----A------
gi|46507                      :                                                                                                                                                                      ttttttaacttctaattcattaatataattcatataaTTTTT-G--TTATA------AT------------------ATA----A---T----CTATG--------GA-A--AT-A--TA-----C---AA---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--TA-T-----A-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G---AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GA-GGA-TA-A-----T-C-C-TT
gi|46508                      :                                                                                                                                                                                                            TCTTAA--TTATA------AA-T--A------AT-T-G-AT----------------AT------------A--A--A--C---------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-TA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG------------------C-A-----C-G-A-GCA-A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C-A-
gi|46509                      :                                                                                                                                                                                                              TTA---TTATG------TG-T--A------AT-T-G-ATT----A---C------ATG--------GA-A--A--A--TA----G----AG---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T------------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TT-T---C-A-----C-G-C-GCA-A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--CAATA-----A--------G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C-A-CG--AGG-AT-CGA-TCTACATGTA-C-C-TTAAt
gi|46510                      :                                                                                                                                                                                                             ttttaaaaTATA------GA-T--A------AT-C-A-ATT----A---T----T------------GA-A--A--A--T-----GT---AAAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--A-TA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--TA-A---C-G-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--CAA-A-----AT-------T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T-A-TG--ATG-GT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttga-T-------T--T---------T------C---AAT---A--T-CA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TGGT---C-A-----T-G-C-ACA---------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A-----A--------C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46512                      :                                                                                                                                                                                        ttgtagttttagttgataagtataaaacaTATA------GA-T--A------AT---G-ATT----A---T----TCATA--------GA-A--ATTA--TA-----C---A----C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--T-CA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--TA-T---C-G-----T-G-T-GCA-C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGT-GT-GGA-GC-T-----A-C-C-TTAAg
gi|46513                      :                                                                                                                                                                                                                      ATA------TT-T--A------AT-T-A-ATC----A---T----CTATG--------GG-----------------C---A-----------------T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46514                      :                                                                                                                                                                                                                      ATA------AA-T--A------AT-T-A-ATG-------------CTATG--------GG-A--A--A--TGAG--GC---AA---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--T-CA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---CAA-----A-G-T-GCA-A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AGA-A-----C--------C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C-ATCGGAAGG-GT-GGA-T
gi|46515                      :                                                                                                                                                                                                                       TA------AT-T--A------ATAT-A-ATT----A---T----CTAT---------------------TA----GC---GA---T-G-------A--TGCGA-----T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-GTT-GCA-GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--GAA-A-----A--------C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C-ATTG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46516                      :                                                                                                                                                                                                                         ------AC-T--A------TT-C-A-ATT----A---C----TTATG--------GA-C--A--A--TT----TC---AA---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--T-CA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--TA-T---C-A-----C-G-A-TCA-A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--TTA-A-----A--------C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C-A-TG--AAG-TT-GGA-
gi|46517                      :                                                                                                                                                                                                                                      ------AT-T-G-ATT----A---T----CTATG--------GA-A--A--AAATA----AA---AC---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--C-CA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                                                                                                                                                                                                                              ttt-T--A------AA-T-G-ATT----A---T----CTATG--------GT-A--A--A--TA----GC---AA---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--T-CA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--TA-T---C-A-----T-C-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-TG--AGG-GT-TTA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46519                      :                                                                                                                                                                                                                                 -T--A------AT-T-G-ATC----A---T----CTATA-----------A--A--A--T----------------------------T---------T------G---AGT---A----CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--TA-C---T-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------ACA-A-----A--------C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-GC-C-----A-C-C-TTAA
gi|46520                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-A-ATTTCAAA---T----CTATG--------A----------------------AA---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--T-CA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--AA-T---C-A-----T-G-C-GCATT----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-AAA-A-----A--------C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C-A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-G-ATT----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TATATGGC--------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--T-C-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--TA-T-----------T-T-A-GCA-A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--ATC-A-----A--------C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C-T-TG--AGG-GT-GGA-
gi|46522                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--T-TA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--TA-T---T-ACTGTAT-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--CAA-A-----A--------CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--GGG-AT-CGA-TC-T-----A-C-C-TTAAattatcct
gi|46523                      :                                                                                                                                                                                                                        taatgtctctttaagtaagaaaaaaaaccT----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--T------CTTTAA---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--T-CG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--TA-T---A-T-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--CAA-GT----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-T-TG--AAG-AT-CAA-TC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--T-CA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--AT--------C---T----T--A----T------------A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G----A-A-----A--------C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C-A-CG--A------GGA-TC-ATTC--A-C-T-TTAA
gi|46525                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                 ataaac--A--TA----GA---AA---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--T-CA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-C-AAT-A----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--CAA-G-----A--------------------------------------------CG-C-A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A---T-T-------T--T---------T------T------------T-TA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA------------------------------C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C-T-TG--AGG-AT-CGC-TC-T-----A-C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--T-GA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A-----------------------------------------------------------------------------------------CA-C-A-CG--AGG-GT-GTA-TC-A-----A-C-C-TT
gi|46528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A----CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--T-CA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA--------C--TG-TA--C-A-----A-G-A-ACA-A----T-GTT-T--------------------------------------------A----T----T--G--C---T------------AA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-AG--AGG-AT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------T--T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CAA-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --T---------T------C---ACT---A--T-CA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T---A--T-CA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----TTCA----T------T-----A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--TG-T---C-A-----T-G-C-ACA-A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A-----A--------C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T---A--T-GA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-------T-A-A-ACC-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A-----A-------------------------------------AC-G--TCA-T-A-CG--AGA-AT-GGA-CC-T-----A-T-C-TT
gi|46534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --T-CA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-TT--C-A-----T-G-T-GGA-C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A-----AAAC-----C---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC-A-TG--AGG-GG-GGA-TA-A-----T-C-C-TTta
gi|46535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--CA-T---C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--ACA-A-----A--------C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGA-GT-GGA-TC-A-----A-C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--TA-T-----A-----TAG-T-GTA-A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTAAA-AT----A--------CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGGAAT-GGG-TC-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-T-C-ACA-A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--CAA-A-----A--------C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C-A-CA--AAG-ATCGGA-TT-A-----
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--CA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAG-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GGA-A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A--T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-AAA-A-----A--------C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A-A-TG--AGC-AT-TGA-TC-G-----A-C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C--TA-T---C-A-----T-G-T-GCA-C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--AAA-A-----A--------T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C-----------A-----T-G-T-GCA-A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AGA-A-----A--------C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -T---C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--AAA-A-----A--------A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GAA-CT-A---------C-TTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  11  1   888888 44 22 555555  22 1 1  1 3333 111 2222     33333333 44 11 33 22  66666 111  666 0 2222222 11 1111111111111111 111   333 22   0 888888888888 33 0 1  2 222  22 555555555555 222 2222 3333333 444444 0 666 22 4444 22 111  1111 111111 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00 111 1 1 0 11111 1 444   0 1111 0   0 0 2222 2 666666666666 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 00 111 22222222 33   0 55555555 111 111 2222 33333 222222 0 1111  1 22   0 1 44 11   0  1   0  0 44444 1 1 1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  ..  .   ...... .. .. ......  .. . .  . .... ... ....     ........ .. .. .. ..  ..... ...  ... . ....... .. ................ ...   ... ..   . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . .. ... . . . ..... . ...   . .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ ..   . ........ ... ... .... ..... ...... . ....  . ..   . . .. ..   .  .   .  . ..... . . .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  99  2   777777 33 66 999999  44 0 0  0 0000 777 1111     55555555 77 33 22 33  99999 777  666 8 6666666 11 1111111111111111 444   111 55   7 888888888888 22 7 4  1 000  44 888888888888 999 2222 4444444 111111 7 888 33 3333 33 222  4444 999999 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 2222 000 3 3 55 3333 88888  0000   6 99 111 9 2 6 66666 2 333   6 4444 6   6 7 0000 6 777777777777 222 999999 4 1111 4  7 111111111 99 99 222 55555555 77   7 66666666 999 999 4444 44444 999999 7 5555  4 44   7 4 22 00   8  5   8  9 99999 9 0 0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AA-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
Reference ( family-349 )      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AN-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46480                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCCTTAA--TT-ATA------AT-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GC-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46481                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AA-T--G------AT--T-CCAT-T----A---T----CTATG--------GG-G--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46482                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------AT-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTAAT--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTAT---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-AT----C-C-C-TTAA
gi|46483                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------AT-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--AA-TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--GAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46484                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AA-T--G------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--ATA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-CTAA
gi|46485                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTCG--TT-ATT------AT-T--GTTT---AT--T-A-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-T-TTAA
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-ATA------AA-TT-A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AT---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-C-A-
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-Tttatttttgaaaaacctttgcacacatgagggtggatcaacct
gi|46487                      : tttttttagttataaattaattaattatctatgggaaatagcatttttttcactatcaaacgtctaccaaattatttatgatatccagtgaatgaaattcctttagaagatatatttctatcatgtgcaaagtttaataataaaaagatttttgaaaaacctttggcatcacattatttttgaaaaacctttgcacacatTTTTTTTGG--TT-ATA------AA-T--A------AT--A-A-A-------A---T------ATG--------GG-A--A--A--TA----AC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GG-GGA-AT-A-----ATC-C-TT
gi|46488                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTGTTCG--TT-ATA------AA-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TA----AC---CA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GAA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C-A-CG--AGG-GA-GGA-T
gi|46489                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATATATTTAGA-T--A------AT--T-G-AT-T----A---TAAATCTATG--------GG-A--A--G--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGATCG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--T--------G--AGG-GT-TGA-TC-A-----A---C-TTAAactcctt
gi|46490                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCA--T--ATA------AA-T--A------AT--T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TC---AAC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--T---A---C-A-----T-G-T-ACA-C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C-A-GA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46491                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------ATAT--A------AC--T-A-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TT----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--TCA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-C-C-------T-G-T-GCA-A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AAG-G--GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46492                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TG-ATA------ATAC--A------AT--C-A-AT-T----A---T----CTATG--------AG-A--A--A--TA----GC---CA---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCCG--TT-TTA------AA-T--A------AT--G-A-TT-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--TA----CC---AA---G-T-------T--T---------T-------------------TCA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--T---A-T-G-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-G-TG--AAG-AT-TGA-TC-A-----A-C-CATTAA
gi|46494                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AA-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----CTACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46495                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGG--TT-ATA------AT-C--ATACTGTAT--T-A-AT-T----A---T----CTATG-----------------A--TA----AC---AATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TAA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-G---G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C-T-GA--AGG-GG-GGA-T--A-----A-T-C-TT
gi|46496                      :                                                                                                                                                                                                                                  -T--A------ATGAT-A-ATCT----A---T----TGATA--------GA-A--A--A--TA-----T---AA---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--AAA-ATAAAG---A---C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T-A-TG--AAG-GT-AGcaa
gi|46497                      :                                                                                                                                                                                                      ttttttTTTTC---TT-ATAT-----GA-T--A------AT------AT-T----A---T----CT-----------GG-A--A--A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--TCA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--ATA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C-A-CG--A---GT-GGA-TC-C-----ATC-C-TTAA
gi|46498                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TTTATAGAAA--AA-T--A------A-----A-AC-T----AGATT----CTATGCGACATGCGG-ATAA--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-TAGCA-T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----A-A--------A---C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C-ATCG--A-G-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-T
gi|46499                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-GGA------A-----A------AT--T------T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TA---AAC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--TT------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-AAA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GG
gi|46500                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGGAATT-ATA------AA-T--A------AT--T-A-AT-T----A---T----TTATT--------AG-A--A--A--TA----AC---AT---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--TCA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--T---A-T-A-G-----T-G---GCA-
gi|46501                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTG--TT-ATA------AC---------------------------A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TG----AC---AAAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-TCA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--T---A-T-C-A-----TAG-T-GGA-C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CAA-TG--AGT-GT-
gi|46502                      :                                                                                                                                                                                                         TTTGTTTCG--TT-ATA------AA-TTGA------CT--T-A-AT-----------------ACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---AT-TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------ATC-T----C--A----G------T-T---A--T----C--A---TA----T--------C--A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATAA-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A---------A----T----A--T--T---C--------G--AAA-AAAAAAAACA---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GTCTGA-TC-A-----A-C-T-CTAA
gi|46503                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCC--TT-A--------AA-T--AG-----AT--TGA-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--TCACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGATTC-A-----T-CGC-TTAA
gi|46504                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TT-ATATG----AT-T--A------AT--T-A-AT-TT---G---T----CTATG--------GG-A--AC-A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA---A-CG--AGG-TT-GGA--C-A-----A-C-T-TTAA
gi|46505                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--CT-ATA------AA-T--A------AT--T-G-AT-T----A---T----CCATG--------GA-A--A--A--TA-----C---AACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------AT--T----T--G----T------T-TA--A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--A---A-T-A-A-----T-----TTA-A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----TTGT--C---T--------G---AA-A--------A---C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GGC-TC-A-----A-G-C-TTAA
gi|46506                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---T----T-----A------
gi|46507                      :                                                                                                                                                                       ttttttaacttctaattcattaatataattcatataaTTTTTG--TT-ATA------AT-------------------AT-A----A---T----CTATG--------GA-A--AT-A--TA-----C---AA---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--T---A-T---A-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G---AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GA-GGA-TA-A-----T-C-C-TT
gi|46508                      :                                                                                                                                                                                                                  --TT-ATA------AA-T--A------AT--T-G-AT-----------------AT------------A--A--A--C---------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TTA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG-------------------C-A-----C-G-A-GCA-A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C-A-
gi|46509                      :                                                                                                                                                                                                            tcttaa--TT-ATG------TG-T--A------AT--T-G-AT-T----A---C------ATG--------GA-A--A--A--TA----G----AG---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T-----------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---T-T-C-A-----C-G-C-GCA-A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--CAATA--------A---G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C-A-CG--AGG-AT-CGA-TCTACATGTA-C-C-TTAAt
gi|46510                      :                                                                                                                                                                                                   ttttaaaattaTTTG--AT-ATA------GA-T--A------AT--C-A-AT-T----A---T----T------------GA-A--A--A--T-----GT---AAAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--ATA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--T---A-A-C-G-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--CAA-A--------AT--T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T-A-TG--ATG-GT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T-------T--T---------T------C---AAT---A--TCA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---GGT-C-A-----T-G-C-ACA---------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46512                      :                                                                                                                                                                                        ttgtagttttagttgataagtataaaacaT-ATA------GA-T--A------AT----G-AT-T----A---T----TCATA--------GA-A--ATTA--TA-----C---A----C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--TCA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GCA-C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGT-GT-GGA-GC-T-----A-C-C-TTAAg
gi|46513                      :                                                                                                                                                                                                                      -ATA------TT-T--A------AT--T-A-AT-C----A---T----CTATG--------GG-----------------C---A-----------------T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46514                      :                                                                                                                                                                                                                      -ATA------AA-T--A------AT--T-A-AT-G-------------CTATG--------GG-A--A--A--TGAG--GC---AA---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--TCA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-CAA-----A-G-T-GCA-A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AGA-A--------C---C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C-ATCGGAAGG-GT-GGA-T
gi|46515                      :                                                                                                                                                                                                                        TA------AT-T--A------ATA-T-A-AT-T----A---T----CTAT---------------------TA----GC---GA---T-G-------A--TGCGA-----T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-GTT-GCA-GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--GAA-A--------A---C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C-ATTG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46516                      :                                                                                                                                                                                                                          ------AC-T--A------TT--C-A-AT-T----A---C----TTATG--------GA-C--A--A--TT----TC---AA---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--TCA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--T---A-T-C-A-----C-G-A-TCA-A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--TTA-A--------A---C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C-A-TG--AAG-TT-GGA-
gi|46517                      :                                                                                                                                                                                                                                       ------AT--T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--AAATA----AA---AC---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--CCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                                                                                                                                                                                                                               ttt-T--A------AA--T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GT-A--A--A--TA----GC---AA---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--TCA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-C-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-TG--AGG-GT-TTA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46519                      :                                                                                                                                                                                                                                  -T--A------AT--T-G-AT-C----A---T----CTATA-----------A--A--A--T----------------------------T---------T------G---AGT---A---CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--T---A-C-T-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------ACA-A--------A---C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-GC-C-----A-C-C-TTAA
gi|46520                      :                                                                                                                                                                                                                                              T--T-A-AT-TTCAAA---T----CTATG--------A----------------------AA---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--A---A-T-C-A-----T-G-C-GCATT----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-AAA-A--------A---C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C-A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                                                                                                                                                                                                                              T--T-G-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TATATGGC--------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--TC-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--T---A-T---------T-T-A-GCA-A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--ATC-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C-T-TG--AGG-GT-GGA-
gi|46522                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--TTA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--T---A-T-T-ACTGTAT-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--CAA-A--------A---CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--GGG-AT-CGA-TC-T-----A-C-C-TTAAattatcct
gi|46523                      :                                                                                                                                                                                                                          taatgtctctttaagtaagaaaaaaaacc-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--T------CTTTAA---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--TCG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--T---A-T-A-T-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--CAA-GT-------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-T-TG--AAG-AT-CAA-TC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--AT--------C---T----T--A----T------------A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G----A-A--------A---C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C-A-CG--A------GGA-TC-ATTC--A-C-T-TTAA
gi|46525                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaac--A--TA----GA---AA---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--TCA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-AAT-A----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--CAA-G--------A---------------------------------------CG-C-A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A---T-T-------T--T---------T------T------------TTA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA-------------------------------C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C-T-TG--AGG-AT-CGC-TC-T-----A-C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A---------------------------------------------------------------------------------------CA-C-A-CG--AGG-GT-GTA-TC-A-----A-C-C-TT
gi|46528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A---CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA--------C--T---G-TAC-A-----A-G-A-ACA-A----T-GTT-T--------------------------------------------A----T----T--G--C---T------------AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-AG--AGG-AT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CAA-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---A--TCA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----TTCA----T------T-----A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--T---G-T-C-A-----T-G-C-ACA-A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---A--TGA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-------T-A-A-ACC-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A--------------------------------AC-G--TCA-T-A-CG--AGA-AT-GGA-CC-T-----A-T-C-TT
gi|46534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --TCA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-TTC-A-----T-G-T-GGA-C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------AAACC---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC-A-TG--AGG-GG-GGA-TA-A-----T-C-C-TTta
gi|46535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--ACA-A--------A---C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGA-GT-GGA-TC-A-----A-C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--T---A-T---A-----TAG-T-GTA-A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTAAA-AT-------A---CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGGAAT-GGG-TC-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-T-C-ACA-A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C-A-CA--AAG-ATCGGA-TT-A-----
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAG-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GGA-A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A-A-TG--AGC-AT-TGA-TC-G-----A-C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--AAA-A--------A---T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T----A-----TA----TTT-C------------A-----T-G-T-GCA-A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AGA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--AAA-A--------A---A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GAA-CT-A---------C-TTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  11  1   888888 55  22 5555  111 1  1 3333 111 2222     33333333 44 11 33 22  66666 111  666 0 2222222 11 1111111111111111 111   333 22   0 888888888888 33 0 1  2 222  22 555555555555 222 2222 3333333 444444 0 666 22 4444 22 111  1111 111111 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00 111 1 1 0 11111 1 444   0 1111 0   0 0 2222 2 666666666666 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 00 111 22222222 33   0 55555555 111 111 2222 33333 222222 0 1111  1 22   0 1 44 11   0  1   0  0 44444 1 1 1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  ..  .   ...... ..  .. ....  ... .  . .... ... ....     ........ .. .. .. ..  ..... ...  ... . ....... .. ................ ...   ... ..   . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . .. ... . . . ..... . ...   . .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ ..   . ........ ... ... .... ..... ...... . ....  . ..   . . .. ..   .  .   .  . ..... . . .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  88  2   999999 33  66 1111  555 0  0 0000 777 1111     55555555 77 33 22 33  99999 777  666 8 6666666 11 1111111111111111 444   111 55   7 888888888888 22 7 4  1 000  44 888888888888 999 2222 4444444 111111 7 888 33 3333 33 222  4444 999999 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 2222 000 3 3 55 3333 88888  0000   6 99 111 9 2 6 66666 2 333   6 4444 6   6 7 0000 6 777777777777 222 999999 4 1111 4  7 111111111 99 99 222 55555555 77   7 66666666 999 999 4444 44444 999999 7 5555  4 44   7 4 22 00   8  5   8  9 99999 9 0 0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
Reference ( family-349 )      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46480                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCCTTAA--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GC-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46481                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-CCAT-T----A---T----CTATG--------GG-G--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46482                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTAAT--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTAT---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-AT----C-C-C-TTAA
gi|46483                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--AA-TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--GAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46484                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--ATA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-CTAA
gi|46485                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTCG--TT-ATT------A--TT--GTTT-AT-T-A-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-T-TTAA
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-ATA------A--ATT-A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AT---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-C-A-
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-Tttatttttgaaaaacctttgcacacatgagggtggatcaacct
gi|46487                      : tttttttagttataaattaattaattatctatgggaaatagcatttttttcactatcaaacgtctaccaaattatttatgatatccagtgaatgaaattcctttagaagatatatttctatcatgtgcaaagtttaataataaaaagatttttgaaaaacctttggcatcacattatttttgaaaaacctttgcacacatTTTTTTTGG--TT-ATA------A--AT--A----AT-A-A-A-------A---T------ATG--------GG-A--A--A--TA----AC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GG-GGA-AT-A-----ATC-C-TT
gi|46488                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTGTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TA----AC---CA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GAA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C-A-CG--AGG-GA-GGA-T
gi|46489                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATATATTTAG--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---TAAATCTATG--------GG-A--A--G--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGATCG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--T--------G--AGG-GT-TGA-TC-A-----A---C-TTAAactcctt
gi|46490                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCA--T--ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TC---AAC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--T---A---C-A-----T-G-T-ACA-C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C-A-GA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46491                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AT-AT--A----AC-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TT----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--TCA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-C-C-------T-G-T-GCA-A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AAG-G--GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46492                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TG-ATA------AT-AC--A----AT-C-A-AT-T----A---T----CTATG--------AG-A--A--A--TA----GC---CA---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCCG--TT-TTA------A--AT--A----AT-G-A-TT-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--TA----CC---AA---G-T-------T--T---------T-------------------TCA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--T---A-T-G-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-G-TG--AAG-AT-TGA-TC-A-----A-C-CATTAA
gi|46494                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46495                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGG--TT-ATA------ATCAT--ACTGTAT-T-A-AT-T----A---T----CTATG-----------------A--TA----AC---AATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TAA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-G---G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C-T-GA--AGG-GG-GGA-T--A-----A-T-C-TT
gi|46496                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTT----------------A--AT--G----AT---A-ATCT----A---T----TGATA--------GA-A--A--A--TA-----T---AA---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--AAA-ATAAAG---A---C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T-A-TG--AAG-GT-AGcaa
gi|46497                      :                                                                                                                                                                                                            TTTTC---TT-ATAT-----G--AT--A----AT-----AT-T----A---T----CT-----------GG-A--A--A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--TCA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--ATA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C-A-CG--A---GT-GGA-TC-C-----ATC-C-TTAA
gi|46498                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TTTATAGAAA--A--AT--A----A----A-AC-T----AGATT----CTATGCGACATGCGG-ATAA--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-TAGCA-T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----A-A--------A---C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C-ATCG--A-G-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-T
gi|46499                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-GGA------A--A--------AT-T------T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TA---AAC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--TT------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-AAA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GG
gi|46500                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGGAATT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----TTATT--------AG-A--A--A--TA----AC---AT---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--TCA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--T---A-T-A-G-----T-G---GCA-
gi|46501                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTG--TT-ATA------A---------------------C----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TG----AC---AAAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-TCA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--T---A-T-C-A-----TAG-T-GGA-C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CAA-TG--AGT-GT-
gi|46502                      :                                                                                                                                                                                                         TTTGTTTCG--TT-ATA------A--ATTGA----CT-T-A-AT-----------------ACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---AT-TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------ATC-T----C--A----G------T-T---A--T----C--A---TA----T--------C--A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATAA-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A---------A----T----A--T--T---C--------G--AAA-AAAAAAAACA---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GTCTGA-TC-A-----A-C-T-CTAA
gi|46503                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCC--TT-A--------A--AT--AG---AT-TGA-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--TCACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGATTC-A-----T-CGC-TTAA
gi|46504                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TT-ATATG----A--TT--A----AT-T-A-AT-TT---G---T----CTATG--------GG-A--AC-A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA---A-CG--AGG-TT-GGA--C-A-----A-C-T-TTAA
gi|46505                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--CT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CCATG--------GA-A--A--A--TA-----C---AACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------AT--T----T--G----T------T-TA--A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--A---A-T-A-A-----T-----TTA-A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----TTGT--C---T--------G---AA-A--------A---C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GGC-TC-A-----A-G-C-TTAA
gi|46506                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---T----T-----A------
gi|46507                      :                                                                                                                                                                       ttttttaacttctaattcattaatataattcatataaTTTTTG--TT-ATA------AT-AT--A----AT----------------------CTATG--------GA-A--AT-A--TA-----C---AA---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--T---A-T---A-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G---AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GA-GGA-TA-A-----T-C-C-TT
gi|46508                      :                                                                                                                                                                                                                  --TT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-----------------AT------------A--A--A--C---------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TTA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG-------------------C-A-----C-G-A-GCA-A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C-A-
gi|46509                      :                                                                                                                                                                                                            tcttaa--TT-ATG------T--GT--A----AT-T-G-AT-T----A---C------ATG--------GA-A--A--A--TA----G----AG---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T-----------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---T-T-C-A-----C-G-C-GCA-A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--CAATA--------A---G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C-A-CG--AGG-AT-CGA-TCTACATGTA-C-C-TTAAt
gi|46510                      :                                                                                                                                                                                                   ttttaaaattaTTTG--AT-ATA------G--AT--A----AT-C-A-AT-T----A---T----T------------GA-A--A--A--T-----GT---AAAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--ATA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--T---A-A-C-G-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--CAA-A--------AT--T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T-A-TG--ATG-GT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-------T--T---------T------C---AAT---A--TCA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---GGT-C-A-----T-G-C-ACA---------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46512                      :                                                                                                                                                                                        ttgtagttttagttgataagtataaaacaT-ATA------G--AT--A----AT---G-AT-T----A---T----TCATA--------GA-A--ATTA--TA-----C---A----C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--TCA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GCA-C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGT-GT-GGA-GC-T-----A-C-C-TTAAg
gi|46513                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-A-AT-C----A---T----CTATG--------GG-----------------C---A-----------------T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46514                      :                                                                                                                                                                                                                 atatt-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-G-------------CTATG--------GG-A--A--A--TGAG--GC---AA---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--TCA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-CAA-----A-G-T-GCA-A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AGA-A--------C---C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C-ATCGGAAGG-GT-GGA-T
gi|46515                      :                                                                                                                                                                                                                        TA------A--TT--A----ATAT-A-AT-T----A---T----CTAT---------------------TA----GC---GA---T-G-------A--TGCGA-----T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-GTT-GCA-GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--GAA-A--------A---C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C-ATTG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46516                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----TT-C-A-AT-T----A---C----TTATG--------GA-C--A--A--TT----TC---AA---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--TCA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--T---A-T-C-A-----C-G-A-TCA-A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--TTA-A--------A---C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C-A-TG--AAG-TT-GGA-
gi|46517                      :                                                                                                                                                                                                                                      ac----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--AAATA----AA---AC---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--CCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                                                                                                                                                                                                                                 tttT--A----AA-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GT-A--A--A--TA----GC---AA---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--TCA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-C-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-TG--AGG-GT-TTA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46519                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-G-AT-C----A---T----CTATA-----------A--A--A--T----------------------------T---------T------G---AGT---A---CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--T---A-C-T-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------ACA-A--------A---C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-GC-C-----A-C-C-TTAA
gi|46520                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-A-AT-TTCAAA---T----CTATG--------A----------------------AA---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--A---A-T-C-A-----T-G-C-GCATT----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-AAA-A--------A---C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C-A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-G-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TATATGGC--------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--TC-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--T---A-T---------T-T-A-GCA-A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--ATC-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C-T-TG--AGG-GT-GGA-
gi|46522                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--TTA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--T---A-T-T-ACTGTAT-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--CAA-A--------A---CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--GGG-AT-CGA-TC-T-----A-C-C-TTAAattatcct
gi|46523                      :                                                                                                                                                                                                                        taatgtctctttaagtaagaaaaaaaacc-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--T------CTTTAA---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--TCG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--T---A-T-A-T-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--CAA-GT-------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-T-TG--AAG-AT-CAA-TC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--AT--------C---T----T--A----T------------A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G----A-A--------A---C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C-A-CG--A------GGA-TC-ATTC--A-C-T-TTAA
gi|46525                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ataaac--A--TA----GA---AA---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--TCA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-AAT-A----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--CAA-G--------A---------------------------------------CG-C-A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A---T-T-------T--T---------T------T------------TTA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA-------------------------------C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C-T-TG--AGG-AT-CGC-TC-T-----A-C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A---------------------------------------------------------------------------------------CA-C-A-CG--AGG-GT-GTA-TC-A-----A-C-C-TT
gi|46528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A---CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA--------C--T---G-TAC-A-----A-G-A-ACA-A----T-GTT-T--------------------------------------------A----T----T--G--C---T------------AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-AG--AGG-AT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CAA-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TCA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----TTCA----T------T-----A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--T---G-T-C-A-----T-G-C-ACA-A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TGA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-------T-A-A-ACC-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A--------------------------------AC-G--TCA-T-A-CG--AGA-AT-GGA-CC-T-----A-T-C-TT
gi|46534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TCA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-TTC-A-----T-G-T-GGA-C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------AAACC---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC-A-TG--AGG-GG-GGA-TA-A-----T-C-C-TTta
gi|46535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--ACA-A--------A---C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGA-GT-GGA-TC-A-----A-C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--T---A-T---A-----TAG-T-GTA-A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTAAA-AT-------A---CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGGAAT-GGG-TC-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-T-C-ACA-A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C-A-CA--AAG-ATCGGA-TT-A-----
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAG-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GGA-A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A-A-TG--AGC-AT-TGA-TC-G-----A-C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--AAA-A--------A---T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C------------A-----T-G-T-GCA-A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AGA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--AAA-A--------A---A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GAA-CT-A---------C-TTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  11  1   888888 55  22 5555  111 1  1 3333 111 2222     33333333 44 11 33 22  66666 111  666 0 2222222 11 1111111111111111 111   333 22   0 888888888888 33 0 1  2 222  22 555555555555 222 2222 3333333 444444 0 666 22 4444 22 111  1111 111111 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00 111 1 1 0 11111 1 444   0 1111 0   0 0 2222 2 666666666666 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 00 111 22222222 33   0 55555555 111 111 2222 33333 222222 0 1111  1 22   0 1 44 11   0  1   0  0 44444 1 1 1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  ..  .   ...... ..  .. ....  ... .  . .... ... ....     ........ .. .. .. ..  ..... ...  ... . ....... .. ................ ...   ... ..   . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . .. ... . . . ..... . ...   . .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ ..   . ........ ... ... .... ..... ...... . ....  . ..   . . .. ..   .  .   .  . ..... . . .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  88  2   999999 33  66 1111  555 0  0 0000 777 1111     55555555 77 33 22 33  99999 777  666 8 6666666 11 1111111111111111 444   111 55   7 888888888888 22 7 4  1 000  44 888888888888 999 2222 4444444 111111 7 888 33 3333 33 222  4444 999999 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 2222 000 3 3 55 3333 88888  0000   6 99 111 9 2 6 66666 2 333   6 4444 6   6 7 0000 6 777777777777 222 999999 4 1111 4  7 111111111 99 99 222 55555555 77   7 66666666 999 999 4444 44444 999999 7 5555  4 44   7 4 22 00   8  5   8  9 99999 9 0 0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
Reference ( family-349 )      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46480                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCCTTAA--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GC-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46481                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-CCAT-T----A---T----CTATG--------GG-G--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46482                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTAAT--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTAT---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-AT----C-C-C-TTAA
gi|46483                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--AA-TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--GAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46484                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--ATA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-CTAA
gi|46485                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTCG--TT-ATT------A--TT--GTTT-AT-T-A-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-T-TTAA
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-ATA------A--ATT-A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AT---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-C-A-
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-Tttatttttgaaaaacctttgcacacatgagggtggatcaacct
gi|46487                      : tttttttagttataaattaattaattatctatgggaaatagcatttttttcactatcaaacgtctaccaaattatttatgatatccagtgaatgaaattcctttagaagatatatttctatcatgtgcaaagtttaataataaaaagatttttgaaaaacctttggcatcacattatttttgaaaaacctttgcacacatTTTTTTTGG--TT-ATA------A--AT--A----AT-A-A-A-------A---T------ATG--------GG-A--A--A--TA----AC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GG-GGA-AT-A-----ATC-C-TT
gi|46488                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTGTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TA----AC---CA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GAA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C-A-CG--AGG-GA-GGA-T
gi|46489                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATATATTTAG--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---TAAATCTATG--------GG-A--A--G--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGATCG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--T--------G--AGG-GT-TGA-TC-A-----A---C-TTAAactcctt
gi|46490                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCA--T--ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TC---AAC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--T---A---C-A-----T-G-T-ACA-C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C-A-GA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46491                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AT-AT--A----AC-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TT----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--TCA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-C-C-------T-G-T-GCA-A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AAG-G--GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46492                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TG-ATA------AT-AC--A----AT-C-A-AT-T----A---T----CTATG--------AG-A--A--A--TA----GC---CA---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCCG--TT-TTA------A--AT--A----AT-G-A-TT-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--TA----CC---AA---G-T-------T--T---------T-------------------TCA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--T---A-T-G-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-G-TG--AAG-AT-TGA-TC-A-----A-C-CATTAA
gi|46494                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46495                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGG--TT-ATA------ATCAT--ACTGTAT-T-A-AT-T----A---T----CTATG-----------------A--TA----AC---AATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TAA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-G---G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C-T-GA--AGG-GG-GGA-T--A-----A-T-C-TT
gi|46496                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTT----------------A--AT--G----AT---A-ATCT----A---T----TGATA--------GA-A--A--A--TA-----T---AA---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--AAA-ATAAAG---A---C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T-A-TG--AAG-GT-AGcaa
gi|46497                      :                                                                                                                                                                                                            TTTTC---TT-ATAT-----G--AT--A----AT-----AT-T----A---T----CT-----------GG-A--A--A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--TCA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--ATA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C-A-CG--A---GT-GGA-TC-C-----ATC-C-TTAA
gi|46498                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TTTATAGAAA--A--AT--A----A----A-AC-T----AGATT----CTATGCGACATGCGG-ATAA--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-TAGCA-T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----A-A--------A---C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C-ATCG--A-G-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-T
gi|46499                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-GGA------A--A--------AT-T------T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TA---AAC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--TT------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-AAA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GG
gi|46500                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGGAATT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----TTATT--------AG-A--A--A--TA----AC---AT---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--TCA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--T---A-T-A-G-----T-G---GCA-
gi|46501                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTG--TT-ATA------A---------------------C----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TG----AC---AAAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-TCA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--T---A-T-C-A-----TAG-T-GGA-C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CAA-TG--AGT-GT-
gi|46502                      :                                                                                                                                                                                                         TTTGTTTCG--TT-ATA------A--ATTGA----CT-T-A-AT-----------------ACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---AT-TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------ATC-T----C--A----G------T-T---A--T----C--A---TA----T--------C--A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATAA-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A---------A----T----A--T--T---C--------G--AAA-AAAAAAAACA---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GTCTGA-TC-A-----A-C-T-CTAA
gi|46503                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCC--TT-A--------A--AT--AG---AT-TGA-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--TCACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGATTC-A-----T-CGC-TTAA
gi|46504                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TT-ATATG----A--TT--A----AT-T-A-AT-TT---G---T----CTATG--------GG-A--AC-A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA---A-CG--AGG-TT-GGA--C-A-----A-C-T-TTAA
gi|46505                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--CT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CCATG--------GA-A--A--A--TA-----C---AACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------AT--T----T--G----T------T-TA--A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--A---A-T-A-A-----T-----TTA-A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----TTGT--C---T--------G---AA-A--------A---C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GGC-TC-A-----A-G-C-TTAA
gi|46506                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---T----T-----A------
gi|46507                      :                                                                                                                                                                       ttttttaacttctaattcattaatataattcatataaTTTTTG--TT-ATA------AT-AT--A----AT----------------------CTATG--------GA-A--AT-A--TA-----C---AA---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--T---A-T---A-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G---AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GA-GGA-TA-A-----T-C-C-TT
gi|46508                      :                                                                                                                                                                                                                  --TT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-----------------AT------------A--A--A--C---------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TTA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG-------------------C-A-----C-G-A-GCA-A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C-A-
gi|46509                      :                                                                                                                                                                                                            tcttaa--TT-ATG------T--GT--A----AT-T-G-AT-T----A---C------ATG--------GA-A--A--A--TA----G----AG---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T-----------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---T-T-C-A-----C-G-C-GCA-A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--CAATA--------A---G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C-A-CG--AGG-AT-CGA-TCTACATGTA-C-C-TTAAt
gi|46510                      :                                                                                                                                                                                                   ttttaaaattaTTTG--AT-ATA------G--AT--A----AT-C-A-AT-T----A---T----T------------GA-A--A--A--T-----GT---AAAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--ATA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--T---A-A-C-G-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--CAA-A--------AT--T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T-A-TG--ATG-GT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-------T--T---------T------C---AAT---A--TCA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---GGT-C-A-----T-G-C-ACA---------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46512                      :                                                                                                                                                                                        ttgtagttttagttgataagtataaaacaT-ATA------G--AT--A----AT---G-AT-T----A---T----TCATA--------GA-A--ATTA--TA-----C---A----C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--TCA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GCA-C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGT-GT-GGA-GC-T-----A-C-C-TTAAg
gi|46513                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-A-AT-C----A---T----CTATG--------GG-----------------C---A-----------------T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46514                      :                                                                                                                                                                                                                 atatt-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-G-------------CTATG--------GG-A--A--A--TGAG--GC---AA---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--TCA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-CAA-----A-G-T-GCA-A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AGA-A--------C---C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C-ATCGGAAGG-GT-GGA-T
gi|46515                      :                                                                                                                                                                                                                        TA------A--TT--A----ATAT-A-AT-T----A---T----CTAT---------------------TA----GC---GA---T-G-------A--TGCGA-----T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-GTT-GCA-GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--GAA-A--------A---C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C-ATTG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46516                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----TT-C-A-AT-T----A---C----TTATG--------GA-C--A--A--TT----TC---AA---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--TCA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--T---A-T-C-A-----C-G-A-TCA-A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--TTA-A--------A---C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C-A-TG--AAG-TT-GGA-
gi|46517                      :                                                                                                                                                                                                                                      ac----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--AAATA----AA---AC---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--CCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                                                                                                                                                                                                                                 tttT--A----AA-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GT-A--A--A--TA----GC---AA---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--TCA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-C-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-TG--AGG-GT-TTA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46519                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-G-AT-C----A---T----CTATA-----------A--A--A--T----------------------------T---------T------G---AGT---A---CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--T---A-C-T-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------ACA-A--------A---C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-GC-C-----A-C-C-TTAA
gi|46520                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-A-AT-TTCAAA---T----CTATG--------A----------------------AA---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--A---A-T-C-A-----T-G-C-GCATT----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-AAA-A--------A---C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C-A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-G-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TATATGGC--------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--TC-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--T---A-T---------T-T-A-GCA-A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--ATC-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C-T-TG--AGG-GT-GGA-
gi|46522                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--TTA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--T---A-T-T-ACTGTAT-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--CAA-A--------A---CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--GGG-AT-CGA-TC-T-----A-C-C-TTAAattatcct
gi|46523                      :                                                                                                                                                                                                                        taatgtctctttaagtaagaaaaaaaacc-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--T------CTTTAA---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--TCG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--T---A-T-A-T-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--CAA-GT-------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-T-TG--AAG-AT-CAA-TC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--AT--------C---T----T--A----T------------A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G----A-A--------A---C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C-A-CG--A------GGA-TC-ATTC--A-C-T-TTAA
gi|46525                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ataaac--A--TA----GA---AA---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--TCA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-AAT-A----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--CAA-G--------A---------------------------------------CG-C-A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A---T-T-------T--T---------T------T------------TTA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA-------------------------------C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C-T-TG--AGG-AT-CGC-TC-T-----A-C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A---------------------------------------------------------------------------------------CA-C-A-CG--AGG-GT-GTA-TC-A-----A-C-C-TT
gi|46528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A---CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA--------C--T---G-TAC-A-----A-G-A-ACA-A----T-GTT-T--------------------------------------------A----T----T--G--C---T------------AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-AG--AGG-AT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CAA-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TCA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----TTCA----T------T-----A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--T---G-T-C-A-----T-G-C-ACA-A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TGA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-------T-A-A-ACC-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A--------------------------------AC-G--TCA-T-A-CG--AGA-AT-GGA-CC-T-----A-T-C-TT
gi|46534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TCA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-TTC-A-----T-G-T-GGA-C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------AAACC---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC-A-TG--AGG-GG-GGA-TA-A-----T-C-C-TTta
gi|46535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--ACA-A--------A---C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGA-GT-GGA-TC-A-----A-C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--T---A-T---A-----TAG-T-GTA-A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTAAA-AT-------A---CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGGAAT-GGG-TC-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-T-C-ACA-A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C-A-CA--AAG-ATCGGA-TT-A-----
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAG-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GGA-A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A-A-TG--AGC-AT-TGA-TC-G-----A-C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--AAA-A--------A---T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C------------A-----T-G-T-GCA-A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AGA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--AAA-A--------A---A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GAA-CT-A---------C-TTA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  AA  T   TATTTA TC  TG CTGT  TG  C    TCAA GAT AAAT     CGACATGC GG TA TT AA  TATGG TTT  CAT   GTTTTTT GT CTTAGTTTTT       TCG   TCA GA     ATATCAACTTT  TC   A  T TAG  CA GTTTTGGTGT   AAC GAGA TGGTT   GTCTCT   TTA GT GTTG TT AGG  AATA TATGCA      AGTT                   AT   AT     G  TAG ACTG TTA A A AT GTGC CTGTA  TAGT        ATA T A   CTGTA A TA      ATTT         CTCT C TATTTTT      TGC TACATG G TAAG T    TTTTG     AA    GCA TTTTTTGG TT     AAAAAAAC AAC CCT GTTT TTTGA CAGCTG   TATC  T TG     A TC GA      C        CATGT T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   GAAA   T   T  TTT   AT  .    T    .   .        .        GG .  C  A   AGG   .    TT    .       .  TTCAATC          .     CT  A      AT           A    A  G A    T  TAA          TC  C    AGC     G        TGC G  ATT  T  .    .    .           C                      T    G      C  CC  AG   TAT C C T  .    G      T           .   T T   .     A TT      .            T    C TGTTAA       .   .      T C    G    AAAGT     TG    .   .        C      TAAAG    T   A   CT   AC    AG       .     A T      A TC .       C        TTC   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   TG     T   .  G     T   .    .    .   .        .        G  .  T  .   G     .    AA    .       .  TTTTTT           .     T   T      AT           A    .  T .    G  AT           T   .    TTA     A        TT  A  AG   G  .    .    .           A                      .    .      .  G   A    T   . . .  .    T      .           .   G .   .     . T       .            .    T CTGAA        .   .      . .    .    TATA      .     .   .        C      T        .   .   .    A     .        .     . G      . TT .       .        T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   T      T   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    AC    .       .  GCGAT            .     .   .      AT           T    .  . .    .  CA           .   .    TAA     G        T   .  A    .  .    .    .           .                      .    .      .  C   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    T TTGAT        .   .      . .    .    TT        .     .   .        T      T        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    C     .       .  TTC              .     .   .      AC           .    .  . .    .  AG           .   .    TCA     .        T   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TGGC         .   .      . .    .    TT        .     .   .        C      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    C     .       .  TTT              .     .   .      TA           .    .  . .    .  GT           .   .    AA      .        A   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TCGT         .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  TTT              .     .   .      AG           .    .  . .    .  AT           .   .    A       .        T   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GAT          .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  TT               .     .   .      AT           .    .  . .    .  GA           .   .    A       .        C   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . AAC          .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     A   .    .    .   .        .        G  .  .  .   A     .    .     .       .  TT               .     .   .      AC           .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GAA          .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   A     .    .     .       .  TT               .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . AGA          .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  TT               .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GAA          .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . G  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   T     .    .     .       .  TT               .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  TT               .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     C   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  TT               .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . G  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     G   .    .    .   .        .        A  .  .  .   C     .    .     .       .  TG               .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   A     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . AA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   T     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   T     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   A     .    .     .       .  C                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   A     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  G            .   .    C       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   C    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     C   .    .    .   .        .        A  .  .  .   T     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . A       .            .    . AA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     C   .    .    .   .        .        G  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GG           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .   .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   T     .    .     .       .  G                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                      .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   A     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                      .   .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        T  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    G       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . A  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                          .      .   .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   G     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                     .  .     T   .    .    .   .        .        A  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . A       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                     .  .     .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                     .  .     .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      C            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . TT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                     .  .     .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . AA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                        .     .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . A       .            .    . TA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . TC           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                              .   .    .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . A  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .    .   .        .        .  .  .  .   .     .    .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . TT           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                        .  .   .     .    .     .       .  A                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .        .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .        .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  C                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    G       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . A       .            .    . TA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    A         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . C  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     .       .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  G            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . A       .            .    . CA           .   .      . .    .    T         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .       .  T                .     .   .      T            .    .  . .    .  A            .   .    T       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .  T                .     .   .      A            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .   .      .            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   T    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GT           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . T  .       .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .   .      .            .    .  . .    .  A            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . GA           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      . .  .                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .   .      .            .    .  . .    .  .            .   .    C       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    . GA           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      .    .                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .      .            .    .  . .    .  .            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   G    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . CA           .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  . .    .  .            .   .    A       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   A    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . G            .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .      .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .            .   .    .       .        .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   .    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . G            .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .        .     . .                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .   .  .    .  .    .    .           .                      .    .      .  .   .    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . G            .   .      . .    .    .         .     .   .        .      .        .   .   .    .     .                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .    .    .           .                      .    .      .  .   .    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . G            .   .      . .                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .                      .    .      .  .   .    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . T       .            .    . .            .   .                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .    .      .  .   .    .   . . .  .    .      .           .   . .   .     . C       .            .    .                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .  .    .      .           .   . .   .     . .       .                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  .    .      .           .   . .   .     . .                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  .    .      .               . .   .     .                                                                                                                                                                                      


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                         
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  11  1   888888 55  22 5555  111 1  1 3333 111 2222     33333333 44 11 33 22  66666 111  666 0 2222222 11 1111111111111111 111   333 22   0 888888888888 33 0 1  2 222  22 555555555555 222 2222 3333333 444444 0 666 22 4444 22 111  1111 111111 0 00 2222   00  00 0 00 00  11 0 11 00  1  333 2222 333 1 1 11 1111 22222  2222   0 00 111 1 1 0 11111 1 444   0 1111 0   0 0 2222 2 666666666666 111 111111 1 2222 1  0 444444444 11 00 111 22222222 33   0 55555555 111 111 2222 33333 222222 0 1111  1 22   0 1 44 11   0  1   0  0 44444 1 1 1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  ..  .   ...... ..  .. ....  ... .  . .... ... ....     ........ .. .. .. ..  ..... ...  ... . ....... .. ................ ...   ... ..   . ............ .. . .  . ...  .. ............ ... .... ....... ...... . ... .. .... .. ...  .... ...... . .. ....   ..  .. . .. ..  .. . .. ..  .  ... .... ... . . .. .... .....  ....   . .. ... . . . ..... . ...   . .... .   . . .... . ............ ... ...... . .... .  . ......... .. .. ... ........ ..   . ........ ... ... .... ..... ...... . ....  . ..   . . .. ..   .  .   .  . ..... . . .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                  88  2   999999 33  66 1111  555 0  0 0000 777 1111     55555555 77 33 22 33  99999 777  666 8 6666666 11 1111111111111111 444   111 55   7 888888888888 22 7 4  1 000  44 888888888888 999 2222 4444444 111111 7 888 33 3333 33 222  4444 999999 7 99 8888   99  99 7 99 99  66 7 66 99  3  444 2222 000 3 3 55 3333 88888  0000   6 99 111 9 2 6 66666 2 333   6 4444 6   6 7 0000 6 777777777777 222 999999 4 1111 4  7 111111111 99 99 222 55555555 77   7 66666666 999 999 4444 44444 999999 7 5555  4 44   7 4 22 00   8  5   8  9 99999 9 0 0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
Reference ( family-349 )      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46480                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCCTTAA--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GC-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46481                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-CCAT-T----A---T----CTATG--------GG-G--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-C---A--T----T--A---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-T----A-AG-A----T----T--T--T---G--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----CC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46482                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTAAT--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A---A--T----A-----TA----TTT-CTAT---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-GT---T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----A--A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-AT----C-C-C-TTAA
gi|46483                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCC--TT-ATA------A--TT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--AA-TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-AA--CC--ATAA---------A---T----T--A----A------T-T---A--TATT-T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T------T-TT---AA--GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--GAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGA-TC-A-----T-C-C-TTAA
gi|46484                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--G----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AA---T-A-------T--T---------T------C---ACT---A--ATA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TC----T------C-C--A----ATA--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TA---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-G----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-CTAA
gi|46485                      :                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTCG--TT-ATT------A--TT--GTTT-AT-T-A-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TTTG---CC--A--A---------A---T----T--A----T------C-G---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--GT--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-T-TTAA
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-ATA------A--ATT-A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GG-A--A--A--TA----GC---AT---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-CT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----T---A------A-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----GC-A--TCA-C-A-
gi|46486                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-Tttatttttgaaaaacctttgcacacatgagggtggatcaacct
gi|46487                      : tttttttagttataaattaattaattatctatgggaaatagcatttttttcactatcaaacgtctaccaaattatttatgatatccagtgaatgaaattcctttagaagatatatttctatcatgtgcaaagtttaataataaaaagatttttgaaaaacctttggcatcacattatttttgaaaaacctttgcacacatTTTTTTTGG--TT-ATA------A--AT--A----AT-A-A-A-------A---T------ATG--------GG-A--A--A--TA----AC---AA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TG----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GG-GGA-AT-A-----ATC-C-TT
gi|46488                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTGTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TA----AC---CA---T-T-------T--TT--------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---GC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--C----T--A---TA----T------T-C--A----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GAA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---A--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----G------T-G----AC-A--T---C-A-CG--AGG-GA-GGA-T
gi|46489                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATATATTTAG--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---TAAATCTATG--------GG-A--A--G--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACT---AGATCG-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----A--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--G--CT-TT---C---GA---A-G-A--T----A-----TA----ATT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--T--------G--AGG-GT-TGA-TC-A-----A---C-TTAAactcctt
gi|46490                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCA--T--ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TC---AAC--T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-T----------T--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------T-C--A----GTG--AA--T-C--A--AA--T-TATC--TT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----CA----TTT-C--T---A---C-A-----T-G-T-ACA-C----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------C-G----AC-A--TCA-C-A-GA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46491                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------AT-AT--A----AC-T-A-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TT----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---TCTCT-A--TCA-A-A----------AA-G-T-TT-A---CCCAA--A---------A---A----T--A----T------T-TT--A--T----C--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G--A------T-T--C-----TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TGT-C--T---A-C-C-------T-G-T-GCA-A----A-GTT-C-A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C--------T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AAG-G--GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46492                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TG-ATA------AT-AC--A----AT-C-A-AT-T----A---T----CTATG--------AG-A--A--A--TA----GC---CA---T-T-------TGTT---------C------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-T---CC--A--A---------A---C----T--A----T------T-T---A--T----C--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----
gi|46493                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTCCG--TT-TTA------A--AT--A----AT-G-A-TT-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--TA----CC---AA---G-T-------T--T---------T-------------------TCA-A-T----------A--G-T-GA-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T--------------------T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-G--T----A-----TA----TTT-A--T---A-T-G-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----C-AG-A----T----G--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-G-TG--AAG-AT-TGA-TC-A-----A-C-CATTAA
gi|46494                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTCG--TT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----CTACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TT-----C---ACA---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----C--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--
gi|46495                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGG--TT-ATA------ATCAT--ACTGTAT-T-A-AT-T----A---T----CTATG-----------------A--TA----AC---AATT-T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TAA-G-A----------A--GTT-TT-A---CCT-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---T-----T------CAG--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---G-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-G---G----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A-------C----T-----A------T------AC-A--T-A-C-T-GA--AGG-GG-GGA-T--A-----A-T-C-TT
gi|46496                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTT----------------A--AT--G----AT---A-ATCT----A---T----TGATA--------GA-A--A--A--TA-----T---AA---A-C-------T--T---------T------C---AGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-T---TG--A--A---------A---A----T--C----T------T-T---A--T----T--G---TA----C------C-C--A----GTA--AA--T-G--A--A---T-T--C--CT-CC---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----TTTTGT--T--T---T--------A--AAA-ATAAAG---A---C---G----T-----A------T-G----AT-G--TCA-T-A-TG--AAG-GT-AGcaa
gi|46497                      :                                                                                                                                                                                                            TTTTC---TT-ATAT-----G--AT--A----AT-----AT-T----A---T----CT-----------GG-A--A--A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACA---A--TCA-G-A----------A--G-T-CT-GTAGCC--A--AT--------G---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A-----T---AA--T-G--A--AA--T-T--C--CTGTT---A----A---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A--TT-T-AT---A-T----G-AT----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--ATA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TC--C-A-CG--A---GT-GGA-TC-C-----ATC-C-TTAA
gi|46498                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TTTATAGAAA--A--AT--A----A----A-AC-T----AGATT----CTATGCGACATGCGG-ATAA--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACC---A--TCA-A-A----------G--G-T-TT-A---CT--A--G---------AAACT----T--A----TG-----T-G---A--T----T--A---TA----G------T-C--A----GTG--AA--T-GTAA--AA--T-------CT-TT---A---GA---A-G-AT-T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-TAGCA-T----A-GTT-A-A----G-T----G--------------------A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G----A-A--------A---C---G----T-----A------T-G----AC-AT-TCA-C-ATCG--A-G-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-T
gi|46499                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTAG--TT-GGA------A--A--------AT-T------T----A---T----CTATG--------GA-A--A--A--TA----TA---AAC--T-T-------T--T---------T------C---AGT---A--TT------------------T-T-TT--------------------------T----T--A----T------T-TTTAA--T----T--T---TA----T------C-C--A----GCA--AA----A--A--AA--T-T--C--CT-CT---A---AA---A-G-A--T----T-----TA----AGT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-G----A-GTT-T-A----ACT----G-----------A------TGA----A-AG-A----T----TAAT--A---C--------GC-AAA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GG
gi|46500                      :                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTGGAATT-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-T----A---T----TTATT--------AG-A--A--A--TA----AC---AT---T-T-------T--T---------TTTTTT-C---ACTT--A--TCA-A-A----------T--G-T-T--A---CC--A--A---------T---T----A--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--T--CC-TT---G---GA---A-G-A--T----A-----TA----TAT-C--T---A-T-A-G-----T-G---GCA-
gi|46501                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTG--TT-ATA------A---------------------C----A---T----CTATG--------GGGA--A--A--TG----AC---AAAA-T-T-------T--T---------T------CTCGACT---AA-TCA-A-A----------AA-G-TATT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----TT-A---TA----T------C-C--AAGTTGTGGGAACTT-A--A--AAATT-T--C--CT------G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTTTC--T---A-T-C-A-----TAG-T-GGA-C----A-TTTAT-A----A-TTGTTA-A-----A---A------T-A----A-AATA----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---CGTTTT-----AAG----T-A----AC-A--TCA-CAA-TG--AGT-GT-
gi|46502                      :                                                                                                                                                                                                         TTTGTTTCG--TT-ATA------A--ATTGA----CT-T-A-AT-----------------ACG--------AG-A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--T---------TTC----C---ACT---AT-TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--AC-A---------ATC-T----C--A----G------T-T---A--T----C--A---TA----T--------C--A----GTG---------------------------------------------G-A--T----A-----TA----TTT-C--TATAA-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-ATT-T-A----A-T----A-AC----A---A------T-A---------A----T----A--T--T---C--------G--AAA-AAAAAAAACA---C---T----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GTCTGA-TC-A-----A-C-T-CTAA
gi|46503                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCC--TT-A--------A--AT--AG---AT-TGA-AT-T----A---T----CTATG--------G--A--A--A--TA----GC---AA---T-T-------T--G---------G------C---AC----A--TCACA-A----------A--G-TATT-A---CC--A--AG--------A---T----T--A----T------T-T---A--TA---T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AAT-T-T--C--CT-TTG--A---GA---A---A--T----AG----TA----TTT-C--T---ATT-C-A-----T---T-GCA-A----A-TTT-T-A----A-T----G-------A---A------T-A----A-AG-G---------T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-A--TCA-C-A-CG--AGG-GT-GGATTC-A-----T-CGC-TTAA
gi|46504                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--TT-ATATG----A--TT--A----AT-T-A-AT-TT---G---T----CTATG--------GG-A--AC-A--TA----TC---AA---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-TT--A--T----T--A---TC----T------C-C--AC---GTG--AA--TTG--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----A-A-----A---A------T-A----A-AG-A------------T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AA-T--TCA---A-CG--AGG-TT-GGA--C-A-----A-C-T-TTAA
gi|46505                      :                                                                                                                                                                                                          TTTTTTCG--CT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-T----A---T----CCATG--------GA-A--A--A--TA-----C---AACATT-T-------T--C---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CT--A--G---------AT--T----T--G----T------T-TA--A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-A--T--TA--T-T--C--CT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----GA----TTG-A--A---A-T-A-A-----T-----TTA-A----A-----T-A----A-T----G-T-----A---A------C-G----A-AT-A----T----TTGT--C---T--------G---AA-A--------A---C---T----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-AT-GGC-TC-A-----A-G-C-TTAA
gi|46506                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---CA--A--A---------G---C----T--T----T------T-TTGCA--T----T--A---TA----C------C-T--A----GTA--CA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---CA---A-T-A--T----A-----GA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-C----A-TTT-T-G----A-T----G-G-----A---A------T-A----A-AG-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---T----T-----A------
gi|46507                      :                                                                                                                                                                       ttttttaacttctaattcattaatataattcatataaTTTTTG--TT-ATA------AT-AT--A----AT----------------------CTATG--------GA-A--AT-A--TA-----C---AA---T-T-------T--TTT-------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CCG-A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A-------T--A---TA----T------C-C--A-----TG--AA--T-G-----AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---A-T-A--T----AT----TAT---TTT-C--T---A-T---A-----T-G-T-GGA-C----A-TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G---AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GA-GGA-TA-A-----T-C-C-TT
gi|46508                      :                                                                                                                                                                                                                  --TT-ATA------A--AT--A----AT-T-G-AT-----------------AT------------A--A--A--C---------------T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TTA-A-T----------A--G-T-TG-A---CC--A--A---------A---T----T-------T------T-C---G--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TC---A---AA---A-T-A--T----G-----TG-------------------C-A-----C-G-A-GCA-A----T-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--TGCAT--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T------AC-A--TGA-C-A-
gi|46509                      :                                                                                                                                                                                                            tcttaa--TT-ATG------T--GT--A----AT-T-G-AT-T----A---C------ATG--------GA-A--A--A--TA----G----AG---T-T-------T--T---------T------A---ACA---A--T-----------------------------------------------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--T---CA----T------C-A--A----GAG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--TT-TC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---T-T-C-A-----C-G-C-GCA-A----A-ATT-T-ACTCTA-TTG--G-C-----C---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--CAATA--------A---G---C----T-----ACAGCTGT-A----ACTA--T-A-C-A-CG--AGG-AT-CGA-TCTACATGTA-C-C-TTAAt
gi|46510                      :                                                                                                                                                                                                   ttttaaaattaTTTG--AT-ATA------G--AT--A----AT-C-A-AT-T----A---T----T------------GA-A--A--A--T-----GT---AAAC-C-T-------T--T---------T------C---GGT---A--ATA-A-AT---------A--G-T-TTGA---CC--A--A---------A---T----T--A----TA-----TAT---A--T----C--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--A-T--C--CT-CC---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTC-C--T---A-A-C-G-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-ATTTTTT---T------T-A----A-AT-T----T----T--T--T---TTTTTTTGGG--CAA-A--------AT--T---T----T-----A------T-G----AC-T--TCA-T-A-TG--ATG-GT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46511                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-------T--T---------T------C---AAT---A--TCA-A-AC---------A--G-T-TTTA---CC--A--A---------T---T----T--T----TG-----T-T---T--T----T--A----A----C------T-C--A----GGG--AA--T-A--A--AA--T-TG-T--CT-TC---C---AA---C-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---GGT-C-A-----T-G-C-ACA---------TT-T-T----A-TCTG-A-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----CTTTGAA------T-G----AC-A--T
gi|46512                      :                                                                                                                                                                                        ttgtagttttagttgataagtataaaacaT-ATA------G--AT--A----AT---G-AT-T----A---T----TCATA--------GA-A--ATTA--TA-----C---A----C-C-------T--T---------T------C---GAT---A--TCA-A-C----------TT-G-T-TT-A---CC--A--A---------T---T----T--T----T------T-TT--A--T----T--G---TA----C------A-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--A--TT-TC---A---AA---G-G-A--T----G-----TG----TTT-C--T---A-T-C-G-----T-G-T-GCA-C----G---T-C-A----A-T----G-A-----C---A------T-A----A-AT-A----T----T--T--T---A--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGT-GT-GGA-GC-T-----A-C-C-TTAAg
gi|46513                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-A-AT-C----A---T----CTATG--------GG-----------------C---A-----------------T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----GAA-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46514                      :                                                                                                                                                                                                                 atatt-ATA------A--AT--A----AT-T-A-AT-G-------------CTATG--------GG-A--A--A--TGAG--GC---AA---T-T-------T--T---------TTCAATCC---A-T---A--TCA-A---------------G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--AA---T------C-T---AG-T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--C-G--A--AA--TAT--C--CC-TTTAGA---GA---A-GAA--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-CAA-----A-G-T-GCA-A----A-ATT-TAA----A-TA---G-A-----A---A------T------A-AG-A---------T--T--T---T--------G--AGA-A--------C---C---C----GA----A------T-G----AC-AG-TCA-C-ATCGGAAGG-GT-GGA-T
gi|46515                      :                                                                                                                                                                                                                        TA------A--TT--A----ATAT-A-AT-T----A---T----CTAT---------------------TA----GC---GA---T-G-------A--TGCGA-----T------C---ACT---A--TCA-A-A----------C--G-T-TT-A---CC--A--G-------------T----T--A----T------T-T---A--T----TTTA---TA----C------C-CTTG----TTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TTCC-A---GG---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-GTT-GCA-GATTTA-GTT-C-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----ATAG-A----TATA-T--T--G---T--------G--GAA-A--------A---C---CCT--C-----A------T-G----ACAA--TCA-C-ATTG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46516                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----TT-C-A-AT-T----A---C----TTATG--------GA-C--A--A--TT----TC---AA---T-T-------T--TCTTAGTTTTT------T---AGT---G--TCA-G-A----------A--G-T-TT-G---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-A---A--T----T--T---CG----T------C-C--G----GT----A--T-A--A--AA--C-A--T--CC-CC---A---AA---G-G-A--T----A-----TT----TTT-C--T---A-T-C-A-----C-G-A-TCA-A----ACG---T-A----ACT----GAA-----A---A------T-A----AGAG-T----T----T--T--T---T--------T--TTA-A--------A---C---C----C-----A------TCG----TC-A--TCA-C-A-TG--AAG-TT-GGA-
gi|46517                      :                                                                                                                                                                                                                                      ac----AT-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GA-A--A--AAATA----AA---AC---C-T-------C--T---------T------G---ACT---A--CCA-A-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------A-T---A--T----T--T---TA----T------C-T--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CTCTT---AACTGA---T-G-AATT----A-----TA----TTT-C--
gi|46518                      :                                                                                                                                                                                                                                 tttT--A----AA-T-G-AT-T----A---T----CTATG--------GT-A--A--A--TA----GC---AA---T-TGTTTTTTT--T---------TG-----C---AAT---A--TCA-ATA----------A------TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T---------------------------------------------G--AA--T-G--A--CA--A-C--C--CT-TT---A---GA---A-G-A--T----T-----T-----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-C-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-TG--AGG-GT-TTA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46519                      :                                                                                                                                                                                                                                    T--A----AT-T-G-AT-C----A---T----CTATA-----------A--A--A--T----------------------------T---------T------G---AGT---A---CG-A-A----------ATCG-C-TT-A---CC--A--GT--------A---T----T--T----T------T-T---T--T----T--A---TAAATAC------C-A--A----GTG--AA--T-G--A--AT--T-T--T--TT-TC---T---AA---A-C-A--TGTGCA-----TT----TTT-C--T---A-C-T-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T----------T-AC---A-AG-A----T----T--T--T---------------ACA-A--------A---C---C----C-----A------T-G----AT-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-GC-C-----A-C-C-TTAA
gi|46520                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-A-AT-TTCAAA---T----CTATG--------A----------------------AA---C-T-------T--C---------T------C---ACTTCAA--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A---------------------T--AGC--T------T-T---A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TATAGTTTT-C--A---A-T-C-A-----T-G-C-GCATT----T-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T--------AG-A----T----T--T--T---T--------AT-AAA-A--------A---C---C----T-----A------A-G----AC-A--CCA-C-A-AG--AGG-
gi|46521                      :                                                                                                                                                                                                                                             T-T-G-AT-T----A---T----CTATA--------GA-A--A--A--TATATGGC--------T-T-------T--T---------A------T---GGT---A--TC-----------------------T-----CC--A--A---------A---T----T--G----T------T-T---T--TGTTGT--AAGGTA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-AT---A---AAT--A-G-A--T----A-----TA----TTT-T--T---A-T---------T-T-A-GCA-A-------TT-T-A----T-T----A-A-----A---T------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------C--ATC-A--------A---C---T----T-----A------T-G----AC-ATGTCA-C-T-TG--AGG-GT-GGA-
gi|46522                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-T-------T--T---------T------C---ACA---G--TTA-A-T----------A--G-T-GT-A---G---A--A---------A---T----TTTA----T------T-T---AGTT----T--T---TA----T------C-C--G----GTG--AA--T-A--A--AA--T-------CT-TC---A---GA---AAG-A--C----A-----TA----TTT-T--T---A-T-T-ACTGTAT-G-C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-TTT--G-AT----A---A------TTA----A-AG-A----T----T--T--T---C--------G--CAA-A--------A---CA--C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--GGG-AT-CGA-TC-T-----A-C-C-TTAAattatcct
gi|46523                      :                                                                                                                                                                                                                        taatgtctctttaagtaagaaaaaaaacc-T----A---T----CTATG--------AA-A--A--A--T------CTTTAA---T-T-------T--T---------TTT----C---ACC---A--TCG-A-T----------A--G---------------------------A---T-------A-----------------A--T----G--A---TA----T------C-C--A----GTG--GA--T-A--A--AA--A-T--C--GG-TG---A----A---A-G-A--T----T-----TG----TTT-T--T---A-T-A-T-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----T---ATACATGT-A----A-AT-A----T----T--T--C---T--------A--CAA-GT-------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-T-TG--AAG-AT-CAA-TC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46524                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-C-------T--T---------T------T---ACT---A--TCA-T-T----------A--G-T-TT-A---CC--A--AT--------C---T----T--A----T------------A--T----T--T---TA----T------C-C--A----GTA--AA--T------------------------------------------------A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-C-----A---T------T-A----C-AG-A----T----T--TTGT---T--------G----A-A--------A---C---C----T-----A------T-A----AC-A--TCA-C-A-CG--A------GGA-TC-ATTC--A-C-T-TTAA
gi|46525                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ataaac--A--TA----GA---AA---CGT-------T--T---------C------C---AGT---G--TCA-A-AG---------A--G-T-TT-A---CC--A--GTTTTGGTGTG---T----T--T----T------T-T---A--T----A--A---TA----C------C-A--A----GTG--AA--T-A--C--AC--T-T--C--AT-CC---A---AA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-C-AAT-A----A-GTA-A-A----A-T----G-A-----A---A------T------A-GG-A----T----T--T--C---T--------G--CAA-G--------A---------------------------------------CG-C-A-CG--AGG-AT-G
gi|46526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A---T-T-------T--T---------T------T------------TTA-A-A----------A----T-CT------C--A--A---------A---T----TTAA----C------T-T---T--T----T------------T------T-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-CT---G---AA---A-GCA--T----A-----TA-------------------------------C-ACA-A----A-GTT-T-A----A-T----T-T-----A---A------T-A----A-AA-AAAAGT----T--C------------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AT-A--TTA-C-T-TG--AGG-AT-CGC-TC-T-----A-C-C-TTAaggatgg
gi|46527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat---T-T-------T--T---------T------C---ACT---A--TGA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--G---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-T-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---G------T-A----A-A---------------------------------------------------------------------------------------CA-C-A-CG--AGG-GT-GTA-TC-A-----A-C-C-TT
gi|46528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------T--T---------T------C---ATT---A---CA-A-ATATCAACTTTA--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--T----T------T-TTT-A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--G--AA--T-T--A--AT-TC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-T-A-----T-
gi|46529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---T-T-------C--T---------T------T---GGT---A--TCA-A-AT---------A--G-T-TT-A---TC--AG-A---------A---TGAGAT--A----T------T-TC--A--T----G--A---TA----C------C-C--A----GTG--AA--T-A--AACAA--T-T-----CT-CC---A---AA---A-G-A--T----A-----TA--------C--T---G-TAC-A-----A-G-A-ACA-A----T-GTT-T--------------------------------------------A----T----T--G--C---T------------AA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-T-A-AG--AGG-AT-GGA-AC-T-----A-C-C-TTAA
gi|46530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -------T--T---------T------C---ACT---A--TCA-A-A----------A--G-T-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--A----T------T-T---A--T----T--A---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---T-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---------------AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-CAA-TG--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T---------T------C---ACT---A--TCA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--G---------A---T----T--TGGTTT------T-T---A--T----T--A---TA----C------C-C--A----GCG--AA--T-A--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---AATTAA-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-
gi|46532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TCA-A-AC---------A--C-T-TT-A---CC--A--A---------C---T----TTCA----T------T-----A--T----T--A---TA----C------T-C--G----GTG--AA--C-A--A--AA--T-T--C--CT-CC---A---AA---A------T----A-----TA----TTT-T--T---G-T-C-A-----T-G-C-ACA-A------TTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----T----T--T--A---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----T------T-G----AC-A--TCA-C-A-TG--Aacaggtcctatgacggtcgcatgaggatcgccct
gi|46533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---A--TGA-A-T----------A--G-C-TT-A---CC--A--A---------A---TC---T--A----C------T-----A--C----T--T---TA----T------T-T--A----CTG--AC--T-A--A--AA--T-T--G--CT-CC---T---AA---A-A-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-------T-A-A-ACC-A----A-GTT-T-A----A-T----T-A-----A---G------T-A----A-AC-A---------T--T--T---T--------G--CAA-A--------A--------------------------------AC-G--TCA-T-A-CG--AGA-AT-GGA-CC-T-----A-T-C-TT
gi|46534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TCA-T-A----------A--A-T-TA-G---CT--T--A---------A---T----T--C----C------T-T---AA-T----T--A---TA----T------G-C--A-----TG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TG---A---GA---ACG-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-TTC-A-----T-G-T-GGA-C----A--TT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----C-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAA-A--------AAACC---T----T-----A------T-G----AC-A--TTACC-A-TG--AGG-GG-GGA-TA-A-----T-C-C-TTta
gi|46535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TT-A---CC--A--A---------A---T----T--A----A------T-T---A--TAG--T--A---TA----CTATGCAC-C--AA---GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--CATCC-TT---G--------A-G-A--T----A-----TG----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-C-ACA-A----A-GTT-T-C----ATT----G-A-----A---A------
gi|46536                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--A--A---------A---T----T--A----TGTCTCTT-C---A--G----TG-A---TA----T------C-C--A----ATG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--AT-TT---T---GA---A-G-A--T----ACTGTATA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-C----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--ACA-A--------A---C---C-----------------T-G----AC-A--TCA-C-A-CG--AGA-GT-GGA-TC-A-----A-C-A-TTAA
gi|46537                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T---A--T----T------TA----T------C-C--A----GCG--AA--T-T--A--AA--T-A--C--CT-TA---A---TA---A-C-A-------A-----TA----TTT-C--T---A-T---A-----TAG-T-GTA-A----A-GTT-T-A----A-TTC--G-T-----A---A------T-A----A----T----T----T--T--T---T--------GTTAAA-AT-------A---CCCTC----T------------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGGAAT-GGG-TC-
gi|46538                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TA----T------C-C--A----GTG--AA--T-A--A--AA--T-T--T--CT-TTC--A---GATATA-C-A--T----G-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-T-C-ACA-A----A-TTT-T-A----ATT----C-A-----ATGCA------T-G----G-AG-AT---T----T--T--T---T--------G--CAA-A--------A---C---C----TAC---A------T-GTATCAT-A--TCA-C-A-CA--AAG-ATCGGA-TT-A-----
gi|46539                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -C--A----GTG--AA--T-G--A--AA--T-T--C--CT-TT---A---GA---A-G-T--T----A-----TA----TTT-C--C---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATT-T-A----C-C----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AAG-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-TGA-TC-A-----A-C-C-TAAA
gi|46540                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G--AA--T-G--A--AA--T-C--C--CT-TT---T---GA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----G-A-----A---A------T-A----A-AA-A----A----A--A--T---T--------C--AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----GC-A--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GGA-TA-A-----T-C-C-TTAA
gi|46541                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--AA--A-T--C--CT-CT---G---AA---A-G-A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GGA-A----A-GTT-T-A----A-T----
gi|46542                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A--T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-A----A-ATA-T-A----A-T----G-T-----A---A------T-A----A-GG-T----T----T--T--T---T--------GC-AAA-A--------A---C---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-A-A-TG--AGC-AT-TGA-TC-G-----A-C-C-TTAA
gi|46543                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C--T---A-T-C-A-----T-G-T-GCA-C----A-TTT-T-A----C-A----G-A-----A---A------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------T--AAA-A--------A---T---C----T-----A------T-G----AC-A--TCA-C-A-TA--AGG-GT-GGA-TC-A-----A-C-C-TTAA
gi|46544                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T----A-----TA----TTT-C------------A-----T-G-T-GCA-A----A-GTA---A----A-T----G-A-----A----------T-A----A-AG-A----T----T--T--T---T--------G--AGA-A--------A---C--------------A------T-G----AC-A--TCA-C-
gi|46545                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-C-A-----T-G-C-GCA-A----A-GTT-T-A----A-T----C-A-----A---A------T-ATAAGA-AA-A----------------------------A--AAA-A--------A---A---T----A-----A------T-G----AC-G--TCA-C-A-TG--AGG-GT-GAA-CT-A---------C-TTA