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Reference ( gi|28494 )        :    TTCCAA-G-G-AAAC-GTACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----G-----T--------T-----C-----------T----T-G-T--CCC-C--T------A--------G-A--T--T-----TCT--T-CT--ACGCC-A---TT-C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC--C-----A---ATGC---------T--T-----A------AG-GCA----A----ATTGCA-ATGAAGAGG
gi|28457                      :    TTCCAA-A-G-AAAC-GTACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----A-----C--------T-----C-----------T----T-A-T--CCC-C--T------A--------T-A--T--T-----TCG--T-TC--ACGCC-A---TT-CTACATATACATT--CAAAT--CCT-AAA--TCT-AC--C-----A---ATGC---------T--T-----A------AG-GCA----A----AAAGCA-ATGAGGA
gi|28453                      :   aTTCCAA-A-A-AAAC-ATACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----G-----C--------T-----C-----------C----T-G-T--CCC-C--T------ATATC----A-A--T--T-----TCT--T-CT--ACGCC-C---TT-T------TACACT--GAAAT--CCT-AAT--TCC-GC--C-----C---ATGC---------T--T-----A------AA-GCA----A----ATTGaaagc
gi|28451                      :  acTTCCAA-AAG-AAAC-ATACA-G--A--A--A----CGACC-AATTAAAAT-----G-----C--------T-----C-----------G----T-G-C--CCC-T--T------ATATTTTAAA-A--T--T-----TCT--C-CC--ACACC-C---TT-C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC--C-----C---ACGC---------T--T-----A------AG-GCA----A----ATTGCA-GTGGAGAAaag
gi|28452                      :  atTTCCAA-A-G-AAAC-ATACA-G--A--A-------TGATC-AAC----AT-----G-----C--------T-----C-----------T----T-G-T--TCC-C--T------A--------T-A--T--TAACT-TCT--T-CA--GCGCA-C---TT-C------TTCATT--GAAAT--TCT-AAA--TCT-GC--C-----C---ATGC---------T--T-----A------AG-GCA----A----ATCGCA-GTGAAGc
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gi|28467                      :  atTTCCAG-A-G-AAAC-ATACA-A--A--A--A----TGACC-AGC----AC-----A-----C--------C-----C-----------T----T-A-T--CCC-C--T------A--------C-A--TA-T-----TTT--T-CC--ATGTC-C---TT----------TATT--GAAAT--C
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gi|28493                      :  atTTCCAA-A-G-AA-C-ATACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----A-----TATA-----T-----C-----------T----T-G-TC-CCC-C--T------A--------T-A--T--T-----TTG--T-CA--ATGCC-ct
gi|28487                      :   tTTCCAA-----AAAC-ATACA-G--ATAAC-A----CGATCTAGC----ATCATTTA-----T--------TTAC--C-----------T----C-G-T--CCCTC--T------A--------CCA--T--T-----TTTA-T-CC--ACGCC-A---TC-C-------A-ATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC--C-----C---ACGCAGCA-----A--T-----A------AG-GCA----A----ATTGTACATGct
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gi|28464                      :    TTCCAA-A-A-GAAC-ATACA-G--A--A--A----CGACCAAAT----AT-----A-----T--------TACTC-T-----------T----T-G-T---CC-C--T------A--------T-A--T--T-----TTG--T-CC--ATGCC-ct
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gi|28492                      :       CAA-A-G-AAAC-ATACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----A-----TATAC----T-----C-----------T----T-G-T--CCC-C--T------G--------T-A--T--T-----TTG--T-CC--ATGTC-----TT-C------
gi|28491                      :    tctCAA-A-G-AAAC-ATACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----A-----TATAC----T-----C-----------T----T-G-T--CCC-C--T------G--------T-A--T--T-----TTG--T-CC--ATGTC-----TT-C------a
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gi|28499                      :         A-A-G-AAAC-ATACA-G--A--A--A----CAACC-AAC----AT-----A-----TATAC----T-----A-----------T----T-G-T--CCC-C--T------A--------T-A--T--T-----TTG--T-CC--ATGCC-C---TT-C---------------AACT--CCT----------GC--C---------ATGT---------T--T-----AATT---AG-GCA----ACTAGATTGCA-GTTGAGAc
gi|28462                      :            -G-AAAC-ATACA-G--A--A--T----CGACC-AAC----AT-----G-----T--------T-----CGAGACGGG---C----T-G-T--CTC-C--G------A--------T-A--G--T-----TAC--T-CC--ACGCC-C---TT-C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC--C-----C---ATGC---------T--G-----C------AG-GCA----T----ATTACA-a
gi|28461                      : atttccattta-G-AAAC-ATACA-G--A--G--T----CGACC-AAC----AT-----G-----C--------T-----CGAGACGGG---C----T-G-T--CTC-----------A--------G-A--TAGT-----TAC--T-CC--ACGCC-GCCCTT-C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC--C-----C---ATGC---------T--T-----CT-----AG-GCA----A----ATTTCA-g
gi|28470                      : atttccattta-G-AAAC-ATACA-G--A--A--T----CGACC-AGC----AT-----G-----C--------T-----CGAGACGGG---C----T-G-T--CTC-CGAT------A--------G-AACT--T-----TATACT-CC--ACGCC-GCCCTT-T------TACGTT--GAAAT--CCT-ATA--TCC-GC--C-----A---TCGC---------T--T-----AC-----AGCACA----A----ATTGCA-gaggcgaag
gi|28450                      :   atttccattta-AAAC-GTACA-G--A--A--A----TGACT-AAC----GT-----A-----C--------------C-----------T----T-A-T--CCC-C--T------A--------C-A--G--T-----TTT--T-CC--CGGCC-C---TC-C------CTCATT--AAAAT--CCC-AAT--TCT-GC--T-----C---ATGC---------A--T-----A------AA-GCA----A----ATTGTA-GTGGAGgaggcgaagc
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gi|28500                      :              atttaagTACA-G--A--A--A----CGACC-AAC----AT-----G-----C--------T-----CAATTTGCAAGGT----T-G-T--CCT-C--G------A--------T-A--G--T-----TAT--T-CC--ACGTC-C---TT-C------TACATT--GAAAT--CAT-AAA--TCC-GC--C-----C---ATGCTTTTAATTTT--T-----A------AG-GCA----A----ATc
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Reference ( family-344 )      :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG
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Reference ( family-344 )      :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG
gi|28442                      :           TTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC-----T--C------CACATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAG
gi|28443                      :         atTTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--T--T-AGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---C----C------CACATT--AAAAT--CTT-AAT--TCT-GC-----TC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAGc
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gi|28445                      :         atTTCCAT---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-A--AC--------A----T-----A------TA-------T-----C-----------T-------TTGT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--TTC--CA-CGCC---ATC----------ACATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AC-GC----A----A----AGCGTA---GTGGAGAAGac
gi|28446                      :         atTTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--A--A-TGACT-A--AC--------C----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CA------AC--A----T----T-----TT--------C--C-C--CC-CGCC---TTT--C------CACGTT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28447                      :              atA-A-G-AAATA-TATA--GA--A--A-CGATT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT-----------T-C--CA-CGCC---CTT--C------CACATT--CAAAT--CCT-AAT--TCT-GT-----CC-----AT-GC---------A--T-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28448                      :          attttcA-A-G-AA-CA-TACA--GA--A--AACGATT-A--AA--------G----A-----A------C--------C-----C-----------T-------TTGT-CC---T------AC--A----A----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTC--A------CACATT--CAAAT--C---AAT--TTC-TT-----CC-----AT-GC---------A--G-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28449                      :       atttTTCCGA---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-T--AC--------A----T-----A------C----------------------------------------CC-CT------AC--G----T----T-----AC--------T--T-C--CA-CACC-----T--C------CACATT--AAAAT----T-AAAATTCT-GT-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAGc
gi|28450                      :                   at-AAACG-TACA--GA--A--A-TGACT-A--AC--------G----T-----A------C--------------C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AC--A----G----T-----TT--------T--T-C--CC-GGCC---CTC--C------CTCATT--AAAAT--CCC-AAT--TCT-GC-----TC-----AT-GC---------A--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGTA---GTGGAGTAGc
gi|28451                      :  atttccactTTCCAA-AAG-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ATTAAA----A----T-----G------C--------T-----C-----------G-------T-GC-CCC-TT------AT--A----T----T-----TTAAAATTTCT--C-C--CA-CACC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AC-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28452                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A----TGATC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-TCC-CT------AT--A----T----TAAC--TT--------C--T-T--CAGCGCA---CTT--C------TTCATT--GAAAT--TCT-AAA--TCT-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGCA---GTGAAGc
gi|28453                      :         atTTCCAA-A-A-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------C-------T-GT-CCC-CT------AT--A----TCAATT-----TC--------T--T-C--TA-CGCC---CTT--T------TACACT--GAAAT--CCT-AAT--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGAA---
gi|28454                      :         acTTCCAA-A---AAGCA-TACA--AA--A--A-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CTC-CT------AC--A----T----T-----CT--------T--C-C--CG-TGCC---CTT--C------CACATT--AGAAT--CCT--AA--TCC-
gi|28455                      :         atTTCCTA-A-G-AAACA-CACC--AA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT---C-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TAAATT--TAAA---CCC-AAA--TTC-GT-----CC-----AT-GT---------T--T-----A------GG-GC----AAATTA----ATTGCA---GTGGAGAtgtc
gi|28456                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CCAGG-------T-------T-GT-CTC-CG------AT--A----G----C-----TA--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TC--------------------C---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAA
gi|28457                      :         atTTCCAA-A-G-AAACG-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TC--------G--T-T--CA-CGCC---ATT--CTACATATACATT--CAAAT--CCT-AAA--TCT-AC-----CA-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----AAAGCA---ATGAGGAA
gi|28458                      :          aTTCCAA-A-G-AACCA-TACA--GA--A--A-TAACC-A--AC--------G----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GC-GTC-CT------AT--A----T----TCATTTTC--------T--T-C--CA-CGTT---ATT--C------TACATT--GCAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------A--C-----A------TG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAAAAGaagc
gi|28459                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----CGAGACGGG---T-------T-GT-TTC-CG------AT--A----G----T-----AC--------T----C--CA-CGCC---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GA---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GAGGCGAAGc
gi|28460                      :          aTTCCAG-A-G-AAACA-AACA--AA--A--A-CGATC-G--AC--------A----TG----A------T--------TGTC--C-----------G-------T-GT-CTC-AT------AT--C----T----T-----TT--------C--C-C--CA-TGCC---CTT--C------TACACT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GT-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAc
gi|28461                      :               at-A-G-AAACA-TACA--GA--G--T-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-AG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA-CGCCGCCCTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----CT-----AG-GC----A----A----ATTTCA---GAGGCGAAG
gi|28462                      :       atttccattt-A-G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACC-A--AC--------A----T-----G------T--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-CG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--G-----C------AG-GC----A----T----ATTACA---
gi|28463                      : atttccatttTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28464                      :         atTTCCAA-A-A-GAACA-TACA--GA--A--A-CGACCAA--AT--------ATAT-T-----A------C--------T-----CT----------T-------T-GT--CC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28465                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGAT---------------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CTT--C------AACA---------------------CC-GG-----CC-----AT-TT---------T--T-----AATT---AG-GCAGCTA----A----ATTGTA---GTTGAGAA
gi|28466                      :          atTCCAA-C-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGGCC-A--AC--------A----T-----G------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCA-CT------CT------------------------------------------C---CTGAAC------TACACT--GAAAT--GCT-AAA--TCT-GC-----AA-----AT-GC---------A--T-----A------AT-GC----A----A----A-TATA---GTGTAGCAG
gi|28467                      :        ataTTCCAG-A-G-AAACA-TACA--AA--A--A-TGACC-A--GC--------A----C-----A------C--------C-----C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AC--A----TA---T-----TT--------T--T-C--CA-TGTC---CTT-----------TATT--GAAAT--C
gi|28468                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGGCC-AATAT--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-G--CCC-CT------A---A----T----T-----TT--------TG-T-C--CA-TGCC---CTT--C-------------------------AAC--TCC-GG-----CC-----AT-TT---------T--T-----AATT---AG-GC----A----T----ATTGTA---GTTGAGAA
gi|28469                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACG--GA--A--A-CGACC-A--AT--------A----T-----A------TATACTCGAT-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-T--CA-TGCC---CTT--C----------------AGG--C---AAC--TCC-GG-----CC---------T---------T--T-----T------AG-GC----A----G----ATTGCA---GTTGAGAA
gi|28470                      :               at-A-G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACC-A--GC--------A----T-----G------C--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-CG------AT--AGAACT----T-----TA--------TACT-C--CA-CGCCGCCCTT--T------TACGTT--GAAAT--CCT-ATA--TCC-G------CC-----ATCGC---------T--T-----AC-----AGCAC----A----A----ATTGCA---GAGGCGAAG
gi|28471                      : atttccatttTTCCAA-A-G-GAACA-TACAGGGA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T------------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A---------------TT--------C--T-C--CA-CGCC---CTTC-C------TATA-T--AAAAT-----------------------C-----AT-GC---------T--TCCC--A------GG-AC----A----A----ATTGCA-----GAAGAAc
gi|28472                      :         atTTCCAA-A-ATAAATA-TACA--GA--A--G-CGAAC-A--AC--------A----T-----ATATATAC--------T-----T-----------G-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--C-C--CA-TGCC---CTT--C----------------AAT-----------TCC-AC-----CC-----AT-GC---------TAAT-----T------AG-GC----A----G----ATTGCA---GTTGAGAac
gi|28473                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACT-A--ACTT------ATT--T-----A------C--------T-----CT----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28474                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-C--------T--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---
gi|28475                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-AACA--GA--A--A-TGGCC-A--AC--------A----T-----ATATA--C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28476                      :         atTTCCAA---G-AAACAGTATC--GA--AGAA-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------------C-----------T-------T-GT-CCC-TT------AC-------T----T-----TT--------T--T-T--CA-CGC
gi|28477                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AG--------G----C-----------------------------------------------T-GT-CTC-CG------AT----------------------------------------------CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CCCGATGAT-GC---------T--TTG---AAC----AG-AC----A----A----ATTGCA---ATGGCGAAGagtgtgcacgataaagggaccctcactgcgcaaaggca
gi|28478                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACTTAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------Ac
gi|28479                      :         atTTCCGA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------ATATGT-----A------C--------T-----T-----------T-------T-TC-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--GA-TGTC---CT
gi|28480                      :         atTTCCAA-A-G-AAACT-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----ATACT--C--------T-----T-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT-------T----T-----TG--------T--T-C--AA-TGCC---CT
gi|28481                      :         atTTCCAA-A-GGAAACA-TACAT-GA--A--T-CGACC-A--AC--------A----T-----A------TTA------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------A
gi|28482                      :         atTTCCAA-A-G-AAGCA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCA-C--------T--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTT--
gi|28483                      :         atTTCTAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----ATATAC-T--------T-----T-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--Ca
gi|28484                      :         atTTCCAA-AAG-CATCC-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------CGACGGGCT-GT-CTC-CG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA--GCCT--CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCTCAAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--TTGG--AC-----AG-CC----A----A----ATTGCA---G-AGCGAAG
gi|28485                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-G--ACCAACATATA----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CTC-CT------AT--A----T----T-----Tc
gi|28486                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TCCA--GA--A--A-CGACC-G--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CTTTGTTAATTAA----T----T-----TC--------T--T-C--CA-ACCC---CT
gi|28487                      :         atTTCCAA-A----AACA-TACA--GATAAC-A-CGATCTA--GC--------A----TCATTTA------T--------TTAC--C-----------T-------C-GT-CCCTCT------ACC-A----T----T-----TT--------TA-T-C--CA-CGCC---ATC--C-------A-ATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----AC-GCAGCA-----A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGTACATGTGG
gi|28488                      :          tTTCCAA-A-G-AAACA-TATA--GT--A--A-GGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAAGA-------T-------T-G--CCC-CG------AT--A----G----T-----TG--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAG--TCC-AC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ACTGAA---GAGAAGAAGgataagc
gi|28489                      :          tTTTCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A----CGAC--A--AC--------A----A-----A------C--------T-----C-----------T-------T--T-CCC-CT------AT--A----T----T-----T--------------C--CA-TGTC---CTC--T------CACACT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GCGGCGTTC-----AT-GC---------T--T------------TT-GC----A----A----TTTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28490                      :           TTTCAA-A-G-AAACA-TACT--CA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----T------G--------T-----C-----------G-------T-G--------------AC--A----G----G-----TA--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--AAAAT--TCT-AAA--TCC-GC-----CA-----TT-GC---------T--T-----C------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGCGAAc
gi|28491                      :              CAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------GT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTac
gi|28492                      :           tctCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------GT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTca
gi|28493                      :        tctTTCCAA-A-G-AA-CA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------TATA-----T-----C-----------T-------T-GTCCCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--AA-TGCC---CTca
gi|28494                      :          tTTCCAA-G-G-AAACG-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AG--A----T----T-----TC--------T--T-C--TA-CGCC---ATT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CA-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAGAGG
gi|28495                      :                A-A-G-AAAC--TACA--GA--A--A--GACC-A--AC--------A----T-----ATTA---C--------T-----C-----------T-------T-GTATCT-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CT
gi|28496                      :        tttcTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------TCAAGAC-----------A-------T-G--CTC-CG------AT--A----G----T-----TT--------C--T-C--CA-CG-C---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-A
gi|28497                      :                A-A-G-AAAGA-AAAG--GA--A--A-AGACA-A--TC--------A----T-----A------T--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-TT------AT--T----T----T-----TT--------T--T-CTCCA-CGCC---CTT--C------TGCAAC--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAGAGG
gi|28498                      :                A-A-G-AAACA-AACA--GA--A--A-CGACC-A--AA--------A----A-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CTT-----AT--A----T----T-----TA--------T--T-C--CA-CGCT---CTT--C------TGCACT--GAAAA--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--TTACTCAGCCTTTAG-GC----A----A----ATTCCA---GCGGAGAAGc
gi|28499                      :                A-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CAACC-A--AC--------A----T-----ATATA--C--------T-----A-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CTT--C---------------AACT--CCT-G---------------CC-----AT-GT---------T--T-----AATT---AG-GC----A----ACTAGATTGCA---GTTGAGAAc
gi|28500                      :                          A-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAATTTGCAAGGT-------T-GT-CCT-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--T-C--CA-CGTC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CAT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GCTTTTAATTTT--T-----A------AG-GC----A----A----AT
gi|28501                      :                          A-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAATTTGCAAGGT-------T-GT-CCT-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--T-C--CA-CGTC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CAT--AA--TCC-GC-----CC-----AT-GCTTTTAATTTT--T-----A------AG-GC----A----A----
gi|28502                      :                                    --A--A-TGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-TCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CACC---CTT--C------CACATT--AAAAT--CTT-AAT--TCT-GA-----CA-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GA----A----A----ATTGCA---GCGGAGAAGttc
gi|28503                      :                                   A--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCA-CT------AT--A----T----T-----TT--------C--T-C--CA-CGCC---CCT--C------TACATC--GAAAT--TCT-AAA--TCC-GT-----TC-----AT-GC---------TTAT-----A------AT-GC----A----A----GTTGCA---GTGGAc
gi|28504                      :                                            GACC-A--AC--------A----T-----G------C--------C-----CAAGG-------T-------T-G--CCC-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--C-C--CA-CGCC---CTT--C------TACACT--GAAG---------A--TCC-GC-----CT-----TT-GT---------T--T-----A------AG-GT----A----A----ATCGCA---GTGGAGAA
gi|28505                      :                                                                                      aata-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----TAATT-TC--------T--T-C--CA-CGCC---CCT--C------TATATT--GAAAT--CCC-AAA--TCA-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAac
gi|28506                      :                                                                                                            taacctacgca-CCC-CC------AC--A----T----A-----CT--------T--T-C--AA-T-CT---CTT--C------TACACG--GAAAT--CCT-AAA--TCT-GT-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGTAGAAtaggc
gi|28507                      :                                                                                                                          C-CT------AC--A----T----T-----TA--------T--T-C--CA-CACA---TTT--C------AACAAT--GAAATATCCT-AAA--TCT-AC-----CC-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTACA---GTGGAGAGGac
gi|28508                      :                                                                                                                                                                               CT---CTT--C------CACATTTTAAAAT--CCT-AAA--TTCTAC-----CC-----TG-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTG-A---GTGGAGAAGc


blockSeqs                     :                   A T          GG     GA       A     ATGCTCAATTTGCAAGG                                     GACGGGC T  C      TTGTTA  TA GAAC CAAT CATTT  AAAATTTCT              GCC   AA TACATAT     TT     AT      AAT      GGCGT  CGATG     TTTACTCAGCCTTT                AGCT AATT CTAG      CAT
blockSeqs                     :                   A G          T      C        T     ATGCTCAATTTGCAAGG                                     .       T  A      T       C  .    A    AATT   TAC                    GCC   C  C           .      .       T        .      .         TTTTAATTTTTA                  .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACTCGAGACGGG                                        .       .  .      .       .  .    .    AAC    TG                     T     .  C           .      .       T        .      .         TTTTAATTTTTA                  .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTCGAGACGGG                                        .       .  .      .       .  .    .    .      TA                     .     .  C           .      .       T        .      .         TTTGAAC                       .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGTTCGAGACGGG                                        .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  C           .      .       T        .      .         TTTGGAC                       .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTCGATC                                        .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  C           .      .       T        .      .         AGCAATA                       .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTCGAGACGGG                                        .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  C           .      .       T        .      .         TTAATT                        .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     CAACATATATACTC                                        .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTAATT                        .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATCATTTATTTACC                                        .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTCCCA                        .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATAATTACTCGT                                          .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       T        .      .         TTAATT                        .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATATACTT                                          .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  C           .      .       A        .      .         TAATT                         .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     TTATTTACTCT                                           .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTATA                         .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTTT                                           .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTCT                          .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTCAAGAC                                           .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTAC                          .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     TAAAATGCTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTCCAGG                                            .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGATTGTCC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATG                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATTACTCT                                            .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  A           .      .       A        .      .         AGG                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       C        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     TTATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       C        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATGTACTT                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATACTCTT                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTCAAGA                                            .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  C           .      .       T        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       G        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTC                                            .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       A        .      .         ACA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATACTA                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCCCAAGG                                            .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATATC                                             .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TGC                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATTACTC                                             .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATTATC                                              .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTT                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATATATC                                               .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  C           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  T           .      .       T        .      .         TTC                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     CTACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  T           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     GAACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  T           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  A           .      .       A        .      .         TTA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  C           .      .       A        .      .         TTG                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  .           .      .       A        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  .           .      .       .        .      .         ATA                           .    .    .         .  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  .           .      .       .        .      .         ATA                           .    .    .            
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     GTGCTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      G                      .     .  .           .      .       .        .      .         TT                            .    .    .            
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  .           .      .       .                                                                              
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .  .           .      .                                                                                      
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ACACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      C                      .     .  .           .      .                                                                                      
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .                                                                                                            
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATGCTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .     .                                                                                                            
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blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     AAACTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATTGTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
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blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     AAGCTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                   . .          .      .        .     ATACCC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                     .          .      .        .     ATATTC                                                .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                .      .        .     GTACC                                                 .       .  .      .       .  .    .    .      T                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                .      .        .     ATTTC                                                 .       .  .      .       .  .    .    .      .                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                       .        .     ATACC                                                 .       .  .      .       .  .    .    .      .                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                       .        .     ATAC                                                  .       .  .      .       .  .    .    .      .                      .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                .     GC                                                    .       .  .      .       .  .    .    .      .                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                            .       .  .      .       .  .    .    .                                                                                                                                                
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blockSeqs                     :                                                                                                                              .                                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  :           
originalCons                  :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG
finalCons                     :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG





Alignments
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lowQualScore                  :                 . . .     .    ..  .. .. .     . ..  ..................................................... ....... .  .   .  ......  .. .... .... .....  ........... . ..  .    ...   .. .......     ..     ..   .  ...   .  .....  .....  .  .........................  .  .... .... ....      ...         
lowQualScore                  :                 7 4 4     7    66  99 55 6     3 99  77777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000000 2  2   6  333333  55 3333 0000 00000  11111111111 6 99  6    999   99 0000000     11     11   9  333   9  22222  22222  9  0000000000000000000000000  9  9999 9999 9999      666         
consensus                     :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG
Reference ( family-344 )      :           TTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAG
gi|28442                      :           TTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC-----T--C------CACATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAG
gi|28443                      :         atTTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--T--T-AGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---C----C------CACATT--AAAAT--CTT-AAT--TCT-GC-----TC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAGc
gi|28444                      :         atTTCCAAGA-A-AAAC--TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------ATAATT-----A------C--------T-----CGT---------C-------T-GT-CCC-C--------T--A----T----T-----TC--------T--T-C--CA-TGCC---CTT--C------c
gi|28445                      :         atTTCCAT---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-A--AC--------A----T-----A------TA-------T-----C-----------T-------TTGT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--TTC--CA-CGCC---ATC----------ACATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AC-GC----A----A----AGCGTA---GTGGAGAAGac
gi|28446                      :         atTTCCAA---G-AAACA-TACA--GA--A--A-TGACT-A--AC--------C----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CA------AC--A----T----T-----TT--------C--C-C--CC-CGCC---TTT--C------CACGTT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28447                      :              atA-A-G-AAATA-TATA--GA--A--A-CGATT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AC--A----T----T-----TT-----------T-C--CA-CGCC---CTT--C------CACATT--CAAAT--CCT-AAT--TCT-GT-----CC-----AT-GC---------A--T-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28448                      :          attttcA-A-G-AA-CA-TACA--GA--A--AACGATT-A--AA--------G----A-----A------C--------C-----C-----------T-------TTGT-CC---T------AC--A----A----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTC--A------CACATT--CAAAT--C---AAT--TTC-TT-----CC-----AT-GC---------A--G-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28449                      :       atttTTCCGA---G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACT-T--AC--------A----T-----A------C----------------------------------------CC-CT------AC--G----T----T-----AC--------T--T-C--CA-CACC-----T--C------CACATT--AAAAT----T-AAAATTCT-GT-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGTA---GTGGAGAAGc
gi|28450                      :                   at-AAACG-TACA--GA--A--A-TGACT-A--AC--------G----T-----A------C--------------C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AC--A----G----T-----TT--------T--T-C--CC-GGCC---CTC--C------CTCATT--AAAAT--CCC-AAT--TCT-GC-----TC-----AT-GC---------A--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGTA---GTGGAGTAGc
gi|28451                      :  atttccactTTCCAA-AAG-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ATTAAA----A----T-----G------C--------T-----C-----------G-------T-GC-CCC-TT------AT--A----T----T-----TTAAAATTTCT--C-C--CA-CACC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AC-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28452                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A----TGATC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-TCC-CT------AT--A----T----TAAC--TT--------C--T-T--CAGCGCA---CTT--C------TTCATT--GAAAT--TCT-AAA--TCT-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATCGCA---GTGAAGc
gi|28453                      :         atTTCCAA-A-A-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------C-------T-GT-CCC-CT------AT--A----TCAATT-----TC--------T--T-C--TA-CGCC---CTT--T------TACACT--GAAAT--CCT-AAT--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGAA---
gi|28454                      :         acTTCCAA-A---AAGCA-TACA--AA--A--A-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CTC-CT------AC--A----T----T-----CT--------T--C-C--CG-TGCC---CTT--C------CACATT--AGAAT--CCT--AA--TCC-
gi|28455                      :         atTTCCTA-A-G-AAACA-CACC--AA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT---C-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TAAATT--TAAA---CCC-AAA--TTC-GT-----CC-----AT-GT---------T--T-----A------GG-GC----AAATTA----ATTGCA---GTGGAGAtgtc
gi|28456                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CCAGG-------T-------T-GT-CTC-CG------AT--A----G----C-----TA--------T--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TC--------------------C---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAGAA
gi|28457                      :         atTTCCAA-A-G-AAACG-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TC--------G--T-T--CA-CGCC---ATT--CTACATATACATT--CAAAT--CCT-AAA--TCT-AC-----CA-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----AAAGCA---ATGAGGAA
gi|28458                      :          aTTCCAA-A-G-AACCA-TACA--GA--A--A-TAACC-A--AC--------G----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GC-GTC-CT------AT--A----T----TCATTTTC--------T--T-C--CA-CGTT---ATT--C------TACATT--GCAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------A--C-----A------TG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAAAAGaagc
gi|28459                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------T-----CGAGACGGG---T-------T-GT-TTC-CG------AT--A----G----T-----AC--------T----C--CA-CGCC---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GA---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GAGGCGAAGc
gi|28460                      :          aTTCCAG-A-G-AAACA-AACA--AA--A--A-CGATC-G--AC--------A----TG----A------T--------TGTC--C-----------G-------T-GT-CTC-AT------AT--C----T----T-----TT--------C--C-C--CA-TGCC---CTT--C------TACACT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GT-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AA-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAc
gi|28461                      :               at-A-G-AAACA-TACA--GA--G--T-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-AG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA-CGCCGCCCTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----CT-----AG-GC----A----A----ATTTCA---GAGGCGAAG
gi|28462                      :       atttccattt-A-G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACC-A--AC--------A----T-----G------T--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-CG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--G-----C------AG-GC----A----T----ATTACA---
gi|28463                      : atttccatttTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28464                      :         atTTCCAA-A-A-GAACA-TACA--GA--A--A-CGACCAA--AT--------ATAT-T-----A------C--------T-----CT----------T-------T-GT--CC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28465                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGAT---------------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CTT--C------AACA---------------------CC-GG-----CC-----AT-TT---------T--T-----AATT---AG-GCAGCTA----A----ATTGTA---GTTGAGAA
gi|28466                      :          atTCCAA-C-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGGCC-A--AC--------A----T-----G------C--------C-----C-----------T-------T-GT-CCA-CT------CT------------------------------------------C---CTGAAC------TACACT--GAAAT--GCT-AAA--TCT-GC-----AA-----AT-GC---------A--T-----A------AT-GC----A----A----A-TATA---GTGTAGCAG
gi|28467                      :        ataTTCCAG-A-G-AAACA-TACA--AA--A--A-TGACC-A--GC--------A----C-----A------C--------C-----C-----------T-------T-AT-CCC-CT------AC--A----TA---T-----TT--------T--T-C--CA-TGTC---CTT-----------TATT--GAAAT--C
gi|28468                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGGCC-AATAT--------A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-G--CCC-CT------A---A----T----T-----TT--------TG-T-C--CA-TGCC---CTT--C-------------------------AAC--TCC-GG-----CC-----AT-TT---------T--T-----AATT---AG-GC----A----T----ATTGTA---GTTGAGAA
gi|28469                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACG--GA--A--A-CGACC-A--AT--------A----T-----A------TATACTCGAT-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-T--CA-TGCC---CTT--C----------------AGG--C---AAC--TCC-GG-----CC---------T---------T--T-----T------AG-GC----A----G----ATTGCA---GTTGAGAA
gi|28470                      :               at-A-G-AAACA-TACA--GA--A--T-CGACC-A--GC--------A----T-----G------C--------T-----CGAGACGGG---C-------T-GT-CTC-CG------AT--AGAACT----T-----TA--------TACT-C--CA-CGCCGCCCTT--T------TACGTT--GAAAT--CCT-ATA--TCC-G------CC-----ATCGC---------T--T-----AC-----AGCAC----A----A----ATTGCA---GAGGCGAAG
gi|28471                      : atttccatttTTCCAA-A-G-GAACA-TACAGGGA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T------------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A---------------TT--------C--T-C--CA-CGCC---CTTC-C------TATA-T--AAAAT-----------------------C-----AT-GC---------T--TCCC--A------GG-AC----A----A----ATTGCA-----GAAGAAc
gi|28472                      :         atTTCCAA-A-ATAAATA-TACA--GA--A--G-CGAAC-A--AC--------A----T-----ATATATAC--------T-----T-----------G-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--C-C--CA-TGCC---CTT--C----------------AAT-----------TCC-AC-----CC-----AT-GC---------TAAT-----T------AG-GC----A----G----ATTGCA---GTTGAGAac
gi|28473                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACT-A--ACTT------ATT--T-----A------C--------T-----CT----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28474                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-C--------T--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---
gi|28475                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-AACA--GA--A--A-TGGCC-A--AC--------A----T-----ATATA--C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CT
gi|28476                      :         atTTCCAA---G-AAACAGTATC--GA--AGAA-CGACT-A--AC--------A----T-----A------C--------------C-----------T-------T-GT-CCC-TT------AC-------T----T-----TT--------T--T-T--CA-CGC
gi|28477                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AG--------G----C-----------------------------------------------T-GT-CTC-CG------AT----------------------------------------------CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CCCGATGAT-GC---------T--TTG---AAC----AG-AC----A----A----ATTGCA---ATGGCGAAGagtgtgcacgataaagggaccctcactgcgcaaaggca
gi|28478                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACTTAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------Ac
gi|28479                      :         atTTCCGA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------ATATGT-----A------C--------T-----T-----------T-------T-TC-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--GA-TGTC---CT
gi|28480                      :         atTTCCAA-A-G-AAACT-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----ATACT--C--------T-----T-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT-------T----T-----TG--------T--T-C--AA-TGCC---CT
gi|28481                      :         atTTCCAA-A-GGAAACA-TACAT-GA--A--T-CGACC-A--AC--------A----T-----A------TTA------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------A
gi|28482                      :         atTTCCAA-A-G-AAGCA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCA-C--------T--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTT--
gi|28483                      :         atTTCTAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----ATATAC-T--------T-----T-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--Ca
gi|28484                      :         atTTCCAA-AAG-CATCC-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------CGACGGGCT-GT-CTC-CG------AT--A----G----T-----TA--------C--T-C--CA--GCCT--CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCTCAAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--TTGG--AC-----AG-CC----A----A----ATTGCA---G-AGCGAAG
gi|28485                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-G--ACCAACATATA----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CTC-CT------AT--A----T----T-----Tc
gi|28486                      :         atTTCCAA-A-G-AAACA-TCCA--GA--A--A-CGACC-G--AC--------A----T-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CTTTGTTAATTAA----T----T-----TC--------T--T-C--CA-ACCC---CT
gi|28487                      :         atTTCCAA-A----AACA-TACA--GATAAC-A-CGATCTA--GC--------A----TCATTTA------T--------TTAC--C-----------T-------C-GT-CCCTCT------ACC-A----T----T-----TT--------TA-T-C--CA-CGCC---ATC--C-------A-ATT--AAAAT--CCT-AAT--TCT-GC-----CC-----AC-GCAGCA-----A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGTACATGTGG
gi|28488                      :          tTTCCAA-A-G-AAACA-TATA--GT--A--A-GGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAAGA-------T-------T-G--CCC-CG------AT--A----G----T-----TG--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAG--TCC-AC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ACTGAA---GAGAAGAAGgataagc
gi|28489                      :          tTTTCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A----CGAC--A--AC--------A----A-----A------C--------T-----C-----------T-------T--T-CCC-CT------AT--A----T----T-----T--------------C--CA-TGTC---CTC--T------CACACT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GCGGCGTTC-----AT-GC---------T--T------------TT-GC----A----A----TTTGCA---GTGGAGAAGc
gi|28490                      :           TTTCAA-A-G-AAACA-TACT--CA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----T------G--------T-----C-----------G-------T-G--------------AC--A----G----G-----TA--------C--T-C--CA-CGCC---CTT--C------TACATT--AAAAT--TCT-AAA--TCC-GC-----CA-----TT-GC---------T--T-----C------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGCGAAc
gi|28491                      :              CAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------GT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTac
gi|28492                      :           tctCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--ACATAT----A----T-----A------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------GT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGTC---TTca
gi|28493                      :        tctTTCCAA-A-G-AA-CA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------TATA-----T-----C-----------T-------T-GTCCCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--AA-TGCC---CTca
gi|28494                      :          tTTCCAA-G-G-AAACG-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AG--A----T----T-----TC--------T--T-C--TA-CGCC---ATT--C------TACATT--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CA-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAGAGG
gi|28495                      :                A-A-G-AAAC--TACA--GA--A--A--GACC-A--AC--------A----T-----ATTA---C--------T-----C-----------T-------T-GTATCT-CT------AT--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CGCC---CT
gi|28496                      :        tttcTCCAA-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------TCAAGAC-----------A-------T-G--CTC-CG------AT--A----G----T-----TT--------C--T-C--CA-CG-C---CTT--C------TACGTT--GAAAT--CCT-A
gi|28497                      :                A-A-G-AAAGA-AAAG--GA--A--A-AGACA-A--TC--------A----T-----A------T--------C-----C-----------T-------T-GT-CCC-TT------AT--T----T----T-----TT--------T--T-CTCCA-CGCC---CTT--C------TGCAAC--GAAAT--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---ATGAAGAGG
gi|28498                      :                A-A-G-AAACA-AACA--GA--A--A-CGACC-A--AA--------A----A-----G------C--------T-----C-----------T-------T-GT-CCC-CTT-----AT--A----T----T-----TA--------T--T-C--CA-CGCT---CTT--C------TGCACT--GAAAA--CCT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GC---------T--TTACTCAGCCTTTAG-GC----A----A----ATTCCA---GCGGAGAAGc
gi|28499                      :                A-A-G-AAACA-TACA--GA--A--A-CAACC-A--AC--------A----T-----ATATA--C--------T-----A-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----T-----TT--------G--T-C--CA-TGCC---CTT--C---------------AACT--CCT-G---------------CC-----AT-GT---------T--T-----AATT---AG-GC----A----ACTAGATTGCA---GTTGAGAAc
gi|28500                      :                          A-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAATTTGCAAGGT-------T-GT-CCT-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--T-C--CA-CGTC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CAT-AAA--TCC-GC-----CC-----AT-GCTTTTAATTTT--T-----A------AG-GC----A----A----AT
gi|28501                      :                          A-TACA--GA--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----G------C--------T-----CAATTTGCAAGGT-------T-GT-CCT-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--T-C--CA-CGTC---CTT--C------TACATT--GAAAT--CAT--AA--TCC-GC-----CC-----AT-GCTTTTAATTTT--T-----A------AG-GC----A----A----
gi|28502                      :                                    --A--A-TGACC-A--AC--------A----T-----A------C--------C-----C-----------T-------T-GT-TCC-CT------AC--A----T----T-----TT--------T--T-C--CA-CACC---CTT--C------CACATT--AAAAT--CTT-AAT--TCT-GA-----CA-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GA----A----A----ATTGCA---GCGGAGAAGttc
gi|28503                      :                                   A--A--A-CGACC-A--AC--------A----T-----A------T--------T-----C-----------T-------T-GT-CCA-CT------AT--A----T----T-----TT--------C--T-C--CA-CGCC---CCT--C------TACATC--GAAAT--TCT-AAA--TCC-GT-----TC-----AT-GC---------TTAT-----A------AT-GC----A----A----GTTGCA---GTGGAc
gi|28504                      :                                            GACC-A--AC--------A----T-----G------C--------C-----CAAGG-------T-------T-G--CCC-CG------AT--A----G----T-----TA--------T--C-C--CA-CGCC---CTT--C------TACACT--GAAG---------A--TCC-GC-----CT-----TT-GT---------T--T-----A------AG-GT----A----A----ATCGCA---GTGGAGAA
gi|28505                      :                                                                                      aata-----C-----------T-------T-GT-CCC-CT------AT--A----T----TAATT-TC--------T--T-C--CA-CGCC---CCT--C------TATATT--GAAAT--CCC-AAA--TCA-GC-----CC-----AT-GC---------T--T-----G------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGGAac
gi|28506                      :                                                                                                            taacctacgca-CCC-CC------AC--A----T----A-----CT--------T--T-C--AA-T-CT---CTT--C------TACACG--GAAAT--CCT-AAA--TCT-GT-----CC-----TT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTGCA---GTGTAGAAtaggc
gi|28507                      :                                                                                                                          C-CT------AC--A----T----T-----TA--------T--T-C--CA-CACA---TTT--C------AACAAT--GAAATATCCT-AAA--TCT-AC-----CC-----AT-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTACA---GTGGAGAGGac
gi|28508                      :                                                                                                                                                                               CT---CTT--C------CACATTTTAAAAT--CCT-AAA--TTCTAC-----CC-----TG-GC---------A--T-----A------AG-GC----A----A----ATTG-A---GTGGAGAAGc