lowQualScore                  :                          1111111111111111                                                                                                             
lowQualScore                  :     0         1  22222 0 4444444444444444 00   00 11 2  99999 3333333  22     1  4444444 0  1 33 1111  1111  1111 1111 1111 11      44444       11    
lowQualScore                  :     .         .  ..... . ................ ..   .. .. .  ..... .......  ..     .  ....... .  . .. ....  ....  .... .... .... ..      .....       ..    
lowQualScore                  :     7         3  22222 6 0000000000000000 88   88 77 5  44444 4444444  00     2  2222222 6  8 77 3333  9999  3333 3333 3333 77      22222       22    
consensus                     : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTCCGTC--TGTC
Reference ( gi|67500 )        : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CTGTCC-----GTCCGTC--TGTC
gi|67502                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CT--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67503                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G--------C--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----A----T--CCGTCC-----GTCTGTC--
gi|67506                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A----T--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-TT-T----TG----TC----C----G----T--CTGTCC-----GTC
gi|67501                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CA-T----TG----TC----C----A----T--CCGTCT-----GTCTGTC--
gi|67509                      : TTTT-TAGGGCCCTTGC-----A-T------TG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CGGGCTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CCGTCC-----GTCCGTC--TGTC
gi|67504                      : TTAT-TAGAGCCCT-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CTGTCC-----ATCTGTC--
gi|67510                      : TTGT-TAGGGCC---GC-----C-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--GTATA-GT-T--T--TTCA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CTGTCC-----GTCCGTC--TGCC
gi|67514                      : TCAT-TAGGGCCCC-GC-----A------------A---G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTTCGTC--TGTC
gi|67505                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-AC-T--T--T-CT-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCTTCT-----GTCTGTC--
gi|67511                      : TTAT-TAGGG-CCC-AC-----A-T------CGC-A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T-CA--T-A----TG----T-----C----G----T--CTGTCT-----GTC
gi|67507                      : TTAT-TAGGGCCC--AT-----A-T------CG--A---C-A--GAC--G--C-GG-T---G-------CC--CTACA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TT----T----G----T--CCGTC
gi|67512                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--AGTT-GA-TATAG-------TC--TTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CCGTCCATAT-GTCCGTC--CGTC
gi|67520                      : TTAT-TAGGGCTCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----T----G----T--CCATCC-----GTCCGTC--
gi|67519                      : TTAG-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CA--A---G-A--AAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-
gi|67518                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----C--CCGTCT-----GTCCGTC--
gi|67517                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----C--CCGTCT-----GTCCGTC--
gi|67515                      : TTAT-TAGAGCCCC-GC-----A-TGCGCATCG--A---C-A--GTT--G----GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----T
gi|67522                      : TTAT-TAGGGCCCCCGC-----A-G-------G--AAATG-A--AAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCATCTA----GTCCGTC--
gi|67513                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--A----GT-T---GATATTATTC--TTATA-GT-T--T--T-CAACT-T----TG----TC----T----G----T--CCGTCCCATATGTCCGTC--CGTC
gi|67521                      : TCAT-TAGGGTCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-TT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTCCATC--CGTC
gi|67524                      : TTTT-TAGGTCCCC-TT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67525                      : TTTT-TAGGGCCCC-GT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GG-----GAA-----CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTC
gi|67516                      : TTAT-TGGAATTCT-GC-------T------CGC-A---G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC---TATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--TCATCT-----GTCTGTCGGTGTC
gi|67526                      : TCAT-TAGGGCCCC-GCCGAATA-T------CG--A---G-G------------GG-A---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CAGCT-T----T-----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTCCGTC--
gi|67523                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----GG----TC----T----G----T--CCGTC
gi|67527                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CGGG-T---GC------CC--CTATG-GA-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTC
gi|67508                      : TTAT-AAAGGCCCG-GT-----A-T------CC--A---C-A--AAT--G--C-AG-C-----------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CTCT----TG----TC----C----G----T--TCGT--------TCTGTC--
gi|67528                      :  TATATAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCGTC
gi|67529                      :  TAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------A--A---G-A--GAT--G----GG-C---G--------C--CTATA-TT-TG-T--T-CA-CT-C----TG----TC----T----G----TTCCTGTCC-----GTC
gi|67530                      :  TAC-TAAGGCCA--GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TT----T----G----T--CCGTCC-----GTCTGTC--TGTC
gi|67531                      :  TGT-TAGGACCCT-GC-----A-A------TG--A---A-A--AAT--ATAC-GG-C---G-------TC--CTATT-GT-T--T--T-CA-CG-T----TG----TCCAATC----G----T--TTGTCT-----GT
gi|67532                      :  TAT-TAGGGCCCT-GCC----A-TA-----TG--G---C-A--GAT--G--T-----------------T--CTGTA-GT-A--A--T-TA-CT-------------C----T----G----T--CTGTCC-----GTCTGTC--TGTC
gi|67533                      :   AT-TAGGATCCC-GT-----A-T------CA--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTCCGTC--TGTC
gi|67534                      :   AT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-C--T----TG----TC----C----G----T--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67535                      :   AT-TAGGGACCC-GC-----A-C------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------TC--CTAAA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TGTCATTC----C----G----T--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67537                      :   AT-TAGGGCCTC-GC-----A-T------CG--T---C-A--GAT--G--C-CG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--GTATCT-----GTCCTTC--TGTC
gi|67536                      :   AT-TAGGGCCC--AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-T---T-------CC--CTATAAGT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----GTCATT--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67545                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CTGTCC-----GTCCGCC--
gi|67539                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTCCGTC--
gi|67538                      :   AT-AAAGGTCCC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CT-T----TG----TC----C----G----T--TCGTCT-----GTCTGT
gi|67541                      :   AT-TAGCGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GC-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTCCGTC--CGTC
gi|67542                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----ATT------CGATA---G-A--GAT--A--C-GG-C---G--------C--CTATA-GC-T--TG-T-CA-CT-T----TGT---TC----C----G----T--CT
gi|67543                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--TTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCC-----GTC
gi|67546                      :   AT-TAGGGTCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATACGT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CTGT-C-----GTCCGTC--
gi|67540                      :   AT-TAGGGCC---AC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTTCGTC--TGTC
gi|67544                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A-----A--GAT--G--C--G-T---G-------CC--TTATA-GTAA--T--T-CA-A--T----TG----TC----C----G----G--CCGTCC-----GTC
gi|67547                      :   AT-TAGGGCCCC-AC--------------CG--A---GTATCGAC--G----GG-A---G-------CC--CTATG-GT-A--A--T-CAGCT-T----T---------------------------TCC-----GTCCGTC--TG
gi|67548                      :    T-TAGGGCCCT-GC-----A-T------TG--A---A-A--GAT--G--G-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTATGTC--TGTC
gi|67550                      :    T-TACGGCCCC-GC-----A-C------AG--A---C-A--GATATG--T-GG-C---G-------TC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--C
gi|67549                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--T----CA-CA-T----TG----TC----CATCCG----T--CTGTCT-----GTCCGTC--
gi|67553                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----A----T--CTGTCT-----GT
gi|67554                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G----GG-T---G-------CC--CTATA-ATAT--TAAT-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTC
gi|67552                      :    T-TAGGGCCC--GC-----A-T--------------G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC--TTATA-GG-TAAT--T--A-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTCCTTC--TGTC
gi|67551                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T------TA--A---------AT--G--C-AG-TT--G-------CC--CTAAA-GT-A--A--T-CA-CA-T----TG----TC----C----G----T--CCTTCT-----GTCTGTC--TGT
gi|67555                      :    T-TAGGGTCCC-GC-----A-T------CG--A---T-A--AAT--G----GG--------------C--CTACA-GT-T--T--T-CA-C-------TG----TC----C----G----T--C
gi|67556                      :     -TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCT-----GTCTGTC--TGTC
gi|67528                      :     -TAGGGCGCT-GC-----A-T------CT--G---T-C--GAT--G--C-GG-G---G-------CC--CTATA-
gi|67557                      :   ta-TAGGGTCCG-AC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-AG-C------------------TA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CCATCtagttttcactttgtccgtccgtc
gi|67559                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CTGTCC-----ATCCATC--TGTC
gi|67558                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----T----G----T--CTGTCC-----ATCCATC--TGTC
gi|67560                      :            CCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TA----TC----C----G----T--CTGTCT-----GTATGTC--TGTC
gi|67561                      :            CTC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-AT-T--T--T-CA-CT-A----TG----TC----C----G----T--CTGTCC-----GTC
gi|67562                      :                 C-----A-T------CA--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----TTGCTGTC
gi|67563                      :                  -----A-T------CG--A---C-A--GTT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CC-T----TG----TC----C----G----T--CCGTCG-----GTCTGTC--TGTC
gi|67564                      :                        -T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TG----TC----C----G----T--CTATCC-----GTCTGTC--TATC
gi|67565                      :                                                         -C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-T----TT----TC----C----G----T--CTGTCT-----GTCCGTC--TGTtgtc
gi|67566                      :                                                               -------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTGTGTG----TC----C----G----T--CTGTCT-----GACCGTC--





Alignments
lowQualScore                  :                          1111111111111111                                                                                              
lowQualScore                  :     0         1  22222 0 3333333333333333 00   00 11 2  99999 3333333  22     1  3333333 0  1 33   0     00      44444   1111    11    
lowQualScore                  :     .         .  ..... . ................ ..   .. .. .  ..... .......  ..     .  ....... .  . ..   .     ..      .....   ....    ..    
lowQualScore                  :     7         3  22222 6 0000000000000000 88   88 77 5  00000 4444444  00     2  9999999 6  8 55   6     88      11111   6666    22    
consensus                     : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
Reference ( family-343 )      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67500                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67501                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67502                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CT--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67503                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G--------C--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCAT--CCGTCC-----GTC----TGTC--
gi|67504                      : TTAT-TAGAGCCCT-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----TGTC--
gi|67505                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-AC-T--T--T-CT-CT-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--
gi|67506                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A----T--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-TT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67507                      : TTAT-TAGGGCCC--AT-----A-T------CG--A---C-A--GAC--G--C-GG-T---G-------CC--CTACA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TTTGT--CCGTC
gi|67508                      : TTAT-AAAGGCCCG-GT-----A-T------CC--A---C-A--AAT--G--C-AG-C-----------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CTCTTG-TCCGT--TCGT--------TC----TGTC--
gi|67509                      : TTTT-TAGGGCCCTTGC-----A-T------TG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CGGGCTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67510                      : TTGT-TAGGGCC---GC-----C-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--GTATA-GT-T--T--TTCA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGCC
gi|67511                      : TTAT-TAGGG-CCC-AC-----A-T------CGC-A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T-CA--T-ATG-T-CGT--CTGTCT-----GTC----
gi|67512                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--AGTT-GA-TATAG-------TC--TTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCCATAT-GTC----CGTC--CGTC
gi|67513                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--A----GT-T---GATATTATTC--TTATA-GT-T--T--T-CAACT-TTG-TCTGT--CCGTCCCATATGTC----CGTC--CGTC
gi|67514                      : TCAT-TAGGGCCCC-GC-----A------------A---G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67515                      : TTAT-TAGAGCCCC-GC-----A-TGCGCATCG--A---C-A--GTT--G----GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-T
gi|67516                      : TTAT-TGGAATTCT-GC-------T------CGC-A---G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC---TATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--TCATCT-----GTC----TGTCGGTGTC
gi|67517                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67518                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67519                      : TTAG-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CA--A---G-A--AAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-
gi|67520                      : TTAT-TAGGGCTCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCTGT--CCATCC-----GTC----CGTC--
gi|67521                      : TCAT-TAGGGTCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-TT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CATC--CGTC
gi|67522                      : TTAT-TAGGGCCCCCGC-----A-G-------G--AAATG-A--AAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCATCTA----GTC----CGTC--
gi|67523                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TGG-TCTGT--CCGTC
gi|67524                      : TTTT-TAGGTCCCC-TT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67525                      : TTTT-TAGGGCCCC-GT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GG-----GAA-----CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----
gi|67526                      : TCAT-TAGGGCCCC-GCCGAATA-T------CG--A---G-G------------GG-A---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--
gi|67527                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CGGG-T---GC------CC--CTATG-GA-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67528                      :  TATATAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67529                      :  TAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------A--A---G-A--GAT--G----GG-C---G--------C--CTATA-TT-TG-T--T-CA-CT-CTG-TCTGT--TC--CT-----GTC----CGTC--
gi|67530                      :  TAC-TAAGGCCA--GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TTTGT--CCGTCC-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67531                      :  TGT-TAGGACCCT-GC-----A-A------TG--A---A-A--AAT--ATAC-GG-C---G-------TC--CTATT-GT-T--T--T-CA-CG-TTG-TCCAA--TCGTTT-----GTC----TGT
gi|67532                      :  TAT-TAGGGCCCT-GCC----A-TA-----TG--G---C-A--GAT--G--T-----------------T--CTGTA-GT-A--A--T-TA-CT-CTG-TCTGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67533                      :   AT-TAGGATCCC-GT-----A-T------CA--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67534                      :   AT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-C--TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67535                      :   AT-TAGGGACCC-GC-----A-C------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------TC--CTAAA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCATT--CCGTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67536                      :   AT-TAGGGCCC--AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-T---T-------CC--CTATAAGT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CATTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67537                      :   AT-TAGGGCCTC-GC-----A-T------CG--T---C-A--GAT--G--C-CG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--GTATCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67538                      :   AT-AAAGGTCCC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CT-TTG-TCCGT--TCGTCT-----GTC----TGT
gi|67539                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67540                      :   AT-TAGGGCC---AC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67541                      :   AT-TAGCGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GC-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--CGTC
gi|67542                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----ATT------CGATA---G-A--GAT--A--C-GG-C---G--------C--CTATA-GC-T--TG-T-CA-CT-TTGTTCCGT--C
gi|67543                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--TTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----t
gi|67544                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A-----A--GAT--G--C--G-T---G-------CC--TTATA-GTAA--T--T-CA-A--TTG-TCCGG--CCGTCC-----GTC----
gi|67545                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGCC--
gi|67546                      :   AT-TAGGGTCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATACGT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGT-C-----GTC----CGTC--
gi|67547                      :   AT-TAGGGCCCC-AC--------------CG--A---GTATCGAC--G----GG-A---G-------CC--CTATG-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCT-----G
gi|67548                      :    T-TAGGGCCCT-GC-----A-T------TG--A---A-A--GAT--G--G-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67549                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--T----CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTCTGTCCGTC--
gi|67550                      :    T-TACGGCCCC-GC-----A-C------AG--A---C-A--GATATG--T-GG-C---G-------TC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--C
gi|67551                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T------TA--A---------AT--G--C-AG-TT--G-------CC--CTAAA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--TGT
gi|67552                      :    T-TAGGGCCC--GC-----A-T--------------G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC--TTATA-GG-TAAT--T--A-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67553                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CTGTCT-----GT
gi|67554                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G----GG-T---G-------CC--CTATA-ATAT--TAAT-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67555                      :    T-TAGGGTCCC-GC-----A-T------CG--A---T-A--AAT--G----GG--------------C--CTACA-GT-T--T--T-CA-C---TG-TCCGT--C
gi|67556                      :     -TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67557                      :     -TAGGGTCCG-AC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-AG-C------------------TA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCATC
gi|67558                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67559                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67560                      :            CCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTA-TCCGT--CTGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67561                      :            CTC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-AT-T--T--T-CA-CT-ATG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67562                      :                 C-----A-T------CA--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGTTGCTGTC
gi|67563                      :                  -----A-T------CG--A---C-A--GTT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CC-TTG-TCCGT--CCGTCG-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67564                      :                        -T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTATCC-----GTC----TGTC--TATC
gi|67565                      :                                                         -C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTT-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--TGTtgtc
gi|67566                      :                                                               -------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TGTGT--CCGTCT-----GTC----TGAC--CGTC





Alignments
lowQualScore                  :                          1111111111111111                                                                                              
lowQualScore                  :     0         1  22222 0 3333333333333333 00   00 11 2  99999 3333333  22     1  3333333 0  1 33   0     00      44444   1111    11    
lowQualScore                  :     .         .  ..... . ................ ..   .. .. .  ..... .......  ..     .  ....... .  . ..   .     ..      .....   ....    ..    
lowQualScore                  :     7         3  22222 6 0000000000000000 88   88 77 5  00000 4444444  00     2  9999999 6  8 55   6     88      11111   6666    22    
consensus                     : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
Reference ( family-343 )      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67500                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67501                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67502                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CT--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67503                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G--------C--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCAT--CCGTCC-----GTC----TGTC--
gi|67504                      : TTAT-TAGAGCCCT-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----TGTC--
gi|67505                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-AC-T--T--T-CT-CT-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--
gi|67506                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A----T--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-TT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67507                      : TTAT-TAGGGCCC--AT-----A-T------CG--A---C-A--GAC--G--C-GG-T---G-------CC--CTACA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TTTGT--CCGTC
gi|67508                      : TTAT-AAAGGCCCG-GT-----A-T------CC--A---C-A--AAT--G--C-AG-C-----------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CTCTTG-TCCGT--TCGT--------TC----TGTC--
gi|67509                      : TTTT-TAGGGCCCTTGC-----A-T------TG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CGGGCTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67510                      : TTGT-TAGGGCC---GC-----C-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--GTATA-GT-T--T--TTCA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGCC
gi|67511                      : TTAT-TAGGG-CCC-AC-----A-T------CGC-A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T-CA--T-ATG-T-CGT--CTGTCT-----GTC----
gi|67512                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--AGTT-GA-TATAG-------TC--TTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCCATAT-GTC----CGTC--CGTC
gi|67513                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--A----GT-T---GATATTATTC--TTATA-GT-T--T--T-CAACT-TTG-TCTGT--CCGTCCCATATGTC----CGTC--CGTC
gi|67514                      : TCAT-TAGGGCCCC-GC-----A------------A---G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67515                      : TTAT-TAGAGCCCC-GC-----A-TGCGCATCG--A---C-A--GTT--G----GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-T
gi|67516                      : TTAT-TGGAATTCT-GC-------T------CGC-A---G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC---TATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--TCATCT-----GTC----TGTCGGTGTC
gi|67517                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67518                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67519                      : TTAG-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CA--A---G-A--AAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-
gi|67520                      : TTAT-TAGGGCTCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCTGT--CCATCC-----GTC----CGTC--
gi|67521                      : TCAT-TAGGGTCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-TT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CATC--CGTC
gi|67522                      : TTAT-TAGGGCCCCCGC-----A-G-------G--AAATG-A--AAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCATCTA----GTC----CGTC--
gi|67523                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TGG-TCTGT--CCGTC
gi|67524                      : TTTT-TAGGTCCCC-TT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67525                      : TTTT-TAGGGCCCC-GT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GG-----GAA-----CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----
gi|67526                      : TCAT-TAGGGCCCC-GCCGAATA-T------CG--A---G-G------------GG-A---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--
gi|67527                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CGGG-T---GC------CC--CTATG-GA-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67528                      :  TATATAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67529                      :  TAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------A--A---G-A--GAT--G----GG-C---G--------C--CTATA-TT-TG-T--T-CA-CT-CTG-TCTGT--TC--CT-----GTC----CGTC--
gi|67530                      :  TAC-TAAGGCCA--GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TTTGT--CCGTCC-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67531                      :  TGT-TAGGACCCT-GC-----A-A------TG--A---A-A--AAT--ATAC-GG-C---G-------TC--CTATT-GT-T--T--T-CA-CG-TTG-TCCAA--TCGTTT-----GTC----TGT
gi|67532                      :  TAT-TAGGGCCCT-GCC----A-TA-----TG--G---C-A--GAT--G--T-----------------T--CTGTA-GT-A--A--T-TA-CT-CTG-TCTGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67533                      :   AT-TAGGATCCC-GT-----A-T------CA--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67534                      :   AT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-C--TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67535                      :   AT-TAGGGACCC-GC-----A-C------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------TC--CTAAA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCATT--CCGTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67536                      :   AT-TAGGGCCC--AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-T---T-------CC--CTATAAGT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CATTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67537                      :   AT-TAGGGCCTC-GC-----A-T------CG--T---C-A--GAT--G--C-CG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--GTATCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67538                      :   AT-AAAGGTCCC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CT-TTG-TCCGT--TCGTCT-----GTC----TGT
gi|67539                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67540                      :   AT-TAGGGCC---AC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67541                      :   AT-TAGCGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GC-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--CGTC
gi|67542                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----ATT------CGATA---G-A--GAT--A--C-GG-C---G--------C--CTATA-GC-T--TG-T-CA-CT-TTGTTCCGT--C
gi|67543                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--TTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----t
gi|67544                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A-----A--GAT--G--C--G-T---G-------CC--TTATA-GTAA--T--T-CA-A--TTG-TCCGG--CCGTCC-----GTC----
gi|67545                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGCC--
gi|67546                      :   AT-TAGGGTCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATACGT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGT-C-----GTC----CGTC--
gi|67547                      :   AT-TAGGGCCCC-AC--------------CG--A---GTATCGAC--G----GG-A---G-------CC--CTATG-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCT-----G
gi|67548                      :    T-TAGGGCCCT-GC-----A-T------TG--A---A-A--GAT--G--G-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67549                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--T----CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTCTGTCCGTC--
gi|67550                      :    T-TACGGCCCC-GC-----A-C------AG--A---C-A--GATATG--T-GG-C---G-------TC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--C
gi|67551                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T------TA--A---------AT--G--C-AG-TT--G-------CC--CTAAA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--TGT
gi|67552                      :    T-TAGGGCCC--GC-----A-T--------------G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC--TTATA-GG-TAAT--T--A-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67553                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CTGTCT-----GT
gi|67554                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G----GG-T---G-------CC--CTATA-ATAT--TAAT-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67555                      :    T-TAGGGTCCC-GC-----A-T------CG--A---T-A--AAT--G----GG--------------C--CTACA-GT-T--T--T-CA-C---TG-TCCGT--C
gi|67556                      :     -TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67557                      :     -TAGGGTCCG-AC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-AG-C------------------TA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCATC
gi|67558                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67559                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67560                      :            CCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTA-TCCGT--CTGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67561                      :            CTC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-AT-T--T--T-CA-CT-ATG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67562                      :                 C-----A-T------CA--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGTTGCTGTC
gi|67563                      :                  -----A-T------CG--A---C-A--GTT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CC-TTG-TCCGT--CCGTCG-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67564                      :                        -T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTATCC-----GTC----TGTC--TATC
gi|67565                      :                                                         -C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTT-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--TGTtgtc
gi|67566                      :                                                               -------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TGTGT--CCGTCT-----GTC----TGAC--CGTC


blockSeqs                     :               T  CGAAT   GCGCATCGAC               GT A  TATA  ATATTAT  GG     A  ATTAA      A TC                 CATAT   TGTC    GG
blockSeqs                     :               C  C       GAAATG                   TA A  GT    AA       T      C  TAAT       G A                  ATAT    .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGATAG                   .  G  GT    C        T      .  TGT        G T                  A       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGCAG                    .  A  GT    .        .      .  TTG        . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGCAG                    .  .  GT    .        .      .  AAT        . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       ATGGC                    .  .  AT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAGT                    .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  AT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CAAC                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CAAC                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  TT    .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CCAC                     .  .  GT    .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       TGAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAT                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAT                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAT                     .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CAAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  T     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       TGAA                     .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CAAT                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  T     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGTC                     .  .  T     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       TGAA                     .  .  T     .        .      .  AA         . G                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       AGAC                     .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAT                     .  .  T     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  T     .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAT                     .  .  A     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  T     .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CAAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAC                     .  .  C     .        .      .  TT         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       CGAG                     .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       AAG                      .  .  T     .        .      .  TT         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       GAA                      .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       TAA                      .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .       .       . 
blockSeqs                     :               .  .       GAA                      .  .  T     .        .      .  AA         . T                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       AG                       .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       GA                       .  .  T     .        .      .  AA         . T                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  A     .        .      .  AA         . A                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  AA         . A                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . A                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  T     .        .      .  AT         . A                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  T     .        .      .  TT         . T                  .       .         
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .                 
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  AA         . T                  .                 
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . C                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :               .  .       G                        .  .  T     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :                  .       G                        .  .  C     .        .      .  TT         . T                                    
blockSeqs                     :                  .       G                        .  .  .     .        .      .  TT         . .                                    
blockSeqs                     :                          G                        .  .  .     .        .      .  TT         . .                                    
blockSeqs                     :                                                         .     .        .      .  TT         . .                                    
blockSeqs                     :                                                               .        .      .  TT                                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
finalCons                     : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC





Alignments
lowQualScore                  :                          1111111111111111                                                                                              
lowQualScore                  :     0         1  22222 0 3333333333333333 00   00 11 2  99999 3333333  22     1  3333333 0  1 33   0     00      44444   1111    11    
lowQualScore                  :     .         .  ..... . ................ ..   .. .. .  ..... .......  ..     .  ....... .  . ..   .     ..      .....   ....    ..    
lowQualScore                  :     7         3  22222 6 0000000000000000 88   88 77 5  00000 4444444  00     2  9999999 6  8 55   6     88      11111   6666    22    
consensus                     : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
Reference ( family-343 )      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67500                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67501                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67502                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CT--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67503                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G--------C--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCAT--CCGTCC-----GTC----TGTC--
gi|67504                      : TTAT-TAGAGCCCT-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----TGTC--
gi|67505                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CA--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-AC-T--T--T-CT-CT-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--
gi|67506                      : TTAT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A----T--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-TT-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67507                      : TTAT-TAGGGCCC--AT-----A-T------CG--A---C-A--GAC--G--C-GG-T---G-------CC--CTACA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TTTGT--CCGTC
gi|67508                      : TTAT-AAAGGCCCG-GT-----A-T------CC--A---C-A--AAT--G--C-AG-C-----------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CTCTTG-TCCGT--TCGT--------TC----TGTC--
gi|67509                      : TTTT-TAGGGCCCTTGC-----A-T------TG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---A-------CGGGCTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67510                      : TTGT-TAGGGCC---GC-----C-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--GTATA-GT-T--T--TTCA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----GTC----CGTC--TGCC
gi|67511                      : TTAT-TAGGG-CCC-AC-----A-T------CGC-A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T-CA--T-ATG-T-CGT--CTGTCT-----GTC----
gi|67512                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--AGTT-GA-TATAG-------TC--TTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCGTCCATAT-GTC----CGTC--CGTC
gi|67513                      : TTAT-TAGGGCCCT-GC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--A----GT-T---GATATTATTC--TTATA-GT-T--T--T-CAACT-TTG-TCTGT--CCGTCCCATATGTC----CGTC--CGTC
gi|67514                      : TCAT-TAGGGCCCC-GC-----A------------A---G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67515                      : TTAT-TAGAGCCCC-GC-----A-TGCGCATCG--A---C-A--GTT--G----GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-T
gi|67516                      : TTAT-TGGAATTCT-GC-------T------CGC-A---G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC---TATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--TCATCT-----GTC----TGTCGGTGTC
gi|67517                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67518                      : TTTT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--T-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGC--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67519                      : TTAG-TAGGGCCCC-GC-----A-T------CA--A---G-A--AAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-
gi|67520                      : TTAT-TAGGGCTCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCTGT--CCATCC-----GTC----CGTC--
gi|67521                      : TCAT-TAGGGTCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-TT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CATC--CGTC
gi|67522                      : TTAT-TAGGGCCCCCGC-----A-G-------G--AAATG-A--AAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCATCTA----GTC----CGTC--
gi|67523                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TGG-TCTGT--CCGTC
gi|67524                      : TTTT-TAGGTCCCC-TT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67525                      : TTTT-TAGGGCCCC-GT-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GG-----GAA-----CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----
gi|67526                      : TCAT-TAGGGCCCC-GCCGAATA-T------CG--A---G-G------------GG-A---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--
gi|67527                      : TTAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CGGG-T---GC------CC--CTATG-GA-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67528                      :  TATATAGGGCCCC-GC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67529                      :  TAT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------A--A---G-A--GAT--G----GG-C---G--------C--CTATA-TT-TG-T--T-CA-CT-CTG-TCTGT--TC--CT-----GTC----CGTC--
gi|67530                      :  TAC-TAAGGCCA--GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TTTGT--CCGTCC-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67531                      :  TGT-TAGGACCCT-GC-----A-A------TG--A---A-A--AAT--ATAC-GG-C---G-------TC--CTATT-GT-T--T--T-CA-CG-TTG-TCCAA--TCGTTT-----GTC----TGT
gi|67532                      :  TAT-TAGGGCCCT-GCC----A-TA-----TG--G---C-A--GAT--G--T-----------------T--CTGTA-GT-A--A--T-TA-CT-CTG-TCTGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--
gi|67533                      :   AT-TAGGATCCC-GT-----A-T------CA--A---T-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----CGTC--TGTC
gi|67534                      :   AT-TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-AG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-C--TTG-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67535                      :   AT-TAGGGACCC-GC-----A-C------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------TC--CTAAA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCATT--CCGTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67536                      :   AT-TAGGGCCC--AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-T---T-------CC--CTATAAGT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CATTCT-----GTC----TGTC--CGTC
gi|67537                      :   AT-TAGGGCCTC-GC-----A-T------CG--T---C-A--GAT--G--C-CG-C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--GTATCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67538                      :   AT-AAAGGTCCC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-AG-C---G-------CC--ATATA-GT-T--T--T--A-CT-TTG-TCCGT--TCGTCT-----GTC----TGT
gi|67539                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGAT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--
gi|67540                      :   AT-TAGGGCC---AC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTT----CGTC--TGTC
gi|67541                      :   AT-TAGCGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--CAGG-T---G-------CC--CTATA-GC-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CGTC--CGTC
gi|67542                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----ATT------CGATA---G-A--GAT--A--C-GG-C---G--------C--CTATA-GC-T--TG-T-CA-CT-TTGTTCCGT--C
gi|67543                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--TTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTCC-----GTC----t
gi|67544                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A-----A--GAT--G--C--G-T---G-------CC--TTATA-GTAA--T--T-CA-A--TTG-TCCGG--CCGTCC-----GTC----
gi|67545                      :   AT-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------TC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----CGCC--
gi|67546                      :   AT-TAGGGTCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATACGT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CTGT-C-----GTC----CGTC--
gi|67547                      :   AT-TAGGGCCCC-AC--------------CG--A---GTATCGAC--G----GG-A---G-------CC--CTATG-GT-A--A--T-CAGCT-TT--TCCGT--CCGTCT-----G
gi|67548                      :    T-TAGGGCCCT-GC-----A-T------TG--A---A-A--GAT--G--G-AG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67549                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--T----CA-CA-TTG-TCCAT--CCGTCT-----GTCTGTCCGTC--
gi|67550                      :    T-TACGGCCCC-GC-----A-C------AG--A---C-A--GATATG--T-GG-C---G-------TC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--C
gi|67551                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T------TA--A---------AT--G--C-AG-TT--G-------CC--CTAAA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCGT--CCTTCT-----GTC----TGTC--TGT
gi|67552                      :    T-TAGGGCCC--GC-----A-T--------------G-A---AT--G--C-GG-T---G-------CC--TTATA-GG-TAAT--T--A-CA-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----CTTC--TGTC
gi|67553                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T--------------G-A--AAT--G--C-GGGT---G-------CC--CTATA-GT-A--A--T-CA-CA-TTG-TCCAT--CTGTCT-----GT
gi|67554                      :    T-TAGGGCCCC-GC-----A-T-------G--A---A-A--TAT--G----GG-T---G-------CC--CTATA-ATAT--TAAT-CA-CA-TTG-TCCGT--CCGTC
gi|67555                      :    T-TAGGGTCCC-GC-----A-T------CG--A---T-A--AAT--G----GG--------------C--CTACA-GT-T--T--T-CA-C---TG-TCCGT--C
gi|67556                      :     -TAGGGCCCC-AC-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CCGTCT-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67557                      :     -TAGGGTCCG-AC-----A-T------CG--A---T-A--GAT--G--C-AG-C------------------TA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CCATC
gi|67558                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67559                      :          GCCCC-AC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CTT-CTTTA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCTGT--CTGTCC-----ATC----CATC--TGTC
gi|67560                      :            CCC-GC-----A-T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTA-TCCGT--CTGTCT-----GTA----TGTC--TGTC
gi|67561                      :            CTC-GT-----A-T------CG--A---C-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-AT-T--T--T-CA-CT-ATG-TCCGT--CTGTCC-----GTC----
gi|67562                      :                 C-----A-T------CA--A---G-A--GAT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGTTGCTGTC
gi|67563                      :                  -----A-T------CG--A---C-A--GTT--G--C-GG-C---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CC-TTG-TCCGT--CCGTCG-----GTC----TGTC--TGTC
gi|67564                      :                        -T------CG--A---G-A--GAT--G--C-GG-T---G-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TCCGT--CTATCC-----GTC----TGTC--TATC
gi|67565                      :                                                         -C---A-------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTT-TCCGT--CTGTCT-----GTC----CGTC--TGTtgtc
gi|67566                      :                                                               -------CC--CTATA-GT-T--T--T-CA-CT-TTG-TGTGT--CCGTCT-----GTC----TGAC--CGTC