lowQualScore : 0 0 1111 1111 0 0 11 0 222 0 1 22 111 1111 2222 11 0 0 4 2222 22 1 333 4 333 0 0 0 0 0 00 22 5555 00 11 111 222 0 0 00
lowQualScore : . . .... .... . . .. . ... . . .. ... .... .... .. . . . .... .. . ... . ... . . . . . .. .. .... .. .. ... ... . . ..
lowQualScore : 7 7 4444 4444 7 6 55 6 111 6 2 00 000 2222 6666 44 2 5 9 2222 66 6 444 7 555 7 7 7 7 7 99 33 3333 99 66 222 222 7 7 99
consensus : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
Reference ( gi|21301 ) : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21302 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21304 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21305 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TGT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21306 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21295 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-C--A--A--A----GA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21296 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-AATAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCGG-TT-AA---TTT-CGT---T-T-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21274 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--TGCGC----GATCCT--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21276 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TGT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AAT
gi|21308 : atATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CA-GGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TT--CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-AA--AATTAAAT
gi|21279 : ATACT-GT-A----G----AG-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---A----G----T--CAGGAA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---ATT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21307 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A--AT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21280 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAAT---TTTTG--TTAAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCT---A-C-GA--AAT
gi|21309 : atATACG-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G----------------A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21297 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TTAAA---TTT-CAT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--T--A---TCC---A-T-GACGAATT
gi|21282 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--A---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21284 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A---TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TT--CGT---TTG-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AAT
gi|21285 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-A--A--A--A---CCAATCA-C-GA--ATTTTAA
gi|21311 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---G-A-TAT--T---C----T----T--CATGGA-TA-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-
gi|21290 : ATACT-GT-ATGAGG----AA-GC-A--C-A---A---TAT--T---C----A----TTTCATGGA-TT-AAAGGTTTTTTG--TTTAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A----C--A-T--A--A--A---TC----A-C-GA--AAT
gi|21283 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TATA-T---C----GTC--T--CATGAC-TT-AAA----TTTCG-----AA---T-----T---C-G-G-T-A-G--C--A-TTAG--A--A---TCA---A-CGGA--AATTAA
gi|21300 : atATATT-GT-A----G----AG-GC-A--G-A---A-A-TAT--T---C----A----TG-CAT-GA-TA-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CAT---T-G-G-C-A-G--C--A-T--A--GATA---TCA---A-C-TA--AATTATAT
gi|21291 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-T---------------------------------------TTCG--TT-AA---TTT-CGT-------G-T-A-G--CC-A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAA
gi|21303 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TT-AAA----TTTCA--TT-AT---TTT-
gi|21312 : ATACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTA-A-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGTGTCT-G-G-A-A-G----------A--A--A---ACA---A-C-AA--AATTAAAT
gi|21275 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21272 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-C-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT--G---TTT-CG
gi|21292 : atATACTAGT-A---------AA-GC-A--C-A---A---TAT--T---CTTCGG----T--C-TGGA-TT-AA-----TTTCGG-TT-TA---TTT--GT---T-G-G-T-A-G--C--A-TA-A--A--A---TC------C-GA--AACTTAAT
gi|21314 : atATACT-GT-A----G----AA-TC-A--C-A---A-A-CAT--T---C----A----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GG---TTT-AAT---T-G-A-T-A-C--C--A----A--A--G---TCG---T-C-GG--GATTTAAT
gi|21281 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21277 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CA--GG-TT-AAA----ATTTG--TT-
gi|21287 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CGCG---TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21310 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--TA-GGT-TA-AAA----TTTCG--CT-
gi|21313 : ATACT-GT-A----A----AC-GT-A--T-T---T-A-AGT--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AATATTTT-CGTGTCT-G-G---A-A--C--A----A--A--A----CA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21278 : ATACT-GT-A----GTTTGAA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21293 : atATACT-GT-A----A----AA-TC-AT-C-A---A-G-T-T--T---T----G----T--TTGGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGT---G-T-G-T-A-A-----A-TC-A--A--A---TAA---A-C-GA--AAATAAAT
gi|21315 : acATACT-GT-A----A----AA-TC-A--T-A---A-A-TTT--T---C----A----T--TGAGGA-TT-TAC----TTTCA--TT-AT---TTT-CGT---G-A-G-TAA-A--C--A----A--A--A---ACA---A-C-GA--AAATGAAT
gi|21294 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21317 : tgTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTCTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21318 : TACT-AT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--TATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCG---A-C-AA--AATTAAAT
gi|21319 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21320 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--A--A--A---TC----A-C-GA--AATTAAAT
gi|21286 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-T-GA--AATTAAAT
gi|21299 : atagTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A-------TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTAG--TT-ACT--TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--------T---TCA---A-C-T---AATTAAAT
gi|21323 : tgTACT-GT-A----G----AA-GCAA--C-A---A-A-TA---T---C----G----T--AATGGATTT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--AT-A---TCA---A-C-G---AATTAAA
gi|21289 : TACT-GT-A----G----AAGGC-A--C-A---G-A-TAT--T---C---------T--CATGGA-TT-AAAT---TTTCG--TT-A-----TT-TGT---T-G-G-T-ACG--CG-A-T--ATCA--A---TC------C-TA--ACTTAAA
gi|21321 : atgTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---C-A-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GA---TTT-
gi|21325 : TACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTA-A-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CATGTCT-G-G-A-A-G----------A--A--A---ACA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21273 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----A----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21288 : atgTATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-
gi|21322 : atgTACT-GA-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-AT---TTT-
gi|21316 : TACT-GT-A----G----AC-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--T
gi|21324 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TT-AAA----
gi|21326 : ACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---ATA-TA---T---C----G----T--AATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCAAT-A-C-GA--AATTAAA
gi|21298 : ACT-GT-A----G----AA-AC-A--CCA---A-A-TAT-----------G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-GTT-A-G--C--A----A--A--A---TCA---C-A-AA--AATTAAAT
gi|21327 : tataATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TATAAT---C----GA---T--CATGGA-------------------T-AA---TTT-CAG---T-G-G-T-A-G--C--ATT--A--A--A---TCA---A-C-AA--CATTAAA
gi|21329 : CT-GTTA----G----AA-AC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TA-AA---TTT-CGT---T-ATG-T-A-G--TAGA-T--A--A--A---TCA---A-C-AA--AATTATAT
gi|21330 : CT-GT------G----AA-CC-AAAC-A---A-T-TATA-C---C----G----T--CATGGA-CT-AAA----TTTCGCTTT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-GGCC--A-C--G--A--AAATTCA---A-C-GA--AA
gi|21328 : CT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21331 : T-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A-AATAT--T---C----G----T--CATGGA-T----------------TT-AA---TTC-AGT---T-G-G-T-A-G-----A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21332 : -GT-A----G----AA-GC-A--G-A---A-A-TAT--T---T----G----T--CATGGA-TT-AAA----TGTCG--TT-AA---TTT-CAC---T-G-G-A-A-G--C--A-T--T--A--A---
gi|21333 : -GT-A----C----AA-GC-A--C-A---A-A-TAT------C----G----T--CATGGA-AT-AAT----TTTCGGTTT-AA---TTT-CGT---T---G-T-A-G--C--A-A--A--A--A---TCA---ACC-GA--AA--AAAT
gi|21334 : -A--C-A---A-A-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TT-AA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-A-T-A-A--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AGTTAAAT
gi|21339 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTTAAT
gi|21335 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTTAAT
gi|21337 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTTAAT
gi|21336 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-C-A-A--C--A----A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTTAAT
gi|21338 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----A--A--A---TTA---A-C-GA--ATTTAA
gi|21340 : -A---A-A-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-G-A-A--C--G-A--A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTAA
gi|21306 : A-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----A--A--A---TTA---A-C-GA--AATTTAAT
gi|21339 : atactgtagaagcacaaatatttgtcaaggA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21335 : aaaaattcgtcatggA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21337 : aaaaattcgtcatggA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21336 : aaaaattcgtcatggA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21338 : aaaaattcgtcatgg-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
gi|21340 : aaaaattcgtcatggAA----TTTCG--TT-AA---TTTTCGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--A--A--A---TCA---A-C-GA--AATTAAAT
Alignments
lowQualScore : 0 0 1111 1111 0 0 11 0 222 1 22 111 1111 2222 11 0 0 4 2222 22 1 333 4 333 0 0 0 0 0 00 22 4444 11 111 222 11 0 00
lowQualScore : . . .... .... . . .. . ... . .. ... .... .... .. . . . .... .. . ... . ... . . . . . .. .. .... .. ... ... .. . ..
lowQualScore : 6 6 4444 4444 6 6 55 6 000 2 55 000 2222 6666 44 1 5 9 2222 66 6 444 1 555 7 7 7 7 7 99 33 5555 66 222 222 66 7 99
consensus : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
Reference ( family-331 ) : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21272 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AC-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT--G---TTT-CG
gi|21273 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21274 : atgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--TGCGC----GATCCT--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21275 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21276 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21277 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA--GG-TT-AAA----ATTTG--TT-
gi|21278 : atATACT-GT-A----GTTTGAA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21279 : atATACT-GT-A----G----AG-GC-A--C-A---AA-TAT--T---A----G----T--CAGGAA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---ATT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21280 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAAT---TTTTG--TTAAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCT---A--C-GA--AAT
gi|21281 : atATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21282 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--A---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21283 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATA-T---C----GTC--T--CATGAC-TT-AAA----TTTCG-----AA---T-----T---C-G-G-T-A-G--C--A-TTAGA--A---TCA---A--CGGA--AATTAA
gi|21284 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TT--CGT---TTG-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21285 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-A--AA--A---CCAATCA--C-GA--ATTTTAA
gi|21286 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--T-GA--AATTAAAT
gi|21287 : atagATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CGCG---TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21288 : atTATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-
gi|21289 : atgTACT-GT-A----G----AAGGC-A--C-A---GA-TAT--T---C---------T--CATGGA-TT-AAAT---TTTCG--TT-A-----TT-TGT---T-G-G-T-ACG--CG-A-T------A---TCA---ATCC-TA--ACTTAAA
gi|21290 : atgATACT-GT-ATGAGG----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----TTTCATGGA-TT-AAAGGTTTTTTG--TTTAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A----C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AAT
gi|21291 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-T---------------------------------------TTCG--TT-AA---TTT-CGT-------G-T-A-G--CC-A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAA
gi|21292 : atATACTAGT-A---------AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---CTTCGG----T--C-TGGA-TT-AA-----TTTCGG-TT-TA---TTT--GT---T-G-G-T-A-G--C--A-TA-AA--A---TC-------C-GA--AACTTAAT
gi|21293 : atATACT-GT-A----A----AA-TC-AT-C-A---AG-T-T--T---T----G----T--TTGGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGT---G-T-G-T-A-A-----A-TC-AA--A---TAA---A--C-GA--AAATAAAT
gi|21294 : acTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21295 : tgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-C--AA--A----GA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21296 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCGG-TT-AA---TTT-CGT---T-T-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21297 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TTAAA---TTT-CAT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AT--A---TCC---A--T-GACGAATT
gi|21298 : tACT-GT-A----G----AA-AC-A--CCA---AA-TAT-----------G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-GTT-A-G--C--A----AA--A---TCA---C--A-AA--AATTAAAT
gi|21299 : tataTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A------TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTAG--TT-ACT--TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T------T---TCA---A--C-T---AATTAAAT
gi|21300 : tgATATT-GT-A----G----AG-GC-A--G-A---AA-TAT--T---C----A----TG-CAT-GA-TA-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CAT---T-G-G-C-A-G--C--A-T--AGATA---TCA---A--C-TA--AATTATAT
gi|21301 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21302 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21303 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TT-AAA----TTTCA--TT-AT---TTT-
gi|21304 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21305 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21306 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21307 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA--AT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21308 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TT--CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21309 : ATACG-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G----------------AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21310 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TA-GGT-TA-AAA----TTTCG--CT-
gi|21311 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---GA-TAT--T---C----T----T--CATGGA-TA-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-
gi|21312 : ATACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGTGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21313 : ATACT-GT-A----A----AC-GT-A--T-T---TA-AGT--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AATATTTT-CGTGTCT-G-G---A-A--C--A----AA--A----CA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21314 : ATACT-GT-A----G----AA-TC-A--C-A---AA-CAT--T---C----A----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GG---TTT-AAT---T-G-A-T-A-C--C--A----AA--G---TCG---T--C-GG--GATTTAAT
gi|21315 : ATACT-GT-A----A----AA-TC-A--T-A---AA-TTT--T---C----A----T--TGAGGA-TT-TAC----TTTCA--TT-AT---TTT-CGT---G-A-G-TAA-A--C--A----AA--A---ACA---A--C-GA--AAATGAAT
gi|21316 : TACT-GT-A----G----AC-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--T
gi|21317 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTCTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21318 : TACT-AT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCG---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21319 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21320 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AATTAAAT
gi|21321 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---CA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GA---TTT-
gi|21322 : TACT-GA-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-AT---TTT-
gi|21323 : TACT-GT-A----G----AA-GCAA--C-A---AA-TA---T---C----G----T--AATGGATTT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AAT-A---TCA---A--C-G---AATTAAA
gi|21324 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TT-AAA----
gi|21325 : TACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CATGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21326 : ACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-----AA-TATA-T---C----G----T--AATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCAAT-A--C-GA--AATTAAA
gi|21327 : ATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATAAT---C----GA---T--CATGGA-------------------T-AA---TTT-CAG---T-G-G-T-A-G--C--ATT--AA--A---TCA---A--C-AA--CATTAAA
gi|21328 : CT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21329 : CT-GTTA----G----AA-AC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TA-AA---TTT-CGT---T-ATG-T-A-G--TAGA-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTATAT
gi|21330 : CT-GT------G----AA-CC-AAAC-A---AT-TATA-C---C----G----T--CATGGA-CT-AAA----TTTCGCTTT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-GGCC--A-C--GA--AAATTCA---A--C-GA--AA
gi|21331 : T-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-T----------------TT-AA---TTC-AGT---T-G-G-T-A-G-----A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21332 : -GT-A----G----AA-GC-A--G-A---AA-TAT--T---T----G----T--CATGGA-TT-AAA----TGTCG--TT-AA---TTT-CAC---T-G-G-A-A-G--C--A-T--TA--A---
gi|21333 : -GT-A----C----AA-GC-A--C-A---AA-TAT------C----G----T--CATGGA-AT-AAT----TTTCGGTTT-AA---TTT-CGT---T---G-T-A-G--C--A-A--AA--A---TCA---AC-C-GA--AA--AAAT
gi|21334 : -A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TT-AA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-A-T-A-A--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AGTTAAAT
gi|21335 : -A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21335 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21336 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21336 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21337 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21337 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21338 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--ATTTAA
gi|21338 : -TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21339 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21339 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21340 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-G-A-A--C--G-A--AA--A---TTA---A--C-GA--AATTAA
gi|21340 : AA----TTTCG--TT-AA---TTTTCGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
Alignments
lowQualScore : 0 0 1111 1111 0 0 11 0 222 1 22 111 1111 2222 11 0 0 4 2222 22 1 333 4 333 0 0 0 0 0 00 22 4444 11 111 222 11 0 00
lowQualScore : . . .... .... . . .. . ... . .. ... .... .... .. . . . .... .. . ... . ... . . . . . .. .. .... .. ... ... .. . ..
lowQualScore : 6 6 4444 4444 6 6 55 6 000 2 55 000 2222 6666 44 1 5 9 2222 66 6 444 1 555 7 7 7 7 7 99 33 5555 66 222 222 66 7 99
consensus : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
Reference ( family-331 ) : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21272 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AC-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT--G---TTT-CG
gi|21273 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21274 : atgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--TGCGC----GATCCT--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21275 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21276 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21277 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA--GG-TT-AAA----ATTTG--TT-
gi|21278 : atATACT-GT-A----GTTTGAA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21279 : atATACT-GT-A----G----AG-GC-A--C-A---AA-TAT--T---A----G----T--CAGGAA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---ATT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21280 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAAT---TTTTG--TTAAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCT---A--C-GA--AAT
gi|21281 : atATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21282 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--A---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21283 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATA-T---C----GTC--T--CATGAC-TT-AAA----TTTCG-----AA---T-----T---C-G-G-T-A-G--C--A-TTAGA--A---TCA---A--CGGA--AATTAA
gi|21284 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TT--CGT---TTG-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21285 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-A--AA--A---CCAATCA--C-GA--ATTTTAA
gi|21286 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--T-GA--AATTAAAT
gi|21287 : atagATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CGCG---TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21288 : atTATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-
gi|21289 : atgTACT-GT-A----G----AAGGC-A--C-A---GA-TAT--T---C---------T--CATGGA-TT-AAAT---TTTCG--TT-A-----TT-TGT---T-G-G-T-ACG--CG-A-T------A---TCA---ATCC-TA--ACTTAAA
gi|21290 : atgATACT-GT-ATGAGG----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----TTTCATGGA-TT-AAAGGTTTTTTG--TTTAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A----C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AAT
gi|21291 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-T---------------------------------------TTCG--TT-AA---TTT-CGT-------G-T-A-G--CC-A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAA
gi|21292 : atATACTAGT-A---------AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---CTTCGG----T--C-TGGA-TT-AA-----TTTCGG-TT-TA---TTT--GT---T-G-G-T-A-G--C--A-TA-AA--A---TC-------C-GA--AACTTAAT
gi|21293 : atATACT-GT-A----A----AA-TC-AT-C-A---AG-T-T--T---T----G----T--TTGGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGT---G-T-G-T-A-A-----A-TC-AA--A---TAA---A--C-GA--AAATAAAT
gi|21294 : acTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21295 : tgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-C--AA--A----GA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21296 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCGG-TT-AA---TTT-CGT---T-T-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21297 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TTAAA---TTT-CAT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AT--A---TCC---A--T-GACGAATT
gi|21298 : tACT-GT-A----G----AA-AC-A--CCA---AA-TAT-----------G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-GTT-A-G--C--A----AA--A---TCA---C--A-AA--AATTAAAT
gi|21299 : tataTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A------TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTAG--TT-ACT--TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T------T---TCA---A--C-T---AATTAAAT
gi|21300 : tgATATT-GT-A----G----AG-GC-A--G-A---AA-TAT--T---C----A----TG-CAT-GA-TA-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CAT---T-G-G-C-A-G--C--A-T--AGATA---TCA---A--C-TA--AATTATAT
gi|21301 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21302 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21303 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TT-AAA----TTTCA--TT-AT---TTT-
gi|21304 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21305 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21306 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21307 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA--AT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21308 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TT--CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21309 : ATACG-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G----------------AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21310 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TA-GGT-TA-AAA----TTTCG--CT-
gi|21311 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---GA-TAT--T---C----T----T--CATGGA-TA-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-
gi|21312 : ATACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGTGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21313 : ATACT-GT-A----A----AC-GT-A--T-T---TA-AGT--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AATATTTT-CGTGTCT-G-G---A-A--C--A----AA--A----CA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21314 : ATACT-GT-A----G----AA-TC-A--C-A---AA-CAT--T---C----A----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GG---TTT-AAT---T-G-A-T-A-C--C--A----AA--G---TCG---T--C-GG--GATTTAAT
gi|21315 : ATACT-GT-A----A----AA-TC-A--T-A---AA-TTT--T---C----A----T--TGAGGA-TT-TAC----TTTCA--TT-AT---TTT-CGT---G-A-G-TAA-A--C--A----AA--A---ACA---A--C-GA--AAATGAAT
gi|21316 : TACT-GT-A----G----AC-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--T
gi|21317 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTCTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21318 : TACT-AT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCG---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21319 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21320 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AATTAAAT
gi|21321 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---CA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GA---TTT-
gi|21322 : TACT-GA-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-AT---TTT-
gi|21323 : TACT-GT-A----G----AA-GCAA--C-A---AA-TA---T---C----G----T--AATGGATTT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AAT-A---TCA---A--C-G---AATTAAA
gi|21324 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TT-AAA----
gi|21325 : TACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CATGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21326 : ACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-----AA-TATA-T---C----G----T--AATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCAAT-A--C-GA--AATTAAA
gi|21327 : ATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATAAT---C----GA---T--CATGGA-------------------T-AA---TTT-CAG---T-G-G-T-A-G--C--ATT--AA--A---TCA---A--C-AA--CATTAAA
gi|21328 : CT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21329 : CT-GTTA----G----AA-AC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TA-AA---TTT-CGT---T-ATG-T-A-G--TAGA-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTATAT
gi|21330 : CT-GT------G----AA-CC-AAAC-A---AT-TATA-C---C----G----T--CATGGA-CT-AAA----TTTCGCTTT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-GGCC--A-C--GA--AAATTCA---A--C-GA--AA
gi|21331 : T-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-T----------------TT-AA---TTC-AGT---T-G-G-T-A-G-----A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21332 : -GT-A----G----AA-GC-A--G-A---AA-TAT--T---T----G----T--CATGGA-TT-AAA----TGTCG--TT-AA---TTT-CAC---T-G-G-A-A-G--C--A-T--TA--A---
gi|21333 : -GT-A----C----AA-GC-A--C-A---AA-TAT------C----G----T--CATGGA-AT-AAT----TTTCGGTTT-AA---TTT-CGT---T---G-T-A-G--C--A-A--AA--A---TCA---AC-C-GA--AA--AAAT
gi|21334 : -A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TT-AA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-A-T-A-A--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AGTTAAAT
gi|21335 : -A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21335 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21336 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21336 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21337 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21337 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21338 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--ATTTAA
gi|21338 : -TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21339 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21339 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21340 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-G-A-A--C--G-A--AA--A---TTA---A--C-GA--AATTAA
gi|21340 : AA----TTTCG--TT-AA---TTTTCGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
blockSeqs : TGAG TTTG AA TTT A AA GCG TTCG ATCC TT A GGTT CT A TAT A GTC AG TTA AT AAT ATC TC
blockSeqs : . . T TTT A A . . TC G A T GT T T A GTC G TA T . AT C
blockSeqs : . . . . . A . . A . A T G A T A GTC C TC . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . A . G . T A . . TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . T A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . T . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
finalCons : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
Alignments
lowQualScore : 0 0 1111 1111 0 0 11 0 222 1 22 111 1111 2222 11 0 0 4 2222 22 1 333 4 333 0 0 0 0 0 00 22 4444 11 111 222 11 0 00
lowQualScore : . . .... .... . . .. . ... . .. ... .... .... .. . . . .... .. . ... . ... . . . . . .. .. .... .. ... ... .. . ..
lowQualScore : 6 6 4444 4444 6 6 55 6 000 2 55 000 2222 6666 44 1 5 9 2222 66 6 444 1 555 7 7 7 7 7 99 33 5555 66 222 222 66 7 99
consensus : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
Reference ( family-331 ) : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21272 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AC-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT--G---TTT-CG
gi|21273 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21274 : atgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--TGCGC----GATCCT--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21275 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21276 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21277 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA--GG-TT-AAA----ATTTG--TT-
gi|21278 : atATACT-GT-A----GTTTGAA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-
gi|21279 : atATACT-GT-A----G----AG-GC-A--C-A---AA-TAT--T---A----G----T--CAGGAA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---ATT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21280 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAAT---TTTTG--TTAAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCT---A--C-GA--AAT
gi|21281 : atATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21282 : acATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--A---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21283 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATA-T---C----GTC--T--CATGAC-TT-AAA----TTTCG-----AA---T-----T---C-G-G-T-A-G--C--A-TTAGA--A---TCA---A--CGGA--AATTAA
gi|21284 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----T--CATGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TT--CGT---TTG-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AAT
gi|21285 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-A--AA--A---CCAATCA--C-GA--ATTTTAA
gi|21286 : atTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-A----------------AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--T-GA--AATTAAAT
gi|21287 : atagATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CGCG---TTAAAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21288 : atTATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-
gi|21289 : atgTACT-GT-A----G----AAGGC-A--C-A---GA-TAT--T---C---------T--CATGGA-TT-AAAT---TTTCG--TT-A-----TT-TGT---T-G-G-T-ACG--CG-A-T------A---TCA---ATCC-TA--ACTTAAA
gi|21290 : atgATACT-GT-ATGAGG----AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---C----A----TTTCATGGA-TT-AAAGGTTTTTTG--TTTAA---TTT-CGT---T-G-G-T-A----C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AAT
gi|21291 : atATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-T---------------------------------------TTCG--TT-AA---TTT-CGT-------G-T-A-G--CC-A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAA
gi|21292 : atATACTAGT-A---------AA-GC-A--C-A---A--TAT--T---CTTCGG----T--C-TGGA-TT-AA-----TTTCGG-TT-TA---TTT--GT---T-G-G-T-A-G--C--A-TA-AA--A---TC-------C-GA--AACTTAAT
gi|21293 : atATACT-GT-A----A----AA-TC-AT-C-A---AG-T-T--T---T----G----T--TTGGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGT---G-T-G-T-A-A-----A-TC-AA--A---TAA---A--C-GA--AAATAAAT
gi|21294 : acTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21295 : tgATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-C--AA--A----GA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21296 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCGG-TT-AA---TTT-CGT---T-T-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21297 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TTAAA---TTT-CAT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AT--A---TCC---A--T-GACGAATT
gi|21298 : tACT-GT-A----G----AA-AC-A--CCA---AA-TAT-----------G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-GTT-A-G--C--A----AA--A---TCA---C--A-AA--AATTAAAT
gi|21299 : tataTACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A------TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTAG--TT-ACT--TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T------T---TCA---A--C-T---AATTAAAT
gi|21300 : tgATATT-GT-A----G----AG-GC-A--G-A---AA-TAT--T---C----A----TG-CAT-GA-TA-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CAT---T-G-G-C-A-G--C--A-T--AGATA---TCA---A--C-TA--AATTATAT
gi|21301 : tATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21302 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21303 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TT-AAA----TTTCA--TT-AT---TTT-
gi|21304 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21305 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TGT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21306 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21307 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA--AT--T---T----G----T--CAAGGA-TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21308 : ATACT-GT-A----A----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TT--CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21309 : ATACG-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CCT---T-G-G----------------AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21310 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TA-GGT-TA-AAA----TTTCG--CT-
gi|21311 : ATACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---GA-TAT--T---C----T----T--CATGGA-TA-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-
gi|21312 : ATACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTCG--TT-AT---TTT-CGTGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21313 : ATACT-GT-A----A----AC-GT-A--T-T---TA-AGT--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AATATTTT-CGTGTCT-G-G---A-A--C--A----AA--A----CA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21314 : ATACT-GT-A----G----AA-TC-A--C-A---AA-CAT--T---C----A----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GG---TTT-AAT---T-G-A-T-A-C--C--A----AA--G---TCG---T--C-GG--GATTTAAT
gi|21315 : ATACT-GT-A----A----AA-TC-A--T-A---AA-TTT--T---C----A----T--TGAGGA-TT-TAC----TTTCA--TT-AT---TTT-CGT---G-A-G-TAA-A--C--A----AA--A---ACA---A--C-GA--AAATGAAT
gi|21316 : TACT-GT-A----G----AC-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--T
gi|21317 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTCTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21318 : TACT-AT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--TATGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCG---A--C-AA--AATTAAAT
gi|21319 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21320 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT--AA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TC----A--C-GA--AATTAAAT
gi|21321 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---CA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TTAAAA----TTTCG--TT-GA---TTT-
gi|21322 : TACT-GA-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T----TGGG-TTAAAA----TTTCG--TT-AT---TTT-
gi|21323 : TACT-GT-A----G----AA-GCAA--C-A---AA-TA---T---C----G----T--AATGGATTT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AAT-A---TCA---A--C-G---AATTAAA
gi|21324 : TACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--C--GGG-TT-AAA----
gi|21325 : TACT-GT-A----G----A---C-A--T-ATTTAA-T-T--T---C----G----T--GTTGGA-TT-AAA----TTTTG--TT-AT---TTT-CATGTCT-G-G-A-A-G----------AA--A---ACA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21326 : ACT-GT-A----G----AA-GC-A--C-----AA-TATA-T---C----G----T--AATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-AAT--TTT-CTT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCAAT-A--C-GA--AATTAAA
gi|21327 : ATT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TATAAT---C----GA---T--CATGGA-------------------T-AA---TTT-CAG---T-G-G-T-A-G--C--ATT--AA--A---TCA---A--C-AA--CATTAAA
gi|21328 : CT-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CA-GGT-TA-AAA----TTTCG--TT-GT---TTT-
gi|21329 : CT-GTTA----G----AA-AC-A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TTTTG--TA-AA---TTT-CGT---T-ATG-T-A-G--TAGA-T--AA--A---TCA---A--C-AA--AATTATAT
gi|21330 : CT-GT------G----AA-CC-AAAC-A---AT-TATA-C---C----G----T--CATGGA-CT-AAA----TTTCGCTTT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-GGCC--A-C--GA--AAATTCA---A--C-GA--AA
gi|21331 : T-GT-A----G----AA-GC-A--C-A---AAATAT--T---C----G----T--CATGGA-T----------------TT-AA---TTC-AGT---T-G-G-T-A-G-----A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21332 : -GT-A----G----AA-GC-A--G-A---AA-TAT--T---T----G----T--CATGGA-TT-AAA----TGTCG--TT-AA---TTT-CAC---T-G-G-A-A-G--C--A-T--TA--A---
gi|21333 : -GT-A----C----AA-GC-A--C-A---AA-TAT------C----G----T--CATGGA-AT-AAT----TTTCGGTTT-AA---TTT-CGT---T---G-T-A-G--C--A-A--AA--A---TCA---AC-C-GA--AA--AAAT
gi|21334 : -A--C-A---AA-TAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-AAA----TT-AA--TT-AA---TTT-CGT---T-G-A-T-A-A--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AGTTAAAT
gi|21335 : -A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21335 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21336 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21336 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21337 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21337 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21338 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--A----AA--A---TTA---A--C-GA--ATTTAA
gi|21338 : -TT-AAA----TT-CG--TT-AA---TTT-TGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21339 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---T-A-C-C-A-A--C--G----AA--A---TTA---A--C-GA--AATTTAAT
gi|21339 : A-TT-AAA----TTTCG--TT-AA---TTT-CGT---T-G-G-T-A-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT
gi|21340 : aaaaattcgtcatgg-A---AA-AAT--T---C----G----T--CATGGA-TT-TAA----TTTCG--TT-GA---TTTATGC---C-A-C-G-A-A--C--G-A--AA--A---TTA---A--C-GA--AATTAA
gi|21340 : AA----TTTCG--TT-AA---TTTTCGT---T-C-G-T-G-G--C--A-T--AA--A---TCA---A--C-GA--AATTAAAT