lowQualScore : 111111111111111 111111
lowQualScore : 11 0 1 2 11 1 0 22 1 2222 0 1 33 3333 22 0 2222222 0 11 11 0 0 22 111 1111 2 00 0 1 1 2 0 22 555555555 22 2 0 1 11 11 111 3333333 1 1 55555 0 3333 1 0 0 33 00 222 0 11 22 0 4444 11 555555555555555 0 1 111 2222 222222 1 1 11111 222 0 0 1 22 111 11 2 1 66666666666 1 22 11 33 0 1 1 11 2 4 0 0 1 3333 11 1 2222 2222 0 11 222 000000 0 0 0 11 0
lowQualScore : .. . . . .. . . .. . .... . . .. .... .. . ....... . .. .. . . .. ... .... . .. . . . . . .. ......... .. . . . .. .. ... ....... . . ..... . .... . . . .. .. ... . .. .. . .... .. ............... . . ... .... ...... . . ..... ... . . . .. ... .. . . ........... . .. .. .. . . . .. . . . . . .... .. . .... .... . .. ... ...... . . . .. .
lowQualScore : 00 7 4 0 66 3 7 99 3 3333 7 3 55 0000 55 6 1111111 6 55 55 6 6 99 888 4444 0 99 7 3 4 7 7 33 666666666 22 6 7 3 55 55 111 8888888 3 3 88888 6 5555 3 6 7 88 99 555 7 99 33 7 2222 66 333333333333333 7 4 999 2222 777777 4 4 88888 666 7 7 4 66 222 77 1 4 44444444444 5 55 00 11 7 4 4 00 1 3 7 7 5 0000 77 5 3333 3333 7 88 000 000000 8 8 8 22 9
consensus : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C-N-T-T-T-T--A-TATT
Reference ( gi|56820 ) : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-TATT
gi|56821 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-TATT
gi|56822 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-------T---C-A-T-A--T---A--T-T---------------T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-----C-T-T-T-T--A-TATT
gi|56823 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------TAT-C--G--AC-TTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---CAA-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-AGT-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--T-TAT
gi|56825 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------AAC--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G--C--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-AATT---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--A-A-T-TT----CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AC---AATGT-T-T-T-T-T--A-TATgtt
gi|56824 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--T--C---T-G--CT--A--G----T--CG-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--A-A-T-TT--A-TG-TTG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TATT
gi|56828 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA---------------AT----------T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-TGATCGAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-TATT
gi|56826 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----T--AC-CT-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-T-AC-A-A-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-C--A--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-T-A-C----G--A-T----GAA----A-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TATT
gi|56827 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-T--GA----G--AC-CGTGAACCGA-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-CTCA------A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-ATT-T---T----T------G-AC-------T---T-A-T-A--T---G--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---TT--T-T-T-T-T-T--T-TAT
gi|56831 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-GGT--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GAAG-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C-----------A----C-A-C-T--G--C---TTG--CG--CA-G----C--CT-C---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--G---C--T-CCT--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-TATT
gi|56830 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--A--CG-------A-C--T--T-TAA--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------GC-T-GAA-G--A--TT---T-------T-T-C--G--ATACTCA----CAA-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TAT-T--------C--C-TA-A--T--G---T-TT--ACCG-TTAGC-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C-TAT-T-A-T--A-TAT
gi|56841 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-CTCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---AA--C-C-T-T-T-T--A-TATT
gi|56840 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-CTCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---AA--C-C-T-T-T-T--A-TATT
gi|56837 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-CG-------A-T--CGGC-G-A--CT---TA----T-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--CC--T-G--C----C-G----T--CA-T---T-----T-C---T-C---G-----------G-AC-G-----TT--C-A-TTA--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----A-C--AA---AA--C-T-T-T-T-
gi|56833 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--T--TAT-A--CT---CT----G-GT--GA-G-A--A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--AATTT---T-------T-T-C--GA-AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CGA-AC-G----T--CA-T---T-----C-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C---T-A--T---A--T-T-T--------CCTC-T--A--T--G-A---TT--A-CG--TA-C-A-C----GGTG-T----GAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-TAT
gi|56834 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--G--T-T-A--CC---CA------GT---A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T---C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC------T--CA-T---T-------C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-C--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-C--TT--C-A-C----G--G-TC---GAA----G-C--AA---A-----C-T-T-T-G--A-TATT
gi|56839 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GAGATTG--AC-TG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--TGG-A-G--A-------T-------T-T-C--G--AT--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T----T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-----------G-T----GAA----G-C--AAC--AA--C---T-T-T-T--A-TATT
gi|56835 : TTCT--C-AC-ATT-TATT-C-A--CGC----AGTTG-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-AACCC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCC----C-ATC-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T--------AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--ATCA---A-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AG---A-----T-G-T-T-T--A-T
gi|56829 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--TA-CTCAT-----T-G-A-T-T---G----T------G-GC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T--------tat
gi|56838 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-C--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT----------------------------------G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-CTCA----A-A-C-T--G--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-T-----------CGA-C-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-TTG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--t
gi|56844 : TTCT--C-AC-GTT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--TA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT----------------------------------G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---TGACTGT-G-A-G-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---A--T-T-C--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CC-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-C-T-T-T--G-TATTtgtt
gi|56846 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-TTTGA----G--AC-CG-------A-CAATA-T-T-A--CCT--CA------GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-A-G-A--A--TT---T-------T-T-CT-G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T---A-T---T-----T-C-A-C-TCCAG----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---AT-T-T-T--------C--C-TTGA--T--G-A-T-TT--A-C--TTA-C-A-C----GA-G-T----GAAG---G-CG-AA---AA--C-T-T-T-T-T--A-T
gi|56842 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--G-TAT
gi|56851 : TTCT----AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-TT-GA----GG-AC-CG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----TGGT--GA-G-AC-A-G-CCGAAT---------GT-T-G-A-G--AT-TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-CA-G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-AT-T---A--T-T-TTTTTTTTCC--T-T--A--T--G-A-T-TT--A-CGTTTA-C-A-T-------G-T----GAGCAATG-CTGAA---AA--C-TAT-T-T-T--A-TAT
gi|56852 : TTCT--C-ACCATT-T--T-C-AATC-T----AGT-G-TC-GG----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--TC---TACAATT-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-AAG--A--TT---TG------T-T-C--G--AT--TCATA--C-A-C-TC-G--C---T-GAGCGC-AC-G----TGTCA-T---T-----TTC-A-T-TT--G----T------G-AC-G-----T---C-A-A-C--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-TGTT--A-CG-TTA-C-AAC----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C-T-T-T-T-C--A-TAT
gi|56847 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-A--G--AT-CTCG----C-A-C-T--G--CT--T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----------------------------------------------------T---G--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---AA--T-A-T-T-T-T--A-TATT
gi|56848 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--G--T---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-----------TG-TTA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---AA--
gi|56853 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-AG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-G---AA-G-AC-A-G-CC---T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------A-T----G--AT-CTCA----C-A-C-TGAG--CTGAT-G--CG--ACAG----C--TA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---T--TAT-T--------C--C-T--A--TTCG-A-T-TT--ACCC-TTA-CGA-C---------T----GAA----A-C--AA---AA--C-T-T-TAT-T--A-Ttgttatttaatt
gi|56845 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-TCT--AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T--------T------G-AT-G-----A---C-A-A-AACT---T--T-T-T--------T--A-T--A--T--G---T-TT----CG-TT
gi|56850 : TTCT--C-AC-ATT-C--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-C-A--CC---CG----T-AT---A-C-AC-A-G-CC--AT------------T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--C--A--CTCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-T-------------A-T-C---T----T------G-AC-A-----T---A-A---A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T----A-T-TTAAA-CG-TTA-C-A-C----G--A-T-----AA----G-C---A---AA--C-T-T-T-A-T--A-T
gi|56843 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--A-C-----GT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-C-T--G--CT-CTCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--G-TAT
gi|56856 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-----------------------------------T-T-A--T---------------------AC-----CC--AC---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-GC-A-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-AG-TTA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-C-T-T-T--A-TA
gi|56854 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T--------T------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-TTA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---AA--G-G-C-T-T-T--G-TATT
gi|56857 : TTC---C-AC--TT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-A--C--T-T-A--CC---GA----TGGT--GA-G-AC-A---CC--ATTG-------G--TAG-A-GT-A--TT---TTAC----T-T-C--A--G---TCA----C-A-C-T-----C---T-G--C---AC-G----T--CA-T---T-----T-T-A-T-A---GT---T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--CAT--A--T--A-A-T-TT--A-CGATTA-C-ATC----G--G-T----ATA----G-C--AA---------T-T-T-T-TCAA-TAT
gi|56836 : TTCT--C-AC-ATTAT--T-C-A--C-CGTTGAGT-G-A--GA----T--AC-CG-------A-C--T--T-------------------GT--GA-GGAC---G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---TCGCATGCT-G-C--A--GT-TTTG------A-C-T--GTAC---T-G--CGGAAC-G----T--C------T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TGT-T--------T--C-T--A--T--GAA-T-TT--A-CG--TA-C-A-CA---G--G-T----GAA----G-C--AA---GA--T-G-TAT-T-T--A-TATT
gi|56832 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AC-TA-------A-C--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCG----C-A-T-T--G--C---
gi|56861 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--C-C----AGT-G-C--AA----G--ATTCA-------A-C--T--T-A-A--CC---CA----T-TT--GA-A-A-------------------------------------T---T-------T-T-T--GTTGT-CTTA----C-A-C-T--G--T---T-G--CA--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---T-A-T-A--T---A--T-T-T--------TT-C-T--C--T--G-A-T-TT--A-CA-TTA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-T--AA---
gi|56862 : TTCT--T-AC-AAT-A--T-C-A--C-C----AG----------------------------A-A--T--T-T-A--CC---CA----T-GC--GA-G-AC-G-G-CC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--TT-TTTG----C-A-C-T--C--C---T-G--CG--AC-G--------------------T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---G--C-T-T--------T--C-T--T--T--G-A-T-AT--A-TA-TTA-G-G-T----G--G-T----GAA----A-T--AA---TA--C-A-T-T-T-T--G-TGTT
gi|56859 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-T----AGT-G-T--AA----C--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-TC-A-G-CT--AT---------G--C-G------------------------T-C--G--A-----A----C-G-C-CGAG--C---T-G--CG--A--G----T--CA----------------------------------------------T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-GT--A-CA-TTA-C-A-T----G----------------G-C--AATCTAA--T-T-T-T-T-T--A-CATT
gi|56863 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-T--T--T-T-A--CC---CA----TCAT--AG-A-AT-ATG-CC--A----------G--CAG-A-GCAA--TTGCAT-------T-T-CATA--AC-GCCATGTTC-A-C-T--G--A---A-A--AA--AC-GTTATT--CA-T---T-----T-C-T-TAT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-------A-C--TGA-A-C-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A
gi|56858 : TTCT--C-AC-ATT-G--T-C-A--C-C----AGT-A-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--G-T-A--CT---CA----T-GT--GA-G-AC-A-A-TT--AT---------G--T-T-A-G--A--CT---T-------T-T-T-----AT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-GATTT--AC-G----T--TA-------------C-A-C-G---G----T------G-AA-G---------C-A-A-A--T---G--T-T-T--------C--A-T--A--T--ttcgtttgaatt
gi|56849 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-TTA--C-C----AGT-G-T--GGAG--G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC-------------------------------AT---------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-C-T--G------TCA----C-A-C-TT-G--T---T-G--CG--AC-G-------CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-----------TG--TA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---AA--t
gi|56855 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A---CC--AT---------G--TAG-A-G--A--TT---T-------T-TTC--T--GT-CTTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T---T----G------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------TT-C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-TTA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---AA--G-G-C-T-T-T--G-TATT
gi|56860 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----C-GA--GA-G-AC-A-A-CC--AT---------T--G-G-A-G--A--TT---T-------
gi|56865 : TTCT--C-CC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-C--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-CG-A-A-TC--TTGTCTCCTCGG--T-G-G-A--A--TT---T-------C-C-T--T--AT-CCCA----C-A-C-T--
gi|56864 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--CGC----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A----T--T-T-A--CC---CA----T-
gi|56866 : TTCT--CGAC-AAC-A--T-C-A--C------AGT-G-TT-GA----G--AG-TC-------A-C--C--T-T-T--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AG---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------C-T-CT-G--GT-CTCA----C-A-
gi|56867 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-
gi|56868 : TTCTGCC-ACCATT-T--C-T-A--C-C----AAT-G-T--GAT---G--AT-AG-------G-T--T--T-T-CT-CC---CA----T-GT--GA-G-AA-A-G-CC--TC---------G--T-G-A-G--A--TC---C-------G-C-C--T--AT-CTCA----C-A-
gi|56869 : TCT--A-AC-ATT-T--T-C-G--C-C----AGT-G-T--AA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GG-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-G-G--A--TT---T-------T-T-C--
gi|56870 : TCT--C-AC-ATT-AA-T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AT-CA-------G-TA-T--T-T-A--CC----A----T-GTTGGA-G-AC-A-G-CC--AT---------AATT-G---G--A--CT---T-------A-T-T--G---C-CTTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--GC-A----T--CA-T---T-----T-T-G-T-T---A----T------G-AC-A-----TATGT-A-T-A--TACAA--T-G-T--------A--T-T--AACT--G-ATT-TT--A-CA-GTA-C-A------G--A-T----AGA----GTT--AA---AA--TAT-T-T-T-T--
gi|56871 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-TT-GA----G--AC--G-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-TTC--G--AT-CTCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----TT-CA-T---T-----T-C-A-TCT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T-----T--G-A-T-TT--A-CGTTTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--C---T-T-T-T--A-TATT
gi|56872 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-T--GA----G--AC--G-------A-C--T--T---A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-GT---T--CATT---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-TCA--T---A--T-T-T--------C--C-TA-A--T--G-A-T-TT--A-CGTTTA-C-A-C----G--G-T----G-A----G-C---A---AA--C-T-T-T-TAT--A-TATT
gi|56873 : T--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT-------------------T------------T-----G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----
gi|56874 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------
gi|56875 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----A--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-GTCC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----CAA-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----TACATTCG-AC-GTTTCTT---T-A-T-A--C---A--T-T-T--------acattcgactttctttata
gi|56876 : -AC-ATT-T--T-C-AC-C-C----AGT-GTT--GA----G--AC-T--------A-C-----T-T-A--CC---CA----T-GG--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CTCA----C-A-C-T---------T-G--CA--AC-AT---T--CA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----TC--C-A-T-A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T--A-----TT--A-CGTTTA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C-------AA--T-T-T-T-T-T--ATTATTt
gi|56877 : C-ATT-C--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A
gi|56878 : -ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-AA--GA-G-AC-A-G-CC--ATATATTA---G--T-G-A-G--A--TT---C-------T-C-T--G---T-ATTA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AC-G----C--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-----A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-AT--A-CG-TTA-C-A-C----T--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TGTT
gi|56879 : -ATT-T--T-C----C-C----TGT-G-T--GA----G--AC-GG-------A-C--T--T-T-A--CCATGCA----T-GT--GA-GAAC-A-G-CC--AT---------G--T-G-AGG--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-CTT--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-----------T-G-A-T-T---G----TG-----G-AC-G-----T---C-ATT-A--C---A--T-TCT--------T--C-T--A--TC-A-A-TCTT--A-CG--TA-C-T-CA---G--G-T----AAA----G-C--AA---AA--A-T-G-T-T-T--A-TGT
gi|56880 : --T-C-A--C-C----AAT-G-T--GA----G--AT-CA-------A-A--T--T-T-A--TT---CA----T-GC--GA-G-AC-A-A-CC--GT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-----------------AT-CTAA----C-T-T-T--G--C---T-A--CA--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--TGT--A--A--G-A-T-TT--A-C----A-T-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---AA--C-A-T-T-A-T--G-TACT
gi|56881 : -A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--T-T-A--AC---CA----A-GT--GA-G-GC-G-G-TC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-A--T--GT-CTCA----C-A-C-T--T--T---T--------AC-G----T--C------T-----A-C-A-T-T---G----T------G-
gi|56882 : C-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---TA----T-GT--GA-G-AC-A----C--GT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-G-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---GTACAT------A-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-C--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----tattcatgagttatttatttt
gi|56883 : --T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-CCCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---ATGT-T-T--------T--C-T----------A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TTTT
gi|56884 : -G-A-T--A--TT---C-------TAT-C--A--GT-CTCT----C-A-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----A---A-A-T-A--T---A--T-T-T----------------A--T--G-A-T-TT--A-CG-GTA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-A-T-T-T-T--A-TATT
gi|56885 : -G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-A----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AT-A---------C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TATTTA-C-A-T----G--G-T----AAT----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TATT
gi|56886 : --TT---G-------T-T-C--C--GT-CTCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-T-A--T----------------------------------------------G-TTA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---AA----T-T-T-T-T--A-TATT
gi|56887 : T-CTCA----C-A-C-T--G--C---C-T--CA--AC-G----T--TA-T---TGATT-T-G-A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--C--A-A-T-GC--A-CA-TTA-T-A-TTAAAG--G-T----GAA----G-T--AA---AA--T-A-T-C-T-T--G-TATT
gi|56888 : ----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-TTG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-
gi|56889 : C-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----A--G-T----AAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-T--A-TATT
gi|56858 : --T--G-A-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C---A---AA--T-G-T-T-T-C--A-TATT
gi|56890 : ttctcacattgtcaccagtatgagaccgacagtactcatgtgagacaattatgttagactttttatctcacactgc-T-TT--A-CG-TTA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AA--T-G-T-T-T-C--A-TATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 11 0 1 2 11 1 0 22 1 2222 0 1 33 2222 22 0 2222222 0 11 11 0 0 22 111 1111 1 00 0 1 1 2 0 22 555555555 22 2 0 1 11 11 111 2222222 1 1 555555 0 00 3333 1 0 0 33 00 111 0 11 22 0 4444 11 444444444444444 0 1 111 2222 222222 1 1 11111 222 0 0 1 22 111 11 2 1 55555555555 1 22 11 33 0 1 1 11 2 4 0 0 0 1 3333 11 1 2222 2222 0 11 111 666 0 0 11 0
lowQualScore : .. . . . .. . . .. . .... . . .. .... .. . ....... . .. .. . . .. ... .... . .. . . . . . .. ......... .. . . . .. .. ... ....... . . ...... . .. .... . . . .. .. ... . .. .. . .... .. ............... . . ... .... ...... . . ..... ... . . . .. ... .. . . ........... . .. .. .. . . . .. . . . . . . .... .. . .... .... . .. ... ... . . .. .
lowQualScore : 00 7 3 0 66 3 6 88 3 3333 6 3 55 9999 44 6 1111111 6 55 55 6 6 88 888 4444 9 99 7 3 3 7 7 22 555555555 22 6 6 3 55 55 111 7777777 3 3 999999 6 99 5555 3 6 7 88 99 888 7 99 33 7 2222 66 888888888888888 7 4 999 1111 666666 4 4 77777 666 7 7 4 66 222 66 1 4 22222222222 4 44 00 11 7 4 4 00 1 3 7 7 7 5 0000 77 5 3333 3333 7 88 333 555 8 8 22 9
consensus : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC-GT-T-TT--A-TATT
Reference ( family-323 ) : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC-NT-T-TT--A-TATT
gi|56820 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--A-TATT
gi|56821 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--A-TATT
gi|56822 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-------T---C-A-T-A--T---A--T-T---------------T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A---CT-T-TT--A-TATT
gi|56823 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------TAT-C--G--AC-T--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---CAA-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-AGT-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--T-TAT
gi|56824 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--C---T-G--CT--A--G----T--CG-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--A-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TATTgtt
gi|56825 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------AAC--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G--C--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-AATT---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--A-A-T-TT----CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AC---AAT-GT-T-TT--T-TAT
gi|56826 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----T--AC-CT-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-T-AC-A-A-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-C--A--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----G--A-T----GAA----A-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TATTat
gi|56827 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-T--GA----G--AC-CGTGAACCGA-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA------A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-ATT-T---T----T------G-AC-------T---T-A-T-A--T---G--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---TTT-TT-T-TT--T-TAT
gi|56828 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA---------------AT----------T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-TGATCGAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--A-TATT
gi|56829 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--TA-CTCAT-----T-G-A-T-T---G----T------G-GC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T--------
gi|56830 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--A--CG-------A-C--T--T-TAA--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------GC-T-GAA-G--A--TT---T-------T-T-C--G--ATAC--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TAT-T--------C--C-TA-A--T--G---T-TT--ACCG-T-TAGC-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC--T-A-TT--A-TATt
gi|56831 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-GGT--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GAAG-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C-------------A----C-A-C-T--G--C---TTG--CG--CA-G----C--CT-C---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--G---C--T-CCT--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--A-TATTat
gi|56832 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AC-TA-------A-C--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCG----C-A-T-T--G--C---
gi|56833 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--T--TAT-A--CT---CT----G-GT--GA-G-A--A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--AATTT---T-------T-T-C--GA-AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CGA-AC-G----T--CA-T---T-----C-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C---T-A--T---A--T-T-T--------CCTC-T--A--T--G-A---TT--A-CG---TA-C-A-C----GGTG-T----GAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TT--A-TAT
gi|56834 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--G--T-T-A--CC---CA------GT---A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T---C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC------T--CA-T---T-------C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-C--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-C--T-T--C-A-C----G--G-TC---GAA----G-C--AA---A---CT-T-TG--A-TATT
gi|56835 : TTCT--C-AC-ATT-TATT-C-A--CGC----AGTTG-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-AACCC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCC----C-ATC-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T--------AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--ATCA----A-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AG---A
gi|56836 : TTCT--C-AC-ATTAT--T-C-A--C-CGTTGAGT-G-A--GA----T--AC-CG-------A-C--T--T-------------------GT--GA-GGAC---G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---TCGCATGCT-G-C--A--GT-T--TTG------A-C-T--GTAC---T-G--CGGAAC-G----T--C------T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TGT-T--------T--C-T--A--T--GAA-T-TT--A-CG---TA-C-A-CA---G--G-T----GAA----G-C--AA---GAT-GTAT-TT--A-TATTtgtttattat
gi|56837 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-CG-------A-T--CGGC-G-A--CT---TA----T-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--CC--T-G--C----C-G----T--CA-T---T-----T-C---T-C---G-----------G-AC-G-----TT--C-A-TTA--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----A-C--AA---AAC-TT-T-T
gi|56838 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-C--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA----A-A-C-T--G--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-T-----------CGA-C-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-
gi|56839 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GAGATTG--AC-TG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--TGG-A-G--A-------T-------T-T-C--G--AT----TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T----T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-----------G-T----GAA----G-C--AA---CAA-CT-T-TT--A-TATT
gi|56840 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---AAC-CT-T-TT--A-TATT
gi|56841 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---AAC-CT-T-TT--A-TATT
gi|56842 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--G-TAT
gi|56843 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--A-C-----GT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-C-T--G--CT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--G-TAT
gi|56844 : TTCT--C-AC-GTT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--TA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---TGACTGT-G-A-G-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---A--T-T-C--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CC-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GC-T-TT--G-TATT
gi|56845 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-TCT--AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T--------T------G-AT-G-----A---C-A-A-AACT---T--T-T-T--------T--A-T--A--T--G---T-TT----CG-T-T
gi|56846 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-TTTGA----G--AC-CG-------A-CAATA-T-T-A--CCT--CA------GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-A-G-A--A--TT---T-------T-T-CT-G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T---A-T---T-----T-C-A-C-TCCAG----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---AT-T-T-T--------C--C-TTGA--T--G-A-T-TT--A-C--T-TA-C-A-C----GA-G-T----GAAG---G-CG-AA---AAC-TT-T-TT--A-T
gi|56847 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--C----------------------------CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-A--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C------------------------------------------T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-T--T---G--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---AAT-AT-T-TT--A-TATT
gi|56848 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--T---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-----------TG-T-TA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-
gi|56849 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-TTA--C-C----AGT-G-T--GGAG--G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC-------------------------------AT---------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-C-T--G--------TCA----C-A-C-TT-G--T---T-G--CG--AC-G-------CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--------------------T--A-TG-TGTA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---AAatttaatt
gi|56850 : TTCT--C-AC-ATT-C--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-C-A--CC---CG----T-AT---A-C-AC-A-G-CC--AT------------T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--C--A--C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-T-------------A-T-C---T----T------G-AC-A-----T---A-A---A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T----A-T-TTAAA-CG-T-TA-C-A-C----G--A-T-----AA----G-C--AA---A----C-T-TT--A-TAT
gi|56851 : TTCT----AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-TT-GA----GG-AC-CG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----TGGT--GA-G-AC-A-G-CCGAAT---------GT-T-G-A-G--AT-TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-CA-G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-AT-T---A--T-T-TTTTTTTTCC--T-T--A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-T-------G-T----GAGCAATG-CTGAA---AACTAT-T-TT--A-TAT
gi|56852 : TTCT--C-ACCATT-T--T-C-AATC-T----AGT-G-TC-GG----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--TC---TACAATT-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-AAG--A--TT---TG------T-T-C--G--AT----TCATA--C-A-C-TC-G--C---T-GAGCGC-AC-G----TGTCA-T---T-----TTC-A-T-TT--G----T------G-AC-G-----T---C-A-A-C--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-TGTT--A-CG-T-TA-C-AAC----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC-TT-T-TC--A-TAT
gi|56853 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-AG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-G---AA-G-AC-A-G-CC---T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------A-T----G--AT-C--TCA----C-A-C-TGAG--CTGAT-G--CG--ACAG----C--TA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---T--TAT-T--------C--C-T--A--TTCG-A-T-TT--ACCC-T-TA-CGA-C---------T----GAA----A-C--AA---AAC-TT-TATT--A-T
gi|56854 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T--------T------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---AAG-GC-T-TT--G-TATT
gi|56855 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A---CC--AT---------G--TAG-A-G--A--TT---T-------T-TTC--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T---T----G------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------TT-C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---AAG-GC-T-TT--G-TATT
gi|56856 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-----------------------------------T-T-A--T---------------------AC-----CC--AC---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-GC-A-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-AG-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GC-T-TT--A-TA
gi|56857 : TTC---C-AC--TT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-A--C--T-T-A--CC---GA----TGGT--GA-G-AC-A---CC--ATTG-------G--TAG-A-GT-A--TT---T-------T-A-C--T---T-CAGTCA----C-A-C-T-----C---T-G--C---AC-G----T--CA-T---T-----T-T-A-T-A---GT---T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--CAT--A--T--A-A-T-TT--A-CGAT-TA-C-ATC----G--G-T----ATA----G-C--AA-------TT-T-TTCAA-TAT
gi|56858 : TTCT--C-AC-ATT-G--T-C-A--C-C----AGT-A-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--G-T-A--CT---CA----T-GT--GA-G-AC-A-A-TT--AT---------G--T-T-A-G--A--CT---T-------T-T-T-----AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-GATTT--AC-G----T--TA-------------C-A-C-G---G----T------G-AA-G---------C-A-A-A--T---G--T-T-T--------C--A-T--A--T--
gi|56859 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-T----AGT-G-T--AA----C--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-TC-A-G-CT--AT---------G--C-G------------------------T-C--G--A-------A----C-G-C-CGAG--C---T-G--CG--A--G----T--CA----------------------------------------------T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-GT--A-CA-T-TA-C-A-T----G----------------G-C--AATCTAAT-TT-T-TT--A-CATTt
gi|56860 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----C-GA--GA-G-AC-A-A-CC--AT---------T--G-G-A-G--A--TT---T-------
gi|56861 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--C-C----AGT-G-C--AA----G--ATTCA-------A-C--T--T-A-A--CC---CA----T-TT--GA-A-A-------------------------------------T---T-------T-T-T--GTTGT-C--TTA----C-A-C-T--G--T---T-G--CA--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---T-A-T-A--T---A--T-T-T--------TT-C-T--C--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-T--AA---
gi|56862 : TTCT--T-AC-AAT-A--T-C-A--C-C----AG----------------------------A-A--T--T-T-A--CC---CA----T-GC--GA-G-AC-G-G-CC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--TT-T--TTG----C-A-C-T--C--C---T-G--CG--AC-G--------------------T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---G--C-T-T--------T--C-T--T--T--G-A-T-AT--A-TA-T-TA-G-G-T----G--G-T----GAA----A-T--AA---TAC-AT-T-TT--G-TGTT
gi|56863 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-T--T--T-T-A--CC---CA----TCAT--AG-A-AT-ATG-CC--A----------G--CAG-A-GCAA--TTGCAT-------T-T-CATA--AC-G--CCATGTTC-A-C-T--G--A---A-A--AA--AC-GTTATT--CA-T---T-----T-C-T-TAT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-------A-C--T-GA-A-C-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A
gi|56864 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--CGC----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A----T--T-T-A--CC---CA----T-ttcgtttgaatt
gi|56865 : TTCT--C-CC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-C--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-CG-A-A-TC--TTGTCTCCTCGG--T-G-G-A--A--TT---T-------C-C-T--T--AT-C--CCA----C-A-C-T--
gi|56866 : TTCT--CGAC-AAC-A--T-C-A--C------AGT-G-TT-GA----G--AG-TC-------A-C--C--T-T-T--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AG---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------C-T-CT-G--GT-C--TCA----C-A-
gi|56867 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-
gi|56868 : TTCTGCC-ACCATT-T--C-T-A--C-C----AAT-G-T--GAT---G--AT-AG-------G-T--T--T-T-CT-CC---CA----T-GT--GA-G-AA-A-G-CC--TC---------G--T-G-A-G--A--TC---C-------G-C-C--T--AT-C--TCA----C-A-
gi|56869 : TCT--A-AC-ATT-T--T-C-G--C-C----AGT-G-T--AA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GG-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-G-G--A--TT---T-------T-T-C--
gi|56870 : TCT--C-AC-ATT-AA-T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AT-CA-------G-TA-T--T-T-A--CC----A----T-GTTGGA-G-AC-A-G-CC--AT---------AATT-G---G--A--CT---T-------A-T-T--G---C-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--GC-A----T--CA-T---T-----T-T-G-T-T---A----T------G-AC-A-----TATGT-A-T-A--TACAA--T-G-T--------A--T-T--AACT--G-ATT-TT--A-CA-G-TA-C-A------G--A-T----AGA----GTT--AA---AAT-AT-T-TT--
gi|56871 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-TT-GA----G--AC--G-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-TTC--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----TT-CA-T---T-----T-C-A-TCT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T-----T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAC--T-T-TT--A-TATTt
gi|56872 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-T--GA----G--AC--G-------A-C--T--T---A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-GT---T--CATT---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-TCA--T---A--T-T-T--------C--C-TA-A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----G-A----G-C--AA---A---CT-T-TT--A-TAT
gi|56873 : T--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT-------------------T------------T-----G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----att
gi|56874 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------
gi|56875 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----A--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-GTCC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----TACATTCG-AC-GTTTCTT---T-A-T-A--C---A--T-T-T--------acattcgactttctttata
gi|56876 : -AC-ATT-T--T-C-AC-C-C----AGT-GTT--GA----G--AC-T--------A-C-----T-T-A--CC---CA----T-GG--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T---------T-G--CA--AC-AT---T--CA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----TC--C-A-T-A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T--A-----TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C-------AAT-TT-T-TT--ATTATTt
gi|56877 : C-ATT-C--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A
gi|56878 : -ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-AA--GA-G-AC-A-G-CC--ATATATTA---G--T-G-A-G--A--TT---C-------T-C-T--G---T-A--TTA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AC-G----C--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-----A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-AT--A-CG-T-TA-C-A-C----T--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TGTT
gi|56879 : -ATT-T--T-C----C-C----TGT-G-T--GA----G--AC-GG-------A-C--T--T-T-A--CCATGCA----T-GT--GA-GAAC-A-G-CC--AT---------G--T-G-AGG--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-CTT--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-----------T-G-A-T-T---G----TG-----G-AC-G-----T---C-ATT-A--C---A--T-TCT--------T--C-T--A--TC-A-A-TCTT--A-CG---TA-C-T-CA---G--G-T----AAA----G-C--AA---AAA-TG-T-TT--A-TGT
gi|56880 : --T-C-A--C-C----AAT-G-T--GA----G--AT-CA-------A-A--T--T-T-A--TT---CA----T-GC--GA-G-AC-A-A-CC--GT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-----------------AT-C--TAA----C-T-T-T--G--C---T-A--CA--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--TGT--A--A--G-A-T-TT--A-C-----A-T-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---AAC-AT-T-AT--G-TACT
gi|56881 : -A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--T-T-A--AC---CA----A-GT--GA-G-GC-G-G-TC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-A--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--T---T--------AC-G----T--C------T-----A-C-A-T-T---G----T------G-
gi|56882 : C-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---TA----T-GT--GA-G-AC-A----C--GT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-G-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---GTACAT------A-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-C--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----tattcatgagttatttatttt
gi|56883 : --T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--CCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---ATGT-T-T--------T--C-T----------A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TTTT
gi|56884 : -G-A-T--A--TT---C-------TAT-C--A--GT-C--TCT----C-A-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----A---A-A-T-A--T---A--T-T-T----------------A--T--G-A-T-TT--A-CG-G-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-AT-T-TT--A-TATT
gi|56885 : -G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-A----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AT-A---------C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TATT-TA-C-A-T----G--G-T----AAT----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TATT
gi|56886 : --TT---G-------T-T-C--C--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-T-A--T----------------------------------------------G-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---AA--TT-T-TT--A-TATT
gi|56887 : T-C--TCA----C-A-C-T--G--C---C-T--CA--AC-G----T--TA-T---TGATT-T-G-A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--C--A-A-T-GC--A-CA-T-TA-T-A-TTAAAG--G-T----GAA----G-T--AA---AAT-AT-C-TT--G-TATT
gi|56888 : ----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-T
gi|56889 : C-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----A--G-T----AAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TT--A-TATT
gi|56890 : -T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---AAT-GT-T-TC--A-TATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 11 0 1 2 11 1 0 22 1 2222 0 1 33 2222 22 0 2222222 0 11 11 0 0 22 111 1111 1 00 0 1 1 2 0 22 555555555 22 2 0 1 11 11 111 2222222 1 1 555555 0 00 3333 1 0 0 33 00 111 0 11 22 0 4444 11 444444444444444 0 1 111 2222 222222 1 1 11111 222 0 0 1 22 111 11 2 1 55555555555 1 22 11 33 0 1 1 11 2 4 0 0 0 1 3333 11 1 2222 2222 0 22 222 0 88 0
lowQualScore : .. . . . .. . . .. . .... . . .. .... .. . ....... . .. .. . . .. ... .... . .. . . . . . .. ......... .. . . . .. .. ... ....... . . ...... . .. .... . . . .. .. ... . .. .. . .... .. ............... . . ... .... ...... . . ..... ... . . . .. ... .. . . ........... . .. .. .. . . . .. . . . . . . .... .. . .... .... . .. ... . .. .
lowQualScore : 00 7 3 0 66 3 6 88 3 3333 6 3 55 9999 44 6 1111111 6 55 55 6 6 88 888 4444 9 99 7 3 3 7 7 22 555555555 22 6 6 3 55 55 111 7777777 3 3 999999 6 99 5555 3 6 7 88 99 888 7 99 33 7 2222 66 888888888888888 7 4 999 1111 666666 4 4 77777 666 7 7 4 66 222 66 1 4 22222222222 4 44 00 11 7 4 4 00 1 3 7 7 7 5 0000 77 5 3333 3333 7 55 000 8 00 8
consensus : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
Reference ( family-323 ) : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
gi|56820 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56821 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56822 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-------T---C-A-T-A--T---A--T-T---------------T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C---A---A-AC--T-TTTATATT
gi|56823 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------TAT-C--G--AC-T--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---CAA-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-AGT-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTTTAT
gi|56824 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--C---T-G--CT--A--G----T--CG-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--A-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTgtt
gi|56825 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------AAC--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G--C--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-AATT---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--A-A-T-TT----CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AC---A-AT-GT-TTTTTAT
gi|56826 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----T--AC-CT-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-T-AC-A-A-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-C--A--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----G--A-T----GAA----A-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTat
gi|56827 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-T--GA----G--AC-CGTGAACCGA-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA------A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-ATT-T---T----T------G-AC-------T---T-A-T-A--T---G--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---
gi|56828 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA---------------AT----------T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-TGATCGAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTttttttttttat
gi|56829 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--TA-CTCAT-----T-G-A-T-T---G----T------G-GC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T--------
gi|56830 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--A--CG-------A-C--T--T-TAA--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------GC-T-GAA-G--A--TT---T-------T-T-C--G--ATAC--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TAT-T--------C--C-TA-A--T--G---T-TT--ACCG-T-TAGC-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-ATTATATt
gi|56831 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-GGT--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GAAG-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C-------------A----C-A-C-T--G--C---TTG--CG--CA-G----C--CT-C---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--G---C--T-CCT--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTat
gi|56832 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AC-TA-------A-C--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCG----C-A-T-T--G--C---
gi|56833 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--T--TAT-A--CT---CT----G-GT--GA-G-A--A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--AATTT---T-------T-T-C--GA-AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CGA-AC-G----T--CA-T---T-----C-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C---T-A--T---A--T-T-T--------CCTC-T--A--T--G-A---TT--A-CG---TA-C-A-C----GGTG-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATAT
gi|56834 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--G--T-T-A--CC---CA------GT---A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T---C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC------T--CA-T---T-------C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-C--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-C--T-T--C-A-C----G--G-TC---GAA----G-C---A---A-AC--T-TTGATATT
gi|56835 : TTCT--C-AC-ATT-TATT-C-A--CGC----AGTTG-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-AACCC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCC----C-ATC-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T--------AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--ATCA----A-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C---A---G-AT-GT-TT
gi|56836 : TTCT--C-AC-ATTAT--T-C-A--C-CGTTGAGT-G-A--GA----T--AC-CG-------A-C--T--T-------------------GT--GA-GGAC---G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---TCGCATGCT-G-C--A--GT-T--TTG------A-C-T--GTAC---T-G--CGGAAC-G----T--C------T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TGT-T--------T--C-T--A--T--GAA-T-TT--A-CG---TA-C-A-CA---G--G-T----GAA----G-C--AA---G-AT-GTATTTATATTattat
gi|56837 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-CG-------A-T--CGGC-G-A--CT---TA----T-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--CC--T-G--C----C-G----T--CA-T---T-----T-C---T-C---G-----------G-AC-G-----TT--C-A-TTA--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----A-C--AA---A-AC-TT-TT
gi|56838 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-C--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA----A-A-C-T--G--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-T-----------CGA-C-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56839 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GAGATTG--AC-TG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--TGG-A-G--A-------T-------T-T-C--G--AT----TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T----T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-----------G-T----GAA----G-C--AAC--A-AC--T-TTTATATT
gi|56840 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56841 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56842 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56843 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--A-C-----GT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-C-T--G--CT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56844 : TTCT--C-AC-GTT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--TA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---TGACTGT-G-A-G-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---A--T-T-C--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CC-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTGTATT
gi|56845 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-TCT--AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T--------T------G-AT-G-----A---C-A-A-AACT---T--T-T-T--------T--A-T--A--T--G---T-TT----CG-T-T
gi|56846 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-TTTGA----G--AC-CG-------A-CAATA-T-T-A--CCT--CA------GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-A-G-A--A--TT---T-------T-T-CT-G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T---A-T---T-----T-C-A-C-TCCAG----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---AT-T-T-T--------C--C-TTGA--T--G-A-T-TT--A-C--T-TA-C-A-C----GA-G-T----GAAG---G-CG-AA---A-AC-TT-TTTAT
gi|56847 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--C----------------------------CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-A--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C------------------------------------------T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-T--T---G--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56848 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--T---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-----------TG-T-TA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56849 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-TTA--C-C----AGT-G-T--GGAG--G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC-------------------------------AT---------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-C-T--G--------TCA----C-A-C-TT-G--T---T-G--CG--AC-G-------CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--------------------T--A-TG-TGTA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-Aatttaatt
gi|56850 : TTCT--C-AC-ATT-C--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-C-A--CC---CG----T-AT---A-C-AC-A-G-CC--AT------------T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--C--A--C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-T-------------A-T-C---T----T------G-AC-A-----T---A-A---A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T----A-T-TTAAA-CG-T-TA-C-A-C----G--A-T-----AA----G-C--AA---A-----C-TTTATAT
gi|56851 : TTCT----AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-TT-GA----GG-AC-CG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----TGGT--GA-G-AC-A-G-CCGAAT---------GT-T-G-A-G--AT-TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-CA-G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-AT-T---A--T-T-TTTTTTTTCC--T-T--A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-T-------G-T----GAGCAATG-CTGAA---A-ACTAT-TTTATAT
gi|56852 : TTCT--C-ACCATT-T--T-C-AATC-T----AGT-G-TC-GG----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--TC---TACAATT-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-AAG--A--TT---TG------T-T-C--G--AT----TCATA--C-A-C-TC-G--C---T-GAGCGC-AC-G----TGTCA-T---T-----TTC-A-T-TT--G----T------G-AC-G-----T---C-A-A-C--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-TGTT--A-CG-T-TA-C-AAC----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTCATAT
gi|56853 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-AG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-G---AA-G-AC-A-G-CC---T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------A-T----G--AT-C--TCA----C-A-C-TGAG--CTGAT-G--CG--ACAG----C--TA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---T--TAT-T--------C--C-T--A--TTCG-A-T-TT--ACCC-T-TA-CGA-C---------T----GAA----A-C--AA---A-AC----TTTAT
gi|56854 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T--------T------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATTtat
gi|56855 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A---CC--AT---------G--TAG-A-G--A--TT---T-------T-TTC--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T---T----G------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------TT-C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATT
gi|56856 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-----------------------------------T-T-A--T---------------------AC-----CC--AC---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-GC-A-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-AG-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTATA
gi|56857 : TTC---C-AC--TT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-A--C--T-T-A--CC---GA----TGGT--GA-G-AC-A---CC--ATTG-------G--TAG-A-GT-A--TT---T-------T-A-C--T---T-CAGTCA----C-A-C-T-----C---T-G--C---AC-G----T--CA-T---T-----T-T-A-T-A---GT---T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--CAT--A--T--A-A-T-TT--A-CGAT-TA-C-ATC----G--G-T----ATA----G-C--AA---
gi|56858 : TTCT--C-AC-ATT-G--T-C-A--C-C----AGT-A-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--G-T-A--CT---CA----T-GT--GA-G-AC-A-A-TT--AT---------G--T-T-A-G--A--CT---T-------T-T-T-----AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-GATTT--AC-G----T--TA-------------C-A-C-G---G----T------G-AA-G---------C-A-A-A--T---G--T-T-T--------C--A-T--A--T--tttttcaatat
gi|56859 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-T----AGT-G-T--AA----C--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-TC-A-G-CT--AT---------G--C-G------------------------T-C--G--A-------A----C-G-C-CGAG--C---T-G--CG--A--G----T--CA----------------------------------------------T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-GT--A-CA-T-TA-C-A-T----G----------------G-C--AATCTA-AT-TT-TTTACATTt
gi|56860 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----C-GA--GA-G-AC-A-A-CC--AT---------T--G-G-A-G--A--TT---T-------
gi|56861 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--C-C----AGT-G-C--AA----G--ATTCA-------A-C--T--T-A-A--CC---CA----T-TT--GA-A-A-------------------------------------T---T-------T-T-T--GTTGT-C--TTA----C-A-C-T--G--T---T-G--CA--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---T-A-T-A--T---A--T-T-T--------TT-C-T--C--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-T--AA---
gi|56862 : TTCT--T-AC-AAT-A--T-C-A--C-C----AG----------------------------A-A--T--T-T-A--CC---CA----T-GC--GA-G-AC-G-G-CC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--TT-T--TTG----C-A-C-T--C--C---T-G--CG--AC-G--------------------T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---G--C-T-T--------T--C-T--T--T--G-A-T-AT--A-TA-T-TA-G-G-T----G--G-T----GAA----A-T--AA---T-AC-AT-TTTGTGTT
gi|56863 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-T--T--T-T-A--CC---CA----TCAT--AG-A-AT-ATG-CC--A----------G--CAG-A-GCAA--TTGCAT-------T-T-CATA--AC-G--CCATGTTC-A-C-T--G--A---A-A--AA--AC-GTTATT--CA-T---T-----T-C-T-TAT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-------A-C--T-GA-A-C-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---ATTC-GT-TT
gi|56864 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--CGC----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A----T--T-T-A--CC---CA----T-gaatt
gi|56865 : TTCT--C-CC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-C--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-CG-A-A-TC--TTGTCTCCTCGG--T-G-G-A--A--TT---T-------C-C-T--T--AT-C--CCA----C-A-C-T--
gi|56866 : TTCT--CGAC-AAC-A--T-C-A--C------AGT-G-TT-GA----G--AG-TC-------A-C--C--T-T-T--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AG---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------C-T-CT-G--GT-C--TCA----C-A-
gi|56867 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-
gi|56868 : TTCTGCC-ACCATT-T--C-T-A--C-C----AAT-G-T--GAT---G--AT-AG-------G-T--T--T-T-CT-CC---CA----T-GT--GA-G-AA-A-G-CC--TC---------G--T-G-A-G--A--TC---C-------G-C-C--T--AT-C--TCA----C-A-
gi|56869 : TCT--A-AC-ATT-T--T-C-G--C-C----AGT-G-T--AA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GG-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-G-G--A--TT---T-------T-T-C--
gi|56870 : TCT--C-AC-ATT-AA-T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AT-CA-------G-TA-T--T-T-A--CC----A----T-GTTGGA-G-AC-A-G-CC--AT---------AATT-G---G--A--CT---T-------A-T-T--G---C-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--GC-A----T--CA-T---T-----T-T-G-T-T---A----T------G-AC-A-----TATGT-A-T-A--TACAA--T-G-T--------A--T-T--AACT--G-ATT-TT--A-CA-G-TA-C-A------G--A-T----AGA----GTT--AA---A-AT-AT-TTT
gi|56871 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-TT-GA----G--AC--G-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-TTC--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----TT-CA-T---T-----T-C-A-TCT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T-----T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-TTTATATTt
gi|56872 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-T--GA----G--AC--G-------A-C--T--T---A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-GT---T--CATT---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-TCA--T---A--T-T-T--------C--C-TA-A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----G-A----G-C---A---A-AC--T-TTTATAT
gi|56873 : T--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT-------------------T------------T-----G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----att
gi|56874 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------
gi|56875 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----A--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-GTCC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----TACATTCG-AC-GTTTCTT---T-A-T-A--C---A--T-T-T--------acattcgactttctttata
gi|56876 : -AC-ATT-T--T-C-AC-C-C----AGT-GTT--GA----G--AC-T--------A-C-----T-T-A--CC---CA----T-GG--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T---------T-G--CA--AC-AT---T--CA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----TC--C-A-T-A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T--A-----TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---------T-TTTTTATTt
gi|56877 : C-ATT-C--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-Aatt
gi|56878 : -ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-AA--GA-G-AC-A-G-CC--ATATATTA---G--T-G-A-G--A--TT---C-------T-C-T--G---T-A--TTA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AC-G----C--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-----A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-AT--A-CG-T-TA-C-A-C----T--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATGTT
gi|56879 : -ATT-T--T-C----C-C----TGT-G-T--GA----G--AC-GG-------A-C--T--T-T-A--CCATGCA----T-GT--GA-GAAC-A-G-CC--AT---------G--T-G-AGG--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-CTT--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-----------T-G-A-T-T---G----TG-----G-AC-G-----T---C-ATT-A--C---A--T-TCT--------T--C-T--A--TC-A-A-TCTT--A-CG---TA-C-T-CA---G--G-T----AAA----G-CA-AA---A-AT-GT-TT
gi|56880 : --T-C-A--C-C----AAT-G-T--GA----G--AT-CA-------A-A--T--T-T-A--TT---CA----T-GC--GA-G-AC-A-A-CC--GT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-----------------AT-C--TAA----C-T-T-T--G--C---T-A--CA--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--TGT--A--A--G-A-T-TT--A-C-----A-T-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AC-AT-TATGTACTatgt
gi|56881 : -A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--T-T-A--AC---CA----A-GT--GA-G-GC-G-G-TC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-A--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--T---T--------AC-G----T--C------T-----A-C-A-T-T---G----T------G-
gi|56882 : C-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---TA----T-GT--GA-G-AC-A----C--GT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-G-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---GTACAT------A-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-C--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----tattcatgagttatttatttt
gi|56883 : --T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--CCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---ATGT-T-T--------T--C-T----------A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATTTT
gi|56884 : -G-A-T--A--TT---C-------TAT-C--A--GT-C--TCT----C-A-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----A---A-A-T-A--T---A--T-T-T----------------A--T--G-A-T-TT--A-CG-G-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56885 : -G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-A----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AT-A---------C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TATT-TA-C-A-T----G--G-T----AAT----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56886 : --TT---G-------T-T-C--C--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-T-A--T----------------------------------------------G-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AT--T-TTTATATT
gi|56887 : T-C--TCA----C-A-C-T--G--C---C-T--CA--AC-G----T--TA-T---TGATT-T-G-A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--C--A-A-T-GC--A-CA-T-TA-T-A-TTAAAG--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-CTTGTATT
gi|56888 : ----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TT
gi|56889 : C-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----A--G-T----AAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56890 : -T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTCATATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 11 0 1 2 11 1 0 22 1 2222 0 1 33 2222 22 0 2222222 0 11 11 0 0 22 111 1111 1 00 0 1 1 2 0 22 555555555 22 2 0 1 11 11 111 2222222 1 1 555555 0 00 3333 1 0 0 33 00 111 0 11 22 0 4444 11 444444444444444 0 1 111 2222 222222 1 1 11111 222 0 0 1 22 111 11 2 1 55555555555 1 22 11 33 0 1 1 11 2 4 0 0 0 1 3333 11 1 2222 2222 0 22 222 0 88 0
lowQualScore : .. . . . .. . . .. . .... . . .. .... .. . ....... . .. .. . . .. ... .... . .. . . . . . .. ......... .. . . . .. .. ... ....... . . ...... . .. .... . . . .. .. ... . .. .. . .... .. ............... . . ... .... ...... . . ..... ... . . . .. ... .. . . ........... . .. .. .. . . . .. . . . . . . .... .. . .... .... . .. ... . .. .
lowQualScore : 00 7 3 0 66 3 6 88 3 3333 6 3 55 9999 44 6 1111111 6 55 55 6 6 88 888 4444 9 99 7 3 3 7 7 22 555555555 22 6 6 3 55 55 111 7777777 3 3 999999 6 99 5555 3 6 7 88 99 888 7 99 33 7 2222 66 888888888888888 7 4 999 1111 666666 4 4 77777 666 7 7 4 66 222 66 1 4 22222222222 4 44 00 11 7 4 4 00 1 3 7 7 7 5 0000 77 5 3333 3333 7 55 000 8 00 8
consensus : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
Reference ( family-323 ) : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
gi|56820 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56821 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56822 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-------T---C-A-T-A--T---A--T-T---------------T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C---A---A-AC--T-TTTATATT
gi|56823 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------TAT-C--G--AC-T--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---CAA-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-AGT-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTTTAT
gi|56824 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--C---T-G--CT--A--G----T--CG-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--A-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTgtt
gi|56825 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------AAC--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G--C--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-AATT---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--A-A-T-TT----CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AC---A-AT-GT-TTTTTAT
gi|56826 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----T--AC-CT-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-T-AC-A-A-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-C--A--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----G--A-T----GAA----A-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTat
gi|56827 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-T--GA----G--AC-CGTGAACCGA-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA------A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-ATT-T---T----T------G-AC-------T---T-A-T-A--T---G--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---
gi|56828 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA---------------AT----------T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-TGATCGAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTttttttttttat
gi|56829 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--TA-CTCAT-----T-G-A-T-T---G----T------G-GC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T--------
gi|56830 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--A--CG-------A-C--T--T-TAA--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------GC-T-GAA-G--A--TT---T-------T-T-C--G--ATAC--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TAT-T--------C--C-TA-A--T--G---T-TT--ACCG-T-TAGC-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-ATTATATt
gi|56831 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-GGT--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GAAG-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C-------------A----C-A-C-T--G--C---TTG--CG--CA-G----C--CT-C---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--G---C--T-CCT--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTat
gi|56832 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AC-TA-------A-C--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCG----C-A-T-T--G--C---
gi|56833 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--T--TAT-A--CT---CT----G-GT--GA-G-A--A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--AATTT---T-------T-T-C--GA-AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CGA-AC-G----T--CA-T---T-----C-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C---T-A--T---A--T-T-T--------CCTC-T--A--T--G-A---TT--A-CG---TA-C-A-C----GGTG-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATAT
gi|56834 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--G--T-T-A--CC---CA------GT---A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T---C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC------T--CA-T---T-------C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-C--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-C--T-T--C-A-C----G--G-TC---GAA----G-C---A---A-AC--T-TTGATATT
gi|56835 : TTCT--C-AC-ATT-TATT-C-A--CGC----AGTTG-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-AACCC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCC----C-ATC-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T--------AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--ATCA----A-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C---A---G-AT-GT-TT
gi|56836 : TTCT--C-AC-ATTAT--T-C-A--C-CGTTGAGT-G-A--GA----T--AC-CG-------A-C--T--T-------------------GT--GA-GGAC---G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---TCGCATGCT-G-C--A--GT-T--TTG------A-C-T--GTAC---T-G--CGGAAC-G----T--C------T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TGT-T--------T--C-T--A--T--GAA-T-TT--A-CG---TA-C-A-CA---G--G-T----GAA----G-C--AA---G-AT-GTATTTATATTattat
gi|56837 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-CG-------A-T--CGGC-G-A--CT---TA----T-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--CC--T-G--C----C-G----T--CA-T---T-----T-C---T-C---G-----------G-AC-G-----TT--C-A-TTA--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----A-C--AA---A-AC-TT-TT
gi|56838 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-C--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA----A-A-C-T--G--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-T-----------CGA-C-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56839 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GAGATTG--AC-TG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--TGG-A-G--A-------T-------T-T-C--G--AT----TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T----T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-----------G-T----GAA----G-C--AAC--A-AC--T-TTTATATT
gi|56840 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56841 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56842 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56843 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--A-C-----GT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-C-T--G--CT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56844 : TTCT--C-AC-GTT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--TA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---TGACTGT-G-A-G-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---A--T-T-C--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CC-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTGTATT
gi|56845 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-TCT--AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T--------T------G-AT-G-----A---C-A-A-AACT---T--T-T-T--------T--A-T--A--T--G---T-TT----CG-T-T
gi|56846 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-TTTGA----G--AC-CG-------A-CAATA-T-T-A--CCT--CA------GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-A-G-A--A--TT---T-------T-T-CT-G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T---A-T---T-----T-C-A-C-TCCAG----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---AT-T-T-T--------C--C-TTGA--T--G-A-T-TT--A-C--T-TA-C-A-C----GA-G-T----GAAG---G-CG-AA---A-AC-TT-TTTAT
gi|56847 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--C----------------------------CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-A--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C------------------------------------------T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-T--T---G--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56848 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--T---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-----------TG-T-TA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56849 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-TTA--C-C----AGT-G-T--GGAG--G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC-------------------------------AT---------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-C-T--G--------TCA----C-A-C-TT-G--T---T-G--CG--AC-G-------CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--------------------T--A-TG-TGTA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-Aatttaatt
gi|56850 : TTCT--C-AC-ATT-C--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-C-A--CC---CG----T-AT---A-C-AC-A-G-CC--AT------------T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--C--A--C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-T-------------A-T-C---T----T------G-AC-A-----T---A-A---A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T----A-T-TTAAA-CG-T-TA-C-A-C----G--A-T-----AA----G-C--AA---A-----C-TTTATAT
gi|56851 : TTCT----AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-TT-GA----GG-AC-CG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----TGGT--GA-G-AC-A-G-CCGAAT---------GT-T-G-A-G--AT-TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-CA-G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-AT-T---A--T-T-TTTTTTTTCC--T-T--A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-T-------G-T----GAGCAATG-CTGAA---A-ACTAT-TTTATAT
gi|56852 : TTCT--C-ACCATT-T--T-C-AATC-T----AGT-G-TC-GG----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--TC---TACAATT-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-AAG--A--TT---TG------T-T-C--G--AT----TCATA--C-A-C-TC-G--C---T-GAGCGC-AC-G----TGTCA-T---T-----TTC-A-T-TT--G----T------G-AC-G-----T---C-A-A-C--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-TGTT--A-CG-T-TA-C-AAC----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTCATAT
gi|56853 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-AG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-G---AA-G-AC-A-G-CC---T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------A-T----G--AT-C--TCA----C-A-C-TGAG--CTGAT-G--CG--ACAG----C--TA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---T--TAT-T--------C--C-T--A--TTCG-A-T-TT--ACCC-T-TA-CGA-C---------T----GAA----A-C--AA---A-AC----TTTAT
gi|56854 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T--------T------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATTtat
gi|56855 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A---CC--AT---------G--TAG-A-G--A--TT---T-------T-TTC--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T---T----G------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------TT-C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATT
gi|56856 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-----------------------------------T-T-A--T---------------------AC-----CC--AC---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-GC-A-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-AG-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTATA
gi|56857 : TTC---C-AC--TT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-A--C--T-T-A--CC---GA----TGGT--GA-G-AC-A---CC--ATTG-------G--TAG-A-GT-A--TT---T-------T-A-C--T---T-CAGTCA----C-A-C-T-----C---T-G--C---AC-G----T--CA-T---T-----T-T-A-T-A---GT---T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--CAT--A--T--A-A-T-TT--A-CGAT-TA-C-ATC----G--G-T----ATA----G-C--AA---
gi|56858 : TTCT--C-AC-ATT-G--T-C-A--C-C----AGT-A-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--G-T-A--CT---CA----T-GT--GA-G-AC-A-A-TT--AT---------G--T-T-A-G--A--CT---T-------T-T-T-----AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-GATTT--AC-G----T--TA-------------C-A-C-G---G----T------G-AA-G---------C-A-A-A--T---G--T-T-T--------C--A-T--A--T--tttttcaatat
gi|56859 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-T----AGT-G-T--AA----C--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-TC-A-G-CT--AT---------G--C-G------------------------T-C--G--A-------A----C-G-C-CGAG--C---T-G--CG--A--G----T--CA----------------------------------------------T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-GT--A-CA-T-TA-C-A-T----G----------------G-C--AATCTA-AT-TT-TTTACATTt
gi|56860 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----C-GA--GA-G-AC-A-A-CC--AT---------T--G-G-A-G--A--TT---T-------
gi|56861 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--C-C----AGT-G-C--AA----G--ATTCA-------A-C--T--T-A-A--CC---CA----T-TT--GA-A-A-------------------------------------T---T-------T-T-T--GTTGT-C--TTA----C-A-C-T--G--T---T-G--CA--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---T-A-T-A--T---A--T-T-T--------TT-C-T--C--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-T--AA---
gi|56862 : TTCT--T-AC-AAT-A--T-C-A--C-C----AG----------------------------A-A--T--T-T-A--CC---CA----T-GC--GA-G-AC-G-G-CC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--TT-T--TTG----C-A-C-T--C--C---T-G--CG--AC-G--------------------T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---G--C-T-T--------T--C-T--T--T--G-A-T-AT--A-TA-T-TA-G-G-T----G--G-T----GAA----A-T--AA---T-AC-AT-TTTGTGTT
gi|56863 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-T--T--T-T-A--CC---CA----TCAT--AG-A-AT-ATG-CC--A----------G--CAG-A-GCAA--TTGCAT-------T-T-CATA--AC-G--CCATGTTC-A-C-T--G--A---A-A--AA--AC-GTTATT--CA-T---T-----T-C-T-TAT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-------A-C--T-GA-A-C-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---ATTC-GT-TT
gi|56864 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--CGC----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A----T--T-T-A--CC---CA----T-gaatt
gi|56865 : TTCT--C-CC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-C--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-CG-A-A-TC--TTGTCTCCTCGG--T-G-G-A--A--TT---T-------C-C-T--T--AT-C--CCA----C-A-C-T--
gi|56866 : TTCT--CGAC-AAC-A--T-C-A--C------AGT-G-TT-GA----G--AG-TC-------A-C--C--T-T-T--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AG---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------C-T-CT-G--GT-C--TCA----C-A-
gi|56867 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-
gi|56868 : TTCTGCC-ACCATT-T--C-T-A--C-C----AAT-G-T--GAT---G--AT-AG-------G-T--T--T-T-CT-CC---CA----T-GT--GA-G-AA-A-G-CC--TC---------G--T-G-A-G--A--TC---C-------G-C-C--T--AT-C--TCA----C-A-
gi|56869 : TCT--A-AC-ATT-T--T-C-G--C-C----AGT-G-T--AA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GG-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-G-G--A--TT---T-------T-T-C--
gi|56870 : TCT--C-AC-ATT-AA-T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AT-CA-------G-TA-T--T-T-A--CC----A----T-GTTGGA-G-AC-A-G-CC--AT---------AATT-G---G--A--CT---T-------A-T-T--G---C-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--GC-A----T--CA-T---T-----T-T-G-T-T---A----T------G-AC-A-----TATGT-A-T-A--TACAA--T-G-T--------A--T-T--AACT--G-ATT-TT--A-CA-G-TA-C-A------G--A-T----AGA----GTT--AA---A-AT-AT-TTT
gi|56871 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-TT-GA----G--AC--G-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-TTC--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----TT-CA-T---T-----T-C-A-TCT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T-----T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-TTTATATTt
gi|56872 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-T--GA----G--AC--G-------A-C--T--T---A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-GT---T--CATT---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-TCA--T---A--T-T-T--------C--C-TA-A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----G-A----G-C---A---A-AC--T-TTTATAT
gi|56873 : T--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT-------------------T------------T-----G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----att
gi|56874 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------
gi|56875 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----A--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-GTCC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----TACATTCG-AC-GTTTCTT---T-A-T-A--C---A--T-T-T--------acattcgactttctttata
gi|56876 : -AC-ATT-T--T-C-AC-C-C----AGT-GTT--GA----G--AC-T--------A-C-----T-T-A--CC---CA----T-GG--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T---------T-G--CA--AC-AT---T--CA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----TC--C-A-T-A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T--A-----TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---------T-TTTTTATTt
gi|56877 : C-ATT-C--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-Aatt
gi|56878 : -ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-AA--GA-G-AC-A-G-CC--ATATATTA---G--T-G-A-G--A--TT---C-------T-C-T--G---T-A--TTA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AC-G----C--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-----A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-AT--A-CG-T-TA-C-A-C----T--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATGTT
gi|56879 : -ATT-T--T-C----C-C----TGT-G-T--GA----G--AC-GG-------A-C--T--T-T-A--CCATGCA----T-GT--GA-GAAC-A-G-CC--AT---------G--T-G-AGG--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-CTT--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-----------T-G-A-T-T---G----TG-----G-AC-G-----T---C-ATT-A--C---A--T-TCT--------T--C-T--A--TC-A-A-TCTT--A-CG---TA-C-T-CA---G--G-T----AAA----G-CA-AA---A-AT-GT-TT
gi|56880 : --T-C-A--C-C----AAT-G-T--GA----G--AT-CA-------A-A--T--T-T-A--TT---CA----T-GC--GA-G-AC-A-A-CC--GT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-----------------AT-C--TAA----C-T-T-T--G--C---T-A--CA--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--TGT--A--A--G-A-T-TT--A-C-----A-T-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AC-AT-TATGTACTatgt
gi|56881 : -A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--T-T-A--AC---CA----A-GT--GA-G-GC-G-G-TC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-A--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--T---T--------AC-G----T--C------T-----A-C-A-T-T---G----T------G-
gi|56882 : C-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---TA----T-GT--GA-G-AC-A----C--GT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-G-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---GTACAT------A-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-C--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----tattcatgagttatttatttt
gi|56883 : --T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--CCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---ATGT-T-T--------T--C-T----------A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATTTT
gi|56884 : -G-A-T--A--TT---C-------TAT-C--A--GT-C--TCT----C-A-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----A---A-A-T-A--T---A--T-T-T----------------A--T--G-A-T-TT--A-CG-G-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56885 : -G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-A----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AT-A---------C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TATT-TA-C-A-T----G--G-T----AAT----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56886 : --TT---G-------T-T-C--C--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-T-A--T----------------------------------------------G-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AT--T-TTTATATT
gi|56887 : T-C--TCA----C-A-C-T--G--C---C-T--CA--AC-G----T--TA-T---TGATT-T-G-A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--C--A-A-T-GC--A-CA-T-TA-T-A-TTAAAG--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-CTTGTATT
gi|56888 : ----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TT
gi|56889 : C-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----A--G-T----AAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56890 : -T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTCATATT
blockSeqs : C A AT T AT G GTTG G TT GATT TG TGAACCG AA GG AC ATG CAAT G G C A GA GTCTCCTCG AT G A CA AT GCA CGCATGC A T GTTG TGTT A GA TGA AG GA TTAT GT TTGACTGTG A CCA TACA ACATTC A C TTTCT ATG T AT ACA TG A C TTTTTTTCC A TG TC G G C T A TAAA GT T GATC CAAT TG TCT TA
blockSeqs : C C A T A G CT T T AG TG . A A A T . G A C A C ATATTA C A G T T . G A T ATAA TA A GA C AT A T T TTGATTTG C T T G A C . T C AC . T G C CCT G A T T C T A T A A T C G G C T
blockSeqs : . C . . A . . . C T G . . . A . . C . . A C TG T A . . . . . . . GAA C . T . . C T . CTCATTG . . . . . . . C . T . . A . TT . A T . . C T . A . . . . A . T
blockSeqs : . . . . C . . . T . . . . . T . . . . . T . . . A . . . . . . . TGA C . A . . . T . TTCTC . . . . . . . . . . . . . . TT . . C . . . T . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGG . . C . . . T . TTCTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TGGTT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TGGTT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . CTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTCC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . ATGA . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . ATGA . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TCG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : TTTC***********
originalCons : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
finalCons : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CATTTC-----------A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111
lowQualScore : 11 0 1 2 11 1 0 22 1 2222 0 1 33 2222 22 0 2222222 0 11 11 0 0 22 111 1111 1 00 0 1 1 2 0 22 555555555 22 2 0 1 11 11 111 2222222 1 1 555555 0 00 3333 1 0 0 33 00 111 0 11 22 0 4444 11 444444444444444 0 1 111 2222 222222 1 1 11111 222 0 0 1 22 111 11 2 1 55555555555 1 22 11 33 0 1 1 11 2 4 0 0 0 1 3333 11 1 2222 2222 0 22 222 0 88 0
lowQualScore : .. . . . .. . . .. . .... . . .. .... .. . ....... . .. .. . . .. ... .... . .. . . . . . .. ......... .. . . . .. .. ... ....... . . ...... . .. .... . . . .. .. ... . .. .. . .... .. ............... . . ... .... ...... . . ..... ... . . . .. ... .. . . ........... . .. .. .. . . . .. . . . . . . .... .. . .... .... . .. ... . .. .
lowQualScore : 00 7 3 0 66 3 6 88 3 3333 6 3 55 9999 44 6 1111111 6 55 55 6 6 88 888 4444 9 99 7 3 3 7 7 22 555555555 22 6 6 3 55 55 111 7777777 3 3 999999 6 99 5555 3 6 7 88 99 888 7 99 33 7 2222 66 888888888888888 7 4 999 1111 666666 4 4 77777 666 7 7 4 66 222 66 1 4 22222222222 4 44 00 11 7 4 4 00 1 3 7 7 7 5 0000 77 5 3333 3333 7 55 000 8 00 8
consensus : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
Reference ( family-323 ) : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-GT-TTTATATT
gi|56820 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56821 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATT
gi|56822 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-------T---C-A-T-A--T---A--T-T---------------T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C---A---A-AC--T-TTTATATT
gi|56823 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------TAT-C--G--AC-T--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---CAA-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-AGT-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTTTAT
gi|56824 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--C---T-G--CT--A--G----T--CG-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--A-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTgtt
gi|56825 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------AAC--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G--C--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-AATT---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--A-A-T-TT----CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AC---A-AT-GT-TTTTTAT
gi|56826 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----T--AC-CT-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-T-AC-A-A-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-C--A--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----G--A-T----GAA----A-C--AA---A-AT-GT-TTTATATTat
gi|56827 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-T--GA----G--AC-CGTGAACCGA-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA------A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-ATT-T---T----T------G-AC-------T---T-A-T-A--T---G--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---
gi|56828 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA---------------AT----------T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-TGATCGAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTttttttttttat
gi|56829 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--TA-CTCAT-----T-G-A-T-T---G----T------G-GC-G-----T---C-A-T-A--T---G--T-T-T--------
gi|56830 : TTCT--C-AC-ATT-T--TTC-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--A--CG-------A-C--T--T-TAA--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------GC-T-GAA-G--A--TT---T-------T-T-C--G--ATAC--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TAT-T--------C--C-TA-A--T--G---T-TT--ACCG-T-TAGC-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-ATTATATt
gi|56831 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-GGT--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GAAG-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C-------------A----C-A-C-T--G--C---TTG--CG--CA-G----C--CT-C---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--G---C--T-CCT--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATATTat
gi|56832 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AC-TA-------A-C--T--T-T-AA-CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCG----C-A-T-T--G--C---
gi|56833 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--T--TAT-A--CT---CT----G-GT--GA-G-A--A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--AATTT---T-------T-T-C--GA-AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CGA-AC-G----T--CA-T---T-----C-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C---T-A--T---A--T-T-T--------CCTC-T--A--T--G-A---TT--A-CG---TA-C-A-C----GGTG-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTTATAT
gi|56834 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T---A----G--AC-CG-------A-C--G--T-T-A--CC---CA------GT---A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T---C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC------T--CA-T---T-------C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-C--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-C--T-T--C-A-C----G--G-TC---GAA----G-C---A---A-AC--T-TTGATATT
gi|56835 : TTCT--C-AC-ATT-TATT-C-A--CGC----AGTTG-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-AACCC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCC----C-ATC-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T--------AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T-----------C-T--A--T--G-A-T-TT--ATCA----A-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C---A---G-AT-GT-TT
gi|56836 : TTCT--C-AC-ATTAT--T-C-A--C-CGTTGAGT-G-A--GA----T--AC-CG-------A-C--T--T-------------------GT--GA-GGAC---G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---TCGCATGCT-G-C--A--GT-T--TTG------A-C-T--GTAC---T-G--CGGAAC-G----T--C------T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--TGT-T--------T--C-T--A--T--GAA-T-TT--A-CG---TA-C-A-CA---G--G-T----GAA----G-C--AA---G-AT-GTATTTATATTattat
gi|56837 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-CG-------A-T--CGGC-G-A--CT---TA----T-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--CC--T-G--C----C-G----T--CA-T---T-----T-C---T-C---G-----------G-AC-G-----TT--C-A-TTA--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----A-C--AA---A-AC-TT-TT
gi|56838 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-C--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--AT-C--TCA----A-A-C-T--G--C---A-G--CG--AC-G----T--CA-T-----------CGA-C-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56839 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GAGATTG--AC-TG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----T-GT--GA---AC-A-G-CC--AT---------G--TGG-A-G--A-------T-------T-T-C--G--AT----TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T----T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-----------G-T----GAA----G-C--AAC--A-AC--T-TTTATATT
gi|56840 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56841 : TTCT--C-AC-ATTCT--T-C-A--C-C----A-T-G-T--GA----GTGAC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--T--GA-G-ACCA-G-CC--AT---------G--C-G-A-G--A--TA---T-------T-T-T--G--AT-C--TCA------A-C-T--G--C-----G--CG--AC-G----T--CA-T---TC----T-C-A-T-T---G----T------G-ACCG-----T---C-A-T-T--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--TT-G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----AAA----G-C--TA---A-AC-CT-TTTATATT
gi|56842 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56843 : TTCG--C-AC-ATT-T--T-C-A--A-C-----GT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GA--GA-G-AC-A-G-CC--AC---------G--T-G-A-T--A--TT---T-------T-C-T--G--CT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---A-G--CG--GT-G----T--CA-TGG-T-----T-----T-T---G----T-------------------------------------T-T-T--------C-------A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-T-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTGTAT
gi|56844 : TTCT--C-AC-GTT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--TA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-A------------------------------------TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---TGACTGT-G-A-G-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---A--T-T-C--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CC-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTGTATT
gi|56845 : TCCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-TCT--AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC----A----T-GT--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-C-A-T-T--------T------G-AT-G-----A---C-A-A-AACT---T--T-T-T--------T--A-T--A--T--G---T-TT----CG-T-T
gi|56846 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-TTTGA----G--AC-CG-------A-CAATA-T-T-A--CCT--CA------GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-A-G-A--A--TT---T-------T-T-CT-G--AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-G----T---A-T---T-----T-C-A-C-TCCAG----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---AT-T-T-T--------C--C-TTGA--T--G-A-T-TT--A-C--T-TA-C-A-C----GA-G-T----GAAG---G-CG-AA---A-AC-TT-TTTAT
gi|56847 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--C----------------------------CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-A--G--AT-C--TCG----C-A-C-T--G--C------------------------------------------T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-T--T---G--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56848 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T--------------------------------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--T---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-----------TG-T-TA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-T
gi|56849 : TTCT--C-GC-ATT-T--T-TTA--C-C----AGT-G-T--GGAG--G--GC-CA-------A-C--T--T-T-A--CC-------------------------------AT---------G--T-G-A-G--A--TG---T-------T-C-T--G--------TCA----C-A-C-TT-G--T---T-G--CG--AC-G-------CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--------------------T--A-TG-TGTA-C-A-T----A--A-T----GAA----G-C--AA---A-Aatttaatt
gi|56850 : TTCT--C-AC-ATT-C--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-C-A--CC---CG----T-AT---A-C-AC-A-G-CC--AT------------T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--C--A--C--TCAC---C-A-C-T--G--C---T-G--C---AC-G----T--CA-T-------------A-T-C---T----T------G-AC-A-----T---A-A---A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T----A-T-TTAAA-CG-T-TA-C-A-C----G--A-T-----AA----G-C--AA---A-----C-TTTATAT
gi|56851 : TTCT----AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-TT-GA----GG-AC-CG-------A-C--T--T-T-A---C---CA----TGGT--GA-G-AC-A-G-CCGAAT---------GT-T-G-A-G--AT-TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-CA-G--C---T-G--CG--AC-GT---T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------GAAC-G-----T---C-A-T-AT-T---A--T-T-TTTTTTTTCC--T-T--A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-T-------G-T----GAGCAATG-CTGAA---A-ACTAT-TTTATAT
gi|56852 : TTCT--C-ACCATT-T--T-C-AATC-T----AGT-G-TC-GG----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--TC---TACAATT-GT--GA-G-AC-AAG-CC--AT---------G--T-G-AAG--A--TT---TG------T-T-C--G--AT----TCATA--C-A-C-TC-G--C---T-GAGCGC-AC-G----TGTCA-T---T-----TTC-A-T-TT--G----T------G-AC-G-----T---C-A-A-C--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-TGTT--A-CG-T-TA-C-AAC----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC-TT-TTCATAT
gi|56853 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-AG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-G---AA-G-AC-A-G-CC---T---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------A-T----G--AT-C--TCA----C-A-C-TGAG--CTGAT-G--CG--ACAG----C--TA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---T--TAT-T--------C--C-T--A--TTCG-A-T-TT--ACCC-T-TA-CGA-C---------T----GAA----A-C--AA---A-AC----TTTAT
gi|56854 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T--------T------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATTtat
gi|56855 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--A-G----AGT-A-T--GA----G--AT-CA-------A-C--T--T------------------------A-G-AC-A---CC--AT---------G--TAG-A-G--A--TT---T-------T-TTC--T--GT-C--TTA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AT-G----T--CA-A---T-----G-A-G-T-T---T----G------G-AC-A-----T---T-T-T-A--T---T--T-T-T--------TT-C-T--A--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-T-C----G--T-T----GGA----G-T--AA---A-AG-GC-TTTGTATT
gi|56856 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-----------------------------------T-T-A--T---------------------AC-----CC--AC---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-GC-A-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-AG-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GC-TTTATA
gi|56857 : TTC---C-AC--TT-T--T-C-A--C-C----CGT-G-T--GA----G--AC-TG-------A-A--C--T-T-A--CC---GA----TGGT--GA-G-AC-A---CC--ATTG-------G--TAG-A-GT-A--TT---T-------T-A-C--T---T-CAGTCA----C-A-C-T-----C---T-G--C---AC-G----T--CA-T---T-----T-T-A-T-A---GT---T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--CAT--A--T--A-A-T-TT--A-CGAT-TA-C-ATC----G--G-T----ATA----G-C--AA---
gi|56858 : TTCT--C-AC-ATT-G--T-C-A--C-C----AGT-A-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--G-T-A--CT---CA----T-GT--GA-G-AC-A-A-TT--AT---------G--T-T-A-G--A--CT---T-------T-T-T-----AT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-GATTT--AC-G----T--TA-------------C-A-C-G---G----T------G-AA-G---------C-A-A-A--T---G--T-T-T--------C--A-T--A--T--tttttcaatat
gi|56859 : TTCT--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-T----AGT-G-T--AA----C--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-TC-A-G-CT--AT---------G--C-G------------------------T-C--G--A-------A----C-G-C-CGAG--C---T-G--CG--A--G----T--CA----------------------------------------------T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-GT--A-CA-T-TA-C-A-T----G----------------G-C--AATCTA-AT-TT-TTTACATTt
gi|56860 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----C-GA--GA-G-AC-A-A-CC--AT---------T--G-G-A-G--A--TT---T-------
gi|56861 : TTCT--C-AC-ATA-A--T-C-A--C-C----AGT-G-C--AA----G--ATTCA-------A-C--T--T-A-A--CC---CA----T-TT--GA-A-A-------------------------------------T---T-------T-T-T--GTTGT-C--TTA----C-A-C-T--G--T---T-G--CA--AT-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---T-A-T-A--T---A--T-T-T--------TT-C-T--C--T--G-A-T-TT--A-CA-T-TA-C-A-C----A--G-T----GAA----G-T--AA---
gi|56862 : TTCT--T-AC-AAT-A--T-C-A--C-C----AG----------------------------A-A--T--T-T-A--CC---CA----T-GC--GA-G-AC-G-G-CC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-C--T--TT-T--TTG----C-A-C-T--C--C---T-G--CG--AC-G--------------------T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---G--C-T-T--------T--C-T--T--T--G-A-T-AT--A-TA-T-TA-G-G-T----G--G-T----GAA----A-T--AA---T-AC-AT-TTTGTGTT
gi|56863 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-T--T--T-T-A--CC---CA----TCAT--AG-A-AT-ATG-CC--A----------G--CAG-A-GCAA--TTGCAT-------T-T-CATA--AC-G--CCATGTTC-A-C-T--G--A---A-A--AA--AC-GTTATT--CA-T---T-----T-C-T-TAT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T--A--T--G-A-------A-C--T-GA-A-C-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---ATTC-GT-TT
gi|56864 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--CGC----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A----T--T-T-A--CC---CA----T-gaatt
gi|56865 : TTCT--C-CC-ATT-T--T-C-A--C-T----AGT-G-C--GA----G--AC-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-CG-A-A-TC--TTGTCTCCTCGG--T-G-G-A--A--TT---T-------C-C-T--T--AT-C--CCA----C-A-C-T--
gi|56866 : TTCT--CGAC-AAC-A--T-C-A--C------AGT-G-TT-GA----G--AG-TC-------A-C--C--T-T-T--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AG---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------C-T-CT-G--GT-C--TCA----C-A-
gi|56867 : TTCT--C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-
gi|56868 : TTCTGCC-ACCATT-T--C-T-A--C-C----AAT-G-T--GAT---G--AT-AG-------G-T--T--T-T-CT-CC---CA----T-GT--GA-G-AA-A-G-CC--TC---------G--T-G-A-G--A--TC---C-------G-C-C--T--AT-C--TCA----C-A-
gi|56869 : TCT--A-AC-ATT-T--T-C-G--C-C----AGT-G-T--AA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GG-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-G-G--A--TT---T-------T-T-C--
gi|56870 : TCT--C-AC-ATT-AA-T-C-A--C-A----AGT-G-T--GA----G--AT-CA-------G-TA-T--T-T-A--CC----A----T-GTTGGA-G-AC-A-G-CC--AT---------AATT-G---G--A--CT---T-------A-T-T--G---C-C--TTG----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--GC-A----T--CA-T---T-----T-T-G-T-T---A----T------G-AC-A-----TATGT-A-T-A--TACAA--T-G-T--------A--T-T--AACT--G-ATT-TT--A-CA-G-TA-C-A------G--A-T----AGA----GTT--AA---A-AT-AT-TTT
gi|56871 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-TT-GA----G--AC--G-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-TTC--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-G----TT-CA-T---T-----T-C-A-TCT---G----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-T-----T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AC--T-TTTATATTt
gi|56872 : CT--C-AC-ATT-T--C-C-AA-C-C----AGT-G-T--GA----G--AC--G-------A-C--T--T---A--CC---CA----T-GT--GA-G-AC-A-G-CCC-AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T--A--C---T-G--CG--AC-GT---T--CATT---T-----T-C-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-A-TCA--T---A--T-T-T--------C--C-TA-A--T--G-A-T-TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--G-T----G-A----G-C---A---A-AC--T-TTTATAT
gi|56873 : T--C-AC-ATT-A--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AT-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT-------------------T------------T-----G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AT-G----T--CA-T---T-----att
gi|56874 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G--C-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----T------
gi|56875 : --C-AC-ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----A--AC-CG-------G-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--AA-G-AC-A-GTCC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----CAA-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-C-A-T-T---G----TACATTCG-AC-GTTTCTT---T-A-T-A--C---A--T-T-T--------acattcgactttctttata
gi|56876 : -AC-ATT-T--T-C-AC-C-C----AGT-GTT--GA----G--AC-T--------A-C-----T-T-A--CC---CA----T-GG--GA-G-AC-A-G-CC--AT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--TCA----C-A-C-T---------T-G--CA--AC-AT---T--CA-----T-----T-C-A---T---G----T------G-AC-G-----TC--C-A-T-A--T---A----T-T--------C--C-T--A--T--A-----TT--A-CGTT-TA-C-A-C----G--GTT----GAA----G-C--AA---------T-TTTTTATTt
gi|56877 : C-ATT-C--T-T-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AA-TG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-GT--GA-G-Aatt
gi|56878 : -ATT-T--T-C-A--C-C----AGT-G-T--GA----G--GC-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---CA----T-AA--GA-G-AC-A-G-CC--ATATATTA---G--T-G-A-G--A--TT---C-------T-C-T--G---T-A--TTA----C-A-T-T--G--C---T-G--CG--AC-G----C--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---C-----A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-AT--A-CG-T-TA-C-A-C----T--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATGTT
gi|56879 : -ATT-T--T-C----C-C----TGT-G-T--GA----G--AC-GG-------A-C--T--T-T-A--CCATGCA----T-GT--GA-GAAC-A-G-CC--AT---------G--T-G-AGG--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-CTT--G--C---T-G--CA--AC-G----T--CA-----------T-G-A-T-T---G----TG-----G-AC-G-----T---C-ATT-A--C---A--T-TCT--------T--C-T--A--TC-A-A-TCTT--A-CG---TA-C-T-CA---G--G-T----AAA----G-CA-AA---A-AT-GT-TT
gi|56880 : --T-C-A--C-C----AAT-G-T--GA----G--AT-CA-------A-A--T--T-T-A--TT---CA----T-GC--GA-G-AC-A-A-CC--GT---------G--T-G-A-A--A--TT---T-----------------AT-C--TAA----C-T-T-T--G--C---T-A--CA--AC-G----T--CA-----C-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--TGT--A--A--G-A-T-TT--A-C-----A-T-A-T----G--G-T----GAA----G-T--AA---A-AC-AT-TATGTACTatgt
gi|56881 : -A--C-C----AGT-G-T--GA----G--AC-CG-------A-C--A--T-T-A--AC---CA----A-GT--GA-G-GC-G-G-TC--AT---------G--T-A-A-T--A--TT---T-------T-T-A--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--T--T---T--------AC-G----T--C------T-----A-C-A-T-T---G----T------G-
gi|56882 : C-CG-------A-C--T--T-T-A--CC---TA----T-GT--GA-G-AC-A----C--GT---------G--T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-G-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---GTACAT------A-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C--C-C--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----tattcatgagttatttatttt
gi|56883 : --T-G-A-G--A--TT---T-------T-T-C--G--AT-C--CCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-G-----T---A-A-T-A--T---ATGT-T-T--------T--C-T----------A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATTTT
gi|56884 : -G-A-T--A--TT---C-------TAT-C--A--GT-C--TCT----C-A-C-T--G--C---T-G--TG--AC-G----T--CA-T---T-----G---A-T-T---G----T------G-AC-G-----A---A-A-T-A--T---A--T-T-T----------------A--T--G-A-T-TT--A-CG-G-TA-C-A-T----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-AT-TTTATATT
gi|56885 : -G--A--TT---T-------T-T-C--T--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CA--AC-A----T--CA-----T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AT-A---------C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TATT-TA-C-A-T----G--G-T----AAT----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56886 : --TT---G-------T-T-C--C--GT-C--TCA----C-A-C-T--G--C---T-G--CG--AC-G----T--CA-T---T-----T-G-A-T-T---G----T------G-AC-A-----T---C-A-T-A--T----------------------------------------------G-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAG----G-C--AA---A-AT--T-TTTATATT
gi|56887 : T-C--TCA----C-A-C-T--G--C---C-T--CA--AC-G----T--TA-T---TGATT-T-G-A-T-T---G----T------G-AT-G-----T---C-A-C-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--C--A-A-T-GC--A-CA-T-TA-T-A-TTAAAG--G-T----GAA----G-T--AA---A-AT-AT-CTTGTATT
gi|56888 : ----T------G-AC-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------T--C-T--A--T--G-A-T-TT--A-TG-T-TG-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TT
gi|56889 : C-G-----T---C-A-T-A--T---A--T-T-T--------C----T--A--T--G-A-T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----A--G-T----AAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTTATATT
gi|56890 : -T-TT--A-CG-T-TA-C-A-C----G--G-T----GAA----G-C--AA---A-AT-GT-TTCATATT