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Reference ( gi|101582 ) : CTTCGAC--A-G-G--G--A-A--T-A-T---G-A---G-TC-C--A---T------A-T-A--C-CC-TG-TCAA---A--AAT--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T---AC-T---A--CT------G-C-A--GAG-CA-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----AG-AGAAG
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gi|101616 : cTTGGC--A-G-G--G--T-A--T-G-T---G-G---C-CT-C--A---T------A-T-T--C-CC-TG-TCAA---A--gaatccatataactaataatgta
gi|101626 : cTTGAC--A-G-G--G--T-A--T-A-C---G-G---A-CT-C--A---T------A-T-T--C-CC-TG-TCAA---A--gaatccatataactaataatgtac
gi|101617 : TTGGC--A-G-G--G--T-A--T-A-T---G-G---A-CT-C--A---T------A-T-T--T-CC-TG-TCAA---A--gaattcatataactaata
gi|101635 : cTTGGC--A-G-G--G--T-A--T-G-T---G-G---C-CT-C--A---T------A-T-T--C-CC-TG-TCAA---A--GTT-------------------------T---A-TA--T---AC-T---A--CT------G-T-A--GAG-CG-A--TC-A-AG--TTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----AG-AGgaatccatataactaagaatgta
gi|101611 : TTGGC--A-G-G--G--T-A--T-A-T---GGA---C-TT-C--A---T------A-T-T--C-CC-TG-TCCA---A--A
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gi|101637 : GAC--A-G-G--G--A-A----------G-A---G-TC----A---T------A-G-A--C-C--TG-C--A---G--AAT--CC-A-T---A----A-C--TAA-T-----TGAAT---AC-----A--CT------G-C-ACGGAGGCA-AG-TC-A-AT--TT--AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----AG-
gi|101615 : tAC--A-G-G--G--A-A----A-T---G-A---G-TC----A----------A-T-A--C-CC-TG-CCAA---G--TAT--CC-A-T---TT-A-A----GAA-TCGCA-AG--T---AC-T---A---T------G-C-A--GAG-CG-A--TC-A-AT--TTG-AAA----TG-AAC-AGTC--A-A-----AG-AGtccgagagg
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gi|101639 : taC--A-G-G--G--A-A--T-A-T---G-A---G-TC-C--A---T------A-T-ATAC-CC-TG-CCAA---G--AAT--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T---AC-T---A--CT------G-C-A--GAG-TG-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AATC--A-A-----AA-AGAG
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gi|101641 : c--A-A--T-A-T---G-A---G-CC-C--A---T------A-T-A--G-CC-TG-CCAA---G--AAT--AC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T---AC-T---A--CT------G-C-A--GAG-CG-A--TC-A-AT--GTG--AAA-T-CG-AAC-AATT--T-A-----AG-AGAccaagaatccatataactaataatgt
gi|101642 : --A-A--T-A-T---G-A---G-TT-C--A---T------A-T-A--C-CT-TG-CCAA---AG-AAT--CC-A-T---AT-A-A-CTATAA-T---A-TA--T---AC-g
gi|101643 : -A--T-A-T---G-A---G-TC-C--A---T------A-T-A--C-CC-TG-TCCA---G--AAT--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-
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lowQualScore : . .. . . .. .. .. . . ... . ... . . ... ...... . .. . . . . . . .. .. . .. . . ... . . . ... . ... . .. . . . ... .. ...... . . .. ..... . . .. . . ... . . . . . .. . ..... .... .
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Reference ( family-321 ) : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--NAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
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gi|101611 : CTTTGGAC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-AA--G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-TA--AT-A-A-C--TAA-TAA-A-TGT-T-A-C-T---A--GT------G-C-A--
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gi|101615 : CTTT--AC--A-G-G--G--AA----A-T---G-A---G-TC--A----------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--TA-T--CC-A-T---TT-A-A----GAA-TCGCA-AG--T-A-C-T---A---T------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAA----TG-AAC-AGTC--A-A-----A----G-AG
gi|101616 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-GCC-A---C------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-C-
gi|101617 : CTTTG-AC--A-G-G--A--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-GA--A-TG--T-A-
gi|101618 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-GCC-A---T------A----A---CC-T-G-CC-AA--G---A-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101619 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-AAT---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CA-AA--G--AA-T--TC-T-T---AT-
gi|101620 : CTTTG-AC--G-G-A--T--AT--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-T-CC-C-G-TT-AA--G--AA-T--CC-A-C---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101621 : CTTTG-AC------G--G--AA--T-A-TTATG-A---G-TCC-A---T------A-T--A-T-CC-C-G-TT-AA--G--AA-T--CC-A-C---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101622 : TTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CA-AA--T--AA-T--CC-A-TATGAT-A-A-C--TAA-TTCAA-TG--T-A-
gi|101623 : TTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---T-TCC-A---T------A-T--A-C-TC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-T--GAA-T---T-AG--T-A-C-T---T--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TT-A-AT--GTG-AAAA-T-AG-AAT-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101624 : TTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-C--T-G-CC-AA--G--A--T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAAA-T-TG-AAC-AAGA--ACA-----A----G-AG
gi|101625 : TTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T-----A---G-TCC-----T------A-T--A-C-CT-C-G-CC-AA--G--A--T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-
gi|101626 : TTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-G---T------A-T--A-C-CC-T-G-TC-AA--G--AA-T--TC-A-T---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101627 : TTTC-AC--A-G-A--G--AA--T-G-T---G-A---G-TTC-A---A------A-T--A-C-CC-T-G-TC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--AAA-T---A-
gi|101628 : TTGG-AC--A-G-G--G--AAATT-T-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--T-A-CC-T-G-CC-AA--G-----T--CC-A-T---AT-A-A-A--CGA-T---G-TC--TGA-C-C---T--CTTGACCAG-C-A--G-G-----C-G-A--TC-A-ATTCTTG-AAAA-T-
gi|101629 : TTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-GCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--TC-A-T---AT-A-A-C--G-A-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C----GAG-----C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-C-----A----G-AG
gi|101630 : TTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-ATGAG-TCC-A---T------A-T--A-C-C--T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TA--T-A-C-C---A--
gi|101631 : TTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCCCA---TG-----A-T--A-C-CC-T-G-C--AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TGT-T-A-CTT---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-AATTC-A-AT--GTG--AAA-T-CG-AAC-AATCCAA-A-----A----G-AGAG
gi|101632 : TTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCCCA---TG-----A-T--A-C-CC-T-G-C--AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TGT-T-A-CTT---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-AATTC-A-AT--GTG--AAA-T-CG-AAC-AATCCAA-A-----A----G-AGAG
gi|101633 : TTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TC--A---T------A-T--A-C-CCCT-G-C---A--G--AACT--CC-A-----AT-A-A-C--GAA-T---A-T---T---C-T---A--CC------G-C-A--GAG-----C-G-A--TT-A-AT--GTGTGAAA-T-CG--AC-AATT--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101634 : TTG-AC--A-G-G--GGAAA--T-A-T---G-A---GGTTC-A---T------A-T--A-C-CC---G-CC-AA--G--AA-TTTCC-AAT---ATCA-A-C--GAA-----A-TG--TTA-C-T---A--CT------G-C-G--GA------C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAAA-T-TG-AAC-AATC--A-G-----A----GTAGAGG
gi|101635 : TTG-GC--A-G-G--G--TA--T-G-T---G-G---C-CTC-A---T------A-T--T-C-CC-T-G-TC-AA-----AG-T--TT-A-T---AT-A------------------------C-T---A--CT------G-T-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AG--TTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AG
gi|101636 : TTG-AC--A-GCG--G--AA--T-A-T---G-A---G-GCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G--C-AA--G---C-T--CC-A-T---A
gi|101637 : TG-AC--A-G-G--G--AA----------G-A---G-TC--A---T------A-G--A-C-C--T-G-C---A--G--AA-T--CC-A-T---A----A-C--TAA-T-----TGAAT-A-C-----A--CT------G-C-ACGGAGG----C-A-AG-TC-A-AT--TT--AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----AGTCCG-AGAGG
gi|101638 : TA-AC--A-A-G--G--AA--T-A-T---G-A---T-TCC-A---T------G-T--A-C-CC-T-G-CC-AC--A--AA-T--CC-A-T----------C--TAA-TA--A-TG--T-A----------------------A--AAGAATGTC-G-A--TC-A-AC--ATG-AAGA-T-
gi|101639 : C--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-TATA-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----T-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AATC--A-A-----A----A-AGAGG
gi|101640 : C--A-G-GCAG--AA--T-A-C---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--CAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----A-AGAGG
gi|101641 : --AA--T-A-T---G-A---G-CCC-A---T------A-T--A-G-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--AC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG--AAA-T-CG-AAC-AATT--T-A-----A----G-AGAG
gi|101642 : --AA--T-A-T---G-A---G-TTC-A---T------A-T--A-C-CT-T-G-CCAAA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-CTATAA-T---A-TA--T-A-C-
gi|101643 : A--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-TC-CA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-
gi|101644 : -A-T---G-A---A-TCC-A---T------A-C--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--AAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GTG-----C-G-A--AT-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AACC--A-G-----C----G-AGAGG
gi|101645 : -TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TT-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATT--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101646 : -AA--A--AA-T--CCCA-T---AT-AGA-C--GAA-T---AGTG--T-A-C-T---G--CT------G-CCA--GAG-----C-GGA--TC-CCAT--TTG-AAAAAT-TG-AAC-AATCT-A-A-----A----G-A-AGG
gi|101647 : --CC-A-T---AT-A-AGC--GAA-TT--A-T---T-A-C-T---A--CT--------C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAAA-T-CG-AACTAATC--A-A-----A----G-
gi|101648 : -TG--T-A-C-T---A--TT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-G-GA-AAC-AATC--A-A-----T----G-AGAGG
gi|101649 : -C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAG-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 0 22 0 0 11 00 00 0 1 111 0 222 0 1 111 222222 1 22 0 0 1 0 0 1 22 11 1 11 1 0 111 0 0 0 222 0 222 1 33 1 0 2 222 11 222222 1 1 11 44444 1 1 33 2 1 555 3 1 1 1 2 44 1 22222 4444 1
lowQualScore : . .. . . .. .. .. . . ... . ... . . ... ...... . .. . . . . . . .. .. . .. . . ... . . . ... . ... . .. . . . ... .. ...... . . .. ..... . . .. . . ... . . . . . .. . ..... .... .
lowQualScore : 7 11 6 6 55 88 88 6 2 999 6 222 6 2 000 999999 2 22 6 6 8 6 6 2 22 44 7 66 7 6 666 6 6 6 000 6 777 2 11 4 7 4 444 22 777777 9 9 33 55555 1 1 99 1 1 222 2 1 1 1 3 33 1 99999 1111 2
consensus : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--NAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
Reference ( family-321 ) : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--NAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101578 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-C--T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101579 : CTTTG-AC--A-C-G--G--AA--T-A-T-----A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CCCAA--G--AA-T--CC-A-T---AA-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-
gi|101580 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TT-G-AT--ATG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101581 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-C---G-A---G-TCT-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-
gi|101582 : CTTCG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-TC-AA--A--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAAG
gi|101583 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--TTA-T---G-A---G-TCC-A---T------AAT--A-C-CC-T-G-CC-AA-----AA-TTCCC-A-T---AT-T-A-C--GAA-TT--A-TG--T-A-C-T---A--C-------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG---AA-T-CG-AAC--ATC--A-A-----ATC--A-AGAG
gi|101584 : CTTTG-ACCAA-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-TTG-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----
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gi|101586 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-C-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---GT-A-A-C--GAA-T---A-TA--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-
gi|101587 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TTC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--A--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101588 : CTTTG-AC--A-C-G--G--GA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AA-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-C-
gi|101589 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-CCC-A---T------A-T--A-C-TC-T-G-TC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--------T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-CGAGG
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gi|101591 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-A--T-C-CC-T-G-CC-AA--G--AAAT--CC-A-T---AT-A-A-C--AAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--AAG-----T-G-A--TT-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101592 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-----G-A---G-TCC-A---T------A-TC-A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---AGTG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TCAA-AT--TTG-AAAA-T--G-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
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gi|101594 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-ACC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-
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gi|101596 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---GAA---G-TCC-A---T------A-T--A---CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-----------T------G---G--GAG-----CGG-A--TC-T-AC--ATGTAACA-T-C
gi|101597 : CTTTG-AC--A-G-G-----AA--T-A-T---G-----G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CT-AA--AGAAA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AATC--A-AGAGCTA----G-AGAGG
gi|101598 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------ATT--A-CACC-T-GCCC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-A-
gi|101599 : CCTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-T---G-TCC-A---T------A-T--A-C-AC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-C---A--A--T-A---T---A--TT------G-C-A--
gi|101600 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-TAT-G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC---AT---TG-AAAA-T-TT-AA--AGTC--A-A-----A----G-AG
gi|101601 : CTTTG-AC--A-G-G-----AA--T-A-T---G-A---A-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T---CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TG--T-
gi|101602 : CTTTG-AC--T-G-G--A--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CA-A-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-TA--A-TA--T-A-C-
gi|101603 : CTTTG-ACC-A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCT-A---T------A-T--A-C-CC-T-G--C-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101604 : CTTTG-ACC-A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCT-A---T------A-T--A-C-CC-T-G--C-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-T---A-
gi|101605 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A---CC-T-G-CC-AA--GA-AA-T--CC---T---AT-A-A-C--GAA-TA--A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C---A--TC---AT---TG-AAA----CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AG
gi|101606 : CTTTG-AC--A-G-GC-G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T----C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CCAA-T---AT-A-A-C--TAA-T---A--A--T-ATC-TG--A--CT------GTC-A--GGG-----
gi|101607 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA----A-T---G-A---G-TTC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--AC---T---AT-A-A-C--TAA-T---G--A--T-A-T-T---A--C
gi|101608 : CTTTG-AC--ACG-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---A------T-T--A-C-CCAT-C-CC-AAG-G--AA-T--CC-A-G---AT-A-A-C--G-A-T---A-TG--T-A-CTT---ACTCT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TCGA-AT--TTA-AAAA-T-TGAAAC-AATC--A-A-----A----G-
gi|101609 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-T-C-A---T------A-T--A---CC-T-G-CC-AATTG--AAGT--CCGA-T---AT-A-A-C--TAA-A---A-T
gi|101610 : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-ACT---G-AT--G-TCC-AGCGT------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AACAG--AA-T--CA-C-T---AT-A---C--GAA-T---A-TG--T-A-C-TTTTA--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--TTGAAAAA-TATG-AGCAAATC--A-A-----A------AGAaatgta
gi|101611 : CTTTGGAC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-AA--G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-TA--AT-A-A-C--TAA-TAA-A-TGT-T-A-C-T---A--GT------G-C-A--
gi|101612 : CTTTG-AC--G-G-G------A--T-A-T---G-A---G-GC--A---T------A-T--A-C-C--T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAATT---A-T---T-A-C-----A--CT------G-C-A--GAGT----C-G-------A-AT--TTG--AAA-T-CG-AAC-AATC--A-C-----A----G-AG
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Reference ( family-321 ) : CTTTG-AC--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--NAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATC--A-A-----A----G-AGAGG
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gi|101639 : C--A-G-G--G--AA--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-TATA-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----T-G-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AATC--A-A-----A----A-AGAGG
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gi|101641 : --AA--T-A-T---G-A---G-CCC-A---T------A-T--A-G-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--AC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--GTG--AAA-T-CG-AAC-AATT--T-A-----A----G-AGAG
gi|101642 : --AA--T-A-T---G-A---G-TTC-A---T------A-T--A-C-CT-T-G-CCAAA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-CTATAA-T---A-TA--T-A-C-
gi|101643 : A--T-A-T---G-A---G-TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-TC-CA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--TAA-
gi|101644 : -A-T---G-A---A-TCC-A---T------A-C--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--AAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GTG-----C-G-A--AT-A-AT--GTG-AAAA-T-TG-AAC-AACC--A-G-----C----G-AGAGG
gi|101645 : -TCC-A---T------A-T--A-C-CC-T-G-CC-AA--G--AA-T--CC-A-T---AT-A-A-C--GAA-T---A-TG--T-A-C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-G-A--TT-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAC-AATT--A-A-----A----G-AGAGG
gi|101646 : -AA--A--AA-T--CCCA-T---AT-AGA-C--GAA-T---AGTG--T-A-C-T---G--CT------G-CCA--GAG-----C-GGA--TC-CCAT--TTG-AAAAAT-TG-AAC-AATCT-A-A-----A----G-A-AGG
gi|101647 : --CC-A-T---AT-A-AGC--GAA-TT--A-T---T-A-C-T---A--CT--------C-A--GAG-----C-G-A--TC-A-AT--TTG-AAAA-T-CG-AACTAATC--A-A-----A----G-
gi|101648 : -TG--T-A-C-T---A--TT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-G-GA-AAC-AATC--A-A-----T----G-AGAGG
gi|101649 : -C-T---A--CT------G-C-A--GAG-----C-A-A--TC-A-AT--GTG-AAAA-T-CG-AAG-AATC--A-A-----A----G-AGAGG