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Reference ( gi|24917 )        :          GTTA-TGTTTT-T-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AAG--C----T--C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24898                      :          GTTA-TGTTTT-T-G-C----T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AAG--CT---T--C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-AC
gi|24897                      :     atcttGTTA-TGTTTT-TTG-C-G--T--C---A--C--G-GC--ACT-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AAG--CT---T--C-C-----C--ATT-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24900                      :     atcttGTTA-TGTATT-T-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C----T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AAC--T----T--C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24921                      :     atcttGTTA-TGTTTT-T-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--A-T-T---G--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AAG--CT---T--C-C-----C--A-T-C-A--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24902                      :      atctGTTT-TGTTTT-T-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--C-C-A-A-T-C---G-A--AAG--CT---T--C-C-----C--A-C-T-C--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24943                      :             A-TGTGTT-T-G-T-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-AG-AAG--CT---T--T-C-----C--A-T-C-T--CA-----T------
gi|24944                      :              -TGTTTC-T-G-C-G--T--T---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AAG--CT---T--C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GT-TCG-T--TTA-ACC
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gi|24954                      :                  TTT-T-G-C-T--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AAG--CT---T--T-C-----C--A-T-T-T--CG-----T------T-A-c
gi|24956                      :                  TTT-T-G-A-G--T--C---AA-C--G-GC--A-T-T---A--TG--G--A--G-T--C--A-CCA-A-T-C---GCAC-AAG--C----TT-C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AT-----GC-CC
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gi|24963                      :                                             -GT--A-T-T---G--TG--A--C--A-T--C--A-C-C-A-T-T---A-A--AAG--T----TT-C-C-----C--A-T-C-T--CG-----T------T-A-AC-----GC-TCT-A--TTA-ACC
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Alignments
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lowQualScore                  :                                       9       4 6 2 77 88 000 99 99 6  88 7 6 444 11  33 33 88 5 99 88 6 3 1 1 1 000 5 99  5 7 333   1 44444 1 7 6 7 88  22222 444444 2 6 7 33333  5   8 99   7   
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Reference ( family-319 )      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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Reference ( family-319 )      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24937                      :                                           TTTT-G-C-C--T--C---A--TT-A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--AAC-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TT--C-----C-G-G-C-T--CG-----T------T-
gi|24938                      :                                     tggtgTTTTT-G-C-G--T--T---A--T--T-CC--A-T-T---A--TT--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-A---TTC-C-----C-A-T-T-T--CG-----T------G-A-A-C-----GC-TCG-T--TTA-
gi|24939                      :                                        gaTTTTT-G-C-G--T--C---A--CA-G-GC--A-T-TG--A--TG--A--C--G-TT-C--AGC-A-A-T-T---G-A--AAAG-C---CTC-CTATGCC-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-T
gi|24940                      :                                    atA-TGTTTTTTG-C----T--C---A--C--G-GC--T-T-TT--A--TG--A--C--G-T--C--A-CCA-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------TGA-A-TA----GC-TCA-
gi|24941                      :                                          TTTTC-G-CCG--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---ATTTG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-TTCGG-A--AA-GAC---TTC-C-----C-A-T-A-T--TG-----T------T-A-A-T-----G
gi|24942                      :                                        atTTTTC-G-CCG--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---ATTTG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-TTCGG-A--AA-GAC---TTC-C-----C-A-T-A-T--TG-----T------T-A-A-T-----G
gi|24943                      :                                    atA-TGTGTTT-G-T-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-AG-AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CA-----T------
gi|24944                      :                                       -TGTTTCT-G-C-G--T--T---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GT-TCG-T--TTA-ACC
gi|24945                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-TG--A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TC--T--TTA-ACC
gi|24946                      :                                          gTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24947                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24948                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24949                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-T---G-A--AA-G-C---CTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TAA-T--TAA-GCC
gi|24950                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C----T--C--A-C-ATA-A-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24951                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-----A--TG--A--C----T--C--A-C-A-A-G-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--T------T------T-ATA-C-----GCATCA-T--TTA-ACC
gi|24952                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TGT-A--C--G-T--C--AAC-A-AAT-C-----A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-T-C-T--CA-----T------C-A-A-C-----GC-TCA-TCATTA-AC
gi|24953                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-A-C---TTC-C-----C-
gi|24954                      :                                           TTTT-G-C-T--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-T-T--CG-----T------T-A-
gi|24955                      :                                           TTTT-G-C-G--TGTC---A--C--G-GC--A-T-----A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C-----A--AA-G-C---ATC-C-----C-A-T-T-T--
gi|24956                      :                                           TTTT-G-A-G--T--C---AA-C--G-GC--A-T-T---A--TG--G--A--G-T--C--A-CCA-A-T-C---GCAC-AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-T-----GC-CCt
gi|24957                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--ACT-T---G--TG--A--C--G-TT-C--A-A-C-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-CAA--AG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-TC-TTA-ATC
gi|24958                      :                                            TTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--G--C--G-T--C--A-C---A-T-C---G-A--AA-G-C----TC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-
gi|24959                      :                                            TTT-G-C-G--T--C---A--T--G-GC--A-T-T---A--TG--A--CCTG-T--C--A---A-A-T-C---G-A--A--G-C---TTCTC-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-AC
gi|24960                      :                                            TCT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A---G--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-G-C-T--CGT----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTT-AC
gi|24961                      :                                                   -G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--G--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-A-A---TTT-C-----C-A-T-
gi|24962                      :                                                           ---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACCt
gi|24963                      :                                                                     -GT--A-T-T---G--TG--A--C--A-T--C--A-C-C-A-T-T---A-A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCT-A--TTA-ACC
gi|24964                      :                                                                        --A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GA-TCA-T--TTA-ACC


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blockSeqs                     :                                       .       T   . AT        A  A        C   TA  T   .  .  T    T     A G . . . TC    T     A T     . .     . G   A     T     .      .     A      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       T   . G         .  .        .   G   .   .  .  .    T     . A . . . TC    G     . T     . .     . .   .     T     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . G         .  .        .   T   .   .  .  .    T     . C . . . A     C     . A     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . G         .  .        .   G   .   .  .  .    .     . C . . . .     .     . A     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
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blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                       .       .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .    .
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .     
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .     .     
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .           
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .           
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .      .           
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .                  
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .                  
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .     .                  
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
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blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                               .   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .      .                        
blockSeqs                     :                                                   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .     .     .                               
blockSeqs                     :                                                   . .         .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .                                           
blockSeqs                     :                                                               .  .        .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .   .                                           
blockSeqs                     :                                                                           .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     . .                                               
blockSeqs                     :                                                                           .   .   .   .  .  .    .     . . . . . .     .     . .     . .     .                                                 
blockSeqs                     :                                                                                          .  .    .     . . . . . .     .                                                                       


blockSeqCons                  :                                                     **                                                                         ***
originalCons                  :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
finalCons                     :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC





Alignments
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lowQualScore                  :                                       .       . . . .. .. ... .. .. .  .. . . ... ..  .. .. .. . .. .. . . . . . ... . ..  . . ...   . ..... . . . . ..  ..... ...... . . . .....  .   . ..   .   
lowQualScore                  :                                       9       4 6 2 77 88 000 99 99 6  88 7 6 444 11  33 33 88 5 99 88 6 3 1 1 1 000 5 99  5 7 333   1 44444 1 7 6 7 88  22222 444444 2 6 7 33333  5   8 99   7   
consensus                     :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
Reference ( family-319 )      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24892                      :                                   GTGA-TGTTTT--G-C-GG-T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-CT--TTC-C-----C-T-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24902                      :                               atctGTTT-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--C-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-C-T-C--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24905                      :                      atcttggtaatgaGTTG-TGTTTTT-G-C-G--G--C---A--C--A-AT--A-T-T---A--TG--A--C--A-T--C--A-C-A-G-T-C---G-A--AA-G-CT--TTT-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-T-A-T-----GT-TCG-T--TTA-
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gi|24913                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-TT--A-T-T---A--TG--A--T--G-T--C--A-C-A-A-T-CA--A-A--AA-G-C---TTT-C-----C-G-T-C-T--CG-----T------T-A-A-T-----GC-TCA-T--TTA-ACC
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gi|24916                      :                                  tGTTA-TATTTT--G-C-G--T--C---A--C--G--C--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TT--C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24917                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C----TC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24918                      :                                   GTTA-TATTTT--G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C-----A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--
gi|24919                      :                                   GTTA-TGTTTT--G-C-G--G--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GT-TCG-T--TTT-ACC
gi|24920                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-CGA-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24921                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--A-T-T---G--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-A--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24922                      :                                   GTTA-TGTTTT--G-C-GG-T--C---A--C--G-GC--A-T-T---AT-TG--A--C--G-T--C--A-CAA-A-T-C---G-A--AA-G-CCGGTTC-C-----CAA-T-C-T--TG-----T------T-
gi|24923                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--A-T-T---G--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-A--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ATC
gi|24924                      :                                   GTTA-TGTTTCT-G-T-G--C--C---A--C--G-GT--A-T-T---A--TA--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-T-----C-A-T-T-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TTA-T--TTA-AC
gi|24925                      :                                   GTTA-TGCTTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---G--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---T-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-A--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-
gi|24926                      :                                   GTTA-TGTTTTT-A-C-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-T-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-T-----GT-GCA-T--TTA-
gi|24927                      :                                   GTTA-TGTTTTTTG-C-A--T--C---A--CCAG-TC--A-T-T---A--TG--A--C--A-T--CTTA---A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24928                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-A--T--C---A--C--C-ACGTA-T-T---A--TG--A--C--A-TT-C--T-T-A-A-T-C---G-AT-AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-AC
gi|24929                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---T-A--AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-G-CCTAATGC-GCA-T--TTA-
gi|24930                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--C--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-G-T-C---G-A--AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CG-----TTAGACCT-A-A-T-----GC-GCA-T--TTA-
gi|24931                      :                                   GTTA-TGTTTT--A-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-TTA-A--TG--AAAC--G-T--C--A-C-A-A-TAC---G-A--AA-G-C---TTC-C-----CAA-T-C-T--CG-----T------T-A-A-CT----AC-TCGTT--TTA-ACC
gi|24932                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTG-C-----C-A-T-C-T--CGT----T------T-A-A-C-----
gi|24933                      :                                   GTTA-TGTTTTG-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-
gi|24934                      :                                   GTTA-TGTTTTTTG-C-G--T--C---A--C--A-AT--A-T-T---A--TG--A--C--AAT--C--A-C-A-A-T-C---A-A--AA-T-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CG-----TTAGGCCT-A-A-T-----GC-GCA-T--TTA-
gi|24935                      :                                   GTTA-TGTTTTT-G-C-G--T------A--C--A-GT--A-T-----A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-A-T---G-A--AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-T-T--CG-----T------T-A-
gi|24936                      :                                   GTTA-TATTTGT-G-C-G--T--T---A--C--A-TT--A-CCT---A--TG--A--CT-G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTCTC-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-
gi|24937                      :                                           TTTT-G-C-C--T--C---A--TT-A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--AAC-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TT--C-----C-G-G-C-T--CG-----T------T-
gi|24938                      :                                     tggtgTTTTT-G-C-G--T--T---A--T--T-CC--A-T-T---A--TT--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-A---TTC-C-----C-A-T-T-T--CG-----T------G-A-A-C-----GC-TCG-T--TTA-
gi|24939                      :                                        gaTTTTT-G-C-G--T--C---A--CA-G-GC--A-T-TG--A--TG--A--C--G-TT-C--AGC-A-A-T-T---G-A--AAAG-C---CTC-CTATGCC-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-T
gi|24940                      :                                    atA-TGTTTTTTG-C----T--C---A--C--G-GC--T-T-TT--A--TG--A--C--G-T--C--A-CCA-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------TGA-A-TA----GC-TCA-
gi|24941                      :                                          TTTTC-G-CCG--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---ATTTG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-TTCGG-A--AA-GAC---TTC-C-----C-A-T-A-T--TG-----T------T-A-A-T-----G
gi|24942                      :                                        atTTTTC-G-CCG--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---ATTTG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-TTCGG-A--AA-GAC---TTC-C-----C-A-T-A-T--TG-----T------T-A-A-T-----G
gi|24943                      :                                    atA-TGTGTTT-G-T-G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-AG-AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-C-T--CA-----T------
gi|24944                      :                                       -TGTTTCT-G-C-G--T--T---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GT-TCG-T--TTA-ACC
gi|24945                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-TG--A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TC--T--TTA-ACC
gi|24946                      :                                          gTTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACC
gi|24947                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24948                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24949                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-T---G-A--AA-G-C---CTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TAA-T--TAA-GCC
gi|24950                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C----T--C--A-C-ATA-A-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-A-
gi|24951                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-----A--TG--A--C----T--C--A-C-A-A-G-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--T------T------T-ATA-C-----GCATCA-T--TTA-ACC
gi|24952                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--A-GC--A-T-T---A--TGT-A--C--G-T--C--AAC-A-AAT-C-----A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-T-C-T--CA-----T------C-A-A-C-----GC-TCA-TCATTA-AC
gi|24953                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-A-C---TTC-C-----C-
gi|24954                      :                                           TTTT-G-C-T--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTT-C-----C-A-T-T-T--CG-----T------T-A-
gi|24955                      :                                           TTTT-G-C-G--TGTC---A--C--G-GC--A-T-----A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C-----A--AA-G-C---ATC-C-----C-A-T-T-T--
gi|24956                      :                                           TTTT-G-A-G--T--C---AA-C--G-GC--A-T-T---A--TG--G--A--G-T--C--A-CCA-A-T-C---GCAC-AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-T-----GC-CCt
gi|24957                      :                                           TTTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GT--ACT-T---G--TG--A--C--G-TT-C--A-A-C-A-T-A---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-CAA--AG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-TC-TTA-ATC
gi|24958                      :                                            TTT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--G--C--G-T--C--A-C---A-T-C---G-A--AA-G-C----TC-C-----C-A-T-C-T--TG-----T------T-
gi|24959                      :                                            TTT-G-C-G--T--C---A--T--G-GC--A-T-T---A--TG--A--CCTG-T--C--A---A-A-T-C---G-A--A--G-C---TTCTC-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-AC
gi|24960                      :                                            TCT-G-C-G--T--C---A--C--G-GC--A-T-T---A---G--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-G-C-T--CGT----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTT-AC
gi|24961                      :                                                   -G--T--C---A--C--A-GT--A-T-T---A--TG--G--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-A-A---TTT-C-----C-A-T-
gi|24962                      :                                                           ---A--C--G-GC--A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCA-T--TTA-ACCt
gi|24963                      :                                                                     -GT--A-T-T---G--TG--A--C--A-T--C--A-C-C-A-T-T---A-A--AA-G-T---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GC-TCT-A--TTA-ACC
gi|24964                      :                                                                        --A-T-T---A--TG--A--C--G-T--C--A-C-A-A-T-C---G-A--AA-G-C---TTC-C-----C-A-T-C-T--CG-----T------T-A-A-C-----GA-TCA-T--TTA-ACC