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Reference ( gi|80997 )        : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A------A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|80999                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTT-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A------A-AAGG-A-TC-GG--AC-A-CTTGTAA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|80998                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----T-A-A----C-------A------A-AGGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---GAA-----AAAAC------T---A-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81052                      :   GA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TCT-T---ATTG-T------C---C---A--G--------A-T-GT---T----A----T-A-A----C-------A------A-AGGG-A-TT-GG--AA-A-C----AA-G--T-TAC-C---G-GTATCTAAAAT------T---T-A-C-A-----A-C----G-TC-C-T
gi|81053                      :    A-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---GAA-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81054                      :     -AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT-TTTTATTG-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81055                      :     -AT-T-GAA-C--A-TT-----TTT-TTT-ATTG-T------T---A---T--A--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-GTTT-T-C-T---G-A-----AAACT------T---C-A-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81056                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-C------T---A---T--G--------A-T-GT---T----A----T-A-A----A-------G------A-AAAG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-CTT---G--------AAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CT-C-TCTCCTA
gi|81057                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG------------A---C--A--------A-T-AA---T----G----C--------C-------A------A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-------A-----TAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81058                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TGT-T----TT--T------T---G---T--A--------G-T-TA---A----A----A-T-A----C-------A------A----G-A-CC-GT--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-A-----AAACT------T---T-A-A-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81062                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-TA-----T---A---T--A--------A---TA---T----A----T---A----C-------A------A-AAGG-A-TT-AG--AA-A-C----AA-G--T-T-C-
gi|81063                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT-T---ATTG-C------C---A---A--A--------A-T-TG-----------------A----C-------A------A-AAGG-A-TT-GG--AT-A-C----AA-C--T-T-C-C-----------AAAAC------T---T-A-T-A-----A-
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gi|81068                      :                                                                                       -A-A----C-------G------A-AAGG-A-TT-AG--GC-A-C----AC-G--T-T-CTT---G--------AAAC------C---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCTA
gi|81069                      :                                                                                                             atgttgt-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-T-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA





Alignments
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lowQualScore                  :     .. . .   . .. .  .....   .. ...    ................................................ .... ....... . .    . . ..  ..  . . ....  . .. . . .............     ...... ... . . . ............ .  . .       
lowQualScore                  :     11 6 6   1 88 6  44444   99 666    222222222222222222222222222222222222222222222222 9999 4444444 6 6    5 1 66  88  5 5 8888  7 33 6 6 8888888888888     333333 777 6 2 2 222222222222 6  6 6       
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Reference ( family-318 )      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81045                      :  TGA-TT-T-GAA-G--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-GT---T----A----C-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-T----AA-G--T-T-C-T---T-A-----AAAG-------T---T-A-G-A-----A-C----G-TC-C-TTTCC
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gi|81053                      :    A-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---GAA-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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Alignments
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Reference ( family-318 )      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|80997                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81004                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--C---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-GT---T----A----C-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------AAAAC------T---T-A-A-A-----A-C----G-CC-A-TCTCCTA
gi|81005                      : TTGA-AT-T-TAA-C--A-AA-----TTGA-T---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-GT---T----A----A-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-A-----AAAAC------C---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81006                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T--------------A--------A-T-TA---A----A----T-T-A----C-------A-A-AGGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----C-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81007                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T--------------A--------A-T-TA---A----A----T-T-A----C-------A-A-AGGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----C-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81008                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------A---CA--------A-TATAG--T----G----C--------C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-A--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81009                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---AGTG-T------C--A----AGAT-----A-T-TA---T----A------A-A----C-------A-A-AA-T-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------AAAAC------T---T-A-G-A-----A-T----A-CC-C-CCTCC
gi|81010                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------A---CA--------A---TA---A----A----C-A-T----C-------A-A-AAGG-A-TT-AG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-CTCTAG-CC-T-TCTCCCA
gi|81011                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------T-G-CA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAAG-G-TC-GGGTGC-A-CA---AA-G--T-C-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-GAA-----A-T----G-CC-CTTCTCC
gi|81012                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TG-----TTT--T---ATTG-T--------------A--------A-T-TA---A----A----T-T-A----C-------T-A-AGGG-A-TT-GG--GT-A-C----AG-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----C-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81013                      : TCGA-AT-T-GAA-CCAA-TA-----TTT--T---ATTG-T------TT-A---TACC------A-T-TA---T----A----T-A-A------------A-A-AAGG-A-TT-GG--AC-A-C----AA-G----T-C-T---G-A-----AAAAC------TA--TAA-G-A-----A-C----A-CC-T-CCTCCCA
gi|81014                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TT-----TTT--TTT-ATTG-T------C--A---AA--------A-T-GT---T----A----C-A-AA---C-------A-A-AAGA-A-TC-AG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------AAAAC------T---T-A-G-A-----A-T----G-CC-C-TCT
gi|81015                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---CATGTATGATG-T-TA---TA---A----C-A-AATTTG-------A-A-AAGG-A-TT-GG--AC-A-C----AC-GT-T-T-T-T---G--------AAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-TC-C-TCTCCTA
gi|81016                      : TTGA-AT-T-GAA-G--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-AT---T----A----G-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AG-G--T-T-C-T---T-------TAAAC------T---T-T-G-A-----A-T----G-TC-C-TCTCC
gi|81017                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTGTT------T--A---TA--------A-T-TGAACC----A----C-A-A----C-------A-A-AAGA-ATTT-GG--CC-A-CA---AA-G--T-T-C-T---G-A-----ATAACCTTCGTC---T-A-A-A-----C-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81018                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TGT--T---TTTG-T--------------A--------G-T-TA---A----A----T-T-A----C-------A-A-AGGG-A-CC-GT--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-A-A-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81019                      : TTGA--T-T-GAA-C--AATA-----TTT--C---ATTG-T------C--AAGATT--------A-T-TA---T----A------A-A----C-------A-A-AAGA-T-TT-GG--GC-AACG---AA-G--T-T-C-T-----------AAAAC------T---T-AAG-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCTA
gi|81020                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------G---CA--------A-T-AT---T----G----C--------T-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-G-C----AA-A--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-T-TCT
gi|81021                      : TTGA-AT-T-GGA-C--A-TA-----TTT--C---ATGA-T------C--A---AG--------A-T-AT---T----A----C-AGA----C-------A-A-AGGA-A-TT-AG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-----G-T-----TAAAC------G---T-A-G-A-----A-C----A-CC-C-TCTCCTA
gi|81022                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TAAA---T--A---TA--------T-T-TA----------------------C-------A-A-TGGG-A-TT-GA--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------AAAAC------T---T-G-G-G-----ATT----G-CT-C-TCTCCC
gi|81023                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TAAA---T--A---TA--------T-T-TA----------------------C-------A-A-TGGG-A-TT-GA--GC-A-T----AA-G--T-T-C-T---T-------AAAAC------T---T-A-G-G-----ATT----G-CT-C-TCTCCC
gi|81024                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-AA-----T-----------G-T-----------------------A-T-T--------------C-A-A----T-------A-A-AAGG-A-TA-GA--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-AT----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81025                      : TTGA-AT-T-GAA-G--A-TA-----TTG--T---TTTG-T------T--A---TG--------A-CGTA---T----A----C-A-A----C-------G-A-AAGG-A-TT-GG--GC-G-T----AA-A--T-T-C-T---T-A-----TAAAT------G---T-A-G-A-----A-C----G-CT-C-T
gi|81026                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TCT--T---ATTG-TAAA---T--A---T---------A-T-T----T----A----C-A-A----C------------GGG-A-TT-GA--GC-A-C----AA-G--G-T-C-TTCAA-A-----AAAAC------T---T-A-G-G-----ATT----G----C-TCTCCC
gi|81027                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-G------G--A---TA--------A----A--------A----C-A-ATAGCC-------A-A-AAGG-A-TTGGG--GC-A-C----AATG--T-T---------A-----AAAACA-----TATAT-A-G-A-----ATT----G-CC-C-TATCCCA
gi|81028                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTG--T---ATTG-C------A--A----A--------A-C-TG-----------------A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--AT-A-C----AA-G--T-T-C-C-----------AAAAC------T---T-A-G-A-----T-A----A-CC-C-ACTCC
gi|81029                      : TTGA-TT-T-GAA-A--A-TA-----TTT--T---ATTG-T-----------------------A-T-CA---T----A----T-ATA----C-------A-A-ATGG-A-TT-GG--AT-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-AC----AAAAC------T---T-A-ATA-----A--------TC-C-TCTCC
gi|81030                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------A---CA--------A-T-AA---T----G----T--------C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-A---G-A-----AA
gi|81031                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---GTTG-TATATAAT--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-ATA----C-------A-A-AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------ACAAC------T---T-G-G-G-----A-G----G-TT-T-TCACCTAct
gi|81032                      : TTGA-AT-TTGAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TA-----T--A---TA--------G-T-T----------------A-A----C-------A-A-AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------ACAAC------T---T-A-
gi|81033                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT---------------------A---TA--------A-G-CA---TTAGAA----C-A-C----C-------A-A-ATAT-A-TT-AG--GC-A-C----AC-G--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-A----G-CC-C-TCTCTCA
gi|81034                      : TTGG-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T--------------A--------A-T-TA---A----A----T-T-A----C-------A-A-AGGG-A-TC-AG--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-
gi|81035                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-G------T--A---TATG------A-T-TA---T-------------A----C-------A-A-AAGG-A-TT-AG--GA-A-C----AA-G--T-T-C-
gi|81036                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG--------T--A---TA------------TA---T----A----CGA-A----CATATACGA-A-AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----ACAAC------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACC
gi|81037                      : TTGA-AT-T-GAA-A--A-TA-----TTT--T---GTTG--------T--A---TA--------A---TA---T----A----T---A----C-------A-A-ATGG-A-TT-GG--AT-T-C----AA-G--T-T-CTT---G--------CAAC------T---T-----A-----A-T----GATC-C-TCTCTC
gi|81038                      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTG--C---ATTG-C------T--A---TG--------A-TGTA---T----A----T-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--CT-A------AC-G--T-T-C-T---
gi|81039                      : TTGA-AT-T-GAAAC--A-TA-----TTTA-G---ATTG-----------A---AA--------A-T-AG---T----G----C-C-A------------A-A-AAAG-A-TT-GG--GC-T-C----AA-A--T-T-T-------A-----AAAAC------T---T-A-G-------A-T----T-CC-C-TCTCCCAa
gi|81040                      : TTGA-AT-T-GAAAC--A-TA-----TTT------ATTG-T-----------------------A-T-TA---T----A----T-A-A----T-------ATACAAAG-T-TC-GA--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----ACAAC------T---T-ACG-A-----G-C----G-TT-C-TCACC
gi|81041                      : TTGA-GT-T-GAA-C--G-TA-----TTTATT---GTTG-T------T--A----A--------G-T-TG---T----ATG--C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----A
gi|81042                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----AAATAC-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAATC------T---T-G-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81043                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---AA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGGTA-TC-GG--GC-A-C----AAGG--T-T-C-T---G-A-----AAAAT------T---T-A-G-A-----A-CG---G-CC-C-TCTCC
gi|81044                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATCG-----------A---CA--------A-C-AA---T----G----C--------C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81045                      :  TGA-TT-T-GAA-G--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-GT---T----A----C-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-T----AA-G--T-T-C-T---T-A-----AAAG-------T---T-A-G-A-----A-C----G-TC-C-TTTCC
gi|81046                      :  TGAGAT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--A---AA--------A-T-AT---T----A----C-AGA----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----TA-G--T-T-C-------A-----AAAA
gi|81047                      :  TGA-ATAT-GAA-C--A-TA-----TTT--T---AATG-A------C--ACCGTA--------A-T------------------G-A----C-------C-A-AAAG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--TAT-C-A---C-AC----CAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-T-TCCCAa
gi|81048                      :  TGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TA-----T--A---TA--------A-A-TA---C----A----T-ATA----C-------A-A-AAGG-T-TT-GA--ACAA-C----AA-G--T-T-C-T---T-------ACAAC------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACCTA
gi|81049                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TT----------G-----------A---CA--------G-T-AG---T----G----C--------C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-------A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-T
gi|81050                      :  TGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TACA---T--G---TAG-------A-T-TA---T----A----T-G-A----CATATAG-A-A-AAGG-T-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-A-----
gi|81051                      :   GA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTA-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----T----C-A-A----G-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AT-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----C-C----G-CC-C-
gi|81052                      :   GA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TCT--T---ATTG-T------C--C---AG--------A-T-GT---T----A----T-A-A----C-------A-A-AGGG-A-TT-GG--AA-A-C----AA-G--T-TAC-C---G-GTATCTAAAAT------T---T-A-C-A-----A-C----G-TC-C-T
gi|81053                      :    A-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---GAA-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81054                      :     -AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--TTTTATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81055                      :     -AT-T-GAA-C--A-TT-----TTT--TTT-ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-GTTT-T-C-T---G-A-----AAACT------T---C-A-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81056                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------T--A---TG--------A-T-GT---T----A----T-A-A----A-------G-A-AAAG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-CTT---G--------AAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CT-C-TCTCCTA
gi|81057                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------A---CA--------A-T-AA---T----G----C--------C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-------A-----TAAAC------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81058                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TGT--T----TT--T------T--G---TA--------G-T-TA---A----A----A-T-A----C-------A-A----G-A-CC-GT--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-A-----AAACT------T---T-A-A-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81059                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TCT--T---ATTG-TACA---T--A---TA--------T-T-TT---T----A----C-A-A----T-------------GG-ATTC-GA--GC-A-C----AACG--T-T-C-T---G-------AAAAC------T---T-A-G-G-----ATT----G-CT-C-TCTCCC
gi|81060                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTA-CA-----T--A---TA--------A-T-TA---T----A----T---A----C-------A-A-AAGG-T-TT-GG--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T---T-------ACAAC------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACCTA
gi|81061                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TATA---T--A---TA--------A-T--A---T----A----C-A-A----------------AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-------ACAAC------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACC
gi|81062                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TA-----T--A---TA--------A---TA---T----A----T---A----C-------A-A-AAGG-A-TT-AG--AA-A-C----AA-G--T-T-C-
gi|81063                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------C--A---AA--------A-T-T----------------G-A----C-------A-A-AAGG-A-TT-GG--AT-A-C----AA-C--T-T-C-C-----------AAAAC------T---T-A-T-A-----A-
gi|81064                      :       T-T-GAA-T--G-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--AA--TA--------AAC-TG--------A----A-G-A----C-------T-A-AAGG-A-TA-GG--GC-G-C----AA-G--T-T-C-T---T-------TAAAC------C---T-A-G-A-----G-C----G-TCAC-TCCCC
gi|81065                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------CCAA---AA--------A-C-CT---G----A----C-A-A----A-------A-A-AAGG-A-TTTGG--AT-A-C----AA-G--T-T-C-C-----------AAAAC------T---T-T-G-ATT---A------A-CC-C-TCTC
gi|81066                      :            AA-T--A-AA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----T-A-A----T-------A-A-AGGA-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---GAA-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81067                      :                                      TG-T------T--G---TA--------A-T-TT---T----AAAAAT-A-A----C-------A-A-CTGG-A-TA-GG--GC-G-C----AA-G--T-T-C-T-----A-----AAAAC------T---T-C-T-A-----C-C----G-CC-C--CTCC
gi|81068                      :                                                                                     -A-A----C-------G-A-AAGG-A-TT-AG--GC-A-C----AC-G--T-T-C-TT--G-A-----AA--C------C---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCTA
gi|81069                      :                                                                                                      atgttgt-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---A-T-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA


blockSeqs                     :     GA       A       ATATA   AT TTT    TTACATGTATGATGTTATAACA                           ATTT ATATACG          T TG          TTGT  T TT     CGGTATCT          CTTCGT ATA   A A ATTTTAC     
blockSeqs                     :     A        A       .       A  TT     TATATAATATAATTATACAT                             TAGC ATATAG           T TT          A     G T      TTCAAA            A      A     C T ATTTTAC     
blockSeqs                     :     A        .       .       A  TT     TTTATAATTGAACCACA                                A    .                . C           A     C .      TGAA              .      .     . . TCTCTA      
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATAAATACA                                .    .                . C           G     . .      TTAT              .      .     . . ATT         
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TACATGTAGATTATATG                                .    .                . C           .     . .      TTAC              .      .     . . ATT         
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTGTAATTTTAAAAATA                                .    .                . T           .     . .      ACAC              .      .     . . ATT         
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTTATACCATTATATA                                 .    .                . C           .     . .      TGAA              .      .     . . ATT         
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TACATATATTTTTACA                                 .    .                . C           .     . .      TGAA              .      .     . . ACG         
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATTATTATAA                                  .    .                . T           .     . .      TTGA              .      .     . . ATT         
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      ATAAGCATTAGAACA                                  .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . TTA         
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TATATAAATACATAT                                  .    .                . C           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TATATATAATATACA                                  .    .                . C           .     . .      TTG               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      CCCAAAAACCTGACA                                  .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATGTTACAG                                   .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATGTTAAAG                                   .    .                . T           .     . .      TAA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TCAAGATATTATAA                                   .    .                . C           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATATTAGAG                                   .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATATTACAG                                   .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATGACGTATACA                                   .    .                . C           .     . .      TTA               .      .     . . CC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TAAATATATTTACA                                   .    .                . T           .     . .      AGA               .      .     . . CC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      CTATGATGTATATA                                   .    .                . T           .     . .      TTG               .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTAAGTTGTATGCA                                   .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAGATGTTACAG                                   .    .                . C           .     . .      TGA               .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCAAAATATTACAG                                   .    .                . T           .     . .      TTA               .      .     . . CC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TCAATAAACTGAAG                                   .    .                . T           .     . .      TAA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATAATTATATA                                    .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATACA                                    .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATACA                                    .    .                . T           .     . .      TGA               .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATGGTGTTGTA                                    .    .                . A           .     . .      TTG               .      .     . . CC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATATA                                    .    .                . T           .     . .      TAA               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATATGCATACA                                    .    .                . T           .     . .      TAT               .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TCAAAATGTTACA                                    .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTAAAATTATACA                                    .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATAATTATTCA                                    .    .                . C           .     . .      TA                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TCCAGATGTTATA                                    .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATACA                                    .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . TA          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATAATTATACA                                    .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AG          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TTATAATTATACA                                    .    .                . C           .     . .      TG                .      .     . . TA          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      CTATGATGTTATA                                    .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AG          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTGTAGTTAAAAT                                    .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      CATATAATTATAT                                    .    .                . T           .     . .      GT                .      .     . . AT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TTATAATTATATA                                    .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . GC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      ACAATATAGTGC                                     .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     G        .       .       .  .      TAAATATATTTA                                     .    .                . C           .     . .      TT                .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TAAATATATTTA                                     .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      GTATATGATTAT                                     .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TATATAATATAT                                     .    .                . C           .     . .      TA                .      .     . . AG          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TATATATACGA                                      .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      AAAATAGTGCC                                      .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . CC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      ACACCGTAATG                                      .    .                . T           .     . .      TG                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TAATTAAATT                                       .    .                . T           .     . .      TT                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TAATTAAATT                                       .    .                . T           .     . .      TG                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      ACAATAAACA                                       .    .                . C           .     . .      TT                .      .     . . TT          
blockSeqs                     :     T        .       .       .  .      TAATTAAATT                                       .    .                . T           .     . .      TA                .      .     . . AC          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      TAGTTAAATT                                       .    .                . C           .     . .      A                 .      .     . . AG          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      GCAATATTGC                                       .    .                . T           .     . .      A                 .      .     . . AG          
blockSeqs                     :     A        .       .       .  .      GGATAAAACA                                       .    .                . C           .     . .      T                 .      .     . . GC          
blockSeqs                     :     .        .       .       .  .      TATCATATAT                                       .    .                . C           .     . .      A                 .      .     . . AC          
blockSeqs                     :              .       .       .  .      ACAATAATGT                                       .    .                . C           .     . .      A                 .      .     . . CC          
blockSeqs                     :              .       .       .  .      TATATAGTTA                                       .    .                . T           .     . .      C                 .      .     . . AC          
blockSeqs                     :              .       .       .  .      TAATTAAATT                                       .    .                . T           .     . .      A                 .      .     . . AC          
blockSeqs                     :              .       .       .  .      TATAATATAT                                       .    .                . C           .     . .      A                 .      .     . . A           
blockSeqs                     :              .       .       .  .      ACAACAATGC                                       .    .                . C           .     . .      A                 .      .     . .             
blockSeqs                     :              .       .       .  .      ACAGTAGTGC                                       .    .                . T           .     . .      A                 .      .     .               
blockSeqs                     :              .       .       .  .      ACAATAATGC                                       .    .                . T           .     . .      A                 .      .                     
blockSeqs                     :              .       .       .  .      TATTATATA                                        .    .                . T           .     . .      A                                              
blockSeqs                     :              .       .       .  .      CCAAAATTG                                        .    .                . T           .     . .      C                                              
blockSeqs                     :              .       .       .  .      CAAAACTG                                         .    .                . A           .     . .      C                                              
blockSeqs                     :              .       .       .  .      TATTCA                                           .    .                . C           .     . .                                                     
blockSeqs                     :                                        A                                                .    .                . A           .     . .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                         .    .                . T           .     . .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                               . T           .                                                             


blockSeqCons                  :                                                                                                                                            TA***********
originalCons                  : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TA---T----A----C-A-A----C-------A-A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T-T-C-T---G-A-----AAAAC------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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Alignments
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lowQualScore                  :     11 0 0   1 00 0  11111   11 222    1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1111 4444444 0    0 1 22  00  0 0 2222  1 00 22222222  33333333 00 0  0 222222 111 1 0 1 555555555555 0  0 0       
lowQualScore                  :     .. . .   . .. .  .....   .. ...    .................................................... .... .... ....... .    . . ..  ..  . . ....  . .. ........  ........ .. .  . ...... ... . . . ............ .  . .       
lowQualScore                  :     11 6 6   1 88 6  44444   99 666    2222222222222222222222222222222222222222222222222222 7777 2222 0000000 6    5 1 66  88  5 5 8888  7 88 66666666  99999999 88 6  6 999999 666 8 6 2 222222222222 6  6 6       
consensus                     : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
Reference ( family-318 )      : TTGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81015                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---CATGTATGATG-T-T----A---T----AA---C-A-A----ATTTGA-------A-AAGG-A-TT-GG--AC-A-C----AC-G--T--------TT-T----T-G--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-TC-C-TCTCCTA
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gi|81019                      : TTGA--T-T-GAA-C--AATA-----TTT--C---ATTG-T------C--AAGATT--------A-T-T----A---T----A------A-A----C----A-------A-AAGA-T-TT-GG--GC-AACG---AA-G--T--------TC-T------A--A-AA-C------T---TAA-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCTA
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gi|81031                      : TTGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---GTTG-TATATAAT--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-ATA----C----A-------A-AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T--------TC-T----T-A--C-AA-C------T---T-G-G-G-----A-G----G-TT-T-TCACCTA
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gi|81042                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-TATAAA---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----G-A--A-AATC------T---T-G-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
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gi|81045                      :  TGA-TT-T-GAA-G--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--A---AG--------A-T-G----T---T----A----C-AGA----C----A-------A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-T----AA-G--T--------TC-T----T-A--A-AA-G------T---T-A-G-A-----A-C----G-TC-C-TTTCC
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gi|81047                      :  TGA-ATAT-GAA-C--A-TA-----TTT--T---AATG-A------C--ACCGTA--------A-T----------------------G-A----C----C-------A-AAAG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--TA-------TC-A----C-ACCA-AA-C------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-T-TCCCA
gi|81048                      :  TGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TA-----T--A---TA--------A-A-T----A---C----A----T-ATA----C----A-------A-AAGG-T-TT-GA--ACAA-C----AA-G--T--------TC-T----T-A--C-AA-C------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACCTA
gi|81049                      :  TGA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TT----------G-----------A---CA--------G-T-A----G---T----G----C--------C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC------A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-T
gi|81050                      :  TGA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TACA---T--G---TAG-------A-T-T----A---T----A----T-G-A----C----ATATAGA-A-AAGG-T-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----A-A--
gi|81051                      :   GA-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTA-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----T----C-A-A----G----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AT-G--T--------TC-TG---A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----C-C----G-CC-C-
gi|81052                      :   GA-TT-T-GAA-C--A-TA-----TCT--T---ATTG-T------C--C---AG--------A-T-G----T---T----A----T-A-A----C----A-------A-AGGG-A-TT-GG--AA-A-C----AA-G--TTACCGGTATC-T------A--A-AA-T------T---T-A-C-A-----A-C----G-TC-C-T
gi|81053                      :    A-AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-TGA--A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81054                      :     -AT-T-GAA-C--A-TA-----TTT--TTTTATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-TG---A-A--A-AA-C------T---T-A-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81055                      :     -AT-T-GAA-C--A-TT-----TTT--TTT-ATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----C-A-A----C----A-------A-AAGG-A-TC-GG--GC-A-C----AA-GTTT--------TC-T----G-A--A-AA-C------T---TCA-G-AATTTTA-C----G-CC-C-TCTCC
gi|81056                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------T--A---TG--------A-T-G----T---T----A----T-A-A----A----G-------A-AAAG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----T-G--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CT-C-TCTCCTA
gi|81057                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-----------A---CA--------A-T-A----A---T----G----C--------C----A-------A-AAGG-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC------A-T--A-AA-C------T---T-A-G-A-----T-T----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81058                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TGT--T----TT--T------T--G---TA--------G-T-T----A---A----A----A-T-A----C----A-------A----G-A-CC-GT--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----A-A--A-AA-CT-----T---T-A-A-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCC
gi|81059                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TCT--T---ATTG-TACA---T--A---TA--------T-T-T----T---T----A----C-A-A----T----------------GG-ATTC-GA--GC-A-C----AACG--T--------TC-T----G-A--A-AA-C------T---T-A-G-G-----ATT----G-CT-C-TCTCCC
gi|81060                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTA-CA-----T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----T---A----C----A-------A-AAGG-T-TT-GG--AC-A-C----AA-G--T--------TC-T----T-A--C-AA-C------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACCTA
gi|81061                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TATA---T--A---TA--------A-T------A---T----A----C-A-A-------------------AAGG-T-TT-GA--AC-A-C----AA-G--T--------TC-T----G-A--C-AA-C------T---T-A-C-G-----A-G----G-TT-C-TCACC
gi|81062                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-TA-----T--A---TA--------A---T----A---T----A----T---A----C----A-------A-AAGG-A-TT-AG--AA-A-C----AA-G--T--------TC-
gi|81063                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------C--A---AA--------A-T-T----G-----------------A----C----A-------A-AAGG-A-TT-GG--AT-A-C----AA-C--T--------TC-C------A--A-AA-C------T---T-A-T-A-----A-
gi|81064                      :       T-T-GAA-T--G-TA-----TTT--T---ATTG-T------C--AA--TA--------AAC-T----G--------A----A-G-A----C----T-------A-AAGG-A-TA-GG--GC-G-C----AA-G--T--------TC-T----T-T--A-AA-C------C---T-A-G-A-----G-C----G-TCAC-TCCCC
gi|81065                      :       T-T-GAA-C--A-TA-----TTT--T---ATTG-C------CCAA---AA--------A-C-C----T---G----A----C-A-A----A----A-------A-AAGG-A-TTTGG--AT-A-C----AA-G--T--------TC-C------A--A-AA-C------T---T-T-G-ATT---A------A-CC-C-TCTC
gi|81066                      :            AA-T--A-AA-----TTT--T---ATTG-T------T--A---TA--------A-T-T----A---T----A----T-A-A----T----A-------A-AGGA-A-TC-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-TGA--A-A--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA
gi|81067                      :                                      TG-T------T--G---TA--------A-T-T----T---T----AAAAAT-A-A----C----A-------A-CTGG-A-TA-GG--GC-G-C----AA-G--T--------TC-T----A-A--A-AA-C------T---T-C-T-A-----C-C----G-CC-C--CTCC
gi|81068                      :                                                                                         -A-A----C----G-------A-AAGG-A-TT-AG--GC-A-C----AC-G--T--------TC-T----T-G--A-AA-C------C---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCTA
gi|81069                      :                                                                                                             atgttgt-A-TT-GG--GC-A-C----AA-G--T--------TC-T----ATA--A-AA-C------T---T-A-G-A-----A-C----G-CC-C-TCTCCCA