lowQualScore                  :                                                                                                     1111111                                   222                                           
lowQualScore                  :    0  0 11  00 0 1  0 0 0  0  0  0   1 0   3333333333   00 11 22  1 1111111 111 3333 111111 1   00  6666666 22 3333  111  22 0 2222  6 00 333 222 2  00 1111 00  00   00 1 0  11 11  0 1    
lowQualScore                  :    .  . ..  .. . .  . . .  .  .  .   . .   ..........   .. .. ..  . ....... ... .... ...... .   ..  ....... .. ....  ...  .. . ....  . .. ... ... .  .. .... ..  ..   .. . .  .. ..  . .    
lowQualScore                  :    7  7 66  99 6 2  6 6 6  6  6  6   7 6   0000000000   88 33 11  1 8888888 555 2222 666666 1   88  2222222 00 8888  666  00 6 6666  4 88 000 555 5  99 3333 99  99   99 3 7  00 00  7 5    
consensus                     : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
Reference ( gi|73549 )        : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----A--T--G----TG---CA--C-C----TCTT--A---T-CGT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73555                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TG-C-------AC--T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCTT--A---T-TGT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TA--A--AT-
gi|73548                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----A------A-TGC--CA----T--T--G----TA---CA--C-C----TCCT--A---T-TCT-AA--A----T--TT--AGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73547                      : AGA-AT-T--AT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--T-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGC--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73550                      : AGA-AT-T--TT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--TA-C-------A---C----G------A-TGC--TG----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73554                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---TTCA-G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C-------T--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73553                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--GT-T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-T-T-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AC-A-ATTT
gi|73551                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TGT--TG--C-C----ACCT--A---T-TTT-AA--A----G--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73552                      : AAA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-A----TCCT--A---T-TTT-GA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-AT
gi|73556                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-T--CA-GGG-A-TTT----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--TA----T--G--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----G--TT--TAA--T-C-TG--A--AT-G-GTTT
gi|73557                      : AGA-AT-T--CT--A-T-AG-A-A-CT-TT-CA-GGG-G-TTC----------TTT--G--C--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---TA--C-C----TTCT--G---T-TTT-AA--A----T--TT--TGC--T-C-TG--A--AT-A-ATTT
gi|73558                      : AGA-AT-T--TT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--C--TC-C-------G---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TGCT--A---T-TTT-AC--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-
gi|73567                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GT-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------CTT--G--T--TA-C-------T---T----G------A-TACCACA----A--T--G----CG---CA--C-C----TTCT--A---T-TTT-AA--G----T--TT--TGA--T-T-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73570                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TA---CA--C-C----TA----A---T------A--A----T--TT--TCA--G-C-TG--A--GT-G-ATTT
gi|73569                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--AT----T--T--G----TG---CA--C-C----TC--------C-CAT-A------------T--TAA--C-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73559                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGGCA-TTC----------TTT--G--TA-TA-C-------A---TTTG-G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA----C----TC-T--A---C-TTT-GA--A----T--TT--TGG--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73562                      : AAA-AT-T--CT--A-T-AA-A-A-CC-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----A------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TTCT--A---T-TTC-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TC--T--TT-G-ATTT
gi|73560                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TC-CA-GGG-A-CTC----------TTG--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TAC--CG----T--T--T----TG---CA--T-T----TCCT--A---T-TCT-AA--G----T--TT--TGA--T-C-TG-----AT-G-ATTT
gi|73563                      : AGA-AG-T--CA--A-T-GA-A-A-CA-TT-CG-GGG-A-TTC----------TAT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---AA--C-C----TCCT--AT--T-CTT-----A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--TT-G-ATTT
gi|73579                      : AGA-GA-T--CT--A-T-GA-A-A-AT-TT-CA-GG--A-TTC----------TTTTTG--T--TA-C-------A---T----G------AGGGC--TA----AT-T--G----TG---CA--C-C----TC-T--A---T-T-C-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73561                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-AA-GCG-A-TTC----------TTT--G--TAATA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--GTGCATG---CA--C-C----TTCT--A---T-TTT-GA--A----T--TA--TGA--T-C-TG--A--TT-A-ATTT
gi|73571                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-ATA----------TTT--G--G--TA-C-------A---T----T------G-TGC--CA----T--T--G----TA---CA--C-C-----CCT--A---C-TTT-AA--A----T--CT--TCA--T-C-TG--G--AA-G-ATTT
gi|73574                      : AGA-GT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GG--A-TTC----------ATT--G--T--TA-T-------A---T----G------A-TGT---A----A--TTTG----TG---AA--T-C----TCCT--A---T-TTT-AG--A----T--TT--TGA--T-C-GG--A--AT-G-ATTT
gi|73564                      : AGA-AT-T--CG--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--G--T--TA-C-------A---T----T------A-TGC--CA----T--T--A----TG---CA--C-C----TCCT--A---
gi|73573                      : AGAGAT-T--GT--A-G-GA-A-A-CT-TT-CA-GCA-A-TTA----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------C-TGT--CA----T--TT-G----TG---CA--C-G----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--AT--CGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTTatttt
gi|73576                      : AGT-AT-T--CT--G-T-AA-A-A-CT-TT-CA-GGA----------------TTT--A--T--TA-C-------T---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--C---T-TTTAAA--A----T--TT--TGA--T-T-TG--A--AT-G-CTTT
gi|73577                      : AAA-AT-T--CT--A-T-GA-C-A-CT-TT-CA-AGG-A-TT---------------------------------------------------TGC--CA----T--T--A----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TC--A--AT-G-ATTT
gi|73575                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-TT-TT-CA-GAG-A-TTC----------TTT--G--T--CA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----
gi|73583                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GATG-A-C--TT-CA-AGG-G-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----T------A-TGT--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-T-T-GA--ATGATT--TT--TGA--tt
gi|73584                      : AGA-AT-T--CTTTA-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TT-----------TTT--G--A--TA-C-------A---T----G-------------------------G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTC-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TC--A--CT-GAATTTgattt
gi|73581                      : AGA-AT-T--CA--A-T-AA-C-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----A------A-TGC--CA----T--T--G----TG---AG--C-C----CTCT--A---T-TTT-AA--A----T--
gi|73580                      : AGA-AT-T--CT--T-T-GA-A-A-CT-TTCCA-GTG-A-T------------CTT--G--T--TA-C-------A---T-----------A-TAC--CA----T--T--GA---TG---CA--C-C----TCTT--AAT-T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--TAC-T------AT-G-AGTT
gi|73587                      : AGA-AT-T--GT--G-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--AA-G-------G---T----T------A-TGC--CA----T--T--T----TG---CA--C-CTTCATCTT--A---T-TGT-
gi|73565                      : AGA-AT-TAATT--A-T------A-CT-TT-CA-AGG-A-TTA----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TAC--CA----T--T--T----TG---CA--C-C----TATT--T---T---------A----T--TT--AAA--T-T-TG--A--AT-G-ATTttatcccaatg
gi|73586                      : AAA-AT-T--CT--G-C-GA-A-A-TT-TG-CA-GGTTA-TTC----------GTT--G--T--TA-C-------A---C----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CAAGC-C----TTCT--A---T-TTT-AG--T----A--TT--TGA--T-T-TG--A--A--G-AT
gi|73582                      : AGA-AT-C--CT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGA-C-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CT----A--T--T----T----CA-------------------------AA--A----T--TT--TGA--T-A-TC--A--TT-G-AT
gi|73589                      : AGA-AT-T--CG--AAT-GA-A-A-CT-TT-CA-AGG-ATTTT----------TTT--T--T--TA-C-------A---C----A------A-TGC--C-----A--T--T----TG---CG--C---------T--A---T-TAT-GA--A----TTATT--TGA--T-TGCG--A--AT-G-ATTT
gi|73590                      : AGA-AT----CT--A-T-GA-A-A-AT-T--CA-GG--A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------T---T----G------A-TGC--TA----T--T--G----TT---CA--C-G----TCTT--G---T-
gi|73572                      : AGA-CT-T--C---A-TCAA-A-A-CT-TT-AA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---G----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---AA--T-T----TCCT--A---T-TTG-AATGA----T--TT--TG
gi|73593                      : AGA-AT-T--CT--A-T-TA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-
gi|73591                      : AGA-AT-T--CA--A-T-TA-A-A----TT-CC-GGG-A-TTCC---------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TAC--TATACCA--T--GT---TG---CAT-T-C----GCCT--A---T--GTAAA--A----T--GT--TGA--T---TG--A--GT-G-ATTT
gi|73588                      : AGA-AT-TT-CT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA--GT-A-TTC----------TTT--G--T--TACC-------A---T-----------A-TTC--------A--T--T----TG---TAT-C-T----TCCT--AT--T-TTT-AG--A----T--TT--TGA--T-C-TG-----AT-G-
gi|73585                      : AGA-AT-T--TC--A-T-GA-A-A-TT-CT-TA-AGG-A-TTC-----------TT--A--T--TA-C-------A---T-----------A-TAC--TA----T--T--T----TG---CA--C-CAT--CCTT--A---T-T-T-AA--A--------G--TGA--T-C-TG--A--
gi|73568                      : AAA-AT-T--AT--A-A-GA-A-A-CT----CG-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--GA-T-------A---T----G------A-TAC--CC----T--T--G----TG---CA--C-----------------------A--A----T--TT--TTA--T-C-TG--G--AT-GAATTT
gi|73566                      : AGA-AT-T--CT----T-GA-A-A-CT-T--CA-------------------------------TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TGCATCA--C-C----ACT-------T-TAA-AA--A----T--TT--T-A--T-C-TG--A--AT-G-AATT
gi|73592                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-ATA-CT-TT-CA-GTA-A-TCT----------TAT--G--T---A-T-------A---T----G------G-TGA--CG----GGTT--G----TG---CA--C-C----GTTT--A---T-TTG-AA--A----T--TT--TAC--T-C-T
gi|73578                      : AGA-AG-T--CT----T-GA-A-G-TT-TT-GA-AAG-A-A-C----------TTT--GAGT--TA-C-------A---T----G------AATGC--CA----T--T--AC---TG----A--C-C----TCCT--A---T-TTTTCC--A----T--TT--TGA--T-T-TG--A--AT-A-AATT
gi|73594                      :  GA-AT-T--CT--A-A-AA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTC----------TTT--G--T--TA-CCTGGGCAG---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-T----TCTT--A---A-TTT-AT--G----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73595                      :  GA-AG-T--CT------GA-A-A-CT-TT-CA-CG--A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---A----G------A-TAC--CA----T--A--G----TG---CA--C-T----TCCT--A---C-TTC-AG--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-T-ATTT
gi|73598                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTT----------TTT--T--T--TA-G-------A---T----G------A-TGC--CA----A--T--G----CG---CA--A-C----TCCT--G---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--G-G-TA--A--AT-G-
gi|73599                      :   A-AT-A--TT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--TA-C-------A---TGATCG------A-TGG--CA----C--T--G----TG---CA--C-C----TCTT--G---T-CTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TC--ATCAT-G-AGTT
gi|73602                      :   A-ATGT--CT--A-T-CA-A-A-CTGTT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-T-------ATTGT----G------A-TGC--CG----AT-T--GGT--TG---CC--C-C----TCGT--A---G-CTT-AA--A----T--TT--TGA--TAC-TG--A--A--G-ATT
gi|73597                      :   A-AT-T--CT--A-C-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTA----------TTT--G--T--TA-C-------G---T----A------A-TGC--TA----T--T--G----TG---CA--A-C----TC
gi|73603                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A--T-TT-CA-GGG-A-GTT----------CTT--G--C--TA-C-------A---T----G------G-TGT--CA----T--T--G----TG---CA--CGC----TCTT--A---
gi|73600                      :   A-AA-T--CC--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GAG-A-TGA----------TAT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGA--CA----T--T--G----TG---CT--C-C----TATT------T-CAT-----A----T--TT--TGA--T-C-TC--A--TT-G-ATTT
gi|73601                      :   A-AT-T--CT--C-T------A-CT-TC-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------T---T----G------A-TGC--CA----T--TA-G----TG---CA--C-C------------------T-AA--A----T--TT--TAA--G-C-T
gi|73596                      :   A-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--TAATA-C-------A---T----G------A-Tttga
gi|73604                      :   A-AT-T--CT--A-TTGA-A-AGCT-TT-CA-GGA-A-TTCAGGATTTCTCTTT--G--T--TA-C-------C---T----G------A-TGC--C-----C--T--G----TG----A--G-C----TCCT--A---TACTT-AA--A----T--atgatccatt
gi|73605                      :    -AT-T--TT--C-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--A--T--TA-G-------A---T----G------T-TGT--CA----T--T--A----TG---CA--A-C----TCCT--T---T-TTTAAA--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73606                      :      T-T--GT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-----------T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TT--A--TT-G-ATTT
gi|73607                      :      T-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-CA-GGG-A-ATC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--A-C----CCTT--ATTTT-CG-----------C--TT--TGC--T-C-TA--A--AT-G-ATTT
gi|73608                      :      T-T--TT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CT-GAGTA-TTC----------CTT--G--T--TT-C-------A---G----T------A-TGC--CG----A--T--T----TG---CA--C-CT---TCAT--A---T-T-T-CA--A----T--TTTATGA--T-C-
gi|73609                      :            T--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-A-C----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--T-C---------------------------------T--TGA--T-C-CG--A--AT-G-ATTT
gi|73610                      :             --A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TTA----------TTT--C--G--TA-C-------A---T----G------A-TGG--TA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCTAAA---T-C---AA--T----T--TT--TGATCT-C-TGACA--AT-G-ATT
gi|73611                      :                -T-GA-A-A-CT-CT-TACGGA-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-----------T----G------A-TGC---A----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---A-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-C-TT--A--TTAG-ATTT
gi|73613                      :                -T-GA-A-T-CT-TC-TA-TGA-A-TTC----------TTT--G--T--TTTC-------A---C----G------A-TGT--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT----------T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT
gi|73612                      :                -T-GA-A-G-TT-TT-GA-AGA-A-ATC----------TTT--G--T--TG-C-------A---T----G------A-TAC--TA----T--A--A----TC---CA--C-C----TCCT--G---T---T-AA--A----T--TT--TGA--T-T-TG--A--AT-A-
gi|73614                      :                    A-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TT------------------------T----A------A-TGC--TA----T--T--G----TG---TT--C-C----TCCT--A---T-TTT-GA--T----A--TT--TAA--T-A-AG--A--TC-G-ATTT
gi|73615                      :                         -CT-TT-AA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TA-C-------A---T----G------A-TGT--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--G----T--TT--TGT--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73616                      :                            -TT-TA-GAG-G-CTT----------TTT--G--T--TA-C-------A---A----G------A-TGT--CA----T--T--G----CG---CA--C-C----TCAT--A---T-TTT-AT--A----T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73617                      :                                 A-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TG-C-------G---T----GTATATTA-TAC--AA----T--T--G----TG---AA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A--------T--TGA--T-A-TG--G--AC-G-ATTT
gi|73618                      :                                            ----------TTT--G--T--TG-C-------A---T----G------A-TGC--CA----T--T--G----TG---CA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA--A----T--TT--TGA--T-A-TG--A--TT-G-GTTT
gi|73619                      :                                                                   -C-------A---G----G------A-TGC---A----T--T--G----TG---TA--C-C----TCCT--A---T-TTT-AA-------T--TT--TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT





Alignments
lowQualScore                  :    0  0 11  00 0 1  0 0 0  0  0  0   1 0   3333333333   00 00 22 0 1 1111111 111 3333 111111 0  1111  11 00 1111 1 22  0  3333 0 0   0 0 22 0 0  22  11  00 0 0   00 1 0  00 00  0 1    
lowQualScore                  :    .  . ..  .. . .  . . .  .  .  .   . .   ..........   .. .. .. . . ....... ... .... ...... .  ....  .. .. .... . ..  .  .... . .   . . .. . .  ..  ..  .. . .   .. . .  .. ..  . .    
lowQualScore                  :    7  6 55  99 6 2  6 6 6  6  6  6   7 6   0000000000   88 88 11 6 1 8888888 555 1111 666666 6  2222  99 88 9999 7 55  6  1111 6 6   6 6 00 6 6  66  77  88 6 6   99 3 6  99 99  7 4    
consensus                     : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
Reference ( family-317 )      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73547                      : AGA-AT-T--AT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73548                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-CT--AA--AT--T-T-AGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73549                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-C-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73550                      : AGA-AT-T--TT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CT--G--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73551                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TGTTG----C-C-ACC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73552                      : AAA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-A-TCC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-AT
gi|73553                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TTA-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A----T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AC-A-ATTT
gi|73554                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---TTCA-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73555                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------AC--T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-T-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TA--A--AT-
gi|73556                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-T--CA-GGG-A-TTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CT--A--T----G-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TAA--T-C-TG--A--AT-G-GTTT
gi|73557                      : AGA-AT-T--CT--A-T-AG-A-A-CT-TT-CA-GGG-G-TTC----------TTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-TA----C-C-TTC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-A-ATTT
gi|73558                      : AGA-AT-T--TT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--C--T-C-C-------G---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TGC-T-A--T-T-TT--AC--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-
gi|73559                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGGCA-TTC----------TTT--G--TA-T-A-C-------A---TTTG-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C----TC-T-A--C-T-TT--GA--AT--T-T-TGG--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73560                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TC-CA-GGG-A-CTC----------TTG--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--G--T----T-T--TG-CA----T-T-TCC-T-A--T-T-CT--AA--GT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-ATTT
gi|73561                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-AA-GCG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CATGCAC-C-TTC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-A-TGA--T-C-TG--A--TT-A-ATTT
gi|73562                      : AAA-AT-T--CT--A-T-AA-A-A-CC-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--T--TT-G-ATTT
gi|73563                      : AGA-AG-T--CA--A-T-GA-A-A-CA-TT-CG-GGG-A-TTC----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-TCTT------AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--TT-G-ATTT
gi|73564                      : AGA-AT-T--CG--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-TAA--T-T-TT--
gi|73565                      : AGA-AT-TAATT--A-T------A-CT-TT-CA-AGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--A--T----T-T--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT------AT--T-T-AAA--T-T-TG--A--AT-G-ATT
gi|73566                      : AGA-AT-T--CT----T-GA-A-A-CT-T--CA-------------------------------T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-ACC---A--C-T-TTAAAA--AT--T-T-T-A--T-C-TG--A--AT-G-AATT
gi|73567                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GT-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------CTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TA----CC--A--CAA--T-G--CG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73568                      : AAA-AT-T--AT--A-A-GA-A-A-CT----CG-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--G-A-T-------A---T----G------A-TA----CC--C--T----T-G--TG-CA----C---------------------A--AT--T-T-TTA--T-C-TG--G--AT-GAATTT
gi|73569                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CA--T--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-C-A--T-A-TT--A-------------A--C-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73570                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TA----A--T--------A--AT--T-T-TCA--G-C-TG--A--GT-G-ATTT
gi|73571                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-ATA----------TTT--G--G--T-A-C-------A---T----T------G-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C--CC-T-A--C-T-TT--AA--AT--C-T-TCA--T-C-TG--G--AA-G-ATTT
gi|73572                      : AGA-CT-T--C---A-TCAA-A-A-CT-TT-AA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---G----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----T-T-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-TG
gi|73573                      : AGAGAT-T--GT--A-G-GA-A-A-CT-TT-CA-GCA-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------C-TG----TC--A--T----TTG--TG-CA----C-G-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--A-T-CGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73574                      : AGA-GT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GG--A-TTC----------ATT--G--T--T-A-T-------A---T----G------A-TG----TA--A--T----TTG--TG-AA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-GG--A--AT-G-ATTT
gi|73575                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-TT-TT-CA-GAG-A-TTC----------TTT--G--T--C-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-
gi|73576                      : AGT-AT-T--CT--G-T-AA-A-A-CT-TT-CA-GGA----------------TTT--A--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-C--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-CTTT
gi|73577                      : AAA-AT-T--CT--A-T-GA-C-A-CT-TT-CA-AGG-A-TT----------------------------------------------------TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--AT-G-ATTT
gi|73578                      : AGA-AG-T--CT----T-GA-A-G-TT-TT-GA-AAG-A-A-C----------TTT--GAGT--T-A-C-------A---T----G------AATG----CC--A--T----T-AC-TG--A----C-C-TCC-T-AT-T-T-TT--CC--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-AATT
gi|73579                      : AGA-GA-T--CT--A-T-GA-A-A-AT-TT-CA-GG--A-TTC----------TTTTTG--T--T-A-C-------A---T----G------A-GG----GCTAA--T----T-G--TG-CA----C-C-T-C-T-A----T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73580                      : AGA-AT-T--CT--T-T-GA-A-A-CT-TTCCA-GTG-A-T------------CTT--G--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CC--A--T----T-GA-TG-CA----C-C-TCT-T-AATT-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-T------AT-G-AGTT
gi|73581                      : AGA-AT-T--CA--A-T-AA-C-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AG----C-C-CTC-T-A--T-T-TT--AA--AT--
gi|73582                      : AGA-AT-C--CT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGA-C-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG-----------------------------------CC-T-A--T-T-TCA-AA--AT--T-T-TGA--T-A-TC--A--TT-G-AT
gi|73583                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GATG-A-C--TT-CA-AGG-G-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-T--------TG--A-----G-ATTT
gi|73584                      : AGA-AT-T--CTTTA-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TT-----------TTT--G--A--T-A-C-------A---T----G----------------------------G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--CT-GAATTT
gi|73585                      : AGA-AT-T--TC--A-T-GA-A-A-TT-CT-TA-AGG-A-TTC-----------TT--A--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CT--A--T----T-T--TG-CA----C-CATCC-T-T--A-T-TT--AA--A-----G-TGA--T-C-TG--A--
gi|73586                      : AAA-AT-T--CT--G-C-GA-A-A-TT-TG-CA-GGTTA-TTC----------GTT--G--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CAAG--C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AG--TA--T-T-TGA--T-T-TG--A--A--G-AT
gi|73587                      : AGA-AT-T--GT--G-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--A-A-G-------G---T----T------A-TG----CC--A--T----T-T--TG-CA----C-C-TTC---A--T-C-TT------AT--TGT-TTA--T-C-CC--A--AT-G-
gi|73588                      : AGA-AT-TT-CT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GT--A-TTC----------TTT--G--T--T-ACC-------A---T-----------A-T-----TC--A--T----T----TG-TAT---C-T-TCC-T-AT-T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-
gi|73589                      : AGA-AT-T--CG--AAT-GA-A-A-CT-TT-CA-AGG-ATTTT----------TTT--T--T--T-A-C-------A---C----A------A-TG----CC--A--T----T----TG-CG----------C-T-A--T-T-AT--GA--ATTAT-T-TGA--T-TGCG--A--AT-G-ATTT
gi|73590                      : AGA-AT----CT--A-T-GA-A-A-AT-T--CA-GG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CT--A--T----T-G--TT-CA----C-G-TCT-T-G--T-
gi|73591                      : AGA-AT-T--CA--A-T-TA-A-A----TT-CC-GGG-A-TTCC---------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--TACCAT-GT-TG-CAT---T-C-GCC-T-A--T-G-TA--AA--AT--G-T-TGA--T---TG--A--GT-G-ATTT
gi|73592                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-ATA-CT-TT-CA-GTA-A-TCT----------TAT--G--T----A-T-------A---T----G------G-TG----AC--GGGT----T-G--TG-CA----C-C-GTT-T-A--T-T-TG--AA--AT--T-T-TAC--T-C-T
gi|73593                      : AGA-AT-T--CT--A-T-TA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-
gi|73594                      :  GA-AT-T--CT--A-A-AA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTC----------TTT--G--T--T-A-CCTGGGCAG---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-T-TCT-T-A--A-T-TT--AT--GT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73595                      :  GA-AG-T--CT------GA-A-A-CT-TT-CA-CG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TA----CC--A--T----A-G--TG-CA----C-T-TCC-T-A--C-T-TC--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-T-ATTT
gi|73596                      :   A-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TATGATCC--A--T----T-
gi|73597                      :   A-AT-T--CT--A-C-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTA----------TTT--G--T--T-A-C-------G---T----A------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-CA----A-C-TC
gi|73598                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTT----------TTT--T--T--T-A-G-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--CG-CA----A-C-TCC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--G-G-TA--A--AT-G-
gi|73599                      :   A-AT-A--TT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---TGATCG------A-TG----GC--A--C----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-G--T-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--ATCAT-G-AGTT
gi|73600                      :   A-AA-T--CC--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GAG-A-TGA----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----AC--A--T----T-G--TG---------C-TCC-T-A--T-T-TC--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--TT-G-ATTT
gi|73601                      :   A-AT-T--CT--C-T------A-CT-TC-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----TAG--TG-CA----C-C-TAA---A--T-T-TT--AA--GC--T-T-TGA--
gi|73602                      :   A-ATGT--CT--A-T-CA-A-A-CTGTT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-T-------ATTGT----G------A-TG----CCG-A--T----T-GGTTG-CC----C-C-TCG-T-A--G-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-TG--A--A--G-ATT
gi|73603                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A--T-TT-CA-GGG-A-GTT----------CTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------G-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----CGC-TCT-T-A--
gi|73604                      :   A-AT-T--CT--A-TTGA-A-AGCT-TT-CA-GGA-A-TTCAGGATTTCTCTTT--G--T--T-A-C-------C---T----G------A-TG----CC-----C----T-G--TG--A----G-C-TCC-T-A--TAC-TT--AA--AT--
gi|73605                      :    -AT-T--TT--C-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--A--T--T-A-G-------A---T----G------T-TG----TC--A--T----T-A--TG-CA----A-C-TCC-T-T--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73606                      :      T-T--GT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TT-G-ATTT
gi|73607                      :      T-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-CA-GGG-A-ATC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----A-C-CCT-T-A--T-T-TT---C--GC--T-T-TGC--T-C-TA--A--AT-G-ATTT
gi|73608                      :      T-T--TT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CT-GAGTA-TTC----------CTT--G--T--T-T-C-------A---G----T------A-TG----CCG-A--T----T----TG-CA----C-C-TTCAT-A--T-T-TC--AA--TT--T-TATGA--T-C-
gi|73609                      :            T--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-A-C----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C----------------------------T-TGA--T-C-CG--A--AT-G-ATTT
gi|73610                      :             --A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TTA----------TTT--C--G--T-A-C-------A---T----G------A-TG----GT--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-A-TC--AA--TT--T-T-TGATCT-C-TGACA--AT-G-ATT
gi|73611                      :                -T-GA-A-A-CT-CT-TACGGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TTAG-ATTT
gi|73612                      :                -T-GA-A-G-TT-TT-GA-AGA-A-ATC----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--T----A-A--TC-CA----C-C-TCC-T-G------TT--AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-
gi|73613                      :                -T-GA-A-T-CT-TC-TA-TGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-TTC-------A---C----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT-------T--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT
gi|73614                      :                    A-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A---------------------------------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-TT----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--GA--TA--T-T-TAA--T-A-AG--A--TC-G-ATTT
gi|73615                      :                         -CT-TT-AA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGT--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73616                      :                            -TT-TA-GAG-G-CTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TG----TC--A--T----T-G--CG-CA----C-C-TCA-T-A--T-T-TT--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73617                      :                                 A-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------G---T----GTATATTA-TA----CA--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--A-----T-TGA--T-A-TG--G--AC-G-ATTT
gi|73618                      :                                            ----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-A-TG--A--TT-G-GTTT
gi|73619                      :                                                                    -C-------A---G----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-TA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT---A--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT





Alignments
lowQualScore                  :    0  0 11  00 0 1  0 0 0  0  0  0   1 0   3333333333   00 00 22 0 1 1111111 111 3333 111111 0  1111  11 00 1111 1 22  0  3333 0 0   0 0 22 0 0  22  11  00 0 0   00 1 0  00 00  0 1    
lowQualScore                  :    .  . ..  .. . .  . . .  .  .  .   . .   ..........   .. .. .. . . ....... ... .... ...... .  ....  .. .. .... . ..  .  .... . .   . . .. . .  ..  ..  .. . .   .. . .  .. ..  . .    
lowQualScore                  :    7  6 55  99 6 2  6 6 6  6  6  6   7 6   0000000000   88 88 11 6 1 8888888 555 1111 666666 6  2222  99 88 9999 7 55  6  1111 6 6   6 6 00 6 6  66  77  88 6 6   99 3 6  99 99  7 4    
consensus                     : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
Reference ( family-317 )      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73547                      : AGA-AT-T--AT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73548                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-CT--AA--AT--T-T-AGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73549                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-C-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73550                      : AGA-AT-T--TT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CT--G--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73551                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TGTTG----C-C-ACC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73552                      : AAA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-A-TCC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-AT
gi|73553                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TTA-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A----T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AC-A-ATTT
gi|73554                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---TTCA-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73555                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------AC--T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-T-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TA--A--AT-
gi|73556                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-T--CA-GGG-A-TTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CT--A--T----G-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TAA--T-C-TG--A--AT-G-GTTT
gi|73557                      : AGA-AT-T--CT--A-T-AG-A-A-CT-TT-CA-GGG-G-TTC----------TTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-TA----C-C-TTC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-A-ATTT
gi|73558                      : AGA-AT-T--TT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--C--T-C-C-------G---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TGC-T-A--T-T-TT--AC--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-
gi|73559                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGGCA-TTC----------TTT--G--TA-T-A-C-------A---TTTG-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C----TC-T-A--C-T-TT--GA--AT--T-T-TGG--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73560                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TC-CA-GGG-A-CTC----------TTG--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--G--T----T-T--TG-CA----T-T-TCC-T-A--T-T-CT--AA--GT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-ATTT
gi|73561                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-AA-GCG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CATGCAC-C-TTC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-A-TGA--T-C-TG--A--TT-A-ATTT
gi|73562                      : AAA-AT-T--CT--A-T-AA-A-A-CC-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--T--TT-G-ATTT
gi|73563                      : AGA-AG-T--CA--A-T-GA-A-A-CA-TT-CG-GGG-A-TTC----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-TCTT------AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--TT-G-ATTT
gi|73564                      : AGA-AT-T--CG--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-TAA--T-T-TT--
gi|73565                      : AGA-AT-TAATT--A-T------A-CT-TT-CA-AGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--A--T----T-T--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT------AT--T-T-AAA--T-T-TG--A--AT-G-ATT
gi|73566                      : AGA-AT-T--CT----T-GA-A-A-CT-T--CA-------------------------------T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-ACC---A--C-T-TTAAAA--AT--T-T-T-A--T-C-TG--A--AT-G-AATT
gi|73567                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GT-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------CTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TA----CC--A--CAA--T-G--CG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73568                      : AAA-AT-T--AT--A-A-GA-A-A-CT----CG-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--G-A-T-------A---T----G------A-TA----CC--C--T----T-G--TG-CA----C---------------------A--AT--T-T-TTA--T-C-TG--G--AT-GAATTT
gi|73569                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CA--T--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-C-A--T-A-TT--A-------------A--C-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73570                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TA----A--T--------A--AT--T-T-TCA--G-C-TG--A--GT-G-ATTT
gi|73571                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-ATA----------TTT--G--G--T-A-C-------A---T----T------G-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C--CC-T-A--C-T-TT--AA--AT--C-T-TCA--T-C-TG--G--AA-G-ATTT
gi|73572                      : AGA-CT-T--C---A-TCAA-A-A-CT-TT-AA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---G----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----T-T-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-TG
gi|73573                      : AGAGAT-T--GT--A-G-GA-A-A-CT-TT-CA-GCA-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------C-TG----TC--A--T----TTG--TG-CA----C-G-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--A-T-CGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73574                      : AGA-GT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GG--A-TTC----------ATT--G--T--T-A-T-------A---T----G------A-TG----TA--A--T----TTG--TG-AA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-GG--A--AT-G-ATTT
gi|73575                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-TT-TT-CA-GAG-A-TTC----------TTT--G--T--C-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-
gi|73576                      : AGT-AT-T--CT--G-T-AA-A-A-CT-TT-CA-GGA----------------TTT--A--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-C--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-CTTT
gi|73577                      : AAA-AT-T--CT--A-T-GA-C-A-CT-TT-CA-AGG-A-TT----------------------------------------------------TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--AT-G-ATTT
gi|73578                      : AGA-AG-T--CT----T-GA-A-G-TT-TT-GA-AAG-A-A-C----------TTT--GAGT--T-A-C-------A---T----G------AATG----CC--A--T----T-AC-TG--A----C-C-TCC-T-AT-T-T-TT--CC--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-AATT
gi|73579                      : AGA-GA-T--CT--A-T-GA-A-A-AT-TT-CA-GG--A-TTC----------TTTTTG--T--T-A-C-------A---T----G------A-GG----GCTAA--T----T-G--TG-CA----C-C-T-C-T-A----T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73580                      : AGA-AT-T--CT--T-T-GA-A-A-CT-TTCCA-GTG-A-T------------CTT--G--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CC--A--T----T-GA-TG-CA----C-C-TCT-T-AATT-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-T------AT-G-AGTT
gi|73581                      : AGA-AT-T--CA--A-T-AA-C-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AG----C-C-CTC-T-A--T-T-TT--AA--AT--
gi|73582                      : AGA-AT-C--CT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGA-C-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG-----------------------------------CC-T-A--T-T-TCA-AA--AT--T-T-TGA--T-A-TC--A--TT-G-AT
gi|73583                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GATG-A-C--TT-CA-AGG-G-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-T--------TG--A-----G-ATTT
gi|73584                      : AGA-AT-T--CTTTA-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TT-----------TTT--G--A--T-A-C-------A---T----G----------------------------G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--CT-GAATTT
gi|73585                      : AGA-AT-T--TC--A-T-GA-A-A-TT-CT-TA-AGG-A-TTC-----------TT--A--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CT--A--T----T-T--TG-CA----C-CATCC-T-T--A-T-TT--AA--A-----G-TGA--T-C-TG--A--
gi|73586                      : AAA-AT-T--CT--G-C-GA-A-A-TT-TG-CA-GGTTA-TTC----------GTT--G--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CAAG--C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AG--TA--T-T-TGA--T-T-TG--A--A--G-AT
gi|73587                      : AGA-AT-T--GT--G-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--A-A-G-------G---T----T------A-TG----CC--A--T----T-T--TG-CA----C-C-TTC---A--T-C-TT------AT--TGT-TTA--T-C-CC--A--AT-G-
gi|73588                      : AGA-AT-TT-CT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GT--A-TTC----------TTT--G--T--T-ACC-------A---T-----------A-T-----TC--A--T----T----TG-TAT---C-T-TCC-T-AT-T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-
gi|73589                      : AGA-AT-T--CG--AAT-GA-A-A-CT-TT-CA-AGG-ATTTT----------TTT--T--T--T-A-C-------A---C----A------A-TG----CC--A--T----T----TG-CG----------C-T-A--T-T-AT--GA--ATTAT-T-TGA--T-TGCG--A--AT-G-ATTT
gi|73590                      : AGA-AT----CT--A-T-GA-A-A-AT-T--CA-GG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CT--A--T----T-G--TT-CA----C-G-TCT-T-G--T-
gi|73591                      : AGA-AT-T--CA--A-T-TA-A-A----TT-CC-GGG-A-TTCC---------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--TACCAT-GT-TG-CAT---T-C-GCC-T-A--T-G-TA--AA--AT--G-T-TGA--T---TG--A--GT-G-ATTT
gi|73592                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-ATA-CT-TT-CA-GTA-A-TCT----------TAT--G--T----A-T-------A---T----G------G-TG----AC--GGGT----T-G--TG-CA----C-C-GTT-T-A--T-T-TG--AA--AT--T-T-TAC--T-C-T
gi|73593                      : AGA-AT-T--CT--A-T-TA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-
gi|73594                      :  GA-AT-T--CT--A-A-AA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTC----------TTT--G--T--T-A-CCTGGGCAG---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-T-TCT-T-A--A-T-TT--AT--GT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73595                      :  GA-AG-T--CT------GA-A-A-CT-TT-CA-CG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TA----CC--A--T----A-G--TG-CA----C-T-TCC-T-A--C-T-TC--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-T-ATTT
gi|73596                      :   A-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TATGATCC--A--T----T-
gi|73597                      :   A-AT-T--CT--A-C-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTA----------TTT--G--T--T-A-C-------G---T----A------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-CA----A-C-TC
gi|73598                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTT----------TTT--T--T--T-A-G-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--CG-CA----A-C-TCC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--G-G-TA--A--AT-G-
gi|73599                      :   A-AT-A--TT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---TGATCG------A-TG----GC--A--C----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-G--T-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--ATCAT-G-AGTT
gi|73600                      :   A-AA-T--CC--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GAG-A-TGA----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----AC--A--T----T-G--TG---------C-TCC-T-A--T-T-TC--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--TT-G-ATTT
gi|73601                      :   A-AT-T--CT--C-T------A-CT-TC-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----TAG--TG-CA----C-C-TAA---A--T-T-TT--AA--GC--T-T-TGA--
gi|73602                      :   A-ATGT--CT--A-T-CA-A-A-CTGTT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-T-------ATTGT----G------A-TG----CCG-A--T----T-GGTTG-CC----C-C-TCG-T-A--G-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-TG--A--A--G-ATT
gi|73603                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A--T-TT-CA-GGG-A-GTT----------CTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------G-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----CGC-TCT-T-A--
gi|73604                      :   A-AT-T--CT--A-TTGA-A-AGCT-TT-CA-GGA-A-TTCAGGATTTCTCTTT--G--T--T-A-C-------C---T----G------A-TG----CC-----C----T-G--TG--A----G-C-TCC-T-A--TAC-TT--AA--AT--
gi|73605                      :    -AT-T--TT--C-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--A--T--T-A-G-------A---T----G------T-TG----TC--A--T----T-A--TG-CA----A-C-TCC-T-T--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73606                      :      T-T--GT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TT-G-ATTT
gi|73607                      :      T-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-CA-GGG-A-ATC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----A-C-CCT-T-A--T-T-TT---C--GC--T-T-TGC--T-C-TA--A--AT-G-ATTT
gi|73608                      :      T-T--TT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CT-GAGTA-TTC----------CTT--G--T--T-T-C-------A---G----T------A-TG----CCG-A--T----T----TG-CA----C-C-TTCAT-A--T-T-TC--AA--TT--T-TATGA--T-C-
gi|73609                      :            T--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-A-C----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C----------------------------T-TGA--T-C-CG--A--AT-G-ATTT
gi|73610                      :             --A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TTA----------TTT--C--G--T-A-C-------A---T----G------A-TG----GT--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-A-TC--AA--TT--T-T-TGATCT-C-TGACA--AT-G-ATT
gi|73611                      :                -T-GA-A-A-CT-CT-TACGGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TTAG-ATTT
gi|73612                      :                -T-GA-A-G-TT-TT-GA-AGA-A-ATC----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--T----A-A--TC-CA----C-C-TCC-T-G------TT--AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-
gi|73613                      :                -T-GA-A-T-CT-TC-TA-TGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-TTC-------A---C----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT-------T--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT
gi|73614                      :                    A-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A---------------------------------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-TT----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--GA--TA--T-T-TAA--T-A-AG--A--TC-G-ATTT
gi|73615                      :                         -CT-TT-AA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGT--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73616                      :                            -TT-TA-GAG-G-CTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TG----TC--A--T----T-G--CG-CA----C-C-TCA-T-A--T-T-TT--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73617                      :                                 A-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------G---T----GTATATTA-TA----CA--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--A-----T-TGA--T-A-TG--G--AC-G-ATTT
gi|73618                      :                                            ----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-A-TG--A--TT-G-GTTT
gi|73619                      :                                                                    -C-------A---G----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-TA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT---A--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT


blockSeqs                     :         AA       C                   C     AGGATTTCTC         AA   C CTGGGCA TTG GATC TATATT    TGAT  TA    ACCA T GT     TGCA           AT      AA  TG              A             A
blockSeqs                     :         T        T                   T     C                  AA   T .       C   TCA  .         .     G     AA   T C      AG             T       A   TG              A             A
blockSeqs                     :         .        .                   T     .                  A    . .       .   TTG  .         .     G     .    A A      T              T       A   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . T      T              .       A   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .             .
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .              
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .              
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .              
blockSeqs                     :         .        .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .               .              
blockSeqs                     :                  .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .                              
blockSeqs                     :                  .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .                              
blockSeqs                     :                  .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .                              
blockSeqs                     :                  .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .   .                              
blockSeqs                     :                  .                   .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .       .                                  
blockSeqs                     :                                      .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .                                          
blockSeqs                     :                                      .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .              .                                          
blockSeqs                     :                                      .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    . .      .                                                         
blockSeqs                     :                                      .     .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    .                                                                  
blockSeqs                     :                                            .                  .    . .       .   .    .         .     .     .    .                                                                  
blockSeqs                     :                                                                    .                                                                                                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
finalCons                     : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT





Alignments
lowQualScore                  :    0  0 11  00 0 1  0 0 0  0  0  0   1 0   3333333333   00 00 22 0 1 1111111 111 3333 111111 0  1111  11 00 1111 1 22  0  3333 0 0   0 0 22 0 0  22  11  00 0 0   00 1 0  00 00  0 1    
lowQualScore                  :    .  . ..  .. . .  . . .  .  .  .   . .   ..........   .. .. .. . . ....... ... .... ...... .  ....  .. .. .... . ..  .  .... . .   . . .. . .  ..  ..  .. . .   .. . .  .. ..  . .    
lowQualScore                  :    7  6 55  99 6 2  6 6 6  6  6  6   7 6   0000000000   88 88 11 6 1 8888888 555 1111 666666 6  2222  99 88 9999 7 55  6  1111 6 6   6 6 00 6 6  66  77  88 6 6   99 3 6  99 99  7 4    
consensus                     : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
Reference ( family-317 )      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73547                      : AGA-AT-T--AT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73548                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-CT--AA--AT--T-T-AGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73549                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-C-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73550                      : AGA-AT-T--TT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CT--G--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73551                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TGTTG----C-C-ACC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73552                      : AAA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-A-TCC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-AT
gi|73553                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--TTA-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A----T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AC-A-ATTT
gi|73554                      : AGA-AT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---TTCA-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73555                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------AC--T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-A--T-T-GT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TA--A--AT-
gi|73556                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-T--CA-GGG-A-TTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CT--A--T----G-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AG--T-T-TAA--T-C-TG--A--AT-G-GTTT
gi|73557                      : AGA-AT-T--CT--A-T-AG-A-A-CT-TT-CA-GGG-G-TTC----------TTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-TA----C-C-TTC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGC--T-C-TG--A--AT-A-ATTT
gi|73558                      : AGA-AT-T--TT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--C--T-C-C-------G---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TGC-T-A--T-T-TT--AC--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-
gi|73559                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGGCA-TTC----------TTT--G--TA-T-A-C-------A---TTTG-G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C----TC-T-A--C-T-TT--GA--AT--T-T-TGG--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73560                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TC-CA-GGG-A-CTC----------TTG--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--G--T----T-T--TG-CA----T-T-TCC-T-A--T-T-CT--AA--GT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-ATTT
gi|73561                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-AA-GCG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CATGCAC-C-TTC-T-A--T-T-TT--GA--AT--T-A-TGA--T-C-TG--A--TT-A-ATTT
gi|73562                      : AAA-AT-T--CT--A-T-AA-A-A-CC-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--T--TT-G-ATTT
gi|73563                      : AGA-AG-T--CA--A-T-GA-A-A-CA-TT-CG-GGG-A-TTC----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-TCTT------AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--TT-G-ATTT
gi|73564                      : AGA-AT-T--CG--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-TAA--T-T-TT--
gi|73565                      : AGA-AT-TAATT--A-T------A-CT-TT-CA-AGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CC--A--T----T-T--TG-CA---------CC-T-A--T-T-TT------AT--T-T-AAA--T-T-TG--A--AT-G-ATT
gi|73566                      : AGA-AT-T--CT----T-GA-A-A-CT-T--CA-------------------------------T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C-ACC---A--C-T-TTAAAA--AT--T-T-T-A--T-C-TG--A--AT-G-AATT
gi|73567                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GT-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------CTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TA----CC--A--CAA--T-G--CG-CA----C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73568                      : AAA-AT-T--AT--A-A-GA-A-A-CT----CG-GGT-A-TTC----------TTT--G--T--G-A-T-------A---T----G------A-TA----CC--C--T----T-G--TG-CA----C---------------------A--AT--T-T-TTA--T-C-TG--G--AT-GAATTT
gi|73569                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CA--T--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-C-A--T-A-TT--A-------------A--C-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73570                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C-TA----A--T--------A--AT--T-T-TCA--G-C-TG--A--GT-G-ATTT
gi|73571                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-ATA----------TTT--G--G--T-A-C-------A---T----T------G-TG----CC--A--T----T-G--TA-CA----C-C--CC-T-A--C-T-TT--AA--AT--C-T-TCA--T-C-TG--G--AA-G-ATTT
gi|73572                      : AGA-CT-T--C---A-TCAA-A-A-CT-TT-AA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---G----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AA----T-T-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-TG
gi|73573                      : AGAGAT-T--GT--A-G-GA-A-A-CT-TT-CA-GCA-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------C-TG----TC--A--T----TTG--TG-CA----C-G-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--A-T-CGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73574                      : AGA-GT-T--CT--G-T-GA-A-A-CT-CT-CA-GG--A-TTC----------ATT--G--T--T-A-T-------A---T----G------A-TG----TA--A--T----TTG--TG-AA----T-C-TCC-T-A--T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-GG--A--AT-G-ATTT
gi|73575                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-TT-TT-CA-GAG-A-TTC----------TTT--G--T--C-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-
gi|73576                      : AGT-AT-T--CT--G-T-AA-A-A-CT-TT-CA-GGA----------------TTT--A--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-C--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-G-CTTT
gi|73577                      : AAA-AT-T--CT--A-T-GA-C-A-CT-TT-CA-AGG-A-TT----------------------------------------------------TG----CC--A--T----T-A--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--AT-G-ATTT
gi|73578                      : AGA-AG-T--CT----T-GA-A-G-TT-TT-GA-AAG-A-A-C----------TTT--GAGT--T-A-C-------A---T----G------AATG----CC--A--T----T-AC-TG--A----C-C-TCC-T-AT-T-T-TT--CC--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-AATT
gi|73579                      : AGA-GA-T--CT--A-T-GA-A-A-AT-TT-CA-GG--A-TTC----------TTTTTG--T--T-A-C-------A---T----G------A-GG----GCTAA--T----T-G--TG-CA----C-C-T-C-T-A----T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73580                      : AGA-AT-T--CT--T-T-GA-A-A-CT-TTCCA-GTG-A-T------------CTT--G--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CC--A--T----T-GA-TG-CA----C-C-TCT-T-AATT-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-T------AT-G-AGTT
gi|73581                      : AGA-AT-T--CA--A-T-AA-C-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTA----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----A------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-AG----C-C-CTC-T-A--T-T-TT--AA--AT--
gi|73582                      : AGA-AT-C--CT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGA-C-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG-----------------------------------CC-T-A--T-T-TCA-AA--AT--T-T-TGA--T-A-TC--A--TT-G-AT
gi|73583                      : AGA-AT-T--CT--A-T-GATG-A-C--TT-CA-AGG-G-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----T------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TG--AATGAT--T-T-T--------TG--A-----G-ATTT
gi|73584                      : AGA-AT-T--CTTTA-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TT-----------TTT--G--A--T-A-C-------A---T----G----------------------------G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TC--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--CT-GAATTT
gi|73585                      : AGA-AT-T--TC--A-T-GA-A-A-TT-CT-TA-AGG-A-TTC-----------TT--A--T--T-A-C-------A---T-----------A-TA----CT--A--T----T-T--TG-CA----C-CATCC-T-T--A-T-TT--AA--A-----G-TGA--T-C-TG--A--
gi|73586                      : AAA-AT-T--CT--G-C-GA-A-A-TT-TG-CA-GGTTA-TTC----------GTT--G--T--T-A-C-------A---C----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CAAG--C-C-TTC-T-A--T-T-TT--AG--TA--T-T-TGA--T-T-TG--A--A--G-AT
gi|73587                      : AGA-AT-T--GT--G-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--A-A-G-------G---T----T------A-TG----CC--A--T----T-T--TG-CA----C-C-TTC---A--T-C-TT------AT--TGT-TTA--T-C-CC--A--AT-G-
gi|73588                      : AGA-AT-TT-CT--A-T-GG-A-A-CT-TT-CA-GT--A-TTC----------TTT--G--T--T-ACC-------A---T-----------A-T-----TC--A--T----T----TG-TAT---C-T-TCC-T-AT-T-T-TT--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG-----AT-G-
gi|73589                      : AGA-AT-T--CG--AAT-GA-A-A-CT-TT-CA-AGG-ATTTT----------TTT--T--T--T-A-C-------A---C----A------A-TG----CC--A--T----T----TG-CG----------C-T-A--T-T-AT--GA--ATTAT-T-TGA--T-TGCG--A--AT-G-ATTT
gi|73590                      : AGA-AT----CT--A-T-GA-A-A-AT-T--CA-GG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CT--A--T----T-G--TT-CA----C-G-TCT-T-G--T-
gi|73591                      : AGA-AT-T--CA--A-T-TA-A-A----TT-CC-GGG-A-TTCC---------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--TACCAT-GT-TG-CAT---T-C-GCC-T-A--T-G-TA--AA--AT--G-T-TGA--T---TG--A--GT-G-ATTT
gi|73592                      : AGA-AT-T--CA--A-T-GA-ATA-CT-TT-CA-GTA-A-TCT----------TAT--G--T----A-T-------A---T----G------G-TG----AC--GGGT----T-G--TG-CA----C-C-GTT-T-A--T-T-TG--AA--AT--T-T-TAC--T-C-T
gi|73593                      : AGA-AT-T--CT--A-T-TA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-
gi|73594                      :  GA-AT-T--CT--A-A-AA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTC----------TTT--G--T--T-A-CCTGGGCAG---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-T-TCT-T-A--A-T-TT--AT--GT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73595                      :  GA-AG-T--CT------GA-A-A-CT-TT-CA-CG--A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TA----CC--A--T----A-G--TG-CA----C-T-TCC-T-A--C-T-TC--AG--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-T-ATTT
gi|73596                      :   A-AT-T--CA--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--TAAT-A-C-------A---T----G------A-TATGATCC--A--T----T-
gi|73597                      :   A-AT-T--CT--A-C-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-GTA----------TTT--G--T--T-A-C-------G---T----A------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-CA----A-C-TC
gi|73598                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTT----------TTT--T--T--T-A-G-------A---T----G------A-TG----CC--A--A----T-G--CG-CA----A-C-TCC-T-G--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--G-G-TA--A--AT-G-
gi|73599                      :   A-AT-A--TT--A-T-GA-A-A-CA-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A--T--T-A-C-------A---TGATCG------A-TG----GC--A--C----T-G--TG-CA----C-C-TCT-T-G--T-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TC--ATCAT-G-AGTT
gi|73600                      :   A-AA-T--CC--A-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GAG-A-TGA----------TAT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----AC--A--T----T-G--TG---------C-TCC-T-A--T-T-TC--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TC--A--TT-G-ATTT
gi|73601                      :   A-AT-T--CT--C-T------A-CT-TC-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------T---T----G------A-TG----CC--A--T----TAG--TG-CA----C-C-TAA---A--T-T-TT--AA--GC--T-T-TGA--
gi|73602                      :   A-ATGT--CT--A-T-CA-A-A-CTGTT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-T-------ATTGT----G------A-TG----CCG-A--T----T-GGTTG-CC----C-C-TCG-T-A--G-C-TT--AA--AT--T-T-TGA--TAC-TG--A--A--G-ATT
gi|73603                      :   A-AT-T--CT--A-T-GA-A-A--T-TT-CA-GGG-A-GTT----------CTT--G--C--T-A-C-------A---T----G------G-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----CGC-TCT-T-A--
gi|73604                      :   A-AT-T--CT--A-TTGA-A-AGCT-TT-CA-GGA-A-TTCAGGATTTCTCTTT--G--T--T-A-C-------C---T----G------A-TG----CC-----C----T-G--TG--A----G-C-TCC-T-A--TAC-TT--AA--AT--
gi|73605                      :    -AT-T--TT--C-T-GA-A-A-CT-TT-TA-GGG-A-TTC----------TCT--A--T--T-A-G-------A---T----G------T-TG----TC--A--T----T-A--TG-CA----A-C-TCC-T-T--T-T-TTA-AA--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73606                      :      T-T--GT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TT-G-ATTT
gi|73607                      :      T-T--CT--A-T-GA-A-A-CG-TT-CA-GGG-A-ATC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----A-C-CCT-T-A--T-T-TT---C--GC--T-T-TGC--T-C-TA--A--AT-G-ATTT
gi|73608                      :      T-T--TT--A-T-GA-A-A-CT-TT-CT-GAGTA-TTC----------CTT--G--T--T-T-C-------A---G----T------A-TG----CCG-A--T----T----TG-CA----C-C-TTCAT-A--T-T-TC--AA--TT--T-TATGA--T-C-
gi|73609                      :            T--G-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-A-C----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----T-C----------------------------T-TGA--T-C-CG--A--AT-G-ATTT
gi|73610                      :             --A-T-GA-A-A-CT-TT-CA-GAG-A-TTA----------TTT--C--G--T-A-C-------A---T----G------A-TG----GT--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-A-TC--AA--TT--T-T-TGATCT-C-TGACA--AT-G-ATT
gi|73611                      :                -T-GA-A-A-CT-CT-TACGGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-----------T----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--A-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-C-TT--A--TTAG-ATTT
gi|73612                      :                -T-GA-A-G-TT-TT-GA-AGA-A-ATC----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TA----CT--A--T----A-A--TC-CA----C-C-TCC-T-G------TT--AA--AT--T-T-TGA--T-T-TG--A--AT-A-
gi|73613                      :                -T-GA-A-T-CT-TC-TA-TGA-A-TTC----------TTT--G--T--T-TTC-------A---C----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT-------T--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT
gi|73614                      :                    A-A-A-CT-TT-CA-GGG-A-TTC----------TTT--A---------------------------------A-TG----CT--A--T----T-G--TG-TT----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--GA--TA--T-T-TAA--T-A-AG--A--TC-G-ATTT
gi|73615                      :                         -CT-TT-AA-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-A-C-------A---T----G------A-TG----TC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--GT--T-T-TGT--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73616                      :                            -TT-TA-GAG-G-CTT----------TTT--G--T--T-A-C-------A---A----G------A-TG----TC--A--T----T-G--CG-CA----C-C-TCA-T-A--T-T-TT--AT--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATTT
gi|73617                      :                                 A-GGG-A-TTC----------TTT--G--T--T-G-C-------G---T----GTATATTA-TA----CA--A--T----T-G--TG-AA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--A-----T-TGA--T-A-TG--G--AC-G-ATTT
gi|73618                      :                                            ----------TTT--G--T--T-G-C-------A---T----G------A-TG----CC--A--T----T-G--TG-CA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT--AA--AT--T-T-TGA--T-A-TG--A--TT-G-GTTT
gi|73619                      :                                                                    -C-------A---G----G------A-TG----C---A--T----T-G--TG-TA----C-C-TCC-T-A--T-T-TT---A--AT--T-T-TGA--T-C-TG--A--AT-G-ATT