lowQualScore : 1 222 77 0 11 0 00 33 11 1111 00 11 0 0 1 1 11111 22 0 0 11 1 11 1 2 111 1111 0 1 11 0 2 1 1 0 1 0 111 1 7777777 0 1 0 0 1111 0 2
lowQualScore : . ... .. . .. . .. .. .. .... .. .. . . . . ..... .. . . .. . .. . . ... .... . . .. . . . . . . . ... . ....... . . . . .... . .
lowQualScore : 2 444 22 6 33 6 88 55 33 2222 88 33 5 5 6 1 99999 00 5 5 33 1 33 1 2 555 1111 5 6 88 5 2 1 6 5 1 5 555 1 3333333 5 1 5 6 7777 6 9
consensus : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
Reference ( gi|74777 ) : TTTT-TTC---TG-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74779 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74778 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74780 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-A-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74783 : TTTT-TTCCA-TG-T-A--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74781 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TACGTC----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74785 : TTTT-TTC---TACT-G----A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74786 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-TTAA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74789 : TTTT-TTC---TG-T-G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTA------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74784 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74787 : TTTT-CCC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------T-A-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74788 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-C-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AG--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----AGA-C-ACAA
gi|74792 : TTTT-TCC---TA-T-G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-AAT-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74791 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AG------GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-
gi|74803 : TTTT-TTC---TG-C-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-C-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-CC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74794 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AATTT-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-
gi|74796 : TTTT-TTC---TA-A-G--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74790 : TTTT-TTC---TG-T-G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTA------A-A-A-AA-G----AT--C-ACAA
gi|74797 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74800 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A-----A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AAT-T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74795 : TTTT-TTT---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-GA-T-AAA-----GT---A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTA------A-A-A-AA-G----ATGCC-ACAA
gi|74801 : TTTT-CCC---TA-C-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-AC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74802 : TTTT-TTC---TA-C-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74805 : TTTT-TTC---TA-T-T--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AAC-A-T-A-A-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-
gi|74807 : TTTT-CTC---TA-T-G--T-A--T--A--T----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--T-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-AT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-
gi|74799 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ATT-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74798 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-GA---ATA-C-
gi|74809 : TTTT-TTC---TA-A-G--T-A--TTAA--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ACT-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74808 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-C-A-AA-G----A-A-G-ACAA
gi|74810 : TTTT-TTC---TA-C-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-GAC-A-T-T-G-G---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAAaa
gi|74812 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-ACAT--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-TA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74804 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--TGTATA--T--C-T-GA-T-AAA-----TTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-AATATATA-C-ACAA
gi|74818 : TTTTATTC---TA-T----T-A--T--A--C----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74817 : TTTT-TTC---TA-T-A--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-T---TA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74816 : TTTT-TTC---TA-C-G--T-A--T--A--C----A--T--C---AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-A-T-T-G-----AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C--CAA
gi|74819 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T----------------------------G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74793 : TTTT-TCC---TA-T-G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AAAT-AAT-----GTT--AAT-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T--AC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74811 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--T--A----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-ACTA---C----G-T-AA--T-TAC-CAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A---------ATA-C-AAAA
gi|74814 : TTTT-CCC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GCA------A-A-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74820 : TTTT-TTC---TA-C-GA-T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AA-------TT--A---G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74813 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--C--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G-----TT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-ACT-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-A----A
gi|74823 : TCTT-TTC---TA-T-G--G-A--T--A--C----G--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--A-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAA-A-T-T-G-A---AA-GT-------C-A-A-AT-G----ATG-T-ACAA
gi|74825 : TTTT-CTCGATTG---G--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-TCAAA-----GTC--T-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T--A--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AAGGT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74821 : TTTT-TTC---TA-T-A--T-A--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-C---AA-AT-------GCA-C-AA-G----A-A-C-
gi|74827 : TTCT-TTC---T------------------C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-T-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------G-A-A-AA-G----TTA-C-ACAA
gi|74815 : TTTT-CCC---TA-T-G--A-T--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GCA------A-A-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74822 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--G-T-G--C-TTT--C-A-TA---G----G-T-AA--T-TAC-AACGA-TAC-A-A---AA-GA-------A-A-A-AA-G----
gi|74826 : TTTT-TTC---TAAT-G--T-T--TT-G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----TGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-ACAA-G----ATA-C-ACAAcac
gi|74828 : TTTT-TTC---TA-T----T-A--TT-A--C----C--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T------TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AC-G----ATA-C-AAAA
gi|74782 : TTTT-TTC---TA-TTG--T-A--T--A--C----ACTT--C-T-AAAT-AAA-----GTT--A---G--C-TTT--C-A-TA---CTGTCG-TTAA--T-TAC-AAC-A---T-G-A---AA-GTA------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74824 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTTAAA-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---
gi|74829 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----------------------------------T-A--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74832 : TTTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-ACG-----GTT--A-C-GGCC-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TACTAAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-ACA-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74830 : TTTT-TTC---TA-A-G--C-A--T-----T----A--TT-C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-G-G--C-TTTT-C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-ATC-A-T-T-G-A---AA-GT-------C-A-A-AA------ATA-C-ACAA
gi|74833 : TTTT-TTT---TA-C-G--T-A--TT-A--C----A--T--C-T-AA-T-AAAA----GTT--A-T-G--C-GT-----G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AA--A-T-T-G-A---AA-GCA------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74835 : TTTT-TTT---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--G--C-T-AA-T-GAA-----GTT--A---G--C-TTTTCT-G-TA---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-TAA-A---AA-GC-------A-A-T-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74806 : TTTT-TTC---TA-T-A--TGA--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-TAAA--T-TAC-TAC-A-T-----A---AATGC-------A-T-A-AA-G----ATA-C-
gi|74834 : TTTT-TTC---TA-C-GCTT-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----G-T--A-T-G--CTTTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC--AC-A---T-G-A---AA-GC-------A-A-A-A
gi|74836 : TTTT-TTC---TAAC-G--T-A--TT-A--C----A--T--CAT-AA-T-GAA-----ATT----T-G--CATTT--T-G-TA---C----G-T-AA--TATAC-AAC-A-T-TTG-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAAgaa
gi|74837 : TTCT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----A--------------------------------G-T-AA--T-TAC-AGC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AC-G----ATG-C-ACAA
gi|74838 : TTTTATTCG--TA-T-G--T-A--T--A--C----A--C--G-T-AA-T-AAA-----GTTA-A-T-G--C-TTT--C-ATTA---C----GTT-AG--T-TAC-AACTA-T-C-GAA---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ACA-
gi|74839 : TTTT-TTT---TACT-G--T-A--T--AG-C----A--T--C-T-AAAT-AAA-----GAT--A-TTG--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AA------T-G-A---AA-AC-------A-ACA-AA-G----
gi|74840 : TTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAG-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-G-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-AAACAA-GT-------A-A-A-AA-T----ATT-C-ACAAt
gi|74841 : TTT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--T----A--T--A-T-GA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-TAA--C-A-TA---C----G-A-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTAAAAAAAA-A-A-AA-A----ATA-C-ACAA
gi|74842 : TTT-TTC---TA-T-G--T-A-----A--C----A--T--T-T-AT-T-TAA-----GTT--A-T-G--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-G-A-AC-A----A-A-C-AC
gi|74843 : TTT-TTC---TA-T-G--T-A--TT-A--C----A--TTCC-T-AA-A-AAATTATAGTTGTA-T-G--A-TTT--T-G-TA---C----G-TCAA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G-----TA-C-AAAA
gi|74844 : TT-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---T----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AATG----GTA-C-ACAA
gi|74845 : T-TTC---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-GTTAC--C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-
gi|74846 : C---TA-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-T--A--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74847 : ---TG-T-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AGT-----TTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TG---C----G-T-AA--A-TAG-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTC------A-A-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74831 : ---TG-T-A--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA------TT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-TAC-A-T-T-A-A---AA-GTAAAA---A-A-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74848 : tttcttctaattaca-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-GG-C-TTT--T-GGTA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-G-T-T-G-A---AA-GC-------A-A-A-AG-T----ATA-C-AAAA
gi|74849 : tac-G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-TAAAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AAT-T-TACAAAC-G-T-T-G-AG--AA-GC-------A-A-A-AA-G-----TA-T-ACAA
gi|74850 : tac--C----A--T--C-T-AG-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-T-A---AA-GC-------A-A-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74851 : AA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TA--AAC-A-T-T-G-A---AA-GT-------A-A-A-AA-G----ATA-C-ATAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 44444444 11 11 0 00 44 22 1111 00 00 0 0 1 1 11111 22 0 0 11 1 11 222 111 1111 0 1 11 0 2 1 1 0 1 1 111 1 1 6666666 1 0 0 1111 0 2
lowQualScore : . . ........ .. .. . .. .. .. .... .. .. . . . . ..... .. . . .. . .. ... ... .... . . .. . . . . . . . ... . . ....... . . . .... . .
lowQualScore : 2 5 22222222 33 33 5 88 00 00 1111 77 77 5 5 6 1 99999 00 5 5 33 1 33 777 555 1111 5 6 88 5 1 1 6 5 1 1 555 1 6 7777777 1 5 6 7777 6 9
consensus : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
Reference ( family-313 ) : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74777 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74778 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74779 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74780 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-A-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74781 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TACGTC----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74782 : TTTT-TTC-TA--------TT-G--T-A--T--A--C----ACTT--C-T-AAAT-AAA-----GTT--A---G--C-TTT--C-A-TA---CTGTCG-TTAA--T-TAC-AAC-A---T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74783 : TTTT-TTC-CA--------T--G--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74784 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74785 : TTTT-TTC-TAC-------T--G----A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74786 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-TTAA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74787 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------TA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74788 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-C-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AG--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----AGA-C-ACAA
gi|74789 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74790 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----AT--C-ACAA
gi|74791 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AG------GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74792 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-AAT-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74793 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AAAT-AAT-----GTT--AAT-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T--AC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74794 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AATTT-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74795 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-GA-T-AAA-----GT---A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATGCC-ACAA
gi|74796 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74797 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74798 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-GA---ATA-C-
gi|74799 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ATT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74800 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AAT-T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74801 : TTTT-CCC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-A-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74802 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74803 : TTTT-TTC-TG--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-C-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-C-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74804 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--TGTATA--T--C-T-GA-T-AAA-----TTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-AATATATA-C-ACAA
gi|74805 : TTTT-TTC-TA--------T--T--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AAC-A-T-A-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74806 : TTTT-TTC-TA--------T--A--TGA--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-TAAA--T-TAC-TAC-A-T-----A---AATG-C-------AT-A-AA-G----ATA-C-
gi|74807 : TTTT-CTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--T-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-A-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74808 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AC-A-AA-G----A-A-G-ACAA
gi|74809 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--TTAA--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAAaa
gi|74810 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-GAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74811 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--T--A----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-ACTA---C----G-T-AA--T-TAC-CAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A---------ATA-C-AAAA
gi|74812 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-ACAT--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-TA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74813 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--C--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G-----TT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----A
gi|74814 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74815 : TTTT-CCC-TA--------T--G--A-T--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74816 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C---AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-A-T-T-G-----AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C--CAA
gi|74817 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-T---TA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74818 : TTTTATTC-TA--------T-----T-A--T--A--C----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74819 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T----------------------------G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74820 : TTTT-TTC-TA--------C--GA-T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AA-------TT--A---G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74821 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-GCA---AATG-C-------AC-A-A
gi|74822 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--G-T-G--C-TTT--C-A-TA---G----G-T-AA--T-TAC-AACGA-TAC-A-A---AA-G-A-------AA-A-AA-G----gaaca
gi|74823 : TCTT-TTC-TA--------T--G--G-A--T--A--C----G--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--A-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAA-A-T-T-G-A---AA-G-T-------CA-A-AT-G----ATG-T-ACAAcac
gi|74824 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTTAAA-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---
gi|74825 : TTTT-CTC-GA--------TTGG--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-TCAAA-----GTC--T-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-A---T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GGT-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74826 : TTTT-TTC-TAA-------T--G--T-T--TT-G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----TGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-ACAA-G----ATA-C-ACAA
gi|74827 : TTCT-TTC-T--------------------------C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-T-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------GA-A-AA-G----TTA-C-ACAA
gi|74828 : TTTT-TTC-TA--------T-----T-A--TT-A--C----C--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T------TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATA-C-AAAA
gi|74829 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----------------------------------T-A--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74830 : TTTT-TTC-TA--------A--G--C-A--TT-A--T-------T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-G-G--C-TTTT-C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-ATC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-A-------ATA-C-ACAA
gi|74831 : TTTC-TTC-TAATTACATGT--A--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA------TT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-TAC-A-T-T-A-A---AA-G-TAAAA---AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74832 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-ACG-----GTT--A-C-GGCC-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TACTAAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AACA-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74833 : TTTT-TTT-TA--------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--C-T-AA-T-AAAA----GTT--A-T-G--C-GT-----G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AA--A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74834 : TTTT-TTC-TA--------C--GCTT-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----G-T--A-T-G--CTTTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC--AC-A---T-G-A---AA-G-C-------AA-A-A
gi|74835 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--G--C-T-AA-T-GAA-----GTT--A---G--C-TTTTCT-G-TA---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-TAA-A---AA-G-C-------AA-T-AA-G----ATA-C-AAAAgaa
gi|74836 : TTTT-TTC-TAA-------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--CAT-AA-T-GAA-----ATT----T-G--CATTT--T-G-TA---C----G-T-AA--TATAC-AAC-A-T-TTG-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74837 : TTCT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----A--------------------------------G-T-AA--T-TAC-AGC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATG-C-ACAA
gi|74838 : TTTTATTCGTA--------T--G--T-A--T--A--C----A--C--G-T-AA-T-AAA-----GTTA-A-T-G--C-TTT--C-ATTA---C----GTT-AG--T-TAC-AACTA-T-C-GAA---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ACA-
gi|74839 : TTTT-TTT-TAC-------T--G--T-A--T--AG-C----A--T--C-T-AAAT-AAA-----GAT--A-TTG--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AA------T-G-A---AA-A-C-------AACA-AA-G----
gi|74840 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAG-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-G-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-AAACAA-G-T-------AA-A-AA-T----ATT-C-ACAAt
gi|74841 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--A-T-GA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-TAA--C-A-TA---C----G-A-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TAAAAAAAAA-A-AA-A----ATA-C-ACAA
gi|74842 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--T-T-AT-T-TAA-----GTT--A-T-G--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AG-A-AC-A----A-A-C-AC
gi|74843 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--TT-A--C----A--TTCC-T-AA-A-AAATTATAGTTGTA-T-G--A-TTT--T-G-TA---C----G-TCAA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-C-AAAA
gi|74844 : TT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---T----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AATG----GTA-C-ACAA
gi|74845 : T-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-GTTAC--C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74846 : C-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-T--A--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74847 : -TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AGT-----TTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TG---C----G-T-AA--A-TAG-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74848 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-GG-C-TTT--T-GGTA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-G-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AG-T----ATA-C-AAAA
gi|74849 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-TAAAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AAT-T-TACAAAC-G-T-T-G-AG--AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-T-ACAA
gi|74850 : --C----A--T--C-T-AG-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-T-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74851 : AA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TA--AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ATAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 44444444 11 11 0 00 44 22 1111 00 00 0 0 1 1 11111 22 0 0 11 1 11 222 111 1111 0 1 11 0 2 1 1 0 1 1 111 1 1 6666666 1 0 0 1111 0 2
lowQualScore : . . ........ .. .. . .. .. .. .... .. .. . . . . ..... .. . . .. . .. ... ... .... . . .. . . . . . . . ... . . ....... . . . .... . .
lowQualScore : 2 5 22222222 33 33 5 88 00 00 1111 77 77 5 5 6 1 99999 00 5 5 33 1 33 777 555 1111 5 6 88 5 1 1 6 5 1 1 555 1 6 7777777 1 5 6 7777 6 9
consensus : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
Reference ( family-313 ) : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74777 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74778 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74779 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74780 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-A-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74781 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TACGTC----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74782 : TTTT-TTC-TA--------TT-G--T-A--T--A--C----ACTT--C-T-AAAT-AAA-----GTT--A---G--C-TTT--C-A-TA---CTGTCG-TTAA--T-TAC-AAC-A---T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74783 : TTTT-TTC-CA--------T--G--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74784 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74785 : TTTT-TTC-TAC-------T--G----A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74786 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-TTAA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74787 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------TA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74788 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-C-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AG--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----AGA-C-ACAA
gi|74789 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74790 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----AT--C-ACAA
gi|74791 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AG------GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74792 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-AAT-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74793 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AAAT-AAT-----GTT--AAT-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T--AC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74794 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AATTT-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74795 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-GA-T-AAA-----GT---A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATGCC-ACAA
gi|74796 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74797 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74798 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-GA---ATA-C-
gi|74799 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ATT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74800 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AAT-T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74801 : TTTT-CCC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-A-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74802 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74803 : TTTT-TTC-TG--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-C-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-C-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74804 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--TGTATA--T--C-T-GA-T-AAA-----TTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-AATATATA-C-ACAA
gi|74805 : TTTT-TTC-TA--------T--T--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AAC-A-T-A-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74806 : TTTT-TTC-TA--------T--A--TGA--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-TAAA--T-TAC-TAC-A-T-----A---AATG-C-------AT-A-AA-G----ATA-C-
gi|74807 : TTTT-CTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--T-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-A-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74808 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AC-A-AA-G----A-A-G-ACAA
gi|74809 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--TTAA--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAAaa
gi|74810 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-GAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74811 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--T--A----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-ACTA---C----G-T-AA--T-TAC-CAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A---------ATA-C-AAAA
gi|74812 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-ACAT--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-TA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74813 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--C--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G-----TT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----A
gi|74814 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74815 : TTTT-CCC-TA--------T--G--A-T--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74816 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C---AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-A-T-T-G-----AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C--CAA
gi|74817 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-T---TA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74818 : TTTTATTC-TA--------T-----T-A--T--A--C----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74819 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T----------------------------G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74820 : TTTT-TTC-TA--------C--GA-T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AA-------TT--A---G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74821 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-GCA---AATG-C-------AC-A-A
gi|74822 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--G-T-G--C-TTT--C-A-TA---G----G-T-AA--T-TAC-AACGA-TAC-A-A---AA-G-A-------AA-A-AA-G----gaaca
gi|74823 : TCTT-TTC-TA--------T--G--G-A--T--A--C----G--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--A-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAA-A-T-T-G-A---AA-G-T-------CA-A-AT-G----ATG-T-ACAAcac
gi|74824 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTTAAA-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---
gi|74825 : TTTT-CTC-GA--------TTGG--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-TCAAA-----GTC--T-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-A---T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GGT-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74826 : TTTT-TTC-TAA-------T--G--T-T--TT-G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----TGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-ACAA-G----ATA-C-ACAA
gi|74827 : TTCT-TTC-T--------------------------C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-T-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------GA-A-AA-G----TTA-C-ACAA
gi|74828 : TTTT-TTC-TA--------T-----T-A--TT-A--C----C--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T------TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATA-C-AAAA
gi|74829 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----------------------------------T-A--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74830 : TTTT-TTC-TA--------A--G--C-A--TT-A--T-------T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-G-G--C-TTTT-C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-ATC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-A-------ATA-C-ACAA
gi|74831 : TTTC-TTC-TAATTACATGT--A--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA------TT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-TAC-A-T-T-A-A---AA-G-TAAAA---AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74832 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-ACG-----GTT--A-C-GGCC-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TACTAAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AACA-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74833 : TTTT-TTT-TA--------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--C-T-AA-T-AAAA----GTT--A-T-G--C-GT-----G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AA--A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74834 : TTTT-TTC-TA--------C--GCTT-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----G-T--A-T-G--CTTTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC--AC-A---T-G-A---AA-G-C-------AA-A-A
gi|74835 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--G--C-T-AA-T-GAA-----GTT--A---G--C-TTTTCT-G-TA---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-TAA-A---AA-G-C-------AA-T-AA-G----ATA-C-AAAAgaa
gi|74836 : TTTT-TTC-TAA-------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--CAT-AA-T-GAA-----ATT----T-G--CATTT--T-G-TA---C----G-T-AA--TATAC-AAC-A-T-TTG-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74837 : TTCT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----A--------------------------------G-T-AA--T-TAC-AGC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATG-C-ACAA
gi|74838 : TTTTATTCGTA--------T--G--T-A--T--A--C----A--C--G-T-AA-T-AAA-----GTTA-A-T-G--C-TTT--C-ATTA---C----GTT-AG--T-TAC-AACTA-T-C-GAA---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ACA-
gi|74839 : TTTT-TTT-TAC-------T--G--T-A--T--AG-C----A--T--C-T-AAAT-AAA-----GAT--A-TTG--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AA------T-G-A---AA-A-C-------AACA-AA-G----
gi|74840 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAG-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-G-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-AAACAA-G-T-------AA-A-AA-T----ATT-C-ACAAt
gi|74841 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--A-T-GA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-TAA--C-A-TA---C----G-A-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TAAAAAAAAA-A-AA-A----ATA-C-ACAA
gi|74842 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--T-T-AT-T-TAA-----GTT--A-T-G--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AG-A-AC-A----A-A-C-AC
gi|74843 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--TT-A--C----A--TTCC-T-AA-A-AAATTATAGTTGTA-T-G--A-TTT--T-G-TA---C----G-TCAA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-C-AAAA
gi|74844 : TT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---T----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AATG----GTA-C-ACAA
gi|74845 : T-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-GTTAC--C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74846 : C-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-T--A--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74847 : -TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AGT-----TTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TG---C----G-T-AA--A-TAG-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74848 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-GG-C-TTT--T-GGTA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-G-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AG-T----ATA-C-AAAA
gi|74849 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-TAAAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AAT-T-TACAAAC-G-T-T-G-AG--AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-T-ACAA
gi|74850 : --C----A--T--C-T-AG-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-T-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74851 : AA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TA--AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ATAA
blockSeqs : A ATTACATG TG CT TA TA GTAT A C TTATA AA GC T TC GG CGT TGTC T TT A G T A C AAC T G AAAAAAA C ATAT T
blockSeqs : A C T A T TA . A A A GT G A T AC C . A T A T C T A G T T AAAA C A T
blockSeqs : . A . . T G . A . . A . . . AT . . C T T . C . . . . T A . . T
blockSeqs : . A . . T . . . . . . . . . GT . . . . A . . . . . . . A . . T
blockSeqs : . C . . T . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . A . . T
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
finalCons : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 44444444 11 11 0 00 44 22 1111 00 00 0 0 1 1 11111 22 0 0 11 1 11 222 111 1111 0 1 11 0 2 1 1 0 1 1 111 1 1 6666666 1 0 0 1111 0 2
lowQualScore : . . ........ .. .. . .. .. .. .... .. .. . . . . ..... .. . . .. . .. ... ... .... . . .. . . . . . . . ... . . ....... . . . .... . .
lowQualScore : 2 5 22222222 33 33 5 88 00 00 1111 77 77 5 5 6 1 99999 00 5 5 33 1 33 777 555 1111 5 6 88 5 1 1 6 5 1 1 555 1 6 7777777 1 5 6 7777 6 9
consensus : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
Reference ( family-313 ) : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74777 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74778 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74779 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74780 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-A-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74781 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TACGTC----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74782 : TTTT-TTC-TA--------TT-G--T-A--T--A--C----ACTT--C-T-AAAT-AAA-----GTT--A---G--C-TTT--C-A-TA---CTGTCG-TTAA--T-TAC-AAC-A---T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74783 : TTTT-TTC-CA--------T--G--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74784 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74785 : TTTT-TTC-TAC-------T--G----A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74786 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-TTAA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74787 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------TA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74788 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-C-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AG--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----AGA-C-ACAA
gi|74789 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74790 : TTTT-TTC-TG--------T--G--T-A--A--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----AT--C-ACAA
gi|74791 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AG------GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74792 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-AAT-----GTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74793 : TTTT-TCC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AAAT-AAT-----GTT--AAT-G--C-TTC--C-A-TA---C----G-T-AA--T--AC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74794 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AATTT-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74795 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-GA-T-AAA-----GT---A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TA------AA-A-AA-G----ATGCC-ACAA
gi|74796 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74797 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74798 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-GA---ATA-C-
gi|74799 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-GTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ATT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74800 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AAT-T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74801 : TTTT-CCC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-A-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74802 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74803 : TTTT-TTC-TG--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-C-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-C-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74804 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--TGTATA--T--C-T-GA-T-AAA-----TTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-AATATATA-C-ACAA
gi|74805 : TTTT-TTC-TA--------T--T--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AAC-A-T-A-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74806 : TTTT-TTC-TA--------T--A--TGA--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-TAAA--T-TAC-TAC-A-T-----A---AATG-C-------AT-A-AA-G----ATA-C-
gi|74807 : TTTT-CTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--T-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-G---AA-A-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74808 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AC-A-AA-G----A-A-G-ACAA
gi|74809 : TTTT-TTC-TA--------A--G--T-A--TTAA--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAAaa
gi|74810 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTC--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-GAC-A-T-T-G-G---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74811 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--T--A----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-ACTA---C----G-T-AA--T-TAC-CAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A---------ATA-C-AAAA
gi|74812 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-ACAT--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-TA--A-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74813 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--C--A--C----A--T--T-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G-----TT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-ACT-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-A----A
gi|74814 : TTTT-CCC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA----TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74815 : TTTT-CCC-TA--------T--G--A-T--T--A--C----A--T--C-T-AA-G-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74816 : TTTT-TTC-TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C---AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-A-T-T-G-----AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C--CAA
gi|74817 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T--ATAC----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-T---TA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74818 : TTTTATTC-TA--------T-----T-A--T--A--C----A--T----T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74819 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T----------------------------G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74820 : TTTT-TTC-TA--------C--GA-T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AA-------TT--A---G--C-TTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74821 : TTTT-TTC-TA--------T--A--T-A--T-----C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-GCA---AATG-C-------AC-A-A
gi|74822 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--G-T-G--C-TTT--C-A-TA---G----G-T-AA--T-TAC-AACGA-TAC-A-A---AA-G-A-------AA-A-AA-G----gaaca
gi|74823 : TCTT-TTC-TA--------T--G--G-A--T--A--C----G--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--A-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-AAA-A-T-T-G-A---AA-G-T-------CA-A-AT-G----ATG-T-ACAAcac
gi|74824 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTTAAA-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-A-A---
gi|74825 : TTTT-CTC-GA--------TTGG--T-A--T--A--C----A--T--T-T-AA-TCAAA-----GTC--T-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-A---T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-GGT-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACA
gi|74826 : TTTT-TTC-TAA-------T--G--T-T--TT-G--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----TGT--A-T-G--C-TTT--C-A-GA---C----G-T-AA--T-TACAAAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-ACAA-G----ATA-C-ACAA
gi|74827 : TTCT-TTC-T--------------------------C----A--T--C-T-AA-T-AAC-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-T-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------GA-A-AA-G----TTA-C-ACAA
gi|74828 : TTTT-TTC-TA--------T-----T-A--TT-A--C----C--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T------TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TGC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATA-C-AAAA
gi|74829 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----------------------------------T-A--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74830 : TTTT-TTC-TA--------A--G--C-A--TT-A--T-------T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-G-G--C-TTTT-C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-ATC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-A-------ATA-C-ACAA
gi|74831 : TTTC-TTC-TAATTACATGT--A--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA------TT--A-T-G--C-TTT--C-A-TG---C----G-T-AA--T-TAC-TAC-A-T-T-A-A---AA-G-TAAAA---AA-A-AA-A----ATA-C-AC
gi|74832 : TTTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--G--C----A--T--A-T-AA-T-ACG-----GTT--A-C-GGCC-TTT--C-G-TT---C----G-T-AA--T-TACTAAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AACA-AA-G----ATA-CTACAA
gi|74833 : TTTT-TTT-TA--------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--C-T-AA-T-AAAA----GTT--A-T-G--C-GT-----G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AA--A-T-T-G-A---AA-G-CA------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74834 : TTTT-TTC-TA--------C--GCTT-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----G-T--A-T-G--CTTTT--T-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC--AC-A---T-G-A---AA-G-C-------AA-A-A
gi|74835 : TTTT-TTT-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--G--C-T-AA-T-GAA-----GTT--A---G--C-TTTTCT-G-TA---A----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-TAA-A---AA-G-C-------AA-T-AA-G----ATA-C-AAAAgaa
gi|74836 : TTTT-TTC-TAA-------C--G--T-A--TT-A--C----A--T--CAT-AA-T-GAA-----ATT----T-G--CATTT--T-G-TA---C----G-T-AA--TATAC-AAC-A-T-TTG-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74837 : TTCT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----A--------------------------------G-T-AA--T-TAC-AGC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AC-G----ATG-C-ACAA
gi|74838 : TTTTATTCGTA--------T--G--T-A--T--A--C----A--C--G-T-AA-T-AAA-----GTTA-A-T-G--C-TTT--C-ATTA---C----GTT-AG--T-TAC-AACTA-T-C-GAA---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ACA-
gi|74839 : TTTT-TTT-TAC-------T--G--T-A--T--AG-C----A--T--C-T-AAAT-AAA-----GAT--A-TTG--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAT-AA------T-G-A---AA-A-C-------AACA-AA-G----
gi|74840 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AT-T-AAG-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-G-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-AAACAA-G-T-------AA-A-AA-T----ATT-C-ACAAt
gi|74841 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--A-T-GA-T-AAA-----ATT--A-T-G--C-TAA--C-A-TA---C----G-A-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-TAAAAAAAAA-A-AA-A----ATA-C-ACAA
gi|74842 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A-----A--C----A--T--T-T-AT-T-TAA-----GTT--A-T-G--C-TT---C-A-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AG-A-AC-A----A-A-C-AC
gi|74843 : TTT-TTC-TA--------T--G--T-A--TT-A--C----A--TTCC-T-AA-A-AAATTATAGTTGTA-T-G--A-TTT--T-G-TA---C----G-TCAA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-C-AAAA
gi|74844 : TT-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--T----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---T----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AATG----GTA-C-ACAA
gi|74845 : T-TTC-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--T-GTTAC--C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-
gi|74846 : C-TA--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----A-T--A--T-TAC-AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74847 : -TG--------T--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AGT-----TTT--A-T-G--C-TTC--C-A-TG---C----G-T-AA--A-TAG-AAC-A-T-T-G-A---AA-GTC-------AA-A-AA-G----ATA-C-ACAA
gi|74848 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-T-AAA-----GTT--A-T-GG-C-TTT--T-GGTA---C----G-T-AA--T-TAA-AAC-G-T-T-G-A---AA-G-C-------AA-A-AG-T----ATA-C-AAAA
gi|74849 : -TA--------C--G--T-A--T--A--C----A--T--C-T-AA-TAAAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--TGG-TA---C----G-T-AAT-T-TACAAAC-G-T-T-G-AG--AA-G-C-------AA-A-AA-G-----TA-T-ACAA
gi|74850 : --C----A--T--C-T-AG-T-AAA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-G-TA---C----G-T-AA--T-TAC-AAC-A-T-T-T-A---AA-G-C-------AA-A-AA-G----ATA-C-AAAA
gi|74851 : AA-----GTT--A-T-G--C-TTT--C-A-TA---C----G-T-AA--T-TA--AAC-A-T-T-G-A---AA-G-T-------AA-A-AA-G----ATA-C-ATAA