lowQualScore                  :                                                                                                     11111                                                                                       
lowQualScore                  :     2 1  0 1 00 0 1 11 22 0 222222  7777777777777777777  1 0 333333 1  11 1 0 11   11  2222 111 0 1 99999 1 222222 000 1 222222 11 11 11  1 0 1  11 111 11 1  11 00 0 1  111 0 0   222 0        
lowQualScore                  :     . .  . . .. . . .. .. . ......  ...................  . . ...... .  .. . . ..   ..  .... ... . . ..... . ...... ... . ...... .. .. ..  . . .  .. ... .. .  .. .. . .  ... . .   ... .        
lowQualScore                  :     1 0  7 3 99 7 3 44 00 6 222222  0000000000000000000  7 5 444444 1  88 1 5 33   22  1111 666 5 6 00000 0 777777 999 5 000000 22 88 22  0 5 0  88 666 99 1  88 77 5 6  555 5 5   111 6        
consensus                     : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
Reference ( gi|22642 )        : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--A--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22644                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAATGTA
gi|22643                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--T-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22648                      : CGGC-T-CGCG-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-AT-----T--A--CA-CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22646                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--T-G-G--AAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CA-A-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22645                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-GC-GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T-----C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-CAAT---A-T-AACT--A-ATAATc
gi|22647                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-A-A--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T---CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22649                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------AA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-A--T--C-CATCATGA---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATGAT
gi|22652                      : CGGC-T-TG-G-A--A-T-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CC-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-T-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--AC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ACAATATA
gi|22655                      : CGG--T-CG-G-G--G-A-A--A--T-A------TA-----A-------------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---GAA-G--T--C-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22653                      : CGGC-T-CG-GCG--A-G-A--A--G-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----A---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CCTT-G-CC------A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAGTATA
gi|22651                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-T------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAA
gi|22650                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-T------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAattt
gi|22654                      : CGGCAT-CG-G-G--A-G-G--A--TCA------TA-----A-----A-------CT-T-T------GGAC--A-G-G--GAA--TA----T---G-AAG--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-ATA--A-T-AACT--A-ATAAattt
gi|22659                      : CGGC-T-CG-G----A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AA------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--G--C-C------A---T-A---------A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22657                      : CGGC-TGCG-G-G--A-G-A--A--T-A------AT-----A-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-ATG--AGTC-C------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22658                      : CGGC-G-AG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--C--C-C------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22660                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----A-----ATAAAA--CT-T-G------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T----C-AT---A-TAAACT--A-
gi|22661                      : CGGC-T-CG-C----A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A-G--T--T-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C--T---A-T-AACT--A-ATGATAT
gi|22662                      : CGGT-T-TG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------TT-T-T------C-AC--A-G-A--GAA--TG----T---G-A-G--T--T-C------A---A-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAtac
gi|22664                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-A-G--AGTC-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-GC--A---A--G--A--T--T-C-AT---------CT--A-ATAATATA
gi|22656                      : CGGC-T-CG-T-T--C-T-A--A--A-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GAA--TA----T-----A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22663                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TATAGTAA-----G-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAA---T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--G-AA--T--T-C-TT---A-T-
gi|22665                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------------------------------------TA----T---G-A-G--T--T-C------A---T-A------T--A--C--CT-T-G-CCA-A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT----ATAATATA
gi|22666                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-------------------------G-AC--A-G-A--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A------------CC--A---A--G-AA--T--CTT-AT---ATT-AATT--A-ACA
gi|22667                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-A------A---T-A------T--A------C-T-G-C-------A--G-AA--T----C-AT---A-A-TACT--A-GTAAtttt
gi|22668                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------
gi|22669                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--C-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-CAT----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AT--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATAT
gi|22671                      :  GGCGT-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G-----T-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---ATTG-AAG-T--C-CGAT---A-T-AACTAAA-ATAATGTAta
gi|22670                      :  GGT-C-CG-G-G--A-G-A--AC-T-A------TA-----A-----A-------CT-T-TTT----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--T-AA--T--C-C-ATATGA-T-AACT--A-AT
gi|22673                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC--G-G-A--TAT--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22672                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC------G--GAA--TA----TTATG-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22674                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A---------------------GC--A-T------A--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--C---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAA
gi|22675                      :  GGC-T-CG-GTG--A-G-T--A--T-A------TG-----AGA---A-------CA-T-T------G-AC--A-GCG--GAA--TA----T---G-A-G--G--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G--C--T--C-C-AT---A-ct
gi|22676                      :  GGC-T-CG-G-GCGA-G-AT-A--T-A------TA-----A-----A-------CT-CGT------GCGC--AAG-G--GAA--TA----T---G-A-GT-T--C-C------A---T-AATATCTT--A--CCGCT-T-G-CCTGA---A--G-GAATT--C-C-AT---A-T-AA-T--A-ATAATATA
gi|22677                      :   GC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A-------A-----A-----A-------CT-T-T------G-ACCAA-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-TTG-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
gi|22678                      :   GC-C-CG-A-G--G-G-ACGA--T-A------TA-----CCC---A-------CT-T-T--------AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A-G-----T-C------A-----A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-TA--T--C-C-AT---T-T-AAc
gi|22679                      :   GC-T-CG-G-A--A-G-A--A--T-A------TA-----A--------------T-T-T---------------------A--TA----C---G-A-C--T--C-C------A---T-A------T--ATGC--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---T-T-AG-T--A-ATA
gi|22680                      :     -T-CG-G-G----G-A--A--T-A------TC-----A-----A-------CT-T-TT-----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T-----A-G--T--C-C----------T-A------T--A--C--CT-C-G-CC--A---A--G-A---T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22681                      :       -CG-A-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A--------T-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22683                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-C-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---G-T-AACG--A-ATA
gi|22693                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----AT----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22682                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--G--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AAC
gi|22691                      :         G-G-G--A-G-A-----T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GA---TA----T-----A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22694                      :         G-A-G--A-G-A--A----A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA--------G-A-G--T--C-C------A---T-A------TC-A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAGTGTA
gi|22684                      :         G-G-G--ATG-A--A--T--------TAC----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAATGTAc
gi|22686                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-ACATGTATA-----T-----A-------CT-T-C------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22685                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G---G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CT--A---AAGA-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22696                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--G-G-G----A--TA----T---G-A-G--G--C--------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATTAT
gi|22692                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G-----T-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-t
gi|22688                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-GT-C--C-C------A---TGA------T--A--C--CC-T-G-C---A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGT
gi|22687                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-GT-C--C-C------A---TGA------T--A--C--CC-T-G-C---A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGTtac
gi|22689                      :         G-G-G--A-G-A--AA-T-A------TA-----C-----AT------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---A-A-G--T--C-C----------T-A------T--AC-C--CC-T-G-CT--A---G--A-AA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAtac
gi|22695                      :         G-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--ACG-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---A-T------T--A--C--CCAT-C-CC--A---AG-G-AA--T--C-C-AG---A-T-AAC---G-AT-ATGTA
gi|22690                      :         G-G-G--A-G-A--ACTT-A------TA-----C-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAC---T---G-ATG--T--C-C------AGCGT-A------T--A--C--CC-T-G-CC--AAC-A--G-AA--T--C-A-CT---A-T--ACG--A-ATActtac
gi|22697                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----G-----ATATCCTACT-T-CTGGTTGG-AC--A-G-G--GAAATTT----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--T--A--CC-T-G-CC--A---A--G-----T--C-C-AT---A-T-AA
gi|22699                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TAT----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----TAT-G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22698                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-T--T--C-C------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AATG--A-AT
gi|22700                      :          -G-A--A-G-A--A--T-AA-----TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-A-G--GA---TAATCTT---G-A-GTTA--C-CG-----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--T--C-CAAT---A-T-TACT--ATATAAT
gi|22701                      :            -G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22702                      :            -G--A-G-G--A--T-A------TA-----A-----A-------CTAT-T------G-AC--A-G-G--AAA--TG--------A-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--T--CC-T-G-CC--ATACG--A-AA--T--C-C-CT---A-T-AATT--A-A
gi|22703                      :              --A-G-T--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--G--C-C------A---C-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22704                      :                   -A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------A--T--C--CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAc
gi|22658                      :                     --A--T-A------TG-----G-----A-------TTCT-T------G-AC--A-G-A--GTA--TA----T---G-G-G--C--T-C------A---T-A------T--T--C--CC-T-G-TCA-A---A--G-AA--T------AT---A-T-
gi|22709                      :         cggcgagggaga--A--T-A------TG-----A-----A-------TTCT-T------G-AC--A-G-G--GTA--TA----C---G---G--A--CTC------A---T-A------T--T--C--CC-T-G-TC--A---A--aacgaata
gi|22686                      :                    t--A--T-A------TG-----G-----A-------TT-T-TT-----G-AC--A-G-G--GTA--TA----T---G---G--A--CTC------A---T-A------T--T--C--CC-T-G-TC--G---A----AG--T------AT---A-T-Aaactaataatata
gi|22706                      :        gggggaatacatg--A--T-A------TT-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A---------A--C--CC-T-G-C-------A--G-AA--T--C---AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAaacgaata
gi|22705                      :                     --A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAAT-TA----T---G-A-G--T--C-C------A---TAA------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--TTCC-C-AT---A-T-TACG--A-ATTATGTA
gi|22707                      :                        --T-A------TG-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----C---G-A-G--T--C-T------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-Ac
gi|22708                      :                           -A------TG-----A-----C-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GGA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22685                      :                                                 -------CT-T-T------A-GC--A-G-G--GTA--TA----T---G---G--A--C-C------A---T-A------T-----T--CC-T-G-TC--A---A----AG--T--G-T-AT---A-T-c
gi|22709                      :                                                   gggagaT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------G---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATAaaatccatataacgaata
gi|22710                      :                                                          -T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G-----T-C------A---T-A------T--AC-C--CC-T-G-C-------A--G-AAC-T--C-C-A----A-T-AACG--A-ATA
gi|22711                      :                                                            -T------A-AC--A-A-G--GAA--TA----T---G-A-T--T--C-C------A---T-G------T--A--C--CC-T-G-CC--A---C--A-AA--T--C-C-AT---------CT--A-ATAATGTAttctac
gi|22712                      :                                                                       C--A-G-G--GAA--TA----T---G-A-G--T--C-C------A---T-A------TATA--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22713                      :                                                                       C--A-G-GCAGAA--TA----C---G-A-G--T--C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22714                      :                                                                                  AA--TA----T---G-A-G--C--C-C------A---T-A------T--A--G--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22715                      :                                                                                       A----T---G-A-A--T--C-C------A---T-A------C--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATA
gi|22716                      :                                                                                                        --C-C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA





Alignments
lowQualScore                  :     2 1  0 1 00 0 1 11 22 0 222222  7777777777777777777  0 0 333333 1  11 1 0 11   11  2222 222 0 222 0 11  222222 000 1 222222 11 11 11  1 0 1  11 111 22 1  11 00 0 1  111 0 0   222 0        
lowQualScore                  :     . .  . . .. . . .. .. . ......  ...................  . . ...... .  .. . . ..   ..  .... ... . ... . ..  ...... ... . ...... .. .. ..  . . .  .. ... .. .  .. .. . .  ... . .   ... .        
lowQualScore                  :     1 0  7 3 99 6 3 55 00 6 333333  4444444444444444444  6 6 000000 1  99 1 6 33   33  2222 444 5 000 5 88  888888 999 6 111111 33 88 33  1 5 1  33 777 00 1  88 88 5 6  555 5 6   000 6        
consensus                     : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
Reference ( family-310 )      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22642                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-A--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22643                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22644                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAATGTA
gi|22645                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-GC-GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T-----C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-CAAT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22646                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--T-G-G--AAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CA-A-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22647                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-A---A-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T---CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATc
gi|22648                      : CGGC-T-CGCG-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-AT-----T--A--CA-CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
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gi|22650                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAA
gi|22651                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAattt
gi|22652                      : CGGC-T-TG-G-A--A-T-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CC-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-T---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--AC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ACAATATAattt
gi|22653                      : CGGC-T-CG-GCG--A-G-A--A--G-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----A---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CCTT-G-CC------A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAGTATA
gi|22654                      : CGGCAT-CG-G-G--A-G-G--A--TCA------TA-----A-----A-------CT-T-T------GGAC--A-G-G--GAA--TA----T---G-AA--G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-ATA--A-T-AACT--A-ATAA
gi|22655                      : CGG--T-CG-G-G--G-A-A--A--T-A------TA-----A-------------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---GAA---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22656                      : CGGC-T-CG-T-T--C-T-A--A--A-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GAA--TA----T-----A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22657                      : CGGC-TGCG-G-G--A-G-A--A--T-A------AT-----A-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-ATGAG-T--CC------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22658                      : CGGC-G-AG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-C--CC------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22659                      : CGGC-T-CG-G----A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AA------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A---------A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22660                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----A-----ATAAAA--CT-T-G------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T----C-AT---A-TAAACT--A-
gi|22661                      : CGGC-T-CG-C----A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C--T---A-T-AACT--A-ATGATAT
gi|22662                      : CGGT-T-TG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------TT-T-T------C-AC--A-G-A--GAA--TG----T---G-A---G-T--TC------A---A-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAtac
gi|22663                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TATAGTAA-----G-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAA---T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--G-AA--T--T-C-TT---A-T-
gi|22664                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----TGA-G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-GC--A---A--G--A--T--T-C-AT---------CT--A-ATAATATA
gi|22665                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------------------------------------TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CT-T-G-CCA-A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT----ATAATATA
gi|22666                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-------------------------G-AC--A-G-A--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A------------CC--A---A--G-AA--T--CTT-AT---ATT-AATT--A-ACA
gi|22667                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CA------A---T-A------T--A------C-T-G-C-------A--G-AA--T----C-AT---A-A-TACT--A-GTAAtttt
gi|22668                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------
gi|22669                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--C-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CCAT----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AT--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATAT
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gi|22671                      :  GGCGT-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---ATTG-AAG-T--C-CGAT---A-T-AACTAAA-ATAATGTA
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gi|22677                      :   GC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A-------A-----A-----A-------CT-T-T------G-ACCAA-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-TTG-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
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lowQualScore                  :     1 0  7 3 99 6 3 55 00 6 333333  4444444444444444444  6 6 000000 1  99 1 6 33   33  2222 444 5 000 5 88  888888 999 6 111111 33 88 33  1 5 1  33 777 00 1  88 88 5 6  555 5 6   000 6        
consensus                     : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
Reference ( family-310 )      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22642                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-A--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22643                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22644                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAATGTA
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gi|22647                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-A---A-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T---CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATc
gi|22648                      : CGGC-T-CGCG-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-AT-----T--A--CA-CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
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gi|22652                      : CGGC-T-TG-G-A--A-T-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CC-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-T---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--AC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ACAATATAattt
gi|22653                      : CGGC-T-CG-GCG--A-G-A--A--G-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----A---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CCTT-G-CC------A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAGTATA
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gi|22656                      : CGGC-T-CG-T-T--C-T-A--A--A-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GAA--TA----T-----A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
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gi|22658                      : CGGC-G-AG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-C--CC------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22659                      : CGGC-T-CG-G----A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AA------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A---------A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22660                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----A-----ATAAAA--CT-T-G------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T----C-AT---A-TAAACT--A-
gi|22661                      : CGGC-T-CG-C----A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C--T---A-T-AACT--A-ATGATAT
gi|22662                      : CGGT-T-TG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------TT-T-T------C-AC--A-G-A--GAA--TG----T---G-A---G-T--TC------A---A-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAtac
gi|22663                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TATAGTAA-----G-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAA---T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--G-AA--T--T-C-TT---A-T-
gi|22664                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----TGA-G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-GC--A---A--G--A--T--T-C-AT---------CT--A-ATAATATA
gi|22665                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------------------------------------TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CT-T-G-CCA-A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT----ATAATATA
gi|22666                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-------------------------G-AC--A-G-A--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A------------CC--A---A--G-AA--T--CTT-AT---ATT-AATT--A-ACA
gi|22667                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CA------A---T-A------T--A------C-T-G-C-------A--G-AA--T----C-AT---A-A-TACT--A-GTAAtttt
gi|22668                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------
gi|22669                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--C-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CCAT----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AT--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATAT
gi|22670                      :  GGT-C-CG-G-G--A-G-A--AC-T-A------TA-----A-----A-------CT-T-TTT----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--T-AA--T--C-C-ATATGA-T-AACT--A-ATta
gi|22671                      :  GGCGT-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---ATTG-AAG-T--C-CGAT---A-T-AACTAAA-ATAATGTA
gi|22672                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC------G--GAA--TA----TTATG-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22673                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC--G-G-A--TAT--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22674                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A---------------------GC--A-T------A--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--C---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAA
gi|22675                      :  GGC-T-CG-GTG--A-G-T--A--T-A------TG-----AGA---A-------CA-T-T------G-AC--A-GCG--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G--C--T--C-C-AT---A-ct
gi|22676                      :  GGC-T-CG-G-GCGA-G-AT-A--T-A------TA-----A-----A-------CT-CGT------GCGC--AAG-G--GAA--TA----T---G-A---GTT--CC------A---T-AATATCTT--A--CCGCT-T-G-CCTGA---A--G-GAATT--C-C-AT---A-T-AA-T--A-ATAATATA
gi|22677                      :   GC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A-------A-----A-----A-------CT-T-T------G-ACCAA-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-TTG-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
gi|22678                      :   GC-C-CG-A-G--G-G-ACGA--T-A------TA-----CCC---A-------CT-T-T--------AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--C-------A-----A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-TA--T--C-C-AT---T-T-AAc
gi|22679                      :   GC-T-CG-G-A--A-G-A--A--T-A------TA-----A--------------T-T-T---------------------A--TA----C---G-A---C-T--CC------A---T-A------T--ATGC--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---T-T-AG-T--A-ATA
gi|22680                      :     -T-CG-G-G----G-A--A--T-A------TC-----A-----A-------CT-T-TT-----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T-----A---G-T--CC----------T-A------T--A--C--CT-C-G-CC--A---A--G-A---T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22681                      :       -CG-A-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A--------T-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22682                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AAC
gi|22683                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-C-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---G-T-AACG--A-ATA
gi|22684                      :         G-G-G--ATG-A--A--T--------TAC----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAATGTA
gi|22685                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-----G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CT--A---AAGA-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22686                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-ACATGTATA-----T-----A-------CT-T-C------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22687                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-TC-CC------A---TGA------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGT
gi|22688                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-TC-CC------A---TGA------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGTtac
gi|22689                      :         G-G-G--A-G-A--AA-T-A------TA-----C-----AT------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---A-A---G-T--CC----------T-A------T--AC-C--CC-T-G-CT--A---G--A-AA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAtac
gi|22690                      :         G-G-G--A-G-A--ACTT-A------TA-----C-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAC---T---G-AT--G-T--CC------AGCGT-A------T--A--C--CC-T-G-CC--AAC-A--G-AA--T--C-A-CT---A-T--ACG--A-ATA
gi|22691                      :         G-G-G--A-G-A-----T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GA---TA----T-----A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22692                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-
gi|22693                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----AT----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22694                      :         G-A-G--A-G-A--A----A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA--------G-A---G-T--CC------A---T-A------TC-A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAGTGTA
gi|22695                      :         G-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--ACG-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---A-T------T--A--C--CCAT-C-CC--A---AG-G-AA--T--C-C-AG---A-T-AAC---G-AT-ATGTAc
gi|22696                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--G-G-G----A--TA----T---G-A---G-G--C-------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATTATcttac
gi|22697                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----G-----ATATCCTACT-T-CTGGTTGG-AC--A-G-G--GAAATTT----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--T--A--CC-T-G-CC--A---A--G-----T--C-C-AT---A-T-AAt
gi|22698                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---T-T--CC------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AATG--A-AT
gi|22699                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TAT----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----TAT-G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22700                      :          -G-A--A-G-A--A--T-AA-----TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-A-G--GA---TAATCTT---G-A---G-TTACCG-----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--T--C-CAAT---A-T-TACT--ATATAAT
gi|22701                      :            -G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22702                      :            -G--A-G-G--A--T-A------TA-----A-----A-------CTAT-T------G-AC--A-G-G--AAA--TG--------A-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-T-G-CC--ATACG--A-AA--T--C-C-CT---A-T-AATT--A-A
gi|22703                      :              --A-G-T--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---C-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22704                      :                   -A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------A--T--C--CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAc
gi|22705                      :                     --A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAAT-TA----T---G-A---G-T--CC------A---TAA------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--TTCC-C-AT---A-T-TACG--A-ATTATGTA
gi|22706                      :                     --A--T-A------TT-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--CC------A---T-A---------A--C--CC-T-G-C-------A--G-AA--T--C---AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
gi|22707                      :                        --T-A------TG-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----C---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-A
gi|22708                      :                           -A------TG-----A-----C-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GGA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22709                      :                                                         T-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------G---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATAc
gi|22710                      :                                                          -T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--AC-C--CC-T-G-C-------A--G-AAC-T--C-C-A----A-T-AACG--A-ATA
gi|22711                      :                                                            -T------A-AC--A-A-G--GAA--TA----T---G-A---T-T--CC------A---T-G------T--A--C--CC-T-G-CC--A---C--A-AA--T--C-C-AT---------CT--A-ATAATGTAttctac
gi|22712                      :                                                                       C--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------TATA--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22713                      :                                                                       C--A-G-GCAGAA--TA----C---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22714                      :                                                                                  AA--TA----T---G-A---G-C--CC------A---T-A------T--A--G--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22715                      :                                                                                       A----T---G-A---A-T--CC------A---T-A------C--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATA
gi|22716                      :                                                                                                       -T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA


blockSeqs                     :     A G    C      G CG CT   CATGTA  GATATCCTA                TGGTTG G  CA A   CA   AT  ATCT TAT   TGA   TA  ATCATG     G ATATCT AT TG CG  T   C  TG TAC TT A  AT      A  ATG       TAA
blockSeqs                     :     G .    T      G T  C    A       AATAAAA                  TT     C  C  C   C    T   A    GA    A     C   AT         G T      C  C  A   A   C  A  AC  AG A  G       G  A         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  A    .       TAGTAAG                  T      .  C  .   .    .   C    AT    T     C   G          A .      .  C  .   .   .  .  .   G  .  C       A  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       ATTTAAA                  .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       ATTTAAA                  .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AAAC                     .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AAAC                     .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AGAA                     .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       CCCA                     .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AAA                      .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       CAA                      .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       CAT                      .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       ATA                      .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       TAA                      .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         A  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       TT                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :     . .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :       .    .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CT                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         A  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       CA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :            .      . .  .    .       TA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         T  
blockSeqs                     :                   . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :                   . .  .    .       AA                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :                     .  .    .       AC                       .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :                     .  .    .       A                        .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         A  
blockSeqs                     :                        .    .       A                        .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         G  
blockSeqs                     :                             .       A                        .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .         .  
blockSeqs                     :                                                              .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .            
blockSeqs                     :                                                              .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .            
blockSeqs                     :                                                              .      .  .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .            
blockSeqs                     :                                                                        .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .            
blockSeqs                     :                                                                        .  .   .    .   .    .     .     .   .          . .      .  .  .   .   .  .  .   .  .  .       .  .            
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
finalCons                     : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA





Alignments
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lowQualScore                  :     . .  . . .. . . .. .. . ......  ...................  . . ...... .  .. . . ..   ..  .... ... . ... . ..  ...... ... . ...... .. .. ..  . . .  .. ... .. .  .. .. . .  ... . .   ... .        
lowQualScore                  :     1 0  7 3 99 6 3 55 00 6 333333  4444444444444444444  6 6 000000 1  99 1 6 33   33  2222 444 5 000 5 88  888888 999 6 111111 33 88 33  1 5 1  33 777 00 1  88 88 5 6  555 5 6   000 6        
consensus                     : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
Reference ( family-310 )      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22642                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-A--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22643                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22644                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAATGTA
gi|22645                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-GC-GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T-----C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-CAAT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22646                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--T-G-G--AAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CA-A-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22647                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-A---A-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T---CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATc
gi|22648                      : CGGC-T-CGCG-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-AT-----T--A--CA-CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22649                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------AA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---A-T--CCATCATGA---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATGAT
gi|22650                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAA
gi|22651                      : CAGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AAC-----CT-T-T------G-ACC-A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAattt
gi|22652                      : CGGC-T-TG-G-A--A-T-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CC-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-T---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--AC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ACAATATAattt
gi|22653                      : CGGC-T-CG-GCG--A-G-A--A--G-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----A---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CCTT-G-CC------A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAGTATA
gi|22654                      : CGGCAT-CG-G-G--A-G-G--A--TCA------TA-----A-----A-------CT-T-T------GGAC--A-G-G--GAA--TA----T---G-AA--G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-ATA--A-T-AACT--A-ATAA
gi|22655                      : CGG--T-CG-G-G--G-A-A--A--T-A------TA-----A-------------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---GAA---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22656                      : CGGC-T-CG-T-T--C-T-A--A--A-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GAA--TA----T-----A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-GCCC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22657                      : CGGC-TGCG-G-G--A-G-A--A--T-A------AT-----A-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-ATGAG-T--CC------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATA
gi|22658                      : CGGC-G-AG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-C--CC------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22659                      : CGGC-T-CG-G----A-G-A--A--T-A------TA-----A-----AA------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A---------A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAAT
gi|22660                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----A-----ATAAAA--CT-T-G------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T----C-AT---A-TAAACT--A-
gi|22661                      : CGGC-T-CG-C----A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C--T---A-T-AACT--A-ATGATAT
gi|22662                      : CGGT-T-TG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------TT-T-T------C-AC--A-G-A--GAA--TG----T---G-A---G-T--TC------A---A-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAtac
gi|22663                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TATAGTAA-----G-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAA---T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--G-AA--T--T-C-TT---A-T-
gi|22664                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----TGA-G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-GC--A---A--G--A--T--T-C-AT---------CT--A-ATAATATA
gi|22665                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------------------------------------TA----T---G-A---G-T--TC------A---T-A------T--A--C--CT-T-G-CCA-A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT----ATAATATA
gi|22666                      : CGGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-------------------------G-AC--A-G-A--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A------------CC--A---A--G-AA--T--CTT-AT---ATT-AATT--A-ACA
gi|22667                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CA------A---T-A------T--A------C-T-G-C-------A--G-AA--T----C-AT---A-A-TACT--A-GTAAtttt
gi|22668                      : CGGC-T-CG-G-G--G-G-A--T--T-T------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------
gi|22669                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--C-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CCAT----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AT--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATAT
gi|22670                      :  GGT-C-CG-G-G--A-G-A--AC-T-A------TA-----A-----A-------CT-T-TTT----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CA--A---A--T-AA--T--C-C-ATATGA-T-AACT--A-ATta
gi|22671                      :  GGCGT-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---ATTG-AAG-T--C-CGAT---A-T-AACTAAA-ATAATGTA
gi|22672                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC------G--GAA--TA----TTATG-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22673                      :  GGC-T-CA-G-G--T-G-A--A--T-A------TA-----ATTTAAA-------CT-T-T------G-AC--G-G-A--TAT--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-C-G-TT--A---A--G-AA--T--C-C-AC---A-T-AACT--A-ATA
gi|22674                      :  GGC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----A-----A---------------------GC--A-T------A--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--C---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-AGAA
gi|22675                      :  GGC-T-CG-GTG--A-G-T--A--T-A------TG-----AGA---A-------CA-T-T------G-AC--A-GCG--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G--C--T--C-C-AT---A-ct
gi|22676                      :  GGC-T-CG-G-GCGA-G-AT-A--T-A------TA-----A-----A-------CT-CGT------GCGC--AAG-G--GAA--TA----T---G-A---GTT--CC------A---T-AATATCTT--A--CCGCT-T-G-CCTGA---A--G-GAATT--C-C-AT---A-T-AA-T--A-ATAATATA
gi|22677                      :   GC-T-CG-G-G--A-G-A--A--T-A-------A-----A-----A-------CT-T-T------G-ACCAA-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-TTG-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
gi|22678                      :   GC-C-CG-A-G--G-G-ACGA--T-A------TA-----CCC---A-------CT-T-T--------AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--C-------A-----A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-TA--T--C-C-AT---T-T-AAc
gi|22679                      :   GC-T-CG-G-A--A-G-A--A--T-A------TA-----A--------------T-T-T---------------------A--TA----C---G-A---C-T--CC------A---T-A------T--ATGC--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---T-T-AG-T--A-ATA
gi|22680                      :     -T-CG-G-G----G-A--A--T-A------TC-----A-----A-------CT-T-TT-----G-AC--A-G-G--GAA--TA----T-----A---G-T--CC----------T-A------T--A--C--CT-C-G-CC--A---A--G-A---T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22681                      :       -CG-A-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A--------T-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G--A--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22682                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AAC
gi|22683                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-C-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---G-T-AACG--A-ATA
gi|22684                      :         G-G-G--ATG-A--A--T--------TAC----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAATGTA
gi|22685                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A---G--GAA--TA----T---G-----G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CT--A---AAGA-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAc
gi|22686                      :         G-G-G--G-G-A--A--T-ACATGTATA-----T-----A-------CT-T-C------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--A-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22687                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-TC-CC------A---TGA------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGT
gi|22688                      :         G-G-G--A-GGA--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T--------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-TC-CC------A---TGA------T--A--C--CC-T-G--C--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-AT-ATGTtac
gi|22689                      :         G-G-G--A-G-A--AA-T-A------TA-----C-----AT------CT-T-T------G-AC--A-G-G--AAA--TA----T---A-A---G-T--CC----------T-A------T--AC-C--CC-T-G-CT--A---G--A-AA--T--C-C--T---A-T-AACG--A-ATAtac
gi|22690                      :         G-G-G--A-G-A--ACTT-A------TA-----C-----T-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TAC---T---G-AT--G-T--CC------AGCGT-A------T--A--C--CC-T-G-CC--AAC-A--G-AA--T--C-A-CT---A-T--ACG--A-ATA
gi|22691                      :         G-G-G--A-G-A-----T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GA---TA----T-----A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22692                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-
gi|22693                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----AT----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A-----CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22694                      :         G-A-G--A-G-A--A----A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA--------G-A---G-T--CC------A---T-A------TC-A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATAGTGTA
gi|22695                      :         G-G-G--A-G-A--A--A-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--ACG-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---A-T------T--A--C--CCAT-C-CC--A---AG-G-AA--T--C-C-AG---A-T-AAC---G-AT-ATGTAc
gi|22696                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--G-G-G----A--TA----T---G-A---G-G--C-------A---T-A------T--A--C--C--T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATTATcttac
gi|22697                      :         G-G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----G-----ATATCCTACT-T-CTGGTTGG-AC--A-G-G--GAAATTT----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--T--A--CC-T-G-CC--A---A--G-----T--C-C-AT---A-T-AAt
gi|22698                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TA-----T-----A-------AT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---T-T--CC------A---T-A------T--A--C--TC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AATG--A-AT
gi|22699                      :          -G-G--A-G-A--A--T-A------TAT----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----TAT-G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22700                      :          -G-A--A-G-A--A--T-AA-----TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-A-G--GA---TAATCTT---G-A---G-TTACCG-----A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--T--C-CAAT---A-T-TACT--ATATAAT
gi|22701                      :            -G--A-G-A--A--T-A------TA-----C-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22702                      :            -G--A-G-G--A--T-A------TA-----A-----A-------CTAT-T------G-AC--A-G-G--AAA--TG--------A-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--T--CC-T-G-CC--ATACG--A-AA--T--C-C-CT---A-T-AATT--A-A
gi|22703                      :              --A-G-T--A--T-A------TA-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-G--CC------A---C-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATGTA
gi|22704                      :                   -A--A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------A--T--C--CC-T-G-CC--A---A--GAAA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATAc
gi|22705                      :                     --A--T-A------TA-----T-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAAT-TA----T---G-A---G-T--CC------A---TAA------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A----AA--TTCC-C-AT---A-T-TACG--A-ATTATGTA
gi|22706                      :                     --A--T-A------TT-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA---A----T---G-A---G-T--CC------A---T-A---------A--C--CC-T-G-C-------A--G-AA--T--C---AT---A-T-AACT--A-ATAATGTAc
gi|22707                      :                        --T-A------TG-----A-----A-------CT-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----C---G-A---G-T--CT------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-A
gi|22708                      :                           -A------TG-----A-----C-------CT-T-T------G-AC--A-C-G--GGA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-A-AACT--A-ATAATGTA
gi|22709                      :                                                         T-T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------G---T-A------T--A--C--CC-T-G-TC--A---A--G-AA--T--T-C-AT---A-T-AACT--A-ATAATATAc
gi|22710                      :                                                          -T-T------G-AC--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T---C------A---T-A------T--AC-C--CC-T-G-C-------A--G-AAC-T--C-C-A----A-T-AACG--A-ATA
gi|22711                      :                                                            -T------A-AC--A-A-G--GAA--TA----T---G-A---T-T--CC------A---T-G------T--A--C--CC-T-G-CC--A---C--A-AA--T--C-C-AT---------CT--A-ATAATGTAttctac
gi|22712                      :                                                                       C--A-G-G--GAA--TA----T---G-A---G-T--CC------A---T-A------TATA--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22713                      :                                                                       C--A-G-GCAGAA--TA----C---G-A---G-T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22714                      :                                                                                  AA--TA----T---G-A---G-C--CC------A---T-A------T--A--G--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--A-C-AT---A-T-AACG--A-ATA
gi|22715                      :                                                                                       A----T---G-A---A-T--CC------A---T-A------C--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACA--A-ATA
gi|22716                      :                                                                                                       -T--CC------A---T-A------T--A--C--CC-T-G-CC--A---A--G-AA--T--C-C-AT---A-T-AACG--A-ATA