lowQualScore : 11111111111111111111 1111111
lowQualScore : 00 0 111 0 11 0 66666666666666666666 0 0 11 0 0 00 6666666 22 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : .. . ... . .. . .................... . . .. . . .. ....... .. . . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 66 4 333 4 11 8 99999999999999999999 4 4 11 4 4 66 1111111 22 4 4 8 4 4 7 4 4 4 4 66 4 222222 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AC------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( gi|58277 ) : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----G-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-----T-T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58273 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58330 : TTGTAAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58358 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58278 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-T--G-G---AC--AG------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58364 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58335 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------T----GC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58385 : TTGTGAACAAG--GT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58317 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AA------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58348 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58381 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--GT------G----GC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58288 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G----A--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58345 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58332 : TTGTGACCAAT--AT-A---G-A--A-G---CA--AA------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58373 : TTGTAAACAAG--AT-A---G-A--A-C---CA--AG------G----GC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58387 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-----T-CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58333 : TTGTGAG-AAG--AT-A---A-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58371 : TTGTGAACAAT--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----CC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-------T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGG
gi|58295 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AT------G----GC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58279 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AT--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58355 : TTCTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----A-CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58274 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AC--AG------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58433 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58305 : TTGTGAATAAG--AT-A---G-A--A-G---AA--AC------A----GT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58408 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58289 : TTGTGAGCAAG--AT-A---G-A--G-GA--CA--CA------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58329 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---AA--AT------A----TG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58411 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CT--AG------G----GA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58447 : TTGTGAACAAG--AC-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-----T-C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58421 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AT--AC------A----GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-----A-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---CA--AG------G----G--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58445 : TTGTGAACATG--AT-A---G-A--A-G---CA--AT------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----C-T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAG--AC-A---G-A--G-GACACA--A-------------C-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58342 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-GACTCA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAA--AT-A---G-A--A-----CAC-AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-T---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58344 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-A---CA---------------GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-----T-C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58339 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58313 : TTGTGAACAAG--AT-A---A-A--G-GACTCA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58328 : TTGTGAACACG--AT-A---G-A--A-G---CA--AT------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----C-T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58365 : TTGCGAACAAA--AT-A---G-A--A-A---AT--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58296 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-A---AA--A-------------C-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----C-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-A---AC--AC------A----TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58375 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-GACTCA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58427 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---CA--AG------T----GC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-----T-T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58275 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58382 : TTGTGAACATG--TT-A---G-A--A-G---AT--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAG--ATTA---G-A--A-G---TAGAAG------ACACAGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--GG-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58368 : TTGTGAACAAG--AT-A---A-A--G-GACACA--A-------------C-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58399 : TTGTGAATAAG--GC-A---G-A--A-GA--CA--AA------A-----C-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58294 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G----A--AG------G----GCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-----T-A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58359 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-GACACA--A-------------C-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58320 : TTGTGAA-AAG--AT-A---G-A--G-A---CA--CA------A-----C-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58388 : TTGTGAACA-G--AT-A---G-A--G-GA--CA--AG------------C-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58310 : TTGTGAACAAA--AT-A---G-A--T-G---AA--AC------A----GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAG--AG-A---G-A--A-G---AA--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58318 : TTGGGAACAA---AT-A---G-T--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58343 : TTGTGGACAAG--AT-A---G-A--G-GACTC-----------G----GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-----T-C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58284 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AC--AC------G----AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAa
gi|58361 : TTGTGAACAAG--AT-A---GTA--A-A---C---AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58376 : TTGTGAACAGG--AT-A---G-A--G-GACTCA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCATAATGA-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58417 : TTGTGAACAAG--GT-A---G-A--A-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58370 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAcag
gi|58336 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-ATTACA---CA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGGgtggcaaa
gi|58369 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AT--AC------A----GC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-----T-C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-T--G-A---CA--CA------G-----C-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58390 : TTGTGAGCAAG--AT-A---A-A--A-GA--CA--AA------A----GT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58432 : TTTTGAACAAG--AA-A---G-A--A-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58440 : TTTTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AA--AC------A----GC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58407 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-ATCA-T---CA--AACCTCTCA----GC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58443 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AA--AC------A----GC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-----T-C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58322 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-T--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-----T-T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58276 : TTGTGAACAAG--AT-AGTGG-A--C-A---CA--CG--------------A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58319 : TTGTGAA-ACG--AT-ACT-G-A--C-A---TA---------------GC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58321 : TTGTGAACAAG--AT-A---G-A--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAA--GT-A---G-A--T-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-----T-C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58448 : TTGTGAACAAG--GT-A---G-A--A-G---AC--AC------A----GC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-----T-C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AC--AG------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58644 : TGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58641 : TGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AT--AC------A----GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-----A-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGa
gi|58622 : TGTGAACAAG--AT-A---G-A--A-G---AC--AG------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58633 : TGTGAACAAGATAT-A---G-A--ATG---CA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58624 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G----A--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAG--GT-A---G-A--A-G---AC--AT------G----GC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58632 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---AA--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----C-T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58630 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAGa
gi|58631 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58639 : TGTGATCAAG--AT-A-----A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58635 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---CA--AG------G----GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58634 : TGTGAACAAG--AT-A---A-A--A-G---AA--AG------G----GT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCA-----GTC--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAG--TT-----G-A--A-G---AC--AC------A----GC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58710 : GTGAACAAG--AA-A---G-A--A------A--AG------ACACAGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-----T-C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGG
gi|58740 : TGAACAAG--AT-A---G-T--G-G---AC--AC------A----GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--GG-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58739 : TGAAGAAG--AT-A---A-A--G-GACTCA---------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-----T-C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
Alignments
lowQualScore : 00 0 00 0 11 11 999999999 444444444 0 0 11 0 0 00 0 11111 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : .. . .. . .. .. ......... ......... . . .. . . .. . ..... .. . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 66 4 66 4 11 00 444444444 333333333 4 4 11 4 4 66 8 00000 88 4 4 8 4 4 4 4 4 4 55 4 111111 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-NA------A------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( family-31 ) : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58273 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58274 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AC------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58275 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58276 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-T--G--GACAC-----A------C-G---A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58277 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-G-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58278 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-T--G--G-AC------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58279 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AT------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58284 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AC------A------C-GAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCA
gi|58288 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G--A------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58289 : TTGTGAGCAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------CAGGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAG--AC-A--G-A--G--G-AC------A------C-AAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAG--ATTA--G-A--A--G-TAGAAGACA------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-T--G--A-CA-------------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58294 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G--A------A------G-GGCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58295 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58296 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--A-AA------A------C-----A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--A-AC------A------C-ATC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-AA------A------T-ATG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58305 : TTGTGAATAAG--AT-A--G-A--A--G-AA------A------C-AGT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAG--AG-A--G-A--A--G-AA------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58310 : TTGTGAACAAA--AT-A--G-A--T--G-AA------A------C-AGC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58313 : TTGTGAACAAG--AT-A--A-A--G--G-AC------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58317 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------A-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58318 : TTGGGAACAA---AT-A--G-T--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58319 : TTGTGAA-ACG--AT-ACTG-A-------CA-------------T-AGC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58320 : TTGTGAA-AAG--AT-A--G-A--G--A-CA-------------C-AAC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58321 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58322 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-T--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58328 : TTGTGAACACG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58329 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58330 : TTGTAAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58332 : TTGTGACCAAT--AT-A--G-A--A--G-CA------A------A-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58333 : TTGTGAG-AAG--AT-A--A-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58335 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-TGC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58336 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-ATTA----C-------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAA--GT-A--G-A--T--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58339 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58342 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58343 : TTGTGGACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------T------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58344 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--A-CA----------------GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAa
gi|58345 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAA--AT-A--G-A--A----CAC-----A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58348 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-CA------A------G-GG--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--T-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58355 : TTCTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCAAC-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58358 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58359 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------A------C-AAC-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GTC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58361 : TTGTGAACAAG--AT-A--GTA--A--A-C-------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58364 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58365 : TTGCGAACAAA--AT-A--G-A--A--A-AT------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58368 : TTGTGAACAAG--AT-A--A-A--G--G-AC------A------C-AAC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58369 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AT------A------C-AGC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58370 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CA
gi|58371 : TTGTGAACAAT--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GCC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T--------AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGGgtggcaaa
gi|58373 : TTGTAAACAAG--AT-A--G-A--A--C-CA------A------G-GGC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58375 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-AC------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58376 : TTGTGAACAGG--AT-A--G-A--G--G-AC------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-TAATGAC--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58381 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------G------T-GGC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58382 : TTGTGAACATG--TT-A--G-A--A--G-AT------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58385 : TTGTGAACAAG--GT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58387 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58388 : TTGTGAACA-G--AT-A--G-A--G--GACA------A---------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58390 : TTGTGAGCAAG--AT-A--A-A--A--GACA------A------A-AGT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------T-GGC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58399 : TTGTGAATAAG--GC-A--G-A--A--GACA------A--------AAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58407 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-ATCA--T-CA------AACCTCTC-AGC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58408 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58411 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CT------A------G-GGA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58417 : TTGTGAACAAG--GT-A--G-A--A--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58421 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AT------A------C-AGC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGcag
gi|58427 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--G--G-CA------A------G-TGC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58432 : TTTTGAACAAG--AA-A--G-A--A--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58433 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58440 : TTTTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AA------A------C-AGC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58443 : TTGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AA------A------C-AGC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-T-----C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58445 : TTGTGAACATG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58447 : TTGTGAACAAG--AC-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58448 : TTGTGAACAAG--GT-A--G-A--A--G-AC------A------C-AGC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-T-----C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AC------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58622 : TGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AC------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58624 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G--A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAG--TT----G-A--A--G-AC------A------C-AGC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58630 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58631 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58632 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-AA------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58633 : TGTGAACAAGATAT-A--G-A--AT-G-CA----------------GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58634 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-AA------A------G-GGT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCAGT-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58635 : TGTGAACAAG--AT-A--A-A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAG--GT-A--G-A--A--G-AC------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58639 : TGTGATCAAG--AT-A----A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58641 : TGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-AT------A------C-AGC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58644 : TGTGAACAAG--AT-A--G-A--A--G-CA------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58710 : GTGAACAAG--AA-A--G-A--AAAG-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGGa
gi|58739 : TGAAGAAG--AT-A--A-A--G--G-AC------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58740 : TGAACAAG--AT-A--G-T--G--G-AC------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
Alignments
lowQualScore : 0 00 00 00 666666666 333333333 0 0 11 0 0 00 0 11111 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : . .. .. .. ......... ......... . . .. . . .. . ..... .. . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 4 66 66 66 999999999 666666666 4 4 11 4 4 66 8 00000 88 4 4 8 4 4 4 4 4 4 55 4 111111 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-N------A------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( family-31 ) : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GN-A------A------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58273 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58274 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-C------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58275 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58276 : TTGTGAACAAGAT-A--GT--G--GA-C------A------C-ACG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58277 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-G-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58278 : TTGTGAACAAGAT-A--GT--G--GA-C------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58279 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-T------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58284 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-C------A------C-GAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCA
gi|58288 : TTGTGAACAAGAT-A--G---A--GG-A------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58289 : TTGTGAGCAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------CAGGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAGAC-A--GA--G--GA-C------A------C-AAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAGATTA--GA--A--GT-AGAAGACA------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAGAT-A--GT-----GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58294 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--G--A------A------G-GGCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58295 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58296 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--AA-A------A------C-----A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--AA-C------A------C-ATC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAGAT-A--AA--A--GA-A------A------T-ATG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58305 : TTGTGAATAAGAT-A--GA--A--GA-A------A------C-AGT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAGAG-A--GA--A--GA-A------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58310 : TTGTGAACAAAAT-A--GA--T--GA-A------A------C-AGC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58313 : TTGTGAACAAGAT-A--AA--G--GA-C------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58317 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------A-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58318 : TTGGGAACAA-AT-A--GT--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58319 : TTGTGAA-ACGAT-ACTGA--C--AT-A----------------GC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58320 : TTGTGAA-AAGAT-A--GA-----GA-C------A------C-AAC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58321 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58322 : TTGTGAACAAGAT-A--GT--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58328 : TTGTGAACACGAT-A--GA--A--GC-A------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58329 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58330 : TTGTAAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58332 : TTGTGACCAATAT-A--GA--A--GC-A------A------A-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58333 : TTGTGAG-AAGAT-A--AA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58335 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-TGC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58336 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--T--TA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAAGT-A--GA--T--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58339 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58342 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58343 : TTGTGGACAAGAT-A--GA--G--GA-C------T------C-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58344 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A------------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAa
gi|58345 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAAAT-A--GA--A--CA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58348 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GC-A------A------G-GG--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--TA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58355 : TTCTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCAAC-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58358 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58359 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------A------C-AAC-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GTC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58361 : TTGTGAACAAGAT-A--GT--A--AA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58364 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58365 : TTGCGAACAAAAT-A--GA--A--AA-T------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58368 : TTGTGAACAAGAT-A--AA--G--GA-C------A------C-AAC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58369 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-T------A------C-AGC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58370 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CA
gi|58371 : TTGTGAACAATAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GCC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T--------AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGGgtggcaaa
gi|58373 : TTGTAAACAAGAT-A--GA--A--CC-A------A------G-GGC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58375 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GA-C------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58376 : TTGTGAACAGGAT-A--GA--G--GA-C------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-TAATGAC--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58381 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------G------T-GGC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58382 : TTGTGAACATGTT-A--GA--A--GA-T------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58385 : TTGTGAACAAGGT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58387 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58388 : TTGTGAACA-GAT-A--GA--G--GA-C------A--------AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58390 : TTGTGAGCAAGAT-A--AA--A--GACA------A------A-AGT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------T-GGC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58399 : TTGTGAATAAGGC-A--GA--A--GA-C------A------A-AAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58407 : TTGTGAACAAGAT-A--GATCA--TC-A------AACCTCTC-AGC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58408 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GAC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58411 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-T------A------G-GGA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58417 : TTGTGAACAAGGT-A--GA--A--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58421 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-T------A------C-AGC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGcag
gi|58427 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--G--GC-A------A------G-TGC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58432 : TTTTGAACAAGAA-A--GA--A--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58433 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58440 : TTTTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-A------A------C-AGC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58443 : TTGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-A------A------C-AGC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-T-----C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58445 : TTGTGAACATGAT-A--GA--A--GC-A------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58447 : TTGTGAACAAGAC-A--GA--A--GC-A------A------G-GGC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58448 : TTGTGAACAAGGT-A--GA--A--GA-C------A------C-AGC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-T-----C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-C------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58622 : TGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-C------A------G-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58624 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--G--A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAGTT----GA--A--GA-C------A------C-AGC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58630 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58631 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58632 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--GA-A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58633 : TGTGAACAAGAT-A--TA--G--AA-T------G------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58634 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--GA-A------A------G-GGT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCAGT-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58635 : TGTGAACAAGAT-A--AA--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAGGT-A--GA--A--GA-C------A------T-GGC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58639 : TGTGATCAAGAT-A---A--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58641 : TGTGAACAAGAT-A--GA--A--GA-T------A------C-AGC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58644 : TGTGAACAAGAT-A--GA--A--GC-A------A------G-GGT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58710 : GTGAACAAGAA-A--GA--AAAGA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGGa
gi|58739 : TGAAGAAGAT-A--AA--G--GA-C------T------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58740 : TGAACAAGAT-A--GT--G--GA-C------A------C-AGC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 00 2 3333333 0 0 11 0 0 00 0 11111 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : ....... ..... .. . ....... . . .. . . .. . ..... .. . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 3333333 00000 66 3 4444444 4 4 11 4 4 55 8 00000 88 4 4 8 4 4 4 4 4 4 55 4 111111 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( family-31 ) : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58273 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58274 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58275 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58276 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-CG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58277 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-G-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58278 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58279 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58284 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCA
gi|58288 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GA-A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58289 : TTGTGAGCAAGAT-------AGA-----G--GACA---CAG-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAGATTAGAAGTAGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAGAT-------AGT--------GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58294 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GA-A---G-G-GCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58295 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58296 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AAAA---C------A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AACA---C-A-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---T-A-TG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58305 : TTGTGAATAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAGAG-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58310 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----T--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58313 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58317 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58318 : TTGGGAACAA-AT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58319 : TTGTGAA-ACGAT-------ACT--------GACA---T-A-GC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58320 : TTGTGAA-AAGAT-------AGA--------GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58321 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58322 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58328 : TTGTGAACACGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58329 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58330 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58332 : TTGTGACCAATAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58333 : TTGTGAG-AAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58335 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-T-GC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58336 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----T--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAAGT-------AGA-----T--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58339 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58342 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58343 : TTGTGGACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58344 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A-----A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAa
gi|58345 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----A--CACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58348 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-G-G--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58355 : TTCTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCAAC-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58358 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58359 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58361 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----A--AACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58364 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58365 : TTGCGAACAAAAT-------AGA-----A--AATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58368 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58369 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58370 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CA
gi|58371 : TTGTGAACAATAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-CC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T--------AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGGgtggcaaa
gi|58373 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--CCAA---G-G-GC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58375 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58376 : TTGTGAACAGGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-TAATGAC--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58381 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAG---T-G-GC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58382 : TTGTGAACATGTT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58385 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58387 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58388 : TTGTGAACA-GAT-------AGA-----G--GACA-----A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58390 : TTGTGAGCAAGAT-------AAA-----A--GACA---A-AAGT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58399 : TTGTGAATAAGGC-------AGA-----A--GACA---A-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58407 : TTGTGAACAAGAT-------AGATCATCA--AACCTCTC-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58408 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58411 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCTA---G-G-GA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58417 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58421 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGcag
gi|58427 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-T-GC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58432 : TTTTGAACAAGAA-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58433 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58440 : TTTTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58443 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-T-----C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58445 : TTGTGAACATGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58447 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58448 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-T-----C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58622 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58624 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GA-A---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAGTT--------GA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58630 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58631 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58632 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58633 : TGTGAACAAGAT-------ATA-----G--AATG---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58634 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCAGT-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58635 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58639 : TGTGATCAAGAT-------A-A-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58641 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58644 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58710 : GTGAACAAGAA-------AGA-----AAAGACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGGa
gi|58739 : TGAAGAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58740 : TGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 00 2 3333333 0 0 11 0 0 00 0 11111 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : ....... ..... .. . ....... . . .. . . .. . ..... .. . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 3333333 00000 66 3 4444444 4 4 11 4 4 55 8 00000 88 4 4 8 4 4 4 4 4 4 55 4 111111 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( family-31 ) : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58273 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58274 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58275 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58276 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-CG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58277 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-G-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58278 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58279 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58284 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCA
gi|58288 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GA-A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58289 : TTGTGAGCAAGAT-------AGA-----G--GACA---CAG-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAGATTAGAAGTAGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAGAT-------AGT--------GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58294 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GA-A---G-G-GCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58295 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58296 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AAAA---C------A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AACA---C-A-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---T-A-TG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58305 : TTGTGAATAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAGAG-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58310 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----T--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58313 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58317 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58318 : TTGGGAACAA-AT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58319 : TTGTGAA-ACGAT-------ACT--------GACA---T-A-GC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58320 : TTGTGAA-AAGAT-------AGA--------GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58321 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58322 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58328 : TTGTGAACACGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58329 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58330 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58332 : TTGTGACCAATAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58333 : TTGTGAG-AAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58335 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-T-GC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58336 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----T--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAAGT-------AGA-----T--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58339 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58342 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58343 : TTGTGGACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58344 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A-----A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAa
gi|58345 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----A--CACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58348 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-G-G--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58355 : TTCTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCAAC-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58358 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58359 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58361 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----A--AACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58364 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58365 : TTGCGAACAAAAT-------AGA-----A--AATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58368 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58369 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58370 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CA
gi|58371 : TTGTGAACAATAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-CC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T--------AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGGgtggcaaa
gi|58373 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--CCAA---G-G-GC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58375 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58376 : TTGTGAACAGGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-TAATGAC--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58381 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAG---T-G-GC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58382 : TTGTGAACATGTT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58385 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58387 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58388 : TTGTGAACA-GAT-------AGA-----G--GACA-----A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58390 : TTGTGAGCAAGAT-------AAA-----A--GACA---A-AAGT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58399 : TTGTGAATAAGGC-------AGA-----A--GACA---A-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58407 : TTGTGAACAAGAT-------AGATCATCA--AACCTCTC-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58408 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58411 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCTA---G-G-GA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58417 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58421 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGcag
gi|58427 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-T-GC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58432 : TTTTGAACAAGAA-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58433 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58440 : TTTTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58443 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-T-----C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58445 : TTGTGAACATGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58447 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58448 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-T-----C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58622 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58624 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GA-A---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAGTT--------GA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58630 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58631 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58632 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58633 : TGTGAACAAGAT-------ATA-----G--AATG---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58634 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCAGT-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58635 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58639 : TGTGATCAAGAT-------A-A-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58641 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58644 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58710 : GTGAACAAGAA-------AGA-----AAAGACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGGa
gi|58739 : TGAAGAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58740 : TGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
blockSeqs : TAGAAGT TCATC C TCTCA AT CA AGTATA G TCAGGAT
blockSeqs : . . C CAG AT A . G .
blockSeqs : . . C AAA . C . G .
blockSeqs : . . A GA . A . G .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . T CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . A GA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C CG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A TA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C AG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C TA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A TG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . C AG . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C GT . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A CG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A GA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . T CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . T CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . T GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C TG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C TG . . . . .
blockSeqs : . . A AA . . . . .
blockSeqs : . . T GG . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . T CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C GT . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A TG . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C GA . . . . .
blockSeqs : . . C GA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . T GG . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . A CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . T TG . . . . .
blockSeqs : . . A GG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . C GG . . . . .
blockSeqs : . . C CA . . . . .
blockSeqs : . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
finalCons : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 00 2 3333333 0 0 11 0 0 00 0 11111 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 111111 0 0 11111 0 0 0 1 0 1111111 0
lowQualScore : ....... ..... .. . ....... . . .. . . .. . ..... .. . . . . . . . . . .. . ...... . . ..... . . . . . ....... .
lowQualScore : 3333333 00000 66 3 4444444 4 4 11 4 4 55 8 00000 88 4 4 8 4 4 4 4 4 4 55 4 111111 4 8 00000 4 4 4 6 4 3333333 4
consensus : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
Reference ( family-31 ) : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GANA---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58273 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58274 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58275 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTA
gi|58276 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-CG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAA-AGT-G---TA-A--ACCCT-ACT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58277 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-G-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58278 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58279 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ACAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGTAGGTCAAGG
gi|58281 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AA-CCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58283 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGATCAAAG
gi|58284 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTATCCA-TGGAG-AGA-G---TA-A--ACCCT-TTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCA
gi|58288 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GA-A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CA-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58289 : TTGTGAGCAAGAT-------AGA-----G--GACA---CAG-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAGTGGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58290 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC---A-G-G-------T-C-AAGGTCAAGG
gi|58291 : TTGTGAACAAGATTAGAAGTAGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-AGA-GGG-TA-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58292 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTG-ACA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCTCATT------G-A-T-----TT-TG-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58293 : TTGTGAACAAGAT-------AGT--------GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-ATCCCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-ACA-G-G-------T-CAAA-GTCAAGG
gi|58294 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GA-A---G-G-GCAA-TTC-T--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAAACT-TCCACACAA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-A-----TT-TC-A-C-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58295 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58296 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AAAA---C------A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACGCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTGATCAAAG
gi|58297 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--AACA---C-A-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58301 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---T-A-TG-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCT-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAGAGGTCAAGG
gi|58305 : TTGTGAATAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GT-C-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-ACCACA-AA-TG-TTGCCCA-T-GAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58306 : TTGTGAACAAGAG-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TA-TTGAGCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACCCT-ATC------C-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58310 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----T--GAAA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TACACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-T--TCTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58313 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--CAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58317 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58318 : TTGGGAACAA-AT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGACCA-TGGAG-AAA-GGA-TGAA--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAA
gi|58319 : TTGTGAA-ACGAT-------ACT--------GACA---T-A-GC-A-TTCGT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58320 : TTGTGAA-AAGAT-------AGA--------GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGATGAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-ATT-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58321 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TGAACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--A--CT-ATT------G-A-T-----TG-TC-A-AGG-G-------T-TATAGGTCAAGG
gi|58322 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAACATCA-T-----T--AAACCT-TCCACA-AAATG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TTCTC-T-A-G-G-------T-CAAGGATCAAAG
gi|58328 : TTGTGAACACGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACCT-TTCATA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58329 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AAATG-TCGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58330 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------A-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58332 : TTGTGACCAATAT-------AGA-----A--GCAA---A-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58333 : TTGTGAG-AAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCTCA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CGAGGGTCAAAG
gi|58335 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-T-GC-G-TTCAT--T-AG-AGAT--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TTGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58336 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----T--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCT-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGACCG-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-AGG-G-------C-CAAAGGTGAAGG
gi|58337 : TTCTGAACAAAGT-------AGA-----T--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TGT-T-----C--AAACCT-TTTACA-AA-TG-TTGACGG-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58339 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-AGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58342 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TT-CCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGAGCAAAG
gi|58343 : TTGTGGACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--TAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-T-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGACAA
gi|58344 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A-----A---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAGCCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCAA-TGGAG-AAA-GGA-TG-A--CCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAa
gi|58345 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACTT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAT-AGA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-CC-A-A-A-G-------T-C-AAGGTCAAAG
gi|58347 : TTGTGAACAAAAT-------AGA-----A--CACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGG-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58348 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TTAAG-AGT-GGG-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAACGGTCAAGG
gi|58351 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-G-G--A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCC-TGCGCA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--GCCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-GAGGTCA
gi|58354 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--TACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGT-TG-A--ATTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTAAAG
gi|58355 : TTCTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCAAC-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-CGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCC-ATT------G-G-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58358 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58359 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACA---C-A-AC-A-TCCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGAAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-AAT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58360 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-TC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-G-G-G-------T-CAA
gi|58361 : TTGTGAACAAGAT-------AGT-----A--AACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----A--AAACCT-TCCACA-AG-TG-TTGCTCA-TGGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58364 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AC-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58365 : TTGCGAACAAAAT-------AGA-----A--AATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGTA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCACA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58368 : TTGTGAACAAGAT-------AAA-----G--GACA---C-A-AC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TA-G--ACCCT-ATTAGTATAG-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAATGTCAAGG
gi|58369 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTTAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAATTT-TACACA-GA-TT-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-TAAAGTTCAAGG
gi|58370 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AC-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCATA-AA-TG-TTGCTCA-AGGAG-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CA
gi|58371 : TTGTGAACAATAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-CC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T--------AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-GAG-------T-CAAAGTTCAAGGgtggcaaa
gi|58373 : TTGTAAACAAGAT-------AGA-----A--CCAA---G-G-GC-A-TTCAA--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-A-------T-CAATGGTCAAAG
gi|58375 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAAC-T-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58376 : TTGTGAACAGGAT-------AGA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-TAATGAC--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGG-GAA-TG-A--ACCC--ATT------G-A-T-----TT-TC-C-A-G-G-------T-CAAGGGTCAA
gi|58381 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAG---T-G-GC-A-TTCAC--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGGGCCAAGG
gi|58382 : TTGTGAACATGTT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACG-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATG------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58385 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TA-TTGCCCT-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------GACAAAGGTCAAGG
gi|58387 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----CCAAAACCT-TCCACA-AA-T--TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------GAA-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58388 : TTGTGAACA-GAT-------AGA-----G--GACA-----A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----CC-AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-G--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-CA
gi|58390 : TTGTGAGCAAGAT-------AAA-----A--GACA---A-AAGT-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGTCCC-TGGCA-ATA-GGA-TG-A--ACTCT-ATT------A-A-T-----CT-TC-A-AGG-G-------T-CAAAGGTCAAGG
gi|58393 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTTATATC-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-T-A-A-G-------T-C-AAGGCCA
gi|58399 : TTGTGAATAAGGC-------AGA-----A--GACA---A-A-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-GA-TG-TTGCCCA-TAGAG-AGA-GGG-TA-A--ACTTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTTAAAG
gi|58407 : TTGTGAACAAGAT-------AGATCATCA--AACCTCTC-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-CGA-GGA-TG-C--ACCCT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-C-------T-CAAGGGGCAAAG
gi|58408 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-AC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTGCATA-TGAAG-AGA-TGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-AC-A-A-G-G-------T-CAAGTGTCAAAG
gi|58411 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCTA---G-G-GA-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GTA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CA
gi|58417 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-ATGA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCTCA-TGGAG-AGG-GGA-TG-A--ACTGT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGATCA
gi|58421 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGGcag
gi|58427 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----G--GCAA---G-T-GC-A-TTTAT--C-AG-AAAA--TCA-T-----T--CAACCTATCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--G-CCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-T-G-------T-CAAAGGTCAAAG
gi|58432 : TTTTGAACAAGAA-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGT-GGA-TG-A--ATCTG-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCGA
gi|58433 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAC--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-CCCACA-AA-TG-TTGCCCA-T--AA-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TT-A-A-G-G-------T-C
gi|58440 : TTTTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-ACTTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TGTTTGTACATTGGAG-AGA-GGATTG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGG
gi|58443 : TTGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GAAA---C-A-GC-A-TTCAA--C-TG-AAAA--TCA-T-----C--AAACAT-TCTACA-AA-TG-TTACCCA-TGGAA-AGA-GAA-TG-A--ACCCT-ATC------A-G-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGGTCAAAG
gi|58445 : TTGTGAACATGAT-------AGA-----A--GCAA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-C-----T--AAATCT-TCCACA-AA-TG-TTACTTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-GTT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTCAAAG
gi|58447 : TTGTGAACAAGAC-------AGA-----A--GCAA---G-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCCAA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAGGGTC
gi|58448 : TTGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCATATT-AG-AGGA--TTA-T-----C--AAACCT-TGCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGAAG-AAA-GGA-TG-A--AGCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGTAATCAAAG
gi|58621 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-AGA-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCA
gi|58622 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GACA---G-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AT-TG-TTGACCA-TGGAG-GGA-GGA-TA-A--ACTCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------C-CAAGGATCAAAG
gi|58624 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GA-A---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58625 : TGTGAACAAGTT--------GA-----A--GACA---C-A-GC-A-TCCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58630 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58631 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--T-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TTTCCCA-TGGGG-AGA-GAA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58632 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-C-----T--AAACTT-TCCAGA-AA-TG-TTACCTA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-CAAGGGTCAA
gi|58633 : TGTGAACAAGAT-------ATA-----G--AATG---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCTACA-AA-TG-TTGCCTA-TGGAG-ATA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------T-A-TTATTGTT-TC-A-A-G-G-------T-CAAAGGTCAAGGa
gi|58634 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GAAA---G-G-GT-A-TTCAT--CCAGCAGGA--TCAGT-----C--AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-C--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TCAA-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58635 : TGTGAACAAGAT-------AAA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----TA-AAACCT-TGCACA-CA-TG-TTTCCCA-TGGAG-AGA--GA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-CAGGGTTCAAAG
gi|58636 : TGTGAACAAGGT-------AGA-----A--GACA---T-G-GC-A-TTCAT--C-AA-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGTCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TC-TC-A-A-G-G-------
gi|58639 : TGTGATCAAGAT-------A-A-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCT-TGCGCA-CA-TG-TT-TCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-T--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-GTCAGGATT-CAAAGGTCAAGG
gi|58641 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GATA---C-A-GC-T-TTCTT--T-AG-AGAA--TCA-A-----C--AAACCT-TCCACA-AA-TG-TTGCCCA-TAGAC-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-T-------T-GAAAGGTCAAGG
gi|58644 : TGTGAACAAGAT-------AGA-----A--GCAA---G-G-GT-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--ATACCT-TCCAAA-AG-TG-TTGCCCA-TAAAG-AGA-GGA-TA-A--ACCTT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-A-G-------T-AAAGGGTCAA
gi|58710 : GTGAACAAGAA-------AGA-----AAAGACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGGA--TCA-T-----C--AAACCA-TCCACA-AA-TA-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TA-A-G-G-G-------T-CAAAGTTCAAGGa
gi|58739 : TGAAGAAGAT-------AAA-----G--GACT---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAC--TTA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TGGAG-AGA-GGA-TG-A--ATCAT-ATT------G-A-T-----TT-TC-A-A-G-G-------T-C-AAGGTCA
gi|58740 : TGAACAAGAT-------AGT-----G--GACA---C-A-GC-A-TTCAT--C-AG-AGAA--TCA-T-----C--AAACCT-TTCACA-AA-TG-TTGCCCA-TG--G-ATA-GGT-TA-A--ACCCT-ATT------G-A-T-----TT-TC-G-A-G-G-------T-CAAAGGTCA