lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   11                                  
lowQualScore                  :     1  22   2  0  11 0 0 1111 0 11  999999999  333333 0 66666666666666666 11 11 3  0 3333 444 11111 0   1 0 22222222 1 33333  1 3333 2 33333333  3333 222222 11   00 11 3333  555 0 111    1 222      
lowQualScore                  :     .  ..   .  .  .. . . .... . ..  .........  ...... . ................. .. .. .  . .... ... ..... .   . . ........ . .....  . .... . ........  .... ...... ..   .. .. ....  ... . ...    . ...      
lowQualScore                  :     0  22   4  8  11 5 5 7777 5 88  333333333  444444 5 77777777777777777 33 55 2  5 3333 444 33333 5   6 5 77777777 1 00000  1 9999 3 77777777  7777 000000 77   99 00 8888  000 7 333    6 888      
consensus                     : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
Reference ( gi|89395 )        : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----A------G--CTGT-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89396                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-T-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89397                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---C-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89399                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GC-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89405                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-C-A--A-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89400                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CTTC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89403                      : TATG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CTGG-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89401                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-T-G--A-A--------TT----A------G--CTGT-A--A-----G---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89404                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CCGCAA--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89406                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-T-G--A-A--------TT----A------G--CCAC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89408                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GC------T-A-----------------A--C--A-AT-T----G---C-----A-TTGAT-G--------A-C-----AT-C-G--T-A--------TT----A------G--ATGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89410                      : TGTA-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--GTGC-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89409                      : TGTG-GC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GA------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-GATCGATGTA-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--TTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TT
gi|89411                      : TGTG-AC--GTC-GC-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-ACAGTTGCATTGTGAGTAA--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------A--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89412                      : TGTG-AC--GTC-AC-AT--T--------T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--T-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TT-T-T---TTATTT
gi|89413                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AA---------AT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----G-TTA-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTAC-A--A----TGTATT-T---TTGT-T---TTGTTT
gi|89416                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-
gi|89415                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACTAATGGCA-GT------G----------------------C--A-GT-T----T---C-----A-TTG-T-GGA------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------A--CTG--A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTTTtg
gi|89414                      : TGTG-AC--GTC-G--AT--T-G-T----CCG--AC---------GT------A-A-----------------A--T--A-GT-TT---G---C-----AACTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CTGC-A--AA---TG---T-T---T-GT-T---TTCTTT
gi|89420                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-T-T----C-G--AC---------AT------A-A-----------------G--C--G-GT-T----G---C-----C-CTG-T-G--------A-C-----AT-C-A--T-A--------TT----A------G--CTGC-A------------T-T---T--T-T---TTCTTT
gi|89418                      : TGTG-AC--GTCTGT-AT--TAG-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----GC--C-----A-TTG-T-G--------A-CG----GT-C-A--A-A--------TT----A------GTTCCGCAA--A----TGT--T-T---TTGTGT---TTCTTT
gi|89402                      : TGTG-AC--GTC-GTTAT--T-G-T----C-G--ACA--------GT------G-------------------A--C--C-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-T-G----A--------TT----A------G--CT-T----A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89423                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACT--------GT------G-A-----------------A--C----GT-T----G---CACATAA-TTG-T-G--------G-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--
gi|89417                      : TGTA-ACCCGTT-GT-AT--T-T-T----G-GTTAC---------AT------G-A-----------------A--C--AAGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-G-----TT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----CG---T-T---TTGT-T---TTTT
gi|89398                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-A-----GT-T-G--T-A------------------------CTGTCA--A----CG---T-
gi|89419                      : TGTG-AC---TC-AT-AT--T-G-T----C-G--CC---------GT------C-A-----------------A--C--A-GT-TG---G---C-----A-TTG-T-G--------C-G-----GT-C-G--C----------TT----A------G---TGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCCTT
gi|89407                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--ATA--------GT------T-G-----------------A--C--A-G--T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-T-G----A--------TTA---A------G--CCAC-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TT
gi|89424                      : TGTG-ACC-GTC-GT-ATATT-G-TT---C-G--AC---------GT------G-ATGCGCTTGC--------AATC--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------ATC-----GT-C-G--T-A--------TT----A------A--C-GCAA--A----TG---T-T---TTGTCT---TTCTTT
gi|89426                      : TGTG-AC--AGC-AT--T--T-G-T----C-A--AC---------G-------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GAA-T-----A-TTG-T-G--------A-T-----TT-C-G--T-A--------TTTA--A------G--CTGC-A--T----TG---T-T---TTGT-T---TTTTTT
gi|89422                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCC-G--T-A--------TT----
gi|89421                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCC-G--T-A--------TT----
gi|89428                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------T-GCC---------------A--C--A-GT-A----GCCAC-----A-TTG-TGG--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----
gi|89425                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-GTT----C-G--ACAT-------GT------G-A-----------------A--C--A-GTGC----A---C-----A-TTG-T-G--------ACC-----GT-C-G--T-A--------T
gi|89427                      : TGTGGAC--GTC-AT-AT--T--------C-G--AC---------GTATGCGCG-T-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T----------A-C-----GT-C-G----A--------TT----A------A--CTGC-A--AT---TG---T-T---TTGT-T---CT
gi|89429                      : TGTG-AT--GT-----AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-
gi|89430                      :  GTG-AC---------AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-T-G--T-A--------TT----
gi|89432                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----C---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89434                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--TAA--------TTA---A------A--CGGC-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89433                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--TAA--------TTA---A------A--CGGC-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89431                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-TCCCCC-G--AC---------GT------GAA-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-A-G--------A-TGAGA-GT-C-A--TAA--------TT----A------GC-CCGC-A--AACCTTG---TGT---TTGT-T---TTCTTT
gi|89435                      :     -AC--GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A--------------------C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-T-G--TGA--------TT----A------G--CT
gi|89436                      :     -AC--GTT-GC-AT----G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-T---T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----actcttggttt
gi|89437                      :       C--GTC-GT--T--T-G-T----C-G--CC---------GT------G-C-----------------C--C--G----T----G---C-----A-TTG-T-G--------C-C-----GT---G--C-A--------TT----A------G--CTGC-C--A----TC---T-T---TTGT-T---TGCTTTgcaat
gi|89438                      :        --GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----A------
gi|89439                      :           TC-GA-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-
gi|89442                      :            C-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--G--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--A-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-TTTGTTGT-T---TTCTTT
gi|89443                      :            C-AT-AT--T-G-T----G-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-CT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-CTGACTGA-C-ATTT-A--------TT----A------G--CTGC-T--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89444                      :            C-GC-AT--T-G-----------AT---------GT------A-C-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----A------A--CTGT-G--A-----------T---TTG--T---TTCTTT
gi|89441                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A---------T----A------G--CTG--A--A----TG---T-T---T
gi|89440                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A---------T----A------G--CTG--A--A----TG---T-T---T
gi|89445                      :               T-AT--A-G-T----C-G--GC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-A--T-A--------TT----A------C--CTG-----A----TA---T-T---CTGT-T---TTCTTT
gi|89446                      :                   --T-G-T----A-G--AT---------GT------A-A-----------------G--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----A------G--CTGC-GATA----TG---T-T---TTGT-C---TT
gi|89452                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89456                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-A--T-A--------TT----A------C--CTG-----A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89453                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-C--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----AG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89454                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-ATG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---ATTTTT
gi|89457                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-C--T-A--------TT----G------T--CTGT-A--G----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89461                      :                      -G-T----C-A--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-A--T-A--------TC----A------G--CTGC-A--A----TG---C-C---TT
gi|89458                      :                      -G-T----T-G--AC---------AT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-C-G--T-A--------TT----A------A--CTGC-C--AT---TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89460                      :                      -G-T----C-G--GC---------AT------T-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----ACTATTAG--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89462                      :                      -G-T----G-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-TAATTG---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-C-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTA--T---TTCTTT
gi|89465                      :                      -G-T----C-A--ACC--------AT------G-A-----------------AA-C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CAA--T-AATTTAT--TT----A------G--CTGC-A--G----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89464                      :                      -G-T----C-G--AC---------GG------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-CTC-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-AATGTCGACTTGAACA------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89450                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------G-C-----GT-C-G--T-A--------TT----
gi|89468                      :                      -G-T----T-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-T--T-A--------TT----A------G--
gi|89449                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTA-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----
gi|89467                      :                      -G-T----C-A--AT---------AT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-A--------A-C-----GC-C-A--T-A--------TA----A------G--TTGC-A--A----TA---T-T---GTGA-TACATTCTTT
gi|89447                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----T-TTG-T-G--------A-C-----AT-C-G--T-A--------TT----
gi|89466                      :                      -G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----CT-C-G--T-A--------TT----T------A--CTGC-A--A----AG---T-T---ATGT-TGCATTCTTT
gi|89463                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--A--C-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TT----
gi|89451                      :                      -G-T----C----AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--C-A--------TT----
gi|89459                      :                      -G-T----C-G--AC---------TT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------CT----
gi|89448                      :                      -G-T----C-G--AC---------AT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-C-G--T-A--------TT----
gi|89455                      :                      -G-T----C-G--AC---------GTCA----G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-
gi|89469                      :                                               T------G-A-----------------A--C--G-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-T-G--T-A--------TT----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTTgatt
gi|89470                      :                                                                           --C--A-GT-C----GAG-T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C-G--T-A--------TC----A------G--CTGC-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT





Alignments
lowQualScore                  :     1  22   2  0  11 0 0 1111 0 11  999999999  333333 0 66666666666666666 11 11 3  0 2222 444 11111 0   1 0 22222222 1 33333  1  22222222 22222222  555555  11   0 2 11 3333  444 0 111    1 222      
lowQualScore                  :     .  ..   .  .  .. . . .... . ..  .........  ...... . ................. .. .. .  . .... ... ..... .   . . ........ . .....  .  ........ ........  ......  ..   . . .. ....  ... . ...    . ...      
lowQualScore                  :     0  22   4  8  11 5 5 7777 5 88  222222222  333333 5 66666666666666666 22 44 2  5 7777 999 33333 5   6 5 66666666 1 00000  1  77777777 00000000  888888  66   7 1 00 6666  888 7 333    5 777      
consensus                     : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
Reference ( family-309 )      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89395                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-T-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89396                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89397                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---C-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89398                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-A-----GT-TG------T-A--------------------CTGTC-A--A----CG---T-
gi|89399                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GC-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89400                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTT-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89401                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CTG-T-A--A-----G---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89402                      : TGTG-AC--GTC-GTTAT--T-G-T----C-G--ACA--------GT------G-------------------A--C--C-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TT------AG--CTT------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89403                      : TATG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-G-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89404                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CCG-CAA--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89405                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CA------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89406                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CCA-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89407                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--ATA--------GT------T-G-----------------A--C--A-G--T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TTA-----AG--CCA-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TT
gi|89408                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GC------T-A-----------------A--C--A-AT-T----G---C-----A-TTGAT-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AG--ATG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89409                      : TGTG-GC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GA------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-GATCGATGTA-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--TTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TT
gi|89410                      : TGTA-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--GTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89411                      : TGTG-AC--GTC-GC-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-ACAGTTGCATTGTGAGTAA--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89412                      : TGTG-AC--GTC-AC-AT--T--------T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--T-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TT-T-T---TTATTT
gi|89413                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AA---------AT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----G-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTA-C-A--A----TGTATT-T---TTGT-T---TTGTTT
gi|89414                      : TGTG-AC--GTC-G--AT--T-G-T----CCG--AC---------GT------A-A-----------------A--T--A-GT-TT---G---C-----AACTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--AA---TG---T-T---T-GT-T---TTCTTT
gi|89415                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACTAATGGCA-GT------G----------------------C--A-GT-T----T---C-----A-TTG-T-GGA------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG---A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89416                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------
gi|89417                      : TGTA-ACCCGTT-GT-AT--T-T-T----G-GTTAC---------AT------G-A-----------------A--C--AAGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-G-----TT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----CG---T-T---TTGT-T---TTTT
gi|89418                      : TGTG-AC--GTCTGT-AT--TAG-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----GC--C-----A-TTG-T-G--------A-CG----GT-CA------A-A--------TT------AGTTCCG-CAA--A----TGT--T-T---TTGTGT---TTCTTT
gi|89419                      : TGTG-AC---TC-AT-AT--T-G-T----C-G--CC---------GT------C-A-----------------A--C--A-GT-T----GG--C-----A-TTG-T-G--------C-G-----GT-CG------C----------TT------AG---TG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCCTT
gi|89420                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-T-T----C-G--AC---------AT------A-A-----------------G--C--G-GT-T----G---C-----C-CTG-T-G--------A-C-----AT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A------------T-T---T--T-T---TTCTTT
gi|89421                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89422                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89423                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACT--------GT------G-A-----------------A--C----GT-T----G---CACATAA-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--
gi|89424                      : TGTG-ACC-GTC-GT-ATATT-G-TT---C-G--AC---------GT------G-ATGCGCTTGC--------AATC--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------ATC-----GT-CG------T-A--------TT------AA--C-G-CAA--A----TG---T-T---TTGTCT---TTCTTT
gi|89425                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-GTT----C-G--ACAT-------GT------G-A-----------------A--C--A-GTGC----A---C-----A-TTG-T-G--------ACC-----GT-CG------T-A--------T
gi|89426                      : TGTG-AC--AGC-AT--T--T-G-T----C-A--AC---------G-------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GAA-T-----A-TTG-T-G--------A-T-----TT-CG------T-A--------TTTA----AG--CTG-C-A--T----TG---T-T---TTGT-T---TTTTTT
gi|89427                      : TGTGGAC--GTC-AT-AT--T--------C-G--AC---------GTATGCGCG-T-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T----------A-C-----GT-CG--------A--------TT------AA--CTG-C-A--AT---TG---T-T---TTGT-T---CT
gi|89428                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------T-GCC---------------A--C--A-GT-A----GCCAC-----A-TTG-TGG--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------
gi|89429                      : TGTG-AT--GT-----AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C
gi|89430                      :  GTG-AC---------AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------
gi|89431                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-TCCCCC-G--AC---------GT------GAA-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-A-G--------A-TGAGA-GT-CA------TAA--------TT------AGC-CCG-C-A--AACCTTG---TGT---TTGT-T---TTCTTT
gi|89432                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----C---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89433                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89434                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89435                      :     -AC--GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A--------------------C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-TG------TGA--------TT------AG--CTA-C--------------T-C---TTGG-T---TT
gi|89436                      :     -AC--GTT-GC-AT----G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-T---T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------T------------TG-C-A--A----T
gi|89437                      :       C--GTC-GT--T--T-G-T----C-G--CC---------GT------G-C-----------------C--C--G----T----G---C-----A-TTG-T-G--------C-C-----GT--G------C-A--------TT------AG--CTG-C-C--A----TC---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89438                      :        --GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------A
gi|89439                      :           TC-GA-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-
gi|89440                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89441                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89442                      :            C-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--G--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-TTTGTTGT-T---TTCTTT
gi|89443                      :            C-AT-AT--T-G-T----G-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-CT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-CTGACTGA-CATT----T-A--------TT------AG--CTG-C-T--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89444                      :            C-GC-AT--T-G-----------AT---------GT------A-C-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AA--CTG-----------TG---A-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89445                      :               T-AT--A-G-T----C-G--GC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TA---T-T---CTGT-T---TTCTTT
gi|89446                      :                   --T-G-T----A-G--AT---------GT------A-A-----------------G--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-GATA----TG---T-T---TTGT-C---TT
gi|89447                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----T-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------
gi|89448                      :                      -G-T----C-G--AC---------AT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89449                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89450                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89451                      :                      -G-T----C----AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------C-A--------TT------
gi|89452                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89453                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CC------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----AG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89454                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-ATG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---ATTTTT
gi|89455                      :                      -G-T----C-G--AC---------GTCA----G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG--------A--------TT------
gi|89456                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89457                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CC------T-A--------TT------GT--CTG-T-A--G----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89458                      :                      -G-T----T-G--AC---------AT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-C--AT---TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89459                      :                      -G-T----C-G--AC---------TT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------CT------
gi|89460                      :                      -G-T----C-G--GC---------AT------T-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TTACTATTAG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89461                      :                      -G-T----C-A--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---C-C---TT
gi|89462                      :                      -G-T----G-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-TAATTG---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTA--T---TTCTTT
gi|89463                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--A--C-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89464                      :                      -G-T----C-G--AC---------GG------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-CTC-T-G--------A-C-----GT-CG------T-AATGTCGACTTGAAC--AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89465                      :                      -G-T----C-A--ACC--------AT------G-A-----------------AA-C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CAATAATTT-A--------TTT-----AG--CTG-C-A--G----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89466                      :                      -G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----CT-CG------T-A--------TT------TA--CTG-C-A--A----AG---T-T---ATGT-TGCATTCTTT
gi|89467                      :                      -G-T----C-A--AT---------AT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-A--------A-C-----GC-CA------T-A--------TA------AG--TTG-C-A--A----TA---T-T---GTGA-TACATTCTTT
gi|89468                      :                      -G-T----T-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CT------T-A--------TT------AG--
gi|89469                      :                                               T------G-A-----------------A--C--G-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89470                      :                                                                           --C--A-GT-C----GAG-T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT





Alignments
lowQualScore                  :     1  22   2  0  11 0 0 1111 0 11  999999999  333333 0 66666666666666666 11 11 3  0 2222 444 11111 0   1 0 22222222 1 33333  1  22222222 22222222  555555  11   0 2 11 3333  444 0 111    1 222      
lowQualScore                  :     .  ..   .  .  .. . . .... . ..  .........  ...... . ................. .. .. .  . .... ... ..... .   . . ........ . .....  .  ........ ........  ......  ..   . . .. ....  ... . ...    . ...      
lowQualScore                  :     0  22   4  8  11 5 5 7777 5 88  222222222  333333 5 66666666666666666 22 44 2  5 7777 999 33333 5   6 5 66666666 1 00000  1  77777777 00000000  888888  66   7 1 00 6666  888 7 333    5 777      
consensus                     : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
Reference ( family-309 )      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89395                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-T-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89396                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89397                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---C-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89398                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-A-----GT-TG------T-A--------------------CTGTC-A--A----CG---T-
gi|89399                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GC-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89400                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTT-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89401                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CTG-T-A--A-----G---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89402                      : TGTG-AC--GTC-GTTAT--T-G-T----C-G--ACA--------GT------G-------------------A--C--C-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TT------AG--CTT------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89403                      : TATG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-G-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89404                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CCG-CAA--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89405                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CA------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89406                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CCA-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89407                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--ATA--------GT------T-G-----------------A--C--A-G--T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TTA-----AG--CCA-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TT
gi|89408                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GC------T-A-----------------A--C--A-AT-T----G---C-----A-TTGAT-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AG--ATG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89409                      : TGTG-GC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GA------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-GATCGATGTA-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--TTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TT
gi|89410                      : TGTA-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--GTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89411                      : TGTG-AC--GTC-GC-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-ACAGTTGCATTGTGAGTAA--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89412                      : TGTG-AC--GTC-AC-AT--T--------T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--T-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TT-T-T---TTATTT
gi|89413                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AA---------AT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----G-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTA-C-A--A----TGTATT-T---TTGT-T---TTGTTT
gi|89414                      : TGTG-AC--GTC-G--AT--T-G-T----CCG--AC---------GT------A-A-----------------A--T--A-GT-TT---G---C-----AACTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--AA---TG---T-T---T-GT-T---TTCTTT
gi|89415                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACTAATGGCA-GT------G----------------------C--A-GT-T----T---C-----A-TTG-T-GGA------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG---A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89416                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------
gi|89417                      : TGTA-ACCCGTT-GT-AT--T-T-T----G-GTTAC---------AT------G-A-----------------A--C--AAGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-G-----TT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----CG---T-T---TTGT-T---TTTT
gi|89418                      : TGTG-AC--GTCTGT-AT--TAG-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----GC--C-----A-TTG-T-G--------A-CG----GT-CA------A-A--------TT------AGTTCCG-CAA--A----TGT--T-T---TTGTGT---TTCTTT
gi|89419                      : TGTG-AC---TC-AT-AT--T-G-T----C-G--CC---------GT------C-A-----------------A--C--A-GT-T----GG--C-----A-TTG-T-G--------C-G-----GT-CG------C----------TT------AG---TG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCCTT
gi|89420                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-T-T----C-G--AC---------AT------A-A-----------------G--C--G-GT-T----G---C-----C-CTG-T-G--------A-C-----AT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A------------T-T---T--T-T---TTCTTT
gi|89421                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89422                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89423                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACT--------GT------G-A-----------------A--C----GT-T----G---CACATAA-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--
gi|89424                      : TGTG-ACC-GTC-GT-ATATT-G-TT---C-G--AC---------GT------G-ATGCGCTTGC--------AATC--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------ATC-----GT-CG------T-A--------TT------AA--C-G-CAA--A----TG---T-T---TTGTCT---TTCTTT
gi|89425                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-GTT----C-G--ACAT-------GT------G-A-----------------A--C--A-GTGC----A---C-----A-TTG-T-G--------ACC-----GT-CG------T-A--------T
gi|89426                      : TGTG-AC--AGC-AT--T--T-G-T----C-A--AC---------G-------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GAA-T-----A-TTG-T-G--------A-T-----TT-CG------T-A--------TTTA----AG--CTG-C-A--T----TG---T-T---TTGT-T---TTTTTT
gi|89427                      : TGTGGAC--GTC-AT-AT--T--------C-G--AC---------GTATGCGCG-T-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T----------A-C-----GT-CG--------A--------TT------AA--CTG-C-A--AT---TG---T-T---TTGT-T---CT
gi|89428                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------T-GCC---------------A--C--A-GT-A----GCCAC-----A-TTG-TGG--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------
gi|89429                      : TGTG-AT--GT-----AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C
gi|89430                      :  GTG-AC---------AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------
gi|89431                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-TCCCCC-G--AC---------GT------GAA-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-A-G--------A-TGAGA-GT-CA------TAA--------TT------AGC-CCG-C-A--AACCTTG---TGT---TTGT-T---TTCTTT
gi|89432                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----C---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89433                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89434                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89435                      :     -AC--GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A--------------------C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-TG------TGA--------TT------AG--CTA-C--------------T-C---TTGG-T---TT
gi|89436                      :     -AC--GTT-GC-AT----G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-T---T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------T------------TG-C-A--A----T
gi|89437                      :       C--GTC-GT--T--T-G-T----C-G--CC---------GT------G-C-----------------C--C--G----T----G---C-----A-TTG-T-G--------C-C-----GT--G------C-A--------TT------AG--CTG-C-C--A----TC---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89438                      :        --GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------A
gi|89439                      :           TC-GA-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-
gi|89440                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89441                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89442                      :            C-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--G--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-TTTGTTGT-T---TTCTTT
gi|89443                      :            C-AT-AT--T-G-T----G-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-CT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-CTGACTGA-CATT----T-A--------TT------AG--CTG-C-T--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89444                      :            C-GC-AT--T-G-----------AT---------GT------A-C-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AA--CTG-----------TG---A-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89445                      :               T-AT--A-G-T----C-G--GC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TA---T-T---CTGT-T---TTCTTT
gi|89446                      :                   --T-G-T----A-G--AT---------GT------A-A-----------------G--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-GATA----TG---T-T---TTGT-C---TT
gi|89447                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----T-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------
gi|89448                      :                      -G-T----C-G--AC---------AT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89449                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89450                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89451                      :                      -G-T----C----AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------C-A--------TT------
gi|89452                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89453                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CC------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----AG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89454                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-ATG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---ATTTTT
gi|89455                      :                      -G-T----C-G--AC---------GTCA----G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG--------A--------TT------
gi|89456                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89457                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CC------T-A--------TT------GT--CTG-T-A--G----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89458                      :                      -G-T----T-G--AC---------AT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-C--AT---TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89459                      :                      -G-T----C-G--AC---------TT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------CT------
gi|89460                      :                      -G-T----C-G--GC---------AT------T-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TTACTATTAG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89461                      :                      -G-T----C-A--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---C-C---TT
gi|89462                      :                      -G-T----G-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-TAATTG---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTA--T---TTCTTT
gi|89463                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--A--C-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89464                      :                      -G-T----C-G--AC---------GG------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-CTC-T-G--------A-C-----GT-CG------T-AATGTCGACTTGAAC--AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89465                      :                      -G-T----C-A--ACC--------AT------G-A-----------------AA-C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CAATAATTT-A--------TTT-----AG--CTG-C-A--G----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89466                      :                      -G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----CT-CG------T-A--------TT------TA--CTG-C-A--A----AG---T-T---ATGT-TGCATTCTTT
gi|89467                      :                      -G-T----C-A--AT---------AT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-A--------A-C-----GC-CA------T-A--------TA------AG--TTG-C-A--A----TA---T-T---GTGA-TACATTCTTT
gi|89468                      :                      -G-T----T-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CT------T-A--------TT------AG--
gi|89469                      :                                               T------G-A-----------------A--C--G-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89470                      :                                                                           --C--A-GT-C----GAG-T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT


blockSeqs                     :        CC   T     AT     CCCC   TT  CTGATGCGC  ATGCGC   CAGTTGCATTGTGAGTA AT GC A    AATT CCA ACATA     A   ATCGATGT T TGACT  C  ATAATTT  ATGTCGAC  ACTATT  TT     A    ACCT  TAT   TTG    G GCA
blockSeqs                     :        C    C     .      T      G   CTGATGCGC  CA       TGCGCTTGC         A  GC T    T    CA  .         T   GA       C GAGA   C  TTT      .         GAAC    C      A    A     T     .      C ACA
blockSeqs                     :        .    C     .      .      G   TAATGGCA   T        CC                .  .  T    C    CA  .         T   .        . G      .  TA       .         TA      .      A    T     T     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   AT         T        .                 .  .  T    C    AA  .         .   .        . .      .  TA       .         A       .      .    T     T     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   A          .        .                 .  .  T    .    AG  .         .   .        . .      .  TA       .         A       .      .    .     T     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   A          .        .                 .  .  T    .    C   .         .   .        . .      .  TG       .         A       .      .    .     T     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   T          .        .                 .  .  .    .    G   .         .   .        . .      .  T        .         T       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   C          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  C        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  C        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :        .    .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  A        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :             .     .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :                   .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :                   .      .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  C        .         .       .      .    .     .     .      . .  
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .     .           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .     .                 
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .      .    .                       
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .                                   
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .       .                                   
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  T        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  .        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  .        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  .        .         .                                           
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .  .        .                                                     
blockSeqs                     :                          .      .   .          .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .                                                                 
blockSeqs                     :                                                .        .                 .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .                                                                 
blockSeqs                     :                                                                           .  .  .    .    .   .         .   .        . .      .                                                                 


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
finalCons                     : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT





Alignments
lowQualScore                  :     1  22   2  0  11 0 0 1111 0 11  999999999  333333 0 66666666666666666 11 11 3  0 2222 444 11111 0   1 0 22222222 1 33333  1  22222222 22222222  555555  11   0 2 11 3333  444 0 111    1 222      
lowQualScore                  :     .  ..   .  .  .. . . .... . ..  .........  ...... . ................. .. .. .  . .... ... ..... .   . . ........ . .....  .  ........ ........  ......  ..   . . .. ....  ... . ...    . ...      
lowQualScore                  :     0  22   4  8  11 5 5 7777 5 88  222222222  333333 5 66666666666666666 22 44 2  5 7777 999 33333 5   6 5 66666666 1 00000  1  77777777 00000000  888888  66   7 1 00 6666  888 7 333    5 777      
consensus                     : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
Reference ( family-309 )      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89395                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-T-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89396                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89397                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---C-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89398                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-A-----GT-TG------T-A--------------------CTGTC-A--A----CG---T-
gi|89399                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GC-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89400                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTT-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89401                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CTG-T-A--A-----G---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89402                      : TGTG-AC--GTC-GTTAT--T-G-T----C-G--ACA--------GT------G-------------------A--C--C-GT-G----G---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TT------AG--CTT------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89403                      : TATG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-G-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89404                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CCG-CAA--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89405                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CA------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89406                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------A-A--------TT------AG--CCA-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89407                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-A--ATA--------GT------T-G-----------------A--C--A-G--T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG--------A--------TTA-----AG--CCA-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TT
gi|89408                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AT---------GC------T-A-----------------A--C--A-AT-T----G---C-----A-TTGAT-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AG--ATG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTT
gi|89409                      : TGTG-GC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GA------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-GATCGATGTA-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--TTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TT
gi|89410                      : TGTA-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--GTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89411                      : TGTG-AC--GTC-GC-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-ACAGTTGCATTGTGAGTAA--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89412                      : TGTG-AC--GTC-AC-AT--T--------T-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--T-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TT-T-T---TTATTT
gi|89413                      : TGTG-AT--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AA---------AT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----G-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTA-C-A--A----TGTATT-T---TTGT-T---TTGTTT
gi|89414                      : TGTG-AC--GTC-G--AT--T-G-T----CCG--AC---------GT------A-A-----------------A--T--A-GT-TT---G---C-----AACTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--AA---TG---T-T---T-GT-T---TTCTTT
gi|89415                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACTAATGGCA-GT------G----------------------C--A-GT-T----T---C-----A-TTG-T-GGA------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AA--CTG---A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89416                      : TGTG-AC--GTC-GT-AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------
gi|89417                      : TGTA-ACCCGTT-GT-AT--T-T-T----G-GTTAC---------AT------G-A-----------------A--C--AAGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-G-----TT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----CG---T-T---TTGT-T---TTTT
gi|89418                      : TGTG-AC--GTCTGT-AT--TAG-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-G----GC--C-----A-TTG-T-G--------A-CG----GT-CA------A-A--------TT------AGTTCCG-CAA--A----TGT--T-T---TTGTGT---TTCTTT
gi|89419                      : TGTG-AC---TC-AT-AT--T-G-T----C-G--CC---------GT------C-A-----------------A--C--A-GT-T----GG--C-----A-TTG-T-G--------C-G-----GT-CG------C----------TT------AG---TG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCCTT
gi|89420                      : TGTG-AC--GTT-GT-AT--T-T-T----C-G--AC---------AT------A-A-----------------G--C--G-GT-T----G---C-----C-CTG-T-G--------A-C-----AT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A------------T-T---T--T-T---TTCTTT
gi|89421                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89422                      : TGTG-AC--G-C-GT-AT--T-G-T----C-GG-AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GCA-C-----A-TTGTT-G--------A-C-----GTCCG------T-A--------TT------
gi|89423                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--ACT--------GT------G-A-----------------A--C----GT-T----G---CACATAA-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--
gi|89424                      : TGTG-ACC-GTC-GT-ATATT-G-TT---C-G--AC---------GT------G-ATGCGCTTGC--------AATC--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------ATC-----GT-CG------T-A--------TT------AA--C-G-CAA--A----TG---T-T---TTGTCT---TTCTTT
gi|89425                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-GTT----C-G--ACAT-------GT------G-A-----------------A--C--A-GTGC----A---C-----A-TTG-T-G--------ACC-----GT-CG------T-A--------T
gi|89426                      : TGTG-AC--AGC-AT--T--T-G-T----C-A--AC---------G-------G-A-----------------A--C--A-GT-T----GAA-T-----A-TTG-T-G--------A-T-----TT-CG------T-A--------TTTA----AG--CTG-C-A--T----TG---T-T---TTGT-T---TTTTTT
gi|89427                      : TGTGGAC--GTC-AT-AT--T--------C-G--AC---------GTATGCGCG-T-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T----------A-C-----GT-CG--------A--------TT------AA--CTG-C-A--AT---TG---T-T---TTGT-T---CT
gi|89428                      : TGTG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----C-G--AC---------GT------T-GCC---------------A--C--A-GT-A----GCCAC-----A-TTG-TGG--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------
gi|89429                      : TGTG-AT--GT-----AT--T-G-T----C-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-C
gi|89430                      :  GTG-AC---------AC--T-G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------
gi|89431                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-TCCCCC-G--AC---------GT------GAA-----------------A--C--A-GT-G----G---C-----A-TTG-A-G--------A-TGAGA-GT-CA------TAA--------TT------AGC-CCG-C-A--AACCTTG---TGT---TTGT-T---TTCTTT
gi|89432                      :   TG-AC--GTC-GT-AT--T-G-T----T-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----C---C-----A-CTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89433                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89434                      :   TG-AC--GTCCGT-AT--T-G-T----C-G--ACCTGATGCGCGTT-----G-A-----------------A--C--A-GT-TC---G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------TAA--------TTA-----AA--CGG-C-A--A----TGT--T-T---TTGT-T---TTCTCT
gi|89435                      :     -AC--GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AT---------GT------G-A--------------------C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-TG------TGA--------TT------AG--CTA-C--------------T-C---TTGG-T---TT
gi|89436                      :     -AC--GTT-GC-AT----G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-T---T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------T------------TG-C-A--A----T
gi|89437                      :       C--GTC-GT--T--T-G-T----C-G--CC---------GT------G-C-----------------C--C--G----T----G---C-----A-TTG-T-G--------C-C-----GT--G------C-A--------TT------AG--CTG-C-C--A----TC---T-T---TTGT-T---TGCTTT
gi|89438                      :        --GTT-GC-AT--T-G-T----C-G--AA---------GT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------A
gi|89439                      :           TC-GA-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-
gi|89440                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89441                      :            C-GT-A-----G-T----C-G--AC---------GA------A-A-----------------A--CGCA-GT-T----G---C-----A-GTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A---------T------AG--CTG---A--A----TG---T-T---T
gi|89442                      :            C-GT-AT--T-G-T----C-A--AC---------GT------G-A-----------------A--G--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------A-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-TTTGTTGT-T---TTCTTT
gi|89443                      :            C-AT-AT--T-G-T----G-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-CT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-CTGACTGA-CATT----T-A--------TT------AG--CTG-C-T--A----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89444                      :            C-GC-AT--T-G-----------AT---------GT------A-C-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AA--CTG-----------TG---A-T---TTG--T---TTCTTT
gi|89445                      :               T-AT--A-G-T----C-G--GC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TA---T-T---CTGT-T---TTCTTT
gi|89446                      :                   --T-G-T----A-G--AT---------GT------A-A-----------------G--C--A-GC-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-GATA----TG---T-T---TTGT-C---TT
gi|89447                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----T-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------
gi|89448                      :                      -G-T----C-G--AC---------AT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89449                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTA-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89450                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------G-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89451                      :                      -G-T----C----AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------C-A--------TT------
gi|89452                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---A-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89453                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CC------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----AG---T-T---TTGT-T---TTATTT
gi|89454                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-ATG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---ATTTTT
gi|89455                      :                      -G-T----C-G--AC---------GTCA----G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG--------A--------TT------
gi|89456                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CA------T-A--------TT------AC--CTG------A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89457                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----GT-CC------T-A--------TT------GT--CTG-T-A--G----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89458                      :                      -G-T----T-G--AC---------AT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----AT-CG------T-A--------TT------AA--CTG-C-C--AT---TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89459                      :                      -G-T----C-G--AC---------TT------G-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------CT------
gi|89460                      :                      -G-T----C-G--GC---------AT------T-A-----------------G--C--A-GT-T----G---C-----A-TTT-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TTACTATTAG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89461                      :                      -G-T----C-A--AC---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CA------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---C-C---TT
gi|89462                      :                      -G-T----G-G--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-TAATTG---C-----A-TTG-T-G--------A-T-----AT-CG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTA--T---TTCTTT
gi|89463                      :                      -G-T----C-G--AC---------GT------G-A-----------------A--A--C-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TT------
gi|89464                      :                      -G-T----C-G--AC---------GG------G-A-----------------A--C--ATGT-T----G---C-----A-CTC-T-G--------A-C-----GT-CG------T-AATGTCGACTTGAAC--AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89465                      :                      -G-T----C-A--ACC--------AT------G-A-----------------AA-C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CAATAATTT-A--------TTT-----AG--CTG-C-A--G----TA---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89466                      :                      -G-T----C-G--AA---------GT------A-A-----------------A--C--A-GT-T----G---T-----A-TTG-T-G--------A-C-----CT-CG------T-A--------TT------TA--CTG-C-A--A----AG---T-T---ATGT-TGCATTCTTT
gi|89467                      :                      -G-T----C-A--AT---------AT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-A--------A-C-----GC-CA------T-A--------TA------AG--TTG-C-A--A----TA---T-T---GTGA-TACATTCTTT
gi|89468                      :                      -G-T----T-A--AT---------GT------G-A-----------------A--C--A-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CT------T-A--------TT------AG--
gi|89469                      :                                               T------G-A-----------------A--C--G-GT-T----G---C-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-TG------T-A--------TT------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT
gi|89470                      :                                                                           --C--A-GT-C----GAG-T-----A-TTG-T-G--------A-C-----GT-CG------T-A--------TC------AG--CTG-C-A--A----TG---T-T---TTGT-T---TTCTTT