lowQualScore                  :                                                                                     111111111111111                        111111111111                                      11111111               111111111111111                                                                         
lowQualScore                  :        2 3   1  3333 22  3 1  666666 22 8 22 77  0  111  22 1 0 222 0 00 4444444444 111111111111111 22222 111 777777 11111 111111111111 1 222 222222 22 2 0 1111 111 00 111  11111111 1 00 111111 0 555555555555555 4444444 0 0 22222 4444444 1111 000 0 1 55555 11  6666  33  222 1 4 1    
lowQualScore                  :        . .   .  .... ..  . .  ...... .. . .. ..  .  ...  .. . . ... . .. .......... ............... ..... ... ...... ..... ............ . ... ...... .. . . .... ... .. ...  ........ . .. ...... . ............... ....... . . ..... ....... .... ... . . ..... ..  ....  ..  ... . . .    
lowQualScore                  :        6 9   2  9999 99  6 2  999999 88 2 99 11  6  000  55 1 6 777 6 88 3333333333 777777777777777 99999 444 444444 88888 666666666666 0 999 000000 55 1 5 6666 444 77 666  66666666 1 77 555555 5 888888888888888 7777777 5 5 11111 1111111 1111 999 5 1 22222 33  8888  22  999 7 8 1    
consensus                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----N-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---NTG--AA--AA-TGC-TAAA
Reference ( gi|102383 )       : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AGA--GT-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TAC-TAAA
gi|102384                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GA---CT--G-T-A---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-ACCCC---C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---CTG--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102385                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--ATA--GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----A---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A-------C-------CACCA---C-C-C-----CCA-----A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TAC-TAAA
gi|102386                     : GCCTG-C-A-TTAAGC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C----------A------G--------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CTT-G----G---G--T---GC-----C-CG-T---------T-G-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AAG-GA-TGC-TAAA
gi|102387                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TTCT-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CTTTG-T-A---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---T--T---GCT----C-CG-T--A------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----AAGAA---CTG--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102388                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--A-A--G--AA-GG---TTT-G-T-AC--A-C--C----------A------G--------T-----TT--G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A---------------G-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102390                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-TAAA------G--GAA--GC-AA--G---CT--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------A----T-G----A---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----T-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GATTGC-TAAA
gi|102393                     : GCCTGTC---TTA-GC----T---G-T-AA------G--A-A--GC-AA-GG---CT--G-T-AG--A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T---------C-A-------A-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTGA-AA--GA-TGC-TGAA
gi|102395                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AGA--GC-AA-GG---CG--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--------------------------------------------------------------C-------C-C-C-----C-------A----C---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TAC-TGAA
gi|102392                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC-----CGCG-T--G------C-A-------CGT-----C-------A-C-T-----C-------A----A---T-T-T-----T--AA---CTG--AA--GA-CGC-TAAA
gi|102391                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC-----CGCG-T--G------C-A-------CGT-----C-------A-C-T-----C-------A----A---T-T-T-----T--AA---CTG--AA--GA-CGC-TAAA
gi|102389                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAAAGGC-AA-GT---TT--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-GC--C------A--C-T----------G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A-------G-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-TGT-----A--AA---CTG--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102394                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------GAAAGG--GC-AACGG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------GT-------G-----G---C------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G------C-CG-T--GGGCAGCC-G-------C-------C-------C-C-C-----CT------A----T---T-T-T-----AG-AA---CTG--AA--GA-TGC-TAA
gi|102396                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TC-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T----------G--T---GC-----C-TG-T--G------C-A-------CATCCCCGC-------C-C-C-----C-------C----TCCAT-T-T-----A--AA---CTG--AA--AA-
gi|102399                     : GTCTGTC-AGTTA-GC----TGTTG-A-TA------G--AGA--GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--G-T-GC---G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A-------C-------CCCCGCCTC-C-C-----C-------A----T---G-T-TACTTAA--AA---CTG--AA--TA-TA
gi|102398                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AATTATAAG--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-ACTGA-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GACTGG---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C---------------------------------------------AA--GA-TGC-TAAA
gi|102397                     : GCCTTTC-A-TTA-GC----T---G-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---AAC--C----------A------GT-------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G---------------------------------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-TTTTA-A--AA---CTG--AA---A-TGC-TAAA
gi|102400                     : GCCTGTC-AATTA-GC----T--TG-T-AA------A--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------GT-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-------------------------------------------G-------C-------C-------C-C-A-----A-------A----T---T-T-T-----T--AA---CTG--AA--GA-TGC-
gi|102402                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----
gi|102401                     : GCCTGTC-A--TA-GC----TA-TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-G--------G-T-A---A-C--------------------A--------G-----T---G------G-----G------------T-G---CA-----A--C-T------G---G--T---G------C-CG-T--G------C-A-------C-------CG------G-A-C-----C-------A----T---TAT-T-----A--AA---CT----A--GA-TGC-TAAA
gi|102404                     : GCCTGTCCA-TTA-GT----T--TAAT-AA------G--AAA--GC-A--------C--T-T-AT--A-C--C----------A------T--------T-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---GCAATGCC-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----A-------C----T---T-T-T-----A--CA---CTGACAA--GA-TGC-TAAA
gi|102405                     : GCCTTCC-A-TTA-TC----T---G-T-AAA-----G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-G---C------A--T-A-G----G---G--TGG-GG-----C-CGCT--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----CCCCT---A----A---T-T-T-----A--AATACCTG--AAC-GA-TGC-TA
gi|102403                     : GTCTGTC-A-TTA-GCT---T--TG-T-AA------G--AGAGGGC-AA-GGGGCCC--G-T-A---A-C--A----------G------G--------G-----G---A------G-----G------------T-GA--G------A--C-T------T---A--T---G------C-CG-T--G------C-C-------CTCCGA--C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---
gi|102406                     : GCCTGTCTG-CCT-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---TT--G-C-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------GT----GGGGGTGT-----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---AT-----T-CG-T--G------C-A-------C-------
gi|102407                     :  CCT-TC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GCCAA-GG---C-----T-T---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-C--T--G------C-A-------C-------C-------C-C-T-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102408                     :  CCTGTC-A-TTA-GC----G--TT-T-AA------GG-AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------TTA---C------A--C-T-G----GC--G--T---GC-----C--G-T--G------C-A-------C-------T-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TGC-CAAA
gi|102409                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------G--------T-----G---G------G--------------------G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----CTTG-T--G------C-A-------CT------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--AG-TGC-TAAA
gi|102410                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--A-A--GC--A-GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-----C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----T-CGAT--G------C-A-------C-------C-------C-C-CCACCAC-------A----T---T-TGT-----T--AA---CTGA-AA--GATTGC-TAAA
gi|102411                     :   CTGTC----TA-G-----T--TG-T-AA------G--A-A--GC-AA-GG---CTT-G-T-A---A-C--C----------A------T--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----GTCCG--T---GC-----A-CC-C--G------C-C-------C-------C-------C-A-C-----C-------A----T---T-T-TAA---A--AA---CTG--AATGAA-TGC-TAA
gi|102413                     :     GTC-A-TTA-GCACTCT--TG-T-AA---------AGA--GC-AA-GG---CC--G-C-A---A-C-------------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---A------A--AAT-A----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-------------------------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--AA-TAC-TAAA
gi|102414                     :      TC-ACTTA-GC----T--TG-T-AA------G--AAA--GC-A--GG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------GAT------G-----G---G------G-----C------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-ACAACCCCC-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-TA----A--AA---CTG--AA--GA-TGT-TAAA
gi|102415                     :       C-A-TTA-GC----T--TG-T-TA------G--AAA--GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-TGG----G---G--T---GC-----C-C--T--G------C-A-------CCCCCT--C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-TTA---A--AA---CTG--AA--GA-TGC-TGAA
gi|102416                     :             A-GT----T--TGAT-AA------T--AAG--AC-AA-GG---AC--G-T-A---G-C--C----------A------G--------G-----G---A------G------------------T-G---C------A--C-----------------------------G-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-------C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AT-TGC-TAAA
gi|102417                     :                      --TG-T-AT------G--AAT--AC-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------GAG------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------G--C-T-A----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------A-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---GTA--AA--GA-TGC-TAAA
gi|102420                     :                               ------G--ACA--AC-AA-GG---CT--G-T-A---A-A--C----------A------G--------G-----A---G------G-----GGGTGT-------T-G---C------A--TAT-G----G---A--A---AC-----C-CC-C--C------C-C-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATA--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102424                     :                                          A--GC-AA-AG---CT--G-T-A---A-C--C----------A------G--------A-----G---G------GATGGGG------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-GA-T--G------C-A-------T-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102427                     :                                           --GC-AA-AG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----AGGGGGTGAT---T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-AG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C------------T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102419                     :                                           --GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------GAGGGGAGGG-----G---G------G-----G------------T-C---C------A--C-T-G----G---A--T---GC-----A-CT-T--G------C-A-------C-------C---------C-C-----C-------A----T---T-T-C-----G--AA---AT---AA--AA-TGC-TAAA
gi|102423                     :                                    taataat--GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G-----------------G----G---GGTT---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------T-------C-C-C-----C-------A--------T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102421                     :                                            agT-AA-GG---TC--G-T-A---A-C--C----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---TCA----C-CA----G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-G-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102428                     :                                           aaac-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------C-------T-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102430                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------AA-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TG--TAAA
gi|102429                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-A---C------A--C-T-A----G---G--T---GC-----C-TG-T--G------C-A-------C---------------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ACG--AA--AA-TAC-TAAA
gi|102432                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-A-----A--AA---ATG--AG--AA-TAC-TAAA
gi|102433                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGG----------T-G---T------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------T-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---TTA--AA--AC-TGC-TTAA
gi|102451                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGG-G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------C-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATGA-AA--AA-TGC-TAAA
gi|102418                     :                                               -AA-AG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----GTTGG------G-----G------------TAG---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-CG-T--G------T-A-------C-------C-------C-T-C-----C-------A----T---T-T-T-----G--AA---AT---AA--GATTAC-TAAA
gi|102425                     :                                      taaataacc-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------GCGTGGA---G------G-----G------------T-T---C------A--C-T-G----G---G--T---AC-----A-TG-T--G------C-A-------C---------------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102452                     :                                            aac-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--CGGGGGAGGGGG------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-AC------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-AGC-TAAA
gi|102431                     :                                               -AG-GA---CC--G-T-A---A-CAGC----------GC-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-CAA---T-------A----T---T-T-T-----G--AA---ATG--AA--AA-TAC-TAAA
gi|102437                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G--------------------------------G----G---G----------------G-T--G------C-A-------C-------C-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CTG--AA--GA-TAA-TAAA
gi|102438                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-A-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-T-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATC--AA--AA-T-C-CAAA
gi|102440                     :                                              c-AA-GA---CT--G-T-A---A-C--T----------A------G--------G-----A---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----G--AA---ATC--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102435                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----AGGGGT-------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GCAT---CGTG-T--G------C-A-------T-------C-------C-C-T-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-T---TAAA
gi|102434                     :                                              c-AG-GG---CC--G-T-A---A-C--TTAGG------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---A--T---GT-----A-TG-C--A------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---TT---AA--AA-TGC-TAAA
gi|102439                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-T--C----------G------G--------G-----G---G------A-----G------------G-G-----------------G----G---G--TTCTGC-----A-TG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102436                     :                                              c-AG-GG---CC--G-T-A---A-C--G----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-----------------------T-T-C-----C-------A----T---T-G-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TA
gi|102441                     :                                              c-AA-GG---CCC-GCT-A---A-T--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGGGGA----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-TTGG------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------AACCTT---T-T-T-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102442                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---G-C--C----------A------G--------A-----G---G------G-----G------------T-G---TGTGTGTA--C-T-G----G---G--T---GC-----A-AG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----C-------T----T---T-T-A-----A--AA---ATG--AG--AA-TGCTTAAA
gi|102446                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TT-T--G------TAA-------C-------C-------C-C-C-----CCCCCCCAA----T---T-T-C-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-CAAA
gi|102443                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------G------G--------G-----G---G------A-----GGAGGGGGTGATAT-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TA-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATG--AA--AC-TGC-CAAA
gi|102445                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-C---A-T--C----------AAGGTGTG--------G-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---GT-----A-CG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATA--AA--AA-TGCTTAAA
gi|102453                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------G--------GA----G---G------G-----G------------A-G-----------------G----G---G--G---GC-----A-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----A-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATG---A--GA--AC-TA
gi|102412                     :                                               -AA-GG---TC--G-T-A---A-C--C----------A------GTAG-----G-----G---GTTT---G-----G------------T-GGTTC------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-AA-T--G------C-A-------G-------C-------CAC-T-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATA--GA--AA-TGC-TAAA
gi|102449                     :                   ctttcattacattttcaaaaacggatac-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------A------T--------G-----G---G------G-----G-------------------------A--G-G-G----G---G--T---GC-----A-CG-T--A------C-A---------------T-------C-C-C-----C-------A----T---T-G-T-----A--GA---ATA--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102448                     :                                              c-AA-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------AAAGTATG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-A----G---G--T---GC-----A-CG-T--G------C-A---------------C-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---
gi|102422                     :                                              c-AA-GG---CC--G-TTC---A-C--C----------AAAGTGTG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---GT-----A-CG-T--G------C-A-------C-------C-------C-C-C-----A-------A----T---T-T-T-----A--AA---A-A--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102447                     :                                          aaacc-AA-GG---CC--GGT-A---A-A--C----------ACAAGT-GT-------G-----G---G------G-----G------------T-GATCC------A--C-T-G----G---G--T---AC-----A-TG-T--G------T-A-----------------------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA----TG--AA---A-TGC-TAAA
gi|102454                     :                                                 c-GG---CC--G-T-A---A-C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A---------------C-------A-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---ATGAAAA--GG-TGC-TAAA
gi|102455                     :                                                  -GG---CC--G-T-A---A-C--CA---------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CAC-G----T---G--T---G--------TG-T--G------C-A-------C-------C-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---AT---AA--AA-TGC-TAAA
gi|102456                     :                                                    G---CC--G-T-A---A-C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------C-------C-------T-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-CAAA
gi|102457                     :                                                                                     ------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-TG-T--G------C-A-------A-------C-------T-C-T-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA----TG--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102426                     :                                                                                    g------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---GC-----A-AG-T--G------C-A-------C-------C-------C-CTC-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA----TG--AA--AC-TGC-TAAA
gi|102458                     :                                                           aacagggccggtaattctccaggggg------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---GC-----A-AG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-CAA---A--AA---ATG--AA--AA-TGT-CAAA
gi|102450                     :                                                                                    g------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-G-G----A---G--T---GT-----A-CG-T--G------C-A-------A-------C-------A-C-C-------------A----T---T-T-T-----A--AA---ATA--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102459                     :                                                                               caaagttgtggag--------G-----G---G------G-----G------------T-T---T------A--C-T-G----G---G--T---GC-----C-CG-T--G------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----A--AA---CT
gi|102444                     :                                                                                            --------G-----G---G------G-----G------------T-A---C------A--C-T-G----G---G--T---GCATG--T-TG-T--G------C-A-------C-------CCCACC--C-C-C-----C-------A----T---T-T-T-----G--AA---ATA--AA--AA-TGC-TAAA
gi|102460                     :                                                                               caaggccgggggt--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-A----G---G--T---GC-----A-TG-T--T------C-A---------------C-------C-C-C-----C-------A----T---T-T-C-----A--AA---ATG--AA--AA-TGC-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                          111111111111111                        111111111111                                                                  111111111111111                                                                    
lowQualScore                  :        2 3   1  3333 22  3 1  666666 1   55555  0  0  111  22 1 1 222 1111 00 4444444444 111111111111111 22222 111 777777 11111 222222222222 1 333 222222 22 1 0 1111 111  111 2222 5555555 000 1 00 3333333  444444444444444 1111 0 0 22222 2222 1111 000 0 1 3333 11  3333  11  11 0 22   1    
lowQualScore                  :        . .   .  .... ..  . .  ...... .   .....  .  .  ...  .. . . ... .... .. .......... ............... ..... ... ...... ..... ............ . ... ...... .. . . .... ...  ... .... ....... ... . .. .......  ............... .... . . ..... .... .... ... . . .... ..  ....  ..  .. . ..   .    
lowQualScore                  :        4 6   2  7777 77  2 1  222222 0   99999  6  6  000  44 6 1 666 2222 88 1111111111 000000000000000 88888 444 333333 88888 888888888888 0 333 000000 44 0 5 6666 444  444 7777 4444444 999 0 77 2222222  999999999999999 6666 5 5 00000 4444 7777 999 5 1 9999 33  7777  33  99 6 11   1    
consensus                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
Reference ( family-304 )      : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-N-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102383                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GT-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102384                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CACCCC---C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102385                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-ATA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----A---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------C-------CACCAC-C-C-----CCA--A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102386                     : GCCTG-C-A-TTAAGC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CTT-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T----------TG-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AAG-G-A--TGC-TAAA
gi|102387                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TTCT-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CTTTG-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---TT---G----CTC-----C---G-T--A-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----AAGAA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102388                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAG--------AA-GG---TTT-G-T-AC--A----C--C----------A------G--------T-----TT--G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA---------------G----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102389                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAAG---GC-AA-GT---TT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-GC--C------A--C-T----------GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------G-------C----C-C-C-----C----A----T---T-TGT----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102390                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-TAAA------G-GAA-----GC-AA--G---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------A----T-G----A---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----T----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-AT-TGC-TAAA
gi|102391                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---GT---GC---C-G-----C---G-T--G-------CA-------CGT-----C----A-C-T-----C----A----A---T-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102392                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---GT---GC---C-G-----C---G-T--G-------CA-------CGT-----C----A-C-T-----C----A----A---T-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102393                     : GCCTGTC---TTA-GC----T---G-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CT--G-T-AG--A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T----------CA-------A-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--AGA--TGC-TGAA
gi|102394                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAGG---GC-AACGG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GT-------G-----G---C------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---GT---G----C-------C---G-T--GGGCAGC-CG-------C-------C----C-C-C-----CT---A----T---T-T-T----AG-AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAA
gi|102395                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GC-AA-GG---CG--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A-------------------------------------------------------------------C----C-C-C-----C----A----C---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TGAA
gi|102396                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TC-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T----------GT---G----C-C-----T---G-T--G-------CA-------CATCCCCGC----C-C-C-----C----C----TCCAT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--
gi|102397                     : GCCTTTC-A-TTA-GC----T---G-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-TAA---A----C--C----------A------GT-------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----------------------------------------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-TTTTAA--AA---CTG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102398                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AATTATAAG-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-ACTGA----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GACTGG---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----------------------------------------AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102399                     : GTCTGTC-AGTTA-GC----TGTTG-A-TA------G-AGA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--G-T-GC---G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----
gi|102400                     : GCCTGTC-AATTA-GC----T--TG-T-AA------A-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G---------------------------------------------G----G---GT---G----C-A-----C---G---------------------C-------C----C-C-A-----A----A----T---T-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--TGC-gcctccccatgttacttaaaactgaatata
gi|102401                     : GCCTGTC-A-T-A-GC----TA-TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-G--------G-T-A---A----C--------------------A--------G-----T---G------G-----G------------T-G---CA-----A--C-T------G---GT---G----C-------C---G-T--G-------CA-------C-------CG---G-A-C-----C----A----T---TAT-T----A--AA---CT----A--G-A--TGC-TAAA
gi|102402                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----
gi|102403                     : GTCTGTC-A-TTA-GCT---T--TG-T-AA------G-AGAGG---GC-AA-GGGGCCC--G-T-A---A----C--A----------G------G--------G-----G---A------G-----G------------T-GA--G------A--C-T------T---AT---G----C-------C---G-T--G-------CC-------CTCCGA--C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---
gi|102404                     : GCCTGTCCA-TTA-GT----T--TAAT-AA------G-AAA-----GC-A--------C--T-T-AT--A----C--C----------A------T--------T-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---GT---G----C-AATGCCC---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----A----C----T---T-T-T----A--CA---CTGACAA--G-A--TGC-TAAA
gi|102405                     : GCCTTCC-A-TTA-TC----T---G-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-G---C------A--T-A-G----G---GT---GGGGCC-G-----C-----T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----CCCCTA----A---T-T-T----A--AATACCTG--AAC-G-A--TGC-TA
gi|102406                     : GCCTGTCTG-CCT-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---TT--G-C-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------GT----GGGGGTGT-----T-G---C------A--C-T-G----G---GT---A----T-T-----C---G-T--G-------CA-------C-------
gi|102407                     :  CCT-TC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GCCAA-GG---C-----T-T---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------G-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C-----T--G-------CA-------C-------C----C-C-T-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102408                     :  CCTGTC-A-TTA-GC----G--TT-T-AA------GGAAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------TTA---C------A--C-T-G----GC--GT---G----C-------C---G-T--G-------CA-------C-------T----T-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-CAAA
gi|102409                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G--------------------G---C------A--C-T-G----G---GT---GC---C-T-----T---G-T--G-------CA-------CT------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--A-G--TGC-TAAA
gi|102410                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AA-----GC--A-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-----C------A--C-T-G----G---GT---G----C-T-----C---GAT--G-------CA-------C-------C----C-C-CCACCAC----A----T---T-TGT----T--AA---CTG--AA--A-GATTGC-TAAA
gi|102411                     :   CTGTC----TA-G-----T--TG-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CTT-G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----GTCCGT---G----C-A-----C---C-C--G-------CC-------C-------C----C-A-C-----C----A----T---T-T-TAA--A--AA---CTG--AATGA-A--TGC-TAA
gi|102412                     :   CTTTC-A-TTA-CA----T--TT-T-CA------A-AAACGGATAC-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GTAG-----G-----G---GTTT---G-----G------------T-GGTTC------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----A---A-T--G-------CA-------G-------C----CAC-T-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATA--GA--A-A--TGC-TAAA
gi|102413                     :     GTC-A-TTA-GCACTCT--TG-T-AA--------AGA-----GC-AA-GG---CC--G-C-A---A-------C----------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-GA--A------A--A-T-A----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G------------------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102414                     :      TC-ACTTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-A--GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GAT------G-----G---G------G-----C------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CACAACCCCC-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-TA---A--AA---CTG--AA--G-A--TGT-TAAA
gi|102415                     :       C-A-TTA-GC----T--TG-T-TA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-TGG----G---GT---G----C-C-----C-----T--G-------CA-------CCCCCT--C----C-C-C-----C----A----T---T-T-TTA--A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TGAA
gi|102416                     :             A-GT----T--TGAT-AA------T-AAG-----AC-AA-GG---AC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------G-----G---A------G------------------------------------------------T---G----C-A-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-------C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-T--TGC-TAAA
gi|102417                     :                      --TG-T-AT------G-AAT-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAG------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------G--C-T-A----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------A-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---GTA--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102418                     :                          -T-AA------A-TAA-----CC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----GTTGG------G-----G------------TAG---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----C---G-T--G-------TA-------C-------C----C-T-C-----C----A----T---T-T-T----G--AA---ATA--AG--A-T--TAC-TAAA
gi|102419                     :                          -T-AA------T-AAT-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAGGGGAGGG-----G---G------G-----G------------T-C---C------A--C-T-G----G---AT---G----C-A-----C---T-T--G-------CA-------C-------C------C-C-----C----A----T---T-T-C----G--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102420                     :                               ------G-ACA-----AC-AA-GG---CT--G-T-A---A----A--C----------A------G--------G-----A---G------G-----GGGTGT-------T-G---C------A--TAT-G----G---AA---A----C-C-----C---C-C--C-------CC-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102421                     :                                      -AAA-----CT-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---T----C-A-----C---C-A--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-G----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102422                     :                                      -AAA-----CC-AA-GG---CC--G-TTC---A----C--C----------AAAGTGTG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---GT---G----T-A-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----A----A----T---T-T-T----A--AA---A-A--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102423                     :                                        AG-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--A----------G------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G-----------------G----G---GTT--G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------T-------C----C-C-C----------A----T---T-T------A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102424                     :                                         A-----GC-AA-AG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------A-----G---G------GATGGGG------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----G---A-T--G-------CA-------T-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102425                     :                                         A-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GCGTGGA---G------G-----G------------T-T---C------A--C-T-G----G---GT---A----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-------C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102426                     :                                         A-----AC-AG-GG---CC--GGT-A---ATTCTC--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGG-------T-G---C------AAGC-T-G----G---GT---G----C-A-----A---G-T--G-------CA-------C-------C----C-CTC-----C----A----T---T-T-T----A--AA----TG--AA--A-C--TGC-TAAA
gi|102427                     :                                          -----GC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----AGGGGGTGAT---T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----A---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C---------T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102428                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------T----C-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102429                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-A---C------A--C-T-A----G---GT---G----C-C-----T---G-T--G-------CA-------C------------C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ACG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102430                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AA-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TG--TAAA
gi|102431                     :                                                C-AG-GA---CC--G-T-A---A----CAGC----------GC-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-CAA---T----A----T---T-T-T----G--AA---ATG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102432                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TAC-TAAA
gi|102433                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGG----------T-G---T------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------T-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---TTA--AA--A-C--TGC-TTAA
gi|102434                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--TTAGG------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---AT---G----T-A-----T---G-C--A-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---TT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102435                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----AGGGGT-------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----TCGTG-T--G-------CA-------T-------C----C-C-T-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--T---TAAA
gi|102436                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--G----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA--------------------T-T-C-----C----A----T---T-G-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TA
gi|102437                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G--------------------------------G----G---G---------------------G-T--G-------CA-------C-------C----T-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAA-TAAA
gi|102438                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-A-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-T-----C----A----T---T-T-C----A--AA---ATC--AA--A-A--T-C-CAAA
gi|102439                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----T--C----------G------G--------G-----G---G------A-----G------------G-G-----------------G----G---GTTCTG----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102440                     :                                                C-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--T----------A------G--------G-----A---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----G--AA---ATC--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102441                     :                                                C-AA-GG---CCC-GCT-A---A----T--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGGGGA----T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-TTGG-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----AACCTT---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102442                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------A-----G---G------G-----G------------T-G---TGTGTGTA--C-T-G----G---GT---G----C-A-----A---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----C----T----T---T-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TGCTTAAA
gi|102443                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---G------A-----GGAGGGGGTGATAT-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---A-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C----------A----T---T-T-C----A--AA---ATG--AA--A-C--TGC-CAAA
gi|102444                     :                                                C-AA-GG---CC--G--------------------------G------GGGT-----G-----G---G------G-----G------------T-A---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---GTT--GTGCACCCCA-------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----G--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102445                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-C---A----T--C----------AAGGTGTG--------G-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---GT---G----T-A-----C---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGCTTAAA
gi|102446                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---T-T--G-------TAACCCCCCC-------C----C-C-C-----C----AA---T---T-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102447                     :                                                C-AA-GG---CC--GGT-A---A----A--C----------ACAAGT-GT-------G-----G---G------G-----G------------T-GATCC------A--C-T-G----G---GT---A----C-A-----T---G-T--G-------TA--------------------C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA----TG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102448                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AAAGTATG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-A----G---GT---G----C-A-----C---G-T--G-------CA---------------C----T-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---
gi|102449                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G-----G-------------------------A--G-G-G----G---GT---G----C-A-----C---G-T--A-------CA-------T-------C----C-C-C----------A----T---T-G-T----A--GA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102450                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-G-G----A---GT---G----T-A-----C---G-T--G-------CA-------A-------C----A-C-C----------A----T---T-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102451                     :                                    caaagttgtggag-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGG-G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA---------------C----T-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---ATGA-AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102452                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--CGGGGGAGGGGG------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CAC------C-------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--AGC-TAAA
gi|102453                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GA----G---G------G-----G------------A-G-----------------G----G---GG---G----C-A-----C---G-T--G-------CA-------C-------C----C-C-C-----A----A----T---T-T-C----A--AA---ATG--AG--A-A--
gi|102454                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA---------------C----A-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-AGGTGC-TAAActa
gi|102455                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--CA---------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C---A----C---GT---G----T-G-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----T-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102456                     :                                                      G---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------C-------C----T-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102457                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----T---G-T--G-------CA-------A-------C----T-C-T-----C----A----T---T-T-T----A--AA----TG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102458                     :                                                                                         g------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-T-G----G---GT---G----C-A-----A---G-T--G-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-CAA--A--AA---ATG--AA--A-A--TGT-CAAA
gi|102459                     :                                                                                                g--------G-----G---G------G-----G------------T-T---T------A--C-T-G----G---GT---G----C-C-----C---G-T--G-------CA-------C------------C-C-C-----C----A----T---T-T-T----A--AA---CT
gi|102460                     :                                                                                                 --------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-A----G---GT---G----C-A-----T---G-T--T-------CA---------------C----C-C-C-----C----A----T---T-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                          111111111111111                        111111111111                                                                       1111111111111                                                                    
lowQualScore                  :        2 3   1  3333 22  3 1  666666 1   55555  0  0  111  22 1 1 222 1111 00 4444444444 111111111111111 22222 111 777777 11111 222222222222 1 222 222222 22 1 0 2222 222 00 000 2222 44444444444 1 1111 3333333 0 2222222222222 1111 0 1 22222 4444444 1111  0 1 3333 11  3333  11  11 0 22   1    
lowQualScore                  :        . .   .  .... ..  . .  ...... .   .....  .  .  ...  .. . . ... .... .. .......... ............... ..... ... ...... ..... ............ . ... ...... .. . . .... ... .. ... .... ........... . .... ....... . ............. .... . . ..... ....... ....  . . .... ..  ....  ..  .. . ..   .    
lowQualScore                  :        4 6   2  7777 77  2 1  222222 0   99999  6  6  000  44 6 1 666 2222 88 1111111111 000000000000000 88888 444 333333 88888 888888888888 0 888 000000 44 5 5 1111 333 77 999 1111 55555555555 0 8888 2222222 5 8888888888888 6666 5 1 00000 1111111 1111  5 1 9999 33  7777  33  99 6 11   1    
consensus                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
Reference ( family-304 )      : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102383                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GT-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102384                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACCCC---C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102385                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-ATA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----CACCAC-C-C-----CCA-----A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102386                     : GCCTG-C-A-TTAAGC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CTT-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------T-G-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AAG-G-A--TGC-TAAA
gi|102387                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TTCT-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CTTTG-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---T--T---G----CTC-----C---G-T----A-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----AAGAA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102388                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAG--------AA-GG---TTT-G-T-AC--A----C--C----------A------G--------T-----TT--G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102389                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAAG---GC-AA-GT---TT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-GC--C------A--C-T----------G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-----C-------A----TT-TGT----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102390                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-TAAA------G-GAA-----GC-AA--G---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------A----T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----T-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-AT-TGC-TAAA
gi|102391                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102392                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102393                     : GCCTGTC---TTA-GC----T---G-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CT--G-T-AG--A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--AGA--TGC-TGAA
gi|102394                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAGG---GC-AACGG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GT-------G-----G---C------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-------C---G-T----GGGCAGC-C-G-------C-----C----C-C-C-----CT------A----TT-T-T----AG-AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAA
gi|102395                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GC-AA-GG---CG--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G--------------------------------------C-A----------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----CT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TGAA
gi|102396                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TC-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GT---GCCTG--T---G----C-A-----C---A-TCCCCG-------C-C-------C-----C----C-CTC-----C-------A-----T-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--
gi|102397                     : GCCTTTC-A-TTA-GC----T---G-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-TAA---A----C--C----------A------GT-------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G-----------------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTTTAA--AA---CTG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102398                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AATTATAAG-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-ACTGA----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GACTGG---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----------------------------------------AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102399                     : GTCTGTC-AGTTA-GC----TGTTG-A-TA------G-AGA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--G-T-GC---G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----
gi|102400                     : GCCTGTC-AATTA-GC----T--TG-T-AA------A-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G-----------------------------------------G--T---G----C-A-----C---G------------------------C-----C----C-C-A-----A-------A----TT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--TGC-gcctccccatgttacttaaaactgaatata
gi|102401                     : GCCTGTC-A-T-A-GC----TA-TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-G--------G-T-A---A----C--------------------A--------G-----T---G------G-----G------------T-G---CA-----A--C-T------G---G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----CG---G-A-C-----C-------A----TTAT-T----A--AA---CT----A--G-A--TGC-TAAA
gi|102402                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----
gi|102403                     : GTCTGTC-A-TTA-GCT---T--TG-T-AA------G-AGAGG---GC-AA-GGGGCCC--G-T-A---A----C--A----------G------G--------G-----G---A------G-----G------------T-GA--G------A--C-T------T---A--T---G----C-------C---G-T----G-------C-C-------CTCCGAC----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102404                     : GCCTGTCCA-TTA-GT----T--TAAT-AA------G-AAA-----GC-A--------C--T-T-AT--A----C--C----------A------T--------T-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-AATGCCC---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------C----TT-T-T----A--CA---CTGACAA--G-A--TGC-TAAA
gi|102405                     : GCCTTCC-A-TTA-TC----T---G-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-G---C------A--T-A-G----G---G--T---GGGGCC-G-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----CCCCT---A----AT-T-T----A--AATACCTG--AAC-G-A--TGC-TA
gi|102406                     : GCCTGTCTG-CCT-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---TT--G-C-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------GT----GGGGGTGT-----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---A----T-T-----C---G-T----G-------C-A-------C-----
gi|102407                     :  CCT-TC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GCCAA-GG---C-----T-T---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102408                     :  CCTGTC-A-TTA-GC----G--TT-T-AA------GGAAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------TTA---C------A--C-T-G----GC--G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----T----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-CAAA
gi|102409                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G--------------------G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-------CTT-G-T----G-------C-A-------CT----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-G--TGC-TAAA
gi|102410                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AA-----GC--A-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-----C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-T-----C---GAT----G-------C-A-------C-----C----C-C-CCACCAC-------A----TT-TGT----T--AA---CTG--AA--A-GATTGC-TAAA
gi|102411                     :   CTGTC----TA-G-----T--TG-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CTT-G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----GTCCG--T---G----C-A-----C---C-C----G-------C-C-------C-----C----C-A-C-----C-------A----TT-T-TAA--A--AA---CTG--AATGA-A--TGC-TAA
gi|102412                     :   CTTTC-A-TTA-CA----T--TT-T-CA------A-AAACGGATAC-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GTAG-----G-----G---GTTT---G-----G------------T-GGTTC------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---A-T----G-------C-A-------G-----C----CAC-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--GA--A-A--TGC-TAAA
gi|102413                     :     GTC-A-TTA-GCACTCT--TG-T-AA--------AGA-----GC-AA-GG---CC--G-C-A---A----C-------------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---A------A--AAT-A----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C--------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102414                     :      TC-ACTTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-A--GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GAT------G-----G---G------G-----C------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACAACCCCC-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TA---A--AA---CTG--AA--G-A--TGT-TAAA
gi|102415                     :       C-A-TTA-GC----T--TG-T-TA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-TGG----G---G--T---G----C-------C---C-T----G-------C-A-------CCCCCTC----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTA--A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TGAA
gi|102416                     :             A-GT----T--TGAT-AA------T-AAG-----AC-AA-GG---AC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------G-----G---A------G--------------------------------------------------T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-T--TGC-TAAA
gi|102417                     :                      --TG-T-AT------G-AAT-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAG------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------G--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---GTA--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102418                     :                          -T-AA------A-TAA-----CC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----GTTGG------G-----G------------TAG---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------T-A-------C-----C----C-T-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AG--A-T--TAC-TAAA
gi|102419                     :                          -T-AA------T-AAT-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAGGGGAGGG-----G---G------G-----G------------T-C---C------A--C-T-G----G---A--T---G----C-A-----C---T-T----G-------C-A-------C-----C------C-C-----C-------A----TT-T-C----G--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102420                     :                               ------G-ACA-----AC-AA-GG---CT--G-T-A---A----A--C----------A------G--------G-----A---G------G-----GGGTGT-------T-G---C------A--TAT-G----G---A--A---A----C-C-----C---C-C----C-------C-C-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102421                     :                                      -AAA-----CT-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---T----C-A-----C---C-A----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-G----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102422                     :                                      -AAA-----CC-AA-GG---CC--G-TTC---A----C--C----------AAAGTGTG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-T----A--AA---A-A--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102423                     :                                        AG-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-------C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G-----------------G----G---GGTT---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A-----T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102424                     :                                         A-----GC-AA-AG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------A-----G---G------GATGGGG------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----G---A-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102425                     :                                         A-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GCGTGGA---G------G-----G------------T-T---C------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102426                     :                                         A-----AC-AG-GG---CC--GGT-A---ATTCTC--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGG-------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-CTC-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-C--TGC-TAAA
gi|102427                     :                                          -----GC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----AGGGGGTGAT---T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C------------TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102428                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----T----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102429                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-A---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-C-----T---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ACG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102430                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AA-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TG--TAAA
gi|102431                     :                                                C-AG-GA---CC--G-T-A---A----CAGC----------GC-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-CAA---T-------A----TT-T-T----G--AA---ATG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102432                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TAC-TAAA
gi|102433                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGG----------T-G---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---TTA--AA--A-C--TGC-TTAA
gi|102434                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--TTAGG------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---A--T---G----T-A-----T---G-C----A-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---TT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102435                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----AGGGGT-------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----TCGTG-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--T---TAAA
gi|102436                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--G----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A------------------T-T-C-----C-------A----TT-G-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TA
gi|102437                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G--------------------------------G----G---G-----------------------G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAA-TAAA
gi|102438                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-A-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATC--AA--A-A--T-C-CAAA
gi|102439                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----T--C----------G------G--------G-----G---G------A-----G------------G-G-----------------G----G---G--TTCTG----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102440                     :                                                C-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--T----------A------G--------G-----A---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATC--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102441                     :                                                C-AA-GG---CCC-GCT-A---A----T--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGGGGA----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-TTG--G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------AACCTTT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102442                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------A-----G---G------G-----G------------T-G---TGTGTGTA--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------T----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TGCTTAAA
gi|102443                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---G------A-----GGAGGGGGTGATAT-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---A-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-C--TGC-CAAA
gi|102444                     :                                                C-AA-GG---CC--G--------------------------G------GGGT-----G-----G---G------G-----G------------T-A---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---GTT----GTGCACCCC-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102445                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-C---A----T--C----------AAGGTGTG--------G-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGCTTAAA
gi|102446                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---T-T----G-------TAA-------C-----C----C-C-C-----CCCCCCCAA----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102447                     :                                                C-AA-GG---CC--GGT-A---A----A--C----------ACAAGT-GT-------G-----G---G------G-----G------------T-GATCC------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------T-A------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102448                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AAAGTATG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102449                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G-----G-------------------------A--G-G-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----A-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A----TT-G-T----A--GA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102450                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-G-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------A-----C----A-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102451                     :                                    caaagttgtggag-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGG-G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATGA-AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102452                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--CGGGGGAGGGGG------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-AC------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--AGC-TAAA
gi|102453                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GA----G---G------G-----G------------A-G-----------------G----G---G--G---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AG--A-A--
gi|102454                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----A-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-AGGTGC-TAAActa
gi|102455                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--CA---------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C---A----C---G--T---G----T-G-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102456                     :                                                      G---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102457                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----T-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102458                     :                                                                                         g------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-CAA--A--AA---ATG--AA--A-A--TGT-CAAA
gi|102459                     :                                                                                                g--------G-----G---G------G-----G------------T-T---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CT
gi|102460                     :                                                                                                 --------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----T-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                          111111111111111                        111111111111                                                                       1111111111111                                                                    
lowQualScore                  :        2 3   1  3333 22  3 1  666666 1   55555  0  0  111  22 1 1 222 1111 00 4444444444 111111111111111 22222 111 777777 11111 222222222222 1 222 222222 22 1 0 2222 222 00 000 2222 44444444444 1 1111 3333333 0 2222222222222 1111 0 1 22222 4444444 1111  0 1 3333 11  3333  11  11 0 22   1    
lowQualScore                  :        . .   .  .... ..  . .  ...... .   .....  .  .  ...  .. . . ... .... .. .......... ............... ..... ... ...... ..... ............ . ... ...... .. . . .... ... .. ... .... ........... . .... ....... . ............. .... . . ..... ....... ....  . . .... ..  ....  ..  .. . ..   .    
lowQualScore                  :        4 6   2  7777 77  2 1  222222 0   99999  6  6  000  44 6 1 666 2222 88 1111111111 000000000000000 88888 444 333333 88888 888888888888 0 888 000000 44 5 5 1111 333 77 999 1111 55555555555 0 8888 2222222 5 8888888888888 6666 5 1 00000 1111111 1111  5 1 9999 33  7777  33  99 6 11   1    
consensus                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
Reference ( family-304 )      : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102383                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GT-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102384                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACCCC---C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102385                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-ATA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----CACCAC-C-C-----CCA-----A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102386                     : GCCTG-C-A-TTAAGC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CTT-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------T-G-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AAG-G-A--TGC-TAAA
gi|102387                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TTCT-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CTTTG-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---T--T---G----CTC-----C---G-T----A-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----AAGAA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102388                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAG--------AA-GG---TTT-G-T-AC--A----C--C----------A------G--------T-----TT--G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102389                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAAG---GC-AA-GT---TT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-GC--C------A--C-T----------G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-----C-------A----TT-TGT----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102390                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-TAAA------G-GAA-----GC-AA--G---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------A----T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----T-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-AT-TGC-TAAA
gi|102391                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102392                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102393                     : GCCTGTC---TTA-GC----T---G-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CT--G-T-AG--A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--AGA--TGC-TGAA
gi|102394                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAGG---GC-AACGG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GT-------G-----G---C------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-------C---G-T----GGGCAGC-C-G-------C-----C----C-C-C-----CT------A----TT-T-T----AG-AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAA
gi|102395                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GC-AA-GG---CG--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G--------------------------------------C-A----------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----CT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TGAA
gi|102396                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TC-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GT---GCCTG--T---G----C-A-----C---A-TCCCCG-------C-C-------C-----C----C-CTC-----C-------A-----T-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--
gi|102397                     : GCCTTTC-A-TTA-GC----T---G-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-TAA---A----C--C----------A------GT-------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G-----------------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTTTAA--AA---CTG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102398                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AATTATAAG-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-ACTGA----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GACTGG---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----------------------------------------AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102399                     : GTCTGTC-AGTTA-GC----TGTTG-A-TA------G-AGA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--G-T-GC---G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----
gi|102400                     : GCCTGTC-AATTA-GC----T--TG-T-AA------A-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G-----------------------------------------G--T---G----C-A-----C---G------------------------C-----C----C-C-A-----A-------A----TT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--TGC-gcctccccatgttacttaaaactgaatata
gi|102401                     : GCCTGTC-A-T-A-GC----TA-TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-G--------G-T-A---A----C--------------------A--------G-----T---G------G-----G------------T-G---CA-----A--C-T------G---G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----CG---G-A-C-----C-------A----TTAT-T----A--AA---CT----A--G-A--TGC-TAAA
gi|102402                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----
gi|102403                     : GTCTGTC-A-TTA-GCT---T--TG-T-AA------G-AGAGG---GC-AA-GGGGCCC--G-T-A---A----C--A----------G------G--------G-----G---A------G-----G------------T-GA--G------A--C-T------T---A--T---G----C-------C---G-T----G-------C-C-------CTCCGAC----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102404                     : GCCTGTCCA-TTA-GT----T--TAAT-AA------G-AAA-----GC-A--------C--T-T-AT--A----C--C----------A------T--------T-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-AATGCCC---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------C----TT-T-T----A--CA---CTGACAA--G-A--TGC-TAAA
gi|102405                     : GCCTTCC-A-TTA-TC----T---G-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-G---C------A--T-A-G----G---G--T---GGGGCC-G-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----CCCCT---A----AT-T-T----A--AATACCTG--AAC-G-A--TGC-TA
gi|102406                     : GCCTGTCTG-CCT-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---TT--G-C-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------GT----GGGGGTGT-----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---A----T-T-----C---G-T----G-------C-A-------C-----
gi|102407                     :  CCT-TC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GCCAA-GG---C-----T-T---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102408                     :  CCTGTC-A-TTA-GC----G--TT-T-AA------GGAAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------TTA---C------A--C-T-G----GC--G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----T----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-CAAA
gi|102409                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G--------------------G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-------CTT-G-T----G-------C-A-------CT----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-G--TGC-TAAA
gi|102410                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AA-----GC--A-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-----C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-T-----C---GAT----G-------C-A-------C-----C----C-C-CCACCAC-------A----TT-TGT----T--AA---CTG--AA--A-GATTGC-TAAA
gi|102411                     :   CTGTC----TA-G-----T--TG-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CTT-G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----GTCCG--T---G----C-A-----C---C-C----G-------C-C-------C-----C----C-A-C-----C-------A----TT-T-TAA--A--AA---CTG--AATGA-A--TGC-TAA
gi|102412                     :   CTTTC-A-TTA-CA----T--TT-T-CA------A-AAACGGATAC-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GTAG-----G-----G---GTTT---G-----G------------T-GGTTC------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---A-T----G-------C-A-------G-----C----CAC-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--GA--A-A--TGC-TAAA
gi|102413                     :     GTC-A-TTA-GCACTCT--TG-T-AA--------AGA-----GC-AA-GG---CC--G-C-A---A----C-------------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---A------A--AAT-A----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C--------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102414                     :      TC-ACTTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-A--GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GAT------G-----G---G------G-----C------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACAACCCCC-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TA---A--AA---CTG--AA--G-A--TGT-TAAA
gi|102415                     :       C-A-TTA-GC----T--TG-T-TA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-TGG----G---G--T---G----C-------C---C-T----G-------C-A-------CCCCCTC----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTA--A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TGAA
gi|102416                     :             A-GT----T--TGAT-AA------T-AAG-----AC-AA-GG---AC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------G-----G---A------G--------------------------------------------------T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-T--TGC-TAAA
gi|102417                     :                      --TG-T-AT------G-AAT-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAG------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------G--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---GTA--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102418                     :                          -T-AA------A-TAA-----CC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----GTTGG------G-----G------------TAG---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------T-A-------C-----C----C-T-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AG--A-T--TAC-TAAA
gi|102419                     :                          -T-AA------T-AAT-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAGGGGAGGG-----G---G------G-----G------------T-C---C------A--C-T-G----G---A--T---G----C-A-----C---T-T----G-------C-A-------C-----C------C-C-----C-------A----TT-T-C----G--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102420                     :                               ------G-ACA-----AC-AA-GG---CT--G-T-A---A----A--C----------A------G--------G-----A---G------G-----GGGTGT-------T-G---C------A--TAT-G----G---A--A---A----C-C-----C---C-C----C-------C-C-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102421                     :                                      -AAA-----CT-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---T----C-A-----C---C-A----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-G----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102422                     :                                      -AAA-----CC-AA-GG---CC--G-TTC---A----C--C----------AAAGTGTG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-T----A--AA---A-A--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102423                     :                                        AG-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-------C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G-----------------G----G---GGTT---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A-----T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102424                     :                                         A-----GC-AA-AG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------A-----G---G------GATGGGG------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----G---A-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102425                     :                                         A-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GCGTGGA---G------G-----G------------T-T---C------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102426                     :                                         A-----AC-AG-GG---CC--GGT-A---ATTCTC--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGG-------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-CTC-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-C--TGC-TAAA
gi|102427                     :                                          -----GC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----AGGGGGTGAT---T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C------------TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102428                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----T----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102429                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-A---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-C-----T---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ACG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102430                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AA-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TG--TAAA
gi|102431                     :                                                C-AG-GA---CC--G-T-A---A----CAGC----------GC-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-CAA---T-------A----TT-T-T----G--AA---ATG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102432                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TAC-TAAA
gi|102433                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGG----------T-G---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---TTA--AA--A-C--TGC-TTAA
gi|102434                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--TTAGG------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---A--T---G----T-A-----T---G-C----A-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---TT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102435                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----AGGGGT-------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----TCGTG-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--T---TAAA
gi|102436                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--G----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A------------------T-T-C-----C-------A----TT-G-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TA
gi|102437                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G--------------------------------G----G---G-----------------------G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAA-TAAA
gi|102438                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-A-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATC--AA--A-A--T-C-CAAA
gi|102439                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----T--C----------G------G--------G-----G---G------A-----G------------G-G-----------------G----G---G--TTCTG----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102440                     :                                                C-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--T----------A------G--------G-----A---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATC--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102441                     :                                                C-AA-GG---CCC-GCT-A---A----T--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGGGGA----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-TTG--G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------AACCTTT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102442                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------A-----G---G------G-----G------------T-G---TGTGTGTA--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------T----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TGCTTAAA
gi|102443                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---G------A-----GGAGGGGGTGATAT-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---A-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-C--TGC-CAAA
gi|102444                     :                                                C-AA-GG---CC--G--------------------------G------GGGT-----G-----G---G------G-----G------------T-A---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---GTT----GTGCACCCC-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102445                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-C---A----T--C----------AAGGTGTG--------G-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGCTTAAA
gi|102446                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---T-T----G-------TAA-------C-----C----C-C-C-----CCCCCCCAA----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102447                     :                                                C-AA-GG---CC--GGT-A---A----A--C----------ACAAGT-GT-------G-----G---G------G-----G------------T-GATCC------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------T-A------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102448                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AAAGTATG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102449                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G-----G-------------------------A--G-G-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----A-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A----TT-G-T----A--GA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102450                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-G-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------A-----C----A-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102451                     :                                    caaagttgtggag-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGG-G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATGA-AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102452                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--CGGGGGAGGGGG------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-AC------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--AGC-TAAA
gi|102453                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GA----G---G------G-----G------------A-G-----------------G----G---G--G---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AG--A-A--
gi|102454                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----A-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-AGGTGC-TAAActa
gi|102455                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--CA---------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C---A----C---G--T---G----T-G-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102456                     :                                                      G---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102457                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----T-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102458                     :                                                                                         g------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-CAA--A--AA---ATG--AA--A-A--TGT-CAAA
gi|102459                     :                                                                                                g--------G-----G---G------G-----G------------T-T---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CT
gi|102460                     :                                                                                                 --------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----T-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-


blockSeqs                     :        C G   A  ACTC GT  C A  TTATAA G   CGGAT             TT G A CTG TTCT    GGGGGAGGGG GAGGGGAGG       CGTGG TTG GGGGGG ATGGG GAGGGGGTGATA T GTT GTGTGT AG T   ACTG CCT        GGGC AATGCCC     A CCCC TGCACCC   CAACCCCC      ACCA   T CACCA CCCCCCA ACCT    G TTTA AG  TACC  AC  TG   AT   T
blockSeqs                     :        T A   .  T    A   A .  A      .   AG                T  C T C   .       TAGG       AAGTGTG         T     T   GGGGGG T     GGGGGTGAT    A ATC A      AG A   T    TCC        C    ATCGT       T TG   GGCAGC    CTCCGA        G      T AA    CCCT    .       G AA   G   C     A   G    GG   T
blockSeqs                     :        . C   .  .    .   A .  A      .   GG                T  G . G   .       A          AGGTGTG         T     .   GGGGG  .     GGGGGGGA     . C   .      T  A   C    C          C    TCC         . .    .         CCCCCT        .      . .     CA      .       . TA   .   C     .   C    T    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  A      .   GG                C  . . T   .       .          CAAGTGT         A     .   TGGG   .     GGGGTGT      . A   .      T  .   .    .          .    CTT         . .    .         CCCCC         .      . .     T       .       . AA   .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          AAGTATG         .     .   TGGG   .     GGTGT        . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         CGT           .      . .     .       .       . A    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GTAG            .     .   TTT    .     GGGGG        . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         CGT           .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GGGT            .     .   .      .     GGGGT        . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         CT            .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GAT             .     .   .      .     GG           . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         CC            .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GAG             .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GT              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GT              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    GC          . .    .         G             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GA              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    GC          . .    .         G             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          AG              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         A             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          CG              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          GA              .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    GC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    TC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          T               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          T               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    TC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AA          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         G             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          A               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         A             .      . .     .       .       . .    .   G     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          T               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :        . .   .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :              .  .    .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                      .   . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AG          . .    .         T             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                          . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          T               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                          . .  .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AA          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                               .      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AA          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                      .   .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                          .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                          .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         T             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                          .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                          .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         T             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                          .                 .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   T     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   T     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AA          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          A               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         A             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         A             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         C             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          T               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AC          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    GT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          A               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AA          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          A               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    CC          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   C     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    AT          . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   A     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          G               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    C           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   .     .   .    .    .
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    A           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   .     .   .    .     
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    C           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   .     .   .    .     
blockSeqs                     :                                                            .  . . .   .       .          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    C           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    C           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .                        
blockSeqs                     :                                                                                          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    C           . .    .         .             .      . .     .       .       . .    .                        
blockSeqs                     :                                                                                          .               .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    .           . .    .         .             .      . .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                          .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .    .          .    .           . .    .         .                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                          .     .   .      .     .            . .   .      .  .   .                                                                                                                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
finalCons                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                          111111111111111                        111111111111                                                                       1111111111111                                                                    
lowQualScore                  :        2 3   1  3333 22  3 1  666666 1   55555  0  0  111  22 1 1 222 1111 00 4444444444 111111111111111 22222 111 777777 11111 222222222222 1 222 222222 22 1 0 2222 222 00 000 2222 44444444444 1 1111 3333333 0 2222222222222 1111 0 1 22222 4444444 1111  0 1 3333 11  3333  11  11 0 22   1    
lowQualScore                  :        . .   .  .... ..  . .  ...... .   .....  .  .  ...  .. . . ... .... .. .......... ............... ..... ... ...... ..... ............ . ... ...... .. . . .... ... .. ... .... ........... . .... ....... . ............. .... . . ..... ....... ....  . . .... ..  ....  ..  .. . ..   .    
lowQualScore                  :        4 6   2  7777 77  2 1  222222 0   99999  6  6  000  44 6 1 666 2222 88 1111111111 000000000000000 88888 444 333333 88888 888888888888 0 888 000000 44 5 5 1111 333 77 999 1111 55555555555 0 8888 2222222 5 8888888888888 6666 5 1 00000 1111111 1111  5 1 9999 33  7777  33  99 6 11   1    
consensus                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
Reference ( family-304 )      : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---NTG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102383                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GT-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102384                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACCCC---C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102385                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-ATA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----CACCAC-C-C-----CCA-----A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TAAA
gi|102386                     : GCCTG-C-A-TTAAGC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--CTT-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------T-G-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AAG-G-A--TGC-TAAA
gi|102387                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TTCT-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CTTTG-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---T--T---G----CTC-----C---G-T----A-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----AAGAA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102388                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAG--------AA-GG---TTT-G-T-AC--A----C--C----------A------G--------T-----TT--G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102389                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAAG---GC-AA-GT---TT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-GC--C------A--C-T----------G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------G-----C----C-C-C-----C-------A----TT-TGT----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102390                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-TAAA------G-GAA-----GC-AA--G---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------A----T-G----A---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----T-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-AT-TGC-TAAA
gi|102391                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102392                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----T---G------G-----G------------T-G---C------AT-C-T-G----G---G--T---GC---C-G-----C---G-T----G-------C-A-------CGT---C----A-C-T-----C-------A----AT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--CGC-TAAA
gi|102393                     : GCCTGTC---TTA-GC----T---G-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CT--G-T-AG--A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T------------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--AGA--TGC-TGAA
gi|102394                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAAGG---GC-AACGG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GT-------G-----G---C------G-----G------------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-------C---G-T----GGGCAGC-C-G-------C-----C----C-C-C-----CT------A----TT-T-T----AG-AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAA
gi|102395                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AGA-----GC-AA-GG---CG--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G--------------------------------------C-A----------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----CT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAC-TGAA
gi|102396                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TC-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GT---GCCTG--T---G----C-A-----C---A-TCCCCG-------C-C-------C-----C----C-CTC-----C-------A-----T-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--
gi|102397                     : GCCTTTC-A-TTA-GC----T---G-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-TAA---A----C--C----------A------GT-------GT----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G-----------------------------------------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTTTAA--AA---CTG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102398                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AATTATAAG-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-ACTGA----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-GACTGG---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----------------------------------------AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102399                     : GTCTGTC-AGTTA-GC----TGTTG-A-TA------G-AGA-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--G-T-GC---G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----
gi|102400                     : GCCTGTC-AATTA-GC----T--TG-T-AA------A-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G-----------------------------------------G--T---G----C-A-----C---G------------------------C-----C----C-C-A-----A-------A----TT-T-T----T--AA---CTG--AA--G-A--TGC-gcctccccatgttacttaaaactgaatata
gi|102401                     : GCCTGTC-A-T-A-GC----TA-TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-G--------G-T-A---A----C--------------------A--------G-----T---G------G-----G------------T-G---CA-----A--C-T------G---G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----CG---G-A-C-----C-------A----TTAT-T----A--AA---CT----A--G-A--TGC-TAAA
gi|102402                     : GCCTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----
gi|102403                     : GTCTGTC-A-TTA-GCT---T--TG-T-AA------G-AGAGG---GC-AA-GGGGCCC--G-T-A---A----C--A----------G------G--------G-----G---A------G-----G------------T-GA--G------A--C-T------T---A--T---G----C-------C---G-T----G-------C-C-------CTCCGAC----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102404                     : GCCTGTCCA-TTA-GT----T--TAAT-AA------G-AAA-----GC-A--------C--T-T-AT--A----C--C----------A------T--------T-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-AATGCCC---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------C----TT-T-T----A--CA---CTGACAA--G-A--TGC-TAAA
gi|102405                     : GCCTTCC-A-TTA-TC----T---G-T-AAA-----G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---T------G-----G------------T-G---C------A--T-A-G----G---G--T---GGGGCC-G-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----CCCCT---A----AT-T-T----A--AATACCTG--AAC-G-A--TGC-TA
gi|102406                     : GCCTGTCTG-CCT-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---TT--G-C-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------GT----GGGGGTGT-----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---A----T-T-----C---G-T----G-------C-A-------C-----
gi|102407                     :  CCT-TC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GCCAA-GG---C-----T-T---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----T------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C-----T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102408                     :  CCTGTC-A-TTA-GC----G--TT-T-AA------GGAAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------TTA---C------A--C-T-G----GC--G--T---G----C-------C---G-T----G-------C-A-------C-----T----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-CAAA
gi|102409                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------T-----G---G------G--------------------G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-------CTT-G-T----G-------C-A-------CT----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-G--TGC-TAAA
gi|102410                     :   CTGTC-A-TTA-GC----T--TG-T-AA------G--AA-----GC--A-GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A---------------G-----T---G------G-----G------------T-----C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-T-----C---GAT----G-------C-A-------C-----C----C-C-CCACCAC-------A----TT-TGT----T--AA---CTG--AA--A-GATTGC-TAAA
gi|102411                     :   CTGTC----TA-G-----T--TG-T-AA------G-AA------GC-AA-GG---CTT-G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----GTCCG--T---G----C-A-----C---C-C----G-------C-C-------C-----C----C-A-C-----C-------A----TT-T-TAA--A--AA---CTG--AATGA-A--TGC-TAA
gi|102412                     :   CTTTC-A-TTA-CA----T--TT-T-CA------A-AAACGGATAC-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GTAG-----G-----G---GTTT---G-----G------------T-GGTTC------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---A-T----G-------C-A-------G-----C----CAC-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--GA--A-A--TGC-TAAA
gi|102413                     :     GTC-A-TTA-GCACTCT--TG-T-AA--------AGA-----GC-AA-GG---CC--G-C-A---A----C-------------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---A------A--AAT-A----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C--------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102414                     :      TC-ACTTA-GC----T--TG-T-AA------G-AAA-----GC-A--GG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------GAT------G-----G---G------G-----C------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-ACAACCCCC-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-TA---A--AA---CTG--AA--G-A--TGT-TAAA
gi|102415                     :       C-A-TTA-GC----T--TG-T-TA------G-AAA-----GC-AA-GG---CT--G-T-A---A-------C----------A------G--------T-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-TGG----G---G--T---G----C-------C---C-T----G-------C-A-------CCCCCTC----C-C-C-----C-------A----TT-T-TTA--A--AA---CTG--AA--G-A--TGC-TGAA
gi|102416                     :             A-GT----T--TGAT-AA------T-AAG-----AC-AA-GG---AC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------G-----G---A------G--------------------------------------------------T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-T--TGC-TAAA
gi|102417                     :                      --TG-T-AT------G-AAT-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAG------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------G--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---GTA--AA--G-A--TGC-TAAA
gi|102418                     :                          -T-AA------A-TAA-----CC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----GTTGG------G-----G------------TAG---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------T-A-------C-----C----C-T-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AG--A-T--TAC-TAAA
gi|102419                     :                          -T-AA------T-AAT-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------GAGGGGAGGG-----G---G------G-----G------------T-C---C------A--C-T-G----G---A--T---G----C-A-----C---T-T----G-------C-A-------C-----C------C-C-----C-------A----TT-T-C----G--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102420                     :                               ------G-ACA-----AC-AA-GG---CT--G-T-A---A----A--C----------A------G--------G-----A---G------G-----GGGTGT-------T-G---C------A--TAT-G----G---A--A---A----C-C-----C---C-C----C-------C-C-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102421                     :                                      -AAA-----CT-AA-GG---TC--G-T-A---A----C--C----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---T----C-A-----C---C-A----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-G----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102422                     :                                      -AAA-----CC-AA-GG---CC--G-TTC---A----C--C----------AAAGTGTG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-T----A--AA---A-A--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102423                     :                                        AG-----GC-AA-GG---CC--G-T-A---A-------C----------A------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G-----------------G----G---GGTT---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A-----T-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102424                     :                                         A-----GC-AA-AG---CT--G-T-A---A----C--C----------A------G--------A-----G---G------GATGGGG------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----G---A-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102425                     :                                         A-----AC-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GCGTGGA---G------G-----G------------T-T---C------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-------C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102426                     :                                         A-----AC-AG-GG---CC--GGT-A---ATTCTC--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGG-------T-G---C------AAGC-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-CTC-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-C--TGC-TAAA
gi|102427                     :                                          -----GC-AA-AG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----AGGGGGTGAT---T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C------------TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102428                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----T----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102429                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-A---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-C-----T---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ACG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102430                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AA-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TG--TAAA
gi|102431                     :                                                C-AG-GA---CC--G-T-A---A----CAGC----------GC-----G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-CAA---T-------A----TT-T-T----G--AA---ATG--AA--A-A--TAC-TAAA
gi|102432                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGGGG-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TAC-TAAA
gi|102433                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGG----------T-G---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---TTA--AA--A-C--TGC-TTAA
gi|102434                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--TTAGG------G------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---A--T---G----T-A-----T---G-C----A-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---TT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102435                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----AGGGGT-------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----TCGTG-T----G-------C-A-------T-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--T---TAAA
gi|102436                     :                                                C-AG-GG---CC--G-T-A---A----C--G----------A------GA-------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A------------------T-T-C-----C-------A----TT-G-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TA
gi|102437                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G-----G--------------------------------G----G---G-----------------------G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CTG--AA--G-A--TAA-TAAA
gi|102438                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---C------A--C-A-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-T-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATC--AA--A-A--T-C-CAAA
gi|102439                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----T--C----------G------G--------G-----G---G------A-----G------------G-G-----------------G----G---G--TTCTG----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102440                     :                                                C-AA-GA---CT--G-T-A---A----C--T----------A------G--------G-----A---G------G------------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATC--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102441                     :                                                C-AA-GG---CCC-GCT-A---A----T--C----------A------G--------G-----G---G------G-----GGGGGGGGA----T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-TTG--G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------AACCTTT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102442                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---G----C--C----------A------G--------A-----G---G------G-----G------------T-G---TGTGTGTA--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----C-------T----TT-T-A----A--AA---ATG--AG--A-A--TGCTTAAA
gi|102443                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---G------A-----GGAGGGGGTGATAT-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---A-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-C--TGC-CAAA
gi|102444                     :                                                C-AA-GG---CC--G--------------------------G------GGGT-----G-----G---G------G-----G------------T-A---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---GTT----GTGCACCCC-A-------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----G--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102445                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-C---A----T--C----------AAGGTGTG--------G-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGCTTAAA
gi|102446                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---G------G------------------T-G---A------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---T-T----G-------TAA-------C-----C----C-C-C-----CCCCCCCAA----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102447                     :                                                C-AA-GG---CC--GGT-A---A----A--C----------ACAAGT-GT-------G-----G---G------G-----G------------T-GATCC------A--C-T-G----G---G--T---A----C-A-----T---G-T----G-------T-A------------------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG---A--A-A--TGC-TAAA
gi|102448                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------AAAGTATG--------T-----G---G------G-----A------------T-C---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---
gi|102449                     :                                                C-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------T--------G-----G---G------G-----G-------------------------A--G-G-G----G---G--T---G----C-A-----C---G-T----A-------C-A-------------T----C-C-C-----C-------A----TT-G-T----A--GA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102450                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-G-G----A---G--T---G----T-A-----C---G-T----G-------C-A-------A-----C----A-C-C-------------A----TT-T-T----A--AA---ATA--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102451                     :                                    caaagttgtggag-AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------G-----G---GGGGGG-G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATGA-AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102452                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--CGGGGGAGGGGG------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-AC------C-----C----C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-A--AGC-TAAA
gi|102453                     :                                                 -AA-GG---CC--G-T-A---A----C--C----------A------G--------GA----G---G------G-----G------------A-G-----------------G----G---G--G---G----C-A-----C---G-T----G-------C-A-------C-----C----C-C-C-----A-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AG--A-A--
gi|102454                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--C----------G------G--------G-----G---GTGGG--G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------------C----A-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---ATG--AA--A-AGGTGC-TAAActa
gi|102455                     :                                                    -GG---CC--G-T-A---A----C--CA---------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C---A----C---G--T---G----T-G-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---AT---AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102456                     :                                                      G---CC--G-T-A---A----C--C----------A------A--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------C-----C----T-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-CAAA
gi|102457                     :                                                                                          ------G--------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----G-------C-A-------A-----C----T-C-T-----C-------A----TT-T-T----A--AA----TG--AA--A-A--TGC-TAAA
gi|102458                     :                                                                                         g------G--------G-----G---G------G-----G------------G-G---C------A--C-T-G----G---G--T---G----C-A-----A---G-T----G-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-CAA--A--AA---ATG--AA--A-A--TGT-CAAA
gi|102459                     :                                                                                                g--------G-----G---G------G-----G------------T-T---T------A--C-T-G----G---G--T---G----C-C-----C---G-T----G-------C-A-------C----------C-C-C-----C-------A----TT-T-T----A--AA---CT
gi|102460                     :                                                                                                 --------G-----G---G------G-----G------------T-G---C------A--C-T-A----G---G--T---G----C-A-----T---G-T----T-------C-A-------------C----C-C-C-----C-------A----TT-T-C----A--AA---ATG--AA--A-A--TGC-