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Reference ( gi|92768 )        : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAA
gi|92769                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAA
gi|92767                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATAAAA
gi|92766                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--ATA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATAAAA
gi|92770                      : TAGGGAG-AAG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-ATTTCT--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAA
gi|92772                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--G----GT-CCC----ATT-CAC-AATT-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-GAATTAAA
gi|92771                      : TAGGGAG-AAG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---T---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---ATATCTG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATAAAAa
gi|92773                      : TAGGGAG-ATG-G-C-T---A--ATA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-TC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CGC-G--T-A----T--------T--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAA
gi|92774                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--A-C--C-T-GA----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-G--T-A----T--T--T--T--T-----------TG-A-AC--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATAAAAa
gi|92775                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--AAC-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-C--C-T-GT----T-TCA--------T--G----AT-CTT----ATT-CAC-A--A-AC---T--T--T-TT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TTTTG-TTT-AAATGAAA
gi|92777                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---A--AAG-T-A-GACATGTGTATG---C---A--G---T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TAT-AAA
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gi|92778                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---T--GTA-T-A-G----------G---C---A--A---A--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-TCC----ATT-AAT-G--T-A----T-----------------------TG-A-AT-----A-A-A-TATTG-TTT-AAATCAAA
gi|92779                      : TAAGGGG-AGG-G-C-T---A--A-------G----------G---C---A--G---T--G-C--T-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CGC----ATT-CAC-A--T-A----T--TTCT-AT--A--G---G----TG-A-AT--A--A-A-A-
gi|92780                      : TATGGAG-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---A--T---TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C-------AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATAGTT--T--T-AC--A--T---G-----G-A-AT-----A-A-A-TATTG-TTC-AAATCAAA
gi|92781                      : TAGGGAG-AGG-G-C-T---G--TAA-T-A-G----------G---C---T--G---TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--G--T-A---T--T---G----GG-A-AT--A--G-A-A-------TTT-AAAT
gi|92784                      : TAAGGAG-AGC-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---A--A---C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-TCT----TTT--------T-A----T--G--T-AT--TA-T---A----CA-ATAT--A--A-A-A-TATTG-TTT-CAACTAAAa
gi|92783                      : TATGGAG-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---A--T---TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATGT-T--T--T-AC--A--T---G-----A-A-ATA-A--A-A-A-TATT--TTC-AAAa
gi|92785                      : TATGGAG-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---TTTG---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----AT----C-A--T-------------------------------G-A-AT--A--A-A-A-TATT--TTC-AAATCAAA
gi|92782                      : TAAGGGG-AGG-G-T-C---C--CGA-T-A-G----------G---C---C--A---A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----A-T-CAA-A------------T--T-A----------G----TG-A-AT-----A-A-A-TATTG-TTT-GAATAAAA
gi|92786                      : TATGGAC-AGG-GGC-TGTAA--ACA-T-A-G----------G---C---ATTG---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT---T-A--T-G----T--C--T-GT--T--TTACA----TA-A-GT--A--A-A-A-TATT--TTT-CAATCAAA
gi|92789                      : TAGGTAG-AGG-G-C-T---G--AAT-T-A-G----------G---C---T--G---T--A-T--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-CCC----ATT-CGC-T--T-A----T--------T--T--T---G----CG-AGGT--A--A--------TG-TTC-AAATCAA
gi|92787                      : TAGGGAC-AGG-G-T-T---A--AAA-T-A-G----------G---CTGTAT-A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------A--C----AT-CCCATAAATT-TAT-A--T------T--T--T-GT--T--T---A-----A-A-AT--A--A-A-A-TA
gi|92788                      : TAGGAGG-AGG-A-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-T--C-T-GC----T-GTC--------T--G----AT-C----------TAG-A--TGA----T--T--T-ATCAT--T-------------AT--A--A-G-A-TATTG-TTT-GAAT
gi|92790                      : TAGGTAG-AGA-A-C-T---A---CAGT-T-G----------G---C---A--G---T--G-A--T-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT--A--ATA-A-TACT--TTT-A
gi|92791                      : TACGGAA-AGG---C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---T--T---G--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CTT----ATT-----A--T-G----T--T-----T--T--A---G----CA-T-AT--A--A-A-A-TAATG-TTTAAAATTAAA
gi|92792                      : TAAGGAG-AAG-G-C-T---T--ACA-T-C-A----------G---C---T------T--A-C--CCT-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--TGA----T--T-----T--T--T---A----T--A-AT--A--A-A-A-TACTG-TTT-a
gi|92794                      :  AGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAA
gi|92795                      :  AGGGAG-AGG-G-C-T---A--TCA-T-A-G----------G---G---A--A---T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A----TG-TTT-AAATAAAA
gi|92796                      :  AGGGAG-AGG-G-C-T---AG-AC--T-G-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GG----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTT-TTT----TTAAA
gi|92797                      :  AGGGAG-AGG-G-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-GT--T--T---T----TG-A-AT--A--A-T-A-TATTG-TTT-AAATt
gi|92799                      :  AGGGAG-AGG-A-C-T---A--AAA-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T-T----T--T--T-GT--T-----------TG-A-AT--T--A-A-A-TA
gi|92793                      :  AGGGAG-AGG-G-C-T---A--TAA-T-A-G----------G---C---T--G---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CTC----AAT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--G--A-A-A-TATTG-TTT----TTAAA
gi|92798                      :  AGGGAG-AAG-G-C-T---A--AAC-T-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--A-T-GC----T-GCC--------C--T----AT-CCC----ATT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--A--A-A-A-TATTT-TAT-AGA-TAAAaaaaa
gi|92800                      :  AGAGAG-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---A--T---TGCG-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----T--G--T--T--T--TAC-A----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTC-AAAT
gi|92801                      :  AGAGAGCAGG-G-C-T---A--AAG-C-A-A----------G---C---A--G---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-TA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-ATAAA--A-A-A-AATCG-TTT-AAATTAAA
gi|92803                      :  AGGAAG-AGG-G-C-T---C--GTA-T-A-G----------G---C---A--A---A--G-C--C-T-GC----T-GCCCAAATGGGC--A----AT-CCC----ATC-AA---------------T--T-AT--------------TG-A-AT-----A-A-A-TATTG-TTT-AAAT
gi|92802                      :  AAGGAG-AAA-A-C-T---T--ACA-T-A-A----------G---C---T------T--GTC--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-TT--T--C---A----T--A-AT--A--G-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAAa
gi|92804                      :  AAGGAA-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---A--A---C--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--C----AT-CCT-----TT-TAT-G--T-A----T--CA-T-ACA-A--T---G----TA-C-AT--AATA-A-A-TATTG-TTT-AAA
gi|92805                      :  AGGGAG-ATG-G-C-T---G--AAA-T-A-A----------G---C---T--G---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AC-AAC----ATT-CAC-----------------------T--T---A----AG-A-AT--A--A-A-A-GACTG-CTT-AAaaaa
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gi|92806                      :  AGGGAG-AGA-G-CGT---A--A-A-T-A-GAAAATG----G---C---A--G---T--G-T--C-T--T----T-ATC--------C--A----AC-AAC----ATT-AAC-AG-T-A----T--T--C--T--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A----TG-TTT-AAATGAAA
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gi|92809                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---A--AAACT-A-G----------G---C---A--G---T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-TCC----ATC-TA-----T-A----T--T--T-AT--T--T---T----AA-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAA
gi|92810                      :   GGGAG-AGG-T-C-T---A--TAA-T-G-G----------G---C---C--AC--T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-ATTATTA---T-AAATCAAAcgaa
gi|92811                      :   GGGAT-AGG-G-C-T---A--TAA-T-A-G----------G---C---C--A---TT-A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-TCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-ATTATTA---T-AAACTAGA
gi|92812                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--A--A-A-A-TGTT--TTT-AAAtaa
gi|92813                      :   GAGAG-AGG-G-C-T---A--TAA-C-A-A----------G---C---T--A---TC-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CACTA--T-A------------AT--T--C---G----TG-A-AT--A--A-A-aaaga
gi|92814                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----G--T--T-AT--C--T-----------A-AT--A--A-A-A-TA-TG-TTT-AA
gi|92815                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---A---T--A---T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----TTT-C--------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--G--A-A-G-TA-TG-TTT-AAATCAA
gi|92816                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---T--A-C--C-T-GT----T-GAC--------C--A----AT-CCT----TTT-GA--A------------T--T-AT--T--T-----------A-AT--A--A-A-A-TA-TG-TTT-AAAT
gi|92817                      :   GAGAG-AAG-G-C-T---A--AAA-C-A-G----------A---T---T--A---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--C----GT-CCC----TTT-TAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-
gi|92818                      :   GGGAG-AGG-G-A-T---C--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---G--G-T--C-T-GC----T-ATC--------C--A----AT-CCC----A----GC-A----A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--ATTA-A-A-TATT--TTT-GAAATAAA
gi|92819                      :   GGGGG-GGG-G-C-T---A--AAA-C-A-A----------G---C---T--T---T--A-C--C-T-AC----T-GCC--------A--A----AT-CCC----ATT-CA--------------------GG--T--T---GA---TG-G-AT--G--A-A-A-TTTTG-TTT-AAA
gi|92820                      :   GGGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---T--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--A----AT--CC----ATT-
gi|92821                      :   GGGAG-AGA-G-C-T---A--AAA-T-A-G----------A---T---T--G---T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CGC----ATT-CA
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gi|92823                      :    GGAG-AGG-G-C-T---TTTACA-T-A-A----------G---G---A--A---TT-G-C--C-T-G-----T-GCC--------CAGG----ATGCCC----ATT-CAC-A--A-A----T--T--TTAT--T--T---G----TG-A-ATT-A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATgaaaa
gi|92824                      :    GGAG-GGG-G-C-T---A--TAA-T-A-G----------G---C---T--G---TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-T-----TAT-AAATTAAA
gi|92825                      :    GGAG-AGG-G-C-T---A--TAA-T-A-G----------G---C---T--G---TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG----------A-A-A-TTTTT-TTT-AA--TAAAa
gi|92826                      :    GGAC-AGG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C---A--T---T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----CTT-TATTG--T-G----T--T--C-TT--A--C---A----TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTC-AAAACAAA
gi|92827                      :    GGAG-AGG-G-C-T---T--CTA-T-A-G----------G---C---T--C---A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT--CC----ATT-TAC-A------------T--T-AT--A--C---A----TG---AT--A--A-A-A-TA-TG-ACT-AAATTAAa
gi|92828                      :    GGAG-AGG-G-C-T---A--GTA-T-G-G----------A---T------T---T--A-C--CTT-GT----T-GCC--------C--A----AT-CTC----ATT-CA--G--T-A----T-----------------------TG-A-AT--A--A-A-A-TGTTG-TAT-AAAT
gi|92830                      :    GGAG-AGG-G-C-T---T--ATA-T-G-G----------GTT-C---A---------G-C--C-T-GC----T-GCC--------G--A----AT--CC----ATT---C-A--T-G----T--TA-T-AC--C--T-----------A-AT--A--A-A-A-TA-TG-ATT-AAATCAA
gi|92829                      :    GGAG-AGGCG-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---T--A---C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCT----TTT-TAT-G--T-A-------T--C-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-A-T-AATTGCTTT-AAA
gi|92831                      :     GAG-AGG-A-T-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---A--G---T--A-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCC----ATT--AC-G----A----T--T--T--T--C--C---A----T--A-AT--A--A-A-A-GACTG-TTT-AAAT
gi|92832                      :     GAG-ATG-G-C-T---T--ATA-T-A-G----------G---C---A--A---C--G-A--C-T-GT----T-GTG--------C--A----AT-CCT-----TT-CAT-G--T-A-------T--T-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-A-A-TGTTG-ATT-AAA
gi|92834                      :      AG-AGG-G-C-T---A--ACA-A-A-G----------G---C---A--A---T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--gaa
gi|92833                      :      AG-AGG-A-C-T---A--ACA-T-A-G----------G---C---A--T---T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----TGTT--T-AT--A--C---G----CA-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTC-AAA
gi|92835                      :      AG-AGG-G-C-T---A--AAA-T-A-G----------G---T---T--G---T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AG-CCC----ATT-AAC-A--T---------------T--T--C---A----TG-A-AT-----A-G-A-TATTG-TTT-AGATcaaa
gi|92836                      :      AG-AAG-G-C-T---T--ACA-T-A-G----------G---C------T---T--G-CT-C-T-AC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T-----T--T--T---G----CATA-AT--A--A-T-A-TAATG-TTT-AAA
gi|92837                      :        -AGG-G-C-T---A--AAA-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-C--C-T-GCATGAT-GCC--------C--G----AC-CCA----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TA-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAA
gi|92838                      :        -AGG-G-T-T---A--A-A-T-A-G----------G---C---A--G---T--G-T--T-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT--G--A-ATA-T-TTG-TTT-AAAT
gi|92839                      :           G-G-A-T---A--GTA-T-A-G----------C---C---A--A---C--G-C--C-T-GTCT--T-GTC--------C--A----AT-CCC----GTT-CAC-A--T-A----T--T--T--T--C--TAA-G----CG-A-ATA-A--A-A-A-TATTG-TTT-CAAT
gi|92840                      :            -G-C-T---A--ATA-T-AAG----------G---C---A--A---T--G-C--C-TTGC----T-GCC--------C--GCCGGAT-CCC----ATT-CAC-A---------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-A-T-TTG-TTT-AAATAAAAaa
gi|92841                      :                -T---A--ACA-C-A-G----------AAAAC---A--AATCT--G-C--C-T-AC----T-GCC--------C--T----AT-CCA----ATTTCAC--------------T--T-GT--T--T---G----T--A-AG--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAA
gi|92842                      :                          A-T-A-G----------G---C---T--G---TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-A-ATTATTA---T-AAATCAAAgaaa
gi|92843                      :                                                    --A---T--G-C--C-T-GC----TTGCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--T--A-A-A-TATTG--TT-AAATTAAA
gi|92844                      :                                                       ---T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT---C-A--T-A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--A--A-A-A-TATTG-TTT-AAATTAAa





Alignments
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lowQualScore                  :        0   0 0  2222 1 0 0 0 3333333333 00 77777777 44 0 33 1 0  1111 0   11111111 3333333  0   1111   33 777777777777777777777777777777777777  0 1  22 11 0    0   0  1 0        
lowQualScore                  :        .   . .  .... . . . . .......... .. ........ .. . .. . .  .... .   ........ .......  .   ....   .. ....................................  . .  .. .. .    .   .  . .        
lowQualScore                  :        5   5 5  7777 5 5 5 5 8888888888 77 55555555 99 5 33 0 5  8888 5   99999999 7777777  5   1111   33 222222222222222222222222222222222222  5 1  33 55 5    6   6  7 6        
consensus                     : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
Reference ( family-301 )      : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92766                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92767                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92768                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92769                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92770                      : TAGGGAG-AAG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-ATTTCT--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92771                      : TAGGGAG-AAG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--T---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---ATATCTG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92772                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--G----GT-CCC----ATT-CAC-AATT-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-GAATTAAA
gi|92773                      : TAGGGAG-ATG-G-CTA---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-TC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CGC-G--T-A----T--------T--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAAa
gi|92774                      : TAGGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--A-C--C-T-GA----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-G--T-A----T--T--T--T--T-----------TG-A-AC--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAAa
gi|92775                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GT----T-TCA--------T--G----AT-CTT----ATT-CAC-A--A-AC---T--T--T-TT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATT-TTG-TT-T-AAATGAAA
gi|92776                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----T--G--T--T--T--T---ACA--TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAA-TAAA
gi|92777                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAG-T-A-GACATGTGTATG--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TA-T-AAA
gi|92778                      : TAGGGAG-AGG-G-CTT---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-TCC----ATT-AAT-G--T-A----T-----------------------TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-AAATCAAAaaataaaa
gi|92779                      : TAAGGGG-AGG-G-CTA---A-------G----------G--C---A--G-T--G-C--T-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CGC----ATT-CAC-A--T-A----T--TTCT-AT--A--G---G----TG-A-AT--A--A-AA
gi|92780                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C-------AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATAGTT--T--T-AC--A--T---G-----G-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-C-AAATCAAA
gi|92781                      : TAGGGAG-AGG-G-CTG---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--G--T-A---T--T---G----GG-A-AT--A--G-AA-------TT-T-AAAT
gi|92782                      : TAAGGGG-AGG-G-TCC---CGA-T-A-G----------G--C---C--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----A-T-CAA-A------------T--T-A----------G----TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-GAATAAAAa
gi|92783                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATGT-T--T--T-AC--A--T---G-----A-A-ATA-A--A-AATA-TT--TT-C-AAA
gi|92784                      : TAAGGAG-AGC-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-TCT----TTT--------T-A----T--G--T-AT--TA-T---A----CA-ATAT--A--A-AATA-TTG-TT-T-CAACTAAA
gi|92785                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---TTTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----AT----C-A--T-------------------------------G-A-AT--A--A-AATA-TT--TT-C-AAATCAAAa
gi|92786                      : TATGGAC-AGG-GGCTGTAAACA-T-A-G----------G--C---ATTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT---T-A--T-G----T--C--T-GT--T--TTACA----TA-A-GT--A--A-AATA-TT--TT-T-CAATCAAA
gi|92787                      : TAGGGAC-AGG-G-TTA---AAA-T-A-G----------G--CTGTAT-A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------A--C----AT-CCCATAAATT-TAT-A--T------T--T--T-GT--T--T---A-----A-A-AT--A--A-AATA-
gi|92788                      : TAGGAGG-AGG-A-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GTC--------T--G----AT-C----------TAG-A--TGA----T--T--T-ATCAT--T-------------AT--A--A-GATA-TTG-TT-T-GAAT
gi|92789                      : TAGGTAG-AGG-G-CTG---AAT-T-A-G----------G--C---T--G-T--A-T--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-CCC----ATT-CGC-T--T-A----T--------T--T--T---G----CG-AGGT--A--A-------TG-TT-C-AAATCAA
gi|92790                      : TAGGTAG-AGA-A-CTA---CAG-T-T-G----------G--C---A--G-T--G-A--T-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT--A--ATAATA-CT--TT-T-A
gi|92791                      : TACGGAA-AGG---CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T--T-G--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CTT----ATT-----A--T-G----T--T-----T--T--A---G----CA-T-AT--A--A-AATA-ATG-TT-TAAAATTAAA
gi|92792                      : TAAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-T-C-A----------G--C---TT-A-C----C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--TGA----T--T-----T--T--T---A----T--A-AT--A--A-AATA-CTG-TT-T-a
gi|92793                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CTC----AAT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--G--A-AATA-TTG-TT-T----TTAAA
gi|92794                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAaaaaa
gi|92795                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TCA-T-A-G----------G--G---A--A-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AA----TG-TT-T-AAATAAAA
gi|92796                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---GAC-T-G-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GG----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTT-TT-T----TTAAA
gi|92797                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-GT--T--T---T----TG-A-AT--A--A-TATA-TTG-TT-T-AAATt
gi|92798                      :  AGGGAG-AAG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--A-T-GC----T-GCC--------C--T----AT-CCC----ATT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--A--A-AATA-TTT-TA-T-AGA-TAAA
gi|92799                      :  AGGGAG-AGG-A-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T-T----T--T--T-GT--T-----------TG-A-AT--T--A-AATA-
gi|92800                      :  AGAGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----T--G--T--T--T--T---ACA--TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAT
gi|92801                      :  AGAGAGCAGG-G-CTA---AAG-C-A-A----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-TA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-ATAAA--A-AAAA-TCG-TT-T-AAATTAAA
gi|92802                      :  AAGGAG-AAA-A-CTT---ACA-T-A-A----------G--C---T----T--GTC--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-TT--T--C---A----T--A-AT--A--G-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92803                      :  AGGAAG-AGG-G-CTC---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCCCAAATGGGC--A----AT-CCC----ATC-AA---------------T--T-AT--------------TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-AAAT
gi|92804                      :  AAGGAA-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--C----AT-CCT-----TT-TAT-G--T-A----T--CA-T-ACA-A--T---G----TA-C-AT--AATA-AATA-TTG-TT-T-AAAa
gi|92805                      :  AGGGAG-ATG-G-CTG---AAA-T-A-A----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AC-AAC----ATT-CAC-----------------------T--T---A----AG-A-AT--A--A-AAGA-CTG-CT-T-AAaaaa
gi|92806                      :  AGGGAG-AGA-G-CGT---AAA-T-A-GAAAATG----G--C---A--G-T--G-T--C-T--T----T-ATC--------C--A----AC-AAC----ATT-AAC-AG-T-A----T--T--C--T--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AA----TG-TT-T-AAATGAAA
gi|92807                      :  AAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-TCA-G----------G--C---T----T--G-C--CCT-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-GT--TGCC---A----TT-A-AT-----A-AATA-ATG-TT-T--AATTAA
gi|92808                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-T--C-T-GC----
gi|92809                      :   GGGAG-AGG-G-CTA---AAACT-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-TCC----ATC-TA-----T-A----T--T--T-AT--T--T---T----AA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAA
gi|92810                      :   GGGAG-AGG-T-CTA---TAA-T-G-G----------G--C---C--ACT--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAATCAAAcgaa
gi|92811                      :   GGGAT-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---C--A-TT-A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-TCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAACTAGA
gi|92812                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--A--A-AATG-TT--TT-T-AAAtaa
gi|92813                      :   GAGAG-AGG-G-CTA---TAA-C-A-A----------G--C---T--A-TC-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CACTA--T-A------------AT--T--C---G----TG-A-AT--A--A-Aaaaga
gi|92814                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----G--T--T-AT--C--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-TT-T-AA
gi|92815                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--A---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----TTT-C--------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--G--A-AGTA--TG-TT-T-AAATCAA
gi|92816                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--A-C--C-T-GT----T-GAC--------C--A----AT-CCT----TTT-GA--A------------T--T-AT--T--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-TT-T-AAAT
gi|92817                      :   GAGAG-AAG-G-CTA---AAA-C-A-G----------A--T---T--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--C----GT-CCC----TTT-TAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT
gi|92818                      :   GGGAG-AGG-G-ATC---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-G--G-T--C-T-GC----T-ATC--------C--A----AT-CCC----A----GC-A----A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--ATTA-AATA-TT--TT-T-GAAATAAA
gi|92819                      :   GGGGG-GGG-G-CTA---AAA-C-A-A----------G--C---T--T-T--A-C--C-T-AC----T-GCC--------A--A----AT-CCC----ATT-CA--------------------GG--T--T---GA---TG-G-AT--G--A-AATT-TTG-TT-T-AAA
gi|92820                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--A----AT--CC----ATT-
gi|92821                      :   GGGAG-AGA-G-CTA---AAA-T-A-G----------A--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CGC----ATT-CA
gi|92822                      :    GGAG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------T--G----AT-CCC----ATT---C-A--T-A----T--T--T-TT--T--T-----------A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-----ATTAA
gi|92823                      :    GGAG-AGG-G-CTTTT-ACA-T-A-A----------G--G---A--A-TT-G-C--C-T-G-----T-GCC--------CAGG----ATGCCC----ATT-CAC-A--A-A----T--T--TTAT--T--T---G----TG-A-ATT-A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATgaaaa
gi|92824                      :    GGAG-GGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT------TA-T-AAATTAAA
gi|92825                      :    GGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG----------A-AATT-TTT-TT-T-AA--TAAAa
gi|92826                      :    GGAC-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----CTT-TATTG--T-G----T--T--C-TT--A--C---A----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAACAAA
gi|92827                      :    GGAG-AGG-G-CTT---CTA-T-A-G----------G--C---T--C-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT--CC----ATT-TAC-A------------T--T-AT--A--C---A----TG---AT--A--A-AATA--TG-AC-T-AAATTAAa
gi|92828                      :    GGAG-AGG-G-CTA---GTA-T-G-G----------A--T------T-T--A-C--CTT-GT----T-GCC--------C--A----AT-CTC----ATT-CA--G--T-A----T-----------------------TG-A-AT--A--A-AATG-TTG-TA-T-AAAT
gi|92829                      :    GGAG-AGGCG-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCT----TTT-TAT-G--T-A-------T--C-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-ATAA-TTGCTT-T-AAA
gi|92830                      :    GGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-G-G----------GTTC---A-------G-C--C-T-GC----T-GCC--------G--A----AT--CC----ATT---C-A--T-G----T--TA-T-AC--C--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-AT-T-AAATCAA
gi|92831                      :     GAG-AGG-A-TTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCC----ATT--AC-G----A----T--T--T--T--C--C---A----T--A-AT--A--A-AAGA-CTG-TT-T-AAAT
gi|92832                      :     GAG-ATG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-A--C-T-GT----T-GTG--------C--A----AT-CCT-----TT-CAT-G--T-A-------T--T-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-AATG-TTG-AT-T-AAA
gi|92833                      :      AG-AGG-A-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----TGTT--T-AT--A--C---G----CA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAgaa
gi|92834                      :      AG-AGG-G-CTA---ACA-A-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--caaa
gi|92835                      :      AG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AG-CCC----ATT-AAC-A--T---------------T--T--C---A----TG-A-AT-----A-GATA-TTG-TT-T-AGAT
gi|92836                      :      AG-AAG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T----T--G-CT-C-T-AC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-----T--T---G----CATA-AT--A--A-TATA-ATG-TT-T-AAA
gi|92837                      :        -AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GCATGAT-GCC--------C--G----AC-CCA----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92838                      :        -AGG-G--TT---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--T-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT-----G-AATATTTG-TT-T-AAAT
gi|92839                      :           G-G-ATA---GTA-T-A-G----------C--C---A--A-C--G-C--C-T-GTCT--T-GTC--------C--A----AT-CCC----GTT-CAC-A--T-A----T--T--T--T--C--TAA-G----CG-A-ATA-A--A-AATA-TTG-TT-T-CAAT
gi|92840                      :            -G-CTA---ATA-T-AAG----------G--C---A--A-T--G-C--C-TTGC----T-GCC--------C--GCCGGAT-CCC----ATT-CAC-A---------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT--TTG-TT-T-AAATAAAAaa
gi|92841                      :                                                   -T--G-C--C-T-AC----T-GCC--------C--T----AT-CCA----ATTTCAC--------------T--T-GT--T--T---G----T--A-AG--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAA
gi|92842                      :     taacacagaaaacaaatcA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAATCAAAgaaa
gi|92843                      :                                                --A-T--G-C--C-T-GC----TTGCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--T--A-AATA-TTG--T-T-AAATTAAA
gi|92844                      :                                                   -T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT---C-A--T-A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAa





Alignments
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lowQualScore                  :        .   . .  .... . . . . .......... .. ........ .. . .. . .  .... .   ........ .......  .   ....   .. ....................................  . .  .. .. .    .   .  . .        
lowQualScore                  :        5   5 5  7777 5 5 5 5 8888888888 77 55555555 99 5 33 0 5  8888 5   99999999 7777777  5   1111   33 222222222222222222222222222222222222  5 1  33 55 5    6   6  7 6        
consensus                     : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
Reference ( family-301 )      : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92766                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92767                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATAAAA
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gi|92775                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GT----T-TCA--------T--G----AT-CTT----ATT-CAC-A--A-AC---T--T--T-TT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATT-TTG-TT-T-AAATGAAA
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gi|92777                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAG-T-A-GACATGTGTATG--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TA-T-AAA
gi|92778                      : TAGGGAG-AGG-G-CTT---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-TCC----ATT-AAT-G--T-A----T-----------------------TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-AAATCAAAaaataaaa
gi|92779                      : TAAGGGG-AGG-G-CTA---A-------G----------G--C---A--G-T--G-C--T-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CGC----ATT-CAC-A--T-A----T--TTCT-AT--A--G---G----TG-A-AT--A--A-AA
gi|92780                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C-------AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATAGTT--T--T-AC--A--T---G-----G-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-C-AAATCAAA
gi|92781                      : TAGGGAG-AGG-G-CTG---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--G--T-A---T--T---G----GG-A-AT--A--G-AA-------TT-T-AAAT
gi|92782                      : TAAGGGG-AGG-G-TCC---CGA-T-A-G----------G--C---C--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----A-T-CAA-A------------T--T-A----------G----TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-GAATAAAAa
gi|92783                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-ATGT-T--T--T-AC--A--T---G-----A-A-ATA-A--A-AATA-TT--TT-C-AAA
gi|92784                      : TAAGGAG-AGC-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-TCT----TTT--------T-A----T--G--T-AT--TA-T---A----CA-ATAT--A--A-AATA-TTG-TT-T-CAACTAAA
gi|92785                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---TTTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----AT----C-A--T-------------------------------G-A-AT--A--A-AATA-TT--TT-C-AAATCAAAa
gi|92786                      : TATGGAC-AGG-GGCTGTAAACA-T-A-G----------G--C---ATTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT---T-A--T-G----T--C--T-GT--T--TTACA----TA-A-GT--A--A-AATA-TT--TT-T-CAATCAAA
gi|92787                      : TAGGGAC-AGG-G-TTA---AAA-T-A-G----------G--CTGTAT-A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------A--C----AT-CCCATAAATT-TAT-A--T------T--T--T-GT--T--T---A-----A-A-AT--A--A-AATA-
gi|92788                      : TAGGAGG-AGG-A-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GTC--------T--G----AT-C----------TAG-A--TGA----T--T--T-ATCAT--T-------------AT--A--A-GATA-TTG-TT-T-GAAT
gi|92789                      : TAGGTAG-AGG-G-CTG---AAT-T-A-G----------G--C---T--G-T--A-T--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-CCC----ATT-CGC-T--T-A----T--------T--T--T---G----CG-AGGT--A--A-------TG-TT-C-AAATCAA
gi|92790                      : TAGGTAG-AGA-A-CTA---CAG-T-T-G----------G--C---A--G-T--G-A--T-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT--A--ATAATA-CT--TT-T-A
gi|92791                      : TACGGAA-AGG---CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T--T-G--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CTT----ATT-----A--T-G----T--T-----T--T--A---G----CA-T-AT--A--A-AATA-ATG-TT-TAAAATTAAA
gi|92792                      : TAAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-T-C-A----------G--C---TT-A-C----C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--TGA----T--T-----T--T--T---A----T--A-AT--A--A-AATA-CTG-TT-T-a
gi|92793                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CTC----AAT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--G--A-AATA-TTG-TT-T----TTAAA
gi|92794                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAaaaaa
gi|92795                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TCA-T-A-G----------G--G---A--A-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AA----TG-TT-T-AAATAAAA
gi|92796                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---GAC-T-G-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GG----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-CT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTT-TT-T----TTAAA
gi|92797                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-GT--T--T---T----TG-A-AT--A--A-TATA-TTG-TT-T-AAATt
gi|92798                      :  AGGGAG-AAG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--A-T-GC----T-GCC--------C--T----AT-CCC----ATT-CAT-A------------T--T-AT--T-----------TG-A-AT--A--A-AATA-TTT-TA-T-AGA-TAAA
gi|92799                      :  AGGGAG-AGG-A-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAT-A--T-T----T--T--T-GT--T-----------TG-A-AT--T--A-AATA-
gi|92800                      :  AGAGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----T--G--T--T--T--T---ACA--TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAT
gi|92801                      :  AGAGAGCAGG-G-CTA---AAG-C-A-A----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-TA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-ATAAA--A-AAAA-TCG-TT-T-AAATTAAA
gi|92802                      :  AAGGAG-AAA-A-CTT---ACA-T-A-A----------G--C---T----T--GTC--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-TT--T--C---A----T--A-AT--A--G-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92803                      :  AGGAAG-AGG-G-CTC---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCCCAAATGGGC--A----AT-CCC----ATC-AA---------------T--T-AT--------------TG-A-AT-----A-AATA-TTG-TT-T-AAAT
gi|92804                      :  AAGGAA-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--C----AT-CCT-----TT-TAT-G--T-A----T--CA-T-ACA-A--T---G----TA-C-AT--AATA-AATA-TTG-TT-T-AAAa
gi|92805                      :  AGGGAG-ATG-G-CTG---AAA-T-A-A----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AC-AAC----ATT-CAC-----------------------T--T---A----AG-A-AT--A--A-AAGA-CTG-CT-T-AAaaaa
gi|92806                      :  AGGGAG-AGA-G-CGT---AAA-T-A-GAAAATG----G--C---A--G-T--G-T--C-T--T----T-ATC--------C--A----AC-AAC----ATT-AAC-AG-T-A----T--T--C--T--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AA----TG-TT-T-AAATGAAA
gi|92807                      :  AAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-TCA-G----------G--C---T----T--G-C--CCT-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-GT--TGCC---A----TT-A-AT-----A-AATA-ATG-TT-T--AATTAA
gi|92808                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-T--C-T-GC----
gi|92809                      :   GGGAG-AGG-G-CTA---AAACT-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-TCC----ATC-TA-----T-A----T--T--T-AT--T--T---T----AA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAA
gi|92810                      :   GGGAG-AGG-T-CTA---TAA-T-G-G----------G--C---C--ACT--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAATCAAAcgaa
gi|92811                      :   GGGAT-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---C--A-TT-A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-TCC----ATT-CAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAACTAGA
gi|92812                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--A--A-AATG-TT--TT-T-AAAtaa
gi|92813                      :   GAGAG-AGG-G-CTA---TAA-C-A-A----------G--C---T--A-TC-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CACTA--T-A------------AT--T--C---G----TG-A-AT--A--A-Aaaaga
gi|92814                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CC----ATT-TG-------A----G--T--T-AT--C--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-TT-T-AA
gi|92815                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--A---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCA----TTT-C--------A----T--T--T-AT--T--C-----------A-AT--G--A-AGTA--TG-TT-T-AAATCAA
gi|92816                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--A-C--C-T-GT----T-GAC--------C--A----AT-CCT----TTT-GA--A------------T--T-AT--T--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-TT-T-AAAT
gi|92817                      :   GAGAG-AAG-G-CTA---AAA-C-A-G----------A--T---T--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--C----GT-CCC----TTT-TAC-----------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT
gi|92818                      :   GGGAG-AGG-G-ATC---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-G--G-T--C-T-GC----T-ATC--------C--A----AT-CCC----A----GC-A----A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--ATTA-AATA-TT--TT-T-GAAATAAA
gi|92819                      :   GGGGG-GGG-G-CTA---AAA-C-A-A----------G--C---T--T-T--A-C--C-T-AC----T-GCC--------A--A----AT-CCC----ATT-CA--------------------GG--T--T---GA---TG-G-AT--G--A-AATT-TTG-TT-T-AAA
gi|92820                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--A----AT--CC----ATT-
gi|92821                      :   GGGAG-AGA-G-CTA---AAA-T-A-G----------A--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CGC----ATT-CA
gi|92822                      :    GGAG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------T--G----AT-CCC----ATT---C-A--T-A----T--T--T-TT--T--T-----------A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-----ATTAA
gi|92823                      :    GGAG-AGG-G-CTTTT-ACA-T-A-A----------G--G---A--A-TT-G-C--C-T-G-----T-GCC--------CAGG----ATGCCC----ATT-CAC-A--A-A----T--T--TTAT--T--T---G----TG-A-ATT-A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATgaaaa
gi|92824                      :    GGAG-GGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT------TA-T-AAATTAAA
gi|92825                      :    GGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG----------A-AATT-TTT-TT-T-AA--TAAAa
gi|92826                      :    GGAC-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----CTT-TATTG--T-G----T--T--C-TT--A--C---A----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAACAAA
gi|92827                      :    GGAG-AGG-G-CTT---CTA-T-A-G----------G--C---T--C-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT--CC----ATT-TAC-A------------T--T-AT--A--C---A----TG---AT--A--A-AATA--TG-AC-T-AAATTAAa
gi|92828                      :    GGAG-AGG-G-CTA---GTA-T-G-G----------A--T------T-T--A-C--CTT-GT----T-GCC--------C--A----AT-CTC----ATT-CA--G--T-A----T-----------------------TG-A-AT--A--A-AATG-TTG-TA-T-AAAT
gi|92829                      :    GGAG-AGGCG-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCT----TTT-TAT-G--T-A-------T--C-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-ATAA-TTGCTT-T-AAA
gi|92830                      :    GGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-G-G----------GTTC---A-------G-C--C-T-GC----T-GCC--------G--A----AT--CC----ATT---C-A--T-G----T--TA-T-AC--C--T-----------A-AT--A--A-AATA--TG-AT-T-AAATCAA
gi|92831                      :     GAG-AGG-A-TTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCC----ATT--AC-G----A----T--T--T--T--C--C---A----T--A-AT--A--A-AAGA-CTG-TT-T-AAAT
gi|92832                      :     GAG-ATG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-A--C-T-GT----T-GTG--------C--A----AT-CCT-----TT-CAT-G--T-A-------T--T-AT--A--C---A----T--A-AT--A--A-AATG-TTG-AT-T-AAA
gi|92833                      :      AG-AGG-A-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCA----ATT-TAT-G--T-A----TGTT--T-AT--A--C---G----CA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-C-AAAgaa
gi|92834                      :      AG-AGG-G-CTA---ACA-A-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--caaa
gi|92835                      :      AG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AG-CCC----ATT-AAC-A--T---------------T--T--C---A----TG-A-AT-----A-GATA-TTG-TT-T-AGAT
gi|92836                      :      AG-AAG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T----T--G-CT-C-T-AC----T-GCC--------T--A----AT-CCT----ATT-----A--T-G----T--T--T-----T--T---G----CATA-AT--A--A-TATA-ATG-TT-T-AAA
gi|92837                      :        -AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GCATGAT-GCC--------C--G----AC-CCA----ATT-CAT-A--T---------------T--T--T---T----TA-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92838                      :        -AGG-G--TT---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--T-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCC----ATT-CA------------------T-AT--T--T---T----TG-A-AT-----G-AATATTTG-TT-T-AAAT
gi|92839                      :           G-G-ATA---GTA-T-A-G----------C--C---A--A-C--G-C--C-T-GTCT--T-GTC--------C--A----AT-CCC----GTT-CAC-A--T-A----T--T--T--T--C--TAA-G----CG-A-ATA-A--A-AATA-TTG-TT-T-CAAT
gi|92840                      :            -G-CTA---ATA-T-AAG----------G--C---A--A-T--G-C--C-TTGC----T-GCC--------C--GCCGGAT-CCC----ATT-CAC-A---------------T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AAT--TTG-TT-T-AAATAAAAaa
gi|92841                      :                                                   -T--G-C--C-T-AC----T-GCC--------C--T----AT-CCA----ATTTCAC--------------T--T-GT--T--T---G----T--A-AG--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAA
gi|92842                      :     taacacagaaaacaaatcA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCC----ATT-CAC-----------T--T--T-A---T--T---G----TG-A-AT--A--A-A--A-TTA-TTAT-AAATCAAAgaaa
gi|92843                      :                                                --A-T--G-C--C-T-GC----TTGCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--T--A-AATA-TTG--T-T-AAATTAAA
gi|92844                      :                                                   -T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT---C-A--T-A----T--T--T-AT--------------TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAa


blockSeqs                     :                 GTAA C       ACATGTGTAT    TGTATA   GC   GC C    ATGA     CAAATGGG GCCGG        ATAA   TC CATATTTCTTTATTTG                        T  AA AT             A
blockSeqs                     :                 TTT  C       AAAATG        TTTG     GC   GC T    CT       .        AGG          .      C  CATATTTCTTTATATC                        G  A  TT             A
blockSeqs                     :                 A    C       .             ATTG     T    GC .    .        .        G            .      C  TGTATAGTTTTACATG                        .  T  .              A
blockSeqs                     :                 A    C       .             TTA      T    GC .    .        .        G            .      C  TGTATGTTTTACATG                         .  A  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             CAC      C    T  .    .        .        G            .      C  TATGTCTGTTTTACA                         .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       T    .  .    .        .        G            .      C  CAATTATTTCTTTG                          .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    T       .             AA       T    .  .    .        .        G            .      C  CATATTTCTATAGG                          .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       T    .  .    .        .        G            .      C  GATGATTTATCATT                          .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AA       T    .  .    .        .        G            .      C  TGTATCATACAATG                          .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      C  TGTATGTTTATACG                          .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      T  CAAACTTTTTTTG                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      C  TGTATGTTTTACA                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      A  TGTATGTTTTACA                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  ATGTTTGTTGCCA                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    G       .             AT       .    .  .    .        .        G            .      T  CAAATTTTATTTG                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  TTGTGTTCTTACA                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 G    T       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      C  CATATTTTCTAAG                           .  .  .              .
blockSeqs                     :                 C    C       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      T  CATATTTATTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AT       .    .  .    .        .        A            .      T  CATATTTATTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      T  CATATTTATTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             CA       .    .  .    .        .        A            .      C  CATATTTCTTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AT       .    .  .    .        .        C            .      C  CATATTTCTTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      C  CATATTTCTTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 G    C       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  CAGTATTCTTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      C  CATGTTATACCT                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  CATATTTATTTG                            .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             TT       .    .  .    .        .        A            .      C  TATGTATTATA                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             TG       .    .  .    .        .        G            .      C  TATTTTGTTTA                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      C  ATGTTTTTTCA                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      T  CATATTTTTTT                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AA       .    .  .    .        .        G            .      T  TGTATCATACA                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      A  TGTATTATACA                             .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       .    .  .    .        .        T            .      T  ATGATTTTTA                              .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AG       .    .  .    .        .        G            .      C  TATTTTTGTT                              .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AT       .    .  .    .        .        A            .      A  TATTTATTTT                              .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    T       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      T  CTATAATTCG                              .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      C  CGATTTTCCA                              .  .  .              .
blockSeqs                     :                 C    A       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      C  CGTATTTTG                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             TG       .    .  .    .        .        C            .      T  CGTATTTTT                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 G    C       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  CTTATTTTG                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      T  ATGTTTTAG                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  CATTATACA                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             CA       .    .  .    .        .        A            .      G  ATGTTTTTG                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      T  CATATTTAT                               .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    T       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  CTGTATTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  ATTTATTC                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  AGTTATCT                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    T       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  ATTTATTC                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  CAATTTAT                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      T  CTTTATTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             TT       .    .  .    .        .        C            .      T  CTTTATTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             TA       .    .  .    .        .        A            .      C  CATATTTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 C    T       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      T  CTTGTTTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      C  CTTTATTG                                .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      T  TATTTTT                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             TG       .    .  .    .        .        G            .      C  TATTATT                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      A  TATTATT                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AT       .    .  .    .        .        A            .      C  CTATTTG                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             TC       .    .  .    .        .        A            .      C  CTATTTG                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             TA       .    .  .    .        .        G            .      C  ATTATTT                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      C  CTATTTG                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    T       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      C  CATTTCA                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             AT       .    .  .    .        .        A            .      C  TATTTTT                                 .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      .  AATTAG                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    T       .             TG       .    .  .    .        .        A            .      .  TATTTT                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    C       .             AG       .    .  .    .        .        A            .      .  TGTTTT                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AG       .    .  .    .        .        G            .      .  TATTTT                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    A       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      .  GGTTGA                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 A    C       .             AA       .    .  .    .        .        A            .      .  TATTTT                                  .  .  .              .
blockSeqs                     :                 T    A       .             TG       .    .  .    .        .        G            .      .  TGTAT                                   .  .  .               
blockSeqs                     :                 A    A       .             T        .    .  .    .        .        A            .      .  TTAT                                    .  .  .               
blockSeqs                     :                 T    T       .             T        .    .  .    .        .        A            .      .  CTTA                                    .  .  .               
blockSeqs                     :                 A    T       .             T        .    .  .    .        .        T            .      .  GTAT                                    .  .  .               
blockSeqs                     :                 A    .       .             A        .    .  .    .        .        A            .      .  CAT                                     .  .  .               
blockSeqs                     :                              .             T        .    .  .    .        .        G            .      .                                                                
blockSeqs                     :                                                     .    .  .    .        .        G            .      .                                                                
blockSeqs                     :                                                     .    .  .    .        .        .            .                                                                       
blockSeqs                     :                                                     .    .  .    .                                                                                                      


blockSeqCons                  :                                                                                                           CGTATTTATTTG************************
originalCons                  : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CAC-A--T-A----T--T--T-AT--T--T---G----TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA
finalCons                     : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCC----ATT-CACGTATTTATTTG------------------------TG-A-AT--A--A-AATA-TTG-TT-T-AAATTAAA





Alignments
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lowQualScore                  :        0   0 0  2222 1 0 0 0 3333333333 00 77777777 44 0 44 1 0  1111 0   11111111 3333333  0      0  55555555555555555555555555555555 000  1  11 11 0  0  0   0  1 0        
lowQualScore                  :        .   . .  .... . . . . .......... .. ........ .. . .. . .  .... .   ........ .......  .      .  ................................ ...  .  .. .. .  .  .   .  . .        
lowQualScore                  :        5   5 5  7777 5 5 5 5 8888888888 77 55555555 22 5 00 0 5  8888 5   99999999 7777777  5      5  22222222222222222222222222222222 999  1  88 55 5  5  6   6  7 6        
consensus                     : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-G--TA----TT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAA
Reference ( family-301 )      : TAGGGAG-AGG-G-CTN---ANA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-G--TA----TT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92766                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92767                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATAAAA
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gi|92770                      : TAGGGAG-AAG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TATTTCTT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92771                      : TAGGGAG-AAG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--T---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-CT--T--T--ATATCT---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATAAAA
gi|92772                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--G----GT-CCCATT-CAC-AATTA----TT--T-CT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-GAATTAAA
gi|92773                      : TAGGGAG-ATG-G-CTA---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-TC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CGC-G--TA----T------T--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAAa
gi|92774                      : TAGGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--A-C--C-T-GA----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-G--TA----TT--T--T--T----------T---GA-AC--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATAAAAa
gi|92775                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GT----T-TCA--------T--G----AT-CTTATT-CAC-A--AAC---TT--T-TT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TT-TTG-TT-T-AAATGAAA
gi|92776                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCAATT-TAT-G--TA----TG--T--T--T--TACA----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-C-AAA-TAAA
gi|92777                      : TAGGGAG-AGG-G-CTA---AAG-T-A-GACATGTGTATG--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CA-----TA----TT--T--T--T----------T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TA-T-AAA
gi|92778                      : TAGGGAG-AGG-G-CTT---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-TCCATT-AAT-G--TA----T--------------------T---GA-AT-----A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATCAAAaaataaaa
gi|92779                      : TAAGGGG-AGG-G-CTA---A-------G----------G--C---A--G-T--G-C--T-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CGCATT-CAC-A--TA----TTTCT-AT--A--G--G----T---GA-AT--A--A-AA-
gi|92780                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-TGCG-C--C-T-GC----T-GCC--------C-------AT-CCAATT-TAT-G--TATAGTTT--T-AC--A--T--G--------GA-AT-----A-AA-TA-TTG-TT-C-AAATCAAA
gi|92781                      : TAGGGAG-AGG-G-CTG---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CACTG--TA--------------T--T--G----G---GA-AT--A--G-AA--------TT-T-AAAT
gi|92782                      : TAAGGGG-AGG-G-TCC---CGA-T-A-G----------G--C---C--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATC-AA-----------------AT--T--A--G----T---GA-AT-----A-AA-TA-TTG-TT-T-GAATAAAAa
gi|92783                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCAATT-TAT-G--TATGT-TT--T-AC--A--T--G--------AA-ATA-A--A-AA-TA-TT--TT-C-AAA
gi|92784                      : TAAGGAG-AGC-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-TCTTTT-TAT-G--TA-----T--T-A------T--A----C---AATAT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-CAACTAAA
gi|92785                      : TATGGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---TTTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCAAT--CA--------------------------------T---GA-AT--A--A-AA-TA-TT--TT-C-AAATCAAAa
gi|92786                      : TATGGAC-AGG-GGCTGTAAACA-T-A-G----------G--C---ATTG-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCAATT-TAT-G--TC----TG--T--T--T--TACA----T---AA-GT--A--A-AA-TA-TT--TT-T-CAATCAAA
gi|92787                      : TAGGGAC-AGG-G-TTA---AAA-T-A-G----------G--CTGTAT-A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------A--C----AT-CCCATA-AAT-T--TA----TA--T--T--T--T--G----TTTAAA-AT--A--A-AA-TA-
gi|92788                      : TAGGAGG-AGG-A-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GTC--------T--G----AT-C---TA-GAT-G---A----TT--T-ATCAT--T--------------AT--A--A-GA-TA-TTG-TT-T-GAAT
gi|92789                      : TAGGTAG-AGG-G-CTG---AAT-T-A-G----------G--C---T--G-T--A-T--C-T-GC----T-ACC--------C--A----AT-CCCATT-CGC-T--TA----T------T--T--T--G----C---GAGGT--A--A--------TG-TT-C-AAATCAA
gi|92790                      : TAGGTAG-AGA-A-CTA---CAG-T-T-G----------G--C---A--G-T--G-A--T-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CA---------------T-AT--T--T--T----T---GA-AT--A--ATAA-TA-CT--TT-T-A
gi|92791                      : TACGGAA-AGG---CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T--T-G--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CTTATT--AT-G--T-----TT--T-A---------G----C---AT-AT--A--A-AA-TA-ATG-TT-TAAAATTAAA
gi|92792                      : TAAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-T-C-A----------G--C---TT-A-C----C--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCTATT--AT-G---A----TT-----T--T--T--A----T----A-AT--A--A-AA-TA-CTG-TT-T-a
gi|92793                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CTCAAT-CA-----TA-----T--T-AT--T----------T---GA-AT--G--A-AA-TA-TTG-TT-T----TTAAA
gi|92794                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-CT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAaaaaa
gi|92795                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---TCA-T-A-G----------G--G---A--A-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-CT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-----TG-TT-T-AAATAAAA
gi|92796                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---GAC-T-G-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GG----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-CT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTT-TT-T----TTAAA
gi|92797                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCCATT-CAT-G--T-----TT--T----------------T---GA-AT--A--A-TA-TA-TTG-TT-T-AAATt
gi|92798                      :  AGGGAG-AAG-G-CTA---AAC-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--A-T-GC----T-GCC--------C--T----AT-CCCATT-CA-----TA-----T--T-AT--T----------T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTT-TA-T-AGA-TAAA
gi|92799                      :  AGGGAG-AGG-A-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--G----AT-CCCATT-CAT-A--TT----TT--T-GT--T----------T---GA-AT--T--A-AA-TA-
gi|92800                      :  AGAGAG-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCAATT-TAT-G--TA----TG--T--T--T--T--ACA--T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-C-AAAT
gi|92801                      :  AGAGAGCAGG-G-CTA---AAG-C-A-A----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-TA---------------T-AT--T--T--T----T---GA-ATAAA--A-AA-AA-TCG-TT-T-AAATTAAA
gi|92802                      :  AAGGAG-AAA-A-CTT---ACA-T-A-A----------G--C---T----T--GTC--C-T-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCTATT--AT-G--T-----TT--T--T--T--C--A----T----A-AT--A--G-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92803                      :  AGGAAG-AGG-G-CTC---GTA-T-A-G----------G--C---A--A-A--G-C--C-T-GC----T-GCCCAAATGGGC--A----AT-CCCATC-AA------------T--T-AT-------------T---GA-AT-----A-AA-TA-TTG-TT-T-AAAT
gi|92804                      :  AAGGAA-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--C----AT-CCT-TT-TAT-G--TA----TCA-T-ACA-A--T--G----T---AC-AT--AATA-AA-TA-TTG-TT-T-AAAa
gi|92805                      :  AGGGAG-ATG-G-CTG---AAA-T-A-A----------G--C---T--G-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AC-AACATT-CAC--------------------T--T--A----A---GA-AT--A--A-AA-GA-CTG-CT-T-AAaaaa
gi|92806                      :  AGGGAG-AGA-G-CGT---AAA-T-A-GAAAATG----G--C---A--G-T--G-T--C-T--T----T-ATC--------C--A----AC-AACATT-AACAG--TA----TT--C--T--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-----TG-TT-T-AAATGAAA
gi|92807                      :  AAGGAG-AAG-G-CTT---ACA-TCA-G----------G--C---T----T--G-C--CCT-GC----T-GCC--------T--A----AT-CCTATT-----A--TG----TT--T-GT--TGCC--A----T---TA-AT-----A-AA-TA-ATG-TT-T--AATTAA
gi|92808                      :  AGGGAG-AGG-G-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--A-T--G-T--C-T-GC----
gi|92809                      :   GGGAG-AGG-G-CTA---AAACT-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-TCCATC-TA-----TA----TT--T-AT--T--T--T----A---AA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAA
gi|92810                      :   GGGAG-AGG-T-CTA---TAA-T-G-G----------G--C---C--ACT--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC--------------T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-A---A-TTA-TTAT-AAATCAAAcgaa
gi|92811                      :   GGGAT-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---C--A-TT-A-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-TCCATT-CAC--------------T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-A---A-TTA-TTAT-AAACTAGA
gi|92812                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CCATT-TG------A----TT--T-AT--T--C------------A-AT--A--A-AA-TG-TT--TT-T-AAAtaa
gi|92813                      :   GAGAG-AGG-G-CTA---TAA-C-A-A----------G--C---T--A-TC-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC----TA-----T--A-AT--T--C--G----T---GA-AT--A--A-Aaaaga
gi|92814                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT--CCATT-TGA-G---------T--T-AT--C--T------------A-AT--A--A-AA-TA--TG-TT-T-AA
gi|92815                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--A---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--A----AT-CCATTT-C-------A----TT--T-AT--T--C------------A-AT--G--A-AG-TA--TG-TT-T-AAATCAA
gi|92816                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--A-C--C-T-GT----T-GAC--------C--A----AT-CCTTTT-GA------A-----T--T-AT--T--T------------A-AT--A--A-AA-TA--TG-TT-T-AAAT
gi|92817                      :   GAGAG-AAG-G-CTA---AAA-C-A-G----------A--T---T--A-T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------T--C----GT-CCCTTT-TAC--------------T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-T
gi|92818                      :   GGGAG-AGG-G-ATC---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-G--G-T--C-T-GC----T-ATC--------C--A----AT-CCCA-G-CA------A----TT--T-AT-------------T---GA-AT--ATTA-AA-TA-TT--TT-T-GAAATAAA
gi|92819                      :   GGGGG-GGG-G-CTA---AAA-C-A-A----------G--C---T--T-T--A-C--C-T-AC----T-GCC--------A--A----AT-CCCATT-CAG-G------------------T--T--GA---T---GG-AT--G--A-AA-TT-TTG-TT-T-AAA
gi|92820                      :   GGGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-T--G-C--C-T-GT----T-GTC--------C--A----AT--CCATT-
gi|92821                      :   GGGAG-AGA-G-CTA---AAA-T-A-G----------A--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CGCATT-CA
gi|92822                      :    GGAG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------T--G----AT-CCCATT-CA-----TA----TT--T-TT--T--T------------A-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-----ATTAA
gi|92823                      :    GGAG-AGG-G-CTTTT-ACA-T-A-A----------G--G---A--A-TT-G-C--C-T-G-----T-GCC--------CAGG----ATGCCCATT-CAC-A--AA----TT--TTAT--T--T--G----T---GA-ATT-A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATgaaaa
gi|92824                      :    GGAG-GGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC----------TT--T-A---T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-T------TA-T-AAATTAAA
gi|92825                      :    GGAG-AGG-G-CTA---TAA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC----------TT--T-A---T--T--G----T---G---------A-AA-TT-TTT-TT-T-AA--TAAAa
gi|92826                      :    GGAC-AGG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCACTT-TATTG--TG----TT--C-TT--A--C--A----T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-C-AAAACAAA
gi|92827                      :    GGAG-AGG-G-CTT---CTA-T-A-G----------G--C---T--C-A--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT--CCATT-TAC-A---------T--T-AT--A--C--A----T---G--AT--A--A-AA-TA--TG-AC-T-AAATTAAa
gi|92828                      :    GGAG-AGG-G-CTA---GTA-T-G-G----------A--T------T-T--A-C--CTT-GT----T-GCC--------C--A----AT-CTCATT-CA--G--TA----T--------------------T---GA-AT--A--A-AA-TG-TTG-TA-T-AAAT
gi|92829                      :    GGAG-AGGCG-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---T--A-C--G-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCTTTT-TAT-G--TA-----T--C-AT--A--C--A----T----A-AT--A--A-AT-AA-TTGCTT-T-AAA
gi|92830                      :    GGAG-AGG-G-CTT---ATA-T-G-G----------GTTC---A-------G-C--C-T-GC----T-GCC--------G--A----AT--CCATT-CAT-G--T-----TA--T-AC--C--T------------A-AT--A--A-AA-TA--TG-AT-T-AAATCAA
gi|92831                      :     GAG-AGG-A-TTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--G-T--A-C--C-T-GC----T-GTC--------C--A----AT-CCCATT--AC-G---A----TT--T--T--C--C--A----T----A-AT--A--A-AA-GA-CTG-TT-T-AAAT
gi|92832                      :     GAG-ATG-G-CTT---ATA-T-A-G----------G--C---A--A-C--G-A--C-T-GT----T-GTG--------C--A----AT-CCT-TT-CAT-G--TA-----T--T-AT--A--C--A----T----A-AT--A--A-AA-TG-TTG-AT-T-AAA
gi|92833                      :      AG-AGG-A-CTA---ACA-T-A-G----------G--C---A--T-T--G-CGCC-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCAATT-TAT-G--TATG--TT--T-AT--A--C--G----C---AA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-C-AAAgaa
gi|92834                      :      AG-AGG-G-CTA---ACA-A-A-G----------G--C---A--A-T--G-C--C-T-GT----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--caaa
gi|92835                      :      AG-AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--T---T--G-T--G-T--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AG-CCCATT-AAC-A--T------------T--T--C--A----T---GA-AT-----A-GA-TA-TTG-TT-T-AGAT
gi|92836                      :      AG-AAG-G-CTT---ACA-T-A-G----------G--C---T----T--G-CT-C-T-AC----T-GCC--------T--A----AT-CCTATT--AT-G--TT----TT--T-GC--A--T------------A-AT--A--A-TA-TA-ATG-TT-T-AAA
gi|92837                      :        -AGG-G-CTA---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-C--C-T-GCATGAT-GCC--------C--G----AC-CCAATT-CA-----TA----TT--T-----T--T-------T---AA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAA
gi|92838                      :        -AGG-G--TT---AAA-T-A-G----------G--C---A--G-T--G-T--T-T-GC----T-GCC--------C--A----GT-CCCATT-CA---------------T-AT--T--T--T----T---GA-AT-----G-AA-TATTTG-TT-T-AAAT
gi|92839                      :           G-G-ATA---GTA-T-A-G----------C--C---A--A-C--G-C--C-T-GTCT--T-GTC--------C--A----AT-CCCGTT-CAC-A--TA----TT--T--T--C--TAAG----C---GA-AT--A--A-AAATA-TTG-TT-T-CAAT
gi|92840                      :            -G-CTA---ATA-T-AAG----------G--C---A--A-T--G-C--C-TTGC----T-GCC--------C--GCCGGAT-CCCATT-CAC-A------------T-AT--T--T--G----T---GA-AT--A--A-AA-T--TTG-TT-T-AAATAAAAaa
gi|92841                      :                                                   -T--G-C--C-T-AC----T-GCC--------C--T----AT-CCAATTTCAC-----------T--T-GT--T--T--G----T----A-AG--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAA
gi|92842                      :     taacacagaaaacaaatcA-T-A-G----------G--C---T--G-TT-G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--A----AT-CCCATT-CAC----------TT--T-A---T--T--G----T---GA-AT--A--A-A---A-TTA-TTAT-AAATCAAAgaaa
gi|92843                      :                                                --A-T--G-C--C-T-GC----TTGCC--------C--G----AT-CCCATT-CAC-A--TA----TT--T-AT--T--T--G----T---GA-AT--T--A-AA-TA-TTG--T-T-AAATTAAA
gi|92844                      :                                                   -T--G-C--C-T-GC----T-GCC--------C--G----AT-CCCATT-CA-----TA----TT--T-AT-------------T---GA-AT--A--A-AA-TA-TTG-TT-T-AAATTAAa