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Reference ( gi|110622 ) : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AAAAAA------C--A--CA----T--C-C--G---AC-T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A----G-GCGA---G-T-A-TATACAG
gi|110626 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--T--------AAAAAA------C--A--CA-------A-C--G---AC-T-----TA---CA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A----G-GCGA---G-T-A-TATACG
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gi|110652 : T-CT-G-CAAA-A---A----GATGC-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-G----G--A----AA-TCCTGC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---ATCAGATATAA------C--A---A----T--C-C--G---AC-T-----TA---TA---A---GCG-AA-----CG-A-C-T------T-GACT-A----G-GCGA---G-T-ATTATAC
gi|110600 : aT-TT-GACAAA-A---A----T---C-CA-G---T-----CCG--C-T--T--AT-A---A-GC--GG-----TC---A------T--G-TT---A--A-------TTCTTC-AAA-T-TT-A-T-CC--G---A----AGGAAG------G--G--TT----C--C-C--G---AC-T-----TA---TA---A---GCG-GG------G-A-C--------T-A--G-A----T-ACGA---G-T-A-TGTAg
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gi|110614 : aaaatcaattctgatgactatgatcaacttataAAA-A---A----A---T-TCAG---T-----CAG-AC-T--T--CT-------GCAAGG--G--TC---AAAATTTT--T-AA---A--A----AA-TTCTTC-AAA-G-AA-A-T-TT--------------AAG------G--T--CA----T--C----G---GC-T-----TG---AA---T---GCA-TG---T-CG-A-C-T------T-T--T-A----C-GCGA---G-T-A-TAggggttatggacttatatgtgagt
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : 55 1 4444 1 1 1 66 8 8 333 44444444444444444444444 7 7 66 55 6 4444 77 55 55 111 22222 88 000000 44 3333 22 6 8 4 22222 88 555555555 66 000 111 22222222222222222222 44 99 000 44444 333 3333333 1 11111 6 6 9 888888 6 55 2 111 99 99 999999 9 6 6 6 7 7
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Reference ( family-299 ) : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CG--CA----N---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--NGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
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gi|110611 : caaagaaacacaactcttggtagaaaatggattttaaggtggtggacgatttgacaaaT-GACAAA-A---A----T---T-CA-G---T-----CTG-AC-T--T--AT-ATA-AGA--AG--G--T----AA-----TTAGTGT---AT-A----AA-TTCTTC-AAA-AAT-----TCT--C----C----AA--A---A---A------GG--TG----TTA-C--C--A---ACT-----TAGTACA---T---GCA-GG---T-CA-A-C-T------T-A--T-A--TGT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110612 : aaagaaatacaactcttgctagaaaatggatattaaaatggcggtcaataGATTT--TAA-G----A-TGGTA-G-ACAATT--T-GACAAA-A---A---------------------------------T--AT-A---TGA--GG--G--TC---AA-----T--G-TT---A--A----T--TTCTT----A-A-C-T-A-TTT--CTCCGAC---AG--A---G---G------GG--TT----C---C--C--G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-G-CGG
gi|110614 : aagaaacaccattcttgctaaaaaaaaaaaaaatgAAA-A---A----A---T-TCAG---T-----CAG-AC-T--T--CT------GCAAGG--G--TC---AAAATTTT--T-AA---A--A----AA-TTCTTC-AAA-G-A-A-A-TTT--------------------A---A------GG--TC----A---T--C--G---GCT-----TG---AA---T---GCA-TG---T-CG-A-C-T------T-T--T-A--CGC--G--A------G-T-A-TA-
gi|110616 : aagaaaaatgactcctgctagataatgggttcaagttaatggacaattcaataCGATT--T-GATAAA-A---A----T---T-TA-G---T-----CCG-AC-T--T--TT-A---AGA--GG--G--TT---AG-----T--G-TT------A----AA-TTCTTC-AAA-A-----ATTCT--C----T----GG--A---A---A------GGGTTT----A---C--T--G---ACT-----TA---CA---T---GCG-GG---T-CA-A-C-T------T-G--A-A--TGC--G--AGTG---G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110617 : acaattcttgctagaaaatggatattttaagatggggaaGATTT--GAA-AAAAAT-TGTCA-A-CCATTC-CT-GGGAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-ACAT--T--AT-A---GGC--AT--G--TC---AT-----T--G-GG---C--A----AA-TCTTTC-AAA-T-T-----TCT--C----A----AA--A----------------------------C--C-----------------------------CA-AT---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110619 : tttttgttaaaaaattttggGATAT--GAAGA----T-GGTGG-A-C-AATT-TT-A-CAAA-A---A----A---T-CA-G---T-GAGTCTG-AC-A--T--AT-A---TGA--GG--G--TT---AG-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-AAATA-T-T-T-TC---C----G----AA--A---A---A------GGGGCT----T---C--C--G---ACT-----TC---CA---C---GCG-GG---T-CG-A-C-T------T-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-
gi|110620 : aaaatg-GACAAA-A---A----T---T-CA-G---T-----CCA-AC-T--T--AT-A---AGA--GG--G--TT---AG-----T--G-TT---A--A----AT-TCTTGA-AAA-A-T-----TCT--C----C----GA--A---A---A------AG------------------G---GGT-----TA---TG-------------------G-A-C-T------T-A--T-A--TGT--G--A------G-T-
gi|110621 : aaaatcaattctgatgactatgatcaacttataGATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CTAATT-TT-GGCAAA-A---A----G---T-T--A---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--A--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TTG--C----G----AA--G---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----AA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------T-T-A-TA-T-A-TGG
gi|110622 : taGATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--CA---A----AA--A---A---A------CA--CA----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110623 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCTATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-AC---A--A----AA-TCGTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110624 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCAATTGTT-GGCAAA-A---C----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TTCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----TA--A---A---A------CA--CA----A---C--T--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--AGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110625 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---G--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--AA----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GC--AA---C-CA-A-C-T------T-A--T-G--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110626 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--T----A----AA--A---A---A------CA--CA----A------C--G---ACT-----TA---CA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110627 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCAATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--A--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TC-------------------------------------------------C--G---ACT-----TA---TA---G---GTG-AA---C-CA-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110628 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-TCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--GT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-AC---A--A----AA-TCCTTT-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-TG-A-C-T------T-T--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110629 : GATCT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GACCAA-A---A----G---T-T--G---A-A---CCG-AC-T--T--AT-A---TGC--GA--G--TC---AG-----T--G-GC---A--A----AA-ACCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---TCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110630 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CC-ATT-CT-GACAAA-A---A----G---T-T--A-------------AC-T--T--AT-A---GGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--ATTAAAA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----T---C--C--G---ACT-----CA---AA---G---GCG--G---T-TG-A-C-T------T-A--C-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-TGG
gi|110631 : GATTT--CAA-A----T-TGTCA-A-TCGATT-CT-GGTAAA-A---A----G---C-T--G---T-T---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCTTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A-------GATCA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---ACG-AG-----TG------------T-A--T-A--TG-------------G-T-A-TA-T-A-C
gi|110632 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCAATT-CT-AGCAAA-A---A----A---T-T--A---T-A---CCA-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---GA-----G--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TGT--A----A----AA--A---A---AAC----CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---ACG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110633 : TTT--GAA-A----TGTGTCA-A-CCAATT-CT-AGCAAA-A---A-------------A---T-A---CCATAC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---GA-----G--G-AC------A----AA-TCCTTC-AAATA-T---A-TGT--A----A----AG--A---A---AAC----CA--CA----A---C--C--GCGAGCT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-CTT------T-A--T-AGTGGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-
gi|110634 : gatGATTT--GAA-A----T-TGTCC-A-AGGATT-CT-GGCAAT-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AG-----T--A-GC---A--A----AA-TCATTG-AAA-A-C-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-G-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110635 : TTT--GAA-A----T-TGTCA-A-C-GATT-CT-GGCAAA-A---AAATTG---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG-----TC---AA-----T--G-GCCAAA--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-T-A-TCC--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110636 : gatGATTT--GAA-A----T-TGACA-AACTGATT-TTAGGCAAA-A---G----T---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GGA-G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AAATCCTTCCAAA-A-T-G-AATCT--A----AGAAAAA--A---A---A------TA--CA----A---C--T--G---ATTCAGATTA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------T-T-A-TA-T-A-CAGtatatacag
gi|110637 : TTT--GAA-A----T--GTCA-A-CTGATT-CT-TGCAAA-A---G----------T--G---T-A---CCA-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-ATTCT--A----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---
gi|110638 : gatGATTT--CAA-A----T-TTTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T----------A---CAA-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----C----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--T--G---ACT-----TA---CA---G---GCA-AG---T----A-C-A------T-A--T-A--T--------------G-T-A-TA-T-A-AGG
gi|110639 : GATTT--CAA-A----T-TGTCA-A-CCTATT-CT-GGTAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---ATC--GG--A--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-A
gi|110640 : GATTT--GAA-A----T-TGTTA-A-CCAATT-CT-GACAAA-A---G----G---T-T--G---T-A---TGG-AC-T--T--AT-A---GGA--GG--G--TC---AA-----T--G-GC------A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--T---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---CA---G---ACG-AG---atatatacgg
gi|110641 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-TTGATT-CT-GGCAAA-A---AAA--G---T-T--T---T-A---TCG-AC-T--A--AT-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TTC-TC-AAA-A-A-A-ATTCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---tatatacgg
gi|110642 : ATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--GC---AA-----T--A-GA---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-T-TA-T-A-CGGtatatacg
gi|110643 : TCT--AAG-A----T-AGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AT-T--T--AT-A---TGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-T-CTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110644 : TTT--GAA-A----T--GTCA-AACCGATTGTT-GGCAAA-A---AA---G---T-T--G---TTA---CCG-AC-TGATCAAT-A---TGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTT---AA-A-TAG-A------C----A----A-----------------------------------C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CT-A-C-T------T-A--C-A--T--------------G-T-A-TG-T-A-CGtatatacag
gi|110645 : TT--AAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---C----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---AGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AC-TCCTTT-AAA-A-T-G-A-GCT--A----A----AA--A---A---AGAAGACCA--CA----A---C--A--G---ATT-----TT---TA---A---GCG-AA---G-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110646 : -GACAAA-A---A----T---T-CA-G---T-----CCG-AC-T--T--AA-A---AG-------G--TT---AC-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-GAG-AGT-G-G-GTT------------------------------------A----C---A--C--G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG-A-T-C------T-A--T-A--TGC--G--A------C-T-A-TA-T-A-C
gi|110647 : aagatgacggacaataa-TGTCA-A-CCAATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--A---T-A---CCA-AA-T--T--AT-A---GGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-TGG
gi|110648 : -TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-T--------G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCATC-ACA-A-T-T-A-TCT--C---------AA--A---A---A------CG--CA----A---C--T--G---CCT-----TA---GA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TT-T-A-CGG
gi|110650 : CGATT-CT-GCAAAA-A---A----G---T-T--------A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--GG-TC---AA-----A--G-GCCAAA--A----AA-TCCT-C-AAA-A---G-A-TCT--C----A----AA--A---A---G------CA--CA----A---CA-C--G---A-T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A--A-T-A-CG
gi|110651 : CGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-G--A---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CC--CA----T---C--C--G---ACT-----TG---TA---G---GCG-AG---
gi|110652 : T-CT-G-CAAA-A---A----GATGC-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-G----G--A----AA-TCCTGC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----ATC--AG--ATATA---A------CA---A----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-AA-----CG-A-C-T------T-GACT-A--GGC--G--A------G-T-ATTA-T-A-CGtatatacgg
gi|110653 : aT-TT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AA-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--T----T----AA--A---A---A------CA--CA----A---T--C--G---AC------TA---TA---G---GTG-AA---C-CG-G-C-T------T-A--A-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110654 : T-GGCAAA-A---A----AA--T-T--G---T-A---CCG-AC-TA-T--AT-A---GGC--GGAAG--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-C-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--TA----A---C--C--G---ACT-----TAT--TA---G---GAA-GA---A-CG-A-C-T------T-A--T----GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110655 : t-GACAAA-A---GT---G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-AA--GGT--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CG----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-ACC-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-AA-T-T-CGG
gi|110656 : -GGCAAA-A---A----A---T-T--G---A-AAG-CCA-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AAA----T--G-GA---A--A----AG-ATCTTC-AAA-A-T-G-ATTCT--C---------AA--A---A---A------CG--AA----A---C--C--G---ACT-----T----TAT--G---GCG-AA---C-CA-C-C-T------T-T--T-----GC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110657 : ---A----G---T-T--G-----------G-AC-T--T--CT------GCAAGG--G--TC---AA-----A--G-TT---A--A----AA--------AAA-A-T-----CTT--C----A----AAGAA---A---A------GG--TC----A---C--C--G---GTT-----TG---AA---T---GCA-TG---T-CG-A-C-T------T-T--T-A--CGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110658 : aaaagttcG--A--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTGC-AAA-A-T-T---TCT--CC---G----AA--A---G---A------GG--GA----T---T--CATG---ACT-----TA---TA---C---GCA-AG---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TAT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110659 : ccaaattactataaa---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-T-CTTC-ATA-T-T-A-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--CT-G---ACT-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG-A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110660 : ---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-T-CTTC-ATA-T-T-A-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--CT-G---ACT-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG-A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110661 : G-AC-T--A--CT-A---TGA--GG--G--TT---AA-----T--G-TT---A--T----A--TTCTTC-AAA-A-T-T---TCT--CCG--A----AA--G---A---G------GG--TT----C---C--C--G---AAT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CA-A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110662 : -T--T--AT-A---GGC--GG--GCGTC---AA-----T--G-GT---C--A----AA-TCCTTC-AAA-A-A-T-A-TCT--C----A----GA--A---A---A------CA--CA----G---C--C--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-AA---C-CG-A-C-T------TAA--T-A--GGC--G--A------G-TAA-TA-TGA-CGG
gi|110663 : GC--GG--G--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-AAC-A-T-T---TGT--C----A----GA--A---ATAGA------GG--CT----C---C--C--G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TGG--G--A------G-T-A-
gi|110664 : G--G--TC---AA-----T--A-TC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--T----A----AA--A---A---ACCC---CA--CAAGGTT---C--C--A---ACT-----TA---TA---C---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-T--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-
gi|110665 : --A----AA-TTCTTC-AAA-A-T-T---TCT--CCGA-A----AG--A---G---G------GG--TT----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---C---ATG-GG---A-TG-A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--AGTACATG-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110666 : ----AA-TTCTTC-AAATA-T-T-G-TC---C----G----AA--A---A---G------GG--GG----T---TATC--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-GG---T-CA-A-C-T------T-A--T-A--TGCCAGCTA------G-T-A-TA-T-A-
gi|110668 : -TTCTTC-AAA-AAT-----TCT--C----G----GA--A---A---A------GG--GG----GTTAC--C--A---ACT-----TA---CA---A---GCG-GG---T-CG-A-C-T------C-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
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gi|110634 : gatGATTT--GAA-A----T-TGTCC-A-AGGATT-CT-GGCAAT-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AG-----T--A-GC---A--A----AA-TCATTG-AAA-A-C-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-G-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110635 : TTT--GAA-A----T-TGTCA-A-C-GATT-CT-GGCAAA-A---AAATTG---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG-----TC---AA-----T--G-GCCAAA--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-T-A-TCC--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110636 : gatGATTT--GAA-A----T-TGACA-AACTGATT-TTAGGCAAA-A---G----T---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GGA-G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AAATCCTTCCAAA-A-T-G-AATCT--A----AGAAAAA--A---A---A------TA--CA----A---C--T--G---ATTCAGATTA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------T-T-A-TA-T-A-CAGtatatacag
gi|110637 : TTT--GAA-A----T--GTCA-A-CTGATT-CT-TGCAAA-A---G----------T--G---T-A---CCA-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-ATTCT--A----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---
gi|110638 : gatGATTT--CAA-A----T-TTTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T----------A---CAA-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----C----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--T--G---ACT-----TA---CA---G---GCA-AG---T----A-C-A------T-A--T-A--T--------------G-T-A-TA-T-A-AGG
gi|110639 : GATTT--CAA-A----T-TGTCA-A-CCTATT-CT-GGTAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---ATC--GG--A--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-A
gi|110640 : GATTT--GAA-A----T-TGTTA-A-CCAATT-CT-GACAAA-A---G----G---T-T--G---T-A---TGG-AC-T--T--AT-A---GGA--GG--G--TC---AA-----T--G-GC------A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--T---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---CA---G---ACG-AG---atatatacgg
gi|110641 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-TTGATT-CT-GGCAAA-A---AAA--G---T-T--T---T-A---TCG-AC-T--A--AT-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TTC-TC-AAA-A-A-A-ATTCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---tatatacgg
gi|110642 : ATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--GC---AA-----T--A-GA---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-T-TA-T-A-CGGtatatacg
gi|110643 : TCT--AAG-A----T-AGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AT-T--T--AT-A---TGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-T-CTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110644 : TTT--GAA-A----T--GTCA-AACCGATTGTT-GGCAAA-A---AA---G---T-T--G---TTA---CCG-AC-TGATCAAT-A---TGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTT---AA-A-TAG-A------C----A----A-----------------------------------C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CT-A-C-T------T-A--C-A--T--------------G-T-A-TG-T-A-CGtatatacag
gi|110645 : TT--AAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---C----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---AGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AC-TCCTTT-AAA-A-T-G-A-GCT--A----A----AA--A---A---AGAAGACCA--CA----A---C--A--G---ATT-----TT---TA---A---GCG-AA---G-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110646 : -GACAAA-A---A----T---T-CA-G---T-----CCG-AC-T--T--AA-A---AG-------G--TT---AC-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-GAG-AGT-G-G-GTT------------------------------------A----C---A--C--G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG-A-T-C------T-A--T-A--TGC--G--A------C-T-A-TA-T-A-C
gi|110647 : aagatgacggacaataa-TGTCA-A-CCAATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--A---T-A---CCA-AA-T--T--AT-A---GGC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-TGG
gi|110648 : -TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-T--------G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCATC-ACA-A-T-T-A-TCT--C---------AA--A---A---A------CG--CA----A---C--T--G---CCT-----TA---GA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TT-T-A-CGG
gi|110650 : CGATT-CT-GCAAAA-A---A----G---T-T--------A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--GG-TC---AA-----A--G-GCCAAA--A----AA-TCCT-C-AAA-A---G-A-TCT--C----A----AA--A---A---G------CA--CA----A---CA-C--G---A-T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A--A-T-A-CG
gi|110651 : CGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-G--A---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CC--CA----T---C--C--G---ACT-----TG---TA---G---GCG-AG---
gi|110652 : T-CT-G-CAAA-A---A----GATGC-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---GGC--GG--G--TC---AA-----T--G-G----G--A----AA-TCCTGC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----ATC--AG--ATATA---A------CA---A----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-AA-----CG-A-C-T------T-GACT-A--GGC--G--A------G-T-ATTA-T-A-CGtatatacgg
gi|110653 : aT-TT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AA-A---AGC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--T----T----AA--A---A---A------CA--CA----A---T--C--G---AC------TA---TA---G---GTG-AA---C-CG-G-C-T------T-A--A-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110654 : T-GGCAAA-A---A----AA--T-T--G---T-A---CCG-AC-TA-T--AT-A---GGC--GGAAG--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-C-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--TA----A---C--C--G---ACT-----TAT--TA---G---GAA-GA---A-CG-A-C-T------T-A--T----GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110655 : t-GACAAA-A---GT---G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-AA--GGT--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CG----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG-ACC-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-AA-T-T-CGG
gi|110656 : -GGCAAA-A---A----A---T-T--G---A-AAG-CCA-AC-T--T--AT-A---AGC--GG--G--TC---AAA----T--G-GA---A--A----AG-ATCTTC-AAA-A-T-G-ATTCT--C---------AA--A---A---A------CG--AA----A---C--C--G---ACT-----T----TAT--G---GCG-AA---C-CA-C-C-T------T-T--T-----GC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110657 : ---A----G---T-T--G-----------G-AC-T--T--CT------GCAAGG--G--TC---AA-----A--G-TT---A--A----AA--------AAA-A-T-----CTT--C----A----AAGAA---A---A------GG--TC----A---C--C--G---GTT-----TG---AA---T---GCA-TG---T-CG-A-C-T------T-T--T-A--CGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110658 : aaaagttcG--A--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTGC-AAA-A-T-T---TCT--CC---G----AA--A---G---A------GG--GA----T---T--CATG---ACT-----TA---TA---C---GCA-AG---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TAT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110659 : ccaaattactataaa---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-T-CTTC-ATA-T-T-A-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--CT-G---ACT-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG-A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110660 : ---CCG-AC-T--T--AT-A---GGT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-T-CTTC-ATA-T-T-A-A-TCT--C----A----AA--A---A---A------CA--CA----A---C--CT-G---ACT-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG-A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110661 : G-AC-T--A--CT-A---TGA--GG--G--TT---AA-----T--G-TT---A--T----A--TTCTTC-AAA-A-T-T---TCT--CCG--A----AA--G---A---G------GG--TT----C---C--C--G---AAT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CA-A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110662 : -T--T--AT-A---GGC--GG--GCGTC---AA-----T--G-GT---C--A----AA-TCCTTC-AAA-A-A-T-A-TCT--C----A----GA--A---A---A------CA--CA----G---C--C--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-AA---C-CG-A-C-T------TAA--T-A--GGC--G--A------G-TAA-TA-TGA-CGG
gi|110663 : GC--GG--G--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-AAC-A-T-T---TGT--C----A----GA--A---ATAGA------GG--CT----C---C--C--G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TGG--G--A------G-T-A-
gi|110664 : G--G--TC---AA-----T--A-TC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-T-G-A-TCT--T----A----AA--A---A---ACCC---CA--CAAGGTT---C--C--A---ACT-----TA---TA---C---GCG-AA---C-CG-A-C-T------T-T--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-
gi|110665 : --A----AA-TTCTTC-AAA-A-T-T---TCT--CCGA-A----AG--A---G---G------GG--TT----T---C--C--G---ACT-----TA---TA---C---ATG-GG---A-TG-A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--AGTACATG-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110666 : ----AA-TTCTTC-AAATA-T-T-G-TC---C----G----AA--A---A---G------GG--GG----T---TATC--G---ACT-----TA---TA---A---GCG-GG---T-CA-A-C-T------T-A--T-A--TGCCAGCTA------G-T-A-TA-T-A-
gi|110668 : -TTCTTC-AAA-AAT-----TCT--C----G----GA--A---A---A------GG--GG----GTTAC--C--A---ACT-----TA---CA---A---GCG-GG---T-CG-A-C-T------C-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110669 : --G---ACT-----TA---TA---C---GCG-GA---T-CG-A-C-C------T-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
blockSeqs : CA G AAAA G G A GT TCC CCAGCATGCG GA CA TGTG AA AA CG CAT AATTT GCCAA TT TTAA AA T A TTA TCCGAC GG TAT GAG CCCCACAAGGTT AT AT CAGAT GTA CATGTAC A TTCC T TACATG AC C GTG GTACAT T
blockSeqs : . . . . . A GT . ATCAGTGAGT A T TAA AA A G . A GCCAA T . A T A GAA AGAAA GA . TAG GAAGACCACAA A T . CC CG A CT T . C A T GTG T
blockSeqs : . . . . . . T . AATTGTTGTA . . AG . . . . . TGT . . A T G GAT CGAA . . . GGGGGTTA . T . T GC . T T . . . T . T
blockSeqs : . . . . . . T . GATGCTGTA . . T . . . . . TT . . A . A AAT CGAA . . . GGTGTTC . . . . CG . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . TTGCGGTA . . T . . . . . TT . . T . . AGA CGAA . . . GGGGTTT . . . . TG . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . AAGTTTTA . . G . . . . . GT . . A . . GAT CGAA . . . GGGGTTA . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . AGTTGTTA . . T . . . . . TT . . A . . TA CGG . . . GGTGTTA . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . ATTGAAAG . . T . . . . . TC . . A . . TC ATC . . . GGGTTTA . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TTCCAGT . . T . . . . . TT . . A . . TA CGA . . . GGGGCTT . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . CTTCAGT . . T . . . . . TT . . A . . AA TA . . . ACCACAA . . . . T . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . ATTCAGT . . A . . . . . TT . . A . . AT CG . . . ACCACAA . . . . A . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . AATTGTA . . T . . . . . TT . . T . . TT AA . . . GGCGTT . . . . G . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TGTTGTA . . A . . . . . AT . . A . . GA CG . . . GATCAA . . . . T . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TCCAGT . . T . . . . . TT . . A . . GA T . . . GGTTC . . . . C . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TCCAGT . . T . . . . . TT . . A . . GA G . . . GGTTC . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TCCAGT . . T . . . . . TT . . A . . GA G . . . GGTTC . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . ATCAGT . . A . . . . . TT . . A . . GA G . . . GGTTC . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TTCAGT . . G . . . . . AA . . A . . GA A . . . GGTTC . . . . T . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . TTTAGT . . T . . . . . TT . . A . . GA C . . . GGTTC . . . . C . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . A . . . . . GG . . A . . GA C . . . GGGTT . . . . T . T . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . C . TTCAGT . . A . . . . . TT . . A . . GA T . . . GGTTC . . . . T . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . GTTATA . . G . . . . . TT . . A . . GA A . . . GGTCA . . . . C . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GA G . . . CACAA . . . . G . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GA C . . . CACAT . . . . G . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . AC . . A . . GA G . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . TA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . A . . . . . GC . . A . . GA A . . . CAAAT . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . T . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGAA . . G . . . . . AC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . T . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GCTGTT . . A . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAT . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . ATTATA . . G . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GG A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . TTTGTA . . A . . . . . GC . . A . . GA A . . . TACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . C . GTTGTA . . G . . . . . AC . . A . . TA A . . . CACAA . . . . G . T . . . . T . .
blockSeqs : . . . T . GTTGTA . . A . . . . . GC . . C . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . GTTGTA . . G . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . G . . . . G . .
blockSeqs : . . GTTGTA . . A . . . . . GC . . A . . GA C . . . CACAA . . . . G . T . . . . T . .
blockSeqs : . . TTCAGT . . G . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . GTTATA . . A . . . . . GC . . A . . GA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . T . .
blockSeqs : . . GTTGTA . . A . . . . . GC . . A . . AA A . . . CACAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . GTGATA . . T . . . . . GA . . A . . AA A . . . CGCAA . . . . G . C . . . . T . .
blockSeqs : . GTTGTA . . T . . . . . GC . . A . . TA A . . . CACAA . . . . G . A . . . . G . .
blockSeqs : . GTTA . . A . . . . . GC . . G . . GA A . . . CCCAT . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . TGTA . . A . . . . . GC . . A . . TG A . . . CACAA . . . . A . C . . . . G . .
blockSeqs : . GTTA . . G . . . . . TT . . A . . T A . . . CATAA . . . . C . T . . . . G . .
blockSeqs : . GTTG . . A . . . . . GC . . A . . T A . . . CACGT . . . . G . T . . . . G . .
blockSeqs : . ATA . . G . . . . . GC . . A . . T A . . . CGAAA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . GTA . . G . . . . . GC . . A . . T T . . . GGTCA . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . GT . . G . . . . . GC . . A . . T A . . . GGGAT . . . . G . T . . . . C . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . GC . . A . . T A . . . CACAA . . . . A . C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . GC . . . . . T A . . . CACAA . . . . G . T . . . . G . .
blockSeqs : . . A . . . . . GA . . . . . T A . . . GGTTC . . . . G . C . . . . G . .
blockSeqs : . . G . . . . . TT . . . . . T A . . . CACAG . . . . G . A . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . . TT . . . . . A A . . . GGCTC . . . . T . T . . . . G . .
blockSeqs : . . T . . . . . TT . . . . . T A . . . GGTTT . . . . C . T . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . . GT . . . . . T A . . . GGGGT . . . . G . T . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . TT . . . . . T G . . . CAAT . . . . G . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . T G . . . AG . . . . C . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . AC . . . . A . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
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gi|110633 : TTT--GAA-A----TGTGTCA-A-CCAATT-CT-AGCAAA-A---A-------------A---T-A---CCATAC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---GA-----G--G-AC------A----AA-TCCTTC-AAATA-T--A-T-GT--A---A----AG--AA---AAC----CA----CA---A----C-C--GCGAGC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---A-CTT------T-A--T-AGTGGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-
gi|110634 : gatGATTT--GAA-A----T-TGTCC-A-AGGATT-CT-GGCAAT-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---A-GC--GG--G--TC---AG-----T--A-GC---A--A----AA-TCATTG-AAA-A-CG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---G-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110635 : TTT--GAA-A----T-TGTCA-A-C-GATT-CT-GGCAAA-A---AAATTG---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GT--GG-----TC---AA-----T--G-GCCAAA--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TT-A-T-CC--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110636 : gatGATTT--GAA-A----T-TGACA-AACTGATT-TTAGGCAAA-A---G----T---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---A-GC--GGA-G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AAATCCTTCCAAA-A-TG-AAT-CT--A---AGAAAAA--AA---A------TA----CA---A----C-T--G---AT--TCAGATTA---TA---G---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------T-T-A-TA-T-A-CAGtatatacag
gi|110637 : TTT--GAA-A----T--GTCA-A-CTGATT-CT-TGCAAA-A---G----------T--G---T-A---CCA-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-ATT-CT--A---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---
gi|110638 : gatGATTT--CAA-A----T-TTTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T----------A---CAA-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---C----AA--AA---A------CA----CA---A----C-T--G---AC--T-----TA---CA---G---GCA-AG---T------A-C-A------T-A--T-A--T--------------G-T-A-TA-T-A-AGG
gi|110639 : GATTT--CAA-A----T-TGTCA-A-CCTATT-CT-GGTAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---A-TC--GG--A--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-A
gi|110640 : GATTT--GAA-A----T-TGTTA-A-CCAATT-CT-GACAAA-A---G----G---T-T--G---T-A---TGG-AC-T--T--AT-A---G-GA--GG--G--TC---AA-----T--G-GC------A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--TA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---CA---G---ACG-AG---atatatacgg
gi|110641 : GATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-TTGATT-CT-GGCAAA-A---AAA--G---T-T--T---T-A---TCG-AC-T--A--AT-A---A-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TTC-TC-AAA-A-AA-ATT-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AG---tatatacgg
gi|110642 : ATTT--GAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---A-GC--GG--G--GC---AA-----T--A-GA---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-T-TA-T-A-CGGtatatacg
gi|110643 : TCT--AAG-A----T-AGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AT-T--T--AT-A---T-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-T-CTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AG---
gi|110644 : TTT--GAA-A----T--GTCA-AACCGATTGTT-GGCAAA-A---AA---G---T-T--G---TTA---CCG-AC-TGATCAAT-A---T-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTT---AA-A-T--------------A----GA--------------------CA---A------C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CT---A-C-T------T-A--C-A--T--------------G-T-A-TG-T-A-CGtatatacag
gi|110645 : TT--AAA-A----T-TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-A---C----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---A-GC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AC-TCCTTT-AAA-A-TG-A-G-CT--A---A----AA--AA---AGAAGACCA----CA---A----C-A--G---AT--T-----TT---TA---A---GCG-AA---G-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110646 : -GACAAA-A---A----T---T-CA-G---T-----CCG-AC-T--T--AA-A---A-G-------G--TT---AC-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-GAG-AGTG-G-G-TT----------------------------A----CA----------C--G---AC--T-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG---A-T-C------T-A--T-A--TGC--G--A------C-T-A-TA-T-A-C
gi|110647 : aagatgacggacaataa-TGTCA-A-CCAATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-T--A---T-A---CCA-AA-T--T--AT-A---G-GC--AG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-TGG
gi|110648 : -TGTCA-A-CCGATT-CT-GGCAAA-T--------G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---A-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCATC-ACA-A-TT-A-T-CT--C--------AA--AA---A------CG----CA---A----C-T--G---CC--T-----TA---GA---G---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TT-T-A-CGG
gi|110649 : CAATT-CT-GACCAA-A---A----T---C-A--G---T-----CCG-AC-T--T--AT-A---ATGC--AGACG--TC---AG-----T--A-TT------A----AA-TCTTTA-AAA-A-CATA-TACT--CG--A----AA--AG---A------AGGGTTCA---A----C-C--GA--ACTAT-----CA---TA---G---A-G-GG---T-CGGGAA-T-TG-----T-A--T-AT-TGC--A--A------G-T-ATTA-T-A-
gi|110650 : gaCGATT-CT-GCAAAA-A---A----G---T-T--------A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--GG-TC---AA-----A--G-GCCAAA--A----AA-TCCT-C-AAA-A--G-A-T-CT--C---A----AA--AA---G------CA----CA---A----CAC--G---A---T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A--A-T-A-CG
gi|110651 : CGATT-CT-GGCAAA-A---A----G---T-G--A---T-A---CTG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CC----CA---T----C-C--G---AC--T-----TG---TA---G---GCG-AG---
gi|110652 : T-CT-G-CAAA-A---A----GATGC-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-G----G--A----AA-TCCTGC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----TC--AG---A------TA----TA---ACAATC-C--G---AC--T-----TA---TA---A---GCG-AA-----CG---A-C-T------T-GACT-A--GGC--G--A------G-T-ATTA-T-A-CGtatatacgg
gi|110653 : aT-TT-GGCAAA-A---A----G---T-T--G---T-A---CTG-AC-T--T--AA-A---A-GC--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--T---T----AA--AA---A------CA----CA---A----T-C--G---AC--------TA---TA---G---GTG-AA---C-CG---G-C-T------T-A--A-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110654 : T-GGCAAA-A---A----AA--T-T--G---T-A---CCG-AC-TA-T--AT-A---G-GC--GGAAG--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-CG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----TA---A----C-C--G---AC--T-----TAT--TA---G---GAA-GA---A-CG---A-C-T------T-A--T----GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110655 : t-GACAAA-A---GT---G---T-T--G---T-A---CCG-AC-T--T--AT-AA--G-GT--GG--G--TC---AA-----T--G-GC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CG---T----C-C--G---AC--T-----TA---TA---G---GCG-AA---C-CG---ACC-T------T-A--T-A--GGC--G--A------G-T-A-AA-T-T-CGG
gi|110656 : -GGCAAA-A---A----A---T-T--G---A-AAG-CCA-AC-T--T--AT-A---A-GC--GG--G--TC---AAA----T--G-GA---A--A----AG-ATCTTC-AAA-A-TG-ATT-CT--C--------AA--AA---A------CG----AA---A----C-C--G---AC--T-----T----TAT--G---GCG-AA---C-CA---C-C-T------T-T--T-----GC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110657 : ---A----G---T-T--G-----------G-AC-T--T--CT-------GCAAGG--G--TC---AA-----A--G-TT---A--A----AA--------AAA-A-T----C-TT--C---A----AAGAAA---A------GG----TC---A----C-C--G---GT--T-----TG---AA---T---GCA-TG---T-CG---A-C-T------T-T--T-A--CGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110658 : aaaagttcG--A--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTGC-AAA-A-TT---T-CT--CC--G----AA--AG---A------GG----GA---T----T-CATG---AC--T-----TA---TA---C---GCA-AG---T-CG---A-C-C------T-A--T-A--TAT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110659 : ccaaattactataaa---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-TC-TTC-ATA-T-TA-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-CT-G---AC--T-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG---A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110660 : ---CCG-AC-T--T--AT-A---G-GT--GG--G--TC---AT-----T--G------A--A----AA-TC-TTC-ATA-T-TA-A-T-CT--C---A----AA--AA---A------CA----CA---A----C-CT-G---AC--T-----TA---CA---G---GCGAAA---C-CG---A-CTT------T-A--T-A--GGC--G--A------GTT-A-TA-T-A-CGG
gi|110661 : G-AC-T--A--CT-A---T-GA--GG--G--TT---AA-----T--G-TT---A--T----A--TTCTTC-AAA-A-TT---T-CT--CCG-A----AA--GA---G------GG----TT---C----C-C--G---AA--T-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CA---A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110662 : -T--T--AT-A---G-GC--GG--GCGTC---AA-----T--G-GT---C--A----AA-TCCTTC-AAA-A-AT-A-T-CT--C---A----GA--AA---A------CA----CA---G----C-C--G---AC--T-----TA---TA---A---GCG-AA---C-CG---A-C-T------TAA--T-A--GGC--G--A------G-TAA-TA-TGA-CGG
gi|110663 : -GC--GG--G--TC---AA-----T--G-TT---A--A----A--TTCTTC-AAC-A-TT---T-GT--C---A----GA--AATAGA------GG----CT---C----C-C--G---AC--T-----TA---TA---C---GCG-GG---T-CG---A-C-C------T-A--T-A--TGG--G--A------G-T-A-
gi|110664 : G--G--TC---AA-----T--A-TC---A--A----AA-TCCTTC-AAA-A-TG-A-T-CT--T---A----AA--AA---ACCC---CA----CA---AGGTTC-C--A---AC--T-----TA---TA---C---GCG-AA---C-CG---A-C-T------T-T--T-A--GGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-
gi|110665 : --A----AA-TTCTTC-AAA-A-TT---T-CT--C---C----GA--AA---G------AG----GG---GTTT-C-C--G---AC--T-----TA---TA---C---ATG-GG---A-TG---A-C-C------T-A--T-A--TGT--G--AGTACATG-T-A-TA-T-A-CGG
gi|110666 : ----AA-TTCTTC-AAATA-TT-G-T-C---C---G----AA--AA---G------GG----GGTT-A----T-C--G---AC--T-----TA---TA---A---GCG-GG---T-CA---A-C-T------T-A--T-A--TGCCAGCTA------G-T-A-TA-T-A-
gi|110668 : -TTCTTC-AAA-AAT----T-CT--C---G----GA--AA---A------GG----GGGTTA----C-C--A---AC--T-----TA---CA---A---GCG-GG---T-CG---A-C-T------C-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CAG
gi|110669 : --G---AC--T-----TA---TA---C---GCG-GA---T-CG---A-C-C------T-A--T-A--TGC--G--A------G-T-A-TA-T-A-CGG
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|110613 ): AAGAAATGCAATTTCTACTAGGAAATGGATAATTCTATTGAGATGGCGGACAATTTGACAAAAATTTCAGCCCGACCCTATTAGAGGGTTAGTATTAAATTTCTCAAAAATCCTCAGAAAAGGG
Unaligned ( gi|110615 ): AGAAAACACTGCTTGGGGCTGAGAAAATGGTAGTGTAAATGGCGGTAGGAGATGAAAACTTCAGTTGACTTATATAAAAGGTAATTAGTGTAATAAATTTCAAAAATTCTCCAAAAGGTGTTACCAACTTTAGTACATGCAGGTCATACTTAATATGTGAGTAATA
Unaligned ( gi|110604 ): ATCAAAGAAACACATTAAGATGTCAGACAATTTGACAAACATCCAGTCAGACATATGCGGGTC
Unaligned ( gi|110610 ): CAAAGAAACACAACTCTTCCCAGAAAAATTGGGGTTTTAAGTTGATAGACAACCTGATAAAAACAATCAGCCGGAC
Unaligned ( gi|110667 ): ATTCTTCAAAATTTCTCCGAAAGAGGGGTTC
Unaligned ( gi|110605 ): ATCAAAGAAACACAATTCTTGCAAGAAAATGAATTTTACATGTAAGATGG
Unaligned ( gi|110618 ): TTGCTAGAAAATAGCGATTTTAAGATGCCGCAGCCACAATTTGACAAAA